METABOLIC INTERFERENCE IN CYANOBACTERIA. EFFECT OF REDOX CONTROL ON THE REGULATION OF CARBON, NITROGEN AND METAL METABOLISM. (Q3134485)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3134485 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | METABOLIC INTERFERENCE IN CYANOBACTERIA. EFFECT OF REDOX CONTROL ON THE REGULATION OF CARBON, NITROGEN AND METAL METABOLISM. |
Project Q3134485 in Spain |
Statements
136,468.64 Euro
0 references
169,400.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 December 2016
0 references
UNIVERSIDAD DE SEVILLA
0 references
41092
0 references
EN ESTE PROYECTO SE ABORDARA COMO LOS PROCESOS DE ASIMILACION DEL NITROGENO, CARBONO O DE METALES COMO EL COBRE ESTAN CONDICIONADOS POR LA INTERFERENCIA QUE EN ELLOS PRODUCE EL ESTADO REDOX CELULAR, A TRAVES DE COMPUESTOS METABOLICOS ESPECIFICOS, COMO ES EL CASO DE LOS OXIACIDOS 2-OXOGLUTARATO O PIRUVATO O BIEN A TRAVES DE LA OXIDACION/REDUCCION DE ALGUNAS PROTEINAS QUE MEDIAN DICHO PROCESO DE REGULACION. PARA ESTUDIAR ESTOS PROCESOS UTILIZAMOS COMO ORGANISMO MODELO LA CIANOBACTERIA UNICELULAR SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803. EN RELACION CON EL PROYECTO ANTERIOR (BFU2010-15708) ESTA PROPUESTA TIENE ASPECTOS DE CONTINUIDAD Y OTROS QUE SON NOVEDOSOS. PARA LLEVAR A CABO ESTE PLAN DE TRABAJO SE CONSTRUYERON EN EL PROYECTO ANTERIOR TODA UNA BATERIA DE ESTIRPES MUTANTES DE DICHA CIANOBACTERIA. EN ESTAS SE PUEDE ALTERAR DICHO ESTADO REDOX CELULAR, BIEN POR UNA MENOR DEFENSA FRENTE A COMPUESTOS QUE PROVOCAN ESTRES OXIDATIVO EN LA CELULA, POR ALTERACIONES EN LOS PROCESOS DE ASIMILACION DE NITROGENO O CARBONO, O EN OTROS CASOS POR PRESENTAR UNA MAYOR SENSIBILIDAD A LA PRESENCIA DE METALES. LOS OBJETIVOS CONCRETOS DEL PROYECTO SERAN LOS SIGUIENTES:_x000D_ 1. INTERFERENCIA EN LOS NIVELES DE 2-OXOGLUTARATO, EL SENSOR DEL ESTADO C/N. SE DETERMINARA COMO SE AFECTAN LOS GENES IMPLICADOS EN LA ASIMILACION DEL NITROGENO EN SYNECHOCYSTIS POR LA ACCION DE DISTINTAS ESPECIES REACTIVAS DE OXIGENO, EN ESPECIAL EL PEROXIDO DE HIDROGENO. LOS RESULTADOS PREVIOS SUGIEREN QUE ESTE COMPUESTO ALTERA LOS NIVELES DE 2-OXOGLUTARATO Y POR TANTO INTERFIERE EN LA EXPRESION GENICA A TRAVES DE LA SEÑALIZACION MEDIADA POR EL FACTOR TRANSCRIPCIONAL NTCA. LOS NIVELES DE DISTINTOS METABOLITOS Y LOS NIVELES DE ENZIMAS COMO LA GLUTAMINA SINTETASA SERVIRAN COMO REFERENCIA DE LA INTERFERENCIA REALIZADA. IGUALMENTE SE ANALIZARA EL EFECTO QUE TIENE EL ESTADO REDOX CELULAR EN LOS PROCESOS DERIVADOS DE LA CARENCIA DE FUENTE NITROGENADA, EN ESPECIAL EL RECICLAJE DEL NITROGENO CONTENIDO EN LAS FICOBILIPROTEINAS, PROCESO CONOCIDO COMO BLEACHING. _x000D_ 2. ALTERACION DE LA ACUMULACION DE CARBONO. UTILIZANDO LOS DISTINTOS MUTANTES CONSTRUIDOS QUE CARECEN DE GLUCOGENO EN SYNECHOCYSTIS SE ANALIZARA QUE OCURRE CON EL CARBONO FIJADO EN DICHOS MUTANTES, EN CONDICIONES NORMALES DE CULTIVO VERSUS CONDICIONES DE DEFICIENCIA DE NITROGENO. ANALIZAREMOS COMO INTERFIERE EL ESTADO REDOX EN LA ACUMULACION DE CARBONO FIJADO, UTILIZANDO MUTANTES INCAPACES DE SINTETIZAR GLUCOGENO. SE ANALIZARA PORQUE DICHOS MUTANTES SON INCAPACES DE REALIZAR EL PROCESO DE BLEACHING EN AUSENCIA DE FUENTE DE NITROGENO EN COMPARACION CON LA ESTIRPE SILVESTRE. SE DETERMINARA IGUALMENTE PORQUE MUTANTES CARENTES DE GLUCOGENO SINTASA, PERO CONTENIENDO LA ENZIMA ADP-GLUCOSA PIROFOSFORILASA, NO SON VIABLES. _x000D_ 3. PERCEPCION DE METALES Y ESTADO REDOX. SE DESCIFRARA EL SISTEMA DE INTERCAMBIO DE EXPRESION MEDIADO POR COBRE DE LOS GENES DE LA PLASTOCIANINA (PETE) Y EL CITOCROMO C6 (PETJ), UTILIZANDO MUTANTES QUE PRESENTAN UNA ALTERACION EN EL SISTEMA DE PERCEPCION DEL COBRE. ACTUALMENTE NO HAY DATOS QUE PERMITAN INFERIR LOS FACTORES TRANSCRIPCIONALES IMPLICADOS, NI SU NATURALEZA DE ACTIVADORES/REPRESORES. ADEMAS, SE ANALIZARA LA ESPECIFICIDAD DE ESTE SISTEMA RESPECTO A LA PRESENCIA DE OTROS METALES QUE ALTERAN LA EXPRESION DE DICHOS GENES. FINALMENTE DETERMINAREMOS COMO EL SISTEMA RESPONDE EN CONDICIONES DE ESTRES OXIDATIVO MEDIADO POR PEROXIDO DE HIDROGENO. (Spanish)
0 references
IN THIS PROJECT IT WILL BE ADDRESSED HOW THE PROCESSES OF ASSIMILATION OF NITROGEN, CARBON OR METALS SUCH AS COPPER ARE CONDITIONED BY THE INTERFERENCE PRODUCED IN THEM BY THE CELLULAR REDOX STATE, THROUGH SPECIFIC METABOLIC COMPOUNDS, SUCH AS THE OXIACIDOS 2-OXOGLUTARATE OR PYRUVATE OR THROUGH THE OXIDATION/REDUCTION OF SOME PROTEINS THAT MEDIATE THIS PROCESS OF REGULATION. TO STUDY THESE PROCESSES WE USE THE SINGLE-CELL CYANOBACTERIA SYNECHOCYSTIS SP AS A MODEL ORGANISM. PCC 6803. IN RELATION TO THE PREVIOUS PROJECT (BFU2010-15708) THIS PROPOSAL HAS CONTINUITY ASPECTS AND OTHERS THAT ARE NOVEL. TO CARRY OUT THIS WORK PLAN, A BATTERY OF MUTANT STRAINS OF THIS CYANOBACTERIA WERE BUILT IN THE PREVIOUS PROJECT. IN THESE, THIS CELLULAR REDOX STATE CAN BE ALTERED, EITHER BY A LOWER DEFENSE AGAINST COMPOUNDS THAT CAUSE OXIDATIVE STRESS IN THE CELL, BY ALTERATIONS IN THE PROCESSES OF ASSIMILATION OF NITROGEN OR CARBON, OR IN OTHER CASES BY PRESENTING A GREATER SENSITIVITY TO THE PRESENCE OF METALS. Project OBJECTIVES WILL BE THE NEXT:_x000D_ 1. INTERFERENCE IN 2-OXOGLUTARATE LEVELS, THE C/N STATE SENSOR WILL BE DETERMINED HOW THE GENES INVOLVED IN NITROGEN ASSIMILATION IN SYNECHOCYSTIS ARE AFFECTED BY THE ACTION OF DIFFERENT REACTIVE OXYGEN SPECIES, ESPECIALLY HYDROGEN PEROXIDE. PREVIOUS RESULTS SUGGEST THAT THIS COMPOUND ALTERS LEVELS OF 2-OXOGLUTARATE AND THUS INTERFERES IN GENIC EXPRESSION THROUGH NTCA-MEDIATED SIGNAGE. LEVELS OF DIFFERENT METABOLITES AND ENZYME LEVELS SUCH AS GLUTAMINE SYNTHETASE WILL SERVE AS A REFERENCE FOR INTERFERENCE. IT WILL ALSO ANALYSE THE EFFECT OF THE CELLULAR REDOX STATE ON THE PROCESSES DERIVED FROM THE LACK OF NITROGEN SOURCE, ESPECIALLY THE RECYCLING OF NITROGEN CONTAINED IN FICOBILIPROTEINS, A PROCESS KNOWN AS BLEACHING. _x000D_ 2. ALTERATION OF CARBON ACCUMULATION. USING THE DIFFERENT MUTANTS CONSTRUCTED WITHOUT GLUCOGENE IN SYNECHOCYSTIS, IT WILL BE ANALYSED THAT OCCURS WITH THE CARBON FIXED IN THESE MUTANTS, UNDER NORMAL CONDITIONS OF CULTIVATION VERSUS NITROGEN DEFICIENCY CONDITIONS. WE WILL ANALYSE HOW THE REDOX STATE INTERFERES IN THE ACCUMULATION OF FIXED CARBON, USING MUTANTS UNABLE TO SYNTHESISE GLUCOGENE. IT WILL BE ANALYSED BECAUSE THESE MUTANTS ARE UNABLE TO PERFORM THE BLEACHING PROCESS IN THE ABSENCE OF A NITROGEN SOURCE COMPARED TO THE WILD STRAIN. IT WILL ALSO BE DETERMINED BECAUSE MUTANTS DEVOID OF GLUCOGENE SYNTHASE, BUT CONTAINING THE ENZYME ADP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE, ARE NOT FEASIBLE. _x000D_ 3. PERCEPTION OF METALS AND REDOX STATUS. THE COPPER-MEDIATED EXPRESSION EXCHANGE SYSTEM OF THE GENES OF PLASTOCYANIN (PETE) AND CYTOCHROME C6 (PETJ) IS DECIPHERED USING MUTANTS THAT PRESENT AN ALTERATION IN THE COPPER PERCEPTION SYSTEM. THERE ARE CURRENTLY NO DATA TO INFER THE TRANSCRIPTIONAL FACTORS INVOLVED, OR THEIR NATURE AS ACTIVATORS/REPRESSORS. IN ADDITION, THE SPECIFICITY OF THIS SYSTEM WITH REGARD TO THE PRESENCE OF OTHER METALS THAT ALTER THE EXPRESSION OF THESE GENES WILL BE ANALYSED. FINALLY WE WILL DETERMINE HOW THE SYSTEM RESPONDS IN CONDITIONS OF OXIDATIVE STRESS MEDIATED BY HYDROGEN PEROXIDE. (English)
12 October 2021
0.4064103329956351
0 references
