GLOBAL ANALYSIS OF THE ROLE OF SAPKS IN EUKARYOTIC CELLS (Q3135322)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3135322 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GLOBAL ANALYSIS OF THE ROLE OF SAPKS IN EUKARYOTIC CELLS |
Project Q3135322 in Spain |
Statements
271,180.6 Euro
0 references
498,036.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 December 2018
0 references
UNIVERSIDAD POMPEU FABRA
0 references
8003
0 references
LAS PROTEINA QUINASAS ACTIVADAS POR ESTRES (SAPK) DESEMPEÑAN UN PAPEL CENTRAL EN MAXIMIZAR LA SUPERVIVENCIA CELULAR A LOS CAMBIOS REPENTINOS EN EL MEDIO AMBIENTE. LAS SAPKS PROTOTIPICAS SON HOG1 DE LEVADURA Y P38 DE MAMIFERO. LA ACTIVACION DE LAS SAPKS HOG1 O P38 RESULTA EN LA GENERACION DE UN CONJUNTO DE RESPUESTAS DE ADAPTACION QUE INCLUYE LA MODULACION DE MUCHOS ASPECTOS DE LA FISIOLOGIA CELULAR. SORPRENDENTEMENTE, MUCHOS DE ESOS ASPECTOS SE CONSERVAN ENTRE LA LEVADURA Y LAS CELULAS DE MAMIFERO. EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES LA CARACTERIZACION GLOBAL DE LOS MECANISMOS MOLECULARES NECESARIOS PARA LA ADAPTACION A ESTRES MEDIADOS POR SAPKS TANTO EN LEVADURA COMO EN MAMIFEROS. EN LEVADURA, MEDIANTE LA UTILIZACION DE ANALISIS BIOQUIMICOS Y ANALISIS IN SILICO, PRETENDEMOS IDENTIFICAR TODOS LOS SUSTRATOS DE HOG1, LO QUE PROPORCIONARA INFORMACION SOBRE NUEVAS FUNCIONES DE LA SAPK EN LEVADURA, ASI COMO DEFINIR NUEVOS MECANISMOS MOLECULARES QUE SIRVAN PARA REGULAR PROCESOS BIOLOGICOS CLAVE. ADEMAS, VAMOS A AMPLIAR NUESTRO CONOCIMIENTO EN DOS FUNCIONES BASICAS PARA HOG1, COMO SON LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA Y EL CONTROL DEL CICLO CELULAR. MUCHOS ASPECTOS DE LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA SON CONTROLADOS POR HOG1; AHORA, TENEMOS LA INTENCION DE CARACTERIZAR MEJOR SU PAPEL EN EL PROCESO DE ELONGACION Y LA POSIBLE ASOCIACION DE HOG1 AL ARN. EL CICLO CELULAR ESTA CLARAMENTE REGULADO POR HOG1 EN RESPUESTA A ESTRES. PRETENDEMOS AMPLIAR NUESTRO CONOCIMIENTO EN LA REGULACION DEL CICLO CELULAR MEDIANTE LA CARACTERIZACION DE UN NUEVO CHECKPOINT EN LA FASE S QUE ES NECESARIO PARA COORDINAR LA EXPRESION GENICA CON LA REPLICACION. ESOS ASPECTOS SERAN TAMBIEN NUESTRO PRINCIPAL OBJETIVO EN LOS ESTUDIOS CON P38 EN CELULAS DE MAMIFERO. LA ENORME CONSERVACION DE LAS FUNCIONES BASICAS EN LEVADURA Y MAMIFEROS NOS HA LLEVADO A ESTUDIAR LA REGULACION DEL CONTROL DE CICLINAS POR RB Y HEMOS DESCUBIERTO QUE ESTA REGULACION PODRIA SER DE GRAN RELEVANCIA PARA CONTROLAR LA PROLIFERACION CELULAR EN CELULAS CANCEROSAS. DEL MISMO MODO, EL CONTROL DE LA PROGRESION DE LA FASE S ES FUNDAMENTAL PARA MANTENER LA INTEGRIDAD GENOMICA. EN ESTE PROYECTO ESTUDIAREMOS LA EXISTENCIA DE UN CHECKPOINT EN MAMIFEROS SIMILAR AL DESCUBIERTO EN LEVADURA. ADEMAS, VAMOS A COMPLEMENTAR NUESTROS ESTUDIOS EN LA BIOGENESIS DEL ARNM Y EL PROCESO DE SPLICING CON EL ANALISIS GLOBAL DE LA EXPRESION GENICA MEDIADA POR P38 CON LA RELEVANCIA DE LA REGULACION Y ESTRUCTURA DE LA CROMATINA. PARA DEFINIR NUEVAS FUNCIONES DE P38, VAMOS A REALIZAR UN CRIBADO GENETICO DE TODO EL GENOMA PARA IDENTIFICAR AQUELLAS ACTIVIDADES NECESARIAS PARA LA ADAPTACION CELULAR AL ESTRES Y PARA DEFINIR NUEVAS DIANAS PARA LA SAPK EN MAMIFERO. ESTOS CRIBADOS SE VAN A COMBINAR CON ANALISIS CUANTITATIVOS Y MATEMATICOS DEL PROCESO DE TRANSDUCCION DE SEÑALES EN CELULAS INDIVIDUALES. LOS DATOS OBTENIDOS AQUI DEBERIAN PROPORCIONAR UNA MEJOR COMPRENSION DE LAS FUNCIONES BIOLOGICAS DE ESTAS ENZIMAS Y OBTENER UN MEJOR CONOCIMIENTO DE LAS RESPUESTAS DE ADAPTACION AL ESTRES TANTO EN LEVADURA COMO EN MAMIFERO. (Spanish)
0 references
STRESS-ACTIVATED PROTEIN KINASES (SAPK) PLAY A CENTRAL ROLE IN MAXIMISING CELL SURVIVAL TO SUDDEN CHANGES IN THE ENVIRONMENT. THE PROTOTIPICAS SAPKS ARE YEAST HOG1 AND MAMMAL P38. THE ACTIVATION OF THE SAPKS HOG1 OR P38 RESULTS IN THE GENERATION OF A SET OF ADAPTATION RESPONSES THAT INCLUDES MODULATION OF MANY ASPECTS OF CELLULAR PHYSIOLOGY. SURPRISINGLY, MANY OF THESE ASPECTS ARE PRESERVED BETWEEN YEAST AND MAMMAL CELLS. THE MAIN OBJECTIVE OF THIS PROJECT IS THE GLOBAL CHARACTERISATION OF THE MOLECULAR MECHANISMS NECESSARY FOR THE ADAPTATION TO STRESS MEDIATED BY SAPKS IN BOTH YEAST AND MAMMALS. IN YEAST, THROUGH THE USE OF BIOCHEMICAL ANALYSIS AND IN SILICO ANALYSIS, WE INTEND TO IDENTIFY ALL HOG1 SUBSTRATES, WHICH WILL PROVIDE INFORMATION ON NEW FUNCTIONS OF SAPK IN YEAST, AS WELL AS DEFINE NEW MOLECULAR MECHANISMS THAT SERVE TO REGULATE KEY BIOLOGICAL PROCESSES. IN ADDITION, WE WILL EXPAND OUR KNOWLEDGE INTO TWO BASIC FUNCTIONS FOR HOG1, SUCH AS THE REGULATION OF GENIC EXPRESSION AND CELL CYCLE CONTROL. MANY ASPECTS OF GENIC EXPRESSION REGULATION ARE CONTROLLED BY HOG1; NOW, WE INTEND TO BETTER CHARACTERISE ITS ROLE IN THE ELONGATION PROCESS AND THE POSSIBLE ASSOCIATION OF HOG1 TO THE RNA. THE CELL CYCLE IS CLEARLY REGULATED BY HOG1 IN RESPONSE TO STRESS. WE INTEND TO EXPAND OUR KNOWLEDGE IN THE REGULATION OF THE CELL CYCLE BY CHARACTERISING A NEW CHECKPOINT IN THE PHASE S THAT IS NECESSARY TO COORDINATE GENIC EXPRESSION WITH REPLICATION. THESE ASPECTS WILL ALSO BE OUR MAIN OBJECTIVE IN STUDIES WITH P38 IN MAMMALIAN CELLS. THE ENORMOUS CONSERVATION OF BASIC FUNCTIONS IN YEAST AND MAMMALS HAS LED US TO STUDY THE REGULATION OF CYCLINE CONTROL BY RB AND WE HAVE DISCOVERED THAT THIS REGULATION COULD BE OF GREAT RELEVANCE TO CONTROL CELL PROLIFERATION IN CANCER CELLS. SIMILARLY, THE CONTROL OF THE PROGRESSION OF PHASE S IS FUNDAMENTAL TO MAINTAINING THE GENOMIC INTEGRITY. IN THIS PROJECT WE WILL STUDY THE EXISTENCE OF A CHECKPOINT IN MAMMALS SIMILAR TO THAT DISCOVERED IN YEAST. IN ADDITION, WE WILL COMPLEMENT OUR STUDIES IN THE BIOGENESIS OF MRNA AND THE SPLICING PROCESS WITH THE GLOBAL ANALYSIS OF GENIC EXPRESSION MEDIATED BY P38 WITH THE RELEVANCE OF THE REGULATION AND STRUCTURE OF CHROMATIN. TO DEFINE NEW FUNCTIONS OF P38, WE WILL PERFORM A GENETIC SCREENING OF THE ENTIRE GENOME TO IDENTIFY THOSE ACTIVITIES NECESSARY FOR CELL ADAPTATION TO STRESS AND TO DEFINE NEW TARGETS FOR SAPK IN MAMIFER. THESE SCREENINGS ARE TO BE COMBINED WITH QUANTITATIVE AND MATHEMATICAL ANALYSIS OF THE TRANSDUCTION PROCESS OF SIGNALS IN INDIVIDUAL CELLS. THE DATA OBTAINED HERE SHOULD PROVIDE A BETTER UNDERSTANDING OF THE BIOLOGICAL FUNCTIONS OF THESE ENZYMES AND OBTAIN A BETTER UNDERSTANDING OF THE RESPONSES OF ADAPTATION TO STRESS IN BOTH YEAST AND MAMMALS. (English)
12 October 2021
0.4643972636428711
0 references
LES PROTÉINES KINASES ACTIVÉES PAR LE STRESS (SAPK) JOUENT UN RÔLE CENTRAL DANS LA MAXIMISATION DE LA SURVIE CELLULAIRE À DES CHANGEMENTS SOUDAINS DANS L’ENVIRONNEMENT. LES SAPKS PROTOTIPICAS SONT DES LEVURES HOG1 ET DES MAMMIFÈRES P38. L’ACTIVATION DU SAPKS HOG1 OU P38 ENTRAÎNE LA GÉNÉRATION D’UN ENSEMBLE DE RÉPONSES D’ADAPTATION QUI INCLUT LA MODULATION DE NOMBREUX ASPECTS DE LA PHYSIOLOGIE CELLULAIRE. ÉTONNAMMENT, BON NOMBRE DE CES ASPECTS SONT PRÉSERVÉS ENTRE LES CELLULES DE LEVURE ET DE MAMMIFÈRES. L’OBJECTIF PRINCIPAL DE CE PROJET EST LA CARACTÉRISATION GLOBALE DES MÉCANISMES MOLÉCULAIRES NÉCESSAIRES À L’ADAPTATION AU STRESS MÉDIÉ PAR SAPKS CHEZ LES LEVURES ET LES MAMMIFÈRES. DANS LA LEVURE, GRÂCE À L’ANALYSE BIOCHIMIQUE ET À L’ANALYSE IN SILICO, NOUS AVONS L’INTENTION D’IDENTIFIER TOUS LES SUBSTRATS HOG1, QUI FOURNIRONT DES INFORMATIONS SUR LES NOUVELLES FONCTIONS DU SAPK DANS LA LEVURE, AINSI QUE DE DÉFINIR DE NOUVEAUX MÉCANISMES MOLÉCULAIRES QUI SERVENT À RÉGULER LES PROCESSUS BIOLOGIQUES CLÉS. EN OUTRE, NOUS ÉLARGIRONS NOS CONNAISSANCES EN DEUX FONCTIONS DE BASE POUR HOG1, TELLES QUE LA RÉGULATION DE L’EXPRESSION GÉNIQUE ET LE CONTRÔLE DU CYCLE CELLULAIRE. DE NOMBREUX ASPECTS DE LA RÉGULATION DE L’EXPRESSION GÉNIQUE SONT CONTRÔLÉS PAR LE HOG1; MAINTENANT, NOUS AVONS L’INTENTION DE MIEUX CARACTÉRISER SON RÔLE DANS LE PROCESSUS D’ALLONGEMENT ET L’ÉVENTUELLE ASSOCIATION DE HOG1 À L’ARN. LE CYCLE CELLULAIRE EST CLAIREMENT RÉGULÉ PAR HOG1 EN RÉPONSE AU STRESS. NOUS AVONS L’INTENTION D’ÉLARGIR NOS CONNAISSANCES EN MATIÈRE DE RÉGULATION DU CYCLE CELLULAIRE EN CARACTÉRISANT UN NOUVEAU POINT DE CONTRÔLE DANS LA PHASE S NÉCESSAIRE POUR COORDONNER L’EXPRESSION GÉNIQUE AVEC LA RÉPLICATION. CES ASPECTS SERONT ÉGALEMENT NOTRE OBJECTIF PRINCIPAL DANS LES ÉTUDES AVEC P38 DANS LES CELLULES DE MAMMIFÈRES. L’ÉNORME CONSERVATION DES FONCTIONS DE BASE CHEZ LES LEVURES ET LES MAMMIFÈRES NOUS A CONDUITS À ÉTUDIER LA RÉGLEMENTATION DE LA LUTTE CONTRE LA CYCLINE PAR RB ET NOUS AVONS DÉCOUVERT QUE CE RÈGLEMENT POURRAIT ÊTRE D’UNE GRANDE IMPORTANCE POUR LUTTER CONTRE LA PROLIFÉRATION CELLULAIRE DANS LES CELLULES CANCÉREUSES. DE MÊME, LE CONTRÔLE DE LA PROGRESSION DE LA PHASE S EST FONDAMENTAL POUR MAINTENIR L’INTÉGRITÉ GÉNOMIQUE. DANS CE PROJET, NOUS ÉTUDIERONS L’EXISTENCE D’UN POINT DE CONTRÔLE CHEZ LES MAMMIFÈRES SEMBLABLE À CELUI DÉCOUVERT DANS LA LEVURE. EN OUTRE, NOUS COMPLÉTERONS NOS ÉTUDES SUR LA BIOGENÈSE DE L’ARNM ET LE PROCESSUS D’ÉPISSAGE PAR L’ANALYSE GLOBALE DE L’EXPRESSION GÉNIQUE MÉDIÉE PAR P38 AVEC LA PERTINENCE DE LA RÉGULATION ET DE LA STRUCTURE DE LA CHROMATINE. POUR DÉFINIR DE NOUVELLES FONCTIONS DE P38, NOUS EFFECTUERONS UN DÉPISTAGE GÉNÉTIQUE DE L’ENSEMBLE DU GÉNOME AFIN D’IDENTIFIER LES ACTIVITÉS NÉCESSAIRES À L’ADAPTATION CELLULAIRE AU STRESS ET DE DÉFINIR DE NOUVELLES CIBLES POUR SAPK DANS MAMIFER. CES TESTS DOIVENT ÊTRE COMBINÉS À UNE ANALYSE QUANTITATIVE ET MATHÉMATIQUE DU PROCESSUS DE TRANSDUCTION DES SIGNAUX DANS DES CELLULES INDIVIDUELLES. LES DONNÉES OBTENUES ICI DEVRAIENT PERMETTRE DE MIEUX COMPRENDRE LES FONCTIONS BIOLOGIQUES DE CES ENZYMES ET DE MIEUX COMPRENDRE LES RÉPONSES DE L’ADAPTATION AU STRESS TANT CHEZ LES LEVURES QUE CHEZ LES MAMMIFÈRES. (French)
