PLANT VIRUSES: PATHOGENS AND ALSO VECTORS FOR THE PRODUCTION OF PROTEINS, METABOLITES, RNAS AND NANOPARTICULAES (Q3136014)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3136014 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | PLANT VIRUSES: PATHOGENS AND ALSO VECTORS FOR THE PRODUCTION OF PROTEINS, METABOLITES, RNAS AND NANOPARTICULAES |
Project Q3136014 in Spain |
Statements
141,651.67 Euro
0 references
260,150.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
30 September 2021
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
46022
0 references
VIRUS Y VIROIDES SON AGENTES CAUSALES DE MUCHAS ENFERMEDADES EN LAS PLANTAS, POR LO QUE CONSTITUYEN UNA AMENAZA PARA LOS CULTIVOS AGRICOLAS Y LOS ECOSISTEMAS NATURALES. A PESAR DE SUS PEQUEÑOS GENOMAS CON CAPACIDAD CODIFICANTE LIMITADA, ESTOS PATOGENOS SON CAPACES DE COMPLETAR UN COMPLEJO CICLO INFECTIVO HACIENDO FRENTE A LOS MECANISMOS DEFENSIVOS DEL HUESPED. PERO AL MISMO TIEMPO, POR SUS PEQUEÑOS GENOMAS FACILES DE MANIPULAR, SU CAPACIDAD DE INVADIR RAPIDAMENTE LA PLANTA Y SU EFICIENTE PRODUCCION DE PROTEINAS Y NANOPARTICULAS, VIRUS Y VIROIDES TAMBIEN PUEDEN SER RECONVERTIDOS EN UTILES HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS. EN VIRALCROP DESARROLLAREMOS VECTORES DERIVADOS DE VIRUS DE RNA DE PLANTAS PARA PRODUCIR NANOPARTICULAS VIRALES DECORADAS CON ANTICUERPOS DE SIMPLE CADENA O NANOCUERPOS, PROTEINAS TERAPEUTICAS RECOMBINANTES COMO FILGRASTIM E INTERFERON ALFA-2A, Y PARA MANIPULAR EL METABOLISMO DE LA PLANTA MEDIANTE LA EXPRESION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION Y ENZIMAS BIOSINTETICAS Y OBTENER CAROTENOIDES DE INTERES COMERCIAL COMO LA ASTAXANTINA Y DIVERSAS ANTOCIANINAS. TAMBIEN SEGUIREMOS DESARROLLANDO NUESTRO SISTEMA VECTOR PATENTADO Y LICENCIADO, DERIVADO DEL VIROIDE LATENTE DE LA BERENJENA, QUE PERMITE OBTENER GRANDES CANTIDADES DE RNA RECOMBINANTE EN ESCHERICHIA COLI, PARA PRODUCIR RNAS BICATENARIOS CON ACTIVIDAD PLAGUICIDA CONTRA LA MOSCA DEL MEDITERRANEO CERATITIS CAPITATA Y EL GUSANO DE LA RAIZ DEL MAIZ DIABROTICA VIRGUIFERA. AL MISMO TIEMPO, EN VIRALCROP DESARROLLAREMOS HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS DESTINADAS A LA PROTECCION DE LOS CULTIVOS. APLICAREMOS NUESTRO SISTEMA DE MARCADORES VISUALES, QUE PERMITE SEGUIR LA INFECCION VIRAL EN TIEMPO REAL SIN NECESIDAD DE INSTRUMENTACION, A DOS VIRUS DE INTERES AGRONOMICO COMO EL TRICOVIRUS DE LAS MANCHAS CLOROTICAS DE LAS HOJAS DEL MANZANO Y EL CRINIVIRUS DEL AMARILLEO Y ENANISMO DE LAS CUCURBITACEAS, PARA DESARROLLAR HERRAMIENTAS QUE PUEDAN SER UTILIZADAS EN PROGRAMAS DE MEJORA. TAMBIEN UTILIZAREMOS MICRORNAS ARTIFICIALES, PEQUEÑOS RNAS INTERFERENTES TRANSACTIVOS SINTETICOS Y ESTRATEGIAS DE EDICION GENOMICA PARA DESARROLLAR VARIEDADES DE CUCURBITACEAS DE INTERES AGRONOMICO RESISTENTES A LOS POTYVIRUS DEL MOSAICO DE LA SANDIA Y DEL MOSAICO AMARILLO DEL CALABACIN. FINALMENTE, EN VIRALCROP NO QUEREMOS DESCUIDAR ALGUNOS ASPECTOS BASICOS DE LA BIOLOGIA MOLECULAR DE VIRUS DE PLANTAS Y VIROIDES, PUES ESTE ES EL CONOCIMIENTO QUE PROPORCIONARA NUESTRAS FUTURAS HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS. MEDIANTE UNA ESTRATEGIA DE PURIFICACION POR CROMATOGRAFIA DE AFINIDAD SEGUIDA DE ANALISIS POR ESPECTROMETRIA DE MASAS (AP-MS), EN VIRALCROP CARACTERIZAREMOS LAS PROTEINAS DE LA PLANTA QUE REGULAN LA ACTIVIDAD DEL COMPLEJO DE SILENCIAMENTO INDUCIDO POR RNA (RISC), ELEMENTO CLAVE EN LA DEFENSA ANTIVIRAL DE LA PLANTA. ETIQUETAREMOS LAS PROTEINAS ARGONAUTA1 Y 2 DE ARABIDOPSIS THALIANA E IDENTIFICAREMOS LAS PROTEINAS DEL HUESPED QUE INTEGRAN RISC DURANTE LA INFECCION POR POTYVIRUS. EL CONOCIMIENTO DE ESTAS PROTEINAS PERMITIRA FUTUROS DESARROLLOS EN PROTECCION DE CULTIVOS. TAMBIEN ANALIZAREMOS EL PAPEL DE LA RNA POLIMERASA CLOROPLASTICA DE CODIFICACION NUCLEAR (NEP) EN LA REPLICACION DE LOS VIROIDES DE LA FAMILIA AVSUNVIROIDAE, PARA EVENTUALMENTE INCORPORARLA EN NUESTRO SISTEMA DE PRODUCCION DE RNA RECOMBINANTE EN E. COLI Y DOTARLO DE MAYOR CAPACIDAD DE PRODUCCION. (Spanish)
0 references
VIRUSES AND VIROIDS ARE THE CAUSAL AGENTS OF MANY DISEASES IN PLANTS, THUS POSING A THREAT TO AGRICULTURAL CROPS AND NATURAL ECOSYSTEMS. DESPITE THEIR SMALL GENOMES WITH LIMITED CODING CAPACITY, THESE PATHOGENS ARE ABLE TO COMPLETE A COMPLEX INFECTIVE CYCLE BY OPPOSING HOST DEFENSIVE MECHANISMS. BUT AT THE SAME TIME, BECAUSE OF ITS SMALL, EASY-TO-MANIPULATE GENOMES, ITS ABILITY TO RAPIDLY INVADE THE PLANT AND ITS EFFICIENT PRODUCTION OF PROTEINS AND NANOPARTICLES, VIRUSES AND VIROIDS CAN ALSO BE RESTRUCTURED INTO USEFUL BIOTECHNOLOGICAL TOOLS. IN VIRALCROP WE WILL DEVELOP VECTORS DERIVED FROM PLANT RNA VIRUSES TO PRODUCE VIRAL NANOPARTICLES DECORATED WITH SINGLE CHAIN ANTIBODIES OR NANOBODIES, RECOMBINANT THERAPEUTIC PROTEINS SUCH AS FILGRASTIM AND INTERFERON ALFA-2A, AND TO MANIPULATE PLANT METABOLISM BY EXPRESSING TRANSCRIPTION FACTORS AND BIOSYNTHETIC ENZYMES TO OBTAIN CAROTENOIDS OF COMMERCIAL INTEREST SUCH AS ASTAXANTHIN AND VARIOUS ANTHOCYANINS. WE WILL FURTHER DEVELOP OUR PATENTED AND LICENSED VECTOR SYSTEM DERIVED FROM EGGPLANT LATENT VIROID, WHICH ALLOWS THE PRODUCTION OF LARGE AMOUNTS OF RECOMBINANT RNA IN ESCHERICHIA COLI, TO PRODUCE DOUBLE-STRANDED RNAS WITH ANTI-PEST ACTIVITY AGAINST THE MEDITERRANEAN FRUIT FLY CERATITIS CAPITATA AND THE CORN ROOTWORM DIABROTICA VIRGUIFERA. AT THE SAME TIME, IN VIRALCROP WE WILL DEVELOP BIOTECHNOLOGICAL TOOLS FOR CROP PROTECTION. WE WILL APPLY OUR SYSTEM OF VISUAL MARKERS, WHICH ALLOWS FOLLOWING VIRUS INFECTION IN REAL TIME WITHOUT THE NEED OF INSTRUMENTATION, TO TWO VIRUSES OF AGRONOMIC INTEREST SUCH AS APPLE CHLOROTIC LEAF SPOT TRICHOVIRUS AND CUCURBIT YELLOW STUNTING DISORDER CRINIVIRUS, TO DEVELOP TOOLS THAT CAN BE USED IN BREEDING PROGRAMS. WE WILL ALSO USE ARTIFICIAL MICRORNAS, SYNTHETIC SMALL INTERFERING TRANSACTIVE RNAS AND GENOME EDITING STRATEGIES TO DEVELOP CUCURBIT VARIETIES OF AGRONOMIC INTEREST RESISTANT TO WATERMELON MOSAIC AND ZUCCHINI YELLOW MOSAIC POTYVIRUSES. FINALLY, IN VIRALCROP WE DO NOT WANT TO FORGET SOME BASIC ASPECTS OF PLANT VIRUSES AND VIROIDS MOLECULAR BIOLOGY, AS THIS IS THE KNOWLEDGE THAT WILL PROVIDE OUR FUTURE BIOTECHNOLOGICAL TOOLS. BY MEANS OF AN AFFINITY CHROMATOGRAPHY PURIFICATION STRATEGY FOLLOWED BY MASS SPECTROMETRY (AP-MS) ANALYSIS, IN VIRALCROP WE WILL CHARACTERIZE THE HOST PROTEINS THAT REGULATE THE ACTIVITY OF THE RNA-INDUCED SILENCING COMPLEX (RISC), A KEY ELEMENT IN PLANT ANTIVIRAL DEFENSE. WE WILL TAG ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 AND 2 PROTEINS AND IDENTIFY THE PLANT PROTEINS THAT INTEGRATE RISC DURING POTYVIRUS INFECTION. THE KNOWLEDGE OF THESE PROTEINS WILL PERMIT FUTURE DEVELOPMENTS IN CROP PROTECTION. WE WILL ALSO ANALYZE THE ROLE OF THE NUCLEAR ENCODED CHLOROPLASTIC RNA POLYMERASE (NEP) IN THE REPLICATION OF THE VIROIDS OF THE FAMILY AVSUNVIROIDAE, TO EVENTUALLY INCORPORATE THIS ENZYME INTO OUR SYSTEM TO PRODUCE RECOMBINANT RNA IN E. COLI, PROVIDING IT WITH MUCH LARGER PRODUCTION CAPACITY. (English)
0.9266674802894443
0 references
LES VIRUS ET LES VIROÏDES SONT DES AGENTS QUI CAUSENT DE NOMBREUSES MALADIES CHEZ LES PLANTES, CE QUI EN FAIT UNE MENACE POUR LES CULTURES AGRICOLES ET LES ÉCOSYSTÈMES NATURELS. MALGRÉ LEURS PETITS GÉNOMES DONT LA CAPACITÉ DE CODAGE EST LIMITÉE, CES AGENTS PATHOGÈNES SONT EN MESURE DE COMPLÉTER UN CYCLE INFECTIEUX COMPLEXE EN FAISANT FACE AUX MÉCANISMES DÉFENSIFS DE L’HÔTE. MAIS EN MÊME TEMPS, EN RAISON DE SES PETITS GÉNOMES FACILES À MANIPULER, SA CAPACITÉ À ENVAHIR RAPIDEMENT LA PLANTE ET SA PRODUCTION EFFICACE DE PROTÉINES ET DE NANOPARTICULAES, VIRUS ET VIROIDS PEUVENT ÉGALEMENT ÊTRE CONVERTIS EN OUTILS BIOTECHNOLOGIQUES UTILES. DANS VIRALCROP, NOUS DÉVELOPPERONS DES VECTEURS DÉRIVÉS DU VIRUS DE L’ARN DES PLANTES POUR PRODUIRE DES NANOPARTICULES VIRALES DÉCORÉES D’ANTICORPS À CHAÎNE SIMPLE OU DE NANOORGANISMES, DES PROTÉINES THÉRAPEUTIQUES RECOMBINANTES TELLES QUE LE FILGRASTIM ET L’INTERFÉRON ALFA-2A, ET POUR MANIPULER LE MÉTABOLISME DE LA PLANTE EN EXPRIMANT DES FACTEURS DE TRANSCRIPTION ET DES ENZYMES BIOSINTETICAS ET OBTENIR DES CAROTÉNOÏDES D’INTÉRÊTS COMMERCIAUX TELS QUE L’ASTAXANTHINE ET DIVERSES ANTHOCYANINES. NOUS CONTINUERONS ÉGALEMENT À DÉVELOPPER NOTRE SYSTÈME VECTORIEL BREVETÉ ET CONCÉDÉ, DÉRIVÉ DU VIROID LATENT DE L’AUBERGINE, QUI PERMET D’OBTENIR DE GRANDES QUANTITÉS D’ARN RECOMBINANT CHEZ ESCHERICHIA COLI, POUR PRODUIRE DES ARN BICATENAIRES AVEC ACTIVITÉ PESTICIDE CONTRE LA MOUCHE MÉDITERRANÉENNE CERATITIS CAPITATA ET LE VER RACINAIRE DU MAÏS DIABROTICA VIRGUIFERA. DANS LE MÊME TEMPS, VIRALCROP METTRA AU POINT DES OUTILS BIOTECHNOLOGIQUES POUR LA PROTECTION DES CULTURES. NOUS APPLIQUERONS NOTRE SYSTÈME DE MARQUEURS VISUELS, QUI PERMET DE SUIVRE L’INFECTION VIRALE EN TEMPS RÉEL SANS AVOIR BESOIN D’INSTRUMENTATION, À DEUX VIRUS D’INTÉRÊT AGRONOMIQUE TELS QUE LE TRICOVIRUS DES TACHES CHROMOTIC DES FEUILLES DE POMME ET LE CRINIVIRUS DU JAUNISSEMENT ET DE LA NAINE DES CUCURBITACÉES, POUR DÉVELOPPER DES OUTILS QUI PEUVENT ÊTRE UTILISÉS DANS LES PROGRAMMES D’AMÉLIORATION. NOUS UTILISERONS ÉGALEMENT DES MICROARN ARTIFICIELS, DE PETITS ARN SYNTHÉTIQUES TRANSACTIFS ET DES STRATÉGIES D’ÉDITION GÉNOMIQUE POUR DÉVELOPPER DES VARIÉTÉS D’INTÉRÊT AGRONOMIQUE CUCURBITACÉES RÉSISTANTES AUX POTYVIRUS DE LA MOSAÏQUE DE SANDIA ET DE LA MOSAÏQUE DE COURGETTES JAUNES. ENFIN, DANS VIRALCROP, NOUS NE VOULONS PAS NÉGLIGER CERTAINS ASPECTS FONDAMENTAUX DE LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE DES VIRUS VÉGÉTAUX ET DES VIROÏDES, CAR C’EST LA CONNAISSANCE QUI FOURNIRA NOS FUTURS OUTILS BIOTECHNOLOGIQUES. PAR UNE STRATÉGIE DE PURIFICATION PAR CHROMATOGRAPHIE D’AFFINITÉ SUIVIE D’UNE ANALYSE PAR SPECTROMÉTRIE DE MASSE (AP-MS), CHEZ VIRALCROP, NOUS CARACTÉRISERONS LES PROTÉINES DE LA PLANTE QUI RÉGULENT L’ACTIVITÉ DU COMPLEXE DE SILENCE INDUIT PAR L’ARN (RISC), UN ÉLÉMENT CLÉ DE LA DÉFENSE ANTIVIRALE DE LA PLANTE. NOUS ALLONS ÉTIQUETER LES PROTÉINES ARGONAUTA1 ET 2 D’ARABIDOPSIS THALIANA ET IDENTIFIER LES PROTÉINES DE L’HÔTE QUI INTÈGRENT RISC LORS DE L’INFECTION PAR LE POTYVIRUS. LA CONNAISSANCE DE CES PROTÉINES PERMETTRA D’ÉVOLUER À L’AVENIR EN MATIÈRE DE PROTECTION DES CULTURES. NOUS ALLONS ÉGALEMENT ANALYSER LE RÔLE DE LA CLOROPLASTICA RNA POLYMÉRASE DU CODAGE NUCLÉAIRE (NEP) DANS LA RÉPLICATION DES VIROÏDES DE LA FAMILLE AVSUNVIROIDAE, AFIN DE L’INCORPORER À NOTRE SYSTÈME DE PRODUCTION D’ARN RECOMBINANT CHEZ E. COLI ET DE LUI FOURNIR UNE PLUS GRANDE CAPACITÉ DE PRODUCTION. (French)