DANS CE PROJET, IL SERA QUESTION DE LA FAÇON DONT LES PROCESSUS D’ASSIMILATION DE L’AZOTE, DU CARBONE OU DES MÉTAUX TELS QUE LE CUIVRE SONT CONDITIONNÉS PAR L’INTERFÉRENCE PRODUITE DANS CES PROCESSUS PAR L’ÉTAT REDOX CELLULAIRE, PAR L’INTERMÉDIAIRE DE COMPOSÉS MÉTABOLIQUES SPÉCIFIQUES, TELS QUE LE 2-OXOGLUTARATE D’OXIACIDOS OU LE PYRUVATE, OU PAR L’OXYDATION/RÉDUCTION DE CERTAINES PROTÉINES QUI MÉDIENT CE PROCESSUS DE RÉGULATION. POUR ÉTUDIER CES PROCESSUS, NOUS UTILISONS LES CYANOBACTÉRIES MONOCELLULAIRES SYNECHOCYSTIS SP COMME ORGANISME MODÈLE. PCC 6803. EN CE QUI CONCERNE LE PROJET PRÉCÉDENT (BFU2010-15708), LA PRÉSENTE PROPOSITION COMPORTE DES ASPECTS DE CONTINUITÉ ET D’AUTRES ASPECTS NOUVEAUX. POUR RÉALISER CE PLAN DE TRAVAIL, UNE BATTERIE DE SOUCHES MUTANTES DE CES CYANOBACTÉRIES A ÉTÉ CONSTRUITE DANS LE PROJET PRÉCÉDENT. DANS CEUX-CI, CET ÉTAT REDOX CELLULAIRE PEUT ÊTRE MODIFIÉ, SOIT PAR UNE DÉFENSE PLUS FAIBLE CONTRE LES COMPOSÉS QUI PROVOQUENT UN STRESS OXYDATIF DANS LA CELLULE, PAR DES ALTÉRATIONS DES PROCESSUS D’ASSIMILATION DE L’AZOTE OU DU CARBONE, SOIT DANS D’AUTRES CAS PAR UNE PLUS GRANDE SENSIBILITÉ À LA PRÉSENCE DE MÉTAUX. Les OBJECTIFS DU PROJET ÊTRE LA NEXTE:_x000D_ 1. INTERFÉRENCE DANS LES NIVEAUX DE 2-OXOGLUTARATE, LE CAPTEUR D’ÉTAT C/N SERA DÉTERMINÉ COMMENT LES GÈNES IMPLIQUÉS DANS L’ASSIMILATION DE L’AZOTE DANS SYNECHOCYSTIS SONT AFFECTÉS PAR L’ACTION DE DIFFÉRENTES ESPÈCES D’OXYGÈNE RÉACTIF, EN PARTICULIER LE PEROXYDE D’HYDROGÈNE. LES RÉSULTATS PRÉCÉDENTS SUGGÈRENT QUE CE COMPOSÉ MODIFIE LES NIVEAUX DE 2-OXOGLUTARATE ET INTERFÈRE DONC DANS L’EXPRESSION GÉNIQUE PAR L’INTERMÉDIAIRE DE LA SIGNALISATION À MÉDIATION NTCA. LES NIVEAUX DE DIFFÉRENTS MÉTABOLITES ET LES NIVEAUX D’ENZYMES TELS QUE LA GLUTAMINE SYNTHÉTASE SERVIRONT DE RÉFÉRENCE POUR LES INTERFÉRENCES. IL ANALYSERA ÉGALEMENT L’EFFET DE L’ÉTAT REDOX CELLULAIRE SUR LES PROCESSUS DÉRIVÉS DU MANQUE DE SOURCE D’AZOTE, EN PARTICULIER LE RECYCLAGE DE L’AZOTE CONTENU DANS LES FICOBILIPROTEINS, UN PROCÉDÉ CONNU SOUS LE NOM DE BLANCHIMENT. _x000D_ 2. ALTÉRATION DE L’ACCUMULATION DE CARBONE. EN UTILISANT LES DIFFÉRENTS MUTANTS CONSTRUITS SANS GLUCOGENE DANS SYNECHOCYSTIS, IL SERA ANALYSÉ QUI SE PRODUIT AVEC LE CARBONE FIXÉ DANS CES MUTANTS, DANS DES CONDITIONS NORMALES DE CULTURE PAR RAPPORT À DES CONDITIONS DE CARENCE EN AZOTE. NOUS ALLONS ANALYSER COMMENT L’ÉTAT REDOX INTERFÈRE DANS L’ACCUMULATION DE CARBONE FIXE, EN UTILISANT DES MUTANTS INCAPABLES DE SYNTHÉTISER GLUCOGENE. IL SERA ANALYSÉ PARCE QUE CES MUTANTS SONT INCAPABLES D’EFFECTUER LE PROCESSUS DE BLANCHIMENT EN L’ABSENCE D’UNE SOURCE D’AZOTE PAR RAPPORT À LA SOUCHE SAUVAGE. IL SERA ÉGALEMENT DÉTERMINÉ PARCE QUE LES MUTANTS DÉPOURVUS DE GLUCOGENE SYNTHASE, MAIS CONTENANT L’ENZYME ADP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE, NE SONT PAS RÉALISABLES. _x000D_ 3. PERCEPTION DES MÉTAUX ET STATUT REDOX. LE SYSTÈME D’ÉCHANGE D’EXPRESSIONS MÉDIÉ PAR LE CUIVRE DES GÈNES DE LA PLASTOCYANINE (PETE) ET DU CYTOCHROME C6 (PETJ) EST DÉCHIFFRÉ À L’AIDE DE MUTANTS QUI PRÉSENTENT UNE ALTÉRATION DU SYSTÈME DE PERCEPTION DU CUIVRE. IL N’EXISTE ACTUELLEMENT AUCUNE DONNÉE PERMETTANT DE DÉDUIRE LES FACTEURS TRANSCRIPTIONNELS EN CAUSE, OU LEUR NATURE D’ACTIVATEURS/RÉPRESSEURS. EN OUTRE, LA SPÉCIFICITÉ DE CE SYSTÈME EN CE QUI CONCERNE LA PRÉSENCE D’AUTRES MÉTAUX QUI ALTÈRENT L’EXPRESSION DE CES GÈNES SERA ANALYSÉE. ENFIN, NOUS DÉTERMINERONS COMMENT LE SYSTÈME RÉPOND DANS DES CONDITIONS DE STRESS OXYDATIF MÉDIÉES PAR LE PEROXYDE D’HYDROGÈNE. (French)
2 December 2021
0 references
IN DIESEM PROJEKT WIRD UNTERSUCHT, WIE DIE PROZESSE DER ASSIMILATION VON STICKSTOFF, KOHLENSTOFF ODER METALLEN WIE KUPFER DURCH DIE DURCH DEN ZELLULÄREN REDOX-ZUSTAND ERZEUGTE INTERFERENZ, DURCH SPEZIFISCHE METABOLISCHE VERBINDUNGEN WIE DAS OXIACIDOS 2-OXOGLUTARAT ODER PYRUVAT ODER DURCH DIE OXIDATION/REDUKTION EINIGER PROTEINE, DIE DIESEN PROZESS DER VERORDNUNG VERMITTELN, KONDITIONIERT WERDEN. UM DIESE PROZESSE ZU UNTERSUCHEN, VERWENDEN WIR DIE EINZELLIGE CYANOBAKTERIE SYNECHOCYSTIS SP ALS MODELLORGANISMUS. PCC 6803. IN BEZUG AUF DAS VORANGEGANGENE PROJEKT (BFU2010-15708) HAT DIESER VORSCHLAG KONTINUITÄTSASPEKTE UND ANDERE NEUARTIGE ASPEKTE. UM DIESEN ARBEITSPLAN DURCHZUFÜHREN, WURDE IM VORANGEGANGENEN PROJEKT EINE BATTERIE MUTANTER STÄMME DIESER CYANOBAKTERIEN GEBAUT. IN DIESEN KANN DIESER ZELLULÄRE REDOX-ZUSTAND GEÄNDERT WERDEN, ENTWEDER DURCH EINE GERINGERE ABWEHR GEGEN VERBINDUNGEN, DIE OXIDATIVEN STRESS IN DER ZELLE VERURSACHEN, DURCH VERÄNDERUNGEN IN DEN PROZESSEN DER ASSIMILATION VON STICKSTOFF ODER KOHLENSTOFF ODER IN ANDEREN FÄLLEN DURCH EINE GRÖSSERE EMPFINDLICHKEIT GEGENÜBER DEM VORHANDENSEIN VON METALLEN. Projektziele:_x000D_ 1. INTERFERENZ IN 2-OXOGLUTARAT-SPIEGELN WIRD DER C/N-STATE-SENSOR BESTIMMT, WIE DIE GENE, DIE AN DER STICKSTOFFASIMILATION IN SYNECHOCYSTIS BETEILIGT SIND, VON DER WIRKUNG VERSCHIEDENER REAKTIVER SAUERSTOFFARTEN, INSBESONDERE VON WASSERSTOFFPEROXID, BEEINFLUSST WERDEN. FRÜHERE ERGEBNISSE DEUTEN DARAUF HIN, DASS DIESE VERBINDUNG DIE NIVEAUS VON 2-OXOGLUTARAT ÄNDERT UND SOMIT DURCH NTCA-VERMITTELTE SIGNAGE IN DIE GENENEXPRESSION EINGREIFT. KONZENTRATIONEN UNTERSCHIEDLICHER METABOLITEN UND ENZYMSPIEGEL WIE GLUTAMIN-SYNTHETASE DIENEN ALS REFERENZ FÜR INTERFERENZ. ES WIRD AUCH DIE WIRKUNG DES ZELLULÄREN REDOX-ZUSTANDS AUF DIE PROZESSE ANALYSIEREN, DIE SICH AUS DEM MANGEL AN STICKSTOFFQUELLE ERGEBEN, INSBESONDERE DAS RECYCLING VON STICKSTOFF IN FICOBILIPROTEINS, EINEM VERFAHREN, DAS ALS BLEICHEN BEZEICHNET WIRD. _x000D_ 2. VERÄNDERUNG DER KOHLENSTOFFAKKUMULATION. UNTER VERWENDUNG DER VERSCHIEDENEN MUTANTEN, DIE OHNE GLUCOGENE IN SYNECHOCYSTIS KONSTRUIERT WURDEN, WIRD ES ANALYSIERT, DER MIT DEM IN DIESEN MUTANTEN FIXIERTEN KOHLENSTOFF UNTER NORMALEN ANBAUBEDINGUNGEN IM VERGLEICH ZU STICKSTOFFMANGELBEDINGUNGEN AUFTRITT. WIR WERDEN ANALYSIEREN, WIE DER REDOX-STAAT IN DIE AKKUMULATION VON FESTEM KOHLENSTOFF EINGREIFT, WOBEI MUTANTEN VERWENDET WERDEN, DIE NICHT IN DER LAGE SIND, GLUCOGENE ZU SYNTHETISIEREN. ES WIRD ANALYSIERT, WEIL DIESE MUTANTEN NICHT IN DER LAGE SIND, DEN BLEICHVORGANG IN ABWESENHEIT EINER STICKSTOFFQUELLE IM VERGLEICH ZU DER WILDEN STAMM DURCHZUFÜHREN. ES WIRD AUCH BESTIMMT, WEIL MUTANTEN OHNE GLUCOGENE-SYNTHASE, ABER DAS ENZYM ADP-GLUCOSE-PYROPHOSPHORYLASE ENTHALTEN, NICHT DURCHFÜHRBAR SIND. _x000D_ 3. WAHRNEHMUNG VON METALLEN UND REDOX-STATUS. DAS KUPFERVERMITTELTE EXPRESSIONSAUSTAUSCHSYSTEM DER GENE VON PLASTOCYANIN (PETE) UND CYTOCHROM C6 (PETJ) WIRD MIT MUTANTEN ENTSCHLÜSSELT, DIE EINE VERÄNDERUNG DES KUPFERWAHRNEHMUNGSSYSTEMS DARSTELLEN. DERZEIT LIEGEN KEINE DATEN VOR, UM DIE BETREFFENDEN TRANSKRIPTIONSFAKTOREN ODER DEREN ART ALS AKTIVATOREN/REPRESSOREN ZU ENTNEHMEN. DARÜBER HINAUS WIRD DIE SPEZIFITÄT DIESES SYSTEMS IM HINBLICK AUF DAS VORHANDENSEIN ANDERER METALLE ANALYSIERT, DIE DIE EXPRESSION DIESER GENE VERÄNDERN. SCHLIESSLICH WERDEN WIR BESTIMMEN, WIE DAS SYSTEM UNTER BEDINGUNGEN VON OXIDATIVEM STRESS DURCH WASSERSTOFFPEROXID REAGIERT. (German)
9 December 2021
0 references
IN DIT PROJECT ZAL WORDEN NAGEGAAN HOE DE ASSIMILATIEPROCESSEN VAN STIKSTOF, KOOLSTOF OF METALEN ZOALS KOPER WORDEN GECONDITIONEERD DOOR DE INTERFERENTIE DIE DAARIN WORDT VEROORZAAKT DOOR DE CELLULAIRE REDOXSTAAT, VIA SPECIFIEKE METABOLISCHE VERBINDINGEN, ZOALS HET OXIACIDOS 2-OXOGLUTARAAT OF PYRUVAAT, OF DOOR DE OXIDATIE/VERMINDERING VAN SOMMIGE EIWITTEN DIE DIT REGLEMENTERINGSPROCES BEMIDDELEN. OM DEZE PROCESSEN TE BESTUDEREN GEBRUIKEN WE DE EENCELLIGE CYANOBACTERIA SYNECHOCYSTIS SP ALS MODELORGANISME. PCC 6803. MET BETREKKING TOT HET VORIGE PROJECT (BFU2010-15708) HEEFT DIT VOORSTEL CONTINUÏTEITSASPECTEN EN ANDERE NIEUW ZIJN. OM DIT WERKPLAN UIT TE VOEREN, WERD IN HET VORIGE PROJECT EEN BATTERIJ VAN MUTANT STAMMEN VAN DEZE CYANOBACTERIËN GEBOUWD. IN DEZE, DEZE CELLULAIRE REDOX STAAT KAN WORDEN VERANDERD, HETZIJ DOOR EEN LAGERE VERDEDIGING TEGEN VERBINDINGEN DIE OXIDATIEVE STRESS IN DE CEL VEROORZAKEN, DOOR VERANDERINGEN IN DE PROCESSEN VAN ASSIMILATIE VAN STIKSTOF OF KOOLSTOF, OF IN ANDERE GEVALLEN DOOR HET PRESENTEREN VAN EEN GROTERE GEVOELIGHEID VOOR DE AANWEZIGHEID VAN METALEN. Project OBJECTIVES ZAL DE NEXT:_x000D_ 1. INTERFERENTIE IN 2-OXOGLUTARAATNIVEAUS, DE C/N-STAATSENSOR ZAL WORDEN BEPAALD HOE DE GENEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ STIKSTOFASSIMILATIE IN SYNECHOCYSTIS WORDEN BEÏNVLOED DOOR DE WERKING VAN VERSCHILLENDE REACTIEVE ZUURSTOFSOORTEN, MET NAME WATERSTOFPEROXIDE. EERDERE RESULTATEN SUGGEREREN DAT DEZE VERBINDING NIVEAUS VAN 2-OXOGLUTARAAT VERANDERT EN ZO INTERFEREERT IN GENIC EXPRESSIE DOOR NTCA-GEMEDIEERDE SIGNAGE. NIVEAUS VAN VERSCHILLENDE METABOLIETEN EN ENZYMNIVEAUS ZOALS GLUTAMINE SYNTHETASE ZULLEN DIENEN ALS REFERENTIE VOOR INTERFERENTIE. HET ZAL OOK HET EFFECT VAN DE CELLULAIRE REDOXSTAAT OP DE PROCESSEN DIE WORDEN AFGELEID VAN HET GEBREK AAN STIKSTOFBRON ANALYSEREN, MET NAME DE RECYCLING VAN STIKSTOF IN FICOBILIPROTEINS, EEN PROCES DAT BEKEND STAAT ALS BLEKEN. _x000D_ 2. VERANDERING VAN KOOLSTOFACCUMULATIE. MET BEHULP VAN DE VERSCHILLENDE MUTANTEN GECONSTRUEERD ZONDER GLUCOGENE IN SYNECHOCYSTIS, ZAL WORDEN GEANALYSEERD DIE OPTREEDT MET DE KOOLSTOF VAST IN DEZE MUTANTEN, ONDER NORMALE OMSTANDIGHEDEN VAN TEELT VERSUS STIKSTOFDEFICIËNTIE OMSTANDIGHEDEN. WE ZULLEN ANALYSEREN HOE DE REDOXSTAAT INTERFEREERT IN DE ACCUMULATIE VAN VASTE KOOLSTOF, MET BEHULP VAN MUTANTEN DIE NIET IN STAAT ZIJN OM GLUCOGENE TE SYNTHETISEREN. HET ZAL WORDEN GEANALYSEERD OMDAT DEZE MUTANTEN NIET IN STAAT ZIJN HET BLEEKPROCES UIT TE VOEREN IN DE AFWEZIGHEID VAN EEN STIKSTOFBRON IN VERGELIJKING MET DE WILDE STAM. HET ZAL OOK WORDEN BEPAALD OMDAT MUTANTEN ZONDER GLUCOGENE SYNTHASE, MAAR DIE HET ENZYM ADP-GLUCOSE PYROFOSFORYLASE BEVATTEN, NIET HAALBAAR ZIJN. _x000D_ 3. PERCEPTIE VAN METALEN EN REDOX STATUS. HET KOPER-GEMEDIEERDE EXPRESSIE-UITWISSELINGSSYSTEEM VAN DE GENEN VAN PLASTOCYANINE (PETE) EN CYTOCHROOM C6 (PETJ) WORDT ONTCIJFERD MET BEHULP VAN MUTANTEN DIE EEN VERANDERING IN HET KOPERPERCEPTIESYSTEEM VERTONEN. ER ZIJN MOMENTEEL GEEN GEGEVENS OM DE BETROKKEN TRANSCRIPTIONELE FACTOREN OF HUN AARD ALS ACTIVATOREN/REPRESSOREN AF TE LEIDEN. BOVENDIEN ZAL DE SPECIFICITEIT VAN DIT SYSTEEM MET BETREKKING TOT DE AANWEZIGHEID VAN ANDERE METALEN DIE DE EXPRESSIE VAN DEZE GENEN VERANDEREN, WORDEN GEANALYSEERD. TOT SLOT ZULLEN WE BEPALEN HOE HET SYSTEEM REAGEERT IN OMSTANDIGHEDEN VAN OXIDATIEVE STRESS GEMEDIEERD DOOR WATERSTOFPEROXIDE. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IN QUESTO PROGETTO VERRÀ AFFRONTATO IL MODO IN CUI I PROCESSI DI ASSIMILAZIONE DI AZOTO, CARBONIO O METALLI COME IL RAME SONO CONDIZIONATI DALL'INTERFERENZA PRODOTTA IN ESSI DALLO STATO DI REDOX CELLULARE, ATTRAVERSO SPECIFICI COMPOSTI METABOLICI, COME OXIACIDOS 2-OSSOGLUTARATO O PIRUVATO O ATTRAVERSO L'OSSIDAZIONE/RIDUZIONE DI ALCUNE PROTEINE CHE MEDIANO QUESTO PROCESSO DI REGOLAMENTO. PER STUDIARE QUESTI PROCESSI UTILIZZIAMO I CIANOBATTERI MONOCELLULARI SYNECHOCYSTIS SP COME ORGANISMO MODELLO. PCC 6803. IN RELAZIONE AL PROGETTO PRECEDENTE (BFU2010-15708) LA PRESENTE PROPOSTA PRESENTA ASPETTI DI CONTINUITÀ E ALTRI ASPETTI NUOVI. PER REALIZZARE QUESTO PIANO DI LAVORO, NEL PROGETTO PRECEDENTE È STATA COSTRUITA UNA BATTERIA DI CEPPI MUTANTI DI QUESTO CIANOBATTERI. IN QUESTI, QUESTO STATO DI REDOX CELLULARE PUÒ ESSERE ALTERATO, SIA DA UNA DIFESA INFERIORE CONTRO I COMPOSTI CHE CAUSANO STRESS OSSIDATIVO NELLA CELLULA, DA ALTERAZIONI NEI PROCESSI DI ASSIMILAZIONE DI AZOTO O CARBONIO, O IN ALTRI CASI PRESENTANDO UNA MAGGIORE SENSIBILITÀ ALLA PRESENZA DI METALLI. Gli obiettivi del progetto saranno i prossimi:_x000D_ 1. INTERFERENZA NEI LIVELLI DI 2-OSSOGLUTARATO, IL SENSORE DI STATO C/N SARÀ DETERMINATO COME I GENI COINVOLTI NELL'ASSIMILAZIONE DELL'AZOTO IN SYNECHOCYSTIS SIANO INFLUENZATI DALL'AZIONE DI DIVERSE SPECIE REATTIVE DI OSSIGENO, IN PARTICOLARE IL PEROSSIDO DI IDROGENO. I RISULTATI PRECEDENTI SUGGERISCONO CHE QUESTO COMPOSTO ALTERA I LIVELLI DI 2-OSSOGLUTARATO E QUINDI INTERFERISCE NELL'ESPRESSIONE GENETICA ATTRAVERSO LA SEGNALETICA MEDIATA DALL'NTCA. I LIVELLI DI DIVERSI METABOLITI E LIVELLI ENZIMATICI COME LA GLUTAMMINA SINTETASI SERVIRANNO DA RIFERIMENTO PER L'INTERFERENZA. ANALIZZERÀ INOLTRE L'EFFETTO DELLO STATO REDOX CELLULARE SUI PROCESSI DERIVANTI DALLA MANCANZA DI FONTE DI AZOTO, IN PARTICOLARE IL RICICLAGGIO DELL'AZOTO CONTENUTO IN FICOBILIPROTEINS, UN PROCESSO NOTO COME SBIANCAMENTO. _x000D_ 2. ALTERAZIONE DELL'ACCUMULO DI CARBONIO. UTILIZZANDO I DIVERSI MUTANTI COSTRUITI SENZA GLUCOGENE IN SYNECHOCYSTIS, SARÀ ANALIZZATO CHE SI VERIFICA CON IL CARBONIO FISSATO IN QUESTI MUTANTI, IN CONDIZIONI NORMALI DI COLTIVAZIONE RISPETTO ALLE CONDIZIONI DI CARENZA DI AZOTO. ANALIZZEREMO COME LO STATO REDOX INTERFERISCE NELL'ACCUMULO DI CARBONIO FISSO, UTILIZZANDO MUTANTI INCAPACI DI SINTETIZZARE GLUCOGENE. SARÀ ANALIZZATO PERCHÉ QUESTI MUTANTI NON SONO IN GRADO DI ESEGUIRE IL PROCESSO DI SBIANCAMENTO IN ASSENZA DI UNA FONTE DI AZOTO RISPETTO AL CEPPO SELVAGGIO. SARÀ ANCHE DETERMINATO PERCHÉ I MUTANTI PRIVI DI GLUCOGENE SINTASI, MA CONTENENTI L'ENZIMA ADP-GLUCOSIO PIROFOSFORILASI, NON SONO FATTIBILI. _x000D_ 3. PERCEZIONE DEI METALLI E STATO REDOX. IL SISTEMA DI SCAMBIO DI ESPRESSIONE MEDIATO DAL RAME DEI GENI DELLA PLASTOCIANINA (PETE) E DEL CITOCROMO C6 (PETJ) È DECIFRATO UTILIZZANDO MUTANTI CHE PRESENTANO UN'ALTERAZIONE NEL SISTEMA DI PERCEZIONE DEL RAME. ATTUALMENTE NON CI SONO DATI PER DEDURRE I FATTORI TRASCRIZIONALI COINVOLTI, O LA LORO NATURA DI ATTIVATORI/REPRESSORI. INOLTRE, SARÀ ANALIZZATA LA SPECIFICITÀ DI QUESTO SISTEMA RISPETTO ALLA PRESENZA DI ALTRI METALLI CHE ALTERANO L'ESPRESSIONE DI QUESTI GENI. INFINE DETERMINEREMO COME IL SISTEMA REAGISCE IN CONDIZIONI DI STRESS OSSIDATIVO MEDIATO DAL PEROSSIDO DI IDROGENO. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΑ ΕΞΕΤΑΣΤΕΊ Ο ΤΡΌΠΟΣ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΟΙ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΑΦΟΜΟΊΩΣΗΣ ΑΖΏΤΟΥ, ΆΝΘΡΑΚΑ Ή ΜΕΤΆΛΛΩΝ, ΌΠΩΣ Ο ΧΑΛΚΌΣ, ΡΥΘΜΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΑΡΕΜΒΟΛΈΣ ΠΟΥ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΙ ΣΕ ΑΥΤΆ ΑΠΌ ΤΗΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΚΑΤΆΣΤΑΣΗ ΟΞΕΙΔΟΑΝΑΓΩΓΉΣ, ΜΈΣΩ ΕΙΔΙΚΏΝ ΜΕΤΑΒΟΛΙΚΏΝ ΕΝΏΣΕΩΝ, ΌΠΩΣ ΤΟ 2-ΟΞΟΓΛΟΥΤΑΡΙΚΌ OXIACIDOS Ή ΠΥΡΟΣΤΑΤΙΚΌ ΆΛΑΣ Ή ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΟΞΕΊΔΩΣΗΣ/ΜΕΊΩΣΗΣ ΟΡΙΣΜΈΝΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΠΟΥ ΜΕΣΟΛΑΒΟΎΝ ΣΕ ΑΥΤΉ ΤΗ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΚΑΝΟΝΙΣΜΟΎ. ΓΙΑ ΝΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΜΕ ΤΑ ΜΟΝΟΚΎΑΝΟ ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΑ SYNECHOCYSTIS SP ΩΣ ΠΡΌΤΥΠΟ ΟΡΓΑΝΙΣΜΌ. PCC 6803. ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΟ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟ ΈΡΓΟ (BFU2010-15708), Η ΠΑΡΟΎΣΑ ΠΡΌΤΑΣΗ ΈΧΕΙ ΠΤΥΧΈΣ ΣΥΝΈΧΕΙΑΣ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΠΤΥΧΈΣ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΝΕΩΤΕΡΙΣΤΙΚΈΣ. ΓΙΑ ΤΗΝ ΥΛΟΠΟΊΗΣΗ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΟΣ ΕΡΓΑΣΊΑΣ, ΚΑΤΑΣΚΕΥΆΣΤΗΚΑΝ ΣΤΟ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟ ΈΡΓΟ ΜΙΑ ΣΕΙΡΆ ΜΕΤΑΛΛΑΓΜΈΝΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΗΡΊΩΝ. ΣΕ ΑΥΤΆ, ΑΥΤΉ Η ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΚΑΤΆΣΤΑΣΗ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉΣ ΤΟΞΙΚΌΤΗΤΑΣ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΘΕΊ, ΕΊΤΕ ΜΕ ΜΙΑ ΧΑΜΗΛΌΤΕΡΗ ΆΜΥΝΑ ΕΝΆΝΤΙΑ ΣΕ ΕΝΏΣΕΙΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΎΝ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉ ΚΑΤΑΠΌΝΗΣΗ ΣΤΟ ΚΎΤΤΑΡΟ, ΜΕ ΜΕΤΑΒΟΛΈΣ ΣΤΙΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΑΦΟΜΟΊΩΣΗΣ ΤΟΥ ΑΖΏΤΟΥ Ή ΤΟΥ ΆΝΘΡΑΚΑ, ΕΊΤΕ ΣΕ ΆΛΛΕΣ ΠΕΡΙΠΤΏΣΕΙΣ ΠΑΡΟΥΣΙΆΖΟΝΤΑΣ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΕΥΑΙΣΘΗΣΊΑ ΣΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΜΕΤΆΛΛΩΝ. Οι ΣΤΟΧΟΙ του έργου θα είναι το επόμενο:_x000D_ 1. ΠΑΡΕΜΒΟΛΈΣ ΣΤΑ ΕΠΊΠΕΔΑ 2-ΟΞΟΓΛΟΥΤΑΪΚΟΎ ΟΞΈΟΣ, Ο ΚΡΑΤΙΚΌΣ ΑΙΣΘΗΤΉΡΑΣ C/N ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΕΊ ΜΕ ΠΟΙΟΝ ΤΡΌΠΟ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΦΟΜΟΊΩΣΗ ΤΟΥ ΑΖΏΤΟΥ ΣΤΟ SYNECHOCYSTIS ΕΠΗΡΕΆΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗ ΔΡΆΣΗ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΙΚΏΝ ΕΙΔΏΝ ΟΞΥΓΌΝΟΥ, ΙΔΊΩΣ ΤΟΥ ΥΠΕΡΟΞΕΙΔΊΟΥ ΤΟΥ ΥΔΡΟΓΌΝΟΥ. ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΔΕΊΧΝΟΥΝ ΌΤΙ ΑΥΤΉ Η ΈΝΩΣΗ ΜΕΤΑΒΆΛΛΕΙ ΤΑ ΕΠΊΠΕΔΑ ΤΟΥ 2-ΟΞΟΓΛΟΥΤΑΪΚΟΎ ΚΑΙ ΈΤΣΙ ΠΑΡΕΜΒΑΊΝΕΙ ΣΤΗ ΓΟΝΙΚΉ ΈΚΦΡΑΣΗ ΜΈΣΩ NTCA-ΜΕΣΟΛΑΒΟΎΜΕΝΗ ΣΉΜΑΝΣΗ. ΤΑ ΕΠΊΠΕΔΑ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΏΝ ΜΕΤΑΒΟΛΙΤΏΝ ΚΑΙ ΕΝΖΎΜΩΝ, ΌΠΩΣ Η ΣΥΝΘΕΤΆΣΗ ΓΛΟΥΤΑΜΊΝΗΣ, ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΕΎΣΟΥΝ ΩΣ ΣΗΜΕΊΟ ΑΝΑΦΟΡΆΣ ΓΙΑ ΠΑΡΕΜΒΟΛΈΣ. ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΤΗΝ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉΣ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉΣ ΚΑΤΆΣΤΑΣΗΣ ΣΤΙΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΎΠΤΟΥΝ ΑΠΌ ΤΗΝ ΈΛΛΕΙΨΗ ΠΗΓΉΣ ΑΖΏΤΟΥ, ΙΔΊΩΣ ΤΗΝ ΑΝΑΚΎΚΛΩΣΗ ΤΟΥ ΑΖΏΤΟΥ ΠΟΥ ΠΕΡΙΈΧΕΤΑΙ ΣΤΟ FICOBILIPROTEINS, ΜΙΑ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΓΝΩΣΤΉ ΩΣ ΛΕΎΚΑΝΣΗ. _x000D_ 2. ΜΕΤΑΒΟΛΉ ΤΗΣ ΣΥΣΣΏΡΕΥΣΗΣ ΆΝΘΡΑΚΑ. ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΩΝ ΠΟΥ ΚΑΤΑΣΚΕΥΆΣΤΗΚΑΝ ΧΩΡΊΣ ΤΟ GLUCOGENE ΣΤΗ SYNECHOCYSTIS, ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΕΊ ΑΥΤΌ ΠΟΥ ΣΥΜΒΑΊΝΕΙ ΜΕ ΤΟΝ ΆΝΘΡΑΚΑ ΠΟΥ ΈΧΕΙ ΣΤΕΡΕΩΘΕΊ ΣΕ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ, ΥΠΌ ΚΑΝΟΝΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ ΈΝΑΝΤΙ ΈΛΛΕΙΨΗΣ ΑΖΏΤΟΥ. ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΟΥΜΕ ΤΟΝ ΤΡΌΠΟ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ Η ΚΑΤΆΣΤΑΣΗ ΟΞΕΙΔΟΑΝΑΓΩΓΉΣ ΠΑΡΕΜΒΑΊΝΕΙ ΣΤΗ ΣΥΣΣΏΡΕΥΣΗ ΣΤΑΘΕΡΟΎ ΆΝΘΡΑΚΑ, ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΠΟΥ ΔΕΝ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΣΥΝΘΈΣΟΥΝ ΤΟ GLUCOGENE. ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΕΊ ΕΠΕΙΔΉ ΟΙ ΕΝ ΛΌΓΩ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΔΕΝ ΕΊΝΑΙ ΣΕ ΘΈΣΗ ΝΑ ΕΚΤΕΛΈΣΟΥΝ ΤΗ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΛΕΎΚΑΝΣΗΣ ΕΛΛΕΊΨΕΙ ΠΗΓΉΣ ΑΖΏΤΟΥ ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ ΤΟ ΆΓΡΙΟ ΣΤΈΛΕΧΟΣ. ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΕΠΕΙΔΉ ΔΕΝ ΕΊΝΑΙ ΕΦΙΚΤΟΊ ΟΙ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΠΟΥ ΣΤΕΡΟΎΝΤΑΙ GLUCOGENE ΣΥΝΘΆΣΗΣ, ΑΛΛΆ ΠΕΡΙΈΧΟΥΝ ΤΟ ΈΝΖΥΜΟ ADP-ΓΛΥΚΌΖΗ ΠΥΡΟΦΩΣΦΟΡΥΛΆΣΗ. _x000D_ 3. ΑΝΤΊΛΗΨΗ ΤΩΝ ΜΕΤΆΛΛΩΝ ΚΑΙ ΚΑΤΆΣΤΑΣΗ ΟΞΕΙΔΟΑΝΑΓΩΓΉΣ. ΤΟ ΣΎΣΤΗΜΑ ΑΝΤΑΛΛΑΓΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΜΕ ΤΗ ΜΕΣΟΛΆΒΗΣΗ ΧΑΛΚΟΎ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΤΗΣ ΠΛΑΣΤΟΚΥΑΝΊΝΗΣ (PETE) ΚΑΙ ΤΟΥ ΚΥΤΟΧΡΏΜΑΤΟΣ C6 (PETJ) ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΕΊΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΩΝ ΠΟΥ ΠΑΡΟΥΣΙΆΖΟΥΝ ΜΕΤΑΒΟΛΉ ΣΤΟ ΣΎΣΤΗΜΑ ΑΝΤΊΛΗΨΗΣ ΤΟΥ ΧΑΛΚΟΎ. ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ ΔΕΝ ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΓΙΑ ΝΑ ΣΥΝΑΧΘΟΎΝ ΟΙ ΣΧΕΤΙΚΟΊ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΟΊ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ, Ή Η ΦΎΣΗ ΤΟΥΣ ΩΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΙΗΤΏΝ/ΚΑΤΑΣΤΑΛΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΕΊ Η ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΆΛΛΩΝ ΜΕΤΆΛΛΩΝ ΠΟΥ ΜΕΤΑΒΆΛΛΟΥΝ ΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ. ΤΈΛΟΣ, ΘΑ ΚΑΘΟΡΊΣΟΥΜΕ ΤΟΝ ΤΡΌΠΟ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΤΟ ΣΎΣΤΗΜΑ ΑΝΤΑΠΟΚΡΊΝΕΤΑΙ ΣΕ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΟΎ ΣΤΡΕΣ ΠΟΥ ΜΕΣΟΛΑΒΕΊ ΑΠΌ ΤΟ ΥΠΕΡΟΞΕΊΔΙΟ ΤΟΥ ΥΔΡΟΓΌΝΟΥ. (Greek)
17 August 2022
0 references
I DETTE PROJEKT VIL DER BLIVE TAGET STILLING TIL, HVORDAN PROCESSERNE MED ASSIMILERING AF KVÆLSTOF, KULSTOF ELLER METALLER SÅSOM KOBBER ER BETINGET AF DEN INTERFERENS, DER PRODUCERES I DEM AF CELLULÆR REDOXSTAT, GENNEM SPECIFIKKE METABOLISKE FORBINDELSER, SÅSOM OXIACIDOS 2-OXOGLUTARAT ELLER PYRUVAT, ELLER GENNEM OXIDATION/REDUKTION AF VISSE PROTEINER, DER FORMIDLER DENNE REGULERINGSPROCES. TIL AT STUDERE DISSE PROCESSER BRUGER VI ENKELTCELLECYANOBAKTERIERNE SYNECHOCYSTIS SP SOM MODELORGANISME. PCC 6803. I FORHOLD TIL DET TIDLIGERE PROJEKT (BFU2010-15708) HAR DETTE FORSLAG KONTINUITETSASPEKTER OG ANDRE, DER ER NYE. FOR AT GENNEMFØRE DENNE ARBEJDSPLAN BLEV DER I DET TIDLIGERE PROJEKT BYGGET ET BATTERI AF MUTANTSTAMMER AF DISSE CYANOBAKTERIER. I DISSE, DENNE CELLULÆRE REDOX TILSTAND KAN ÆNDRES, ENTEN VED ET LAVERE FORSVAR MOD FORBINDELSER, DER FORÅRSAGER OXIDATIV STRESS I CELLEN, VED ÆNDRINGER I PROCESSERNE FOR ASSIMILERING AF NITROGEN ELLER CARBON, ELLER I ANDRE TILFÆLDE VED AT PRÆSENTERE EN STØRRE FØLSOMHED OVER FOR TILSTEDEVÆRELSEN AF METALLER. Projektnavne, der vil være NEXT:_x000D_ 1. INTERFERENS I 2-OXOGLUTARATNIVEAUER VIL C/N-TILSTANDSSENSOREN BLIVE BESTEMT, HVORDAN DE GENER, DER ER INVOLVERET I KVÆLSTOFASSIMILERING I SYNECHOCYSTIS, PÅVIRKES AF VIRKNINGEN AF FORSKELLIGE REAKTIVE OXYGENARTER, ISÆR HYDROGENPEROXID. TIDLIGERE RESULTATER TYDER PÅ, AT DENNE FORBINDELSE ÆNDRER NIVEAUERNE AF 2-OXOGLUTARAT OG DERMED INTERFERERER I GENISK UDTRYK GENNEM NTCA-MEDIERET SKILTNING. NIVEAUER AF FORSKELLIGE METABOLITTER OG ENZYMNIVEAUER SÅSOM GLUTAMINSYNTHETASE VIL TJENE SOM REFERENCE FOR INTERFERENS. DEN VIL OGSÅ ANALYSERE VIRKNINGEN AF DEN CELLULÆRE REDOXSTAT PÅ DE PROCESSER, DER STAMMER FRA MANGLEN PÅ KVÆLSTOFKILDE, ISÆR GENANVENDELSEN AF KVÆLSTOF INDEHOLDT I FICOBILIPROTEINS, EN PROCES KENDT SOM BLEGNING. _x000D_ 2. ÆNDRING AF KULSTOFAKKUMULERING. VED HJÆLP AF DE FORSKELLIGE MUTANTER KONSTRUERET UDEN GLUCOGENE I SYNECHOCYSTIS, VIL DET BLIVE ANALYSERET, DER OPSTÅR MED KULSTOF FAST I DISSE MUTANTER, UNDER NORMALE DYRKNINGSBETINGELSER VERSUS KVÆLSTOFMANGEL. VI VIL ANALYSERE, HVORDAN REDOXSTATEN BLANDER SIG I AKKUMULERINGEN AF FAST KULSTOF VED HJÆLP AF MUTANTER, DER IKKE KAN SYNTETISERE GLUCOGENE. DET VIL BLIVE ANALYSERET, FORDI DISSE MUTANTER IKKE ER I STAND TIL AT UDFØRE BLEGNINGSPROCESSEN I MANGEL AF EN KVÆLSTOFKILDE I FORHOLD TIL DEN VILDE STAMME. DET VIL OGSÅ BLIVE BESTEMT, FORDI MUTANTER UDEN GLUCOGENE SYNTHASE, MEN SOM INDEHOLDER ENZYMET ADP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE, IKKE ER MULIGE. _x000D_ 3. OPFATTELSE AF METALLER OG REDOX STATUS. DET KOBBERMEDIEREDE EKSPRESSIONSUDVEKSLINGSSYSTEM FOR GENER AF PLASTOCYANIN (PETE) OG CYTOKROM C6 (PETJ) AFKODES VED HJÆLP AF MUTANTER, DER UDGØR EN ÆNDRING I KOBBEROPFATTELSESSYSTEMET. DER ER I ØJEBLIKKET INGEN DATA TIL AT UDLEDE DE PÅGÆLDENDE TRANSSKRIPTIONSFAKTORER ELLER DERES KARAKTER SOM AKTIVATORER/REPRESSORER. DESUDEN VIL SPECIFICITETEN AF DETTE SYSTEM MED HENSYN TIL TILSTEDEVÆRELSEN AF ANDRE METALLER, DER ÆNDRER EKSPRESSIONEN AF DISSE GENER, BLIVE ANALYSERET. ENDELIG VIL VI BESTEMME, HVORDAN SYSTEMET REAGERER UNDER OXIDATIV STRESS MEDIERET AF HYDROGENPEROXID. (Danish)
17 August 2022
0 references
TÄSSÄ HANKKEESSA TARKASTELLAAN SITÄ, MITEN TYPEN, HIILEN TAI METALLIEN, KUTEN KUPARIN, ASSIMILAATIOPROSESSIT EHDOLLISTETAAN SOLUN REDOKSITILASSA, TIETTYJEN METABOLISTEN YHDISTEIDEN, KUTEN OXIACIDOS 2-OKSOGLUTARAATTI- TAI PYRUVATIN, KAUTTA TAI JOIDENKIN TÄTÄ SÄÄNTELYPROSESSIA VÄLITTÄVIEN PROTEIINIEN HAPETTUMISEN/VÄHENTÄMISEN KAUTTA. NÄIDEN PROSESSIEN TUTKIMISEKSI KÄYTÄMME YKSISOLUISTA SYANOBAKTEERIA SYNECHOCYSTIS SP MALLIORGANISMINA. PCC 6803. EDELLISEEN HANKKEESEEN (BFU2010–15708) LIITTYEN TÄHÄN EHDOTUKSEEN SISÄLTYY JATKUVUUTTA KOSKEVIA NÄKÖKOHTIA JA MUITA, JOTKA OVAT UUSIA. TÄMÄN TYÖSUUNNITELMAN TOTEUTTAMISEKSI AIEMMASSA HANKKEESSA RAKENNETTIIN AKKU TÄMÄN SYANOBAKTEERIN MUTANTTIKANTOJA. NÄISSÄ, TÄMÄ SOLUN REDOX VALTION VOIDAAN MUUTTAA, JOKO ALEMPI PUOLUSTUS YHDISTEITÄ, JOTKA AIHEUTTAVAT OKSIDATIIVISTA STRESSIÄ SOLUSSA, MUUTOKSIA PROSESSIEN ASSIMILAATIO TYPEN TAI HIILEN, TAI MUISSA TAPAUKSISSA ESITTÄMÄLLÄ SUUREMPI HERKKYYS LÄSNÄOLO METALLEJA. Hankkeen OBJECTIVES ON NEXT:_x000D_ 1. HÄIRIÖT 2-OKSOGLUTARAATTIPITOISUUKSISSA, C/N VALTION ANTURI MÄÄRITETÄÄN, MITEN ERI REAKTIIVISTEN HAPPILAJIEN, ERITYISESTI VETYPEROKSIDIN, VAIKUTUS VAIKUTTAA TYPEN ASSIMILAATIOON SYNECHOCYSTIKSEN GEENEIHIN. AIEMMAT TULOKSET VIITTAAVAT SIIHEN, ETTÄ TÄMÄ YHDISTE MUUTTAA 2-OKSOGLUTARAATTIPITOISUUKSIA JA HÄIRITSEE SITEN GEENIEN ILMENTYMISTÄ NTCA-VÄLITTEISEN OPASTEEN KAUTTA. ERI METABOLIITTIEN JA ENTSYYMITASOJEN, KUTEN GLUTAMIINISYNTEETAASIN, TASOT TOIMIVAT VERTAILUKOHTANA HÄIRIÖILLE. SIINÄ ANALYSOIDAAN MYÖS SOLUN REDOX-TILAN VAIKUTUSTA TYPEN LÄHTEEN PUUTTUMISESTA JOHDETTUIHIN PROSESSEIHIN, ERITYISESTI FICOBILIPROTEINS-MENETELMÄN SISÄLTÄMÄN TYPEN KIERRÄTYKSEEN, JOKA TUNNETAAN VALKAISUNA. _x000D_ 2. HIILEN KERTYMÄN MUUTOS. KÄYTTÄMÄLLÄ ERI MUTANTTEJA, JOTKA ON RAKENNETTU ILMAN GLUCOGENEA SYNECHOCYSTIS -BAKTEERISSA, ANALYSOIDAAN, MIKÄ TAPAHTUU NÄIDEN MUTANTTIEN HIILELLÄ NORMAALEISSA VILJELYOLOSUHTEISSA SUHTEESSA TYPEN PUUTOKSEEN. ANALYSOIMME, MITEN REDOX-TILA HÄIRITSEE KIINTEÄN HIILEN KERTYMISTÄ KÄYTTÄEN MUTANTTEJA, JOTKA EIVÄT VOI SYNTETISOIDA GLUCOGENEA. SE ANALYSOIDAAN, KOSKA NÄMÄ MUTANTIT EIVÄT PYSTY SUORITTAMAAN VALKAISUPROSESSIA ILMAN TYPPILÄHDETTÄ VERRATTUNA LUONNONVARAISEEN KANTAAN. SE MÄÄRITETÄÄN MYÖS, KOSKA MUTANTIT, JOILLA EI OLE GLUCOGENE-SYNTAAASIA MUTTA JOTKA SISÄLTÄVÄT ADP-GLUKOOSIPYROFOSFORYLAASIENTSYYMIÄ, EIVÄT OLE MAHDOLLISIA. _x000D_ 3. KÄSITYS METALLEISTA JA REDOKSISTA. PLASTOSYANIININ (PETE) JA SYTOKROMI C6:N (PETJ) GEENIEN KUPARIVÄLITTEINEN EKSPRESSIOJÄRJESTELMÄ TULKITAAN KÄYTTÄEN MUTANTTEJA, JOTKA AIHEUTTAVAT MUUTOKSEN KUPARIN HAVAINNOINTIJÄRJESTELMÄSSÄ. TÄLLÄ HETKELLÄ EI OLE OLEMASSA TIETOJA, JOIDEN PERUSTEELLA VOITAISIIN PÄÄTELLÄ ASIAAN LIITTYVÄT TRANSKRIPTIOTEKIJÄT TAI NIIDEN LUONNE AKTIVAATTOREINA/REPRESSORTEINA. LISÄKSI ANALYSOIDAAN TÄMÄN JÄRJESTELMÄN SPESIFISYYTTÄ SUHTEESSA MUIDEN METALLIEN ESIINTYMISEEN, JOTKA MUUTTAVAT NÄIDEN GEENIEN ILMENTYMISTÄ. LOPUKSI PÄÄTÄMME, MITEN JÄRJESTELMÄ REAGOI VETYPEROKSIDIN VÄLITTÄMÄN OKSIDATIIVISEN STRESSIN OLOSUHTEISSA. (Finnish)
17 August 2022
0 references
