HOMEOSTASIS IONICA IN MODEL PLANTS AND INTERACTION WITH KEY MICROORGANISMS IN THE ADAPTATION OF PLANTS TO PROBLEMATIC SOILS (Q3136051)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3136051 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | HOMEOSTASIS IONICA IN MODEL PLANTS AND INTERACTION WITH KEY MICROORGANISMS IN THE ADAPTATION OF PLANTS TO PROBLEMATIC SOILS |
Project Q3136051 in Spain |
Statements
118,592.1 Euro
0 references
217,800.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 July 2017
0 references
UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA
0 references
8193
0 references
LA DEFICIENTE ADAPTACION DE MUCHAS PLANTAS DE CULTIVO A LAS CONDICIONES DE SUELOS CALCAREOS LIMITA LA PRODUCCION AGRARIA EN AMPLIAS ZONAS DEL MUNDO, ESPECIALMENTE EN REGIONES ARIDAS O SEMIARIDAS. LA ESCASA DISPONIBILIDAD DE HIERRO Y ZINC PARA LAS PLANTAS EN ESTOS SUELOS DIFICULTA A SU VEZ LA BIOFORTIFICACION DE LOS ALIMENTOS VEGETALES CON ESTOS NUTRIENTES ESENCIALES. LOS MECANISMOS RESPUESTA DE LAS PLANTAS AL DEFICIT DE FE Y DE ZN ESTAN YA BASTANTE BIEN ESTABLECIDOS. MAS LENTA RESULTA LA INTEGRACION PRACTICA DEL CONJUNTO DE ESTOS CONOCIMIENTOS GENETICO-MOLECULARES EN PRO DE LA MEJORA GENETICA DE LOS CULTIVOS Y DE SU GESTION SOSTENIBLE. MEJORAR LA ADAPTACION DE PLANTAS A SUELOS CALCAREOS ES UN PROBLEMA COMPLEJO QUE IMPLICA EFICIENCIA DE FE Y ZN, RESISTENCIA AL EXCESO DE CARBONATO CALCICO Y LA INTERACCION PLANTA-SUELO-MICROORGANISMOS. EL PRESENTE PROYECTO TIENE COMO FINALIDAD APORTAR INFORMACION CLAVE PARA ACELERAR LOS PROGRAMAS DE MEJORA GENETICA DIRIGIDOS A ESTA IMPORTANTE PROBLEMATICA Y AYUDAR EN LA GESTION SOSTENIBLE DE LOS CULTIVOS EN ESTE TIPO DE SUELOS. PARA ELLO NOS BASAMOS EN EL ESTUDIO DE LA VARIACION GENETICA NATURAL Y DE LOS MECANISMOS MOLECULARES Y FISIOLOGICOS DISTINTIVOS EN POBLACIONES SILVESTRES DE ARABIDOPSIS THALIANA ADAPTADAS A SUELOS DE CARACTERISTICAS CONTRASTADAS, SILICEOS VERSUS CALCAREOS, LOCALIZADOS EN ZONAS PROXIMAS EN EL NE PENINSULAR. DURANTE OTRO PROYECTO NUESTRO, FINANCIADO POR EL NIH DE EEUU, ¿THE GENETIC BASIS OF NATURAL IONOMIC VARIATION¿ ACERCA DE LA BASE GENETICA DE ADAPTACION DE POBLACIONES NATURALES COSTERAS AL ESTRES SALINO, OBSERVAMOS CASUALMENTE LA PREFERENCIA DE A. THALIANA POR SUELOS SILICEOS Y SU BAJA PRESENCIA EN SUELOS CALCAREOS. NUESTRA HIPOTESIS DE PARTIDA PARA EL PRESENTE PROYECTO ES QUE LA VARIACION NATURAL DE LA PLANTA A. THALIANA EN SUELOS CONTRASTADOS (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) ES UNA FUENTE IMPORTANTISIMA DE INFORMACION GENETICA PARA EL ESTUDIO DE LOS PROCESOS ADAPTATIVOS QUE PERMITEN A LAS PLANTAS HACER FRENTE A LAS CONDICIONES DE LOS SUELOS CALCAREOS. LA COLABORACION DE NUESTRO EQUIPO CON GRUPOS LIDERES EN ESTE CAMPO (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK Y PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, EEUU) NOS PERMITE FORMULAR LOS OBJETIVOS (O) CONCRETOS AGRUPADOS EN TRES HIPOTESIS DE TRABAJO (HT): HT1: EL CARBONATO CALCICO INHIBE LA DISTRIBUCION NATURAL DE A. THALIANA. O1: COMPROBAR LA RELACION INVERSA ENTRE LA DISTRIBUCION NATURAL DE A. THALIANA Y LA DISTRIBUCION DE SUELOS CALCAREOS. O2: SELECCIONAR, EN BASE A FENOTIPO, ECOTIPOS DE TOLERANCIA CONTRASTADA A SUELOS CALCAREOS. HT2: LAS EFICIENCIAS DE FE Y DE ZN SON CLAVE PARA LA ¿FITNESS¿ DE A. THALIANA EN SUELOS CALCAREOS. O3: COMPARACION DE RESPUESTA DE ECOTIPOS CONTRASTADOS A DEFICIT DE FE Y DE ZN, EN COMBINACION O NO CON CARBONATO CALCICO, A NIVEL FISIOLOGICO. O4: CARACTERIZACION DE LAS DIFERENCIAS GENICAS RESPONSABLES DEL COMPORTAMIENTO DIFERENCIAL MEDIANTE EL CRUCE ENTRE ECOTIPOS CONTRASTADOS Y LA IDENTIFICACION DE MARCADORES GENETICOS LIGADOS AL FENOTIPO TOLERANTE EN UNA POBLACION DE MAPEO F2 SEGREGANTE MEDIANTE "BULK SEGRAGATION ANALYSIS" BASADO EN "NEXT GENERATION SEQUENCING"(BSA-SEQ). HT3: EL ZN Y EL FE SON CLAVE EN LA INTERACCION PLANTA-SUELO-MICROORGANISMOS. O5. CARACTERIZACION DEL MICROBIOMA DE PLANTAS DE EFICIENCIA DIFERENCIAL DE FE Y DE ZN Y SU POSIBLE PAPEL EN LA MOVILIZACION DE NUTRIENTES. O6: REGULACION POR ZN Y MICROORGANISMOS DE RESPUESTAS DE CRECIMIENTO ADAPTATIVO Y DESARROLLO A TRAVES DE LA INTERACCION ZN-AUXINA. (Spanish)
0 references
THE POOR ADAPTATION OF MANY CULTIVATION PLANTS TO THE CONDITIONS OF CALCAREOUS SOIL LIMITS AGRICULTURAL PRODUCTION IN LARGE AREAS OF THE WORLD, ESPECIALLY IN ARIDAS OR SEMI-ARID REGIONS. THE LOW AVAILABILITY OF IRON AND ZINC FOR PLANTS IN THESE SOILS MAKES IT DIFFICULT FOR PLANT FOODS WITH THESE ESSENTIAL NUTRIENTS TO BE BIOFORTIFICATION. THE MECHANISMS OF RESPONSE OF PLANTS TO THE DEFICIT OF FAITH AND ZN ARE ALREADY WELL ESTABLISHED. SLOWER RESULTS THE PRACTICAL INTEGRATION OF ALL THESE GENETIC-MOLECULAR KNOWLEDGE IN FAVOR OF THE GENETIC IMPROVEMENT OF CROPS AND THEIR SUSTAINABLE MANAGEMENT. IMPROVING THE ADAPTATION OF PLANTS TO CALCAREOUS SOILS IS A COMPLEX PROBLEM THAT INVOLVES EFFICIENCY OF FAITH AND ZN, RESISTANCE TO EXCESS CALCIC CARBONATE AND THE INTERACTION PLANT-SOIL-MICROORGANISMS. THIS PROJECT AIMS TO PROVIDE KEY INFORMATION TO ACCELERATE GENETIC IMPROVEMENT PROGRAMS AIMED AT THIS IMPORTANT PROBLEM AND TO HELP IN THE SUSTAINABLE MANAGEMENT OF CROPS IN THIS TYPE OF SOIL. FOR THIS WE RELY ON THE STUDY OF NATURAL GENETIC VARIATION AND DISTINCTIVE MOLECULAR AND PHYSIOLOGICAL MECHANISMS IN WILD POPULATIONS OF ARABIDOPSIS THALIANA ADAPTED TO SOILS OF CONTRASTED, SILICEOUS VERSUS CALCAREOUS CHARACTERISTICS, LOCATED IN NEAR AREAS IN THE PENINSULAR NE. DURING ANOTHER PROJECT OF OURS, FUNDED BY THE US NIH, THE GENETIC BASIS OF NATURAL IONOMIC VARIATIONABOUT THE GENETIC BASIS OF ADAPTATION OF NATURAL COASTAL POPULATIONS TO THE SALINE STRESS, WE CASUALLY OBSERVED A. THALIANA’S PREFERENCE FOR SILICEOUS SOILS AND ITS LOW PRESENCE IN CALCAREOUS SOILS. OUR STARTING HYPOTHESIS FOR THIS PROJECT IS THAT THE NATURAL VARIATION OF PLANT A. THALIANA IN CONTRASTED SOILS (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) IS AN IMPORTANT SOURCE OF GENETIC INFORMATION FOR THE STUDY OF ADAPTIVE PROCESSES THAT ALLOW PLANTS TO COPE WITH THE CONDITIONS OF CALCAREOUS SOILS. THE COLLABORATION OF OUR TEAM WITH LEADING GROUPS IN THIS FIELD (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK AND PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) ALLOWS US TO FORMULATE CONCRETE OBJECTIVES (OR) GROUPED INTO THREE WORKING SCENARIOS (HT): HT1: CALCIC CARBONATE INHIBITS THE NATURAL DISTRIBUTION OF A. THALIANA. O1: CHECK THE INVERSE RELATIONSHIP BETWEEN THE NATURAL DISTRIBUTION OF A. THALIANA AND THE DISTRIBUTION OF CALCAREOUS SOILS. O2: SELECT, BASED ON PHENOTYPE, ECOTYPES OF PROVEN TOLERANCE TO CALCAREOUS SOILS. HT2: FAITH EFFICIENCIES AND ZN EFFICIENCIES ARE KEY TO A. THALIANA’S FITNESS IN CALCAREOUS SOILS. O3: COMPARISON OF RESPONSE OF CONTRASTED ECOTYPES TO FAITH DEFICIT AND ZN, WHETHER OR NOT COMBINED WITH CALCIC CARBONATE, AT PHYSIOLOGICAL LEVEL. O4: CHARACTERISATION OF THE GENICAS DIFFERENCES RESPONSIBLE FOR DIFFERENTIAL BEHAVIOR BY CROSSING CONTRASTED ECOTYPES AND IDENTIFYING GENETIC MARKERS LINKED TO THE TOLERANT PHENOTYPE IN A SEGREGATING F2 MAPPING POPULATION USING “BULK SEGRAGATION ANALYSIS” BASED ON “NEXT GENERATION SEQUENCING” (BSA-SEQ). HT3: ZN AND FAITH ARE KEY IN PLANT-SOIL-MICROORGANISMS INTERACTION. O5. CHARACTERISATION OF THE PLANT MICROBIOME OF DIFFERENTIAL EFFICIENCY OF FAITH AND ZN AND ITS POSSIBLE ROLE IN THE MOBILISATION OF NUTRIENTS. O6: ZN REGULATION AND MICROORGANISMS ADAPTIVE GROWTH RESPONSES AND DEVELOPMENT THROUGH ZN-AUXIN INTERACTION. (English)
12 October 2021
0.4882321783333106
0 references
LA MAUVAISE ADAPTATION DE NOMBREUSES PLANTES CULTIVÉES AUX CONDITIONS DU SOL CALCAIRE LIMITE LA PRODUCTION AGRICOLE DANS DE GRANDES RÉGIONS DU MONDE, EN PARTICULIER DANS LES RÉGIONS ARIDAS OU SEMI-ARIDES. LA FAIBLE DISPONIBILITÉ DU FER ET DU ZINC POUR LES PLANTES DANS CES SOLS REND DIFFICILE LA BIOFORTIFICATION POUR LES ALIMENTS CONTENANT CES ÉLÉMENTS NUTRITIFS ESSENTIELS. LES MÉCANISMES DE RÉPONSE DES PLANTES AU DÉFICIT DE FOI ET DE ZN SONT DÉJÀ BIEN ÉTABLIS. PLUS LENT RÉSULTAT L’INTÉGRATION PRATIQUE DE TOUTES CES CONNAISSANCES GÉNÉTIQUES-MOLÉCULAIRES EN FAVEUR DE L’AMÉLIORATION GÉNÉTIQUE DES CULTURES ET DE LEUR GESTION DURABLE. L’AMÉLIORATION DE L’ADAPTATION DES PLANTES AUX SOLS CALCAIRES EST UN PROBLÈME COMPLEXE QUI IMPLIQUE L’EFFICACITÉ DE LA FOI ET DU ZN, LA RÉSISTANCE À L’EXCÈS DE CARBONATE CALCIQUE ET L’INTERACTION PLANTE-SOL-MICRO-ORGANISMES. CE PROJET VISE À FOURNIR DES RENSEIGNEMENTS CLÉS POUR ACCÉLÉRER LES PROGRAMMES D’AMÉLIORATION GÉNÉTIQUE VISANT CE PROBLÈME IMPORTANT ET AIDER À LA GESTION DURABLE DES CULTURES DANS CE TYPE DE SOL. POUR CELA, NOUS NOUS APPUYONS SUR L’ÉTUDE DE LA VARIATION GÉNÉTIQUE NATURELLE ET DES MÉCANISMES MOLÉCULAIRES ET PHYSIOLOGIQUES DISTINCTIFS CHEZ DES POPULATIONS SAUVAGES D’ARABIDOPSIS THALIANA ADAPTÉES À DES SOLS DE CARACTÉRISTIQUES CONTRASTÉES, SILICEUSES ET CALCAIRES, SITUÉES DANS DES ZONES PROCHES DE LA PÉNINSULE. DANS LE CADRE D’UN AUTRE PROJET, FINANCÉ PAR LES NIH, LA BASE GÉNÉTIQUE DE LA VARIATION IONOMIQUE NATURELLE SANS LA BASE GÉNÉTIQUE DE L’ADAPTATION DES POPULATIONS CÔTIÈRES NATURELLES AU STRESS SALIN, NOUS AVONS OBSERVÉ OCCASIONNELLEMENT LA PRÉFÉRENCE D’A. THALIANA POUR LES SOLS SILICEUX ET SA FAIBLE PRÉSENCE DANS LES SOLS CALCAIRES. NOTRE HYPOTHÈSE DE DÉPART POUR CE PROJET EST QUE LA VARIATION NATURELLE DE LA PLANTE A. THALIANA DANS LES SOLS CONTRASTÉS (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) EST UNE SOURCE IMPORTANTE D’INFORMATION GÉNÉTIQUE POUR L’ÉTUDE DES PROCESSUS ADAPTATIFS QUI PERMETTENT AUX PLANTES DE FAIRE FACE AUX CONDITIONS DES SOLS CALCAIRES. LA COLLABORATION DE NOTRE ÉQUIPE AVEC LES PRINCIPAUX GROUPES DANS CE DOMAINE (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, ROYAUME-UNI ET PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, ÉTATS-UNIS) NOUS PERMET DE FORMULER DES OBJECTIFS CONCRETS (OU) REGROUPÉS EN TROIS SCÉNARIOS DE TRAVAIL (HT): HT1: LE CARBONATE CALCIQUE INHIBE LA DISTRIBUTION NATURELLE D’A. THALIANA. O1: VÉRIFIER LA RELATION INVERSE ENTRE LA DISTRIBUTION NATURELLE D’A. THALIANA ET LA DISTRIBUTION DES SOLS CALCAIRES. O2: SÉLECTIONNER, EN FONCTION DU PHÉNOTYPE, DES ÉCOTYPES DE TOLÉRANCE ÉPROUVÉE AUX SOLS CALCAIRES. HT2: L’EFFICACITÉ DE LA FOI ET L’EFFICACITÉ DE ZN SONT ESSENTIELLES À LA CONDITION PHYSIQUE D’A. THALIANA DANS LES SOLS CALCAIRES. O3: COMPARAISON DE LA RÉPONSE DES ÉCOTYPES CONTRASTÉS AU DÉFICIT DE FOI ET AU ZN, COMBINÉS OU NON AVEC DU CARBONATE CALCIQUE, AU NIVEAU PHYSIOLOGIQUE. O4: CARACTÉRISATION DES DIFFÉRENCES DE GENICAS RESPONSABLES DU COMPORTEMENT DIFFÉRENTIEL EN CROISANT DES ÉCOTYPES CONTRASTÉS ET EN IDENTIFIANT DES MARQUEURS GÉNÉTIQUES LIÉS AU PHÉNOTYPE TOLÉRANT DANS UNE POPULATION DE CARTOGRAPHIE F2 SÉGRÉGANTE À L’AIDE D’UNE «ANALYSE DE SÉGRAGATION EN VRAC» BASÉE SUR LE «SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION» (BSA-SEQ). HT3: ZN ET LA FOI SONT CLÉS DANS L’INTERACTION PLANTE-SOL-MICRO-ORGANISMES. O5. CARACTÉRISATION DU MICROBIOME VÉGÉTAL DE L’EFFICACITÉ DIFFÉRENTIELLE DE LA FOI ET DU ZN ET SON RÔLE POSSIBLE DANS LA MOBILISATION DES NUTRIMENTS. O6: ZN RÉGLEMENTATION ET LES MICRO-ORGANISMES ADAPTENT LES RÉPONSES DE CROISSANCE ET LE DÉVELOPPEMENT PAR L’INTERACTION ZN-AUXIN. (French)