2 December 2021
0 references
VIREN UND VIROIDE SIND WIRKSTOFFE, DIE VIELE KRANKHEITEN IN PFLANZEN VERURSACHEN, WAS SIE ZU EINER BEDROHUNG FÜR LANDWIRTSCHAFTLICHE NUTZPFLANZEN UND NATÜRLICHE ÖKOSYSTEME MACHT. TROTZ IHRER KLEINEN GENOME MIT BEGRENZTER KODIERUNGSKAPAZITÄT SIND DIESE KRANKHEITSERREGER IN DER LAGE, EINEN KOMPLEXEN INFEKTIÖSEN KREISLAUF DURCH DIE ABWEHRMECHANISMEN DES WIRTS ZU VOLLENDEN. ABER GLEICHZEITIG KÖNNEN AUFGRUND SEINER LEICHT MANIPULIERBAREN KLEINEN GENOME SEINE FÄHIGKEIT, SCHNELL IN DIE PFLANZE EINZUDRINGEN UND DIE EFFIZIENTE PRODUKTION VON PROTEINEN UND NANOPARTICULAES, VIREN UND VIROIDE IN NÜTZLICHE BIOTECHNOLOGISCHE WERKZEUGE UMZUWANDELN. IN VIRALCROP WERDEN WIR VEKTOREN AUS PFLANZEN-RNA-VIRUS ENTWICKELN, UM VIRALE NANOPARTIKATE ZU PRODUZIEREN, DIE MIT EINFACHEN KETTENANTIKÖRPERN ODER NANOKÖRPERN, REKOMBINANTEN THERAPEUTISCHEN PROTEINEN WIE FILGRASTIM UND INTERFERON ALFA-2A VERZIERT SIND, UND DEN STOFFWECHSEL DER PFLANZE DURCH AUSDRUCK VON TRANSKRIPTIONSFAKTOREN UND BIOSINTETICAS-ENZYMEN ZU MANIPULIEREN UND CAROTINOIDE VON KOMMERZIELLEN INTERESSEN WIE ASTAXANTHIN UND VERSCHIEDENEN ANTHOCYANEN ZU ERHALTEN. WIR WERDEN AUCH WEITERHIN UNSER PATENTIERTES UND LIZENZIERTES VEKTORSYSTEM ENTWICKELN, DAS AUS DEM LATENTEN VIROID DER AUBERGINEN STAMMT, DAS ES ERLAUBT, GROSSE MENGEN REKOMBINANTER RNA IN ESCHERICHIA COLI ZU ERHALTEN, UM BICATENARY RNAS MIT PESTIZIDAKTIVITÄT GEGEN DIE MITTELMEERFLIEGE CERATITIS CAPITATA UND DEN WURZELWURM DES MAIS DIABROTICA VIRGUIFERA HERZUSTELLEN. GLEICHZEITIG WIRD VIRALCROP BIOTECHNOLOGISCHE INSTRUMENTE FÜR DEN PFLANZENSCHUTZ ENTWICKELN. WIR WERDEN UNSER SYSTEM VON VISUELLEN MARKERN ANWENDEN, DIE ES ERLAUBT, VIRALE INFEKTIONEN IN ECHTZEIT OHNE INSTRUMENTIERUNG ZU VERFOLGEN, ZU ZWEI VIREN VON AGRONOMISCHEM INTERESSE WIE DEM TRICOVIRUS DER CHROMOTIC FLECKEN VON APFELBLÄTTERN UND DEM CRINIVIRUS DER VERGILBUNG UND ZWERGBILDUNG DER CUCURBITACEA, UM WERKZEUGE ZU ENTWICKELN, DIE IN VERBESSERUNGSPROGRAMMEN VERWENDET WERDEN KÖNNEN. WIR WERDEN AUCH KÜNSTLICHE MIKRORNAS, KLEINE TRANSAKTIVE SYNTHETISCHE INTERFERIERENDE RNAS UND GENOMISCHE BEARBEITUNGSSTRATEGIEN VERWENDEN, UM SORTEN VON AGRONOMISCHER INTERESSE CUCURBITACEA ZU ENTWICKELN, DIE GEGEN DIE TÖPFVIREN DES SANDIA-MOSAIKS UND DES GELBEN ZUCCHINI-MOSAIKS RESISTENT SIND. SCHLIESSLICH WOLLEN WIR IN VIRALCROP EINIGE GRUNDLEGENDE ASPEKTE DER MOLEKULARBIOLOGIE VON PFLANZENVIREN UND VIROIDEN NICHT VERNACHLÄSSIGEN, DENN DIES IST DAS WISSEN, DAS UNSERE ZUKÜNFTIGEN BIOTECHNOLOGISCHEN WERKZEUGE LIEFERN WIRD. DURCH EINE STRATEGIE DER REINIGUNG DURCH CHROMATOGRAPH DER AFFINITÄT GEFOLGT VON DER MASSENSPEKTROMETRIEANALYSE (AP-MS) WERDEN WIR IN VIRALCROP DIE PROTEINE DER PFLANZE CHARAKTERISIEREN, DIE DIE AKTIVITÄT DES VON RNA (RISC) INDUZIERTEN SCHWEIGENKOMPLEXES REGULIEREN, EIN SCHLÜSSELELEMENT IN DER ANTIVIRALEN ABWEHR DER PFLANZE. WIR WERDEN DIE PROTEINE ARGONAUTA1 UND 2 VON ARABIDOPSIS THALIANA KENNZEICHNEN UND DIE PROTEINE DES WIRTS IDENTIFIZIEREN, DIE RISC WÄHREND DER INFEKTION MIT POTYVIRUS INTEGRIEREN. DAS WISSEN ÜBER DIESE PROTEINE WIRD ZUKÜNFTIGE ENTWICKLUNGEN IM PFLANZENSCHUTZ ERMÖGLICHEN. WIR WERDEN AUCH DIE ROLLE DER CLOROPLASTICA RNA-POLYMERASE DER KERNCODIERUNG (NEP) BEI DER REPLIKATION DER VIROIDE DER FAMILIE AVSUNVIROIDAE ANALYSIEREN, UM SIE SCHLIESSLICH IN UNSER REKOMBINANTES RNA-PRODUKTIONSSYSTEM IN E. COLI ZU INTEGRIEREN UND IHM EINE GRÖSSERE PRODUKTIONSKAPAZITÄT ZU BIETEN. (German)
9 December 2021
0 references
VIRUSSEN EN VIROÏDEN ZIJN AGENTIA DIE VEEL ZIEKTEN IN PLANTEN VEROORZAKEN, WAARDOOR ZE EEN BEDREIGING VORMEN VOOR LANDBOUWGEWASSEN EN NATUURLIJKE ECOSYSTEMEN. ONDANKS HUN KLEINE GENOOM MET BEPERKTE CODERINGSCAPACITEIT, ZIJN DEZE PATHOGENEN IN STAAT OM EEN COMPLEXE INFECTIEVE CYCLUS TE VOLTOOIEN DOOR HET OMGAAN MET DE DEFENSIEVE MECHANISMEN VAN DE GASTHEER. MAAR TEGELIJKERTIJD, VANWEGE ZIJN KLEINE GENOOM GEMAKKELIJK TE MANIPULEREN, KUNNEN VIRUSSEN EN VIROÏDEN OOK WORDEN OMGEZET IN NUTTIGE BIOTECHNOLOGISCHE HULPMIDDELEN, OMDAT HET IN STAAT IS DE PLANT EN DE EFFICIËNTE PRODUCTIE VAN EIWITTEN EN NANOPARTICULAES SNEL BINNEN TE VALLEN. IN VIRALCROP ZULLEN WE VECTOREN ONTWIKKELEN DIE AFKOMSTIG ZIJN VAN PLANT RNA VIRUS OM VIRALE NANOPARTICULATEN TE PRODUCEREN DIE ZIJN VERSIERD MET EENVOUDIGE KETTINGANTILICHAMEN OF NANOLICHAMEN, RECOMBINANTE THERAPEUTISCHE EIWITTEN ZOALS FILGRASTIM EN INTERFERON ALFA-2A, EN OM HET METABOLISME VAN DE PLANT TE MANIPULEREN DOOR TRANSCRIPTIEFACTOREN EN BIOSINTETICAS-ENZYMEN UIT TE DRUKKEN EN CAROTENOÏDEN TE VERKRIJGEN UIT COMMERCIËLE BELANGEN ZOALS ASTAXANTHINE EN VERSCHILLENDE ANTHOCYANINES. WE ZULLEN OOK ONS GEPATENTEERDE EN GELICENTIEERDE VECTORSYSTEEM BLIJVEN ONTWIKKELEN, AFGELEID VAN DE LATENTE VIROID VAN AUBERGINE, WAARMEE GROTE HOEVEELHEDEN RECOMBINANT RNA IN ESCHERICHIA COLI KUNNEN WORDEN VERKREGEN, OM BICATENARY RNA’S TE PRODUCEREN MET BESTRIJDINGSMIDDELENACTIVITEIT TEGEN DE MEDITERRANE VLIEG CERATITIS CAPITATA EN DE WORTELWORM VAN DE MAÏS DIABROTICA VIRGUIFERA. TEGELIJKERTIJD ZAL VIRALCROP BIOTECHNOLOGISCHE INSTRUMENTEN VOOR GEWASBESCHERMING ONTWIKKELEN. WE ZULLEN ONS SYSTEEM VAN VISUELE MARKERS, DIE HET MOGELIJK MAAKT OM VIRALE INFECTIE IN REAL TIME ZONDER DE NOODZAAK VAN INSTRUMENTATIE, TOEPASSEN OP TWEE VIRUSSEN VAN AGRONOMISCH BELANG, ZOALS DE TRICOVIRUS VAN DE CHROMOTIC VLEKKEN VAN APPLE BLADEREN EN HET CRINIVIRUS VAN VERGELING EN DWERGVORMING VAN DE CUCURBITACEA, OM TOOLS TE ONTWIKKELEN DIE KUNNEN WORDEN GEBRUIKT IN VERBETERINGSPROGRAMMA’S. WE ZULLEN OOK KUNSTMATIGE MICRORNAS, KLEINE TRANSACTIEVE SYNTHETISCHE INTERFERERENDE RNA’S EN GENOMISCHE BEWERKINGSSTRATEGIEËN GEBRUIKEN OM VARIËTEITEN VAN AGRONOMISCH BELANG CUCURBITACEA TE ONTWIKKELEN DIE BESTAND ZIJN TEGEN DE POTYVIRUSSEN VAN HET SANDIA-MOZAÏEK EN HET GELE COURGETTEMOZAÏEK. TOT SLOT WILLEN WE IN VIRALCROP EEN AANTAL FUNDAMENTELE ASPECTEN VAN DE MOLECULAIRE BIOLOGIE VAN PLANTENVIRUSSEN EN VIROÏDEN NIET VERWAARLOZEN, WANT DIT IS DE KENNIS DIE ONZE TOEKOMSTIGE BIOTECHNOLOGISCHE HULPMIDDELEN ZAL LEVEREN. DOOR MIDDEL VAN EEN STRATEGIE VAN ZUIVERING DOOR CHROMATOGRAAF VAN AFFINITEIT GEVOLGD DOOR MASSASPECTROMETRIE ANALYSE (AP-MS), ZULLEN WE IN VIRALCROP KARAKTERISEREN DE EIWITTEN VAN DE PLANT DIE DE ACTIVITEIT VAN HET COMPLEX VAN STILTE GEÏNDUCEERD DOOR RNA (RISC), EEN BELANGRIJK ELEMENT IN DE ANTIVIRALE AFWEER VAN DE PLANT REGULEREN. WE ZULLEN DE EIWITTEN ARGONAUTA1 EN 2 VAN ARABIDOPSIS THALIANA LABELEN EN DE EIWITTEN VAN DE GASTHEER IDENTIFICEREN DIE RISC INTEGREREN TIJDENS DE INFECTIE MET POTYVIRUS. KENNIS VAN DEZE EIWITTEN ZAL TOEKOMSTIGE ONTWIKKELINGEN OP HET GEBIED VAN GEWASBESCHERMING MOGELIJK MAKEN. WE ZULLEN OOK DE ROL ANALYSEREN VAN DE CLOROPLASTICA RNA POLYMERASE VAN NUCLEAIRE CODERING (NEP) IN DE REPLICATIE VAN DE VIROIDS VAN DE FAMILIE AVSUNVIROIDAE, OM HET UITEINDELIJK TE INTEGREREN IN ONS RECOMBINANT RNA-PRODUCTIESYSTEEM IN E. COLI EN HET TE VOORZIEN VAN EEN GROTERE PRODUCTIECAPACITEIT. (Dutch)
17 December 2021
0 references
VIRUS E VIROIDI SONO AGENTI CHE CAUSANO MOLTE MALATTIE NELLE PIANTE, RENDENDOLI UNA MINACCIA PER LE COLTURE AGRICOLE E GLI ECOSISTEMI NATURALI. NONOSTANTE I LORO PICCOLI GENOMI CON CAPACITÀ DI CODIFICA LIMITATA, QUESTI AGENTI PATOGENI SONO IN GRADO DI COMPLETARE UN CICLO INFETTIVO COMPLESSO AFFRONTANDO I MECCANISMI DIFENSIVI DELL'OSPITE. MA ALLO STESSO TEMPO, A CAUSA DEI SUOI PICCOLI GENOMI FACILI DA MANIPOLARE, LA SUA CAPACITÀ DI INVADERE RAPIDAMENTE LA PIANTA E LA SUA EFFICIENTE PRODUZIONE DI PROTEINE E NANOPARTICULAES, VIRUS E VIROIDI POSSONO ANCHE ESSERE CONVERTITI IN UTILI STRUMENTI BIOTECNOLOGICI. IN VIRALCROP SVILUPPEREMO VETTORI DERIVATI DAL VIRUS DELL'RNA VEGETALE PER PRODURRE NANOPARTICOLATI VIRALI DECORATI CON SEMPLICI ANTICORPI A CATENA O NANOBODIES, PROTEINE TERAPEUTICHE RICOMBINANTI COME FILGRASTIM E INTERFERONE ALFA-2A, E PER MANIPOLARE IL METABOLISMO DELLA PIANTA ESPRIMENDO FATTORI DI TRASCRIZIONE E ENZIMI BIOSINTETICAS E OTTENERE CAROTENOIDI DA INTERESSI COMMERCIALI COME ASTAXANTINA E VARIE ANTOCIANINE. CONTINUEREMO INOLTRE A SVILUPPARE IL NOSTRO SISTEMA VETTORIALE BREVETTATO E LICENZIATO, DERIVATO DAL VIROIDE LATENTE DI MELANZANE, CHE PERMETTE DI OTTENERE GRANDI QUANTITÀ DI RNA RICOMBINANTE IN ESCHERICHIA COLI, PER PRODURRE RNA BICATENARIO CON ATTIVITÀ PESTICIDA CONTRO LA MOSCA MEDITERRANEA CERATITIS CAPITATA E IL VERME RADICE DEL MAIS DIABROTICA VIRGUIFERA. ALLO STESSO TEMPO, VIRALCROP SVILUPPERÀ STRUMENTI BIOTECNOLOGICI PER LA PROTEZIONE DELLE COLTURE. APPLICHEREMO IL NOSTRO SISTEMA DI MARCATORI VISIVI, CHE PERMETTE DI SEGUIRE L'INFEZIONE VIRALE IN TEMPO REALE SENZA LA NECESSITÀ DI STRUMENTAZIONE, A DUE VIRUS DI INTERESSE AGRONOMICO COME IL TRICOVIRUS DELLE MACCHIE CHROMOTIC DELLE FOGLIE DI MELA E IL CRINIVIRUS DI INGIALLIMENTO E NANIZZAZIONE DELLA CUCURBITACEA, PER SVILUPPARE STRUMENTI CHE POSSANO ESSERE UTILIZZATI IN PROGRAMMI DI MIGLIORAMENTO. UTILIZZEREMO ANCHE MICRORNAS ARTIFICIALI, PICCOLI RNA INTERATTIVI SINTETICI TRANSATTIVI E STRATEGIE DI EDITING GENOMICO PER SVILUPPARE VARIETÀ DI INTERESSE AGRONOMICO CUCURBITACEE RESISTENTI AI POTYVIRUS DEL MOSAICO DI SANDIA E AL MOSAICO GIALLO DELLE ZUCCHINE. INFINE, IN VIRALCROP NON VOGLIAMO TRASCURARE ALCUNI ASPETTI FONDAMENTALI DELLA BIOLOGIA MOLECOLARE DEI VIRUS VEGETALI E DEI VIROIDI, PERCHÉ QUESTA È LA CONOSCENZA CHE FORNIRÀ I NOSTRI FUTURI STRUMENTI BIOTECNOLOGICI. ATTRAVERSO UNA STRATEGIA DI PURIFICAZIONE PER CROMATOGRAFO DI AFFINITÀ SEGUITA DALL'ANALISI SPETTROMETRIA DI MASSA (AP-MS), IN VIRALCROP SI CARATTERIZZERANNO LE PROTEINE DELLA PIANTA CHE REGOLANO L'ATTIVITÀ DEL COMPLESSO DI SILENZIO INDOTTO DAL RNA (RISC), ELEMENTO CHIAVE NELLA DIFESA ANTIVIRALE DELLA PIANTA. ETICHETTEREMO LE PROTEINE ARGONAUTA1 E 2 DI ARABIDOPSIS THALIANA E IDENTIFICHEREMO LE PROTEINE DELL'OSPITE CHE INTEGRANO RISC DURANTE L'INFEZIONE DA POTYVIRUS. LA CONOSCENZA DI QUESTE PROTEINE CONSENTIRÀ SVILUPPI FUTURI NELLA PROTEZIONE DELLE COLTURE. ANALIZZEREMO ANCHE IL RUOLO DELLA POLIMERASI CLOROPLASTICA RNA DELLA CODIFICA NUCLEARE (NEP) NELLA REPLICA DEI VIROIDI DELLA FAMIGLIA AVSUNVIROIDAE, PER INCORPORARLA NEL NOSTRO SISTEMA DI PRODUZIONE DI RNA RICOMBINANTE IN E. COLI E FORNIRGLI UNA MAGGIORE CAPACITÀ PRODUTTIVA. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΙΟΊ ΚΑΙ ΤΑ ΙΟΕΙΔΉ ΕΊΝΑΙ ΟΙ ΑΙΤΊΕΣ ΠΟΛΛΏΝ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ ΣΤΑ ΦΥΤΆ, ΓΕΓΟΝΌΣ ΠΟΥ ΣΥΝΙΣΤΆ ΑΠΕΙΛΉ ΓΙΑ ΤΙΣ ΓΕΩΡΓΙΚΈΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΕΣ ΚΑΙ ΤΑ ΦΥΣΙΚΆ ΟΙΚΟΣΥΣΤΉΜΑΤΑ. ΠΑΡΆ ΤΑ ΜΙΚΡΆ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΑ ΤΟΥΣ ΜΕ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΗ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΚΩΔΙΚΟΠΟΊΗΣΗΣ, ΑΥΤΆ ΤΑ ΠΑΘΟΓΌΝΑ ΕΊΝΑΙ ΣΕ ΘΈΣΗ ΝΑ ΟΛΟΚΛΗΡΏΣΟΥΝ ΈΝΑΝ ΠΟΛΎΠΛΟΚΟ ΜΟΛΥΣΜΑΤΙΚΌ ΚΎΚΛΟ ΜΕ ΤΗΝ ΑΝΤΊΘΕΣΗ ΤΩΝ ΑΜΥΝΤΙΚΏΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ. ΑΛΛΆ ΤΑΥΤΌΧΡΟΝΑ, ΛΌΓΩ ΤΩΝ ΜΙΚΡΏΝ, ΕΎΧΡΗΣΤΩΝ ΓΟΝΙΔΙΩΜΆΤΩΝ ΤΟΥ, Η ΙΚΑΝΌΤΗΤΆ ΤΟΥ ΝΑ ΕΙΣΒΆΛΕΙ ΓΡΉΓΟΡΑ ΣΤΟ ΦΥΤΌ ΚΑΙ Η ΑΠΟΔΟΤΙΚΉ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΚΑΙ ΝΑΝΟΣΩΜΑΤΙΔΊΩΝ, ΙΏΝ ΚΑΙ ΙΟΕΙΔΏΝ ΜΠΟΡΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΝΑ ΑΝΑΔΙΑΡΘΡΩΘΕΊ ΣΕ ΧΡΉΣΙΜΑ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ. ΣΤΟ VIRALCROP ΘΑ ΑΝΑΠΤΎΞΟΥΜΕ ΦΟΡΕΊΣ ΠΟΥ ΠΡΟΈΡΧΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΙΟΎΣ RNA ΦΥΤΏΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΙΟΓΕΝΏΝ ΝΑΝΟΣΩΜΑΤΙΔΊΩΝ ΔΙΑΚΟΣΜΗΜΈΝΩΝ ΜΕ ΑΝΤΙΣΏΜΑΤΑ ΜΊΑΣ ΑΛΥΣΊΔΑΣ Ή ΝΑΝΟΣΏΜΑΤΑ, ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΕΣ ΘΕΡΑΠΕΥΤΙΚΈΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΌΠΩΣ Η ΦΙΛΓΡΑΣΤΊΜΗ ΚΑΙ Η ΙΝΤΕΡΦΕΡΌΝΗ ALFA-2A, ΚΑΙ ΓΙΑ ΝΑ ΧΕΙΡΑΓΩΓΗΘΕΊ Ο ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΌΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΕΚΦΡΆΖΟΝΤΑΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ ΚΑΙ ΒΙΟΣΥΝΘΕΤΙΚΆ ΈΝΖΥΜΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΠΌΚΤΗΣΗ ΚΑΡΟΤΕΝΟΕΙΔΏΝ ΕΜΠΟΡΙΚΟΎ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝΤΟΣ, ΌΠΩΣ Η ΑΣΤΑΞΑΝΘΊΝΗ ΚΑΙ ΔΙΆΦΟΡΕΣ ΑΝΘΟΚΥΑΝΊΝΕΣ. ΘΑ ΑΝΑΠΤΎΞΟΥΜΕ ΠΕΡΑΙΤΈΡΩ ΤΟ ΚΑΤΟΧΥΡΩΜΈΝΟ ΜΕ ΔΊΠΛΩΜΑ ΕΥΡΕΣΙΤΕΧΝΊΑΣ ΚΑΙ ΑΔΕΙΟΔΟΤΗΜΈΝΟ ΣΎΣΤΗΜΑ ΦΟΡΈΩΝ ΜΑΣ ΠΟΥ ΠΡΟΈΡΧΕΤΑΙ ΑΠΌ ΛΑΝΘΆΝΟΝ ΙΟΕΙΔΈΣ ΜΕΛΙΤΖΆΝΑΣ, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΜΕΓΆΛΩΝ ΠΟΣΟΤΉΤΩΝ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΟΥ RNA ΣΤΟ ESCHERICHIA COLI, ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΔΙΤΤΏΝ RNA ΜΕ ΑΝΤΙ-ΕΠΙΒΛΑΒΉ ΔΡΆΣΗ ΚΑΤΆ ΤΗΣ ΜΎΓΑΣ ΤΩΝ ΦΡΟΎΤΩΝ ΤΗΣ ΜΕΣΟΓΕΊΟΥ CERATITIS CAPITATA ΚΑΙ ΤΟΥ ΡΙΖΟΣΚΏΛΗΚΑ ΚΑΛΑΜΠΟΚΙΟΎ DIABROTICA VIRGUIFERA. ΠΑΡΆΛΛΗΛΑ, ΣΤΟ VIRALCROP ΘΑ ΑΝΑΠΤΎΞΟΥΜΕ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΟΣΤΑΣΊΑ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ. ΘΑ ΕΦΑΡΜΌΣΟΥΜΕ ΤΟ ΣΎΣΤΗΜΆ ΜΑΣ ΟΠΤΙΚΏΝ ΔΕΙΚΤΏΝ, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗΝ ΠΑΡΑΚΟΛΟΎΘΗΣΗ ΤΗΣ ΛΟΊΜΩΞΗΣ ΤΟΥ ΙΟΎ ΣΕ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌ ΧΡΌΝΟ ΧΩΡΊΣ ΤΗΝ ΑΝΆΓΚΗ ΟΡΓΆΝΩΝ, ΣΕ ΔΎΟ ΙΟΎΣ ΓΕΩΠΟΝΙΚΟΎ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝΤΟΣ, ΌΠΩΣ Ο ΤΡΙΧΟΪΌΣ ΤΟΥ ΧΛΩΡΟΤΙΚΟΎ ΦΥΛΛΏΜΑΤΟΣ ΤΗΣ APPLE ΚΑΙ Ο ΚΊΤΡΙΝΟΣ ΚΟΛΟΚΥΝΤΙΚΌΣ CRINIVIRUS ΔΙΑΤΑΡΑΧΉΣ, ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΕΡΓΑΛΕΊΩΝ ΠΟΥ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΣΕ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΑ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ. ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΕΠΊΣΗΣ ΤΕΧΝΗΤΆ MICRORNAS, ΣΥΝΘΕΤΙΚΆ ΜΙΚΡΆ ΠΑΡΕΜΒΑΊΝΟΝΤΑ ΔΙΑΔΡΑΣΤΙΚΆ RNAS ΚΑΙ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑΣ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΠΟΙΚΙΛΙΏΝ ΚΟΛΟΚΥΝΘΟΕΙΔΏΝ ΑΓΡΟΝΟΜΙΚΟΎ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝΤΟΣ ΑΝΘΕΚΤΙΚΏΝ ΣΤΟ ΜΩΣΑΪΚΌ ΚΑΡΠΟΎ ΚΑΙ ΚΟΛΟΚΥΘΆΚΙΑ ΚΊΤΡΙΝΟ ΜΩΣΑΪΚΌ POTYVIRUSES. ΤΈΛΟΣ, ΣΤΟ VIRALCROP ΔΕΝ ΘΈΛΟΥΜΕ ΝΑ ΞΕΧΆΣΟΥΜΕ ΚΆΠΟΙΕΣ ΒΑΣΙΚΈΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΗΣ ΜΟΡΙΑΚΉΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ ΤΩΝ ΙΏΝ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΙΟΕΙΔΏΝ, ΚΑΘΏΣ ΑΥΤΉ ΕΊΝΑΙ Η ΓΝΏΣΗ ΠΟΥ ΘΑ ΠΑΡΆΣΧΕΙ ΤΑ ΜΕΛΛΟΝΤΙΚΆ ΜΑΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ. ΜΈΣΩ ΜΙΑΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΉΣ ΚΑΘΑΡΙΣΜΟΎ ΧΡΩΜΑΤΟΓΡΑΦΊΑΣ ΣΥΓΓΈΝΕΙΑΣ ΑΚΟΛΟΥΘΟΎΜΕΝΗΣ ΑΠΌ ΑΝΆΛΥΣΗ ΦΑΣΜΑΤΟΜΕΤΡΊΑΣ ΜΆΖΑΣ (AP-MS), ΣΤΟ VIRALCROP ΘΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΞΕΝΙΣΤΉ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΣΥΜΠΛΈΓΜΑΤΟΣ ΣΙΓΑΣΤΉΡΩΝ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ RNA (RISC), ΒΑΣΙΚΌ ΣΤΟΙΧΕΊΟ ΤΗΣ ΦΥΤΙΚΉΣ ΑΝΤΙΙΙΚΉΣ ΆΜΥΝΑΣ. ΘΑ ΕΠΙΣΗΜΆΝΟΥΜΕ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 ΚΑΙ 2 ΚΑΙ ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΦΥΤΙΚΈΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΕΝΣΩΜΑΤΏΝΟΥΝ ΤΟ RISC ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΛΟΊΜΩΞΗΣ ΑΠΌ POTYVIRUS. Η ΓΝΏΣΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΘΑ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΜΕΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΕΞΕΛΊΞΕΙΣ ΣΤΟΝ ΤΟΜΈΑ ΤΗΣ ΠΡΟΣΤΑΣΊΑΣ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ. ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΟΥΜΕ ΕΠΊΣΗΣ ΤΟ ΡΌΛΟ ΤΗΣ ΠΥΡΗΝΙΚΉΣ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΗΜΈΝΗΣ ΧΛΩΡΟΠΛΑΣΤΙΚΉΣ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗΣ RNA (NEP) ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉ ΤΩΝ ΙΟΕΙΔΏΝ ΤΗΣ ΟΙΚΟΓΈΝΕΙΑΣ AVSUNVIROIDAE, ΓΙΑ ΝΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΣΟΥΜΕ ΤΕΛΙΚΆ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΝΖΥΜΟ ΣΤΟ ΣΎΣΤΗΜΆ ΜΑΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΟΥ RNA ΣΕ E. COLI, ΠΑΡΈΧΟΝΤΆΣ ΤΟΥ ΠΟΛΎ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΠΑΡΑΓΩΓΙΚΉ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ. (Greek)
17 August 2022
0 references
VIRA OG VIROIDER ER ÅRSAGSAGEN TIL MANGE SYGDOMME I PLANTER, HVILKET UDGØR EN TRUSSEL MOD LANDBRUGSAFGRØDER OG NATURLIGE ØKOSYSTEMER. PÅ TRODS AF DERES SMÅ GENOMER MED BEGRÆNSET KODNINGSKAPACITET ER DISSE PATOGENER I STAND TIL AT FULDFØRE EN KOMPLEKS INFEKTIØS CYKLUS VED AT MODSÆTTE SIG VÆRTSDEFENSIVE MEKANISMER. MEN SAMTIDIG KAN DENS EVNE TIL HURTIGT AT INVADERE PLANTEN OG DENS EFFEKTIVE PRODUKTION AF PROTEINER OG NANOPARTIKLER, VIRA OG VIROIDER PÅ GRUND AF DETS SMÅ, LETMANIPULEREDE GENOMER OGSÅ OMSTRUKTURERES TIL NYTTIGE BIOTEKNOLOGISKE VÆRKTØJER. I VIRALCROP VIL VI UDVIKLE VEKTORER AFLEDT AF PLANTE RNA-VIRUS TIL AT PRODUCERE VIRALE NANOPARTIKLER DEKORERET MED ENKELTKÆDEDE ANTISTOFFER ELLER NANOSTOFFER, REKOMBINANTE TERAPEUTISKE PROTEINER SÅSOM FILGRASTIM OG INTERFERON ALFA-2A, OG TIL AT MANIPULERE PLANTEMETABOLISMEN VED AT UDTRYKKE TRANSSKRIPTIONSFAKTORER OG BIOSYNTETISKE ENZYMER FOR AT OPNÅ CAROTENOIDER AF KOMMERCIEL INTERESSE SÅSOM ASTAXANTHIN OG FORSKELLIGE ANTHOCYANINER. VI VIL VIDEREUDVIKLE VORES PATENTEREDE OG LICENSEREDE VEKTORSYSTEM AFLEDT AF AUBERGINE LATENT VIROID, SOM GØR DET MULIGT AT PRODUCERE STORE MÆNGDER REKOMBINANT RNA I ESCHERICHIA COLI, AT PRODUCERE DOBBELTSTRENGEDE RNA'ER MED ANTI-PEST AKTIVITET MOD MIDDELHAVET FRUGT FLYVE CERATITIS CAPITATA OG MAJS ROOTWORM DIABROTICA VIRGUIFERA. SAMTIDIG VIL VI I VIRALCROP UDVIKLE BIOTEKNOLOGISKE VÆRKTØJER TIL AFGRØDEBESKYTTELSE. VI VIL ANVENDE VORES SYSTEM AF VISUELLE MARKØRER, SOM TILLADER FØLGENDE VIRUSINFEKTION I REALTID UDEN BEHOV FOR INSTRUMENTERING, TIL TO VIRA AF AGRONOMISK INTERESSE SÅSOM APPLE CHLOROTIC BLAD SPOT TRICHOVIRUS OG CUCURBIT GUL STUNTING DISORDER CRINIVIRUS, AT UDVIKLE VÆRKTØJER, DER KAN BRUGES I AVLSPROGRAMMER. VI VIL OGSÅ BRUGE KUNSTIGE MIKRORNA'ER, SYNTETISKE SMÅ INTERFERERENDE TRANSAKTIVE RNA'ER OG GENOMREDIGERINGSSTRATEGIER TIL AT UDVIKLE CUCURBIT SORTER AF AGRONOMISK INTERESSE RESISTENTE OVER FOR VANDMELON MOSAIK OG COURGETTE GULE MOSAIK POTYVIRUS. ENDELIG ØNSKER VI I VIRALCROP IKKE AT GLEMME NOGLE GRUNDLÆGGENDE ASPEKTER AF PLANTEVIRA OG VIROIDER MOLEKYLÆR BIOLOGI, DA DETTE ER DEN VIDEN, DER VIL GIVE VORES FREMTIDIGE BIOTEKNOLOGISKE VÆRKTØJER. VED HJÆLP AF EN AFFINITETSKROMATOGRAFI RENSNINGSSTRATEGI EFTERFULGT AF MASSESPEKTROMETRI (AP-MS) ANALYSE, VIL VI I VIRALCROP KARAKTERISERE DE VÆRTSPROTEINER, DER REGULERER AKTIVITETEN AF RNA-INDUCERET LYDDÆMPNING KOMPLEKS (RISC), ET NØGLEELEMENT I PLANTE ANTIVIRALT FORSVAR. VI VIL MÆRKE ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 OG 2 PROTEINER OG IDENTIFICERE DE PLANTEPROTEINER, DER INTEGRERER RISC UNDER POTYVIRUSINFEKTION. KENDSKABET TIL DISSE PROTEINER VIL GØRE DET MULIGT AT UDVIKLE AFGRØDEBESKYTTELSEN I FREMTIDEN. VI VIL OGSÅ ANALYSERE DEN ROLLE, SOM DEN NUKLEARE KODEDE CHLOROPLASTISK RNA-POLYMERASE (NEP) SPILLER I REPLIKATIONEN AF VIROIDER AF FAMILIEN AVSUNVIROIDAE, FOR I SIDSTE ENDE AT INDARBEJDE DETTE ENZYM I VORES SYSTEM FOR AT PRODUCERE REKOMBINANT RNA I E. COLI, HVILKET GIVER DET MEGET STØRRE PRODUKTIONSKAPACITET. (Danish)
17 August 2022
0 references
