PARTICIPATION OF NON-CODING RNAS IN REGULATORY CIRCUITS CONTROLLED BY NITROGEN AVAILABILITY IN CYANOBACTERIA (Q3135887)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3135887 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | PARTICIPATION OF NON-CODING RNAS IN REGULATORY CIRCUITS CONTROLLED BY NITROGEN AVAILABILITY IN CYANOBACTERIA |
Project Q3135887 in Spain |
Statements
136,468.64 Euro
0 references
169,400.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
30 December 2016
0 references
31 December 2020
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
41092
0 references
LAS CIANOBACTERIAS SON UN GRUPO DE ORGANISMOS FOTOSINTETICOS ADAPTADOS A CASI TODOS LOS AMBIENTES. TIENEN REQUERIMIENTOS NUTRICIONALES REDUCIDOS Y SON VERSATILES Y FACILMENTE ADAPTABLES A CAMBIOS DE LUZ, DISPONIBILIDAD DE NUTRIENTES, ETC. ADEMAS, LAS CIANOBACTERIAS FILAMENTOSAS SON DE LOS POCOS PROCARIOTAS QUE LLEVAN A CABO PROCESOS DE DIFERENCIACION CELULAR CONDUCENTES A LA ADAPTACION AL ESTRES NUTRICIONAL O AMBIENTAL. ESTOS PROCESOS SE BASAN EN EL ESTABLECIMIENTO DE PATRONES DE EXPRESION GENICA DIFERENCIAL, EN OCASIONES RESTRINGIDOS A CELULAS ESPECIFICAS EN LOS FILAMENTOS._x000D_ _x000D_ EN NUESTRO LABORATORIO ESTAMOS INTERESADOS EN LA RESPUESTA DE LAS CIANOBACTERIAS A LA CARENCIA NUTRICIONAL DE NITROGENO, QUE INCLUYE DIFERENCIACION DE HETEROCISTOS (UN TIPO DE CELULA ESPECIALIZADA EN LA FIJACION DEL NITROGENO ATMOSFERICO) Y QUE ESTAMOS ANALIZANDO DESDE LA PERSPECTIVA DE LA POSIBLE IMPLICACION DE RNAS REGULADORES. UTILIZAMOS COMO ORGANISMO MODELO NOSTOC SP. PCC 7120, UNA CIANOBACTERIA PARA LA QUE YA DISPONEMOS DE UN ANALISIS DE TRANSCRIPTOMICA GLOBAL MEDIANTE RNASEQ. DE FORMA SIMILAR A LO OBSERVADO PARA OTRAS BACTERIAS, LA APLICACION DE ESTA METODOLOGIA A LAS CIANOBACTERIAS REVELA LA PRESENCIA DE ABUNDANTES TRANSCRITOS NO CODIFICANTES, TANTO PEQUEÑOS RNAS (SRNAS) COMO TRANSCRITOS ANTISENTIDO._x000D_ _x000D_ LAS RESPUESTAS DE LAS CIANOBACTERIAS AL ESTRES DE NITROGENO ESTAN CONTROLADAS POR EL REGULADOR TRANSCRIPCIONAL NTCA. EN EL MARCO DE NUESTRO PROYECTO ACTUAL (BFU2013-48282-C2-1-P) HEMOS PODIDO IDENTIFICAR VARIOS SRNAS CUYA TRANSCRIPCION DEPENDE DE NTCA Y HEMOS PODIDO DEMOSTRAR QUE UNO DE ELLOS, NSIR4, PARTICIPA EN UN CIRCUITO COHERENTE (FEED FORWARD LOOP) DE REGULACION MIXTA (TRANSCRIPCIONAL Y POST-TRANSCRIPCIONAL), ACTUANDO A MODO DE INTERMEDIARIO DE NTCA EN LA REGULACION DE LA GLUTAMINA SINTETASA. EN LA PRESENTE PROPUESTA CONTINUAREMOS DEFINIENDO POSIBLES FUNCIONES PARA NSIR4 Y ANALIZAREMOS TAMBIEN LA POSIBLE IMPLICACION DE UN NUEVO SRNA IDENTIFICADO EN NUESTRO GRUPO, NSRR1, EN LA ESTABILIDAD/DEGRADACION DE LOS FICOBILISOMAS, COMPLEJOS PROTEICOS EXCLUSIVOS DE CIANOBACTERIAS Y ALGAS ROJAS._x000D_ _x000D_ LA DIFERENCIACION DE HETEROCISTOS, QUE TAMBIEN SE INDUCE EN RESPUESTA AL DEFICIT DE NITROGENO Y EN ULTIMA INSTANCIA ESTA CONTROLADA POR NTCA, IMPLICA UN PROGRAMA TRANSCRIPCIONAL ESPECIFICO DE LOS HETEROCISTOS QUE ESTA REGULADO POR HETR. POR TANTO, HIPOTETIZAMOS QUE LOS SRNAS REGULADOS POR HETR PODRIAN ESTAR IMPLICADOS EN LA DIFERENCIACION. ESTA PROPUESTA INCLUYE EL ESTUDIO DE DOS SRNAS QUE HEMOS DEMOSTRADO QUE SE TRANSCRIBEN EXCLUSIVAMENTE EN LOS HETEROCISTOS (NSIR1 Y NSIR8). NSIR1 ES UN MARCADOR MUY TEMPRANO DE LAS CELULAS QUE INICIAN SU DIFERENCIACION._x000D_ _x000D_ ADEMAS DEL ESTUDIO DETALLADO DE LA REGULACION MEDIADA POR LOS SRNAS MENCIONADOS MAS ARRIBA, LLEVAREMOS A CABO ACERCAMIENTOS COMPUTACIONALES EXPLORATORIOS EN DOS DIRECCIONES. POR UN LADO LLEVAREMOS A CABO PREDICCIONES AUTOMATIZADAS DE LAS POSIBLES DIANAS DE TODOS LOS SRNAS (UN TOTAL DE 327) IDENTIFICADOS CON EL ALGORITMO IMPLEMENTADO EN NUESTRO PROYECTO ACTUAL. VARIOS DE ESTOS SRNAS ESTAN RESTRINGIDOS A GENOMAS DE ESTIRPES FORMADORAS DE HETEROCISTOS, POR LO QUE SU FUNCION PODRIA ESTAR VINCULADA CON ESTE PROCESO. POR OTRO LADO, EN BASE A LOS DATOS DE HIBRIDACION DE LOS MICROARRAYS DISEÑADOS EN EL PROYECTO VIGENTE, CONSTRUIREMOS REDES DE CO-EXPRESION PARA IDENTIFICAR TRANSCRITOS ANTISENTIDO CON PERFILES DE EXPRESION SIMILARES A LOS DE GENES DE EXPRESION ESPECIFICA EN LOS HETEROCISTOS. (Spanish)
0 references
CYANOBACTERIA ARE A GROUP OF PHOTOSYNTHETIC ORGANISMS ADAPTED TO ALMOST ALL ENVIRONMENTS. THEY HAVE REDUCED NUTRITIONAL REQUIREMENTS AND ARE VERSATILE AND EASILY ADAPTABLE TO CHANGES IN LIGHT, AVAILABILITY OF NUTRIENTS, ETC., FILAMENTARY CYANOBACTERIA ARE AMONG THE FEW PROKARYOTES THAT CARRY OUT CELL DIFFERENTIATION PROCESSES LEADING TO ADAPTATION TO NUTRITIONAL OR ENVIRONMENTAL STRESS. These processes are based on the stabilising of genetically-differentially expressive PATRONS, ON OCASIONS RESTRING TO SPECIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ IN OUR LABORATORY we are interested in the reply of the CIANOBACTERIAS to the NUTRICIONAL CARENCE OF NITROGENO, that INCLUDE DIFFERENTATION OF heterocysts (a type of CELULA SPECIALISED IN THE FIJATION OF the atmospheric NITROGEN) and that we are analysing from the perspective of the Possible IMPLICATION OF REGULators. WE USE AS A NOSTOC SP MODEL ORGANISM. PCC 7120, A CYANOBACTERIA FOR WHICH WE ALREADY HAVE A GLOBAL TRANSCRIPTOMICA ANALYSIS USING RNASEQ. From SIMILAR TO THE OBSERVED FOR Other BACTERIAS, THE APPLICATION OF THIS METODOLOGY TO CYANNOBACTERIAS REVIEW THE PRESENCE OF transcribed non-coding, small RNAS (sRNAs) AS transcribed ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D_ the NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR is controlled by the NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. IN THE FRAMEWORK OF OUR CURRENT PROJECT (BFU2013-48282-C2-1-P) WE HAVE BEEN ABLE TO IDENTIFY SEVERAL SRNAS WHOSE TRANSCRIPTION DEPENDS ON NTCA AND WE HAVE BEEN ABLE TO DEMONSTRATE THAT ONE OF THEM, NSIR4, PARTICIPATES IN A COHERENT CIRCUIT (FEED FORWARD LOOP) OF MIXED REGULATION (TRANSCRIPTIONAL AND POST-TRANSCRIPTIONAL), ACTING AS AN INTERMEDIARY OF NTCA IN THE REGULATION OF GLUTAMINE SYNTHETASE. In the present proposal we will continue to define POSSIBLE FUNCIONS FOR NSIR4 and we will also analyse the potential IMPLEMENTATION of a new SRNA IDENTIFICATED IN OUR GROUP, NSRR1, IN THE STABILITY/Degration of phycobilisomas, exclusive PROTEIC COMPLEMENTS OF CYYNOBACTERIAS AND ROJAS._x000D_ _x000D_ THE DIFFERENTATION OF heterocysts, which are still presented in response to the NITROGEN DEFICIT and in ULTIMAL INSTANCY is controlled by NTCA, IMPLEMENTES A SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMME OF the heterocysts that are regulated by HETR. THEREFORE, WE HYPOTHESISED THAT SRNAS REGULATED BY HETR MIGHT BE INVOLVED IN DIFFERENTIATION. THIS PROPOSAL INCLUDES THE STUDY OF TWO SRNAS THAT WE HAVE SHOWN TO BE TRANSCRIBED EXCLUSIVELY IN THE HETEROCYSTS (NSIR1 AND NSIR8). NSIR1 IS A VERY TEMPRANOUS MARCADER OF THE CELLS INCLUDING YOUR DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ ADEMAS OF THE STUDY DETAILED OF THE REGULATION MEDIATED BY THE MENDED SERVICES, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL approaches EXPLORATORY IN TWO DIRECCIONS. ON THE ONE HAND WE WILL CARRY OUT AUTOMATED PREDICTIONS OF THE POSSIBLE TARGETS OF ALL THE SRNAS (A TOTAL OF 327) IDENTIFIED WITH THE ALGORITHM IMPLEMENTED IN OUR CURRENT PROJECT. SEVERAL OF THESE SRNAS ARE RESTRICTED TO GENOMES OF HETEROCYST-FORMING STRAINS, SO THEIR FUNCTION COULD BE LINKED TO THIS PROCESS. ON THE OTHER HAND, BASED ON THE HYBRIDISATION DATA OF THE MICROARRAYS DESIGNED IN THE CURRENT PROJECT, WE WILL BUILD CO-EXPRESSION NETWORKS TO IDENTIFY ANTISENSE TRANSCRIPTS WITH EXPRESSION PROFILES SIMILAR TO THOSE OF SPECIFIC EXPRESSION GENES IN THE HETEROCYSTS. (English)
12 October 2021
0.4620381093616765
0 references
LES CYANOBACTÉRIES SONT UN GROUPE D’ORGANISMES PHOTOSYNTHÉTIQUES ADAPTÉS À PRESQUE TOUS LES ENVIRONNEMENTS. ILS ONT RÉDUIT LES BESOINS NUTRITIONNELS ET SONT POLYVALENTS ET FACILEMENT ADAPTABLES AUX CHANGEMENTS DANS LA LUMIÈRE, LA DISPONIBILITÉ DES NUTRIMENTS, ETC., LES CYANOBACTÉRIES FILAMENTEUSES SONT PARMI LES QUELQUES PROKARYOTES QUI EFFECTUENT DES PROCESSUS DE DIFFÉRENCIATION CELLULAIRE MENANT À L’ADAPTATION AU STRESS NUTRITIONNEL OU ENVIRONNEMENTAL. Ces processus sont basés sur la stabilisation de PATRONS génétiquement-différentiellement expressifs, ON Ocasions se reposant AUX VILLES SPÉCIFIQUES DANS LES FILAMENTS._x000D_ _x000D_ DANS NOTRE LABORATOIRE nous sommes intéressés par la réponse des CIANOBACTERIAS à la carence nutricionale de NITROGENO, cela comprend la différenciation des hétérocystes (un type de celula SPÉCIALISÉ DANS LA FIJATION DU NITROGEN atmosphérique) et que nous analysons du point de vue de la possible IMPLICATION DES régulateurs. NOUS UTILISONS COMME ORGANISME MODÈLE NOSTOC SP. PCC 7120, UNE CYANOBACTÉRIE POUR LAQUELLE NOUS AVONS DÉJÀ UNE ANALYSE GLOBALE TRANSCRIPTOMICA À L’AIDE DE RNASEQ. Du SIMILAR À L’OBSERVÉ POUR D’autres bactéries, L’APPLICATION DE CYANNOBACTERIAS DE CYANNOBACTERIAS D’APPLICATION DE CYANNOBACTERIAS SUR LA PRÉSENCE DU non-codage transcrit, de petits ARN (ARNs) Comme transcrits ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_ x000D__x000D_x000D__x000D_x000F_x000D_x000D_x000F_x000F_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D_x000D__x000D__x000D_005F_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D__x000D_x000D_x000F_x000D_x000D___x000D_x000D__x000D__x000D_x000D_x000D___x000D___x000D___x000D_le REGULATEUR TRANSCRIPCIONAL NTCA est contrôlé par le REGULATEUR TRANSCRIPCIONAL NTCA. DANS LE CADRE DE NOTRE PROJET ACTUEL (BFU2013-48282-C2-1-P), NOUS AVONS PU IDENTIFIER PLUSIEURS ARNS DONT LA TRANSCRIPTION DÉPEND DU NTCA ET NOUS AVONS PU DÉMONTRER QUE L’UN D’ENTRE EUX, NSIR4, PARTICIPE À UN CIRCUIT COHÉRENT (BOUCLE D’ALIMENTATION VERS L’AVANT) DE RÉGULATION MIXTE (TRANSCRIPTIONNEL ET POST-TRANSCRIPTIONNEL), AGISSANT EN TANT QU’INTERMÉDIAIRE DE NTCA DANS LA RÉGULATION DE LA GLUTAMINE SYNTHÉTASE. Dans la présente proposition, nous continuerons à définir les funcions POSSIBLES POUR NSIR4 et nous analyserons également le potentiel de mise en œuvre d’un nouvel ANS identifié dans notre groupe, NSRR1, DANS LA STABILITÉ/dégration des phycobilisomas, COMPLEMENTS PROTEIQUES exclusifs de CYYNOBACTERIAS ET ROJAS._x000D_ _x000D_ La différenciation des hétérocystes, qui sont encore présentés en réponse à la DÉFICIT NITROGEN et en instance ULTIMAL est contrôlé par NTCA, met en œuvre un PROGRAMME TRANSCRIPCTIONNEL SPÉCIFIQUE DES hétérocystes qui sont réglementés par HETR. PAR CONSÉQUENT, NOUS AVONS ÉMIS L’HYPOTHÈSE QUE LES ARN S RÉGULÉS PAR HETR POURRAIENT ÊTRE IMPLIQUÉS DANS LA DIFFÉRENCIATION. CETTE PROPOSITION COMPREND L’ÉTUDE DE DEUX ARN S’ÉTANT RÉVÉLÉS TRANSCRITS EXCLUSIVEMENT DANS LES HÉTÉROCYSTES (NSIR1 ET NSIR8). NSIR1 est un VERY TEMPRANOUS MARCADER DES VOTRE DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ _x000D_ Ademas of the STUDY DÉTAILED DU RÈGLEMENT MÉDÉ PAR LES SERVICES MODIFICATIONS, LLEVAREMOS À CABO Approches COMPUTATIONNELLES EXPLORATOIRE DANS DEUX DIRECCIONS. D’UNE PART, NOUS RÉALISERONS DES PRÉDICTIONS AUTOMATISÉES DES CIBLES POSSIBLES DE TOUS LES SRNAS (UN TOTAL DE 327) IDENTIFIÉS AVEC L’ALGORITHME MIS EN ŒUVRE DANS NOTRE PROJET ACTUEL. PLUSIEURS DE CES ARN SONT LIMITÉS AUX GÉNOMES DES SOUCHES FORMANT HETEROCYST, DE SORTE QUE LEUR FONCTION POURRAIT ÊTRE LIÉE À CE PROCESSUS. D’AUTRE PART, SUR LA BASE DES DONNÉES D’HYBRIDATION DES MICRORÉSEAUX CONÇUES DANS LE CADRE DU PROJET ACTUEL, NOUS ALLONS CONSTRUIRE DES RÉSEAUX DE CO-EXPRESSION POUR IDENTIFIER DES TRANSCRIPTIONS ANTISENS AVEC DES PROFILS D’EXPRESSION SIMILAIRES À CEUX DES GÈNES D’EXPRESSION SPÉCIFIQUES DANS LES HÉTÉROCYSTES. (French)
