EARLY DETECTION OF ANTIBIOTIC AND ANTIFUNGAL RESISTANCE USING MASS SPECTROMETRY (MALDI-TOF MS) (Q3134854)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3134854 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EARLY DETECTION OF ANTIBIOTIC AND ANTIFUNGAL RESISTANCE USING MASS SPECTROMETRY (MALDI-TOF MS) |
Project Q3134854 in Spain |
Statements
23,685.75 Euro
0 references
43,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL GREGORIO MARAÑON
0 references
La tecnología MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorption ionization -time of flight mass spectrometry), basada en la espectrometría de masas (MS) se ha abierto camino en el laboratorio de microbiología en la última década gracias a su gran eficacia y precisión para identificar bacterias y levaduras frecuentes en muestras clínicas. Pero sus aplicaciones no terminan en la identificación de patógenos, sino que en los últimos años se ha demostrado que esta tecnología puede facilitar, por ejemplo, información sobre su sensibilidad antibiótica y antifúngica. El objetivo principal de este estudio es desarrollar un ensayo sencillo para determinar la sensibilidad de los microorganismos identificados a antibióticos y antifúngicos de uso más extendido, con el foco puesto en su aplicación a los microorganismos identificados directamente de hemocultivos. De esta manera, la tecnología MALDI-TOF MS permitiría obtener, en el mismo día en que se identifica el patógeno, su sensibilidad antibiótica/antifúngica, facilitando así el comienzo temprano de la terapia antimicrobiana específica. En este proyecto queremos determinar resistencias a antibióticos betalactámicos, carbapenems, meticilina y vancomicina, así como a rifampicina e isoniazida -utilizados en el control de la tuberculosis-, a los antifúngicos del grupo de las equinocandinas (caspofungina, anidulafungina y micafungina) y a otros antifúngicos clásicos como el fluconazol. La detección de resistencias se ensayará tanto incubando el patógeno en presencia del antibiótico/antifúngico ante el que se sospecha resistencia, como buscando cambios en el perfil de proteínas del microorganismo estudiado que nos permitan reconocer cepas resistentes. (Spanish)
0 references
The MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorption ionisation — time of flight mass spectrometry) technology, based on mass spectrometry (MS), has paved its way in the microbiology laboratory in the last decade thanks to its high efficiency and accuracy in identifying frequent bacteria and yeasts in clinical samples. But its applications do not end in the identification of pathogens, but in recent years it has been shown that this technology can provide, for example, information on their antibiotic and antifungal sensitivity. The main objective of this study is to develop a simple trial to determine the sensitivity of the microorganisms identified to antibiotics and antifungals of more widespread use, with the focus on their application to microorganisms directly identified from hemocultures. In this way, the MALDI-TOF MS technology would make it possible to obtain, on the same day the pathogen is identified, its antibiotic/antifungal sensitivity, thus facilitating the early onset of specific antimicrobial therapy. In this project we want to determine resistance to beta-lactamic antibiotics, carbapenems, methicillin and vancomycin, as well as to rifampicin and isoniazid -used in the tuberculosis control-, to antifungals of the equinocandine group (caspofungin, anidulafungin and mycafungin) and to other classical antifungals such as fluconazole. The detection of resistance will be tested both by incubating the pathogen in the presence of the antibiotic/antifungal to which resistance is suspected, and by looking for changes in the protein profile of the microorganism studied that allow us to recognise resistant strains. (English)
12 October 2021
0.7945021689368075
0 references
La technologie MALDI-TOF MS (ionisation par désorption laser assistée par Matrix — temps de spectrométrie de masse de vol), basée sur la spectrométrie de masse (MS), a ouvert son chemin dans le laboratoire de microbiologie au cours de la dernière décennie grâce à sa grande efficacité et précision dans l’identification des bactéries et levures fréquentes dans les échantillons cliniques. Mais ses applications ne se terminent pas par l’identification des agents pathogènes, mais au cours des dernières années, il a été démontré que cette technologie peut fournir, par exemple, des informations sur leur sensibilité antibiotique et antifongique. L’objectif principal de cette étude est de mettre au point un essai simple visant à déterminer la sensibilité des microorganismes identifiés aux antibiotiques et aux antifongiques d’une utilisation plus répandue, en mettant l’accent sur leur application à des microorganismes directement identifiés à partir d’hémocultures. De cette façon, la technologie MALDI-TOF MS permettrait d’obtenir, le jour même de l’identification de l’agent pathogène, sa sensibilité aux antibiotiques/antifongiques, facilitant ainsi l’apparition précoce d’une thérapie antimicrobienne spécifique. Dans ce projet, nous voulons déterminer la résistance aux antibiotiques bêta-lactamines, aux carbapénèmes, à la méthicilline et à la vancomycine, ainsi qu’à la rifampicine et à l’isoniazide — utilisés dans le contrôle de la tuberculose — aux antifongiques du groupe equinocandine (caspofungine, anidulafungine et mycafungine) et à d’autres antifongiques classiques comme le fluconazole. La détection de la résistance sera testée à la fois en incubatant l’agent pathogène en présence de l’antibiotique/antifungal auquel la résistance est suspectée, et en recherchant des changements dans le profil protéique du micro-organisme étudié qui nous permettent de reconnaître les souches résistantes. (French)