2 December 2021
0 references
DIE SCHLECHTE ANPASSUNG VIELER ANBAUPFLANZEN AN DIE BEDINGUNGEN DES KALKHALTIGEN BODENS BEGRENZT DIE LANDWIRTSCHAFTLICHE PRODUKTION IN GROSSEN GEBIETEN DER WELT, INSBESONDERE IN ARIDAS ODER HALBARIDEN REGIONEN. DIE GERINGE VERFÜGBARKEIT VON EISEN UND ZINK FÜR PFLANZEN IN DIESEN BÖDEN MACHT ES FÜR PFLANZEN MIT DIESEN ESSENTIELLEN NÄHRSTOFFEN SCHWIERIG, EINE BIOBEFESTIGUNG ZU SEIN. DIE MECHANISMEN DER REAKTION DER PFLANZEN AUF DAS DEFIZIT DES GLAUBENS UND ZN SIND BEREITS GUT ETABLIERT. LANGSAMERE ERGEBNISSE DIE PRAKTISCHE INTEGRATION ALL DIESER GENETISCH-MOLEKULAREN KENNTNISSE ZUGUNSTEN DER GENETISCHEN VERBESSERUNG DER KULTUREN UND IHRER NACHHALTIGEN BEWIRTSCHAFTUNG. DIE VERBESSERUNG DER ANPASSUNG VON PFLANZEN AN KALKHALTIGE BÖDEN IST EIN KOMPLEXES PROBLEM, DAS EFFIZIENZ VON GLAUBEN UND ZN, WIDERSTAND GEGEN ÜBERSCHÜSSIGE KALKKARBONAT UND DIE WECHSELWIRKUNG VON PFLANZENÖL-MIKROORGANISMEN BEINHALTET. ZIEL DIESES PROJEKTS IST ES, WICHTIGE INFORMATIONEN BEREITZUSTELLEN, UM PROGRAMME ZUR GENETISCHEN VERBESSERUNG, DIE AUF DIESES WICHTIGE PROBLEM ABZIELEN, ZU BESCHLEUNIGEN UND BEI DER NACHHALTIGEN BEWIRTSCHAFTUNG DER KULTUREN IN DIESER ART VON BODEN ZU HELFEN. DAZU SETZEN WIR AUF DIE UNTERSUCHUNG DER NATÜRLICHEN GENETISCHEN VARIATION UND DER CHARAKTERISTISCHEN MOLEKULAREN UND PHYSIOLOGISCHEN MECHANISMEN IN WILDEN POPULATIONEN VON ARABIDOPSIS THALIANA, DIE AN BÖDEN KONTRASTIERTER, KIESELIGER UND KALKHALTIGER EIGENSCHAFTEN ANGEPASST SIND, DIE SICH IN NAHEN GEBIETEN AUF DER HALBINSEL BEFINDEN. IN EINEM ANDEREN PROJEKT VON UNS, DAS VON UNS FINANZIERT WIRD, DIE GENETISCHE GRUNDLAGE DER NATÜRLICHEN IONOMIC VARIATIONABOUT DIE GENETISCHE GRUNDLAGE DER ANPASSUNG DER NATÜRLICHEN KÜSTENPOPULATIONEN AN DEN SALZSTRESS, HABEN WIR ZUFÄLLIG A. THALIANAS PRÄFERENZ FÜR KIESELIGE BÖDEN UND SEINE GERINGE PRÄSENZ IN KALKHALTIGEN BÖDEN BEOBACHTET. UNSERE AUSGANGSHYPOTHESE FÜR DIESES PROJEKT IST, DASS DIE NATÜRLICHE VARIATION DER PFLANZE A. THALIANA IN KONTRASTIERTEN BÖDEN (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) EINE WICHTIGE QUELLE FÜR GENETISCHE INFORMATIONEN FÜR DIE UNTERSUCHUNG ADAPTIVER PROZESSE IST, DIE ES PFLANZEN ERMÖGLICHEN, DIE BEDINGUNGEN VON KALKHALTIGEN BÖDEN ZU BEWÄLTIGEN. DIE ZUSAMMENARBEIT UNSERES TEAMS MIT FÜHRENDEN GRUPPEN IN DIESEM BEREICH (PROF. D.E. SALZ UNIV. ABERDEEN, UK UND PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) ERMÖGLICHEN ES UNS, KONKRETE ZIELE (ODER) IN DREI ARBEITSSZENARIEN (HT) ZU FORMULIEREN: HT1: KALKCARBONAT HEMMT DIE NATÜRLICHE VERTEILUNG VON A. THALIANA. O1: ÜBERPRÜFEN SIE DIE UMGEKEHRTE BEZIEHUNG ZWISCHEN DER NATÜRLICHEN VERTEILUNG VON A. THALIANA UND DER VERTEILUNG VON KALKHALTIGEN BÖDEN. O2: WÄHLEN SIE ANHAND DES PHÄNOTYPS ÖKOTYPEN DER NACHGEWIESENEN TOLERANZ GEGENÜBER KALKHALTIGEN BÖDEN AUS. HT2: GLAUBENSEFFIZIENZEN UND ZN-EFFIZIENZEN SIND DER SCHLÜSSEL ZUR FITNESS VON A. THALIANA IN KALKHALTIGEN BÖDEN. O3: VERGLEICH DER REAKTION VON KONTRASTIERTEN ÖKOTYPEN AUF GLAUBENSDEFIZIT UND ZN, AUCH KOMBINIERT MIT KALKKARBONAT, AUF PHYSIOLOGISCHER EBENE. O4: CHARAKTERISIERUNG DER GENICAS-UNTERSCHIEDE, DIE FÜR DAS DIFFERENTIALVERHALTEN VERANTWORTLICH SIND, INDEM MAN KONTRASTIERTE ÖKOTYPEN KREUZT UND GENETISCHE MARKER IDENTIFIZIERT, DIE MIT DEM TOLERANTEN PHÄNOTYP VERBUNDEN SIND, IN EINER SEGREGIERENDEN F2-MAPPING-BEVÖLKERUNG UNTER VERWENDUNG VON „BULK SEGRAGATION ANALYSIS“ BASIEREND AUF DER „NEXT GENERATION SEQUENCING“ (BSA-SEQ). HT3: ZN UND GLAUBE SIND DER SCHLÜSSEL ZUR WECHSELWIRKUNG VON PFLANZENÖL-MIKROORGANISMEN. O5. CHARAKTERISIERUNG DES PFLANZENMIKROBIOMS DER DIFFERENTIALEFFIZIENZ VON GLAUBEN UND ZN UND SEINER MÖGLICHEN ROLLE BEI DER MOBILISIERUNG VON NÄHRSTOFFEN. O6: ZN REGULATION UND MIKROORGANISMEN ADAPTIVE WACHSTUMSREAKTIONEN UND ENTWICKLUNG DURCH ZN-AUXIN INTERAKTION. (German)
9 December 2021
0 references
DE SLECHTE AANPASSING VAN VEEL TEELTGEWASSEN AAN DE OMSTANDIGHEDEN VAN DE KALKHOUDENDE BODEM BEPERKT DE LANDBOUWPRODUCTIE IN GROTE DELEN VAN DE WERELD, MET NAME IN ARIDAS OF SEMI-ARIDE GEBIEDEN. DE GERINGE BESCHIKBAARHEID VAN IJZER EN ZINK VOOR PLANTEN IN DEZE BODEMS MAAKT HET VOOR PLANTENVOEDING MET DEZE ESSENTIËLE VOEDINGSSTOFFEN MOEILIJK OM BIOFORTIFICATIE TE ZIJN. DE MECHANISMEN VAN REACTIE VAN PLANTEN OP HET GEBREK AAN GELOOF EN ZN ZIJN REEDS GOED OPGEZET. LANGZAMER RESULTEERT DE PRAKTISCHE INTEGRATIE VAN AL DEZE GENETISCHE-MOLECULAIRE KENNIS TEN GUNSTE VAN DE GENETISCHE VERBETERING VAN GEWASSEN EN HUN DUURZAAM BEHEER. HET VERBETEREN VAN DE AANPASSING VAN PLANTEN AAN KALKHOUDENDE BODEMS IS EEN COMPLEX PROBLEEM DAT DE EFFICIËNTIE VAN GELOOF EN ZN, WEERSTAND TEGEN OVERTOLLIG CALCIUMCARBONAAT EN DE INTERACTIE PLANT-BODEM-MICRO-ORGANISMEN OMVAT. DIT PROJECT IS BEDOELD OM BELANGRIJKE INFORMATIE TE VERSTREKKEN OM GENETISCHE VERBETERINGSPROGRAMMA’S TE VERSNELLEN DIE GERICHT ZIJN OP DIT BELANGRIJKE PROBLEEM EN OM TE HELPEN BIJ HET DUURZAME BEHEER VAN GEWASSEN IN DIT SOORT BODEM. HIERVOOR STEUNEN WIJ OP DE STUDIE VAN NATUURLIJKE GENETISCHE VARIATIE EN ONDERSCHEIDENDE MOLECULAIRE EN FYSIOLOGISCHE MECHANISMEN IN WILDE POPULATIES VAN ARABIDOPSIS THALIANA AANGEPAST AAN BODEMS VAN CONTRASTERENDE, KIEZELACHTIGE VERSUS KALKHOUDENDE EIGENSCHAPPEN, GELEGEN IN DE BUURT VAN GEBIEDEN IN HET SCHIEREILAND NE. TIJDENS EEN ANDER PROJECT VAN ONS, GEFINANCIERD DOOR DE ONS NIH, DE GENETISCHE BASIS VAN NATUURLIJKE IONOMISCHE VARIATIONABOUT DE GENETISCHE BASIS VAN AANPASSING VAN NATUURLIJKE KUSTPOPULATIES AAN DE ZOUTE STRESS, ZAGEN WE TERLOOPS DE VOORKEUR VAN A. THALIANA VOOR KIEZELACHTIGE BODEMS EN DE LAGE AANWEZIGHEID ERVAN IN KALKHOUDENDE BODEMS. ONZE UITGANGSPUNT VOOR DIT PROJECT IS DAT DE NATUURLIJKE VARIATIE VAN PLANT A. THALIANA IN CONTRASTERENDE BODEMS (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) EEN BELANGRIJKE BRON VAN GENETISCHE INFORMATIE IS VOOR DE STUDIE VAN ADAPTIEVE PROCESSEN DIE PLANTEN IN STAAT STELLEN OM TE GAAN MET DE OMSTANDIGHEDEN VAN KALKHOUDENDE BODEMS. DE SAMENWERKING VAN ONS TEAM MET TOONAANGEVENDE GROEPEN OP DIT GEBIED (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK EN PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, VS) STELT ONS IN STAAT OM CONCRETE DOELSTELLINGEN TE FORMULEREN (OF) GEGROEPEERD IN DRIE WERKSCENARIO’S (HT): HT1: CALCICCARBONAAT REMT DE NATUURLIJKE VERDELING VAN A. THALIANA. O1: CONTROLEER DE OMGEKEERDE RELATIE TUSSEN DE NATUURLIJKE VERDELING VAN A. THALIANA EN DE VERDELING VAN KALKHOUDENDE BODEMS. O2: SELECTEER, OP BASIS VAN FENOTYPE, ECOTYPES VAN BEWEZEN TOLERANTIE VOOR KALKHOUDENDE BODEMS. HT2: GELOOFSEFFICIËNTIE EN ZN-EFFICIËNTIE ZIJN DE SLEUTEL TOT DE GESCHIKTHEID VAN A. THALIANA IN KALKHOUDENDE BODEMS. O3: VERGELIJKING VAN DE RESPONS VAN CONTRASTERENDE ECOTYPEN OP GELOOFSTEKORT EN ZN, AL DAN NIET GECOMBINEERD MET CALCICCARBONAAT, OP FYSIOLOGISCH NIVEAU. O4: KARAKTERISERING VAN DE GENICAS-VERSCHILLEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR DIFFERENTIEEL GEDRAG DOOR CONTRASTERENDE ECOTYPEN TE KRUISEN EN GENETISCHE MARKERS TE IDENTIFICEREN DIE GEKOPPELD ZIJN AAN HET TOLERANTE FENOTYPE IN EEN GESCHEIDEN F2-MAPPINGSPOPULATIE MET BEHULP VAN „BULK SEGRAGATION ANALYSIS” OP BASIS VAN „NEXT GENERATION SEQUENCING” (BSA-SEQ). HT3: ZN EN GELOOF ZIJN DE SLEUTEL TOT DE INTERACTIE TUSSEN PLANTEN-BODEM-MICRO-ORGANISMEN. O5. KARAKTERISERING VAN HET PLANTENMICROBIOOM VAN DIFFERENTIËLE EFFICIËNTIE VAN GELOOF EN ZN EN ZIJN MOGELIJKE ROL IN DE MOBILISATIE VAN VOEDINGSSTOFFEN. O6: ZN VERORDENING EN MICRO-ORGANISMEN ADAPTIEVE GROEIREACTIES EN ONTWIKKELING DOOR ZN-AUXIN INTERACTIE. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LO SCARSO ADATTAMENTO DI MOLTE PIANTE DI COLTIVAZIONE ALLE CONDIZIONI DEL SUOLO CALCAREO LIMITA LA PRODUZIONE AGRICOLA IN VASTE AREE DEL MONDO, IN PARTICOLARE NELLE REGIONI ARIDAS O SEMI-ARIDE. LA SCARSA DISPONIBILITÀ DI FERRO E ZINCO PER LE PIANTE IN QUESTI TERRENI RENDE DIFFICILE PER GLI ALIMENTI VEGETALI CON QUESTI NUTRIENTI ESSENZIALI ESSERE BIOFORTIFICAZIONE. I MECCANISMI DI RISPOSTA DELLE PIANTE AL DEFICIT DI FEDE E ZN SONO GIÀ BEN STABILITI. PIÙ LENTO RISULTA L'INTEGRAZIONE PRATICA DI TUTTE QUESTE CONOSCENZE GENETICHE-MOLECOLARI A FAVORE DEL MIGLIORAMENTO GENETICO DELLE COLTURE E DELLA LORO GESTIONE SOSTENIBILE. MIGLIORARE L'ADATTAMENTO DELLE PIANTE AI SUOLI CALCAREI È UN PROBLEMA COMPLESSO CHE COMPORTA L'EFFICIENZA DELLA FEDE E DELLO ZN, LA RESISTENZA ALL'ECCESSO DI CARBONATO CALCICO E L'INTERAZIONE TRA PIANTE E MICRORGANISMI. QUESTO PROGETTO MIRA A FORNIRE INFORMAZIONI CHIAVE PER ACCELERARE I PROGRAMMI DI MIGLIORAMENTO GENETICO VOLTI A QUESTO IMPORTANTE PROBLEMA E PER CONTRIBUIRE ALLA GESTIONE SOSTENIBILE DELLE COLTURE IN QUESTO TIPO DI SUOLO. PER QUESTO CI AFFIDIAMO ALLO STUDIO DELLA VARIAZIONE GENETICA NATURALE E DEI MECCANISMI MOLECOLARI E FISIOLOGICI DISTINTIVI NELLE POPOLAZIONI SELVATICHE DI ARABIDOPSIS THALIANA ADATTATE A SUOLI DI CARATTERISTICHE CONTRASTATE, SILICEE E CALCAREE, SITUATE IN ZONE VICINE AL NE PENINSULARE. DURANTE UN ALTRO NOSTRO PROGETTO, FINANZIATO DA NOI NIH, LA BASE GENETICA DELLA VARIAZIONE IONOMICA NATURALE, ABBIAMO OSSERVATO CASUALMENTE LA PREFERENZA DI A. THALIANA PER I SUOLI SILICEI E LA SUA BASSA PRESENZA IN SUOLI CALCAREI. LA NOSTRA IPOTESI DI PARTENZA PER QUESTO PROGETTO È CHE LA VARIAZIONE NATURALE DELLA PIANTA A. THALIANA IN TERRENI CONTRASTATI (SILICEOS CONTRO CALCAREOS) SIA UN'IMPORTANTE FONTE DI INFORMAZIONE GENETICA PER LO STUDIO DEI PROCESSI ADATTATIVI CHE PERMETTONO ALLE PIANTE DI FAR FRONTE ALLE CONDIZIONI DEI SUOLI CALCAREI. LA COLLABORAZIONE DEL NOSTRO TEAM CON GRUPPI LEADER IN QUESTO CAMPO (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK E PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) CI PERMETTE DI FORMULARE OBIETTIVI CONCRETI (O) RAGGRUPPATI IN TRE SCENARI DI LAVORO (HT): HT1: IL CARBONATO CALCICO INIBISCE LA DISTRIBUZIONE NATURALE DI A. THALIANA. O1: VERIFICARE IL RAPPORTO INVERSO TRA LA DISTRIBUZIONE NATURALE DI A. THALIANA E LA DISTRIBUZIONE DEI SUOLI CALCAREI. O2: SELEZIONARE, IN BASE AL FENOTIPO, ECOTIPI DI COMPROVATA TOLLERANZA AI SUOLI CALCAREI. HT2: LE EFFICIENZE DI FEDE E LE EFFICIENZE ZN SONO FONDAMENTALI PER IL FITNESS DI A. THALIANA NEI SUOLI CALCAREI. O3: CONFRONTO DELLA RISPOSTA DEGLI ECOTIPI CONTRASTATI AL DEFICIT DI FEDE E ZN, COMBINATO O MENO CON CARBONATO CALCICO, A LIVELLO FISIOLOGICO. O4: CARATTERIZZAZIONE DELLE DIFFERENZE GENICAS RESPONSABILI DEL COMPORTAMENTO DIFFERENZIALE ATTRAVERSO L'INCROCIO DI ECOTIPI CONTRASTATI E L'IDENTIFICAZIONE DI MARCATORI GENETICI LEGATI AL FENOTIPO TOLLERANTE IN UNA POPOLAZIONE DI MAPPATURA F2 SEGREGANTE UTILIZZANDO "ANALISI DI SEGRAGAZIONE DI MASSA" BASATA SUL "SEQUENZIAMENTO DELLA GENERAZIONE SUCCESSIVA" (BSA-SEQ). HT3: LO ZN E LA FEDE SONO FONDAMENTALI NELL'INTERAZIONE TRA PIANTE E MICRORGANISMI. O5. CARATTERIZZAZIONE DEL MICROBIOMA VEGETALE DI EFFICIENZA DIFFERENZIALE DELLA FEDE E ZN E IL SUO POSSIBILE RUOLO NELLA MOBILIZZAZIONE DEI NUTRIENTI. O6: ZN REGOLAZIONE E MICRORGANISMI RISPOSTE DI CRESCITA ADATTATIVE E SVILUPPO ATTRAVERSO L'INTERAZIONE ZN-AUXINA. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η ΑΝΕΠΑΡΚΉΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΠΟΛΛΏΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΗΤΙΚΏΝ ΦΥΤΏΝ ΣΤΙΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΤΟΥ ΑΣΒΕΣΤΟΛΙΘΙΚΟΎ ΕΔΆΦΟΥΣ ΠΕΡΙΟΡΊΖΕΙ ΤΗ ΓΕΩΡΓΙΚΉ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΣΕ ΜΕΓΆΛΕΣ ΠΕΡΙΟΧΈΣ ΤΟΥ ΚΌΣΜΟΥ, ΙΔΊΩΣ ΣΤΟΝ ΑΡΙΔΆ Ή ΣΕ ΗΜΙΆΓΟΝΕΣ ΠΕΡΙΟΧΈΣ. Η ΧΑΜΗΛΉ ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ ΣΙΔΉΡΟΥ ΚΑΙ ΨΕΥΔΑΡΓΎΡΟΥ ΓΙΑ ΤΑ ΦΥΤΆ ΣΕ ΑΥΤΆ ΤΑ ΕΔΆΦΗ ΚΑΘΙΣΤΆ ΔΎΣΚΟΛΗ ΤΗ ΒΙΟΕΝΊΣΧΥΣΗ ΤΩΝ ΦΥΤΙΚΏΝ ΤΡΟΦΊΜΩΝ ΜΕ ΑΥΤΆ ΤΑ ΒΑΣΙΚΆ ΘΡΕΠΤΙΚΆ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ. ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΑΝΤΊΔΡΑΣΗΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΣΤΟ ΈΛΛΕΙΜΜΑ ΠΊΣΤΗΣ ΚΑΙ ZN ΕΊΝΑΙ ΉΔΗ ΚΑΛΆ ΚΑΘΙΕΡΩΜΈΝΟΙ. ΒΡΑΔΎΤΕΡΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ Η ΠΡΑΚΤΙΚΉ ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΌΛΩΝ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ-ΜΟΡΙΑΚΏΝ ΓΝΏΣΕΩΝ ΥΠΈΡ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΒΕΛΤΊΩΣΗΣ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ ΚΑΙ ΤΗΣ ΒΙΏΣΙΜΗΣ ΔΙΑΧΕΊΡΙΣΉΣ ΤΟΥΣ. Η ΒΕΛΤΊΩΣΗ ΤΗΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΣΤΑ ΑΣΒΕΣΤΟΛΙΘΙΚΆ ΕΔΆΦΗ ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΣΎΝΘΕΤΟ ΠΡΌΒΛΗΜΑ ΠΟΥ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΤΗΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ ΤΗΣ ΠΊΣΤΗΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ZN, ΤΗΝ ΑΝΤΟΧΉ ΣΕ ΠΕΡΊΣΣΕΙΑ ΑΝΘΡΑΚΙΚΟΎ ΑΣΒΕΣΤΊΟΥ ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΦΥΤΟ-ΈΔΑΦΟΥ-ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΈΧΕΙ ΩΣ ΣΤΌΧΟ ΤΗΝ ΠΑΡΟΧΉ ΒΑΣΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΤΆΧΥΝΣΗ ΤΩΝ ΠΡΟΓΡΑΜΜΆΤΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΒΕΛΤΊΩΣΗΣ ΠΟΥ ΣΤΟΧΕΎΟΥΝ ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΠΡΌΒΛΗΜΑ ΚΑΙ ΤΗ ΣΥΜΒΟΛΉ ΣΤΗ ΒΙΏΣΙΜΗ ΔΙΑΧΕΊΡΙΣΗ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΕΊΔΟΣ ΕΔΆΦΟΥΣ. ΓΙ’ ΑΥΤΌ ΒΑΣΙΖΌΜΑΣΤΕ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΦΥΣΙΚΏΝ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΔΙΑΚΥΜΆΝΣΕΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΙΑΚΡΙΤΏΝ ΜΟΡΙΑΚΏΝ ΚΑΙ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΣΕ ΆΓΡΙΟΥΣ ΠΛΗΘΥΣΜΟΎΣ ΤΗΣ ARABIDOPSIS THALIANA ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΜΈΝΩΝ ΣΕ ΕΔΆΦΗ ΑΝΤΙΚΡΟΥΌΜΕΝΩΝ, ΠΥΡΙΤΙΚΏΝ ΈΝΑΝΤΙ ΑΣΒΕΣΤΟΛΙΘΙΚΏΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΏΝ, ΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΚΟΝΤΙΝΈΣ ΠΕΡΙΟΧΈΣ ΣΤΗ ΧΕΡΣΌΝΗΣΟ. ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΕΝΌΣ ΆΛΛΟΥ ΈΡΓΟΥ ΜΑΣ, ΠΟΥ ΧΡΗΜΑΤΟΔΟΤΉΘΗΚΕ ΑΠΌ ΕΜΆΣ ΤΗ ΝΙΗ, ΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΒΆΣΗ ΤΗΣ ΦΥΣΙΚΉΣ ΙΟΝΙΚΗΣ ΒΑΘΜΙΚΗΣ ΕΚΘΕΣΗΣ, ΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΒΆΣΗ ΤΗΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΤΩΝ ΦΥΣΙΚΏΝ ΠΑΡΆΚΤΙΩΝ ΠΛΗΘΥΣΜΏΝ ΣΤΟ ΑΛΑΤΟΎΧΟ ΣΤΡΕΣ, ΠΑΡΑΤΗΡΉΣΑΜΕ ΠΕΡΙΣΤΑΣΙΑΚΆ ΤΗΝ ΠΡΟΤΊΜΗΣΗ ΤΟΥ Α. ΘΑΛΙΑΝΆ ΓΙΑ ΠΥΡΙΤΙΚΆ ΕΔΆΦΗ ΚΑΙ ΤΗ ΧΑΜΗΛΉ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΤΟΥ ΣΕ ΑΣΒΕΣΤΟΎΧΑ ΕΔΆΦΗ. Η ΑΡΧΙΚΉ ΜΑΣ ΥΠΌΘΕΣΗ ΓΙΑ ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΕΊΝΑΙ ΌΤΙ Η ΦΥΣΙΚΉ ΠΟΙΚΙΛΊΑ ΤΟΥ ΦΥΤΟΎ A. THALIANA ΣΕ ΑΝΤΙΠΑΡΑΤΙΘΈΜΕΝΑ ΕΔΆΦΗ (SILICEOS ΈΝΑΝΤΙ CALCAREOS) ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΣΗΜΑΝΤΙΚΉ ΠΗΓΉ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΙΚΏΝ ΔΙΕΡΓΑΣΙΏΝ ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΟΥΝ ΣΤΑ ΦΥΤΆ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΊΣΟΥΝ ΤΙΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΤΩΝ ΑΣΒΕΣΤΟΛΙΘΙΚΏΝ ΕΔΑΦΏΝ. Η ΣΥΝΕΡΓΑΣΊΑ ΤΗΣ ΟΜΆΔΑΣ ΜΑΣ ΜΕ ΚΟΡΥΦΑΊΕΣ ΟΜΆΔΕΣ ΣΕ ΑΥΤΌΝ ΤΟΝ ΤΟΜΈΑ (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK ΚΑΙ PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, ΗΠΑ) ΜΑΣ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΝΑ ΔΙΑΤΥΠΏΣΟΥΜΕ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ (Ή) ΟΜΑΔΟΠΟΙΗΜΈΝΟΥΣ ΣΕ ΤΡΊΑ ΣΕΝΆΡΙΑ ΕΡΓΑΣΊΑΣ (HT): HT1: ΤΟ ΑΝΘΡΑΚΙΚΌ ΑΣΒΈΣΤΙΟ ΑΝΑΣΤΈΛΛΕΙ ΤΗ ΦΥΣΙΚΉ ΚΑΤΑΝΟΜΉ ΤΟΥ A. THALIANA. O1: ΕΛΈΓΞΤΕ ΤΗΝ ΑΝΤΊΣΤΡΟΦΗ ΣΧΈΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΤΗΣ ΦΥΣΙΚΉΣ ΚΑΤΑΝΟΜΉΣ ΤΟΥ A. THALIANA ΚΑΙ ΤΗΣ ΚΑΤΑΝΟΜΉΣ ΤΩΝ ΑΣΒΕΣΤΟΛΙΘΙΚΏΝ ΕΔΑΦΏΝ. O2: ΕΠΙΛΈΞΤΕ, ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΟΝ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟ, ΟΙΚΟΤΎΠΟΥΣ ΑΠΟΔΕΔΕΙΓΜΈΝΗΣ ΑΝΟΧΉΣ ΣΤΑ ΑΣΒΕΣΤΟΛΙΘΙΚΆ ΕΔΆΦΗ. HT2: Η ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ ΤΗΣ ΠΊΣΤΗΣ ΚΑΙ Η ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ZN ΕΊΝΑΙ ΤΟ ΚΛΕΙΔΊ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΛΛΗΛΌΤΗΤΑ ΤΗΣ A. THALIANA ΣΕ ΑΣΒΕΣΤΟΎΧΑ ΕΔΆΦΗ. O3: ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΤΗΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ ΤΩΝ ΟΙΚΟΤΎΠΩΝ ΣΕ ΑΝΤΊΘΕΣΗ ΜΕ ΤΗΝ ΈΛΛΕΙΨΗ ΠΊΣΤΗΣ ΚΑΙ ZN, ΕΊΤΕ ΣΥΝΔΥΆΖΕΤΑΙ ΕΊΤΕ ΌΧΙ ΜΕ ΑΝΘΡΑΚΙΚΌ ΑΣΒΈΣΤΙΟ, ΣΕ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ. O4: ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΟΡΏΝ GENICAS ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΕΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΑΦΟΡΙΚΉ ΣΥΜΠΕΡΙΦΟΡΆ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΔΙΑΣΤΑΎΡΩΣΗΣ ΤΩΝ ΟΙΚΟΤΎΠΩΝ ΚΑΙ ΤΟΥ ΕΝΤΟΠΙΣΜΟΎ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΔΕΙΚΤΏΝ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΟΝ ΑΝΕΚΤΙΚΌ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟ ΣΕ ΈΝΑΝ ΔΙΑΧΩΡΙΣΤΙΚΌ ΠΛΗΘΥΣΜΌ ΧΑΡΤΟΓΡΆΦΗΣΗΣ F2 ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ «ΑΝΑΛΎΣΕΩΝ ΔΙΑΛΟΓΉΣ ΧΎΔΗΝ» ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΗΝ «ΔΙΑΛΟΓΙΚΉ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΕΠΌΜΕΝΗΣ ΓΕΝΙΆΣ» (BSA-SEQ). HT3: ZN ΚΑΙ Η ΠΊΣΤΗ ΕΊΝΑΙ ΤΟ ΚΛΕΙΔΊ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΦΥΤΟ-ΈΔΑΦΟΣ-ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ. O5. ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌΣ ΤΟΥ ΦΥΤΙΚΟΎ ΜΙΚΡΟΒΙΏΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΔΙΑΦΟΡΙΚΉΣ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΤΗΣ ΠΊΣΤΗΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ZN ΚΑΙ ΤΟΥ ΠΙΘΑΝΟΎ ΡΌΛΟΥ ΤΟΥ ΣΤΗΝ ΚΙΝΗΤΟΠΟΊΗΣΗ ΤΩΝ ΘΡΕΠΤΙΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ. Ο6: ZN REGULATION ΚΑΙ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΊ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΙΚΈΣ ΑΥΞΗΤΙΚΈΣ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΙΣ ΚΑΙ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ZN-AUXIN. (Greek)
17 August 2022
0 references
DEN RINGE TILPASNING AF MANGE DYRKNINGSPLANTER TIL BETINGELSERNE FOR KALKHOLDIG JORD BEGRÆNSER LANDBRUGSPRODUKTIONEN I STORE DELE AF VERDEN, ISÆR I ARIDAS ELLER SEMI-ARIDOMRÅDER. DEN RINGE TILGÆNGELIGHED AF JERN OG ZINK TIL PLANTER I DISSE JORDER GØR DET VANSKELIGT FOR PLANTEFØDEVARER MED DISSE ESSENTIELLE NÆRINGSSTOFFER AT VÆRE BIOFORTIFICERING. MEKANISMERNE FOR PLANTERS REAKTION PÅ TROSUNDERSKUD OG ZN ER ALLEREDE VELETABLEREDE. LANGSOMMERE RESULTATER DEN PRAKTISKE INTEGRATION AF AL DISSE GENETISK-MOLEKYLÆRE VIDEN TIL FORDEL FOR DEN GENETISKE FORBEDRING AF AFGRØDER OG DERES BÆREDYGTIGE FORVALTNING. FORBEDRING AF PLANTERNES TILPASNING TIL KALKHOLDIG JORD ER ET KOMPLEKST PROBLEM, DER INVOLVERER EFFEKTIVITET AF TRO OG ZN, RESISTENS OVER FOR OVERSKYDENDE KALCIUMCARBONAT OG VEKSELVIRKNINGEN PLANTE-JORD-MIKROORGANISMER. DETTE PROJEKT HAR TIL FORMÅL AT GIVE VIGTIGE OPLYSNINGER TIL AT FREMSKYNDE GENETISKE FORBEDRINGSPROGRAMMER RETTET MOD DETTE VIGTIGE PROBLEM OG AT HJÆLPE MED BÆREDYGTIG FORVALTNING AF AFGRØDER I DENNE TYPE JORD. TIL DETTE ER VI AFHÆNGIGE AF UNDERSØGELSEN AF NATURLIGE GENETISKE VARIATIONER OG KARAKTERISTISKE MOLEKYLÆRE OG FYSIOLOGISKE MEKANISMER I VILDE POPULATIONER AF ARABIDOPSIS THALIANA TILPASSET JORDER MED KONTRASTEREDE, SILICEOUS VERSUS KALKHOLDIGE EGENSKABER, DER LIGGER I NÆRHEDEN AF OMRÅDER I HALVØEN NE. UNDER ET ANDET PROJEKT AF VORES, FINANSIERET AF OS NIH, DET GENETISKE GRUNDLAG FOR NATURLIGE IONOMIC VARIATIONABOUT DET GENETISKE GRUNDLAG FOR TILPASNING AF NATURLIGE KYSTPOPULATIONER TIL SALTVAND STRESS, VI TILFÆLDIGT OBSERVERET A. THALIANA "S PRÆFERENCE FOR KISELHOLDIGE JORDER OG DENS LAVE TILSTEDEVÆRELSE I KALKHOLDIGE JORDER. VORES UDGANGSPUNKT FOR DETTE PROJEKT ER, AT DEN NATURLIGE VARIATION AF PLANTE A. THALIANA I MODSÆTNING TIL JORD (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) ER EN VIGTIG KILDE TIL GENETISK INFORMATION TIL STUDIET AF ADAPTIVE PROCESSER, DER GØR DET MULIGT FOR PLANTER AT KLARE BETINGELSERNE FOR KALKHOLDIG JORD. SAMARBEJDET MELLEM VORES TEAM MED FØRENDE GRUPPER PÅ DETTE OMRÅDE (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK OG PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) GIVER OS MULIGHED FOR AT FORMULERE KONKRETE MÅL (ELLER) GRUPPERET I TRE ARBEJDSSCENARIER (HT): HT1: KALCIUMCARBONAT HÆMMER DEN NATURLIGE DISTRIBUTION AF A. THALIANA. O1: KONTROLLÉR DET OMVENDTE FORHOLD MELLEM DEN NATURLIGE FORDELING AF A. THALIANA OG FORDELINGEN AF KALKHOLDIG JORD. O2: VÆLG, BASERET PÅ FÆNOTYPE, ØKOTYPER AF DOKUMENTERET TOLERANCE OVER FOR KALKHOLDIG JORD. HT2: EFFEKTIVITETSGEVINSTER I TROEN OG ZN-EFFEKTIVITET ER NØGLEN TIL A. THALIANAS EGNETHED I KALKHOLDIG JORD. O3: SAMMENLIGNING AF RESPONS AF KONTRASTEREDE ØKOTYPER TIL TRO UNDERSKUD OG ZN, UANSET OM DET KOMBINERES MED CALCIC CARBONAT, PÅ FYSIOLOGISK NIVEAU. O4: KARAKTERISERING AF GENICAS-FORSKELLE, DER ER ANSVARLIGE FOR DIFFERENTIERET ADFÆRD VED AT KRYDSE KONTRASTEREDE ØKOTYPER OG IDENTIFICERE GENETISKE MARKØRER, DER ER KNYTTET TIL DEN TOLERANTE FÆNOTYPE I EN SEPARAT F2-KORTLÆGNINGSPOPULATION VED HJÆLP AF "BULK SEGRAGATIONSANALYSE" BASERET PÅ "NÆSTE GENERATION SEKVENTERING" (BSA-SEQ). HT3: ZN OG TRO ER AFGØRENDE FOR SAMSPILLET MELLEM PLANTE-JORD OG MIKROORGANISMER. O5. KARAKTERISERING AF PLANTEMIKROBIOMET AF DIFFERENTIERET EFFEKTIVITET AF TRO OG ZN OG DENS MULIGE ROLLE I MOBILISERINGEN AF NÆRINGSSTOFFER. O6: ZN REGULERING OG MIKROORGANISMER ADAPTIV VÆKST RESPONS OG UDVIKLING GENNEM ZN-AUXIN INTERAKTION. (Danish)
17 August 2022
0 references
