PATHOGENICITY OF BETANODAVIRUS IN SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) CULTIVATED AND ITS RELATION TO THE INMNE RESPONSE. (Q3135224)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3135224 in Spain
Language Label Description Also known as
English
PATHOGENICITY OF BETANODAVIRUS IN SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) CULTIVATED AND ITS RELATION TO THE INMNE RESPONSE.
Project Q3135224 in Spain

    Statements

    0 references
    59,296.05 Euro
    0 references
    108,900.0 Euro
    0 references
    54.45 percent
    0 references
    1 January 2015
    0 references
    30 September 2018
    0 references
    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
    0 references

    43°20'33.83"N, 8°24'27.90"W
    0 references
    15071
    0 references
    LA NECROSIS NERVIOSA VIRAL (NNV) ES UNA ENFERMEDAD QUE AFECTA A GRAN VARIEDAD DE PECES EN TODO EL MUNDO, CAUSANDO ELEVADAS TASAS DE MORTALIDAD, SOBRE TODO EN LARVAS Y JUVENILES. LOS AGENTES ETIOLOLOGICOS DE LA ENFERMEDAD SON LOS BETANODAVIRUS, QUE POSEEN UN GENOMA RNA MONOCATENARIO BISEGMENTADO COMPUESTO POR EL RNA1, QUE CODIFICA LA POLIMERASA VIRAL, Y EL RNA2, QUE CODIFICA LA PROTEINA DE LA CAPSIDE. ADEMAS, SINTETIZAN UN RNA SUBGENOMICO, RNA3, QUE CODIFICA LAS PROTEINAS B1 (FACTOR ANTI-NECROTICO) Y B2 (PROTECCION DE LA REPLICACION VIRAL FRENTE A RNA INTERFERENTES CELULARES). LOS BETANODAVIRUS SE CLASIFICAN EN 4 GENOTIPOS SEGUN LA SECUENCIA T4 DEL RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV Y RGNNV. SIN EMBARGO EN LOS ULTIMOS AÑOS SE DOCUMENTADO EL AISLAMIENTO DE RECOMBINANTES NATURALES RG/SJ (RNA1 TIPO RGNNV Y RNA2 SJNNV) EN EL SUR DE EUROPA. TODOS LOS RECOMBINATES AISLADOS DE LENGUADO Y DORADA CULTIVADOS EN LA PENINSULA IBERICA TIENEN UNA PROTEINA DE LA CAPSIDE CON 3 POSICIONES AMINOACIDICAS DIFERENTES RESPECTO A LA DE SJNNV, 2 DE ELLAS EN EL EXTREMO C-TERMINAL, REGION DETERMINANTE DE ESPECIFICIDAD DE HOSPEDADOR, QUE SE HA DEMOSTRADO JUEGAN UN PAPEL IMPORTANTE EN LA VIRULENCIA, Y UNA EN LA REGION N-TERMINAL. ASIMISMO, ESTOS RECOMBINANTES PRESENTAN EN LA POLIMERASA 19 RESIDUOS AMIOACIDICOS DIFERENTES CON RESPECTO A LA POLIMERASA DE LA CEPA TIPO RG Y EN LAS REGIONES NO CODIFICANTES DE AMBOS SEGMENTOS GENOMICOS UN TOTAL DE 4 NUCLEOTIDOS QUE NO COINCIDEN CON LAS CEPAS TIPO RGNNV (RNA1) Y SJNNV (RNA2). TODOS ESTOS CAMBIOS PUEDEN DESEMPEÑAR UN PAPEL IMPORTANTE EN LA VIRULENCIA Y EN LA CAPACIDAD REPLICATIVA. EL ESTUDIO DE LOS DETERMINANTES DE VIRULENCIA Y DE LA CAPACIDAD REPLICATIVA (RELACIONADA ADEMAS DE CON LA POLIMERASA CON LOS ORF B1 Y B2) ES FUNDAMENTAL PARA ENTENDER Y CONTROLAR LA ENFERMEDAD, ASPECTOS QUE SERAN ABORDADOS POR EL EQUIPO DE INVESTIGACION DE LA USC. PERO ES BIEN SABIDO QUE EL DESARROLLO DE LA ENFERMEDAD NO DEPENDE SOLO DEL PATOGENO, ESTANDO DETERMINADO POR LA INTERACCION VIRUS-HOSPEDADOR. LA IMPLICACION DEL HOSPEDADOR ESTA BASADA EN LA ESTIMULACION DEL SISTEMA INMUNE, QUE SERA CARACTERIZADO POR EL EQUIPO DE INVESTIGACION DE LA UMA. LA INFECCION VIRICA INDUCE LA ACTIVACION TANTO DEL SISTEMA INMUNE INNATO COMO DEL ADAPTATIVO. LOS ESTUDIOS SOBRE LA ACTIVACION DEL SISTEMA INMUNE QUE SE LLEVARAN A CABO INCLUYEN LA REALIZACION DE UNA SECUENCIACION MASIVA TRANSCRIPTOMICA (RNA-SEQ) EN RESPUESTA A INFECCIONES POR VIRUS DE DISTINTA VIRULENCIA PARA LENGUADO. ESTE ESTUDIO GENERARA UNA INFORMACION VALIOSISIMA SOBRE LOS INMUNOGENES IMPLICADOS EN RUTAS DE DEFENSA ANTIVIRICAS, AL TIEMPO QUE PERMITIRA EL DISEÑO DE OPENARRAYS BASADOS EN PCR A TIEMPO REAL CON SONDAS TAQMAN QUE SE UTILIZARAN PARA ESTUDIAR, A NIVEL DE EXPESION GENICA, LA RESPUESTA DEL SISTEMA INMUNE DE LENGUADO FRENTE A VIRUS RECOMBINANTES, OBTENIDOS POR GENETICA INVERSA, CON DISTINTO GRADO DE VIRULENCIA Y CAPACIDAD REPLICATIVA._x000D_ ATENDIENDO A ESTA HIPOTESIS, EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PRESENTE PROYECTO ES ANALIZAR LOS FACTORES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA Y LA CAPACIDAD REPLICATIVA DE BETANODAVIRUS EN LENGUADO Y SU RELACION CON LA RESPUESTA INMUNE DEL HOSPEDADOR. (Spanish)
    0 references
    VIRAL NERVE NECROSIS (NNV) IS A DISEASE THAT AFFECTS A VARIETY OF FISH WORLDWIDE, CAUSING HIGH MORTALITY RATES, ESPECIALLY IN LARVAE AND JUVENILES. THE ETHIOLOGIC AGENTS OF THE DISEASE ARE BETANODAVIRUSES, WHICH HAVE A BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOME COMPOSED OF RNA1, WHICH ENCODES VIRAL POLYMERASE, AND RNA2, WHICH ENCODES THE CAPSIDE PROTEIN. IN ADDITION, THEY SYNTHESISE A SUBGENOMIC RNA, RNA3, WHICH ENCODES PROTEINS B1 (ANTI-NECROTIC FACTOR) AND B2 (PROTECTION OF VIRAL REPLICATION AGAINST CELLULAR INTERFERING RNA). BETANODAVIRUSES ARE CLASSIFIED INTO 4 GENOTYPES ACCORDING TO THE T4 SEQUENCE OF RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV AND RGNNV. HOWEVER, IN RECENT YEARS THE ISOLATION OF NATURAL RECOMBINANTS RG/SJ (RNA1 TYPE RGNNV AND RNA2 SJNNV) HAS BEEN DOCUMENTED IN SOUTHERN EUROPE. ALL ISOLATED RECOMBINANTS OF SOLE AND GOLD GROWN IN THE IBERIAN PENINSULA HAVE A CAPSIDE PROTEIN WITH 3 DIFFERENT AMINOACIDIC POSITIONS COMPARED TO THAT OF SJNNV, 2 OF THEM AT THE END C-TERMINAL, REGION DETERMINING HOST SPECIFICITY, WHICH HAS BEEN SHOWN TO PLAY AN IMPORTANT ROLE IN VIRULENCE, AND ONE IN THE N-TERMINAL REGION. IN ADDITION, THESE RECOMBINANTS PRESENT IN POLYMERASE 19 DIFFERENT AMIOACIDIC RESIDUES WITH RESPECT TO POLYMERASE OF THE RG-TYPE STRAIN AND IN THE NON-CODING REGIONS OF BOTH GENOMIC SEGMENTS A TOTAL OF 4 NUCLEOTIDES THAT DO NOT MATCH THE RGNNV (RNA1) AND SJNNV (RNA2) TYPE STRAINS. ALL THESE CHANGES CAN PLAY AN IMPORTANT ROLE IN VIRULENCE AND REPLICATIVE CAPACITY. THE STUDY OF VIRULENCE DETERMINANTS AND REPLICATIVE CAPACITY (RELATED TO POLYMERASE WITH ORF B1 AND B2) IS FUNDAMENTAL TO UNDERSTANDING AND CONTROLLING THE DISEASE, ASPECTS THAT WILL BE ADDRESSED BY THE USC RESEARCH TEAM. BUT IT IS WELL KNOWN THAT THE DEVELOPMENT OF THE DISEASE DOES NOT DEPEND ONLY ON THE PATHOGEN, BEING DETERMINED BY VIRUS-HOST INTERACTION. THE IMPLICATION OF THE HOST IS BASED ON THE STIMULATION OF THE IMMUNE SYSTEM, WHICH WILL BE CHARACTERISED BY THE RESEARCH TEAM OF THE UMA. THE VIRIC INFECTION INDUCES THE ACTIVATION OF BOTH THE INNATE IMMUNE SYSTEM AND THE ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM. STUDIES ON THE ACTIVATION OF THE IMMUNE SYSTEM TO BE CARRIED OUT INCLUDE PERFORMING A MASSIVE TRANSCRIPTOMIC SEQUENCING (RNA-SEQ) IN RESPONSE TO VIRUS INFECTIONS OF DIFFERENT VIRULENCE FOR SOLE. This STUDY will generate a VALIOSISIM INFORMATION ON Immunogens IMPLICED IN ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, THE TIME that will allow the design of OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS to be used to study, a LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, THE RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LENGUAING LINK TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED BY GENETICAL INVERSA, WITH DYSTEM GROUND OF VIRULENCE AND REPLICATIVE CAPACITY._x000D_ Attention to this hypothesis, the PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT is to analyse the agents involved in the replicative capacity of Betanodavirus and its relationship with the host’s immediate answer. (English)
    12 October 2021
    0.7575994519771166
    0 references
    LA NÉCROSE NERVEUSE VIRALE (NNV) EST UNE MALADIE QUI TOUCHE UNE VARIÉTÉ DE POISSONS DANS LE MONDE ENTIER, PROVOQUANT DES TAUX DE MORTALITÉ ÉLEVÉS, EN PARTICULIER CHEZ LES LARVES ET LES JUVÉNILES. LES AGENTS ETHIOLOGIQUES DE LA MALADIE SONT BETANODAVIRUSES, QUI ONT UN GÉNOME DE L’ARN MONOCATENAIRE BISEGMENTÉ COMPOSÉ DE L’ARN1, QUI CODE LA POLYMÉRASE VIRALE, ET DE L’ARN2, QUI CODE LA PROTÉINE CAPSIDE. EN OUTRE, ILS SYNTHÉTISENT UN ARN SUBGÉNOMIQUE, L’ARN3, QUI CODE LES PROTÉINES B1 (FACTEUR ANTINÉCROTIQUE) ET B2 (PROTECTION DE LA RÉPLICATION VIRALE CONTRE L’ARN INTERFÉRENTIEL CELLULAIRE). LES BETANODAVIRUSES SONT CLASSÉS EN 4 GÉNOTYPES SELON LA SÉQUENCE T4 DE L’ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV ET RGNNV. TOUTEFOIS, CES DERNIÈRES ANNÉES, L’ISOLEMENT DES RECOMBINANTS NATURELS RG/SJ (RNA1 DE TYPE RGNNV ET RNA2 SJNNV) A ÉTÉ DOCUMENTÉ DANS LE SUD DE L’EUROPE. TOUS LES RECOMBINANTS ISOLÉS DE SOLE ET D’OR CULTIVÉS DANS LA PÉNINSULE IBÉRIQUE ONT UNE PROTÉINE DE CAPSIDE AVEC 3 POSITIONS AMINOACIDES DIFFÉRENTES PAR RAPPORT À CELLES DE SJNNV, DONT 2 À LA FIN DU C-TERMINAL, RÉGION DÉTERMINANT LA SPÉCIFICITÉ DE L’HÔTE, QUI A ÉTÉ DÉMONTRÉE POUR JOUER UN RÔLE IMPORTANT DANS LA VIRULENCE, ET UN DANS LA RÉGION N-TERMINALE. EN OUTRE, CES RECOMBINANTS PRÉSENTENT DANS LA POLYMÉRASE 19 RÉSIDUS AMIOACIDIC DIFFÉRENTS PAR RAPPORT À LA POLYMÉRASE DE LA SOUCHE DE TYPE RG ET DANS LES RÉGIONS NON CODANTES DES DEUX SEGMENTS GÉNOMIQUES, UN TOTAL DE 4 NUCLÉOTIDES QUI NE CORRESPONDENT PAS AUX SOUCHES DE TYPE RGNNV (RNA1) ET SJNNV (RNA2). TOUS CES CHANGEMENTS PEUVENT JOUER UN RÔLE IMPORTANT DANS LA VIRULENCE ET LA CAPACITÉ DE REPRODUCTION. L’ÉTUDE DES DÉTERMINANTS DE VIRULENCE ET DE LA CAPACITÉ DE REPRODUCTION (LIÉS À LA POLYMÉRASE AVEC ORF B1 ET B2) EST FONDAMENTALE POUR COMPRENDRE ET CONTRÔLER LA MALADIE, ASPECTS QUI SERONT ABORDÉS PAR L’ÉQUIPE DE RECHERCHE DE L’USC. MAIS IL EST BIEN CONNU QUE LE DÉVELOPPEMENT DE LA MALADIE NE DÉPEND PAS SEULEMENT DE L’AGENT PATHOGÈNE, ÉTANT DÉTERMINÉ PAR L’INTERACTION VIRUS-HÔTE. L’IMPLICATION DE L’HÔTE EST BASÉE SUR LA STIMULATION DU SYSTÈME IMMUNITAIRE, QUI SERA CARACTÉRISÉE PAR L’ÉQUIPE DE RECHERCHE DE L’UMA. L’INFECTION VIRALE INDUIT L’ACTIVATION À LA FOIS DU SYSTÈME IMMUNITAIRE INNÉ ET DU SYSTÈME IMMUNITAIRE ADAPTATIF. LES ÉTUDES SUR L’ACTIVATION DU SYSTÈME IMMUNITAIRE À RÉALISER COMPRENNENT LA RÉALISATION D’UN SÉQUENÇAGE TRANSCRIPTOMIQUE MASSIF (ARN-SEQ) EN RÉPONSE À DES INFECTIONS VIRALES DE VIRULENCE DIFFÉRENTE POUR LA SOLE. Cette ÉTUDE générera une INFORMATION VALIOSISIM sur les immunogènes impliqués DANS LES RUTS ANTIVIRICES DE DEFENSA, LE TEMPS qui permettra la conception d’OPENARRAYS BASED DANS PCR REAL TIME AVEC TaqMan SOUNDS à utiliser pour étudier, un NIVEAU DE DÉPENDITURE GÉNIQUE, la RÉPONSE DU SYSTÈME IMMUNE DU LINK DE LANGUE POUR RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED PAR l’inversa génétique, AVEC DYSTEM GROUND DE VIRULENCE ET CAPACITÉ Réplicative._x000D_ Attention à cette hypothèse, l’OBJECTIVE PRINCIPALE DU PROJET PRESENT consiste à analyser les agents impliqués dans la capacité de reproduction du bêtadavirus et sa relation avec la réponse immédiate de l’hôte. (French)