2 December 2021
0 references
Die MALDI-TOF MS (Matrix-unterstützte Laserdesorptionsionalisierung – Zeit der Flugmassenspektrometrie) auf Basis der Massenspektrometrie (MS) hat sich im Mikrobiologie-Labor in den letzten zehn Jahren dank seiner hohen Effizienz und Genauigkeit bei der Identifizierung von häufigen Bakterien und Hefen in klinischen Proben den Weg geebnet. Aber ihre Anwendungen enden nicht bei der Identifizierung von Krankheitserregern, aber in den letzten Jahren hat sich gezeigt, dass diese Technologie beispielsweise Informationen über ihre Antibiotika- und Antimykotika-Sensitivität liefern kann. Hauptziel dieser Studie ist es, eine einfache Studie zu entwickeln, um die Empfindlichkeit der Mikroorganismen zu ermitteln, die für Antibiotika und Antimykotika mit breiterer Verwendung identifiziert wurden, wobei der Schwerpunkt auf deren Anwendung auf Mikroorganismen liegt, die direkt aus der Hämokultur identifiziert wurden. Auf diese Weise würde die MALDI-TOF-MS-Technologie es ermöglichen, am selben Tag, an dem der Erreger identifiziert wird, seine antibiotische/antifungale Empfindlichkeit zu erhalten und so den frühzeitigen Beginn einer spezifischen antimikrobiellen Therapie zu erleichtern. In diesem Projekt wollen wir die Resistenz gegen beta-lactamische Antibiotika, Carbapenem, Methicillin und Vancomycin sowie gegen Rifampicin und Isoniazid -verwendet in der Tuberkulosebekämpfung -, gegen Antimykotika der Equinocandin-Gruppe (Capofungin, Anidulafungin und Mycafungin) und gegen andere klassische Antimykotika wie Fluconazol bestimmen. Der Nachweis der Resistenz wird sowohl durch die Inkubation des Erregers in Gegenwart des Antibiotikums/Antifungal, gegen das eine Resistenz vermutet wird, als auch durch die Suche nach Veränderungen im Proteinprofil des untersuchten Mikroorganismus getestet, die es uns ermöglichen, resistente Stämme zu erkennen. (German)
9 December 2021
0 references
De MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorptie ionisatie — tijd van vluchtmassaspectrometrie) technologie, gebaseerd op massaspectrometrie (MS), heeft zijn weg gebaand in het microbiologielaboratorium in het afgelopen decennium dankzij zijn hoge efficiëntie en nauwkeurigheid bij het identificeren van frequente bacteriën en gisten in klinische monsters. Maar de toepassingen ervan eindigen niet in de identificatie van ziekteverwekkers, maar in de afgelopen jaren is aangetoond dat deze technologie bijvoorbeeld informatie kan verschaffen over hun antibiotica en schimmelwerende gevoeligheid. Het belangrijkste doel van deze studie is het ontwikkelen van een eenvoudig onderzoek om de gevoeligheid te bepalen van de micro-organismen die geïdentificeerd zijn voor antibiotica en antischimmels met een wijdverbreid gebruik, waarbij de nadruk ligt op de toepassing ervan op micro-organismen die rechtstreeks uit hemoculturen worden geïdentificeerd. Op deze manier zou de MALDI-TOF MS-technologie het mogelijk maken om op dezelfde dag het ziekteverwekker te verkrijgen, zijn antibiotica/antifungale gevoeligheid, waardoor het vroegtijdig begin van specifieke antimicrobiële therapie wordt vergemakkelijkt. In dit project willen we de resistentie tegen bètalactamitische antibiotica, carbapenems, methicilline en vancomycine bepalen, evenals tegen rifampicine en isoniazide -gebruikt in de tuberculosebestrijding -, tegen schimmelwerende middelen van de equinocandinegroep (caspofungine, anidulafungine en mycafungine) en tegen andere klassieke schimmelwerende middelen zoals fluconazol. De detectie van resistentie zal worden getest door het pathogeen te incuberen in aanwezigheid van het antibioticum/antifungaal waartegen resistentie wordt vermoed, en door te zoeken naar veranderingen in het eiwitprofiel van het onderzochte micro-organisme die ons in staat stellen resistente stammen te herkennen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La tecnologia MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorbption ionisation — time of flight mass mass spectrometry), basata sulla spettrometria di massa (MS), ha aperto la sua strada nel laboratorio microbiologico nell'ultimo decennio grazie alla sua elevata efficienza e precisione nell'identificazione di batteri e lieviti frequenti nei campioni clinici. Ma le sue applicazioni non finiscono nell'identificazione degli agenti patogeni, ma negli ultimi anni è stato dimostrato che questa tecnologia può fornire, ad esempio, informazioni sulla loro sensibilità antibiotica e antimicotica. L'obiettivo principale di questo studio è quello di sviluppare una semplice sperimentazione per determinare la sensibilità dei microrganismi identificati agli antibiotici e agli antifungini di uso più diffuso, con particolare attenzione alla loro applicazione ai microrganismi direttamente identificati dalle emocolture. In