CHARACTERISATION OF ANKRD55, SHARED RISK LOCUS IN AUTOIMMUNE DISEASE WITH UNKNOWN FUNCTION (Q3135563)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3135563 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | CHARACTERISATION OF ANKRD55, SHARED RISK LOCUS IN AUTOIMMUNE DISEASE WITH UNKNOWN FUNCTION |
Project Q3135563 in Spain |
Statements
59,296.05 Euro
0 references
108,900.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
30 December 2016
0 references
31 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD DEL PAIS VASCO/EUSKAL HERRIKO UNIBERTSITATEA
0 references
48940
0 references
EL GEN ANKRD55 CONTIENE UNA VARIANTE INTRONICA POLIMORFICA QUE ESTA ASOCIADA CON VARIAS ENFERMEDADES AUTOINMUNES (ESCLEROSIS MULTIPLE, ENFERMEDAD DE CROHN, CELIAQUIA, ARTRITIS REUMATOIDE, DIABETES TIPO 2) CON SIGNIFICANCIA GENOME-WIDE, Y QUE COINCIDE CON UN EQTL QUE REGULA FUERTEMENTE LA EXPRESION DE ANDRD55 EN PBMCS Y CELULAS T CD4+. LA(S) FUNCION(ES) DE LA(S) PROTEINA(S) ANKRD55 SON DESCONOCIDAS. EL LOCUS ANKRD55 ES COMPLEJO, Y NOSOTROS HEMOS RECIENTEMENTE INFORMADO QUE PRODUCE DOS PROTEINAS CODIFICANTES, Y UN RNA-NO CODIFICANTE LARGO (ISOFORMA DE LA PROTEINA COMPLETA 001, ISOFORMA DE PROTEINA MAS CORTA 005 & LNCRNA 007, RESPECTIVAMENTE). PROTEINAS CODIFICADAS POR LA ISOFORMA 001 Y 005 ESTAN EXPRESADAS UBICUAMENTE, Y MUESTRAN UN PATRON PREDOMINANTE DE LOCALIZACION NUCLEAR. ESTO SUGIERE QUE LAS PROTEINAS ANKRD55 PUEDEN SER CONSTITUYENTES DE UN COMPLEJO DE TRANSCRIPCION, ESTAR INVOLUCRADAS EN REESTRUCTURACION DE CROMATINA, EN ASPECTOS RELACIONADOS CON LA GESTION Y ARQUITECTURA NUCLEAR, O PUEDEN ACTUAR COMO PROTEINAS TRANSPORTADORAS PARA IMPORTE DE FACTORES NUCLEARES O DE TRANSCRIPCION EN EL NUCLEO. POR TANTO, ANKRD55 SEGURAMENTE CONTROLA O MODULA TANTO DIRECTAMENTE O INDIRECTAMENTE EL PATRON ESPECIFICO DE EXPRESION GENICA. ESTE PROYECTO SE ENFOCA EN DOS ESTRATEGIAS COMPLEMENTARIAS PARA CLARIFICAR LA FUNCION Y LA BIOLOGIA DE LOS PRODUCTOS DE EXPRESION DEL GEN DE RIESGO AUTOINMUNE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFICACION Y VALIDACION DE CAMBIOS GENOME-WIDE EN LA EXPRESION UTILIZANDO ANALISIS DE TRANSCRIPTOMA BASADOS EN RNA-SEQ EN CELULAS PRIMARIAS T CD4+ SALVAJES Y KNOCK-OUT Y LINEAS CELULARES RELEVANTES; (II) IDENTIFICACION DEL INTERACTOMA DE LA PROTEINA ANKRD55 A TRAVES DE CAPTURA DE AFINIDAD DE LAS ISOFORMAS 001 Y 005 CON ETIQUETAS (TAGGED) Y MASS SPEC DE PROTEINAS CO-PURIFICADAS. EL INTERACTOMA DE LNCRNA 007 SERA DETERMINADO MEDIANTE LA PURIFICACION DE RNA ANTISENSE (RAP). ESTAS TACTICAS COMBINADAS PROVEERAN INFORMACION COMPLEMENTARIA DE LAS VIAS BIOLOGICAS EN LAS CUALES PARTICIPA ANKRD55. ESTE PROYECTO CONLLEVARA TAMBIEN AL ENTENDIMIENTO DE ELEMENTOS ESPECIFICOS CELULARES O ELEMENTOS COMPARTIDOS DE LAS VIAS DE ANKRD55, Y DEBERIA REVELAR LAS BASES MOLECULARES DE COMO ANKRD55 CONTRIBUYE A LOS MECANISMOS DE AUTOINMUNIDAD EN CELULAS T CD4+, UNA CATEGORIA DE LINFOCITOS CRUCIAL CON VINCULACION DOCUMENTADA EN AUTOINMUNIDAD. (Spanish)
0 references
THE ANKRD55 GENE CONTAINS A POLYMORPHIC INTRONICA VARIANT THAT IS ASSOCIATED WITH SEVERAL AUTOIMMUNE DISEASES (MULTIPLE SCLEROSIS, CROHN’S DISEASE, CELIAC DISEASE, RHEUMATOID ARTHRITIS, TYPE 2) DIABETES WITH GENOME-WIDE SIGNIFICANCE, AND THAT COINCIDES WITH AN EQTL THAT STRONGLY REGULATES THE EXPRESSION OF ANDRD55 IN PBMCS AND CD4+ T CELLS. THE FUNCTION(S) OF THE ANKRD55 PROTEIN(S) ARE UNKNOWN. The ANKRD55 LOCUS IS COMPLETE, AND WE WE RECIENTLY RECIENTLY REPORTED THAT PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform more SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. PROTEINS ENCODED BY THE ISOFORM 001 AND 005 ARE UBIQUITOUSLY EXPRESSED, AND SHOW A PREDOMINANT PATTERN OF NUCLEAR LOCATION. THIS SUGGESTS THAT ANKRD55 PROTEINS MAY BE CONSTITUENTS OF A TRANSCRIPTION COMPLEX, BE INVOLVED IN CHROMATIN RESTRUCTURING, IN ASPECTS RELATED TO NUCLEAR MANAGEMENT AND ARCHITECTURE, OR MAY ACT AS TRANSPORT PROTEINS FOR THE AMOUNT OF NUCLEAR OR TRANSCRIPTION FACTORS IN THE NUCLEUS. THEREFORE, ANKRD55 SURELY CONTROLS OR MODULATES BOTH DIRECTLY OR INDIRECTLY THE SPECIFIC PATTERN OF GENIC EXPRESSION. THIS PROJECT FOCUSES ON TWO COMPLEMENTARY STRATEGIES TO CLARIFY THE FUNCTION AND BIOLOGY OF EXPRESSION PRODUCTS OF THE ANKRD55 AUTOIMMUNE RISK GENE: I.E. (I) IDENTIFICATION AND VALIDATION OF GENOME-WIDE CHANGES IN EXPRESSION USING RNA-SEQ-BASED TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN WILD CD4+ PRIMARY CELLS AND KNOCK-OUT AND RELEVANT CELL LINES; (II) IDENTIFICATION OF THE ANKRD55 PROTEIN INTERACTOME THROUGH AFFINITY CAPTURE OF ISOFORMS 001 AND 005 WITH LABELS (TAGGED) AND MASS SPEC OF CO-PURIFIED PROTEINS. THE INTERACTION OF LNCRNA 007 WILL BE DETERMINED BY PURIFICATION OF ANTISENSE RNA (RAP). THESE COMBINED TACTICS WILL PROVIDE COMPLEMENTARY INFORMATION ON THE BIOLOGICAL PATHWAYS IN WHICH ANKRD55 PARTICIPATES. THIS PROJECT WILL ALSO INVOLVE THE UNDERSTANDING OF SPECIFIC CELLULAR ELEMENTS OR SHARED ELEMENTS OF ANKRD55 PATHWAYS, AND SHOULD REVEAL THE MOLECULAR BASES OF HOW ANKRD55 CONTRIBUTES TO THE MECHANISMS OF AUTOIMMUNITY IN CD4+ CELLS, A CRUCIAL LYMPHOCYTE CATEGORY WITH DOCUMENTED AUTOIMMUNITY LINKAGE. (English)
12 October 2021
0.2271526001510455
0 references
LE GÈNE ANKRD55 CONTIENT UNE VARIANTE D’INTRONICA POLYMORPHE QUI EST ASSOCIÉE À PLUSIEURS MALADIES AUTO-IMMUNES (SCLÉROSE MULTIPLE, MALADIE DE CROHN, MALADIE CŒLIAQUE, POLYARTHRITE RHUMATOÏDE, TYPE 2) DIABÈTE AYANT UNE SIGNIFICATION À L’ÉCHELLE DU GÉNOME, ET QUI COÏNCIDE AVEC UN EQTL QUI RÉGULE FORTEMENT L’EXPRESSION DE L’ANDRD55 DANS LES CELLULES PBMC ET CD4+. LA OU LES FONCTIONS DE LA OU DES PROTÉINES ANKRD55 SONT INCONNUES. Le LOCUS ANKRD55 est COMPLÈTE, ET NOUS NOUS NOUS NOUS nous avons récemment rapporté ce PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform plus SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. LES PROTÉINES CODÉES PAR L’ISOFORME 001 ET 005 SONT OMNIPRÉSENTES ET PRÉSENTENT UN SCHÉMA PRÉDOMINANT DE LOCALISATION NUCLÉAIRE. CELA SUGGÈRE QUE LES PROTÉINES ANKRD55 PEUVENT ÊTRE DES CONSTITUANTS D’UN COMPLEXE DE TRANSCRIPTION, ÊTRE IMPLIQUÉES DANS LA RESTRUCTURATION DE LA CHROMATINE, DANS DES ASPECTS LIÉS À LA GESTION ET À L’ARCHITECTURE NUCLÉAIRES, OU AGIR COMME PROTÉINES DE TRANSPORT POUR LA QUANTITÉ DE FACTEURS NUCLÉAIRES OU DE TRANSCRIPTION DANS LE NOYAU. PAR CONSÉQUENT, ANKRD55 CONTRÔLE OU MODULE SÛREMENT À LA FOIS DIRECTEMENT OU INDIRECTEMENT LE MODÈLE SPÉCIFIQUE D’EXPRESSION GÉNIQUE. CE PROJET MET L’ACCENT SUR DEUX STRATÉGIES COMPLÉMENTAIRES VISANT À CLARIFIER LA FONCTION ET LA BIOLOGIE DES PRODUITS D’EXPRESSION DU GÈNE À RISQUE AUTO-IMMUNE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFICATION ET VALIDATION DES CHANGEMENTS D’EXPRESSION À L’ÉCHELLE DU GÉNOME À L’AIDE DE L’ANALYSE DU TRANSCRIPTOME BASÉ SUR L’ARN-SÉQ DANS LES CELLULES PRIMAIRES CD4+ SAUVAGES ET LES LIGNÉES CELLULAIRES CONCERNÉES; (II) IDENTIFICATION DE L’INTERACTION DE LA PROTÉINE ANKRD55 PAR CAPTURE D’AFFINITÉ DES ISOFORMES 001 ET 005 AVEC DES ÉTIQUETTES (ÉTIQUETTES) ET DES SPÉCIFICATIONS DE MASSE DE PROTÉINES CO-PURIFIÉES. L’INTERACTION DU LNCRNA 007 SERA DÉTERMINÉE PAR PURIFICATION DE L’ARN ANTISENS (RAP). CES TACTIQUES COMBINÉES FOURNIRONT DES INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES SUR LES VOIES BIOLOGIQUES AUXQUELLES PARTICIPE ANKRD55. CE PROJET IMPLIQUERA ÉGALEMENT LA COMPRÉHENSION D’ÉLÉMENTS CELLULAIRES SPÉCIFIQUES OU D’ÉLÉMENTS PARTAGÉS DES VOIES ANKRD55, ET DEVRAIT RÉVÉLER LES BASES MOLÉCULAIRES DE LA FAÇON DONT ANKRD55 CONTRIBUE AUX MÉCANISMES DE L’AUTO-IMMUNITÉ DANS LES CELLULES CD4+, UNE CATÉGORIE DE LYMPHOCYTES CRUCIAUX AVEC UN LIEN D’AUTO-IMMUNITÉ DOCUMENTÉ. (French)