    2 December 2021
    0 references
    VIRALE NERVENNEKROSE (NNV) IST EINE KRANKHEIT, DIE EINE VIELZAHL VON FISCHEN WELTWEIT BETRIFFT UND HOHE STERBLICHKEITSRATEN VERURSACHT, INSBESONDERE BEI LARVEN UND JUNGFISCHEN. DIE ETHIOLOGIC-ERREGER DER KRANKHEIT SIND BETANODAVIRUSES, DIE EIN BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM BESTEHEND AUS RNA1 HABEN, DAS VIRALE POLYMERASE KODIERT, UND RNA2, DAS DAS CAPSIDE PROTEIN KODIERT. DARÜBER HINAUS SYNTHETISIEREN SIE EINE SUBGENOMISCHE RNA, RNA3, DIE PROTEINE B1 (ANTINEKROTIKFAKTOR) UND B2 (SCHUTZ DER VIRUSREPLIKATION GEGEN ZELLULÄRE INTERFERING RNA) KODIERT. BETANODAVIRUSES WERDEN GEMÄSS DER T4-SEQUENZ VON RNA2 IN 4 GENOTYPEN EINGESTUFT: SJNNV, TPNNV, BFNNV UND RGNNV. IN DEN LETZTEN JAHREN WURDE JEDOCH DIE ISOLIERUNG DER NATÜRLICHEN REKOMBINANTEN RG/SJ (RNA1 TYP RGNNV UND RNA2 SJNNV) IN SÜDEUROPA DOKUMENTIERT. ALLE ISOLIERTEN REKOMBINANTEN VON SOHLE UND GOLD, DIE AUF DER IBERISCHEN HALBINSEL ANGEBAUT WERDEN, HABEN EIN CAPSIDE-PROTEIN MIT 3 VERSCHIEDENEN AMINOAZIDISCHEN POSITIONEN IM VERGLEICH ZU DER VON SJNNV, 2 DAVON AM ENDE C-TERMINAL, VON DENEN 2 AM ENDE DER C-TERMINALREGION, DIE DIE WIRTSSPEZIALITÄT BESTIMMT, EINE WICHTIGE ROLLE IN DER VIRULENZ SPIELEN, UND EINES IN DER N-TERMINAL-REGION. DARÜBER HINAUS ENTHALTEN DIESE REKOMBINANZIEN IN DER POLYMERASE 19 VERSCHIEDENE AMIOACIDIC-RÜCKSTÄNDE IN BEZUG AUF POLYMERASE DES RG-TYP-STAMMS UND IN DEN NICHTKODIERUNGSREGIONEN BEIDER GENOMISCHEN SEGMENTE INSGESAMT 4 NUKLEOTIDE, DIE NICHT DEN STÄMMEN DER RGNNV (RNA1) UND SJNNV (RNA2) ENTSPRECHEN. ALL DIESE VERÄNDERUNGEN KÖNNEN EINE WICHTIGE ROLLE BEI VIRULENZ UND REPLIKATIONSFÄHIGKEIT SPIELEN. DIE UNTERSUCHUNG VON VIRULENZDETERMINANTEN UND REPLIKATIONSKAPAZITÄTEN (IM ZUSAMMENHANG MIT DER POLYMERASE MIT ORF B1 UND B2) IST VON GRUNDLEGENDER BEDEUTUNG FÜR DAS VERSTÄNDNIS UND DIE KONTROLLE DER KRANKHEIT, DIE VOM USC-FORSCHUNGSTEAM BEHANDELT WERDEN. ABER ES IST BEKANNT, DASS DIE ENTWICKLUNG DER KRANKHEIT NICHT NUR VON DEM ERREGER ABHÄNGT, DER DURCH DIE WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN VIREN UND WIRTS BESTIMMT WIRD. DIE IMPLIKATION DES WIRTS BASIERT AUF DER STIMULATION DES IMMUNSYSTEMS, DAS SICH DURCH DAS FORSCHUNGSTEAM DER UMA AUSZEICHNEN WIRD. DIE VIRISCHE INFEKTION INDUZIERT DIE AKTIVIERUNG SOWOHL DES ANGEBORENEN IMMUNSYSTEMS ALS AUCH DES ADAPTIVEN IMMUNSYSTEMS. STUDIEN ZUR AKTIVIERUNG DES ZU DURCHFÜHRENDEN IMMUNSYSTEMS UMFASSEN DIE DURCHFÜHRUNG EINER MASSIVEN TRANSKRIPTOM-SEQUENZIERUNG (RNA-SEQ) ALS REAKTION AUF VIRUSINFEKTIONEN UNTERSCHIEDLICHER VIRULENZ FÜR DIE SEEZUNGE. Diese STUDY wird eine VALIOSISIM INFORMATIONEN für Immunogene erzeugen, die in ANTIVIRIC RUTS von DEFENSA, DIE ZEIT, die das Design von OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME mit Taqman-Sounds verwendet werden, verwendet werden, um zu studieren, ein LEVEL GENICAL EXPENDITURE, DAS RESPONSE DES IMMUNE SYSTEM DER LENGUAING LINK, um zu empfehlen, VIRUS, OBTAINED BY genetische Inversa, MIT DYSTEM GROUND OF VIRULENCE UND replizierende CAPACITY._x000D_ Achtung dieser Hypothese ist das PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT die Agenten zu analysieren, die an der repliktiven Fähigkeit des Betanodavirus und seiner Beziehung zur sofortigen Antwort des Wirts beteiligt sind. (German)
    9 December 2021
    0 references
    VIRALE ZENUWNECROSE (NNV) IS EEN ZIEKTE DIE WERELDWIJD EEN VERSCHEIDENHEID AAN VISSEN TREFT EN HOGE STERFTECIJFERS VEROORZAAKT, VOORAL BIJ LARVEN EN JUVENIELEN. DE ETHIOLOGISCHE AGENTIA VAN DE ZIEKTE ZIJN BETANODAVIRUSES, DIE EEN BISEGMENTED MONOCATENARY RNA-GENOOM HEBBEN DAT BESTAAT UIT RNA1, DAT VIRALE POLYMERASE CODEERT, EN RNA2, DAT HET CAPSIDE-EIWIT CODEERT. DAARNAAST SYNTHETISEREN ZIJ EEN SUBGENOMIC RNA, RNA3, DAT EIWITTEN B1 (ANTI-NECROTISCHE FACTOR) EN B2 (BESCHERMING VAN VIRALE REPLICATIE TEGEN CELLULAIR INTERFERING RNA) CODEERT. BETANODAVIRUSES WORDEN INGEDEELD IN 4 GENOTYPES VOLGENS DE T4-SEQUENTIE VAN RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV EN RGNNV. IN DE AFGELOPEN JAREN IS DE ISOLATIE VAN NATUURLIJKE RECOMBINANTEN RG/SJ (RNA1 TYPE RGNNV EN RNA2 SJNNV) ECHTER GEDOCUMENTEERD IN ZUID-EUROPA. ALLE GEÏSOLEERDE RECOMBINANTEN VAN TONG EN GOUD DIE OP HET IBERISCH SCHIEREILAND WORDEN GETEELD, HEBBEN EEN CAPSIDE-EIWIT MET 3 VERSCHILLENDE AMINOZUURPOSITIES IN VERGELIJKING MET DIE VAN SJNNV, 2 VAN HEN AAN HET EIND VAN DE C-TERMINAL, REGIO DIE DE SPECIFICITEIT VAN DE GASTHEER BEPAALT, DIE EEN BELANGRIJKE ROL IN VIRULENTIE HEEFT AANGETOOND, EN ÉÉN IN DE N-TERMINALREGIO. BOVENDIEN BEVATTEN DEZE RECOMBINANTEN IN POLYMERASE 19 VERSCHILLENDE AMIOACIDIC-RESIDUEN MET BETREKKING TOT POLYMERASE VAN HET RG-TYPE STAM EN IN DE NIET-CODERENDE GEBIEDEN VAN BEIDE GENOMISCHE SEGMENTEN EEN TOTAAL VAN 4 NUCLEOTIDEN DIE NIET OVEREENKOMEN MET DE STAMMEN VAN HET RGNNV-TYPE (RNA1) EN SJNNV (RNA2). AL DEZE VERANDERINGEN KUNNEN EEN BELANGRIJKE ROL SPELEN IN VIRULENTIE EN REPLICATIECAPACITEIT. DE STUDIE NAAR VIRULENTIEDETERMINANTEN EN REPLICATIECAPACITEIT (IN VERBAND MET POLYMERASE MET ORF B1 EN B2) IS VAN FUNDAMENTEEL BELANG VOOR HET BEGRIJPEN EN BEHEERSEN VAN DE ZIEKTE, ASPECTEN DIE DOOR HET USC-ONDERZOEKSTEAM ZULLEN WORDEN AANGEPAKT. MAAR HET IS BEKEND DAT DE ONTWIKKELING VAN DE ZIEKTE NIET ALLEEN AFHANGT VAN HET PATHOGEEN, WORDT BEPAALD DOOR VIRUS-HOST INTERACTIE. DE IMPLICATIE VAN DE GASTHEER IS GEBASEERD OP DE STIMULATIE VAN HET IMMUUNSYSTEEM, DAT ZAL WORDEN GEKENMERKT DOOR HET ONDERZOEKSTEAM VAN DE UMA. DE VIRIC INFECTIE INDUCEERT DE ACTIVERING VAN ZOWEL HET AANGEBOREN IMMUUNSYSTEEM ALS HET ADAPTIEVE IMMUUNSYSTEEM. STUDIES NAAR DE ACTIVERING VAN HET UIT TE VOEREN IMMUUNSYSTEEM OMVATTEN HET UITVOEREN VAN EEN MASSIEVE TRANSCRIPTOMISCHE SEQUENCING (RNA-SEQ) IN REACTIE OP VIRUSINFECTIES VAN VERSCHILLENDE VIRULENTIE VOOR TONG. Deze STUDIE zal een VALIOSISIM INFORMATIE genereren over immunogenen die betrokken zijn in ANTIVIRIC RUTS VAN DEFENSA, DE TIJD waarmee het ontwerp van OPENARRAYS in PCR REAL TIJD MET TaqMan SOUNDS kan worden gebruikt om te bestuderen, een LEVEL VAN GENICALE EXPENDITURE, de RESPONSE VAN DE IMMUNE SYSTEM VAN LENGUAING LINK AAN AANBEVELING VAN VIRUS, OBTAINED BY genetical inversa, MET DYSTEM GROUND VAN VIRULENCE EN replicatieve CAPACITY._x000D_ Aandacht voor deze hypothese, de PRINCIPAL OBJECTIVE VAN HET VERTEGENDE PROJECT is het analyseren van de agenten die betrokken zijn bij de reproductieve capaciteit van Betanodavirus en haar relatie met het onmiddellijke antwoord van de gastheer. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    LA NECROSI NERVOSA VIRALE (NNV) È UNA MALATTIA CHE COLPISCE UNA VARIETÀ DI PESCI IN TUTTO IL MONDO, CAUSANDO ALTI TASSI DI MORTALITÀ, SOPRATTUTTO NELLE LARVE E NEL NOVELLAME. GLI AGENTI ETHIOLOGIC DELLA MALATTIA SONO BETANODAVIRUSES, CHE HANNO UN GENOMA MONOCATENARY RNA BISEGMENTATO COMPOSTO DA RNA1, CHE CODIFICA LA POLIMERASI VIRALE, E RNA2, CHE CODIFICA LA PROTEINA CAPSIDE. INOLTRE, SINTETIZZANO UN RNA SUBGENOMICO, RNA3, CHE CODIFICA LE PROTEINE B1 (FATTORE ANTINECROTICO) E B2 (PROTEZIONE DELLA REPLICAZIONE VIRALE CONTRO L'RNA INTERFERENTE CELLULARE). I BETANODAVIRUSES SONO CLASSIFICATI IN 4 GENOTIPI SECONDO LA SEQUENZA T4 DI RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV E RGNNV. TUTTAVIA, NEGLI ULTIMI ANNI L'ISOLAMENTO DEI RICOMBINANTI NATURALI RG/SJ (RNA1 TIPO RGNNV E RNA2 SJNNV) È STATO DOCUMENTATO NELL'EUROPA MERIDIONALE. TUTTI I RICOMBINANTI ISOLATI DI SOGLIOLA E ORO COLTIVATI NELLA PENISOLA IBERICA HANNO UNA PROTEINA CAPSIDE CON 3 DIVERSE POSIZIONI AMINOACIDE RISPETTO A QUELLA DEL SJNNV, DI CUI 2 ALLA FINE DEL C-TERMINALE, REGIONE CHE DETERMINA LA SPECIFICITÀ DELL'OSPITE, CHE HA DIMOSTRATO DI SVOLGERE UN RUOLO IMPORTANTE NELLA VIRULENZA, E UNA NELLA REGIONE TERMINALE N. INOLTRE, QUESTI RICOMBINANTI PRESENTI NELLA POLIMERASI 19 DIVERSI RESIDUI DI AMIOACIDIC RISPETTO ALLA POLIMERASI DEL CEPPO DI TIPO RG E NELLE REGIONI NON CODIFICANTI DI ENTRAMBI I SEGMENTI GENOMICI UN TOTALE DI 4 NUCLEOTIDI CHE NON CORRISPONDONO AI CEPPI DI TIPO RGNNV (RNA1) E SJNNV (RNA2). TUTTI QUESTI CAMBIAMENTI POSSONO SVOLGERE UN RUOLO IMPORTANTE NELLA VIRULENZA E NELLA CAPACITÀ REPLICATIVA. LO STUDIO DEI DETERMINANTI DELLA VIRULENZA E DELLA CAPACITÀ REPLICATIVA (RELATIVA ALLA POLIMERASI CON ORF B1 E B2) È FONDAMENTALE PER COMPRENDERE E CONTROLLARE LA MALATTIA, ASPETTI CHE SARANNO AFFRONTATI DAL TEAM DI RICERCA USC. MA È BEN NOTO CHE LO SVILUPPO DELLA MALATTIA NON DIPENDE SOLO DALL'AGENTE PATOGENO, ESSENDO DETERMINATO DALL'INTERAZIONE VIRUS-OSPITE. L'IMPLICAZIONE DELL'OSPITE SI BASA SULLA STIMOLAZIONE DEL SISTEMA IMMUNITARIO, CHE SARÀ CARATTERIZZATA DAL TEAM DI RICERCA DELL'UMA. L'INFEZIONE VIRIC INDUCE L'ATTIVAZIONE SIA DEL SISTEMA IMMUNITARIO INNATO CHE DEL SISTEMA IMMUNITARIO ADATTIVO. GLI STUDI SULL'ATTIVAZIONE DEL SISTEMA IMMUNITARIO DA EFFETTUARE INCLUDONO L'ESECUZIONE DI UN SEQUENZIAMENTO TRASCRITTOMICO MASSICCIO (RNA-SEQ) IN RISPOSTA A INFEZIONI VIRALI DI DIVERSA VIRULENZA PER LA SOGLIOLA. Questo STUDY genererà un VALIOSISIM INFORMAZIONI SULL'immunogeni impliced IN RUTS ANTIVIRICI DI DEFENSA, IL TEMPO che permetterà la progettazione di OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TEMPO CON I SOUNDS di TaqMan da utilizzare per studiare, un LEVELLO DI SPESE GENICALE, LA RISPONSA DEL SISTEMA IMMUNE DI LENGUAING LINK to RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED DA inversa genetico, CON GROUND DI SISTEMA DI VIRULENZA E CAPACITÀ replicativa._x000D_ Attenzione a questa ipotesi, l'OBIETTIVO PRINCIPALE DEL PROGETTO PRESENTE è quello di analizzare gli agenti coinvolti nella capacità replicativa del Betanodavirus e il suo rapporto con la risposta immediata dell'ospite. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    VIIRUSNÄRVI NEKROOS (NNV) ON HAIGUS, MIS MÕJUTAB ERINEVAID KALU KOGU MAAILMAS, PÕHJUSTADES KÕRGET SUREMUST, ERITI VASTSETE JA NOORLOOMADE PUHUL. HAIGUSE ETHIOLOGIC ON BETANODAVIRUSES, MILLEL ON BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOOMI, MIS KOOSNEB RNA1, MIS KODEERIB VIIRUSE POLÜMERAASI, JA RNA2, MIS KODEERIB CAPSIDE VALKU. LISAKS SÜNTEESIVAD NAD SUBGENOOMILIST RNA-D, RNA3, MIS KODEERIB VALKE B1 (ANTINEKROOTILINE TEGUR) JA B2 (VIIRUSE REPLIKATSIOONI KAITSE RAKULISE SEGAVA RNA VASTU). BETANODAVIRUSES LIIGITATAKSE 4 GENOTÜÜBIKS VASTAVALT RNA2 T4 JÄRJESTUSELE: SJNNV, TPNNV, BFNNV JA RGNNV. KUID VIIMASTEL AASTATEL ON LÕUNA-EUROOPAS DOKUMENTEERITUD LOODUSLIKE REKOMBINANTIDE RG/SJ (RNA1 TÜÜPI RGNNV JA RNA2 SJNNV) ISOLEERIMINE. KÕIGIL PÜRENEE POOLSAAREL KASVATATUD TALLA JA KULLA ISOLEERITUD REKOMBINANTIDEL ON CAPSIDE’I VALK, MILLEL ON SJNNV-GA VÕRRELDES KOLM ERINEVAT AMINOHAPPELIST ASENDIT, NEIST 2 C-TERMINALI LÕPUS, MIS MÄÄRAB KINDLAKS PEREMEESORGANISMI SPETSIIFILISUSE, MILLEL ON VIRULENTSUSES OLULINE ROLL, JA ÜKS N-TERMINAALSES PIIRKONNAS. LISAKS ESINEVAD NEED REKOMBINANDID 19 ERINEVAS AMIOACIDIC-JÄÄGIS RG-TÜÜPI TÜVE POLÜMERAASI SUHTES JA MÕLEMA GENOOMISEGMENDI MITTEKODEERIVATES PIIRKONDADES KOKKU 4 NUKLEOTIIDI, MIS EI VASTA RGNNV (RNA1) JA SJNNV (RNA2) TÜÜPI TÜVEDELE. KÕIK NEED MUUTUSED VÕIVAD MÄNGIDA OLULIST ROLLI VIRULENTSUSE JA REPLIKATSIOONIVÕIME. VIRULENTSUST MÄÄRAVATE TEGURITE JA REPLIKATSIOONIVÕIME UURING (SEOTUD POLÜMERAASIGA ORF B1 JA B2) ON HAIGUSE MÕISTMISEKS JA KONTROLLIKS VÄGA OLULINE, SEST NEID ASPEKTE KÄSITLEB USC UURIMISRÜHM. KUID ON HÄSTI TEADA, ET HAIGUSE ARENG EI SÕLTU AINULT PATOGEENIST, MIS MÄÄRATAKSE KINDLAKS VIIRUSE JA VASTUVÕTJA KOOSTOIMEGA. PEREMEESORGANISMI MÕJU PÕHINEB IMMUUNSÜSTEEMI STIMULEERIMISEL, MIDA ISELOOMUSTAB UMA UURIMISRÜHM. VIRIC INFEKTSIOON INDUTSEERIB NII KAASASÜNDINUD IMMUUNSÜSTEEMI KUI KA ADAPTIIVSE IMMUUNSÜSTEEMI AKTIVEERUMIST. IMMUUNSÜSTEEMI AKTIVEERIMISE UURINGUD HÕLMAVAD MASSIIVSET TRANSKRIPTOOMSET SEKVENEERIMIST (RNA-SEQ) VASTUSENA VIIRUSINFEKTSIOONIDELE, MILLE VIRULENTSUS ON MERIKEELE SUHTES ERINEV. See STUDY genereerib VALIOSISIM INFORMATION ON immunogens kaasatud ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, AEG, mis võimaldab disaini OPENARRAYS BASED PCR REAL AEG WITH TaqMan SOUNDS, et uurida, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, IMMUNE SÜSTEEMI KOHUSTUSLIK LENGUADE KOHTUASI VÄLJA, OBTAINED BY geneetiline inversa, WITH DYSTEM VÄLJAVÕTJA JA replikatiivne CAPACITY._x000D_ Tähelepanu sellele hüpoteesile on PRESENT PROJECTi PRINCIPAL OBJEKTIVE analüüsida betanodaviiruse replikatsioonivõimes osalevaid aineid ja selle seost peremeesorganismi vahetu vastusega. (Estonian)
    4 August 2022
    0 references
    VIRUSINĖ NERVŲ NEKROZĖ (NNV) YRA LIGA, KURI PAVEIKIA ĮVAIRIAS ŽUVIS VISAME PASAULYJE IR SUKELIA DIDELĮ MIRTINGUMĄ, YPAČ LERVŲ IR JAUNIKLIŲ. ETHIOLOGIC LIGOS SUKĖLĖJAI YRA BETANODAVIRUSES, KURIŲ SUDĖTYJE YRA BISEGMENTED MONOCATENARY RNR GENOMAS, SUDARYTAS IŠ RNR1, KURIS KODUOJA VIRUSINĘ POLIMERAZĘ, IR RNR2, KURIS KODUOJA CAPSIDE BALTYMĄ. BE TO, JIE SINTETINA SUBGENOMINĘ RNR, RNR3, KURI KODUOJA BALTYMUS B1 (ANTIKROZINIS FAKTORIUS) IR B2 (VIRUSŲ REPLIKACIJOS APSAUGA NUO LĄSTELIŲ TRUKDANČIOS RNR). BETANODAVIRUSES SKIRSTOMI Į 4 GENOTIPUS PAGAL RNR2 T4 SEKĄ: SJNNV, TPNNV, BFNNV IR RGNNV. TAČIAU PASTARAISIAIS METAIS NATŪRALIŲ REKOMBINANTŲ RG/SJ (RNA1 TIPO RGNNV IR RNA2 SJNNV) IZOLIAVIMAS BUVO UŽFIKSUOTAS PIETŲ EUROPOJE. VISI IBERIJOS PUSIASALYJE IŠAUGINTI IZOLIUOTI PAPRASTŲJŲ PADŲ IR AUKSO REKOMBINANTAI TURI CAPSIDE BALTYMĄ SU 3 SKIRTINGOMIS AMINORŪGŠTIES POZICIJOMIS, PALYGINTI SU SJNNV, 2 IŠ JŲ – C TERMINALO PABAIGOJE, REGIONE, LEMIANČIAME ŠEIMININKO SPECIFIŠKUMĄ, KURIS, KAIP ĮRODYTA, ATLIEKA SVARBŲ VAIDMENĮ VIRULENTIŠKUMUI, IR VIENAS N-TERMINALO REGIONE. BE TO, ŠIŲ REKOMBINANTŲ, ESANČIŲ 19 SKIRTINGŲ AMIOACIDIC POLIMERAZĖS LIKUČIŲ RG PADERMĖS POLIMERAZĖS ATŽVILGIU IR ABIEJŲ GENOMINIŲ SEGMENTŲ NEKODUOJANČIOSE SRITYSE, IŠ VISO YRA 4 NUKLEOTIDŲ, KURIE NEATITINKA RGNNV (RNR1) IR SJNNV (RNA2) TIPO PADERMIŲ. VISI ŠIE POKYČIAI GALI VAIDINTI SVARBŲ VAIDMENĮ VIRULENTIŠKUMO IR REPLIKACIJOS PAJĖGUMŲ. VIRULENTIŠKUMO DETERMINANTŲ IR REPLIKACIJOS PAJĖGUMŲ (SUSIJUSIŲ SU POLIMERAZE SU ORF B1 IR B2) TYRIMAS YRA LABAI SVARBUS NORINT SUPRASTI IR KONTROLIUOTI LIGĄ, ASPEKTUS, KURIUOS SPRĘS USC MOKSLINIŲ TYRIMŲ GRUPĖ. TAČIAU GERAI ŽINOMA, KAD LIGOS VYSTYMASIS PRIKLAUSO NE TIK NUO PATOGENO, KURĮ LEMIA VIRUSO IR ŠEIMININKO SĄVEIKA. ŠEIMININKO POVEIKIS GRINDŽIAMAS IMUNINĖS SISTEMOS STIMULIAVIMU, KURĮ APIBŪDINS UMA TYRIMŲ KOMANDA. VIRUSINĖ INFEKCIJA SKATINA TIEK ĮGIMTOS IMUNINĖS SISTEMOS, TIEK ADAPTYVIOS IMUNINĖS SISTEMOS AKTYVAVIMĄ. ATLIKTINI IMUNINĖS SISTEMOS AKTYVACIJOS TYRIMAI APIMA MASINĮ TRANSKRIPTOGRAFINĮ SEKOS NUSTATYMĄ (RNR-SEQ) ATSAKANT Į SKIRTINGO VIRULENTIŠKUMO VIRUSO INFEKCIJAS. Šis STUDIJA generuos VALIOSISIM INFORMACIJA Imunogenų, susijusių su ANTIVIRIC RUTS DEFENSA, LAIKAS, kuri leis sukurti OPENARRAYS, PGR REAL TIME su TaqMan SOUNDS, naudotinas tyrimui, GENICAL EXPENDITURE LEVEL, LENGUAINĖS SYSTIJOS REKOMENDACIJOS VIRUS, OBTAINED BY genetinės inversijos, su DYSTEM GROUND OF VIRULENCE IR replikacinės CAPACITY._x000D_ Dėmesio šiai hipotezei PRINCIPALOJA PRESENTO PROJEKTAS yra analizuoti agentus, dalyvaujančius Betanodavirus replikacijos gebėjime ir jo santykį su priimančiosios nedelsiant atsakymu. (Lithuanian)
    4 August 2022
    0 references
    VIRUSNA NEKROZA ŽIVACA (NNV) JE BOLEST KOJA POGAĐA RAZNE RIBE DILJEM SVIJETA, UZROKUJUĆI VISOKE STOPE SMRTNOSTI, OSOBITO U LIČINKI I MLADIH. ETHIOLOGIC AGENSI BOLESTI SU BETANODAVIRUSI, KOJI IMAJU OPISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM KOJI SE SASTOJI OD RNA1, KOJI KODIRA VIRUSNU POLIMERAZU, I RNA2, KOJI KODIRA PROTEIN CAPSIDE. OSIM TOGA, ONI SINTETIZIRAJU SUBGENOMSKU RNK, RNA3, KOJA KODIRA PROTEINE B1 (ANTINEKROTIČKI FAKTOR) I B2 (ZAŠTITA VIRUSNE REPLIKACIJE PROTIV STANIČNE INTERFERIRAJUĆE RNK). BETANODAVIRUSES SE RAZVRSTAVA U 4 GENOTIPA PREMA T4 SLIJEDU RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV I RGNNV. MEĐUTIM, POSLJEDNJIH JE GODINA U JUŽNOJ EUROPI DOKUMENTIRANA IZOLACIJA PRIRODNIH REKOMBINANATA RG/SJ (RNA1 TIP RGNNV I RNA2 SJNNV). SVI IZOLIRANI REKOMBINANTI LISTA I ZLATA KOJI SE UZGAJAJU NA IBERSKOM POLUOTOKU IMAJU CAPSIDE PROTEIN S 3 RAZLIČITA AMINOACIDIČNA POLOŽAJA U USPOREDBI SA SJNNV-OM, 2 NA KRAJU C-TERMINALA, REGIJA KOJA ODREĐUJE SPECIFIČNOST DOMAĆINA, ZA KOJU SE POKAZALO DA IMA VAŽNU ULOGU U VIRULENCI, A JEDAN U N-TERMINALU. OSIM TOGA, TI REKOMBINANTI U POLIMERAZI 19 RAZLIČITIH OSTATAKA AMIOACIDIC-A U ODNOSU NA POLIMERAZU SOJA TIPA RG I U NEKODIRAJUĆIM PODRUČJIMA OBA GENOMSKA SEGMENTA UKUPNO SU 4 NUKLEOTIDA KOJI NE ODGOVARAJU SOJEVIMA TIPA RGNNV (RNA1) I SJNNV (RNA2). SVE TE PROMJENE MOGU IGRATI VAŽNU ULOGU U VIRULENCIJE I REPLIKACIJE KAPACITETA. STUDIJA VIRULENCIJE DETERMINANTA I REPLICIRAJUĆIH KAPACITETA (POVEZANA S POLIMERAZOM S ORF B1 I B2) KLJUČNA JE ZA RAZUMIJEVANJE I KONTROLU BOLESTI, ASPEKATA KOJIMA ĆE SE BAVITI ISTRAŽIVAČKI TIM USC-A. NO, DOBRO JE POZNATO DA RAZVOJ BOLESTI NE OVISI SAMO O PATOGENU, KOJI JE ODREĐEN INTERAKCIJOM VIRUSA I DOMAĆINA. IMPLIKACIJA DOMAĆINA TEMELJI SE NA STIMULACIJI IMUNOLOŠKOG SUSTAVA, KOJI ĆE KARAKTERIZIRATI ISTRAŽIVAČKI TIM UME. VIRIC INFEKCIJA IZAZIVA AKTIVACIJU I UROĐENOG IMUNOLOŠKOG SUSTAVA I ADAPTIVNOG IMUNOLOŠKOG SUSTAVA. ISPITIVANJA AKTIVACIJE IMUNOSNOG SUSTAVA KOJA ĆE SE PROVESTI UKLJUČUJU IZVOĐENJE MASOVNOG TRANSKRIPTOMSKOG SEKVENCIRANJA (RNA-SEQ) KAO ODGOVOR NA VIRUSNE INFEKCIJE RAZLIČITIH VIRULENCIJE ZA JEDINI. Ova STUDIJA će generirati VALIOSISIM INFORMACIJE o imunogenima impliciranih u ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME koji će omogućiti dizajn OPENARRAYS BASED U PCR REAL TIME S TaqMan SOUNDS koji će se koristiti za proučavanje, LEVEL GENICAL EXPENDITURE, odgovor IMMUNE SYSTEM LENGUAING LINK ZA PREPORUČUJE VIRUS, OBTAINED BY genetički inversa, S DISTEM GROUND VIRULENCE I replikativnom CAPACITY._x000D_ Pažnja na ovu hipotezu, PRINCIPAL OBJECTIVE PRESENT PROJECT je analizirati agente koji su uključeni u replicirajući kapacitet betanodavirusa i njegov odnos s domaćinovim neposrednim odgovorom. (Croatian)
    4 August 2022
    0 references
