REPLICATION AND TRANSCRIPTION OF MITOCHONDRIAL DNA AS THE CENTRAL MECHANISM OF THE PATHOLOGICAL SEQUENCE LEADING TO NEURODEGENERATION. (Q3136083)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3136083 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | REPLICATION AND TRANSCRIPTION OF MITOCHONDRIAL DNA AS THE CENTRAL MECHANISM OF THE PATHOLOGICAL SEQUENCE LEADING TO NEURODEGENERATION. |
Project Q3136083 in Spain |
Statements
131,769.0 Euro
0 references
242,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
30 June 2021
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
LAS ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS PUEDEN TENER DIFERENTES CAUSAS Y UNO DE LOS PRINCIPALES OBJETIVOS DE LA INVESTIGACION ACTUAL ES IDENTIFICAR UN MECANISMO BIOQUIMICO COMUN CENTRAL EN EL QUE CONVERGEN. LA MAYORIA DE CAUSAS DE LAS ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS SON AUN DESCONOCIDAS, PERO LAS MUTACIONES GENETICAS QUE PRODUCEN NEURODEGENERACION EN FAMILIAS PROPORCIONAN UN MODELO EXPERIMENTAL ROBUSTO PARA IDENTIFICAR LOS MECANISMOS BIOQUIMICOS CENTRALES DEL PROCESO NEURODEGENERATIVO. LA HIPOTESIS DEL PRESENTE PROYECTO ES QUE LA ALTERACION DE LA REGULACION DEL ADN MITOCONDRIAL (MTDNA) ES UN MECANISMO CENTRAL COMUN EN LA CADENA PATOLOGICA DEL PROCESO NEURODEGENERATIVO. SIN EMBARGO, EL ESTUDIO DE LA REPLICACION Y LA TRANSCRIPCION DEL MTDNA HA ESTADO LIMITADO POR LA DIFICULTAD DE MEDIR CON PRECISION EL NUMERO DE COPIAS DE GENOMA MITOCONDRIAL. RECIENTEMENTE HEMOS DESARROLLADO UN METODO LLAMADO SELFIE-DPCR QUE PERMITE LA CUANTIFICACION EN NUMEROS ABSOLUTOS DEL NUMERO DE TRANSCRITOS MITOCONDRIALES EN RELACION CON SU PROPIA CADENA DE TRANSCRIPCION EN EL MTDNA. ADEMAS, EN NUESTROS PROYECTOS ANTERIORES, HEMOS DESCUBIERTO QUE UNA DISMINUCION DEL CONTENIDO DE MTDNA CIRCULANTE EN EL LIQUIDO CEFALORRAQUIDEO (LCR) PRECEDE A LA MANIFESTACION DE LA ENFERMEDAD DE ALZHEIMER FAMILIAR, MIENTRAS QUE UN AUMENTO EN EL CONTENIDO DE MTDNA EN EL LCR SE ASOCIA CON PARKINSON EN PACIENTES CON MUTACIONES EN EL GEN LRRK2. SOBRE LA BASE DE ESTOS RESULTADOS ANTERIORES, PLANTEAMOS LA HIPOTESIS DE QUE LA ALTERACION EN EL BALANCE ENTRE LA REPLICACION Y LA DEGRADACION DE MTDNA POR LOS SISTEMAS DE CONTROL DE CALIDAD MITOCONDRIAL DETERMINA EL TIPO DE PROCESO NEURODEGENERATIVO. NO OBSTANTE, LOS SISTEMAS DE REGULACION DEL NUMERO DE COPIAS Y DE LA EXPRESION DEL MTDNA AUN NO SE CONOCEN EN PROFUNDIDAD. EN EL PRESENTE PROYECTO PROPONEMOS INVESTIGAR LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION Y LA REPLICACION DE MTDNA EN MODELOS GENETICOS DE LAS ENFERMEDADES DE ALZHEIMER Y PARKINSON. LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS INCLUYEN: 1) ESTUDIAR LA INFLUENCIA DE LOS SISTEMAS DE CONTROL DE CALIDAD MITOCONDRIAL EN LA LIBERACION DE MTDNA EN EL ESPACIO EXTRACELULAR, 2) MEDIR LA REPLICACION Y TRANSCRIPCION DE MTDNA POR SELFIE-DPCR EN MODELOS GENETICOS Y 3) CARACTERIZAR EL MAPA DE TRANSCRIPCION GENICA DE LA VIA DE SEÑALIZACION ANTEROGRADA NUCLEAR-MITOCONDRIAL INDUCIDO POR UNA MUTACION PATOGENICA DEL GEN APP UTILIZANDO EL METODO SELFIE ACOPLADO A SECUENCIACION PARALELA MASIVA SEGUIDO DE VALIDACION POR SELFIE-DPCR. LOS RESULTADOS NOS PERMITIRAN CONTRASTAR LA HIPOTESIS DE QUE LA REGULACION DEL ADN MITOCONDRIAL ES UN MECANISMO CLAVE EN EL PROCESO NEURODEGENERATIVO Y QUE SU NORMALIZACION PUEDE EVITAR LA NEURODEGENERACION. (Spanish)
0 references
NEURODEGENERATIVE DISEASES MAY HAVE DIFFERENT CAUSES AND ONE OF THE MAIN OBJECTIVES OF CURRENT RESEARCH IS TO IDENTIFY A COMMON CENTRAL BIOCHEMICAL MECHANISM ON WHICH THEY CONVERGE. MOST OF THE CAUSES OF NEURODEGENERATIVE DISEASES ARE STILL UNKNOWN, BUT GENETIC MUTATIONS THAT PRODUCE NEURODEGENERATION IN FAMILIES PROVIDE A ROBUST EXPERIMENTAL MODEL TO IDENTIFY THE CENTRAL BIOCHEMICAL MECHANISMS OF THE NEURODEGENERATIVE PROCESS. THE GENERAL HYPOTHESIS OF THE PRESENT PROJECT IS THAT ALTERED REGULATION OF MITOCHONDRIAL DNA (MTDNA) IS A COMMON CENTRAL MECHANISM IN THE PATHOLOGICAL CHAIN OF THE NEURODEGENERATIVE PROCESS. HOWEVER, THE STUDY OF MTDNA REPLICATION AND TRANSCRIPTION HAS BEEN LIMITED BY THE DIFFICULTY OF ACCURATELY MEASURING THE NUMBER OF MITOCHONDRIAL GENOME COPIES. WE HAVE RECENTLY DEVELOPED A METHOD CALLED SELFIE-DPCR THAT ALLOWS ABSOLUTE QUANTIFICATION OF THE NUMBER OF MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTS RELATIVE TO THEIR OWN TRANSCRIPTION CHAIN IN THE MTDNA. FURTHERMORE, IN OUR EARLIER PROJECTS, WE HAVE FOUND THAT A DECREASE IN CIRCULATING MTDNA CONTENT IN CEREBROSPINAL FLUID (CSF) PRECEDES THE MANIFESTATION OF FAMILIAL ALZHEIMER'S DISEASE, WHILE AN INCREASE IN THE CSF CONTENT OF MTDNA IS ASSOCIATED WITH PARKINSON'S DISEASE IN PATIENTS WITH MUTATIONS IN THE LRRK2 GENE. BASED ON THESE PREVIOUS RESULTS, WE HYPOTHESIZE THAT ALTERATION IN THE BALANCE BETWEEN MTDNA REPLICATION AND DEGRADATION BY MITOCHONDRIAL QUALITY CONTROL SYSTEMS DETERMINES THE TYPE OF NEURODEGENERATIVE PROCESS. NEVERTHELESS, THE SYSTEMS THAT REGULATE THE NUMBER OF MTDNA COPIES AND THEIR TRANSCRIPTION ARE NOT WELL KNOWN YET. IN THE PRESENT PROJECT WE PROPOSE TO INVESTIGATE THE REGULATION OF TRANSCRIPTION AND MTDNA REPLICATION IN GENETIC MODELS OF ALZHEIMER'S AND PARKINSON'S DISEASES. SPECIFIC OBJECTIVES INCLUDE: 1) TO STUDY THE INFLUENCE OF MITOCHONDRIAL QUALITY CONTROL SYSTEMS ON THE RELEASE OF MTDNA IN THE EXTRACELLULAR SPACE, 2) TO MEASURE REPLICATION AND TRANSCRIPTION OF MTDNA BY SELFIE-DPCR IN GENETIC MODELS, AND 3) TO CHARACTERIZE THE GENE TRANSCRIPTION MAP OF THE MITOCHONDRIAL NUCLEAR ANTEROGRADE SIGNALING PATHWAY EVOKED BY A PATHOGENIC APP GENE MUTATION USING SELFIE METHOD COUPLED TO TO MASSIVE PARALLEL SEQUENCING FOLLOWED BY VALIDATION WITH SELFIE-DPCR. THE RESULTS WILL ALLOW US CONTRASTING THE HYPOTHESIS THAT REGULATION OF MITOCHONDRIAL DNA IS A KEY MECHANISM IN THE NEURODEGENERATIVE PROCESS AND THAT ITS NORMALIZATION MAY PREVENT NEURODEGENERATION. (English)
0.5793327627459193
0 references
LES MALADIES NEURODÉGÉNÉRATIVES PEUVENT AVOIR DES CAUSES DIFFÉRENTES ET L’UN DES PRINCIPAUX OBJECTIFS DE LA RECHERCHE ACTUELLE EST D’IDENTIFIER UN MÉCANISME BIOCHIMIQUE COMMUN CENTRAL DANS LEQUEL ELLES CONVERGENT. LA PLUPART DES CAUSES DES MALADIES NEURODÉGÉNÉRATIVES SONT ENCORE INCONNUES, MAIS LES MUTATIONS GÉNÉTIQUES QUI PRODUISENT LA NEURODÉGÉNÉRESCENCE DANS LES FAMILLES FOURNISSENT UN MODÈLE EXPÉRIMENTAL ROBUSTE POUR IDENTIFIER LES MÉCANISMES BIOCHIMIQUES CENTRAUX DU PROCESSUS NEURODÉGÉNÉRATIF. L’HYPOTHÈSE DE CE PROJET EST QUE LA MODIFICATION DE LA RÉGULATION DE L’ADN MITOCHONDRIAL (ADNMT) EST UN MÉCANISME CENTRAL COMMUN DANS LA CHAÎNE PATHOLOGIQUE DU PROCESSUS NEURODÉGÉNÉRATIF. CEPENDANT, L’ÉTUDE DE LA RÉPLICATION ET DE LA TRANSCRIPTION DE L’ADNMT A ÉTÉ LIMITÉE PAR LA DIFFICULTÉ DE MESURER AVEC PRÉCISION LE NOMBRE DE COPIES DU GÉNOME MITOCHONDRIAL. NOUS AVONS RÉCEMMENT DÉVELOPPÉ UNE MÉTHODE APPELÉE SELFIE-DPCR QUI PERMET LA QUANTIFICATION EN NOMBRE ABSOLU DU NOMBRE DE TRANSCRIPTIONS MITOCHONDRIALES PAR RAPPORT À LEUR PROPRE CHAÎNE DE TRANSCRIPTION DANS L’ADNMT. DE PLUS, DANS NOS PROJETS PRÉCÉDENTS, NOUS AVONS CONSTATÉ QU’UNE DIMINUTION DE LA TENEUR EN ADNMT CIRCULANT DANS LE LIQUIDE CÉPHALO-RACHIDIEN (CSF) PRÉCÈDE LA MANIFESTATION DE LA MALADIE D’ALZHEIMER FAMILIALE, TANDIS QU’UNE AUGMENTATION DE LA TENEUR EN ADNMT DANS LE LCR EST ASSOCIÉE AU S DE PARKINSON CHEZ LES PATIENTS PRÉSENTANT DES MUTATIONS DANS LE GÈNE LRRK2. SUR LA BASE DE CES RÉSULTATS, NOUS PROPOSONS L’HYPOTHÈSE QUE LA MODIFICATION DE L’ÉQUILIBRE ENTRE LA RÉPLICATION ET LA DÉGRADATION DE L’ADNMT PAR LES SYSTÈMES DE CONTRÔLE DE LA QUALITÉ MITOCHONDRIAUX DÉTERMINE LE TYPE DE PROCESSUS NEURODÉGÉNÉRATIF. CEPENDANT, LES SYSTÈMES DE RÉGULATION DU NOMBRE D’EXEMPLAIRES ET DE L’EXPRESSION DE L’ADNMT NE SONT PAS ENCORE CONNUS EN PROFONDEUR. DANS CE PROJET, NOUS PROPOSONS D’ÉTUDIER LA RÉGULATION DE LA TRANSCRIPTION ET DE LA RÉPLICATION DE L’ADNMT DANS LES MODÈLES GÉNÉTIQUES DES MALADIES DE LA MALADIE D’ALZHEIMER ET DE PARKINSON. LES OBJECTIFS SPÉCIFIQUES SONT LES SUIVANTS: 1) ÉTUDIER L’INFLUENCE DES SYSTÈMES MITOCHONDRIAUX DE CONTRÔLE DE LA QUALITÉ SUR LA LIBÉRATION DE L’ADNMT DANS L’ESPACE EXTRACELLULAIRE, 2) MESURER LA RÉPLICATION ET LA TRANSCRIPTION DE L’ADNMT PAR SELFIE-DPCR DANS LES MODÈLES GÉNÉTIQUES ET 3) CARACTÉRISER LA CARTE DE TRANSCRIPTION GÉNIQUE DE LA VOIE DE SIGNALISATION NUCLÉAIRE-MYITOCHONDRIAL INDUITE PAR UNE MUTATION PATHOGÈNE DU GÈNE DE L’APPLICATION À L’AIDE DE LA MÉTHODE SELFIE COUPLÉE À UNE SÉQUENCE PARALLÈLE MASSIVE SUIVIE D’UNE VALIDATION PAR SELFIE-DPCR. LES RÉSULTATS NOUS PERMETTRONT DE COMPARER L’HYPOTHÈSE SELON LAQUELLE LA RÉGULATION DE L’ADN MITOCHONDRIAL EST UN MÉCANISME CLÉ DANS LE PROCESSUS NEURODÉGÉNÉRATIF ET QUE SA NORMALISATION PEUT PRÉVENIR LA NEURODÉGÉNÉRESCENCE. (French)