MONIEN VILJELYKASVIEN HEIKKO SOPEUTUMINEN KALKKIPITOISEEN MAAPERÄÄN RAJOITTAA MAATALOUSTUOTANTOA MAAILMAN SUURILLA ALUEILLA, ERITYISESTI ARIDAS-ALUEILLA TAI PUOLIKUIVA-ALUEILLA. RAUDAN JA SINKIN VÄHÄINEN SAATAVUUS KASVEILLE NÄISSÄ MAAPERÄSSÄ VAIKEUTTAA NÄITÄ VÄLTTÄMÄTTÖMIÄ RAVINTOAINEITA SISÄLTÄVIEN KASVIELINTARVIKKEIDEN BIOLINNOITUMISTA. MEKANISMIT, JOILLA KASVIT REAGOIVAT USKON JA ZN:N VAJEESEEN, OVAT JO VAKIINTUNEET. HITAAMMAT TULOKSET KAIKKIEN NÄIDEN GENEETTISTEN JA MOLEKYYLITIETÄMYKSEN KÄYTÄNNÖN INTEGROIMISESTA VILJELYKASVIEN GENEETTISEN PARANTAMISEN JA KESTÄVÄN HOIDON EDISTÄMISEKSI. KASVIEN SOPEUTTAMINEN KALKKIPITOISEEN MAAPERÄÄN ON MONIMUTKAINEN ONGELMA, JOHON KUULUU USKON JA ZN:N TEHOKKUUS, YLIKALSIUMKARBONAATIN VASTUSTUSKYKY JA VUOROVAIKUTUS KASVIEN, MAAPERÄN JA MIKRO-ORGANISMIEN KANSSA. TÄLLÄ HANKKEELLA PYRITÄÄN TARJOAMAAN KESKEISIÄ TIETOJA, JOILLA NOPEUTETAAN TÄHÄN TÄRKEÄÄN ONGELMAAN TÄHTÄÄVIÄ GENEETTISIÄ PARANNUSOHJELMIA JA AUTETAAN TÄMÄNTYYPPISESSÄ MAAPERÄSSÄ KASVAVIEN VILJELYKASVIEN KESTÄVÄÄ HOITOA. TÄTÄ VARTEN LUOTAMME TUTKIMUKSEEN LUONNOLLISTA GENEETTISTÄ VAIHTELUA JA EROTTUVA MOLEKYYLI- JA FYSIOLOGISIA MEKANISMEJA LUONNONVARAISISSA POPULAATIOISSA ARABIDOPSIS THALIANA SOPEUTUNUT MAAPERÄÄN KONTRASTISIA, PIIPITOISIA VS. KALKKIPITOISIA OMINAISUUKSIA, JOTKA SIJAITSEVAT LÄHELLÄ ALUEITA NIEMIMAALLA NE. ERÄÄSSÄ TOISESSA PROJEKTISSAMME, JOTA ME NIH RAHOITIMME, LUONNOLLISEN IONOMIC VARIATIONABOUTIN GENEETTISEN PERUSTAN LUONTAISTEN RANNIKKOPOPULAATIOIDEN SOPEUTTAMISELLE SUOLALIUOKSEEN, HAVAITSIMME SATUNNAISESTI A. THALIANAN MIELTYMYKSEN PIIPITOISEEN MAAPERÄÄN JA SEN VÄHÄISEN ESIINTYMISEN KALKKIPITOISESSA MAAPERÄSSÄ. LÄHTÖKOHTANAMME ON, ETTÄ A. THALIANA -KASVIN LUONNOLLINEN VAIHTELU VERRATTUNA MAAPERÄÄN (SILICEOS VS CALCAREOS) ON TÄRKEÄ GENEETTISEN TIEDON LÄHDE TUTKITTAESSA MUKAUTUVIA PROSESSEJA, JOIDEN AVULLA KASVIT SELVIYTYVÄT KALKKIMAISEN MAAPERÄN OLOSUHTEISTA. TIIMIMME YHTEISTYÖ JOHTAVIEN RYHMIEN KANSSA TÄLLÄ ALALLA (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK JA PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, YHDYSVALLAT) ANTAA MEILLE MAHDOLLISUUDEN MUOTOILLA KONKREETTISIA TAVOITTEITA (TAI) RYHMITELTY KOLMEEN TYÖSKENAARIOON (HT): HT1: KALSIINIKARBONAATTI ESTÄÄ A. THALIANAN LUONNOLLISTA JAKAUTUMISTA. O1: TARKISTA A. THALIANAN LUONNOLLISEN JAKAUTUMISEN JA KALKKIPITOISTEN MAA-AINESTEN JAKAUTUMISEN VÄLINEN KÄÄNTEISSUHDE. O2: VALITAAN FENOTYYPIN PERUSTEELLA EKOTYYPIT, JOIDEN ON TODISTETUSTI SIETOKYKY KALKKIPITOISILLE MAA-AINEKSILLE. HT2: USKOTEHOKKUUDET JA ZN-TEHOKKUUS OVAT AVAINASEMASSA A. THALIANAN KELVOLLISUUDESSA KALKKIPITOISESSA MAAPERÄSSÄ. O3: VERRATAAN VASTAKKAISTEN EKOTYYPPIEN REAKTIOTA USKONPUUTTEESEEN JA ZN, RIIPPUMATTA SIITÄ, YHDISTETÄÄNKÖ NE KALSIINIKARBONAATTIIN, FYSIOLOGISELLA TASOLLA. O4: NIIDEN GENICAS-EROJEN KARAKTERISOINTI, JOTKA OVAT VASTUUSSA ERILAISESTA KÄYTTÄYTYMISESTÄ YLITTÄMÄLLÄ VASTAKKAISIA EKOTYYPPEJÄ JA TUNNISTAMALLA SUVAITSEVAISEEN FENOTYYPPIIN LIITTYVIÄ GENEETTISIÄ MARKKEREITA ERILLISESSÄ F2-KARTOITUSPOPULAATIOSSA KÄYTTÄEN ”SELKEÄÄ SEGRAGAATIOANALYYSIA”, JOKA PERUSTUU ”SEURAAVAN SUKUPOLVEN SEKVENSOINTIIN” (BSA-SEQ). HT3: ZN JA USKO OVAT AVAINASEMASSA KASVIEN, MAAPERÄN JA MIKRO-ORGANISMIEN VUOROVAIKUTUKSESSA. O5. LUONNEHDINTA KASVIEN MIKROBIOMIN ERIYTETYN TEHOKKUUDEN USKON JA ZN JA SEN MAHDOLLINEN ROOLI RAVINTEIDEN MOBILISOINNISSA. O6: ZN-SÄÄNTELY JA MIKRO-ORGANISMIT MUKAUTUVAT KASVUVASTEISIIN JA KEHITYKSEEN ZN-AUKSIININ VUOROVAIKUTUKSEN KAUTTA. (Finnish)
17 August 2022
0 references
L-ADATTAMENT FQIR TA’ ĦAFNA PJANTI TA’ KULTIVAZZJONI GĦALL-KUNDIZZJONIJIET TA’ ĦAMRIJA KALKARJA JILLIMITA L-PRODUZZJONI AGRIKOLA F’ŻONI KBAR TAD-DINJA, SPEĊJALMENT F’ARIDAS JEW F’REĠJUNI SEMI-ARIDI. ID-DISPONIBBILTÀ BAXXA TAL-ĦADID U Ż-ŻINGU GĦALL-PJANTI F’DIN IL-ĦAMRIJA TAGĦMILHA DIFFIĊLI GĦALL-IKEL TAL-PJANTI B’DAWN IN-NUTRIJENTI ESSENZJALI BIEX IKUNU BIJOFORTIFIKAZZJONI. IL-MEKKANIŻMI TA ‘REAZZJONI TAL-PJANTI GĦALL-IŻBILANĊ TA’ FIDI U ZN HUMA DIĠÀ STABBILITI SEW. RIŻULTATI AKTAR BIL-MOD L-INTEGRAZZJONI PRATTIKA TA ‘DAWN L-GĦARFIEN ĠENETIKU-MOLEKULARI FAVUR IT-TITJIB ĠENETIKU TAL-GĦELEJJEL U L-ĠESTJONI SOSTENIBBLI TAGĦHOM. IT-TITJIB TAL-ADATTAMENT TAL-PJANTI GĦALL-ĦAMRIJA KALKARJA HIJA PROBLEMA KUMPLESSA LI TINVOLVI L-EFFIĊJENZA TAL-FIDI U ZN, IR-REŻISTENZA GĦALL-KARBONAT KALĊIKU ŻEJJED U L-INTERAZZJONI BEJN IL-PJANTI U L-ĦAMRIJA MIKROORGANIŻMI. DAN IL-PROĠETT GĦANDU L-GĦAN LI JIPPROVDI INFORMAZZJONI EWLENIJA BIEX JAĊĊELLERA L-PROGRAMMI TA’ TITJIB ĠENETIKU MMIRATI LEJN DIN IL-PROBLEMA IMPORTANTI U BIEX JGĦIN FIL-ĠESTJONI SOSTENIBBLI TAL-GĦELEJJEL F’DAN IT-TIP TA’ ĦAMRIJA. GĦAL DAN AĦNA NIDDEPENDU FUQ L-ISTUDJU TAL-VARJAZZJONI ĠENETIKA NATURALI U L-MEKKANIŻMI DISTINTIVI MOLEKULARI U FIŻJOLOĠIĊI F’POPOLAZZJONIJIET SELVAĠĠI TA’ ARABIDOPSIS THALIANA ADATTATI GĦAL ĦAMRIJA TA’ KARATTERISTIĊI KUNTRASTATI, SILIĊIKI KONTRA DAWK KALKARJI, LI JINSABU F’ŻONI QRIB FIL-PENIŻULARI NE. MATUL PROĠETT IEĦOR TAGĦNA, IFFINANZJAT MILL-NIH TAGĦNA, IL-BAŻI ĠENETIKA TA’ VARIATIONABOUT IONOMIC NATURALI BĦALA L-BAŻI ĠENETIKA TAL-ADATTAMENT TAL-POPOLAZZJONIJIET KOSTALI NATURALI GĦALL-ISTRESS MIELAĦ, AĦNA OSSERVAJNA B’MOD KAŻWALI L-PREFERENZA TA’ A. THALIANA’S GĦAL ĦAMRIJA SILIĊIKA U L-PREŻENZA BAXXA TAGĦHA F’ĦAMRIJA KALKARJA. L-IPOTEŻI TAL-BIDU TAGĦNA GĦAL DAN IL-PROĠETT HIJA LI L-VARJAZZJONI NATURALI TAL-PJANTA A. THALIANA F’ĦAMRIJA KKUNTRASTATA (SILICEOS KONTRA CALCAREOS) HIJA SORS IMPORTANTI TA’ INFORMAZZJONI ĠENETIKA GĦALL-ISTUDJU TA’ PROĊESSI ADATTIVI LI JIPPERMETTU LILL-PJANTI JLAĦĦQU MAL-KUNDIZZJONIJIET TA’ ĦAMRIJA KALKARJA. IL-KOLLABORAZZJONI TAT-TIM TAGĦNA MA’ GRUPPI EWLENIN F’DAN IL-QASAM (PROF. E.D. MELĦ UNIV. ABERDEEN, UK U PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) TIPPERMETTILNA NIFFORMULAW OBJETTIVI KONKRETI (JEW) MIĠBURA FI TLIET XENARJI TA’ ĦIDMA (HT): HT1: IL-KARBONAT KALĊIKU JINIBIXXI D-DISTRIBUZZJONI NATURALI TA’ A. THALIANA. O1: IĊĊEKKJA R-RELAZZJONI INVERSA BEJN ID-DISTRIBUZZJONI NATURALI TA’ A. THALIANA U D-DISTRIBUZZJONI TA’ ĦAMRIJA KALKARJA. O2: AGĦŻEL, ABBAŻI TAL-FENOTIP, L-EKOTIPI TA’ TOLLERANZA PPRUVATA GĦALL-ĦAMRIJA KALKARJA. HT2: L-EFFIĊJENZI TAL-FIDI U L-EFFIĊJENZI TA’ ZN HUMA ESSENZJALI GĦALL-KAPAĊITÀ TA’ A. THALIANA’S F’ĦAMRIJA KALKARJA. O3: TQABBIL TAR-RISPONS TA’ EKOTIPI KUNTRASTATI GĦAD-DEFIĊIT TAL-FIDI U ZN, KEMM JEKK IKKOMBINATI MA’ KARBONAT KALĊIKU KIF UKOLL JEKK LE, F’LIVELL FIŻJOLOĠIKU. O4: IL-KARATTERIZZAZZJONI TAD-DIFFERENZI GENICAS RESPONSABBLI GĦALL-IMĠIBA DIFFERENZJALI PERMEZZ TAL-QSIM TA’ EKOTIPI KUNTRASTATI U L-IDENTIFIKAZZJONI TA’ MARKATURI ĠENETIĊI MARBUTA MAL-FENOTIP TOLLERANTI F’POPOLAZZJONI TA’ MMAPPJAR F2 SEGREGATA BL-UŻU TA’ “ANALIŻI TAS-SEGRAGAZZJONI TAL-MASSA” ABBAŻI TA’ “SEKWENZAR TAL-ĠENERAZZJONI LI JMISS” (BSA-SEQ). HT3: ZN U L-FIDI HUMA ESSENZJALI FL-INTERAZZJONI PJANTI-ĦAMRIJA MIKROORGANIŻMI. O5. KARATTERIZZAZZJONI TAL-MIKROBIJOMA TAL-PJANTA TAL-EFFIĊJENZA DIFFERENZJALI TAL-FIDI U ZN U R-RWOL POSSIBBLI TAGĦHA FIL-MOBILIZZAZZJONI TAN-NUTRIJENTI. O6: ZN REGOLAMENTAZZJONI U MIKROORGANIŻMI RISPONSI TA ‘TKABBIR ADATTIVI U L-IŻVILUPP PERMEZZ TA’ INTERAZZJONI ZN-AUXIN. (Maltese)
17 August 2022
0 references
DAUDZU AUDZĒŠANAS AUGU SLIKTĀ PIELĀGOŠANĀS KAĻĶAINAS AUGSNES APSTĀKĻIEM IEROBEŽO LAUKSAIMNIECISKO RAŽOŠANU LIELOS PASAULES REĢIONOS, JO ĪPAŠI ARIDAS VAI PUSKALNU REĢIONOS. ZEMĀ DZELZS UN CINKA PIEEJAMĪBA AUGIEM ŠAJĀS AUGSNĒS APGRŪTINA TO, KA AUGU PĀRTIKA AR ŠĪM BŪTISKAJĀM BARĪBAS VIELĀM IR BIOFORTIFIKĀCIJA. MEHĀNISMI REAĢĒŠANAI UZ TRŪKUMU TICĪBAS UN ZN JAU IR LABI IZVEIDOTA. LĒNĀKU REZULTĀTU PRAKTISKĀ INTEGRĀCIJA VISU ŠO ĢENĒTISKI-MOLEKULĀRO ZINĀŠANU PAR LABU ĢENĒTISKO UZLABOŠANU KULTŪRAUGU UN TO ILGTSPĒJĪGU PĀRVALDĪBU. AUGU PIELĀGOŠANĀS KAĻĶAINAI AUGSNEI UZLABOŠANA IR SAREŽĢĪTA PROBLĒMA, KAS IETVER TICĪBAS UN ZN EFEKTIVITĀTI, IZTURĪBU PRET PĀRMĒRĪGU KALCISKO KARBONĀTU UN MIJIEDARBĪBU AR AUGU-AUGSNES-MIKROORGANISMIEM. ŠĀ PROJEKTA MĒRĶIS IR SNIEGT GALVENO INFORMĀCIJU, LAI PAĀTRINĀTU ĢENĒTISKĀS UZLABOŠANAS PROGRAMMAS, KAS VĒRSTAS UZ ŠO SVARĪGO PROBLĒMU, UN PALĪDZĒTU ILGTSPĒJĪGI APSAIMNIEKOT ŠĀDA VEIDA AUGSNES KULTŪRAUGUS. ŠIM NOLŪKAM MĒS PAĻAUJAMIES UZ PĒTĪJUMU PAR DABISKAJĀM ĢENĒTISKĀM VARIĀCIJĀM UN ATŠĶIRĪGAJIEM MOLEKULĀRAJIEM UN FIZIOLOĢISKAJIEM MEHĀNISMIEM ARABIDOPSIS THALIANA SAVVAĻAS POPULĀCIJĀS, KAS PIELĀGOTAS KONTRASTĒTU, SILIKĀTU UN KAĻĶAINU ĪPAŠĪBU AUGSNĒM, KAS ATRODAS NETĀLU NO PUSSALAS. CITA MŪSU PROJEKTA LAIKĀ, KO FINANSĒJA MĒS NIH, DABISKĀS IONOMIC VARIATIONĀCIJAS ĢENĒTISKAIS PAMATS IONOMIC VARIATIONABOUT ĢENĒTISKAIS PAMATS DABAS PIEKRASTES POPULĀCIJU PIELĀGOŠANAI SĀLS STRESAM, MĒS NEJAUŠI NOVĒROJĀM A. THALIANA’S PRIEKŠROKU SILIKĀTA AUGSNĒM UN TO ZEMO KLĀTBŪTNI KAĻĶAINĀS AUGSNĒS. MŪSU SĀKOTNĒJĀ HIPOTĒZE ŠIM PROJEKTAM IR TĀDA, KA AUGU A. THALIANA DABISKĀS VARIĀCIJAS KONTRASTĒTĀS AUGSNĒS (SILICEOS PRET CALCAREOS) IR SVARĪGS ĢENĒTISKĀS INFORMĀCIJAS AVOTS ADAPTĪVO PROCESU IZPĒTEI, KAS ĻAUJ AUGIEM TIKT GALĀ AR KAĻĶAINU AUGŠŅU APSTĀKĻIEM. MŪSU KOMANDAS SADARBĪBA AR VADOŠAJĀM GRUPĀM ŠAJĀ JOMĀ (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK UN PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, ASV) ĻAUJ MUMS FORMULĒT KONKRĒTUS MĒRĶUS (VAI) SAGRUPĒT TRĪS DARBA SCENĀRIJOS (HT): HT1: KALCISKAIS KARBONĀTS KAVĒ A. THALIANA DABISKO IZPLATĪBU. O1: PĀRBAUDIET APGRIEZTO SAISTĪBU STARP A. THALIANA DABISKO IZPLATĪBU UN KAĻĶAINO AUGŠŅU IZPLATĪBU. O2: PAMATOJOTIES UZ FENOTIPU, IZVĒLIETIES EKOTIPUS AR PIERĀDĪTU TOLERANCI PRET KAĻĶAINO AUGSNI. HT2: TICĪBAS EFEKTIVITĀTE UN ZN EFEKTIVITĀTE IR ATSLĒGA UZ A. THALIANA’S FITNESA KAĻĶAINĀS AUGSNĒS. O3: SALĪDZINĀJUMS STARP KONTRASTĒTU EKOTIPU REAKCIJU UZ TICĪBAS DEFICĪTU UN ZN (KOMBINĀCIJĀ AR KALCISKO KARBONĀTU VAI BEZ TĀ) FIZIOLOĢISKĀ LĪMENĪ. O4: GENICAS ATŠĶIRĪBU RAKSTUROJUMS, KAS IR ATBILDĪGAS PAR ATŠĶIRĪGU UZVEDĪBU, ŠĶĒRSOJOT KONTRASTĒTUS EKOTIPUS UN IDENTIFICĒJOT ĢENĒTISKOS MARĶIERUS, KAS SAISTĪTI AR TOLERANTU FENOTIPU, NOŠĶIROT F2 KARTĒŠANAS POPULĀCIJU, IZMANTOJOT “TILPUMA SEGRAGĀCIJAS ANALĪZI”, KURAS PAMATĀ IR “NĀKAMĀS PAAUDZES SEKVENCĒŠANA” (BSA-SEQ). HT3: ZN UN TICĪBA IR GALVENAIS AUGU-AUGSNES-MIKROORGANISMU MIJIEDARBĪBĀ. O5. TICĪBAS UN ZN ATŠĶIRĪGĀS EFEKTIVITĀTES AUGU MIKROBIOMA RAKSTUROJUMS UN TĀ IESPĒJAMĀ LOMA BARĪBAS VIELU MOBILIZĀCIJĀ. O6: ZN REGULĀCIJA UN MIKROORGANISMI ADAPTĪVĀS AUGŠANAS REAKCIJAS UN ATTĪSTĪBA, MIJIEDARBOJOTIES AR ZN-AUXIN. (Latvian)
17 August 2022
0 references