2 December 2021
0 references
STRESSAKTIVIERTE PROTEINKINASEN (SAPK) SPIELEN EINE ZENTRALE ROLLE BEI DER MAXIMIERUNG DES ZELLÜBERLEBENS AUF PLÖTZLICHE VERÄNDERUNGEN IN DER UMGEBUNG. DIE PROTOTIPICAS SAPKS SIND HEFE HOG1 UND SÄUGETIER P38. DIE AKTIVIERUNG DES SAPKS HOG1 ODER P38 FÜHRT ZUR GENERIERUNG EINER REIHE VON ANPASSUNGSREAKTIONEN, DIE DIE MODULATION VIELER ASPEKTE DER ZELLULÄREN PHYSIOLOGIE UMFASSEN. ÜBERRASCHENDERWEISE SIND VIELE DIESER ASPEKTE ZWISCHEN HEFE- UND SÄUGETIERZELLEN ERHALTEN. HAUPTZIEL DIESES PROJEKTS IST DIE GLOBALE CHARAKTERISIERUNG DER MOLEKULAREN MECHANISMEN, DIE FÜR DIE ANPASSUNG AN STRESS DURCH SAPKS SOWOHL IN HEFE ALS AUCH SÄUGETIEREN ERFORDERLICH SIND. IN HEFE WOLLEN WIR DURCH DIE BIOCHEMISCHE ANALYSE UND DIE SILICO-ANALYSE ALLE HOG1-SUBSTRATE IDENTIFIZIEREN, DIE INFORMATIONEN ÜBER NEUE FUNKTIONEN VON SAPK IN HEFE LIEFERN, SOWIE NEUE MOLEKULARE MECHANISMEN ZUR REGULIERUNG WICHTIGER BIOLOGISCHER PROZESSE DEFINIEREN. DARÜBER HINAUS WERDEN WIR UNSER WISSEN UM ZWEI GRUNDLEGENDE FUNKTIONEN FÜR HOG1 ERWEITERN, WIE Z. B. DIE REGULIERUNG DER GENEXPRESSION UND DIE ZELLZYKLUSKONTROLLE. VIELE ASPEKTE DER VERORDNUNG ÜBER DIE GENGENE EXPRESSION WERDEN VON HOG1 KONTROLLIERT; NUN WOLLEN WIR IHRE ROLLE IM DEHNUNGSPROZESS UND DIE MÖGLICHE VEREINIGUNG VON HOG1 MIT DER RNA BESSER CHARAKTERISIEREN. DER ZELLZYKLUS WIRD DURCH HOG1 ALS REAKTION AUF STRESS KLAR GEREGELT. WIR BEABSICHTIGEN, UNSER WISSEN IN DER REGULIERUNG DES ZELLZYKLUS ZU ERWEITERN, INDEM WIR EINEN NEUEN KONTROLLPUNKT IN DER PHASE S CHARAKTERISIEREN, DER NOTWENDIG IST, UM DIE GENETISCHE EXPRESSION MIT REPLIKATION ZU KOORDINIEREN. DIESE ASPEKTE WERDEN AUCH UNSER HAUPTZIEL IN STUDIEN MIT P38 IN SÄUGETIERZELLEN SEIN. DIE ENORME ERHALTUNG DER GRUNDLEGENDEN FUNKTIONEN IN HEFE UND SÄUGETIEREN HAT UNS VERANLASST, DIE REGULIERUNG DER CYCLINE-KONTROLLE DURCH RB ZU UNTERSUCHEN, UND WIR HABEN FESTGESTELLT, DASS DIESE VERORDNUNG FÜR DIE KONTROLLE DER ZELLPROLIFERATION IN KREBSZELLEN VON GROSSER BEDEUTUNG SEIN KÖNNTE. EBENSO IST DIE KONTROLLE DES FORTSCHREITENS DER PHASE S VON GRUNDLEGENDER BEDEUTUNG FÜR DIE AUFRECHTERHALTUNG DER GENOMISCHEN INTEGRITÄT. IN DIESEM PROJEKT UNTERSUCHEN WIR DIE EXISTENZ EINES KONTROLLPUNKTES BEI SÄUGETIEREN, ÄHNLICH DEM, DER IN HEFE ENTDECKT WURDE. DARÜBER HINAUS WERDEN WIR UNSERE STUDIEN ZUR BIOGENESE VON MRNA UND DEM SPLEISSPROZESS DURCH DIE GLOBALE ANALYSE DER VON P38 VERMITTELTEN GENEXPRESSION MIT DER RELEVANZ DER REGULATION UND STRUKTUR VON CHROMATIN ERGÄNZEN. UM NEUE FUNKTIONEN VON P38 ZU DEFINIEREN, WERDEN WIR EIN GENETISCHES SCREENING DES GESAMTEN GENOMS DURCHFÜHREN, UM DIE AKTIVITÄTEN ZU IDENTIFIZIEREN, DIE FÜR DIE ZELLANPASSUNG AN STRESS ERFORDERLICH SIND, UND UM NEUE ZIELE FÜR SAPK IN MAMIFER ZU DEFINIEREN. DIESE SCREENINGS SOLLEN MIT DER QUANTITATIVEN UND MATHEMATISCHEN ANALYSE DES TRANSDUKTIONSPROZESSES VON SIGNALEN IN EINZELNEN ZELLEN KOMBINIERT WERDEN. DIE HIER GEWONNENEN DATEN SOLLTEN EIN BESSERES VERSTÄNDNIS DER BIOLOGISCHEN FUNKTIONEN DIESER ENZYME ERMÖGLICHEN UND EIN BESSERES VERSTÄNDNIS DER REAKTIONEN DER ANPASSUNG AN STRESS IN HEFE UND SÄUGETIEREN ERHALTEN. (German)
9 December 2021
0 references
STRESSGEACTIVEERDE EIWITKINASEN (SAPK) SPELEN EEN CENTRALE ROL BIJ HET MAXIMALISEREN VAN DE OVERLEVING VAN CELLEN TOT PLOTSELINGE VERANDERINGEN IN HET MILIEU. DE PROTOTIPICAS SAPKS ZIJN GIST HOG1 EN ZOOGDIER P38. DE ACTIVERING VAN DE SAPKS HOG1 OF P38 RESULTEERT IN DE GENERATIE VAN EEN REEKS AANPASSINGSREACTIES DIE MODULATIE VAN VELE ASPECTEN VAN CELLULAIRE FYSIOLOGIE OMVAT. VERRASSEND GENOEG WORDEN VEEL VAN DEZE ASPECTEN BEWAARD TUSSEN GIST EN ZOOGDIERCELLEN. HET BELANGRIJKSTE DOEL VAN DIT PROJECT IS DE GLOBALE KARAKTERISERING VAN DE MOLECULAIRE MECHANISMEN DIE NODIG ZIJN VOOR DE AANPASSING AAN STRESS GEMEDIEERD DOOR SAPKS IN ZOWEL GIST ALS ZOOGDIEREN. IN GIST, DOOR HET GEBRUIK VAN BIOCHEMISCHE ANALYSE EN IN SILICO ANALYSE, WILLEN WE ALLE HOG1 SUBSTRATEN IDENTIFICEREN, DIE INFORMATIE GEVEN OVER NIEUWE FUNCTIES VAN SAPK IN GIST, EN NIEUWE MOLECULAIRE MECHANISMEN DEFINIËREN DIE DIENEN OM BELANGRIJKE BIOLOGISCHE PROCESSEN TE REGULEREN. DAARNAAST ZULLEN WE ONZE KENNIS UITBREIDEN NAAR TWEE BASISFUNCTIES VOOR HOG1, ZOALS DE VERORDENING VAN GENIC EXPRESSIE EN CELCYCLUSCONTROLE. VEEL ASPECTEN VAN DE GENIC EXPRESSIEVERORDENING WORDEN GECONTROLEERD DOOR HOG1; NU ZIJN WE VAN PLAN OM ZIJN ROL IN HET VERLENGINGSPROCES EN DE MOGELIJKE ASSOCIATIE VAN HOG1 MET HET RNA BETER TE KARAKTERISEREN. DE CELCYCLUS WORDT DUIDELIJK GEREGELD DOOR HOG1 ALS REACTIE OP STRESS. WE ZIJN VAN PLAN ONZE KENNIS IN DE VERORDENING VAN DE CELCYCLUS UIT TE BREIDEN DOOR EEN NIEUW CONTROLEPUNT TE KARAKTERISEREN IN DE FASE S DIE NODIG IS OM GENIC EXPRESSIE TE COÖRDINEREN MET REPLICATIE. DEZE ASPECTEN ZULLEN OOK ONZE BELANGRIJKSTE DOELSTELLING ZIJN IN STUDIES MET P38 IN ZOOGDIERCELLEN. HET ENORME BEHOUD VAN BASISFUNCTIES BIJ GIST EN ZOOGDIEREN HEEFT ONS ERTOE GEBRACHT DE VERORDENING INZAKE CYCLISCHE CONTROLE DOOR RB TE BESTUDEREN EN WE HEBBEN ONTDEKT DAT DEZE VERORDENING VAN GROOT BELANG ZOU KUNNEN ZIJN VOOR DE BESTRIJDING VAN CELPROLIFERATIE IN KANKERCELLEN. EVENZO IS DE BEHEERSING VAN DE PROGRESSIE VAN FASE S VAN FUNDAMENTEEL BELANG VOOR HET BEHOUD VAN DE GENOMISCHE INTEGRITEIT. IN DIT PROJECT BESTUDEREN WE HET BESTAAN VAN EEN CONTROLEPUNT BIJ ZOOGDIEREN VERGELIJKBAAR MET DAT IN GIST. DAARNAAST ZULLEN WE ONZE STUDIES IN DE BIOGENESE VAN MRNA EN HET VERBINDENDE PROCES AANVULLEN MET DE GLOBALE ANALYSE VAN GENIC EXPRESSIE GEMEDIEERD DOOR P38 MET DE RELEVANTIE VAN DE VERORDENING EN DE STRUCTUUR VAN CHROMATINE. OM NIEUWE FUNCTIES VAN P38 TE DEFINIËREN, ZULLEN WE EEN GENETISCHE SCREENING VAN HET GEHELE GENOOM UITVOEREN OM DIE ACTIVITEITEN TE IDENTIFICEREN DIE NODIG ZIJN VOOR CELAANPASSING AAN STRESS EN OM NIEUWE DOELEN VOOR SAPK IN MAMIFER TE DEFINIËREN. DEZE SCREENINGS MOETEN WORDEN GECOMBINEERD MET KWANTITATIEVE EN WISKUNDIGE ANALYSE VAN HET TRANSDUCTIEPROCES VAN SIGNALEN IN INDIVIDUELE CELLEN. DE HIER VERKREGEN GEGEVENS MOETEN EEN BETER INZICHT VERSCHAFFEN IN DE BIOLOGISCHE FUNCTIES VAN DEZE ENZYMEN EN EEN BETER INZICHT KRIJGEN IN DE REACTIES VAN AANPASSING AAN STRESS BIJ ZOWEL GIST ALS ZOOGDIEREN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LE PROTEINE CHINASI ATTIVATE DALLO STRESS (SAPK) SVOLGONO UN RUOLO CENTRALE NEL MASSIMIZZARE LA SOPRAVVIVENZA CELLULARE A CAMBIAMENTI IMPROVVISI NELL'AMBIENTE. I SAPK PROTOTIPICAS SONO LIEVITO HOG1 E MAMMIFERO P38. L'ATTIVAZIONE DEL SAPKS HOG1 O P38 SI TRADUCE NELLA GENERAZIONE DI UN INSIEME DI RISPOSTE DI ADATTAMENTO CHE INCLUDE LA MODULAZIONE DI MOLTI ASPETTI DELLA FISIOLOGIA CELLULARE. SORPRENDENTEMENTE, MOLTI DI QUESTI ASPETTI SONO CONSERVATI TRA LE CELLULE DI LIEVITO E MAMMIFERI. L'OBIETTIVO PRINCIPALE DI QUESTO PROGETTO È LA CARATTERIZZAZIONE GLOBALE DEI MECCANISMI MOLECOLARI NECESSARI PER L'ADATTAMENTO ALLO STRESS MEDIATO DAL SAPKS SIA NEI LIEVITI CHE NEI MAMMIFERI. NEI LIEVITI, ATTRAVERSO L'UTILIZZO DI ANALISI BIOCHIMICHE E IN ANALISI SILICO, INTENDIAMO IDENTIFICARE TUTTI I SUBSTRATI HOG1, CHE FORNIRANNO INFORMAZIONI SULLE NUOVE FUNZIONI DEL SAPK NEI LIEVITI, OLTRE A DEFINIRE NUOVI MECCANISMI MOLECOLARI CHE SERVONO A REGOLARE I PROCESSI BIOLOGICI CHIAVE. INOLTRE, AMPLIEREMO LE NOSTRE CONOSCENZE IN DUE FUNZIONI DI BASE PER HOG1, COME LA REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE GENICA E IL CONTROLLO DEL CICLO CELLULARE. MOLTI ASPETTI DELLA REGOLAMENTAZIONE DELL'ESPRESSIONE GENETICA SONO CONTROLLATI DA HOG1; ORA, INTENDIAMO CARATTERIZZARE MEGLIO IL SUO RUOLO NEL PROCESSO DI ALLUNGAMENTO E LA POSSIBILE ASSOCIAZIONE DI HOG1 ALL'RNA. IL CICLO CELLULARE È CHIARAMENTE REGOLATO DA HOG1 IN RISPOSTA ALLO STRESS. INTENDIAMO AMPLIARE LA NOSTRA CONOSCENZA NELLA REGOLAZIONE DEL CICLO CELLULARE CARATTERIZZANDO UN NUOVO PUNTO DI CONTROLLO NELLA FASE S CHE È NECESSARIO PER COORDINARE L'ESPRESSIONE GENETICA CON LA REPLICAZIONE. QUESTI ASPETTI SARANNO ANCHE IL NOSTRO OBIETTIVO PRINCIPALE NEGLI STUDI CON P38 NELLE CELLULE DI MAMMIFERI. L'ENORME CONSERVAZIONE DELLE FUNZIONI DI BASE NEI LIEVITI E NEI MAMMIFERI CI HA PORTATO A STUDIARE LA REGOLAMENTAZIONE DEL CONTROLLO DELLA CICLINA DA PARTE DELLA RB E ABBIAMO SCOPERTO CHE QUESTO REGOLAMENTO POTREBBE ESSERE DI GRANDE IMPORTANZA PER CONTROLLARE LA PROLIFERAZIONE CELLULARE NELLE CELLULE TUMORALI. ALLO STESSO MODO, IL CONTROLLO DELLA PROGRESSIONE DELLA FASE S È FONDAMENTALE PER MANTENERE L'INTEGRITÀ GENOMICA. IN QUESTO PROGETTO STUDIEREMO L'ESISTENZA DI UN PUNTO DI CONTROLLO NEI MAMMIFERI SIMILE A QUELLO SCOPERTO NEL LIEVITO. INOLTRE, COMPLETEREMO I NOSTRI STUDI SULLA BIOGENESI DI MRNA E IL PROCESSO DI SPLICING CON L'ANALISI GLOBALE DELL'ESPRESSIONE GENICA MEDIATA DAL P38 CON LA PERTINENZA DELLA REGOLAZIONE E LA STRUTTURA DELLA CROMATINA. PER DEFINIRE NUOVE FUNZIONI DEL P38, EFFETTUEREMO UNO SCREENING GENETICO DELL'INTERO GENOMA PER IDENTIFICARE LE ATTIVITÀ NECESSARIE PER L'ADATTAMENTO CELLULARE ALLO STRESS E PER DEFINIRE NUOVI OBIETTIVI PER SAPK IN MAMIFER. QUESTE PROIEZIONI DEVONO ESSERE COMBINATE CON L'ANALISI QUANTITATIVA E MATEMATICA DEL PROCESSO DI TRASDUZIONE DEI SEGNALI NELLE SINGOLE CELLULE. I DATI QUI OTTENUTI DOVREBBERO FORNIRE UNA MIGLIORE COMPRENSIONE DELLE FUNZIONI BIOLOGICHE DI QUESTI ENZIMI E OTTENERE UNA MIGLIORE COMPRENSIONE DELLE RISPOSTE DI ADATTAMENTO ALLO STRESS SIA NEI LIEVITI CHE NEI MAMMIFERI. (Italian)