VIRUKSET JA VIROIDIT OVAT MONIEN KASVIEN SAIRAUKSIEN AIHEUTTAJIA, MIKÄ UHKAA VILJELYKASVEJA JA LUONNON EKOSYSTEEMEJÄ. HUOLIMATTA NIIDEN PIENISTÄ GENOMISTA, JOILLA ON RAJALLINEN KOODAUSKAPASITEETTI, NÄMÄ PATOGEENIT PYSTYVÄT SUORITTAMAAN MONIMUTKAISEN INFEKTOIVAN SYKLIN VASTUSTAMALLA ISÄNTÄPUOLUSTUSMEKANISMEJA. MUTTA SAMAAN AIKAAN, KOSKA SEN PIENI, HELPPO MANIPULOIDA GENOMIT, SEN KYKY NOPEASTI TUNKEUTUA KASVI JA SEN TEHOKAS TUOTANTO PROTEIINEJA JA NANOPARTIKKELEITA, VIRUKSIA JA VIROIDEJA VOIDAAN MYÖS JÄRJESTELLÄ HYÖDYLLISIÄ BIOTEKNOLOGIAN TYÖKALUJA. VIRALCROPISSA KEHITÄMME KASVIN RNA-VIRUKSISTA JOHDETTUJA VEKTOREITA TUOTTAMAAN VIRUKSEN NANOHIUKKASIA, JOTKA ON KORISTELTU YKSIKETJUISILLA VASTA-AINEILLA TAI NANOBODIEILLA, REKOMBINANTTIPROTEIINEILLA, KUTEN FILGRASTIIMILLA JA INTERFERONI ALFA-2A:LLA, JA MANIPULOIDA KASVIEN AINEENVAIHDUNTAA ILMAISEMALLA TRANSKRIPTIOTEKIJÖITÄ JA BIOSYNTEETTISIÄ ENTSYYMEJÄ KAUPALLISESTI KIINNOSTAVIEN KAROTENOIDIEN, KUTEN ASTAKSANTIININ JA ERILAISTEN ANTOSYAANIEN, SAAMISEKSI. KEHITÄMME EDELLEEN PATENTOITUA JA LISENSOITUA VEKTORIJÄRJESTELMÄÄ, JOKA ON JOHDETTU MUNAKOISOPIILESTÄ, JOKA MAHDOLLISTAA SUURTEN MÄÄRIEN REKOMBINANTTI RNA: N TUOTANNON ESCHERICHIA COLISSA TUOTTAMAAN KAKSISÄIKEISIÄ RNA:ITA, JOILLA ON ANTI-TUHOINEN TOIMINTA VÄLIMEREN HEDELMÄPERHOA VASTAAN CERATITIS CAPITATA JA MAISSIN JUURIMATO DIABROTICA VIRGUIFERA. SAMALLA KEHITÄMME VIRALCROPISSA BIOTEKNOLOGISIA VÄLINEITÄ KASVINSUOJELUUN. KÄYTÄMME JÄRJESTELMÄÄMME VISUAALINEN MERKKIAINE, JOKA MAHDOLLISTAA VIRUSINFEKTION REAALIAJASSA ILMAN INSTRUMENTOINTITARVETTA, KAHTEEN AGRONOMISESTI KIINNOSTAVAAN VIRUKSEEN, KUTEN APPLEN KLOROOTTINEN LEHTILÄISTRIKOVIRUS JA CUCURBIT KELTAINEN TAINNUTUSHÄIRIÖ CRINIVIRUS, KEHITTÄÄ TYÖKALUJA, JOITA VOIDAAN KÄYTTÄÄ JALOSTUSOHJELMISSA. KÄYTÄMME MYÖS KEINOTEKOISIA MIKRORNA:ITA, SYNTEETTISIÄ PIENIÄ HÄIRITSEVIÄ TRANSAKTIIVISIA RNA:ITA JA GENOMIMUOKKAUSSTRATEGIOITA KEHITTÄÄKSEMME AGRONOMISEN KIINNOSTUKSEN CUCURBIT-LAJIKKEITA, JOTKA KESTÄVÄT VESIMELONIN MOSAIIKKI- JA KESÄKURPITSAN KELTAISIA MOSAIIKKIPOTYVIRUKSIA. LOPUKSI, VIRALCROP EMME HALUA UNOHTAA JOITAKIN PERUSNÄKÖKOHTIA KASVIVIRUSTEN JA VIROIDIEN MOLEKYYLIBIOLOGIAN, KOSKA TÄMÄ ON TIETO, JOKA TARJOAA TULEVAISUUDEN BIOTEKNOLOGISIA VÄLINEITÄ. AFFINITEETTIKROMATOGRAFIAN PUHDISTUSSTRATEGIAN AVULLA, JOTA SEURAA MASSASPEKTROMETRIA (AP-MS) -ANALYYSI, VIRALCROPISSA LUONNEHDIMME ISÄNTÄPROTEIINEJA, JOTKA SÄÄTELEVÄT RNA-INDUSOIMAN ÄÄNENVAIMENNUSKOMPLEKSIN (RISC) TOIMINTAA, JOKA ON KESKEINEN ELEMENTTI KASVIEN ANTIVIRAALISESSA PUOLUSTUKSESSA. MERKITSEMME ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 JA 2 PROTEIINEJA JA TUNNISTAMME KASVIPROTEIINIT, JOTKA INTEGROIVAT RISC: N POTYVIRUSINFEKTION AIKANA. TIETÄMYS NÄISTÄ PROTEIINEISTA MAHDOLLISTAA TULEVAN KEHITYKSEN KASVINSUOJELUSSA. ANALYSOIMME MYÖS YDINKOODATUN KLOORIPLASTISEN RNA POLYMERAASIN (NEP) ROOLIA AVSUNVIROIDAE-HEIMON VIROIDIEN REPLIKAATIOSSA, JOTTA TÄMÄ ENTSYYMI LOPULTA SISÄLLYTETTÄISIIN JÄRJESTELMÄÄNMME REKOMBINANTTI RNA: N TUOTTAMISEKSI E. COLISSA, MIKÄ TARJOAA SILLE PALJON SUUREMMAN TUOTANTOKAPASITEETIN. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-VIRUSES U L-VIROJDI HUMA L-AĠENTI KAWŻALI TA’ ĦAFNA MARD FIL-PJANTI, U B’HEKK HUMA TA’ THEDDIDA GĦALL-GĦELEJJEL AGRIKOLI U GĦALL-EKOSISTEMI NATURALI. MINKEJJA L-ĠENOMI ŻGĦAR TAGĦHOM B’KAPAĊITÀ LIMITATA TA’ KODIFIKAZZJONI, DAWN IL-PATOĠENI JISTGĦU JIKKOMPLETAW ĊIKLU INFETTIV KUMPLESS BILLI JOPPONU MEKKANIŻMI DIFENSIVI OSPITANTI. IŻDA FL-ISTESS ĦIN, MINĦABBA L-ĠENOMI ŻGĦAR U FAĊLI BIEX JIĠU MANIPULATI, IL-KAPAĊITÀ TAGĦHA LI TINVADI MALAJR L-IMPJANT U L-PRODUZZJONI EFFIĊJENTI TAGĦHA TA ‘PROTEINI U NANOPARTIĊELLI, VIRUSES U VIROJDI JISTGĦU WKOLL JIĠU RISTRUTTURATI F’GĦODOD BIJOTEKNOLOĠIĊI UTLI. F’ VIRALCROP SE NIŻVILUPPAW VETTURI DERIVATI MINN VIRUSES TA ' L- RNA TAL- PJANTI BIEX JIPPRODUĊU NANOPARTIĊELLI VIRALI MŻEJNA B’ ANTIKORPI B’ KATINA WAĦDA JEW B’ NANOKORPI, PROTEINI TERAPEWTIĊI RIKOMBINANTI BĦAL FILGRASTIM U INTERFERON ALFA-2A, U BIEX JIMMANIPULAW IL- METABOLIŻMU TAL- PJANTA BILLI JESPRIMU FATTURI TA ' TRASKRIZZJONI U ENZIMI BIJOSINTETIĊI BIEX JINKISBU KAROTENOJDI TA ' INTERESS KUMMERĊJALI BĦAL ASTAXANTHIN U DIVERSI ANTHOCYANINS. AĦNA SE TKOMPLI TIŻVILUPPA SISTEMA TAGĦNA PRIVATTIVA U LIĊENZJATI VETTUR DERIVAT MINN VIROJDI LATENTI TAL-BRUNĠIEL, LI TIPPERMETTI L-PRODUZZJONI TA ‘AMMONTI KBAR TA’ RNA RIKOMBINANTI FL-ESCHERICHIA COLI, BIEX JIPPRODUĊU DOUBLE STRANDED RNAS B’ATTIVITÀ KONTRA L-PESTI KONTRA D-DUBBIENA TAL-FROTT MEDITERRAN CERATITIS CAPITATA U D-DUDU TA ‘L-GĦERUQ TAL-QAMĦ DIABROTICA VIRGUIFERA. FL-ISTESS ĦIN, FIL VIRALCROP AĦNA SE JIŻVILUPPAW GĦODOD BIJOTEKNOLOĠIĊI GĦALL-PROTEZZJONI TAL-UĊUĦ TAR-RABA. AĦNA SE TAPPLIKA S-SISTEMA TAGĦNA TA ‘MARKATURI VIŻWALI, LI TIPPERMETTI INFEZZJONI TAL-VIRUS WARA FIL-ĦIN REALI MINGĦAJR IL-ĦTIEĠA TA’ STRUMENTAZZJONI, GĦAL ŻEWĠ VIRUSES TA ‘INTERESS AGRONOMIKU BĦAL TRICHOVIRUS SPOT WERQA CHLOROTIC APPLE U CUCURBIT ISFAR STUNTING DISTURB CRINIVIRUS, BIEX JIŻVILUPPAW GĦODOD LI JISTGĦU JINTUŻAW FI PROGRAMMI TAT-TGĦAMMIR. AĦNA SE NUŻAW UKOLL MIKRORNAS ARTIFIĊJALI, RNAS TRANSATTIVI SINTETIĊI ŻGĦAR LI JINTERFERIXXU U STRATEĠIJI TA ‘EDITJAR TAL-ĠENOMA BIEX JIŻVILUPPAW VARJETAJIET TA’ CUCURBIT TA ‘INTERESS AGRONOMIKU REŻISTENTI GĦAD-DULLIEGĦ MUŻAJK U POTYVIRUSES SOFOR ZUCCHINI YELLOW MOSAIC. FL-AĦĦAR NETT, FIL VIRALCROP MA RRIDUX NINSEW XI ASPETTI BAŻIĊI TAL-VIRUSES TAL-PJANTI U L-BIJOLOĠIJA MOLEKULARI TAL-VIROJDI, PERESS LI DAN HUWA L-GĦARFIEN LI SE JIPPROVDI L-GĦODOD BIJOTEKNOLOĠIĊI FUTURI TAGĦNA. PERMEZZ TA’ STRATEĠIJA TA’ PURIFIKAZZJONI TAL-KROMATOGRAFIJA TA’ AFFINITÀ SEGWITA MINN ANALIŻI TAL-ISPETTROMETRIJA TAL-MASSA (AP-MS), F’VIRALCROP SE NIKKARATTERIZZAW IL-PROTEINI OSPITANTI LI JIRREGOLAW L-ATTIVITÀ TAL-KUMPLESS TAS-SAJLENSER INDOTT MILL-RNA (RISC), ELEMENT EWLIENI FID-DIFIŻA ANTIVIRALI TAL-PJANTI. AĦNA SE TAG ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 U 2 PROTEINI U JIDENTIFIKAW IL-PROTEINI TAL-PJANTI LI JINTEGRAW RISC MATUL INFEZZJONI BIL-POTYVIRUS. L-GĦARFIEN TA’ DAWN IL-PROTEINI SE JIPPERMETTI ŻVILUPPI FUTURI FIL-PROTEZZJONI TAL-UĊUĦ TAR-RABA’. SER NANALIZZAW UKOLL IR-RWOL TAL-POLIMERAŻI KLOROPLASTIKA RNA (NEP) KODIFIKATA NUKLEARI FIR-REPLIKAZZJONI TAL-VIROJDI TAL-FAMILJA AVSUNVIROIDAE, BIEX EVENTWALMENT DIN L-ENZIMA TIĠI INKORPORATA FIS-SISTEMA TAGĦNA BIEX TIPPRODUĊI RNA RIKOMBINANTI FL-E. COLI, U TIPPROVDIHA B’KAPAĊITÀ TA’ PRODUZZJONI ĦAFNA AKBAR. (Maltese)
17 August 2022
0 references
VĪRUSI UN VIROĪDI IR DAUDZU AUGU SLIMĪBU IZRAISĪTĀJI, TĀDĒJĀDI APDRAUDOT LAUKSAIMNIECĪBAS KULTŪRAS UN DABISKĀS EKOSISTĒMAS. NESKATOTIES UZ TO MAZAJIEM GENOMIEM AR IEROBEŽOTU KODĒŠANAS SPĒJU, ŠIE PATOGĒNI SPĒJ PABEIGT SAREŽĢĪTU INFICĒJOŠO CIKLU, PRETOJOTIES SAIMNIEKORGANISMA AIZSARDZĪBAS MEHĀNISMIEM. BET TAJĀ PAŠĀ LAIKĀ, PATEICOTIES TĀ MAZAJIEM, VIEGLI MANIPULĒJAMIEM GENOMIEM, TĀ SPĒJU STRAUJI IEBRUKT AUGĀ UN TĀ EFEKTĪVU OLBALTUMVIELU UN NANODAĻIŅU RAŽOŠANU, VĪRUSUS UN VIROĪDUS VAR ARĪ PĀRSTRUKTURĒT PAR NODERĪGIEM BIOTEHNOLOĢISKIEM RĪKIEM. VIRALCROP SASTĀVĀ MĒS IZSTRĀDĀSIM VEKTORUS, KAS IEGŪTI NO AUGU RNS VĪRUSIEM, LAI RADĪTU VĪRUSU NANODAĻIŅAS, KAS DEKORĒTAS AR VIENAS ĶĒDES ANTIVIELĀM VAI NANOVIELĀM, REKOMBINANTIEM TERAPEITISKIEM PROTEĪNIEM, PIEMĒRAM, FILGRASTĪMU UN INTERFERONU ALFA-2A, UN LAI MANIPULĒTU AR AUGU METABOLISMU, IZSAKOT TRANSKRIPCIJAS FAKTORUS UN BIOSINTĒTISKOS ENZĪMUS, LAI IEGŪTU KOMERCIĀLI INTERESĒJOŠUS KAROTINOĪDUS, PIEMĒRAM, ASTAKSANTĪNU UN DAŽĀDUS ANTOCIANĪNUS. MĒS TURPINĀSIM ATTĪSTĪT MŪSU PATENTĒTO UN LICENCĒTO VEKTORU SISTĒMU, KAS IEGŪTA NO BAKLAŽĀNU LATENTĀ VIROĪDA, KAS ĻAUJ RAŽOT LIELU DAUDZUMU REKOMBINANTO RNS ESCHERICHIA COLI, LAI RAŽOTU DIVSLĀŅU RNS AR ANTI-KAITĒJOŠU AKTIVITĀTI PRET VIDUSJŪRAS AUGĻU LIDOT CERATITIS CAPITATA UN KUKURŪZAS SAKŅU TĀRPU DIABROTICA VIRGUIFERA. TAJĀ PAŠĀ LAIKĀ VIRALCROP MĒS IZSTRĀDĀSIM BIOTEHNOLOĢISKOS INSTRUMENTUS AUGU AIZSARDZĪBAI. MĒS PIEMĒROSIM MŪSU VIZUĀLO MARĶIERU SISTĒMU, KAS ĻAUJ SEKOT VĪRUSU INFEKCIJAI REĀLAJĀ LAIKĀ BEZ INSTRUMENTIEM, DIVIEM AGRONOMISKAS INTERESES VĪRUSIEM, PIEMĒRAM, APPLE HLOROTISKO LAPU PLANKUMU TRIHOVĪRUSAM UN ĶIRBJU DZELTENĀS AIZKAVĒTAS AUGŠANAS TRAUCĒJUMIEM CRINIVIRUS, LAI IZSTRĀDĀTU RĪKUS, KO VAR IZMANTOT SELEKCIJAS PROGRAMMĀS. MĒS IZMANTOSIM ARĪ MĀKSLĪGĀS MIKRORNS, SINTĒTISKĀS MAZĀS INTERFEKTĪVĀS TRANSAKTĪVĀS RNS UN GENOMU REDIĢĒŠANAS STRATĒĢIJAS, LAI IZSTRĀDĀTU CUCURBIT ŠĶIRNES, KAS IR IZTURĪGAS PRET ARBŪZU MOZAĪKAS MOZAĪKAS UN CUKINI DZELTENĀS POTYVĪRUSIEM. VISBEIDZOT, VIRALCROP MĒS NEVĒLAMIES AIZMIRST DAŽUS AUGU VĪRUSU UN VIROĪDU MOLEKULĀRĀS BIOLOĢIJAS PAMATASPEKTUS, JO TĀS IR ZINĀŠANAS, KAS NODROŠINĀS MŪSU NĀKOTNES BIOTEHNOLOĢISKOS INSTRUMENTUS. IZMANTOJOT AFINITĀTES HROMATOGRĀFIJAS ATTĪRĪŠANAS STRATĒĢIJU, KAM SEKO MASAS SPEKTROMETRIJAS (AP-MS) ANALĪZE, VIRALCROP MĒS RAKSTUROSIM SAIMNIEKPROTEĪNUS, KAS REGULĒ RNS INDUCĒTĀ TROKŠŅA SLĀPĒŠANAS KOMPLEKSA (RISC) AKTIVITĀTI, KAS IR GALVENAIS AUGU PRETVĪRUSU AIZSARDZĪBAS ELEMENTS. MĒS IEZĪMĒSIM ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 UN 2 PROTEĪNUS UN IDENTIFICĒSIM AUGU OLBALTUMVIELAS, KAS POTYVIRUS INFEKCIJAS LAIKĀ INTEGRĒ RISC. ZINĀŠANAS PAR ŠIEM PROTEĪNIEM ĻAUS TURPMĀK ATTĪSTĪT KULTŪRAUGU AIZSARDZĪBU. MĒS ARĪ ANALIZĒSIM KODOLKODĒTĀS HLOROPLASTISKĀS RNS POLIMERĀZES (NEP) LOMU AVSUNVIROIDAE SAIMES VIROĪDU REPLIKĀCIJĀ, LAI GALU GALĀ IEKĻAUTU ŠO FERMENTU MŪSU SISTĒMĀ, LAI RAŽOTU REKOMBINANTO RNS E. COLI, NODROŠINOT TO AR DAUDZ LIELĀKU RAŽOŠANAS JAUDU. (Latvian)
17 August 2022
0 references