NEDOSTATOČNÉ PRISPÔSOBENIE MNOHÝCH PESTOVATEĽSKÝCH RASTLÍN PODMIENKAM VÁPENATEJ PÔDY OBMEDZUJE POĽNOHOSPODÁRSKU VÝROBU VO VEĽKÝCH OBLASTIACH SVETA, NAJMÄ V REGIÓNOCH ARIDAS ALEBO POLOSUCHÝCH REGIÓNOCH. NÍZKA DOSTUPNOSŤ ŽELEZA A ZINKU PRE RASTLINY V TÝCHTO PÔDACH SŤAŽUJE BIOFORTIFIKÁCIU RASTLINNÝCH POTRAVÍN S TÝMITO ZÁKLADNÝMI ŽIVINAMI. MECHANIZMY REAKCIE RASTLÍN NA NEDOSTATOK VIERY A ZN SÚ UŽ DOBRE ZAVEDENÉ. POMALŠIE VÝSLEDKY PRAKTICKEJ INTEGRÁCIE VŠETKÝCH TÝCHTO GENETICKO-MOLEKULÁRNYCH POZNATKOV V PROSPECH GENETICKÉHO ZLEPŠENIA PLODÍN A ICH UDRŽATEĽNÉHO RIADENIA. ZLEPŠENIE ADAPTÁCIE RASTLÍN NA VÁPENATÉ PÔDY JE KOMPLEXNÝ PROBLÉM, KTORÝ ZAHŔŇA ÚČINNOSŤ VIERY A ZN, ODOLNOSŤ VOČI NADMERNÉMU UHLIČITANU KALCIKU A INTERAKCII RASTLINNO-PÔDNO-MIKROORGANIZMY. CIEĽOM TOHTO PROJEKTU JE POSKYTNÚŤ KĽÚČOVÉ INFORMÁCIE NA URÝCHLENIE PROGRAMOV GENETICKÉHO ZLEPŠENIA ZAMERANÝCH NA TENTO DÔLEŽITÝ PROBLÉM A POMÔCŤ PRI TRVALO UDRŽATEĽNOM OBHOSPODAROVANÍ PLODÍN V TOMTO TYPE PÔDY. PRETO SA SPOLIEHAME NA ŠTÚDIUM PRÍRODNÝCH GENETICKÝCH VARIÁCIÍ A VÝRAZNÝCH MOLEKULÁRNYCH A FYZIOLOGICKÝCH MECHANIZMOV U VOĽNE ŽIJÚCICH POPULÁCIÍ ARABIDOPSIS THALIANA PRISPÔSOBENÝCH PÔDAM KONTRASTNÝCH, KREMIČITÝCH VERZUS VÁPENATÝCH VLASTNOSTÍ, KTORÉ SA NACHÁDZAJÚ V BLÍZKOSTI POLOSTROVA NE. POČAS ĎALŠIEHO NÁŠHO PROJEKTU FINANCOVANÉHO NAMI NIH, GENETICKÉHO ZÁKLADU PRÍRODNÉHO IONOMICKÉHO VARIATIONABOOUTIE GENETICKÉHO ZÁKLADU ADAPTÁCIE PRIRODZENÝCH POBREŽNÝCH POPULÁCIÍ NA FYZIOLOGICKÝ STRES, SME PRÍLEŽITOSTNE POZOROVALI PREFERENCIU A. THALIANA PRED KREMIČITÝMI PÔDAMI A JEJ NÍZKU PRÍTOMNOSŤ V VÁPENATÝCH PÔDACH. NAŠA VÝCHODISKOVÁ HYPOTÉZA PRE TENTO PROJEKT SPOČÍVA V TOM, ŽE PRIRODZENÁ VARIÁCIA RASTLINY A. THALIANA V KONTRASTNÝCH PÔDACH (SILICEOS VERZUS CALCAREOS) JE DÔLEŽITÝM ZDROJOM GENETICKÝCH INFORMÁCIÍ PRE ŠTÚDIUM ADAPTÍVNYCH PROCESOV, KTORÉ UMOŽŇUJÚ RASTLINÁM VYROVNAŤ SA S PODMIENKAMI VÁPENATÝCH PÔD. SPOLUPRÁCA NÁŠHO TÍMU S VEDÚCIMI SKUPINAMI V TEJTO OBLASTI (PROF. D.E. SOĽ UNIV. ABERDEEN, UK A PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) NÁM UMOŽŇUJE FORMULOVAŤ KONKRÉTNE CIELE (ALEBO) ZOSKUPENÉ DO TROCH PRACOVNÝCH SCENÁROV (HT): HT1: UHLIČITAN KALCIOVÝ INHIBUJE PRIRODZENÚ DISTRIBÚCIU A. THALIANA. O1: SKONTROLUJTE INVERZNÝ VZŤAH MEDZI PRIRODZENOU DISTRIBÚCIOU A. THALIANA A DISTRIBÚCIOU VÁPENATÝCH PÔD. O2: NA ZÁKLADE FENOTYPU VYBERTE EKOTYPY PREUKÁZANEJ TOLERANCIE VOČI VÁPENATÝM PÔDAM. HT2: ÚČINNOSŤ VIERY A EFEKTÍVNOSŤ ZN SÚ KĽÚČOM K ZDATNOSTI A. THALIANA V VÁPENATÝCH PÔDACH. O3: POROVNANIE REAKCIE KONTRASTNÝCH EKOTYPOV NA NEDOSTATOK VIERY A ZN, TIEŽ V KOMBINÁCII S UHLIČITANOM KALCIKOM, NA FYZIOLOGICKEJ ÚROVNI. O4: CHARAKTERIZÁCIA ROZDIELOV GENICAS ZODPOVEDNÝCH ZA DIFERENCIÁLNE SPRÁVANIE KRÍŽENÍM KONTRASTNÝCH EKOTYPOV A IDENTIFIKÁCIOU GENETICKÝCH MARKEROV SPOJENÝCH S TOLERANTNÝM FENOTYPOM V SEGREGUJÚCEJ POPULÁCII NA MAPOVANIE F2 POMOCOU „ROZBOROVEJ SEGRAGÁCIE“ ZALOŽENEJ NA SEKVENOVANÍ ĎALŠEJ GENERÁCIE (BSA-SEQ). HT3: ZN A VIERA SÚ KĽÚČOM K INTERAKCII RASTLINNO-PÔDNO-MIKROORGANIZMY. O5. CHARAKTERIZÁCIA RASTLINNÉHO MIKROBIÓMU DIFERENCIÁLNEJ ÚČINNOSTI VIERY A ZN A JEJ MOŽNEJ ÚLOHY PRI MOBILIZÁCII ŽIVÍN. O6: ZN REGULÁCIA A MIKROORGANIZMY ADAPTÍVNE RASTOVÉ REAKCIE A VÝVOJ PROSTREDNÍCTVOM ZN-AUXÍNOVEJ INTERAKCIE. (Slovak)
17 August 2022
0 references
CUIREANN DROCH-OIRIÚNÚ GO LEOR PLANDAÍ SAOTHRAITHE AR CHOINNÍOLLACHA ITHREACH CALCAREOUS TEORAINN LE TÁIRGEADH TALMHAÍOCHTA I GCEANTAIR MHÓRA AR FUD AN DOMHAIN, GO HÁIRITHE I RÉIGIÚIN ARIDAS NÓ LEATH-ARID. MAR GHEALL AR INFHAIGHTEACHT ÍSEAL IARAINN AGUS SINCE DO PHLANDAÍ SNA HITHREACHA SEO TÁ SÉ DEACAIR DO BHIANNA PLANDAÍ LEIS NA COTHAITHIGH RIACHTANACHA SEO A BHEITH BIOFORTIFICATION. TÁ MEICNÍOCHTAÍ FREAGARTHA PLANDAÍ AR EASNAMH AN CHREIDIMH AGUS ZN BUNAITHE GO MAITH CHEANA FÉIN. TORTHAÍ NÍOS MOILLE AR CHOMHTHÁTHÚ PRAITICIÚIL NA N-EOLAS GÉINITEACH-MÓILÍNEACH SEO GO LÉIR I BHFABHAR FEABHAS GÉINITEACH BARRA AGUS A MBAINISTÍOCHT INBHUANAITHE. IS FADHB CHASTA É FEABHAS A CHUR AR OIRIÚNÚ PLANDAÍ D’ITHREACHA CAILCREACHA A BHAINEANN LE HÉIFEACHTÚLACHT CHREIDIMH AGUS ZN, FRIOTAÍOCHT LE CARBÓNÁIT CHAILCEACH BHREIS AGUS NA MIOCRORGÁNAIGH PLANDAÍ IDIRGHNÍOMHAÍOCHTA. TÁ SÉ MAR AIDHM AG AN TIONSCADAL SEO FAISNÉIS THÁBHACHTACH A SHOLÁTHAR CHUN DLÚS A CHUR LE CLÁIR FEABHSÚCHÁIN GHÉINITEACHA ATÁ DÍRITHE AR AN BHFADHB THÁBHACHTACH SEO AGUS CHUN CABHRÚ LE BAINISTIÚ INBHUANAITHE A DHÉANAMH AR BHARRA SA CHINEÁL SEO ITHREACH. MAR SIN TÁIMID AG BRATH AR AN STAIDÉAR AR ATHRÚ GÉINITEACH NÁDÚRTHA AGUS MEICNÍOCHTAÍ MÓILÍNEACHA AGUS FISEOLAÍOCHA SAINIÚIL I NDAONRAÍ FIÁINE DE ARABIDOPSIS THALIANA IN OIRIÚINT D’ITHREACHA CODARSNACHTA, SILICEOUS VERSUS CALCAREOUS, ATÁ SUITE I GCEANTAIR IN AICE LEIS AN NE LEITHINIS. LE LINN TIONSCADAL EILE DE LINNE, MAOINITHE AG AN NIH DÚINN, AN BONN GÉINITEACH VARIATIONAB INONOMIC NÁDÚRTHA MAIDIR LE BUNÚS GÉINITEACH OIRIÚNÚ DAONRAÍ CÓSTA NÁDÚRTHA DON STRUS SALINE, THUGAMAR FAOI DEARA CASUALLY ROGHA A. THALIANA AR ITHREACHA SILICEOUS AGUS A LÁITHREACHT ÍSEAL IN ITHREACHA CALCAREOUS. IS É ÁR HIPITÉIS AG TOSÚ DON TIONSCADAL SEO GO BHFUIL AN ÉAGSÚLACHT NÁDÚRTHA PLANDAÍ A. THALIANA IN ITHREACHA GCODARSNACHT (SILICEOS I GCOINNE CALCAREOS) INA FHOINSE THÁBHACHTACH FAISNÉISE GÉINITÍ CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR PHRÓISIS OIRIÚNAITHEACHA A CHUIREANN AR CHUMAS PLANDAÍ DUL I NGLEIC LE COINNÍOLLACHA ITHREACHA CALCAREOUS. CEADAÍONN COMHOIBRIÚ ÁR BHFOIREANN LE GRÚPAÍ TOSAIGH SA RÉIMSE SEO (AN TOLLAMH D.E. SALANN UNIV. ABERDEEN, AN RÍOCHT AONTAITHE AGUS AN TOLLAMH M.L. GUERINOT, COLÁISTE DARTMOUTH, STÁIT AONTAITHE MHEIRICEÁ) DÚINN CUSPÓIRÍ NITHIÚLA (NÓ) A GHRÚPÁIL I DTRÍ CHÁS OIBRE (HT): HT1: CUIREANN CARBÓNÁIT CHAILCEACH COSC AR DHÁILEADH NÁDÚRTHA A. THALIANA. O1: SEICEÁIL AN GAOL INBHÉARTACH IDIR DÁILEADH NÁDÚRTHA A. THALIANA AGUS DÁILEADH ITHREACHA CAILCREACH. O2: ROGHNAIGH, BUNAITHE AR FHEINITÍOPA, ECOTYPES DE CHAOINFHULAINGT CRUTHAITHE ITHREACHA CAILCREACH. HT2: TÁ ÉIFEACHTÚLACHTAÍ FAITH AGUS ÉIFEACHTÚLACHTAÍ ZN EOCHAIR DO A. THALIANA’S FOLLÁINE IN ITHREACHA CALCAREOUS. O3: COMPARÁID IDIR FREAGAIRT NA HÉICITÍOPAÍ ATÁ I GCODARSNACHT LEIS AN EASNAMH CREIDIMH AGUS ZN, BÍDÍS COMHCHEANGAILTE LE CARBÓNÁIT CHAILCEACH NÓ NÁ BÍDÍS, AR LEIBHÉAL FISEOLAÍOCH. O4: TRÉITHRIÚ NA DIFRÍOCHTAÍ GENICAS ATÁ FREAGRACH AS IOMPAR DIFREÁLACH AG TRASNÚ ECOTYPES I GCODARSNACHT AGUS A AITHINT MARCÓIRÍ GÉINITEACHA NASCTHA LEIS AN BHFEINITÍOPA CAOINFHULANGACH I DAONRA MAPÁIL F2 SCARADH AG BAINT ÚSÁIDE AS “ANAILÍS SEGRAGATION BULC” BUNAITHE AR “SEICHEAMHÚ GHLÚIN EILE” (BSA-SEQ). HT3: TÁ ZN AGUS CREIDEAMH RÍTHÁBHACHTACH I IDIRGHNÍOMHÚ PLANDAÍ-ITHREACH-MIOCRORGÁNACH. O5. TRÉITHRIÚ AN MICREABHITHÓM PLANDAÍ AR ÉIFEACHTÚLACHT DIFREÁLACH AN CHREIDIMH AGUS ZN AGUS A RÓL FÉIDEARTHA I SLÓGADH NA COTHAITHIGH. O6: ZN RIALACHÁN AGUS MICROORGANISMS FREAGAIRTÍ FÁIS OIRIÚNAITHEACH AGUS FORBAIRT TRÍ ZN-AUXIN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT. (Irish)
17 August 2022
0 references
NEDOSTATEČNÉ PŘIZPŮSOBENÍ MNOHA PĚSTITELSKÝCH ROSTLIN PODMÍNKÁM VÁPENATÉ PŮDY OMEZUJE ZEMĚDĚLSKOU PRODUKCI VE VELKÝCH OBLASTECH SVĚTA, ZEJMÉNA V ARIDAS NEBO POLOSUCHÝCH OBLASTECH. VZHLEDEM K NÍZKÉ DOSTUPNOSTI ŽELEZA A ZINKU PRO ROSTLINY V TĚCHTO PŮDÁCH JE PRO ROSTLINNÉ POTRAVINY S TĚMITO ZÁKLADNÍMI ŽIVINAMI OBTÍŽNÉ BIOOPEVNĚNÍ. MECHANISMY REAKCE ROSTLIN NA DEFICIT VÍRY A ZN JSOU JIŽ DOBŘE ZAVEDENY. POMALEJŠÍ VÝSLEDKY PRAKTICKÉ INTEGRACE VŠECH TĚCHTO GENETICKO-MOLEKULÁRNÍCH ZNALOSTÍ VE PROSPĚCH GENETICKÉHO ZLEPŠENÍ PLODIN A JEJICH UDRŽITELNÉ ŘÍZENÍ. ZLEPŠENÍ ADAPTACE ROSTLIN NA VÁPENATÉ PŮDY JE SLOŽITÝ PROBLÉM, KTERÝ ZAHRNUJE ÚČINNOST VÍRY A ZN, ODOLNOST VŮČI NADBYTEČNÉMU UHLIČITANU VÁPENATÉMU A INTERAKCI ROSTLIN-PŮDA-MIKROORGANISMY. CÍLEM TOHOTO PROJEKTU JE POSKYTNOUT KLÍČOVÉ INFORMACE PRO URYCHLENÍ PROGRAMŮ GENETICKÉHO ZLEPŠENÍ ZAMĚŘENÝCH NA TENTO DŮLEŽITÝ PROBLÉM A POMOCI PŘI UDRŽITELNÉM HOSPODAŘENÍ S PLODINAMI V TOMTO TYPU PŮDY. PRO TO SE SPOLÉHÁME NA STUDIUM PŘIROZENÉ GENETICKÉ VARIACE A CHARAKTERISTICKÝCH MOLEKULÁRNÍCH A FYZIOLOGICKÝCH MECHANISMŮ U VOLNĚ ŽIJÍCÍCH POPULACÍ ARABIDOPSIS THALIANA PŘIZPŮSOBENÝCH PŮDÁM KONTRASTNÍCH, KŘEMIČITÝCH VERSUS VÁPENATÝCH VLASTNOSTÍ, KTERÉ SE NACHÁZEJÍ V BLÍZKOSTI OBLASTÍ NA POLOOSTROVĚ. BĚHEM DALŠÍHO NAŠEHO PROJEKTU, FINANCOVANÉHO NÁMI NIH, GENETICKOU ZÁKLADNOU PŘIROZENÉHO IONOMICKÉHO VARIACEABOUT GENETICKÉHO ZÁKLADU ADAPTACE PŘÍRODNÍCH POBŘEŽNÍCH POPULACÍ NA SOLNÝ STRES, JSME NÁHODNĚ POZOROVALI PREFERENCI A. THALIANY PRO KŘEMIČITÉ PŮDY A JEJÍ NÍZKOU PŘÍTOMNOST VE VÁPENITÝCH PŮDÁCH. NAŠE VÝCHOZÍ HYPOTÉZA PRO TENTO PROJEKT JE, ŽE PŘIROZENÁ VARIACE ROSTLINY A. THALIANA V KONTRASTNÍCH PŮDÁCH (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) JE DŮLEŽITÝM ZDROJEM GENETICKÝCH INFORMACÍ PRO STUDIUM ADAPTIVNÍCH PROCESŮ, KTERÉ ROSTLINÁM UMOŽŇUJÍ VYROVNAT SE S PODMÍNKAMI VÁPENATÝCH PŮD. SPOLUPRÁCE NAŠEHO TÝMU S PŘEDNÍMI SKUPINAMI V TÉTO OBLASTI (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK A PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) NÁM UMOŽŇUJE FORMULOVAT KONKRÉTNÍ CÍLE (NEBO) SESKUPENÉ DO TŘÍ PRACOVNÍCH SCÉNÁŘŮ (HT): HT1: UHLIČITAN VÁPENATÝ INHIBUJE PŘIROZENOU DISTRIBUCI A. THALIANY. O1: ZKONTROLUJTE INVERZNÍ VZTAH MEZI PŘIROZENÝM ROZDĚLENÍM A. THALIANA A ROZDĚLENÍM VÁPENATÝCH PŮD. O2: NA ZÁKLADĚ FENOTYPU VYBERTE EKOTYPY OSVĚDČENÉ TOLERANCE VŮČI VÁPENATÝM PŮDÁM. HT2: ÚČINNOST VÍRY A EFEKTIVITA ZN JSOU KLÍČEM KE KONDICE A. THALIANY VE VÁPENITÝCH PŮDÁCH. O3: SROVNÁNÍ ODEZVY KONTRASTNÍCH EKOTYPŮ NA DEFICIT VÍRY A ZN, TÉŽ V KOMBINACI S UHLIČITANEM VÁPENATÝM, NA FYZIOLOGICKÉ ÚROVNI. O4: CHARAKTERIZACE ROZDÍLŮ GENICAS ZODPOVĚDNÝCH ZA DIFERENCIÁLNÍ CHOVÁNÍ KŘÍŽENÍM KONTRASTNÍCH EKOTYPŮ A IDENTIFIKACÍ GENETICKÝCH MARKERŮ SPOJENÝCH S TOLERANTNÍM FENOTYPEM V SEGREGAČNÍ POPULACI MAPUJÍCÍ F2 POMOCÍ „HROMADNÉ SEGRAGAČNÍ ANALÝZY“ ZALOŽENÉ NA „SEKVENOVÁNÍ DALŠÍ GENERACE“ (BSA-SEQ). HT3: ZN A VÍRA JSOU KLÍČEM K INTERAKCI ROSTLIN, PŮDY A MIKROORGANISMŮ. O5. CHARAKTERIZACE ROSTLINNÉHO MIKROBIOMU DIFERENCIÁLNÍ ÚČINNOSTI VÍRY A ZN A JEHO MOŽNÉ ROLE V MOBILIZACI ŽIVIN. O6: ZN REGULACE A MIKROORGANISMY ADAPTIVNÍ RŮSTOVÉ REAKCE A VÝVOJ PROSTŘEDNICTVÍM INTERAKCE ZN-AUXIN. (Czech)
17 August 2022
0 references