2 December 2021
0 references
CYANOBAKTERIEN SIND EINE GRUPPE VON PHOTOSYNTHETISCHEN ORGANISMEN, DIE AN FAST ALLE UMGEBUNGEN ANGEPASST SIND. SIE HABEN REDUZIERTEN NÄHRSTOFFBEDARF UND SIND VIELSEITIG UND LEICHT AN VERÄNDERUNGEN IM LICHT, VERFÜGBARKEIT VON NÄHRSTOFFEN USW. ANGEPASST, FADENFÖRMIGE CYANOBAKTERIEN GEHÖREN ZU DEN WENIGEN PROKARYOTEN, DIE ZELLDIFFERENZIERUNGSPROZESSE DURCHFÜHREN, DIE ZUR ANPASSUNG AN NÄHRSTOFF- ODER UMWELTBELASTUNGEN FÜHREN. Diese Prozesse basieren auf der Stabilisierung von genetisch-differenzial ausdrucksstarken PATRONS, ON ocasions restring to SPEZIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ IN UNSER LABORATORY Wir sind an der Antwort des CIANOBACTERIAS auf die Nutricional Carence OF NITROGENO interessiert. dass INCLUDE Differenzierung von Heterozysten (eine Art von Sellula, die in der FIJATION der atmosphärischen NITROGEN spezifisch ist) und dass wir aus der Perspektive der möglichen IMPLICATION von Regulatoren analysieren. WIR VERWENDEN ALS NOSTOC SP MODELLORGANISMUS. PCC 7120, EINE CYANOBAKTERIEN, FÜR DIE WIR BEREITS EINE GLOBALE TRANSCRIPTOMICA-ANALYSE MIT RNASEQ HABEN. Von SIMILAR AN DIE OBSERVIERUNG für andere Bakterien, die Anwendung dieser Metodologie an CYANNOBACTERIAS REVIEW DIE PRESENCE der transkribierten Nichtkodierung, kleine RNAS (sRNAs) als transkribierte ANTISENTIDO._x000D_x000D_x000D__x000D__x000D_x000D_x000005F_x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000 5F_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000F_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000 der NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR wird vom NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR gesteuert. IM RAHMEN UNSERES AKTUELLEN PROJEKTS (BFU2013-48282-C2-1-P) KONNTEN WIR MEHRERE SRNAS IDENTIFIZIEREN, DEREN TRANSKRIPTION VON NTCA ABHÄNGT, UND WIR KONNTEN NACHWEISEN, DASS EINER VON IHNEN, NSIR4, AN EINER KOHÄRENTEN SCHALTUNG (FEED FORWARD LOOP) DER GEMISCHTEN VERORDNUNG (TRANSCRIPTIONAL UND POST-TRANSCRIPTIONAL) BETEILIGT IST UND ALS VERMITTLER VON NTCA BEI DER REGULIERUNG VON GLUTAMIN-SYNTHETASE FUNGIERT. Im vorliegenden Vorschlag werden wir weiterhin POSSIBLE Funcions FÜR NSIR4 definieren, und wir werden auch die mögliche IMPLEMENTATION einer neuen SRNA identificated IN OUR GROUP, NSRR1, IN DER STABILITÄT/Degration von Phycobilisomas, exklusive PROTEIC COMPLEMENTS OF CYYNOBACTERIAS UND ROJAS analysieren._x000D_ _x000D_ Die Differenzierung von Heterozysten, die nach wie vor als Reaktion auf die NITROGEN DEFICIT und in ULTIMALer Instancy präsentiert werden, wird von NTCA kontrolliert, implementiert ein TECHNISCHE TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMME der Heterozysten, die von HETR reguliert werden. DAHER GEHEN WIR DAVON AUS, DASS SRNAS, DIE DURCH HETR REGULIERT WERDEN, AN DER DIFFERENZIERUNG BETEILIGT SEIN KÖNNTEN. DIESER VORSCHLAG ENTHÄLT DIE UNTERSUCHUNG VON ZWEI SRNAS, DIE WIR AUSSCHLIESSLICH IN DEN HETEROZYSTEN (NSIR1 UND NSIR8) TRANSKRIBIERT HABEN. NSIR1 ist ein sehr großer TEMPRANOUS-MARCADER DER KELLEN, die Ihre DIFFERENCECIONATION einschließen._x000D_ _x000D_ Ademas of the STUDY DETAILED OF THE REGULATION MEDIATED BY MIT DIENSTLEISTUNGEN, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL Ansätze EXPLORATORY IN TWO DIRECCIONS. EINERSEITS WERDEN WIR AUTOMATISIERTE VORHERSAGEN DER MÖGLICHEN ZIELE ALLER SRNAS (INSGESAMT 327) DURCHFÜHREN, DIE MIT DEM IN UNSEREM AKTUELLEN PROJEKT IMPLEMENTIERTEN ALGORITHMUS IDENTIFIZIERT WURDEN. MEHRERE DIESER SRNAS SIND AUF GENOME VON HETEROCYST-BILDENDEN STÄMMEN BESCHRÄNKT, SO DASS IHRE FUNKTION MIT DIESEM PROZESS VERKNÜPFT WERDEN KÖNNTE. AUF DER ANDEREN SEITE WERDEN WIR AUF DER GRUNDLAGE DER HYBRIDISIERUNGSDATEN DER MIKROARRAYS, DIE IM AKTUELLEN PROJEKT ENTWICKELT WURDEN, KOEXPRESSIONSNETZWERKE AUFBAUEN, UM ANTISENSE-TRANSKRIPTE MIT EXPRESSIONSPROFILEN ZU IDENTIFIZIEREN, DIE DENEN SPEZIFISCHER EXPRESSIONSGENE IN DEN HETEROZYSTEN ÄHNLICH SIND. (German)
9 December 2021
0 references
CYANOBACTERIËN ZIJN EEN GROEP FOTOSYNTHETISCHE ORGANISMEN DIE ZIJN AANGEPAST AAN BIJNA ALLE OMGEVINGEN. ZE HEBBEN MINDER VOEDINGSBEHOEFTEN EN ZIJN VEELZIJDIG EN GEMAKKELIJK AAN TE PASSEN AAN VERANDERINGEN IN HET LICHT, BESCHIKBAARHEID VAN VOEDINGSSTOFFEN, ENZ., FILAMENTAIRE CYANOBACTERIËN BEHOREN TOT DE WEINIGE PROKARYOTES DIE CELDIFFERENTIATIEPROCESSEN UITVOEREN DIE LEIDEN TOT AANPASSING AAN VOEDINGS- OF MILIEUSTRESS. Deze processen zijn gebaseerd op het stabiliseren van genetisch-differentieel expressieve PATRONS, OP ocasions rust OP SPECIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ IN ONZE LABORATORY zijn we geïnteresseerd in het antwoord van de CIANOBACTERIAS op de Nutricional carence OF NITROGENO, dat INCLUDE differentatie van heterocysten (een type celula SPECIALISED IN DE FIJATIE van de atmosferische NITROGEN) en dat we analyseren vanuit het perspectief van de Mogelijke IMPLICATIE VAN regelgevers. WE GEBRUIKEN ALS EEN NOSTOC SP MODEL ORGANISME. PCC 7120, EEN CYANOBACTERIËN WAARVOOR WE AL EEN WERELDWIJDE TRANSCRIPTOMICA-ANALYSE HEBBEN MET BEHULP VAN RNASEQ. Van SIMILAR AAN DE OBSERVED VOOR Andere bacteriën, DE TOEPASSING VAN DEZE metodologie AAN CYANNOBACTERIAS OP DE PRESENCE VAN transcribeerde niet-codering, kleine RNAS (sRNA’s) AS transcribed ANTISENTIDO._x000D__x000D_x000D__x005D__x005D__x000D__x005D__x005D__x005D__x000D_x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D_x000D_x000D__x000D_x005D_x000D_x000D_x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D__x x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D_ de NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR wordt gecontroleerd door de NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. IN HET KADER VAN ONS HUIDIGE PROJECT (BFU2013-48282-C2-1-P) HEBBEN WE VERSCHILLENDE SRNAS KUNNEN IDENTIFICEREN WAARVAN DE TRANSCRIPTIE AFHANKELIJK IS VAN NTCA EN WE HEBBEN KUNNEN AANTONEN DAT EEN VAN HEN, NSIR4, DEELNEEMT AAN EEN COHERENT CIRCUIT (FEED FORWARD LOOP) VAN GEMENGDE REGELGEVING (TRANSCRIPTIONAL EN POST-TRANSCRIPTIONAL), ALS TUSSENPERSOON VAN NTCA IN DE VERORDENING GLUTAMINE SYNTHETASE. In het huidige voorstel zullen wij POSSIBLE funcions VOOR NSIR4 blijven definiëren en zullen we ook de mogelijke IMPLEMENTATION van een nieuwe SRNA identificated IN ONZE GROUP, NSRR1, in de STABILITEIT/degratie van fycobilisoma’s, exclusieve PROTEIC COMPLEMENTS VAN CYYNOBACTERIAS EN ROJAS analyseren._x000D_ _x000D_ DE differentatie van heterocysten, die nog steeds worden gepresenteerd in reactie op de NITROGEN DEFICIT en in ULTIMAL instancy wordt gecontroleerd door NTCA, implementeert een SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMMA van de heterocysten die worden gereguleerd door HETR. DAAROM VERONDERSTELDEN WE DAT SRNAS DIE DOOR HETR WORDEN GEREGULEERD, BETROKKEN ZOUDEN KUNNEN ZIJN BIJ DIFFERENTIATIE. DIT VOORSTEL OMVAT DE STUDIE VAN TWEE SRNA’S WAARVAN WE HEBBEN AANGETOOND DAT ZE UITSLUITEND IN DE HETEROCYSTEN (NSIR1 EN NSIR8) ZIJN GETRANSCRIBEERD. NSIR1 is een zeer TEMPRANOUS MARCADER van de CELLS INCLUDING UW DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Ademas OF THE STUDY DETAILED OF THE VERORDENING GEMEENSCHAPPEN VAN DE GEMEENSCHAPPENDE DIENSTEN, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL approach EXPLORATORY IN TWEE DIRECCIES. AAN DE ENE KANT ZULLEN WE GEAUTOMATISEERDE VOORSPELLINGEN UITVOEREN VAN DE MOGELIJKE DOELEN VAN ALLE SRNA’S (IN TOTAAL 327) GEÏDENTIFICEERD MET HET ALGORITME DAT IN ONS HUIDIGE PROJECT IS GEÏMPLEMENTEERD. VERSCHEIDENE VAN DEZE SRNA’S ZIJN BEPERKT TOT GENOOMS VAN HETEROCYST-VORMENDE STAMMEN, ZODAT HUN FUNCTIE AAN DIT PROCES KAN WORDEN GEKOPPELD. AAN DE ANDERE KANT ZULLEN WE, OP BASIS VAN DE HYBRIDISATIEGEGEVENS VAN DE MICROARRAYS DIE IN HET HUIDIGE PROJECT ZIJN ONTWORPEN, CO-EXPRESSIENETWERKEN BOUWEN OM ANTISENSE TRANSCRIPTEN TE IDENTIFICEREN MET EXPRESSIEPROFIELEN DIE VERGELIJKBAAR ZIJN MET DIE VAN SPECIFIEKE EXPRESSIEGENEN IN DE HETEROCYSTEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I CIANOBATTERI SONO UN GRUPPO DI ORGANISMI FOTOSINTETICI ADATTATI A QUASI TUTTI GLI AMBIENTI. HANNO RIDOTTO IL FABBISOGNO NUTRIZIONALE E SONO VERSATILI E FACILMENTE ADATTABILI AI CAMBIAMENTI DELLA LUCE, ALLA DISPONIBILITÀ DI NUTRIENTI, ECC., I CIANOBATTERI FILAMENTOSI SONO TRA I POCHI PROCARIOTI CHE EFFETTUANO PROCESSI DI DIFFERENZIAZIONE CELLULARE CHE PORTANO ALL'ADATTAMENTO ALLO STRESS NUTRIZIONALE O AMBIENTALE. Questi processi si basano sulla stabilizzazione di PATRONI geneticamente diversificati espressivi, SUO ocasioni riposanti PER CELLI SPECIFICI NEI FILAMENTI._x000D_ _x000D_ NEL NOSTRO LABORATORIA siamo interessati alla risposta della CIANOBACTERIAS alla carenza Nutrizionale di NITROGENO, che INCLUDE la differenziazione degli eterocisti (un tipo di celula SPECIALIZZATA NEL FIJAZIONE DEL NITROGEN atmosferico) e che stiamo analizzando dal punto di vista della possibile IMPLICAZIONE DEI regolatori. USIAMO COME ORGANISMO MODELLO NOSTOC SP. PCC 7120, UN CIANOBATTERI PER I QUALI ABBIAMO GIÀ UN'ANALISI GLOBALE TRANSCRIPTOMICA UTILIZZANDO RNASEQ. Dal SIMILARIO ALL'OBSERVATO PER Altri batteri, L'APPLICAZIONE DI QUESTO metodologico A CYANNOBACTERIAS REVIEW LA PRESENZA DI RNA SCRITTI senza codifica, di piccole dimensioni (sRNA) come ANTISENTIDO trascritto._x000D__x000D__x000D__x000D____________________________________________x_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___ x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR è controllato da NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. NEL QUADRO DEL NOSTRO PROGETTO ATTUALE (BFU2013-48282-C2-1-P) SIAMO STATI IN GRADO DI IDENTIFICARE DIVERSI SRNA LA CUI TRASCRIZIONE DIPENDE DALL'NTCA E SIAMO STATI IN GRADO DI DIMOSTRARE CHE UNO DI ESSI, NSIR4, PARTECIPA A UN CIRCUITO COERENTE (FEED FORWARD LOOP) DI