2 December 2021
0 references
DAS ANKRD55-GEN ENTHÄLT EINE POLYMORPHE INTRONICA-VARIANTE, DIE MIT MEHREREN AUTOIMMUNERKRANKUNGEN (MULTIPLE SKLEROSE, CROHN’S-KRANKHEIT, ZÖLIAKIE, RHEUMATOIDER ARTHRITIS, TYP 2) DIABETES MIT GENOMWEITER BEDEUTUNG ASSOZIIERT IST UND DAS MIT EINEM EQTL ZUSAMMENFÄLLT, DAS DIE EXPRESSION VON ANDRD55 IN PBMCS UND CD4+ T ZELLEN STARK REGULIERT. DIE FUNKTION(EN) DES/DER ANKRD55-PROTEIN(S) IST NICHT BEKANNT. Die ANKRD55 LOCUS IST COMPLETE, UND WIR WIR reciently reported thatAT PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN Isoform mehr SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. PROTEINE, DIE DURCH DIE ISOFORM 001 UND 005 KODIERT WERDEN, WERDEN ALLGEGENWÄRTIG AUSGEDRÜCKT UND WEISEN EIN VORHERRSCHENDES MUSTER DER KERNLAGE AUF. DIES DEUTET DARAUF HIN, DASS ANKRD55 PROTEINE BESTANDTEILE EINES TRANSKRIPTIONSKOMPLEXES SEIN KÖNNEN, AN DER UMSTRUKTURIERUNG VON CHROMATIN BETEILIGT SIND, IN ASPEKTE IM ZUSAMMENHANG MIT DEM NUKLEAREN MANAGEMENT UND DER ARCHITEKTUR EINBEZOGEN WERDEN ODER ALS TRANSPORTPROTEINE FÜR DIE MENGE DER KERN- ODER TRANSKRIPTIONSFAKTOREN IM KERN FUNGIEREN KÖNNEN. DAHER STEUERT ODER MODULIERT ANKRD55 SICHER BEIDES DIREKT ODER INDIREKT DAS SPEZIFISCHE MUSTER DER GENEXPRESSION. DAS PROJEKT KONZENTRIERT SICH AUF ZWEI KOMPLEMENTÄRE STRATEGIEN ZUR KLÄRUNG DER FUNKTION UND BIOLOGIE VON EXPRESSIONSPRODUKTEN DES AUTOIMMUNRISIKOGENS ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFIZIERUNG UND VALIDIERUNG VON GENOMWEITEN VERÄNDERUNGEN DER EXPRESSION MITTELS RNA-SEQ-BASIERTER TRANSKRIPTOMANALYSE IN WILDEN CD4± PRIMÄRZELLEN UND KNOCK-OUT- UND RELEVANTEN ZELLLINIEN; (II) IDENTIFIZIERUNG DES ANKRD55-PROTEIN-INTERVALLOMS DURCH AFFINITÄTSERFASSUNG VON ISOFORMEN 001 UND 005 MIT ETIKETTEN (AUFGEZEICHNET) UND MASSENSPEZIFIKATION VON KO-REINIGEN PROTEINEN. DIE WECHSELWIRKUNG VON LNCRNA 007 WIRD DURCH DIE REINIGUNG VON ANTISENSE RNA (RAP) BESTIMMT. DIESE KOMBINIERTEN TAKTIKEN WERDEN ERGÄNZENDE INFORMATIONEN ÜBER DIE BIOLOGISCHEN PFADE LIEFERN, AN DENEN ANKRD55 TEILNIMMT. DIESES PROJEKT WIRD AUCH DAS VERSTÄNDNIS SPEZIFISCHER ZELLULÄRER ELEMENTE ODER GEMEINSAMER ELEMENTE VON ANKRD55 PFADEN BEINHALTEN UND DIE MOLEKULAREN GRUNDLAGEN ZEIGEN, WIE ANKRD55 ZU DEN MECHANISMEN DER AUTOIMMUNITÄT IN CD4±ZELLEN BEITRÄGT, EINER ENTSCHEIDENDEN LYMPHOZYTENKATEGORIE MIT DOKUMENTIERTER AUTOIMMUNITÄTSBINDUNG. (German)
9 December 2021
0 references
HET ANKRD55-GEN BEVAT EEN POLYMORFE INTRONICA-VARIANT DIE GEASSOCIEERD WORDT MET VERSCHILLENDE AUTO-IMMUUNZIEKTEN (MULTIPLE SCLEROSE, ZIEKTE VAN CROHN, COELIAKIE, REUMATOÏDE ARTRITIS, TYPE 2) DIABETES MET GENOOMBREDE BETEKENIS, EN DIE SAMENVALT MET EEN EQTL DAT DE EXPRESSIE VAN ANDRD55 IN PBMC’S EN CD4+ T-CELLEN STERK REGULEERT. DE FUNCTIE(S) VAN DE ANKRD55-EIWIT(EN) IS ONBEKEND. De ANKRD55 LOCUS IS COMPLETE, en we hebben opnieuw wetenschappelijk verslag uitgebracht dat PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform meer SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. EIWITTEN DIE ZIJN GECODEERD DOOR HET ISOFORM 001 EN 005 WORDEN ALOMTEGENWOORDIG UITGEDRUKT EN VERTONEN EEN OVERHEERSEND PATROON VAN NUCLEAIRE LOCATIE. DIT SUGGEREERT DAT ANKRD55-EIWITTEN BESTANDDELEN VAN EEN TRANSCRIPTIECOMPLEX KUNNEN ZIJN, BETROKKEN KUNNEN ZIJN BIJ CHROMATINEHERSTRUCTURERING, IN ASPECTEN DIE VERBAND HOUDEN MET NUCLEAIR BEHEER EN ARCHITECTUUR, OF KUNNEN FUNGEREN ALS TRANSPORTEIWITTEN VOOR DE HOEVEELHEID NUCLEAIRE OF TRANSCRIPTIEFACTOREN IN DE KERN. DAAROM CONTROLEERT OF MODULEERT ANKRD55 ZOWEL DIRECT ALS INDIRECT HET SPECIFIEKE PATROON VAN GENIC EXPRESSIE. DIT PROJECT RICHT ZICH OP TWEE COMPLEMENTAIRE STRATEGIEËN OM DE FUNCTIE EN DE BIOLOGIE VAN EXPRESSIEPRODUCTEN VAN HET ANKRD55 AUTO-IMMUUNRISICOGEN TE VERDUIDELIJKEN: I.E. (I) IDENTIFICATIE EN VALIDATIE VAN GENOOMBREDE VERANDERINGEN IN EXPRESSIE MET BEHULP VAN OP RNA-SEQ GEBASEERDE TRANSCRIPTOOMANALYSE IN WILDE CD4± PRIMAIRE CELLEN EN KNOCK-OUT EN RELEVANTE CELLIJNEN; (II) IDENTIFICATIE VAN HET ANKRD55-EIWITINTERACTOOM DOOR AFFINITEIT VAN ISOVORMEN 001 EN 005 MET ETIKETTEN (GELABELD) EN MASSASPECTRUM VAN CO-GEZUIVERDE EIWITTEN. DE INTERACTIE VAN LNCRNA 007 ZAL WORDEN BEPAALD DOOR ZUIVERING VAN ANTISENSE RNA (RAP). DEZE GECOMBINEERDE TACTIEKEN ZULLEN AANVULLENDE INFORMATIE VERSCHAFFEN OVER DE BIOLOGISCHE TRAJECTEN WAARAAN ANKRD55 DEELNEEMT. DIT PROJECT ZAL OOK BETREKKING HEBBEN OP HET BEGRIJPEN VAN SPECIFIEKE CELLULAIRE ELEMENTEN OF GEDEELDE ELEMENTEN VAN ANKRD55-TRAJECTEN, EN MOET DE MOLECULAIRE BASEN ONTHULLEN VAN HOE ANKRD55 BIJDRAAGT AAN DE MECHANISMEN VAN AUTO-IMMUNITEIT IN CD4±CELLEN, EEN CRUCIALE LYMFOCYTENCATEGORIE MET GEDOCUMENTEERDE AUTO-IMMUNITEITSKOPPELING. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL GENE ANKRD55 CONTIENE UNA VARIANTE POLIMORFICA INTRONICA ASSOCIATA A DIVERSE MALATTIE AUTOIMMUNI (SCLEROSI MULTIPLA, MALATTIA DI CROHN, CELIACHIA, ARTRITE REUMATOIDE, DIABETE DI TIPO 2) CON SIGNIFICATO GENOMA-WIDE, E CHE COINCIDE CON UN EQTL CHE REGOLA FORTEMENTE L'ESPRESSIONE DI ANDRD55 NELLE CELLULE PBMC E CD4+ T. LE FUNZIONI DELLE PROTEINE ANKRD55 SONO SCONOSCIUTE. Il LOCUS ANKRD55 è completo, e noi reciently reported che PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PRO LE PROTEINE CODIFICATE DALL'ISOFORMA 001 E 005 SONO ESPRESSE ONNIPRESENTEMENTE E MOSTRANO UN MODELLO PREDOMINANTE DI LOCALIZZAZIONE NUCLEARE. CIÒ SUGGERISCE CHE LE PROTEINE ANKRD55 POSSONO ESSERE COSTITUENTI DI UN COMPLESSO DI TRASCRIZIONE, ESSERE COINVOLTE NELLA RISTRUTTURAZIONE DELLA CROMATINA, IN ASPETTI LEGATI ALLA GESTIONE NUCLEARE E ALL'ARCHITETTURA, O POSSONO FUNGERE DA PROTEINE DI TRASPORTO PER LA QUANTITÀ DI FATTORI NUCLEARI O DI TRASCRIZIONE NEL NUCLEO. PERTANTO, ANKRD55 SICURAMENTE CONTROLLA O MODULA DIRETTAMENTE O INDIRETTAMENTE IL MODELLO SPECIFICO DELL'ESPRESSIONE GENICA. QUESTO PROGETTO SI CONCENTRA SU DUE STRATEGIE COMPLEMENTARI PER CHIARIRE LA FUNZIONE E LA BIOLOGIA DEI PRODOTTI ESPRESSIVI DEL GENE A RISCHIO AUTOIMMUNE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFICAZIONE E CONVALIDA DI CAMBIAMENTI DI ESPRESSIONE A LIVELLO DI GENOMA MEDIANTE ANALISI DEL TRASCRITTOMA BASATO SU RNA-SEQ IN CELLULE PRIMARIE CD4+ WILD E LINEE CELLULARI PERTINENTI; II) L'IDENTIFICAZIONE DELLA PROTEINA ANKRD55 INTERAGITAOME ATTRAVERSO LA CATTURA DI AFFINITÀ DELLE ISOFORME 001 E 005 CON ETICHETTE (TAGGED) E SPECIFICHE DI MASSA DI PROTEINE CO-PURIFICATE. L'INTERAZIONE DI LNCRNA 007 SARÀ DETERMINATA MEDIANTE PURIFICAZIONE DELL'RNA ANTISENSO (RAP). QUESTE TATTICHE COMBINATE FORNIRANNO INFORMAZIONI COMPLEMENTARI SULLE VIE BIOLOGICHE CUI PARTECIPA ANKRD55. QUESTO PROGETTO COINVOLGERÀ ANCHE LA COMPRENSIONE DI SPECIFICI ELEMENTI CELLULARI O ELEMENTI CONDIVISI DELLE VIE ANKRD55, E DOVREBBE RIVELARE LE BASI MOLECOLARI DI COME ANKRD55 CONTRIBUISCE AI MECCANISMI DI AUTOIMMUNITÀ NELLE CELLULE CD4+, UNA CATEGORIA CRUCIALE DI LINFOCITI CON LEGAME AUTOIMMUNITÀ DOCUMENTATO. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΟ ΓΟΝΊΔΙΟ ANKRD55 ΠΕΡΙΈΧΕΙ ΜΙΑ ΠΟΛΥΜΟΡΦΙΚΉ ΠΑΡΑΛΛΑΓΉ INTRONICA ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΕΤΑΙ ΜΕ ΔΙΆΦΟΡΕΣ ΑΥΤΟΆΝΟΣΕΣ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ (ΣΚΛΉΡΥΝΣΗ ΚΑΤΆ ΠΛΆΚΑΣ, ΝΌΣΟΣ ΤΟΥ CROHN, ΚΟΙΛΙΟΚΆΚΗ, ΡΕΥΜΑΤΟΕΙΔΉΣ ΑΡΘΡΊΤΙΔΑ, ΔΙΑΒΉΤΗΣ ΤΎΠΟΥ 2) ΜΕ ΜΕΓΆΛΗ ΣΗΜΑΣΊΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ, ΚΑΙ ΠΟΥ ΣΥΜΠΊΠΤΕΙ ΜΕ ΈΝΑ EQTL ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΕΙ ΈΝΤΟΝΑ ΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΤΟΥ ANDRD55 ΣΕ PBMCS ΚΑΙ CD4+ T ΚΎΤΤΑΡΑ. Η ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ Ή ΟΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΤΗΣ/ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗΣ/-ΏΝ ANKRD55 ΕΊΝΑΙ ΆΓΝΩΣΤΕΣ. Το ANKRD55 LOCUS ΕΙΝΑΙ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΕΝΟ, ΚΑΙ ΑΝΤΙΚΕΙΜΕΝΟ ΑΝΤΙΚΕΙΜΕΝΟΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΙΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΙΝΗΣ ΠΡΩΤΕΙΝΗΣ ΠΡΩΤΕΙΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΑΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΗΣ 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. ΟΙ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΙΣΟΜΟΡΦΉ 001 ΚΑΙ 005 ΕΚΦΡΆΖΟΝΤΑΙ ΠΑΝΤΟΎ ΚΑΙ ΔΕΊΧΝΟΥΝ ΈΝΑ ΚΥΡΊΑΡΧΟ ΠΡΌΤΥΠΟ ΠΥΡΗΝΙΚΉΣ ΘΈΣΗΣ. ΑΥΤΌ ΥΠΟΔΗΛΏΝΕΙ ΌΤΙ ΟΙ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ANKRD55 ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΊΝΑΙ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΕΝΌΣ ΣΥΓΚΡΟΤΉΜΑΤΟΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ, ΝΑ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΝΑΔΙΆΡΘΡΩΣΗ ΤΗΣ ΧΡΩΜΑΤΊΝΗΣ, ΣΕ ΠΤΥΧΈΣ ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΠΥΡΗΝΙΚΉ ΔΙΑΧΕΊΡΙΣΗ ΚΑΙ ΑΡΧΙΤΕΚΤΟΝΙΚΉ, Ή ΝΑ ΕΝΕΡΓΟΎΝ ΩΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΜΕΤΑΦΟΡΆΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΟΣΌΤΗΤΑ ΠΥΡΗΝΙΚΏΝ Ή ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΣΤΟΝ ΠΥΡΉΝΑ. ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ANKRD55 ΣΊΓΟΥΡΑ ΕΛΈΓΧΕΙ Ή ΔΙΑΜΟΡΦΏΝΕΙ ΤΌΣΟ ΆΜΕΣΑ ΌΣΟ ΚΑΙ ΈΜΜΕΣΑ ΤΟ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΟ ΜΟΤΊΒΟ ΤΗΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΤΟΥ ΓΟΝΙΚΟΎ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΕΠΙΚΕΝΤΡΏΝΕΤΑΙ ΣΕ ΔΎΟ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΠΟΣΑΦΉΝΙΣΗ ΤΗΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ ΤΩΝ ΠΡΟΪΌΝΤΩΝ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΤΟΥ ΑΥΤΟΆΝΟΣΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ ΚΙΝΔΎΝΟΥ ANKRD55: I.E. (I) ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗ ΚΑΙ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΑΛΛΑΓΏΝ ΣΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΣΕ ΕΠΊΠΕΔΟ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΟΎ RNA ΣΕ ΆΓΡΙΑ ΠΡΩΤΟΓΕΝΉ ΚΎΤΤΑΡΑ CD4+ ΚΑΙ ΝΟΚ-ΆΟΥΤ ΚΑΙ ΣΧΕΤΙΚΏΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΏΝ ΣΕΙΡΏΝ· (II) ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ANKRD55 ΜΈΣΩ ΔΈΣΜΕΥΣΗΣ ΣΥΓΓΈΝΕΙΑΣ ΤΩΝ ΙΣΟΜΟΡΦΏΝ 001 ΚΑΙ 005 ΜΕ ΕΤΙΚΈΤΕΣ (ΣΗΜΕΙΩΜΈΝΕΣ) ΚΑΙ ΠΡΟΔΙΑΓΡΑΦΈΣ ΜΆΖΑΣ ΤΩΝ ΣΥΜΚΑΘΑΡΙΣΜΈΝΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ. Η ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΟΥ LNCRNA 007 ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΕΊ ΜΕ ΚΑΘΑΡΙΣΜΌ ΤΟΥ ΑΝΤΙΑΙΣΘΗΤΙΚΟΎ RNA (RAP). ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΕΣ ΤΑΚΤΙΚΈΣ ΘΑ ΠΑΡΈΧΟΥΝ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΈΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΙΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΟΔΟΎΣ ΣΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ Η ANKRD55. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΘΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΩΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΏΝ ΣΤΟΙΧΕΊΩΝ Ή ΚΟΙΝΏΝ ΣΤΟΙΧΕΊΩΝ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ANKRD55, ΚΑΙ ΘΑ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΑΠΟΚΑΛΎΨΕΙ ΤΙΣ ΜΟΡΙΑΚΈΣ ΒΆΣΕΙΣ ΤΟΥ ΤΡΌΠΟΥ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΤΟ ANKRD55 ΣΥΜΒΆΛΛΕΙ ΣΤΟΥΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΑΥΤΟΆΝΟΣΗΣ ΣΤΑ ΚΎΤΤΑΡΑ CD4+, ΜΙΑ ΚΡΊΣΙΜΗ ΚΑΤΗΓΟΡΊΑ ΛΕΜΦΟΚΥΤΤΆΡΩΝ ΜΕ ΤΕΚΜΗΡΙΩΜΈΝΗ ΣΎΝΔΕΣΗ ΑΥΤΟΆΝΟΣΗΣ. (Greek)
17 August 2022
0 references
ANKRD55-GENET INDEHOLDER EN POLYMORF INTRONICA-VARIANT, DER ER FORBUNDET MED FLERE AUTOIMMUNE SYGDOMME (MULTIPEL SKLEROSE, CROHN'S SYGDOM, CØLIAKI, REUMATOID ARTHRITIS, TYPE 2) DIABETES MED GENOMDÆKKENDE BETYDNING, OG SOM FALDER SAMMEN MED EN EQTL, DER I HØJ GRAD REGULERER FOREKOMSTEN AF ANDRD55 I PBMC'ER OG CD4+ T-CELLER. FUNKTIONEN/FUNKTIONERNE AF ANKRD55-PROTEINERNE ER UKENDT. ANKRD55 LOCUS er COMPLETE, og vi vil reciently reciently REPORTED DET PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform mere SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. PROTEINER, DER ER KODET AF ISOFORMEN 001 OG 005, UDTRYKKES ALLESTEDSNÆRVÆRENDE OG UDVISER ET FREMHERSKENDE MØNSTER AF NUKLEAR PLACERING. DETTE TYDER PÅ, AT ANKRD55-PROTEINER KAN VÆRE BESTANDDELE I ET TRANSSKRIPTIONSKOMPLEKS, VÆRE INVOLVERET I CHROMATINOMSTRUKTURERING, I ASPEKTER VEDRØRENDE NUKLEAR FORVALTNING OG ARKITEKTUR ELLER KAN FUNGERE SOM TRANSPORTPROTEINER FOR MÆNGDEN AF NUKLEARE ELLER TRANSSKRIPTIONSFAKTORER I KERNEN. DERFOR KONTROLLERER ELLER MODULERER ANKRD55 SIKKERT BÅDE DIREKTE ELLER INDIREKTE DET SPECIFIKKE MØNSTER AF GENISK UDTRYK. DETTE PROJEKT FOKUSERER PÅ TO KOMPLEMENTÆRE STRATEGIER TIL AFKLARING AF FUNKTIONEN OG BIOLOGIEN AF EKSPRESSIONSPRODUKTER AF ANKRD55 AUTOIMMUNE RISIKOGENET: I.E. (I) IDENTIFIKATION OG VALIDERING AF GENOMDÆKKENDE ÆNDRINGER I EKSPRESSION VED HJÆLP AF RNA-SEQ-BASERET TRANSKRIPTOMANALYSE I VILDE CD4±PRIMÆRE CELLER OG KNOCK-OUT OG RELEVANTE CELLELINJER IDENTIFIKATION AF ANKRD55-PROTEININTERACTOMET GENNEM AFFINITETSFANGST AF ISOFORMER 001 OG 005 MED ETIKETTER (TAGGED) OG MASSESPECIFIKATION AF CO-RENSEDE PROTEINER. INTERAKTIONEN MELLEM LNCRNA 007 VIL BLIVE BESTEMT VED RENSNING AF ANTISENSE RNA (RAP). DISSE KOMBINEREDE TAKTIKKER VIL GIVE SUPPLERENDE OPLYSNINGER OM DE BIOLOGISKE VEJE, SOM ANKRD55 DELTAGER I. DETTE PROJEKT VIL OGSÅ OMFATTE FORSTÅELSE AF SPECIFIKKE CELLEELEMENTER ELLER FÆLLES ELEMENTER I ANKRD55-VEJE OG BØR AFSLØRE DE MOLEKYLÆRE BASER FOR, HVORDAN ANKRD55 BIDRAGER TIL MEKANISMERNE FOR AUTOIMMUNITET I CD4±CELLER, EN AFGØRENDE LYMFOCYTKATEGORI MED DOKUMENTERET AUTOIMMUNITETSFORBINDELSE. (Danish)