16 January 2022
0 references
STRESSIGA PROTEIINKINAASIDEL (SAPK) ON KESKNE ROLL RAKKUDE ELLUJÄÄMISE MAKSIMEERIMISEL OOTAMATUTE MUUTUSTE KORRAL KESKKONNAS. PROTOTIPICAS SAPKS ON PÄRM HOG1 JA IMETAJA P38. SAPKS HOG1 VÕI P38 AKTIVEERIMISE TULEMUSEKS ON KOHANEMISREAKTSIOONIDE LOOMINE, MIS HÕLMAB RAKU FÜSIOLOOGIA PALJUDE ASPEKTIDE MODULATSIOONI. ÜLLATAVALT ON PALJUD NEIST ASPEKTIDEST SÄILINUD PÄRMI JA IMETAJA RAKKUDE VAHEL. SELLE PROJEKTI PEAMINE EESMÄRK ON SAPKSI POOLT VAHENDATUD STRESSIGA KOHANEMISEKS VAJALIKE MOLEKULAARMEHHANISMIDE ÜLEMAAILMNE ISELOOMUSTAMINE NII PÄRMI KUI KA IMETAJATE PUHUL. PÄRMI PUHUL KAVATSEME BIOKEEMILISE ANALÜÜSI JA RÄNIANALÜÜSI ABIL TUVASTADA KÕIK HOG1 SUBSTRAADID, MIS ANNAVAD TEAVET SAPK-I UUTE FUNKTSIOONIDE KOHTA PÄRMIS, SAMUTI MÄÄRATLEME UUED MOLEKULAARMEHHANISMID, MIS REGULEERIVAD PEAMISI BIOLOOGILISI PROTSESSE. LISAKS LAIENDAME OMA TEADMISI KAHELE HOG1 PÕHIFUNKTSIOONILE, NAGU GENILISE EKSPRESSIOONI JA RAKUTSÜKLI KONTROLLI REGULEERIMINE. HOG1 KONTROLLIB PALJUSID GEENVÄLJENDEID KÄSITLEVA MÄÄRUSE ASPEKTE; NÜÜD KAVATSEME PAREMINI ISELOOMUSTADA TEMA ROLLI PIKENEMISE PROTSESSIS JA VÕIMALIKUS HOG1 ÜHENDUSES RNA-GA. RAKUTSÜKLIT REGULEERIB SELGELT HOG1 VASTUSEKS STRESSILE. ME KAVATSEME LAIENDADA OMA TEADMISI RAKUTSÜKLI REGULEERIMISEST, ISELOOMUSTADES UUT KONTROLLPUNKTI FAASIS S, MIS ON VAJALIK GEENSE EKSPRESSIOONI KOOSKÕLASTAMISEKS REPLIKATSIOONIGA. NEED ASPEKTID ON KA MEIE PEAMINE EESMÄRK UURINGUTES P38 IMETAJATE RAKUD. PÄRMI JA IMETAJATE PÕHIFUNKTSIOONIDE TOHUTU SÄILITAMINE ON SUNDINUD MEID UURIMA RB POOLT JALGRATTAKONTROLLI REGULEERIMIST NING OLEME AVASTANUD, ET SEE MÄÄRUS VÕIB OLLA VÄGA OLULINE RAKKUDE PALJUNEMISE KONTROLLIMISEKS VÄHIRAKKUDES. SAMAMOODI ON GENOOMILISE TERVIKLIKKUSE SÄILITAMISEKS OLULINE KONTROLLIDA FAASI S PROGRESSEERUMIST. SELLES PROJEKTIS UURIME, KAS IMETAJATEL ON OLEMAS KONTROLLPUNKT, MIS SARNANEB PÄRMIGA AVASTATUD KONTROLLPUNKTILE. LISAKS TÄIENDAME OMA UURINGUID MRNA BIOGENEESI JA SPLICEERIMISPROTSESSI KOHTA P38 VAHENDUSEL VAHENDATUD GEENSE EKSPRESSIOONI GLOBAALSE ANALÜÜSIGA, MIS ON KOOSKÕLAS KROMATIINI REGULATSIOONI JA STRUKTUURIGA. P38 UUTE FUNKTSIOONIDE MÄÄRATLEMISEKS TEOSTAME KOGU GENOOMI GENEETILISE SÕELUMISE, ET TEHA KINDLAKS NEED TEGEVUSED, MIS ON VAJALIKUD RAKKUDE KOHANDAMISEKS STRESSIGA JA SAPKI UUTE EESMÄRKIDE KINDLAKSMÄÄRAMISEKS MAMIFERIS. NEED SÕELUURINGUD TULEB ÜHENDADA SIGNAALIDE ÜLEKANDMISE PROTSESSI KVANTITATIIVSE JA MATEMAATILISE ANALÜÜSIGA ÜKSIKUTES RAKKUDES. SIIN SAADUD ANDMED PEAKSID VÕIMALDAMA PAREMINI MÕISTA NENDE ENSÜÜMIDE BIOLOOGILISI FUNKTSIOONE NING PAREMINI MÕISTA NII PÄRMI KUI KA IMETAJATE STRESSIGA KOHANEMISE REAKTSIOONE. (Estonian)
4 August 2022
0 references
STRESU AKTYVUOTOS BALTYMINĖS KINAZĖS (SAPK) ATLIEKA PAGRINDINĮ VAIDMENĮ DIDINANT LĄSTELIŲ IŠLIKIMĄ STAIGIŲ APLINKOS POKYČIŲ ATVEJU. PROTOTIPICAS SAPKS YRA MIELĖS HOG1 IR ŽINDUOLIS P38. AKTYVAVUS SAPKS HOG1 ARBA P38, SUSIDARO ADAPTACIJOS ATSAKAS, KURIS APIMA DAUGELIO LĄSTELIŲ FIZIOLOGIJOS ASPEKTŲ MODULIAVIMĄ. STEBĖTINA, KAD DAUGELIS ŠIŲ ASPEKTŲ IŠLIEKA TARP MIELIŲ IR ŽINDUOLIŲ LĄSTELIŲ. PAGRINDINIS ŠIO PROJEKTO TIKSLAS – PASAULINIS MOLEKULINIŲ MECHANIZMŲ, REIKALINGŲ PRISITAIKYTI PRIE STRESO, KURĮ PALAIKO SAPKS TIEK MIELĖSE, TIEK ŽINDUOLIUOSE, APIBŪDINIMAS. MIELĖSE, NAUDOJANT BIOCHEMINĘ ANALIZĘ IR SILICIO ANALIZĘ, MES KETINAME NUSTATYTI VISUS HOG1 SUBSTRATUS, KURIE SUTEIKS INFORMACIJOS APIE NAUJAS SAPK FUNKCIJAS MIELĖSE, TAIP PAT NUSTATYS NAUJUS MOLEKULINIUS MECHANIZMUS, KURIE PADEDA REGULIUOTI PAGRINDINIUS BIOLOGINIUS PROCESUS. BE TO, MES IŠPLĖSIME SAVO ŽINIAS Į DVI PAGRINDINES HOG1 FUNKCIJAS, TOKIAS KAIP GENINĖS IŠRAIŠKOS REGULIAVIMAS IR LĄSTELIŲ CIKLO KONTROLĖ. DAUGELĮ GENETINIŲ IŠRAIŠKŲ REGULIAVIMO ASPEKTŲ KONTROLIUOJA HOG1; DABAR MES KETINAME GERIAU APIBŪDINTI SAVO VAIDMENĮ PAILGĖJIMO PROCESE IR GALIMĄ HOG1 ASOCIACIJĄ SU RNA. LĄSTELIŲ CIKLAS YRA AIŠKIAI REGULIUOJAMAS HOG1 REAGUOJANT Į STRESĄ. KETINAME IŠPLĖSTI SAVO ŽINIAS APIE LĄSTELIŲ CIKLO REGULIAVIMĄ, APIBŪDINDAMI NAUJĄ KONTROLINĮ TAŠKĄ S FAZĖJE, KURI YRA BŪTINA SIEKIANT KOORDINUOTI GENINĘ IŠRAIŠKĄ SU REPLIKACIJA. ŠIE ASPEKTAI TAIP PAT BUS PAGRINDINIS MŪSŲ TIKSLAS ATLIEKANT TYRIMUS SU P38 ŽINDUOLIŲ LĄSTELĖSE. DIDŽIULIS PAGRINDINIŲ MIELIŲ IR ŽINDUOLIŲ FUNKCIJŲ IŠSAUGOJIMAS PASKATINO MUS IŠTIRTI, KAIP REGULIUOJAMAS RB VYKDOMAS CIKLINŲ VALDYMAS, IR NUSTATĖME, KAD ŠIS REGLAMENTAS GALI BŪTI LABAI SVARBUS SIEKIANT KONTROLIUOTI LĄSTELIŲ PROLIFERACIJĄ VĖŽIO LĄSTELĖSE. PANAŠIAI, FAZĖS S PROGRESAVIMO KONTROLĖ YRA LABAI SVARBI SIEKIANT IŠLAIKYTI GENOMINĮ VIENTISUMĄ. ŠIAME PROJEKTE MES TIRSIME, AR ŽINDUOLIUOSE YRA KONTROLĖS PUNKTAS, PANAŠUS Į TĄ, KURIS APTIKTAS MIELĖSE. BE TO, PAPILDYSIME SAVO TYRIMUS MRNR BIOGENEZĖS IR SUJUNGIMO PROCESO SRITYJE SU PASAULINE GENINĖS RAIŠKOS, KURIĄ PALAIKO P38, ANALIZE, ATSIŽVELGDAMI Į REGLAMENTO SVARBĄ IR CHROMATINO STRUKTŪRĄ. NORĖDAMI APIBRĖŽTI NAUJAS P38 FUNKCIJAS, ATLIKSIME VISO GENOMO GENETINĘ ATRANKĄ, KAD NUSTATYTUME TAS VEIKLAS, REIKALINGAS LĄSTELIŲ PRISITAIKYMUI PRIE STRESO, IR APIBRĖŽTI NAUJUS SAPK TIKSLUS MAMIFER. ŠIOS ATRANKINĖS PATIKROS TURI BŪTI DERINAMOS SU KIEKYBINE IR MATEMATINE SIGNALŲ PERDAVIMO PROCESO ATSKIROSE LĄSTELĖSE ANALIZE. ČIA GAUTI DUOMENYS TURĖTŲ PADĖTI GERIAU SUPRASTI BIOLOGINES ŠIŲ FERMENTŲ FUNKCIJAS IR GERIAU SUPRASTI PRISITAIKYMO PRIE STRESO REAKCIJAS TIEK MIELĖSE, TIEK ŽINDUOLIUOSE. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
PROTEIN KINAZE AKTIVIRANE STRESOM (SAPK) IMAJU SREDIŠNJU ULOGU U MAKSIMIZIRANJU PREŽIVLJAVANJA STANICA DO NAGLIH PROMJENA U OKOLIŠU. PROTOTIPICAS SAPKS SU KVASAC HOG1 I SISAVAC P38. AKTIVACIJA SAPKS HOG1 ILI P38 REZULTIRA STVARANJEM SKUPA ODGOVORA NA PRILAGODBU KOJI UKLJUČUJE MODULACIJU MNOGIH ASPEKATA STANIČNE FIZIOLOGIJE. IZNENAĐUJUĆE, MNOGI OD TIH ASPEKATA SU OČUVANI IZMEĐU KVASCA I STANICA SISAVACA. GLAVNI CILJ OVOG PROJEKTA JE GLOBALNA KARAKTERIZACIJA MOLEKULARNIH MEHANIZAMA POTREBNIH ZA PRILAGODBU STRESU KOJI SAPKS POSREDUJE U KVASCU I SISAVCIMA. U KVASCU, KORIŠTENJEM BIOKEMIJSKE ANALIZE I ANALIZE SILICO, NAMJERAVAMO IDENTIFICIRATI SVE HOG1 SUPSTRATE, KOJI ĆE PRUŽITI INFORMACIJE O NOVIM FUNKCIJAMA SAPK-A U KVASCU, KAO I DEFINIRATI NOVE MOLEKULARNE MEHANIZME KOJI SLUŽE ZA REGULACIJU KLJUČNIH BIOLOŠKIH PROCESA. OSIM TOGA, PROŠIRIT ĆEMO SVOJE ZNANJE NA DVIJE OSNOVNE FUNKCIJE ZA HOG1, POPUT REGULACIJE GENSKOG IZRAŽAVANJA I KONTROLE STANIČNOG CIKLUSA. MNOGI ASPEKTI GENSKE EKSPRESIJE REGULIRANI SU HOG1; SADA NAMJERAVAMO BOLJE OKARAKTERIZIRATI NJEGOVU ULOGU U PROCESU PRODULJENJA I MOGUĆEM UDRUŽENJU HOG1 U RNA. CIKLUS STANICA JASNO REGULIRA HOG1 KAO ODGOVOR NA STRES. NAMJERAVAMO PROŠIRITI SVOJE ZNANJE U REGULACIJI STANIČNOG CIKLUSA KARAKTERIZIRAJUĆI NOVU KONTROLNU TOČKU U FAZI S KOJA JE POTREBNA ZA KOORDINACIJU GENSKOG IZRAZA S REPLIKACIJOM. TI ĆE ASPEKTI BITI I NAŠ GLAVNI CILJ U ISPITIVANJIMA S P38 NA STANICAMA SISAVACA. GOLEMO OČUVANJE OSNOVNIH FUNKCIJA KVASCA I SISAVACA DOVELO NAS JE DO PROUČAVANJA UREDBE O KONTROLI CIKLONA OD STRANE RB-A I OTKRILI SMO DA BI OVA UREDBA MOGLA BITI OD VELIKE VAŽNOSTI ZA KONTROLU PROLIFERACIJE STANICA U STANICAMA RAKA. SLIČNO TOME, KONTROLA NAPREDOVANJA FAZE S KLJUČNA JE ZA ODRŽAVANJE GENOMSKOG INTEGRITETA. U OVOM PROJEKTU PROUČAVAT ĆEMO POSTOJANJE KONTROLNE TOČKE KOD SISAVACA SLIČNE ONOJ OTKRIVENOJ U KVASCU. OSIM TOGA, NAŠA ISTRAŽIVANJA O BIOGENEZI MRNA I PROCESU SPAJANJA DOPUNIT ĆEMO GLOBALNOM ANALIZOM GENSKOG IZRAŽAVANJA POSREDOVANOG P38-OM S RELEVANTNOŠĆU UREDBE I STRUKTUROM KROMATINA. DA BISMO DEFINIRALI NOVE FUNKCIJE P38, OBAVIT ĆEMO GENETSKU PROBIR CIJELOG GENOMA KAKO BISMO IDENTIFICIRALI ONE AKTIVNOSTI POTREBNE ZA PRILAGODBU STANICA STRESU I DEFINIRALI NOVE CILJEVE ZA SAPK U MAMIFER-U. TI SE PREGLEDI TREBAJU KOMBINIRATI S KVANTITATIVNOM I MATEMATIČKOM ANALIZOM TRANSDUKCIJSKOG PROCESA SIGNALA U POJEDINAČNIM STANICAMA. PODACI DOBIVENI OVDJE TREBALI BI OMOGUĆITI BOLJE RAZUMIJEVANJE BIOLOŠKIH FUNKCIJA TIH ENZIMA I BOLJE RAZUMIJEVANJE ODGOVORA PRILAGODBE STRESU U KVASCA I SISAVACA. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΟΙ ΚΙΝΆΣΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΙΟΎΜΕΝΕΣ ΑΠΌ ΤΟ ΣΤΡΕΣ (SAPK) ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΖΟΥΝ ΚΕΝΤΡΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗ ΜΕΓΙΣΤΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉΣ ΕΠΙΒΊΩΣΗΣ ΣΕ ΞΑΦΝΙΚΈΣ ΑΛΛΑΓΈΣ ΣΤΟ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝ. ΤΑ PROTOTIPICAS SAPKS ΕΊΝΑΙ ΖΥΜΟΜΎΚΗΤΕΣ HOG1 ΚΑΙ ΘΗΛΑΣΤΙΚΆ P38. Η ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΩΝ SAPKS HOG1 Ή P38 ΈΧΕΙ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΤΗ ΔΗΜΙΟΥΡΓΊΑ ΕΝΌΣ ΣΥΝΌΛΟΥ ΑΠΑΝΤΉΣΕΩΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΤΗ ΔΙΑΜΌΡΦΩΣΗ ΠΟΛΛΏΝ ΠΤΥΧΏΝ ΤΗΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉΣ ΦΥΣΙΟΛΟΓΊΑΣ. ΠΑΡΑΔΌΞΩΣ, ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΠΤΥΧΈΣ ΔΙΑΤΗΡΟΎΝΤΑΙ ΜΕΤΑΞΎ ΖΥΜΟΜΥΚΉΤΩΝ ΚΑΙ ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΘΗΛΑΣΤΙΚΏΝ. Ο ΚΎΡΙΟΣ ΣΤΌΧΟΣ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΕΊΝΑΙ Ο ΠΑΓΚΌΣΜΙΟΣ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌΣ ΤΩΝ ΜΟΡΙΑΚΏΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΠΟΥ ΑΠΑΙΤΟΎΝΤΑΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΣΤΟ ΣΤΡΕΣ ΠΟΥ ΔΙΑΜΕΣΟΛΑΒΕΊ Η SAPKS ΤΌΣΟ ΣΤΗ ΜΑΓΙΆ ΌΣΟ ΚΑΙ ΣΤΑ ΘΗΛΑΣΤΙΚΆ. ΣΤΗ ΜΑΓΙΆ, ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΒΙΟΧΗΜΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΠΥΡΙΤΊΟΥ, ΣΚΟΠΕΎΟΥΜΕ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΟΥΜΕ ΌΛΑ ΤΑ ΥΠΟΣΤΡΏΜΑΤΑ HOG1, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΘΑ ΠΑΡΈΧΟΥΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΓΙΑ ΤΙΣ ΝΈΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΤΗΣ SAPK ΣΤΗ ΜΑΓΙΆ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΝΑ ΟΡΊΣΟΥΜΕ ΝΈΟΥΣ ΜΟΡΙΑΚΟΎΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΠΟΥ ΧΡΗΣΙΜΕΎΟΥΝ ΓΙΑ ΤΗ ΡΎΘΜΙΣΗ ΒΑΣΙΚΏΝ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΔΙΕΡΓΑΣΙΏΝ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΘΑ ΕΠΕΚΤΕΊΝΟΥΜΕ ΤΙΣ ΓΝΏΣΕΙΣ ΜΑΣ ΣΕ ΔΎΟ ΒΑΣΙΚΈΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΓΙΑ ΤΟ HOG1, ΌΠΩΣ Ο ΚΑΝΟΝΙΣΜΌΣ ΓΙΑ ΤΗ ΓΟΝΙΚΉ ΈΚΦΡΑΣΗ ΚΑΙ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΟΥ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎ ΚΎΚΛΟΥ. ΠΟΛΛΈΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΟΥ ΚΑΝΟΝΙΣΜΟΎ ΓΙΑ ΤΗ ΓΟΝΙΚΉ ΈΚΦΡΑΣΗ ΕΛΈΓΧΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ HOG1· ΤΏΡΑ, ΣΚΟΠΕΎΟΥΜΕ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΚΑΛΎΤΕΡΑ ΤΟ ΡΌΛΟ ΤΗΣ ΣΤΗ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΕΠΙΜΉΚΥΝΣΗΣ ΚΑΙ ΤΗΝ ΠΙΘΑΝΉ ΣΎΝΔΕΣΗ ΤΟΥ HOG1 ΣΤΟ RNA. Ο ΚΥΤΤΑΡΙΚΌΣ ΚΎΚΛΟΣ ΡΥΘΜΊΖΕΤΑΙ ΣΑΦΏΣ ΑΠΌ ΤΟ HOG1 ΩΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗ ΣΤΟ ΣΤΡΕΣ. ΣΚΟΠΕΎΟΥΜΕ ΝΑ ΔΙΕΥΡΎΝΟΥΜΕ ΤΙΣ ΓΝΏΣΕΙΣ ΜΑΣ ΣΤΟΝ ΚΑΝΟΝΙΣΜΌ ΤΟΥ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎ ΚΎΚΛΟΥ, ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΟΝΤΑΣ ΈΝΑ ΝΈΟ ΣΗΜΕΊΟ ΕΛΈΓΧΟΥ ΣΤΗ ΦΆΣΗ S ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΑΠΑΡΑΊΤΗΤΗ ΓΙΑ ΤΟ ΣΥΝΤΟΝΙΣΜΌ ΤΗΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΜΕ ΤΗΝ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉ. ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΠΤΥΧΈΣ ΘΑ ΕΊΝΑΙ ΕΠΊΣΗΣ Ο ΚΎΡΙΟΣ ΣΤΌΧΟΣ ΜΑΣ ΣΕ ΜΕΛΈΤΕΣ ΜΕ P38 ΣΕ ΚΎΤΤΑΡΑ ΘΗΛΑΣΤΙΚΏΝ. Η ΤΕΡΆΣΤΙΑ ΔΙΑΤΉΡΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΣΙΚΏΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΏΝ ΤΩΝ ΖΥΜΟΜΥΚΉΤΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΘΗΛΑΣΤΙΚΏΝ ΜΑΣ ΟΔΉΓΗΣΕ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΟΥ ΚΑΝΟΝΙΣΜΟΎ ΓΙΑ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΗΣ ΚΥΚΛΊΝΗΣ ΑΠΌ ΤΗΝ RB ΚΑΙ ΑΝΑΚΑΛΎΨΑΜΕ ΌΤΙ Ο ΚΑΝΟΝΙΣΜΌΣ ΑΥΤΌΣ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΕ ΝΑ ΈΧΕΙ ΜΕΓΆΛΗ ΣΗΜΑΣΊΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΟΥ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎ ΠΟΛΛΑΠΛΑΣΙΑΣΜΟΎ ΤΩΝ ΚΑΡΚΙΝΙΚΏΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ. ΟΜΟΊΩΣ, Ο ΈΛΕΓΧΟΣ ΤΗΣ ΕΞΈΛΙΞΗΣ ΤΗΣ ΦΆΣΗΣ S ΕΊΝΑΙ ΘΕΜΕΛΙΏΔΗΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΑΤΉΡΗΣΗ ΤΗΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΑΚΕΡΑΙΌΤΗΤΑΣ. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΎΠΑΡΞΗ ΕΝΌΣ ΣΗΜΕΊΟΥ ΕΛΈΓΧΟΥ ΣΕ ΘΗΛΑΣΤΙΚΆ ΠΑΡΌΜΟΙΟ ΜΕ ΑΥΤΌ ΠΟΥ ΑΝΑΚΑΛΎΦΘΗΚΕ ΣΤΗ ΜΑΓΙΆ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΘΑ ΣΥΜΠΛΗΡΏΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΜΑΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗ ΒΙΟΓΈΝΕΣΗ ΤΟΥ MRNA ΚΑΙ ΤΗ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΣΎΖΕΥΞΗΣ ΜΕ ΤΗ ΣΥΝΟΛΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΓΟΝΙΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΠΟΥ ΔΙΑΜΕΣΟΛΑΒΕΊ ΑΠΌ ΤΟ P38 ΜΕ ΤΗ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΟΥ ΚΑΝΟΝΙΣΜΟΎ ΚΑΙ ΤΗΣ ΔΟΜΉΣ ΤΗΣ ΧΡΩΜΑΤΊΝΗΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΟΡΊΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΝΈΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΤΟΥ P38, ΘΑ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΈΝΑΝ ΓΕΝΕΤΙΚΌ ΈΛΕΓΧΟ ΟΛΌΚΛΗΡΟΥ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΓΙΑ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΕΣ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΑΠΑΡΑΊΤΗΤΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΤΩΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΣΤΟ ΣΤΡΕΣ ΚΑΙ ΝΑ ΟΡΊΣΟΥΜΕ ΝΈΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ ΓΙΑ ΤΟ SAPK ΣΤΟ MAMIFER. ΟΙ ΕΞΕΤΆΣΕΙΣ ΑΥΤΈΣ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΣΥΝΔΥΑΣΤΟΎΝ ΜΕ ΠΟΣΟΤΙΚΉ ΚΑΙ ΜΑΘΗΜΑΤΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ ΜΕΤΑΓΩΓΉΣ ΣΗΜΆΤΩΝ ΣΕ ΜΕΜΟΝΩΜΈΝΑ ΚΕΛΙΆ. ΤΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΠΟΥ ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΕΔΏ ΘΑ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΠΑΡΈΧΟΥΝ ΚΑΛΎΤΕΡΗ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΤΩΝ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΏΝ ΤΩΝ ΕΝ ΛΌΓΩ ΕΝΖΎΜΩΝ ΚΑΙ ΝΑ ΚΑΤΑΝΟΟΎΝ ΚΑΛΎΤΕΡΑ ΤΙΣ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΙΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΣΤΟ ΣΤΡΕΣ ΤΌΣΟ ΣΤΗ ΜΑΓΙΆ ΌΣΟ ΚΑΙ ΣΤΑ ΘΗΛΑΣΤΙΚΆ. (Greek)
4 August 2022
0 references
STRESOM AKTIVOVANÉ PROTEÍNKINÁZY (SAPK) ZOHRÁVAJÚ ÚSTREDNÚ ÚLOHU PRI MAXIMALIZÁCII PREŽITIA BUNIEK NA NÁHLE ZMENY V ŽIVOTNOM PROSTREDÍ. PROTOTIPICAS SAPKS SÚ KVASINKY HOG1 A CICAVCE P38. AKTIVÁCIA SAPKS HOG1 ALEBO P38 VEDIE K VYTVORENIU SÚBORU ADAPTAČNÝCH REAKCIÍ, KTORÉ ZAHŔŇAJÚ MODULÁCIU MNOHÝCH ASPEKTOV BUNKOVEJ FYZIOLÓGIE. PREKVAPIVO SA MNOHÉ Z TÝCHTO ASPEKTOV ZACHOVÁVAJÚ MEDZI BUNKAMI KVASINIEK A CICAVCOV. HLAVNÝM CIEĽOM TOHTO PROJEKTU JE GLOBÁLNA CHARAKTERIZÁCIA MOLEKULÁRNYCH MECHANIZMOV POTREBNÝCH NA PRISPÔSOBENIE SA STRESU SPROSTREDKOVANÉMU SAPKS U KVASINIEK AJ CICAVCOV. V KVASINKÁCH PLÁNUJEME POMOCOU BIOCHEMICKEJ ANALÝZY A ANALÝZY SILIKOM IDENTIFIKOVAŤ VŠETKY SUBSTRÁTY HOG1, KTORÉ POSKYTNÚ INFORMÁCIE O NOVÝCH FUNKCIÁCH SAPK V KVASINKÁCH, AKO AJ DEFINOVAŤ NOVÉ MOLEKULÁRNE MECHANIZMY, KTORÉ SLÚŽIA NA REGULÁCIU KĽÚČOVÝCH BIOLOGICKÝCH PROCESOV. OKREM TOHO ROZŠÍRIME NAŠE ZNALOSTI DO DVOCH ZÁKLADNÝCH FUNKCIÍ PRE HOG1, AKO JE REGULÁCIA GÉNOVEJ EXPRESIE A KONTROLA BUNKOVÉHO CYKLU. MNOHÉ ASPEKTY NARIADENIA O GENETICKÝCH VÝRAZOCH SÚ KONTROLOVANÉ HOG1; TERAZ, MÁME V ÚMYSLE LEPŠIE CHARAKTERIZOVAŤ JEHO ÚLOHU V PROCESE PREDĹŽENIA A MOŽNÉ ZDRUŽENIE HOG1 K RNA. BUNKOVÝ CYKLUS JE JASNE REGULOVANÝ HOG1 V REAKCII NA STRES. MÁME V ÚMYSLE ROZŠÍRIŤ NAŠE ZNALOSTI V REGULÁCII BUNKOVÉHO CYKLU CHARAKTERIZÁCIOU NOVÉHO KONTROLNÉHO BODU VO FÁZE S, KTORÝ JE POTREBNÝ NA KOORDINÁCIU GENETICKÉHO VYJADRENIA S REPLIKÁCIOU. TIETO ASPEKTY BUDÚ NAŠÍM HLAVNÝM CIEĽOM AJ V ŠTÚDIÁCH S P38 V BUNKÁCH CICAVCOV. OBROVSKÉ ZACHOVANIE ZÁKLADNÝCH FUNKCIÍ KVASINIEK A CICAVCOV NÁS VIEDLO K ŠTÚDIU NARIADENIA O KONTROLE CYKLÍNU RB A ZISTILI SME, ŽE TOTO NARIADENIE BY MOHLO MAŤ VEĽKÝ VÝZNAM PRE KONTROLU PROLIFERÁCIE BUNIEK V RAKOVINOVÝCH BUNKÁCH. PODOBNE AJ KONTROLA PROGRESIE FÁZY S MÁ ZÁSADNÝ VÝZNAM PRE ZACHOVANIE GENÓMOVEJ INTEGRITY. V TOMTO PROJEKTE BUDEME SKÚMAŤ EXISTENCIU KONTROLNÉHO BODU U CICAVCOV PODOBNÉHO TOMU, KTORÝ SA OBJAVIL V KVASINKÁCH. OKREM TOHO NAŠE ŠTÚDIE V BIOGENÉZE MRNA A V PROCESE SPÁJANIA DOPLNÍME GLOBÁLNOU ANALÝZOU GÉNOVEJ EXPRESIE SPROSTREDKOVANEJ P38 S VÝZNAMOM NARIADENIA A ŠTRUKTÚRY CHROMATÍNU. NA DEFINOVANIE NOVÝCH FUNKCIÍ P38 VYKONÁME GENETICKÝ SKRÍNING CELÉHO GENÓMU, ABY SME IDENTIFIKOVALI ČINNOSTI POTREBNÉ NA ADAPTÁCIU BUNIEK NA STRES A DEFINOVALI NOVÉ CIELE PRE SAPK V SPOLOČNOSTI MAMIFER. TIETO SKRÍNINGY SA MAJÚ KOMBINOVAŤ S KVANTITATÍVNOU A MATEMATICKOU ANALÝZOU PROCESU PRENOSU SIGNÁLOV V JEDNOTLIVÝCH BUNKÁCH. ZÍSKANÉ ÚDAJE BY MALI ZABEZPEČIŤ LEPŠIE POCHOPENIE BIOLOGICKÝCH FUNKCIÍ TÝCHTO ENZÝMOV A LEPŠIE POCHOPIŤ REAKCIE ADAPTÁCIE NA STRES U KVASINIEK AJ CICAVCOV. (Slovak)
4 August 2022
0 references