A MÁ ADAPTAÇÃO DE MUITAS PLANTAS CULTIVADAS ÀS CONDIÇÕES DO SOLO CALCÁRIO LIMITA A PRODUÇÃO AGRÍCOLA EM GRANDES ÁREAS DO MUNDO, ESPECIALMENTE EM REGIÕES ARIDAS OU SEMIÁRIDAS. A BAIXA DISPONIBILIDADE DE FERRO E ZINCO PARA PLANTAS NESSES SOLOS DIFICULTA A BIOFORTIFICAÇÃO DOS ALIMENTOS VEGETAIS COM ESSES NUTRIENTES ESSENCIAIS. OS MECANISMOS DE RESPOSTA DAS PLANTAS AO DÉFICIT DE FÉ E ZN JÁ ESTÃO BEM ESTABELECIDOS. RESULTADOS MAIS LENTOS A INTEGRAÇÃO PRÁTICA DE TODOS ESSES CONHECIMENTOS GENÉTICO-MOLECULARES EM FAVOR DA MELHORIA GENÉTICA DAS CULTURAS E SUA GESTÃO SUSTENTÁVEL. MELHORAR A ADAPTAÇÃO DAS PLANTAS AOS SOLOS CALCÁRIOS É UM PROBLEMA COMPLEXO QUE ENVOLVE A EFICIÊNCIA DA FÉ E O ZN, A RESISTÊNCIA AO EXCESSO DE CARBONATO DE CÁLCIO E A INTERAÇÃO PLANTA-SOLO-MICRORGANISMOS. ESTE PROJETO TEM COMO OBJETIVO FORNECER INFORMAÇÕES-CHAVE PARA ACELERAR OS PROGRAMAS DE MELHORIA GENÉTICA VOLTADOS PARA ESTE IMPORTANTE PROBLEMA E AJUDAR NO MANEJO SUSTENTÁVEL DAS CULTURAS NESTE TIPO DE SOLO. PARA ISSO, CONTAMOS COM O ESTUDO DA VARIAÇÃO GENÉTICA NATURAL E MECANISMOS MOLECULARES E FISIOLÓGICOS DISTINTIVOS EM POPULAÇÕES SELVAGENS DE ARABIDOPSIS THALIANA ADAPTADOS A SOLOS DE CARACTERÍSTICAS CONTRASTADAS, SILICIOSAS VERSUS CALCÁRIAS, LOCALIZADAS EM ÁREAS PRÓXIMAS DA PENÍNSULA NE. EM OUTRO PROJETO NOSSO, FINANCIADO POR NÓS NIH, A BASE GENÉTICA DA VARIAÇÃO IONÓMICA NATURAL SOBRE A BASE GENÉTICA DE ADAPTAÇÃO DAS POPULAÇÕES COSTEIRAS NATURAIS AO ESTRESSE SALINO, OBSERVAMOS CASUALMENTE A PREFERÊNCIA DE A. THALIANA POR SOLOS SILICIOSOS E SUA BAIXA PRESENÇA EM SOLOS CALCÁRIOS. NOSSA HIPÓTESE INICIAL PARA ESTE PROJETO É QUE A VARIAÇÃO NATURAL DA PLANTA A. THALIANA EM SOLOS CONTRASTADOS (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) É UMA IMPORTANTE FONTE DE INFORMAÇÃO GENÉTICA PARA O ESTUDO DE PROCESSOS ADAPTATIVOS QUE PERMITEM ÀS PLANTAS LIDAR COM AS CONDIÇÕES DOS SOLOS CALCÁRIOS. A COLABORAÇÃO DA NOSSA EQUIPA COM GRUPOS LÍDERES NESTE CAMPO (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, REINO UNIDO E PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, EUA) PERMITE-NOS FORMULAR OBJETIVOS CONCRETOS (OU) AGRUPADOS EM TRÊS CENÁRIOS DE TRABALHO (HT): HT1: O CARBONATO DE CÁLCIO INIBE A DISTRIBUIÇÃO NATURAL DE A. THALIANA. O1: VERIFICAR A RELAÇÃO INVERSA ENTRE A DISTRIBUIÇÃO NATURAL DE A. THALIANA E A DISTRIBUIÇÃO DOS SOLOS CALCÁRIOS. O2: SELECIONAR, COM BASE NO FENÓTIPO, ECÓTIPOS DE TOLERÂNCIA COMPROVADA AOS SOLOS CALCÁRIOS. HT2: EFICIÊNCIAS DE FÉ E EFICIÊNCIAS DE ZN SÃO FUNDAMENTAIS PARA A APTIDÃO DE A. THALIANA EM SOLOS CALCÁRIOS. O3: COMPARAÇÃO DA RESPOSTA DE ECÓTIPOS CONTRASTADOS AO DÉFICIT DE FÉ E ZN, COMBINADO OU NÃO COM CARBONATO DE CÁLCIO, EM NÍVEL FISIOLÓGICO. O4: CARACTERIZAÇÃO DAS DIFERENÇAS GENICAS RESPONSÁVEIS PELO COMPORTAMENTO DIFERENCIAL CRUZANDO ECÓTIPOS CONTRASTADOS E IDENTIFICANDO MARCADORES GENÉTICOS LIGADOS AO FENÓTIPO TOLERANTE EM UMA POPULAÇÃO DE MAPEAMENTO F2 SEGREGANTE USANDO «ANÁLISE DE SEGRAÇÃO EM MASSA» BASEADA EM «SEQUENCIAMENTO DE PRÓXIMA GERAÇÃO» (BSA-SEQ). HT3: ZN E A FÉ SÃO FUNDAMENTAIS NA INTERAÇÃO PLANTA-SOLO-MICRO-ORGANISMOS. O5. CARACTERIZAÇÃO DO MICROBIOMA VEGETAL DE EFICIÊNCIA DIFERENCIAL DA FÉ E ZN E SEU POSSÍVEL PAPEL NA MOBILIZAÇÃO DE NUTRIENTES. O6: ZN REGULAÇÃO E MICRORGANISMOS RESPOSTAS ADAPTATIVAS DE CRESCIMENTO E DESENVOLVIMENTO ATRAVÉS DA INTERAÇÃO ZN-AUXIN. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
PALJUDE VILJELUSTAIMEDE HALB KOHANEMINE LUBJARIKKA MULLAGA PIIRAB PÕLLUMAJANDUSTOOTMIST MAAILMA SUURTEL ALADEL, ERITI ARIDAS-E VÕI POOLKUIVADE PIIRKONDADE PUHUL. RAUA JA TSINGI VÄHENE KÄTTESAADAVUS TAIMEDELE KÕNEALUSTES MULDADES MUUDAB NENDE OLULISTE TOITAINETEGA TAIMSE TOIDU BIOFORTIFITSEERUMISE KEERULISEKS. MEHHANISMID, KUIDAS TAIMED REAGEERIVAD USU JA ZN PUUDUJÄÄGILE, ON JUBA HÄSTI JUURDUNUD. AEGLASEMAD TULEMUSED KÕIGI NENDE GENEETILISTE MOLEKULAARTEADMISTE PRAKTILISE INTEGREERIMISE KASUKS PÕLLUKULTUURIDE GENEETILISELE PARANDAMISELE JA NENDE SÄÄSTVALE MAJANDAMISELE. TAIMEDE PAREM KOHANEMINE LUBJARIKKA PINNASEGA ON KEERULINE PROBLEEM, MIS HÕLMAB USU JA ZN TÕHUSUST, VASTUPIDAVUST LIIGSELE KALTSIUMKARBONAADILE NING TAIME-MULLA-MIKROORGANISMIDE VASTASTIKMÕJU. PROJEKTI EESMÄRK ON ANDA PÕHITEAVET, ET KIIRENDADA SELLELE OLULISELE PROBLEEMILE SUUNATUD GENEETILISE PARANDAMISE PROGRAMME JA AIDATA KAASA SEDA TÜÜPI PINNASE PÕLLUKULTUURIDE SÄÄSTVALE MAJANDAMISELE. SELLEKS TOETUME UURINGULE LOODUSLIKU GENEETILISE VARIATSIOONI NING ISELOOMULIKE MOLEKULAARSETE JA FÜSIOLOOGILISTE MEHHANISMIDE KOHTA ARABIDOPSIS THALIANA LOODUSLIKES POPULATSIOONIDES, MIS ON KOHANENUD VASTANDATUD, RÄNI- VÕI LUBJARIKASTE OMADUSTEGA MULDADEGA, MIS ASUVAD POOLSAARE NE LÄHIÜMBRUSES. MEIE TEISE PROJEKTI AJAL, MIDA RAHASTASIME MEIE POOLT NIH, LOODUSLIKU IONOMIC VARIATIONABOUT GENEETILINE ALUS LOODUSLIKE RANNIKUPOPULATSIOONIDE KOHANEMISEKS SOOLASE STRESSIGA, TÄHELDASIME JUHUSLIKULT A. THALIANA EELISTUST RÄNIMULDADELE JA SELLE VÄHEST SISALDUST LUBJARIKASTES MULDADES. MEIE PROJEKTI LÄHTEHÜPOTEES ON SEE, ET TAIME A. THALIANA LOODUSLIKUD VARIATSIOONID KONTRASTSETES MULDADES (SILICEOS VS CALCAREOS) ON OLULINE GENEETILISE TEABE ALLIKAS ADAPTIIVSETE PROTSESSIDE UURIMISEKS, MIS VÕIMALDAVAD TAIMEDEL TULLA TOIME LUBJARIKKA PINNASE TINGIMUSTEGA. MEIE MEESKONNA KOOSTÖÖ SELLE VALDKONNA JUHTIVATE RÜHMADEGA (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK JA PROF M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) VÕIMALDAB MEIL SÕNASTADA KONKREETSED EESMÄRGID (VÕI) RÜHMITATUD KOLME TÖÖSTSENAARIUMI (HT): HT1: KALTSIUMKARBONAAT PÄRSIB A. THALIANA LOOMULIKKU JAOTUMIST. O1: KONTROLLITAKSE A. THALIANA LOODUSLIKU JAOTUSE JA LUBJARIKASTE MULDADE JAOTUSE PÖÖRDVÕRDELIST SUHET. O2: VALIDA FENOTÜÜBI ALUSEL TÕESTATUD LUBJARIKASTE MULDADE TALUVUSE ÖKOTÜÜBID. HT2: A. THALIANA SOBIVUS LUBJARIKASTES MULDADES ON VÕTMEKS USUTÕHUSUSELE JA ZN TÕHUSUSELE. O3: KONTRASTSETE ÖKOTÜÜPIDE REAGEERINGU VÕRDLUS USUPUUDUSELE JA ZN-LE, OLENEMATA SELLEST, KAS SEE ON KOMBINEERITUD KALTSIUMKARBONAADIGA VÕI MITTE, FÜSIOLOOGILISEL TASANDIL. O4: GENICASE ERINEVUSTE ISELOOMUSTUS, MIS PÕHJUSTAB DIFERENTSIAALKÄITUMIST, ÜLETADES VASTANDATUD ÖKOTÜÜPE JA TUVASTADES TOLERANTSE FENOTÜÜBIGA SEOTUD GENEETILISI MARKEREID ERALDAVAS F2 KAARDISTAMISE POPULATSIOONIS, KASUTADES „SUURE SEGRAGATSIOONI ANALÜÜSI“, MIS PÕHINEB „JÄRGMISE PÕLVKONNA SEKVENEERIMISEL“ (BSA-SEQ). HT3: ZN JA USK ON TAIME-MULLA-MIKROORGANISMIDE KOOSTOIME VÕTI. O5 TAIME MIKROBIOOMI ISELOOMUSTAMINE USU JA ZN TÕHUSUSE ERINEVUSEST NING SELLE VÕIMALIK ROLL TOITAINETE MOBILISEERIMISEL. O6: ZN MÄÄRUS JA MIKROORGANISMID KOHANEVAD KASVUREAKTSIOONID JA ARENG ZN-AUXINI KOOSTOIME KAUDU. (Estonian)
17 August 2022
0 references
SZÁMOS NÖVÉNYNEK A MESZES TALAJ ÁLLAPOTÁHOZ VALÓ GYENGE ALKALMAZKODÁSA KORLÁTOZZA A MEZŐGAZDASÁGI TERMELÉST A VILÁG NAGY TERÜLETEIN, KÜLÖNÖSEN AZ ARIDAS-BAN VAGY A FÉLSZÁRAZ RÉGIÓKBAN. A VAS ÉS A CINK ALACSONY ELÉRHETŐSÉGE A NÖVÉNYEK SZÁMÁRA EZEKBEN A TALAJOKBAN MEGNEHEZÍTI AZ ILYEN ALAPVETŐ TÁPANYAGOKKAL RENDELKEZŐ NÖVÉNYI ÉLELMISZEREK BIOERŐSÍTÉSÉT. A NÖVÉNYEK HITHIÁNYRA ÉS ZN-RE VALÓ REAGÁLÁSI MECHANIZMUSAI MÁR JÓL MEGALAPOZOTTAK. LASSABB EREDMÉNYEK AZ ÖSSZES GENETIKAI-MOLEKULÁRIS TUDÁS GYAKORLATI INTEGRÁCIÓJA A NÖVÉNYEK GENETIKAI JAVÍTÁSA ÉS FENNTARTHATÓ KEZELÉSE ÉRDEKÉBEN. A NÖVÉNYEK MESZES TALAJHOZ VALÓ ALKALMAZKODÁSÁNAK JAVÍTÁSA ÖSSZETETT PROBLÉMA, AMELY MAGÁBAN FOGLALJA A HIT ÉS A ZN HATÉKONYSÁGÁT, A FELESLEGES KALCIK-KARBONÁTTAL SZEMBENI ELLENÁLLÁST ÉS A KÖLCSÖNHATÁST A NÖVÉNY-TALAJ-MIKROORGANIZMUSOKKAL SZEMBEN. A PROJEKT CÉLJA, HOGY KULCSFONTOSSÁGÚ INFORMÁCIÓKKAL SZOLGÁLJON AZ E FONTOS PROBLÉMÁRA IRÁNYULÓ GENETIKAI FEJLESZTÉSI PROGRAMOK FELGYORSÍTÁSÁHOZ ÉS AZ ILYEN TÍPUSÚ TALAJBAN TERMESZTETT NÖVÉNYEK FENNTARTHATÓ KEZELÉSÉHEZ. EHHEZ TÁMASZKODUNK A TERMÉSZETES GENETIKAI VARIÁCIÓK ÉS JELLEGZETES MOLEKULÁRIS ÉS FIZIOLÓGIAI MECHANIZMUSOK TANULMÁNYOZÁSÁRA AZ ARABIDOPSIS THALIANA VADON ÉLŐ POPULÁCIÓIBAN, AMELYEK A FÉLSZIGET KÖZELSÉGÉBEN ELHELYEZKEDŐ, KONTRASZTOS, KOVASAVAS ÉS MESZES TULAJDONSÁGOKKAL RENDELKEZŐ TALAJOKHOZ IGAZODNAK. EGY MÁSIK PROJEKTÜNK SORÁN, MELYET AZ NIH FINANSZÍROZ, A TERMÉSZETES IONOMIC VARIATIONABOUT A TERMÉSZETES PART MENTI POPULÁCIÓK SÓS STRESSZHEZ VALÓ ALKALMAZKODÁSÁNAK GENETIKAI ALAPJA, VÉLETLENÜL MEGFIGYELTÜK, HOGY A. THALIANA KEDVELI A KOVASAVAS TALAJOKAT ÉS ALACSONY JELENLÉTÉT A MESZES TALAJOKBAN. A PROJEKT KIINDULÓPONTJA AZ, HOGY AZ A. THALIANA NÖVÉNY TERMÉSZETES VARIÁCIÓJA KONTRASZTOS TALAJOKBAN (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) FONTOS GENETIKAI INFORMÁCIÓFORRÁS AZ ADAPTÍV FOLYAMATOK TANULMÁNYOZÁSÁHOZ, AMELYEK LEHETŐVÉ TESZIK A NÖVÉNYEK SZÁMÁRA, HOGY MEGBIRKÓZZANAK A MESZES TALAJOK KÖRÜLMÉNYEIVEL. CSAPATUNK EGYÜTTMŰKÖDÉSE VEZETŐ CSOPORTOKKAL EZEN A TERÜLETEN (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK ÉS PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) LEHETŐVÉ TESZI SZÁMUNKRA, HOGY KONKRÉT CÉLOKAT FOGALMAZZUNK MEG (VAGY) HÁROM MUNKAFORGATÓKÖNYVBE CSOPORTOSÍTVA (HT): HT1: A KALCIKUS KARBONÁT GÁTOLJA AZ A. THALIANA TERMÉSZETES ELOSZLÁSÁT. O1: ELLENŐRIZZE AZ A. THALIANA TERMÉSZETES ELOSZLÁSA ÉS A MESZES TALAJOK ELOSZLÁSA KÖZÖTTI INVERZ KAPCSOLATOT. O2: FENOTÍPUS ALAPJÁN VÁLASSZA KI A MESZES TALAJOKKAL SZEMBENI IGAZOLT TOLERANCIA ÖKOTÍPUSAIT. HT2: A HITHATÉKONYSÁG ÉS A ZN-HATÉKONYSÁG KULCSFONTOSSÁGÚ AZ A. THALIANA MESZES TALAJBAN VALÓ ALKALMASSÁGÁHOZ. O3: A KONTRASZT ÖKOTÍPUSOKNAK A HITHIÁNYRA ÉS A ZN-RE ADOTT VÁLASZÁNAK ÖSSZEHASONLÍTÁSA KALCIKUS KARBONÁTTAL KOMBINÁLVA IS, FIZIOLÓGIAI SZINTEN. O4: A KÜLÖNBÖZŐ VISELKEDÉSÉRT FELELŐS GENICAS-KÜLÖNBSÉGEK JELLEMZÉSE A KONTRASZTOS ÖKOTÍPUSOK KERESZTEZÉSÉVEL ÉS A TOLERÁNS FENOTÍPUSHOZ KAPCSOLÓDÓ GENETIKAI MARKEREK AZONOSÍTÁSÁVAL EGY ELKÜLÖNÍTŐ F2 TÉRKÉPEZÉSI POPULÁCIÓBAN, A „KÖVETKEZŐ GENERÁCIÓS SZEKVENÁLÁSON” (BSA-SEQ) ALAPULÓ „ÖMLESZTETT SEGRAGÁCIÓS ELEMZÉS” FELHASZNÁLÁSÁVAL. HT3: A ZN ÉS A HIT KULCSFONTOSSÁGÚAK A NÖVÉNY-TALAJ-MIKROORGANIZMUSOK KÖLCSÖNHATÁSÁBAN. O5. A NÖVÉNY MIKROBIÓMJÁNAK JELLEMZÉSE A HIT ÉS A ZN KÜLÖNBÖZŐ HATÉKONYSÁGA ÉS LEHETSÉGES SZEREPE A TÁPANYAGOK MOZGÓSÍTÁSÁBAN. O6: ZN RENDELET ÉS MIKROORGANIZMUSOK ADAPTÍV NÖVEKEDÉSI VÁLASZOK ÉS FEJLŐDÉS RÉVÉN ZN-AUXIN KÖLCSÖNHATÁS. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ЛОШОТО АДАПТИРАНЕ НА МНОГО КУЛТИВИРАЩИ РАСТЕНИЯ КЪМ УСЛОВИЯТА НА ВАРОВИКОВИТЕ ПОЧВИ ОГРАНИЧАВА СЕЛСКОСТОПАНСКОТО ПРОИЗВОДСТВО В ГОЛЕМИ РАЙОНИ НА СВЕТА, ОСОБЕНО В ARIDAS ИЛИ ПОЛУСУХИТЕ РАЙОНИ. НИСКАТА НАЛИЧНОСТ НА ЖЕЛЯЗО И ЦИНК ЗА РАСТЕНИЯТА В ТЕЗИ ПОЧВИ ЗАТРУДНЯВА БИООБОГАТЯВАНЕТО НА РАСТИТЕЛНИТЕ ХРАНИ С ТЕЗИ ОСНОВНИ ХРАНИТЕЛНИ ВЕЩЕСТВА. МЕХАНИЗМИТЕ НА РЕАКЦИЯ НА РАСТЕНИЯТА КЪМ НЕДОСТИГА НА ВЯРА И ZN ВЕЧЕ СА ДОБРЕ УСТАНОВЕНИ. ПО-БАВНИ РЕЗУЛТАТИ ПРАКТИЧЕСКОТО ИНТЕГРИРАНЕ НА ВСИЧКИ ТЕЗИ ГЕНЕТИЧНО-МОЛЕКУЛНИ ЗНАНИЯ В ПОЛЗА НА ГЕНЕТИЧНОТО ПОДОБРЯВАНЕ НА КУЛТУРИТЕ И ТЯХНОТО УСТОЙЧИВО УПРАВЛЕНИЕ. ПОДОБРЯВАНЕТО НА АДАПТИРАНЕТО НА РАСТЕНИЯТА КЪМ ВАРОВИКОВИТЕ ПОЧВИ Е СЛОЖЕН ПРОБЛЕМ, КОЙТО ВКЛЮЧВА ЕФЕКТИВНОСТ НА ВЯРАТА И ZN, УСТОЙЧИВОСТ НА ИЗЛИШНИЯ КАЛЦИЧЕН КАРБОНАТ И ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО МЕЖДУ РАСТИТЕЛНИТЕ И ПОЧВЕНИТЕ МИКРООРГАНИЗМИ И МИКРООРГАНИЗМИТЕ. ТОЗИ ПРОЕКТ ИМА ЗА ЦЕЛ ДА ПРЕДОСТАВИ КЛЮЧОВА ИНФОРМАЦИЯ ЗА УСКОРЯВАНЕ НА ПРОГРАМИТЕ ЗА ГЕНЕТИЧНО ПОДОБРЕНИЕ, НАСОЧЕНИ КЪМ ТОЗИ ВАЖЕН ПРОБЛЕМ, И ДА ПОМОГНЕ ЗА УСТОЙЧИВОТО УПРАВЛЕНИЕ НА КУЛТУРИТЕ В ТОЗИ ВИД ПОЧВА. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ РАЗЧИТАМЕ НА ИЗУЧАВАНЕТО НА ЕСТЕСТВЕНИТЕ ГЕНЕТИЧНИ ВАРИАЦИИ И ОТЛИЧИТЕЛНИТЕ МОЛЕКУЛЯРНИ И ФИЗИОЛОГИЧНИ МЕХАНИЗМИ В ДИВИТЕ ПОПУЛАЦИИ НА ARABIDOPSIS THALIANA, ПРИСПОСОБЕНИ КЪМ ПОЧВИ С КОНТРАСТНИ, СИЛИКАТНИ СПРЯМО ВАРОВИКОВИ ХАРАКТЕРИСТИКИ, РАЗПОЛОЖЕНИ В БЛИЗКИ РАЙОНИ НА ПОЛУОСТРОВА NE. ПО ВРЕМЕ НА ДРУГ НАШ ПРОЕКТ, ФИНАНСИРАН ОТ НАС NIH, ГЕНЕТИЧНАТА ОСНОВА НА ЕСТЕСТВЕНИЯ IONOMIC VARIATIONABOUT ГЕНЕТИЧНАТА ОСНОВА НА ПРИСПОСОБЯВАНЕТО НА ЕСТЕСТВЕНИТЕ КРАЙБРЕЖНИ ПОПУЛАЦИИ КЪМ СОЛЕНИЯ СТРЕС, СЛУЧАЙНО НАБЛЮДАВАХМЕ ПРЕДПОЧИТАНИЕТО НА А. ТАЛИАНА КЪМ СИЛИКАТНИ ПОЧВИ И СЛАБОТО МУ ПРИСЪСТВИЕ ВЪВ ВАРОВИКОВИ ПОЧВИ. НАШАТА НАЧАЛНА ХИПОТЕЗА ЗА ТОЗИ ПРОЕКТ Е, ЧЕ ЕСТЕСТВЕНАТА ВАРИАЦИЯ НА РАСТЕНИЕТО А. ТАЛИАНА В КОНТРАСТНИ ПОЧВИ (SILICEOS СРЕЩУ CALCAREOS) Е ВАЖЕН ИЗТОЧНИК НА ГЕНЕТИЧНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА ИЗУЧАВАНЕТО НА АДАПТИВНИ ПРОЦЕСИ, КОИТО ПОЗВОЛЯВАТ НА РАСТЕНИЯТА ДА СЕ СПРАВЯТ С УСЛОВИЯТА НА ВАРОВИКОВИТЕ ПОЧВИ. СЪТРУДНИЧЕСТВОТО НА НАШИЯ ЕКИП С ВОДЕЩИ ГРУПИ В ТАЗИ ОБЛАСТ (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK И ПРОФ. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, САЩ) НИ ПОЗВОЛЯВА ДА ФОРМУЛИРАМЕ КОНКРЕТНИ ЦЕЛИ (ИЛИ) ГРУПИРАНИ В ТРИ РАБОТНИ СЦЕНАРИЯ (HT): HT1: КАЛЦИСНИЯТ КАРБОНАТ ИНХИБИРА ЕСТЕСТВЕНОТО РАЗПРЕДЕЛЕНИЕ НА A. THALIANA. O1: ПРОВЕРЕТЕ ОБРАТНАТА ВРЪЗКА МЕЖДУ ЕСТЕСТВЕНОТО РАЗПРЕДЕЛЕНИЕ НА A. THALIANA И РАЗПРЕДЕЛЕНИЕТО НА ВАРОВИКОВИ ПОЧВИ. O2: ИЗБЕРЕТЕ, ВЪЗ ОСНОВА НА ФЕНОТИПА, ЕКОТИПОВЕ С ДОКАЗАНА ПОНОСИМОСТ КЪМ ВАРОВИКОВИ ПОЧВИ. HT2: ЕФЕКТИВНОСТТА НА ВЯРАТА И ЕФЕКТИВНОСТТА НА ZN СА ОТ КЛЮЧОВО ЗНАЧЕНИЕ ЗА ГОДНОСТТА НА А. ТАЛИАНА ВЪВ ВАРОВИКОВИ ПОЧВИ. O3: СРАВНЕНИЕ НА РЕАКЦИЯТА НА КОНТРАСТИРАНИ ЕКОТИПОВЕ КЪМ ДЕФИЦИТ НА ВЯРА И ZN, НЕЗАВИСИМО ДАЛИ СЕ КОМБИНИРА С КАЛЦИНОВ КАРБОНАТ, НА ФИЗИОЛОГИЧНО НИВО. O4: ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА РАЗЛИКИТЕ В GENICAS, ОТГОВОРНИ ЗА ДИФЕРЕНЦИАЛНОТО ПОВЕДЕНИЕ, ЧРЕЗ КРЪСТОСВАНЕ НА КОНТРАСТИРАНИ ЕКОТИПОВЕ И ИДЕНТИФИЦИРАНЕ НА ГЕНЕТИЧНИ МАРКЕРИ, СВЪРЗАНИ С ТОЛЕРАНТНИЯ ФЕНОТИП, В СЕГРЕГИРАЩА ПОПУЛАЦИЯ, КАРТОГРАФИРАЩА F2, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВА „АНАЛИЗ НА НАСИПНАТА СЕГРЕГАЦИЯ„ВЪЗ ОСНОВА НА „СЛЕДВАЩО ПОКОЛЕНИЕ СЕКВЕНИРАНЕ“ (BSA-SEQ). HT3: ZN И ВЯРАТА СА КЛЮЧОВИ ВЪВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО РАСТЕНИЕ-ПОЧВА-МИКРООРГАНИЗМИ. O5. ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА РАСТИТЕЛНИЯ МИКРОБИОМ НА ДИФЕРЕНЦИАЛНАТА ЕФЕКТИВНОСТ НА ВЯРАТА И ZN И НЕГОВАТА ВЪЗМОЖНА РОЛЯ В МОБИЛИЗИРАНЕТО НА ХРАНИТЕЛНИ ВЕЩЕСТВА. O6: ZN РЕГУЛАЦИЯ И МИКРООРГАНИЗМИ АДАПТИВНИ РЕАКЦИИ НА РАСТЕЖА И РАЗВИТИЕ ЧРЕЗ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ZN-AUXIN. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