17 August 2022
0 references
ANKRD55-GEENI SISÄLTÄÄ POLYMORFISEN INTRONICA-MUUNNELMAN, JOKA LIITTYY USEISIIN AUTOIMMUUNISAIRAUKSIIN (MULTI-SKLEROOSI, CROHNIN TAUTI, KELIAKIA, NIVELREUMA, TYYPIN 2 DIABETES, JOLLA ON GENOMIN LAAJUINEN MERKITYS JA JOKA VASTAA EQTL:ÄÄ, JOKA SÄÄTELEE VOIMAKKAASTI ANDRD55:N ILMENTYMISTÄ PBMC- JA CD4+ T-SOLUISSA. ANKRD55-PROTEIININ (PROTEIINIEN) TOIMINTOJA EI TUNNETA. ANKRD55 LOCUS on COMPLETE, JA me olemme reciently rePORTed tämän PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform enemmän SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. ISOFORMILLA 001 JA 005 KOODATUT PROTEIINIT ILMAISTAAN KAIKKIALLA, JA NIIDEN YDINALUEEN SIJAINTI ON HALLITSEVA. TÄMÄ VIITTAA SIIHEN, ETTÄ ANKRD55-PROTEIINIT VOIVAT OLLA TRANSKRIPTIOKOMPLEKSIN OSATEKIJÖITÄ, OSALLISTUA KROMATIININ UUDELLEENJÄRJESTELYYN, YDINHALLINTOON JA -ARKKITEHTUURIIN LIITTYVIIN NÄKÖKOHTIIN TAI TOIMIA KULJETUSPROTEIINEINA YDINYDIN- TAI TRANSKRIPTIOTEKIJÖIDEN MÄÄRÄN OSALTA. SIKSI ANKRD55 VARMASTI OHJAA TAI MODULOI SEKÄ SUORAAN TAI VÄLILLISESTI GEENISEN ILMENTYMÄN ERITYISTÄ MALLIA. HANKKEESSA KESKITYTÄÄN KAHTEEN TÄYDENTÄVÄÄN STRATEGIAAN, JOILLA SELVENNETÄÄN ANKRD55:N AUTOIMMUUNIRISKIGEENIN EKSPRESSIOTUOTTEIDEN TOIMINTAA JA BIOLOGIAA: I) GENOMIN LAAJUISTEN EKSPRESSIONMUUTOSTEN TUNNISTAMINEN JA VALIDOINTI RNA-SEQ-POHJAISELLA TRANSKRIPTOMIANALYYSILLÄ LUONNONVARAISISSA CD4±PRIMÄÄRISOLUISSA JA TYRMÄYS- JA ASIAANKUULUVISSA SOLULINJOISSA; II) ANKRD55-PROTEIINIEN VUOROVAIKUTUKSEN TUNNISTAMINEN ISOMUOTOJEN 001 JA 005 AFFINITEETTISIDONNAISUUDEN AVULLA YHDESSÄ PUHDISTETTUJEN PROTEIINIEN ETIKETEILLÄ (MERKITTY) JA MASSASPEKTRILLÄ. LNCRNA 007: N YHTEISVAIKUTUS MÄÄRITETÄÄN PUHDISTAMALLA ANTISENSE RNA (RAP). NÄMÄ YHDISTETYT TAKTIIKAT ANTAVAT TÄYDENTÄVÄÄ TIETOA BIOLOGISISTA VÄYLISTÄ, JOIHIN ANKRD55 OSALLISTUU. TÄHÄN HANKKEESEEN KUULUU MYÖS ANKRD55-REITTIEN TIETTYJEN SOLUELEMENTTIEN TAI JAETTUJEN ELEMENTTIEN YMMÄRTÄMINEN, JA SEN OLISI PALJASTETTAVA MOLEKYYLIEMÄKSET SIITÄ, MITEN ANKRD55 EDISTÄÄ AUTOIMMUNITEETIN MEKANISMEJA CD4±SOLUISSA, JOTKA OVAT RATKAISEVAN TÄRKEITÄ LYMFOSYYTTIEN LUOKKAA, JOLLA ON DOKUMENTOITU AUTOIMMUNITEETTIYHTEYS. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-ĠENE ANKRD55 FIH VARJANT POLYMORPHIC INTRONICA LI HUWA ASSOĊJAT MA’ DIVERSI MARD AWTOIMMUNI (SKLEROŻI MULTIPLA, IL-MARDA CROHN’S, IL-MARDA CELIAC, ARTRITE REWMATOJDE, TIP 2) DIJABETE B’SINIFIKAT MIFRUX MAL-ĠENOMA, U LI JIKKOINĊIDI MA’ EQTL LI JIRREGOLA BIL-QAWWA L-ESPRESSJONI TA’ ANDRD55 F’PBMCS U ĊELLULI CD4+ T. IL-FUNZJONI(JIET) TAL-PROTEINA/I ANKRD55 MHUMIEX MAGĦRUFA. Il-LOCUS ANKRD55 huwa KOMPLUTA, U WE WE reciently reciently REPORTED LI PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform aktar PROTEIN 005 & lncRNA 007, RISPECTIVELY. IL-PROTEINI KKODIFIKATI BL-ISOFORMA 001 U 005 HUMA ESPRESSI KULLIMKIEN, U JURU MUDELL PREDOMINANTI TA’ LOKAZZJONI NUKLEARI. DAN JISSUĠĠERIXXI LI L-PROTEINI ANKRD55 JISTGĦU JKUNU KOSTITWENTI TA’ KUMPLESS TA’ TRASKRIZZJONI, IKUNU INVOLUTI FIR-RISTRUTTURAR TAL-KROMATIN, F’ASPETTI RELATATI MAL-ĠESTJONI U L-ARKITETTURA NUKLEARI, JEW JISTGĦU JAĠIXXU BĦALA PROTEINI TAT-TRASPORT GĦALL-AMMONT TA’ FATTURI NUKLEARI JEW TA’ TRASKRIZZJONI FIN-NUKLEU. GĦALHEKK, ANKRD55 ŻGUR LI JIKKONTROLLA JEW JIMMODULA DIRETTAMENT JEW INDIRETTAMENT IX-XEJRA SPEĊIFIKA TAL-ESPRESSJONI ĠENIKA. DAN IL-PROĠETT JIFFOKA FUQ ŻEWĠ STRATEĠIJI KOMPLEMENTARI BIEX TIĠI ĊĊARATA L-FUNZJONI U L-BIJOLOĠIJA TAL-PRODOTTI TA’ ESPRESSJONI TAL-ĠENE TA’ RISKJU AWTOIMMUNI ANKRD55: I.E. (I) L-IDENTIFIKAZZJONI U L-VALIDAZZJONI TA’ BIDLIET FIL-ĠENOMA KOLLHA FL-ESPRESSJONI BL-UŻU TA’ ANALIŻI TAT-TRASKRITOMA BBAŻATA FUQ L-ISTESS RNA F’ĊELLOLI PRIMARJI CD4+ SELVAĠĠI U LINJI TA’ ĊELLOLI U LINJI TA’ ĊELLOLI RILEVANTI; (II) L-IDENTIFIKAZZJONI TAL-INTERAZZJONI TAL-PROTEINA ANKRD55 PERMEZZ TAL-QBID TAL-AFFINITÀ TAL-ISOFORMI 001 U 005 B’TIKKETTI (TAGGED) U SPEC TAL-MASSA TA’ PROTEINI KOPURIFIKATI. L- INTERAZZJONI TA ‘LNCRNA 007 GĦANDHA TIĠI STABBILITA BIL- PURIFIKAZZJONI TA’ L- RNA KONTRA S- SENS (RAP). DAWN IT-TATTIĊI KKOMBINATI SE JIPPROVDU INFORMAZZJONI KOMPLEMENTARI DWAR IL-MOGĦDIJIET BIJOLOĠIĊI LI FIHOM JIPPARTEĊIPA ANKRD55. DAN IL-PROĠETT SE JINVOLVI WKOLL IL-FEHIM TA’ ELEMENTI ĊELLULARI SPEĊIFIĊI JEW ELEMENTI KONDIVIŻI TAL-PASSAĠĠI ANKRD55, U GĦANDU JIŻVELA L-BAŻIJIET MOLEKULARI TA’ KIF ANKRD55 JIKKONTRIBWIXXI GĦALL-MEKKANIŻMI TA’ AWTOIMMUNITÀ F’ĊELLOLI CD4+, KATEGORIJA KRUĊJALI TA’ LIMFOĊITI B’KONNESSJONI AWTOIMMUNITÀ DOKUMENTATA. (Maltese)
17 August 2022
0 references
ANKRD55 GĒNS SATUR POLIMORFU INTRONICA VARIANTU, KAS IR SAISTĪTS AR VAIRĀKĀM AUTOIMŪNĀM SLIMĪBĀM (VAIRĀKU SKLEROZI, KRONA SLIMĪBU, CELIAKIJU, REIMATOĪDO ARTRĪTU, 2. TIPA DIABĒTU AR GENOMA MĒROGA NOZĪMI UN KAS SAKRĪT AR EQTL, KAS STINGRI REGULĒ ANDRD55 EKSPRESIJU PBMC UN CD4+ T ŠŪNĀS. ANKRD55 PROTEĪNA(-U) FUNKCIJA(-AS) NAV ZINĀMA(-AS). The ANKRD55 LOCUS IS COMPLETETE, Un mēs esam reciently reciently REPORTED THAT PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN izoformas vairāk SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. OLBALTUMVIELAS, KAS KODĒTAS AR IZOFORMU 001 UN 005, TIEK PLAŠI IZTEIKTAS, UN TĀM IR DOMINĒJOŠS KODOLA ATRAŠANĀS VIETAS MODELIS. TAS LIECINA, KA ANKRD55 PROTEĪNI VAR BŪT TRANSKRIPCIJAS KOMPLEKSA SASTĀVDAĻAS, BŪT IESAISTĪTI HROMATĪNA RESTRUKTURIZĀCIJĀ, ASPEKTOS, KAS SAISTĪTI AR KODOLVADĪBU UN ARHITEKTŪRU, VAI VAR DARBOTIES KĀ TRANSPORTA PROTEĪNI KODOLKODOLU VAI TRANSKRIPCIJAS FAKTORU DAUDZUMĀ. TĀPĒC ANKRD55 NOTEIKTI KONTROLĒ VAI MODULĒ GAN TIEŠI, GAN NETIEŠI SPECIFISKO ĢENERISKĀS EKSPRESIJAS MODELI. ŠIS PROJEKTS KONCENTRĒJAS UZ DIVĀM SAVSTARPĒJI PAPILDINOŠĀM STRATĒĢIJĀM, LAI PRECIZĒTU ANKRD55 AUTOIMŪNĀ RISKA GĒNA EKSPRESIJAS PRODUKTU FUNKCIJU UN BIOLOĢIJU: I) GENOMA MĒROGA IZTEIKSMES IZMAIŅU IDENTIFIKĀCIJA UN VALIDĒŠANA, IZMANTOJOT RNS-SEQ BALSTĪTU TRANSKRIPTOME ANALĪZI SAVVAĻAS CD4+ PRIMĀRAJĀS ŠŪNĀS UN KLAUVĒ, UN ATTIECĪGAJĀS ŠŪNU LĪNIJĀS; (II) ANKRD55 PROTEĪNA MIJIEDARBĪBAS NOTEIKŠANA, IZMANTOJOT IZOFORMU 001 UN 005 AFINITĀTI AR ETIĶETĒM (TAGGED) UN LĪDZATTĪRĪTU PROTEĪNU MASU SPEC. LNCRNS 007 MIJIEDARBĪBU NOTEIKS, ATTĪROT ANTISENSE RNS (RAPŠU). ŠĪ KOMBINĒTĀ TAKTIKA SNIEGS PAPILDU INFORMĀCIJU PAR BIOLOĢISKAJIEM CEĻIEM, KUROS PIEDALĀS ANKRD55. ŠIS PROJEKTS IETVERS ARĪ IZPRATNI PAR SPECIFISKIEM ŠŪNU ELEMENTIEM VAI ANKRD55 CEĻU KOPĪGIEM ELEMENTIEM, UN TAM BŪTU JĀATKLĀJ MOLEKULĀRĀS BĀZES PAR TO, KĀ ANKRD55 VEICINA AUTOIMUNITĀTES MEHĀNISMUS CD4+ ŠŪNĀS, KAS IR BŪTISKA LIMFOCĪTU KATEGORIJA AR DOKUMENTĒTU AUTOIMUNITĀTES SAIKNI. (Latvian)
17 August 2022
0 references