2 December 2021
0 references
NEURODEGENERATIVE ERKRANKUNGEN KÖNNEN UNTERSCHIEDLICHE URSACHEN HABEN, UND EINES DER HAUPTZIELE DER AKTUELLEN FORSCHUNG IST ES, EINEN ZENTRALEN GEMEINSAMEN BIOCHEMISCHEN MECHANISMUS ZU IDENTIFIZIEREN, IN DEM SIE AUFEINANDERTREFFEN. DIE MEISTEN URSACHEN NEURODEGENERATIVER ERKRANKUNGEN SIND NOCH UNBEKANNT, ABER GENETISCHE MUTATIONEN, DIE NEURODEGENERATION IN FAMILIEN ERZEUGEN, LIEFERN EIN ROBUSTES EXPERIMENTELLES MODELL, UM DIE ZENTRALEN BIOCHEMISCHEN MECHANISMEN DES NEURODEGENERATIVEN PROZESSES ZU IDENTIFIZIEREN. DIE HYPOTHESE DIESES PROJEKTS IST, DASS DIE ÄNDERUNG DER REGULATION DER MITOCHONDRIALEN DNA (MTDNA) EIN GEMEINSAMER ZENTRALER MECHANISMUS IN DER PATHOLOGISCHEN KETTE DES NEURODEGENERATIVEN PROZESSES IST. DIE STUDIE ZUR REPLIKATION UND TRANSKRIPTION VON MTDNA WURDE JEDOCH DURCH DIE SCHWIERIGKEIT BEGRENZT, DIE ANZAHL DER KOPIEN DES MITOCHONDRIALEN GENOMS PRÄZISE ZU MESSEN. WIR HABEN VOR KURZEM EINE METHODE NAMENS SELFIE-DPCR ENTWICKELT, DIE DIE QUANTIFIZIERUNG DER ANZAHL DER MITOCHONDRIALEN TRANSKRIPTE IN ABSOLUTEN ZAHLEN IN BEZUG AUF IHRE EIGENE TRANSKRIPTIONSKETTE IM MTDNA ERMÖGLICHT. DARÜBER HINAUS HABEN WIR IN UNSEREN FRÜHEREN PROJEKTEN FESTGESTELLT, DASS EINE ABNAHME DES ZIRKULIERENDEN MTDNA-GEHALTS IN ZEREBROSPINALER FLÜSSIGKEIT (CSF) DER MANIFESTATION DER ALZHEIMER-KRANKHEIT DER FAMILIE VORAUSGEHT, WÄHREND EINE ERHÖHUNG DES MTDNA-GEHALTS IM CSF MIT PARKINSON’S BEI PATIENTEN MIT MUTATIONEN IM LRRK2-GEN ASSOZIIERT WIRD. AUSGEHEND VON DIESEN ERGEBNISSEN SCHLAGEN WIR DIE HYPOTHESE VOR, DASS DIE VERÄNDERUNG DES GLEICHGEWICHTS ZWISCHEN REPLIKATION UND ABBAU VON MTDNA DURCH MITOCHONDRIALE QUALITÄTSKONTROLLSYSTEME DIE ART DES NEURODEGENERATIVEN PROZESSES BESTIMMT. DIE SYSTEME ZUR REGELUNG DER ANZAHL DER KOPIEN UND DES AUSDRUCKS DER MTDNA SIND JEDOCH NOCH NICHT IN DER TIEFE BEKANNT. IN DIESEM PROJEKT SCHLAGEN WIR VOR, DIE REGULIERUNG DER TRANSKRIPTION UND REPLIKATION VON MTDNA IN GENETISCHEN MODELLEN VON ALZHEIMER- UND PARKINSON-KRANKHEITEN ZU UNTERSUCHEN. ZU DEN SPEZIFISCHEN ZIELEN GEHÖREN: 1) DEN EINFLUSS VON MITOCHONDRIALEN QUALITÄTSKONTROLLSYSTEMEN AUF DIE FREISETZUNG VON MTDNA IM EXTRAZELLULÄREN RAUM ZU UNTERSUCHEN, 2) DIE REPLIKATION UND TRANSKRIPTION VON MTDNA DURCH SELFIE-DPCR IN GENETISCHEN MODELLEN ZU MESSEN UND 3) DIE GEN-TRANSKRIPTIONSKARTE DES KERN-MYITOCHONDRIAL-SIGNALWEGS ZU CHARAKTERISIEREN, DER DURCH EINE PATHOGENE MUTATION DES APP-GENS INDUZIERT WIRD, WOBEI DIE SELFIE-METHODE MIT MASSIVER PARALLELSEQUENZ VERBUNDEN IST, GEFOLGT VON DER VALIDIERUNG DURCH SELFIE-DPCR. DIE ERGEBNISSE WERDEN ES UNS ERMÖGLICHEN, DIE HYPOTHESE ZU KONTRASTIEREN, DASS DIE REGULATION DER MITOCHONDRIALEN DNA EIN SCHLÜSSELMECHANISMUS IM NEURODEGENERATIVEN PROZESS IST UND DASS SEINE NORMALISIERUNG DIE NEURODEGENERATION VERHINDERN KANN. (German)
9 December 2021
0 references
NEURODEGENERATIEVE ZIEKTEN KUNNEN VERSCHILLENDE OORZAKEN HEBBEN EN EEN VAN DE BELANGRIJKSTE DOELSTELLINGEN VAN HET HUIDIGE ONDERZOEK IS HET IDENTIFICEREN VAN EEN CENTRAAL GEMEENSCHAPPELIJK BIOCHEMISCH MECHANISME WAARIN ZE SAMENKOMEN. DE MEESTE OORZAKEN VAN NEURODEGENERATIEVE ZIEKTEN ZIJN NOG ONBEKEND, MAAR GENETISCHE MUTATIES DIE NEURODEGENERATIE IN FAMILIES PRODUCEREN, BIEDEN EEN ROBUUST EXPERIMENTEEL MODEL OM DE CENTRALE BIOCHEMISCHE MECHANISMEN VAN HET NEURODEGENERATIEVE PROCES TE IDENTIFICEREN. DE HYPOTHESE VAN DIT PROJECT IS DAT DE WIJZIGING VAN DE REGELING VAN MITOCHONDRIAAL DNA (MTDNA) EEN GEMEENSCHAPPELIJK CENTRAAL MECHANISME IS IN DE PATHOLOGISCHE KETEN VAN HET NEURODEGENERATIEVE PROCES. NOCHTANS, IS DE STUDIE VAN REPLICATIE EN TRANSCRIPTIE VAN MTDNA BEPERKT DOOR DE MOEILIJKHEID OM MET PRECISIE HET AANTAL KOPIEËN VAN MITOCHONDRIAAL GENOOM TE METEN. WIJ HEBBEN ONLANGS EEN METHODE ONTWIKKELD GENAAMD SELFIE-DPCR DIE DE KWANTIFICERING IN ABSOLUTE AANTALLEN VAN HET AANTAL MITOCHONDRIALE TRANSCRIPTIES IN RELATIE TOT HUN EIGEN TRANSCRIPTIEREEKS IN DE MTDNA TOESTAAT. DAARNAAST HEBBEN WE IN ONZE VORIGE PROJECTEN VASTGESTELD DAT EEN AFNAME VAN HET CIRCULERENDE MTDNA-GEHALTE IN CEREBROSPINALE VLOEISTOF (CSF) VOORAFGAAT AAN DE MANIFESTATIE VAN DE ZIEKTE VAN DE FAMILIE ALZHEIMER, TERWIJL EEN TOENAME VAN HET MTDNA-GEHALTE IN DE CSF IN VERBAND WORDT GEBRACHT MET PARKINSON’S BIJ PATIËNTEN MET MUTATIES IN HET LRRK2-GEN. OP BASIS VAN DEZE BOVENSTAANDE RESULTATEN, STELLEN WE DE HYPOTHESE VOOR DAT DE VERANDERING IN HET EVENWICHT TUSSEN REPLICATIE EN DEGRADATIE VAN MTDNA DOOR MITOCHONDRIALE KWALITEITSCONTROLESYSTEMEN HET TYPE NEURODEGENERATIEVE PROCES BEPAALT. ECHTER, DE SYSTEMEN VOOR HET REGULEREN VAN HET AANTAL KOPIEËN EN EXPRESSIE VAN DE MTDNA ZIJN NOG NIET BEKEND IN DE DIEPTE. IN DIT PROJECT STELLEN WE VOOR OM DE REGELING VAN TRANSCRIPTIE EN REPLICATIE VAN MTDNA IN GENETISCHE MODELLEN VAN DE ZIEKTE VAN ALZHEIMER EN PARKINSON TE ONDERZOEKEN. SPECIFIEKE DOELSTELLINGEN ZIJN ONDER MEER: 1) OM DE INVLOED VAN MITOCHONDRIALE KWALITEITSCONTROLESYSTEMEN OP DE RELEASE VAN MTDNA IN DE EXTRACELLULAIRE RUIMTE TE BESTUDEREN, 2) DE REPLICATIE EN TRANSCRIPTIE VAN MTDNA TE METEN DOOR SELFIE-DPCR IN GENETISCHE MODELLEN EN 3) DE GENIC TRANSCRIPTIEKAART VAN DE NUCLEAIRE-MYITOCHONDRIAL SIGNALERENDE ROUTE TE KARAKTERISEREN DIE WORDT GEÏNDUCEERD DOOR EEN PATHOGENE MUTATIE VAN HET APP-GEN MET BEHULP VAN DE SELFIE-METHODE GEKOPPELD AAN MASSALE PARALLELLE SEQUENTIE GEVOLGD DOOR VALIDATIE DOOR SELFIE-DPCR. DE RESULTATEN ZULLEN ONS IN STAAT STELLEN OM DE HYPOTHESE TE CONTRASTEREN DAT DE VERORDENING VAN MITOCHONDRIAAL DNA EEN BELANGRIJK MECHANISME IS IN HET NEURODEGENERATIEVE PROCES EN DAT DE NORMALISATIE ERVAN NEURODEGENERATIE KAN VOORKOMEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LE MALATTIE NEURODEGENERATIVE POSSONO AVERE CAUSE DIVERSE E UNO DEI PRINCIPALI OBIETTIVI DELLA RICERCA ATTUALE È INDIVIDUARE UN MECCANISMO BIOCHIMICO COMUNE CENTRALE IN CUI CONVERGONO. LA MAGGIOR PARTE DELLE CAUSE DELLE MALATTIE NEURODEGENERATIVE SONO ANCORA SCONOSCIUTE, MA LE MUTAZIONI GENETICHE CHE PRODUCONO NEURODEGENERAZIONE NELLE FAMIGLIE FORNISCONO UN SOLIDO MODELLO SPERIMENTALE PER IDENTIFICARE I MECCANISMI BIOCHIMICI CENTRALI DEL PROCESSO NEURODEGENERATIVO. L'IPOTESI DI QUESTO PROGETTO È CHE L'ALTERAZIONE DELLA REGOLAZIONE DEL DNA MITOCONDRIALE (MTDNA) SIA UN MECCANISMO CENTRALE COMUNE NELLA CATENA PATOLOGICA DEL PROCESSO NEURODEGENERATIVO. TUTTAVIA, LO STUDIO DELLA REPLICAZIONE E DELLA TRASCRIZIONE DEL MTDNA È STATO LIMITATO DALLA DIFFICOLTÀ DI MISURARE CON PRECISIONE IL NUMERO DI COPIE DEL GENOMA MITOCONDRIALE. ABBIAMO RECENTEMENTE SVILUPPATO UN METODO CHIAMATO SELFIE-DPCR CHE PERMETTE LA QUANTIFICAZIONE IN NUMERI ASSOLUTI DEL NUMERO DI TRASCRIZIONI MITOCONDRIALI IN RELAZIONE ALLA PROPRIA STRINGA DI TRASCRIZIONE NEL MTDNA. INOLTRE, NEI NOSTRI PRECEDENTI PROGETTI, ABBIAMO RISCONTRATO CHE UNA DIMINUZIONE DEL CONTENUTO DI MTDNA CIRCOLANTE NEL LIQUIDO CEREBROSPINALE (CSF) PRECEDE LA MANIFESTAZIONE DELLA MALATTIA DI ALZHEIMER DELLA FAMIGLIA, MENTRE UN AUMENTO DEL CONTENUTO DI MTDNA NEL LIQUIDO CEREBROSPINALE È ASSOCIATO A PARKINSON IN PAZIENTI CON MUTAZIONI NEL GENE LRRK2. SULLA BASE DI QUESTI RISULTATI, PROPONIAMO L'IPOTESI CHE IL CAMBIAMENTO NELL'EQUILIBRIO TRA REPLICAZIONE E DEGRADAZIONE DEL MTDNA DA PARTE DEI SISTEMI DI CONTROLLO DELLA QUALITÀ MITOCONDRIALE DETERMINI IL TIPO DI PROCESSO NEURODEGENERATIVO. TUTTAVIA, I SISTEMI PER REGOLARE IL NUMERO DI COPIE E L'ESPRESSIONE DEL MTDNA NON SONO ANCORA NOTI IN PROFONDITÀ. IN QUESTO PROGETTO PROPONIAMO DI INDAGARE LA REGOLAZIONE DELLA TRASCRIZIONE E DELLA REPLICA DEL MTDNA NEI MODELLI GENETICI DELLE MALATTIE DI ALZHEIMER E PARKINSON. TRA GLI OBIETTIVI SPECIFICI FIGURANO: 1) STUDIARE L'INFLUENZA DEI SISTEMI DI CONTROLLO DELLA QUALITÀ MITOCONDRIALE SUL RILASCIO DI MTDNA NELLO SPAZIO EXTRACELLULARE, 2) MISURARE LA REPLICAZIONE E LA TRASCRIZIONE DEL MTDNA TRAMITE SELFIE-DPCR NEI MODELLI GENETICI E 3) CARATTERIZZARE LA MAPPA DI TRASCRIZIONE GENETICA DELLA VIA DI SEGNALAZIONE NUCLEARE-MYITOCHONDRIAL INDOTTA DA UNA MUTAZIONE PATOGENA DEL GENE APP UTILIZZANDO IL METODO SELFIE ACCOPPIATO A UNA SEQUENZA PARALLELA MASSICCIA SEGUITA DALLA CONVALIDA DA SELFIE-DPCR. I RISULTATI CI PERMETTERANNO DI CONTRASTARE L'IPOTESI CHE LA REGOLAZIONE DEL DNA MITOCONDRIALE SIA UN MECCANISMO CHIAVE NEL PROCESSO NEURODEGENERATIVO E CHE LA SUA NORMALIZZAZIONE POSSA PREVENIRE LA NEURODEGENERAZIONE. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΈΣ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΈΧΟΥΝ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΑΙΤΊΕΣ ΚΑΙ ΈΝΑΣ ΑΠΌ ΤΟΥΣ ΚΎΡΙΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ ΤΗΣ ΤΡΈΧΟΥΣΑΣ ΈΡΕΥΝΑΣ ΕΊΝΑΙ Ο ΕΝΤΟΠΙΣΜΌΣ ΕΝΌΣ ΚΟΙΝΟΎ ΚΕΝΤΡΙΚΟΎ ΒΙΟΧΗΜΙΚΟΎ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎ ΣΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΣΥΓΚΛΊΝΟΥΝ. ΟΙ ΠΕΡΙΣΣΌΤΕΡΕΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΑΙΤΊΕΣ ΤΩΝ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΏΝ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ ΕΞΑΚΟΛΟΥΘΟΎΝ ΝΑ ΕΊΝΑΙ ΆΓΝΩΣΤΕΣ, ΑΛΛΆ ΟΙ ΓΕΝΕΤΙΚΈΣ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΠΟΥ ΠΑΡΆΓΟΥΝ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΜΌ ΣΤΙΣ ΟΙΚΟΓΈΝΕΙΕΣ ΠΑΡΈΧΟΥΝ ΈΝΑ ΙΣΧΥΡΌ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΌ ΜΟΝΤΈΛΟ ΓΙΑ ΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΤΩΝ ΚΕΝΤΡΙΚΏΝ ΒΙΟΧΗΜΙΚΏΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΤΗΣ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΉΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ. Η ΓΕΝΙΚΉ ΥΠΌΘΕΣΗ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ ΈΡΓΟΥ ΕΊΝΑΙ ΌΤΙ Η ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΜΈΝΗ ΡΎΘΜΙΣΗ ΤΟΥ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΟΎ DNA (MTDNA) ΕΊΝΑΙ ΈΝΑΣ ΚΟΙΝΌΣ ΚΕΝΤΡΙΚΌΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΣΤΗΝ ΠΑΘΟΛΟΓΙΚΉ ΑΛΥΣΊΔΑ ΤΗΣ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΉΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ. ΩΣΤΌΣΟ, Η ΜΕΛΈΤΗ ΤΗΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΉΣ ΚΑΙ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ MTDNA ΠΕΡΙΟΡΊΣΤΗΚΕ ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΔΥΣΚΟΛΊΑΣ ΤΗΣ ΑΚΡΙΒΟΎΣ ΜΈΤΡΗΣΗΣ ΤΟΥ ΑΡΙΘΜΟΎ ΤΩΝ ΑΝΤΙΓΡΆΦΩΝ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΟΎ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ. ΠΡΌΣΦΑΤΑ ΑΝΑΠΤΎΞΑΜΕ ΜΙΑ ΜΈΘΟΔΟ ΠΟΥ ΟΝΟΜΆΖΕΤΑΙ SELFIE-DPCR ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗΝ ΑΠΌΛΥΤΗ ΠΟΣΟΤΙΚΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ ΑΡΙΘΜΟΎ ΤΩΝ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΏΝ ΜΕΤΑΓΡΑΦΏΝ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΗ ΔΙΚΉ ΤΟΥΣ ΑΛΥΣΊΔΑ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ ΣΤΟ MTDNA. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΣΕ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΑ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΆ ΜΑΣ, ΔΙΑΠΙΣΤΏΣΑΜΕ ΌΤΙ Η ΜΕΊΩΣΗ ΤΗΣ ΠΕΡΙΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΣΕ MTDNA ΠΟΥ ΚΥΚΛΟΦΟΡΕΊ ΣΤΟ ΕΓΚΕΦΑΛΟΝΩΤΙΑΊΟ ΥΓΡΌ (CSF) ΠΡΟΗΓΕΊΤΑΙ ΤΗΣ ΕΚΔΉΛΩΣΗΣ ΤΗΣ ΟΙΚΟΓΕΝΕΙΑΚΉΣ ΝΌΣΟΥ ΤΟΥ ALZHEIMER, ΕΝΏ Η ΑΎΞΗΣΗ ΤΗΣ ΠΕΡΙΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΤΟΥ MTDNA ΣΕ CSF ΣΥΝΔΈΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΝΌΣΟ ΤΟΥ PARKINSON ΣΕ ΑΣΘΕΝΕΊΣ ΜΕ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΣΤΟ ΓΟΝΊΔΙΟ LRRK2. ΜΕ ΒΆΣΗ ΑΥΤΆ ΤΑ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ, ΥΠΟΘΈΤΟΥΜΕ ΌΤΙ Η ΜΕΤΑΒΟΛΉ ΤΗΣ ΙΣΟΡΡΟΠΊΑΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΗΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΉΣ MTDNA ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΠΟΔΌΜΗΣΗΣ ΑΠΌ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΆ ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΕΛΈΓΧΟΥ ΠΟΙΌΤΗΤΑΣ ΚΑΘΟΡΊΖΕΙ ΤΟΝ ΤΎΠΟ ΤΗΣ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΉΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ. ΩΣΤΌΣΟ, ΤΑ ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΟΝ ΑΡΙΘΜΌ ΤΩΝ ΑΝΤΙΓΡΆΦΩΝ MTDNA ΚΑΙ ΤΗ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉ ΤΟΥΣ ΔΕΝ ΕΊΝΑΙ ΑΚΌΜΗ ΓΝΩΣΤΆ. ΣΤΟ ΠΑΡΌΝ ΈΡΓΟ ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΝΑ ΔΙΕΡΕΥΝΗΘΕΊ Η ΡΎΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΉΣ MTDNA ΣΕ ΓΕΝΕΤΙΚΆ ΜΟΝΤΈΛΑ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ ΑΛΤΣΧΆΙΜΕΡ ΚΑΙ ΠΆΡΚΙΝΣΟΝ. ΟΙ ΕΙΔΙΚΟΊ ΣΤΌΧΟΙ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ: 1) ΝΑ ΜΕΛΕΤΉΣΕΙ ΤΗΝ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΩΝ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΏΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ ΠΟΙΟΤΙΚΟΎ ΕΛΈΓΧΟΥ ΣΤΗΝ ΑΠΕΛΕΥΘΈΡΩΣΗ ΤΟΥ MTDNA ΣΤΟΝ ΕΞΩΚΥΤΤΑΡΙΚΌ ΧΏΡΟ, 2) ΝΑ ΜΕΤΡΉΣΕΙ ΤΗΝ ΑΝΤΙΓΡΑΦΉ ΚΑΙ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉ ΤΟΥ MTDNA ΑΠΌ SELFIE-DPCR ΣΕ ΓΕΝΕΤΙΚΆ ΜΟΝΤΈΛΑ, ΚΑΙ 3) ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΕΙ ΤΟ ΧΆΡΤΗ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΤΟΥ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΟΎ ΠΥΡΗΝΙΚΟΎ ANTEROGRADE ΠΟΡΕΊΑΣ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ ΠΑΘΟΓΌΝΟ ΓΟΝΙΔΙΑΚΉ ΜΕΤΆΛΛΑΞΗ ΕΦΑΡΜΟΓΉΣ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΜΈΘΟΔΟ SELFIE ΣΕ ΣΥΝΔΥΑΣΜΌ ΜΕ ΜΑΖΙΚΉ ΠΑΡΆΛΛΗΛΗ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΑΚΟΛΟΥΘΟΎΜΕΝΗ ΑΠΌ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΜΕ SELFIE-DPCR. ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΘΑ ΜΑΣ ΕΠΙΤΡΈΨΟΥΝ ΝΑ ΑΝΤΙΠΑΡΑΒΆΛΟΥΜΕ ΤΗΝ ΥΠΌΘΕΣΗ ΌΤΙ Η ΡΎΘΜΙΣΗ ΤΟΥ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΟΎ DNA ΕΊΝΑΙ ΈΝΑΣ ΒΑΣΙΚΌΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΣΤΗ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΉ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΚΑΙ ΌΤΙ Η ΟΜΑΛΟΠΟΊΗΣΉ ΤΟΥ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΑΠΟΤΡΈΨΕΙ ΤΗ ΝΕΥΡΟΕΚΦΎΛΙΣΗ. (Greek)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERATIVE SYGDOMME KAN HAVE FORSKELLIGE ÅRSAGER, OG ET AF HOVEDFORMÅLENE MED DEN NUVÆRENDE FORSKNING ER AT IDENTIFICERE EN FÆLLES CENTRAL BIOKEMISK MEKANISME, SOM DE KONVERGERER OM. DE FLESTE AF ÅRSAGERNE TIL NEURODEGENERATIVE SYGDOMME ER STADIG UKENDTE, MEN GENETISKE MUTATIONER, DER PRODUCERER NEURODEGENERATION I FAMILIER, GIVER EN ROBUST EKSPERIMENTEL MODEL TIL AT IDENTIFICERE DE CENTRALE BIOKEMISKE MEKANISMER I DEN NEURODEGENERATIVE PROCES. DEN GENERELLE HYPOTESE FOR DETTE PROJEKT ER, AT ÆNDRET REGULERING AF MITOKONDRISK DNA (MTDNA) ER EN FÆLLES CENTRAL MEKANISME I DEN PATOLOGISKE KÆDE AF NEURODEGENERATIVE PROCESSER. UNDERSØGELSEN AF MTDNA-REPLIKATION OG TRANSSKRIPTION ER IMIDLERTID BLEVET BEGRÆNSET AF VANSKELIGHEDEN VED NØJAGTIGT AT MÅLE ANTALLET AF MITOKONDRIEGENOMKOPIER. VI HAR FOR NYLIG UDVIKLET EN METODE KALDET SELFIE-DPCR, DER TILLADER ABSOLUT KVANTIFICERING AF ANTALLET AF MITOKONDRISKE UDSKRIFTER I FORHOLD TIL DERES EGEN TRANSSKRIPTIONSKÆDE I MTDNA. DESUDEN HAR VI I VORES TIDLIGERE PROJEKTER FUNDET, AT ET FALD I CIRKULERENDE MTDNA-INDHOLD I CEREBROSPINALVÆSKE (CSF) GÅR FORUD FOR MANIFESTATIONEN AF FAMILIÆR ALZHEIMERS SYGDOM, MENS EN STIGNING I CSF-INDHOLDET I MTDNA ER FORBUNDET MED PARKINSONS SYGDOM HOS PATIENTER MED MUTATIONER I LRRK2-GENET. PÅ GRUNDLAG AF DISSE TIDLIGERE RESULTATER ANTAGER VI, AT ÆNDRINGEN I BALANCEN MELLEM MTDNA-REPLIKATION OG NEDBRYDNING VED MITOKONDRIE KVALITETSKONTROLSYSTEMER BESTEMMER TYPEN AF NEURODEGENERATIV PROCES. IKKE DESTO MINDRE ER DE SYSTEMER, DER REGULERER ANTALLET AF MTDNA-KOPIER OG DERES TRANSSKRIPTION, ENDNU IKKE VELKENDTE. I DETTE PROJEKT FORESLÅR VI AT UNDERSØGE REGULERINGEN AF TRANSSKRIPTION OG MTDNA-REPLIKATION I GENETISKE MODELLER AF ALZHEIMERS OG PARKINSONS SYGDOMME. BLANDT DE SPECIFIKKE MÅL KAN NÆVNES: 1) AT UNDERSØGE VIRKNINGEN AF MITOKONDRIE KVALITETSSTYRINGSSYSTEMER PÅ FRIGIVELSEN AF MTDNA I DET EKSTRACELLULÆRE RUM, 2) AT MÅLE REPLIKERING OG TRANSSKRIPTION AF MTDNA VED SELFIE-DPCR I GENETISKE MODELLER, OG 3) AT KARAKTERISERE GENTRANSSKRIPTION KORTET OVER MITOKONDRIE NUKLEARE ANTEROGRAD SIGNALERINGSVEJ FREMKALDT AF EN PATOGEN APP GENMUTATION VED HJÆLP AF SELFIE-METODE KOMBINERET MED MASSIV PARALLEL SEKVENTERING EFTERFULGT AF VALIDERING MED SELFIE-DPCR. RESULTATERNE VIL GIVE OS MULIGHED FOR AT KONTRASTERE HYPOTESEN OM, AT REGULERING AF MITOKONDRISK DNA ER EN CENTRAL MEKANISME I DEN NEURODEGENERATIVE PROCES, OG AT DENS NORMALISERING KAN FORHINDRE NEURODEGENERATION. (Danish)