PRASTAS DAUGELIO AUGINIMO AUGALŲ PRISITAIKYMAS PRIE KALKINGO DIRVOŽEMIO SĄLYGŲ RIBOJA ŽEMĖS ŪKIO GAMYBĄ DIDELIUOSE PASAULIO REGIONUOSE, YPAČ ARIDAS AR PUSIAU SAUSRINGUOSE REGIONUOSE. DĖL TO, KAD ŠIUOSE DIRVOŽEMIUOSE AUGALAMS TRŪKSTA GELEŽIES IR CINKO, AUGALŲ MAISTO PRODUKTAMS SU ŠIOMIS PAGRINDINĖMIS MAISTINĖMIS MEDŽIAGOMIS SUNKU BIOFORTIFIKUOTI. AUGALŲ REAGAVIMO Į TIKĖJIMO TRŪKUMĄ IR ZN MECHANIZMAI JAU YRA GERAI ĮSITVIRTINĘ. LĖTESNIS VISŲ ŠIŲ GENETINIŲ-MOLEKULINIŲ ŽINIŲ INTEGRAVIMAS Į GENETINĮ AUGALŲ TOBULINIMĄ IR JŲ TVARŲ VALDYMĄ. AUGALŲ PRISITAIKYMO PRIE KALKINGŲ DIRVOŽEMIŲ GERINIMAS YRA SUDĖTINGA PROBLEMA, SUSIJUSI SU TIKĖJIMO IR ZN EFEKTYVUMU, ATSPARUMU PERTEKLINIAM KALCINIO KARBONATO KIEKIUI IR AUGALŲ-DIRVOŽEMIŲ-MIKROORGANIZMŲ SĄVEIKA. ŠIO PROJEKTO TIKSLAS – TEIKTI PAGRINDINĘ INFORMACIJĄ, KAD BŪTŲ GALIMA PASPARTINTI GENETINIO TOBULINIMO PROGRAMAS, SKIRTAS ŠIAI SVARBIAI PROBLEMAI SPRĘSTI, IR PADĖTI TVARIAI VALDYTI ŠIOS RŪŠIES DIRVOŽEMĮ. TAM MES PASIKLIAUJAME NATŪRALIOS GENETINĖS VARIACIJOS IR SAVITŲ MOLEKULINIŲ IR FIZIOLOGINIŲ MECHANIZMŲ TYRIMU LAUKINĖSE ARABIDOPSIS THALIANA POPULIACIJOSE, PRISITAIKIUSIOSE PRIE KONTRASTINGŲ, SILIKATINIŲ IR KALKAKMENIŲ DIRVOŽEMIŲ, ESANČIŲ ARTIMOSE PUSIASALIO VIETOVĖSE. PER KITĄ MŪSŲ PROJEKTĄ, FINANSUOJAMĄ IŠ MŪSŲ NIH, NATŪRALAUS IONOMIC VARIATIONABOUT GENETINIO PAGRINDO PRISITAIKYMĄ PRIE FIZIOLOGINIO STRESO GENETINIS PAGRINDAS, MES ATSITIKTINAI STEBĖJOME A. THALIANA’S PIRMENYBĘ SILIKATIŠKAM DIRVOŽEMIUI IR JO MAŽĄ BUVIMĄ KALKINGUOSE DIRVOŽEMIUOSE. MŪSŲ PRADINĖ ŠIO PROJEKTO HIPOTEZĖ YRA TA, KAD NATŪRALUS AUGALO A. THALIANA VARIACIJA KONTRASTINGUOSE DIRVOŽEMIUOSE (SILICEOS PRIEŠ CALCAREOS) YRA SVARBUS GENETINĖS INFORMACIJOS ŠALTINIS ADAPTACINIŲ PROCESŲ, KURIE LEIDŽIA AUGALAMS SUSIDOROTI SU KALKINGŲ DIRVOŽEMIŲ SĄLYGOMIS, TYRIMUI. MŪSŲ KOMANDOS BENDRADARBIAVIMAS SU PIRMAUJANČIOMIS ŠIOS SRITIES GRUPĖMIS (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK IR PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH KOLEDŽAS, JAV) LEIDŽIA SUFORMULUOTI KONKREČIUS TIKSLUS (ARBA) SUGRUPUOTUS Į TRIS DARBO SCENARIJUS (HT): HT1: KALCIO KARBONATAS SLOPINA NATŪRALŲ A. THALIANA PASISKIRSTYMĄ. O1: PATIKRINKITE ATVIRKŠTINĮ RYŠĮ TARP NATŪRALAUS A. THALIANA PASISKIRSTYMO IR KALKINGŲ DIRVOŽEMIŲ PASISKIRSTYMO. O2: PAGAL FENOTIPĄ PASIRINKITE ĮRODYTO TOLERANCIJOS KALKINGAM DIRVOŽEMIUI EKOTIPUS. HT2: TIKĖJIMO EFEKTYVUMAS IR ZN EFEKTYVUMAS YRA LABAI SVARBŪS A. THALIANA’S FITNESO KALKINGUOSE DIRVOŽEMIUOSE. O3: KONTRASTINGŲ EKOTIPŲ ATSAKO Į TIKĖJIMO TRŪKUMĄ IR ZN (KARTU SU KALCIO KARBONATU ARBA NE) FIZIOLOGINIU LYGIU PALYGINIMAS. O4: GENICAS SKIRTUMŲ, SUSIJUSIŲ SU DIFERENCINE ELGSENA, APIBŪDINIMAS KRYŽMINANT KONTRASTINGUS EKOTIPUS IR IDENTIFIKUOJANT GENETINIUS ŽYMENIS, SUSIJUSIUS SU TOLERANTIŠKU FENOTIPU ATSKIRTOJE F2 KARTOGRAFAVIMO POPULIACIJOJE, NAUDOJANT DIDELĖS APIMTIES SEGRAGACIJOS ANALIZĘ, PAGRĮSTĄ „KITOS KARTOS SEKOS NUSTATYMU“ (BSA-SEQ). HT3: ZN IR TIKĖJIMAS YRA LABAI SVARBŪS AUGALŲ, DIRVOŽEMIO IR MIKROORGANIZMŲ SĄVEIKAI. O5. AUGALO MIKROBIOMO, PASIŽYMINČIO DIFERENCINIU TIKĖJIMO IR ZN EFEKTYVUMU, APIBŪDINIMAS IR GALIMAS JO VAIDMUO MAISTINIŲ MEDŽIAGŲ MOBILIZAVIMUI. O6: ZN REGULIAVIMAS IR MIKROORGANIZMAI ADAPTYVUS AUGIMO ATSAKAS IR VYSTYMASIS PER ZN-AUXIN SĄVEIKOS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
LOŠA PRILAGODBA MNOGIH UZGOJNIH BILJAKA UVJETIMA VAPNENAČKOG TLA OGRANIČAVA POLJOPRIVREDNU PROIZVODNJU U VELIKIM DIJELOVIMA SVIJETA, POSEBNO U PODRUČJIMA ARIDAS-A ILI POLUSUŠNIM PODRUČJIMA. NISKA DOSTUPNOST ŽELJEZA I CINKA ZA BILJKE U TIM TLIMA OTEŽAVA BIOFORTIFIKACIJU BILJNE HRANE S TIM ESENCIJALNIM HRANJIVIM TVARIMA. MEHANIZMI ODGOVORA BILJAKA NA MANJAK VJERE I ZN VEĆ SU DOBRO USPOSTAVLJENI. SPORIJE REZULTIRA PRAKTIČNOM INTEGRACIJOM SVIH OVIH GENETSKI-MOLEKULARNIH ZNANJA U KORIST GENETSKOG POBOLJŠANJA USJEVA I NJIHOVOG ODRŽIVOG UPRAVLJANJA. POBOLJŠANJE PRILAGODBE BILJAKA VAPNENAČKIM TLIMA SLOŽEN JE PROBLEM KOJI UKLJUČUJE UČINKOVITOST VJERE I ZN, OTPORNOST NA VIŠAK KALCIJEVOG KARBONATA I INTERAKCIJU BILJNIH MIKROORGANIZAMA. CILJ JE OVOG PROJEKTA PRUŽITI KLJUČNE INFORMACIJE KAKO BI SE UBRZALI PROGRAMI GENETSKOG POBOLJŠANJA USMJERENI NA OVAJ VAŽAN PROBLEM I POMOGLO U ODRŽIVOM UPRAVLJANJU USJEVIMA U OVOJ VRSTI TLA. ZA TO SE OSLANJAMO NA PROUČAVANJE PRIRODNIH GENETSKIH VARIJACIJA I PREPOZNATLJIVIH MOLEKULARNIH I FIZIOLOŠKIH MEHANIZAMA U DIVLJIM POPULACIJAMA ARABIDOPSIS THALIANA PRILAGOĐENE TLIMA KONTRASTNIH, SILIKATNIH NASPRAM VAPNENAČKIH SVOJSTAVA, KOJA SE NALAZE U BLIZINI PODRUČJA NA POLUOTOKU NE. TIJEKOM DRUGOG NAŠEG PROJEKTA, FINANCIRANOG OD STRANE NAS NIH, GENETSKE OSNOVE PRIRODNE IONOMIC VARIATIONABOO GENETSKOJ OSNOVI PRILAGODBE PRIRODNIH OBALNIH POPULACIJA STRESU SLANE OTOPINE, SLUČAJNO SMO UOČILI SKLONOST A. THALIANE ZA SILIKATNA TLA I NJEGOVU NISKU PRISUTNOST U VAPNENAČKIM TLIMA. NAŠA POČETNA HIPOTEZA ZA OVAJ PROJEKT JE DA JE PRIRODNA VARIJACIJA BILJKE A. THALIANA U KONTRASTNIM TLIMA (SILICEOS NASPRAM CALCAREOS-A) VAŽAN IZVOR GENETSKIH INFORMACIJA ZA PROUČAVANJE ADAPTIVNIH PROCESA KOJI BILJKAMA OMOGUĆUJU DA SE NOSE S UVJETIMA VAPNENAČKOG TLA. SURADNJA NAŠEG TIMA S VODEĆIM GRUPAMA U OVOM PODRUČJU (PROF. D.E. SOL UNIV. ABERDEEN, VELIKA BRITANIJA I PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, SAD) OMOGUĆUJE NAM DA FORMULIRAMO KONKRETNE CILJEVE (ILI) GRUPIRANE U TRI RADNA SCENARIJA (HT): HT1: KALCIJEV KARBONAT INHIBIRA PRIRODNU DISTRIBUCIJU A. TALIANE. O1: PROVJERITI OBRNUTI ODNOS IZMEĐU PRIRODNE DISTRIBUCIJE A. TALIANE I RASPODJELE VAPNENAČKIH TLA. O2: NA TEMELJU FENOTIPA ODABERITE EKOTIPOVE DOKAZANE TOLERANCIJE NA VAPNENAČKA TLA. HT2: UČINKOVITOST VJERE I ZN UČINKOVITOSTI KLJUČNI SU ZA SPOSOBNOST A. THALIANE U VAPNENAČKIM TLIMA. O3: USPOREDBA ODGOVORA KONTRASTNIH EKOTIPOVA NA VJERSKI DEFICIT I ZN, BILO DA SE KOMBINIRA S KALCIJEVIM KARBONATOM ILI NE, NA FIZIOLOŠKOJ RAZINI. O4: KARAKTERIZACIJA RAZLIKA GENICAS-A ODGOVORNA ZA DIFERENCIJALNO PONAŠANJE KRIŽANJEM KONTRASTNIH EKOTIPOVA I IDENTIFICIRANJEM GENETSKIH MARKERA POVEZANIH S TOLERANTNIM FENOTIPOM U SEGREGIRAJUĆOJ POPULACIJI ZA MAPIRANJE F2 KORIŠTENJEM „ANALIZE SEGRAGACIJE U VELIKIM KOLIČINAMA” NA TEMELJU „SEKVENCIRANJA SLJEDEĆE GENERACIJE” (BSA-SEQ). HT3: ZN I VJERA SU KLJUČNI ZA MEĐUDJELOVANJE BILJAKA, TLA I MIKROORGANIZAMA. O5. KARAKTERIZACIJA BILJNOG MIKROBIOMA DIFERENCIJALNE UČINKOVITOSTI VJERE I ZN I NJEGOVA MOGUĆA ULOGA U MOBILIZACIJI HRANJIVIH TVARI. O6: ZN REGULACIJA I MIKROORGANIZMI ADAPTIVNI ODGOVORI RASTA I RAZVOJ KROZ INTERAKCIJE ZN-AUXIN. (Croatian)
17 August 2022
0 references
DEN DÅLIGA ANPASSNINGEN AV MÅNGA ODLINGSVÄXTER TILL KALKHALTIGA JORDMÅNER BEGRÄNSAR JORDBRUKSPRODUKTIONEN I STORA DELAR AV VÄRLDEN, SÄRSKILT I ARIDAS ELLER HALVTORRA REGIONER. DEN LÅGA TILLGÅNGEN PÅ JÄRN OCH ZINK FÖR VÄXTER I DESSA JORDAR GÖR DET SVÅRT FÖR VÄXTFODER MED DESSA VIKTIGA NÄRINGSÄMNEN ATT VARA BIOBERIKANDE. MEKANISMERNA FÖR ATT REAGERA PÅ VÄXTERNAS BRIST PÅ TRO OCH ZN ÄR REDAN VÄLETABLERADE. LÅNGSAMMARE RESULTAT DEN PRAKTISKA INTEGRATIONEN AV ALLA DESSA GENETISKA-MOLEKYLÄRA KUNSKAPER TILL FÖRMÅN FÖR GENETISK FÖRBÄTTRING AV GRÖDOR OCH DERAS HÅLLBARA FÖRVALTNING. ATT FÖRBÄTTRA VÄXTERNAS ANPASSNING TILL KALKHALTIGA JORDAR ÄR ETT KOMPLEXT PROBLEM SOM INBEGRIPER EFFEKTIVITETEN I TRO OCH ZN, RESISTENS MOT ÖVERSKOTT AV KALCISKT KARBONAT OCH INTERAKTIONEN MELLAN VÄXT-JORD-MIKROORGANISMER. DETTA PROJEKT SYFTAR TILL ATT TILLHANDAHÅLLA VIKTIG INFORMATION FÖR ATT PÅSKYNDA DE GENETISKA FÖRBÄTTRINGSPROGRAM SOM SYFTAR TILL DETTA VIKTIGA PROBLEM OCH FÖR ATT BIDRA TILL EN HÅLLBAR FÖRVALTNING AV GRÖDOR I DENNA TYP AV JORD. FÖR DETTA FÖRLITAR VI OSS PÅ STUDIEN AV NATURLIG GENETISK VARIATION OCH DISTINKTA MOLEKYLÄRA OCH FYSIOLOGISKA MEKANISMER I VILDA POPULATIONER AV ARABIDOPSIS THALIANA ANPASSADE TILL JORDAR AV KONTRASTERADE, KISELAKTIGA KONTRA KALKHALTIGA EGENSKAPER, BELÄGNA I NÄRHETEN AV OMRÅDEN I HALVÖN. UNDER ETT ANNAT PROJEKT AV VÅRT, FINANSIERAT AV OSS NIH, DEN GENETISKA GRUNDEN FÖR NATURLIGA IONOMIC VARIATIONABOUT DEN GENETISKA GRUNDEN FÖR ANPASSNING AV NATURLIGA KUSTPOPULATIONER TILL SALTA STRESS, OBSERVERADE VI TILLFÄLLIGT A. THALIANA’S PREFERENS FÖR KISELHALTIGA JORDAR OCH DESS LÅGA FÖREKOMST I KALKJORDAR. VÅR STARTHYPOTES FÖR DETTA PROJEKT ÄR ATT DEN NATURLIGA VARIATIONEN AV VÄXT A. THALIANA I KONTRASTERADE JORDAR (SILICEOS KONTRA CALCAREOS) ÄR EN VIKTIG KÄLLA TILL GENETISK INFORMATION FÖR ATT STUDERA ADAPTIVA PROCESSER SOM GÖR DET MÖJLIGT FÖR VÄXTER ATT KLARA AV KALKHALTIGA JORDAR. SAMARBETET MELLAN VÅRT TEAM OCH LEDANDE GRUPPER INOM DETTA OMRÅDE (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, STORBRITANNIEN OCH PROFESSOR M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) GÖR DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT FORMULERA KONKRETA MÅL (ELLER) GRUPPERADE I TRE ARBETSSCENARIER (HT): HT1: CALCIC CARBONATE HÄMMAR DEN NATURLIGA FÖRDELNINGEN AV A. THALIANA. O1: KONTROLLERA DET OMVÄNDA FÖRHÅLLANDET MELLAN DEN NATURLIGA FÖRDELNINGEN AV A. THALIANA OCH FÖRDELNINGEN AV KALKJORDAR. O2: VÄLJ, BASERAT PÅ FENOTYP, EKOTYPER AV BEVISAD TOLERANS MOT KALKJORDAR. HT2: TROSEFFEKTIVITET OCH ZN-EFFEKTIVITET ÄR NYCKELN TILL A. THALIANA’S FITNESS I KALKHALTIGA JORDAR. O3: JÄMFÖRELSE AV HUR KONTRASTERADE EKOTYPER REAGERAR PÅ TROSUNDERSKOTT OCH ZN, ÄVEN I KOMBINATION MED KALCISKT KARBONAT, PÅ FYSIOLOGISK NIVÅ. O4: KARAKTERISERING AV DE GENICAS-SKILLNADER SOM ÄR ANSVARIGA FÖR DIFFERENTIALBETEENDE GENOM ATT KORSA KONTRASTERADE EKOTYPER OCH IDENTIFIERA GENETISKA MARKÖRER KOPPLADE TILL DEN TOLERANTA FENOTYPEN I EN SEGREGERANDE F2-KARTLÄGGNINGSPOPULATION MED HJÄLP AV ”BULK SEGRAGATIONSANALYS” BASERAD PÅ ”NÄSTA GENERATIONSSEKVENSERING” (BSA-SEQ). HT3: ZN OCH TRO ÄR NYCKELN TILL VÄXELVERKAN MELLAN VÄXT-JORD OCH MIKROORGANISMER. O5. KARAKTERISERING AV VÄXTMIKROBIOM AV DIFFERENTIAL EFFEKTIVITET I TRO OCH ZN OCH DESS MÖJLIGA ROLL I MOBILISERINGEN AV NÄRINGSÄMNEN. O6: ZN REGULATION OCH MIKROORGANISMER ADAPTIVA TILLVÄXTRESPONSER OCH UTVECKLING GENOM ZN-AUXIN INTERAKTION. (Swedish)