F’DAN IL-PROĠETT SE JIĠI INDIRIZZAT KIF IL-PROĊESSI TA’ ASSIMILAZZJONI TAN-NITROĠENU, TAL-KARBONJU JEW TAL-METALLI BĦAR-RAM HUMA KKUNDIZZJONATI MILL-INTERFERENZA PRODOTTA FIHOM MILL-ISTAT TAR-REDOX ĊELLULARI, PERMEZZ TA’ KOMPOSTI METABOLIĊI SPEĊIFIĊI, BĦALL-OSSIGLUTARATE 2-OXOGLUTARATE JEW IL-PYRUVATE OXIACIDOS JEW PERMEZZ TAL-OSSIDAZZJONI/TNAQQIS TA’ XI PROTEINI LI JIMMEDJAW DAN IL-PROĊESS TA’ REGOLAMENT. BIEX NISTUDJAW DAWN IL-PROĊESSI NUŻAW IĊ-ĊJANOBATTERJI TA ‘ĊELLULA WAĦDA SYNECHOCYSTIS SP BĦALA ORGANIŻMU MUDELL. PCC 6803. FIR-RIGWARD TAL-PROĠETT PREĊEDENTI (BFU2010–15708) DIN IL-PROPOSTA GĦANDHA ASPETTI TA’ KONTINWITÀ U OĦRAJN LI HUMA ĠODDA. BIEX JITWETTAQ DAN IL-PJAN TA’ ĦIDMA, INBNEW SENSIELA TA’ RAZEZ MUTANTI TA’ DAN IĊ-ĊJANOBATTERJI FIL-PROĠETT PREĊEDENTI. F’DAWN, DAN L-ISTAT TAR-REDOX ĊELLULARI JISTA’ JINBIDEL, JEW B’DIFIŻA AKTAR BAXXA KONTRA KOMPOSTI LI JIKKAWŻAW STRESS OSSIDATTIV FIĊ-ĊELLOLA, B’ALTERAZZJONIJIET FIL-PROĊESSI TA’ ASSIMILAZZJONI TAN-NITROĠENU JEW TAL-KARBONJU, JEW F’KAŻIJIET OĦRA BILLI TIĠI PPREŻENTATA SENSITTIVITÀ AKBAR GĦALL-PREŻENZA TA’ METALLI. Objettivi tal-Proġett JIEĦU QABEL L-INEXT:_x000D_ 1. INTERFERENZA FIL-LIVELLI TA’ 2-OXOGLUTARATE, IS-SENSUR TAL-ISTAT C/N JIĠI DDETERMINAT KIF IL-ĠENI INVOLUTI FL-ASSIMILAZZJONI TAN-NITROĠENU F’SYNECHOCYSTIS HUMA AFFETTWATI MILL-AZZJONI TA’ SPEĊI DIFFERENTI TA’ OSSIĠNU REATTIV, SPEĊJALMENT IL-PEROSSIDU TAL-IDROĠENU. RIŻULTATI PREĊEDENTI JISSUĠĠERIXXU LI DAN IL-KOMPOST JIBDEL IL-LIVELLI TA’ 2-OXOGLUTARATE U B’HEKK JINTERFERIXXI FL-ESPRESSJONI ĠENIKA PERMEZZ TA’ SINJALI MEDJATI MINN NTCA. IL-LIVELLI TA’ METABOLITI DIFFERENTI U L-LIVELLI TAL-ENZIMI BĦAL GLUTAMINE SYNTHETASE SE JSERVU BĦALA REFERENZA GĦALL-INTERFERENZA. SE TANALIZZA WKOLL L-EFFETT TAL-ISTAT TAR-REDOX ĊELLULARI FUQ IL-PROĊESSI DERIVATI MIN-NUQQAS TA’ SORS TA’ NITROĠENU, SPEĊJALMENT IR-RIĊIKLAĠĠ TAN-NITROĠENU LI JINSAB F’FICOBILIPROTEINS, PROĊESS MAGĦRUF BĦALA IBBLIĊJAR. _x000D_ 2. TIBDIL FL-AKKUMULAZZJONI TAL-KARBONJU. BL-UŻU TA’ MUTANTI DIFFERENTI MIBNIJA MINGĦAJR GLUCOGENE F’SYNECHOCYSTIS, SE JIĠI ANALIZZAT LI JSEĦĦ BIL-KARBONJU FFISSAT F’DAWN IL-MUTANTI, F’KUNDIZZJONIJIET NORMALI TA’ KULTIVAZZJONI META MQABBLA MA’ KUNDIZZJONIJIET TA’ NUQQAS TA’ NITROĠENU. AĦNA SER NANALIZZAW KIF L-ISTAT REDOX JINTERFERIXXI FL-AKKUMULAZZJONI TA’ KARBONJU FISS, BL-UŻU TA’ MUTANTI LI MA JISTGĦUX JISSINTETIZZAW IL-GLUCOGENE. DAN SE JIĠI ANALIZZAT MINĦABBA LI DAWN IL-MUTANTI MA JKUNUX JISTGĦU JWETTQU L-PROĊESS TAL-IBBLIĊJAR FIN-NUQQAS TA’ SORS TA’ NITROĠENU META MQABBEL MAR-RAZZA SELVAĠĠA. SE JIĠI STABBILIT UKOLL MINĦABBA LI MUTANTI LI M’GĦANDHOMX GLUCOGENE SYNTHASE, IŻDA LI FIHOM L-ENZIMA ADP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE, MHUMIEX POSSIBBLI. _x000D_ 3. IL-PERĊEZZJONI TAL-METALLI U L-ISTATUS TAR-REDOX. IS-SISTEMA TA’ SKAMBJU TA’ ESPRESSJONI MEDJATA MIR-RAM TAL-ĠENI TA’ PLASTOCYANIN (PETE) U CYTOCHROME C6 (PETJ) HIJA DEĊIFRATA BL-UŻU TA’ MUTANTI LI JIPPREŻENTAW BIDLA FIS-SISTEMA TA’ PERĊEZZJONI TAR-RAM. BĦALISSA MA HEMM L-EBDA DATA LI TINFERIXXI L-FATTURI TRASKRIZZJONALI INVOLUTI, JEW IN-NATURA TAGĦHOM BĦALA ATTIVATURI/RIPRESSURI. BARRA MINN HEKK, L-ISPEĊIFIĊITÀ TA’ DIN IS-SISTEMA FIR-RIGWARD TAL-PREŻENZA TA’ METALLI OĦRA LI JBIDDLU L-ESPRESSJONI TA’ DAWN IL-ĠENI SE TIĠI ANALIZZATA. FL-AĦĦAR NETT SE NIDDETERMINAW KIF IS-SISTEMA TIRRISPONDI F’KUNDIZZJONIJIET TA’ STRESS OSSIDATTIV MEDJAT MILL-PEROSSIDU TAL-IDROĠENU. (Maltese)
17 August 2022
0 references
ŠAJĀ PROJEKTĀ TIKS RISINĀTS JAUTĀJUMS PAR TO, KĀ SLĀPEKĻA, OGLEKĻA VAI METĀLU, PIEMĒRAM, VARA, ASIMILĀCIJAS PROCESUS IETEKMĒ ŠŪNU REDOKSA STĀVOKĻA RADĪTIE TRAUCĒJUMI, IZMANTOJOT SPECIFISKUS METABOLISKUS SAVIENOJUMUS, PIEMĒRAM, OXIACIDOS 2-OKSOGLUTARĀTU VAI PIRUVĀTU, VAI OKSIDĒJOT/SAMAZINOT DAŽUS PROTEĪNUS, KAS IR ŠO REGULAS PROCESU NOTEICOŠAIS FAKTORS. LAI IZPĒTĪTU ŠOS PROCESUS, MĒS IZMANTOJAM VIENŠŪNAS CIANOBAKTĒRIJU SYNECHOCYSTIS SP KĀ MODEĻA ORGANISMU. PCC 6803. ATTIECĪBĀ UZ IEPRIEKŠĒJO PROJEKTU (BFU2010–15708) ŠIM PRIEKŠLIKUMAM IR NEPĀRTRAUKTĪBAS ASPEKTI, BET CITI — JAUNI. LAI ĪSTENOTU ŠO DARBA PLĀNU, IEPRIEKŠĒJĀ PROJEKTĀ TIKA UZBŪVĒTS ŠĪS CIANOBAKTĒRIJU MUTANTU CELMU AKUMULATORS. ŠAJĀS ŠŪNĀS REDOKSA STĀVOKLI VAR MAINĪT, VAI NU AR ZEMĀKU AIZSARDZĪBU PRET SAVIENOJUMIEM, KAS IZRAISA OKSIDATĪVO STRESU ŠŪNĀ, PĀRVEIDOJOT SLĀPEKĻA VAI OGLEKĻA ASIMILĀCIJAS PROCESUS, VAI CITOS GADĪJUMOS RADOT LIELĀKU JUTĪBU PRET METĀLU KLĀTBŪTNI. Projekta mērķis būs NEXT:_x000D_ 1. IEJAUKŠANĀS 2-OKSOGLUTARĀTA LĪMEŅOS, C/N VALSTS SENSORS TIKS NOTEIKTS, KĀ SLĀPEKĻA ASIMILĀCIJĀ IESAISTĪTOS GĒNUS SYNECHOCYSTIS IETEKMĒ DAŽĀDU REAKTĪVO SKĀBEKĻA SUGU, JO ĪPAŠI ŪDEŅRAŽA PEROKSĪDA, DARBĪBA. IEPRIEKŠĒJIE REZULTĀTI LIECINA, KA ŠIS SAVIENOJUMS MAINA 2-OKSOGLUTARĀTA LĪMENI UN TĀDĒJĀDI TRAUCĒ ĢENĒNO EKSPRESIJU AR NTCA STARPNIECĪBU. DAŽĀDU METABOLĪTU UN FERMENTU LĪMEŅU, PIEMĒRAM, GLUTAMĪNA SINTETĀZES, LĪMEŅI KALPOS PAR ATSAUCI UZ TRAUCĒJUMIEM. TĀ ARĪ ANALIZĒS ŠŪNU REDOKSA STĀVOKĻA IETEKMI UZ PROCESIEM, KAS IZRIET NO SLĀPEKĻA AVOTA TRŪKUMA, JO ĪPAŠI FICOBILIPROTEINS SASTĀVĀ ESOŠĀ SLĀPEKĻA PĀRSTRĀDI, KAS PAZĪSTAMA KĀ BALINĀŠANA. _x000D_ 2. OGLEKĻA UZKRĀŠANĀS IZMAIŅAS. IZMANTOJOT DAŽĀDUS MUTANTUS, KAS BEZ GLUCOGENE UZBŪVĒTI SYNECHOCYSTIS SASTĀVĀ, TO ANALIZĒS AR ŠAJOS MUTANTOS FIKSĒTO OGLEKLI NORMĀLOS AUDZĒŠANAS APSTĀKĻOS SALĪDZINĀJUMĀ AR SLĀPEKĻA DEFICĪTA APSTĀKĻIEM. MĒS ANALIZĒSIM, KĀ REDOX VALSTS IETEKMĒ FIKSĒTĀ OGLEKĻA UZKRĀŠANOS, IZMANTOJOT MUTANTUS, KAS NESPĒJ SINTEZĒT GLUCOGENE. TAS TIKS ANALIZĒTS, JO ŠIE MUTANTI NESPĒJ VEIKT BALINĀŠANAS PROCESU, JA NAV SLĀPEKĻA AVOTA, SALĪDZINOT AR SAVVAĻAS CELMU. TO NOTEIKS ARĪ TĀPĒC, KA MUTANTI, KURIEM NAV GLUCOGENE SINTĀZES, BET KURI SATUR FERMENTU ADP-GLIKOZES PIROFOSFORLĀZI, NAV IESPĒJAMI. _x000D_ 3. METĀLU UZTVERE UN REDOX STATUSS. PLASTOCIANĪNA (PETE) UN CITOHROMA C6 (PETJ) GĒNU VARA MEDIĒTĀS EKSPRESIJAS APMAIŅAS SISTĒMU ATŠIFRĒ, IZMANTOJOT MUTANTUS, KAS RADA VARA UZTVERES SISTĒMAS IZMAIŅAS. PAŠLAIK NAV DATU, KAS LIECINĀTU PAR IESAISTĪTAJIEM TRANSKRIPCIJAS FAKTORIEM VAI TO KĀ AKTIVATORU/REPRESORU RAKSTURU. TURKLĀT TIKS ANALIZĒTA ŠĪS SISTĒMAS SPECIFIKA ATTIECĪBĀ UZ CITU METĀLU KLĀTBŪTNI, KAS MAINA ŠO GĒNU EKSPRESIJU. VISBEIDZOT, MĒS NOTEIKSIM, KĀ SISTĒMA REAĢĒ ŪDEŅRAŽA PEROKSĪDA OKSIDATĪVĀ STRESA APSTĀKĻOS. (Latvian)
17 August 2022
0 references
V TOMTO PROJEKTE SA BUDE RIEŠIŤ, AKO SA PROCESY ASIMILÁCIE DUSÍKA, UHLÍKA ALEBO KOVOV, AKO JE MEĎ, KONDICIONUJÚ INTERFERENCIOU, KTORÚ V NICH SPÔSOBUJE BUNKOVÝ REDOXNÝ STAV, PROSTREDNÍCTVOM ŠPECIFICKÝCH METABOLICKÝCH ZLÚČENÍN, AKO JE OXIACIDOS 2-OXOGLUTARÁT ALEBO PYRUVÁT, ALEBO OXIDÁCIOU/REDUKCIOU NIEKTORÝCH BIELKOVÍN, KTORÉ SPROSTREDKÚVAJÚ TENTO PROCES REGULÁCIE. NA ŠTÚDIUM TÝCHTO PROCESOV POUŽÍVAME JEDNOBUNKOVÝ CYANOBAKTÉRIE SYNECHOCYSTIS SP AKO MODELOVÝ ORGANIZMUS. PCC 6803. V SÚVISLOSTI S PREDCHÁDZAJÚCIM PROJEKTOM (BFU2010 – 15708) MÁ TENTO NÁVRH ASPEKTY KONTINUITY A ĎALŠIE PRVKY, KTORÉ SÚ NOVÉ. NA VYKONANIE TOHTO PRACOVNÉHO PLÁNU BOLA V PREDCHÁDZAJÚCOM PROJEKTE VYBUDOVANÁ BATÉRIA MUTANTNÝCH KMEŇOV TÝCHTO CYANOBAKTÉRIÍ. V TÝCHTO, TENTO BUNKOVÝ REDOX STAV MÔŽE BYŤ ZMENENÝ, BUĎ NIŽŠOU OBRANOU PROTI ZLÚČENINÁM, KTORÉ SPÔSOBUJÚ OXIDAČNÝ STRES V BUNKE, ZMENAMI V PROCESOCH ASIMILÁCIE DUSÍKA ALEBO UHLÍKA, ALEBO V INÝCH PRÍPADOCH TÝM, ŽE PREDSTAVUJE VÄČŠIU CITLIVOSŤ NA PRÍTOMNOSŤ KOVOV. Projekt OBECTIVES bude NEXT:_x000D_ 1. INTERFERENCIA S HLADINAMI 2-OXOGLUTARÁTU, SNÍMAČ STAVU C/N SA URČÍ, AKO SÚ GÉNY PODIEĽAJÚCE SA NA ASIMILÁCII DUSÍKA V SYNECHOCYSTIS OVPLYVNENÉ PÔSOBENÍM RÔZNYCH REAKTÍVNYCH DRUHOV KYSLÍKA, NAJMÄ PEROXIDU VODÍKA. PREDCHÁDZAJÚCE VÝSLEDKY NAZNAČUJÚ, ŽE TÁTO ZLÚČENINA MENÍ HLADINY 2-OXOGLUTARÁTU A TÝM ZASAHUJE DO GÉNOVEJ EXPRESIE PROSTREDNÍCTVOM NTCA SPROSTREDKOVANÉHO ZNAČENIA. HLADINY RÔZNYCH METABOLITOV A ENZÝMOV, AKO JE GLUTAMÍN SYNTETÁZA, BUDÚ SLÚŽIŤ AKO REFERENCIA PRE INTERFERENCIU. BUDE TIEŽ ANALYZOVAŤ VPLYV BUNKOVÉHO REDOXNÉHO STAVU NA PROCESY ODVODENÉ Z NEDOSTATKU ZDROJA DUSÍKA, NAJMÄ RECYKLÁCIU DUSÍKA OBSIAHNUTÉHO V FICOBILIPROTEINS, PROCES ZNÁMY AKO BIELENIE. _x000D_ 2. ZMENA AKUMULÁCIE UHLÍKA. POMOCOU RÔZNYCH MUTANTOV VYROBENÝCH BEZ GLUCOGENE V SYNECHOCYSTIS SA BUDE ANALYZOVAŤ, KTORÁ SA VYSKYTUJE S UHLÍKOM FIXOVANÝM V TÝCHTO MUTANTOCH ZA NORMÁLNYCH PODMIENOK KULTIVÁCIE VERZUS PODMIENKY NEDOSTATKU DUSÍKA. BUDEME ANALYZOVAŤ, AKO REDOXNÝ ŠTÁT ZASAHUJE DO AKUMULÁCIE PEVNÉHO UHLÍKA POMOCOU MUTANTOV, KTORÉ NIE SÚ SCHOPNÉ SYNTETIZOVAŤ GLUCOGENE. BUDE SA ANALYZOVAŤ, PRETOŽE TIETO MUTANTY NIE SÚ SCHOPNÉ VYKONAŤ PROCES BIELENIA BEZ ZDROJA DUSÍKA V POROVNANÍ S DIVOKÝM KMEŇOM. STANOVÍ SA AJ PRETO, ŽE MUTANTY BEZ GLUCOGENE SYNTÁZY, ALE OBSAHUJÚCE ENZÝM ADP-GLUKÓZA PYROFOSFORYLÁZY, NIE SÚ REALIZOVATEĽNÉ. _x000D_ 3. VNÍMANIE KOVOV A REDOXNÝ STAV. MEĎOU SPROSTREDKOVANÝ SYSTÉM VÝMENY EXPRESIE GÉNOV PLASTOKYANÍNU (PETE) A CYTOCHRÓMU C6 (PETJ) SA DEŠIFRUJE POMOCOU MUTANTOV, KTORÉ PREDSTAVUJÚ ZMENU V SYSTÉME VNÍMANIA MEDI. V SÚČASNOSTI NEEXISTUJÚ ŽIADNE ÚDAJE, KTORÉ BY VYVODZOVALI PRÍSLUŠNÉ TRANSKRIPČNÉ FAKTORY ALEBO ICH POVAHU AKO AKTIVÁTOROV/REPRESOROV. OKREM TOHO SA BUDE ANALYZOVAŤ ŠPECIFICKOSŤ TOHTO SYSTÉMU, POKIAĽ IDE O PRÍTOMNOSŤ INÝCH KOVOV, KTORÉ MENIA EXPRESIU TÝCHTO GÉNOV. NAKONIEC URČÍME, AKO SYSTÉM REAGUJE V PODMIENKACH OXIDAČNÉHO STRESU SPROSTREDKOVANÉHO PEROXIDOM VODÍKA. (Slovak)