GÉN ANKRD55 OBSAHUJE POLYMORFNÝ VARIANT INTRONICA, KTORÝ JE SPOJENÝ S VIACERÝMI AUTOIMUNITNÝMI OCHORENIAMI (VIACNÁSOBNÁ SKLERÓZA, CROHNOVA CHOROBA, CELIAKIÁ, REUMATOIDNÁ ARTRITÍDA, TYP 2) S DIABETOM V CELOM GENÓME A KTORÝ SA ZHODUJE S EQTL, KTORÝ SILNE REGULUJE EXPRESIU ANDRD55 V PBMC A CD4+ T BUNKÁCH. FUNKCIA(-Y) PROTEÍNU(-OV) ANKRD55 NIE JE ZNÁMA. ANKRD55 LOCUS je COMPLETE, a WE WE reciently REPORTED, že PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN viac SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. BIELKOVINY KÓDOVANÉ IZOFORMOU 001 A 005 SÚ VŠADEPRÍTOMNE EXPRIMOVANÉ A VYKAZUJÚ PREVLÁDAJÚCI MODEL JADROVÉHO UMIESTNENIA. TO NAZNAČUJE, ŽE PROTEÍNY ANKRD55 MÔŽU BYŤ ZLOŽKAMI TRANSKRIPČNÉHO KOMPLEXU, MÔŽU BYŤ ZAPOJENÉ DO REŠTRUKTURALIZÁCIE CHROMATÍNU, POKIAĽ IDE O ASPEKTY SÚVISIACE S JADROVÝM RIADENÍM A ARCHITEKTÚROU, ALEBO MÔŽU PÔSOBIŤ AKO TRANSPORTNÉ BIELKOVINY PRE MNOŽSTVO JADROVÝCH ALEBO TRANSKRIPČNÝCH FAKTOROV V JADRE. PRETO ANKRD55 URČITE PRIAMO ALEBO NEPRIAMO REGULUJE ALEBO MODULUJE ŠPECIFICKÝ MODEL GÉNOVEJ EXPRESIE. TENTO PROJEKT SA ZAMERIAVA NA DVE DOPLNKOVÉ STRATÉGIE NA OBJASNENIE FUNKCIE A BIOLÓGIE EXPRESNÝCH PRODUKTOV AUTOIMUNITNÉHO RIZIKOVÉHO GÉNU ANKRD55: I) IDENTIFIKÁCIA A VALIDÁCIA ZMIEN EXPRESIE V CELOM GENÓME POUŽITÍM TRANSKRIPTÓMOVEJ ANALÝZY ZALOŽENEJ NA RNA-SEQ V PRIMÁRNYCH BUNKÁCH DIVOKÝCH CD4+ A KNOCK-OUT A PRÍSLUŠNÝCH BUNKOVÝCH LÍNIÁCH; II) IDENTIFIKÁCIA INTERAKČNÉHO PROTEÍNU ANKRD55 PROSTREDNÍCTVOM ZACHYTÁVANIA AFINITY IZOFORIEM 001 A 005 S ETIKETAMI (OZNAČENÝMI) A HMOTNOSTNÝM SPEKTROM KOČISTENÝCH PROTEÍNOV. INTERAKCIA LNCRNA 007 SA STANOVÍ ČISTENÍM ANTISENSE RNA (RAP). TIETO KOMBINOVANÉ TAKTIKY POSKYTNÚ DOPLŇUJÚCE INFORMÁCIE O BIOLOGICKÝCH CESTÁCH, NA KTORÝCH SA ANKRD55 ZÚČASTŇUJE. TENTO PROJEKT BUDE ZAHŔŇAŤ AJ POCHOPENIE ŠPECIFICKÝCH BUNKOVÝCH PRVKOV ALEBO SPOLOČNÝCH PRVKOV CIEST ANKRD55 A MAL BY ODHALIŤ MOLEKULÁRNE ZÁKLADY TOHO, AKO ANKRD55 PRISPIEVA K MECHANIZMOM AUTOIMUNITY V CD4+ BUNKÁCH, ČO JE KĽÚČOVÁ KATEGÓRIA LYMFOCYTOV S DOKUMENTOVANOU AUTOIMUNITNOU VÄZBOU. (Slovak)
17 August 2022
0 references
TÁ LEAGAN POLAMORFACH INTRONICA SA GHÉINE ANKRD55 A BHAINEANN LE ROINNT GALAIR AUTOIMMUNE (SCLÉARÓIS IOLRACH, GALAR CROHN’S, GALAR CELIAC, AIRTRÍTEAS RÉAMATÓIDEACH, CINEÁL 2) DIAIBÉITEAS LE TÁBHACHT GHÉANÓIM, AGUS GO DTAGANN SÉ LE EQTL A RIALAÍONN GO LÁIDIR LÉIRIÚ ANDRD55 I PBMCS AGUS CD4 + T CEALLA. NÍ FIOS FEIDHM(EANNA) NA PRÓITÉINE ANKRD55 (NA BPRÓITÉINÍ) ANKRD55. Tá an ANKRD55 LOCUS COMPLETETETE, agus WE WE RÉIGIÚN LEIS AN RÉIGIÚN GO GHAIRMIÚN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform níos mó SHORT 005 & lncRNA 007, Go ginearálta. MAIDIR LE PRÓITÉINÍ ATÁ IONCHÓDAITHE AG ISEFORM 001 AGUS 005, LÉIRÍTEAR GO HUILÍOCH IAD, AGUS TAISPEÁNANN SIAD PATRÚN PRÍOMHÚIL DE SHUÍOMH NÚICLÉACH. TUGANN SÉ SIN LE FIOS GO BHFÉADFADH PRÓITÉINÍ ANKRD55 A BHEITH INA GCOMHCHODANNA DE CHOIMPLÉASC TRAS-SCRÍOFA, GO MBEADH BAINT ACU LE HATHSTRUCHTÚRÚ CHROMATIN, I NGNÉITHE A BHAINEANN LE BAINISTIÚ AGUS AILTIREACHT NÚICLÉACH, NÓ GO BHFÉADFADH SIAD GNÍOMHÚ MAR PHRÓITÉINÍ IOMPAIR DO MHÉID NA BHFACHTÓIRÍ NÚICLÉACHA NÓ TRAS-SCRÍOFA SA NÚICLÉAS. DÁ BHRÍ SIN, ANKRD55 RIALUITHE SURELY NÓ MODULATES ARAON GO DÍREACH NÓ GO HINDÍREACH AN PATRÚN SONRACH DE LÉIRIÚ GENIC. DÍRÍONN AN TIONSCADAL SEO AR DHÁ STRAITÉIS CHOMHLÁNTACHA CHUN FEIDHM AGUS BITHEOLAÍOCHT NA DTÁIRGÍ LÉIRITHE DE GHÉINE RIOSCA AUTOIMMUNE ANKRD55 A SHOILÉIRIÚ: I.E. (I) ATHRUITHE AR LÉIRIÚ AR FUD GHÉANÓM A SHAINAITHINT AGUS A BHAILÍOCHTÚ TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS ANAILÍS TRAS-SCRÍBHINNE BUNAITHE AR RNA I GCEALLA PRÍOMHÚLA CD4+ FIÁINE AGUS AS LÍNTE CILLE ÁBHARTHA; (II) SAINAITHINT AN IDIRGHNÍOMHÓM PRÓITÉINE ANKRD55 TRÍ GHABHÁIL CHLEAMHNACHTA ISE-FHOIRMEACHA 001 AGUS 005 LE LIPÉID (TAGGED) AGUS MAIS-SPEICTREAM DE PHRÓITÉINÍ COMHÍONAITHE. CINNFEAR IDIRGHNÍOMHAÍOCHT LNCRNA 007 TRÍ ÍONÚ ANTISENSE RNA (RAP). CUIRFIDH NA BEARTA COMHCHEANGAILTE SEO FAISNÉIS CHOMHLÁNTACH AR FÁIL MAIDIR LEIS NA CONAIRÍ BITHEOLAÍOCHA INA NGLACANN ANKRD55 PÁIRT. BEIDH TUISCINT AR EILIMINTÍ CEALLACHA SONRACHA NÓ EILIMINTÍ COMHROINNTE DE CHONAIRÍ ANKRD55 I GCEIST LEIS AN TIONSCADAL SEO FREISIN, AGUS BA CHEART GO NOCHTFAÍ LEIS NA BUNÁITEANNA MÓILÍNEACHA A BHAINEANN LEIS AN GCAOI A GCUIREANN ANKRD55 LE MEICNÍOCHTAÍ UATH-DÍOLÚINE I GCEALLA CD4+, CATAGÓIR RÍTHÁBHACHTACH LYMPHOCYTE LE NASCÁIL UATHDHÍOLÚINE DHOICIMÉADAITHE. (Irish)
17 August 2022
0 references
GEN ANKRD55 OBSAHUJE POLYMORFNÍ VARIANTU INTRONICA, KTERÁ JE SPOJENA S NĚKOLIKA AUTOIMUNITNÍMI ONEMOCNĚNÍMI (MNOHOČETNÁ SKLERÓZA, CROHNOVA CHOROBA, CELIAKIE, REVMATOIDNÍ ARTRITIDA, TYP 2) DIABETU S VÝZNAMEM GENOMU A KTERÁ SE SHODUJE S EQTL, KTERÁ SILNĚ REGULUJE EXPRESI ANDRD55 V PBMC A CD4+ T BUŇKÁCH. FUNKCE PROTEINU (PROTEINŮ) ANKRD55 NEJSOU ZNÁMY. ANKRD55 LOCUS je COMPLETE, a my jsme reciently reciently ZPRÁVA, že PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform více SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. PROTEINY ZAKÓDOVANÉ IZOFORMOU 001 A 005 JSOU VŠUDYPŘÍTOMNĚ EXPRIMOVÁNY A VYKAZUJÍ PŘEVAŽUJÍCÍ VZOREC JADERNÉ POLOHY. TO NAZNAČUJE, ŽE PROTEINY ANKRD55 MOHOU BÝT SLOŽKAMI TRANSKRIPČNÍHO KOMPLEXU, MOHOU BÝT ZAPOJENY DO RESTRUKTURALIZACE CHROMATINU V ASPEKTECH SOUVISEJÍCÍCH S JADERNÝM ŘÍZENÍM A ARCHITEKTUROU NEBO MOHOU PŮSOBIT JAKO TRANSPORTNÍ PROTEINY PRO MNOŽSTVÍ JADERNÝCH NEBO TRANSKRIPČNÍCH FAKTORŮ V JÁDRU. PROTO ANKRD55 JISTĚ OVLÁDÁ NEBO MODULUJE JAK PŘÍMO, TAK NEPŘÍMO SPECIFICKÝ VZOREC GENOVÉ EXPRESE. TENTO PROJEKT SE ZAMĚŘUJE NA DVĚ DOPLŇKOVÉ STRATEGIE K OBJASNĚNÍ FUNKCE A BIOLOGIE EXPRESE PRODUKTŮ AUTOIMUNITNÍHO RIZIKA GENU ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFIKACE A VALIDACE ZMĚN EXPRESE V CELÉM GENOMU POMOCÍ ANALÝZY TRANSKRIPTOMU ZALOŽENÉ NA RNA-SEQ VE VOLNĚ ŽIJÍCÍCH PRIMÁRNÍCH BUŇKÁCH CD4+ A KNOCK-OUT A PŘÍSLUŠNÝCH BUNĚČNÝCH LINIÍCH; II) IDENTIFIKACE INTERAKCE PROTEINU ANKRD55 PROSTŘEDNICTVÍM AFINITNÍHO ZACHYCENÍ IZOFOREM 001 A 005 S ETIKETAMI (ZNAČKAMI) A HMOTNOSTNÍM SPEKTREM KOČIŠTĚNÝCH PROTEINŮ. INTERAKCE LNCRNA 007 BUDE URČENA ČIŠTĚNÍM ANTISENSE RNA (RAP). TATO KOMBINOVANÁ TAKTIKA POSKYTNE DOPLŇUJÍCÍ INFORMACE O BIOLOGICKÝCH CESTÁCH, KTERÝCH SE ANKRD55 ÚČASTNÍ. TENTO PROJEKT BUDE ZAHRNOVAT TAKÉ POCHOPENÍ SPECIFICKÝCH BUNĚČNÝCH PRVKŮ NEBO SDÍLENÝCH PRVKŮ CEST ANKRD55 A MĚL BY ODHALIT MOLEKULÁRNÍ ZÁKLADY TOHO, JAK ANKRD55 PŘISPÍVÁ K MECHANISMŮM AUTOIMUNITY V BUŇKÁCH CD4+, COŽ JE KLÍČOVÁ LYMFOCYTOVÁ KATEGORIE S DOKUMENTOVANOU AUTOIMUNITNÍ VAZBOU. (Czech)
17 August 2022
0 references