questo modo, la tecnologia MALDI-TOF MS consentirebbe di ottenere, lo stesso giorno di identificazione dell'agente patogeno, la sua sensibilità antibiotica/antifungina, facilitando così l'inizio precoce della terapia antimicrobica specifica. In questo progetto vogliamo determinare la resistenza agli antibiotici beta-lattamici, carbapenemi, meticillina e vancomicina, nonché alla rifampicina e all'isooniazide -utilizzati nel controllo della tubercolosi-, agli antifungini del gruppo equinocandina (caspofungin, anidulafungin e mycafungin) e ad altri antifungini classici come il fluconazolo. Il rilevamento della resistenza sarà testato sia incubando l'agente patogeno in presenza dell'antimico/antimicotico a cui si sospetta la resistenza, sia cercando cambiamenti nel profilo proteico del microrganismo studiato che ci consentano di riconoscere ceppi resistenti. (Italian)
16 January 2022
0 references
MALDI-TOF MS (Matrixi abiga laserdesorptsiooni ionisatsioon – lennu massispektromeetria aeg) tehnoloogia, mis põhineb massispektromeetrial (MS), on sillutanud teed mikrobioloogialaboris viimase kümne aasta jooksul tänu oma suurele tõhususele ja täpsusele sagedaste bakterite ja pärmide tuvastamisel kliinilistes proovides. Kuid selle rakendused ei lõpe patogeenide tuvastamisega, kuid viimastel aastatel on tõestatud, et see tehnoloogia võib anda näiteks teavet nende antibiootikumide ja seenevastase tundlikkuse kohta. Selle uuringu peamine eesmärk on töötada välja lihtne uuring, et määrata kindlaks tuvastatud mikroorganismide tundlikkus antibiootikumide ja seenevastaste ainete suhtes, mida kasutatakse laiemalt, keskendudes nende kasutamisele otseselt hemokultuuridest identifitseeritud mikroorganismide suhtes. Sel viisil võimaldaks MALDI-TOF MS tehnoloogia saavutada samal päeval, kui patogeen identifitseeritakse, selle antibiootikumi-/seenevastase tundlikkuse, hõlbustades seega konkreetse antimikroobse ravi varajast algust. Selles projektis tahame kindlaks määrata resistentsuse beetalaktaamsete antibiootikumide, karbapeneemide, metitsilliini ja vankomütsiini suhtes, samuti tuberkuloosikontrollis kasutatava rifampitsiini ja isoniasiidi suhtes, equinocandiini rühma seenevastaste ravimite (kaspofungiin, anidulafungiin ja mükafungiin) ning teiste klassikaliste seenevastaste ravimite, näiteks flukonasooli suhtes. Resistentsuse tuvastamist testitakse nii patogeeni inkubeerimisega antibiootikumi/seenevastase aine juuresolekul, mille suhtes kahtlustatakse resistentsust, kui ka uuritava mikroorganismi valguprofiili muutuste otsimisega, mis võimaldavad meil resistentseid tüvesid ära tunda. (Estonian)
4 August 2022
0 references
MALDI-TOF MS (matrica paremta lazerio desorbcijos jonizacija – skrydžio masių spektrometrijos laikas) technologija, pagrįsta masių spektrometrija (MS), pastarąjį dešimtmetį nutiesė kelią mikrobiologijos laboratorijoje dėl didelio efektyvumo ir tikslumo nustatant dažnus bakterijas ir mieles klinikiniuose mėginiuose. Tačiau jos taikymas nesibaigia patogenų nustatymu, tačiau pastaraisiais metais buvo įrodyta, kad ši technologija gali suteikti, pavyzdžiui, informaciją apie jų antibiotikų ir priešgrybelinių jautrumą. Pagrindinis šio tyrimo tikslas – sukurti paprastą tyrimą, siekiant nustatyti plačiau naudojamų antibiotikų ir priešgrybelinių mikroorganizmų jautrumą, daugiausia dėmesio skiriant jų taikymui mikroorganizmams, tiesiogiai nustatytiems iš hemokultūrų. Tokiu būdu MALDI-TOF MS technologija leistų tą pačią dieną gauti patogeno jautrumą antibiotikams ir (arba) priešgrybeliniais preparatais, taip sudarant palankesnes sąlygas anksti pradėti specifinį antimikrobinį gydymą. Šiame projekte norime nustatyti atsparumą beta laktaminiams antibiotikams, karbapenemams, meticilinui ir vankomicinui, taip pat rifampicinui ir izoniazidui, kurie naudojami tuberkuliozės kontrolei, ekvinokandino grupės priešgrybeliams (kaspofunginui, anidulafunginui ir mikofunginui) ir kitiems klasikiniams priešgrybeliams, pvz., flukonazolui. Atsparumo nustatymas bus tiriamas tiek inkubuojant patogeną esant antibiotikui/priešgrybeliui, kuriam įtariamas atsparumas, tiek ieškant tiriamo mikroorganizmo baltymų profilio pokyčių, leidžiančių mums atpažinti atsparias padermes. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
MALDI-TOF MS (Matrix-Asisted laser desorption ionisation – time of flight mass spectrometry) tehnologija, temeljena na masenoj spektrometriji (MS), utrla je put u mikrobiološkom laboratoriju u posljednjem desetljeću zahvaljujući visokoj učinkovitosti i točnosti u prepoznavanju čestih bakterija i kvasaca u kliničkim uzorcima. No, njegove primjene ne završavaju u identifikaciji patogena, ali posljednjih godina pokazalo se da ova tehnologija može pružiti, na primjer, informacije o njihovim antibioticima i antifungalnoj osjetljivosti. Glavni cilj ove studije je razviti jednostavno ispitivanje kako bi se utvrdila osjetljivost mikroorganizama identificiranih na antibiotike i antimikotike raširenije uporabe, s naglaskom na njihovu primjenu na mikroorganizme izravno identificirane iz hemokulture. Na taj bi način tehnologija MALDI-TOF MS omogućila da se na isti dan identificira patogen dobije antibiotska/antifungalna osjetljivost, čime bi se olakšao rani početak specifične antimikrobne terapije. U ovom projektu želimo odrediti otpornost na beta-laktamičke antibiotike, karbapeneme, meticilin i vankomicin, kao i na rifampicin i izoniazid – koji se primjenjuju u kontroli tuberkuloze – na antimikotike skupine ekvinokandina (kaspofungin, anidulafungin i mikafungin) i na druge klasične antifungike poput flukonazola. Otkrivanje rezistencije ispitat će se inkubacijom patogena u prisutnosti antibiotika/antifungalnog na koji se sumnja na otpornost i traženjem promjena u profilu proteina ispitivanog mikroorganizma koje nam omogućuju prepoznavanje otpornih sojeva. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η τεχνολογία MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser deorption ionization — time of flight mass spectrometry), βασισμένη στη φασματομετρία μάζας (MS), έχει ανοίξει το δρόμο της στο μικροβιολογικό εργαστήριο την τελευταία δεκαετία χάρη στην υψηλή αποτελεσματικότητα και ακρίβεια στον εντοπισμό συχνών βακτηρίων και ζυμομυκήτων σε κλινικά δείγματα. Ωστόσο, οι εφαρμογές της δεν καταλήγουν στον προσδιορισμό των παθογόνων παραγόντων, αλλά τα τελευταία χρόνια έχει αποδειχθεί ότι η τεχνολογία αυτή μπορεί να παρέχει, για παράδειγμα, πληροφορίες σχετικά με την ευαισθησία των αντιβιοτικών και των αντιμυκητιασικών. Κύριος στόχος αυτής της μελέτης είναι η ανάπτυξη μιας απλής δοκιμής για τον προσδιορισμό της ευαισθησίας των μικροοργανισμών που αναγνωρίζονται στα αντιβιοτικά και τα αντιμυκητιασικά ευρύτερης χρήσης, με έμφαση στην εφαρμογή τους σε μικροοργανισμούς που ταυτοποιούνται άμεσα από αιμοκαλλιέργειες. Κατ’ αυτόν τον τρόπο, η τεχνολογία MALDI-TOF MS θα καταστήσει δυνατή την απόκτηση, την ίδια ημέρα εντοπισμού του παθογόνου παράγοντα, της ευαισθησίας του αντιβιοτικού/αντιφλεγμονώδους παράγοντα, διευκολύνοντας έτσι την πρώιμη έναρξη της ειδικής αντιμικροβιακής θεραπείας. Σε αυτό το έργο θέλουμε να προσδιορίσουμε την αντοχή σε β-λακταμινικά αντιβιοτικά, καρβαπενέμες, μεθικιλλίνη και βανκομυκίνη, καθώς και στη ριφαμπικίνη και την ισονιαζίδη -που χρησιμοποιούνται στον έλεγχο της φυματίωσης-, στα αντιμυκητιακά της ομάδας της ισινοκανδίνης (κασποφουνγίνη, anidulafungin και mycafungin) και σε άλλα κλασικά αντιμυκητιασικά όπως η φλουκοναζόλη. Η ανίχνευση της αντοχής θα ελεγχθεί τόσο με την επώαση του παθογόνου παράγοντα παρουσία του αντιβιοτικού/αντιφουγγικού για το οποίο υπάρχει υποψία αντίστασης, όσο και με την αναζήτηση αλλαγών στο πρωτεϊνικό προφίλ του μελετημένου μικροοργανισμού που μας επιτρέπει να αναγνωρίσουμε ανθεκτικά στελέχη. (Greek)
4 August 2022
0 references
Technológia MALDI-TOF MS (Matrixom podporovaná laserová desorpčná ionizácia – čas letovej hmotnostnej spektrometrie) založená na hmotnostnej spektrometrii (MS) vydláždila cestu v mikrobiologickom laboratóriu za posledné desaťročie vďaka svojej vysokej účinnosti a presnosti pri identifikácii častých baktérií a kvasiniek v klinických vzorkách. Jeho aplikácie však nekončia identifikáciou patogénov, ale v posledných rokoch sa ukázalo, že táto technológia môže poskytnúť napríklad informácie o ich antibiotickej a antimykotickej citlivosti. Hlavným cieľom tejto štúdie je vyvinúť jednoduchú skúšku na určenie citlivosti mikroorganizmov identifikovaných na antibiotiká a antimykotiká širšieho používania s dôrazom na ich aplikáciu na mikroorganizmy priamo identifikované z hemokultúr. Týmto spôsobom by technológia MALDI-TOF MS umožnila získať v ten istý deň, keď sa zistí patogén, jeho citlivosť na antibiotikum/antifungálnu citlivosť, čím by sa uľahčil skorý začiatok špecifickej antimikrobiálnej liečby. V tomto projekte chceme určiť rezistenciu na beta-laktamikové antibiotiká, karbapenémy, meticilín a vankomycín, ako aj na rifampicín a izoniazid – používané pri kontrole tuberkulózy – na antimykotiká equinocandínovej skupiny (kaspofungín, anidulafungín a mykafungín) a na iné klasické antimykotiká, ako je flukonazol. Zistenie rezistencie sa bude testovať inkubáciou patogénu v prítomnosti antibiotika/antifungálu, na ktorý sa predpokladá rezistencia, ako aj hľadaním zmien v proteínovom profile skúmaného mikroorganizmu, ktoré nám umožňujú rozpoznať rezistentné kmene. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Massaspektrometriaan (MS) perustuva MALDI-TOF MS (Matrix-avusteinen laserdesorptioionisaatio – lennon massaspektrometrian aika) on tasoittanut tiensä mikrobiologisessa laboratoriossa viime vuosikymmenen aikana, koska se on erittäin tehokas ja tarkka tunnistaessaan usein esiintyviä bakteereja ja hiivoja kliinisistä näytteistä. Mutta sen sovellukset eivät pääty taudinaiheuttajien tunnistamiseen, mutta viime vuosina on osoitettu, että tämä tekniikka voi tarjota esimerkiksi tietoa niiden antibiootti- ja sieniherkkyydestä. Tämän tutkimuksen päätavoitteena on kehittää yksinkertainen tutkimus, jossa määritetään tunnistettujen mikro-organismien herkkyys laajemmassa käytössä oleville antibiooteille ja sienilääkkeille keskittyen niiden soveltamiseen hemokulttuurista suoraan tunnistettuihin mikro-organismeihin. Tällä tavoin MALDI-TOF MS -teknologia mahdollistaisi patogeenin tunnistamisen samana päivänä sen antibiootti- tai sienitaudin herkkyyden ja helpottaisi näin tietyn mikrobilääkkeen varhaista puhkeamista. Tässä hankkeessa haluamme määrittää vastustuskyvyn beeta-laktaemeille, karbapeneemille, metisilliinille ja vankomysiinille sekä tuberkuloosikontrollissa käytettävälle rifampisiinille ja isoniatsidille, ekinokandiiniryhmän sienilääkkeille (kaspofungiini, anidulafungiini ja mykafungiini) ja muille klassisille sienilääkkeille, kuten flukonatsolille. Resistenssin toteaminen testataan inkuboimalla patogeenia sellaisen antibiootti/antibiootin/antifungaalin läsnäollessa, jolle resistenssiä epäillään, ja etsimällä tutkittavan mikro-organismin proteiiniprofiiliin muutoksia, joiden avulla voimme tunnistaa resistentit kannat. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Technologia MALDI-TOF MS (jonizacja laserowa desorpcji wspomaganej Matrix – czas spektrometrii mas) oparta na spektrometrii masowej (MS), utorowała sobie drogę w laboratorium mikrobiologicznym w ciągu ostatniej dekady dzięki wysokiej wydajności i dokładności identyfikacji częstych bakterii i drożdży w próbkach klinicznych. Ale jego zastosowania nie kończą się identyfikacją patogenów, ale w ostatnich latach wykazano, że technologia ta może dostarczyć na przykład informacji na temat ich wrażliwości na antybiotyki i przeciwgrzybicze. Głównym celem tego badania jest opracowanie prostego badania w celu określenia wrażliwości mikroorganizmów zidentyfikowanych na antybiotyki i leki przeciwgrzybicze o szerszym zastosowaniu, ze szczególnym uwzględnieniem ich zastosowania do mikroorganizmów bezpośrednio identyfikowanych z hemokulturami. W ten sposób technologia MALDI-TOF MS umożliwiłaby uzyskanie w tym samym dniu identyfikacji patogenu jego wrażliwości na antybiotyki/przeciwgrzybicze, ułatwiając w ten sposób wczesne rozpoczęcie specyficznej terapii przeciwdrobnoustrojowej. W tym projekcie chcemy określić oporność na antybiotyki beta-laktamowe, karbapenems, metycylinę i wankomycynę, a także na ryfampicynę i izoniazyd – stosowane w kontroli gruźlicy – na leki przeciwgrzybicze grupy ekwinokandyna (kaspofungina, anidulafungina i mykafungina) oraz na inne klasyczne leki przeciwgrzybicze, takie jak flukonazol. Wykrycie oporności będzie badane zarówno poprzez inkubację patogenu w obecności antybiotyku/przeciwgrzybiczego, na które podejrzewa się oporność, jak i poprzez poszukiwanie zmian w profilu białkowym badanego mikroorganizmu, które pozwalają nam rozpoznać szczepy oporne. (Polish)
4 August 2022
0 references
A MALDI-TOF SM (Matrix-támogatott lézerdeszorpciós ionizáció – a repülési tömegspektrometria ideje) technológia, amely tömegspektrometrián (MS) alapul, az elmúlt évtizedben a gyakori baktériumok és élesztők klinikai mintákban történő azonosításának magas hatékonyságával és pontosságával a mikrobiológiai laboratóriumban utat nyitott. Alkalmazásai azonban nem a kórokozók azonosításával végződnek, de az utóbbi években bebizonyosodott, hogy ez a technológia tájékoztatást nyújthat például antibiotikum- és gombaellenes érzékenységükről. Ennek a vizsgálatnak a fő célja egy egyszerű vizsgálat kidolgozása a szélesebb körben használt antibiotikumokkal és gombaellenes szerekkel szemben azonosított mikroorganizmusok érzékenységének meghatározására, különös tekintettel a hemokultúrákból közvetlenül azonosított mikroorganizmusokra történő alkalmazásukra. Ily módon a MALDI-TOF MS technológia lehetővé tenné a kórokozó azonosításának napján az antibiotikum-/antifungális érzékenységének elérését, elősegítve a specifikus antimikrobiális kezelés korai megjelenését. Ebben a projektben meg akarjuk határozni a béta-laktamiás antibiotikumokkal, karbapenemekkel, meticillinnel és vankomicinnel, valamint a tuberkulózis-kontrollban használt rifampicinnel és izoniaziddal szembeni rezisztenciát, az equinocandin csoport gombaellenes szereivel (kaszpofungin, anidulafungin és mikafungin) és más klasszikus gombaellenes szerekkel, például a flukonazollal szembeni rezisztenciát. A rezisztencia kimutatását egyrészt a kórokozó inkubálásával kell vizsgálni azon antibiotikum/antifungal jelenlétében, amellyel szemben rezisztencia gyanúja merül fel, másrészt a vizsgált mikroorganizmus fehérjeprofiljának olyan megváltoztatásával, amely lehetővé teszi számunkra a rezisztens törzsek felismerését. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Technologie MALDI-TOF MS (Matrix asistovaná laserová desorpční ionizace – čas letové hmotnostní spektrometrie) založená na hmotnostní spektrometrii (MS) vydláždila svou cestu v mikrobiologické laboratoři v posledním desetiletí díky své vysoké účinnosti a přesnosti při identifikaci častých bakterií a kvasinek v klinických vzorcích. Její aplikace však neskončí v identifikaci patogenů, ale v posledních letech bylo prokázáno, že tato technologie může například poskytnout informace o jejich antibiotické a protiplísňové citlivosti. Hlavním cílem této studie je vyvinout jednoduchou studii k určení citlivosti mikroorganismů identifikovaných na antibiotika a antimykotika širšího použití, se zaměřením na jejich aplikaci na mikroorganismy přímo identifikované z hemokultur. Technologie MALDI-TOF MS by tak umožnila získat ve stejný den, kdy je patogen identifikován, citlivost na antibiotikum/antifungal, což by usnadnilo brzký nástup specifické antimikrobiální terapie. V tomto projektu chceme určit rezistenci na beta-laktamická antibiotika, karbapenemy, methicilin a vankomycin, stejně jako na rifampicin a isoniazid – používaný při kontrole tuberkulózy – na antimykodia skupiny (kaspofungin, anidulafungin a mykafungin) a na další klasické antimykotika, jako je flukonazol. Detekce rezistence bude testována jak inkubací patogenu v přítomnosti antibiotika/antifungalu, na které je podezření na rezistenci, tak hledáním změn proteinového profilu zkoumaných mikroorganismů, které nám umožňují rozpoznat rezistentní kmeny. (Czech)