17 August 2022
0 references
HERMOSTON RAPPEUTUMISSAIRAUKSILLA VOI OLLA ERILAISIA SYITÄ, JA YKSI NYKYISEN TUTKIMUKSEN PÄÄTAVOITTEISTA ON MÄÄRITTÄÄ YHTEINEN KESKEINEN BIOKEMIALLINEN MEKANISMI, JOHON NE LÄHENTYVÄT. USEIMMAT HERMOSTON RAPPEUTUMISSAIRAUKSIEN SYYT OVAT EDELLEEN TUNTEMATTOMIA, MUTTA PERHEIDEN NEURODEGENERAATIOTA TUOTTAVAT GENEETTISET MUTAATIOT TARJOAVAT VANKAN KOKEELLISEN MALLIN NEURODEGENERATIIVISEN PROSESSIN KESKEISTEN BIOKEMIALLISTEN MEKANISMIEN TUNNISTAMISEKSI. TÄMÄN HANKKEEN YLEINEN HYPOTEESI ON, ETTÄ MITOKONDRIAALISEN DNA:N (MTDNA) SÄÄNTELYN MUUTTAMINEN ON YHTEINEN KESKUSMEKANISMI HERMOSTON RAPPEUTUMISPROSESSIN PATOLOGISESSA KETJUSSA. MTDNA-REPLIKAATIO- JA TRANSKRIPTIOTUTKIMUSTA ON KUITENKIN RAJOITETTU, KOSKA MITOKONDRIOIDEN GENOMIN KOPIOIDEN MÄÄRÄÄ ON VAIKEA MITATA TARKASTI. OLEMME ÄSKETTÄIN KEHITTÄNEET MENETELMÄN NIMELTÄ SELFIE-DPCR, JOKA MAHDOLLISTAA MTDNA: N MITOKONDRIOIDEN MÄÄRÄN ABSOLUUTTISEN KVANTIFIOINNIN SUHTEESSA OMAAN TRANSKRIPTIOKETJUUNSA. LISÄKSI AIEMMISSA PROJEKTEISSAMME OLEMME HAVAINNEET, ETTÄ AIVO-SELKÄYDINNESTEEN (CSF) KIERTÄVÄN MTDNA-PITOISUUDEN VÄHENEMINEN EDELTÄÄ FAMILIAALISEN ALZHEIMERIN TAUDIN ILMENEMISTÄ, KUN TAAS MTDNA: N CSF-PITOISUUDEN KASVU LIITTYY PARKINSONIN TAUTIIN POTILAILLA, JOILLA ON LRRK2-GEENIN MUTAATIOITA. NÄIDEN AIEMPIEN TULOSTEN PERUSTEELLA OLETAMME, ETTÄ MTDNA-REPLIKOINNIN JA MITOKONDRIOIDEN LAADUNVALVONTAJÄRJESTELMIEN HAJOAMISEN VÄLISEN TASAPAINON MUUTOS MÄÄRITTÄÄ NEURODEGENERATIIVISEN PROSESSIN TYYPIN. KUITENKIN JÄRJESTELMÄT, JOTKA SÄÄTELEVÄT MTDNA-KOPIOIDEN MÄÄRÄÄ JA NIIDEN TRANSKRIPTIOTA, EIVÄT OLE VIELÄ HYVIN TIEDOSSA. TÄSSÄ HANKKEESSA EHDOTAMME, ETTÄ TUTKITAAN ALZHEIMERIN JA PARKINSONIN TAUDIN GENEETTISTEN MALLIEN TRANSKRIPTIOTA JA MTDNA-REPLIKAATIOTA KOSKEVAA ASETUSTA. ERITYISTAVOITTEITA OVAT MUUN MUASSA SEURAAVAT: 1) TUTKIA MITOKONDRIOIDEN LAADUNVALVONTAJÄRJESTELMIEN VAIKUTUSTA MTDNA:N VAPAUTUMISEEN SOLUNULKOISESSA AVARUUDESSA, 2) MITATA MTDNA:N REPLIKAATIOTA JA TRANSKRIPTIOTA SELFIE-DPCR:LLÄ GENEETTISISSÄ MALLEISSA JA 3) LUONNEHTIA MITOKONDRIAALISEN YDINANTEROGRADIN SIGNAALIREITTIÄ KOSKEVAA GEENITRANSKRIPTIOKARTTAA, JOHON LIITTYY PATOGEENISEN SOVELLUKSEN GEENIMUTAATIO, JOSSA KÄYTETÄÄN SELFIE-MENETELMÄÄ YHDISTETTYNÄ MASSIIVISEEN RINNAKKAISSEKVENSOINTIIN, JOTA SEURAA VALIDOINTI SELFIE-DPCR:LLÄ. TULOKSET ANTAVAT MEILLE MAHDOLLISUUDEN VERRATA OLETTAMUSTA, ETTÄ MITOKONDRIOIDEN DNA: N SÄÄTELY ON KESKEINEN MEKANISMI HERMOSTON RAPPEUTUMISPROSESSISSA JA ETTÄ SEN NORMALISOINTI VOI ESTÄÄ NEURODEGENERAATIOTA. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-MARD NEWRODEĠENERATTIV JISTA’ JKOLLU KAWŻI DIFFERENTI U WIEĦED MILL-GĦANIJIET EWLENIN TAR-RIĊERKA ATTWALI HUWA LI JIĠI IDENTIFIKAT MEKKANIŻMU BIJOKIMIKU ĊENTRALI KOMUNI LI JIKKONVERĠI FUQU. ĦAFNA MILL-KAWŻI TAL-MARD NEWRODEĠENERATTIV GĦADHOM MHUX MAGĦRUFA, IŻDA MUTAZZJONIJIET ĠENETIĊI LI JIPPRODUĊU NEWRODEĠENERAZZJONI FIL-FAMILJI JIPPROVDU MUDELL SPERIMENTALI ROBUST BIEX JIĠU IDENTIFIKATI L-MEKKANIŻMI BIJOKIMIĊI ĊENTRALI TAL-PROĊESS NEWRODEĠENERATTIV. L-IPOTEŻI ĠENERALI TAL-PROĠETT PREŻENTI HIJA LI R-REGOLAMENT MIBDUL TAD-DNA MITOKONDRIJALI (MTDNA) HUWA MEKKANIŻMU ĊENTRALI KOMUNI FIL-KATINA PATOLOĠIKA TAL-PROĊESS NEWRODEĠENERATTIV. MADANKOLLU, L-ISTUDJU TAR-REPLIKAZZJONI U T-TRASKRIZZJONI TA’ MTDNA ĠIE LIMITAT MINĦABBA D-DIFFIKULTÀ LI JITKEJJEL B’MOD PREĊIŻ IN-NUMRU TA’ KOPJI TAL-ĠENOMA MITOKONDRIJALI. DAN L-AĦĦAR ŻVILUPPAJNA METODU MSEJJAĦ SELFIE-DPCR LI JIPPERMETTI KWANTIFIKAZZJONI ASSOLUTA TAN-NUMRU TA’ TRASKRIZZJONIJIET MITOKONDRIJALI RELATTIVI GĦALL-KATINA TAT-TRASKRIZZJONI TAGĦHOM STESS FL-MTDNA. BARRA MINN HEKK, FIL-PROĠETTI PREĊEDENTI TAGĦNA, SIBNA LI TNAQQIS FIL-KONTENUT TA’ MTDNA FIĊ-ĊIRKOLAZZJONI FIL-FLUWIDU ĊEREBROSPINALI (CSF) JIPPREĊEDI L-MANIFESTAZZJONI TAL-MARDA FAMILJALI TA’ ALZHEIMER, FILWAQT LI ŻIEDA FIL-KONTENUT TA’ MTDNA FIS-CSF HIJA ASSOĊJATA MAL-MARDA TA’ PARKINSON F’PAZJENTI B’MUTAZZJONIJIET FIL-ĠENE LRRK2. FUQ IL-BAŻI TA’ DAWN IR-RIŻULTATI PREĊEDENTI, AĦNA NISSOPONU LI L-ALTERAZZJONI FIL-BILANĊ BEJN IR-REPLIKAZZJONI U D-DEGRADAZZJONI TAL-MTDNA PERMEZZ TA’ SISTEMI TA’ KONTROLL TAL-KWALITÀ MITOKONDRIJALI TIDDETERMINA T-TIP TA’ PROĊESS NEWRODEĠENERATTIV. MADANKOLLU, IS-SISTEMI LI JIRREGOLAW IN-NUMRU TA’ KOPJI MTDNA U T-TRASKRIZZJONI TAGĦHOM GĦADHOM MHUMIEX MAGĦRUFA SEW. F’DAN IL-PROĠETT QED NIPPROPONU LI NINVESTIGAW IR-REGOLAMENT TAT-TRASKRIZZJONI U R-REPLIKAZZJONI TAL-MTDNA F’MUDELLI ĠENETIĊI TAL-MARDA TA’ ALZHEIMER’S U PARKINSON’S. L-GĦANIJIET SPEĊIFIĊI JINKLUDU: 1) BIEX TIĠI STUDJATA L-INFLUWENZA TA’ SISTEMI TA’ KONTROLL TAL-KWALITÀ MITOKONDRIJALI FUQ IR-RILAXX TA’ MTDNA FL-ISPAZJU EKSTRAĊELLULARI, 2) BIEX TITKEJJEL IR-REPLIKAZZJONI U T-TRASKRIZZJONI TA’ MTDNA PERMEZZ TA’ SELFIE-DPCR F’MUDELLI ĠENETIĊI, U 3) BIEX TIĠI KKARATTERIZZATA L-MAPPA TAT-TRASKRIZZJONI TAL-ĠENE TAL-PASSAĠĠ TA’ SINJALAR ANTEROGRAD NUKLEARI MITOKONDRIJALI EVOKAT MINN MUTAZZJONI TA’ ĠENE PATOĠENIKU TA’ APP BL-UŻU TA’ METODU SELFIE AKKOPPJAT MA’ SEKWENZAR PARALLEL MASSIV SEGWIT MINN VALIDAZZJONI B’AWTO-DPCR. IR-RIŻULTATI SE JIPPERMETTULNA NIKKUNTRASTAW L-IPOTEŻI LI R-REGOLAMENT TAD-DNA MITOKONDRIJALI HUWA MEKKANIŻMU EWLIENI FIL-PROĊESS NEWRODEĠENERATTIV U LI N-NORMALIZZAZZJONI TIEGĦU TISTA’ TIPPREVJENI N-NEWRODEĠENERAZZJONI. (Maltese)
17 August 2022
0 references
NEIRODEĢENERATĪVĀM SLIMĪBĀM VAR BŪT DAŽĀDI CĒLOŅI, UN VIENS NO GALVENAJIEM PAŠREIZĒJO PĒTĪJUMU MĒRĶIEM IR NOTEIKT KOPĒJU CENTRĀLO BIOĶĪMISKO MEHĀNISMU, KURĀ TĀS SAPLŪST. LIELĀKĀ DAĻA NEIRODEĢENERATĪVO SLIMĪBU CĒLOŅU JOPROJĀM NAV ZINĀMA, BET ĢENĒTISKĀS MUTĀCIJAS, KAS IZRAISA NEIRODEĢENERĀCIJU ĢIMENĒS, NODROŠINA STABILU EKSPERIMENTĀLU MODELI, LAI IDENTIFICĒTU NEIRODEĢENERATĪVĀ PROCESA CENTRĀLOS BIOĶĪMISKOS MEHĀNISMUS. ŠĀ PROJEKTA VISPĀRĒJĀ HIPOTĒZE IR TĀDA, KA MITOHONDRIJU DNS (MTDNS) REGULĒŠANA IR KOPĪGS CENTRĀLAIS MEHĀNISMS NEIRODEĢENERATĪVĀ PROCESA PATOLOĢISKAJĀ ĶĒDĒ. TOMĒR MTDNS REPLIKĀCIJAS UN TRANSKRIPCIJAS PĒTĪJUMU IEROBEŽOJA GRŪTĪBAS PRECĪZI IZMĒRĪT MITOHONDRIJU GENOMA KOPIJU SKAITU. MĒS NESEN ESAM IZSTRĀDĀJUŠI METODI, KO SAUC PAR SELFIE-DPCR, KAS ĻAUJ ABSOLŪTI KVANTITATĪVI NOTEIKT MITOHONDRIJU TRANSKRIPTU SKAITU ATTIECĪBĀ PRET VIŅU PAŠU TRANSKRIPCIJAS ĶĒDI MTDNS. TURKLĀT MŪSU IEPRIEKŠĒJOS PROJEKTOS MĒS ESAM KONSTATĒJUŠI, KA CIRKULĒJOŠĀ MTDNS SATURA SAMAZINĀŠANĀS CEREBROSPINĀLAJĀ ŠĶIDRUMĀ (CSF) PIRMS ĢIMENES ALCHEIMERA SLIMĪBAS IZPAUSMES, SAVUKĀRT CSŠ SATURA PALIELINĀŠANĀS MTDNS IR SAISTĪTA AR PARKINSONA SLIMĪBU PACIENTIEM AR MUTĀCIJĀM LRRK2 GĒNĀ. PAMATOJOTIES UZ ŠIEM IEPRIEKŠĒJIEM REZULTĀTIEM, MĒS HIPOTĒZĒ, KA IZMAIŅAS BALANSĀ STARP MTDNS REPLIKĀCIJU UN DEGRADĀCIJU AR MITOHONDRIJU KVALITĀTES KONTROLES SISTĒMĀM NOSAKA NEIRODEĢENERATĪVĀ PROCESA VEIDU. TOMĒR SISTĒMAS, KAS REGULĒ MTDNS KOPIJU SKAITU UN TO TRANSKRIPCIJU, VĒL NAV LABI ZINĀMAS. ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS IEROSINĀM IZPĒTĪT TRANSKRIPCIJAS UN MTDNS REPLIKĀCIJAS REGULĒJUMU ALCHEIMERA UN PARKINSONA SLIMĪBU ĢENĒTISKAJOS MODEĻOS. KONKRĒTIE MĒRĶI IR ŠĀDI: 1) PĒTĪT MITOHONDRIJU KVALITĀTES KONTROLES SISTĒMU IETEKMI UZ MTDNS IZDALĪŠANOS EKSTRACELULĀRAJĀ TELPĀ, 2) IZMĒRĪT MTDNS REPLIKĀCIJU UN TRANSKRIPCIJU AR SELFIE-DPCR ĢENĒTISKAJOS MODEĻOS UN 3) RAKSTUROT MITOHONDRIJU KODOLA ANTEROGRADAS SIGNALIZĀCIJAS CEĻA GĒNU TRANSKRIPCIJAS KARTI, KO IZRAISA PATOGĒNA LIETOTNE GĒNU MUTĀCIJA, IZMANTOJOT SELFIE METODI, KAS SAISTĪTA AR MASVEIDA PARALĒLO SEKVENCĒŠANU, KAM SEKO VALIDĀCIJA AR SELFIE-DPCR. REZULTĀTI ĻAUS MUMS KONTRASTĒT HIPOTĒZI, KA MITOHONDRIJU DNS REGULĒŠANA IR GALVENAIS MEHĀNISMS NEIRODEĢENERATĪVAJĀ PROCESĀ UN KA TĀ NORMALIZĒŠANA VAR NOVĒRST NEIRODEĢENERĀCIJU. (Latvian)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERATÍVNE OCHORENIA MÔŽU MAŤ RÔZNE PRÍČINY A JEDNÝM Z HLAVNÝCH CIEĽOV SÚČASNÉHO VÝSKUMU JE IDENTIFIKOVAŤ SPOLOČNÝ CENTRÁLNY BIOCHEMICKÝ MECHANIZMUS, NA KTOROM SA ZBLIŽUJÚ. VÄČŠINA PRÍČIN NEURODEGENERATÍVNYCH OCHORENÍ JE STÁLE NEZNÁMA, ALE GENETICKÉ MUTÁCIE, KTORÉ PRODUKUJÚ NEURODEGENERÁCIU V RODINÁCH, POSKYTUJÚ ROBUSTNÝ EXPERIMENTÁLNY MODEL NA IDENTIFIKÁCIU CENTRÁLNYCH BIOCHEMICKÝCH MECHANIZMOV NEURODEGENERATÍVNEHO PROCESU. VŠEOBECNÁ HYPOTÉZA SÚČASNÉHO PROJEKTU SPOČÍVA V TOM, ŽE ZMENA REGULÁCIE MITOCHONDRIÁLNEJ DNA (MTDNA) JE SPOLOČNÝM ÚSTREDNÝM MECHANIZMOM V PATOLOGICKOM REŤAZCI NEURODEGENERATÍVNEHO PROCESU. ŠTÚDIA REPLIKÁCIE A TRANSKRIPCIE MTDNA VŠAK BOLA OBMEDZENÁ ŤAŽKOSŤAMI S PRESNÝM MERANÍM POČTU KÓPIÍ MITOCHONDRIÁLNEHO GENÓMU. NEDÁVNO SME VYVINULI METÓDU NAZÝVANÚ SELFIE-DPCR, KTORÁ UMOŽŇUJE ABSOLÚTNU KVANTIFIKÁCIU POČTU MITOCHONDRIÁLNYCH PREPISOV VO VZŤAHU K ICH VLASTNÉMU TRANSKRIPČNÉMU REŤAZCU V MTDNA. OKREM TOHO V NAŠICH PREDCHÁDZAJÚCICH PROJEKTOCH SME ZISTILI, ŽE ZNÍŽENIE OBSAHU CIRKULUJÚCEHO MTDNA V MOZGOVOMIECHOVOM MOKU (CSF) PREDCHÁDZA PREJAVOM RODINNEJ ALZHEIMEROVEJ CHOROBY, ZATIAĽ ČO ZVÝŠENIE OBSAHU MTDNA V CSF JE SPOJENÉ S PARKINSONOVOU CHOROBOU U PACIENTOV S MUTÁCIAMI V GÉNE LRRK2. NA ZÁKLADE TÝCHTO PREDCHÁDZAJÚCICH VÝSLEDKOV PREDPOKLADÁME, ŽE ZMENA ROVNOVÁHY MEDZI REPLIKÁCIOU MTDNA A DEGRADÁCIOU MITOCHONDRIÁLNYMI SYSTÉMAMI KONTROLY KVALITY URČUJE TYP NEURODEGENERATÍVNEHO PROCESU. SYSTÉMY, KTORÉ REGULUJÚ POČET KÓPIÍ MTDNA A ICH PREPIS, VŠAK EŠTE NIE SÚ DOBRE ZNÁME. V TOMTO PROJEKTE NAVRHUJEME PRESKÚMAŤ NARIADENIE TRANSKRIPCIE A REPLIKÁCIE MTDNA V GENETICKÝCH MODELOCH ALZHEIMEROVEJ A PARKINSONOVEJ CHOROBY. KONKRÉTNE CIELE ZAHŔŇAJÚ: 1) ŠTUDOVAŤ VPLYV MITOCHONDRIÁLNYCH SYSTÉMOV KONTROLY KVALITY NA UVOĽŇOVANIE MTDNA V EXTRACELULÁRNOM PRIESTORE, 2) MERAŤ REPLIKÁCIU A TRANSKRIPCIU MTDNA SELFIE-DPCR V GENETICKÝCH MODELOCH A 3) CHARAKTERIZOVAŤ MAPU GÉNOVEJ TRANSKRIPCIE MITOCHONDRIÁLNEJ JADROVEJ PREDROGRADE SIGNALIZAČNEJ DRÁHY VYVOLANEJ PATOGÉNNOU MUTÁCIOU GÉNU APLIKÁCIE POMOCOU SELFIE METÓDY SPOJENEJ S MASÍVNYM PARALELNÝM SEKVENCOVANÍM, PO KTOROM NASLEDUJE VALIDÁCIA POMOCOU SELFIE-DPCR. VÝSLEDKY NÁM UMOŽNIA POROVNAŤ HYPOTÉZU, ŽE REGULÁCIA MITOCHONDRIÁLNEJ DNA JE KĽÚČOVÝM MECHANIZMOM V NEURODEGENERATÍVNOM PROCESE A ŽE JEJ NORMALIZÁCIA MÔŽE ZABRÁNIŤ NEURODEGENERÁCII. (Slovak)
17 August 2022
0 references
D’FHÉADFADH CÚISEANNA ÉAGSÚLA A BHEITH AG GALAIR NÉARMHEATHLÚCHÁIN AGUS TÁ SÉ AR CHEANN DE PHRÍOMHCHUSPÓIRÍ AN TAIGHDE REATHA MEICNÍOCHT CHOITEANN BITHCHEIMICEACH LÁRNACH A SHAINAITHINT AR A DTAGANN SIAD LE CHÉILE. NÍL AN CHUID IS MÓ DE NA CÚISEANNA A BHAINEANN LE GALAIR NÉARMHEATHLÚCHÁIN FÓS AR EOLAS, ACH SOLÁTHRAÍONN SÓCHÁIN GHÉINITEACHA A THÁIRGEANN NÉARGHINIÚINT I DTEAGHLAIGH SAMHAIL THURGNAMHACH LÁIDIR CHUN MEICNÍOCHTAÍ LÁRNACHA BITHCHEIMICEACHA AN PHRÓISIS NÉARMHEATHLÚCHÁIN A AITHINT. IS É HIPITÉIS GHINEARÁLTA AN TIONSCADAIL ATÁ ANN FAOI LÁTHAIR NÁ GUR MEICNÍOCHT LÁRNACH CHOITEANN I SLABHRA PAITEOLAÍOCH AN PHRÓISIS NÉARMHEATHLÚCHÁIN É AN RIALACHÁN MAIDIR LE DNA MITOCHONDRIALACH (MTDNA) A ATHRÚ. MAR SIN FÉIN, TÁ AN STAIDÉAR AR MHACASAMHLÚ MTDNA AGUS AN TRAS-SCRÍOBH TEORANTA AG AN DEACRACHT A BHAINEANN LE LÍON NA GCÓIPEANNA GENOME MITOCHONDRIAL A THOMHAS GO CRUINN. TÁ MODH AR A DTUGTAR SELFIE-DPCR FORBARTHA AGAINN LE DÉANAÍ A CHEADAÍONN CAINNÍOCHTÚ IOMLÁN AR LÍON NA DTRAS-SCRÍBHINNÍ MITOCHONDRIALACHA I NDÁIL LENA SLABHRA TRAS-SCRÍOFA FÉIN SA MTDNA. INA THEANNTA SIN, INÁR DTIONSCADAIL NÍOS LUAITHE, FUAIREAMAR AMACH GO DTAGANN LAGHDÚ AR ÁBHAR MTDNA A SCAIPTEAR I SREABHACH CEREBROSPINAL (CSF) ROIMH GHALAR ALZHEIMER FAMILIAL A LÉIRIÚ, AGUS BAINEANN MÉADÚ AR ÁBHAR CSF MTDNA LE GALAR PARKINSON IN OTHAIR A BHFUIL SÓCHÁIN ACU SA GHÉINE LRRK2. BUNAITHE AR NA TORTHAÍ ROIMHE SEO, TÁIMID HYPOTHESIZE GO ATHRÚ AR AN GCOTHROMAÍOCHT IDIR MACASAMHLÚ MTDNA AGUS DÍGHRÁDÚ AG CÓRAIS RIALAITHE CÁILÍOCHTA MITOCHONDRIAL CINNEANN AN CINEÁL PRÓISEAS NEURODEGENERATIVE. MAR SIN FÉIN, NÍL EOLAS MAITH AR NA CÓRAIS A RIALAÍONN LÍON NA GCÓIPEANNA MTDNA AGUS A DTRAS-SCRÍOBH GO FÓILL. SA TIONSCADAL REATHA, MOLAIMID IMSCRÚDÚ A DHÉANAMH AR AN RIALACHÁN MAIDIR LE TRAS-SCRÍOBH AGUS MACASAMHLÚ MTDNA I SAMHLACHA GÉINITEACHA GALAR ALZHEIMER’S AGUS PARKINSON’S. I MEASC NA GCUSPÓIRÍ SONRACHA TÁ: 1) STAIDÉAR A DHÉANAMH AR THIONCHAR NA GCÓRAS RIALAITHE CÁILÍOCHTA MITOCHONDRIALACH AR SCAOILEADH MTDNA SA SPÁS EXTRACELLULAR, 2) MACASAMHLÚ AGUS TRAS-SCRÍOBH MTDNA A THOMHAS AG SELFIE-DPCR I SAMHLACHA GÉINITEACHA, AGUS 3) CHUN TRÉITHRIÚ A DHÉANAMH AR LÉARSCÁIL TRAS-SCRÍOFA GÉINE AN CHONAIR COMHARTHAÍOCHTA RÉAMHGHRÁDÚ NÚICLÉACH MITOCHONDRIAL EVOKED AG AIP PATAIGINEACH SÓCHÁN GÉINE AG BAINT ÚSÁIDE AS MODH SELFIE I DTEANNTA LE SEICHEAMHÚ OLLMHÓR COMHTHREOMHAR AGUS BAILÍOCHTÚ LE SELFIE-DPCR. LIGFIDH NA TORTHAÍ DÚINN CODARSNACHT A DHÉANAMH AR AN HIPITÉIS GUR PRÍOMHSHÁSRA SA PHRÓISEAS NÉARMHEATHLÚCHÁIN É AN DNA MITOCHONDRIAL A RIALÁIL AGUS GO BHFÉADFADH A NORMALÚ COSC A CHUR AR NÉARGHINIÚINT. (Irish)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERATIVNÍ ONEMOCNĚNÍ MOHOU MÍT RŮZNÉ PŘÍČINY A JEDNÍM Z HLAVNÍCH CÍLŮ SOUČASNÉHO VÝZKUMU JE URČIT SPOLEČNÝ CENTRÁLNÍ BIOCHEMICKÝ MECHANISMUS, NA KTERÉM SE SBLIŽUJÍ. VĚTŠINA PŘÍČIN NEURODEGENERATIVNÍCH ONEMOCNĚNÍ JE STÁLE NEZNÁMÁ, ALE GENETICKÉ MUTACE, KTERÉ VYTVÁŘEJÍ NEURODEGENERACI V RODINÁCH, POSKYTUJÍ ROBUSTNÍ EXPERIMENTÁLNÍ MODEL PRO IDENTIFIKACI CENTRÁLNÍCH BIOCHEMICKÝCH MECHANISMŮ NEURODEGENERATIVNÍHO PROCESU. OBECNÁ HYPOTÉZA SOUČASNÉHO PROJEKTU JE TAKOVÁ, ŽE POZMĚNĚNÁ REGULACE MITOCHONDRIÁLNÍ DNA (MTDNA) JE SPOLEČNÝM CENTRÁLNÍM MECHANISMEM V PATOLOGICKÉM ŘETĚZCI NEURODEGENERATIVNÍHO PROCESU. STUDIE REPLIKACE A TRANSKRIPCE MTDNA BYLA VŠAK OMEZENA OBTÍŽNOSTÍ PŘESNÉHO MĚŘENÍ POČTU MITOCHONDRIÁLNÍCH KOPIÍ GENOMU. NEDÁVNO JSME VYVINULI METODU ZVANOU SELFIE-DPCR, KTERÁ UMOŽŇUJE ABSOLUTNÍ KVANTIFIKACI POČTU MITOCHONDRIÁLNÍCH PŘEPISŮ VZHLEDEM K JEJICH VLASTNÍMU TRANSKRIPČNÍMU ŘETĚZCI V MTDNA. V NAŠICH DŘÍVĚJŠÍCH PROJEKTECH JSME NAVÍC ZJISTILI, ŽE POKLES CIRKULUJÍCÍHO OBSAHU MTDNA V MOZKOMÍŠNÍM MOKU (CSF) PŘEDCHÁZÍ PROJEVŮM FAMILIÁRNÍ ALZHEIMEROVY CHOROBY, ZATÍMCO ZVÝŠENÍ OBSAHU CSF MTDNA JE SPOJENO S PARKINSONOVOU CHOROBOU U PACIENTŮ S MUTACEMI V GENU LRRK2. NA ZÁKLADĚ TĚCHTO PŘEDCHOZÍCH VÝSLEDKŮ PŘEDPOKLÁDÁME, ŽE ZMĚNA ROVNOVÁHY MEZI REPLIKACÍ MTDNA A DEGRADACÍ MITOCHONDRIÁLNÍCH SYSTÉMŮ KONTROLY KVALITY URČUJE TYP NEURODEGENERATIVNÍHO PROCESU. SYSTÉMY, KTERÉ REGULUJÍ POČET KOPIÍ MTDNA A JEJICH PŘEPIS, VŠAK ZATÍM NEJSOU DOBŘE ZNÁMY. V TOMTO PROJEKTU NAVRHUJEME PROZKOUMAT NAŘÍZENÍ O TRANSKRIPCI A REPLIKACI MTDNA V GENETICKÝCH MODELECH ALZHEIMEROVY A PARKINSONOVY CHOROBY. MEZI SPECIFICKÉ CÍLE PATŘÍ: 1) STUDOVAT VLIV MITOCHONDRIÁLNÍCH SYSTÉMŮ KONTROLY KVALITY NA UVOLŇOVÁNÍ MTDNA V EXTRACELULÁRNÍM PROSTORU, 2) MĚŘIT REPLIKACI A TRANSKRIPCI MTDNA SELFIE-DPCR V GENETICKÝCH MODELECH A 3) CHARAKTERIZOVAT GENOVOU TRANSKRIPČNÍ MAPU MITOCHONDRIÁLNÍ NUKLEÁRNÍ ANTEROGRADNÍ SIGNALIZAČNÍ DRÁHY EVOKOVANÉ PATOGENNÍM GENOVÝM MUTACÍ APLIKACE POMOCÍ SELFIE METODY SPOJENÝ S MASIVNÍM PARALELNÍM SEKVENOVÁNÍM NÁSLEDOVANÝM VALIDACÍ S SELFIE-DPCR. VÝSLEDKY NÁM UMOŽNÍ KONTRASTOVAT HYPOTÉZU, ŽE REGULACE MITOCHONDRIÁLNÍ DNA JE KLÍČOVÝM MECHANISMEM NEURODEGENERATIVNÍHO PROCESU A ŽE JEJÍ NORMALIZACE MŮŽE ZABRÁNIT NEURODEGENERACI. (Czech)
17 August 2022
0 references