O gene ANKRD55 contém uma variante polímero-intrónica que está associada a várias doenças autônomas (esclerose múltipla, doença de Crohn, doença celíaca, artrite reumatóide, tipo 2), e que colide com um EQTL que regula fortemente a expressão de ANDRD55 em PBMCS e células T CD4+. A(s) função(ões) da(s) proteína(s) ANKRD55 é(são) desconhecida(s). O LOCUS ANKRD55 ESTÁ COMPLETO, E RECIENTEMENTE COMUNICAMOS QUE PROTEÍNA PROTEÍNA PROTEÍNA PROTEÍNA PROTEÍNA PROTEÍNA PROTEÍNA isoforma mais CURTO 005 & lncRNA 007, RESPECTIVAMENTE. AS PROTEÍNAS CODIFICADAS PELAS ISOFORMAS 001 E 005 SÃO UBIQUITOUSENTEMENTE EXPRESSAS E APRESENTAM UM PAINEL PREDOMINANTE DE LOCALIZAÇÃO NUCLEAR. Sugere-se que as proteínas ANKRD55 possam ser componentes de um conjunto de transcrições, estar envolvidas na reestruturação da cromatina, em aspetos relacionados com a gestão e arquitetura nuclear, ou atuar como proteínas de transporte para o volume de fatores nucleares ou de transcrição no nucleus. Por conseguinte, o ANKRD55 CONTROLE OU MODULA, DIRETA OU INDIRETAMENTE, O PAINEL ESPECÍFICO DE EXPRESSÃO GENICA. O presente projecto centra-se em duas estratégias complementares destinadas a clarificar a função e a biologia dos produtos de expressão do RISCO DE AUTOIMUNIDADE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFICAÇÃO E VALIDAÇÃO DE ALTERAÇÕES GENÓMICAS NA EXPRESSÃO UTILIZADAS NA ANÁLISE TRANSCRÍPTICA BASEADA EM ARN-SEQ EM CÉLULAS PRIMÁRIAS SELVAGENS CD4+ E EM LINHAS DE COLHEITA E EM CÉLULAS RELEVANTES; II) IDENTIFICAÇÃO DO INTERACTO DA PROTEÍNA ANKRD55 ATRAVÉS DA CAPTURA DE AFINIDADE DAS ISOFORMES 001 E 005 COM LABORATÓRIOS (CONDICIONADOS) E ESPECIAL MASSA DE PROTEÍNAS CO-PURIFIADAS. A INTERACÇÃO DO LNCRNA 007 SERÁ DETERMINADA PELA PURIFICAÇÃO DO ARN ANTISENSE (RAP). Estas táticas combinadas fornecerão informações complementares sobre os percursos biológicos em que a ANKRD55 participa. Este projecto incluirá igualmente a compreensão de elementos específicos das células ou elementos partilhados dos percursos ANKRD55 e deverá reavaliar as bases moleculares da contribuição do ANKRD55 para os mecanismos de auto-imunidade em células CD4+, uma categoria de linfocitos CRUCIAIS com ligação de auto-imunidade documentada. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
ANKRD55 GEEN SISALDAB POLÜMORFSET INTRONICA VARIANTI, MIS ON SEOTUD MITME AUTOIMMUUNHAIGUSEGA (MITMEKORDNE SKLEROOS, CROHNI TÕBI, TSÖLIAAKIA, REUMATOIDARTRIIT, 2) GENOOMI OLULISUST OMAV DIABEET, MIS LANGEB KOKKU EQTLIGA, MIS REGULEERIB TUGEVALT ANDRD55 EKSPRESSIOONI PBMCDES JA CD4+ T RAKKUDES. ANKRD55 VALGU(TE) FUNKTSIOON (FUNKTSIOONID) EI OLE TEADA. ANKRD55 LOCUS on COMPLETE, JA WE reciently reciently REPORTED THAT PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform rohkem SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. ISOVORMIDEGA 001 JA 005 KODEERITUD VALGUD ON ÜLDLEVINUD JA NEIL ON ÜLEKAALUS TUUMAASUSTUSE MUSTER. SEE VIITAB SELLELE, ET ANKRD55 VALGUD VÕIVAD OLLA TRANSKRIPTSIOONIKOMPLEKSI KOOSTISOSAD, OSALEDA KROMATIINI RESTRUKTUREERIMISES, TUUMA HALDAMISE JA ARHITEKTUURIGA SEOTUD ASPEKTIDES VÕI TOIMIDA TRANSPORTVALKUDENA TUUMA TUUMAS SISALDUVATE TUUMAFAKTORITE KOGUSE VÕI TRANSKRIPTSIOONIFAKTORITE OSAS. SEETÕTTU KONTROLLIB ANKRD55 KINDLASTI OTSESELT VÕI KAUDSELT GENILISE EKSPRESSIOONI KONKREETSET MUSTRIT VÕI MODULEERIB SEDA. PROJEKT KESKENDUB KAHELE TÄIENDAVALE STRATEEGIALE ANKRD55 AUTOIMMUUNSE RISKIGEENI EKSPRESSIOONITOODETE FUNKTSIOONI JA BIOLOOGIA SELGITAMISEKS: I) EKSPRESSIOONI GENOOMIMUUTUSTE KINDLAKSTEGEMINE JA VALIDEERIMINE, KASUTADES RNA-SEQ-PÕHIST TRANSKRIPTOOMIANALÜÜSI LOODUSLIKES CD4+ PRIMAARSETES RAKKUDES NING VÄLJALÜLITATUD RAKKUDES JA ASJAKOHASTES RAKULIINIDES; II) ANKRD55-VALGU INTERAKTSIOON, KASUTADES ISOVORMIDE 001 JA 005 AFIINSUST, MÄRGISTEGA (MÄRGISTATUD) JA KOOS PUHASTATUD VALKUDE MASSIGA. LNCRNA 007 KOOSTOIME MÄÄRATAKSE ANTISENSE RNA (RAP) PUHASTAMISEGA. NEED KOMBINEERITUD TAKTIKAD ANNAVAD TÄIENDAVAT TEAVET BIOLOOGILISTE RADADE KOHTA, MILLES ANKRD55 OSALEB. SEE PROJEKT HÕLMAB KA ANKRD55 RADADE KONKREETSETE RAKUELEMENTIDE VÕI JAGATUD ELEMENTIDE MÕISTMIST NING PEAKS PALJASTAMA MOLEKULAARSED ALUSED SELLEST, KUIDAS ANKRD55 AITAB KAASA AUTOIMMUUNSUSE MEHHANISMIDELE CD4+ RAKKUDES, MIS ON OLULINE LÜMFOTSÜÜTIDE KATEGOORIA DOKUMENTEERITUD AUTOIMMUUNSUSE SIDEMEGA. (Estonian)
17 August 2022
0 references
AZ ANKRD55 GÉN TARTALMAZ EGY POLIMORF INTRONICA VARIÁNST, AMELY SZÁMOS AUTOIMMUN BETEGSÉGGEL (SKLERÓZIS MULTIPLEX, CROHN-BETEGSÉG, CÖLIÁKUS BETEGSÉG, REUMATOID ARTRITISZ, 2-ES TÍPUSÚ CUKORBETEGSÉG) TÁRSUL, ÉS AMELY EGYBEESIK EGY OLYAN EQTL-LEL, AMELY ERŐSEN SZABÁLYOZZA AZ ANDRD55 KIFEJEZÉSÉT PBMC-KBEN ÉS CD4+ T SEJTEKBEN. AZ ANKRD55 FEHÉRJE(OK) FUNKCIÓJA(I) NEM ISMERTEK. Az ANKRD55 LOCUS összeállt, és mi kellő időben jeleztük, hogy a PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN több SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. A 001 ÉS 005 IZOFORMÁVAL KÓDOLT FEHÉRJÉK MINDENÜTT JELEN VANNAK, ÉS A NUKLEÁRIS HELY DOMINÁNS MINTÁZATÁT MUTATJÁK. EZ ARRA UTAL, HOGY AZ ANKRD55 FEHÉRJÉK EGY TRANSZKRIPCIÓS KOMPLEX ALKOTÓRÉSZEI LEHETNEK, RÉSZT VEHETNEK A KROMATIN SZERKEZETÁTALAKÍTÁSÁBAN, A NUKLEÁRIS IRÁNYÍTÁSSAL ÉS AZ ÉPÍTÉSZETTEL KAPCSOLATOS VONATKOZÁSOKBAN, VAGY TRANSZPORTFEHÉRJEKÉNT LÉPHETNEK FEL A MAGBAN LÉVŐ NUKLEÁRIS VAGY TRANSZKRIPCIÓS FAKTOROK MENNYISÉGÉRE VONATKOZÓAN. EZÉRT AZ ANKRD55 BIZONYOSAN SZABÁLYOZZA VAGY MODULÁLJA MIND KÖZVETLENÜL, MIND KÖZVETVE A GÉNEXPRESSZIÓ SPECIFIKUS MINTÁJÁT. EZ A PROJEKT KÉT EGYMÁST KIEGÉSZÍTŐ STRATÉGIÁRA ÖSSZPONTOSÍT AZ ANKRD55 AUTOIMMUN KOCKÁZATI GÉN EXPRESSZIÓS TERMÉKEINEK FUNKCIÓJÁNAK ÉS BIOLÓGIÁJÁNAK TISZTÁZÁSÁRA: I.E. A KIFEJEZÉS GENOM EGÉSZÉRE KITERJEDŐ VÁLTOZÁSAINAK AZONOSÍTÁSA ÉS VALIDÁLÁSA RNS-SEQ-ALAPÚ TRANSZKRIPTOMANALÍZISSEL A VADON ÉLŐ CD4+ PRIMER SEJTEKBEN, VALAMINT A KIÜTÉSBEN ÉS A RELEVÁNS SEJTVONALAKBAN; II. AZ ANKRD55 FEHÉRJEINTERAKTEROM AZONOSÍTÁSA A 001 ÉS 005 IZOFORMÁK AFFINITÁSA RÉVÉN, A TÁRSTISZTÍTOTT FEHÉRJÉK CÍMKÉIVEL ÉS TÖMEGADATAIVAL EGYÜTT. AZ LNCRNS 007 KÖLCSÖNHATÁSÁT AZ ANTISENSE RNS (RAP) TISZTÍTÁSÁVAL HATÁROZZÁK MEG. EZEK A KOMBINÁLT TAKTIKÁK KIEGÉSZÍTŐ INFORMÁCIÓKKAL SZOLGÁLNAK MAJD AZOKRÓL A BIOLÓGIAI ÚTVONALAKRÓL, AMELYEKBEN AZ ANKRD55 RÉSZT VESZ. EZ A PROJEKT MAGÁBAN FOGLALJA A KONKRÉT SEJTELEMEK VAGY AZ ANKRD55 ÚTVONALAK KÖZÖS ELEMEINEK MEGÉRTÉSÉT IS, ÉS FELTÁRJA ANNAK MOLEKULÁRIS ALAPJAIT, HOGY AZ ANKRD55 HOGYAN JÁRUL HOZZÁ AZ AUTOIMMUNITÁS MECHANIZMUSAIHOZ A CD4+ SEJTEKBEN, AMELY DÖNTŐ FONTOSSÁGÚ LIMFOCITA KATEGÓRIA DOKUMENTÁLT AUTOIMMUNITÁSSAL. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ГЕНЪТ ANKRD55 СЪДЪРЖА ПОЛИМОРФЕН ВАРИАНТ INTRONICA, КОЙТО Е СВЪРЗАН С НЯКОЛКО АВТОИМУННИ ЗАБОЛЯВАНИЯ (МНОЖЕСТВЕНА СКЛЕРОЗА, БОЛЕСТ НА КРОН, ЦЕЛИАКИЯ, РЕВМАТОИДЕН АРТРИТ, ТИП 2) ДИАБЕТ С ГЕНОМНО ЗНАЧЕНИЕ И КОЙТО СЪВПАДА С EQTL, КОЙТО СИЛНО РЕГУЛИРА ЕКСПРЕСИЯТА НА ANDRD55 В PBMC И CD4+ T КЛЕТКИ. ФУНКЦИЯТА(ИТЕ) НА ПРОТЕИНА(ИТЕ) ANKRD55 НЕ Е(СА) ИЗВЕСТНА(И). The ANKRD55 LOCUS Е КОМПЛЕТИНА, И НИЕ НИЕЛИЧНО ДОКУМЕНТНО, че PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN изоформи повече SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. ПРОТЕИНИТЕ, КОДИРАНИ ОТ ИЗОФОРМИТЕ 001 И 005, СЕ ИЗРАЗЯВАТ ПОВСЕМЕСТНО И ПОКАЗВАТ ПРЕОБЛАДАВАЩ МОДЕЛ НА ЯДРЕНО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ. ТОВА ПРЕДПОЛАГА, ЧЕ ПРОТЕИНИТЕ ANKRD55 МОГАТ ДА БЪДАТ СЪСТАВКИ НА ТРАНСКРИПЦИОНЕН КОМПЛЕКС, ДА УЧАСТВАТ В ПРЕСТРУКТУРИРАНЕТО НА ХРОМАТИНА В АСПЕКТИ, СВЪРЗАНИ С ЯДРЕНОТО УПРАВЛЕНИЕ И АРХИТЕКТУРА, ИЛИ ДА ДЕЙСТВАТ КАТО ТРАНСПОРТНИ ПРОТЕИНИ ЗА КОЛИЧЕСТВОТО НА ЯДРЕНИТЕ ИЛИ ТРАНСКРИПЦИОННИТЕ ФАКТОРИ В ЯДРОТО. СЛЕДОВАТЕЛНО ANKRD55 СЪС СИГУРНОСТ КОНТРОЛИРА ИЛИ МОДУЛИРА КАКТО ПРЯКО, ТАКА И ИНДИРЕКТНО СПЕЦИФИЧНИЯ МОДЕЛ НА ГЕННА ЕКСПРЕСИЯ. ТОЗИ ПРОЕКТ Е НАСОЧЕН КЪМ ДВЕ ДОПЪЛВАЩИ СЕ СТРАТЕГИИ ЗА ИЗЯСНЯВАНЕ НА ФУНКЦИЯТА И БИОЛОГИЯТА НА ЕКСПРЕСИВНИТЕ ПРОДУКТИ НА ГЕНА ЗА АВТОИМУНЕН РИСК ANKRD55: I.E. (I) ИДЕНТИФИКАЦИЯ И ВАЛИДИРАНЕ НА ПРОМЕНИТЕ В ИЗРАЗЯВАНЕТО, ОБХВАЩАЩИ ЦЕЛИЯ ГЕНОМ, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВА АНАЛИЗ НА ТРАНССКРИПТОМ НА БАЗАТА НА РНК-SEQ В ДИВИ CD4+ ПЪРВИЧНИ КЛЕТКИ И НОКАУТ И СЪОТВЕТНИТЕ КЛЕТЪЧНИ ЛИНИИ; II) ИДЕНТИФИКАЦИЯ НА БЕЛТЪЧНОТО ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ANKRD55 ЧРЕЗ УЛАВЯНЕ НА АФИНИТЕТ НА ИЗОФОРМИ 001 И 005 С ЕТИКЕТИ (МАРКИРАНИ) И МАССПЕКТР НА СЪВМЕСТНО ПРЕЧИСТЕНИ ПРОТЕИНИ. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО НА LNCRNA 007 ЩЕ БЪДЕ ОПРЕДЕЛЕНО ЧРЕЗ ПРЕЧИСТВАНЕ НА АНТИСЕНСНАТА РНК (РАП). ТЕЗИ КОМБИНИРАНИ ТАКТИКИ ЩЕ ПРЕДОСТАВЯТ ДОПЪЛНИТЕЛНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА БИОЛОГИЧНИТЕ ПЪТИЩА, В КОИТО УЧАСТВА ANKRD55. ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ ВКЛЮЧВА СЪЩО ТАКА РАЗБИРАНЕТО НА СПЕЦИФИЧНИ КЛЕТЪЧНИ ЕЛЕМЕНТИ ИЛИ СПОДЕЛЕНИ ЕЛЕМЕНТИ НА ПЪТЕКИТЕ ANKRD55 И ТРЯБВА ДА РАЗКРИЕ МОЛЕКУЛЯРНИТЕ БАЗИ ЗА ТОВА КАК ANKRD55 ДОПРИНАСЯ ЗА МЕХАНИЗМИТЕ НА АВТОИМУННОСТТА В CD4+ КЛЕТКИТЕ, КЛЮЧОВА КАТЕГОРИЯ ЛИМФОЦИТИ С ДОКУМЕНТИРАНА АВТОИМУННА ВРЪЗКА. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