    Η ΝΈΚΡΩΣΗ ΤΟΥ ΙΟΎ ΤΩΝ ΝΕΎΡΩΝ (NNV) ΕΊΝΑΙ ΜΙΑ ΝΌΣΟΣ ΠΟΥ ΕΠΗΡΕΆΖΕΙ ΜΙΑ ΠΟΙΚΙΛΊΑ ΨΑΡΙΏΝ ΠΑΓΚΟΣΜΊΩΣ, ΠΡΟΚΑΛΏΝΤΑΣ ΥΨΗΛΆ ΠΟΣΟΣΤΆ ΘΝΗΣΙΜΌΤΗΤΑΣ, ΙΔΊΩΣ ΣΤΙΣ ΠΡΟΝΎΜΦΕΣ ΚΑΙ ΣΤΑ ΝΕΑΡΆ ΖΏΑ. ΟΙ ETHIOLOGIC ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΤΗΣ ΝΌΣΟΥ ΕΊΝΑΙ ΟΙ BETANODAVIRUSES, ΟΙ ΟΠΟΊΟΙ ΈΧΟΥΝ ΈΝΑ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA ΓΟΝΙΔΊΩΜΑ ΑΠΟΤΕΛΟΎΜΕΝΟ ΑΠΌ RNA1, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΕΊ ΤΗΝ ΙΟΓΕΝΉ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ, ΚΑΙ RNA2, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΕΊ ΤΗΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ CAPSIDE. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΣΥΝΘΈΤΟΥΝ ΈΝΑ ΥΠΟΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΌ RNA, ΤΟ RNA3, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΕΊ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ Β1 (ΑΝΤΙ-ΝΕΚΡΩΤΙΚΌΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ) ΚΑΙ Β2 (ΠΡΟΣΤΑΣΊΑ ΤΗΣ ΙΙΚΉΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΉΣ ΑΠΌ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΠΑΡΕΜΒΟΛΉ RNA). ΤΟ BETANODAVIRUSES ΤΑΞΙΝΟΜΕΊΤΑΙ ΣΕ 4 ΓΟΝΌΤΥΠΟΥΣ ΣΎΜΦΩΝΑ ΜΕ ΤΗΝ ΑΚΟΛΟΥΘΊΑ Τ4 ΤΟΥ RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV ΚΑΙ RGNNV. ΩΣΤΌΣΟ, ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ Η ΑΠΟΜΌΝΩΣΗ ΤΩΝ ΦΥΣΙΚΏΝ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΩΝ RG/SJ (RNA1 ΤΎΠΟΥ RGNNV ΚΑΙ RNA2 SJNNV) ΈΧΕΙ ΤΕΚΜΗΡΙΩΘΕΊ ΣΤΗ ΝΌΤΙΑ ΕΥΡΏΠΗ. ΌΛΟΙ ΟΙ ΑΠΟΜΟΝΩΜΈΝΟΙ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΊ ΓΛΏΣΣΑΣ ΚΑΙ ΧΡΥΣΟΎ ΠΟΥ ΚΑΛΛΙΕΡΓΟΎΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΙΒΗΡΙΚΉ ΧΕΡΣΌΝΗΣΟ ΈΧΟΥΝ ΜΙΑ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ CAPSIDE ΜΕ 3 ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΑΜΙΝΟΞΈΕΣ ΘΈΣΕΙΣ ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ ΕΚΕΊΝΗ ΤΟΥ SJNNV, 2 ΑΠΌ ΑΥΤΈΣ ΣΤΟ ΤΈΛΟΣ ΤΟΥ ΤΕΡΜΑΤΙΚΟΎ C, ΠΕΡΙΟΧΉ ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΊΖΕΙ ΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ, Η ΟΠΟΊΑ ΈΧΕΙ ΑΠΟΔΕΙΧΘΕΊ ΌΤΙ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΖΕΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟ ΔΡΆΣΗ, ΚΑΙ ΜΊΑ ΣΤΗΝ ΠΕΡΙΟΧΉ N-ΤΕΡΜΑΤΙΚΌ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΕΣ ΟΥΣΊΕΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΈΧΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ 19 ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΥΠΟΛΕΊΜΜΑΤΑ AMIOACIDIC ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΗΝ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ ΤΟΥ ΣΤΕΛΈΧΟΥΣ ΤΎΠΟΥ RG ΚΑΙ ΣΤΙΣ ΜΗ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΗΜΈΝΕΣ ΠΕΡΙΟΧΈΣ ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΎΟ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ ΤΜΗΜΆΤΩΝ, ΣΥΝΟΛΙΚΆ 4 ΝΟΥΚΛΕΟΤΊΔΙΑ ΠΟΥ ΔΕΝ ΤΑΙΡΙΆΖΟΥΝ ΜΕ ΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ ΤΎΠΟΥ RGNNV (RNA1) ΚΑΙ SJNNV (RNA2). ΌΛΕΣ ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΑΛΛΑΓΈΣ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΣΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΚΑΙ ΣΤΗΝ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ. Η ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑΣ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ (ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ ΜΕ ORF B1 ΚΑΙ B2) ΕΊΝΑΙ ΘΕΜΕΛΙΏΔΟΥΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΚΑΙ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΗΣ ΝΌΣΟΥ, ΠΤΥΧΈΣ ΠΟΥ ΘΑ ΕΞΕΤΑΣΤΟΎΝ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΤΟΥ USC. ΑΛΛΆ ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΌ ΌΤΙ Η ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΤΗΣ ΝΌΣΟΥ ΔΕΝ ΕΞΑΡΤΆΤΑΙ ΜΌΝΟ ΑΠΌ ΤΟ ΠΑΘΟΓΌΝΟ, ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΙΟΎ-ΞΕΝΙΣΤΉ. Η ΕΠΊΠΤΩΣΗ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ ΒΑΣΊΖΕΤΑΙ ΣΤΗ ΔΙΈΓΕΡΣΗ ΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΘΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΤΗΣ ΟΎΜΑ. Η ΛΟΊΜΩΞΗ ΤΟΥ VIRIC ΠΡΟΚΑΛΕΊ ΤΗΝ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΌΣΟ ΤΟΥ ΈΜΦΥΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΌΣΟ ΚΑΙ ΤΟΥ ΠΡΟΣΑΡΜΟΖΌΜΕΝΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ. ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΠΟΥ ΠΡΌΚΕΙΤΑΙ ΝΑ ΔΙΕΞΑΧΘΟΎΝ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ ΤΗΝ ΕΚΤΈΛΕΣΗ ΜΙΑΣ ΜΑΖΙΚΉΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑΣ (RNA-SEQ) ΩΣ ΑΠΆΝΤΗΣΗ ΣΕ ΙΙΚΈΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΉΣ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ ΓΙΑ ΤΗ ΓΛΏΣΣΑ. Αυτή η ΜΕΛΕΤΗ θα δημιουργήσει ένα VALIOSISIM ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ για τα ανοσογόνα που εμπλέκονται σε ΑΝΤΙΒΙΙΚΙΚΕΣ ΡΥΘΜΙΣΕΙΣ ΤΗΣ DEFENSA, Ο ΧΡΟΝΟΣ που θα επιτρέψει τον σχεδιασμό των OPENARRAYS BASED σε PCR REAL TIME ΜΕ TaqMan SOUNDS που θα χρησιμοποιηθούν για τη μελέτη, ένα επίπεδο ΓΕΝΙΚΗΣ ΔΑΠΑΝΗΣ, η ΑΝΤΙΚΕΙΜΕΝΟ ΤΟΥ ΣΥΣΤΗΜΑΤΟΣ ΙΜΟΝΙΟΥ ΤΟΥ ΣΥΓΧΡΟΝΟΥ ΣΥΝΔΕΣΜΟΥ ΓΙΑ ΤΗ ΣΥΣΤΑΣΗ ΒΕΡΟΥΣ, ΑΠΟ ΤΗ γενετική ΕΙΣΠΡΑΞΗ, ΜΕ ΤΟ ΔΥΣΤΗΜΑ ΤΗΣ ΒΙΟΜΗΧΑΝΙΑΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΝΑΠΛΗΡΩΤΙΚΗΣ ΙΚΑΝΟΤΗΤΑΣ._x000D_ Προσοχή σε αυτή την υπόθεση, ο ΠΡΟΔΙΚΑΣΤΙΚΟΣ ΣΤΟΧΟΣ του ΠΡΟΕΔΡΟΥ είναι να αναλύσει τους παράγοντες που εμπλέκονται στην αναπαραγωγική ικανότητα του Betanodavirus και τη σχέση του με την άμεση απάντηση του οικοδεσπότη. (Greek)
    4 August 2022
    0 references
    VÍRUSOVÁ NERVOVÁ NEKRÓZA (NNV) JE OCHORENIE, KTORÉ POSTIHUJE CELÝ RAD RÝB NA CELOM SVETE A SPÔSOBUJE VYSOKÚ ÚMRTNOSŤ, NAJMÄ U LARIEV A JUVENILNÝCH JEDINCOV. ETHIOLOGICKÝMI PÔVODCAMI OCHORENIA SÚ BETANODAVIRUSES, KTORÉ MAJÚ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENÓM ZLOŽENÝ Z RNA1, KTORÝ KÓDUJE VÍRUSOVÚ POLYMERÁZU, A RNA2, KTORÝ KÓDUJE CAPSIDEOV PROTEÍN. OKREM TOHO SYNTETIZUJÚ SUBGENOMICKÚ RNA, RNA3, KTORÁ KÓDUJE PROTEÍNY B1 (ANTINEKROTICKÝ FAKTOR) A B2 (OCHRANA VÍRUSOVEJ REPLIKÁCIE PROTI BUNKOVEJ INTERFERUJÚCEJ RNA). BETANODAVIRUSES SÚ KLASIFIKOVANÉ DO 4 GENOTYPOV PODĽA T4 SEKVENCIE RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV A RGNNV. V POSLEDNÝCH ROKOCH VŠAK BOLA IZOLÁCIA PRÍRODNÝCH REKOMBINANTOV RG/SJ (RNA1 TYPU RGNNV A RNA2 SJNNV) ZDOKUMENTOVANÁ V JUŽNEJ EURÓPE. VŠETKY IZOLOVANÉ REKOMBINANTY SOLEY A ZLATA VYPESTOVANÉ NA PYRENEJSKOM POLOSTROVE MAJÚ CAPSIDE PROTEÍN S 3 ODLIŠNÝMI AMINOCÍDNYMI POZÍCIAMI V POROVNANÍ SO SJNNV, 2 Z NICH NA KONCI TERMINÁLU C, REGIÓN URČUJÚCI ŠPECIFICKOSŤ HOSTITEĽA, KTORÝ PREUKÁZATEĽNE ZOHRÁVA DÔLEŽITÚ ÚLOHU VO VIRULENCII, A JEDEN V REGIÓNE N-TERMINÁL. OKREM TOHO TIETO REKOMBINANTY PRÍTOMNÉ V POLYMERÁZE 19 RÔZNYCH REZÍDUÍ AMIOACIDIC VZHĽADOM NA POLYMERÁZU KMEŇA RG A V NEKÓDUJÚCICH OBLASTIACH OBOCH GENOMICKÝCH SEGMENTOV CELKOVO 4 NUKLEOTIDY, KTORÉ NEZODPOVEDAJÚ KMEŇOM RGNNV (RNA1) A SJNNV (RNA2). VŠETKY TIETO ZMENY MÔŽU ZOHRÁVAŤ DÔLEŽITÚ ÚLOHU PRI VIRULENCII A REPLIKAČNEJ KAPACITE. ŠTÚDIA VIRULENTNÝCH DETERMINANTOV A REPLIKAČNEJ KAPACITY (SÚVISIACICH S POLYMERÁZOU S ORF B1 A B2) MÁ ZÁSADNÝ VÝZNAM PRE POCHOPENIE A KONTROLU OCHORENIA, ASPEKTOV, KTORÝMI SA BUDE ZAOBERAŤ VÝSKUMNÝ TÍM USC. JE VŠAK DOBRE ZNÁME, ŽE VÝVOJ OCHORENIA NEZÁVISÍ LEN OD PATOGÉNU, KTORÝ JE URČENÝ INTERAKCIOU VÍRUS-HOSTITEĽ. VPLYV HOSTITEĽA JE ZALOŽENÝ NA STIMULÁCII IMUNITNÉHO SYSTÉMU, KTORÝ BUDE CHARAKTERIZOVANÝ VÝSKUMNÝM TÍMOM UMY. INFEKCIA VÍRUSOM INDUKUJE AKTIVÁCIU VRODENÉHO IMUNITNÉHO SYSTÉMU A ADAPTÍVNEHO IMUNITNÉHO SYSTÉMU. ŠTÚDIE O AKTIVÁCII IMUNITNÉHO SYSTÉMU, KTORÉ SA MAJÚ VYKONAŤ, ZAHŔŇAJÚ VYKONANIE MASÍVNEHO TRANSKRIPTOMICKÉHO SEKVENOVANIA (RNA-SEQ) V REAKCII NA VÍRUSOVÉ INFEKCIE RÔZNEJ VIRULENCIE U SOLEY. Tento ŠTUDY vygeneruje VALIOSISIM INFORMÁCIE o imunogenoch implikovaných v ANTIVIRICKÝCH RUTS OF DEFENSA, TIME, ktorý umožní návrh OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME S Taqmanovými SOUNDS, ktoré sa majú použiť na štúdium, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LENGUAAING LINK TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED BY genetická inversa, S DYSTEM GROUND of VIRULENCE a replikatívnou CAPACITY._x000D_ Pozor na túto hypotézu, PRINCIPAL OBJECTIVE PRESENTNÉHO PROJEKTU je analyzovať látky podieľajúce sa na replikačnej kapacite betaanodavírusu a jeho vzťah k okamžitej odpovedi hostiteľa. (Slovak)
    4 August 2022
    0 references