STRESSILLÄ AKTIVOIDUILLA PROTEIINIKINAASEILLA (SAPK) ON KESKEINEN ROOLI SOLUJEN ELOONJÄÄMISEN MAKSIMOINNISSA YMPÄRISTÖN ÄKILLISIIN MUUTOKSIIN. PROTOTIPICAS SAPKS ON HIIVA HOG1 JA NISÄKÄS P38. SAPKS HOG1:N TAI P38:N AKTIVOINTI JOHTAA SIIHEN, ETTÄ SYNTYY JOUKKO SOPEUTUMISVASTEITA, JOIHIN SISÄLTYY SOLUJEN FYSIOLOGIAN MONIEN NÄKÖKOHTIEN MUKAUTTAMINEN. YLLÄTTÄEN MONET NÄISTÄ NÄKÖKOHDISTA SÄILYVÄT HIIVAN JA NISÄKÄSSOLUJEN VÄLILLÄ. HANKKEEN PÄÄTAVOITTEENA ON NIIDEN MOLEKYYLIMEKANISMIEN MAAILMANLAAJUINEN LUONNEHDINTA, JOITA TARVITAAN SAPKS:N AIHEUTTAMAN STRESSIN SOPEUTUMISEEN HIIVA- JA NISÄKKÄISSÄ. HIIVASSA, BIOKEMIALLISTEN ANALYYSIEN JA SILIKOANALYYSIN AVULLA, AIOMME TUNNISTAA KAIKKI HOG1-SUBSTRAATIT, JOTKA ANTAVAT TIETOA SAPK:N UUSISTA TOIMINNOISTA HIIVASSA SEKÄ MÄÄRITTELEVÄT UUDET MOLEKYYLIMEKANISMIT, JOILLA SÄÄNNELLÄÄN KESKEISIÄ BIOLOGISIA PROSESSEJA. LISÄKSI LAAJENNAMME TIETÄMYSTÄMME KAHTEEN PERUSTOIMINTOON HOG1: LLE, KUTEN GEENIEN ILMENTYMÄN JA SOLUSYKLIN HALLINNAN SÄÄNTELY. MONIA GEENIEN ILMENTYMIÄ KOSKEVAN ASETUKSEN NÄKÖKOHTIA VALVOTAAN HOG1:LLÄ; AIOMME NYT KUVATA PAREMMIN SEN ROOLIA VENYMÄPROSESSISSA JA HOG1:N MAHDOLLISTA YHDISTYMISTÄ RNA:HAN. HOG1 SÄÄTELEE SELVÄSTI SOLUSYKLIÄ STRESSIN VUOKSI. AIOMME LAAJENTAA TIETÄMYSTÄMME SOLUSYKLIN SÄÄNTELYSSÄ LUONNEHTIMALLA VAIHEESSA S UUTTA TARKASTUSPISTETTÄ, JOKA ON TARPEEN GEENISEN ILMENTYMÄN KOORDINOIMISEKSI REPLIKOINNIN KANSSA. NÄMÄ NÄKÖKOHDAT OVAT MYÖS TÄRKEIN TAVOITTEEMME TUTKIMUKSISSA P38 NISÄKÄSSOLUJA. HIIVAN JA NISÄKKÄIDEN PERUSTOIMINTOJEN VALTAVA SÄILYMINEN ON JOHTANUT SIIHEN, ETTÄ TUTKIMME RB:N HARJOITTAMAA SYKLIN VALVONTAA KOSKEVAA ASETUSTA, JA OLEMME HAVAINNEET, ETTÄ TÄLLÄ ASETUKSELLA VOISI OLLA SUURI MERKITYS SYÖPÄSOLUJEN PROLIFERAATIOLLE. SAMOIN VAIHEEN S ETENEMISEN HALLINTA ON OLENNAISEN TÄRKEÄÄ GENOMISEN EHEYDEN SÄILYTTÄMISEKSI. TÄSSÄ HANKKEESSA TUTKIMME, ONKO OLEMASSA TARKASTUSPISTE NISÄKKÄISSÄ SAMANLAINEN KUIN HIIVA. LISÄKSI TÄYDENNÄMME MRNA:N BIOGENEESIÄ JA LIITOSPROSESSIA KOSKEVIA TUTKIMUKSIAMME P38:N VÄLITTÄMÄN GENEETTISEN ILMENTYMÄN MAAILMANLAAJUISELLA ANALYYSILLÄ, JOLLA ON MERKITYSTÄ ASETUKSEN JA KROMATIININ RAKENTEEN KANNALTA. P38:N UUSIEN TOIMINTOJEN MÄÄRITTELEMISEKSI TEEMME KOKO GENOMIN GENEETTISEN SEULONNAN TUNNISTAAKSEMME NE TOIMINNOT, JOITA SOLUJEN SOPEUTUMINEN STRESSIIN EDELLYTTÄÄ, JA MÄÄRITELLÄKSEMME UUDET TAVOITTEET SAPK:LLE MAMIFERISSA. NÄMÄ SEULONNAT ON YHDISTETTÄVÄ YKSITTÄISTEN SOLUJEN SIGNAALIEN TRANSDUKTIOPROSESSIN KVANTITATIIVISEEN JA MATEMAATTISEEN ANALYYSIIN. TÄSSÄ SAATUJEN TIETOJEN PITÄISI AUTTAA YMMÄRTÄMÄÄN PAREMMIN NÄIDEN ENTSYYMIEN BIOLOGISIA TOIMINTOJA JA SAADA PAREMPI KÄSITYS SEKÄ HIIVAN ETTÄ NISÄKKÄIDEN STRESSIIN SOPEUTUMISEN VASTEISTA. (Finnish)
4 August 2022
0 references
KINAZY BIAŁKOWE AKTYWOWANE PRZEZ STRES (SAPK) ODGRYWAJĄ CENTRALNĄ ROLĘ W MAKSYMALIZACJI PRZEŻYWALNOŚCI KOMÓREK DO NAGŁYCH ZMIAN W ŚRODOWISKU. PROTOTIPICAS SAPKS TO DROŻDŻE HOG1 I SSAKI P38. AKTYWACJA SAPKS HOG1 LUB P38 POWODUJE GENEROWANIE ZESTAWU ODPOWIEDZI ADAPTACYJNYCH, KTÓRE OBEJMUJĄ MODULACJĘ WIELU ASPEKTÓW FIZJOLOGII KOMÓRKOWEJ. CO ZASKAKUJĄCE, WIELE Z TYCH ASPEKTÓW JEST ZACHOWANYCH MIĘDZY KOMÓRKAMI DROŻDŻY I SSAKÓW. GŁÓWNYM CELEM TEGO PROJEKTU JEST GLOBALNA CHARAKTERYSTYKA MECHANIZMÓW MOLEKULARNYCH NIEZBĘDNYCH DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO STRESU PRZEZ SAPKS ZARÓWNO U DROŻDŻY, JAK I SSAKÓW. W DROŻDŻY, POPRZEZ ZASTOSOWANIE ANALIZY BIOCHEMICZNEJ I ANALIZY SILICO, ZAMIERZAMY ZIDENTYFIKOWAĆ WSZYSTKIE SUBSTRATY HOG1, KTÓRE DOSTARCZAJĄ INFORMACJI NA TEMAT NOWYCH FUNKCJI SAPK W DROŻDŻY, A TAKŻE DEFINIUJĄ NOWE MECHANIZMY MOLEKULARNE, KTÓRE SŁUŻĄ DO REGULACJI KLUCZOWYCH PROCESÓW BIOLOGICZNYCH. PONADTO POSZERZYMY NASZĄ WIEDZĘ O DWÓCH PODSTAWOWYCH FUNKCJACH HOG1, TAKICH JAK REGULACJA EKSPRESJI GENETYCZNEJ I KONTROLI CYKLU KOMÓRKOWEGO. WIELE ASPEKTÓW ROZPORZĄDZENIA W SPRAWIE EKSPRESJI GENETYCZNEJ JEST KONTROLOWANYCH PRZEZ HOG1; TERAZ ZAMIERZAMY LEPIEJ SCHARAKTERYZOWAĆ JEGO ROLĘ W PROCESIE WYDŁUŻANIA I EWENTUALNEGO STOWARZYSZENIA HOG1 DO RNA. CYKL KOMÓRKOWY JEST WYRAŹNIE REGULOWANY PRZEZ HOG1 W ODPOWIEDZI NA STRES. ZAMIERZAMY POSZERZYĆ NASZĄ WIEDZĘ W ZAKRESIE REGULACJI CYKLU KOMÓRKOWEGO POPRZEZ SCHARAKTERYZOWANIE NOWEGO PUNKTU KONTROLNEGO W FAZIE S, KTÓRY JEST NIEZBĘDNY DO KOORDYNOWANIA EKSPRESJI GENETYCZNEJ Z REPLIKACJĄ. TE ASPEKTY BĘDĄ RÓWNIEŻ NASZYM GŁÓWNYM CELEM W BADANIACH NAD P38 NA KOMÓRKACH SSAKÓW. OGROMNA OCHRONA PODSTAWOWYCH FUNKCJI U DROŻDŻY I SSAKÓW DOPROWADZIŁA NAS DO ZBADANIA REGULACJI KONTROLI CYKLINY PRZEZ RB I ODKRYLIŚMY, ŻE ROZPORZĄDZENIE TO MOŻE MIEĆ OGROMNE ZNACZENIE DLA KONTROLI PROLIFERACJI KOMÓREK W KOMÓRKACH NOWOTWOROWYCH. PODOBNIE, KONTROLA PROGRESJI FAZY S MA ZASADNICZE ZNACZENIE DLA UTRZYMANIA INTEGRALNOŚCI GENOMOWEJ. W TYM PROJEKCIE ZBADAMY ISTNIENIE PUNKTU KONTROLNEGO U SSAKÓW PODOBNEGO DO ODKRYTEGO W DROŻDŻY. PONADTO UZUPEŁNIMY NASZE BADANIA W ZAKRESIE BIOGENEZY MRNA I PROCESU ŁĄCZENIA GLOBALNĄ ANALIZĄ EKSPRESJI GENETYCZNEJ PROWADZONĄ PRZEZ P38 O ADEKWATNOŚĆ ROZPORZĄDZENIA I STRUKTURY CHROMATYNY. ABY ZDEFINIOWAĆ NOWE FUNKCJE P38, PRZEPROWADZIMY BADANIA GENETYCZNE CAŁEGO GENOMU W CELU ZIDENTYFIKOWANIA CZYNNOŚCI NIEZBĘDNYCH DO ADAPTACJI KOMÓREK DO STRESU I OKREŚLENIA NOWYCH CELÓW SAPK W MAMIFER. TE BADANIA PRZESIEWOWE MAJĄ BYĆ POŁĄCZONE Z ILOŚCIOWĄ I MATEMATYCZNĄ ANALIZĄ PROCESU TRANSDUKCJI SYGNAŁÓW W POSZCZEGÓLNYCH KOMÓRKACH. UZYSKANE TUTAJ DANE POWINNY ZAPEWNIĆ LEPSZE ZROZUMIENIE FUNKCJI BIOLOGICZNYCH TYCH ENZYMÓW I UZYSKAĆ LEPSZE ZROZUMIENIE REAKCJI ADAPTACJI DO STRESU ZARÓWNO U DROŻDŻY, JAK I SSAKÓW. (Polish)
4 August 2022
0 references
A STRESSZ-AKTIVÁLT FEHÉRJEKINÁZOK (SAPK) KÖZPONTI SZEREPET JÁTSZANAK A SEJTTÚLÉLÉS MAXIMALIZÁLÁSÁBAN A HIRTELEN KÖRNYEZETI VÁLTOZÁSOKKAL SZEMBEN. A PROTOTIPICAS SAPKS A HOG1 ÉLESZTŐ ÉS A P38 EMLŐS. A SAPKS HOG1 VAGY P38 AKTIVÁLÁSA OLYAN ADAPTÁCIÓS VÁLASZOKAT EREDMÉNYEZ, AMELYEK A SEJTFIZIOLÓGIA SZÁMOS ASPEKTUSÁNAK MODULÁCIÓJÁT IS MAGUKBAN FOGLALJÁK. MEGLEPŐ MÓDON SOK ILYEN SZEMPONT MEGMARAD AZ ÉLESZTŐ ÉS AZ EMLŐS SEJTEK KÖZÖTT. A PROJEKT FŐ CÉLJA A SAPKS ÁLTAL KÖZVETÍTETT STRESSZHEZ VALÓ ALKALMAZKODÁSHOZ SZÜKSÉGES MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSOK GLOBÁLIS JELLEMZÉSE MIND AZ ÉLESZTŐBEN, MIND AZ EMLŐSÖKBEN. AZ ÉLESZTŐBEN BIOKÉMIAI ELEMZÉS ÉS IN SILICO ELEMZÉS SEGÍTSÉGÉVEL SZÁNDÉKOZUNK AZONOSÍTANI AZ ÖSSZES HOG1 SZUBSZTRÁTOT, AMELY INFORMÁCIÓT NYÚJT A SAPK ÚJ FUNKCIÓIRÓL AZ ÉLESZTŐBEN, VALAMINT ÚJ MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSOKAT HATÁROZ MEG, AMELYEK A KULCSFONTOSSÁGÚ BIOLÓGIAI FOLYAMATOK SZABÁLYOZÁSÁRA SZOLGÁLNAK. EMELLETT TUDÁSUNKAT A HOG1 KÉT ALAPVETŐ FUNKCIÓJÁRA BŐVÍTJÜK, MINT PÉLDÁUL A GÉNEXPRESSZIÓ SZABÁLYOZÁSA ÉS A SEJTCIKLUS-SZABÁLYOZÁS. A GENETIKAI KIFEJEZÉSEKRŐL SZÓLÓ RENDELET SZÁMOS ASPEKTUSÁT A HOG1 SZABÁLYOZZA; MOST ARRA TÖREKSZÜNK, HOGY JOBBAN JELLEMEZZÜK SZEREPÉT A NYÚLÁSI FOLYAMATBAN ÉS A HOG1 LEHETSÉGES TÁRSULÁSÁT AZ RNA-HOZ. A SEJTCIKLUST EGYÉRTELMŰEN A HOG1 SZABÁLYOZZA A STRESSZRE ADOTT VÁLASZKÉNT. SZÁNDÉKUNKBAN ÁLL BŐVÍTENI TUDÁSUNKAT A SEJTCIKLUS SZABÁLYOZÁSÁBAN EGY ÚJ ELLENŐRZÉSI PONT JELLEMZÉSÉVEL AZ S FÁZISBAN, AMELY SZÜKSÉGES A GÉN KIFEJEZÉS ÉS A REPLIKÁCIÓ ÖSSZEHANGOLÁSÁHOZ. EZEK A SZEMPONTOK LESZNEK A FŐ CÉLUNK AZ EMLŐSSEJTEK P38-AS VIZSGÁLATAIBAN IS. AZ ÉLESZTŐBEN ÉS AZ EMLŐSÖKBEN AZ ALAPVETŐ FUNKCIÓK ÓRIÁSI MEGŐRZÉSE VEZETETT ARRA, HOGY TANULMÁNYOZZUK AZ RB ÁLTAL A CIKLONSZABÁLYOZÁSRÓL SZÓLÓ RENDELETET, ÉS FELFEDEZTÜK, HOGY EZ A RENDELET NAGY JELENTŐSÉGGEL BÍRHAT A RÁKOS SEJTEK SEJTPROLIFERÁCIÓJÁNAK SZABÁLYOZÁSÁBAN. HASONLÓKÉPPEN, AZ S FÁZIS PROGRESSZIÓJÁNAK ELLENŐRZÉSE ALAPVETŐ FONTOSSÁGÚ A GENOMIKAI INTEGRITÁS FENNTARTÁSÁHOZ. EBBEN A PROJEKTBEN AZ ÉLESZTŐBEN FELFEDEZETT EMLŐSÖKHÖZ HASONLÓ ELLENŐRZŐPONT LÉTEZÉSÉT VIZSGÁLJUK. EMELLETT KIEGÉSZÍTJÜK AZ MRNS BIOGENEZISÉVEL ÉS A SPLICING FOLYAMATTAL KAPCSOLATOS VIZSGÁLATAINKAT A P38 ÁLTAL KÖZVETÍTETT GÉNEXPRESSZIÓ GLOBÁLIS ELEMZÉSÉVEL, A RENDELET RELEVANCIÁJÁVAL ÉS A KROMATIN SZERKEZETÉVEL. A P38 ÚJ FUNKCIÓINAK MEGHATÁROZÁSÁHOZ A TELJES GENOM GENETIKAI SZŰRÉSÉT VÉGEZZÜK, HOGY AZONOSÍTSUK AZOKAT A TEVÉKENYSÉGEKET, AMELYEK A SEJTEK STRESSZHEZ VALÓ ALKALMAZKODÁSÁHOZ SZÜKSÉGESEK, ÉS ÚJ CÉLOKAT HATÁROZUNK MEG A SAPK SZÁMÁRA A MAMIFER-BEN. EZEKET A SZŰRÉSEKET AZ EGYES SEJTEKBEN LÉVŐ JELEK TRANSZDUKCIÓS FOLYAMATÁNAK MENNYISÉGI ÉS MATEMATIKAI ELEMZÉSÉVEL KELL KOMBINÁLNI. AZ ITT KAPOTT ADATOKNAK JOBBAN MEG KELL ÉRTENIÜK EZEN ENZIMEK BIOLÓGIAI FUNKCIÓIT, ÉS JOBBAN MEG KELL ÉRTENIÜK AZ ÉLESZTŐBEN ÉS AZ EMLŐSÖKBEN A STRESSZHEZ VALÓ ALKALMAZKODÁS REAKCIÓIT. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
PROTEINOVÉ KINÁZY AKTIVOVANÉ STRESEM (SAPK) HRAJÍ ÚSTŘEDNÍ ROLI PŘI MAXIMALIZACI PŘEŽITÍ BUNĚK AŽ K NÁHLÝM ZMĚNÁM V ŽIVOTNÍM PROSTŘEDÍ. PROTOTIPICAS SAPKS JSOU KVASINKY HOG1 A SAVCI P38. AKTIVACE SAPKS HOG1 NEBO P38 VEDE K VYTVOŘENÍ SOUBORU ADAPTAČNÍCH REAKCÍ, KTERÉ ZAHRNUJÍ MODULACI MNOHA ASPEKTŮ BUNĚČNÉ FYZIOLOGIE. PŘEKVAPIVĚ JE MNOHO Z TĚCHTO ASPEKTŮ ZACHOVÁNO MEZI KVASINKAMI A BUŇKAMI SAVCŮ. HLAVNÍM CÍLEM TOHOTO PROJEKTU JE GLOBÁLNÍ CHARAKTERIZACE MOLEKULÁRNÍCH MECHANISMŮ NEZBYTNÝCH PRO ADAPTACI NA STRES ZPROSTŘEDKOVANÝ SAPKS JAK U KVASINEK, TAK U SAVCŮ. V KVASNICÍCH, POMOCÍ BIOCHEMICKÉ ANALÝZY A ANALÝZY IN SILICO, MÁME V ÚMYSLU IDENTIFIKOVAT VŠECHNY SUBSTRÁTY HOG1, KTERÉ POSKYTNOU INFORMACE O NOVÝCH FUNKCÍCH SAPK V KVASINKÁCH, A TAKÉ DEFINOVAT NOVÉ MOLEKULÁRNÍ MECHANISMY, KTERÉ SLOUŽÍ K REGULACI KLÍČOVÝCH BIOLOGICKÝCH PROCESŮ. KROMĚ TOHO ROZŠÍŘÍME NAŠE ZNALOSTI DO DVOU ZÁKLADNÍCH FUNKCÍ PRO HOG1, JAKO JE REGULACE GENOVÉ EXPRESE A ŘÍZENÍ BUNĚČNÉHO CYKLU. MNOHO ASPEKTŮ REGULACE GENOVÉ EXPRESE JE ŘÍZENO HOG1; NYNÍ MÁME V ÚMYSLU LÉPE CHARAKTERIZOVAT JEJÍ ÚLOHU V PROCESU PRODLOUŽENÍ A MOŽNÉ PŘIDRUŽENÍ HOG1 K RNA. BUNĚČNÝ CYKLUS JE JASNĚ REGULOVÁN HOG1 V REAKCI NA STRES. CHCEME ROZŠÍŘIT SVÉ ZNALOSTI V REGULACI BUNĚČNÉHO CYKLU CHARAKTERIZACÍ NOVÉHO KONTROLNÍHO BODU VE FÁZI S, KTERÝ JE NEZBYTNÝ PRO KOORDINACI GENOVÉ EXPRESE S REPLIKACÍ. TYTO ASPEKTY BUDOU TAKÉ NAŠÍM HLAVNÍM CÍLEM VE STUDIÍCH S P38 NA BUŇKÁCH SAVCŮ. OBROVSKÉ ZACHOVÁNÍ ZÁKLADNÍCH FUNKCÍ U KVASINEK A SAVCŮ NÁS VEDLO KE STUDIU NAŘÍZENÍ O KONTROLE CYKLINU ZE STRANY RB A ZJISTILI JSME, ŽE TOTO NAŘÍZENÍ BY MOHLO MÍT VELKÝ VÝZNAM PRO KONTROLU BUNĚČNÉ PROLIFERACE V RAKOVINNÝCH BUŇKÁCH. STEJNĚ TAK KONTROLA PROGRESE FÁZE S JE ZÁSADNÍ PRO ZACHOVÁNÍ GENOMICKÉ INTEGRITY. V TOMTO PROJEKTU BUDEME ZKOUMAT EXISTENCI KONTROLNÍHO BODU U SAVCŮ PODOBNÉHO TOMU, KTERÝ BYL OBJEVEN U KVASINEK. KROMĚ TOHO DOPLNÍME NAŠE STUDIE V OBLASTI BIOGENEZE MRNA A PROCESU SESAZOVÁNÍ O GLOBÁLNÍ ANALÝZU GENOVÉ EXPRESE ZPROSTŘEDKOVANÉ P38 S VÝZNAMEM REGULACE A STRUKTURY CHROMATINU. PRO DEFINOVÁNÍ NOVÝCH FUNKCÍ P38 PROVEDEME GENETICKÝ SCREENING CELÉHO GENOMU, ABYCHOM IDENTIFIKOVALI ČINNOSTI NEZBYTNÉ PRO ADAPTACI BUNĚK NA STRES A DEFINOVALI NOVÉ CÍLE SAPK V MAMIFERU. TYTO SCREENINGY MAJÍ BÝT KOMBINOVÁNY S KVANTITATIVNÍ A MATEMATICKOU ANALÝZOU PROCESU TRANSDUKCE SIGNÁLŮ V JEDNOTLIVÝCH BUŇKÁCH. ZDE ZÍSKANÉ ÚDAJE BY MĚLY LÉPE POROZUMĚT BIOLOGICKÝM FUNKCÍM TĚCHTO ENZYMŮ A LÉPE POROZUMĚT REAKCÍM ADAPTACE NA STRES JAK U KVASINEK, TAK U SAVCŮ. (Czech)