4 August 2022
0 references
MALDI-TOF MS (Matrix atbalstīta lāzera desorbcijas jonizācija — lidojuma masspektrometrijas laiks) tehnoloģija, kuras pamatā ir masspektrometrija (MS), pēdējo desmit gadu laikā ir bruģējusi ceļu mikrobioloģijas laboratorijā, pateicoties tās augstajai efektivitātei un precizitātei, nosakot biežas baktērijas un raugus klīniskos paraugos. Bet tās lietojumprogrammas nebeidzas ar patogēnu identificēšanu, bet pēdējos gados ir pierādīts, ka šī tehnoloģija var sniegt, piemēram, informāciju par to antibiotikām un pretsēnīšu jutīgumu. Šā pētījuma galvenais mērķis ir izstrādāt vienkāršu izmēģinājumu, lai noteiktu identificēto mikroorganismu jutīgumu pret plašāk izmantotām antibiotikām un pretsēnīšu līdzekļiem, galveno uzmanību pievēršot to piemērošanai mikroorganismiem, kas tieši identificēti no hemokultūrām. Tādējādi MALDI-TOF MS tehnoloģija ļautu tajā pašā dienā, kad tiek identificēts patogēns, iegūt tā jutību pret antibiotikām/pretsēnītēm, tādējādi atvieglojot konkrētu antimikrobiālo līdzekļu agrīnu sākumu. Šajā projektā vēlamies noteikt rezistenci pret beta-laktamiskiem antibiotikām, karbapenēmiem, meticilīnu un vankomicīnu, kā arī pret rifampicīnu un izoniazīdu, ko lieto tuberkulozes kontrolei, pret ehinokandīna grupas pretsēnīšu līdzekļiem (kaspofungīnu, anidulafungīnu un mikafungīnu) un citiem klasiskiem pretsēnīšu līdzekļiem, piemēram, flukonazolu. Rezistences noteikšana tiks pārbaudīta, gan inkubējot patogēnu antibiotiku/pretsēnīšu klātbūtnē, pret kuru ir aizdomas par rezistenci, gan meklējot pētītā mikroorganisma olbaltumvielu profila izmaiņas, kas ļauj mums atpazīt rezistentus celmus. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Tá teicneolaíocht MALDI-TOF MS (ianú dí-asaithe léasair le cúnamh Maitrís — am mais-speictriméadrachta eitilte), bunaithe ar mhais-speictriméadracht (MS), tar éis a bhealach a réiteach sa tsaotharlann micribhitheolaíochta le deich mbliana anuas mar gheall ar a ardéifeachtúlacht agus a cruinneas maidir le baictéir agus giostaí a aithint go minic i samplaí cliniciúla. Ach ní chríochnaíonn a chuid iarratas i sainaithint pataiginí, ach le blianta beaga anuas tá sé léirithe gur féidir leis an teicneolaíocht seo, mar shampla, faisnéis a sholáthar maidir lena n-íogaireacht antaibheathach agus antifungal. Is é príomhchuspóir an staidéir seo triail shimplí a fhorbairt chun íogaireacht na miocrorgánach a shainaithnítear i leith antaibheathaigh agus frithfhungasaigh a mbaintear úsáid níos forleithne astu a chinneadh, agus béim á leagan ar a gcur i bhfeidhm ar mhiocrorgánaigh a aithnítear go díreach ó hemocultures. Ar an mbealach seo, d’fhágfadh teicneolaíocht MS MALDI-TOF go bhféadfaí, an lá céanna a shainaithnítear an phataigin, a híogaireacht antaibheathach/antifungach a fháil, rud a d’éascódh tús luath na teiripe frithmhiocróbacha ar leith. Sa tionscadal seo, is mian linn an fhrithsheasmhacht in aghaidh antaibheathach béite-lachttamaí, carbaipeineimí, meithicillin agus vancomycin a chinneadh, chomh maith le rifampicin agus isoniazid a úsáidtear sa rialú eitinne-, le antifungals an ghrúpa equinocandine (caspofungin, anidulafungin agus mycafungin) agus le antifungals clasaiceach eile amhail fluconazole. Déanfar brath friotaíochta a thástáil tríd an pataigin a ghoradh i láthair antaibheathaigh/antifungal a bhfuil amhras ann go bhfuil frithsheasmhacht ann ina leith, agus trí athruithe a lorg ar phróifíl próitéine an mhiocrorgánaigh a ndearnadh staidéar air a ligeann dúinn tréithchineálacha frithsheasmhacha a aithint. (Irish)
4 August 2022
0 references
Tehnologija MALDI-TOF MS (Matrix podprta laserska desorpcija ionizacija – čas letalske masne spektrometrije), ki temelji na masni spektrometriji (MS), je v zadnjem desetletju utrla svojo pot v mikrobiološkem laboratoriju zaradi visoke učinkovitosti in natančnosti pri identifikaciji pogostih bakterij in kvasovk v kliničnih vzorcih. Vendar se njegova uporaba ne konča z identifikacijo patogenov, vendar je bilo v zadnjih letih dokazano, da lahko ta tehnologija zagotovi na primer informacije o njihovi občutljivosti na antibiotike in protiglivične bolezni. Glavni cilj te študije je razviti preprosto preskušanje za določitev občutljivosti mikroorganizmov, ugotovljenih za antibiotike in antimikotike, ki so bolj razširjeni, s poudarkom na njihovi uporabi na mikroorganizmih, neposredno identificiranih iz hemokultur. Na ta način bi tehnologija MS MALDI-TOF omogočila, da se na isti dan prepozna patogena, njegova občutljivost na antibiotike/antifungal, kar bi olajšalo zgodnji začetek specifičnega protimikrobnega zdravljenja. V tem projektu želimo ugotoviti odpornost na betalaktamske antibiotike, karbapeneme, meticilin in vankomicin, pa tudi na rifampicin in izoniazid – ki se uporabljata pri kontroli tuberkuloze – na antimikotike ekvinokandin skupine (kaspofungin, anidulafungin in mikafungin) in na druge klasične antimikotike, kot je flukonazol. Odkrivanje odpornosti se bo testiralo z inkubacijo patogena v prisotnosti antibiotika/antifungala, na katerega se sumi odpornost, in z iskanjem sprememb v proteinskem profilu preučevanega mikroorganizma, ki nam omogočajo prepoznavanje odpornih sevov. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Технологията MALDI-TOF MS (Matrix-подпомагана лазерна десорбционна йонизация — време на полетна масспектрометрия), базирана на масспектрометрия (MS), проправи пътя си в микробиологичната лаборатория през последното десетилетие благодарение на високата си ефективност и точност при идентифицирането на чести бактерии и дрожди в клиничните проби. Но нейните приложения не завършват с идентифицирането на патогени, но през последните години е доказано, че тази технология може да предостави например информация за тяхната антибиотична и антигъбична чувствителност. Основната цел на това проучване е да се разработи просто изпитване за определяне на чувствителността на микроорганизмите, идентифицирани към антибиотици и противогъбични средства с по-широко приложение, с акцент върху прилагането им върху микроорганизми, пряко идентифицирани от хемокултурите. По този начин MALDI-TOF MS технологията MALDI-TOF ще даде възможност да се получи, в същия ден, когато патогенът бъде идентифициран, неговата антибиотична/антифунгална чувствителност, като по този начин се улесни ранното начало на специфична антимикробна терапия. В този проект искаме да определим резистентността към бета-лактамни антибиотици, карбапенеми, метицилин и ванкомицин, както и към рифампицин и изониазид — използвани в контрола на туберкулозата — към противогъби от групата на еквинокандин (каспофунгин, анидулафунгин и микафунгин) и към други класически противогъбици като флуконазол. Откриването на резистентност ще бъде тествано както чрез инкубиране на патогена в присъствието на антибиотик/антифунгал, към който се подозира резистентност, така и чрез търсене на промени в протеиновия профил на изследвания микроорганизъм, които ни позволяват да разпознаем резистентни щамове. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
It-teknoloġija MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorption jonizzazzjoni — ħin ta ‘spettrometrija tal-massa tat-titjira), ibbażata fuq spettrometrija tal-massa (MS), wittiet triqtu fil-laboratorju tal-mikrobijoloġija fl-aħħar għaxar snin grazzi għall-effiċjenza għolja u l-preċiżjoni tagħha fl-identifikazzjoni ta’ batterji frekwenti u ħmira fil-kampjuni kliniċi. Iżda l-applikazzjonijiet tiegħu ma jispiċċawx fl-identifikazzjoni ta’ patoġeni, iżda f’dawn l-aħħar snin intwera li din it-teknoloġija tista’ tipprovdi, pereżempju, informazzjoni dwar is-sensittività antibijotika u antifungali tagħhom. L-għan ewlieni ta’ dan l-istudju huwa li tiġi żviluppata prova sempliċi biex tiġi ddeterminata s-sensittività tal-mikroorganiżmi identifikati għall-antibijotiċi u l-fungi ta’ użu aktar mifrux, b’enfasi fuq l-applikazzjoni tagħhom għal mikroorganiżmi identifikati direttament mill-emokulturi. B’dan il-mod, it-teknoloġija MALDI-TOF MS tagħmilha possibbli li jinkiseb, fl-istess jum li jiġi identifikat il-patoġenu, is-sensittività antibijotika/antifungali tiegħu, u b’hekk tiġi ffaċilitata l-bidu bikri ta’ terapija antimikrobika speċifika. F’dan il-proġett irridu niddeterminaw ir-reżistenza għal antibijotiċi beta-lactamic, carbapenems, methicillin u vancomycin, kif ukoll għal rifampicin u isoniazid — użati fil-kontroll tat-tuberkolożi — għal antifungali tal-grupp ta’ equinocandine (caspofungin, anidulafungin u mycafungin) u għal antifungali klassiċi oħra bħal fluconazole. Id-detezzjoni tar-reżistenza għandha tiġi ttestjata kemm billi jiġi inkubat il-patoġenu fil-preżenza tal-antibijotiku/antifungali li għalih hija suspettata r-reżistenza, kif ukoll billi jiġu mfittxija bidliet fil-profil tal-proteina tal-mikroorganiżmu studjat li jippermettulna nirrikonoxxu razez reżistenti. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A tecnologia MALDI-TOF MS (ionização por dessorção a laser assistida por matriz — tempo de espetrometria de massa de voo), baseada em espetrometria de massa (MS), abriu caminho no laboratório de microbiologia na última década graças à sua alta eficiência e precisão na identificação de bactérias e leveduras frequentes em amostras clínicas. Mas suas aplicações não terminam na identificação de patógenos, mas nos últimos anos tem sido demonstrado que esta tecnologia pode fornecer, por exemplo, informações sobre sua sensibilidade antibiótica e antifúngica. O principal objetivo deste estudo é desenvolver um ensaio simples para determinar a sensibilidade dos microrganismos identificados a antibióticos e antifúngicos de uso mais generalizado, com foco na sua aplicação em microrganismos diretamente identificados a partir de hemoculturas. Dessa forma, a tecnologia MALDI-TOF MS permitiria obter, no mesmo dia em que o patógeno é identificado, sua sensibilidade antibiótica/antifúngica, facilitando assim o início precoce da terapia antimicrobiana específica. Neste projeto queremos determinar a resistência aos antibióticos beta-lactamicos, carbapenemes, meticilina e vancomicina, bem como à rifampicina e isoniazida -usadas no controle da tuberculose-, aos antifúngicos do grupo equinocandina (caspofungina, anidulafungina e micafungina) e a outros antifúngicos clássicos, como o fluconazol. A deteção de resistência será testada tanto pela incubação do patógeno na presença do antibiótico/antifúngico para o qual se suspeita de resistência, quanto pela busca de alterações no perfil proteico do microrganismo estudado que nos permitam reconhecer cepas resistentes. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