REGOLAMENTO MISTO (TRANSCRIPTIONAL E POST-TRANSCRIPTIONAL), CHE FUNGE DA INTERMEDIARIO DI NTCA NEL REGOLAMENTO DELLA GLUTAMMINA SINTETASI. Nella presente proposta continueremo a definire POSSIBILI Funzioni PER NSIR4 e analizzeremo anche la potenziale IMPLEMENTAZIONE di un nuovo SRNA identificato NEL NOSTRO GRUPPO, NSRR1, NELLA STABILITÀ/degrazione dei ficobilisomi, esclusivi COMPLEMENTI PROTEICI DI CYNOBACTERIAS E ROJAS._x000D_ _x000D_ La diversità degli eterocisti, che sono ancora presentati in risposta al NITROGEN DEFICIT e in ULTIMAL instancy è controllato da NTCA, implementa un PROGRAMMA TRASCRIPZIONALE SPECIFICO DEGLI eterocisti che sono regolati da HETR. PERTANTO, ABBIAMO IPOTIZZATO CHE GLI SRNA REGOLATI DALL'HETR POSSANO ESSERE COINVOLTI NELLA DIFFERENZIAZIONE. QUESTA PROPOSTA COMPRENDE LO STUDIO DI DUE SRNA CHE ABBIAMO DIMOSTRATO DI ESSERE TRASCRITTI ESCLUSIVAMENTE NEGLI ETEROCISTI (NSIR1 E NSIR8). NSIR1 è un MARCADER MOLTO TEMPRANOO dei CELLI INCLUSO LA VOSTRA DIFFERENCIONAZIONE._x000D_ _x000D_ Ademas dello STUDY DETAILED DEL REGOLAMENTO MEDIATO DEI SERVIZI riparati, LLEVAREMOS A CABO COMPUTATIONAL approcci EXPLORATORY IN TWO DIRECCIONS. DA UN LATO EFFETTUEREMO PREVISIONI AUTOMATIZZATE DEI POSSIBILI TARGET DI TUTTI GLI SRNA (UN TOTALE DI 327) IDENTIFICATI CON L'ALGORITMO IMPLEMENTATO NEL NOSTRO ATTUALE PROGETTO. MOLTI DI QUESTI SRNA SONO LIMITATI AI GENOMI DI CEPPI FORMANTI HETEROCYST, QUINDI LA LORO FUNZIONE POTREBBE ESSERE COLLEGATA A QUESTO PROCESSO. D'ALTRA PARTE, SULLA BASE DEI DATI DI IBRIDAZIONE DEI MICROARRAY PROGETTATI NELL'ATTUALE PROGETTO, COSTRUIREMO RETI DI CO-ESPRESSIONE PER IDENTIFICARE TRASCRIZIONI ANTISENSO CON PROFILI ESPRESSIVI SIMILI A QUELLI DI SPECIFICI GENI DI ESPRESSIONE NEGLI ETEROCISTI. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΑ ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΑ ΕΊΝΑΙ ΜΙΑ ΟΜΆΔΑ ΦΩΤΟΣΥΝΘΕΤΙΚΏΝ ΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΜΈΝΩΝ ΣΕ ΌΛΑ ΣΧΕΔΌΝ ΤΑ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝΤΑ. ΈΧΟΥΝ ΜΕΙΩΜΈΝΕΣ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΈΣ ΑΠΑΙΤΉΣΕΙΣ ΚΑΙ ΕΊΝΑΙ ΕΥΠΡΟΣΆΡΜΟΣΤΕΣ ΚΑΙ ΕΎΚΟΛΑ ΠΡΟΣΑΡΜΌΣΙΜΕΣ ΣΤΙΣ ΑΛΛΑΓΈΣ ΣΤΟ ΦΩΣ, ΤΗ ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ ΘΡΕΠΤΙΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ Κ.ΛΠ., ΤΑ ΝΗΜΑΤΏΔΗ ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΗΡΊΔΙΑ ΕΊΝΑΙ ΑΠΌ ΤΑ ΛΊΓΑ ΠΡΟΚΑΡΥΏΤΑ ΠΟΥ ΕΚΤΕΛΟΎΝ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗΣ ΤΩΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΠΟΥ ΟΔΗΓΟΎΝ ΣΕ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΣΤΗ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΉ Ή ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΉ ΚΑΤΑΠΌΝΗΣΗ. Οι διαδικασίες αυτές βασίζονται στη σταθεροποίηση των γενετικά-διαφορικά εκφραστικών ΠΑΤΡΩΝ, ΣΤΑΘΜΙΣΜΕΝΕΣ ΠΕΡΙΣΣΟΤΕΡΕΣ ΑΝΑΠΤΥΞΕΙΣ ΣΤΙΣ ΕΙΔΙΚΕΣ ΚΑΛΥΨΕΙΣ ΣΤΙΣ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ._x000D_ _x000D_ ΣΤΗ ΔΗΜΟΚΡΑΤΙΑ ΜΑΣ ενδιαφερόμαστε για την απάντηση της CIANOBACTERIAS στο Nutricional carence of NITROGENO, ότι INCLUDE διαφοροποίηση των ετεροκύστων (ένα είδος celula ΠΡΟΔΙΑΓΡΑΦΈΣ ΣΤΗ ΦΙΛΟΦΟΡΙΑ του ατμοσφαιρικού NITROGEN) και ότι αναλύουμε από την προοπτική της Πιθανή ΕΜΠΛΗΡΩΣΗ των ρυθμιστών. ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΜΕ ΩΣ ΠΡΌΤΥΠΟ ΟΡΓΑΝΙΣΜΌ NOSTOC SP. PCC 7120, ΈΝΑ ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΟ ΓΙΑ ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΈΧΟΥΜΕ ΉΔΗ ΜΙΑ ΠΑΓΚΌΣΜΙΑ ΑΝΆΛΥΣΗ TRANSCRIPTOMICA ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ RNASEQ. Από το SIMILAR έως το OBSERVED για άλλα βακτήρια, η εφαρμογή της παρούσας μεθοδολογίας σε CYANNOBACTERIAS ΑΝΑΘΕΩΡΕΙ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΑ ΜΕΤΑΓΡΑΦΗ ΜΗ ΚΩΔΙΚΟΥ, μικρών RNAS (sRNAs) όπως μεταγράφηκαν ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D__x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D ο TRANSCRIPCIONAL REGULATOR NTCA ελέγχεται από τον TRANSCRIPCIONAL REGULATOR NTCA. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΤΟΥ ΤΡΈΧΟΝΤΟΣ ΈΡΓΟΥ ΜΑΣ (BFU2013-48282-C2-1-P) ΜΠΟΡΈΣΑΜΕ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΟΥΜΕ ΑΡΚΕΤΆ SRNA ΤΩΝ ΟΠΟΊΩΝ Η ΜΕΤΑΓΡΑΦΉ ΕΞΑΡΤΆΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ NTCA ΚΑΙ ΜΠΟΡΈΣΑΜΕ ΝΑ ΑΠΟΔΕΊΞΟΥΜΕ ΌΤΙ ΈΝΑ ΑΠΌ ΑΥΤΆ, ΤΟ NSIR4, ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ ΣΕ ΈΝΑ ΣΥΝΕΚΤΙΚΌ ΚΎΚΛΩΜΑ (ΒΡΑΧΊΟΝΑΣ ΤΡΟΦΟΔΟΣΊΑΣ) ΜΙΚΤΟΎ ΚΑΝΟΝΙΣΜΟΎ (ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ ΚΑΙ ΜΕΤΑΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ), ΕΝΕΡΓΏΝΤΑΣ ΩΣ ΜΕΣΆΖΩΝ ΤΗΣ NTCA ΣΤΟΝ ΚΑΝΟΝΙΣΜΌ ΤΗΣ ΣΥΝΘΕΤΆΣΗΣ ΓΛΟΥΤΑΜΊΝΗΣ. Στην παρούσα πρόταση θα εξακολουθήσουμε να ορίζουμε τις ΙΣΧΥΕΣ ΣΥΣΚΕΥΑΣΙΕΣ για το NSIR4 και θα αναλύσουμε επίσης την πιθανή ΕΦΑΡΜΟΓΗ ενός νέου SRNA που ταυτοποιείται στον Όμιλο μας, το NSRR1, ΣΤΗ ΣΤΑΘΕΡΟΠΟΙΗΣΗ/εξάλειψη των φυτομπιλισωμάτων, αποκλειστικές Προστατευτικές Εφαρμογές ΚΥΙΝΟΒΑΚΤΕΡΙΩΝ ΚΑΙ ΡΩΜΑΤΩΝ._x000D_ _x000D_ _x000D_ Η διαφοροποίηση των ετεροκυττάρων, τα οποία εξακολουθούν να παρουσιάζονται ως απάντηση στο NITROGEN DEFICIT και σε ULTIMAL instancy ελέγχεται από το NTCA, εφαρμόζει ΕΙΔΙΚΟ ΜΕΤΑΦΡΑΣΤΙΚΟ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ των ετεροκύστων που ρυθμίζονται από το HETR. ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΥΠΟΘΈΣΑΜΕ ΌΤΙ ΤΑ SRNA ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟΝ HETR ΕΝΔΈΧΕΤΑΙ ΝΑ ΣΥΜΜΕΤΈΧΟΥΝ ΣΤΗ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ. Η ΠΡΌΤΑΣΗ ΑΥΤΉ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΔΎΟ SRNA ΠΟΥ ΑΠΟΔΕΊΞΑΜΕ ΌΤΙ ΜΕΤΑΓΡΆΦΟΝΤΑΙ ΑΠΟΚΛΕΙΣΤΙΚΆ ΣΤΟΥΣ ΕΤΕΡΟΚΎΣΤΟΥΣ (NSIR1 ΚΑΙ NSIR8). NSIR1 ΕΙΝΑΙ ΠΟΛΥ ΤΕΜΠΡΑΝΟΣ ΘΑΛΑΣΣΑΣ ΤΩΝ ΚΥΛΩΝ ΠΟΥ ΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΝΤΑΙ ΤΩΝ ΔΙΑΦΟΡΩΝ ΣΑΣ._x000D_ _x000D_ _x000D_ Ademas ΤΗΣ ΜΕΛΕΤΗΣ που ΑΝΑΦΕΡΟΝΤΑΙ στον ΚΑΝΟΝΙΣΜΟ που διαμορφωνεται απο ΤΙΣ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΜΕΝΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ, ΛΕΒΑΡΕΜΟ ΣΕ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΕΣ ΠΡΟΣΕΓΓΙΣΜΕΝΕΣ ΠΡΟΣΕΓΓΙΣΕΙΣ ΣΕ ΔΙΟΙΚΗΤΙΚΕΣ ΟΔΗΓΙΕΣ. ΑΠΌ ΤΗ ΜΊΑ ΠΛΕΥΡΆ ΘΑ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΑΥΤΟΜΑΤΟΠΟΙΗΜΈΝΕΣ ΠΡΟΒΛΈΨΕΙΣ ΤΩΝ ΠΙΘΑΝΏΝ ΣΤΌΧΩΝ ΌΛΩΝ ΤΩΝ SRNA (ΣΥΝΟΛΙΚΆ 327) ΠΟΥ ΤΑΥΤΟΠΟΙΉΘΗΚΑΝ ΜΕ ΤΟΝ ΑΛΓΌΡΙΘΜΟ ΠΟΥ ΥΛΟΠΟΙΕΊΤΑΙ ΣΤΟ ΤΡΈΧΟΝ ΜΑΣ ΈΡΓΟ. ΑΡΚΕΤΆ ΑΠΌ ΑΥΤΆ ΤΑ SRNA ΠΕΡΙΟΡΊΖΟΝΤΑΙ ΣΕ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΑ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΠΟΥ ΣΧΗΜΑΤΊΖΟΥΝ HETEROCYST, ΟΠΌΤΕ Η ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΤΟΥΣ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΕ ΝΑ ΣΥΝΔΕΘΕΊ ΜΕ ΑΥΤΉ ΤΗ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ. ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΛΛΗ ΠΛΕΥΡΆ, ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΥΒΡΙΔΟΠΟΊΗΣΗΣ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΣΥΣΤΟΙΧΙΏΝ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΣΧΕΔΙΑΣΤΕΊ ΣΤΟ ΤΡΈΧΟΝ ΈΡΓΟ, ΘΑ ΔΗΜΙΟΥΡΓΉΣΟΥΜΕ ΔΊΚΤΥΑ ΣΥΝΈΚΦΡΑΣΗΣ ΓΙΑ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΟΥΜΕ ΑΠΟΜΑΓΝΗΤΟΦΏΝΗΣΗ ΜΕ ΠΡΟΦΊΛ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΠΑΡΌΜΟΙΑ ΜΕ ΑΥΤΆ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΕΙΔΙΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΣΤΟΥΣ ΕΤΕΡΟΚΎΣΤΟΥΣ. (Greek)
17 August 2022
0 references
CYANOBAKTERIER ER EN GRUPPE AF FOTOSYNTETISKE ORGANISMER, DER ER TILPASSET NÆSTEN ALLE MILJØER. DE HAR REDUCERET ERNÆRINGSMÆSSIGE BEHOV OG ER ALSIDIGE OG LET KAN TILPASSES ÆNDRINGER I LYS, TILGÆNGELIGHED AF NÆRINGSSTOFFER OSV., FILAMENTARY CYANOBAKTERIER ER BLANDT DE FÅ PROKARYOTER, DER UDFØRER CELLEDIFFERENTIERING PROCESSER, DER FØRER TIL TILPASNING TIL ERNÆRINGSMÆSSIGE ELLER MILJØMÆSSIGE STRESS. Disse processer er baseret på stabilisering af genetisk-differentialt udtryksfulde PATRONS, ON ocasions hviler TIL SPECIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ I VORES LABORATORY vi er interesseret i svaret fra CIANOBACTERIAS til Nutricional carence of NITROGEN, at INCLUDE differentiering af heterocysts (en type celula SPECIALISED I FIJATION AF den atmosfæriske NITROGEN), og at vi analyserer ud fra perspektivet af den mulige IMPLICATION OF regulatorer. VI BRUGER SOM EN NOSTOC SP MODEL ORGANISME. PCC 7120, EN CYANOBAKTERIER, FOR HVILKE VI ALLEREDE HAR EN GLOBAL TRANSCRIPTOMICA ANALYSE VED HJÆLP AF RNASEQ. Fra SIMILAR til OBSERVED FOR andre bakterier, APPLICATION AF DENNE metodologi til CYANNOBACTERIAS REVIEW PRESENCE of transcribed non-kodning, små RNAS (sRNA'er) AS transkriberet ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR kontrolleres af NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. INDEN FOR RAMMERNE AF VORES NUVÆRENDE PROJEKT (BFU2013-48282-C2-1-P) HAR VI VÆRET I STAND TIL AT IDENTIFICERE FLERE SRNA'ER, HVIS TRANSSKRIPTION AFHÆNGER AF NTCA, OG VI HAR VÆRET I STAND TIL AT PÅVISE, AT EN AF DEM, NSIR4, DELTAGER I ET SAMMENHÆNGENDE KREDSLØB (FEED FORWARD LOOP) I BLANDET FORORDNING (TRANSCRIPTIONAL OG POST-TRANSCRIPTIONAL), DER FUNGERER SOM MELLEMLED FOR NTCA I REGULERINGEN AF GLUTAMINSYNTHETASE. I nærværende forslag vil vi fortsætte med at definere POSSIBLE funcions FOR NSIR4 og vi vil også analysere den potentielle IMPLEMENTATION af en ny SRNA identificeret i vores GROUP, NSRR1, I STABILITY/degration af fykobilisomer, eksklusive PROTEIC COMPLEMENTER AF CYNOBACTERIAS OG ROJAS._x000D_ _x000D_ The differentation of heterocysts, som stadig præsenteres som svar på NITROGEN DEFICIT og i ULTIMAL instans kontrolleres af NTCA, implementerer en SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMME af heterocysts, der er reguleret af HETR. DERFOR ANTOG VI, AT SRNA'ER, DER REGULERES AF HETR, KAN VÆRE INVOLVERET I DIFFERENTIERING. DETTE FORSLAG OMFATTER EN UNDERSØGELSE AF TO SRNA'ER, SOM VI HAR PÅVIST UDELUKKENDE AT BLIVE TRANSSKRIBERET I HETEROCYSTERNE (NSIR1 OG NSIR8). NSIR1 er en meget TEMPRANOUS MARCADER AF DIN DIFFERENCEKIONATION._x000D_ _x000D_ _x000D_ Ademaer af den STUDY DETAILED OF THE Regulation MediaTED af de blandede selskaber, LLEVAREMOS TIL CABO COMPUTATIONAL nærmer sig EXPLORATORY i TWO DIREKCIONER. PÅ DEN ENE SIDE VIL VI UDFØRE AUTOMATISEREDE FORUDSIGELSER AF DE MULIGE MÅL FOR ALLE SRNA'ER (I ALT 327) IDENTIFICERET MED ALGORITMEN IMPLEMENTERET I VORES NUVÆRENDE PROJEKT. FLERE AF DISSE SRNA'ER ER BEGRÆNSET TIL GENOMER AF HETEROCYST-DANNENDE STAMMER, SÅ DERES FUNKTION KAN KÆDES SAMMEN MED DENNE PROCES. PÅ DEN ANDEN SIDE, BASERET PÅ HYBRIDISERINGSDATA FRA MIKROARRAYS DESIGNET I DET NUVÆRENDE PROJEKT, VIL VI OPBYGGE SAMEKSPRESSIONSNETVÆRK TIL AT IDENTIFICERE ANTISENSE-UDSKRIFTER MED EKSPRESSIONSPROFILER SVARENDE TIL DEM AF SPECIFIKKE EKSPRESSIONSGENER I HETEROCYSTERNE. (Danish)