    VIRUSHERMONEKROOSI (NNV) ON SAIRAUS, JOKA VAIKUTTAA MONIIN KALOIHIN MAAILMANLAAJUISESTI JA AIHEUTTAA SUURTA KUOLLEISUUTTA ERITYISESTI TOUKISSA JA NUORILLA. TAUDIN ETHIOLOGIC-AGENTIT OVAT BETANODAVIRUSES, JOILLA ON BISEGMENTED MONOCATENARY RNA -GENOMI, JOKA KOOSTUU RNA1:STA, JOKA KOODAA VIRUSPOLYMERAASIN, JA RNA2, JOKA KOODAA CAPSIDE-PROTEIINIA. LISÄKSI NE SYNTETISOIVAT SUBGENOMISEN RNA:N, RNA3, JOKA KOODAA PROTEIINEJA B1 (ANTI-NEKROOTTINEN TEKIJÄ) JA B2 (VIRUKSEN REPLIKAATION SUOJAAMINEN SOLUJA HÄIRITSEVÄÄ RNA:TA VASTAAN). BETANODAVIRUSES LUOKITELLAAN NELJÄÄN GENOTYYPPIIN RNA2:N T4-SEKVENSSIN MUKAAN: SJNNV, TPNNV, BFNNV JA RGNNV. VIIME VUOSINA ETELÄ-EUROOPASSA ON KUITENKIN DOKUMENTOITU LUONNOLLISTEN REKOMBINANTTIEN RG/SJ (RNA1 TYYPPI RGNNV JA RNA2 SJNNV) ERISTÄMINEN. KAIKILLA IBERIAN NIEMIMAALLA VILJELLYILLÄ MERIANTURAN JA KULLAN ERISTETYILLÄ REKOMBINANTEILLA ON CAPSIDE-PROTEIINI, JOSSA ON KOLME ERI AMINOASIDISTA KUIN SJNNV:LLÄ, JOISTA KAKSI ON C-TERMINAALIN LOPUSSA, JOKA MÄÄRITTÄÄ ISÄNTÄSPESIFISYYDEN, JOLLA ON OSOITETTU OLEVAN TÄRKEÄ ROOLI VIRULENSSISSA, JA YKSI N-TERMINAALIALUEELLA. LISÄKSI NÄITÄ REKOMBINANTTEJA ESIINTYY POLYMERAASISSA 19 ERI AMIOACIDIC-JÄÄMISSÄ RG-TYYPPISEN KANNAN POLYMERAASIN SUHTEEN JA MOLEMPIEN GENOMISEGMENTTIEN KOODAAMATTOMILLA ALUEILLA YHTEENSÄ 4 NUKLEOTIDIA, JOTKA EIVÄT VASTAA RGNNV- (RNA1)- JA SJNNV (RNA2) -TYYPPISIÄ KANTOJA. KAIKILLA NÄILLÄ MUUTOKSILLA VOI OLLA TÄRKEÄ ROOLI VIRULENSSISSA JA REPLIKAATIOKYVYSSÄ. VIRULENSSIN TAUSTA-AINEIDEN JA REPLIKAATIOKYVYN TUTKIMUS (JOKA LIITTYY POLYMERAASIIN ORF B1:N JA B2:N KANSSA) ON OLENNAISEN TÄRKEÄÄ TAUDIN YMMÄRTÄMISEKSI JA HALLITSEMISEKSI. USC:N TUTKIMUSRYHMÄ KÄSITTELEE NÄITÄ NÄKÖKOHTIA. MUTTA ON HYVIN TIEDOSSA, ETTÄ TAUDIN KEHITTYMINEN EI RIIPU VAIN PATOGEENISTÄ, MÄÄRITETÄÄN VIRUS-ISÄNTÄVUOROVAIKUTUKSELLA. ISÄNTÄN VAIKUTUS PERUSTUU IMMUUNIJÄRJESTELMÄN STIMULAATIOON, JOTA LUONNEHTII UMAN TUTKIMUSRYHMÄ. VIRUSINFEKTIO AKTIVOI SEKÄ SYNNYNNÄISEN IMMUUNIJÄRJESTELMÄN ETTÄ MUKAUTUVAN IMMUUNIJÄRJESTELMÄN. IMMUUNIJÄRJESTELMÄN AKTIVAATIOTA KOSKEVIIN TUTKIMUKSIIN KUULUU MASSIIVISEN TRANSCRIPTOMISEN SEKVENSOINNIN (RNA-SEQ) SUORITTAMINEN VASTAUKSENA VIRUSINFEKTIOIHIN, JOILLA ON ERI VIRULENSSIPOHJA. Tämä STUDY tuottaa VALIOSISIM INFORMATION ON Immunogens impliced in ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME, joka mahdollistaa suunnittelun OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS voidaan käyttää tutkimukseen, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, LENGUAING LINKIN SYSTEMIN SUOSITUS SUOSITUKSEN VIRUS, OBTAINED BY geneettisen inversan, VIRULENCE- JA replikatiivisen CAPACITY: n DYSTEM GROUNDIN JA replikoivan CAPACITY._x000D_ Huomio tähän hypoteesiin, PRINCIPAL OBJECTive of the PRESENT PROJECT on analysoida tekijöitä, jotka osallistuvat Betanodaviruksen replikaatiokapasiteettiin ja sen suhteeseen isäntän välittömään vastaukseen. (Finnish)
    4 August 2022
    0 references
    MARTWICA NERWÓW WIRUSOWYCH (NNV) JEST CHOROBĄ, KTÓRA DOTYKA RÓŻNE RYBY NA CAŁYM ŚWIECIE, POWODUJĄC WYSOKĄ ŚMIERTELNOŚĆ, ZWŁASZCZA U LARW I MŁODYCH OSOBNIKÓW. ETHIOLOGIC CZYNNIKÓW CHOROBOTWÓRCZYCH SĄ BETANODAVIRUSES, KTÓRE MAJĄ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM ZŁOŻONY Z RNA1, KTÓRY KODUJE POLIMERAZĘ WIRUSOWĄ, I RNA2, KTÓRY KODUJE BIAŁKO CAPSIDE. PONADTO SYNTETYZUJĄ PODGENOMICZNY RNA, RNA3, KTÓRY KODUJE BIAŁKA B1 (WSPÓŁCZYNNIK ANTY-NEKROTYCZNY) I B2 (OCHRONA REPLIKACJI WIRUSOWEJ PRZED ZAKŁÓCAJĄCYMI KOMÓRKI RNA). BETANODAVIRUSES SĄ KLASYFIKOWANE NA 4 GENOTYPY ZGODNIE Z SEKWENCJĄ T4 RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV I RGNNV. JEDNAK W OSTATNICH LATACH W EUROPIE POŁUDNIOWEJ UDOKUMENTOWANO IZOLACJĘ NATURALNYCH REKOMBINANTÓW RG/SJ (TYP RNA1 RGNNV I RNA2 SJNNV). WSZYSTKIE IZOLOWANE REKOMBINACJE SOLI I ZŁOTA UPRAWIANE NA PÓŁWYSPIE IBERYJSKIM MAJĄ BIAŁKO CAPSIDE O 3 RÓŻNYCH POZYCJACH AMINOKWASOWYCH W PORÓWNANIU Z SJNNV, 2 Z NICH NA KOŃCU C-TERMINALU, REGION OKREŚLAJĄCY SPECYFICZNOŚĆ ŻYWICIELA, KTÓRY OKAZAŁ SIĘ ODGRYWAĆ WAŻNĄ ROLĘ W ZJADLIWOŚCI, A JEDEN W REGIONIE N-TERMINALU. PONADTO REKOMBINACJE TE WYSTĘPUJĄ W 19 RÓŻNYCH POZOSTAŁOŚCIACH POLIMERAZY AMIOACIDIC W ODNIESIENIU DO POLIMERAZY SZCZEPU RG, A W REGIONACH NIEKODUJĄCYCH OBU SEGMENTÓW GENOMOWYCH ŁĄCZNIE 4 NUKLEOTYDY, KTÓRE NIE ODPOWIADAJĄ SZCZEPOM RGNNV (RNA1) I SJNNV (RNA2). WSZYSTKIE TE ZMIANY MOGĄ ODGRYWAĆ WAŻNĄ ROLĘ W ZJADLIWOŚCI I ZDOLNOŚCI REPLIKACJI. BADANIE DETERMINANTÓW ZJADLIWOŚCI I ZDOLNOŚCI REPLIKACYJNYCH (ZWIĄZANYCH Z POLIMERAZĄ Z ORF B1 I B2) MA ZASADNICZE ZNACZENIE DLA ZROZUMIENIA I KONTROLOWANIA CHOROBY, ASPEKTÓW, KTÓRE ZOSTANĄ OMÓWIONE PRZEZ ZESPÓŁ BADAWCZY USC. ALE POWSZECHNIE WIADOMO, ŻE ROZWÓJ CHOROBY NIE ZALEŻY TYLKO OD PATOGENU, JEST OKREŚLANY PRZEZ INTERAKCJĘ WIRUS-HOST. IMPLIKACJA GOSPODARZA OPIERA SIĘ NA STYMULACJI UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO, KTÓRY BĘDZIE CHARAKTERYZOWAŁ ZESPÓŁ BADAWCZY UMA. ZAKAŻENIE WIRUSEM VIRIC INDUKUJE AKTYWACJĘ ZARÓWNO WRODZONEGO UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO, JAK I ADAPTACYJNEGO UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO. BADANIA NAD AKTYWACJĄ UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO, KTÓRE MAJĄ BYĆ PRZEPROWADZONE, OBEJMUJĄ WYKONANIE MASOWEGO SEKWENCJONOWANIA TRANSKRYPTOMICZNEGO (RNA-SEQ) W ODPOWIEDZI NA INFEKCJE WIRUSOWE O RÓŻNEJ ZJADLIWOŚCI NA PODESZWĘ. Ten STUDY wygeneruje WALIOSISIM INFORMACJI ON immunogenów zaangażowanych w ANTIVIRIC RUTS DEFENSA, TIME, który pozwoli na zaprojektowanie OPENARRAYS pokrytych w czasie rzeczywistym z TaqMan SOUNDS do badania, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LENGUAING LINK TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED BY genetyczna inversa, Z DYSTEM GROUND WIRULENCJI I replikacyjnej CAPACITY._x000D_ Uwaga na tę hipotezę, PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT jest analiza czynników zaangażowanych w replikacyjne zdolności Betanodavirus i jego związek z natychmiastową odpowiedzią gospodarza. (Polish)
    4 August 2022
    0 references
    A VÍRUSOS IDEGNEKRÓZIS (NNV) OLYAN BETEGSÉG, AMELY VILÁGSZERTE SZÁMOS HALAT ÉRINT, ÉS MAGAS MORTALITÁST OKOZ, KÜLÖNÖSEN A LÁRVÁKBAN ÉS A FIATAL EGYEDEKBEN. A BETEGSÉG ETHIOLOGIC-KÓROKOZÓI A BETANODAVIRUSES, AMELYNEK BISEGMENTES MONOCATENARY RNS GENOMJA VAN, AMELY RNS1-BŐL ÁLL, AMELY VÍRUSPOLIMERÁZT KÓDOL, ÉS RNA2, AMELY A CAPSIDE FEHÉRJÉT KÓDOLJA. EMELLETT SZINTETIZÁLNAK EGY SZUBGENOMIKUS RNS-T, RNS3-AT, AMELY B1 (ANTINEKROTIKUS FAKTOR) ÉS B2 (A VÍRUSREPLIKÁCIÓNAK A SEJTINTERFERÁLÓ RNS ELLENI VÉDELME) FEHÉRJÉKET KÓDOL. A BETANODAVIRUSES AZ RNA2 T4 SZEKVENCIÁJA SZERINT 4 GENOTÍPUSBA SOROLHATÓ: SJNNV, TPNNV, BFNNV ÉS RGNNV. AZ ELMÚLT ÉVEKBEN AZONBAN DÉL-EURÓPÁBAN DOKUMENTÁLTÁK A TERMÉSZETES REKOMBINÁNSOK (RGNNV ÉS RNA2 SJNNV) IZOLÁLÁSÁT. AZ IBÉRIAI-FÉLSZIGETEN TERMESZTETT NYELVHAL ÉS ARANY VALAMENNYI IZOLÁLT REKOMBINÁNSÁNAK CAPSIDE-FEHÉRJE 3 KÜLÖNBÖZŐ AMINOACIDOS, MINT AZ SJNNV, EZEK KÖZÜL KETTŐ A C-TERMINÁL VÉGÉN, A GAZDA-SPECIFIKUSSÁGOT MEGHATÁROZÓ RÉGIÓ, AMELY BIZONYÍTOTTAN FONTOS SZEREPET JÁTSZIK A VIRULENCIÁBAN, ÉS EGY AZ N-TERMINÁLIS RÉGIÓBAN. EZEN TÚLMENŐEN EZEK A REKOMBINÁNSOK A POLIMERÁZBAN 19 KÜLÖNBÖZŐ AMIOACIDIC-MARADÉKOT TARTALMAZNAK AZ RG-TÍPUSÚ TÖRZS POLIMERÁZA TEKINTETÉBEN, ÉS MINDKÉT GENOMSZEGMENS NEM KÓDOLÓ RÉGIÓJÁBAN ÖSSZESEN 4 NUKLEOTIDOT TARTALMAZNAK, AMELYEK NEM EGYEZNEK MEG AZ RGNNV (RNA1) ÉS AZ SJNNV (RNA2) TÍPUSÚ TÖRZSEKKEL. MINDEZEK A VÁLTOZÁSOK FONTOS SZEREPET JÁTSZHATNAK A VIRULENCIA ÉS A REPLIKÁCIÓS KÉPESSÉG TERÉN. A VIRULENCIA DETERMINÁNSOK ÉS REPLIKÁCIÓS KAPACITÁS (AZ ORF B1 ÉS B2 POLIMERÁZZAL KAPCSOLATOS) VIZSGÁLATA ALAPVETŐ FONTOSSÁGÚ A BETEGSÉG MEGÉRTÉSÉHEZ ÉS KONTROLLÁLÁSÁHOZ, AZ USC KUTATÓCSOPORT ÁLTAL KEZELT SZEMPONTOKHOZ. DE KÖZTUDOTT, HOGY A BETEGSÉG KIALAKULÁSA NEM CSAK A KÓROKOZÓTÓL FÜGG, AMELYET A VÍRUS-HOST INTERAKCIÓ HATÁROZ MEG. A GAZDATEST HATÁSA AZ IMMUNRENDSZER STIMULÁCIÓJÁN ALAPUL, AMELYET AZ UMA KUTATÓCSOPORTJA JELLEMEZ. A VIRIC FERTŐZÉS MIND A VELESZÜLETETT IMMUNRENDSZER, MIND AZ ADAPTÍV IMMUNRENDSZER AKTIVÁLÁSÁT INDUKÁLJA. AZ IMMUNRENDSZER AKTIVÁLÁSÁRA IRÁNYULÓ VIZSGÁLATOK KÖZÉ TARTOZIK EGY MASSZÍV TRANSZKRIPTOMIKUS SZEKVENÁLÁS (RNS-SEQ) ELVÉGZÉSE A KÖZÖNSÉGES NYELVHAL KÜLÖNBÖZŐ VIRULENCIÁJÚ VÍRUSFERTŐZÉSEIRE ADOTT VÁLASZKÉNT. Ez a STUDY létre fog hozni egy VALIOSISIM INFORMÁCIÓK A DEFENSA ANTIVIRIC RUTS-ban érintett immunogénekkel, A TIME, amely lehetővé teszi a PCR REAL TIME-ben engedélyezett OPENARRAY-ok megtervezését a tanulmányozáshoz használt Taqman SOUNDS-okkal, a GENICAL EXPENDITURE LEVELE, az IMMUNE SYSTEM LENGUAING LINK A RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED A genetikai inversa, A VIRULENCE DYSTEM GROUND OF VIULENCIÓ ÉS replikatív KAPACITY._x000D_ Figyelem erre a feltevésre, A PRINCIPAL OBJECT IRÁNYELV A PRINCIPAL OBJECT IRÁNYELVE a Betanodavírus replikatív kapacitásában részt vevő ügynököket és annak kapcsolatát a fogadó azonnali válaszával. (Hungarian)
    4 August 2022
    0 references
    VIROVÁ NERVOVÁ NEKRÓZA (NNV) JE ONEMOCNĚNÍ, KTERÉ POSTIHUJE CELOU ŘADU RYB PO CELÉM SVĚTĚ A ZPŮSOBUJE VYSOKOU ÚMRTNOST, ZEJMÉNA U LARVY A NEDOSPĚLÝCH JEDINCŮ. ETHIOLOGIC AGENTI TÉTO CHOROBY JSOU BETANODAVIRUSY, KTERÉ MAJÍ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SLOŽENÝ Z RNA1, KTERÝ KÓDUJE VIROVOU POLYMERÁZU, A RNA2, KTERÝ KÓDUJE CAPSIDE PROTEIN. KROMĚ TOHO SYNTETIZUJÍ SUBGENOMICKOU RNA, RNA3, KTERÁ KÓDUJE PROTEINY B1 (ANTINEKROTICKÝ FAKTOR) A B2 (OCHRANA REPLIKACE VIRŮ PROTI BUNĚČNÉ INTERFERUJÍCÍ RNA). BETANODAVIRUSY JSOU KLASIFIKOVÁNY DO 4 GENOTYPŮ PODLE T4 SEKVENCE RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV A RGNNV. V POSLEDNÍCH LETECH VŠAK BYLA IZOLACE PŘÍRODNÍCH REKOMBINANTŮ RG/SJ (RNA1 TYPU RGNNV A RNA2 SJNNV) ZDOKUMENTOVÁNA V JIŽNÍ EVROPĚ. VŠECHNY IZOLOVANÉ REKOMBINANTY JAZYKA A ZLATA PĚSTOVANÉ NA PYRENEJSKÉM POLOOSTROVĚ MAJÍ CAPSIDE PROTEIN SE TŘEMI ODLIŠNÝMI AMINOACIDICKÝMI POZICEMI NEŽ SJNNV, 2 Z NICH NA KONCI C-TERMINAL, REGION URČUJÍCÍ SPECIFIČNOST HOSTITELE, KTERÝ SE UKÁZAL, ŽE HRAJE DŮLEŽITOU ROLI V VIRULENCI, A JEDEN V REGIONU N-TERMINAL. KROMĚ TOHO SE TYTO REKOMBINANTY VYSKYTUJÍ V POLYMERÁZOVÝCH ZBYTCÍCH 19 RŮZNÝCH REZIDUÍ AMIOACIDIC, POKUD JDE O POLYMERÁZU KMENE RG TYPU, A V NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTECH OBOU GENOMICKÝCH SEGMENTŮ CELKEM 4 NUKLEOTIDY, KTERÉ NEODPOVÍDAJÍ KMENŮM TYPU RGNNV (RNA1) A SJNNV (RNA2). VŠECHNY TYTO ZMĚNY MOHOU HRÁT DŮLEŽITOU ROLI V VIRULENCE A REPLIKAČNÍ KAPACITĚ. STUDIE DETERMINANT VIRULENCE A REPLIKAČNÍ KAPACITY (SOUVISEJÍCÍ S POLYMERÁZOU S ORF B1 A B2) JE ZÁSADNÍ PRO POCHOPENÍ A KONTROLU ONEMOCNĚNÍ, COŽ JSOU ASPEKTY, KTERÝMI SE BUDE ZABÝVAT VÝZKUMNÝ TÝM USC. ALE JE DOBŘE ZNÁMO, ŽE VÝVOJ ONEMOCNĚNÍ NEZÁVISÍ POUZE NA PATOGENU, KTERÝ JE URČEN INTERAKCÍ VIRU A HOSTITELE. DŮSLEDKY HOSTITELE JSOU ZALOŽENY NA STIMULACI IMUNITNÍHO SYSTÉMU, KTERÝ BUDE CHARAKTERIZOVÁN VÝZKUMNÝM TÝMEM UMY. VIROVÁ INFEKCE VYVOLÁVÁ AKTIVACI JAK VROZENÉHO IMUNITNÍHO SYSTÉMU, TAK ADAPTIVNÍHO IMUNITNÍHO SYSTÉMU. STUDIE O AKTIVACI IMUNITNÍHO SYSTÉMU, KTERÉ MAJÍ BÝT PROVEDENY, ZAHRNUJÍ PROVEDENÍ MASIVNÍHO TRANSKRIPTOMICKÉHO SEKVENOVÁNÍ (RNA-SEQ) V REAKCI NA VIROVÉ INFEKCE RŮZNÉ VIRULENCE U JAZYKA OBECNÉHO. Tato STUDIE vytvoří VALIOSISIM INFORMACE O imunogenech zapojených do ANTIVIRICKÝCH RUTCH DEFENSA, TIME, které umožní navrhnout OPENARRAYS BASED V PCR REAL TIME S Taqmanovými SOUNDS, které mají být použity ke studiu, LEVEL GENICAL EXPENDITURE, RESPONCE IMMUNE SYSTÉMU LENGUAING LINK TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED BY genetická inversa, S DYSTEM GROUND OF VIRULENCE A replikativní CAPACITY._x000D_ Pozor na tuto hypotézu, PRINCIPAL OBJEKTU PRESENT PROJECT je analyzovat agenty zapojené do replikační kapacity Betanodavirus a jeho vztah k okamžité odpovědi hostitele. (Czech)