VÍRUSY A VIROIDY SÚ PRÍČINNÝMI ČINITEĽMI MNOHÝCH CHORÔB RASTLÍN, ČO PREDSTAVUJE HROZBU PRE POĽNOHOSPODÁRSKE PLODINY A PRÍRODNÉ EKOSYSTÉMY. NAPRIEK SVOJIM MALÝM GENÓMOM S OBMEDZENOU SCHOPNOSŤOU KÓDOVANIA SÚ TIETO PATOGÉNY SCHOPNÉ DOKONČIŤ KOMPLEXNÝ INFEKČNÝ CYKLUS PROTICHODNÝMI OBRANNÝMI MECHANIZMAMI HOSTITEĽA. ALE ZÁROVEŇ VĎAKA SVOJIM MALÝM, ĽAHKO OVLÁDATEĽNÝM GENÓMOM, JEHO SCHOPNOSTI RÝCHLO NAPADNÚŤ RASTLINU A JEJ EFEKTÍVNEJ PRODUKCIE BIELKOVÍN A NANOČASTÍC, VÍRUSOV A VIROIDOV MOŽNO TIEŽ REŠTRUKTURALIZOVAŤ NA UŽITOČNÉ BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE. VO VIRALCROPE VYVINIEME VEKTORY ODVODENÉ Z RASTLINNÝCH RNA VÍRUSOV NA PRODUKCIU VÍRUSOVÝCH NANOČASTÍC ZDOBENÝCH JEDNOREŤAZOVÝMI PROTILÁTKAMI ALEBO NANOLÁTKAMI, REKOMBINANTNÝCH TERAPEUTICKÝCH PROTEÍNOV AKO FILGRASTIM A INTERFERÓN ALFA-2A A NA MANIPULÁCIU S RASTLINNÝM METABOLIZMOM EXPRESIOU TRANSKRIPČNÝCH FAKTOROV A BIOSYNTETICKÝCH ENZÝMOV S CIEĽOM ZÍSKAŤ KAROTENOIDY KOMERČNÉHO ZÁUJMU, AKO JE NAPR. TAXANTÍN A RÔZNE ANTOKYANÍNY. BUDEME ĎALEJ ROZVÍJAŤ NÁŠ PATENTOVANÝ A LICENCOVANÝ VEKTOROVÝ SYSTÉM ODVODENÝ Z LATENTNÉHO VIROIDU BAKLAŽÁNU, KTORÝ UMOŽŇUJE VÝROBU VEĽKÉHO MNOŽSTVA REKOMBINANTNEJ RNA V ESCHERICHIA COLI, NA VÝROBU DVOJPRÚDOVÝCH RNA S ANTI-ŠKODLIVOU AKTIVITOU PROTI STREDOMORSKEJ OVOCNEJ MUŠKE CERATITIS CAPITATA A KUKURIČNEJ ROOTWORM DIABROTICA VIRGUIFERA. ZÁROVEŇ VO VIRALCROP VYVINIEME BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE NA OCHRANU PLODÍN. BUDEME APLIKOVAŤ NÁŠ SYSTÉM VIZUÁLNYCH MARKEROV, KTORÝ UMOŽŇUJE NASLEDUJÚCE INFEKCIE VÍRUSOM V REÁLNOM ČASE BEZ POTREBY PRÍSTROJOV, NA DVA VÍRUSY AGRONOMICKÉHO ZÁUJMU, AKO JE APPLE CHLOROTIC LEAF SPOT TRICHOVIRUS A TEKCURBIT ŽLTÁ KASKADÉRSKA PORUCHA KRINIVÍRUS, VYVINÚŤ NÁSTROJE, KTORÉ MÔŽU BYŤ POUŽITÉ V ŠĽACHTITEĽSKÝCH PROGRAMOCH. BUDEME TIEŽ POUŽÍVAŤ UMELÉ MIKRORNA, SYNTETICKÉ MALÉ INTERFERUJÚCE TRANSAKTÍVNE RNA A STRATÉGIE ÚPRAVY GENÓMOV NA VÝVOJ TEKVICOVITÝCH ODRÔD AGRONOMICKÉHO ZÁUJMU ODOLNÝCH VOČI MELÓNOVEJ MOZAIKE A CUKETÁM ŽLTÝM MOZAIKOVÝM VÍRUSOM. NAKONIEC, VO VIRALCROP NECHCEME ZABUDNÚŤ NA NIEKTORÉ ZÁKLADNÉ ASPEKTY RASTLINNÝCH VÍRUSOV A VIROIDOV MOLEKULÁRNEJ BIOLÓGIE, PRETOŽE TOTO JE POZNANIE, KTORÉ POSKYTNE NAŠE BUDÚCE BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE. POMOCOU AFINITNEJ CHROMATOGRAFIE PURIFIKAČNEJ STRATÉGIE, PO KTOREJ NASLEDUJE ANALÝZA HMOTNOSTNEJ SPEKTROMETRIE (AP-MS), VO VIRALCROP BUDEME CHARAKTERIZOVAŤ HOSTITEĽSKÉ PROTEÍNY, KTORÉ REGULUJÚ AKTIVITU KOMPLEXU TLMENIA HLUKU VYVOLANÉHO RNA (RISC), KTORÝ JE KĽÚČOVÝM PRVKOM V PROTIVÍRUSOVEJ OBRANE RASTLÍN. BUDEME OZNAČOVAŤ ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 A 2 PROTEÍNY A IDENTIFIKOVAŤ RASTLINNÉ PROTEÍNY, KTORÉ INTEGRUJÚ RISC POČAS POTYVIRUS INFEKCIE. POZNATKY O TÝCHTO BIELKOVINÁCH UMOŽNIA BUDÚCI VÝVOJ V OBLASTI OCHRANY PLODÍN. BUDEME TIEŽ ANALYZOVAŤ ÚLOHU NUKLEÁRNEJ KÓDOVANEJ CHLÓROPLASTOVEJ RNA POLYMERÁZY (NEP) PRI REPLIKÁCII VIROIDOV RODINY AVSUNVIROIDAE, ABY SA TENTO ENZÝM NAKONIEC ZAČLENIL DO NÁŠHO SYSTÉMU NA VÝROBU REKOMBINANTNEJ RNA V E. COLI, ČÍM SA POSKYTNE OVEĽA VÄČŠIA VÝROBNÁ KAPACITA. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS IAD VÍRIS AGUS VIROIDS GNÍOMHAIRÍ CÚISEACHA GO LEOR GALAR I BPLANDAÍ, RUD A CHUIREANN BARRA TALMHAÍOCHTA AGUS ÉICEACHÓRAIS NÁDÚRTHA I MBAOL. IN AINNEOIN A NGÉANÓIM BHEAGA A BHFUIL CUMAS CÓDAITHE TEORANTA ACU, IS FÉIDIR LEIS NA PATAIGINÍ SIN TIMTHRIALL CASTA IONFHABHTAÍOCH A CHUR I GCRÍCH TRÍ CHUR I GCOINNE SÁSRAÍ COSANTA ÓSTACHA. ACH AG AN AM CÉANNA, MAR GHEALL AR A GHÉANÓIM BHEAGA ATÁ ÉASCA LE LÁIMHSEÁIL, IS FÉIDIR ATHSTRUCHTÚRÚ A DHÉANAMH AR A CHUMAS AN GLÉASRA A IONRADH GO TAPA AGUS A THÁIRGEADH GO HÉIFEACHTACH PRÓITÉINÍ AGUS NANACHÁITHNÍNÍ, VÍRIS AGUS VIROIDS A ATHSTRUCHTÚRÚ FREISIN IN UIRLISÍ BITEICNEOLAÍOCHTA ÚSÁIDEACHA. I VIRALCROP FORBRÓIMID VEICTEOIRÍ A DHÍORTHAÍTEAR Ó VÍRIS RNA PLANDAÍ CHUN NANACHÁITHNÍNÍ VÍREASACHA ATÁ MAISITHE LE ANTASUBSTAINTÍ SLABHRA AONAIR NÓ NANASUBSTAINTÍ A THÁIRGEADH, PRÓITÉINÍ TEIRIPEACHA ATHCHUINGREACHA AMHAIL FILGRASTIM AGUS INTERFERON ALFA-2A, AGUS MEITIBILEACHT PLANDAÍ A IONRAMHÁIL TRÍ FHACHTÓIRÍ TRAS-SCRÍOFA AGUS EINSÍMÍ BITHSHINTÉISEACHA A CHUR IN IÚL CHUN CAROTENOIDS A BHFUIL LEAS TRÁCHTÁLA ACU AR NÓS ASTAXANTHIN AGUS ANTHOCYANINS ÉAGSÚLA A FHÁIL. FORBRÓIMID TUILLEADH ÁR GCÓRAS VEICTEOIR PAITINNITHE AGUS CEADÚNAITHE A DHÍORTHAÍTEAR Ó VIROID FOLAIGH EGGPLANT, A CHEADAÍONN TÁIRGEADH MÉIDEANNA MÓRA RNA ATHCHUINGREACH I ESCHERICHIA COLI, A THÁIRGEADH RNAS DÚBAILTE-STRANDED LE GNÍOMHAÍOCHT FRITH-PEST I GCOINNE AN EITILT TORTHAÍ MEÁNMHARA CERATITIS CAPITATA AGUS AN ROOTWORM ARBHAR DIABROTICA VIRGUIFERA. AG AN AM CÉANNA, I VIRALCROP FORBRÓIMID UIRLISÍ BITEICNEOLAÍOCHTA LE HAGHAIDH COSAINT BARR. CUIRFIMID ÁR GCÓRAS MARCÓIRÍ AMHAIRC I BHFEIDHM, A CHEADAÍONN IONFHABHTÚ VÍREAS A LEANÚINT I BHFÍOR-AM GAN GÁ LE HIONSTRAIMÍOCHT, LE DHÁ VÍRIS DE LEAS AGRANAMAÍOCH, MAR SHAMPLA TRICHOVIRUS AGUS NEAMHORD STUNTING BUÍ CUCURBIT, CHUN UIRLISÍ A FHORBAIRT AR FÉIDIR IAD A ÚSÁID I GCLÁIR PHÓRAITHE. BAINFIMID ÚSÁID FREISIN AS MICRORNAS SAORGA, RNAS TRASGHNÍOMHACHA TRASNAÍOCHTA SINTÉISEACHA AGUS STRAITÉISÍ EAGARTHÓIREACHTA GENOME CHUN CINEÁLACHA CUCURBIT DE SPÉIS AGRONOMIC A FHORBAIRT ATÁ FRITHSHEASMHACH IN AGHAIDH MÓSÁIC WATERMELON AGUS POTYVIRUSÍ MÓSÁIC BUÍ ZUCCHINI. AR DEIREADH, I VIRALCROP NÍL MUID AG IARRAIDH DEARMAD A DHÉANAMH AR ROINNT GNÉITHE BUNÚSACHA DE VÍRIS PLANDAÍ AGUS BITHEOLAÍOCHT MHÓILÍNEACH VIROIDS, MAR IS É SEO AN T-EOLAS A SHOLÁTHRÓIDH ÁR N-UIRLISÍ BITEICNEOLAÍOCHTA SA TODHCHAÍ. TRÍ BHÍTHIN STRAITÉIS ÍONÚ CRÓMATAGRAFAÍOCHTA CLEAMHNACHTA AGUS ANAILÍS MAIS-SPEICTRIMÉADRACHTA (AP-MS) INA DHIAIDH SIN, IN VIRALCROP DÉANFAIMID NA PRÓITÉINÍ ÓSTACHA A RIALAÍONN GNÍOMHAÍOCHT CHOIMPLÉASC TOSTA RNA-SPREAGTHA (RISC), PRÍOMHGHNÉ I GCOSAINT ANTIVIRAL PLANDAÍ. DÉANFAIMID TAG ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 AGUS 2 PRÓITÉINÍ AGUS A AITHINT NA PRÓITÉINÍ PLANDAÍ A CHOMHTHÁTHÚ RISC LE LINN IONFHABHTÚ POTYVIRUS. FÁGFAIDH AN T-EOLAS AR NA PRÓITÉINÍ SIN GO MBEIFEAR IN ANN FORBAIRTÍ A DHÉANAMH AMACH ANSEO MAIDIR LE COSAINT BARR. DÉANFAIMID ANAILÍS FREISIN AR RÓL AN PHOLAIMÉIRÁISE CHLOROPLASTIC RNA (NEP) ATÁ IONCHÓDAITHE NÚICLÉACH (NEP) I MACASAMHLÚ VIROIDS AN TEAGHLAIGH AVSUNVIROIDAE, CHUN AN EINSÍM SEO A IONCHORPRÚ INÁR GCÓRAS CHUN RNA ATHCHUINGREACH A THÁIRGEADH IN E. COLI, RUD A CHUIREANN CUMAS TÁIRGTHE I BHFAD NÍOS MÓ AR FÁIL. (Irish)
17 August 2022
0 references
VIRY A VIROIDY JSOU PŘÍČINNÝMI ČINITELI MNOHA CHOROB ROSTLIN, COŽ PŘEDSTAVUJE HROZBU PRO ZEMĚDĚLSKÉ PLODINY A PŘÍRODNÍ EKOSYSTÉMY. NAVZDORY SVÝM MALÝM GENOMŮM S OMEZENOU SCHOPNOSTÍ KÓDOVÁNÍ, JSOU TYTO PATOGENY SCHOPNY DOKONČIT KOMPLEXNÍ INFEKČNÍ CYKLUS PROTICHŮDNÝMI OBRANNÝMI MECHANISMY HOSTITELE. ALE ZÁROVEŇ, DÍKY SVÝM MALÝM, SNADNO MANIPULOVATELNÝM GENOMŮM, JEJÍ SCHOPNOSTI RYCHLE NAPADNOUT ROSTLINU A JEJÍ EFEKTIVNÍ PRODUKCI BÍLKOVIN A NANOČÁSTIC, VIRŮ A VIROIDŮ LZE TAKÉ RESTRUKTURALIZOVAT NA UŽITEČNÉ BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE. VE VIRALCROPU VYVINEME VEKTORY ODVOZENÉ Z ROSTLINNÝCH RNA VIRŮ PRO VÝROBU VIROVÝCH NANOČÁSTIC ZDOBENÝCH JEDNOŘETĚZNÝMI PROTILÁTKY NEBO NANOTĚLO, REKOMBINANTNÍMI TERAPEUTICKÝMI PROTEINY, JAKO JE FILGRASTIM A INTERFERON ALFA-2A, A MANIPULACÍ S ROSTLINNÝM METABOLISMUS EXPRIMACÍ TRANSKRIPČNÍCH FAKTORŮ A BIOSYNTETICKÝCH ENZYMŮ ZA ÚČELEM ZÍSKÁNÍ KAROTENOIDŮ KOMERČNÍHO ZÁJMU, JAKO JE ASTAXANTHIN A RŮZNÉ ANTOKYANY. DÁLE BUDEME ROZVÍJET NÁŠ PATENTOVANÝ A LICENCOVANÝ VEKTOROVÝ SYSTÉM ODVOZENÝ Z LATENTNÍHO VIROIDU LILKU, KTERÝ UMOŽŇUJE VÝROBU VELKÉHO MNOŽSTVÍ REKOMBINANTNÍ RNA V ESCHERICHIA COLI K VÝROBĚ DVOUPROUŽKŮ RNA S ANTI-ŠESTOVOU AKTIVITOU PROTI STŘEDOMOŘSKÉMU OVOCNÉMU MOUCHU CERATITIS CAPITATA A KUKUŘIČNÉMU KOŘENOVÉMU ČERVU DIABROTICA VIRGUIFERA. SOUČASNĚ BUDEME VE VIRALCROPU VYVÍJET BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE PRO OCHRANU PLODIN. APLIKUJEME NÁŠ SYSTÉM VIZUÁLNÍCH MARKERŮ, KTERÝ UMOŽŇUJE NÁSLEDUJÍCÍ VIROVOU INFEKCI V REÁLNÉM ČASE BEZ NUTNOSTI INSTRUMENTACE, NA DVA VIRY AGRONOMICKÉHO ZÁJMU, JAKO JE JABLEČNÝ CHLOROTICKÝ LIST SPOTOVÝ TRICHOVIRUS A CUCURBIT ŽLUTÁ PORUCHA ZAKRINIVIRU, ABYCHOM VYVINULI NÁSTROJE, KTERÉ MOHOU BÝT POUŽITY V ŠLECHTITELSKÝCH PROGRAMECH. BUDEME TAKÉ POUŽÍVAT UMĚLÉ MIKRORNA, SYNTETICKÉ MALÉ INTERFERUJÍCÍ TRANSAKTIVNÍ RNA A STRATEGIE ÚPRAVY GENOMU K VÝVOJI TYKVOVÝCH ODRŮD AGRONOMICKÉHO ZÁJMU ODOLNÝCH VŮČI MELOUNOVÉ MOZAICE A CUKETY ŽLUTÉ MOZAIKOVÉ POTYVIRY. A KONEČNĚ, VE VIRALCROPU NECHCEME ZAPOMENOUT NA NĚKTERÉ ZÁKLADNÍ ASPEKTY ROSTLINNÝCH VIRŮ A VIROIDŮ MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE, PROTOŽE TO JSOU ZNALOSTI, KTERÉ POSKYTNOU NAŠE BUDOUCÍ BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE. POMOCÍ AFINITNÍ CHROMATOGRAFIE ČISTÍCÍ STRATEGIE NÁSLEDOVANÉ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE (AP-MS) ANALÝZA, VE VIRALCROP BUDEME CHARAKTERIZOVAT HOSTITELSKÉ PROTEINY, KTERÉ REGULUJÍ AKTIVITU RNA-INDUKOVANÝ TLUMICÍ KOMPLEX (RISC), KLÍČOVÝ PRVEK V ROSTLINNÉ ANTIVIROVÉ OBRANY. OZNAČÍME ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 A 2 PROTEINY A IDENTIFIKUJEME ROSTLINNÉ BÍLKOVINY, KTERÉ INTEGRUJÍ RISC BĚHEM POTYVIROVÉ INFEKCE. ZNALOST TĚCHTO BÍLKOVIN UMOŽNÍ BUDOUCÍ VÝVOJ V OBLASTI OCHRANY PLODIN. BUDEME TAKÉ ANALYZOVAT ROLI NUKLEÁRNÍ KÓDOVANÉ CHLOROPLASTICKÉ RNA POLYMERÁZY (NEP) V REPLIKACI VIROIDŮ RODINY AVSUNVIROIDAE, ABYCHOM TENTO ENZYM NAKONEC ZAČLENILI DO NAŠEHO SYSTÉMU PRO VÝROBU REKOMBINANTNÍ RNA V E. COLI, COŽ MU POSKYTNE MNOHEM VĚTŠÍ VÝROBNÍ KAPACITU. (Czech)
17 August 2022
0 references