17 August 2022
0 references
SYANOBAKTEERIT OVAT FOTOSYNTEETTISTEN ORGANISMIEN RYHMÄ, JOKA ON SOPEUTUNUT LÄHES KAIKKIIN YMPÄRISTÖIHIN. NIIDEN RAVITSEMUKSELLISET TARPEET OVAT VÄHENTYNEET JA NE OVAT MONIPUOLISIA JA HELPOSTI MUKAUTETTAVISSA VALON MUUTOKSIIN, RAVINTOAINEIDEN SAATAVUUTEEN JNE., SÄIESYANOBAKTEERIT OVAT HARVOJA PROKARYOOTTEJA, JOTKA SUORITTAVAT SOLUJEN ERILAISTUMISPROSESSEJA, JOTKA JOHTAVAT SOPEUTUMISEEN RAVITSEMUKSELLISEEN TAI YMPÄRISTÖÖN LIITTYVÄÄN STRESSIIN. Nämä prosessit perustuvat geneettisesti eri ilmeikäs PATRONS, ON Ocasions restring to SPECIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ IN OUR LABORATORY, olemme kiinnostuneita vastauksesta CIANOBACTERIAS Nutricional carence NITROGENO, että INCLUDE eriyttäminen heterokystit (tyyppi celula TEKNISET TIEDOT ilmakehän NITROGEN) ja että analysoimme näkökulmasta Mahdollinen IMPLICATION sääntelijöiden. KÄYTÄMME NOSTOC SP MALLI ORGANISMI. PCC 7120, SYANOBAKTEERI, JOTA VARTEN MEILLÄ ON JO MAAILMANLAAJUINEN TRANSCRIPTOMICA-ANALYYSI RNASEQIN AVULLA. Muilta bakteereilta: tämän metodologian HYVÄKSYNNÖN PÄÄTÖKSEN KÄYTETTÄVÄT TIEDOT TIETOJEN MÄÄRÄT TIETOJEN TIETOJEN TIEDOT, pienet RNAS (sRNA) kuten transkriptio ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR on NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATORin määräysvallassa. NYKYISEN PROJEKTIMME (BFU2013–48282-C2–1-P) PUITTEISSA OLEMME PYSTYNEET TUNNISTAMAAN USEITA SRNA:ITA, JOIDEN TRANSKRIPTIO RIIPPUU NTCA: STA, JA OLEMME PYSTYNEET OSOITTAMAAN, ETTÄ YKSI NIISTÄ, NSIR4, OSALLISTUU JOHDONMUKAISEEN PIIRIIN (SYÖTE ETEENPÄIN SILMUKKA) SEKA-ASETUKSEN (TRANSCRIPTIONAL JA POST-TRANSCRIPTIONAL) TOIMIJANA NTCA ASETUKSESSA GLUTAMIINISYNTEETAASIA. Tässä ehdotuksessa määritämme edelleen NSIR4:n PUOSIBLE funcions ja analysoimme myös uuden SRNA-tunnisteen mahdollista TÄYTÄNTÖÖN, joka on tunnistettu OUR GROUP, NSRR1, IN STABILITY/Fycobilisomas, yksinomainen PROTEIC COMPLEMENTS OF CYYNOBACTERIAS JA ROJAS._x000D_ _x000D_ The differentation of heterocysts, jotka on edelleen esitetty vastauksena NITROGEN DEFICITiin ja ULTIMAL instancy on NTCA:n määräysvallassa, toteuttaa HETR:n sääntelemien heterokystien SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMME. TÄMÄN VUOKSI OLETIMME, ETTÄ HETR:N SÄÄNTELEMÄT SRNA:T SAATTAVAT OSALLISTUA ERIYTTÄMISEEN. TÄMÄ EHDOTUS SISÄLTÄÄ TUTKIMUKSEN KAHDESTA SRNA:STA, JOTKA ON OSOITETTU TRANSKRIPTIOIKSI YKSINOMAAN HETEROKYSTIT (NSIR1 JA NSIR8). NSIR1 on erittäin TEMPRANOUS MARCADER TEMPRANOUS MARCADER of the CELLS INLEURERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ STUDY DETAILED ASETUKSEN MEDIOITUJA SERVICES, LLEVAREMOS CABO COMPUTATIONAL lähestymistapoja EXPLORATORIA TWO DIRECCIONS. TOISAALTA TEEMME AUTOMATISOITUJA ENNUSTUKSIA KAIKKIEN SRNA:IDEN MAHDOLLISISTA TAVOITTEISTA (YHTEENSÄ 327), JOTKA ON YKSILÖITY NYKYISESSÄ HANKKEESSAMME TOTEUTETULLA ALGORITMILLA. USEAT NÄISTÄ SRNA:ISTA RAJOITTUVAT HETEROCYST-MUODOSTAVIEN KANTOJEN GENOMIIN, JOTEN NIIDEN TOIMINTA VOIDAAN YHDISTÄÄ TÄHÄN PROSESSIIN. TOISAALTA NYKYISESSÄ HANKKEESSA SUUNNITELTUJEN MIKROSARJOJEN HYBRIDISAATIOTIETOJEN PERUSTEELLA RAKENNAMME RINNAKKAISILMAISUVERKOSTOJA TUNNISTAMAAN ANTISENSE-KOPIOIJAT, JOIDEN EKSPRESSIOPROFIILIT OVAT SAMANLAISIA KUIN HETEROKYSTIEN ERITYISTEN EKSPRESSIOGEENIEN. (Finnish)
17 August 2022
0 references
CYANOBACTERIA HUMA GRUPP TA ‘ORGANIŻMI FOTOSINTETIĊI ADATTATI GĦAL KWAŻI L-AMBJENTI KOLLHA. HUMA NAQQSU R-REKWIŻITI NUTRIZZJONALI U HUMA VERSATILI U FAĊILMENT ADATTABBLI GĦAL BIDLIET FID-DAWL, ID-DISPONIBBILTÀ TA ‘NUTRIJENTI, EĊĊ., IĊ-ĊJANOBATTERJI FILAMENTARI HUMA FOST IL-FTIT PROKARJOTI LI JWETTQU PROĊESSI TA’ DIFFERENZJAZZJONI TAĊ-ĊELLOLI LI JWASSLU GĦAL ADATTAMENT GĦAL STRESS NUTRITTIV JEW AMBJENTALI. Dawn il-proċessi huma bbażati fuq l-istabbilizzazzjoni ta ‘PATRONS espressiva ġenetikament-differenzjali, ON ocasions restring GĦANDHOM SPIFIĊI FIL FILAMENTS._x000D_ _x000D_ F’LABORATORJU OUR aħna interessati fit-tweġiba tal-CIANOBACTERIAS għall-karenza Nutricional carence OF NITROGENO, li INCLUDE differentation OF heterocysts (tip ta ‘celula SPECIALISED FL-FIJATION TA’ l-NITROGEN atmosferika) u li aħna qed janalizzaw mill-perspettiva tar-regolaturi tal-possibbiltà. AĦNA NUŻAW BĦALA ORGANIŻMU MUDELL NOSTOC SP. PCC 7120, ĊJANOBATTERJI LI GĦALIHOM DIĠÀ GĦANDNA ANALIŻI GLOBALI TRANSCRIPTOMICA BL-UŻU TA’ RNASEQ. Minn SIMILAR GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM JIEĦDU BIL-Fakteru Oħrajn, L-APPLIKAZZJONI TA’ din il-metodoloġija għar-REVIŻI TA’ CYANNOBACTERIAS IL-PRESENZA TA’ Traskritt ta’ non-kodifikazzjoni traskritti, RNAS żgħar (sRNAs) kif traskritt ANTISENTIDO._x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000_D__x000D__x000_D___x000D__x000_D_x000_D_x000_D___x000D__x000_D__x000_D___x000_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR huwa kkontrollat minn NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. FIL-QAFAS TAL-PROĠETT ATTWALI TAGĦNA (BFU2013–48282-C2–1-P) STAJNA NIDENTIFIKAW DIVERSI SRNAS LI T-TRASKRIZZJONI TAGĦHOM TIDDEPENDI FUQ NTCA U STAJNA NURU LI WIEĦED MINNHOM, NSIR4, JIPPARTEĊIPA F’ĊIRKWIT KOERENTI (FEED FORWARD LOOP) TA’ REGOLAMENT IMĦALLAT (TRASKRIZZJONI U POST-TRASKRIZZJONI), LI JAĠIXXI BĦALA INTERMEDJARJU TA’ NTCA FIR-REGOLAMENT TA’ GLUTAMINE SYNTHETASE. Fil-proposta preżenti se nkomplu niddefinixxu funcions POSSIBLE GĦAL NSIR4 u se nanalizzaw ukoll l-IMPLEMENTAZZJONI potenzjali ta’ SRNA identifikata F’GROPP OUR, NSRR1, Fl-iSTABILITÀ/degrazzjoni ta’ filkobilisomi, KOMPLIMENTI PROTEĊIĊI esklussivi TA’ CYNOBACTERIAS U ROJAS._x000D_ _x000D_ _x000D_ Id-differenzazzjoni tal-eteroċisti, li għadhom ippreżentati b’reazzjoni għad-DEFICIT NITROGEN u fl-istanza ULTIMALI hija kkontrollata minn NTCA, timplimenta PROGRAMME SPEĊIFIKU TRANSCRIPCTIONALI tal-eteroċisti li huma rregolati mill-HETR. GĦALHEKK, AĦNA IPOTHESIZZAT LI L-SRNAS REGOLATI MILL-HETR JISTGĦU JKUNU INVOLUTI FID-DIFFERENZJAZZJONI. DIN IL-PROPOSTA TINKLUDI L-ISTUDJU TA ‘ŻEWĠ SRNAS LI AĦNA WREW LI JIĠU TRASKRITTI ESKLUSSIVAMENT FIL-ETEROĊISTI (NSIR1 U NSIR8). NSIR1 huwa MARCADER TEMPRANOUS VERY TA ‘L-INKLUŻ TIEGĦEK DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Ademas TAL-ISTUDJU ID-DETTALJONIJIET TAR-REGOLAMENT MEDIATTI MAL-SERVIZZI Mended, LLEVAREMOS għal approċċi KOMPUTAZZJONI TA ‘KABO KOMPUTAZZJONI F’DIREZZJONIJIET DWO. MIN-NAĦA WAĦDA AĦNA SE TWETTAQ PREVIŻJONIJIET AWTOMATIZZATI TAL-MIRI POSSIBBLI TA ‘L-SRNAS (TOTAL TA’ 327) IDENTIFIKATI BL-ALGORITMU IMPLIMENTAT FIL-PROĠETT ATTWALI TAGĦNA. BOSTA MINN DAWN L-SRNAS HUMA RISTRETTI GĦAL ĠENOMI TA’ RAZEZ LI JIFFURMAW HETEROCYST, U GĦALHEKK IL-FUNZJONI TAGĦHOM TISTA’ TKUN MARBUTA MA’ DAN IL-PROĊESS. MIN-NAĦA L-OĦRA, ABBAŻI TAD-DATA TAL-IBRIDIZZAZZJONI TAL-MIKROARRANĠAMENTI MFASSLA FIL-PROĠETT ATTWALI, SE NIBNU NETWERKS TA’ KOESPRESSJONI BIEX JIĠU IDENTIFIKATI TRASKRIZZJONIJIET ANTISENSE BI PROFILI TA’ ESPRESSJONI SIMILI GĦAL DAWK TA’ ĠENI TA’ ESPRESSJONI SPEĊIFIĊI FL-ETEROĊISTATI. (Maltese)
17 August 2022
0 references
CIANOBAKTĒRIJAS IR FOTOSINTĒTISKO ORGANISMU GRUPA, KAS PIELĀGOTA GANDRĪZ VISĀM VIDĒM. TIEM IR SAMAZINĀTAS UZTURA PRASĪBAS, UN TIE IR DAUDZPUSĪGI UN VIEGLI PIELĀGOJAMI GAISMAS, BARĪBAS VIELU PIEEJAMĪBAS UTT. IZMAIŅĀM, PAVEDIENU CIANOBAKTĒRIJAS IR VIENI NO NEDAUDZAJIEM PROKARYOTES, KAS VEIC ŠŪNU DIFERENCIĀCIJAS PROCESUS, KAS NOVED PIE PIELĀGOŠANĀS UZTURA VAI VIDES STRESAM. Šie procesi ir balstīti uz ģenētiski diferencēti izteiksmīgu PATRONS stabilizēšanu, ON ocasions, kas atpūšas īpašas CELLS FILAMENTS._x000D_ _x000D_ mūsu LABORATORIJAS, mēs esam ieinteresēti CIANOBACTERIAS atbildē uz NITROGENO Nutricional carence, ka INCLUDE diferenciācija heterocistu (veids celula SPECIALISZĒTA FIJACIJAS atmosfēras NITROGEN) un ka mēs analizējam no viedokļa iespējamo regulatoru IMPLICATION. MĒS IZMANTOJAM KĀ NOSTOC SP MODEĻA ORGANISMU. PCC 7120, CIANOBAKTĒRIJAS, PAR KURĀM MUMS JAU IR GLOBĀLA TRANSCRIPTOMICA ANALĪZE, IZMANTOJOT RNASEQ. No SIMILAR līdz OBSERVED citām baktērijām, šīs metodoloģijas PIETEIKUMS UZ CYANNOBACTERIAS APSTIPRINĀŠANA pārrakstīto nekodēto, mazo RNSS (SRNS) AS transkribēts ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__ NTCA TRANSCRIPCIONAL Regulatoru kontrolē NTCA TRANSCRIPCIONAL regulators. MŪSU PAŠREIZĒJĀ PROJEKTA IETVAROS (BFU2013–48282-C2–1-P) MĒS ESAM SPĒJUŠI IDENTIFICĒT VAIRĀKAS SRNS, KURU TRANSKRIPCIJA IR ATKARĪGA NO NTCA, UN MĒS ESAM SPĒJUŠI PIERĀDĪT, KA VIENS NO TIEM, NSIR4, PIEDALĀS SASKAŅOTĀ JAUKTĀ REGULĒJUMA ĶĒDĒ (BARĪBAS UZ PRIEKŠU) (TRANSSCRIPTIONAL UN POST-TRANSCRIPTIONAL), DARBOJOTIES KĀ NTCA STARPNIEKS GLUTAMĪNA SINTETĀZES REGULĀ. Šajā priekšlikumā mēs turpināsim definēt POSSIBLE funcions NSIR4 un mēs arī analizēsim iespējamo jaunā SRNA, kas identificēta mūsu grupā, NSRR1, STABILITY/phycobilisomas, ekskluzīvo PROTEIKU COMPLEMENTS OF CYYNOBACTERIAS UN ROJAS._x000D_ _x000D_ _x000D_ The differentation of CYYNOBACTERIAS AND ROJAS, kas joprojām tiek uzrādītas, reaģējot uz NITROGEN DEFICIT, un ULTIMĀLĀ instanci kontrolē NTCA, īsteno īpašu TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMMU HETR reglamentētajiem heterocistiem. TĀPĒC MĒS PIEŅĒMĀM, KA HETR REGLAMENTĒTĀS SRNS VARĒTU BŪT IESAISTĪTAS DIFERENCĒŠANĀ. ŠIS PRIEKŠLIKUMS IETVER PĒTĪJUMU PAR DIVĀM SRNS, PAR KURĀM ESAM PIERĀDĪJUŠI, KA TĀS IR TRANSKRIBĒTAS TIKAI HETEROCISTOS (NSIR1 UN NSIR8). NSIR1 Ir ļoti TEMPRANOUS MARCADER PĀRDOŠANAS JŪSU DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ STUDY DETAIED REGULAS REGULU, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL pieejas ĀRĒJĀ DIREKTĪVU KOPĀ. NO VIENAS PUSES, MĒS VEIKSIM AUTOMATIZĒTAS PROGNOZES PAR IESPĒJAMIEM VISU SRNS MĒRĶIEM (KOPĀ 327), KAS IDENTIFICĒTI AR MŪSU PAŠREIZĒJĀ PROJEKTĀ ĪSTENOTO ALGORITMU. VAIRĀKI NO ŠIEM SRNS ATTIECAS TIKAI UZ HETEROCYST VEIDOJOŠO CELMU GENOMIEM, TĀPĒC TO FUNKCIJAS VARĒTU SAISTĪT AR ŠO PROCESU. NO OTRAS PUSES, PAMATOJOTIES UZ PAŠREIZĒJĀ PROJEKTĀ IZSTRĀDĀTO MIKROBLOKU HIBRIDIZĀCIJAS DATIEM, MĒS IZVEIDOSIM LĪDZEKSPRESIJAS TĪKLUS, LAI IDENTIFICĒTU ANTISENSE TRANSKRIPTUS AR IZTEIKSMES PROFILIEM, KAS IR LĪDZĪGI KONKRĒTU IZTEIKSMES GĒNU HETEROCISTU PROFILIEM. (Latvian)
17 August 2022
0 references