    4 August 2022
    0 references
    VĪRUSU NERVA NEKROZE (NNV) IR SLIMĪBA, KAS SKAR DAŽĀDAS ZIVIS VISĀ PASAULĒ, IZRAISOT AUGSTU MIRSTĪBAS LĪMENI, JO ĪPAŠI KĀPURIEM UN MAZUĻIEM. SLIMĪBAS ETHIOLOGIC IEROSINĀTĀJI IR BETANODAVIRUSES, KURIEM IR BISEGMENTED MONOCATENARY RNS GENOMS, KAS SASTĀV NO RNS1, KAS KODĒ VĪRUSU POLIMERĀZI, UN RNS2, KAS KODĒ CAPSIDE PROTEĪNU. TURKLĀT TIE SINTEZĒ SUBGENOMISKU RNS, RNS3, KAS KODĒ PROTEĪNUS B1 (ANTINEKROTISKO FAKTORU) UN B2 (VĪRUSU REPLIKĀCIJAS AIZSARDZĪBA PRET ŠŪNU TRAUCĒJOŠO RNS). BETANODAVIRUSES IEDALA 4 GENOTIPOS SASKAŅĀ AR RNA2 T4 SECĪBU: SJNNV, TPNNV, BFNNV UN RGNNV. TOMĒR PĒDĒJOS GADOS DIENVIDEIROPĀ IR DOKUMENTĒTA DABISKO REKOMBINANTU RG/SJ (RNA1 TIPS RGNNV UN RNA2 SJNNV) IZOLĀCIJA. VISIEM IZOLĒTAJIEM JŪRASMĒLES UN ZELTA REKOMBINANTIEM, KAS AUDZĒTI IBĒRIJAS PUSSALĀ, IR CAPSIDE PROTEĪNS AR 3 DAŽĀDIEM AMINOSKĀBJU STĀVOKĻIEM SALĪDZINĀJUMĀ AR SJNNV, 2 NO TIEM BEIGĀS C-TERMINĀLS, REĢIONS, KAS NOSAKA SAIMNIEKORGANISMA SPECIFIKU, KAS IR PIERĀDĪTS, KA TAM IR SVARĪGA LOMA VIRULENCE, UN VIENS N-TERMINĀLĀ REĢIONĀ. TURKLĀT ŠIE REKOMBINANTI, KAS ATRODAS POLIMERĀZI 19 DAŽĀDĀS AMIOACIDIC ATLIEKĀS ATTIECĪBĀ UZ RG TIPA CELMA POLIMERĀZI, UN ABU GENOMISKO SEGMENTU NEKODĒŠANAS REĢIONOS KOPĀ IR 4 NUKLEOTĪDI, KAS NEATBILST RGNNV (RNA1) UN SJNNV (RNA2) TIPA CELMIEM. VISĀM ŠĪM IZMAIŅĀM VAR BŪT LIELA NOZĪME VIRULENCES UN REPLIKĀCIJAS SPĒJAS NODROŠINĀŠANĀ. VIRULENCES DETERMINANTU UN REPLIKĀCIJAS SPĒJU (SAISTĪBĀ AR POLIMERĀZI AR ORF B1 UN B2) PĒTĪJUMS IR BŪTISKS, LAI IZPRASTU UN KONTROLĒTU SLIMĪBU, ASPEKTUS, KURIEM PIEVĒRSĪSIES USC PĒTNIECĪBAS GRUPA. BET IR LABI ZINĀMS, KA SLIMĪBAS ATTĪSTĪBA NAV ATKARĪGA TIKAI NO PATOGĒNA, KO NOSAKA VĪRUSA UN UZŅĒMĒJAS MIJIEDARBĪBA. UZŅĒMĒJA IETEKME IR BALSTĪTA UZ IMŪNSISTĒMAS STIMULĀCIJAS, KO RAKSTUROS UMA PĒTNIECĪBAS KOMANDA. VĪRUSA INFEKCIJA INDUCĒ GAN IEDZIMTĀS IMŪNSISTĒMAS, GAN ADAPTĪVĀS IMŪNSISTĒMAS AKTIVĀCIJU. VEICAMIE PĒTĪJUMI PAR IMŪNSISTĒMAS AKTIVĀCIJU IETVER MASVEIDA TRANSKRIPTOMIKAS SEKVENCĒŠANAS (RNS-SEQ) VEIKŠANU, REAĢĒJOT UZ DAŽĀDU VIRULENCES VĪRUSU INFEKCIJĀM. Šī STUDY ģenerēs VALIOSISIM INFORMĀCIJA par imūngēniem, kas iesaistīti DEFENSA ANTIVIRIC RUTS, LAIKS, kas ļaus izstrādāt OPENARRAYS BASED PCR REAL TIME ar TaqMan SOUNDS izmantot, lai pētītu ĢENICĀLĀS IZDEVUMIEM, IMMUNE SYSTEM OF LENGUAING SYSTEM RESPONSE TO IETEIKUMS VIRUS, OBTAINED BY genetical inversa, AR VIRULENCE DISSTEM GROUND UN replicative CAPACITY._x000D_ Uzmanību šai hipotēzei, PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT ir analizēt aģentus, kas iesaistīti Betanodavirus replikācijas spējā, un tā saistību ar saimnieka tūlītējo atbildi. (Latvian)
    4 August 2022
    0 references
    IS GALAR É NECRÓIS NÉARÓG VÍREASACH (NNV) A THÉANN I BHFEIDHM AR ÉAGSÚLACHT NA N-IASC AR FUD AN DOMHAIN, RUD A FHÁGANN RÁTAÍ MORTLAÍOCHTA ARDA, GO HÁIRITHE I LARBHAÍ AGUS IN ÓGÁNAIGH. IS IAD NA GNÍOMHAIRÍ ETHIOLOGIC AN GHALAIR BETANODAVIRUSES, A BHFUIL GENOME MONOCATENARY BISEGMENTED COMHDHÉANTA DE RNA1, A IONCHÓDAÍONN POLYMERASE VÍREASACH, AGUS RNA2, A IONCHÓDAÍONN AN PRÓITÉIN CAPSIDE. INA THEANNTA SIN, SINTÉISÍONN SIAD RNA SUBGENOMIC, RNA3, A IONCHÓDAÍONN PRÓITÉINÍ B1 (FACHTÓIR FRITH-NECROTIC) AGUS B2 (COSAINT MHACASAMHLÚ VÍREASACH I GCOINNE CUR ISTEACH CEALLACH RNA). AICMÍTEAR BETANODAVIRUSES I 4 GHÉINITÍOPA DE RÉIR SHEICHEAMH T4 RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV AGUS RGNNV. MAR SIN FÉIN, LE BLIANTA BEAGA ANUAS TÁ AONRÚ NA N-ATHCHUINGNEOIRÍ NÁDÚRTHA RG/SJ (RNA1 CINEÁL RGNNV AGUS RNA2 SJNNV) DOICIMÉADAITHE I NDEISCEART NA HEORPA. TÁ GACH RECOMBINANTS SCOITE AONAIR AGUS ÓR TAR ÉIS FÁS I LEITHINIS NA HIBÉIRE PRÓITÉIN CAPSIDE LE 3 POIST AMINOACIDIC ÉAGSÚLA I GCOMPARÁID LEIS SIN DE SJNNV, 2 ACU AG AN DEIREADH C-CRÍOCHFORT, RÉIGIÚN A CHINNEADH SAINIÚLACHT ÓSTACH, ATÁ LÉIRITHE A IMIRT RÓL TÁBHACHTACH I NIMHNEACHT, AGUS CEANN AMHÁIN SA RÉIGIÚN N-CRÍOCHFORT. INA THEANNTA SIN, TÁ NA HATHCHUINGLEÁIN SIN I BPOLAIMÉARÁIS 19 IARMHAR AMIOACIDIC ÉAGSÚLA I NDÁIL LE POLAIMÉARÁIS DEN TRÉITHCHINEÁL DE CHINEÁL RG AGUS I RÉIGIÚIN NEAMHCHÓDAITHE AN DÁ DHEIGHLEOG GHÉANÓMAÍOCHA SAN IOMLÁN 4 NÚICLÉITÍDÍ NACH BHFUIL AG TEACHT LEIS NA TRÉITHCHINEÁLACHA DE CHINEÁL RGNNV (RNA1) AGUS SJNNV (RNA2). D’FHÉADFADH RÓL TÁBHACHTACH A BHEITH AG NA HATHRUITHE SIN GO LÉIR SA NIMHNEACHT AGUS SA CHUMAS MACASAMHLAITHEACH. TÁ AN STAIDÉAR AR DHEITÉARMANAINT NIMHNEACHTA AGUS CUMAS MACASAMHLAITHEACH (A BHAINEANN LE POLAIMÉIRIÚ LE ORF B1 AGUS B2) RÍTHÁBHACHTACH CHUN AN GALAR A THUISCINT AGUS A RIALÚ, GNÉITHE A DTABHARFAIDH FOIREANN TAIGHDE MSU AGHAIDH ORTHU. ACH TÁ SÉ AR EOLAS GO MAITH NACH MBRAITHEANN FORBAIRT AN GHALAIR ACH AR AN BPATAIGIN, AGUS É Á CHINNEADH AG IDIRGHNÍOMHAÍOCHT VÍREAS-ÓSTACH. TÁ IMPLEACHT AN ÓSTAIGH BUNAITHE AR SPREAGADH AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA, A MBEIDH FOIREANN TAIGHDE AN UMA MAR SHAINTRÉITH ACU. SPREAGANN IONFHABHTÚ VIRIC GNÍOMHACHTÚ AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA DHÚCHASAIGH AGUS AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA OIRIÚNAITHEACH ARAON. ÁIRÍTEAR AR NA STAIDÉIR AR GHNÍOMHACHTÚ AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA ATÁ LE DÉANAMH SEICHEAMHÚ OLLMHÓR TRAS-SCRÍBHINNE (RNA-SEQ) A DHÉANAMH MAR FHREAGAIRT AR IONFHABHTUITHE VÍREAS A BHFUIL NIMHNEACHT ÉAGSÚIL ACU DON SÓL. Ginfidh an STUD seo faisnéis VALIOSISIM maidir le himdhíoniginí a chuirtear i bhfeidhm i ruts ANTIVIRIC DEFENSA, AN TIME a cheadóidh dearadh OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME LE SOUNDS TaqMan le húsáid chun staidéar a dhéanamh, TÁBHÁIL GINEARÁLTA GINEARÁLTA, maidir le CÓRAS IMMUNE LENGUAING LINK LECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED BY GENETICAL inversa, Le GROUND Dystem of virulence and replicative CAPACITY._x000D_ aird a thabhairt ar an hipitéis seo, is é an PRINCIPAL OBJECTIVE an PROJECT PRESENT anailís a dhéanamh ar na gníomhairí a bhfuil baint acu le cumas macasamhlaithe Betanodavirus agus a ghaol le freagra láithreach an óstaigh. (Irish)
    4 August 2022
    0 references
    VIRUSNA NEKROZA ŽIVCEV (NNV) JE BOLEZEN, KI PRIZADENE RAZLIČNE RIBE PO VSEM SVETU IN POVZROČA VISOKO STOPNJO UMRLJIVOSTI, ZLASTI PRI LIČINKAH IN MLADIČIH. ETHIOLOGIC AGENTI BOLEZNI SO BETANODAVIRUSES, KI IMAJO BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SESTAVLJEN IZ RNA1, KI KODIRA VIRUSNO POLIMERAZO, IN RNA2, KI KODIRA BELJAKOVINO CAPSIDE. POLEG TEGA SINTETIZIRAJO SUBGENOMSKO RNK, RNA3, KI KODIRA BELJAKOVINE B1 (ANTINEKROTIČNI FAKTOR) IN B2 (ZAŠČITA REPLIKACIJE VIRUSOV PRED CELIČNO MOTEČE RNK). BETANODAVIRUSES SE RAZVRSTIJO V 4 GENOTIPE V SKLADU Z ZAPOREDJEM T4 RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV IN RGNNV. VENDAR JE BILA V ZADNJIH LETIH V JUŽNI EVROPI DOKUMENTIRANA IZOLACIJA NARAVNIH REKOMBINANTOV RG/SJ (RNA1 TIPA RGNNV IN RNA2 SJNNV). VSE IZOLIRANE REKOMBINANTE MORSKEGA LISTA IN ZLATA, KI SE GOJIJO NA IBERSKEM POLOTOKU, IMAJO BELJAKOVINO CAPSIDE S 3 RAZLIČNIMI AMINOKISLINSKIMI POLOŽAJI V PRIMERJAVI S SJNNV, 2 OD NJIH NA KONCU C-TERMINAL, REGIJA, KI DOLOČA SPECIFIČNOST GOSTITELJA, KI SE JE IZKAZALA ZA POMEMBNO VLOGO PRI VIRULENCI, IN ENA V REGIJI N-TERMINAL. POLEG TEGA SO TI REKOMBINANTI V POLIMERAZI 19 RAZLIČNI OSTANKI AMIOACIDIC GLEDE NA POLIMERAZO SEVA TIPA RG IN V NEKODIRNIH DELIH OBEH GENOMSKIH SEGMENTOV SKUPAJ 4 NUKLEOTIDI, KI SE NE UJEMAJO S SEVOMA TIPA RGNNV (RNA1) IN SJNNV (RNA2). VSE TE SPREMEMBE IMAJO LAHKO POMEMBNO VLOGO PRI VIRULENCI IN REPLIKACIJSKI SPOSOBNOSTI. ŠTUDIJA DETERMINANT VIRULENCE IN REPLIKACIJSKE SPOSOBNOSTI (POVEZANA S POLIMERAZO Z ORF B1 IN B2) JE BISTVENA ZA RAZUMEVANJE IN OBVLADOVANJE BOLEZNI, VIDIKOV, KI JIH BO OBRAVNAVALA RAZISKOVALNA SKUPINA USC. VENDAR JE DOBRO ZNANO, DA RAZVOJ BOLEZNI NI ODVISEN LE OD PATOGENA, KI GA DOLOČA INTERAKCIJA MED VIRUSOM IN GOSTITELJEM. POSLEDICE GOSTITELJA TEMELJIJO NA STIMULACIJI IMUNSKEGA SISTEMA, ZA KATEREGA BO ZNAČILNA RAZISKOVALNA SKUPINA UMA. OKUŽBA Z VIRUSOM VIRIC SPROŽI AKTIVIRANJE TAKO PRIROJENEGA IMUNSKEGA SISTEMA KOT TUDI PRILAGODLJIVEGA IMUNSKEGA SISTEMA. ŠTUDIJE O AKTIVACIJI IMUNSKEGA SISTEMA, KI JIH JE TREBA IZVESTI, VKLJUČUJEJO IZVAJANJE MASIVNEGA TRANSKRIPTOMSKEGA SEKVENCIRANJA (RNA-SEQ) KOT ODZIV NA VIRUSNE OKUŽBE Z RAZLIČNO VIRULENCO ZA PODPLAT. Ta STUDIJA bo ustvarila VALIOSISIM INFORMACIJA O imunogenih genih, vključenih v ANTIVIRIC RUTS DEFENSA, TIME, ki bo omogočal oblikovanje OPENARRAYS, ki se uporabljajo v PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS, za preučevanje, RESPONSE OF IMMUNE OF LENGUAING LINK TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED Z genetsko inverzijo, Z DYSTEM GROUND VIRULENCE IN replikativno CAPACITY._x000D_ Pozor na to hipotezo, PRINCIPAL OBJECTIVE PRESENTNEGA PROJEKTA je analizirati sredstva, ki sodelujejo v replikativni zmogljivosti Betanodavirusa in njegovo povezavo s takojšnjim odgovorom gostitelja. (Slovenian)