4 August 2022
0 references
STRESA AKTIVIZĒTĀM OLBALTUMVIELU KINĀZĒM (SAPK) IR GALVENĀ LOMA ŠŪNU IZDZĪVOŠANAS PALIELINĀŠANĀ LĪDZ PĒKŠŅĀM IZMAIŅĀM VIDĒ. PROTOTIPICAS SAPKS IR RAUGA HOG1 UN ZĪDĪTĀJU P38. SAPKS HOG1 VAI P38 AKTIVIZĒŠANAS REZULTĀTĀ RODAS ADAPTĀCIJAS REAKCIJU KOPUMS, KAS IETVER DAUDZU ŠŪNU FIZIOLOĢIJAS ASPEKTU MODULĀCIJU. PĀRSTEIDZOŠI, KA DAUDZI NO ŠIEM ASPEKTIEM TIEK SAGLABĀTI STARP RAUGA UN ZĪDĪTĀJU ŠŪNĀM. ŠĀ PROJEKTA GALVENAIS MĒRĶIS IR PASAULES MĒROGĀ RAKSTUROT MOLEKULĀROS MEHĀNISMUS, KAS NEPIECIEŠAMI, LAI PIELĀGOTOS STRESAM, KO SAPKS VEIC GAN RAUGA, GAN ZĪDĪTĀJU VIDŪ. RAUGA, IZMANTOJOT BIOĶĪMISKO ANALĪZI UN SILICO ANALĪZES, MĒS PLĀNOJAM IDENTIFICĒT VISUS HOG1 SUBSTRĀTUS, KAS SNIEGS INFORMĀCIJU PAR JAUNĀM SAPK FUNKCIJĀM RAUGA, KĀ ARĪ DEFINĒT JAUNUS MOLEKULĀROS MEHĀNISMUS, KAS KALPO, LAI REGULĒTU GALVENOS BIOLOĢISKOS PROCESUS. TURKLĀT MĒS PAPLAŠINĀSIM SAVAS ZINĀŠANAS DIVĀS HOG1 PAMATFUNKCIJĀS, PIEMĒRAM, GENOLOĢISKĀS EKSPRESIJAS REGULĀCIJĀ UN ŠŪNU CIKLA KONTROLĒ. DAUDZUS GENOGĒNAS EKSPRESIJAS REGULAS ASPEKTUS KONTROLĒ HOG1; TAGAD MĒS PLĀNOJAM LABĀK RAKSTUROT TĀS LOMU PAGARINĀŠANAS PROCESĀ UN IESPĒJAMO HOG1 ASOCIĀCIJU AR RNA. REAĢĒJOT UZ STRESU, ŠŪNU CIKLU SKAIDRI REGULĒ HOG1. MĒS PLĀNOJAM PAPLAŠINĀT SAVAS ZINĀŠANAS ŠŪNU CIKLA REGULĀ, RAKSTUROJOT JAUNU KONTROLPUNKTU FĀZĒ, KAS IR NEPIECIEŠAMA, LAI KOORDINĒTU ĢENERISKO EKSPRESIJU AR REPLIKĀCIJU. ŠIE ASPEKTI BŪS ARĪ MŪSU GALVENAIS MĒRĶIS PĒTĪJUMOS AR P38 ZĪDĪTĀJU ŠŪNĀS. MILZĪGĀ PAMATFUNKCIJU SAGLABĀŠANA RAUGA UN ZĪDĪTĀJU ORGANISMĀ IR LIKUSI MUMS IZPĒTĪT RB VEIKTO CIKLĪNA KONTROLES REGULU, UN MĒS ESAM ATKLĀJUŠI, KA ŠĪ REGULA VARĒTU BŪT ĻOTI SVARĪGA, LAI KONTROLĒTU ŠŪNU PROLIFERĀCIJU VĒŽA ŠŪNĀS. LĪDZĪGI, LAI SAGLABĀTU GENOMISKO INTEGRITĀTI, IR BŪTISKI KONTROLĒT FĀZES S PROGRESĒŠANU. ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS PĒTĪSIM, VAI ZĪDĪTĀJIEM IR KONTROLPUNKTS, KAS LĪDZĪGS RAUGAM. TURKLĀT MĒS PAPILDINĀSIM MŪSU PĒTĪJUMUS PAR MRNS BIOĢENĒZI UN SPLICĒŠANAS PROCESU AR P38 MEDIĒTĀS GENĒNISKĀS EKSPRESIJAS GLOBĀLO ANALĪZI, ŅEMOT VĒRĀ REGULAS NOZĪMI UN HROMATĪNA STRUKTŪRU. LAI DEFINĒTU JAUNAS P38 FUNKCIJAS, MĒS VEIKSIM VISA GENOMA ĢENĒTISKO SKRĪNINGU, LAI IDENTIFICĒTU TĀS DARBĪBAS, KAS NEPIECIEŠAMAS ŠŪNU ADAPTĀCIJAI STRESAM, UN NOTEIKTU JAUNUS SAPK MĒRĶUS MAMIFER. ŠIE SKRĪNINGI JĀAPVIENO AR SIGNĀLU TRANSDUKCIJAS PROCESA KVANTITATĪVO UN MATEMĀTISKO ANALĪZI ATSEVIŠĶĀS ŠŪNĀS. ŠEIT IEGŪTAJIEM DATIEM BŪTU JĀSNIEDZ LABĀKA IZPRATNE PAR ŠO FERMENTU BIOLOĢISKAJĀM FUNKCIJĀM UN JĀIEGŪST LABĀKA IZPRATNE PAR REAKCIJU UZ PIELĀGOŠANOS STRESAM GAN RAUGA, GAN ZĪDĪTĀJU GADĪJUMĀ. (Latvian)
4 August 2022
0 references
TÁ RÓL LÁRNACH AG KINASES PRÓITÉINE GNÍOMHACHTAITHE STRUIS (SAPK) MAIDIR LE MARTHANAIS CILLE A UASMHÉADÚ LE HATHRUITHE TOBANNA SA CHOMHSHAOL. IS IAD NA SAPKS PROTOTIPICAS GIOSTA HOG1 AGUS MAMACH P38. MAR THORADH AR GHNÍOMHACHTÚ SAPKS HOG1 NÓ P38 TÁ SRAITH DE FHREAGAIRTÍ OIRIÚNAITHE Á NGINIÚINT LENA N-ÁIRÍTEAR MODHNÚ AR GO LEOR GNÉITHE DEN FHISEOLAÍOCHT CHEALLACHA. IS IONADH É, CAOMHNAÍTEAR GO LEOR DE NA GNÉITHE SEO IDIR GIOSTA AGUS CEALLA MAMACH. IS É PRÍOMHCHUSPÓIR AN TIONSCADAIL SEO NÁ TRÉITHRIÚ DOMHANDA NA MEICNÍOCHTAÍ MÓILÍNEACHA IS GÁ CHUN OIRIÚNÚ DO STRUS A DHÉANANN SAPKS I GIOSTA AGUS I MAMAIGH ARAON. I GIOSTA, TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS ANAILÍS BITHCHEIMICEACH AGUS IN ANAILÍS SILICO, TÁ SÉ AR INTINN AGAINN GACH FOSHRAITH HOG1 A AITHINT, RUD A CHUIRFIDH FAISNÉIS AR FÁIL MAIDIR LE FEIDHMEANNA NUA SAPK I GIOSTA, CHOMH MAITH LE MEICNÍOCHTAÍ MÓILÍNEACHA NUA A FHEIDHMÍONN CHUN PRÍOMHPHRÓISIS BHITHEOLAÍOCHA A RIALÁIL. INA THEANNTA SIN, DÉANFAIMID ÁR N-EOLAS A LEATHNÚ INA DHÁ FHEIDHM BHUNÚSACHA DO HOG1, MAR SHAMPLA AN RIALACHÁN MAIDIR LE LÉIRIÚ GENIC AGUS RIALÚ TIMTHRIALL CILLE. TÁ GO LEOR GNÉITHE DEN RIALACHÁN MAIDIR LE LÉIRIÚ GÉINE Á RIALÚ AG HOG1; ANOIS, AR INTINN AGAINN CHUN CHARACTERIZE NÍOS FEARR A RÓL SA PHRÓISEAS FADÚ AGUS AN CUMANN FÉIDEARTHA HOG1 LEIS AN RNA. TÁ AN TIMTHRIALL CILLE RIALAITHE GO SOILÉIR AG HOG1 MAR FHREAGRA AR STRUS. TÁ SÉ I GCEIST AGAINN ÁR N-EOLAS A LEATHNÚ MAIDIR LE TIMTHRIALL NA GCEALL A RIALÁIL TRÍ SHEICPHOINTE NUA A LÉIRIÚ SA CHÉIM ATÁ RIACHTANACH CHUN LÉIRIÚ GENIC A CHOMHORDÚ LE MACASAMHLÚ. BEIDH NA GNÉITHE SEO MAR PHRÍOMHCHUSPÓIR AGAINN I STAIDÉIR LE P38 I GCEALLA MAMACHA. MAR GHEALL AR CHAOMHNÚ OLLMHÓR NA BHFEIDHMEANNA BUNÚSACHA I NGIOSTA AGUS I MAMAIGH, TÁ STAIDÉAR DÉANTA AGAINN AR AN RIALACHÁN MAIDIR LE RIALÚ CIOGLÍNE AG AN EITINN AGUS TÁ SÉ FAIGHTE AMACH AGAINN GO BHFÉADFADH AN RIALACHÁN SEO A BHEITH AN-ÁBHARTHA MAIDIR LE HIOMADÚ CEALL I GCEALLA AILSE A RIALÚ. AR AN GCAOI CHÉANNA, TÁ RIALÚ AR DHUL CHUN CINN CHÉIM S BUNRIACHTANACH CHUN AN TSLÁINE GHÉANÓMAÍOCH A CHOINNEÁIL. SA TIONSCADAL SEO DÉANFAIMID STAIDÉAR AR GO BHFUIL SEICPHOINTE I MAMAIGH COSÚIL LEIS SIN A FUAIR SÉ AMACH I GIOSTA. INA THEANNTA SIN, DÉANFAIMID ÁR GCUID STAIDÉAR I MBITHGHINEAS MRNA AGUS SA PHRÓISEAS SPLICING A CHOMHLÁNÚ LEIS AN ANAILÍS DHOMHANDA AR LÉIRIÚ GÉICE ARNA IDIRGHABHÁIL AG P38 LE HÁBHARTHACHT AN RIALACHÁIN AGUS STRUCHTÚR CHROMATIN. CHUN FEIDHMEANNA NUA P38 A SHAINIÚ, DÉANFAIMID SCAGADH GÉINITEACH AR AN NGÉANÓM AR FAD CHUN NA GNÍOMHAÍOCHTAÍ SIN A SHAINAITHINT ATÁ RIACHTANACH LE HAGHAIDH OIRIÚNÚ CILLE GO STRUS AGUS SPRIOCANNA NUA A SHAINIÚ DO SAPK I MAMIFER. DÉANFAR NA SCAGTHÁSTÁLACHA SIN A CHOMHCHEANGAL LE HANAILÍS CHAINNÍOCHTÚIL AGUS MHATAMAITICIÚIL AR PHRÓISEAS TRASDUCHTAITHE COMHARTHAÍ I GCEALLA AONAIR. BA CHÓIR GO DTABHARFADH NA SONRAÍ A FHAIGHTEAR ANSEO TUISCINT NÍOS FEARR AR FHEIDHMEANNA BITHEOLAÍOCHA NA N-EINSÍMÍ SEO AGUS TUISCINT NÍOS FEARR A FHÁIL AR NA FREAGAIRTÍ A BHAINEANN LE HOIRIÚNÚ DO STRUS I GIOSTA AGUS I MAMAIGH ARAON. (Irish)
4 August 2022
0 references
S STRESOM AKTIVIRANE PROTEINSKE KINAZE (SAPK) IMAJO OSREDNJO VLOGO PRI MAKSIMIRANJU PREŽIVETJA CELIC DO NENADNIH SPREMEMB V OKOLJU. PROTOTIPICAS SAPKS STA KVAS HOG1 IN SESALEC P38. AKTIVACIJA SAPKS HOG1 ALI P38 POVZROČI NASTANEK NIZA PRILAGODITVENIH ODZIVOV, KI VKLJUČUJEJO MODULACIJO ŠTEVILNIH VIDIKOV CELIČNE FIZIOLOGIJE. PRESENETLJIVO JE, DA SO MNOGI OD TEH VIDIKOV OHRANJENI MED KVASOVKAMI IN CELICAMI SESALCEV. GLAVNI CILJ TEGA PROJEKTA JE GLOBALNA KARAKTERIZACIJA MOLEKULARNIH MEHANIZMOV, POTREBNIH ZA PRILAGODITEV STRESU, KI GA SAPKS POSREDUJE PRI KVASU IN SESALCIH. V KVASOVKAH NAMERAVAMO Z UPORABO BIOKEMIČNIH ANALIZ IN IN SILICO ANALIZO IDENTIFICIRATI VSE SUBSTRATE HOG1, KI BODO ZAGOTOVILI INFORMACIJE O NOVIH FUNKCIJAH SAPK V KVASOVKAH TER OPREDELILI NOVE MOLEKULARNE MEHANIZME, KI SLUŽIJO URAVNAVANJU KLJUČNIH BIOLOŠKIH PROCESOV. POLEG TEGA BOMO SVOJE ZNANJE RAZŠIRILI NA DVE OSNOVNI FUNKCIJI ZA HOG1, KOT STA REGULACIJA GENSKEGA IZRAŽANJA IN NADZOR CELIČNEGA CIKLA. ŠTEVILNE VIDIKE REGULACIJE GENSKEGA IZRAŽANJA NADZORUJE HOG1; ZDAJ NAMERAVAMO BOLJE OPREDELITI NJENO VLOGO V PROCESU RAZTEZNOSTI IN MOREBITNO ZDRUŽENJE HOG1 K RNA. CELIČNI CIKEL JE JASNO UREJEN S HOG1 KOT ODZIV NA STRES. NAŠE ZNANJE O REGULACIJI CELIČNEGA CIKLA NAMERAVAMO RAZŠIRITI Z OPREDELITVIJO NOVE KONTROLNE TOČKE V FAZI S, KI JE POTREBNA ZA USKLAJEVANJE GENSKEGA IZRAŽANJA Z REPLIKACIJO. TI VIDIKI BODO TUDI NAŠ GLAVNI CILJ ŠTUDIJ S P38 V CELICAH SESALCEV. ZARADI OGROMNEGA OHRANJANJA OSNOVNIH FUNKCIJ PRI KVASU IN SESALCIH SMO PREUČILI UREDITEV NADZORA NAD CIKLINOM, KI JO IZVAJA RB, IN UGOTOVILI SMO, DA BI LAHKO BILA TA UREDBA ZELO POMEMBNA ZA NADZOR PROLIFERACIJE CELIC V RAKAVIH CELICAH. PODOBNO JE NADZOR NAPREDOVANJA FAZE S TEMELJNEGA POMENA ZA OHRANJANJE GENOMSKE CELOVITOSTI. V TEM PROJEKTU BOMO PREUČILI OBSTOJ KONTROLNE TOČKE PRI SESALCIH, KI JE PODOBNA TISTI, ODKRITI V KVASOVKAH. POLEG TEGA BOMO DOPOLNILI NAŠE ŠTUDIJE BIOGENEZE MRNA IN PROCESA SPAJANJA Z GLOBALNO ANALIZO GENSKEGA IZRAŽANJA, KI JO POSREDUJE P38, Z RELEVANTNOSTJO UREDBE IN STRUKTURE KROMATINA. DA BI OPREDELILI NOVE FUNKCIJE P38, BOMO IZVEDLI GENETSKO PRESEJANJE CELOTNEGA GENOMA, DA BI OPREDELILI DEJAVNOSTI, POTREBNE ZA PRILAGODITEV CELIC STRESU, IN OPREDELILI NOVE CILJE ZA SAPK V MAMIFER-U. TE PRESEJALNE TESTE JE TREBA KOMBINIRATI S KVANTITATIVNO IN MATEMATIČNO ANALIZO TRANSDUKCIJSKEGA PROCESA SIGNALOV V POSAMEZNIH CELICAH. TUKAJ PRIDOBLJENI PODATKI MORAJO ZAGOTOVITI BOLJŠE RAZUMEVANJE BIOLOŠKIH FUNKCIJ TEH ENCIMOV IN BOLJŠE RAZUMEVANJE ODZIVOV PRILAGAJANJA STRESU TAKO PRI KVASIH KOT PRI SESALCIH. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