VÍRUS E VÍRÓIDOS SÃO OS AGENTES CAUSAIS DE MUITAS DOENÇAS EM PLANTAS, O QUE PÕE UMA AMEAÇA ÀS CULTURAS AGRÍCOLAS E AOS ECOSSISTEMAS NATURAIS. Apesar de os seus pequenos genomas terem uma capacidade de codificação limitada, estes organismos são capazes de completar um ciclo infeccioso completo através da instalação de mecanismos defensivos do hospedeiro. Mas, ao mesmo tempo, devido aos seus pequenos e fáceis de manipulá-los, a sua capacidade de invadir rapidamente a planta e a sua produção eficaz de proteínas e nanopartículas, vírus e vírus também podem ser reestruturados em ferramentas biotecnológicas úteis. Em VIRALCROP, DESENVOLVERemos VECTORES PROVENIENTES DE VÍRUS DE ARN VEGETAL PARA PRODUZIR NANOPARTICLES VIRALES DECORADOS COM ANTIBOLOGIAS OU NANOBORGIAS DE CADEIA ÚNICA, RECOMBINANTES PROTEÍNAS TEMPÉTICAS COMO FILGRASTIM E INTERFERON ALFA-2A, E MANIPULAR O METABOLISMO VEGETAL POR EXPRESSÃO DE FATORES DE TRANSCRIÇÃO E ENZIMES BIOSINTÉTICOS PARA OBTER CAROTENÓIDOS DE INTERESSE COMERCIAL TAIS ASTAXANTINAS E ANTOCIANINAS VARIOSAS. Continuaremos a desenvolver o nosso sistema de vetores padronizados e licenciados, provenientes do EGGPLANT LATENT VIROID, que permite a produção de grandes quantidades de ARN recombinante na ESCHERICHIA COLI, para produzir RNAS de dupla estrutura com atividade anti-preparada contra a CAPITA MEDITERRÂNICA FRUIT FLY CERATITIS e a CORN ROOTWORM DIABROTICA VIRGUIFERA. Ao mesmo tempo, em VIRALCROP, desenvolveremos ferramentas biotecnológicas para a protecção das culturas. Aplicaremos o nosso sistema de marcadores visuais, que permite seguir a infecção por vírus em tempo real, sem necessidade de instalação, a dois vírus de interesse acromómico, como o TRICHOVIRUS CHLOROTIC LEAF SPOT e o CRINIVIRUS CUCURBIT YOW STUNTING DISORDER, para desenvolver ferramentas que possam ser utilizadas em programas de criação. Iremos também utilizar microRNAS ARTIFICIAIS, RNAS SINTÉTICOS PEQUENOS QUE INTERFEREM A TRANSACÇÃO E ESTRATÉGIAS DE EDIÇÃO DE GÉNEROS PARA DESENVOLVIMENTO DE VARIEDADES CUCURBITAS DE INTERESSE AGRÓNÓMICO RESISTENTES A POTIVÍCULOS MOSAICOS AMARELOS A WATERMELON E ZUCCHINI. Finalmente, na VIRALCROP, não queremos esquecer alguns aspectos básicos da biologia molecular dos vírus e das viroides, já que este é o conhecimento que fornecerá nossas futuras ferramentas biotecnológicas. Por meio de uma estratégia de purificação por cromatografia de precisão seguida de uma análise por espetrometria de massa (AP-MS), caracterizaremos, em VIRALCROP, as proteínas hospedeiras que regulam a atividade do módulo de silenciamento (RISC) induzido pelo ARN, um elemento-chave na defesa antiviral vegetal. Iremos identificar as proteínas da aridiopsia Taliana Argonata1 e 2 proteínas e identificar as proteínas vegetais que integram o risco durante a infecção por Potívio. O conhecimento destas proteínas permitirá o desenvolvimento futuro da protecção das culturas. Analisaremos também o papel da polimerase de ARN CLOROPLÁSTICO CODIFICADO NUCLEAR (NEP) na substituição dos vírus da família AVSUNVIROIDAE, para incorporar este enzima no nosso sistema para produzir ARN recombinante em E. COLI, fornecendo-o com grande capacidade de produção. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
VIIRUSED JA VIROIDID ON PALJUDE TAIMEDE HAIGUSTE PÕHJUSTAJAD, OHUSTADES SEEGA PÕLLUKULTUURE JA LOODUSLIKKE ÖKOSÜSTEEME. HOOLIMATA NENDE VÄIKESTEST GENOOMIDEST, MILLEL ON PIIRATUD KODEERIMISVÕIME, ON NEED PATOGEENID VÕIMELISED LÄBIMA KOMPLEKSSE NAKKUSTSÜKLI, VASTANDADES PEREMEESORGANISMI KAITSEMEHHANISME. KUID SAMAL AJAL, TÄNU OMA VÄIKESELE, KERGESTI MANIPULEERITAVALE GENOOMILE, SELLE VÕIMELE TAIME KIIRESTI TUNGIDA NING VALKUDE JA NANOOSAKESTE, VIIRUSTE JA VIROIDIDE TÕHUSALE TOOTMISELE SAAB ÜMBER STRUKTUREERIDA KA KASULIKEKS BIOTEHNOLOOGILISTEKS VAHENDITEKS. VIRALCROPIS ARENDAME VÄLJA TAIME RNA VIIRUSTEST SAADUD VEKTOREID, ET TOOTA VIIRUSLIKKE NANOOSAKESI, MIS ON KAUNISTATUD ÜHE AHELAGA ANTIKEHADEGA VÕI NANOKEHADEGA, REKOMBINANTSETE TERAPEUTILISTE VALKUDEGA, NAGU FILGRASTIIM JA INTERFEROON ALFA-2A, NING MANIPULEERIDA TAIMEDE AINEVAHETUSEGA, VÄLJENDADES TRANSKRIPTSIOONIFAKTOREID JA BIOSÜNTEETILISI ENSÜÜME, ET SAADA KAUBANDUSLIKKU HUVI PAKKUVAID KAROTENOIDE, NAGU NÄITEKS ASTAKSANTIIN JA MITMESUGUSED ANTOTSÜANIINID. ARENDAME EDASI OMA PATENTEERITUD JA LITSENTSEERITUD VEKTORISÜSTEEMI, MIS ON SAADUD BAKLAŽAANI LATENTSEST VIROIDIST, MIS VÕIMALDAB TOOTA SUURES KOGUSES REKOMBINANTSET RNAD ESCHERICHIA COLIS, ET TOOTA KAHEKORDSEID RNASID, MILLEL ON KAHJURIVASTANE TOIME VAHEMERE PUUVILJAKÄRBSE VASTU CERATITIS CAPITATA JA MAISI JUUREUSSI DIABROTICA VIRGUIFERA. SAMAL AJAL ARENDAME VIRALCROPIS VÄLJA BIOTEHNOLOOGILISED VAHENDID TAIMEKAITSEKS. RAKENDAME OMA VISUAALSETE MARKERITE SÜSTEEMI, MIS VÕIMALDAB JÄLGIDA VIIRUSNAKKUST REAALAJAS ILMA INSTRUMENDITA, KAHELE AGRONOOMILIST HUVI PAKKUVALE VIIRUSELE, NAGU APPLE’I KLOOROOTILISE LEHTEDE PUNKTTRICHOVIIRUS JA KÕRVITSAKOLLANE KÄNGUMISE HÄIRE KRINIVIIRUS, ET ARENDADA VAHENDEID, MIDA SAAB KASUTADA ARETUSPROGRAMMIDES. SAMUTI KASUTAME KUNSTLIKKE MICRORNASID, SÜNTEETILISI VÄIKESEID SEKKUVAID TRANSAKTIIVSEID RNASID JA GENOOMI REDIGEERIMISE STRATEEGIAID, ET ARENDADA ARBUUSI MOSAIIK- JA SUVIKÕRVITSAKOLLASTE MOSAIIKPOLÜVIIRUSTE SUHTES RESISTENTSEID AGRONOOMILISI HUVE. LÕPUKS, VIRALCROPIS EI TAHA ME UNUSTADA MÕNINGAID TAIMEVIIRUSTE JA VIROIDIDE MOLEKULAARBIOLOOGIA PÕHIASPEKTE, SEST NEED ON TEADMISED, MIS PAKUVAD MEIE TULEVASI BIOTEHNOLOOGILISI VAHENDEID. KASUTADES AFIINSUSKROMATOGRAAFIA PUHASTUSSTRATEEGIAT, MILLELE JÄRGNEB MASSISPEKTROMEETRIA (AP-MS) ANALÜÜS, ISELOOMUSTAME VIRALCROPIS PEREMEESVALKE, MIS REGULEERIVAD RNA INDUTSEERITUD SUMMUTIKOMPLEKSI (RISC) AKTIIVSUST, MIS ON TAIMEDE VIIRUSEVASTASE KAITSE PÕHIELEMENT. MÄRGISTAME ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 JA 2 VALGUD NING TUVASTAME TAIMSED VALGUD, MIS INTEGREERIVAD RISC POTYVIRUS INFEKTSIOONI AJAL. NENDE VALKUDE TUNDMINE VÕIMALDAB TAIMEKAITSE EDASIST ARENGUT. ANALÜÜSIME KA TUUMA KODEERITUD KLOROPLASTILISE RNA POLÜMERAASI (NEP) ROLLI PEREKONNA AVSUNVIROIDAE VIROIDIDE REPLIKATSIOONIS, ET LÕPUKS LISADA SEE ENSÜÜM MEIE SÜSTEEMI REKOMBINANTSE RNA TOOTMISEKS E. COLIS, PAKKUDES SELLELE PALJU SUUREMAT TOOTMISVÕIMSUST. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A VÍRUSOK ÉS A VIROIDOK OKOZZÁK A NÖVÉNYEK SZÁMOS BETEGSÉGÉT, AMI VESZÉLYEZTETI A MEZŐGAZDASÁGI NÖVÉNYEKET ÉS A TERMÉSZETES ÖKOSZISZTÉMÁKAT. ANNAK ELLENÉRE, HOGY KIS GENOMOK KORLÁTOZOTT KÓDOLÁSI KAPACITÁSSAL, EZEK A KÓROKOZÓK KÉPESEK BEFEJEZNI EGY KOMPLEX FERTŐZŐ CIKLUS ELLENTÉTES GAZDA VÉDELMI MECHANIZMUSOK. UGYANAKKOR A KIS, KÖNNYEN MANIPULÁLHATÓ GENOMOK MIATT A NÖVÉNY GYORS BEHATOLÁSÁNAK KÉPESSÉGE, VALAMINT A FEHÉRJÉK ÉS NANORÉSZECSKÉK, VÍRUSOK ÉS VIROIDOK HATÉKONY ELŐÁLLÍTÁSA SZINTÉN HASZNOS BIOTECHNOLÓGIAI ESZKÖZÖKKÉ ALAKÍTHATÓ ÁT. A VIRALCROP-BAN NÖVÉNYI RNS VÍRUSOKBÓL SZÁRMAZÓ VEKTOROKAT FOGUNK KIFEJLESZTENI EGYLÁNCÚ ANTITESTEKKEL VAGY NANOTESTEKKEL DÍSZÍTETT VÍRUSOS NANORÉSZECSKÉK, REKOMBINÁNS TERÁPIÁS FEHÉRJÉK, PÉLDÁUL FILGRASZTIM ÉS INTERFERON ALFA-2A ELŐÁLLÍTÁSÁRA, VALAMINT A NÖVÉNYI METABOLIZMUS MANIPULÁLÁSÁRA TRANSZKRIPCIÓS FAKTOROK ÉS BIOSZINTETIKUS ENZIMEK MEGADÁSÁVAL, HOGY KERESKEDELMI ÉRDEKLŐDÉSRE SZÁMOT TARTÓ KAROTINOIDOKAT, PÉLDÁUL ASZTAXANTINT ÉS KÜLÖNBÖZŐ ANTOCIÁNOKAT NYERJENEK. TOVÁBBFEJLESZTJÜK A PADLIZSÁN LÁTENS VIROIDBÓL SZÁRMAZÓ SZABADALMAZTATOTT ÉS ENGEDÉLYEZETT VEKTORRENDSZERÜNKET, AMELY LEHETŐVÉ TESZI A NAGY MENNYISÉGŰ REKOMBINÁNS RNS TERMELÉSÉT ESCHERICHIA COLIBAN, HOGY KETTŐS SZÁLÚ RNS-EKET ÁLLÍTSUNK ELŐ KÁRTEVŐ-ELLENES AKTIVITÁSSAL A CERATITIS CAPITATA ÉS A DIABROTICA VIRGUIFERA KUKORICAGYÖKÉR ELLEN. UGYANAKKOR A VIRALCROP-BAN BIOTECHNOLÓGIAI ESZKÖZÖKET FEJLESZTÜNK KI A NÖVÉNYVÉDELEM ÉRDEKÉBEN. VIZUÁLIS MARKEREK RENDSZERÜNKET ALKALMAZZUK, AMELY LEHETŐVÉ TESZI A VÍRUSFERTŐZÉS VALÓS IDŐBEN TÖRTÉNŐ ALKALMAZÁSÁT MŰSZEREK NÉLKÜL, KÉT AGRONÓMIAI JELENTŐSÉGŰ VÍRUSRA, PÉLDÁUL AZ APPLE KLÓROS LEVÉLFOLTOS TRICHOVÍRUSRA ÉS A CUCURBIT SÁRGA KASZKADŐRZAVAR CRINIVÍRUSRA, HOGY OLYAN ESZKÖZÖKET FEJLESSZEN KI, AMELYEK FELHASZNÁLHATÓK A TENYÉSZTÉSI PROGRAMOKBAN. MESTERSÉGES MIKRORNS-EKET, SZINTETIKUS KIS INTERFERÁLÓ TRANSZAKTÍV RNS-EKET ÉS GENOMSZERKESZTÉSI STRATÉGIÁKAT IS HASZNÁLUNK A GÖRÖGDINNYE MOZAIKNAK ÉS CUKKINI SÁRGA MOZAIK POTYVÍRUSOKNAK ELLENÁLLÓ AGRONÓMIAI ÉRDEKLŐDÉSŰ KUBAI FAJTÁK KIFEJLESZTÉSÉHEZ. VÉGÜL A VIRALCROP-BAN NEM SZERETNÉNK ELFELEJTENI A NÖVÉNYI VÍRUSOK ÉS A VIROIDOK MOLEKULÁRIS BIOLÓGIA NÉHÁNY ALAPVETŐ ASPEKTUSÁT, MIVEL EZ AZ A TUDÁS, AMELY A JÖVŐ BIOTECHNOLÓGIAI ESZKÖZEIT BIZTOSÍTJA. AZ AFFINITÁSKROMATOGRÁFIÁS TISZTÍTÁSI STRATÉGIA SEGÍTSÉGÉVEL, AMELYET TÖMEGSPEKTROMETRIÁS (AP-MS) ELEMZÉS KÖVET, A VIRALCROP-BAN JELLEMEZZÜK AZOKAT A GAZDAFEHÉRJÉKET, AMELYEK SZABÁLYOZZÁK AZ RNS-INDUKÁLT HANGTOMPÍTÓ KOMPLEX (RISC) AKTIVITÁSÁT, AMELY KULCSFONTOSSÁGÚ ELEME A NÖVÉNYI ANTIVIRÁLIS VÉDELEMNEK. MEGCÍMKÉZZÜK AZ ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 ÉS 2 FEHÉRJÉT, ÉS AZONOSÍTJUK AZOKAT A NÖVÉNYI FEHÉRJÉKET, AMELYEK INTEGRÁLJÁK A RISC-T A POTYVÍRUS FERTŐZÉS SORÁN. E FEHÉRJÉK ISMERETE LEHETŐVÉ TESZI A NÖVÉNYVÉDELEM JÖVŐBELI FEJLŐDÉSÉT. ELEMEZNI FOGJUK TOVÁBBÁ A NUKLEÁRIS KÓDOLT KLÓRMŰANYAG RNS POLIMERÁZ (NEP) SZEREPÉT AZ AVSUNVIROIDAE CSALÁD VIROIDJAINAK REPLIKÁCIÓJÁBAN, HOGY VÉGÜL EZT AZ ENZIMET BEÉPÍTSÜK RENDSZERÜNKBE, HOGY REKOMBINÁNS RNS-T ÁLLÍTSUNK ELŐ AZ E. COLI-BAN, SOKKAL NAGYOBB TERMELÉSI KAPACITÁST BIZTOSÍTVA. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ВИРУСИТЕ И ВИРОИДИТЕ СА ПРИЧИНИТЕЛИ НА МНОГО БОЛЕСТИ ПО РАСТЕНИЯТА, КАТО ПО ТОЗИ НАЧИН ПРЕДСТАВЛЯВАТ ЗАПЛАХА ЗА СЕЛСКОСТОПАНСКИТЕ КУЛТУРИ И ЕСТЕСТВЕНИТЕ ЕКОСИСТЕМИ. ВЪПРЕКИ МАЛКИТЕ СИ ГЕНОМИ С ОГРАНИЧЕН КАПАЦИТЕТ ЗА КОДИРАНЕ, ТЕЗИ ПАТОГЕНИ СА В СЪСТОЯНИЕ ДА ЗАВЪРШАТ СЛОЖЕН ИНФЕКЦИОЗЕН ЦИКЪЛ ЧРЕЗ ПРОТИВОПОЛОЖНИ ЗАЩИТНИ МЕХАНИЗМИ НА ГОСТОПРИЕМНИКА. НО В СЪЩОТО ВРЕМЕ, ПОРАДИ МАЛКИТЕ СИ, ЛЕСНИ ЗА МАНИПУЛАЦИЯ ГЕНОМИ, СПОСОБНОСТТА МУ БЪРЗО ДА НАХЛУЕ В РАСТЕНИЕТО И ЕФЕКТИВНОТО МУ ПРОИЗВОДСТВО НА ПРОТЕИНИ И НАНОЧАСТИЦИ, ВИРУСИ И ВИРОИДИ СЪЩО МОГАТ ДА БЪДАТ ПРЕСТРУКТУРИРАНИ В ПОЛЕЗНИ БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ. ВЪВ VIRALCROP ЩЕ РАЗРАБОТИМ ВЕКТОРИ, ПОЛУЧЕНИ ОТ РАСТИТЕЛНИ РНК ВИРУСИ, ЗА ПРОИЗВОДСТВО НА ВИРУСНИ НАНОЧАСТИЦИ, УКРАСЕНИ С ЕДНОВЕРИЖНИ АНТИТЕЛА ИЛИ НАНОТЕЛА, РЕКОМБИНАНТНИ ТЕРАПЕВТИЧНИ ПРОТЕИНИ КАТО ФИЛГРАСТИМ И ИНТЕРФЕРОН ALFA-2A, КАКТО И ЗА МАНИПУЛИРАНЕ НА РАСТИТЕЛНИЯ МЕТАБОЛИЗЪМ ЧРЕЗ ИЗРАЗЯВАНЕ НА ТРАНСКРИПЦИОННИ ФАКТОРИ И БИОСИНТЕТИЧНИ ЕНЗИМИ ЗА ПОЛУЧАВАНЕ НА КАРОТЕНОИДИ ОТ ТЪРГОВСКИ ИНТЕРЕС КАТО АСТАКСАНТИН И РАЗЛИЧНИ АНТОЦИАНИНИ. ЩЕ ДОРАЗВИЕМ ПАТЕНТОВАНАТА И ЛИЦЕНЗИРАНА ВЕКТОРНА СИСТЕМА, ПОЛУЧЕНА ОТ ПАТЛАДЖАН ЛАТЕНТЕН ВИРОИД, КОЯТО ПОЗВОЛЯВА ПРОИЗВОДСТВОТО НА ГОЛЕМИ КОЛИЧЕСТВА РЕКОМБИНАНТНА РНК В ESCHERICHIA COLI, ЗА ДА ПРОИЗВЕДЕ ДВОЙНО ВЛАКНО РНК С АНТИ-ВРЕДИТЕЛНА АКТИВНОСТ СРЕЩУ СРЕДИЗЕМНОМОРСКАТА ПЛОДОВА МУХА CERATITIS CAPITATA И ЦАРЕВИЧНИЯ КОРЕНЕН ЧЕРВЕЙ DIABROTICA VIRGUIFERA. В СЪЩОТО ВРЕМЕ ВЪВ VIRALCROP ЩЕ РАЗРАБОТИМ БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА РАСТИТЕЛНА ЗАЩИТА. ЩЕ ПРИЛОЖИМ НАШАТА СИСТЕМА ОТ ВИЗУАЛНИ МАРКЕРИ, КОЯТО ПОЗВОЛЯВА ПРОСЛЕДЯВАНЕ НА ВИРУСНА ИНФЕКЦИЯ В РЕАЛНО ВРЕМЕ, БЕЗ ДА Е НЕОБХОДИМА АПАРАТУРА, КЪМ ДВА АГРОНОМИЧНИ ВИРУСА, КАТО НАПРИМЕР ЯБЪЛКОВ ХЛОРОТИЧЕН ЛИСТЕН СПОТ ТРИХОВИРУС И ЖЪЛТО КАСКАДЬОРНО РАЗСТРОЙСТВО КРИНИВИРУС, ЗА ДА РАЗРАБОТИМ ИНСТРУМЕНТИ, КОИТО МОГАТ ДА СЕ ИЗПОЛЗВАТ В РАЗВЪДНИТЕ ПРОГРАМИ. СЪЩО ТАКА ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ ИЗКУСТВЕНИ МИКРОРНК, СИНТЕТИЧНИ МАЛКИ ИНТЕРФЕРИРАЩИ ТРАНСАКТИВНИ РНК И СТРАТЕГИИ ЗА РЕДАКТИРАНЕ НА ГЕНОМА, ЗА ДА РАЗРАБОТИМ СОРТОВЕ ОТ АГРОНОМИЧЕСКИ ИНТЕРЕС, УСТОЙЧИВИ НА ДИНЯ МОЗАЙКА И ЖЪЛТИ МОЗАЕЧНИ ВИРУСИ ОТ ТИКВИЧКИ. И НАКРАЯ, В VIRALCROP НЕ ИСКАМЕ ДА ЗАБРАВЯМЕ НЯКОИ ОСНОВНИ АСПЕКТИ НА РАСТИТЕЛНИТЕ ВИРУСИ И МОЛЕКУЛЯРНАТА БИОЛОГИЯ НА ВИРОИДИТЕ, ТЪЙ КАТО ТОВА Е ЗНАНИЕТО, КОЕТО ЩЕ ОСИГУРИ БЪДЕЩИТЕ НИ БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ. С ПОМОЩТА НА АФИНИТЕТНА ХРОМАТОГРАФИЯ СТРАТЕГИЯ ЗА ПРЕЧИСТВАНЕ, ПОСЛЕДВАНА ОТ МАССПЕКТРОМЕТРИЯ (AP-MS) АНАЛИЗ, В VIRALCROP НИЕ ЩЕ ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ГОСТОПРИЕМНИКА ПРОТЕИНИ, КОИТО РЕГУЛИРАТ АКТИВНОСТТА НА РНК-ИНДУЦИРАН ШУМОЗАГЛУШИТЕЛЕН КОМПЛЕКС (RISC), КЛЮЧОВ ЕЛЕМЕНТ В РАСТИТЕЛНАТА АНТИВИРУСНА ЗАЩИТА. ЩЕ МАРКИРАМЕ ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 И 2 ПРОТЕИНИ И ЩЕ ИДЕНТИФИЦИРАМЕ РАСТИТЕЛНИТЕ ПРОТЕИНИ, КОИТО ИНТЕГРИРАТ RISC ПО ВРЕМЕ НА ВИРУСНА ИНФЕКЦИЯ. ПОЗНАВАНЕТО НА ТЕЗИ ПРОТЕИНИ ЩЕ ПОЗВОЛИ БЪДЕЩО РАЗВИТИЕ В ОБЛАСТТА НА РАСТИТЕЛНАТА ЗАЩИТА. СЪЩО ТАКА ЩЕ АНАЛИЗИРАМЕ РОЛЯТА НА ЯДРЕНО КОДИРАНАТА ХЛОРОПЛАСТИЧНА РНК ПОЛИМЕРАЗА (NEP) В РЕПЛИКАЦИЯТА НА ВИРОИДИТЕ НА СЕМЕЙСТВОТО AVSUNVIROIDAE, ЗА ДА ВКЛЮЧИМ ТОЗИ ЕНЗИМ В НАШАТА СИСТЕМА, ЗА ДА ПРОИЗВЕДЕМ РЕКОМБИНАНТНА РНК В E. COLI, ОСИГУРЯВАЙКИ МУ МНОГО ПО-ГОЛЯМ ПРОИЗВОДСТВЕН КАПАЦИТЕТ. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