    4 August 2022
    0 references
    ВИРУСНАТА НЕКРОЗА (NNV) Е ЗАБОЛЯВАНЕ, КОЕТО ЗАСЯГА РАЗЛИЧНИ РИБИ В СВЕТОВЕН МАЩАБ, ПРИЧИНЯВАЙКИ ВИСОКА СМЪРТНОСТ, ОСОБЕНО ПРИ ЛАРВИТЕ И МЛАДИТЕ ЕКЗЕМПЛЯРИ. ETHIOLOGIC АГЕНТИТЕ НА ЗАБОЛЯВАНЕТО СА BETANODAVIRUSES, КОИТО ИМАТ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA ГЕНОМ, СЪСТАВЕН ОТ РНК1, КОЙТО КОДИРА ВИРУСНАТА ПОЛИМЕРАЗА, И РНК2, КОЙТО КОДИРА ПРОТЕИНА CAPSIDE. ОСВЕН ТОВА ТЕ СИНТЕЗИРАТ СУБГЕНОМНА РНК, РНК3, КОЯТО КОДИРА ПРОТЕИНИ В1 (АНТИНЕКРОТИЧЕН ФАКТОР) И В2 (ЗАЩИТА НА ВИРУСНАТА РЕПЛИКАЦИЯ СРЕЩУ КЛЕТЪЧНА ИНТЕРФЕРИРАЩА РНК). BETANODAVIRUSES СЕ КЛАСИФИЦИРАТ В 4 ГЕНОТИПА В СЪОТВЕТСТВИЕ С ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА T4 НА РНК2: SJNNV, TPNNV, BFNNV И RGNNV. ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ ГОДИНИ ОБАЧЕ ИЗОЛИРАНЕТО НА ЕСТЕСТВЕНИ РЕКОМБИНАНТИ RG/SJ (RNA1 ТИП RGNNV И RNA2 SJNNV) Е ДОКУМЕНТИРАНО В ЮЖНА ЕВРОПА. ВСИЧКИ ИЗОЛИРАНИ РЕКОМБИНАНТИ НА МОРСКИ ЕЗИК И ЗЛАТО, ОТГЛЕЖДАНИ НА ИБЕРИЙСКИЯ ПОЛУОСТРОВ, ИМАТ ПРОТЕИН CAPSIDE С 3 РАЗЛИЧНИ АМИНОАЦИДНИ ПОЗИЦИИ В СРАВНЕНИЕ С ТЕЗИ НА SJNNV, 2 ОТ ТЯХ В КРАЯ НА C-ТЕРМИНАЛА, РЕГИОН, ОПРЕДЕЛЯЩ СПЕЦИФИЧНОСТТА НА ГОСТОПРИЕМНИКА, ЗА КОЙТО Е ДОКАЗАНО, ЧЕ ИГРАЕ ВАЖНА РОЛЯ ВЪВ ВИРУЛЕНТНОСТТА, И ЕДИН В РЕГИОНА НА N-ТЕРМИНАЛА. ОСВЕН ТОВА ТЕЗИ РЕКОМБИНАНТИ ПРИСЪСТВАТ В ПОЛИМЕРАЗА 19 РАЗЛИЧНИ ОСТАТЪЦИ ОТ AMIOACIDIC ПО ОТНОШЕНИЕ НА ПОЛИМЕРАЗАТА НА ЩАМА ТИП RG И В НЕКОДИРАЩИТЕ РЕГИОНИ НА ДВАТА ГЕНОМНИ СЕГМЕНТА ОБЩО 4 НУКЛЕОТИДА, КОИТО НЕ СЪОТВЕТСТВАТ НА ЩАМОВЕТЕ ОТ ТИПА RGNNV (RNA1) И SJNNV (RNA2). ВСИЧКИ ТЕЗИ ПРОМЕНИ МОГАТ ДА ИГРАЯТ ВАЖНА РОЛЯ ВЪВ ВИРУЛЕНТНОСТТА И КАПАЦИТЕТА ЗА ВЪЗПРОИЗВЕЖДАНЕ. ПРОУЧВАНЕТО НА ДЕТЕРМИНАНТИТЕ НА ВИРУЛЕНТНОСТТА И КАПАЦИТЕТА ЗА ВЪЗПРОИЗВЕЖДАНЕ (СВЪРЗАНИ С ПОЛИМЕРАЗАТА С ORF B1 И B2) Е ОТ ОСНОВНО ЗНАЧЕНИЕ ЗА РАЗБИРАНЕТО И КОНТРОЛИРАНЕТО НА ЗАБОЛЯВАНЕТО — АСПЕКТИ, КОИТО ЩЕ БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ ОТ ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИЯ ЕКИП НА USC. НО Е ДОБРЕ ИЗВЕСТНО, ЧЕ РАЗВИТИЕТО НА БОЛЕСТТА НЕ ЗАВИСИ САМО ОТ ПАТОГЕНА, КОЙТО СЕ ОПРЕДЕЛЯ ОТ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ВИРУС-ГОСТОПРИЕМНИК. ВЛИЯНИЕТО НА ГОСТОПРИЕМНИКА СЕ ОСНОВАВА НА СТИМУЛИРАНЕТО НА ИМУННАТА СИСТЕМА, КОЯТО ЩЕ СЕ ХАРАКТЕРИЗИРА С ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИЯ ЕКИП НА УМА. ВИРУСНАТА ИНФЕКЦИЯ ИНДУЦИРА АКТИВИРАНЕТО КАКТО НА ВРОДЕНАТА ИМУННА СИСТЕМА, ТАКА И НА АДАПТИВНАТА ИМУННА СИСТЕМА. ПРОУЧВАНИЯТА ЗА АКТИВИРАНЕ НА ИМУННАТА СИСТЕМА, КОИТО ТРЯБВА ДА СЕ ИЗВЪРШАТ, ВКЛЮЧВАТ ИЗВЪРШВАНЕ НА МАСИВНА ТРАНСКРИПТОМНА СЕКВЕНЦИЯ (РНК-SEQ) В ОТГОВОР НА ВИРУСНИ ИНФЕКЦИИ С РАЗЛИЧНА ВИРУЛЕНТНОСТ ЗА МОРСКИ ЕЗИК. Тази статия ще генерира VALIOSISIM ИНФОРМАЦИОННА ИНФОРМАЦИЯ относно имуногените, замесени в ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME, които ще позволят да се използва дизайнът на ОТВЪРЖДАВИТЕЛНИ ИНФОРМАЦИИ В PCR REAL TIME с TaqMan SOUNDS да се използва за изследване, НИВО НА ГЕНИКАЛНИТЕ ЕКСПОНДИЦИИ, РЕЗОПОНЪТ НА СИСТЕМА НА МИМОНАТА НА ЛЕНГУАНАТА ЛИНК ЗА ПРЕПОРЪЧАНЕ НА ВИРУС, Обект на генетична инверса, С дистема на ВИПУЛЕНЦИЯ И репликативна Капацит._x000D_ Внимание към тази хипотеза, PRINCIPAL OBJECTIVE НА ПРЕДСТАВИТЕЛНИЯ ПРОЕКТ е да се анализират агентите, участващи в репликативния капацитет на бетанодавируса и връзката му с непосредствения отговор на домакина. (Bulgarian)
    4 August 2022
    0 references
    IN-NEKROŻI TAN-NERVITURI VIRALI (NNV) HIJA MARDA LI TAFFETTWA VARJETÀ TA’ ĦUT MADWAR ID-DINJA, LI TIKKAWŻA RATI GĦOLJIN TA’ MORTALITÀ, SPEĊJALMENT FIL-LARVI U Ż-ŻGĦAR. L-AĠENTI ETHIOLOGIC TAL-MARDA HUMA BETANODAVIRUSES, LI GĦANDHOM ĠENOMA BISEGMENTED MONOCATENARY RNA KOMPOST MINN RNA1, LI JIKKODIFIKA L-POLYMERASE VIRALI, U RNA2, LI JIKKODIFIKA L-PROTEINA CAPSIDE. BARRA MINN HEKK, HUMA JISSINTETIZZAW RNA SUBĠENOMIKA, RNA3, LI TIKKODIFIKA L-PROTEINI B1 (FATTUR ANTINEKROTIKU) U B2 (PROTEZZJONI TAR-REPLIKAZZJONI VIRALI KONTRA L-RNA LI JINTERFERIXXI FIĊ-ĊELLULI). BETANODAVIRUSES HUMA KKLASSIFIKATI F’4 ĠENOTIPI SKONT IS-SEKWENZA T4 TA’ RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV U RGNNV. MADANKOLLU, F’DAWN L-AĦĦAR SNIN L-IŻOLAMENT TAR-RIKOMBINANTI NATURALI RG/SJ (RNA1 TIP RGNNV U RNA2 SJNNV) ĠIE DDOKUMENTAT FIN-NOFSINHAR TAL-EWROPA. IR-RIKOMBINANTI IŻOLATI KOLLHA TAL-LINGWATA U TAD-DEHEB IMKABBRA FIL-PENIŻOLA IBERIKA GĦANDHOM PROTEINA CAPSIDE BI 3 POŻIZZJONIJIET AMMINAĊIDIĊI DIFFERENTI META MQABBLA MA’ DIK TA’ SJNNV, 2 MINNHOM FL-AĦĦAR C-TERMINAL, IR-REĠJUN LI JIDDETERMINA L-ISPEĊIFIĊITÀ OSPITANTI, LI NTWERA LI GĦANDU RWOL IMPORTANTI FIL-VIRULENZA, U WIEĦED FIR-REĠJUN N-TERMINAL. BARRA MINN HEKK, DAWN IR-RIKOMBINANTI PREŻENTI FIL-POLIMERAŻI 19 RESIDWI DIFFERENTI TA’ AMIOACIDIC FIR-RIGWARD TAL-POLIMERAŻI TAR-RAZZA TAT-TIP RG U FIR-REĠJUNI MHUX IKKODIFIKATI TAŻ-ŻEWĠ SEGMENTI ĠENOMIĊI, TOTAL TA’ 4 NUKLEOTIDI LI MA JAQBLUX MAR-RAZEZ TAT-TIP RGNNV (RNA1) U SJNNV (RNA2). DAWN IL-BIDLIET KOLLHA JISTA’ JKOLLHOM RWOL IMPORTANTI FIL-KAPAĊITÀ TA’ VIRULENZA U REPLIKAZZJONI. L-ISTUDJU TAD-DETERMINANTI TAL-VIRULENZA U L-KAPAĊITÀ REPLIKATTIVA (RELATATI MAL-POLIMERAŻI BL-ORF B1 U B2) HUMA FUNDAMENTALI GĦALL-FEHIM U L-KONTROLL TAL-MARDA, ASPETTI LI SE JIĠU INDIRIZZATI MIT-TIM TA’ RIĊERKA TAL-USC. IŻDA HUWA MAGĦRUF SEW LI L-IŻVILUPP TAL-MARDA MA JIDDEPENDIX BISS FUQ IL-PATOĠENU, LI JIĠI DETERMINAT MILL-INTERAZZJONI TAL-VIRUS-HOST. L-IMPLIKAZZJONI TAL-OSPITANT HIJA BBAŻATA FUQ L-ISTIMULAZZJONI TAS-SISTEMA IMMUNITARJA, LI SE TKUN IKKARATTERIZZATA MIT-TIM TA ‘RIĊERKA TAL-UMA. L-INFEZZJONI VIRIC TINDUĊI L-ATTIVAZZJONI KEMM TAS-SISTEMA IMMUNITARJA INNATA KIF UKOLL TAS-SISTEMA IMMUNITARJA ADATTIVA. STUDJI DWAR L-ATTIVAZZJONI TAS-SISTEMA IMMUNITARJA LI GĦANDHA TITWETTAQ JINKLUDU T-TWETTIQ TA’ SEKWENZJAR TRASKRITOMIKU MASSIV (RNA-SEQ) B’RISPONS GĦAL INFEZZJONIJIET VIRALI TA’ VIRULENZA DIFFERENTI GĦAL-LINGWATA. Din l-ISTUDJA se tiġġenera INFORMAZZJONI VALIOSISIM DWAR l-immunoġeni implikati fir-RUTS ANTIVIĊI TA’ DEFENSA, IL-ĦIN li se jippermetti d-disinn ta’ l-OPENARRAYS BASED F’TIEM REAL TAL-PCR li għandu jintuża għall-istudju, LEVEL TA’ NEFQA ĠENIKALI, RISPONZJONI TA’ L-IMUNEZZJONI TA’ LINK LENGWALI GĦAL RAKKOMANDAZZJONI, OBTAINED BY ġenetika inversa, BIL-GROUND DYSTEM TAL-VIRULENZA U CAPACITY replikattiv._x000D_ Attenzjoni għal din l-ipoteżi, l-OBJETTIVA PRINĊIPALI TAL-PROJETTIVA PRESENTI hija li tanalizza l-aġenti involuti fil-kapaċità replikattiva tal-Betanodavirus u r-relazzjoni tagħha mat-tweġiba immedjata tal-ospitant. (Maltese)
    4 August 2022
    0 references
    A neurose nervosa viral (NNV) é uma doença que afeta uma variedade de peixes em todo o mundo, causando altas taxas de mortalidade, especialmente em larvas e juvenis. Os agentes etiológicos da doença são os betanodaviroses, que têm um genoma de ARN MONOCATENÁRIO BISEGMENTADO composto de ARN1, que codifica a polimerização viral, e o ARN2, que codifica a proteína cápside. Além disso, sintetizam um ARN subgenómico, o ARN3, que codifica as proteínas B1 (fator anti-necrótico) e B2 (proteção da replicação viral contra o ARN de interferência celular). CLASSIFICAM-SE OS BETANODAVÍRIOS EM 4 GENÓTIPOS DE ACORDO COM A SEQUÊNCIA T4 DO ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV E RGNNV. No entanto, em anos recentes, a ISOLAÇÃO DE RECOMBINANTES NATURAIS RG/SJ (Tipo de ARN1 RGNNV e ARN2 SJNNV) foi DOCUMENTADA na Europa do Sul. Todos os recombinantes isolados de só e de ouro cultivados na pENÍNSULA IBERIA têm uma proteína cápside com 3 posições aminoacídicas diferentes em comparação com a de SJNNV, 2 delas no final do C-terminal, região que determina a especificidade do hospedeiro, que foi mostrado para jogar um papel importante em virulência, e uma na região N-terminal. Além disso, estes recombinantes estão presentes na polimerização 19 diferentes resíduos amioacídicos no que diz respeito à polimerização da estirpe do tipo RG e nas regiões não codificantes de ambos os segmentos genéticos um total de 4 nucleótidos que não correspondem às estirpes do tipo RGNNV (RNA1) e SJNNV (RNA2). Todas estas mudanças podem desempenhar um papel importante na violência e na capacidade de resposta. O ESTUDO DOS DETERMINANTES DE VIRULÊNCIA E DA CAPACIDADE REPLICATIVA (RELACIONADA COM A POLIMERASE COM ORF B1 E B2) É FUNDAMENTAL PARA A COMPREENSÃO E CONTROLO DA DOENÇA, ASPECTOS QUE SERÃO RESPONSÁVEIS PELA EQUIPA DE INVESTIGAÇÃO DO UTILIZADOR. Mas é bem sabido que o desenvolvimento da doença não depende apenas do patogéneo, sendo determinado pela interacção com o vírus. A implantação do hospedeiro baseia-se na estabilização do sistema de imunização, que será caracterizado pela equipa de investigação da UMA. A INFEÇÃO VIRICA INDUZ A ATIVAÇÃO DO SISTEMA INNATE IMMUNE E DO SISTEMA ADAPTIVE IMMUNE. ESTUDOS SOBRE A ATIVAÇÃO DO SISTEMA DE IMUNAS A REALIZAR INCLUINDO A REALIZAÇÃO DE UMA SEQUÊNCIA TRANSCRIPTÓMICA MASSIVA (RNA-SEQ) EM RESPOSTA A INFEÇÕES VÍRUS DE DIFERENTES VIRULÊNCIAS POR SOLA. Este ESTUDO irá gerar uma INFORMAÇÃO VALIOSÍSIMA SOBRE Imunogénios IMPLICADOS EM RUAS ANTIVIÁRIAS DE DEFENSA, O TEMPO que permitirá o desenho de OPENARRAYS BASEADOS EM PCR TEMPO REAL COM SOMES TaqMan a serem utilizados para o estudo, um NÍVEL DE DESPESAS GENICAS, A RESPOSTA DO SISTEMA IMUNO DE LÍNGUA LIGADA A VÍRUS RECOMENDANTE, OBTIDO PELA INVERSA GENETICA, COM UM SISTEMA FUNDADO DE VIRULÊNCIA E CAPACIDADE REPLICATIVA._x000D_ Atenção a esta hipótese, o OBJETIVO PRINCIPAL DO PRESENTE PROJETO é analisar os agentes envolvidos na capacidade replicativa do Betanodavírus e a sua relação com a resposta imediata do hospedeiro. (Portuguese)