CYANOBAKTÉRIE SÚ SKUPINA FOTOSYNTETICKÝCH ORGANIZMOV PRISPÔSOBENÝCH TAKMER VŠETKÝM PROSTREDIAM. MAJÚ ZNÍŽENÉ VÝŽIVOVÉ POŽIADAVKY A SÚ VŠESTRANNÉ A ĽAHKO SA PRISPÔSOBUJÚ ZMENÁM VO SVETLE, DOSTUPNOSTI ŽIVÍN ATĎ., VLÁKNOVÉ CYANOBAKTÉRIE PATRIA MEDZI NIEKOĽKO PROKARYOTOV, KTORÉ VYKONÁVAJÚ PROCESY DIFERENCIÁCIE BUNIEK VEDÚCE K PRISPÔSOBENIU SA NUTRIČNÉMU ALEBO ENVIRONMENTÁLNEMU STRESU. Tieto procesy sú založené na stabilizácii geneticky rozlíšených expresívnych PATRONS, na okázaniach, ktoré spočívajú na špekulatívnych výrobkoch._x000D_ _x000D_ V našej LABORATORY nás zaujíma odpoveď CIANOBACTERIAS na Nutricional carence of NITROGENO, že INCLUDE diferenciácia heterocystov (typ celula SPECIALISED IN THE FIJATION OF the atmosférické NITROGEN) a že analyzujeme z pohľadu možnej IMPLIKÁCIE regulátorov. POUŽÍVAME AKO MODELOVÝ ORGANIZMUS NOSTOC SP. PCC 7120, CYANOBAKTÉRIE, PRE KTORÉ UŽ MÁME GLOBÁLNU TRANSCRIPTOMICA ANALÝZU POMOCOU RNASEQ. Od SIMILAR DO POZORENÝCH PRE Iné baktérie, APPLIKÁCIA tejto metodológie na CYANNOBACTERIASOVÝ PRÍSLUŠNÝ PRÍSLUŠENSKÝ PRÍSLUŠENSTVO, malý RNAS (sRNA) AS prepísaný ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D___x000D___x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR je riadený NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. V RÁMCI NÁŠHO SÚČASNÉHO PROJEKTU (BFU2013 – 48282-C2 – 1-P) SME BOLI SCHOPNÍ IDENTIFIKOVAŤ NIEKOĽKO SRNA, KTORÝCH PREPIS ZÁVISÍ OD NTCA A BOLI SME SCHOPNÍ PREUKÁZAŤ, ŽE JEDEN Z NICH, NSIR4, SA PODIEĽA NA KOHERENTNOM OKRUHU (FEED FORWARD LOOP) ZMIEŠANEJ REGULÁCIE (PREPISNEJ A POST-PREPISNEJ), KTORÁ PÔSOBÍ AKO SPROSTREDKOVATEĽ NTCA V REGULÁCII GLUTAMÍN SYNTETÁZY. V tomto návrhu budeme pokračovať v definovaní POSSIBLE funcions FOR NSIR4 a budeme tiež analyzovať potenciálnu IMPLEMENTÁCU novej SRNA identifikovanej v našej skupine, NSRR1, v STABILITY/degration fytobilizómov, exkluzívnych PROTEIC COMPLEMENTS OF CYNOBACTERIAS AND ROJAS._x000D_ _x000D_ Rozlišovanie heterocyst, ktoré sú stále prezentované v reakcii na NITROGEN DEFICIT a ULTIMAL instancy je kontrolovaná NTCA, implementuje SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAM heterocysty, ktoré sú regulované HETR. PRETO SME PREDPOKLADALI, ŽE SRNA REGULOVANÉ HETR BY MOHLI BYŤ ZAPOJENÉ DO DIFERENCIÁCIE. TENTO NÁVRH ZAHŔŇA ŠTÚDIU DVOCH SRNA, KTORÉ SME UKÁZALI AKO PREPÍSANÉ VÝLUČNE V HETEROCYSTOCH (NSIR1 A NSIR8). NSIR1 je VERY TEMPRANOUS MARCADER ZDRAVÝCH VÝCHODNÝCH VÝCHODOV._x000D_ _x000D_ Dôvody STUDY DETAILED NARIADENIA NARIADENÝCH SLUŽIEB, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL approaches EXPLORATORY IN TWO DIRECCIONS. NA JEDNEJ STRANE VYKONÁME AUTOMATIZOVANÉ PREDPOVEDE MOŽNÝCH CIEĽOV VŠETKÝCH SRNA (CELKOVO 327) IDENTIFIKOVANÝCH ALGORITMOM IMPLEMENTOVANÝM V NAŠOM SÚČASNOM PROJEKTE. NIEKTORÉ Z TÝCHTO SRNA SÚ OBMEDZENÉ NA GENÓMY KMEŇOV TVORIACICH HETEROCYST, TAKŽE ICH FUNKCIA BY MOHLA BYŤ SPOJENÁ S TÝMTO PROCESOM. NA DRUHEJ STRANE, NA ZÁKLADE HYBRIDIZAČNÝCH ÚDAJOV Z MIKROARRAY NAVRHNUTÝCH V SÚČASNOM PROJEKTE, BUDEME BUDOVAŤ KOEXPRESNÉ SIETE NA IDENTIFIKÁCIU ANTISENSE PREPISOV S EXPRESNÝMI PROFILMI PODOBNÝMI ŠPECIFICKÝM EXPRESNÝM GÉNOM V HETEROCYSTOCH. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS GRÚPA ORGÁNACH FÓTAISINTÉISEACH IAD CYANOBACTERIA ATÁ OIRIÚNAITHE DO BHEAGNACH GACH TIMPEALLACHT. TÁ LAGHDÚ TAGTHA AR RIACHTANAIS CHOTHAITHEACHA AGUS TÁ SIAD SOLÚBTHA AGUS INOIRIÚNAITHE GO HÉASCA D’ATHRUITHE I BHFIANAISE, INFHAIGHTEACHT COTHAITHEACH, ETC., TÁ CIANOBACTERIA FHILIMÉADACH I MEASC AN BHEAGÁN PRÓCARÓIT A DHÉANANN PRÓISIS DIFREÁLA CILLE AS A DTIOCFAIDH OIRIÚNÚ DO STRUS COTHAITHEACH NÓ COMHSHAOIL. Tá na próisis seo bunaithe ar chobhsú PATRONS atá léirithe go géiniteach, AR ocasions restring LE CELLS SPECIFIC I FILAMENTS._x000D_ _x000D_ IN AIRT LABORATORY tá suim againn i bhfreagra na CIANOBACTERIAS ar an carence nutricional of NITROGENO, go bhfuil idirdhealú INCLUDE de heterocysts (cineál Celula SPEISIALTA I FIJATION an NITROGEN atmaisféarach) agus go bhfuil muid ag déanamh anailíse ó thaobh an IMPLICATION Féideartha rialtóirí. BAINIMID ÚSÁID AS MAR ORGÁNACH MÚNLA NOSTOC SP. PCC 7120, A CYANOBACTERIA A BHFUIL ANAILÍS TRANSCRIPTOMICA DOMHANDA AGAINN CHEANA FÉIN AG BAINT ÚSÁIDE AS RNASEQ. Ó SIMILAR to the OBSERVED FOR Other BACTERIAS, AN tIarratas a rinneadh ar an meitéareolaíochta seo chun CYANNOBACTERIAS Athbheochan Ó PRESANCE __x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D_ x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D FAOI CHUIMSIÚ ÁR DTIONSCADAIL REATHA (BFU2013-48282-C2-1-P) BHÍOMAR IN ANN ROINNT SRNAS A BHFUIL A DTRAS-SCRÍOBH AG BRATH AR NTCA A SHAINAITHINT AGUS BHÍOMAR IN ANN A LÉIRIÚ GO NGLACANN DUINE ACU, NSIR4, PÁIRT I GCIORCAD COMHLEANÚNACH (LÚB CHUN TOSAIGH BEATHA) DE RIALACHÁN MEASCTHA (TRAS-TRAS-SCRÍBHINN AGUS IAR-THRASSCRÍOBH), AG GNÍOMHÚ MAR IDIRGHABHÁLAÍ DE NTCA I RIALACHÁN GLUTAMINE SYNTHETASE. Sa togra seo leanfaimid ar aghaidh ag sainmhíniú funcions POSSIBLE DO NSIR4 agus déanfaimid anailís freisin ar an IMPLEMENTATION féideartha SRNA aitheanta nua I OUR GROUP, NSRR1, I STABILITY/degration of phycobilisomas, comhlánaítear proteic eisiacha CYYNOBACTERIAS AGUS ROJAS._x000D_ _x000D_ Difríocht na heitreach, a chuirtear i láthair fós mar fhreagra ar an DEFICIT NITROGEN agus i dtosaíocht ULTIMAL á rialú ag NTCA, IMPLEMENTES A PROGRAMME SPEISIALTA SPEISIALTA NA heterocysts atá rialaithe ag HETR. DÁ BHRÍ SIN, CHUIREAMAR IN IÚL GO BHFÉADFADH BAINT A BHEITH AG SRNAS ARNA RIALÚ AG HETR LE DIFREÁIL. ÁIRÍTEAR SA TOGRA SEO STAIDÉAR AR DHÁ SRNA A LÉIRIGH MUID A BHEITH TRAS-SCRÍOFA GO HEISIACH SNA HETEROCYSTS (NSIR1 AGUS NSIR8). _X000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_demas of the STUDY atá faoi stiúir an Rialacháin MEDIATED Ó SEIRBHÍSÍ MAIDIR LE SEIRBHÍSÍ MAIDIR LE CABO STIÚRTHÓIREACHT I RÉIGIÚNACH. AR THAOBH AMHÁIN, DÉANFAIMID RÉAMH-MHEASTACHÁIN UATHOIBRITHE AR SPRIOCANNA FÉIDEARTHA NA SRNANNA UILE (IOMLÁN 327) A SAINAITHNÍODH LEIS AN ALGARTAM A CUIREADH CHUN FEIDHME INÁR DTIONSCADAL REATHA. TÁ ROINNT DE NA SRNANNA SIN TEORANTA DO GHÉANÓIM DE THRÉITHCHINEÁLACHA FOIRMITHE HEITREAICÍTÍ, AGUS DÁ BHRÍ SIN D’FHÉADFAÍ A BHFEIDHM A NASCADH LEIS AN BPRÓISEAS SIN. AR AN TAOBH EILE, BUNAITHE AR SHONRAÍ HIBRIDITHE NA MICROARRAYS ATÁ DEARTHA SA TIONSCADAL REATHA, TÓGFAIMID LÍONRAÍ COMHLÉIRITHE CHUN TRAS-SCRÍBHINNÍ ANTISENSE A SHAINAITHINT LE PRÓIFÍLÍ LÉIRITHE COSÚIL LE PRÓIFÍLÍ LÉIRITHE SONRACHA SNA HETEROCYSTS. (Irish)
17 August 2022
0 references
SINIC JSOU SKUPINA FOTOSYNTETICKÝCH ORGANISMŮ PŘIZPŮSOBENÝCH TÉMĚŘ VŠEM PROSTŘEDÍM. MAJÍ NIŽŠÍ NUTRIČNÍ POŽADAVKY A JSOU UNIVERZÁLNÍ A SNADNO PŘIZPŮSOBITELNÉ ZMĚNÁM VE SVĚTLE, DOSTUPNOSTI ŽIVIN ATD., VLÁKNITÉ SINICE PATŘÍ MEZI NĚKOLIK MÁLO PROKARYOTŮ, KTERÉ PROVÁDĚJÍ PROCESY DIFERENCIACE BUNĚK VEDOUCÍ K PŘIZPŮSOBENÍ SE NUTRIČNÍMU NEBO ENVIRONMENTÁLNÍMU STRESU. Tyto procesy jsou založeny na stabilizaci geneticky-diferenciálně expresivních PATRONS, NA ocasions restring to SPECIFICIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ V naší LABORATORIE máme zájem o odpověď CIANOBACTERIAS na Nutricional carence of NITROGENO, že INCLUDE diferenciace heterocystů (typ celula SPECIALISED IN THE FIJATION atmosférické NITROGEN) a že analyzujeme z hlediska možné IMPLICATION regulátorů. POUŽÍVÁME JAKO VZOROVÝ ORGANISMUS NOSTOC SP. PCC 7120, SINIC, PRO KTERÉ JIŽ MÁME GLOBÁLNÍ ANALÝZU TRANSCRIPTOMICA POMOCÍ RNASEQ. Od SIMILARu k OBSERVED pro jiné bakterie, PŘIHLÁŠENÍ této metodologie KYANNOBACTERIÁLNÍ PŘÍPRAVU přepsaného nekódování, malé RNAS (sRNA) AS přepsal ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR je kontrolován podnikem NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. V RÁMCI NAŠEHO SOUČASNÉHO PROJEKTU (BFU2013–48282-C2–1-P) JSME BYLI SCHOPNI IDENTIFIKOVAT NĚKOLIK SRNA, JEJICHŽ TRANSKRIPCE ZÁVISÍ NA NTCA A DOKÁZALI JSME PROKÁZAT, ŽE JEDEN Z NICH, NSIR4, SE PODÍLÍ NA KOHERENTNÍM OKRUHU (FEED FORWARD LOOP) SMÍŠENÉ REGULACE (PŘEPIS A POST-PŘEPIS), KTERÝ PŮSOBÍ JAKO PROSTŘEDNÍK NTCA V REGULACI GLUTAMIN SYNTETÁZY. V tomto návrhu budeme pokračovat v definování POSSIBLE funcions pro NSIR4 a budeme také analyzovat potenciální IMPLEMENTACE nového SRNA identifikovaného v naší GROUP, NSRR1, V STABILITY/degration fycobilisomas, exkluzivní PROTEICKÉ SPOLEČENSTVÍ A ROJAS._x000D_ _x000D_ Rozlišení heterocystů, které jsou stále prezentovány v reakci na NITROGEN DEFICIT a v ULTIMAL instancy je kontrolována NTCA, implementuje SPECIFICKÝ TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMU heterocystů, které jsou regulovány HETR. PROTO JSME PŘEDPOKLÁDALI, ŽE DO DIFERENCIACE MOHOU BÝT ZAPOJENY SRNA REGULOVANÉ HETR. TENTO NÁVRH ZAHRNUJE STUDII DVOU SRNA, U NICHŽ SE UKÁZALO, ŽE JSOU PŘEPISOVÁNY VÝHRADNĚ V HETEROCYTECH (NSIR1 A NSIR8). NSIR1 je velmi TEMPRANOUS MARCADER CELLS, které zahrnují vaše DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Ademas of the STUDY DETAILED of the Regulation MEDIATEDY by the zapravené služby, LLEVAREMOS to CABO COMPUTATIONAL approach EXPLORATORY IN TWO DIRECCIONS. NA JEDNÉ STRANĚ PROVEDEME AUTOMATIZOVANÉ PŘEDPOVĚDI MOŽNÝCH CÍLŮ VŠECH SRNA (CELKEM 327) IDENTIFIKOVANÝCH ALGORITMEM IMPLEMENTOVANÝM V NAŠEM AKTUÁLNÍM PROJEKTU. NĚKTERÉ Z TĚCHTO SRNA JSOU OMEZENY NA GENOMY KMENŮ TVOŘÍCÍCH HETEROCYST, TAKŽE JEJICH FUNKCE BY MOHLA BÝT SPOJENA S TÍMTO PROCESEM. NA DRUHÉ STRANĚ, NA ZÁKLADĚ HYBRIDIZAČNÍCH DAT MIKROARRAYS NAVRŽENÝCH V SOUČASNÉM PROJEKTU, BUDEME BUDOVAT KOEXPRESNÍ SÍTĚ K IDENTIFIKACI ANTISENSE TRANSKRIPTŮ S EXPRESNÍMI PROFILY PODOBNÝCH PROFILŮM SPECIFICKÝCH EXPRESE GENŮ HETEROCYSTŮ. (Czech)
17 August 2022
0 references
A CYANOBACTERIA É UM GRUPO DE ORGANISMOS FOTOSSINTÉTICOS ADAPTADOS A QUASE TODOS OS AMBIENTES. REDUZIRAM REQUISITOS NUTRICIONAIS E SÃO VERSÁVEIS E FÁCILMENTE ADAPTÁVEIS A ALTERAÇÕES À LUZ, A DISPONIBILIDADE DE NUTRIENTES, ETC., A CIANOBACTERIA FILAMENTAR ENTRE OS Pouquíssimos PROKARYOTES QUE REALIZAM PROCESSOS DE DIFERENCIAÇÃO CELULAR QUE LEVAM À ADAPTAÇÃO À STRESSA NUTRICIONAL OU AMBIENTAL. Estes processos baseiam-se na estabilização de PATRONS geneticamente expressivos, EM OCAÇÕES QUE RESTREM CÉLULAS ESPECÍFICAS EM FILAMENTOS._x000D_ _x000D_ EM NOSSO LABORATÓRIO estamos interessados na resposta das CIANOBACTERIAS à CARENÇA NUTRICIONAL DE NITROGENO, que INCLUI A DIFERENCIAÇÃO DE heterocistos (um tipo de CELULA ESPECIALIZADO NA FIJAÇÃO DO NITROGÉNIO atmosférico) e que estamos a analisar sob a perspectiva da Possível IMPLICAÇÃO DE REGULATORES. Usamos como um modelo de Organismo NOSTOC SP. PCC 7120, CIANOBACTERIA PARA A QUAL JÁ TEMOS UMA ANÁLISE GLOBAL TRANSCRIPTÓMICA COM O RNASEQ. DE SIMILAR ÀS OBSERVADAS PARA OUTRAS BACTERIAS, A APLICAÇÃO DESTA METODOLOGIA A CYANNOBACTERIAS REVISÃO A PRESENÇA DE não codificação transcrita, pequenos RNAS (sRNAs) como transcritos ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ o REGULAMENTADOR TRANSCRIPCIONAL NTCA é controlado pelo REGULAMENTADOR TRANSCRIPCIONAL NTCA. No âmbito do nosso actual projecto (BFU2013-48282-C2-1-P) fomos capazes de identificar vários SRNAS cuja TRANSCRIPÇÃO depende da NTCA e fomos capazes de demonstrar que um deles, NSIR4, participa num circuito coerente (alimentado para a frente) de regulação mista (transcricional e pós-transcricional), actuando como intermediário da NTCA na regulação da sintase da glutamina. Na presente proposta continuaremos a definir FUNÇÕES POSSÍVEIS PARA NSIR4 e analisaremos também a potencial IMPLEMENTAÇÃO de um novo SRNA IDENTIFICADO NO NOSSO GRUPO, NSRR1, NA ESTABILIDADE/Degração de phycobilisomas, COMPLEMENTOS PROTEICOS exclusivos DE CYNOBACTERIAS E ROJAS._x000D_ _x000D_ A DIFERENCIAÇÃO DE heterocistos, que ainda são apresentados em resposta ao DEFICITO DE ATROGÉNIO e na INSTÂNCIA ULTIMAL é controlada pela NTCA, IMPLEMENTA UM PROGRAMA ESPECÍFICO TRANSCRICIONAL DOS heterocistos que são regulados por HETR. Portanto, hipotetizamos que o SRNAS regulado pelo HETR possa ser envolvido na diferenciação. Esta proposta inclui o estudo de dois RNs que mostrámos serem transcritos de forma exclusiva nos HETEROCISTAS (NSIR1 e NSIR8). O NSIR1 é um MARCADOR MUITO TEMPRANOSO DAS CÉLULAS, INCLUINDO A SUA DIFERENCIALIZAÇÃO._x000D_ _x000D_ ADEMAS DO ESTUDO DETALHADO DO REGULAMENTO MEDIADO PELOS SERVIÇOS MENDIDOS, LLEVAREMOS À EXPLORATÓRIA DA COMPUTAÇÃO CABO EM DUAS DIRECTÕES. Por um lado, realizaremos previsões automatizadas dos possíveis objectivos de todos os SRNAS (um total de 327) identificados com o algoritmo implementado no nosso actual projecto. Vários destes SRNAS estão limitados a genes de estirpes formadoras de HETEROCISTAS, pelo que a sua função pode estar ligada a este processo. Por outro lado, com base nos dados de hibridação dos microarregios concebidos no actual projecto, construiremos redes de co-expressão para identificar as transmissões de anti-anti-sons com perfis de expressão semelhantes aos dos genes de expressão específicos nos heterOCISTAS. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