AS DOENÇAS NEURODEGENERATIVAS PODEM TER CAUSAS DIFERENTES E UM DOS PRINCIPAIS OBJETIVOS DA PESQUISA ATUAL É IDENTIFICAR UM MECANISMO BIOQUÍMICO CENTRAL COMUM SOBRE O QUAL ELAS CONVERGEM. A MAIORIA DAS CAUSAS DAS DOENÇAS NEURODEGENERATIVAS AINDA É DESCONHECIDA, MAS MUTAÇÕES GENÉTICAS QUE PRODUZEM NEURODEGENERAÇÃO EM FAMÍLIAS FORNECEM UM MODELO EXPERIMENTAL ROBUSTO PARA IDENTIFICAR OS MECANISMOS BIOQUÍMICOS CENTRAIS DO PROCESSO NEURODEGENERATIVO. A HIPÓTESE GERAL DO PRESENTE PROJETO É QUE A REGULAÇÃO ALTERADA DO DNA MITOCONDRIAL (MTDNA) É UM MECANISMO CENTRAL COMUM NA CADEIA PATOLÓGICA DO PROCESSO NEURODEGENERATIVO. NO ENTANTO, O ESTUDO DA REPLICAÇÃO E TRANSCRIÇÃO DO MTDNA TEM SIDO LIMITADO PELA DIFICULDADE DE MEDIR COM PRECISÃO O NÚMERO DE CÓPIAS DO GENOMA MITOCONDRIAL. RECENTEMENTE DESENVOLVEMOS UM MÉTODO CHAMADO SELFIE-DPCR QUE PERMITE A QUANTIFICAÇÃO ABSOLUTA DO NÚMERO DE TRANSCRIÇÕES MITOCONDRIAIS EM RELAÇÃO À SUA PRÓPRIA CADEIA DE TRANSCRIÇÃO NO MTDNA. ALÉM DISSO, EM NOSSOS PROJETOS ANTERIORES, DESCOBRIMOS QUE UMA DIMINUIÇÃO DO CONTEÚDO DE MTDNA CIRCULANTE NO LÍQUIDO CEFALORRAQUIDIANO (LCR) PRECEDE A MANIFESTAÇÃO DA DOENÇA DE ALZHEIMER FAMILIAR, ENQUANTO UM AUMENTO NO CONTEÚDO DE LCR DO MTDNA ESTÁ ASSOCIADO À DOENÇA DE PARKINSON EM PACIENTES COM MUTAÇÕES NO GENE LRRK2. COM BASE NESSES RESULTADOS ANTERIORES, HIPOTETIZAMOS QUE A ALTERAÇÃO NO EQUILÍBRIO ENTRE REPLICAÇÃO DE MTDNA E DEGRADAÇÃO POR SISTEMAS DE CONTROLE DE QUALIDADE MITOCONDRIAL DETERMINA O TIPO DE PROCESSO NEURODEGENERATIVO. NO ENTANTO, OS SISTEMAS QUE REGULAM O NÚMERO DE CÓPIAS DE MTDNA E SUA TRANSCRIÇÃO AINDA NÃO SÃO BEM CONHECIDOS. NO PRESENTE PROJETO, PROPOMOS INVESTIGAR O REGULAMENTO DE TRANSCRIÇÃO E REPLICAÇÃO DE MTDNA EM MODELOS GENÉTICOS DE DOENÇAS DE ALZHEIMER E PARKINSON. OS OBJETIVOS ESPECÍFICOS INCLUEM: 1) ESTUDAR A INFLUÊNCIA DOS SISTEMAS DE CONTROLE DE QUALIDADE MITOCONDRIAL NA LIBERAÇÃO DE MTDNA NO ESPAÇO EXTRACELULAR, 2) MEDIR A REPLICAÇÃO E TRANSCRIÇÃO DE MTDNA POR SELFIE-DPCR EM MODELOS GENÉTICOS, E 3) CARACTERIZAR O MAPA DE TRANSCRIÇÃO GENÉTICA DA VIA DE SINALIZAÇÃO ANTERÓGRADA NUCLEAR MITOCONDRIAL EVOCADA POR UMA MUTAÇÃO GENÉTICA DO APLICATIVO PATOGÊNICO USANDO O MÉTODO SELFIE ACOPLADO A SEQUENCIAMENTO PARALELO MACIÇO SEGUIDO DE VALIDAÇÃO COM SELFIE-DPCR. OS RESULTADOS PERMITIRÃO CONTRASTAR A HIPÓTESE DE QUE A REGULAÇÃO DO DNA MITOCONDRIAL É UM MECANISMO CHAVE NO PROCESSO NEURODEGENERATIVO E QUE SUA NORMALIZAÇÃO PODE PREVENIR A NEURODEGENERAÇÃO. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERATIIVSETEL HAIGUSTEL VÕIVAD OLLA ERINEVAD PÕHJUSED JA ÜKS KÄIMASOLEVATE UURINGUTE PÕHIEESMÄRKE ON MÄÄRATA KINDLAKS ÜHINE KESKNE BIOKEEMILINE MEHHANISM, MILLELE NAD LÄHENEVAD. ENAMIK NEURODEGENERATIIVSETE HAIGUSTE PÕHJUSEID EI OLE VEEL TEADA, KUID GEENIMUTATSIOONID, MIS TEKITAVAD PEREKONDADES NEURODEGENERATSIOONI, PAKUVAD TUGEVAT EKSPERIMENTAALSET MUDELIT NEURODEGENERATIIVSE PROTSESSI KESKSETE BIOKEEMILISTE MEHHANISMIDE KINDLAKSTEGEMISEKS. KÄESOLEVA PROJEKTI ÜLDINE HÜPOTEES ON SEE, ET MITOKONDRIAALSE DNA (MTDNA) MUUDETUD REGULATSIOON ON NEURODEGENERATIIVSE PROTSESSI PATOLOOGILISE AHELA ÜHINE KESKNE MEHHANISM. MTDNA REPLIKATSIOONI JA TRANSKRIPTSIOONI UURING ON SIISKI PIIRATUD MITOKONDRIAALSETE GENOOMIKOOPIATE ARVU TÄPSE MÕÕTMISE KEERUKUSEGA. HILJUTI OLEME VÄLJA TÖÖTANUD MEETODI, MIDA NIMETATAKSE SELFIE-DPCRIKS, MIS VÕIMALDAB ABSOLUUTSELT KVANTIFITSEERIDA MITOKONDRIAALSETE TRANSKRIPTSIOONIDE ARVU VÕRRELDES NENDE ENDA TRANSKRIPTSIOONIAHELAGA MTDNAS. LISAKS OLEME OMA VARASEMATES PROJEKTIDES LEIDNUD, ET TSIRKULEERIVA MTDNA SISALDUSE VÄHENEMINE TSEREBROSPINAALVEDELIKUS (CSF) EELNEB PEREKONDLIKU ALZHEIMERI TÕVE AVALDUMISELE, SAMAS KUI MTDNA CSF SISALDUSE SUURENEMINE ON SEOTUD PARKINSONI TÕVEGA PATSIENTIDEL, KELLEL ON LRRK2 GEENI MUTATSIOONID. NENDE VARASEMATE TULEMUSTE PÕHJAL OLETAME, ET MTDNA REPLIKATSIOONI JA MITOKONDRIAALSETE KVALITEEDIKONTROLLISÜSTEEMIDE LAGUNEMISE TASAKAALU MUUTUS MÄÄRAB NEURODEGENERATIIVSE PROTSESSI TÜÜBI. SIISKI EI OLE MTDNA KOOPIATE ARVU JA NENDE TRANSKRIPTSIOONI REGULEERIVAD SÜSTEEMID VEEL HÄSTI TEADA. KÄESOLEVAS PROJEKTIS TEEME ETTEPANEKU UURIDA TRANSKRIPTSIOONI JA MTDNA REPLIKATSIOONI REGULATSIOONI ALZHEIMERI JA PARKINSONI TÕVE GENEETILISTES MUDELITES. KONKREETSED EESMÄRGID ON JÄRGMISED: 1) UURIDA MITOKONDRIAALSETE KVALITEEDIKONTROLLISÜSTEEMIDE MÕJU MTDNA VABANEMISELE RAKUVÄLISES RUUMIS, 2) MÕÕTA MTDNA REPLIKATSIOONI JA TRANSKRIPTSIOONI SELFIE-DPCRI ABIL GENEETILISTES MUDELITES NING 3) ISELOOMUSTADA MITOKONDRIAALSE TUUMA ANTEROGRADI SIGNAALIMISRAJA GEENITRANSKRIPTSIOONI KAARTI, MIS ON ESILE KUTSUTUD PATOGEENSE RAKENDUSE GEENIMUTATSIOONIGA, KASUTADES SELFIE MEETODIT KOOS MASSIIVSE PARALLEELSE SEKVENEERIMISEGA, MILLELE JÄRGNEB VALIDEERIMINE SELFIE-DPCRIGA. TULEMUSED VÕIMALDAVAD MEIL VASTANDADA HÜPOTEESI, ET MITOKONDRIAALSE DNA REGULEERIMINE ON NEURODEGENERATIIVSE PROTSESSI PEAMINE MEHHANISM JA ET SELLE NORMALISEERIMINE VÕIB TAKISTADA NEURODEGENERATSIOONI. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A NEURODEGENERATÍV BETEGSÉGEKNEK KÜLÖNBÖZŐ OKAI LEHETNEK, ÉS A JELENLEGI KUTATÁS EGYIK FŐ CÉLKITŰZÉSE EGY OLYAN KÖZÖS KÖZPONTI BIOKÉMIAI MECHANIZMUS AZONOSÍTÁSA, AMELYHEZ KÖZELÍTENEK. A NEURODEGENERATÍV BETEGSÉGEK LEGTÖBB OKA MÉG MINDIG ISMERETLEN, DE A CSALÁDOKBAN NEURODEGENERÁCIÓT EREDMÉNYEZŐ GENETIKAI MUTÁCIÓK ROBUSZTUS KÍSÉRLETI MODELLT NYÚJTANAK A NEURODEGENERATÍV FOLYAMAT KÖZPONTI BIOKÉMIAI MECHANIZMUSAINAK AZONOSÍTÁSÁRA. A JELENLEGI PROJEKT ÁLTALÁNOS HIPOTÉZISE AZ, HOGY A MITOKONDRIÁLIS DNS (MTDNS) SZABÁLYOZÁSA A NEURODEGENERATÍV FOLYAMAT PATOLÓGIÁS LÁNCÁNAK KÖZÖS KÖZPONTI MECHANIZMUSA. AZ MTDNS REPLIKÁCIÓ ÉS TRANSZKRIPCIÓ VIZSGÁLATÁT AZONBAN KORLÁTOZTA A MITOKONDRIÁLIS GENOM MÁSOLATOK SZÁMÁNAK PONTOS MÉRÉSE. A KÖZELMÚLTBAN KIFEJLESZTETTÜNK EGY SELFIE-DPCR NEVŰ MÓDSZERT, AMELY LEHETŐVÉ TESZI A MITOKONDRIÁLIS ÁTIRATOK SZÁMÁNAK ABSZOLÚT SZÁMSZERŰSÍTÉSÉT A SAJÁT ÁTÍRÁSI LÁNCUKHOZ KÉPEST AZ MTDNS-BEN. TOVÁBBÁ KORÁBBI PROJEKTJEINKBEN MEGÁLLAPÍTOTTUK, HOGY A KERINGŐ MTDNS-TARTALOM CSÖKKENÉSE A CEREBROSPINALIS FOLYADÉKBAN (CSF) MEGELŐZI A FAMILIÁRIS ALZHEIMER-KÓR MEGNYILVÁNULÁSÁT, MÍG AZ LRRK2 GÉN MUTÁCIÓIBAN SZENVEDŐ BETEGEKNÉL AZ MTDNS CSF-TARTALMÁNAK NÖVEKEDÉSE PARKINSON-KÓRRAL JÁR EGYÜTT. A KORÁBBI EREDMÉNYEK ALAPJÁN AZT FELTÉTELEZZÜK, HOGY AZ MTDNS REPLIKÁCIÓ ÉS LEBOMLÁSA KÖZÖTTI EGYENSÚLYNAK A MITOKONDRIÁLIS MINŐSÉGELLENŐRZÉSI RENDSZEREK ÁLTALI MEGVÁLTOZTATÁSA HATÁROZZA MEG A NEURODEGENERATÍV FOLYAMAT TÍPUSÁT. MINDAZONÁLTAL AZ MTDNS MÁSOLATOK SZÁMÁT ÉS ÁTÍRÁSÁT SZABÁLYOZÓ RENDSZEREK MÉG NEM ISMERTEK JÓL. EBBEN A PROJEKTBEN AZ ALZHEIMER- ÉS PARKINSON-KÓR GENETIKAI MODELLJEIBEN A TRANSZKRIPCIÓ ÉS AZ MTDNS REPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁNAK VIZSGÁLATÁT JAVASOLJUK. A KONKRÉT CÉLKITŰZÉSEK KÖZÉ TARTOZNAK A KÖVETKEZŐK: 1) A MITOKONDRIÁLIS MINŐSÉGELLENŐRZÉSI RENDSZEREK HATÁSÁNAK TANULMÁNYOZÁSA AZ MTDNS KIBOCSÁTÁSÁRA AZ EXTRACELLULÁRIS TÉRBEN, 2) AZ MTDNS REPLIKÁCIÓJÁNAK ÉS ÁTÍRÁSÁNAK MÉRÉSE A SELFIE-DPCR ÁLTAL GENETIKAI MODELLEKBEN, ÉS 3) A MITOKONDRIÁLIS NUKLEÁRIS ANTEROGRÁD JELÁTVITELI ÚTVONAL GÉNÁTÍRÁSI TÉRKÉPÉNEK JELLEMZÉSE, AMELYET EGY PATOGÉN APP GÉNMUTÁCIÓ IDÉZ ELŐ SZELFI MÓDSZERREL, MASSZÍV PÁRHUZAMOS SZEKVENÁLÁSSAL, MAJD VALIDÁLÁSSAL SELFIE-DPCR-REL. AZ EREDMÉNYEK LEHETŐVÉ TESZIK, HOGY SZEMBESÍTSÜK AZT A FELTÉTELEZÉST, HOGY A MITOKONDRIÁLIS DNS SZABÁLYOZÁSA KULCSFONTOSSÁGÚ MECHANIZMUS A NEURODEGENERATÍV FOLYAMATBAN, ÉS HOGY NORMALIZÁLÓDÁSA MEGAKADÁLYOZHATJA A NEURODEGENERÁCIÓT. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИТЕ ЗАБОЛЯВАНИЯ МОГАТ ДА ИМАТ РАЗЛИЧНИ ПРИЧИНИ И ЕДНА ОТ ОСНОВНИТЕ ЦЕЛИ НА НАСТОЯЩИТЕ ИЗСЛЕДВАНИЯ Е ДА СЕ ОПРЕДЕЛИ ОБЩ ЦЕНТРАЛЕН БИОХИМИЧЕН МЕХАНИЗЪМ, КЪМ КОЙТО ТЕ ДА СЕ СБЛИЖАТ. ПОВЕЧЕТО ОТ ПРИЧИНИТЕ ЗА НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИТЕ ЗАБОЛЯВАНИЯ ВСЕ ОЩЕ НЕ СА ИЗВЕСТНИ, НО ГЕНЕТИЧНИТЕ МУТАЦИИ, КОИТО ПРОИЗВЕЖДАТ НЕВРОДЕГЕНЕРАЦИЯ В СЕМЕЙСТВАТА, ОСИГУРЯВАТ СТАБИЛЕН ЕКСПЕРИМЕНТАЛЕН МОДЕЛ ЗА ИДЕНТИФИЦИРАНЕ НА ЦЕНТРАЛНИТЕ БИОХИМИЧНИ МЕХАНИЗМИ НА НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИЯ ПРОЦЕС. ОБЩАТА ХИПОТЕЗА НА НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ Е, ЧЕ ПРОМЕНЕНОТО РЕГУЛИРАНЕ НА МИТОХОНДРИАЛНАТА ДНК (MTDNA) Е ОБЩ ЦЕНТРАЛЕН МЕХАНИЗЪМ В ПАТОЛОГИЧНАТА ВЕРИГА НА НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИЯ ПРОЦЕС. ИЗСЛЕДВАНЕТО НА РЕПЛИКАЦИЯТА И ТРАНСКРИПЦИЯТА НА MTDNA ОБАЧЕ Е ОГРАНИЧЕНО ОТ ТРУДНОСТТА ЗА ТОЧНО ИЗМЕРВАНЕ НА БРОЯ НА МИТОХОНДРИАЛНИТЕ ГЕНОМНИ КОПИЯ. НАСКОРО РАЗРАБОТИХМЕ МЕТОД, НАРЕЧЕН СЕЛФИ-DPCR, КОЙТО ПОЗВОЛЯВА АБСОЛЮТНО КОЛИЧЕСТВЕНО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА БРОЯ НА МИТОХОНДРИАЛНИТЕ ПРЕПИСИ СПРЯМО СОБСТВЕНАТА ИМ ТРАНСКРИПЦИОННА ВЕРИГА В MTDNA. ОСВЕН ТОВА В ПРЕДИШНИТЕ НИ ПРОЕКТИ УСТАНОВИХМЕ, ЧЕ НАМАЛЯВАНЕТО НА ЦИРКУЛИРАЩОТО СЪДЪРЖАНИЕ НА MTDNA В ЦЕРЕБРОСПИНАЛНАТА ТЕЧНОСТ (CSF) ПРЕДХОЖДА ПРОЯВАТА НА ФАМИЛНА БОЛЕСТ НА АЛЦХАЙМЕР, ДОКАТО УВЕЛИЧАВАНЕТО НА СЪДЪРЖАНИЕТО