17 August 2022
0 references
SA TIONSCADAL SEO, TABHARFAR AGHAIDH AR AN GCAOI A BHFUIL PRÓISIS ASAMHLAITHE NÍTRIGINE, CARBÓIN NÓ MIOTAL AMHAIL COPAR MAR CHOINNÍOLL LEIS AN GCUR ISTEACH A DHÉANANN AN STÁT REDOX CEALLACH ORTHU, TRÍ CHOMHDHÚILE MEITIBILEACHA SONRACHA, AMHAIL OXIACIDOS 2-OCSAIGLÚTARÁIT NÓ PIRLÍOCHT NÓ TRÍ OCSAÍDIÚ/LAGHDÚ A DHÉANAMH AR ROINNT PRÓITÉINÍ A DHÉANANN IDIRGHABHÁIL AR AN BPRÓISEAS RIALACHÁIN SEO. CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR NA PRÓISIS ÚSÁIDIMID AN CYANOBACTERIA AON-CHILL SYNECHOCYSTIS SP MAR ORGÁNACH MÚNLA. PCC 6803. MAIDIR LEIS AN TIONSCADAL ROIMHE SEO (BFU2010-15708) TÁ GNÉITHE LEANÚNACHAIS AG AN TOGRA SEO AGUS GNÉITHE EILE ATÁ NUA. CHUN AN PLEAN OIBRE SEO A CHUR I GCRÍCH, TÓGADH CEALLRAÍ DE THRÉITHCHINEÁLACHA MUTANT DEN CHIANOBACTERIA SEO SA TIONSCADAL ROIMHE SEO. SNA CÁSANNA SEO, IS FÉIDIR AN STÁIT REDOX CHEALLACHA SEO A ATHRÚ, TRÍ CHOSAINT NÍOS ÍSLE I GCOINNE COMHDHÚILE A CHRUTHAÍONN STRUS OCSAÍDIÚCHÁIN SA CHILL, TRÍ ATHRUITHE A DHÉANAMH AR PHRÓISIS ASAMHLAITHE NÍTRIGINE NÓ CARBÓIN, NÓ I GCÁSANNA EILE TRÍ ÍOGAIREACHT NÍOS MÓ A CHUR I LÁTHAIR MIOTAIL. Ba mhaith leis an Tionscadal Bí ar an leathanach seo chugainn: _x000D_ 1. CUR ISTEACH AR LEIBHÉIL 2-OXOGLUTARÁIT, DÉANFAR AN BRAITEOIR STÁIT C/N A CHINNEADH CONAS A BHEIDH TIONCHAR AG GNÍOMHAÍOCHT SPEICEAS OCSAIGIN IMOIBRÍOCH ÉAGSÚIL, GO HÁIRITHE SÁROCSAÍD HIDRIGINE, AR NA GÉINTE A BHAINEANN LE COMHSHAMHLÚ NÍTRIGINE I SYNECHOCYSTIS. TUGANN TORTHAÍ ROIMHE SEO LE FIOS GO N-ATHRAÍONN AN COMHDHÚIL SEO LEIBHÉIL 2-OXOGLUTARATE AGUS DÁ BHRÍ SIN GO GCUIREANN SÉ ISTEACH AR LÉIRIÚ GENIC TRÍ CHOMHARTHAÍOCHT TRÍ MHEÁN NTCA. BEIDH LEIBHÉIL MEITIBILÍTÍ ÉAGSÚLA AGUS LEIBHÉIL EINSÍMÍ COSÚIL LE GLUTAMINE SYNTHETASE MAR THAGAIRT DO CHUR ISTEACH. DÉANFAIDH SÉ ANAILÍS FREISIN AR ÉIFEACHT AN STÁIT REDOX CHEALLACHA AR NA PRÓISIS A DHÍORTHAÍTEAR ÓN EASPA FOINSE NÍTRIGINE, GO HÁIRITHE ATHCHÚRSÁIL NÍTRIGINE ATÁ IN FICOBILIPROTEINS, PRÓISEAS AR A DTUGTAR TUARADH. _x000D_ 2. CARNADH CARBÓIN A ATHRÚ. AG BAINT ÚSÁIDE AS NA MUTANTS ÉAGSÚLA A TÓGADH GAN GLUCOGENE I SYNECHOCYSTIS, DÉANFAR ANAILÍS AIR A THARLAÍONN LEIS AN CARBÓN ATÁ SOCRAITHE SNA MUTANTS SEO, FAOI GHNÁTHCHOINNÍOLLACHA SAOTHRAITHE I GCOMPARÁID LE COINNÍOLLACHA EASNAIMH NÍTRIGINE. DÉANFAIMID ANAILÍS AR AN GCAOI A GCUIREANN AN STÁT REDOX ISTEACH AR CHARNADH CARBÓIN SHEASTA, AG BAINT ÚSÁIDE AS MUTANTS NACH FÉIDIR LEO GLUCOGENE A SHINTÉISIÚ. DÉANFAR ANAILÍS AIR TOISC NACH BHFUIL NA MUTANTS SEO IN ANN AN PRÓISEAS TUARADH A DHÉANAMH IN ÉAGMAIS FOINSE NÍTRIGINE I GCOMPARÁID LEIS AN MBRÚ FIÁIN. CINNFEAR FREISIN TOISC NACH BHFUIL SÉ INDÉANTA MUTANTS DE SYNTHASE GLUCOGENE, ACH INA BHFUIL AN EINSÍM ADP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE. _x000D_ 3. DEARCADH AR MHIOTAIL AGUS STÁDAS REDOX. TÁ AN CÓRAS MALARTAITHE LÉIRITHE COPAIR DE GHÉINTE PLASTOCYANIN (PETE) AGUS CÍTECRÓM C6 (PETJ) DÍBRITHE AG BAINT ÚSÁIDE AS MUTANTS A DHÉANANN ATHRÚ AR AN GCÓRAS BRAISTINTE COPAIR. NÍL AON SONRAÍ ANN FAOI LÁTHAIR CHUN CUR SÍOS A DHÉANAMH AR NA TOSCA TRAS-SCRÍOFA ATÁ I GCEIST, NÓ AR A GCINEÁL MAR GHNÍOMHRÓIRÍ/REPRESSORS. INA THEANNTA SIN, DÉANFAR ANAILÍS AR SHAINIÚLACHT AN CHÓRAIS SEO MAIDIR LE MIOTAIL EILE A BHEITH ANN A ATHRAÍONN LÉIRIÚ NA NGÉINTE SEO. AR DEIREADH, DÉANFAIMID AMACH CONAS A FHREAGRAÍONN AN CÓRAS I NDÁLAÍ STRUIS OCSAÍDIÚCHÁIN A DHÉANTAR TRÍ SHÁROCSAÍD HIDRIGINE. (Irish)
17 August 2022
0 references
V RÁMCI TOHOTO PROJEKTU SE BUDE ZABÝVAT TÍM, JAK JSOU PROCESY ASIMILACE DUSÍKU, UHLÍKU NEBO KOVŮ, JAKO JE MĚĎ, PODMÍNĚNY INTERFERENCÍ, KTEROU V NICH VYTVÁŘÍ BUNĚČNÝ REDOXNÍ STÁT, PROSTŘEDNICTVÍM SPECIFICKÝCH METABOLICKÝCH SLOUČENIN, JAKO JE OXIACIDOS 2-OXOGLUTARÁT NEBO PYRUVAT, NEBO PROSTŘEDNICTVÍM OXIDACE/REDUKCE NĚKTERÝCH PROTEINŮ, KTERÉ TENTO PROCES NAŘÍZENÍ ZPROSTŘEDKOVÁVAJÍ. KE STUDIU TĚCHTO PROCESŮ POUŽÍVÁME JEDNOBUNĚČNÉ SINICE SYNECHOCYSTIS SP JAKO MODELOVÝ ORGANISMUS. PCC 6803. V SOUVISLOSTI S PŘEDCHOZÍM PROJEKTEM (BFU2010–15708) MÁ TENTO NÁVRH ASPEKTY KONTINUITY A DALŠÍ ASPEKTY, KTERÉ JSOU NOVÉ. K PROVEDENÍ TOHOTO PRACOVNÍHO PLÁNU BYLA V PŘEDCHOZÍM PROJEKTU POSTAVENA BATERIE MUTANTNÍCH KMENŮ SINIC. V TĚCHTO PŘÍPADECH MŮŽE BÝT TENTO BUNĚČNÝ REDOXNÍ STAV ZMĚNĚN BUĎ NIŽŠÍ OBRANOU PROTI SLOUČENINÁM, KTERÉ ZPŮSOBUJÍ OXIDAČNÍ STRES V BUŇCE, ZMĚNAMI V PROCESECH ASIMILACE DUSÍKU NEBO UHLÍKU, NEBO V JINÝCH PŘÍPADECH VĚTŠÍ CITLIVOSTÍ NA PŘÍTOMNOST KOVŮ. Projektové OBJEKTIVY budou NEXT:_x000D_ 1. INTERFERENCE PŘI HLADINÁCH 2-OXOGLUTARÁTU, C/N STATE SENZOR SE URČÍ, JAK JSOU GENY ZAPOJENÉ DO ASIMILACE DUSÍKU V SYNECHOCYSTIS OVLIVNĚNY PŮSOBENÍM RŮZNÝCH REAKTIVNÍCH DRUHŮ KYSLÍKU, ZEJMÉNA PEROXIDU VODÍKU. PŘEDCHOZÍ VÝSLEDKY NAZNAČUJÍ, ŽE TATO SLOUČENINA MĚNÍ HLADINU 2-OXOGLUTARÁTU A TÍM INTERFERUJE DO GENOVÉ EXPRESE PROSTŘEDNICTVÍM NTCA ZPROSTŘEDKOVANÉHO ZNAČENÍ. JAKO REFERENČNÍ HODNOTA PRO INTERFERENCI BUDOU SLOUŽIT HLADINY RŮZNÝCH METABOLITŮ A ENZYMŮ, JAKO JE GLUTAMIN-SYNTETÁZA. BUDE ROVNĚŽ ANALYZOVAT VLIV BUNĚČNÉHO REDOXNÍHO STÁTU NA PROCESY ODVOZENÉ Z NEDOSTATKU ZDROJE DUSÍKU, ZEJMÉNA NA RECYKLACI DUSÍKU OBSAŽENÉHO V FICOBILIPROTEINS, COŽ JE PROCES ZNÁMÝ JAKO BĚLENÍ. _x000D_ 2. ZMĚNA AKUMULACE UHLÍKU. S POUŽITÍM RŮZNÝCH MUTANTŮ VYTVOŘENÝCH BEZ GLUCOGENE V SYNECHOCYSTIS BUDE ANALYZOVÁNO, KE KTERÉMU DOCHÁZÍ S UHLÍKEM UPEVNĚNÝM V TĚCHTO MUTANTECH, ZA NORMÁLNÍCH PODMÍNEK KULTIVACE VERSUS NEDOSTATKU DUSÍKU. BUDEME ANALYZOVAT, JAK REDOX STATE ZASAHUJE DO AKUMULACE PEVNÉHO UHLÍKU, POMOCÍ MUTANTŮ, KTERÉ NEJSOU SCHOPNY SYNTETIZOVAT GLUCOGENE. BUDE ANALYZOVÁNA, PROTOŽE TITO MUTANTI NEJSOU SCHOPNI PROVÉST BĚLENÍ BEZ ZDROJE DUSÍKU VE SROVNÁNÍ S DIVOKÝM KMENEM. ROVNĚŽ SE STANOVÍ, ŽE MUTANTY BEZ GLUCOGENE SYNTÁZY, ALE OBSAHUJÍCÍ ENZYM ADP-GLUKOSY PYROFOSFORYLÁZY, NEJSOU PROVEDITELNÉ. _x000D_ 3. VNÍMÁNÍ KOVŮ A STATUS REDOXU. SYSTÉM VÝMĚNY EXPRESE ZPROSTŘEDKOVANÉ MĚDÍ GENŮ PLASTOCYANINU (PETE) A CYTOCHROMU C6 (PETJ) JE DEŠIFROVÁN POMOCÍ MUTANTŮ, KTERÉ PŘEDSTAVUJÍ ZMĚNU SYSTÉMU VNÍMÁNÍ MĚDI. V SOUČASNÉ DOBĚ NEJSOU K DISPOZICI ŽÁDNÉ ÚDAJE, KTERÉ BY UMOŽŇOVALY ODVODIT PŘÍSLUŠNÉ TRANSKRIPČNÍ FAKTORY NEBO JEJICH POVAHU AKTIVÁTORŮ/REPRESORŮ. KROMĚ TOHO BUDE ANALYZOVÁNA SPECIFIČNOST TOHOTO SYSTÉMU S OHLEDEM NA PŘÍTOMNOST JINÝCH KOVŮ, KTERÉ MĚNÍ EXPRESI TĚCHTO GENŮ. NAKONEC URČÍME, JAK SYSTÉM REAGUJE V PODMÍNKÁCH OXIDAČNÍHO STRESU ZPROSTŘEDKOVANÉHO PEROXIDEM VODÍKU. (Czech)
17 August 2022
0 references