MALDI-TOF MS-teknologien (Matrix-assisteret laserdesorptionsionisering — tidspunktet for flyvemassespektrometri) baseret på massespektrometri (MS) har banet vej i mikrobiologilaboratoriet i det seneste årti takket være dens høje effektivitet og nøjagtighed med hensyn til at identificere hyppige bakterier og gær i kliniske prøver. Men dens anvendelser ender ikke med at identificere patogener, men i de senere år har det vist sig, at denne teknologi f.eks. kan give oplysninger om deres antibiotika og svampedræbende følsomhed. Hovedformålet med denne undersøgelse er at udvikle et enkelt forsøg for at bestemme følsomheden af de identificerede mikroorganismer over for antibiotika og svampedræbende midler til mere udbredt anvendelse med fokus på deres anvendelse på mikroorganismer, der er direkte identificeret fra hæmokulturer. På denne måde vil MALDI-TOF MS-teknologien gøre det muligt at opnå dets antibiotiske/antifungale følsomhed samme dag som patogenet og dermed lette begyndelsen af specifik antimikrobiel behandling. I dette projekt ønsker vi at bestemme resistens over for beta-laktamiske antibiotika, carbapenemer, methicillin og vancomycin samt mod rifampicin og isoniazid — der anvendes i tuberkulosekontrollen — mod svampedræbende midler fra equinocandin-gruppen (caspofungin, anidulafungin og mycafungin) og over for andre klassiske svampedræbende midler såsom fluconazol. Påvisningen af resistens vil blive testet både ved at inkubere patogenet under tilstedeværelse af det antibiotikum/antifungal, som der er mistanke om resistens over for, og ved at søge efter ændringer i proteinprofilen for den undersøgte mikroorganisme, der gør det muligt for os at genkende resistente stammer. (Danish)
4 August 2022
0 references
Tehnologia MALDI-TOF MS (ionizare laser desorbție asistată de Matrix – timpul spectrometriei de masă de zbor), bazată pe spectrometria de masă (MS), și-a deschis drumul în laboratorul de microbiologie în ultimul deceniu datorită eficienței și preciziei ridicate în identificarea bacteriilor și drojdiilor frecvente în probele clinice. Dar aplicațiile sale nu se termină în identificarea agenților patogeni, dar în ultimii ani s-a demonstrat că această tehnologie poate oferi, de exemplu, informații cu privire la sensibilitatea lor la antibiotice și antifungice. Obiectivul principal al acestui studiu este de a dezvolta un studiu simplu pentru a determina sensibilitatea microorganismelor identificate la antibiotice și antifungice de utilizare pe scară mai largă, cu accent pe aplicarea lor la microorganisme identificate direct din hemoculturi. Astfel, tehnologia MALDI-TOF MS ar permite obținerea, în aceeași zi a identificării agentului patogen, a sensibilității sale antibiotice/antifungice, facilitând astfel debutul precoce al terapiei antimicrobiene specifice. În acest proiect dorim să determinăm rezistența la antibiotice beta-lactamice, carbapeneme, meticilină și vancomicină, precum și la rifampicină și izoniazidă – utilizate în controlul tuberculozei – la antifungice din grupul equinocandină (caspofungin, anidulafungin și micafungin) și la alte antifungice clasice, cum ar fi fluconazolul. Detectarea rezistenței va fi testată atât prin incubarea agentului patogen în prezența antibioticului/antifungicului la care se suspectează rezistența, cât și prin căutarea unor modificări ale profilului proteic al microorganismului studiat care ne permit să recunoaștem tulpini rezistente. (Romanian)
4 August 2022
0 references
MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorption jonisation – time of flight mass spectrometry) teknik, baserad på masspektrometri (MS), har banat väg i mikrobiologilaboratoriet under det senaste decenniet tack vare sin höga effektivitet och noggrannhet när det gäller att identifiera frekventa bakterier och jäst i kliniska prover. Men dess tillämpningar slutar inte med att identifiera patogener, men under de senaste åren har det visat sig att denna teknik kan ge t.ex. information om deras antibiotika- och svampkänslighet. Huvudsyftet med denna studie är att utveckla en enkel studie för att fastställa känsligheten hos de mikroorganismer som identifierats för antibiotika och antimykotika vid mer utbredd användning, med fokus på deras applicering på mikroorganismer som direkt identifieras från hemokulturer. På så sätt skulle MALDI-TOF MS-tekniken göra det möjligt att samma dag som patogenen identifieras få sin antibiotika-/antimykotikakänslighet, vilket skulle underlätta ett tidigt insättande av specifik antimikrobiell behandling. I detta projekt vill vi bestämma resistens mot beta-laktaminantibiotika, karbapenemer, methicillin och vankomycin, liksom mot rifampicin och isoniazid – som används i tuberkuloskontrollen – mot svampdödande medel i equinocandingruppen (caspofungin, anidulafungin och mykafungin) och mot andra klassiska svampdödande medel som flukonazol. Detektionen av resistens testas både genom att inkubera patogenen i närvaro av det antibiotika/antimykotika som resistens misstänks för, och genom att leta efter förändringar i proteinprofilen hos den undersökta mikroorganismen som gör det möjligt för oss att känna igen resistenta stammar. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_01073
0 references