НА CSF В MTDNA Е СВЪРЗАНО С БОЛЕСТТА НА ПАРКИНСОН ПРИ ПАЦИЕНТИ С МУТАЦИИ В ГЕНА LRRK2. ВЪЗ ОСНОВА НА ТЕЗИ ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ, НИЕ ПРЕДПОЛАГАМЕ, ЧЕ ПРОМЯНАТА В БАЛАНСА МЕЖДУ РЕПЛИКАЦИЯТА НА MTDNA И РАЗГРАЖДАНЕТО ЧРЕЗ МИТОХОНДРИАЛНИ СИСТЕМИ ЗА КОНТРОЛ НА КАЧЕСТВОТО ОПРЕДЕЛЯ ВИДА НА НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИЯ ПРОЦЕС. ВЪПРЕКИ ТОВА СИСТЕМИТЕ, КОИТО РЕГУЛИРАТ БРОЯ НА MTDNA КОПИЯ И ТЯХНАТА ТРАНСКРИПЦИЯ ВСЕ ОЩЕ НЕ СА ДОБРЕ ИЗВЕСТНИ. В НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ ПРЕДЛАГАМЕ ДА СЕ ПРОУЧИ РЕГУЛИРАНЕТО НА ТРАНСКРИПЦИЯТА И РЕПЛИКАЦИЯТА НА MTDNA В ГЕНЕТИЧНИ МОДЕЛИ НА БОЛЕСТТА НА АЛЦХАЙМЕР И ПАРКИНСОН. СПЕЦИФИЧНИТЕ ЦЕЛИ ВКЛЮЧВАТ: 1) ИЗСЛЕДВАНЕ НА ВЛИЯНИЕТО НА МИТОХОНДРИАЛНИТЕ СИСТЕМИ ЗА КОНТРОЛ НА КАЧЕСТВОТО ВЪРХУ ОСВОБОЖДАВАНЕТО НА MTDNA В ИЗВЪНКЛЕТЪЧНОТО ПРОСТРАНСТВО, 2) ЗА ИЗМЕРВАНЕ НА РЕПЛИКАЦИЯТА И ТРАНСКРИПЦИЯТА НА MTDNA ЧРЕЗ СЕЛФИ-DPCR В ГЕНЕТИЧНИ МОДЕЛИ И 3) ЗА ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА ТРАНСКРИПЦИОННАТА КАРТА НА МИТОХОНДРИАЛНИЯ НУКЛЕАРЕН АНТИРОГРАДЕН ПЪТ, ПРЕДИЗВИКАН ОТ ПАТОГЕННА АП ГЕННА МУТАЦИЯ, ИЗПОЛЗВАЙКИ СЕЛФИ МЕТОД, СВЪРЗАН С МАСИВНО ПАРАЛЕЛНО СЕКВЕНИРАНЕ, ПОСЛЕДВАНО ОТ ВАЛИДИРАНЕ СЪС СЕЛФИ-DPCR. РЕЗУЛТАТИТЕ ЩЕ НИ ПОЗВОЛЯТ ДА КОНТРАСТИРАМЕ ХИПОТЕЗАТА, ЧЕ РЕГУЛИРАНЕТО НА МИТОХОНДРИАЛНАТА ДНК Е КЛЮЧОВ МЕХАНИЗЪМ В НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИЯ ПРОЦЕС И ЧЕ НОРМАЛИЗИРАНЕТО МУ МОЖЕ ДА ПРЕДОТВРАТИ НЕВРОДЕГЕНЕРАЦИЯ. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERACINIŲ LIGŲ PRIEŽASTYS GALI BŪTI SKIRTINGOS IR VIENAS IŠ PAGRINDINIŲ DABARTINIŲ MOKSLINIŲ TYRIMŲ TIKSLŲ – NUSTATYTI BENDRĄ CENTRINĘ BIOCHEMINĘ SISTEMĄ, PRIE KURIOS JOS SUSILIEJA. DAUGUMA NEURODEGENERACINIŲ LIGŲ PRIEŽASČIŲ VIS DAR NEŽINOMOS, TAČIAU GENETINĖS MUTACIJOS, SUKELIANČIOS NEURODEGENERACIJĄ ŠEIMOSE, YRA PATIKIMAS EKSPERIMENTINIS MODELIS, SKIRTAS NUSTATYTI PAGRINDINIUS NEURODEGENERACINIO PROCESO BIOCHEMINIUS MECHANIZMUS. BENDRA ŠIO PROJEKTO HIPOTEZĖ YRA TA, KAD PAKEISTAS MITOCHONDRIJŲ DNR (MTDNR) REGULIAVIMAS YRA BENDRAS CENTRINIS NEURODEGENERACINIO PROCESO PATOLOGINĖS GRANDINĖS MECHANIZMAS. TAČIAU MTDNR REPLIKACIJOS IR TRANSKRIPCIJOS TYRIMAS BUVO RIBOTAS DĖL TO, KAD SUNKU TIKSLIAI IŠMATUOTI MITOCHONDRIJŲ GENOMO KOPIJŲ SKAIČIŲ. MES NESENIAI SUKŪRĖME METODĄ, VADINAMĄ SELFIE-DPCR, KURIS LEIDŽIA ABSOLIUČIAI KIEKYBIŠKAI ĮVERTINTI MITOCHONDRIJŲ NUORAŠŲ SKAIČIŲ, PALYGINTI SU JŲ PAČIŲ TRANSKRIPCIJOS GRANDINE MTDNR. BE TO, MŪSŲ ANKSTESNIUOSE PROJEKTUOSE MES NUSTATĖME, KAD CIRKULIUOJANČIO MTDNR KIEKIO SUMAŽĖJIMAS CEREBROSPINALINIAME SKYSTYJE (CSF) PRIEŠ ŠEIMINĖS ALZHEIMERIO LIGOS PASIREIŠKIMĄ, O MTDNR CSF KIEKIO PADIDĖJIMAS YRA SUSIJĘS SU PARKINSONO LIGA PACIENTAMS, TURINTIEMS LRRK2 GENO MUTACIJŲ. REMDAMIESI ŠIAIS ANKSTESNIAIS REZULTATAIS, MES MANOME, KAD PUSIAUSVYROS TARP MTDNR REPLIKACIJOS IR DEGRADACIJOS POKYTIS MITOCHONDRIJŲ KOKYBĖS KONTROLĖS SISTEMOSE LEMIA NEURODEGENERACINIO PROCESO TIPĄ. VIS DĖLTO SISTEMOS, KURIOMIS REGULIUOJAMAS MTDNR KOPIJŲ SKAIČIUS IR JŲ TRANSKRIPCIJA, DAR NĖRA GERAI ŽINOMOS. ŠIAME PROJEKTE SIŪLOME IŠTIRTI TRANSKRIPCIJOS IR MTDNR REPLIKACIJOS REGULIAVIMĄ ALZHEIMERIO S IR PARKINSONO LIGŲ GENETINIUOSE MODELIUOSE. KONKRETŪS TIKSLAI: 1) IŠTIRTI MITOCHONDRIJŲ KOKYBĖS KONTROLĖS SISTEMŲ ĮTAKĄ MTDNR IŠSISKYRIMUI EKSTRALĄSTELINĖJE ERDVĖJE, 2) IŠMATUOTI MTDNR REPLIKACIJĄ IR TRANSKRIPCIJĄ NAUDOJANT SELFIE-DPGR GENETINIUS MODELIUS IR 3) APIBŪDINTI MITOCHONDRIJŲ BRANDUOLINĖS PRIEŠEROGRADINĖS SIGNALIZACIJOS KELIO GENŲ TRANSKRIPCIJOS ŽEMĖLAPĮ, KURĮ SUKELIA PATOGENINĖS PROGRAMOS GENŲ MUTACIJA, NAUDOJANT ASMENUKĖS METODĄ, SUSIETĄ SU MASINIU LYGIAGREČIU SEKOS NUSTATYMU, PO KURIO ATLIEKAMAS PATVIRTINIMAS SU SELFIE-DPCR. REZULTATAI LEIS MUMS PALYGINTI HIPOTEZĘ, KAD MITOCHONDRIJŲ DNR REGULIAVIMAS YRA PAGRINDINIS NEURODEGENERACINIO PROCESO MECHANIZMAS IR KAD JO NORMALIZAVIMAS GALI UŽKIRSTI KELIĄ NEURODEGENERACIJAI. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERATIVNE BOLESTI MOGU IMATI RAZLIČITE UZROKE, A JEDAN OD GLAVNIH CILJEVA TRENUTAČNIH ISTRAŽIVANJA JE UTVRĐIVANJE ZAJEDNIČKOG SREDIŠNJEG BIOKEMIJSKOG MEHANIZMA NA KOJEM SE SPAJAJU. VEĆINA UZROKA NEURODEGENERATIVNIH BOLESTI JOŠ UVIJEK NIJE POZNATA, ALI GENETSKE MUTACIJE KOJE PROIZVODE NEURODEGENERACIJU U OBITELJIMA PRUŽAJU ROBUSTAN EKSPERIMENTALNI MODEL ZA IDENTIFIKACIJU SREDIŠNJIH BIOKEMIJSKIH MEHANIZAMA NEURODEGENERATIVNOG PROCESA. OPĆA PRETPOSTAVKA OVOG PROJEKTA JE DA JE IZMIJENJENA REGULACIJA MITOHONDRIJSKE DNK (MTDNK) ZAJEDNIČKI SREDIŠNJI MEHANIZAM U PATOLOŠKOM LANCU NEURODEGENERATIVNOG PROCESA. MEĐUTIM, ISPITIVANJE MTDNA REPLIKACIJE I TRANSKRIPCIJE OGRANIČENO JE ZBOG POTEŠKOĆA U TOČNOM MJERENJU BROJA PRIMJERAKA MITOHONDRIJSKIH GENOMA. NEDAVNO SMO RAZVILI METODU POD NAZIVOM SELFIE-DPCR KOJA OMOGUĆUJE APSOLUTNU KVANTIFIKACIJU BROJA MITOHONDRIJSKIH TRANSKRIPTA U ODNOSU NA VLASTITI TRANSKRIPCIJSKI LANAC U MTDNA. NADALJE, U NAŠIM RANIJIM PROJEKTIMA UTVRDILI SMO DA SMANJENJE CIRKULIRAJUĆEG SADRŽAJA MTDNA U CEREBROSPINALNOJ TEKUĆINI (CSF) PRETHODI MANIFESTACIJI OBITELJSKE ALZHEIMEROVE BOLESTI, DOK JE POVEĆANJE SADRŽAJA KSK-A MTDNK POVEZANO S PARKINSONOVOM BOLEŠĆU U BOLESNIKA S MUTACIJAMA GENA LRRK2. NA TEMELJU OVIH PRETHODNIH REZULTATA, PRETPOSTAVLJAMO DA PROMJENA RAVNOTEŽE IZMEĐU MTDNA REPLIKACIJE I RAZGRADNJE POMOĆU MITOHONDRIJSKIH SUSTAVA KONTROLE KVALITETE ODREĐUJE VRSTU NEURODEGENERATIVNOG PROCESA. IPAK, SUSTAVI KOJI REGULIRAJU BROJ MTDNA KOPIJA I NJIHOVU TRANSKRIPCIJU JOŠ NISU DOBRO POZNATI. U OVOM PROJEKTU PREDLAŽEMO ISTRAŽIVANJE REGULACIJE TRANSKRIPCIJE I MTDNA REPLIKACIJE U GENETSKIM MODELIMA ALZHEIMEROVE I PARKINSONOVE BOLESTI. POSEBNI CILJEVI UKLJUČUJU: 1) PROUČITI UTJECAJ MITOHONDRIJSKIH SUSTAVA ZA KONTROLU KVALITETE NA OSLOBAĐANJE MTDNK U IZVANSTANIČNOM PROSTORU, 2) MJERITI REPLIKACIJU I TRANSKRIPCIJU MTDNK SELFIE-DPCR-OM U GENETSKIM MODELIMA I 3) KARAKTERIZIRATI KARTU TRANSKRIPCIJE GENA MITOHONDRIJSKOG NUKLEARNOG ANTEROGRADNOG SIGNALNOG PUTA EVOCIRANOG PATOGENOM MUTACIJOM GENA APLIKACIJE SELFIE METODOM U KOMBINACIJI S MASIVNIM PARALELNIM SEKVENCIRANJEM NAKON ČEGA SLIJEDI VALIDACIJA S SELFIE-DPCR-OM. REZULTATI ĆE NAM OMOGUĆITI KONTRAST HIPOTEZE DA JE REGULACIJA MITOHONDRIJSKE DNK KLJUČNI MEHANIZAM U NEURODEGENERATIVNOM PROCESU I DA NJEGOVA NORMALIZACIJA MOŽE SPRIJEČITI NEURODEGENERACIJU. (Croatian)
17 August 2022
0 references
NEURODEGENERATIVA SJUKDOMAR KAN HA OLIKA ORSAKER OCH ETT AV HUVUDSYFTENA MED DEN PÅGÅENDE FORSKNINGEN ÄR ATT IDENTIFIERA EN GEMENSAM CENTRAL BIOKEMISK MEKANISM DÄR DE KONVERGERAR. DE FLESTA AV ORSAKERNA TILL NEURODEGENERATIVA SJUKDOMAR ÄR FORTFARANDE OKÄNDA, MEN GENETISKA MUTATIONER SOM PRODUCERAR NEURODEGENERATION I FAMILJER GER EN ROBUST EXPERIMENTELL MODELL FÖR ATT IDENTIFIERA DE CENTRALA BIOKEMISKA MEKANISMERNA I DEN NEURODEGENERATIVA PROCESSEN. DEN ALLMÄNNA HYPOTESEN FÖR DETTA PROJEKT ÄR ATT FÖRÄNDRAD REGLERING AV MITOKONDRIELLT DNA (MTDNA) ÄR EN GEMENSAM CENTRAL MEKANISM I DEN PATOLOGISKA KEDJAN AV DEN NEURODEGENERATIVA PROCESSEN. STUDIEN AV MTDNA-REPLIKERING OCH TRANSKRIPTION HAR DOCK BEGRÄNSATS AV SVÅRIGHETEN ATT EXAKT MÄTA ANTALET MITOKONDRIELLA GENOMKOPIOR. VI HAR NYLIGEN UTVECKLAT EN METOD SOM KALLAS SELFIE-DPCR SOM MÖJLIGGÖR ABSOLUT KVANTIFIERING AV ANTALET MITOKONDRIELLA TRANSKRIPTIONER I FÖRHÅLLANDE TILL DERAS EGEN TRANSKRIPTIONSKEDJA I MTDNA. DESSUTOM HAR VI I VÅRA TIDIGARE PROJEKT FUNNIT ATT EN MINSKNING AV CIRKULERANDE MTDNA-INNEHÅLL I CEREBROSPINALVÄTSKA (CSF) FÖREGÅR MANIFESTATIONEN AV FAMILJÄR ALZHEIMERS SJUKDOM, MEDAN EN ÖKNING AV CSF-INNEHÅLLET I MTDNA ÄR ASSOCIERAD MED PARKINSONS SJUKDOM HOS PATIENTER MED MUTATIONER I LRRK2-GENEN. BASERAT PÅ DESSA TIDIGARE RESULTAT, HYPOTESER VI ATT FÖRÄNDRING I BALANSEN MELLAN MTDNA REPLIKERING OCH NEDBRYTNING AV MITOKONDRIELLA KVALITETSKONTROLLSYSTEM BESTÄMMER VILKEN TYP AV NEURODEGENERATIV PROCESS. ÄNDÅ, DE SYSTEM SOM REGLERAR ANTALET MTDNA KOPIOR OCH DERAS TRANSKRIPTION ÄR ÄNNU INTE VÄL KÄNDA. I DETTA PROJEKT FÖRESLÅR VI ATT MAN UNDERSÖKER REGLERINGEN AV TRANSKRIPTION OCH MTDNA-REPLIKATION I GENETISKA MODELLER AV ALZHEIMERS OCH PARKINSONS SJUKDOMAR. DE SÄRSKILDA MÅLEN ÄR BLAND ANNAT FÖLJANDE: 1) ATT STUDERA MITOKONDRIELLA KVALITETSKONTROLLSYSTEMS PÅVERKAN PÅ FRISÄTTNINGEN AV MTDNA I DET EXTRACELLULÄRA UTRYMMET, 2) ATT MÄTA REPLIKERING OCH TRANSKRIPTION AV MTDNA GENOM SELFIE-DPCR I GENETISKA MODELLER, OCH 3) ATT KARAKTERISERA GENTRANSKRIPTIONSKARTAN FÖR DEN MITOKONDRIELLA NUKLEÄRA ANTEROGRADE-SIGNALVÄGEN FRAMKALLAD AV EN PATOGEN APPGENMUTATION MED SELFIE-METOD KOPPLAD TILL MASSIV PARALLELL SEKVENSERING FÖLJT AV VALIDERING MED SELFIE-DPCR. RESULTATEN KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT KONTRASTERA HYPOTESEN ATT REGLERING AV MITOKONDRIELLT DNA ÄR EN VIKTIG MEKANISM I DEN NEURODEGENERATIVA PROCESSEN OCH ATT DESS NORMALISERING KAN FÖRHINDRA NEURODEGENERATION. (Swedish)