СТРЕС-АКТИВИРАНИТЕ ПРОТЕИНОВИ КИНАЗИ (SAPK) ИГРАЯТ ЦЕНТРАЛНА РОЛЯ ЗА МАКСИМИЗИРАНЕ НА ОЦЕЛЯВАНЕТО НА КЛЕТКИТЕ ДО ВНЕЗАПНИ ПРОМЕНИ В ОКОЛНАТА СРЕДА. PROTOTIPICAS SAPKS СА ДРОЖДИ HOG1 И БОЗАЙНИЦИ P38. АКТИВИРАНЕТО НА SAPKS HOG1 ИЛИ P38 ВОДИ ДО ГЕНЕРИРАНЕ НА НАБОР ОТ ОТГОВОРИ ЗА АДАПТАЦИЯ, КОИТО ВКЛЮЧВАТ МОДУЛАЦИЯ НА МНОГО АСПЕКТИ НА КЛЕТЪЧНАТА ФИЗИОЛОГИЯ. ИЗНЕНАДВАЩО, МНОГО ОТ ТЕЗИ АСПЕКТИ СА ЗАПАЗЕНИ МЕЖДУ ДРОЖДИТЕ И КЛЕТКИТЕ НА БОЗАЙНИЦИТЕ. ОСНОВНАТА ЦЕЛ НА ТОЗИ ПРОЕКТ Е ГЛОБАЛНАТА ХАРАКТЕРИСТИКА НА МОЛЕКУЛЯРНИТЕ МЕХАНИЗМИ, НЕОБХОДИМИ ЗА АДАПТИРАНЕТО КЪМ СТРЕСА, МЕДИИРАН ОТ SAPKS КАКТО ПРИ ДРОЖДИТЕ, ТАКА И ПРИ БОЗАЙНИЦИТЕ. В ДРОЖДИТЕ, ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕТО НА БИОХИМИЧЕН АНАЛИЗ И IN SILICO АНАЛИЗ, НИЕ ВЪЗНАМЕРЯВАМЕ ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ ВСИЧКИ HOG1 СУБСТРАТИ, КОИТО ЩЕ ПРЕДОСТАВЯТ ИНФОРМАЦИЯ ЗА НОВИТЕ ФУНКЦИИ НА SAPK В ДРОЖДИТЕ, КАКТО И ДА ДЕФИНИРАМЕ НОВИ МОЛЕКУЛЯРНИ МЕХАНИЗМИ, КОИТО СЛУЖАТ ЗА РЕГУЛИРАНЕ НА КЛЮЧОВИ БИОЛОГИЧНИ ПРОЦЕСИ. В ДОПЪЛНЕНИЕ, НИЕ ЩЕ РАЗШИРИМ ЗНАНИЯТА СИ В ДВЕ ОСНОВНИ ФУНКЦИИ ЗА HOG1, КАТО НАПРИМЕР РЕГУЛИРАНЕТО НА ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ И КОНТРОЛА НА КЛЕТЪЧНИЯ ЦИКЪЛ. МНОГО АСПЕКТИ НА РЕГУЛИРАНЕТО НА ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ СЕ КОНТРОЛИРАТ ОТ HOG1; СЕГА ВЪЗНАМЕРЯВАМЕ ДА ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ПО-ДОБРЕ РОЛЯТА МУ В ПРОЦЕСА НА УДЪЛЖАВАНЕ И ВЪЗМОЖНОТО АСОЦИИРАНЕ НА HOG1 КЪМ РНК. КЛЕТЪЧНИЯТ ЦИКЪЛ Е ЯСНО РЕГУЛИРАН ОТ HOG1 В ОТГОВОР НА СТРЕСА. ВЪЗНАМЕРЯВАМЕ ДА РАЗШИРИМ ЗНАНИЯТА СИ В РЕГУЛИРАНЕТО НА КЛЕТЪЧНИЯ ЦИКЪЛ, КАТО ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ НОВ КОНТРОЛЕН ПУНКТ ВЪВ ФАЗА S, КОЙТО Е НЕОБХОДИМ ЗА КООРДИНИРАНЕ НА ГЕНИЧНАТА ЕКСПРЕСИЯ С РЕПЛИКАЦИЯТА. ТЕЗИ АСПЕКТИ ЩЕ БЪДАТ И НАШАТА ОСНОВНА ЦЕЛ В ПРОУЧВАНИЯТА С P38 В КЛЕТКИТЕ НА БОЗАЙНИЦИТЕ. ОГРОМНОТО ЗАПАЗВАНЕ НА ОСНОВНИТЕ ФУНКЦИИ В ДРОЖДИТЕ И БОЗАЙНИЦИТЕ НИ НАКАРА ДА ПРОУЧИМ РЕГУЛИРАНЕТО НА КОНТРОЛА НА ЦИКЛИТЕ ОТ RB И ОТКРИХМЕ, ЧЕ ТОЗИ РЕГЛАМЕНТ МОЖЕ ДА БЪДЕ ОТ ГОЛЯМО ЗНАЧЕНИЕ ЗА КОНТРОЛА НА КЛЕТЪЧНАТА ПРОЛИФЕРАЦИЯ В РАКОВИТЕ КЛЕТКИ. ПО СЪЩИЯ НАЧИН КОНТРОЛЪТ НА ПРОГРЕСИЯТА НА ФАЗА S Е ОТ ОСНОВНО ЗНАЧЕНИЕ ЗА ПОДДЪРЖАНЕТО НА ГЕНОМНАТА ЦЯЛОСТ. В ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ ПРОУЧИМ СЪЩЕСТВУВАНЕТО НА КОНТРОЛНО-ПРОПУСКАТЕЛЕН ПУНКТ ПРИ БОЗАЙНИЦИ, ПОДОБЕН НА ТОЗИ, ОТКРИТ В ДРОЖДИТЕ. В ДОПЪЛНЕНИЕ, ЩЕ ДОПЪЛНИМ НАШИТЕ ИЗСЛЕДВАНИЯ В ОБЛАСТТА НА БИОГЕНЕЗАТА НА ИРНК И ПРОЦЕСА НА СРАСТВАНЕ С ГЛОБАЛНИЯ АНАЛИЗ НА ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ, МЕДИИРАН ОТ Р38, С УМЕСТНОСТТА НА РЕГЛАМЕНТА И СТРУКТУРАТА НА ХРОМАТИН. ЗА ДА ДЕФИНИРАМЕ НОВИ ФУНКЦИИ НА Р38, ЩЕ ИЗВЪРШИМ ГЕНЕТИЧЕН СКРИНИНГ НА ЦЕЛИЯ ГЕНОМ, ЗА ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ ДЕЙНОСТИТЕ, НЕОБХОДИМИ ЗА КЛЕТЪЧНА АДАПТАЦИЯ КЪМ СТРЕСА И ДА ОПРЕДЕЛИМ НОВИ ЦЕЛИ ЗА SAPK В MAMIFER. ТЕЗИ СКРИНИНГИ ТРЯБВА ДА СЕ КОМБИНИРАТ С КОЛИЧЕСТВЕН И МАТЕМАТИЧЕСКИ АНАЛИЗ НА ПРОЦЕСА НА ТРАНСДУКЦИЯ НА СИГНАЛИТЕ В ОТДЕЛНИТЕ КЛЕТКИ. ПОЛУЧЕНИТЕ ТУК ДАННИ СЛЕДВА ДА ОСИГУРЯТ ПО-ДОБРО РАЗБИРАНЕ НА БИОЛОГИЧНИТЕ ФУНКЦИИ НА ТЕЗИ ЕНЗИМИ И ДА ПОЛУЧАТ ПО-ДОБРО РАЗБИРАНЕ НА РЕАКЦИИТЕ НА АДАПТАЦИЯТА КЪМ СТРЕСА КАКТО ПРИ ДРОЖДИТЕ, ТАКА И ПРИ БОЗАЙНИЦИТЕ. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IL-KINASES TAL-PROTEINA ATTIVATI BL-ISTRESS (SAPK) GĦANDHOM RWOL ĊENTRALI FIL-MASSIMIZZAZZJONI TAS-SOPRAVIVENZA TAĊ-ĊELLOLI GĦAL BIDLIET F’DAQQA FL-AMBJENT. PROTOTIPICAS SAPKS HUMA ĦMIRA HOG1 U MAMMIFERI P38. L-ATTIVAZZJONI TAS-SAPKS HOG1 JEW P38 TIRRIŻULTA FIL-ĠENERAZZJONI TA’ SETT TA’ REAZZJONIJIET TA’ ADATTAMENT LI JINKLUDI L-MODULAZZJONI TA’ ĦAFNA ASPETTI TAL-FIŻJOLOĠIJA ĊELLULARI. B’MOD SORPRENDENTI, ĦAFNA MINN DAWN L-ASPETTI HUMA PPRESERVATI BEJN IL-ĦMIRA U Ċ-ĊELLOLI TAL-MAMMIFERI. L-GĦAN EWLIENI TA’ DAN IL-PROĠETT HUWA L-KARATTERIZZAZZJONI GLOBALI TAL-MEKKANIŻMI MOLEKULARI MEĦTIEĠA GĦALL-ADATTAMENT GĦALL-ISTRESS MEDJAT MIS-SAPKS KEMM FIL-ĦMIRA KIF UKOLL FIL-MAMMIFERI. FIL-ĦMIRA, PERMEZZ TAL-UŻU TA’ ANALIŻI BIJOKIMIKA U ANALIŻI IN SILICO, BIĦSIEBNA NIDENTIFIKAW IS-SOTTOSTRATI KOLLHA TAL-HOG1, LI SE JIPPROVDU INFORMAZZJONI DWAR FUNZJONIJIET ĠODDA TAS-SAPK FIL-ĦMIRA, KIF UKOLL NIDDEFINIXXU MEKKANIŻMI MOLEKULARI ĠODDA LI JSERVU BIEX JIRREGOLAW IL-PROĊESSI BIJOLOĠIĊI EWLENIN. BARRA MINN HEKK, AĦNA SE JESPANDU L-GĦARFIEN TAGĦNA F’ŻEWĠ FUNZJONIJIET BAŻIĊI GĦALL-HOG1, BĦAR-REGOLAMENT TAL-ESPRESSJONI ĠENIKA U L-KONTROLL TAĊ-ĊIKLU TAĊ-ĊELLOLI. ĦAFNA ASPETTI TAR-REGOLAMENT DWAR L-ESPRESSJONI ĠENIKA HUMA KKONTROLLATI MILL-HOG1; ISSA, BIĦSIEBNA NIKKARATTERIZZAW AĦJAR IR-RWOL TAGĦHA FIL-PROĊESS TA’ TITWIL U L-ASSOĊJAZZJONI POSSIBBLI TAL-HOG1 MAL-RNA. IĊ-ĊIKLU TAĊ-ĊELLOLI HUWA RREGOLAT B’MOD ĊAR MILL-HOG1 B’RISPONS GĦALL-ISTRESS. GĦANDNA L-INTENZJONI LI JESPANDU L-GĦARFIEN TAGĦNA FIR-REGOLAMENT TAĊ-ĊIKLU TAĊ-ĊELLOLI BILLI JIKKARATTERIZZAW PUNT TA ‘KONTROLL ĠDID FIL-FAŻI S LI HUWA MEĦTIEĠ BIEX JIKKOORDINAW ESPRESSJONI ĠENIKU MAR-REPLIKAZZJONI. DAWN L-ASPETTI SE JKUNU WKOLL L-GĦAN EWLIENI TAGĦNA FL-ISTUDJI BIL-P38 FIĊ-ĊELLOLI TAL-MAMMIFERI. IL-KONSERVAZZJONI ENORMI TAL-FUNZJONIJIET BAŻIĊI FIL-ĦMIRA U L-MAMMIFERI WASSLETNA BIEX NISTUDJAW IR-REGOLAMENT DWAR IL-KONTROLL TAĊ-ĊIKLIN MINN RB U SKOPREJNA LI DAN IR-REGOLAMENT JISTA’ JKUN TA’ RILEVANZA KBIRA GĦALL-KONTROLL TAL-PROLIFERAZZJONI TAĊ-ĊELLOLI FIĊ-ĊELLOLI TAL-KANĊER. BL-ISTESS MOD, IL-KONTROLL TAL-PROGRESSJONI TAL-FAŻI S HUWA FUNDAMENTALI BIEX TINŻAMM L-INTEGRITÀ ĠENOMIKA. F’DAN IL-PROĠETT AĦNA SE TISTUDJA L-EŻISTENZA TA ‘PUNT TA’ KONTROLL FIL-MAMMIFERI SIMILI GĦAL DAK SKOPERT FIL-ĦMIRA. BARRA MINN HEKK, SE NIKKUMPLIMENTAW L-ISTUDJI TAGĦNA FIL-BIJOĠENESI TAL-MRNA U L-PROĊESS TAL-ISPLICING BL-ANALIŻI GLOBALI TAL-ESPRESSJONI ĠENIKA MEDJATA MINN P38 BIR-RILEVANZA TAR-REGOLAMENT U L-ISTRUTTURA TAL-KROMATIN. BIEX NIDDEFINIXXU FUNZJONIJIET ĠODDA TA’ P38, SE NWETTQU SKRINJAR ĠENETIKU TAL-ĠENOMA KOLLU BIEX NIDENTIFIKAW DAWK L-ATTIVITAJIET MEĦTIEĠA GĦALL-ADATTAMENT TAĊ-ĊELLOLI GĦALL-ISTRESS U BIEX NIDDEFINIXXU MIRI ĠODDA GĦAS-SAPK FL-MAMIFER. DAWN L-ISKRININGS GĦANDHOM JIĠU KKOMBINATI MA’ ANALIŻI KWANTITATTIVA U MATEMATIKA TAL-PROĊESS TA’ TRASDUZZJONI TA’ SINJALI F’ĊELLOLI INDIVIDWALI. ID-DATA MIKSUBA HAWNHEKK GĦANDHA TIPPROVDI FEHIM AĦJAR TAL-FUNZJONIJIET BIJOLOĠIĊI TA’ DAWN L-ENZIMI U TIKSEB FEHIM AĦJAR TAR-RISPONSI TAL-ADATTAMENT GĦALL-ISTRESS KEMM FIL-ĦMIRA KIF UKOLL FIL-MAMMIFERI. (Maltese)
4 August 2022
0 references
KINASES DE PROTEÍNAS (SAPK) ATIVADAS PELO DESENVOLVIMENTO JOGAM UM PAPEL CENTRAL NA MAXIMIZAÇÃO DA SOBREVIVÊNCIA CELULAR A ALTERAÇÕES SÚBIDAS NO AMBIENTE. Os SAPKS PROTOTIPICAS são YEAST HOG1 e MAMMAL P38. A ATIVAÇÃO DOS RPUS HOG1 OU P38 RESULTADOS NA GERAÇÃO DE UM CONJUNTO DE RESPOSTAS DE ADAPTAÇÃO QUE INCLUI A MODULAÇÃO DE MUITOS ASPECTOS DA FSIOLOGIA CELULAR. Surpreendentemente, muitos destes aspectos são preservados entre os tecidos e as células mamárias. O OBJETIVO PRINCIPAL DO PRESENTE PROJETO É A CARACTERIZAÇÃO GLOBAL DOS MECANISMOS MOLECULARES NECESSÁRIOS PARA A ADAPTAÇÃO AO DESENVOLVIMENTO MEDIADO PELOS RPUS, INCLUINDO OS ANIMAIS E OS MAMAIS. No entanto, através da utilização da análise bioquímica e da análise silícica, pretendemos identificar todos os substratos HOG1, que fornecerão informações sobre novas funções do SAPK em si, bem como definir novos mecanismos moleculares que sirvam para regular os principais processos biológicos. Além disso, expandiremos o nosso conhecimento em duas funções básicas para o HOG1, como a regulação da expressão genética e o controlo do ciclo de células. MUITOS ASPECTOS DO REGULAMENTO GÉNICO DE EXPRESSÃO SÃO CONTROLADOS PELA HOG1; Agora, pretendemos caracterizar melhor o seu papel no processo de expansão e na possível associação de HOG1 ao ARN. O ciclo celular é claramente regulado pela HOG1 em resposta ao stress. Tencionamos despender o nosso conhecimento na regulação do ciclo celular através da caracterização de um novo ponto de verificação na fase S que é necessário para coordenar a expressão genética com a réplica. Estes aspectos serão também o nosso principal objectivo em estudos com P38 em células mamárias. A enorme conservação das funções básicas em massa e em mamíferos levou-nos a estudar o regulamento do controlo da ciclina pela RB e descobrimos que este regulamento pode ser de grande relevância para o controlo da proliferação de células cancerígenas. O CONTROLO DA PROGRESSÃO DA FASE S É FUNDAMENTAL PARA MANTER A INTEGRIDADE GENÓMICA. Neste projeto vamos estudar a existência de um ponto de verificação em mamíferos semelhantes aos descobertos no passado. Além disso, completaremos os nossos estudos sobre a biogénese do MRNA e o processo de implantação com a análise global da expressão genética mediada pela P38 com a relevância do regulamento e da estrutura da cromatina. Para definir novas funções da P38, realizaremos uma análise genética de todo o genoma para identificar as atividades necessárias para a adaptação das células ao stress e para definir novos objetivos para o SAPK na MAMIFER. Estas análises devem ser acompanhadas de uma análise quantitativa e matemática do processo de transformação dos sinais em células individuais. Os dados aqui obtidos devem proporcionar um melhor entendimento das funções biológicas destes enzimas e obter um melhor entendimento das respostas da adaptação ao stresse, tanto nos tecidos como nos mamíferos. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