ANKRD55 GENAS TURI POLIMORFINĮ INTRONICA VARIANTĄ, KURIS YRA SUSIJĘS SU KELIOMIS AUTOIMUNINĖMIS LIGOMIS (IŠSĖTINE SKLEROZE, KRONO LIGA, CELIAKIJA, REUMATOIDINIU ARTRITU, 2 TIPO DIABETU, TURINČIU GENOMO REIKŠMĘ), IR KURIS SUTAMPA SU EQTL, KURIS STIPRIAI REGULIUOJA ANDRD55 EKSPRESIJĄ PBMC IR CD4+ T LĄSTELĖSE. NEŽINOMA (-OS) ANKRD55 BALTYMO (-Ų) FUNKCIJA (-OS). ANKRD55 LOCUS yra KOMPLEKTAS, ir mes mes nuolat reciently reportavo tai PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN daugiau SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVEVELY. BALTYMAI, UŽKODUOTI IZOFORMOMIS 001 IR 005, YRA VISUR IŠREIŠKIAMI IR RODO VYRAUJANTĮ BRANDUOLINĖS VIETOS MODELĮ. TAI LEIDŽIA MANYTI, KAD ANKRD55 BALTYMAI GALI BŪTI TRANSKRIPCIJOS KOMPLEKSO SUDEDAMOSIOS DALYS, DALYVAUTI CHROMATINO RESTRUKTŪRIZAVIME, SUSIJUSIUOSE SU BRANDUOLINĖS ENERGETIKOS VALDYMU IR ARCHITEKTŪRA, ARBA GALI VEIKTI KAIP TRANSPORTAVIMO BALTYMAI BRANDUOLIO BRANDUOLIO AR TRANSKRIPCIJOS FAKTORIŲ KIEKIUI. TODĖL ANKRD55 TIKRAI KONTROLIUOJA ARBA MODULIUOJA TIEK TIESIOGIAI, TIEK NETIESIOGIAI SPECIFINĮ GENINĖS IŠRAIŠKOS MODELĮ. ŠIAME PROJEKTE DAUGIAUSIA DĖMESIO SKIRIAMA DVIEM PAPILDOMOMS STRATEGIJOMS, KURIOMIS SIEKIAMA PAAIŠKINTI ANKRD55 AUTOIMUNINĖS RIZIKOS GENO EKSPRESIJOS PRODUKTŲ FUNKCIJĄ IR BIOLOGIJĄ: I. E. (I) GENOMO MASTO EKSPRESIJOS POKYČIŲ NUSTATYMAS IR PATVIRTINIMAS, NAUDOJANT RNR-SEQ PAGRĮSTĄ TRANSKRIPTOMOS ANALIZĖS LAUKINIŲ CD4+ PIRMINIŲ LĄSTELIŲ IR GRANDININIŲ LĄSTELIŲ BEI ATITINKAMŲ LĄSTELIŲ LINIJŲ DUOMENIS; II) ANKRD55 PROTEINOVEIKOMĄ IDENTIFIKUOJANT AFINITETĄ IZOFORMŲ 001 IR 005 FIKSAVIMO BŪDU, NURODANT KOGRYNINTŲ BALTYMŲ ETIKETES (ŽENKLUS) IR MASĖS SPECIFIKĄ. LNCRNR 007 SĄVEIKA BUS NUSTATOMA GRYNINANT ANTISENSE RNR (RAP). ŠI BENDRA TAKTIKA SUTEIKS PAPILDOMOS INFORMACIJOS APIE BIOLOGINIUS KELIUS, KURIUOSE DALYVAUJA ANKRD55. ŠIS PROJEKTAS TAIP PAT APIMS KONKREČIŲ LĄSTELIŲ ELEMENTŲ AR BENDRŲ ELEMENTŲ SUPRATIMĄ APIE ANKRD55 KELIUS IR TURĖTŲ ATSKLEISTI MOLEKULINES BAZES, KAIP ANKRD55 PRISIDEDA PRIE AUTOIMUNIŠKUMO MECHANIZMŲ CD4+ LĄSTELĖSE, LABAI SVARBIOJE LIMFOCITŲ KATEGORIJOJE SU DOKUMENTUOTA AUTOIMUNIŠKUMO SĄSAJA. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
GEN ANKRD55 SADRŽI POLIMORFNU INAČICU INTRONICA KOJA JE POVEZANA S NEKOLIKO AUTOIMUNIH BOLESTI (MULTIPLA SKLEROZA, CROHNOVA BOLEST, CELIJAKIJA, REUMATOIDNI ARTRITIS, TIP 2) DIJABETES S GENOMSKIM ZNAČAJEM, A KOJA SE PODUDARA S EQTL-OM KOJI SNAŽNO REGULIRA EKSPRESIJU ANDRD55 U PBMC-IMA I CD4+ T STANICAMA. FUNKCIJE PROTEINA ANKRD55 NISU POZNATE. ANKRD55 LOCUS je kompletiran, a mi smo reciently reciently IZVJEŠĆA o tome PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN izoform više SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. BJELANČEVINE KODIRANE IZOFORMOM 001 I 005 SVEPRISUTNO SU IZRAŽENE I POKAZUJU PREVLADAVAJUĆI UZORAK NUKLEARNE LOKACIJE. TO UPUĆUJE NA TO DA PROTEINI ANKRD55 MOGU BITI SASTAVNI DIJELOVI TRANSKRIPCIJSKOG KOMPLEKSA, BITI UKLJUČENI U RESTRUKTURIRANJE KROMATA, U ASPEKTIMA POVEZANIMA S NUKLEARNIM UPRAVLJANJEM I ARHITEKTUROM, ILI MOGU DJELOVATI KAO PROTEINI ZA TRANSPORT ZA KOLIČINU NUKLEARNIH ILI TRANSKRIPCIJSKIH ČIMBENIKA U JEZGRI. DAKLE, ANKRD55 SIGURNO KONTROLIRA ILI MODULIRA I IZRAVNO ILI NEIZRAVNO SPECIFIČAN UZORAK GENSKOG IZRAZA. OVAJ JE PROJEKT USMJEREN NA DVIJE KOMPLEMENTARNE STRATEGIJE ZA POJAŠNJENJE FUNKCIJE I BIOLOGIJE EKSPRESIJSKIH PROIZVODA GENA AUTOIMUNOG RIZIKA ANKRD55: I.E. IDENTIFIKACIJA I VALIDACIJA PROMJENA U IZRAŽAVANJU NA RAZINI GENOMA PRIMJENOM TRANSKRIPTOMA TEMELJENE NA RNK-SEQ U DIVLJIM PRIMARNIM STANICAMA CD4+ I KNOCK-OUT I RELEVANTNIM STANIČNIM LINIJAMA; II. IDENTIFIKACIJA MEĐUAGENOMA PROTEINA ANKRD55 PUTEM HVATANJA AFINITETA IZOOBLIKA 001 I 005 S OZNAKAMA (OZNAČENIM) I MASENIM SPEKTROM SUPROČIŠĆENIH BJELANČEVINA. INTERAKCIJA LNCRNA 007 BIT ĆE ODREĐENA PROČIŠĆAVANJEM ANTISENSE RNK (RAP). TE KOMBINIRANE TAKTIKE PRUŽIT ĆE DODATNE INFORMACIJE O BIOLOŠKIM PUTOVIMA U KOJIMA SUDJELUJE ANKRD55. OVAJ PROJEKT ĆE TAKOĐER UKLJUČIVATI RAZUMIJEVANJE SPECIFIČNIH STANIČNIH ELEMENATA ILI ZAJEDNIČKIH ELEMENATA ANKRD55 PUTEVA, TE BI TREBAO OTKRITI MOLEKULARNE BAZE KAKO ANKRD55 DOPRINOSI MEHANIZMIMA AUTOIMUNOSTI U CD4+ STANICAMA, KLJUČNOJ KATEGORIJI LIMFOCITA S DOKUMENTIRANOM AUTOIMUNOM VEZOM. (Croatian)
17 August 2022
0 references
ANKRD55-GENEN INNEHÅLLER EN POLYMORFISK INTRONICA VARIANT SOM ÄR ASSOCIERAD MED FLERA AUTOIMMUNA SJUKDOMAR (MULTIPEL SKLEROS, CROHN’S SJUKDOM, CELIAKI, REUMATOID ARTRIT, TYP 2) DIABETES MED GENOMOMFATTANDE BETYDELSE, OCH SOM SAMMANFALLER MED EN EQTL SOM STARKT REGLERAR UTTRYCKET AV ANDRD55 I PBMC OCH CD4+ T CELLER. ANKRD55-PROTEINERNAS FUNKTION(ER) ÄR OKÄND. Den ANKRD55 LOCUS ÄR COMPLETETEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN isoform mer SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIVELY. PROTEINER KODADE AV ISOFORMERNA 001 OCH 005 UTTRYCKS ALLMÄNT, OCH VISAR ETT DOMINERANDE MÖNSTER AV KÄRNVAPENPOSITION. DETTA TYDER PÅ ATT ANKRD55-PROTEINER KAN VARA BESTÅNDSDELAR I ETT TRANSKRIPTIONSKOMPLEX, VARA INVOLVERADE I KROMATINOMSTRUKTURERING, I ASPEKTER SOM RÖR KÄRNHANTERING OCH KÄRNARKITEKTUR, ELLER KAN FUNGERA SOM TRANSPORTPROTEINER FÖR MÄNGDEN NUKLEÄRA ELLER TRANSKRIPTIONSFAKTORER I KÄRNAN. DÄRFÖR KONTROLLERAR ELLER MODULERAR ANKRD55 SÄKERT BÅDE DIREKT ELLER INDIREKT DET SPECIFIKA MÖNSTRET FÖR GENICUTTRYCK. DETTA PROJEKT FOKUSERAR PÅ TVÅ KOMPLETTERANDE STRATEGIER FÖR ATT KLARGÖRA FUNKTIONEN OCH BIOLOGIN HOS UTTRYCKSPRODUKTER AV ANKRD55 AUTOIMMUNA RISKGENEN: I.E. (I) IDENTIFIERING OCH VALIDERING AV GENOMOMFATTANDE FÖRÄNDRINGAR I UTTRYCK MED RNA-SEQ-BASERAD TRANSKRIPTOMANALYS I VILDA CD4+ PRIMÄRCELLER OCH KNOCK-OUT OCH RELEVANTA CELLINJER. II) IDENTIFIERING AV ANKRD55-PROTEINET SOM INTERAGERAR GENOM AFFINITETSINFÅNGNING AV ISOFORMER 001 OCH 005 MED ETIKETTER (TAGGADE) OCH MASSSPECIFIKATION AV SAMRENA PROTEINER. INTERAKTIONEN MELLAN LNCRNA 007 BESTÄMS GENOM RENING AV ANTISENSE RNA (RAP). DENNA KOMBINERADE TAKTIK KOMMER ATT GE KOMPLETTERANDE INFORMATION OM DE BIOLOGISKA VÄGAR SOM ANKRD55 DELTAR I. DETTA PROJEKT KOMMER OCKSÅ ATT OMFATTA FÖRSTÅELSE AV SPECIFIKA CELLULÄRA ELEMENT ELLER DELAR AV ANKRD55-VÄGAR, OCH BÖR AVSLÖJA DE MOLEKYLÄRA GRUNDERNA FÖR HUR ANKRD55 BIDRAR TILL MEKANISMERNA FÖR AUTOIMMUNITET I CD4±CELLER, EN AVGÖRANDE LYMFOCYTKATEGORI MED DOKUMENTERAD AUTOIMMUNITETSLÄNKNING. (Swedish)