17 August 2022
0 references
BOLILE NEURODEGENERATIVE POT AVEA CAUZE DIFERITE ȘI UNUL DINTRE OBIECTIVELE PRINCIPALE ALE CERCETĂRII ACTUALE ESTE DE A IDENTIFICA UN MECANISM BIOCHIMIC CENTRAL COMUN ASUPRA CĂRUIA CONVERG. MAJORITATEA CAUZELOR BOLILOR NEURODEGENERATIVE SUNT ÎNCĂ NECUNOSCUTE, DAR MUTAȚIILE GENETICE CARE PRODUC NEURODEGENERAREA ÎN FAMILII OFERĂ UN MODEL EXPERIMENTAL ROBUST PENTRU IDENTIFICAREA MECANISMELOR BIOCHIMICE CENTRALE ALE PROCESULUI NEURODEGENERATIV. IPOTEZA GENERALĂ A PREZENTULUI PROIECT ESTE ACEEA CĂ MODIFICAREA REGLĂRII ADN-ULUI MITOCONDRIAL (MTADN) ESTE UN MECANISM CENTRAL COMUN ÎN LANȚUL PATOLOGIC AL PROCESULUI NEURODEGENERATIV. CU TOATE ACESTEA, STUDIUL REPLICĂRII ȘI TRANSCRIPȚIEI MTDNA A FOST LIMITAT DE DIFICULTATEA DE A MĂSURA CU PRECIZIE NUMĂRUL DE COPII MITOCONDRIALE ALE GENOMULUI. AM DEZVOLTAT RECENT O METODĂ NUMITĂ SELFIE-DPCR CARE PERMITE CUANTIFICAREA ABSOLUTĂ A NUMĂRULUI DE TRANSCRIERI MITOCONDRIALE ÎN RAPORT CU PROPRIUL LANȚ DE TRANSCRIERE DIN ADNM. ÎN PLUS, ÎN PROIECTELE NOASTRE ANTERIOARE, AM CONSTATAT CĂ O SCĂDERE A CONȚINUTULUI CIRCULANT DE ADNMT ÎN LICHIDUL CEFALORAHIDIAN (LCR) PRECEDE MANIFESTAREA BOLII ALZHEIMER FAMILIALE, ÎN TIMP CE O CREȘTERE A CONȚINUTULUI DE LCR AL ADNM ESTE ASOCIATĂ CU BOALA PARKINSON LA PACIENȚII CU MUTAȚII ALE GENEI LRRK2. PE BAZA ACESTOR REZULTATE ANTERIOARE, PRESUPUNEM CĂ MODIFICAREA ECHILIBRULUI DINTRE REPLICAREA ȘI DEGRADAREA MTDNA DE CĂTRE SISTEMELE DE CONTROL AL CALITĂȚII MITOCONDRIALE DETERMINĂ TIPUL DE PROCES NEURODEGENERATIV. CU TOATE ACESTEA, SISTEMELE CARE REGLEMENTEAZĂ NUMĂRUL DE COPII MTDNA ȘI TRANSCRIEREA ACESTORA NU SUNT ÎNCĂ BINE CUNOSCUTE. ÎN PREZENTUL PROIECT PROPUNEM SĂ INVESTIGĂM REGULAMENTUL DE TRANSCRIERE ȘI REPLICAREA ADNM ÎN MODELELE GENETICE ALE BOLILOR ALZHEIMER ȘI PARKINSON. PRINTRE OBIECTIVELE SPECIFICE SE NUMĂRĂ: 1) SĂ STUDIEZE INFLUENȚA SISTEMELOR DE CONTROL AL CALITĂȚII MITOCONDRIALE ASUPRA ELIBERĂRII DE ADNMT ÎN SPAȚIUL EXTRACELULAR, 2) SĂ MĂSOARE REPLICAREA ȘI TRANSCRIPȚIA MTDNA PRIN SELFIE-DPCR ÎN MODELELE GENETICE ȘI 3) SĂ CARACTERIZEZE HARTA TRANSCRIPȚIEI GENETICE A CĂII DE SEMNALIZARE MITOCONDRIALĂ NUCLEARĂ ANTEROGRADĂ EVOCATĂ DE O MUTAȚIE GENETICĂ A APLICAȚIEI PATOGENE FOLOSIND METODA SELFIE CUPLATĂ LA SECVENȚIEREA PARALELĂ MASIVĂ URMATĂ DE VALIDAREA CU SELFIE-DPCR. REZULTATELE NE VOR PERMITE SĂ CONTRASTĂM IPOTEZA CONFORM CĂREIA REGLEMENTAREA ADN-ULUI MITOCONDRIAL ESTE UN MECANISM CHEIE ÎN PROCESUL NEURODEGENERATIV ȘI CĂ NORMALIZAREA ACESTUIA POATE PREVENI NEURODEGENERAREA. (Romanian)
17 August 2022
0 references
NEVRODEGENERATIVNE BOLEZNI IMAJO LAHKO RAZLIČNE VZROKE IN EDEN OD GLAVNIH CILJEV SEDANJIH RAZISKAV JE OPREDELITI SKUPNI OSREDNJI BIOKEMIJSKI MEHANIZEM, NA KATEREGA SE ZBLIŽUJEJO. VEČINA VZROKOV NEVRODEGENERATIVNIH BOLEZNI JE ŠE VEDNO NEZNANA, VENDAR GENETSKE MUTACIJE, KI PROIZVAJAJO NEVRODEGENERACIJO V DRUŽINAH, ZAGOTAVLJAJO ROBUSTEN EKSPERIMENTALNI MODEL ZA IDENTIFIKACIJO OSREDNJIH BIOKEMIČNIH MEHANIZMOV NEVRODEGENERATIVNEGA PROCESA. SPLOŠNA HIPOTEZA SEDANJEGA PROJEKTA JE, DA JE SPREMENJENA REGULACIJA MITOHONDRIJSKE DNA (MTDNA) SKUPNI OSREDNJI MEHANIZEM V PATOLOŠKI VERIGI NEVRODEGENERATIVNEGA PROCESA. VENDAR PA JE BILA ŠTUDIJA REPLIKACIJE MTDNA IN TRANSKRIPCIJE OMEJENA ZARADI TEŽAV PRI NATANČNEM MERJENJU ŠTEVILA KOPIJ MITOHONDRIJSKEGA GENOMA. PRED KRATKIM SMO RAZVILI METODO, IMENOVANO SELFIE-DPCR, KI OMOGOČA ABSOLUTNO KOLIČINSKO OPREDELITEV ŠTEVILA MITOHONDRIJSKIH PREPISOV GLEDE NA NJIHOVO LASTNO TRANSKRIPCIJSKO VERIGO V MTDNA. POLEG TEGA SMO V PREJŠNJIH PROJEKTIH UGOTOVILI, DA JE ZMANJŠANJE VSEBNOSTI MTDNA V CEREBROSPINALNI TEKOČINI V OBTOKU PRED MANIFESTACIJO DRUŽINSKE ALZHEIMERJEVE BOLEZNI, MEDTEM KO JE POVEČANJE VSEBNOSTI CSF V MTDNA POVEZANO S PARKINSONOVO BOLEZNIJO PRI BOLNIKIH Z MUTACIJAMI GENA LRRK2. NA PODLAGI TEH PREJŠNJIH REZULTATOV DOMNEVAMO, DA SPREMEMBA V RAVNOTEŽJU MED REPLIKACIJO MTDNA IN DEGRADACIJO MITOHONDRIJSKIH SISTEMOV ZA NADZOR KAKOVOSTI DOLOČA VRSTO NEVRODEGENERATIVNEGA PROCESA. KLJUB TEMU SISTEMI, KI UREJAJO ŠTEVILO KOPIJ MTDNA IN NJIHOV PREPIS, ŠE NISO DOBRO ZNANI. V TEM PROJEKTU PREDLAGAMO, DA SE RAZIŠČE UREDITEV TRANSKRIPCIJE IN REPLIKACIJE MTDNA V GENETSKIH MODELIH ALZHEIMERJEVE IN PARKINSONOVE BOLEZNI. POSEBNI CILJI VKLJUČUJEJO: 1) PREUČITI VPLIV MITOHONDRIJSKIH SISTEMOV ZA NADZOR KAKOVOSTI NA SPROŠČANJE MTDNA V ZUNAJCELIČNI PROSTOR, 2) IZMERITI REPLIKACIJO IN TRANSKRIPCIJO MTDNA S SELFIE-DPCR V GENETSKIH MODELIH IN 3) OPREDELITI KARTO GENSKE TRANSKRIPCIJSKE KARTE MITOHONDRIJSKE JEDRSKE ANTEROGRADNE SIGNALNE POTI, KI JO SPROŽI PATOGENA GENSKA MUTACIJA APLIKACIJE Z METODO SELFIE V POVEZAVI Z MASIVNIM VZPOREDNIM SEKVENCIRANJEM, KI MU SLEDI VALIDACIJA S SELFIE-DPCR. REZULTATI NAM BODO OMOGOČILI, DA PRIMERJAMO HIPOTEZO, DA JE REGULACIJA MITOHONDRIJSKE DNA KLJUČNI MEHANIZEM V NEVRODEGENERATIVNEM PROCESU IN DA LAHKO NJENA NORMALIZACIJA PREPREČI NEVRODEGENERACIJO. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
CHOROBY NEURODEGENERACYJNE MOGĄ MIEĆ RÓŻNE PRZYCZYNY, A JEDNYM Z GŁÓWNYCH CELÓW OBECNYCH BADAŃ JEST OKREŚLENIE WSPÓLNEGO CENTRALNEGO MECHANIZMU BIOCHEMICZNEGO, Z KTÓRYM SIĘ ZBIEGAJĄ. WIĘKSZOŚĆ PRZYCZYN CHORÓB NEURODEGENERACYJNYCH JEST NADAL NIEZNANA, ALE MUTACJE GENETYCZNE, KTÓRE WYTWARZAJĄ NEURODEGENERACJĘ W RODZINACH, STANOWIĄ SOLIDNY MODEL EKSPERYMENTALNY DO IDENTYFIKACJI CENTRALNYCH MECHANIZMÓW BIOCHEMICZNYCH PROCESU NEURODEGENERACYJNEGO. OGÓLNA HIPOTEZA OBECNEGO PROJEKTU JEST TAKA, ŻE ZMIENIONA REGULACJA MITOCHONDRIALNEGO DNA (MTDNA) JEST WSPÓLNYM CENTRALNYM MECHANIZMEM W PATOLOGICZNYM ŁAŃCUCHU PROCESU NEURODEGENERACYJNEGO. JEDNAK BADANIE MTDNA REPLIKACJI I TRANSKRYPCJI ZOSTAŁO OGRANICZONE PRZEZ TRUDNOŚĆ DOKŁADNEGO POMIARU LICZBY KOPII GENOMU MITOCHONDRIALNEGO. NIEDAWNO OPRACOWALIŚMY METODĘ O NAZWIE SELFIE-DPCR, KTÓRA POZWALA NA BEZWZGLĘDNE ILOŚCIOWE OZNACZANIE LICZBY TRANSKRYPCJI MITOCHONDRIALNYCH WZGLĘDEM ICH WŁASNEGO ŁAŃCUCHA TRANSKRYPCJI W MTDNA. PONADTO WE WCZEŚNIEJSZYCH PROJEKTACH ODKRYLIŚMY, ŻE SPADEK ZAWARTOŚCI MTDNA W PŁYNIE MÓZGOWO-RDZENIOWYM (CSF) POPRZEDZA PRZEJAW RODZINNEJ CHOROBY ALZHEIMERA, PODCZAS GDY WZROST ZAWARTOŚCI CSF W MTDNA JEST ZWIĄZANY Z CHOROBĄ PARKINSONA U PACJENTÓW Z MUTACJAMI GENU LRRK2. NA PODSTAWIE TYCH POPRZEDNICH WYNIKÓW ZAKŁADAMY, ŻE ZMIANA RÓWNOWAGI MIĘDZY REPLIKACJĄ MTDNA A DEGRADACJĄ PRZEZ MITOCHONDRIALNE SYSTEMY KONTROLI JAKOŚCI OKREŚLA RODZAJ PROCESU NEURODEGENERACYJNEGO. NIEMNIEJ JEDNAK SYSTEMY REGULUJĄCE LICZBĘ KOPII MTDNA I ICH TRANSKRYPCJĘ NIE SĄ JESZCZE DOBRZE ZNANE. W OBECNYM PROJEKCIE PROPONUJEMY ZBADANIE REGULACJI TRANSKRYPCJI I REPLIKACJI MTDNA W MODELACH GENETYCZNYCH CHORÓB ALZHEIMERA I PARKINSONA. CELE SZCZEGÓŁOWE OBEJMUJĄ: 1) ZBADAĆ WPŁYW MITOCHONDRIALNYCH SYSTEMÓW KONTROLI JAKOŚCI NA UWALNIANIE MTDNA W PRZESTRZENI POZAKOMÓRKOWEJ, 2) ZMIERZYĆ REPLIKACJĘ I TRANSKRYPCJĘ MTDNA ZA POMOCĄ SELFIE-DPCR W MODELACH GENETYCZNYCH ORAZ 3) SCHARAKTERYZOWAĆ MAPĘ TRANSKRYPCJI GENU MITOCHONDRIALNEGO SZLAKU SYGNALIZACYJNEGO PRZEDWSTĘPNEGO PRZEDWZMACNIACZA WYWOŁANEGO PRZEZ PATOGENNĄ MUTACJĘ GENOWĄ APLIKACJI ZA POMOCĄ METODY SELFIE POŁĄCZONEJ Z MASOWYM SEKWENCJONOWANIEM RÓWNOLEGŁYM, A NASTĘPNIE WALIDACJĄ ZA POMOCĄ SELFIE-DPCR. WYNIKI POZWOLĄ NAM PRZECIWSTAWIĆ HIPOTEZĘ, ŻE REGULACJA MITOCHONDRIALNEGO DNA JEST KLUCZOWYM MECHANIZMEM W PROCESIE NEURODEGENERACYJNYM I ŻE JEGO NORMALIZACJA MOŻE ZAPOBIEC NEURODEGENERACJI. (Polish)
17 August 2022
0 references
Barcelona
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
SAF2017-89791-R
0 references