STRESSAKTIVEREDE PROTEINKINASER (SAPK) SPILLER EN CENTRAL ROLLE MED HENSYN TIL AT MAKSIMERE CELLEOVERLEVELSER TIL PLUDSELIGE ÆNDRINGER I MILJØET. PROTOTIPICAS SAPKS ER GÆR HOG1 OG PATTEDYR P38. AKTIVERINGEN AF SAPKS HOG1 ELLER P38 RESULTERER I GENERERING AF ET SÆT TILPASNINGSSVAR, DER OMFATTER GRADUERING AF MANGE ASPEKTER AF CELLULÆR FYSIOLOGI. OVERRASKENDE NOK ER MANGE AF DISSE ASPEKTER BEVARET MELLEM GÆR- OG PATTEDYRSCELLER. HOVEDFORMÅLET MED DETTE PROJEKT ER DEN GLOBALE KARAKTERISERING AF DE MOLEKYLÆRE MEKANISMER, DER ER NØDVENDIGE FOR TILPASNINGEN TIL STRESS MEDIERET AF SAPKS I BÅDE GÆR OG PATTEDYR. I GÆR, GENNEM BRUG AF BIOKEMISK ANALYSE OG I SILICO ANALYSE, AGTER VI AT IDENTIFICERE ALLE HOG1 SUBSTRATER, SOM VIL GIVE OPLYSNINGER OM NYE FUNKTIONER AF SAPK I GÆR, SAMT DEFINERE NYE MOLEKYLÆRE MEKANISMER, DER TJENER TIL AT REGULERE VIGTIGE BIOLOGISKE PROCESSER. DERUDOVER VIL VI UDVIDE VORES VIDEN TIL TO GRUNDLÆGGENDE FUNKTIONER FOR HOG1, SÅSOM REGULERING AF GENISK UDTRYK OG CELLECYKLUSSTYRING. MANGE ASPEKTER AF FORORDNINGEN OM GENISK UDTRYK KONTROLLERES AF HOG1; NU VIL VI BEDRE KARAKTERISERE DETS ROLLE I FORLÆNGELSESPROCESSEN OG DEN MULIGE SAMMENSLUTNING AF HOG1 TIL RNA. CELLECYKLUSSEN ER KLART REGULERET AF HOG1 SOM REAKTION PÅ STRESS. VI HAR TIL HENSIGT AT UDVIDE VORES VIDEN I REGULERINGEN AF CELLECYKLUSSEN VED AT KARAKTERISERE ET NYT KONTROLPUNKT I FASEN S, DER ER NØDVENDIGT FOR AT KOORDINERE GENISK UDTRYK MED REPLIKERING. DISSE ASPEKTER VIL OGSÅ VÆRE VORES VIGTIGSTE MÅL I UNDERSØGELSER MED P38 I PATTEDYRCELLER. DEN ENORME BEVARELSE AF GRUNDLÆGGENDE FUNKTIONER HOS GÆR OG PATTEDYR HAR FÅET OS TIL AT UNDERSØGE REGULERINGEN AF RB'S CYKLINKONTROL, OG VI HAR OPDAGET, AT DENNE FORORDNING KAN VÆRE AF STOR BETYDNING FOR BEKÆMPELSE AF CELLEPROLIFERATION I KRÆFTCELLER. PÅ SAMME MÅDE ER KONTROLLEN MED PROGRESSIONEN AF FASE S AFGØRENDE FOR AT OPRETHOLDE DEN GENOMISKE INTEGRITET. I DETTE PROJEKT VIL VI UNDERSØGE EKSISTENSEN AF ET CHECKPOINT HOS PATTEDYR SVARENDE TIL DET, DER OPDAGES I GÆR. DERUDOVER VIL VI SUPPLERE VORES UNDERSØGELSER AF BIOGENESIS AF MRNA OG SPLEJSNINGSPROCESSEN MED DEN GLOBALE ANALYSE AF GENISK UDTRYK MEDIERET AF P38 MED RELEVANSEN AF FORORDNINGEN OG CHROMATINSTRUKTUREN. FOR AT DEFINERE NYE FUNKTIONER I P38 VIL VI FORETAGE EN GENETISK SCREENING AF HELE GENOMET FOR AT IDENTIFICERE DE AKTIVITETER, DER ER NØDVENDIGE FOR CELLETILPASNING TIL STRESS OG FOR AT DEFINERE NYE MÅL FOR SAPK I MAMIFER. DISSE SCREENINGER SKAL KOMBINERES MED KVANTITATIV OG MATEMATISK ANALYSE AF TRANSDUKTIONSPROCESSEN AF SIGNALER I DE ENKELTE CELLER. DE DATA, DER OPNÅS HER, BØR GIVE EN BEDRE FORSTÅELSE AF DISSE ENZYMERS BIOLOGISKE FUNKTIONER OG OPNÅ EN BEDRE FORSTÅELSE AF REAKTIONERNE PÅ TILPASNING TIL STRESS HOS BÅDE GÆR OG PATTEDYR. (Danish)
4 August 2022
0 references
PROTEINKINAZELE ACTIVATE PRIN STRES (SAPK) JOACĂ UN ROL CENTRAL ÎN MAXIMIZAREA SUPRAVIEȚUIRII CELULELOR LA SCHIMBĂRI BRUȘTE ÎN MEDIU. PROTOTIPICAS SAPKS SUNT DROJDIE HOG1 ȘI MAMIFER P38. ACTIVAREA SAPKS HOG1 SAU P38 ARE CA REZULTAT GENERAREA UNUI SET DE RĂSPUNSURI DE ADAPTARE CARE INCLUDE MODULAREA MULTOR ASPECTE ALE FIZIOLOGIEI CELULARE. ÎN MOD SURPRINZĂTOR, MULTE DINTRE ACESTE ASPECTE SUNT PĂSTRATE ÎNTRE DROJDIE ȘI CELULELE MAMIFERELOR. OBIECTIVUL PRINCIPAL AL ACESTUI PROIECT ESTE CARACTERIZAREA GLOBALĂ A MECANISMELOR MOLECULARE NECESARE PENTRU ADAPTAREA LA STRESUL MEDIAT DE SAPKS ATÂT LA DROJDIE, CÂT ȘI LA MAMIFERE. ÎN DROJDIE, PRIN UTILIZAREA ANALIZEI BIOCHIMICE ȘI ÎN ANALIZA SILICO, INTENȚIONĂM SĂ IDENTIFICĂM TOATE SUBSTRATURILE HOG1, CARE VOR OFERI INFORMAȚII DESPRE NOILE FUNCȚII ALE SAPK ÎN DROJDIE, PRECUM ȘI SĂ DEFINIM NOI MECANISME MOLECULARE CARE SERVESC LA REGLAREA PROCESELOR BIOLOGICE CHEIE. ÎN PLUS, NE VOM EXTINDE CUNOȘTINȚELE ÎN DOUĂ FUNCȚII DE BAZĂ PENTRU HOG1, CUM AR FI REGULAMENTUL PRIVIND EXPRESIA GENICĂ ȘI CONTROLUL CICLULUI CELULAR. MULTE ASPECTE ALE REGLEMENTĂRII PRIVIND EXPRESIA GENICĂ SUNT CONTROLATE DE HOG1; ACUM, INTENȚIONĂM SĂ CARACTERIZĂM MAI BINE ROLUL SĂU ÎN PROCESUL DE ALUNGIRE ȘI POSIBILA ASOCIERE A HOG1 LA ARN. CICLUL CELULAR ESTE REGLEMENTAT ÎN MOD CLAR DE HOG1 CA RĂSPUNS LA STRES. INTENȚIONĂM SĂ NE EXTINDEM CUNOȘTINȚELE ÎN REGULAMENTUL CICLULUI CELULAR PRIN CARACTERIZAREA UNUI NOU PUNCT DE CONTROL ÎN FAZA S CARE ESTE NECESAR PENTRU A COORDONA EXPRESIA GENICĂ CU REPLICAREA. ACESTE ASPECTE VOR FI, DE ASEMENEA, OBIECTIVUL NOSTRU PRINCIPAL ÎN STUDIILE CU P38 PE CELULE DE MAMIFERE. CONSERVAREA ENORMĂ A FUNCȚIILOR DE BAZĂ LA DROJDIE ȘI MAMIFERE NE-A DETERMINAT SĂ STUDIEM REGULAMENTUL PRIVIND CONTROLUL CICLINEI DE CĂTRE RB ȘI AM DESCOPERIT CĂ ACEST REGULAMENT AR PUTEA AVEA O MARE RELEVANȚĂ PENTRU CONTROLUL PROLIFERĂRII CELULARE ÎN CELULELE CANCEROASE. ÎN MOD SIMILAR, CONTROLUL PROGRESIEI FAZEI S ESTE FUNDAMENTAL PENTRU MENȚINEREA INTEGRITĂȚII GENOMICE. ÎN ACEST PROIECT VOM STUDIA EXISTENȚA UNUI PUNCT DE CONTROL LA MAMIFERE SIMILAR CELUI DESCOPERIT ÎN DROJDIE. ÎN PLUS, VOM COMPLETA STUDIILE NOASTRE ÎN BIOGENEZA MARN ȘI PROCESUL DE ÎMBINARE CU ANALIZA GLOBALĂ A EXPRESIEI GENICE MEDIATĂ DE P38 CU RELEVANȚA REGULAMENTULUI ȘI A STRUCTURII CROMATINEI. PENTRU A DEFINI NOI FUNCȚII ALE P38, VOM EFECTUA UN SCREENING GENETIC AL ÎNTREGULUI GENOM PENTRU A IDENTIFICA ACELE ACTIVITĂȚI NECESARE PENTRU ADAPTAREA CELULELOR LA STRES ȘI PENTRU A DEFINI NOI OBIECTIVE PENTRU SAPK ÎN MAMIFER. ACESTE PROIECȚII TREBUIE COMBINATE CU ANALIZA CANTITATIVĂ ȘI MATEMATICĂ A PROCESULUI DE TRANSDUCȚIE A SEMNALELOR ÎN CELULE INDIVIDUALE. DATELE OBȚINUTE AICI AR TREBUI SĂ OFERE O MAI BUNĂ ÎNȚELEGERE A FUNCȚIILOR BIOLOGICE ALE ACESTOR ENZIME ȘI SĂ OBȚINĂ O MAI BUNĂ ÎNȚELEGERE A RĂSPUNSURILOR ADAPTĂRII LA STRES ATÂT LA DROJDIE, CÂT ȘI LA MAMIFERE. (Romanian)
4 August 2022
0 references
STRESSAKTIVERADE PROTEINKINASER (SAPK) SPELAR EN CENTRAL ROLL FÖR ATT MAXIMERA CELLÖVERLEVNADEN TILL PLÖTSLIGA FÖRÄNDRINGAR I MILJÖN. PROTOTIPICAS SAPKS ÄR JÄST HOG1 OCH DÄGGDJUR P38. AKTIVERINGEN AV SAPKS HOG1 ELLER P38 RESULTERAR I SKAPANDET AV EN UPPSÄTTNING ANPASSNINGSSVAR SOM INKLUDERAR MODULERING AV MÅNGA ASPEKTER AV CELLFYSIOLOGI. ÖVERRASKANDE NOG BEVARAS MÅNGA AV DESSA ASPEKTER MELLAN JÄST- OCH DÄGGDJURSCELLER. HUVUDSYFTET MED DETTA PROJEKT ÄR DEN GLOBALA KARAKTERISERINGEN AV DE MOLEKYLÄRA MEKANISMER SOM KRÄVS FÖR ANPASSNING TILL STRESSMEDIERAD AV SAPKS I BÅDE JÄST OCH DÄGGDJUR. I JÄST, GENOM ANVÄNDNING AV BIOKEMISK ANALYS OCH I SILICO-ANALYS, AVSER VI ATT IDENTIFIERA ALLA HOG1-SUBSTRAT, SOM KOMMER ATT GE INFORMATION OM NYA FUNKTIONER AV SAPK I JÄST, SAMT DEFINIERA NYA MOLEKYLÄRA MEKANISMER SOM TJÄNAR TILL ATT REGLERA VIKTIGA BIOLOGISKA PROCESSER. DESSUTOM KOMMER VI ATT UTÖKA VÅR KUNSKAP TILL TVÅ GRUNDLÄGGANDE FUNKTIONER FÖR HOG1, SÅSOM REGLERINGEN AV GENISKT UTTRYCK OCH CELLCYKELKONTROLL. MÅNGA ASPEKTER AV GENIC EXPRESSION REGULATION STYRS AV HOG1. NU HAR VI FÖR AVSIKT ATT BÄTTRE KARAKTERISERA DESS ROLL I FÖRLÄNGNINGSPROCESSEN OCH DEN MÖJLIGA FÖRENINGEN AV HOG1 TILL RNA. CELLCYKELN REGLERAS TYDLIGT AV HOG1 SOM SVAR PÅ STRESS. VI HAR FÖR AVSIKT ATT UTÖKA VÅR KUNSKAP I REGLERINGEN AV CELLCYKELN GENOM ATT KARAKTERISERA EN NY KONTROLLPUNKT I FAS S SOM ÄR NÖDVÄNDIG FÖR ATT KOORDINERA GENIC UTTRYCK MED REPLIKERING. DESSA ASPEKTER KOMMER OCKSÅ ATT VARA VÅRT FRÄMSTA MÅL I STUDIER MED P38 I DÄGGDJURSCELLER. DET ENORMA BEVARANDET AV GRUNDLÄGGANDE FUNKTIONER I JÄST OCH DÄGGDJUR HAR FÅTT OSS ATT STUDERA REGLERINGEN AV CYKLONKONTROLL GENOM RB OCH VI HAR UPPTÄCKT ATT DENNA FÖRORDNING SKULLE KUNNA VARA AV STOR BETYDELSE FÖR ATT KONTROLLERA CELLSPRIDNINGEN I CANCERCELLER. PÅ SAMMA SÄTT ÄR KONTROLLEN AV UTVECKLINGEN AV FAS S GRUNDLÄGGANDE FÖR ATT UPPRÄTTHÅLLA GENOMISK INTEGRITET. I DETTA PROJEKT KOMMER VI ATT STUDERA FÖREKOMSTEN AV EN KONTROLLPUNKT HOS DÄGGDJUR LIKNANDE DEN SOM UPPTÄCKS I JÄST. DESSUTOM KOMMER VI ATT KOMPLETTERA VÅRA STUDIER I BIOGENESEN AV MRNA OCH SKARVNINGSPROCESSEN MED DEN GLOBALA ANALYSEN AV GENICUTTRYCK SOM FÖRMEDLAS AV P38 MED RELEVANSEN AV FÖRORDNINGEN OCH KROMATINS STRUKTUR. FÖR ATT DEFINIERA NYA FUNKTIONER I P38 KOMMER VI ATT UTFÖRA EN GENETISK SCREENING AV HELA GENOMET FÖR ATT IDENTIFIERA DE AKTIVITETER SOM KRÄVS FÖR CELLANPASSNING TILL STRESS OCH FÖR ATT DEFINIERA NYA MÅL FÖR SAPK I MAMIFER. DESSA SCREENINGER SKA KOMBINERAS MED KVANTITATIV OCH MATEMATISK ANALYS AV TRANSDUKTIONSPROCESSEN AV SIGNALER I ENSKILDA CELLER. DE DATA SOM ERHÅLLS HÄR BÖR GE EN BÄTTRE FÖRSTÅELSE FÖR DESSA ENZYMERS BIOLOGISKA FUNKTIONER OCH FÅ EN BÄTTRE FÖRSTÅELSE FÖR HUR ANPASSNING TILL STRESS HOS BÅDE JÄST OCH DÄGGDJUR REAGERAR. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Barcelona
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2015-64437-P
0 references