TSÜANOBAKTERID ON RÜHM FOTOSÜNTEETILISI ORGANISME, MIS ON KOHANDATUD PEAAEGU KÕIGIS KESKKONDADES. NEIL ON VÄHENENUD TOITUMISVAJADUSED NING NEED ON MITMEKÜLGSED JA KERGESTI KOHANDATAVAD VALGUSE, TOITAINETE KÄTTESAADAVUSE JNE MUUTUSTEGA, HÕÕGNIIDI TSÜANOBAKTERID KUULUVAD VÄHESTE PROKARÜOOTIDE HULKA, MIS VIIVAD LÄBI RAKKUDE DIFERENTSEERIMISE PROTSESSE, MIS VIIVAD TOITUMIS- VÕI KESKKONNASTRESSIGA KOHANEMISENI. Need protsessid põhinevad geneetiliselt diferentsiaalselt ekspressiivsete PATRONSide stabiliseerimisel, mis on seotud SPETSIFIKATSIOONID FILAMENTS._x000D_ _x000D_ IN OUR LABORATORY, oleme huvitatud CIANOBACTERIASe vastusest NITROGENO Nutricional carence of NITROGENO, et INCLUDE eristamine heterotsüstide (teatud tüüpi celula SPETSIALISED atmosfääri NITROGENi FIJATION) ja et me analüüsime seisukohast võimalik IMPLICATION regulaatorid. ME KASUTAME NOSTOC SP MUDELORGANISMINA. PCC 7120, TSÜANOBAKTERID, MILLE KOHTA ON JUBA OLEMAS ÜLEMAAILMNE TRANSCRIPTOMICA ANALÜÜS RNASEQI ABIL. Teiste bakterite SIMILAR’I TEADMISEKS metodoloogia TYANNOBACTERIASE KOHUSTUSED transkribeeritud mittekodeerimise, väikeste RNASide (sRNAd) AS transkribeeritud ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATORi kontrollib NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. MEIE PRAEGUSE PROJEKTI (BFU2013–48282-C2–1-P) RAAMES OLEME SUUTNUD TUVASTADA MITU SRNA-D, MILLE TRANSKRIPTSIOON SÕLTUB NTCA-ST, NING OLEME SUUTNUD NÄIDATA, ET ÜKS NEIST, NSIR4, OSALEB SEGAMÄÄRUSE (TRANSKRIPTSIONAALNE JA POST-TRANSKRIPTSIONAALNE) SIDUSAS AHELAS (ETTEPOOLE SUUNATUD RING), TEGUTSEDES GLUTAMIINI SÜNTETAASI MÄÄRUSES NTCA VAHENDAJANA. Käesolevas ettepanekus määratleme jätkuvalt POSSIBLE funcions FOR NSIR4 ja analüüsime ka uue SRNA võimalikku rakendamist meie GROUPis NSRR1, STABILITYS/fükobilisoomide degration, eksklusiivsete CYYNOBACTERIASe ja ROJAS._x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_ heterotsüstide eristamine, mis on endiselt esitatud vastuseks NITROGEN DEFICIT ja ULTIMAL instancy on NTCA, rakendab SPETSIFIKATSIOON TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMME heterotsüstid, mis on reguleeritud HETR. SEETÕTTU ARVASIME, ET HETRI REGULEERITUD SRNAD VÕIVAD OLLA SEOTUD DIFERENTSEERIMISEGA. KÄESOLEV ETTEPANEK HÕLMAB UURINGUT KAHE SRNA KOHTA, MILLE ME OLEME TÕESTANUD, ET NEID TRANSKRIBEERITAKSE AINULT HETEROTSÜSTIDES (NSIR1 JA NSIR8). NSIR1 VERY TEMPRANOUS MARCADER of the CELLS INCLUDING oma DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Ademad of the STUDY DETAILED of the Regulation MEDIATED BY MERVICES, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL lähenemisviisid EXPLORATORY IN TWO DIREKTSIOONID. ÜHEST KÜLJEST TEOSTAME AUTOMAATSEID PROGNOOSE KÕIGI SRNADE (KOKKU 327) VÕIMALIKE SIHTMÄRKIDE KOHTA, MIS ON IDENTIFITSEERITUD MEIE PRAEGUSES PROJEKTIS RAKENDATUD ALGORITMIGA. MITMED NEIST SRNA-DEST PIIRDUVAD HETEROCYSTI MOODUSTAVATE TÜVEDE GENOOMIDEGA, NII ET NENDE FUNKTSIOON VÕIB OLLA SEOTUD SELLE PROTSESSIGA. TEISEST KÜLJEST, TUGINEDES PRAEGUSES PROJEKTIS KAVANDATUD MIKROARRAYDE HÜBRIDISATSIOONIANDMETELE, EHITAME ME KAASEKSPRESSIOONIVÕRGUSTIKUD, ET TUVASTADA ANTISENSE TRANSKRIPTE, MILLE EKSPRESSIOONIPROFIILID SARNANEVAD SPETSIIFILISTE EKSPRESSIOONGEENIDE OMADELE HETEROTSÜSTIDES. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A CIANOBAKTÉRIUMOK SZINTE MINDEN KÖRNYEZETHEZ IGAZODÓ FOTOSZINTETIKUS ORGANIZMUSOK CSOPORTJA. CSÖKKENTETT TÁPLÁLKOZÁSI IGÉNYÜK VAN, SOKOLDALÚAK ÉS KÖNNYEN ALKALMAZKODHATNAK A FÉNYBEN, A TÁPANYAGOK RENDELKEZÉSRE ÁLLÁSÁBAN STB. BEKÖVETKEZŐ VÁLTOZÁSOKHOZ, A ROSTOS CIANOBAKTÉRIUMOK AZON KEVÉS PROKARIÓTÁK KÖZÉ TARTOZNAK, AMELYEK SEJTDIFFERENCIÁLÓ FOLYAMATOKAT VÉGEZNEK, AMI TÁPLÁLKOZÁSI VAGY KÖRNYEZETI STRESSZHEZ VEZET. Ezek a folyamatok alapja a stabilizáló genetikailag kifejező PATRONS, Ocasions nyugszik SPECIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ A LABORATORY Mi érdekel a válasz a CIANOBACTERIAS a táplálkozási carence of NITROGENO, hogy INCLUDE különbség heterociszták (egy típusú celula SPECIALISED A FIJÁCIÓK atmoszférikus NITROGEN) és hogy a szabályozók lehetséges IMPLICATION-jának szemszögéből vizsgáljuk. NOSTOC SP MODELLKÉNT HASZNÁLJUK. PCC 7120, EGY CIANOBAKTÉRIUM, AMELYRE MÁR VAN EGY GLOBÁLIS TRANSCRIPTOMICA ANALÍZISÜNK RNSSEQ-ET HASZNÁLVA. Az egyéb baktériumok számára létrehozott SIMILAR-tól A metalógiának a transzkriptált nem kódoló, kis RNS-ek (sRNS-ek) átírása során a CYANNOBACTERIAS VIZSGÁLATI KÖVETELMEZÉSÉNEK MEGÁLLAPODÁSA._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___ a NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR a NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR irányítása alatt áll. JELENLEGI PROJEKTÜNK (BFU2013–48282-C2–1-P) KERETÉBEN TÖBB OLYAN SRNS-T AZONOSÍTOTTUNK, AMELYEK ÁTÍRÁSA A NTCA-TÓL FÜGG, ÉS BIZONYÍTANI TUDTUK, HOGY EGYIKÜK, AZ NSIR4 RÉSZT VESZ A VEGYES SZABÁLYOZÁS (TRANSCRIPTIONAL ÉS POSZTTRANSCRIPTIONAL) ÖSSZEFÜGGŐ KÖRÉBEN (TRANSCRIPTIONAL ÉS POST-TRANSCRIPTIONAL), AMELY A GLUTAMIN-SZINTETÁZ SZABÁLYOZÁSÁBAN AZ NTCA KÖZVETÍTŐJEKÉNT MŰKÖDIK. Ebben a javaslatban továbbra is meghatározzuk az NSIR4-re vonatkozó POSSIBLE Funcions-okat, és elemezzük az új SRNS lehetséges megvalósítását a csoportunkban, NSRR1-ben, A phycobilisomák sztábolitikájában/diegrációjában, a CYNOBACTERIAS ÉS ROJAS exkluzív PROTEIC COMPLEMENTS-ét._x000D_ _x000D_ A heterociszták különbsége, amelyek továbbra is a NITROGEN DEFICIT válaszában és az ULTIMAL instancyben a NTCA ellenőrzése alatt állnak, a HETR által szabályozott heterociszták SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAM-ját valósítják meg. EZÉRT AZT FELTÉTELEZTÜK, HOGY A HETR ÁLTAL SZABÁLYOZOTT SRNS-EK SZEREPET JÁTSZHATNAK A DIFFERENCIÁLÁSBAN. EZ A JAVASLAT KÉT SRNS TANULMÁNYÁT TARTALMAZZA, AMELYEKRŐL BEBIZONYOSODOTT, HOGY KIZÁRÓLAG A HETEROCISZTÁKBAN (NSIR1 ÉS NSIR8) VANNAK ÁTÍRVA. Az NSIR1 a módosított SZOLGÁLTATÁSOK MEGJEGYZÉSÉNEK TEMPRANOUS MARCADERJE, amely a módosított SZOLGÁLTATÁSOK alapján MEGÁLLAPÍTOTT RENDELETRE VONATKOZÓ MEGJEGYZÉSEKRE VONATKOZÓ SZERZŐDÉSEKRE VONATKOZÓ MEGJEGYZÉSEKRE VONATKOZÓ TERMÉKEKRE VONATKOZÓK. EGYRÉSZT AUTOMATIZÁLT ELŐREJELZÉSEKET KÉSZÍTÜNK A JELENLEGI PROJEKTÜNKBEN VÉGREHAJTOTT ALGORITMUSSAL AZONOSÍTOTT ÖSSZES SRNS LEHETSÉGES CÉLPONTJÁRÓL (ÖSSZESEN 327). EZEN SRNS-EK KÖZÜL TÖBB A HETEROCYST-KÉPZŐ TÖRZSEK GENOMJAIRA KORLÁTOZÓDIK, ÍGY FUNKCIÓJUK KAPCSOLÓDHAT EHHEZ A FOLYAMATHOZ. MÁSRÉSZT A JELENLEGI PROJEKTBEN TERVEZETT MIKROARRAYEK HIBRIDIZÁCIÓS ADATAI ALAPJÁN TÁRSKIFEJEZÉSI HÁLÓZATOKAT ÉPÍTÜNK A HETEROCISZTÁK SPECIFIKUS EXPRESSZIÓS GÉNJEIHEZ HASONLÓ EXPRESSZIÓS PROFILOKKAL RENDELKEZŐ ANTISENSE TRANSZKRIPTOK AZONOSÍTÁSÁRA. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ЦИАНОБАКТЕРИИТЕ СА ГРУПА ФОТОСИНТЕТИЧНИ ОРГАНИЗМИ, АДАПТИРАНИ КЪМ ПОЧТИ ВСИЧКИ СРЕДИ. ТЕ ИМАТ НАМАЛЕНИ ХРАНИТЕЛНИ ПОТРЕБНОСТИ И СА ГЪВКАВИ И ЛЕСНО ПРИСПОСОБИМИ КЪМ ПРОМЕНИТЕ В СВЕТЛИНАТА, НАЛИЧИЕТО НА ХРАНИТЕЛНИ ВЕЩЕСТВА И Т.Н., НИШКОВИДНИТЕ ЦИАНОБАКТЕРИИ СА СРЕД МАЛКОТО ПРОКАРИОТИ, КОИТО ИЗВЪРШВАТ ПРОЦЕСИ НА КЛЕТЪЧНА ДИФЕРЕНЦИАЦИЯ, ВОДЕЩИ ДО АДАПТИРАНЕ КЪМ ХРАНИТЕЛНИЯ СТРЕС ИЛИ СТРЕСА НА ОКОЛНАТА СРЕДА. Тези процеси се основават на стабилизирането на генетично-диференциално експресивните патрони, за случаите, при които се възобновява СПЕЦИФИЧНИТЕ ЦЕЛИ В FILAMENTS._x000D_ _x000D_ В нашата LABORATORY се интересуваме от отговора на CIANOBACTERIAS на Nutricional carence OF NITROGENO, тази разлика между хетероцистите (вид целула СПЕЦИАЛЕН във ФИЯЦИЯТА на атмосферните нитрогени) и че ние анализираме от гледна точка на възможната ИМПЛИКАЦИЯ на регулаторите. НИЕ ИЗПОЛЗВАМЕ КАТО NOSTOC SP МОДЕЛ ОРГАНИЗЪМ. PCC 7120, ЦИАНОБАКТЕРИИ, ЗА КОИТО ВЕЧЕ ИМАМЕ ГЛОБАЛЕН АНАЛИЗ TRANSCRIPTOMICA, ИЗПОЛЗВАЩ RNASEQ. От SIMILAR до OBSERVED за други бактерии, ПРИЛОЖЕНИЕТО НА ТОЗИ методология до CYANNOBACTERIAS ПРЕЗ ПРЕДСТАВЯНЕТО на транскрибираните некодирани малки РНК (РНК), които транскрибират ANTISENTIDO._x000D__x000D___x000D_x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D___x000D_x000D___x000D_x000D_x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D__x000D_x000D__x000D__x000D___x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000 г. NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR се контролира от NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. В РАМКИТЕ НА НАСТОЯЩИЯ НИ ПРОЕКТ (BFU2013—48282-C2—1-P) УСПЯХМЕ ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ НЯКОЛКО SRNAS, ЧИЯТО ТРАНСКРИПЦИЯ ЗАВИСИ ОТ NTCA И УСПЯХМЕ ДА ДОКАЖЕМ, ЧЕ ЕДИН ОТ ТЯХ, NSIR4, УЧАСТВА В КОХЕРЕНТНА ВЕРИГА (ЗАХРАНВАНЕ НАПРЕД КОНТУР) НА СМЕСЕНА РЕГУЛАЦИЯ (ТРАНСКРИПЦИЯ И ПОСТТРАНСКРИПЦИЯ), ДЕЙСТВАЩА КАТО ПОСРЕДНИК НА NTCA В РЕГЛАМЕНТА ЗА ГЛУТАМИН СИНТЕТАЗА. В настоящото предложение ще продължим да определяме POSSIBLE funcions FOR NSIR4 и също така ще анализираме потенциалната ИЗПЪЛНЕНИЕ на нова SRNA, идентифицирана в нашата ГРУП, NSRR1, В СТАБИЛНОСТта/дегустацията на физикобилизомите, изключителни ПРОТЕИКОВИ КОМПЛЕНТИ НА СИНОБАКТЕРИИ И ROJAS._x000D_ _x000D_ диференциация на хетероцистите, които все още са представени в отговор на NITROGEN DEFICIT и в ULTIMAL Инстанцията се контролира от NTCA, изпълнява СПЕЦИФИЧНА ПРЕХОДНА ПРОГРАМА НА хетероцистите, които се регулират от HETR. ЕТО ЗАЩО НИЕ ПРЕДПОЛОЖИХМЕ, ЧЕ SRNAS, РЕГУЛИРАНИ ОТ HETR, МОГАТ ДА УЧАСТВАТ В ДИФЕРЕНЦИАЦИЯТА. НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ ВКЛЮЧВА ПРОУЧВАНЕ НА ДВЕ SRNAS, ЗА КОИТО ПОКАЗАХМЕ, ЧЕ СА ТРАНСКРИБИРАНИ ИЗКЛЮЧИТЕЛНО В ХЕТЕРОЦИСТИТЕ (NSIR1 И NSIR8). NSIR1 е много TEMPRANOUS MARCADER OF THE CELLS InCLUDING Your DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Ademas OF THE STUDY DETAILED OF THE РЕГЛАМЕНТ НА РЕГИОНАЛНИТЕ УСЛУГИ, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL approaches EXPLORATORY IN TWO DIRECCIONS. ОТ ЕДНА СТРАНА ЩЕ ИЗВЪРШИМ АВТОМАТИЗИРАНИ ПРОГНОЗИ ЗА ВЪЗМОЖНИТЕ ЦЕЛИ НА ВСИЧКИ SRNAS (ОБЩО 327), ИДЕНТИФИЦИРАНИ С АЛГОРИТЪМА, ПРИЛОЖЕН В НАСТОЯЩИЯ НИ ПРОЕКТ. НЯКОИ ОТ ТЕЗИ SRNAS СА ОГРАНИЧЕНИ ДО ГЕНОМИ НА ЩАМОВЕ, ОБРАЗУВАЩИ HETEROCYST, ТАКА ЧЕ ТЯХНАТА ФУНКЦИЯ МОЖЕ ДА БЪДЕ СВЪРЗАНА С ТОЗИ ПРОЦЕС. ОТ ДРУГА СТРАНА, ВЪЗ ОСНОВА НА ДАННИТЕ ЗА ХИБРИДИЗАЦИЯТА НА МИКРОПОДРЕДИТЕ, ПРОЕКТИРАНИ В НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ, ЩЕ ИЗГРАДИМ МРЕЖИ ЗА СЪВМЕСТНО ИЗРАЗЯВАНЕ, ЗА ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ АНТИСЕНСМИСЛЕНИТЕ ПРЕПИСИ С ЕКСПРЕСНИ ПРОФИЛИ, ПОДОБНИ НА ТЕЗИ НА СПЕЦИФИЧНИТЕ ЕКСПРЕСИОННИ ГЕНИ В ХЕТЕРОЦИСТИТЕ. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