17 August 2022
0 references
GENA ANKRD55 CONȚINE O VARIANTĂ POLIMORFĂ INTRONICA CARE ESTE ASOCIATĂ CU MAI MULTE BOLI AUTOIMUNE (SCLEROZĂ MULTIPLĂ, BOALA CROHN, BOALA CELIACĂ, POLIARTRITA REUMATOIDĂ, TIPUL 2) DIABET ZAHARAT CU SEMNIFICAȚIE GENOMICĂ ȘI CARE COINCIDE CU UN EQTL CARE REGLEAZĂ PUTERNIC EXPRESIA ANDRD55 ÎN CELULELE PBMC ȘI CD4+ T. FUNCȚIA (FUNCȚIILE) PROTEINEI (PROTEINELOR) ANKRD55 SUNT NECUNOSCUTE. ANKRD55 LOCUS este complet, și ne-am raportat reciently reciently că PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN izoformă izoformă mai SHORT 005 & lncRNA 007, RESPECTIV. PROTEINELE CODIFICATE DE IZOFORMELE 001 ȘI 005 SUNT EXPRIMATE OMNIPREZENT ȘI PREZINTĂ UN TIPAR PREDOMINANT DE LOCALIZARE NUCLEARĂ. ACEST LUCRU SUGEREAZĂ CĂ PROTEINELE ANKRD55 POT FI COMPONENTE ALE UNUI COMPLEX DE TRANSCRIERE, POT FI IMPLICATE ÎN RESTRUCTURAREA CROMATINEI, ÎN ASPECTE LEGATE DE GESTIONAREA ȘI ARHITECTURA NUCLEARĂ SAU POT ACȚIONA CA PROTEINE DE TRANSPORT PENTRU CANTITATEA DE FACTORI NUCLEARI SAU DE TRANSCRIERE DIN NUCLEU. PRIN URMARE, ANKRD55 CONTROLEAZĂ SAU MODULEAZĂ CU SIGURANȚĂ ATÂT DIRECT, CÂT ȘI INDIRECT MODELUL SPECIFIC AL EXPRESIEI GENICE. ACEST PROIECT SE AXEAZĂ PE DOUĂ STRATEGII COMPLEMENTARE DE CLARIFICARE A FUNCȚIEI ȘI A BIOLOGIEI PRODUSELOR DE EXPRESIE ALE GENEI DE RISC AUTOIMUNE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFICAREA ȘI VALIDAREA MODIFICĂRILOR DE EXPRESIE LA NIVELUL GENOMULUI UTILIZÂND ANALIZA TRANSCRIMOMULUI BAZAT PE ARN-SEQ ÎN CELULELE PRIMARE CD4+ SĂLBATICE ȘI KNOCK-OUT ȘI LINIILE CELULARE RELEVANTE; (II) IDENTIFICAREA INTERACȚIUNII PROTEICE ANKRD55 PRIN CAPTURAREA AFINITĂȚII IZOFORMELOR 001 ȘI 005 CU ETICHETE (ETICHETATE) ȘI SPECTACULOASE DE MASĂ ALE PROTEINELOR COPURIFICATE. INTERACȚIUNEA LNCARN 007 VA FI DETERMINATĂ PRIN PURIFICAREA ARN-ULUI ANTISENS (RAP). ACESTE TACTICI COMBINATE VOR OFERI INFORMAȚII COMPLEMENTARE PRIVIND CĂILE BIOLOGICE LA CARE PARTICIPĂ ANKRD55. ACEST PROIECT VA IMPLICA, DE ASEMENEA, ÎNȚELEGEREA ELEMENTELOR CELULARE SPECIFICE SAU A ELEMENTELOR COMUNE ALE CĂILOR ANKRD55 ȘI AR TREBUI SĂ DEZVĂLUIE BAZELE MOLECULARE ALE MODULUI ÎN CARE ANKRD55 CONTRIBUIE LA MECANISMELE DE AUTOIMUNITATE ÎN CELULELE CD4+, O CATEGORIE CRUCIALĂ DE LIMFOCITE CU LEGĂTURI AUTOIMUNITATE DOCUMENTATE. (Romanian)
17 August 2022
0 references
GEN ANKRD55 VSEBUJE POLIMORFNO RAZLIČICO INTRONICA, KI JE POVEZANA Z VEČ AVTOIMUNSKIMI BOLEZNIMI (MULTIPLA SKLEROZA, CROHNOVA BOLEZEN, CELIAKIJA, REVMATOIDNI ARTRITIS, TIP 2) SLADKORNA BOLEZEN Z GENOMSKIM POMENOM IN KI SOVPADA Z EQTL, KI MOČNO URAVNAVA IZRAŽANJE ANDRD55 V CELICAH PBMC IN CD4+ T. FUNKCIJE BELJAKOVIN ANKRD55 NISO ZNANE. ANKRD55 LOCUS je kompleten, IN POTRJUJE, da je izooblika PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN izoforma več SHORT 005 & amp; lncRNA 007, RESPECTIVELY. BELJAKOVINE, KODIRANE Z IZOOBLIKO 001 IN 005, SO SPLOŠNO IZRAŽENE IN KAŽEJO PREVLADUJOČ VZOREC JEDRSKE LOKACIJE. TO KAŽE, DA SO BELJAKOVINE ANKRD55 LAHKO SESTAVINE TRANSKRIPCIJSKEGA KOMPLEKSA, VKLJUČENE V PRESTRUKTURIRANJE KROMATINA, VIDIKI, POVEZANI Z JEDRSKIM UPRAVLJANJEM IN ARHITEKTURO, ALI PA LAHKO DELUJEJO KOT TRANSPORTNE BELJAKOVINE ZA KOLIČINO JEDRSKIH ALI TRANSKRIPCIJSKIH FAKTORJEV V JEDRU. ZATO ANKRD55 ZAGOTOVO NADZORUJE ALI MODULIRA TAKO NEPOSREDNO KOT POSREDNO SPECIFIČEN VZOREC GENEGA IZRAŽANJA. TA PROJEKT SE OSREDOTOČA NA DVE DOPOLNILNI STRATEGIJI ZA POJASNITEV FUNKCIJE IN BIOLOGIJE IZRAZNIH PRODUKTOV GENA ZA AVTOIMUNSKO TVEGANJE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFIKACIJA IN VALIDACIJA SPREMEMB IZRAŽANJA NA RAVNI GENOMA Z UPORABO TRANSKRIPTOMSKE ANALIZE NA OSNOVI RNK V DIVJIH PRIMARNIH CELICAH CD4+ TER IZLOČITVI IN USTREZNIH CELIČNIH LINIJAH; (II) IDENTIFIKACIJA INTERAKCIJE PROTEINA ANKRD55 Z ZAJEMOM AFINITETE IZOOBLIK 001 IN 005 Z OZNAKAMI (OZNAČENIMI) IN MASNIM SPEKTROM SOČIŠČENIH BELJAKOVIN. INTERAKCIJA LNCRNA 007 BO DOLOČENA S ČIŠČENJEM ANTISENSE RNA (RAP). TE KOMBINIRANE TAKTIKE BODO ZAGOTOVILE DODATNE INFORMACIJE O BIOLOŠKIH POTEH, V KATERIH SODELUJE ANKRD55. TA PROJEKT BO VKLJUČEVAL TUDI RAZUMEVANJE SPECIFIČNIH CELIČNIH ELEMENTOV ALI SKUPNIH ELEMENTOV POTI ANKRD55 IN NAJ BI RAZKRIL MOLEKULARNE OSNOVE, KAKO ANKRD55 PRISPEVA K MEHANIZMOM AVTOIMUNOSTI V CELICAH CD4+, KLJUČNI KATEGORIJI LIMFOCITOV Z DOKUMENTIRANO AVTOIMUNOSTNO POVEZAVO. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
GEN ANKRD55 ZAWIERA POLIMORFICZNY WARIANT INTRONICA ZWIĄZANY Z KILKOMA CHOROBAMI AUTOIMMUNOLOGICZNYMI (STWARDNIENIE ROZSIANE, CHOROBA CROHNA, CELIAKIA, REUMATOIDALNE ZAPALENIE STAWÓW, TYP 2) CUKRZYCA O ZNACZENIU GENOMOWYM, I KTÓRA POKRYWA SIĘ Z EQTL, KTÓRA SILNIE REGULUJE EKSPRESJĘ ANDRD55 W KOMÓRKACH PBMC I CD4+ T. FUNKCJE BIAŁEK ANKRD55 SĄ NIEZNANE. ANKRD55 LOCUS jest COMPLETE, I my Reciently Reciently Reported THAT PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN PROTEIN izoform więcej SHORT 005 & amp; lncRNA 007, RESPECTIVELY. BIAŁKA KODOWANE PRZEZ IZOFORM 001 I 005 SĄ POWSZECHNIE WYRAŻANE I WYKAZUJĄ DOMINUJĄCY WZÓR LOKALIZACJI JĄDROWEJ. SUGERUJE TO, ŻE BIAŁKA ANKRD55 MOGĄ BYĆ SKŁADNIKAMI KOMPLEKSU TRANSKRYPCYJNEGO, UCZESTNICZYĆ W RESTRUKTURYZACJI CHROMATYNY, W ASPEKTACH ZWIĄZANYCH Z ZARZĄDZANIEM JĄDROWYM I ARCHITEKTURĄ JĄDROWĄ LUB MOGĄ DZIAŁAĆ JAKO BIAŁKA TRANSPORTOWE DLA ILOŚCI CZYNNIKÓW JĄDROWYCH LUB TRANSKRYPCYJNYCH W JĄDRZE JĄDROWYM. DLATEGO ANKRD55 Z PEWNOŚCIĄ KONTROLUJE LUB MODULUJE ZARÓWNO BEZPOŚREDNIO, JAK I POŚREDNIO SPECYFICZNY WZÓR EKSPRESJI GENETYCZNEJ. PROJEKT TEN KONCENTRUJE SIĘ NA DWÓCH UZUPEŁNIAJĄCYCH SIĘ STRATEGIACH MAJĄCYCH NA CELU WYJAŚNIENIE FUNKCJI I BIOLOGII PRODUKTÓW EKSPRESJI GENU RYZYKA AUTOIMMUNOLOGICZNEGO ANKRD55: I.E. (I) IDENTYFIKACJA I WALIDACJA ZMIAN W EKSPRESJI W SKALI GENOMU ZA POMOCĄ ANALIZY TRANSKRYPCJI OPARTEJ NA RNA W KOMÓRKACH PIERWOTNYCH DZIKICH CD4+ ORAZ KNOCK-OUT I ODPOWIEDNICH LINIACH KOMÓRKOWYCH; (II) IDENTYFIKACJA INTERAKCJI BIAŁKA ANKRD55 POPRZEZ WYCHWYT POWINOWACTWA IZOFORM 001 I 005 Z ETYKIETAMI (TAGOWANYMI) I SPECYFIKACJĄ MASOWĄ KOOOOCZYSZCZONYCH BIAŁEK. INTERAKCJA LNCRNA 007 ZOSTANIE OKREŚLONA PRZEZ OCZYSZCZANIE ANTYSENSE RNA (RAP). TE POŁĄCZONE TAKTYKI ZAPEWNIĄ DODATKOWE INFORMACJE NA TEMAT ŚCIEŻEK BIOLOGICZNYCH, W KTÓRYCH UCZESTNICZY ANKRD55. PROJEKT TEN BĘDZIE RÓWNIEŻ OBEJMOWAŁ ZROZUMIENIE KONKRETNYCH ELEMENTÓW KOMÓRKOWYCH LUB WSPÓLNYCH ELEMENTÓW ŚCIEŻEK ANKRD55 I POWINIEN UJAWNIĆ MOLEKULARNE PODSTAWY TEGO, W JAKI SPOSÓB ANKRD55 PRZYCZYNIA SIĘ DO MECHANIZMÓW AUTOIMMUNIZACJI W KOMÓRKACH CD4+, KLUCZOWEJ KATEGORII LIMFOCYTÓW Z UDOKUMENTOWANYM POWIĄZANIEM AUTOIMMUNOLOGICZNYM. (Polish)
17 August 2022
0 references
Leioa
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
SAF2016-74891-R
0 references