    4 August 2022
    0 references
    VIRAL NERVENEKROSE (NNV) ER EN SYGDOM, DER PÅVIRKER EN RÆKKE FISK VERDEN OVER, HVILKET FORÅRSAGER HØJ DØDELIGHED, ISÆR HOS LARVER OG UNGE. DE ETHIOLOGIC-AGENSER AF SYGDOMMEN ER BETANODAVIRUSES, SOM HAR ET BISEGMENTED MONOCATENARY-GENOM, DER BESTÅR AF RNA1, SOM INDKODER VIRAL POLYMERASE, OG RNA2, SOM INDKODER CAPSIDE-PROTEINET. DERUDOVER SYNTETISERER DE EN SUBGENOMISK RNA, RNA3, SOM INDKODER PROTEINERNE B1 (ANTINEKROTISK FAKTOR) OG B2 (BESKYTTELSE AF VIRAL REPLIKATION MOD CELLEINTERFERERENDE RNA). BETANODAVIRUSES KLASSIFICERES I 4 GENOTYPER EFTER T4-SEKVENSEN AF RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV OG RGNNV. I DE SENERE ÅR ER ISOLERINGEN AF NATURLIGE REKOMBINANTER RG/SJ (RNA1-TYPE RGNNV OG RNA2 SJNNV) IMIDLERTID BLEVET DOKUMENTERET I SYDEUROPA. ALLE ISOLEREDE REKOMBINANTER AF TUNGE OG GULD DYRKET PÅ DEN IBERISKE HALVØ HAR ET CAPSIDE-PROTEIN MED 3 FORSKELLIGE AMINOACIDISKE POSITIONER SAMMENLIGNET MED SJNNV'S, 2 AF DEM I SLUTNINGEN C-TERMINAL, REGION, DER BESTEMMER VÆRTSSPECIFICITET, SOM HAR VIST SIG AT SPILLE EN VIGTIG ROLLE I VIRULENS, OG EN I N-TERMINAL-REGIONEN. DESUDEN ER DISSE REKOMBINANTER TIL STEDE I POLYMERASE 19 FORSKELLIGE AMIOACIDIC-RESTER MED HENSYN TIL POLYMERASE AF RG-STAMMEN OG I DE IKKE-KODENDE REGIONER I BEGGE GENOMSEGMENTER I ALT 4 NUKLEOTIDER, DER IKKE SVARER TIL RGNNV (RNA1)- OG SJNNV (RNA2)-TYPEN. ALLE DISSE ÆNDRINGER KAN SPILLE EN VIGTIG ROLLE FOR VIRULENS OG REPLIKATORISK KAPACITET. UNDERSØGELSEN AF VIRULENSDETERMINANTER OG REPLIKATIV KAPACITET (RELATERET TIL POLYMERASE MED ORF B1 OG B2) ER AFGØRENDE FOR AT FORSTÅ OG KONTROLLERE SYGDOMMEN, SOM VIL BLIVE BEHANDLET AF USC'S FORSKNINGSTEAM. MEN DET ER VELKENDT, AT UDVIKLINGEN AF SYGDOMMEN IKKE KUN AFHÆNGER AF PATOGENET, BESTEMMES AF VIRUS-VÆRT INTERAKTION. IMPLIKATIONEN AF VÆRTEN ER BASERET PÅ STIMULERING AF IMMUNSYSTEMET, SOM VIL BLIVE KARAKTERISERET AF UMA'S FORSKERHOLD. DEN VIRIC INFEKTION INDUCERER AKTIVERING AF BÅDE DET MEDFØDTE IMMUNSYSTEM OG DET ADAPTIVE IMMUNSYSTEM. UNDERSØGELSER AF AKTIVERINGEN AF IMMUNSYSTEMET, DER SKAL UDFØRES, OMFATTER UDFØRELSE AF EN MASSIV TRANSSKRIPTOMISK SEKVENTERING (RNA-SEQ) SOM REAKTION PÅ VIRUSINFEKTIONER AF FORSKELLIG VIRULENS FOR SÅL. Denne STUDY vil generere en VALIOSISIM INFORMATION OM immungener impliceret i ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME, der vil gøre det muligt at designe OPENARRAYS BASED I PCR REAL TIME MED TaqMan SOUNDS, der skal anvendes til at studere, en LEVEL AF GENICAL EXPENDITURE, RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LENGUAING LINK TIL RECOMMENDANT VIRUS, OBTAINED DY genetisk inversa, MED DYSTEM GROUND OF VIRULENCE OG replikativ CAPACITY._x000D_ Opmærksomhed på denne hypotese, er PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJEKT at analysere de agenter, der er involveret i den replikative kapacitet af Betanodavirus og dets forhold til værtens umiddelbare svar. (Danish)
    4 August 2022
    0 references
    NECROZA NERVOASĂ VIRALĂ (NNV) ESTE O BOALĂ CARE AFECTEAZĂ O VARIETATE DE PEȘTI DIN ÎNTREAGA LUME, PROVOCÂND RATE RIDICATE ALE MORTALITĂȚII, ÎN SPECIAL ÎN CAZUL LARVELOR ȘI AL PUIETULUI. AGENȚII ETHIOLOGIC AI BOLII SUNT BETANODAVIRUSES, CARE AU UN GENOM BISEGMENTAT MONOCATENARY COMPUS DIN ARN1, CARE CODIFICĂ POLIMERAZA VIRALĂ, ȘI ARN2, CARE CODIFICĂ PROTEINA CAPSIDE. ÎN PLUS, ACESTEA SINTETIZEAZĂ UN ARN SUBGENOMIC, ARN3, CARE CODIFICĂ PROTEINELE B1 (FACTOR ANTINECROTIC) ȘI B2 (PROTECȚIA REPLICĂRII VIRALE ÎMPOTRIVA ARN-ULUI CARE INTERFEREAZĂ CELULAR). BETANODAVIRUSES SUNT CLASIFICATE ÎN 4 GENOTIPURI ÎN CONFORMITATE CU SECVENȚA T4 A ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV ȘI RGNNV. CU TOATE ACESTEA, ÎN ULTIMII ANI, IZOLAREA RECOMBINANȚILOR NATURALI RG/SJ (RNA1 TIP RGNNV ȘI RNA2 SJNNV) A FOST DOCUMENTATĂ ÎN SUDUL EUROPEI. TOATE RECOMBINANȚII IZOLAȚI DE LIMBĂ-DE-MARE ȘI AUR CULTIVAȚI ÎN PENINSULA IBERICĂ AU O PROTEINĂ CAPSIDE CU 3 POZIȚII AMINOACIDE DIFERITE FAȚĂ DE CEA A SJNNV, 2 DINTRE ELE LA TERMINALUL C FINAL, REGIUNE CARE DETERMINĂ SPECIFICITATEA GAZDĂ, CARE S-A DOVEDIT A JUCA UN ROL IMPORTANT ÎN VIRULENȚĂ, ȘI UNA ÎN REGIUNEA N-TERMINAL. ÎN PLUS, ACEȘTI RECOMBINANȚI PREZINTĂ ÎN POLIMERAZĂ 19 REZIDUURI AMIOACIDIC DIFERITE ÎN CEEA CE PRIVEȘTE POLIMERAZA TULPINEI DE TIP RG ȘI, ÎN REGIUNILE NECODANTE ALE AMBELOR SEGMENTE GENOMICE, UN TOTAL DE 4 NUCLEOTIDE CARE NU CORESPUND TULPINILOR DE TIP RGNNV (RNA1) ȘI SJNNV (RNA2). TOATE ACESTE SCHIMBĂRI POT JUCA UN ROL IMPORTANT ÎN VIRULENȚĂ ȘI CAPACITATEA DE REPLICARE. STUDIUL DETERMINANȚILOR VIRULENȚEI ȘI CAPACITĂȚII DE REPLICARE (LEGATE DE POLIMERAZĂ CU ORF B1 ȘI B2) ESTE FUNDAMENTAL PENTRU ÎNȚELEGEREA ȘI CONTROLUL BOLII, ASPECTE CARE VOR FI ABORDATE DE ECHIPA DE CERCETARE USC. DAR ESTE BINE CUNOSCUT FAPTUL CĂ DEZVOLTAREA BOLII NU DEPINDE NUMAI DE AGENTUL PATOGEN, FIIND DETERMINATĂ DE INTERACȚIUNEA VIRUS-GAZDĂ. IMPLICAREA GAZDEI SE BAZEAZĂ PE STIMULAREA SISTEMULUI IMUNITAR, CARE VA FI CARACTERIZATĂ DE ECHIPA DE CERCETARE A UMA. INFECȚIA CU VIRIC INDUCE ACTIVAREA ATÂT A SISTEMULUI IMUNITAR ÎNNĂSCUT, CÂT ȘI A SISTEMULUI IMUNITAR ADAPTIV. STUDIILE PRIVIND ACTIVAREA SISTEMULUI IMUNITAR CARE URMEAZĂ SĂ FIE EFECTUATE INCLUD EFECTUAREA UNEI SECVENȚE TRANSCRIMINICE MASIVE (ARN-SEQ) CA RĂSPUNS LA INFECȚIILE VIRALE CU VIRULENȚĂ DIFERITĂ PENTRU LIMBĂ-DE-MARE. Această STUDIE va genera o INFORMAȚII VALIOSISIMĂ privind imunogenii implicați în RUTurile ANTIVIRICE ale DEFENSA, TIMPUL care va permite proiectarea OPENARRAYS BASED ÎN TIMPUL REAL PCR cu sounele TaqMan care urmează să fie utilizate pentru a studia, o LEVEL DE EXPENDITURĂ GENICALĂ, REZONDAREA SISTEMULUI IUNUNĂRII LENUMULUI LINK LA VIRUSUL RECOMANDANT, OBTAINED BY genetic inversa, cu DYSTEM GROUND de VIRULENȚĂ ȘI CAPACITATE replicativă._x000D_ Atenție la această ipoteză, OBJECTIVE PRINCIPAL al PRINCIPAL PROJECT este de a analiza agenții implicați în capacitatea de replicare a Betanodavirus și relația sa cu răspunsul imediat al gazdei. (Romanian)
    4 August 2022
    0 references
    VIRAL NERVNEKROS (NNV) ÄR EN SJUKDOM SOM DRABBAR EN MÄNGD OLIKA FISKAR VÄRLDEN ÖVER OCH ORSAKAR HÖG DÖDLIGHET, SÄRSKILT HOS LARVER OCH UNGA EXEMPLAR. DE ETHIOLOGIC MEDEL AV SJUKDOMEN ÄR BETANODAVIRUSES, SOM HAR ETT BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SOM BESTÅR AV RNA1, SOM KODAR VIRAL POLYMERAS, OCH RNA2, SOM KODAR CAPSIDE PROTEIN. DESSUTOM SYNTETISERAR DE EN SUBGENOMISK RNA, RNA3, SOM KODAR PROTEINERNA B1 (ANTI-NEKROTISK FAKTOR) OCH B2 (SKYDD AV VIRUSREPLIKATION MOT CELLULÄR STÖRANDE RNA). BETANODAVIRUSES KLASSIFICERAS I 4 GENOTYPER ENLIGT T4-SEKVENSEN AV RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV OCH RGNNV. UNDER DE SENASTE ÅREN HAR DOCK ISOLERINGEN AV NATURLIGA REKOMBINANTER RG/SJ (RNA1 TYP RGNNV OCH RNA2 SJNNV) DOKUMENTERATS I SÖDRA EUROPA. ALLA ISOLERADE REKOMBINANTER AV SULA OCH GULD SOM ODLAS PÅ DEN IBERISKA HALVÖN HAR ETT CAPSIDE-PROTEIN MED 3 OLIKA AMINOSYRAPOSITIONER JÄMFÖRT MED SJNNV, VARAV TVÅ I SLUTET AV C-TERMINALEN, REGION SOM BESTÄMMER VÄRDSPECIFICITETEN, VILKET HAR VISAT SIG SPELA EN VIKTIG ROLL FÖR VIRULENS, OCH EN I N-TERMINALREGIONEN. DESSUTOM FÖREKOMMER DESSA REKOMBINANTER I POLYMERAS 19 OLIKA AMIOACIDIC-RESTER MED AVSEENDE PÅ POLYMERAS AV RG-TYP OCH I DE ICKE-KODANDE REGIONERNA I BÅDA GENOMSEGMENTEN TOTALT 4 NUKLEOTIDER SOM INTE MOTSVARAR STAMMARNA RGNNV (RNA1) OCH SJNNV (RNA2). ALLA DESSA FÖRÄNDRINGAR KAN SPELA EN VIKTIG ROLL FÖR VIRULENS OCH REPLIKERINGSFÖRMÅGA. STUDIEN AV VIRULENSDETERMINANTER OCH REPLIKATIONSFÖRMÅGA (RELATERAD TILL POLYMERAS MED ORF B1 OCH B2) ÄR GRUNDLÄGGANDE FÖR ATT FÖRSTÅ OCH KONTROLLERA SJUKDOMEN, ASPEKTER SOM KOMMER ATT BEHANDLAS AV USC:S FORSKARGRUPP. MEN DET ÄR VÄL KÄNT ATT UTVECKLINGEN AV SJUKDOMEN INTE BARA BEROR PÅ PATOGENEN, SOM BESTÄMS AV VIRUS-VÄRDINTERAKTION. IMPLIKATIONEN AV VÄRDEN BYGGER PÅ STIMULERING AV IMMUNSYSTEMET, SOM KOMMER ATT KARAKTERISERAS AV FORSKARGRUPPEN I UMA. VIRIC-INFEKTIONEN INDUCERAR AKTIVERING AV BÅDE DET MEDFÖDDA IMMUNSYSTEMET OCH DET ADAPTIVA IMMUNSYSTEMET. STUDIER PÅ AKTIVERING AV IMMUNSYSTEMET SOM SKA UTFÖRAS INKLUDERAR ATT UTFÖRA EN MASSIV TRANSKRIPTOMISK SEKVENSERING (RNA-SEQ) SOM SVAR PÅ VIRUSINFEKTIONER AV OLIKA VIRULENS MOT SULA. Denna STUDY kommer att generera en VALIOSISIM INFORMATION OM immunogener inblandade i ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, den tid som kommer att göra det möjligt att utforma OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME MED TaqMan SOUNDS att användas för att studera, en LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, REKOMMENDANT VIRUS, OBTAINED av genetisk inversa, MED DYSTEM GROUND AV VIRULEN OCH replikativ CAPACITY._x000D_ Uppmärksamhet till denna hypotes är att analysera de medel som är inblandade i Betanodaviruss replikationsförmåga och dess förhållande till värdens omedelbara svar. (Swedish)
    4 August 2022
    0 references
    Santiago de Compostela
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    AGL2014-54532-C2-2-R
    0 references