CIANOBAKTERIJOS YRA FOTOSINTETINIŲ ORGANIZMŲ GRUPĖ, PRITAIKYTA BEVEIK VISOMS APLINKOMS. JIE TURI MAŽESNIUS MITYBOS REIKALAVIMUS IR YRA UNIVERSALŪS IR LENGVAI PRITAIKOMI ŠVIESOS POKYČIAMS, MAISTINIŲ MEDŽIAGŲ PRIEINAMUMUI IR KT., GIJINĖS CIANOBAKTERIJOS YRA VIENA IŠ NEDAUGELIO PROKARIOTŲ, KURIE ATLIEKA LĄSTELIŲ DIFERENCIACIJOS PROCESUS, KURIE PADEDA PRISITAIKYTI PRIE MITYBOS AR APLINKOS STRESO. Šie procesai yra pagrįsti genetiškai skirtingai išraiškingų PATRONS, ON ocasions, poilsio į SPECIFIC CELLS FILAMENTS._x000D_ _x000D_ _x000D_ mūsų LABORATORYJE, mes esame suinteresuoti CIANOBACTERIAS atsakymu į NITROGENO maistinį rūpestį, kad INCLUDE heterocistų (Celula tipas SPECIALISED į atmosferos NITROGENO FIJACIJA) ir kad mes analizuojame iš galimo reguliatorių IMPLICATION perspektyvos. MES NAUDOJAME KAIP NOSTOC SP MODELIO ORGANIZMĄ. PCC 7120, CIANOBAKTERIJOS, KURIOMS MES JAU TURIME PASAULINĘ TRANSCRIPTOMICA ANALIZĘ, NAUDOJANT RNRSEQ. Iš SIMILARO, skirto kitoms bakterijoms, KIANNOBAKRIJŲ TYANNOBACTERIJŲ AAPLIZAVIMAS Į transkribuojamų nekoduojamųjų, mažų RNAS (sRNR) PRESENCE, kaip transkripuotą ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___ d__x000D___x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR kontroliuoja NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. PAGAL MŪSŲ DABARTINĮ PROJEKTĄ (BFU2013–48282-C2–1-P) MES SUGEBĖJOME NUSTATYTI KELETĄ SRNR, KURIŲ TRANSKRIPCIJA PRIKLAUSO NUO NTCA, IR MES SUGEBĖJOME ĮRODYTI, KAD VIENAS IŠ JŲ, NSIR4, DALYVAUJA MIŠRIOJO REGULIAVIMO NUOSEKLIOJE GRANDINĖJE (PAŠARŲ PRIEKINĖJE KILPOJE) (TRANSCRIPTIONAL IR POST-TRANSCRIPTIONAL), VEIKDAMA KAIP NTCA TARPININKAS GLUTAMINO SINTETAZĖS REGLAMENTE. Šiame pasiūlyme mes ir toliau apibrėžsime NSIR4 POSSIBLEMENTAI, taip pat analizuosime galimą naujos SRNA atpažinimą mūsų grupėje, NSRR1, STABILITYJE/filobilizomose, išskirtiniuose CYYNOBACTERIAS IR ROJAS PROTEKINIAI COMPLEMENTAI._x000D_ _x000D_ The differentation of heterocysts, kurie vis dar pateikiami atsakant į NITROGEN DEFICIT ir ULTIMAL instancy yra kontroliuojama NTCA, įgyvendina SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAMME OF heterocistus, kuriuos reguliuoja HETR. TODĖL HIPOTEZAVOME, KAD HETR REGULIUOJAMOS SRNR GALI BŪTI ĮTRAUKTOS Į DIFERENCIACIJĄ. Į ŠĮ PASIŪLYMĄ ĮTRAUKTAS DVIEJŲ SRNR TYRIMAS, KURĮ, KAIP ĮRODYTA, TRANSKRIBUOJA TIK HETEROCISTAI (NSIR1 IR NSIR8). NSIR1 yra labai svarbus TEMPRANOJŲ PASLAUGŲJŲ PASLAUGŲJŲ PASLAUGOS._x000D_ _x000D_ REGLAMENTO PASLAUGOS PASLAUGOS PASLAUGOS, LLEVAREMOS į CABO COMPUTATIONAL Priežiūros dvidešimčiais atvejais. VIENA VERTUS, MES ATLIKSIME AUTOMATINES PROGNOZES DĖL GALIMŲ VISŲ SRNR TIKSLŲ (IŠ VISO 327), NUSTATYTŲ SU ALGORITMU, ĮGYVENDINTU MŪSŲ DABARTINIAME PROJEKTE. KAI KURIE IŠ ŠIŲ SRNR YRA TIK HETEROCYST FORMAVIMO ŠTAMŲ GENOMAI, TODĖL JŲ FUNKCIJA GALI BŪTI SUSIETA SU ŠIUO PROCESU. KITA VERTUS, REMDAMIESI DABARTINIAME PROJEKTE SUKURTŲ MIKRO MATRICŲ HIBRIDIZACIJOS DUOMENIMIS, SUKURSIME BENDROS RAIŠKOS TINKLUS, KAD NUSTATYTUME ANTISENSIŠKUS TRANSKRIPTUS SU IŠRAIŠKOS PROFILIAIS, PANAŠIAIS Į SPECIFINIUS HETEROCISTŲ IŠRAIŠKOS GENUS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
CIJANOBAKTERIJE SU SKUPINA FOTOSINTETIČKIH ORGANIZAMA PRILAGOĐENIH GOTOVO SVIM OKRUŽENJIMA. IMAJU SMANJENE PREHRAMBENE POTREBE I SVESTRANE SU I LAKO PRILAGODLJIVE PROMJENAMA U SVJETLU, DOSTUPNOSTI HRANJIVIH TVARI ITD., FILAMENTNE CIJANOBAKTERIJE SU MEĐU RIJETKIM PROKARYOTAMA KOJI PROVODE PROCESE DIFERENCIJACIJE STANICA KOJI DOVODE DO PRILAGODBE NUTRITIVNOM ILI EKOLOŠKOM STRESU. Ovi procesi temelje se na stabiliziranju genetički-diferencijalno izražajnih PATRONA, ON ocasions koji počivaju na SPECIFIC CELLS U FILAMENTS._x000D_ _x000D_ U našoj LABORATORIJI Zainteresirani smo za odgovor CIANOBACTERIAS na Nutricionalnu karence NITROGENO, da INCLUDE diferencijacija heterocista (vrsta celule SPECIALISI U FIJACIJACIJU NITROGENA) atmosferski NITROGEN) i da analiziramo iz perspektive Moguće IMPLICACIJE regulatora. KORISTIMO KAO NOSTOC SP MODEL ORGANIZMA. PCC 7120, CIJANOBAKTERIJA ZA KOJU VEĆ IMAMO GLOBALNU TRANSCRIPTOMICA ANALIZU POMOĆU RNASEQ. Od SIMILAR NA OBSERVED za druge bakterije, APPLIKACIJA OVU metodologiju za CYANNOBACTERIAS REVIEW PRESENCIJA transkribiranog nekodiranog, malih RNAS (sRNA) kao transkribirana ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D___x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR pod kontrolom je NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. U OKVIRU NAŠEG TRENUTNOG PROJEKTA (BFU2013 – 48282-C2 – 1-P) USPJELI SMO IDENTIFICIRATI NEKOLIKO SRNA ČIJA TRANSKRIPCIJA OVISI O NTCA-I I USPJELI SMO DOKAZATI DA JEDAN OD NJIH, NSIR4, SUDJELUJE U KOHERENTNOM KRUGU (FEED FORWARD LOOP) MJEŠOVITE REGULACIJE (TRANSKRIPCIJSKI I POST-TRANSKRIPCIJSKI), DJELUJUĆI KAO POSREDNIK NTCA-E U REGULACIJI GLUTAMINSKE SINTETAZE. U ovom prijedlogu nastavit ćemo definirati POSSIBLE funcions FOR NSIR4 te ćemo analizirati i potencijalnu IMPLEMENTATION novog SRNA identificiranog u našoj grupi, NSRR1, U STABILITY/degration of phycobilisomas, ekskluzivne PROTEIC COMPLEMENTS OF CYNOBACTERIAS AND ROJAS._x000D_ _x000D_ Razmjena heterocista, koji su još uvijek predstavljeni kao odgovor na NITROGEN DEFICIT i u ULTIMALnom postanku kontrolira NTCA, provodi SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAM heterocista koji su regulirani od strane HETR-a. STOGA SMO PRETPOSTAVILI DA BI SRNA-E KOJE REGULIRA HETR MOGLE BITI UKLJUČENE U DIFERENCIJACIJU. OVAJ PRIJEDLOG UKLJUČUJE STUDIJU DVIJU SRNA ZA KOJE SMO POKAZALI DA SU TRANSKRIBIRANI ISKLJUČIVO U HETEROCISTE (NSIR1 I NSIR8). NSIR1 je vrlo TEMPRANOUS MARCADER OF THE CELLS INCLUDING Svoje DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Adems of the STUDY DETALED UREDBE MEDIATED KOJI SERVICE, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL pristupi EXPLORATORY U TWO DIREKCIONS. S JEDNE STRANE, IZVRŠIT ĆEMO AUTOMATIZIRANA PREDVIĐANJA MOGUĆIH CILJEVA SVIH SRNA (UKUPNO 327) IDENTIFICIRANIH ALGORITMOM KOJI SE PROVODI U NAŠEM TRENUTAČNOM PROJEKTU. NEKOLIKO OD TIH SRNA-A OGRANIČENO JE NA GENOME SOJEVA KOJI STVARAJU HETEROCYST, TAKO DA BI NJIHOVA FUNKCIJA MOGLA BITI POVEZANA S TIM PROCESOM. S DRUGE STRANE, NA TEMELJU PODATAKA O HIBRIDIZACIJI MIKROARRAYS DIZAJNIRANIH U TRENUTNOM PROJEKTU, IZGRADIT ĆEMO KO-IZRAŽAJNE MREŽE KAKO BISMO IDENTIFICIRALI TRANSKRIPTE ANTISENSE S PROFILIMA IZRAŽAVANJA SLIČNIM ONIMA SPECIFIČNIH EKSPRESIJSKIH GENA U HETEROCISTIMA. (Croatian)
17 August 2022
0 references
CYANOBAKTERIER ÄR EN GRUPP FOTOSYNTETISKA ORGANISMER ANPASSADE TILL NÄSTAN ALLA MILJÖER. DE HAR MINSKAT NÄRINGSBEHOVET OCH ÄR MÅNGSIDIGA OCH LÄTT ANPASSNINGSBARA TILL LJUSFÖRÄNDRINGAR, TILLGÅNG TILL NÄRINGSÄMNEN ETC., FILAMENTLIKNANDE CYANOBAKTERIER ÄR BLAND DE FÅ PROKARYOTER SOM UTFÖR CELLDIFFERENTIERINGSPROCESSER SOM LEDER TILL ANPASSNING TILL NÄRINGS- ELLER MILJÖPÅFRESTNINGAR. Dessa processer är baserade på stabilisering av genetiskt-differentialt uttrycksfulla PATRONS, PÅ ocasions vilande till SPECIFIC CELLS I FILAMENTS._x000D_ _x000D_ I VÅRA LABORATORY vi är intresserade av svaret från CIANOBACTERIAS till Nutricional karensen av NITROGENO, att INCLUDE differentiering av heterocysts (en typ av celula SPECIALISED I FIJATION AV den atmosfäriska NITROGEN) och att vi analyserar ur perspektivet Posible IMPLICATION OF regulators. VI ANVÄNDER OSS AV EN NOSTOC SP-MODELLORGANISM. PCC 7120, EN CYANOBAKTERIER FÖR VILKEN VI REDAN HAR EN GLOBAL TRANSCRIPTOMICA-ANALYS MED RNASEQ. Från SIMILAR till OBSERVEDAT FÖR andra bakterier, APPLICATION AV DETTA metodologi för att CYANNOBACTERIAS UPPREPAR PRESENCE OF transcribed non-coding, små RNAS (sRNAs) AS transcribed ANTISENTIDO._x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D___x000D___x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000 NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR kontrolleras av NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. INOM RAMEN FÖR VÅRT PÅGÅENDE PROJEKT (BFU2013–48282-C2–1-P) HAR VI KUNNAT IDENTIFIERA FLERA SRNAS VARS TRANSKRIPTION BEROR PÅ NTCA OCH VI HAR KUNNAT VISA ATT EN AV DEM, NSIR4, DELTAR I EN SAMMANHÄNGANDE KRETS (FEED FORWARD LOOP) AV BLANDAD FÖRORDNING (TRANSCRIPTIONAL OCH POST-TRANSCRIPTIONAL), SOM FUNGERAR SOM EN MELLANHAND TILL NTCA I REGLERINGEN AV GLUTAMINSYNTETAS. I detta förslag kommer vi att fortsätta att definiera POSSIBLE funcions FÖR NSIR4 och vi kommer också att analysera den potentiella ImpleMENTATIONen av en ny SRNA-identifierad i vår GROUP, NSRR1, I STABILITY/degration av fykobilisomas, exklusiva PROTEIC COMPLEMENTER OF CYYNOBACTERIAS OCH ROJAS._x000D_ _x000D_The differentation of heterocysts, som fortfarande presenteras som svar på NITROGEN DEFICIT och i ULTIMAL instancy kontrolleras av NTCA, genomför ett SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAM av de heterocysts som regleras av HETR. DÄRFÖR ANTOG VI ATT SRNA SOM REGLERAS AV HETR KAN VARA INBLANDADE I DIFFERENTIERING. DETTA FÖRSLAG OMFATTAR EN STUDIE AV TVÅ SRNA SOM VI HAR VISAT OSS VARA TRANSKRIBERADE UTESLUTANDE I HETEROCYSTERNA (NSIR1 OCH NSIR8). NSIR1 är en VERY TEMPRANOUS MARCADER of the CELLS INCLUDING DIN DIFFERENCECIONATION._x000D_ _x000D_ Ademas of the STUDY DETAILED of the Regulation MEDIATED genom de ändrade TJÄNSTER, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL tillvägagångssätt EXPLORATORY I WO DIREKCIONER. Å ENA SIDAN KOMMER VI ATT UTFÖRA AUTOMATISERADE FÖRUTSÄGELSER AV MÖJLIGA MÅL FÖR ALLA SRNA (TOTALT 327) IDENTIFIERADE MED ALGORITMEN IMPLEMENTERAD I VÅRT NUVARANDE PROJEKT. FLERA AV DESSA SRNAS ÄR BEGRÄNSADE TILL GENOM AV HETEROCYST-BILDANDE STAMMAR, SÅ DERAS FUNKTION KAN KOPPLAS TILL DENNA PROCESS. Å ANDRA SIDAN, BASERAT PÅ HYBRIDISERINGSDATA FRÅN MIKROARRAYER UTFORMADE I DET AKTUELLA PROJEKTET, KOMMER VI ATT BYGGA SAMUTTRYCKSNÄTVERK FÖR ATT IDENTIFIERA ANTISENSE TRANSKRIPT MED UTTRYCKSPROFILER LIKNANDE DEM FÖR SPECIFIKA UTTRYCKSGENER I HETEROCYSTERNA. (Swedish)