VIRUSAI IR VIROIDAI YRA DAUGELIO AUGALŲ LIGŲ SUKĖLĖJAI, TODĖL KYLA GRĖSMĖ ŽEMĖS ŪKIO KULTŪROMS IR NATŪRALIOMS EKOSISTEMOMS. NEPAISANT NEDIDELIO JŲ GENOMO SU RIBOTU KODAVIMO PAJĖGUMU, ŠIE PATOGENAI GALI UŽBAIGTI SUDĖTINGĄ UŽKREČIAMĄJĮ CIKLĄ, PRIEŠINDAMIESI ŠEIMININKO GYNYBINIAMS MECHANIZMAMS. TAČIAU TUO PAČIU METU DĖL SAVO MAŽŲ, LENGVAI VALDOMŲ GENOMŲ, JO GEBĖJIMAS GREITAI ĮSIVERŽTI Į AUGALĄ IR JO VEIKSMINGĄ BALTYMŲ IR NANODALELIŲ, VIRUSŲ IR VIROIDŲ GAMYBĄ TAIP PAT GALI BŪTI PERTVARKYTAS Į NAUDINGAS BIOTECHNOLOGINES PRIEMONES. VIRALCROP VYSTYSIS VEKTORIŲ, GAUTŲ IŠ AUGALŲ RNR VIRUSŲ, GAMINTI VIRUSINES NANODALELES, PUOŠTAS VIENOS GRANDINĖS ANTIKŪNAIS AR NANOKŪNAIS, REKOMBINANTINIAIS TERAPINIAIS BALTYMAIS, TOKIAIS KAIP FILGRASTIMAS IR INTERFERONAS ALFA-2A, IR MANIPULIUOTI AUGALŲ METABOLIZMU, IŠREIŠKIANT TRANSKRIPCIJOS VEIKSNIUS IR BIOSINTETINIUS FERMENTUS, KAD BŪTŲ GAUTI KOMERCINĖS SVARBOS KAROTINOIDAI, TOKIE KAIP ASTAKSANTINAS IR ĮVAIRŪS ANTOCIANINAI. TOLIAU PLĖTOSIME PATENTUOTĄ IR LICENCIJUOTĄ VEKTORIŲ SISTEMĄ, GAUTĄ IŠ BAKLAŽANŲ LATENTINIO VIROIDO, KURI LEIDŽIA GAMINTI DIDELIUS KIEKIUS REKOMBINANTINĖS RNR ESCHERICHIA COLI, GAMINTI DVIGUBUS RNR SU KENKĖJAIS PRIEŠ VIDURŽEMIO JŪROS VAISIŲ MUSES CERATITIS CAPITATA IR KUKURŪZŲ ŠAKNIASTIEBIUS DIABROTICA VIRGUIFERA. TUO PAČIU METU VIRALCROP KURSIME BIOTECHNOLOGINES PASĖLIŲ APSAUGOS PRIEMONES. MES TAIKYSIME SAVO VIZUALINIŲ ŽYMEKLIŲ SISTEMĄ, KURI LEIDŽIA PO VIRUSINĖS INFEKCIJOS REALIU LAIKU BE PRIETAISŲ POREIKIO, DVIEM AGRONOMINĖS SVARBOS VIRUSAMS, TOKIEMS KAIP „APPLE CHLOROTIC“ LAPŲ DĖMĖS TRICHOVIRUSAS IR CUKURBITŲ GELTONOS SUTRIKIMO SUTRIKIMO KRINIVIRUSAS, KURTI ĮRANKIUS, KURIE GALI BŪTI NAUDOJAMI VEISIMO PROGRAMOSE. MES TAIP PAT NAUDOSIME DIRBTINES MICRORNR, SINTETINES MAŽAS TRUKDANČIAS TRANSAKTYVIAS RNR IR GENOMO REDAGAVIMO STRATEGIJAS, KAD SUKURTUME MOLIŪGŲ VEISLES, ATSPARIAS ARBŪZŲ MOZAIKOS IR CUKINIJŲ GELTONOSIOS MOZAIKOS POTYVIRUSAMS. GALIAUSIAI „VIRALCROP“ NENORIME PAMIRŠTI KAI KURIŲ PAGRINDINIŲ AUGALŲ VIRUSŲ IR VIROIDŲ MOLEKULINĖS BIOLOGIJOS ASPEKTŲ, NES TAI YRA ŽINIOS, KURIOS SUTEIKS MŪSŲ ATEITIES BIOTECHNOLOGINES PRIEMONES. NAUDOJANT AFINITETO CHROMATOGRAFIJOS VALYMO STRATEGIJĄ, PO KURIOS ATLIEKAMA MASIŲ SPEKTROMETRIJOS (AP-MS) ANALIZĖ, VIRALCROP SISTEMOJE APIBŪDINSIME ŠEIMININKO BALTYMUS, KURIE REGULIUOJA RNR SUKELTO TRIUKŠMO KOMPLEKSO (RISC), KURIS YRA PAGRINDINIS AUGALŲ ANTIVIRUSINĖS GYNYBOS ELEMENTAS, VEIKLĄ. MES SUŽYMĖSIME ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 IR 2 BALTYMUS IR IDENTIFIKUOSIME AUGALINIUS BALTYMUS, KURIE INTEGRUOJA RISC PER POTYVIRUSO INFEKCIJĄ. ŽINIOS APIE ŠIUOS BALTYMUS LEIS ATEITYJE PLĖTOTI PASĖLIŲ APSAUGĄ. MES TAIP PAT ANALIZUOSIME BRANDUOLINĖS UŽKODUOTOS CHLOROPLASTINĖS RNR POLIMERAZĖS (NEP) VAIDMENĮ REPLIKUOJANT ŠEIMOS AVSUNVIROIDAE VIROIDUS, KAD GALIAUSIAI ŠIS FERMENTAS BŪTŲ ĮTRAUKTAS Į MŪSŲ SISTEMĄ, KAD BŪTŲ GALIMA GAMINTI REKOMBINANTINĘ RNR E. COLI, SUTEIKIANT JAI DAUG DIDESNIUS GAMYBOS PAJĖGUMUS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
VIRUSI I VIROIDI UZROČNI SU UZROČNICI MNOGIH BOLESTI BILJAKA, ŠTO PREDSTAVLJA PRIJETNJU POLJOPRIVREDNIM USJEVIMA I PRIRODNIM EKOSUSTAVIMA. UNATOČ MALIM GENOMIMA S OGRANIČENIM KAPACITETOM KODIRANJA, TI PATOGENI MOGU DOVRŠITI SLOŽENI INFEKTIVNI CIKLUS SUPROTSTAVLJAJUĆI SE OBRAMBENIM MEHANIZMIMA DOMAĆINA. NO, U ISTO VRIJEME, ZBOG SVOJIH MALIH, LAKO MANIPULATNIH GENOMA, NJEGOVA SPOSOBNOST BRZOG NAPADA NA BILJKU I UČINKOVITU PROIZVODNJU PROTEINA I NANOČESTICA, VIRUSA I VIROIDA TAKOĐER SE MOGU RESTRUKTURIRATI U KORISNE BIOTEHNOLOŠKE ALATE. U VIRALCROP-U ĆEMO RAZVITI VEKTORE DOBIVENE IZ BILJNIH RNK VIRUSA ZA PROIZVODNJU VIRUSNIH NANOČESTICA UKRAŠENIH JEDNOLANČANIM ANTITIJELIMA ILI NANOTIJELA, REKOMBINANTNIM TERAPIJSKIM PROTEINIMA KAO ŠTO SU FILGRASTIM I INTERFERON ALFA-2A, TE ZA MANIPULACIJU METABOLIZMOM BILJAKA IZRAŽAVANJEM TRANSKRIPCIJSKIH FAKTORA I BIOSINTETIČKIH ENZIMA KAKO BI SE DOBILI KAROTENOIDI KOMERCIJALNOG INTERESA KAO ŠTO SU ASTAKSANTIN I RAZNI ANTOCIJANINI. DODATNO ĆEMO RAZVITI NAŠ PATENTIRANI I LICENCIRANI VEKTORSKI SUSTAV IZVEDEN IZ LATENTNOG VIROIDA PATLIDŽANA, KOJI OMOGUĆUJE PROIZVODNJU VELIKIH KOLIČINA REKOMBINANTNE RNA U ESCHERICHIA COLI, ZA PROIZVODNJU DVOSTRANIH RNA S ANTI-ŠTETNIM DJELOVANJEM PROTIV MEDITERANSKOG VOĆA CERATITIS CAPITATA I KUKURUZNOG KORIJENA DIABROTICA VIRGUIFERA. ISTODOBNO ĆEMO U VIRALCROP-U RAZVITI BIOTEHNOLOŠKE ALATE ZA ZAŠTITU USJEVA. PRIMIJENIT ĆEMO NAŠ SUSTAV VIZUALNIH MARKERA, KOJI OMOGUĆUJE PRAĆENJE VIRUSNE INFEKCIJE U REALNOM VREMENU BEZ POTREBE ZA INSTRUMENTACIJOM, NA DVA VIRUSA OD AGRONOMSKOG INTERESA, KAO ŠTO SU APPLE KLOROTIČNI LIST SPOT TRICHOVIRUS I CUCURBIT ŽUTI ZAOSTAJANJE POREMEĆAJ KRINIVIRUS, ZA RAZVOJ ALATA KOJI SE MOGU KORISTITI U UZGOJNIM PROGRAMIMA. TAKOĐER ĆEMO KORISTITI UMJETNE MIKRORNA-E, SINTETIČKE MALE TRANSAKTIVNE RNA-E I STRATEGIJE ZA UREĐIVANJE GENOMA KAKO BISMO RAZVILI VRSTE KUKURBATA OTPORNE NA MOZAIK I TIKVICE ŽUTE MOZAIK POTYVIRUSE. KONAČNO, U VIRALCROP-U NE ŽELIMO ZABORAVITI NEKE OSNOVNE ASPEKTE BILJNIH VIRUSA I MOLEKULARNE BIOLOGIJE VIROIDA, JER TO JE ZNANJE KOJE ĆE PRUŽITI NAŠE BUDUĆE BIOTEHNOLOŠKE ALATE. POMOĆU STRATEGIJE PROČIŠĆAVANJA AFINITETNE KROMATOGRAFIJE NAKON KOJE SLIJEDI ANALIZA MASENE SPEKTROMETRIJE (AP-MS), U VIRALCROP-U ĆEMO OKARAKTERIZIRATI DOMAĆINSKE PROTEINE KOJI REGULIRAJU DJELOVANJE RNA-INDUCIRANOG KOMPLEKSA ZA PRIGUŠIVANJE (RISC), KLJUČNOG ELEMENTA U BILJNOJ ANTIVIRUSNOJ OBRANI. MI ĆEMO OZNAČITI ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 I 2 PROTEINA I IDENTIFICIRATI BILJNE PROTEINE KOJI INTEGRIRAJU RISC TIJEKOM POTYVIRUS INFEKCIJE. POZNAVANJE TIH BJELANČEVINA OMOGUĆIT ĆE BUDUĆI RAZVOJ ZAŠTITE USJEVA. TAKOĐER ĆEMO ANALIZIRATI ULOGU NUKLEARNE KODIRANE KLOROPLASTIČNE RNA POLIMERAZE (NEP) U REPLIKACIJI VIROIDA OBITELJI AVSUNVIROIDAE, KAKO BISMO NA KRAJU UKLJUČILI OVAJ ENZIM U NAŠ SUSTAV ZA PROIZVODNJU REKOMBINANTNE RNK U E. COLI, PRUŽAJUĆI MU MNOGO VEĆI PROIZVODNI KAPACITET. (Croatian)
17 August 2022
0 references
VIRUS OCH VIROIDER ÄR ORSAKEN TILL MÅNGA SJUKDOMAR HOS VÄXTER, VILKET UTGÖR ETT HOT MOT JORDBRUKSGRÖDOR OCH NATURLIGA EKOSYSTEM. TROTS SINA SMÅ GENOM MED BEGRÄNSAD KODNINGSKAPACITET KAN DESSA PATOGENER SLUTFÖRA EN KOMPLEX SMITTSAM CYKEL GENOM ATT MOTSÄTTA SIG VÄRDFÖRSVARSMEKANISMER. MEN PÅ GRUND AV DESS SMÅ, LÄTTMANIPULERADE GENOM KAN DESS FÖRMÅGA ATT SNABBT INVADERA VÄXTEN OCH DESS EFFEKTIVA PRODUKTION AV PROTEINER OCH NANOPARTIKLAR, VIRUS OCH VIROIDER OCKSÅ OMSTRUKTURERAS TILL ANVÄNDBARA BIOTEKNISKA VERKTYG. I VIRALCROP KOMMER VI ATT UTVECKLA VEKTORER FRÅN VÄXTRNA-VIRUS FÖR ATT PRODUCERA VIRALA NANOPARTIKLAR DEKORERADE MED EN KEDJA AV ANTIKROPPAR ELLER NANOKROPPAR, REKOMBINANTA TERAPEUTISKA PROTEINER SOM FILGRASTIM OCH INTERFERON ALFA-2A, OCH FÖR ATT MANIPULERA VÄXTMETABOLISMEN GENOM ATT UTTRYCKA TRANSKRIPTIONSFAKTORER OCH BIOSYNTETISKA ENZYMER FÖR ATT ERHÅLLA KAROTENOIDER AV KOMMERSIELLT INTRESSE SÅSOM ASTAXANTIN OCH OLIKA ANTOCYANINER. VI KOMMER ATT VIDAREUTVECKLA VÅRT PATENTERADE OCH LICENSIERADE VEKTORSYSTEM SOM HÄRRÖR FRÅN AUBERGINE LATENT VIROID, VILKET GÖR DET MÖJLIGT ATT PRODUCERA STORA MÄNGDER REKOMBINANT RNA I ESCHERICHIA COLI, FÖR ATT PRODUCERA DUBBELSTRÄNGADE RNA MED ANTIPESTAKTIVITET MOT MEDELHAVSFRUKTFLUGAN CERATITIS CAPITATA OCH MAJSROTMASKEN DIABROTICA VIRGUIFERA. SAMTIDIGT KOMMER VI I VIRALCROP ATT UTVECKLA BIOTEKNISKA VERKTYG FÖR VÄXTSKYDD. VI KOMMER ATT TILLÄMPA VÅRT SYSTEM AV VISUELLA MARKÖRER, SOM GÖR DET MÖJLIGT ATT FÖLJA VIRUSINFEKTION I REALTID UTAN BEHOV AV INSTRUMENTERING, PÅ TVÅ VIRUS AV AGRONOMISKT INTRESSE SÅSOM APPLE KLOROTISKA BLAD SPOT TRICHOVIRUS OCH GUCURBIT GUL STUNTING DISORDER CRINIVIRUS, FÖR ATT UTVECKLA VERKTYG SOM KAN ANVÄNDAS I AVELSPROGRAM. VI KOMMER OCKSÅ ATT ANVÄNDA ARTIFICIELLA MIKRORNAS, SYNTETISKA SMÅ INTERFERERANDE TRANSAKTIVA RNAS OCH GENOMREDIGERINGSSTRATEGIER FÖR ATT UTVECKLA CUCURBIT SORTER AV AGRONOMISKT INTRESSE RESISTENTA MOT VATTENMELON MOSAIK OCH ZUCCHINI GULA MOSAIK POTYVIRUS. SLUTLIGEN VILL VI I VIRALCROP INTE GLÖMMA NÅGRA GRUNDLÄGGANDE ASPEKTER AV VÄXTVIRUS OCH VIROIDER MOLEKYLÄRBIOLOGI, EFTERSOM DETTA ÄR DEN KUNSKAP SOM KOMMER ATT GE VÅRA FRAMTIDA BIOTEKNISKA VERKTYG. MED HJÄLP AV EN AFFINITET KROMATOGRAFI RENINGSSTRATEGI FÖLJT AV MASSPEKTROMETRI (AP-MS) ANALYS, I VIRALCROP KOMMER VI ATT KARAKTERISERA VÄRDPROTEINER SOM REGLERAR AKTIVITETEN I RNA-INDUCERAD LJUDDÄMPNING KOMPLEX (RISC), ETT NYCKELELEMENT I VÄXTER ANTIVIRALA FÖRSVAR. VI KOMMER ATT MÄRKA ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 OCH 2 PROTEINER OCH IDENTIFIERA DE VÄXTPROTEINER SOM INTEGRERAR RISC UNDER POTYVIRUSINFEKTION. KUNSKAPEN OM DESSA PROTEINER KOMMER ATT MÖJLIGGÖRA FRAMTIDA UTVECKLING AV VÄXTSKYDDET. VI KOMMER OCKSÅ ATT ANALYSERA ROLLEN AV KÄRNKODADE KLOROPLASTISKT RNA-POLYMERAS (NEP) I REPLIKERINGEN AV VIROIDERNA I FAMILJEN AVSUNVIROIDAE, FÖR ATT SÅ SMÅNINGOM INFÖRLIVA DETTA ENZYM I VÅRT SYSTEM FÖR ATT PRODUCERA REKOMBINANT RNA I E. COLI, VILKET GER DET MYCKET STÖRRE PRODUKTIONSKAPACITET. (Swedish)