17 August 2022
0 references
ADAPTAREA NECORESPUNZĂTOARE A MULTOR PLANTE DE CULTURĂ LA CONDIȚIILE SOLULUI CALCAROS LIMITEAZĂ PRODUCȚIA AGRICOLĂ ÎN ZONE MARI ALE LUMII, ÎN SPECIAL ÎN REGIUNILE ARIDAS SAU SEMIARIDE. DISPONIBILITATEA SCĂZUTĂ A FIERULUI ȘI ZINCULUI PENTRU PLANTE ÎN ACESTE SOLURI ÎNGREUNEAZĂ BIOFORTIFICAREA ALIMENTELOR VEGETALE CU ACEȘTI NUTRIENȚI ESENȚIALI. MECANISMELE DE REACȚIE A PLANTELOR LA DEFICITUL DE CREDINȚĂ ȘI ZN SUNT DEJA BINE STABILITE. REZULTATE MAI LENTE INTEGRAREA PRACTICĂ A TUTUROR ACESTOR CUNOȘTINȚE GENETICO-MOLECULARE ÎN FAVOAREA ÎMBUNĂTĂȚIRII GENETICE A CULTURILOR ȘI A GESTIONĂRII DURABILE A ACESTORA. ÎMBUNĂTĂȚIREA ADAPTĂRII PLANTELOR LA SOLURILE CALCAROASE ESTE O PROBLEMĂ COMPLEXĂ CARE IMPLICĂ EFICIENȚA CREDINȚEI ȘI ZN, REZISTENȚA LA EXCESUL DE CARBONAT CALCIC ȘI INTERACȚIUNEA DINTRE PLANTE ȘI SOL-MICROORGANISME. ACEST PROIECT ÎȘI PROPUNE SĂ OFERE INFORMAȚII ESENȚIALE PENTRU ACCELERAREA PROGRAMELOR DE ÎMBUNĂTĂȚIRE GENETICĂ CARE VIZEAZĂ ACEASTĂ PROBLEMĂ IMPORTANTĂ ȘI SĂ AJUTE LA GESTIONAREA DURABILĂ A CULTURILOR ÎN ACEST TIP DE SOL. PENTRU ACEASTA NE BAZĂM PE STUDIUL VARIAȚIEI GENETICE NATURALE ȘI A MECANISMELOR MOLECULARE ȘI FIZIOLOGICE DISTINCTIVE ÎN POPULAȚIILE SĂLBATICE DE ARABIDOPSIS THALIANA ADAPTATE SOLURILOR DE CARACTERISTICI CONTRASTATE, SILICIOASE VERSUS CALCAROASE, SITUATE ÎN ZONE APROPIATE DIN PENINSULARĂ. ÎN CADRUL UNUI ALT PROIECT AL NOSTRU, FINANȚAT DE NOI, NIH, BAZA GENETICĂ A VARIAȚIEI NATURALE IONOMICĂ, AVÂND ÎN VEDERE BAZA GENETICĂ A ADAPTĂRII POPULAȚIILOR DE COASTĂ NATURALE LA STRESUL SALIN, AM OBSERVAT OCAZIONAL PREFERINȚA LUI A. THALIANA PENTRU SOLURILE SILICIOASE ȘI PREZENȚA SA SCĂZUTĂ ÎN SOLURILE CALCAROASE. IPOTEZA NOASTRĂ INIȚIALĂ PENTRU ACEST PROIECT ESTE CĂ VARIAȚIA NATURALĂ A PLANTEI A. THALIANA ÎN SOLURI CONTRASTANTE (SILICEOS VERSUS CALCAREOS) ESTE O SURSĂ IMPORTANTĂ DE INFORMAȚII GENETICE PENTRU STUDIUL PROCESELOR ADAPTIVE CARE PERMIT PLANTELOR SĂ FACĂ FAȚĂ CONDIȚIILOR SOLURILOR CALCAROASE. COLABORAREA ECHIPEI NOASTRE CU GRUPURI DE CONDUCERE ÎN ACEST DOMENIU (PROF. D.E. SARE UNIV. ABERDEEN, UK ȘI PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, SUA) NE PERMITE SĂ FORMULĂM OBIECTIVE CONCRETE (SAU) GRUPATE ÎN TREI SCENARII DE LUCRU (HT): HT1: CARBONATUL CALCIC INHIBĂ DISTRIBUȚIA NATURALĂ A LUI A. THALIANA. O1: VERIFICAȚI RELAȚIA INVERSĂ DINTRE DISTRIBUȚIA NATURALĂ A LUI A. THALIANA ȘI DISTRIBUȚIA SOLURILOR CALCAROASE. O2: SELECTAȚI, PE BAZA FENOTIPULUI, ECOTIPURILE DE TOLERANȚĂ DOVEDITĂ LA SOLURILE CALCAROASE. HT2: EFICIENȚA CREDINȚEI ȘI CREȘTEREA EFICIENȚEI ZN SUNT ESENȚIALE PENTRU FITNESS-UL LUI A. THALIANA ÎN SOLURILE CALCAROASE. O3: COMPARAREA RĂSPUNSULUI ECOTIPURILOR CONTRASTATE LA DEFICITUL DE CREDINȚĂ ȘI ZN, COMBINAT SAU NU CU CARBONAT CALCIC, LA NIVEL FIZIOLOGIC. O4: CARACTERIZAREA DIFERENȚELOR GENICAS RESPONSABILE PENTRU COMPORTAMENTUL DIFERENȚIAL PRIN ÎNCRUCIȘAREA ECOTIPURILOR CONTRASTATE ȘI IDENTIFICAREA MARKERILOR GENETICI LEGAȚI DE FENOTIPUL TOLERANT ÎNTR-O POPULAȚIE DE CARTOGRAFIERE F2 SEGREGANTĂ UTILIZÂND „ANALIZA SEGRAGĂRII ÎN VRAC” BAZATĂ PE „SECVENȚIEREA GENERAȚIEI URMĂTOARE” (BSA-SEQ). HT3: ZN ȘI CREDINȚA SUNT ESENȚIALE ÎN INTERACȚIUNEA DINTRE PLANTE ȘI SOL ȘI MICROORGANISME. O5. CARACTERIZAREA MICROBIOMULUI VEGETAL AL EFICIENȚEI DIFERENȚIALE A CREDINȚEI ȘI ZN ȘI ROLUL SĂU POSIBIL ÎN MOBILIZAREA NUTRIENȚILOR. O6: ZN REGULATION ȘI MICROORGANISME ADAPTIVE RĂSPUNSURI DE CREȘTERE ȘI DEZVOLTARE PRIN INTERACȚIUNEA ZN-AUXIN. (Romanian)
17 August 2022
0 references
SLABA PRILAGODITEV ŠTEVILNIH PRIDELOVALNIH RASTLIN RAZMERAM APNENČASTIH TAL OMEJUJE KMETIJSKO PROIZVODNJO NA VELIKIH OBMOČJIH SVETA, ZLASTI V REGIJAH ARIDAS ALI POLSUŠNIH REGIJAH. NIZKA RAZPOLOŽLJIVOST ŽELEZA IN CINKA ZA RASTLINE V TEH TLEH OTEŽUJE BIOLOŠKO UTRJEVANJE RASTLINSKIH ŽIVIL S TEMI BISTVENIMI HRANILI. MEHANIZMI ODZIVA RASTLIN NA POMANJKANJE VERE IN ZN SO ŽE DOBRO UVELJAVLJENI. POČASNEJŠI REZULTATI PRAKTIČNE INTEGRACIJE VSEH TEH GENETSKO-MOLEKULARNIH ZNANJ V KORIST GENETSKEGA IZBOLJŠANJA PRIDELKOV IN NJIHOVEGA TRAJNOSTNEGA UPRAVLJANJA. IZBOLJŠANJE PRILAGAJANJA RASTLIN NA APNENČASTA TLA JE KOMPLEKSEN PROBLEM, KI VKLJUČUJE UČINKOVITOST VERE IN ZN, ODPORNOST NA ODVEČNI KALCIC KARBONAT IN INTERAKCIJO RASTLIN, TAL IN MIKROORGANIZMOV. CILJ TEGA PROJEKTA JE ZAGOTOVITI KLJUČNE INFORMACIJE ZA POSPEŠITEV PROGRAMOV GENETSKEGA IZBOLJŠANJA, NAMENJENIH TEMU POMEMBNEMU PROBLEMU, IN POMAGATI PRI TRAJNOSTNEM GOSPODARJENJU S PRIDELKI V TEJ VRSTI TAL. ZA TO SE ZANAŠAMO NA ŠTUDIJO NARAVNIH GENETSKIH VARIACIJ IN ZNAČILNIH MOLEKULARNIH IN FIZIOLOŠKIH MEHANIZMOV PRI DIVJIH POPULACIJAH ARABIDOPSIS THALIANA, PRILAGOJENIH TLEH KONTRASTNIH, SILIKAOZNIH V PRIMERJAVI Z APNENČASTIMI ZNAČILNOSTMI, KI SE NAHAJAJO V BLIŽINI OBMOČIJ POLOTOKA. V DRUGEM PROJEKTU, KI GA FINANCIRAMO Z NIH, GENETSKO OSNOVO NARAVNE IONOMIC VARIATIONABOUT GENETSKE OSNOVE PRILAGAJANJA NARAVNIH OBALNIH POPULACIJ FIZIOLOŠKEMU STRESU, SMO SLUČAJNO OPAZILI A. THALIANA’S PREFERENCE ZA SILIKATNA TLA IN NJENO NIZKO PRISOTNOST V APNENČASTIH TLEH. NAŠA ZAČETNA HIPOTEZA ZA TA PROJEKT JE, DA JE NARAVNA VARIACIJA RASTLINE A. THALIANA V KONTRASTNIH TLEH (SILICEOS PROTI CALCAREOS) POMEMBEN VIR GENETSKIH INFORMACIJ ZA PREUČEVANJE PRILAGODLJIVIH PROCESOV, KI OMOGOČAJO RASTLINAM, DA SE SPOPADEJO S POGOJI APNENČASTIH TAL. SODELOVANJE NAŠE EKIPE Z VODILNIMI SKUPINAMI NA TEM PODROČJU (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, ZDRUŽENO KRALJESTVO IN PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, ZDA) NAM OMOGOČA OBLIKOVANJE KONKRETNIH CILJEV (ALI) ZDRUŽENIH V TRI DELOVNE SCENARIJE (HT): HT1: KALCIC KARBONAT ZAVIRA NARAVNO PORAZDELITEV A. TALANA. O1: PREVERITE OBRATNO RAZMERJE MED NARAVNO PORAZDELITVIJO A. THALIANA IN PORAZDELITVIJO APNENČASTIH TAL. O2: NA PODLAGI FENOTIPA IZBERITE EKOTIPE DOKAZANE TOLERANCE NA APNENČASTA TLA. HT2: VERA UČINKOVITOSTI IN ZN UČINKOVITOSTI SO KLJUČNEGA POMENA ZA A. THALIANA’S FITNES V APNENČASTIH TLEH. O3: PRIMERJAVA ODZIVA NASPROTUJOČIH SI EKOTIPOV NA POMANJKANJE VERE IN ZN, V KOMBINACIJI S KALCIČNIM KARBONATOM ALI NE, NA FIZIOLOŠKI RAVNI. O4: KARAKTERIZACIJA RAZLIK GENICAS, KI SO ODGOVORNE ZA RAZLIČNO VEDENJE S PREČKANJEM NASPROTUJOČIH SI EKOTIPOV IN IDENTIFIKACIJO GENETSKIH OZNAČEVALCEV, POVEZANIH S TOLERANTNIM FENOTIPOM, V SEGREGIRANI POPULACIJI ZA KARTIRANJE F2 Z UPORABO „ANALIZE SEGRAGACIJE V RAZSUTEM STANJU“, KI TEMELJI NA „SEKVENCIRANJU NASLEDNJE GENERACIJE“ (BSA-SEQ). HT3: ZN IN VERA STA KLJUČNEGA POMENA ZA INTERAKCIJO MED RASTLINSKO, TALNO IN MIKROORGANIZMI. O5. KARAKTERIZACIJA RASTLINSKEGA MIKROBIOMA Z DIFERENCIALNO UČINKOVITOSTJO VERE IN ZN TER NJEGOVO MOŽNO VLOGO PRI MOBILIZACIJI HRANIL. O6: ZN REGULACIJA IN MIKROORGANIZMI PRILAGAJAJO RASTNE ODZIVE IN RAZVOJ PREK INTERAKCIJE ZN-AUXIN. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
SŁABE DOSTOSOWANIE WIELU ROŚLIN UPRAWNYCH DO WARUNKÓW GLEB WAPIENNYCH OGRANICZA PRODUKCJĘ ROLNĄ NA DUŻYCH OBSZARACH ŚWIATA, ZWŁASZCZA W REGIONACH ARIDAS LUB PÓŁSUCHYCH. NISKA DOSTĘPNOŚĆ ŻELAZA I CYNKU DLA ROŚLIN W TYCH GLEBACH SPRAWIA, ŻE ŻYWNOŚĆ ROŚLINNA Z TYMI NIEZBĘDNYMI SKŁADNIKAMI ODŻYWCZYMI MA TRUDNOŚCI Z BIOFORTYFIKACJĄ. MECHANIZMY REAGOWANIA ROŚLIN NA DEFICYT WIARY I ZN SĄ JUŻ UGRUNTOWANE. WOLNIEJSZE WYNIKI PRAKTYCZNEJ INTEGRACJI CAŁEJ TEJ GENETYCZNO-MOLEKULARNEJ WIEDZY NA RZECZ POPRAWY GENETYCZNEJ UPRAW I ICH ZRÓWNOWAŻONEGO ZARZĄDZANIA. POPRAWA ADAPTACJI ROŚLIN DO GLEB WAPIENNYCH JEST ZŁOŻONYM PROBLEMEM, KTÓRY WIĄŻE SIĘ Z EFEKTYWNOŚCIĄ WIARY I ZN, ODPORNOŚCIĄ NA NADMIAR WĘGLANU WAPNIA I INTERAKCJĄ ROŚLIN Z GLEBĄ-MIKROORGANIZMAMI. PROJEKT TEN MA NA CELU DOSTARCZENIE KLUCZOWYCH INFORMACJI W CELU PRZYSPIESZENIA PROGRAMÓW POPRAWY GENETYCZNEJ UKIERUNKOWANYCH NA TEN WAŻNY PROBLEM ORAZ POMOC W ZRÓWNOWAŻONYM ZARZĄDZANIU UPRAWAMI W TEGO TYPU GLEBACH. W TYM CELU OPIERAMY SIĘ NA BADANIU NATURALNEJ ZMIENNOŚCI GENETYCZNEJ I CHARAKTERYSTYCZNYCH MECHANIZMÓW MOLEKULARNYCH I FIZJOLOGICZNYCH W DZIKICH POPULACJACH ARABIDOPSIS THALIANA PRZYSTOSOWANYCH DO GLEB O SKONTRASTOWANYCH, KRZEMIONKOWYCH I WAPIENNYCH CECHACH, ZNAJDUJĄCYCH SIĘ W POBLIŻU OBSZARÓW PÓŁWYSPU NE. PODCZAS KOLEJNEGO NASZEGO PROJEKTU, FINANSOWANEGO PRZEZ NAS NIH, GENETYCZNĄ PODSTAWĘ NATURALNEJ WARIATYCZNEGO IONOMICZNEGO O GENETYCZNYCH PODSTAWACH ADAPTACJI NATURALNYCH POPULACJI PRZYBRZEŻNYCH DO STRESU SOLI FIZJOLOGICZNEJ, PRZYPADKOWO ZAOBSERWOWALIŚMY PREFERENCJE A. THALIANY DO GLEB KRZEMIONKOWYCH I JEJ NISKĄ OBECNOŚĆ W GLEBACH WAPIENNYCH. NASZA HIPOTEZA POCZĄTKOWA DLA TEGO PROJEKTU POLEGA NA TYM, ŻE NATURALNA ZMIENNOŚĆ ROŚLINY A. THALIANA W KONTRASTOWANYCH GLEBACH (SILICEOS KONTRA CALCAREOS) JEST WAŻNYM ŹRÓDŁEM INFORMACJI GENETYCZNYCH DO BADANIA PROCESÓW ADAPTACYJNYCH, KTÓRE POZWALAJĄ ROŚLINOM RADZIĆ SOBIE Z WARUNKAMI GLEB WAPIENNYCH. WSPÓŁPRACA NASZEGO ZESPOŁU Z WIODĄCYMI GRUPAMI W TEJ DZIEDZINIE (PROF. D.E. SALT UNIV. ABERDEEN, UK I PROF. M.L. GUERINOT, DARTMOUTH COLLEGE, USA) POZWALA NAM SFORMUŁOWAĆ KONKRETNE CELE (LUB) POGRUPOWANE W TRZY SCENARIUSZE ROBOCZE (HT): HT1: WĘGLAN KALCYKU HAMUJE NATURALNĄ DYSTRYBUCJĘ A. THALIANA. O1: SPRAWDZIĆ ODWROTNĄ ZALEŻNOŚĆ MIĘDZY NATURALNYM ROZKŁADEM A. THALIANA A ROZKŁADEM GLEB WAPIENNYCH. O2: WYBRAĆ, W OPARCIU O FENOTYP, EKOTYPY SPRAWDZONEJ TOLERANCJI NA GLEBY WAPIENNE. HT2: EFEKTYWNOŚĆ WIARY I EFEKTYWNOŚĆ ZN SĄ KLUCZEM DO SPRAWNOŚCI A. THALIANY W GLEBACH WAPIENNYCH. O3: PORÓWNANIE REAKCJI KONTRASTOWANYCH EKOTYPÓW NA DEFICYT WIARY I ZN, NAWET W POŁĄCZENIU Z WĘGLANEM WAPNIA, NA POZIOMIE FIZJOLOGICZNYM. O4: CHARAKTERYSTYKA RÓŻNIC GENICAS ODPOWIEDZIALNYCH ZA ZACHOWANIE RÓŻNICOWE POPRZEZ KRZYŻOWANIE KONTRASTOWANYCH EKOTYPÓW I IDENTYFIKOWANIE MARKERÓW GENETYCZNYCH POWIĄZANYCH Z TOLERANCYJNYM FENOTYPEM W SEGREGUJĄCEJ POPULACJI MAPUJĄCEJ F2 PRZY UŻYCIU „ANALIZY SEGRAGACJI LUZEM” OPARTEJ NA „SEKWENCJONOWANIU NASTĘPNEJ GENERACJI” (BSA-SEQ). HT3: ZN I WIARA MAJĄ KLUCZOWE ZNACZENIE W INTERAKCJI MIĘDZY ROŚLINĄ A GLEBĄ I MIKROORGANIZMAMI. O5. CHARAKTERYSTYKA MIKROBIOMU ROŚLINNEGO O ZRÓŻNICOWANEJ SKUTECZNOŚCI WIARY I ZN ORAZ JEGO EWENTUALNA ROLA W MOBILIZACJI SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH. O6: ROZPORZĄDZENIE ZN I MIKROORGANIZMY ADAPTACYJNE REAKCJE WZROSTU I ROZWÓJ POPRZEZ INTERAKCJĘ ZN-AUXIN. (Polish)
17 August 2022
0 references
Cerdanyola del Vallès
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2013-42839-R
0 references