17 August 2022
0 references
CIANOBACTERIILE SUNT UN GRUP DE ORGANISME FOTOSINTETICE ADAPTATE LA APROAPE TOATE MEDIILE. ACESTEA AU CERINȚE NUTRIȚIONALE REDUSE ȘI SUNT VERSATILE ȘI UȘOR ADAPTABILE LA SCHIMBĂRILE DE LUMINĂ, DISPONIBILITATEA NUTRIENȚILOR ETC., CIANOBACTERIILE FILAMENTARE SE NUMĂRĂ PRINTRE PUȚINELE PROCARIOTE CARE EFECTUEAZĂ PROCESE DE DIFERENȚIERE CELULARĂ CARE CONDUC LA ADAPTAREA LA STRESUL NUTRIȚIONAL SAU DE MEDIU. Aceste procese se bazează pe stabilizarea PATRONS-urilor expresive din punct de vedere genetic, ON ocazii care se odihnesc la CELELE SPECIFICE ÎN FILAMENTE._x000D_ _x000D_ în LOCALITATEA noastră suntem interesați de răspunsul CIANOBACTERIAS la îngrijirea nutrițională a NITROGENO, că diferențierea INCLUDE a heterochiștilor (un tip de celulă SPECIALIZATĂ ÎN FIJAREA NITROGENULUI atmosferic) și pe care o analizăm din perspectiva posibilei IMPLICARE a autorităților de reglementare. FOLOSIM CA ORGANISM MODEL NOSTOC SP. PCC 7120, CIANOBACTERII PENTRU CARE AVEM DEJA O ANALIZĂ GLOBALĂ TRANSCRIPTOMICA FOLOSIND ARNSEQ. De la SIMILAR la OBSERVED PENTRU Alte bacterii, APLICAREA acestei metodologii la CYANNOBACTERIAS PRIVIND PRESENȚA necodificării transcrise, ARN-uri mici (SRNA) ca transcrise ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D REGULATORul TRANSCRIPCIONAL NTCA este controlat de REGULATORul TRANSCRIPCIONAL NTCA. ÎN CADRUL PROIECTULUI NOSTRU ACTUAL (BFU2013-48282-C2-1-P) AM REUȘIT SĂ IDENTIFICĂM MAI MULTE SRNA A CĂROR TRANSCRIERE DEPINDE DE NTCA ȘI AM REUȘIT SĂ DEMONSTRĂM CĂ UNUL DINTRE EI, NSIR4, PARTICIPĂ LA UN CIRCUIT COERENT (BUCLĂ DE ALIMENTARE ÎNAINTE) AL REGULAMENTULUI MIXT (TRANSCRIPTIONAL ȘI POST-TRANSCRIPTIONAL), ACȚIONÂND CA INTERMEDIAR AL NTCA ÎN REGULAMENTUL GLUTAMINE SINTETAZA. In prezenta propunere vom continua sa definim functiile POSSIBLE PENTRU NSIR4 si vom analiza, de asemenea, posibila IMPLEMENTARE a unei noi SRNA identificate in GROUP, NSRR1, in STABILITATEA/degrarea ficobilizomilor, COMPLEMENTE PROTECIALE exclusive ale CYYNOBACTERIAS ȘI ROJAS._x000D_ _x000D_ diferentiarea heterochistilor, care sunt încă prezentate ca răspuns la NITROGEN DEFICIT și în instanța ULTIMALă este controlată de NTCA, implementează un PROGRAM SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL AL heterochiștilor care sunt reglementați de HETR. PRIN URMARE, AM PRESUPUS CĂ SRNA REGLEMENTATE DE HETR AR PUTEA FI IMPLICATE ÎN DIFERENȚIERE. ACEASTĂ PROPUNERE INCLUDE STUDIUL A DOUĂ SRNA PE CARE LE-AM DEMONSTRAT A FI TRANSCRISE EXCLUSIV ÎN HETEROCISTI (NSIR1 ȘI NSIR8). NSIR1 este un adevărat MARCADER TEMPRANOUS al CELLS care vă include DIFFERENCECIAȚIA._x000D_ _x000D_ Ademe ale STUDY DETAILITATE A REGULAMENTULUI MEDIATATE de către SERVICIILE reparate, LLEVAREMOS to CABO COMPUTATIONAL Abordări EXPLORATORIE ÎN DOUA DIRECCII. PE DE O PARTE, VOM EFECTUA PREDICȚII AUTOMATE ALE POSIBILELOR ȚINTE ALE TUTUROR SRNA (UN TOTAL DE 327) IDENTIFICATE CU ALGORITMUL IMPLEMENTAT ÎN PROIECTUL NOSTRU ACTUAL. MAI MULTE DINTRE ACESTE SRNA SUNT LIMITATE LA GENOMUL TULPINILOR CARE FORMEAZĂ HETEROCYST, ASTFEL ÎNCÂT FUNCȚIA LOR AR PUTEA FI LEGATĂ DE ACEST PROCES. PE DE ALTĂ PARTE, PE BAZA DATELOR DE HIBRIDIZARE ALE MICROARRAY-URILOR PROIECTATE ÎN PROIECTUL ACTUAL, VOM CONSTRUI REȚELE DE CO-EXPRIMARE PENTRU A IDENTIFICA TRANSCRIERI ANTISENS CU PROFILURI DE EXPRESIE SIMILARE CU CELE ALE GENELOR DE EXPRESIE SPECIFICE DIN HETEROCIST. (Romanian)
17 August 2022
0 references
CIANOBAKTERIJE SO SKUPINA FOTOSINTETIČNIH ORGANIZMOV, PRILAGOJENIH SKORAJ VSEM OKOLJEM. IMAJO ZMANJŠANE PREHRANSKE POTREBE TER SO VSESTRANSKE IN SE ZLAHKA PRILAGAJAJO SPREMEMBAM V SVETLOBI, RAZPOLOŽLJIVOSTI HRANIL ITD., NITASTE CIANOBAKTERIJE SO MED REDKIMI PROKARIONTI, KI IZVAJAJO PROCESE DIFERENCIACIJE CELIC, KI VODIJO V PRILAGAJANJE PREHRANSKIM ALI OKOLJSKIM STRESOM. Ti procesi temeljijo na stabilizaciji genetsko-diferencialno ekspresivnih PATRONS, NA okazijah, ki počivajo na SPECIFIC CELLS V FILAMENTS._x000D_ _x000D_ V NAŠEM LABORATORIJAh smo zainteresirani za odgovor CIANOBACTERIAS na Nutricionalni karence NITROGENO, da INCLUDE diferenciacijo heterocisti (vrsta celula SPECIALISED V FIJATION OF ALIGEN) in da analiziramo z vidika možne IMPLIKACIJE regulatorja. UPORABLJAMO KOT NOSTOC SP MODEL ORGANIZEM. PCC 7120, CIANOBAKTERIJE, ZA KATERE ŽE IMAMO GLOBALNO ANALIZO TRANSCRIPTOMICA Z UPORABO RNASEQ. Od SIMILARJA do OBSERVED ZA druge bakterije, ODPRAVLJANJE THIS metodologije CYANNOBACTERIAS PREDSTAVLJANJA transkriminiranih nekodiranih, majhnih RNAS (sRNA) kot prepisov ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR je pod nadzorom NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. V OKVIRU NAŠEGA SEDANJEGA PROJEKTA (BFU2013–48282-C2–1-P) SMO LAHKO IDENTIFICIRALI VEČ SRNA, KATERIH TRANSKRIPCIJA JE ODVISNA OD NTCA, IN DOKAZALI SMO, DA EDEN OD NJIH, NSIR4, SODELUJE V KOHERENTNEM VEZJU (PREDHODNA ZANKA KRME) MEŠANE REGULACIJE (TRANSKRIPCIJA IN POSTTRANKRIPCIJA), KI DELUJE KOT POSREDNIK NTCA PRI UREDITVI GLUTAMINSKE SINTETAZE. V tem predlogu bomo še naprej določali možnosti za NSIR4 in analizirali bomo tudi potencialno IMPLEMENTATION nove SRNA identifikirane V NAŠI GROUP, NSRR1, V STABILITY/degration of phycobilisomas, ekskluzivne PROTEIC COMPLEMENTS CYYNOBACTERIAS IN ROJAS._x000D_ _x000D_ Razlikovanje heterocistk, ki so še vedno predstavljeni kot odziv na NITROGEN DEFICIT in v instenci ULTIMAL je pod nadzorom NTCA, izvaja SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAM heterocist, ki jih ureja HETR. ZATO SMO DOMNEVALI, DA BI LAHKO BILE SRNA, KI JIH UREJA HETR, VKLJUČENE V DIFERENCIACIJO. TA PREDLOG VKLJUČUJE ŠTUDIJO DVEH SRNK, ZA KATERE SMO DOKAZALI, DA SO ZAPISANI IZKLJUČNO V HETEROCISTAH (NSIR1 IN NSIR8). NSIR1 je zelo TEMPRANOUS MARCADER CELLS VKLJUČENO DIREKIONACIONATION._x000D_ _x000D_ Ademe STUDY DETAILED of the UREDBE, ki so bile uvedene z novimi STORITVE, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL pristopi IZVAJANJE V DRUGIH DIREKCIJAH. NA ENI STRANI BOMO IZVEDLI AVTOMATIZIRANE NAPOVEDI MOŽNIH CILJEV VSEH SRNA (SKUPAJ 327), OPREDELJENIH Z ALGORITMOM, KI SE IZVAJA V NAŠEM SEDANJEM PROJEKTU. NEKATERE OD TEH SRNK SO OMEJENE NA GENOME SEVOV, KI TVORIJO HETEROCYST, ZATO JE NJIHOVA FUNKCIJA POVEZANA S TEM PROCESOM. PO DRUGI STRANI PA BOMO NA PODLAGI PODATKOV O HIBRIDIZACIJI MIKROARKIJEV, OBLIKOVANIH V SEDANJEM PROJEKTU, GRADILI SOIZRAZNA OMREŽJA ZA PREPOZNAVANJE ANTISENSE TRANSKRIPTOV Z EKSPRESIVNIMI PROFILI, PODOBNIMI TISTIM PRI SPECIFIČNIH EKSPRESIVNIH GENIH V HETEROCISTIH. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
CYJANOBAKTERIE SĄ GRUPĄ ORGANIZMÓW FOTOSYNTETYCZNYCH PRZYSTOSOWANYCH DO PRAWIE WSZYSTKICH ŚRODOWISK. MAJĄ ONE OGRANICZONE WYMAGANIA ŻYWIENIOWE I SĄ WSZECHSTRONNE I ŁATWE DO DOSTOSOWANIA DO ZMIAN W ŚWIETLE, DOSTĘPNOŚCI SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH ITP., CYJANOBAKTERIE WŁÓKIENKOWE NALEŻĄ DO NIEWIELU PROKARIOTÓW, KTÓRE PRZEPROWADZAJĄ PROCESY RÓŻNICOWANIA KOMÓREK PROWADZĄCE DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO STRESU ŻYWIENIOWEGO LUB ŚRODOWISKOWEGO. Procesy te opierają się na stabilizowaniu genetycznie-różnorodnie wyrazistych PATRONS, WYŁĄCZONYCH OCAZJI odpoczywających DO SPECIFIC CELLS IN FILAMENTS._x000D_ _x000D_ W naszej LABORATORII jesteśmy zainteresowani odpowiedzią CIANOBACTERIAS na próchnicę Nutricional NITROGENO, że INCLUDE różnicowanie heterocystów (rodzaj Cella SPECJALIZACJI W FIJACJI NITROGENU atmosferycznego) i że analizujemy z perspektywy możliwej WYKONAWCZEJ regulatorów. UŻYWAMY JAKO ORGANIZM MODELOWY NOSTOC SP. PCC 7120, CYJANOBAKTERIA, DLA KTÓREJ MAMY JUŻ GLOBALNĄ ANALIZĘ TRANSCRIPTOMICA PRZY UŻYCIU RNASEQ. Od SIMILARU DO OBSERWOWANIA innych bakterii, ZASTOSOWANIE TYCH metodologii DO CYANNOBACTERIAJĄCYCH PRZEZ PRESENCE transkrybowanego niekodowania, małe RNAS (sRNA) Jak transkrypowane ANTISENTIDO._x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_ x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D__x000D__x000D__x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D__x000D_x000D_x000D_x000D__x000D__x000D__x000D NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR jest kontrolowany przez NTCA TRANSCRIPCIONAL REGULATOR. W RAMACH NASZEGO OBECNEGO PROJEKTU (BFU2013-48282-C2-1-P) UDAŁO NAM SIĘ ZIDENTYFIKOWAĆ KILKA SRNA, KTÓRYCH TRANSKRYPCJA ZALEŻY OD NTCA I UDAŁO NAM SIĘ WYKAZAĆ, ŻE JEDEN Z NICH, NSIR4, UCZESTNICZY W SPÓJNYM OBIEGU (PĘTLA DO PRZODU) MIESZANEGO ROZPORZĄDZENIA (TRANSCRIPTIONAL I POST-TRANSCRIPTIONAL), DZIAŁAJĄCEGO JAKO POŚREDNIK NTCA W REGULACJI SYNTEZY GLUTAMINOWEJ. W niniejszym wniosku będziemy nadal definiować POSSIBLE funcions DLA NSIR4 i przeanalizujemy również potencjalne WYKONAWCZENIE nowej SRNA zidentyfikowanej w naszej grupie, NSRR1, W STABILNOŚCI/degration fitobilizomas, wyłącznych komplementów PROTEIC CYYNOBACTERIAS I ROJAS._x000D_ _x000D_ Różnica heterocystów, które są nadal przedstawione w odpowiedzi na DEFICIT NITROGEN i w instancji ULTIMAL jest kontrolowany przez NTCA, wdraża SPECIFIC TRANSCRIPCTIONAL PROGRAM heterocystów, które są regulowane przez HETR. W ZWIĄZKU Z TYM ZAKŁADALIŚMY, ŻE SRNA REGULOWANE PRZEZ HETR MOGĄ BYĆ ZAANGAŻOWANE W RÓŻNICOWANIE. NINIEJSZY WNIOSEK OBEJMUJE BADANIE DWÓCH SRNA, KTÓRE OKAZAŁY SIĘ TRANSKRYPOWANE WYŁĄCZNIE W HETEROCYSTACH (NSIR1 I NSIR8). NSIR1 jest BARDZO TEMPRANOUS MARCADER KLIKNIJĄCYCH ZAMÓWIENIA._x000D_ _x000D_ ademas of the STUDY DETAILED OF THE ROZPORZĄDZENIA MEDIATED DYSTEMES, LLEVAREMOS TO CABO COMPUTATIONAL approach EXPLORATORY IN DWO DYREKCJI. Z JEDNEJ STRONY PRZEPROWADZIMY AUTOMATYCZNE PRZEWIDYWANIE MOŻLIWYCH CELÓW WSZYSTKICH SRNA (ŁĄCZNIE 327) ZIDENTYFIKOWANYCH ALGORYTMEM ZAIMPLEMENTOWANYM W NASZYM OBECNYM PROJEKCIE. NIEKTÓRE Z TYCH SRNA SĄ OGRANICZONE DO GENOMÓW SZCZEPÓW TWORZĄCYCH HETEROCYST, WIĘC ICH FUNKCJA MOŻE BYĆ POWIĄZANA Z TYM PROCESEM. Z DRUGIEJ STRONY, NA PODSTAWIE DANYCH HYBRYDYZACJI MIKROARRAYI ZAPROJEKTOWANYCH W BIEŻĄCYM PROJEKCIE, ZBUDUJEMY SIECI WSPÓŁEKSPRESJI W CELU IDENTYFIKACJI TRANSKRYPCJI ANTYSENSE Z PROFILAMI EKSPRESJI PODOBNYMI DO GENÓW SPECYFICZNEJ EKSPRESJI W HETEROCYSTACH. (Polish)
17 August 2022
0 references
Sevilla
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2016-74943-C2-1-P
0 references