17 August 2022
0 references
VIRUSURILE ȘI VIROIZII SUNT AGENȚII CAUZALI AI MULTOR BOLI DIN PLANTE, REPREZENTÂND ASTFEL O AMENINȚARE PENTRU CULTURILE AGRICOLE ȘI ECOSISTEMELE NATURALE. ÎN CIUDA GENOMULUI LOR MIC, CU O CAPACITATE LIMITATĂ DE CODIFICARE, ACEȘTI AGENȚI PATOGENI SUNT CAPABILI SĂ FINALIZEZE UN CICLU INFECȚIOS COMPLEX, OPUNÂNDU-SE MECANISMELOR DEFENSIVE ALE GAZDEI. DAR, ÎN ACELAȘI TIMP, DATORITĂ GENOMULUI SĂU MIC, UȘOR DE MANIPULAT, CAPACITATEA SA DE A INVADA RAPID PLANTA ȘI PRODUCȚIA EFICIENTĂ DE PROTEINE ȘI NANOPARTICULE, VIRUȘI ȘI VIROIDI POT FI, DE ASEMENEA, RESTRUCTURATE ÎN INSTRUMENTE BIOTEHNOLOGICE UTILE. ÎN VIRALCROP VOM DEZVOLTA VECTORI DERIVAȚI DIN VIRUSURILE ARN VEGETAL PENTRU A PRODUCE NANOPARTICULE VIRALE DECORATE CU ANTICORPI CU UN SINGUR LANȚ SAU NANOCORPI, PROTEINE TERAPEUTICE RECOMBINANTE, CUM AR FI FILGRASTIM ȘI INTERFERON ALFA-2A, ȘI PENTRU A MANIPULA METABOLISMUL PLANTELOR PRIN EXPRIMAREA FACTORILOR DE TRANSCRIERE ȘI A ENZIMELOR BIOSINTETICE PENTRU A OBȚINE CAROTENOIDE DE INTERES COMERCIAL, CUM AR FI ASTAXANTINA ȘI DIVERSE ANTOCIANI. VOM DEZVOLTA ÎN CONTINUARE SISTEMUL VECTORIAL BREVETAT ȘI LICENȚIAT DERIVAT DIN VIROIDUL LATENT DE VINETE, CARE PERMITE PRODUCEREA UNOR CANTITĂȚI MARI DE ARN RECOMBINANT ÎN ESCHERICHIA COLI, PENTRU A PRODUCE ARN DUBLU CU ACTIVITATE ANTI-DĂUNĂTOARE ÎMPOTRIVA MUȘTEI MEDITERANEENE DE FRUCTE CERATITIS CAPITATA ȘI VIERMII RĂDĂCINII DE PORUMB DIABROTICA VIRGUIFERA. ÎN ACELAȘI TIMP, ÎN VIRALCROP VOM DEZVOLTA INSTRUMENTE BIOTEHNOLOGICE PENTRU PROTECȚIA CULTURILOR. VOM APLICA SISTEMUL NOSTRU DE MARKERI VIZUALI, CARE PERMITE URMĂRIREA INFECȚIEI CU VIRUSUL ÎN TIMP REAL, FĂRĂ A FI NEVOIE DE INSTRUMENTE, LA DOI VIRUȘI DE INTERES AGRONOMIC, CUM AR FI TRICHOVIRUSUL LA FAȚA LOCULUI CLOROTIC APPLE ȘI TULBURAREA CUCURBITICĂ GALBENĂ DE ASOMARE CRINIVIRUS, PENTRU A DEZVOLTA INSTRUMENTE CARE POT FI UTILIZATE ÎN PROGRAMELE DE REPRODUCERE. DE ASEMENEA, VOM FOLOSI MICRORNA ARTIFICIALE, ARN-URI TRANSACTIVE INTERFERENTE SINTETICE ȘI STRATEGII DE EDITARE A GENOMULUI PENTRU A DEZVOLTA SOIURI DE CUCURBIT DE INTERES AGRONOMIC REZISTENTE LA MOZAIC PEPENE VERDE ȘI POTYVIRUSURI MOZAIC GALBEN DE DOVLECEI. ÎN CELE DIN URMĂ, ÎN VIRALCROP NU DORIM SĂ UITĂM UNELE ASPECTE DE BAZĂ ALE VIRUSURILOR PLANTELOR ȘI BIOLOGIEI MOLECULARE VIROIZI, DEOARECE ACEASTA ESTE CUNOAȘTEREA CARE VA OFERI VIITOARELE NOASTRE INSTRUMENTE BIOTEHNOLOGICE. PRIN INTERMEDIUL UNEI STRATEGII DE PURIFICARE A CROMATOGRAFIEI DE AFINITATE URMATĂ DE ANALIZA SPECTROMETRIEI DE MASĂ (AP-MS), ÎN VIRALCROP SE VOR CARACTERIZA PROTEINELE GAZDĂ CARE REGLEAZĂ ACTIVITATEA COMPLEXULUI DE AMORTIZARE A ZGOMOTULUI INDUS DE ARN (RISC), UN ELEMENT CHEIE ÎN APĂRAREA ANTIVIRALĂ A PLANTELOR. VOM ETICHETA ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 ȘI 2 PROTEINE ȘI VOM IDENTIFICA PROTEINELE VEGETALE CARE INTEGREAZĂ RISC ÎN TIMPUL INFECȚIEI CU POTYVIRUS. CUNOAȘTEREA ACESTOR PROTEINE VA PERMITE DEZVOLTAREA VIITOARE A PROTECȚIEI CULTURILOR. VOM ANALIZA, DE ASEMENEA, ROLUL POLIMERAZEI DE ARN CLOROPLASTIC CODIFICATE NUCLEAR (NEP) ÎN REPLICAREA VIROIZILOR FAMILIEI AVSUNVIROIDAE, PENTRU A ÎNCORPORA ÎN CELE DIN URMĂ ACEASTĂ ENZIMĂ ÎN SISTEMUL NOSTRU PENTRU A PRODUCE ARN RECOMBINANT ÎN E. COLI, OFERINDU-I O CAPACITATE DE PRODUCȚIE MULT MAI MARE. (Romanian)
17 August 2022
0 references
VIRUSI IN VIROIDI SO POVZROČITELJI ŠTEVILNIH BOLEZNI RASTLIN, KAR OGROŽA KMETIJSKE PRIDELKE IN NARAVNE EKOSISTEME. KLJUB MAJHNIM GENOMOM Z OMEJENO ZMOGLJIVOSTJO KODIRANJA LAHKO TI PATOGENI DOKONČAJO KOMPLEKSEN INFEKTIVNI CIKEL Z NASPROTOVANJEM GOSTITELJSKIM OBRAMBNIM MEHANIZMOM. HKRATI PA SE LAHKO ZARADI MAJHNIH, ENOSTAVNO MANIPULIRAJOČIH GENOMOV NJENA SPOSOBNOST HITREGA VDORA V RASTLINO IN UČINKOVITA PROIZVODNJA BELJAKOVIN IN NANODELCEV, VIRUSOV IN VIROIDOV PRESTRUKTURIRA TUDI V UPORABNA BIOTEHNOLOŠKA ORODJA. V VIRALCROP BOMO RAZVILI VEKTORJE, PRIDOBLJENE IZ RASTLINSKIH RNK VIRUSOV ZA PROIZVODNJO VIRUSNIH NANODELCEV, OKRAŠENIH Z ENOVERIŽNIMI PROTITELESI ALI NANOORGANIJAMI, REKOMBINANTNIMI TERAPEVTSKIMI BELJAKOVINAMI, KOT STA FILGRASTIM IN INTERFERON ALFA-2A, TER ZA MANIPULACIJO METABOLIZMA RASTLIN Z IZRAŽANJEM TRANSKRIPCIJSKIH FAKTORJEV IN BIOSINTETIČNIH ENCIMOV ZA PRIDOBIVANJE KAROTENOIDOV KOMERCIALNEGA INTERESA, KOT SO ASTAKSANTIN IN RAZLIČNI ANTOCIANINI. ŠE NAPREJ BOMO RAZVIJALI NAŠ PATENTIRAN IN LICENCIRAN VEKTORSKI SISTEM, PRIDOBLJEN IZ LATENTNEGA VIROIDA JAJČEVCEV, KI OMOGOČA PROIZVODNJO VELIKIH KOLIČIN REKOMBINANTNE RNA V ESCHERICHIA COLI, ZA PROIZVODNJO DVOJNO VISEČE RNA Z DELOVANJEM PROTI ŠKODLJIVCEM PROTI MEDITERANSKI SADNI MUHI CERATITIS CAPITATA IN KORUZNEMU HROŠČU DIABROTICA VIRGUIFERA. HKRATI BOMO V VIRALCROP RAZVILI BIOTEHNOLOŠKA ORODJA ZA ZAŠČITO PRIDELKOV. UPORABILI BOMO NAŠ SISTEM VIZUALNIH OZNAČEVALCEV, KI OMOGOČA SPREMLJANJE VIRUSNE OKUŽBE V REALNEM ČASU BREZ POTREBE PO INSTRUMENTACIJI, ZA DVA VIRUSA AGRONOMSKEGA POMENA, KOT STA APPLE KLOROTIČNI LISTNI SPOT TRICHOVIRUS IN BUČNICA RUMENA MOTNJA ZAOSTANKA CRINIVIRUS, ZA RAZVOJ ORODIJ, KI SE LAHKO UPORABLJAJO V PROGRAMIH VZREJE. UPORABILI BOMO TUDI UMETNE MIKRORNA, SINTETIČNE MAJHNE MOTEČE TRANSAKTIVNE RNK IN STRATEGIJE ZA UREJANJE GENOMA ZA RAZVOJ BUČNIH SORT AGRONOMSKEGA INTERESA, ODPORNIH NA MOZAIK LUBENICE IN BUČKE RUMENE MOZAIČNE BAKTERIJE. KONČNO, V VIRALCROP NE ŽELIMO POZABITI NEKATERIH OSNOVNIH VIDIKOV RASTLINSKIH VIRUSOV IN VIROIDOV MOLEKULARNE BIOLOGIJE, SAJ JE TO ZNANJE, KI BO ZAGOTOVILO NAŠA BODOČA BIOTEHNOLOŠKA ORODJA. S STRATEGIJO ČIŠČENJA AFINITETNE KROMATOGRAFIJE, KI JI SLEDI ANALIZA MASNE SPEKTROMETRIJE (AP-MS), BOMO V VIRALCROP-U OPREDELILI GOSTITELJSKE BELJAKOVINE, KI URAVNAVAJO DELOVANJE KOMPLEKSA ZA DUŠENJE ZVOKA, KI GA POVZROČA RNK (RISC), KLJUČNEGA ELEMENTA V RASTLINSKI PROTIVIRUSNI OBRAMBI. OZNAČILI BOMO ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 IN 2 PROTEINE IN IDENTIFICIRALI RASTLINSKE BELJAKOVINE, KI INTEGRIRAJO RISC MED OKUŽBO S POTYVIRUSI. POZNAVANJE TEH BELJAKOVIN BO OMOGOČILO PRIHODNJI RAZVOJ VARSTVA PRIDELKOV. ANALIZIRALI BOMO TUDI VLOGO JEDRSKE KODIRANE KLOROPLASTIČNE RNA POLIMERAZE (NEP) PRI REPLIKACIJI VIROIDOV DRUŽINE AVSUNVIROIDAE, DA BI SČASOMA VKLJUČILI TA ENCIM V NAŠ SISTEM ZA PROIZVODNJO REKOMBINANTNE RNK V E. COLI, KAR MU ZAGOTAVLJA VELIKO VEČJO PROIZVODNO ZMOGLJIVOST. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
WIRUSY I WIROIDY SĄ CZYNNIKAMI PRZYCZYNOWYMI WIELU CHORÓB ROŚLIN, CO STANOWI ZAGROŻENIE DLA UPRAW ROLNYCH I EKOSYSTEMÓW NATURALNYCH. POMIMO MAŁYCH GENOMÓW O OGRANICZONEJ ZDOLNOŚCI KODOWANIA, PATOGENY TE SĄ W STANIE UKOŃCZYĆ ZŁOŻONY CYKL ZAKAŹNY POPRZEZ PRZECIWSTAWIANIE SIĘ MECHANIZMOM DEFENSYWNYM GOSPODARZA. ALE JEDNOCZEŚNIE, ZE WZGLĘDU NA JEGO MAŁE, ŁATWE DO MANIPULOWANIA GENOMY, JEGO ZDOLNOŚĆ DO SZYBKIEGO NAJAZDU NA ROŚLINĘ I JEGO EFEKTYWNA PRODUKCJA BIAŁEK I NANOCZĄSTECZEK, WIRUSÓW I WIROIDÓW MOŻNA RÓWNIEŻ PRZEKSZTAŁCIĆ W UŻYTECZNE NARZĘDZIA BIOTECHNOLOGICZNE. W VIRALCROP OPRACUJEMY WEKTORY POCHODZĄCE Z WIRUSÓW RNA ROŚLIN DO PRODUKCJI NANOCZĄSTECZEK WIRUSOWYCH OZDOBIONYCH JEDNOŁAŃCUCHOWYMI PRZECIWCIAŁAMI LUB NANOCIAŁAMI, REKOMBINOWANYCH BIAŁEK TERAPEUTYCZNYCH, TAKICH JAK FILGRASTYM I INTERFERON ALFA-2A, ORAZ DO MANIPULOWANIA METABOLIZMEM ROŚLIN POPRZEZ EKSPRESJĘ CZYNNIKÓW TRANSKRYPCYJNYCH I ENZYMÓW BIOSYNTETYCZNYCH W CELU UZYSKANIA KAROTENOIDÓW O ZNACZENIU HANDLOWYM, TAKICH JAK ASTAKSANTYNA I RÓŻNE ANTOCYJANY. BĘDZIEMY DALEJ ROZWIJAĆ NASZ OPATENTOWANY I LICENCJONOWANY SYSTEM WEKTOROWY POCHODZĄCY Z UTAJONEGO WIROIDA BAKŁAŻANA, KTÓRY POZWALA NA PRODUKCJĘ DUŻYCH ILOŚCI REKOMBINOWANEGO RNA W ESCHERICHIA COLI, DO PRODUKCJI DWUSIECIOWYCH RNA O DZIAŁANIU ANTY-SZKODLIWYM PRZECIWKO ŚRÓDZIEMNOMORSKIEJ MUCHY CERATITIS CAPITATA I KUKURYDZY ROOTWORM DIABROTICA VIRGUIFERA. JEDNOCZEŚNIE W VIRALCROP OPRACUJEMY BIOTECHNOLOGICZNE NARZĘDZIA OCHRONY ROŚLIN. ZASTOSUJEMY NASZ SYSTEM MARKERÓW WIZUALNYCH, KTÓRY POZWALA NA ŚLEDZENIE ZAKAŻENIA WIRUSEM W CZASIE RZECZYWISTYM BEZ KONIECZNOŚCI OPRZYRZĄDOWANIA, DO DWÓCH WIRUSÓW O ZNACZENIU AGRONOMICZNYM, TAKICH JAK TRICHOVIRUS PLAMKI LIŚCI JABŁEK I CUCURBIT ŻÓŁTY ZABURZENIE ZAHAMOWANIA KRINIWIRUSA, W CELU OPRACOWANIA NARZĘDZI, KTÓRE MOGĄ BYĆ STOSOWANE W PROGRAMACH HODOWLANYCH. UŻYJEMY RÓWNIEŻ SZTUCZNYCH MIKRORNA, SYNTETYCZNYCH MAŁYCH INTERFERUJĄCYCH TRANSAKTYWNYCH RNA I STRATEGII EDYCJI GENOMU DO OPRACOWANIA ODMIAN DYNIOWYCH O ZAINTERESOWANIACH AGRONOMICZNYCH ODPORNYCH NA MOZAIKĘ ARBUZA I CUKINIĘ ŻÓŁTĄ MOZAIKĘ POTYWIRUSÓW. WRESZCIE, W VIRALCROP NIE CHCEMY ZAPOMINAĆ O PODSTAWOWYCH ASPEKTACH WIRUSÓW ROŚLINNYCH I BIOLOGII MOLEKULARNEJ WIROIDÓW, PONIEWAŻ JEST TO WIEDZA, KTÓRA ZAPEWNI NASZE PRZYSZŁE NARZĘDZIA BIOTECHNOLOGICZNE. ZA POMOCĄ STRATEGII OCZYSZCZANIA CHROMATOGRAFII POWINOWACTWA, A NASTĘPNIE ANALIZY SPEKTROMETRII MASOWEJ (AP-MS), W VIRALCROP SCHARAKTERYZUJEMY BIAŁKA GOSPODARZY, KTÓRE REGULUJĄ AKTYWNOŚĆ KOMPLEKSU TŁUMIĄCEGO WYWOŁANEGO RNA (RISC), KLUCZOWEGO ELEMENTU W OCHRONIE PRZECIWWIRUSOWEJ ROŚLIN. OZNACZYMY BIAŁKA ARABIDOPSIS THALIANA ARGONAUTA1 I 2 BIAŁKAMI ROŚLINNYMI, KTÓRE INTEGRUJĄ RISC PODCZAS ZAKAŻENIA POTYWIRUSEM. WIEDZA NA TEMAT TYCH BIAŁEK POZWOLI NA PRZYSZŁY ROZWÓJ W ZAKRESIE OCHRONY ROŚLIN. PRZEANALIZUJEMY RÓWNIEŻ ROLĘ ZAKODOWANEJ NUKLEARNIE CHLOROPLASTYCZNEJ POLIMERAZY RNA (NEP) W REPLIKACJI WIROIDÓW Z RODZINY AVSUNVIROIDAE, ABY OSTATECZNIE WŁĄCZYĆ TEN ENZYM DO NASZEGO SYSTEMU DO PRODUKCJI REKOMBINOWANEGO RNA W E. COLI, ZAPEWNIAJĄC MU ZNACZNIE WIĘKSZĄ ZDOLNOŚĆ PRODUKCYJNĄ. (Polish)
17 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BIO2017-83184-R
0 references