NESTE PROJETO SERÁ ABORDADO COMO OS PROCESSOS DE ASSIMILAÇÃO DE NITROGÊNIO, CARBONO OU METAIS COMO O COBRE SÃO CONDICIONADOS PELA INTERFERÊNCIA PRODUZIDA NELES PELO ESTADO REDOX TELEMÓVEL, ATRAVÉS DE COMPOSTOS METABÓLICOS ESPECÍFICOS, COMO O OXIACIDOS 2-OXOGLUTARATO OU PIRUVATO OU ATRAVÉS DA OXIDAÇÃO/REDUÇÃO DE ALGUMAS PROTEÍNAS QUE MEDIAM ESTE PROCESSO DE REGULAMENTAÇÃO. PARA ESTUDAR ESSES PROCESSOS UTILIZAMOS A CIANOBACTÉRIA MONOCELULAR SYNECHOCYSTIS SP COMO UM ORGANISMO MODELO. PCC 6803. EM RELAÇÃO AO PROJETO ANTERIOR (BFU2010-15708), A PRESENTE PROPOSTA APRESENTA ASPETOS DE CONTINUIDADE E OUTROS NOVOS. PARA REALIZAR ESTE PLANO DE TRABALHO, UMA PILHA DE CEPAS MUTANTES DESTA CIANOBACTÉRIAS FORAM CONSTRUÍDAS NO PROJETO ANTERIOR. NESSES, ESSE ESTADO REDOX TELEMÓVEL PODE SER ALTERADO, SEJA POR UMA MAIS PEQUENO DEFESA CONTRA COMPOSTOS QUE CAUSAM ESTRESSE OXIDATIVO NA CÉLULA, POR ALTERAÇÕES NOS PROCESSOS DE ASSIMILAÇÃO DE NITROGÊNIO OU CARBONO, OU, EM OUTROS CASOS, POR APRESENTAR MAIOR SENSIBILIDADE À PRESENÇA DE METAIS. Os objetivos do projeto serão os próximos:_x000D_ 1. INTERFERÊNCIA NOS NÍVEIS DE 2-OXOGLUTARATO, O SENSOR DE ESTADO C/N SERÁ DETERMINADO COMO OS GENES ENVOLVIDOS NA ASSIMILAÇÃO DE NITROGÊNIO EM SYNECHOCYSTIS SÃO AFETADOS PELA AÇÃO DE DIFERENTES ESPÉCIES REATIVAS DE OXIGÊNIO, ESPECIALMENTE PERÓXIDO DE HIDROGÊNIO. RESULTADOS ANTERIORES SUGEREM QUE ESTE COMPOSTO ALTERA OS NÍVEIS DE 2-OXOGLUTARATO E, ASSIM, INTERFERE NA EXPRESSÃO GÊNICA ATRAVÉS DA SINALIZAÇÃO MEDIADA PELO NTCA. OS NÍVEIS DE DIFERENTES METABOLITOS E NÍVEIS ENZIMÁTICOS, COMO A GLUTAMINA SINTETASE, SERVIRÃO DE REFERÊNCIA PARA A INTERFERÊNCIA. ELE TAMBÉM ANALISARÁ O EFEITO DO ESTADO REDOX TELEMÓVEL SOBRE OS PROCESSOS DERIVADOS DA FALTA DE FONTE DE NITROGÊNIO, ESPECIALMENTE A RECICLAGEM DE NITROGÊNIO CONTIDO EM FICOBILIPROTEINS, UM PROCESSO CONHECIDO COMO BRANQUEAMENTO. _x000D_ 2. ALTERAÇÃO DA ACUMULAÇÃO DE CARBONO. UTILIZANDO OS DIFERENTES MUTANTES CONSTRUÍDOS SEM GLUCOGENE EM SYNECHOCYSTIS, SERÁ ANALISADO QUE OCORRE COM O CARBONO FIXADO NESSES MUTANTES, EM CONDIÇÕES NORMAIS DE CULTIVO VERSUS CONDIÇÕES DE DEFICIÊNCIA DE NITROGÊNIO. ANALISAREMOS COMO O ESTADO REDOX INTERFERE NO ACÚMULO DE CARBONO FIXO, USANDO MUTANTES INCAPAZES DE SINTETIZAR GLUCOGENE. SERÁ ANALISADA PORQUE ESTES MUTANTES SÃO INCAPAZES DE REALIZAR O PROCESSO DE BRANQUEAMENTO NA AUSÊNCIA DE UMA FONTE DE AZOTO EM COMPARAÇÃO COM A ESTIRPE SELVAGEM. TAMBÉM SERÁ DETERMINADO PORQUE OS MUTANTES DESPROVIDOS DE GLUCOGENE SINTASE, MAS CONTENDO A ENZIMA ADP-GLUCOSE PIROFOSFORILASE, NÃO SÃO VIÁVEIS. _x000D_ 3. PERCEÇÃO DE METAIS E STATUS REDOX. O SISTEMA DE TROCA DE EXPRESSÃO MEDIADO PELO COBRE DOS GENES DA PLASTOCIANINA (PETE) E DO CITOCROMO C6 (PETJ) É DECIFRADO USANDO MUTANTES QUE APRESENTAM UMA ALTERAÇÃO NO SISTEMA DE PERCEÇÃO DE COBRE. ATUALMENTE, NÃO EXISTEM DADOS PARA INFERIR OS FATORES TRANSCRICIONAIS ENVOLVIDOS, OU SUA NATUREZA COMO ATIVADORES/REPRESSORES. ALÉM DISSO, SERÁ ANALISADA A ESPECIFICIDADE DESSE SISTEMA EM RELAÇÃO À PRESENÇA DE OUTROS METAIS QUE ALTERAM A EXPRESSÃO DESSES GENES. FINALMENTE, DETERMINAREMOS COMO O SISTEMA RESPONDE EM CONDIÇÕES DE ESTRESSE OXIDATIVO MEDIADO POR PERÓXIDO DE HIDROGÊNIO. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
SELLES PROJEKTIS KÄSITLETAKSE SEDA, KUIDAS LÄMMASTIKU, SÜSINIKU VÕI METALLIDE, NÄITEKS VASE ASSIMILEERIMISE PROTSESSID ON TINGITUD RAKKUDE REDOKSOLEKUS TEKKIVATEST HÄIRETEST KONKREETSETE METABOOLSETE ÜHENDITE, NÄITEKS OXIACIDOS 2-OKSOGLUTARAADI VÕI PÜRUVAADI KAUDU, VÕI MÕNE VALGU OKSÜDEERIMISE/VÄHENDAMISE KAUDU, MIS SEDA MÄÄRUSE PROTSESSI VAHENDAB. NENDE PROTSESSIDE UURIMISEKS KASUTAME MUDELORGANISMINA ÜHERAKULIST TSÜANOBAKTERIT SYNECHOCYSTIS SP. PCC 6803. VÕRRELDES EELMISE PROJEKTIGA (BFU2010–15708) ON ETTEPANEKUL JÄRJEPIDEVUSE ASPEKTID JA MUUD UUDSED ASPEKTID. SELLE TÖÖPLAANI ELLUVIIMISEKS EHITATI EELMISES PROJEKTIS NENDE TSÜANOBAKTERITE MUTANTSETE TÜVEDE AKU. NENDE PUHUL VÕIB SEDA RAKU REDOKSOLEKUT MUUTA KAS MADALAMA KAITSEGA ÜHENDITE VASTU, MIS PÕHJUSTAVAD RAKUS OKSÜDATIIVSET STRESSI, LÄMMASTIKU VÕI SÜSINIKU ASSIMILATSIOONIPROTSESSIDE MUUTMISEGA VÕI MUUDEL JUHTUDEL SUUREMA TUNDLIKKUSEGA METALLIDE OLEMASOLU SUHTES. Projekti OBJEKTIVID NEXT:_x000D_ 1. SEGAV 2-OKSOGLUTRAADI TASE, C/N STATE SENSOR MÄÄRATAKSE, KUIDAS MÕJUTAB LÄMMASTIKU ASSIMILATSIOONI GEENID SYNECHOCYSTIS ERINEVATE REAKTIIVSETE HAPNIKULIIKIDE, ERITI VESINIKPEROKSIIDI TOIMEL. VARASEMAD TULEMUSED NÄITAVAD, ET SEE ÜHEND MUUDAB 2-OKSOGLUTRAADI TASET JA HÄIRIB SEEGA GEENSET EKSPRESSIOONI NTCA VAHENDATUD MÄRGISTUSTE KAUDU. ERINEVATE METABOLIITIDE JA ENSÜÜMIDE, NÄITEKS GLUTAMIINI SÜNTETAASI TASEMED ON HÄIRETASEMED. SAMUTI ANALÜÜSITAKSE RAKU REDOKSOLEKU MÕJU LÄMMASTIKUALLIKA PUUDUMISEST TULENEVATELE PROTSESSIDELE, EELKÕIGE FICOBILIPROTEINS-IS SISALDUVA LÄMMASTIKU RINGLUSSEVÕTULE, MIDA TUNTAKSE PLEEGITAMISENA. _x000D_ 2. SÜSINIKU KOGUNEMISE MUUTMINE. KASUTADES ERINEVAID MUTAANTE, MIS ON EHITATUD ILMA GLUCOGENETA SYNECHOCYSTIS’ES, ANALÜÜSITAKSE, ET NENDE MUTANTIDE SÜSINIK ON NORMAALSETES KULTIVEERIMISTINGIMUSTES JA LÄMMASTIKUPUUDUSE TINGIMUSTES. ANALÜÜSIME, KUIDAS REDOKSRIIK SEKKUB FIKSEERITUD SÜSINIKU KOGUNEMISSE, KASUTADES MUTANTE, MIS EI SUUDA GLUCOGENET SÜNTEESIDA. SEDA ANALÜÜSITAKSE, SEST NEED MUTANDID EI SUUDA TEHA PLEEGITAMIST LÄMMASTIKUALLIKA PUUDUMISEL VÕRRELDES LOODUSLIKU TÜVEGA. SEE MÄÄRATAKSE KA SEETÕTTU, ET MUTANDID, MILLEL PUUDUB GLUCOGENE SÜNTAASI, KUID MIS SISALDAVAD ENSÜÜMI ADP-GLÜKOOSI PÜROFOSFORÜLAASI, EI OLE TEOSTATAVAD. _x000D_ 3. METALLIDE TAJUMINE JA REDOKSSTAATUS. PLASTOTSÜANIINI (PETE) JA TSÜTOKROOM C6 (PETJ) GEENIDE VASEVAHENDATUD EKSPRESSIOONIVAHETUSSÜSTEEM DEŠIFREERITAKSE MUTANTIDE ABIL, MIS MUUDAVAD VASE TAJUSÜSTEEMI. PRAEGU PUUDUVAD ANDMED, MIS VÕIMALDAKSID TULETADA ASJASSEPUUTUVAID TRANSKRIPTSIOONITEGUREID VÕI NENDE OLEMUST AKTIVAATORITENA/REPRESSORITENA. LISAKS ANALÜÜSITAKSE SELLE SÜSTEEMI SPETSIIFILISUST TEISTE METALLIDE OLEMASOLU SUHTES, MIS MUUDAVAD NENDE GEENIDE EKSPRESSIOONI. LÕPUKS ME KINDLAKS, KUIDAS SÜSTEEM REAGEERIB TINGIMUSTES OKSÜDATIIVNE STRESS VAHENDATUD VESINIKPEROKSIID. (Estonian)
17 August 2022
0 references
EBBEN A PROJEKTBEN AZT VIZSGÁLJÁK, HOGY A NITROGÉN, A SZÉN VAGY A FÉMEK, PÉLDÁUL A RÉZ ASSZIMILÁCIÓS FOLYAMATAIT HOGYAN KONDICIONÁLJÁK A CELLULÁRIS REDOX ÁLLAPOT ÁLTAL ELŐIDÉZETT INTERFERENCIA, BIZONYOS ANYAGCSERE-VEGYÜLETEK, MINT PÉLDÁUL AZ OXIACIDOS 2-OXOGLUTARÁT VAGY PIRUVÁT, VAGY A RENDELETI FOLYAMATOT KÖZVETÍTŐ EGYES FEHÉRJÉK OXIDÁCIÓJA/CSÖKKENTÉSE RÉVÉN. EZEKNEK A FOLYAMATOKNAK A TANULMÁNYOZÁSÁHOZ A SYNECHOCYSTIS SP EGYSEJTŰ CIANOBAKTÉRIUMOT HASZNÁLJUK MODELLSZERVEZETKÉNT. PCC 6803. AZ ELŐZŐ PROJEKTTEL (BFU2010–15708) KAPCSOLATBAN EZ A JAVASLAT FOLYTONOSSÁGI ÉS EGYÉB, ÚJSZERŰ SZEMPONTOKAT TARTALMAZ. ENNEK A MUNKATERVNEK A VÉGREHAJTÁSÁHOZ A CIANOBAKTÉRIUMOK MUTÁNS TÖRZSEINEK AKKUMULÁTORA ÉPÜLT AZ ELŐZŐ PROJEKTBEN. EZEKBEN, EZ A CELLULÁRIS REDOX ÁLLAPOT MEGVÁLTOZTATHATÓ, VAGY EGY ALACSONYABB VÉDELEM A VEGYÜLETEKKEL SZEMBEN, AMELYEK OXIDATÍV STRESSZT OKOZNAK A SEJTBEN, A NITROGÉN VAGY SZÉN ASSZIMILÁCIÓS FOLYAMATAINAK MEGVÁLTOZTATÁSÁVAL, VAGY MÁS ESETEKBEN A FÉMEK JELENLÉTÉRE VALÓ NAGYOBB ÉRZÉKENYSÉGGEL. A projekt CÉLKITŰZÉSEK A NEXT:_x000D_ 1. A 2-OXOGLUTARÁT-SZINTEK INTERFERENCIÁJA, A C/N ÁLLAPOTÉRZÉKELŐ MEGHATÁROZZA, HOGY A SYNECHOCYSTIS NITROGÉN ASSZIMILÁCIÓJÁBAN RÉSZT VEVŐ GÉNEKET HOGYAN BEFOLYÁSOLJA A KÜLÖNBÖZŐ REAKTÍV OXIGÉNFAJOK, KÜLÖNÖSEN A HIDROGÉN-PEROXID HATÁSA. A KORÁBBI EREDMÉNYEK ARRA UTALNAK, HOGY EZ A VEGYÜLET MEGVÁLTOZTATJA A 2-OXOGLUTARÁT SZINTJÉT, ÉS ÍGY AZ NTCA ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELZÉSEKEN KERESZTÜL GÁTOLJA A GÉN EXPRESSZIÓT. A KÜLÖNBÖZŐ METABOLITOK ÉS ENZIMSZINTEK, PÉLDÁUL A GLUTAMIN-SZINTETÁZ SZINTJE REFERENCIAKÉNT SZOLGÁL AZ INTERFERENCIA SZEMPONTJÁBÓL. ELEMZI TOVÁBBÁ A CELLULÁRIS REDOX ÁLLAPOTNAK A NITROGÉNFORRÁS HIÁNYÁBÓL SZÁRMAZÓ FOLYAMATOKRA GYAKOROLT HATÁSÁT, KÜLÖNÖSEN A FEHÉRÍTÉS NÉVEN ISMERT FICOBILIPROTEINS-BEN TALÁLHATÓ NITROGÉN ÚJRAHASZNOSÍTÁSÁT. _x000D_ 2. A SZÉNFELHALMOZÓDÁS MEGVÁLTOZÁSA. A SYNECHOCYSTIS-BAN GLUCOGENE NÉLKÜL KIALAKÍTOTT KÜLÖNBÖZŐ MUTÁNSOK FELHASZNÁLÁSÁVAL ELEMEZNI KELL, HOGY AZ EZEKBEN A MUTÁNSOKBAN RÖGZÍTETT SZÉNNEL, NORMÁL TERMESZTÉSI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT VAGY NITROGÉNHIÁNYOS KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT FORDUL ELŐ. ELEMEZNI FOGJUK, HOGY A REDOX ÁLLAM HOGYAN AVATKOZIK BE A RÖGZÍTETT SZÉN FELHALMOZÓDÁSÁBA, OLYAN MUTÁNSOKAT HASZNÁLVA, AMELYEK NEM KÉPESEK SZINTETIZÁLNI A GLUCOGENE-T. ELEMEZNI KELL, MERT EZEK A MUTÁNSOK NEM TUDJÁK ELVÉGEZNI A FEHÉRÍTÉSI FOLYAMATOT NITROGÉNFORRÁS HIÁNYÁBAN A VADON ÉLŐ TÖRZSHÖZ KÉPEST. AZT IS MEG KELL HATÁROZNI, MERT A GLUCOGENE-SZINTÁZT NEM TARTALMAZÓ, DE AZ ADP-GLÜKÓZ PIROFOSZFORILÁZ ENZIMET TARTALMAZÓ MUTÁNSOK NEM MEGVALÓSÍTHATÓK. _x000D_ 3. FÉMEK ÉSZLELÉSE ÉS REDOX ÁLLAPOT. A PLASTOCIANIN (PETE) ÉS A CITOKRÓM C6 (PETJ) GÉNJEINEK RÉZ-MEDIÁLT EXPRESSZIÓS CSERERENDSZERÉT A RÉZÉRZÉKELÉSI RENDSZERBEN VÁLTOZÁST MUTATÓ MUTÁNSOK SEGÍTSÉGÉVEL FEJTIK KI. JELENLEG NINCSENEK OLYAN ADATOK, AMELYEK ALAPJÁN LE LEHETNE VONNI A TRANSZKRIPCIÓS TÉNYEZŐKET VAGY AZOK AKTIVÁTORKÉNT/REPRESSZORKÉNT VALÓ JELLEGÉT. EZEN TÚLMENŐEN ELEMEZNI KELL A RENDSZER SAJÁTOSSÁGAIT MÁS OLYAN FÉMEK JELENLÉTE TEKINTETÉBEN, AMELYEK MEGVÁLTOZTATJÁK E GÉNEK KIFEJEZŐDÉSÉT. VÉGÜL MEGHATÁROZZUK, HOGYAN REAGÁL A RENDSZER A HIDROGÉN-PEROXID ÁLTAL KÖZVETÍTETT OXIDATÍV STRESSZ ÁLLAPOTÁBAN. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
В ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ БЪДЕ РАЗГЛЕДАНО КАК ПРОЦЕСИТЕ НА АСИМИЛАЦИЯ НА АЗОТ, ВЪГЛЕРОД ИЛИ МЕТАЛИ КАТО МЕДТА СЕ ОБУСЛАВЯТ ОТ ИНТЕРФЕРЕНЦИЯТА, ПОЛУЧЕНА В ТЯХ ОТ КЛЕТЪЧНОТО РЕДУКЦИОННО СЪСТОЯНИЕ, ЧРЕЗ СПЕЦИФИЧНИ МЕТАБОЛИТНИ СЪЕДИНЕНИЯ, КАТО OXIACIDOS 2-ОКСОГЛУТАРАТ ИЛИ ПИРУВАТ, ИЛИ ЧРЕЗ ОКИСЛЯВАНЕ/НАМАЛЯВАНЕ НА НЯКОИ ПРОТЕИНИ, КОИТО ПОСРЕДНИЧАТ ЗА ТОЗИ ПРОЦЕС НА РЕГУЛИРАНЕ. ЗА ДА ИЗСЛЕДВАМЕ ТЕЗИ ПРОЦЕСИ, ИЗПОЛЗВАМЕ ЕДНОКЛЕТЪЧНИТЕ ЦИАНОБАКТЕРИИ SYNECHOCYSTIS SP КАТО МОДЕЛЕН ОРГАНИЗЪМ. PCC 6803. ПО ОТНОШЕНИЕ НА ПРЕДИШНИЯ ПРОЕКТ (BFU2010—15708) ТОВА ПРЕДЛОЖЕНИЕ ИМА АСПЕКТИ НА ПРИЕМСТВЕНОСТТА И ДРУГИ, КОИТО СА НОВИ. ЗА ИЗПЪЛНЕНИЕТО НА ТОЗИ РАБОТЕН ПЛАН В ПРЕДИШНИЯ ПРОЕКТ СА ПОСТРОЕНИ БАТЕРИИ ОТ МУТАНТНИ ЩАМОВЕ НА ТЕЗИ ЦИАНОБАКТЕРИИ. В ТЯХ ТОЗИ КЛЕТЪЧЕН РЕДОКС СЪСТОЯНИЕ МОЖЕ ДА БЪДЕ ПРОМЕНЕН ИЛИ ЧРЕЗ ПО-НИСКА ЗАЩИТА СРЕЩУ СЪЕДИНЕНИЯ, КОИТО ПРИЧИНЯВАТ ОКСИДАТИВЕН СТРЕС В КЛЕТКАТА, ЧРЕЗ ПРОМЕНИ В ПРОЦЕСИТЕ НА АСИМИЛАЦИЯ НА АЗОТ ИЛИ ВЪГЛЕРОД, ИЛИ В ДРУГИ СЛУЧАИ ЧРЕЗ ПО-ГОЛЯМА ЧУВСТВИТЕЛНОСТ КЪМ НАЛИЧИЕТО НА МЕТАЛИ. Целите на проекта ще бъдат NEXT:_x000D_ 1. ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ В НИВАТА НА 2-ОКСОГЛУТАРАТ, ЩЕ СЕ ОПРЕДЕЛИ КАК ГЕНИТЕ, УЧАСТВАЩИ В АЗОТНАТА АСИМИЛАЦИЯ В SYNECHOCYSTIS, СА ПОВЛИЯНИ ОТ ДЕЙСТВИЕТО НА РАЗЛИЧНИ РЕАКТИВНИ КИСЛОРОДНИ ВИДОВЕ, ОСОБЕНО ВОДОРОДЕН ПЕРОКСИД. ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ ПРЕДПОЛАГАТ, ЧЕ ТОВА СЪЕДИНЕНИЕ ПРОМЕНЯ НИВАТА НА 2-ОКСОГЛУТАРАТ И ПО ТОЗИ НАЧИН ВЛИЯЕ В ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ ЧРЕЗ NTCA-МЕДИИРАНА СИГНАЛИЗАЦИЯ. НИВАТА НА РАЗЛИЧНИ МЕТАБОЛИТИ И ЕНЗИМНИ НИВА, КАТО ГЛУТАМИН СИНТЕТАЗА, ЩЕ СЛУЖАТ КАТО ОТПРАВНА ТОЧКА ЗА ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ. ТОЙ СЪЩО ТАКА ЩЕ АНАЛИЗИРА ВЪЗДЕЙСТВИЕТО НА КЛЕТЪЧНОТО СЪСТОЯНИЕ НА РЕДОКС ВЪРХУ ПРОЦЕСИТЕ, ПОЛУЧЕНИ ОТ ЛИПСАТА НА ИЗТОЧНИК НА АЗОТ, ОСОБЕНО РЕЦИКЛИРАНЕТО НА АЗОТ, СЪДЪРЖАЩ СЕ ВЪВ FICOBILIPROTEINS, ПРОЦЕС, ИЗВЕСТЕН КАТО ИЗБЕЛВАНЕ. _x000D_ 2. ПРОМЯНА НА НАТРУПВАНЕТО НА ВЪГЛЕРОД. КАТО СЕ ИЗПОЛЗВАТ РАЗЛИЧНИТЕ МУТАНТИ, КОНСТРУИРАНИ БЕЗ GLUCOGENE В SYNECHOCYSTIS, ЩЕ СЕ АНАЛИЗИРА ТОВА, КОЕТО СЕ СЛУЧВА С ВЪГЛЕРОДА, ФИКСИРАН В ТЕЗИ МУТАНТИ, ПРИ НОРМАЛНИ УСЛОВИЯ НА КУЛТИВИРАНЕ СПРЯМО АЗОТЕН ДЕФИЦИТ. ЩЕ АНАЛИЗИРАМЕ КАК РЕДОКСЪТ СЕ НАМЕСВА В НАТРУПВАНЕТО НА ФИКСИРАН ВЪГЛЕРОД, ИЗПОЛЗВАЙКИ МУТАНТИ, КОИТО НЕ МОГАТ ДА СИНТЕЗИРАТ GLUCOGENE. ТОЙ ЩЕ БЪДЕ АНАЛИЗИРАН, ТЪЙ КАТО ТЕЗИ МУТАНТИ НЕ МОГАТ ДА ИЗВЪРШАТ ПРОЦЕСА НА ИЗБЕЛВАНЕ ПРИ ЛИПСА НА ИЗТОЧНИК НА АЗОТ В СРАВНЕНИЕ С ДИВИЯ ЩАМ. ТОЙ СЪЩО ТАКА ЩЕ БЪДЕ ОПРЕДЕЛЕН, ТЪЙ КАТО МУТАНТИ, ЛИШЕНИ ОТ GLUCOGENE СИНТАЗА, НО СЪДЪРЖАЩИ ЕНЗИМА ADP-ГЛЮКОЗЕН ПИРОФОСФОРИЛАЗА, НЕ СА ОСЪЩЕСТВИМИ. _x000D_ 3. ВЪЗПРИЕМАНЕ НА МЕТАЛИТЕ И РЕДОКС СТАТУС. МЕДНО-МЕДИИРАНАТА СИСТЕМА ЗА ОБМЕН НА ЕКСПРЕСИЯ НА ГЕНИТЕ НА ПЛАСТОЦИАНИН (PETE) И ЦИТОХРОМ C6 (PETJ) СЕ ДЕШИФРИРА С ПОМОЩТА НА МУТАНТИ, КОИТО ПРЕДСТАВЛЯВАТ ПРОМЯНА В СИСТЕМАТА ЗА ВЪЗПРИЯТИЕ НА МЕДТА. ПОНАСТОЯЩЕМ НЯМА ДАННИ, ВЪЗ ОСНОВА НА КОИТО ДА СЕ УСТАНОВЯТ ФАКТОРИТЕ ЗА ТРАНСКРИПЦИЯ ИЛИ ТЯХНОТО ЕСТЕСТВО КАТО АКТИВАТОРИ/РЕПРЕСОРИ. ОСВЕН ТОВА ЩЕ БЪДЕ АНАЛИЗИРАНА СПЕЦИФИКАТА НА ТАЗИ СИСТЕМА ПО ОТНОШЕНИЕ НА НАЛИЧИЕТО НА ДРУГИ МЕТАЛИ, КОИТО ПРОМЕНЯТ ЕКСПРЕСИЯТА НА ТЕЗИ ГЕНИ. НАКРАЯ ЩЕ ОПРЕДЕЛИМ КАК СИСТЕМАТА РЕАГИРА В УСЛОВИЯ НА ОКСИДАТИВЕН СТРЕС, МЕДИИРАН ОТ ВОДОРОДЕН ПЕРОКСИД. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
ŠIAME PROJEKTE BUS NAGRINĖJAMA, KAIP AZOTO, ANGLIES AR METALŲ, PVZ., VARIO, ĮSISAVINIMO PROCESUS SĄLYGOJA LĄSTELINĖS REDUKSO BŪSENOS, NAUDOJANT SPECIFINIUS METABOLINIUS JUNGINIUS, PVZ., OXIACIDOS 2-OKSOGLUTARATĄ AR PIRUVATĄ, ATSIRANDANTYS TRUKDŽIAI, ARBA OKSIDACIJOS IR (ARBA) MAŽINIMO METU, KURIE TARPININKAUJA ŠIAM REGLAMENTAVIMO PROCESUI. ŠIEMS PROCESAMS TIRTI NAUDOJAME VIENOS LĄSTELĖS CIANOBAKTERIJĄ SYNECHOCYSTIS SP KAIP PAVYZDINĮ ORGANIZMĄ. PCC 6803. KALBANT APIE ANKSTESNĮ PROJEKTĄ (BFU2010–15708), ŠIS PASIŪLYMAS TURI TĘSTINUMO IR KITŲ NAUJŲ ASPEKTŲ. SIEKIANT ĮGYVENDINTI ŠĮ DARBO PLANĄ, ANKSTESNIAME PROJEKTE BUVO PASTATYTA ŠIŲ MUTANTINIŲ PADERMIŲ CIANOBAKTERIJŲ BATERIJA. JUOSE ŠI LĄSTELIŲ REDUKSO BŪSENA GALI BŪTI PAKEISTA ARBA DĖL MAŽESNĖS APSAUGOS NUO JUNGINIŲ, KURIE SUKELIA OKSIDACINĮ STRESĄ LĄSTELĖJE, KEIČIANT AZOTO AR ANGLIES ĮSISAVINIMO PROCESUS, ARBA KITAIS ATVEJAIS PATEIKIANT DIDESNĮ JAUTRUMĄ METALŲ BUVIMUI. Projekto OBJECTIVAI bus NEXT:_x000D_ 1. TRUKDYMAS 2-OKSOGLUTARATO KIEKIUI, C/N VALSTYBINIS JUTIKLIS BUS NUSTATYTAS, KAIP GENAMS, DALYVAUJANTIEMS SINECHOCYSTIS AZOTO ASIMILIACIJOS PROCESE, VEIKIA ĮVAIRIŲ REAKTYVIŲJŲ DEGUONIES RŪŠIŲ, YPAČ VANDENILIO PEROKSIDO, VEIKIMAS. ANKSTESNI REZULTATAI RODO, KAD ŠIS JUNGINYS KEIČIA 2-OKSOGLUTARATO KONCENTRACIJĄ IR TAIP TRUKDO GENINEI EKSPRESIJAI PER NTCA VEIKIAMUS ŽENKLUS. ĮVAIRIŲ METABOLITŲ IR FERMENTŲ, PVZ., GLUTAMINO SINTETAZĖS, KIEKIAI BUS NAUDOJAMI KAIP TRUKDŽIŲ ATSKAITOS TAŠKAS. JI TAIP PAT ANALIZUOS LĄSTELIŲ REDUKSO BŪSENOS POVEIKĮ PROCESAMS, ATSIRANDANTIEMS DĖL AZOTO ŠALTINIO TRŪKUMO, YPAČ AZOTO, ESANČIO FICOBILIPROTEINS – PROCESE, VADINAMAME BALINIMU. _x000D_ 2. ANGLIES KAUPIMOSI POKYTIS. NAUDOJANT SKIRTINGUS MUTANTUS, PAGAMINTUS BE GLUCOGENE SYNECHOCYSTIS TIRPALE, BUS ANALIZUOJAMA, AR NORMALIOMIS AUGINIMO SĄLYGOMIS, PALYGINTI SU AZOTO TRŪKUMO SĄLYGOMIS, SUSIDARO ANGLIS, NUSTATYTA ŠIUOSE MUTANTUOSE. MES ANALIZUOSIME, KAIP REDOKSO VALSTYBĖ KIŠASI Į FIKSUOTŲ ANGLIES KAUPIMĄSI, NAUDODAMI MUTANTUS, KURIE NEGALI SINTETINTI GLUCOGENE. JIS BUS ANALIZUOJAMAS, NES ŠIE MUTANTAI NEGALI ATLIKTI BALINIMO PROCESO NESANT AZOTO ŠALTINIO, PALYGINTI SU LAUKINE PADERME. JIS TAIP PAT BUS NUSTATYTAS DĖL TO, KAD GLUCOGENE SINTAZĖS NETURINTYS MUTANTAI, KURIŲ SUDĖTYJE YRA FERMENTO ADP-GLIUKOZĖS PIROFOSFORYLAZĖS, YRA NEĮMANOMI. _x000D_ 3. METALO SUVOKIMAS IR REDOKSO BŪSENA. PLASTOCIANINO (PETE) IR CITOCHROMO C6 (PETJ) GENŲ IŠRAIŠKOS MAINŲ SISTEMA SU VARIU YRA IŠŠIFRUOTA NAUDOJANT MUTANTUS, KURIE KEIČIA VARIO SUVOKIMO SISTEMĄ. ŠIUO METU NĖRA DUOMENŲ, KURIAIS REMIANTIS BŪTŲ GALIMA DARYTI IŠVADĄ APIE TRANSKRIPCINIUS VEIKSNIUS ARBA JŲ, KAIP AKTYVATORIŲ IR (ARBA) REPRESORIŲ, POBŪDĮ. BE TO, BUS ANALIZUOJAMAS ŠIOS SISTEMOS SPECIFIŠKUMAS KITŲ METALŲ, KURIE KEIČIA ŠIŲ GENŲ EKSPRESIJĄ, BUVIMO ATŽVILGIU. GALIAUSIAI MES NUSTATYSIME, KAIP SISTEMA REAGUOJA OKSIDACINIO STRESO SĄLYGOMIS, KURIAS SĄLYGOJA VANDENILIO PEROKSIDAS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
U OVOM ĆE SE PROJEKTU RAZMOTRITI KAKO SE PROCESI ASIMILACIJE DUŠIKA, UGLJIKA ILI METALA KAO ŠTO JE BAKAR KONDICIONIRAJU INTERFERENCIJOM KOJU U NJIMA PROIZVODI STANIČNI REDOKS, PUTEM ODREĐENIH METABOLIČKIH SPOJEVA, KAO ŠTO SU OXIACIDOS 2-OKSOGLUTARAT ILI PIRUVAT ILI OKSIDACIJOM/SMANJENJEM NEKIH PROTEINA KOJI POSREDUJU OVIM POSTUPKOM UREDBE. ZA PROUČAVANJE TIH PROCESA KORISTIMO JEDNOSTANIČNI CIJANOBAKTERIJA SYNECHOCYSTIS SP KAO MODEL ORGANIZMA. PCC 6803. U ODNOSU NA PRETHODNI PROJEKT (BFU2010 – 15708) OVAJ PRIJEDLOG IMA ASPEKTE KONTINUITETA, A DRUGI SU NOVI. KAKO BI SE PROVEO OVAJ PLAN RADA, U PRETHODNOM PROJEKTU IZGRAĐENA JE BATERIJA MUTIRANIH SOJEVA OVE CIJANOBAKTERIJE. U TIM, OVAJ STANIČNI REDOKS STANJE MOŽE SE MIJENJATI, BILO MANJOM OBRANOM OD SPOJEVA KOJI UZROKUJU OKSIDATIVNI STRES U ĆELIJI, PROMJENAMA U PROCESIMA ASIMILACIJE DUŠIKA ILI UGLJIKA, ILI U DRUGIM SLUČAJEVIMA PREDSTAVLJAJUĆI VEĆU OSJETLJIVOST NA PRISUTNOST METALA. Projekt CILOVI će biti sljedeći:_x000D_ 1. INTERFERENCIJA U RAZINAMA 2-OKSOGLUTARATA, C/N STATE SENZOR ĆE SE ODREDITI KAKO GENI UKLJUČENI U ASIMILACIJU DUŠIKA U SYNECHOCYSTIS SU POGOĐENI DJELOVANJEM RAZLIČITIH REAKTIVNIH VRSTA KISIKA, POSEBNO VODIKOVOG PEROKSIDA. PRETHODNI REZULTATI UKAZUJU NA TO DA OVAJ SPOJ MIJENJA RAZINE 2-OKSOGLUTARATA I TAKO OMETA GENSKI IZRAZ KROZ ZNAKOVE POSREDOVANE NTCA-OM. RAZINE RAZLIČITIH METABOLITA I RAZINA ENZIMA KAO ŠTO JE SINTETAZA GLUTAMINA POSLUŽIT ĆE KAO REFERENCA ZA INTERFERENCIJU. TAKOĐER ĆE ANALIZIRATI UČINAK STANIČNOG REDOKS STANJA NA PROCESE KOJI PROIZLAZE IZ NEDOSTATKA IZVORA DUŠIKA, POSEBNO RECIKLIRANJE DUŠIKA SADRŽANOG U FICOBILIPROTEINS, POSTUPKU POZNATOM KAO IZBJELJIVANJE. _x000D_ 2. PROMJENA AKUMULACIJE UGLJIKA. KORISTEĆI RAZLIČITE MUTANTE IZGRAĐENE BEZ GLUCOGENE U SYNECHOCYSTISU, ANALIZIRAT ĆE SE ŠTO SE DOGAĐA S UGLJIKOM UTVRĐENIM U TIM MUTANTIMA, U NORMALNIM UVJETIMA UZGOJA U ODNOSU NA UVJETE NEDOSTATKA DUŠIKA. ANALIZIRAT ĆEMO KAKO REDOKS STANJE OMETA AKUMULACIJU FIKSNOG UGLJIKA, KORISTEĆI MUTANTE KOJI NE MOGU SINTETIZIRATI GLUCOGENE. ANALIZIRAT ĆE SE JER TI MUTANTI NE MOGU PROVESTI POSTUPAK IZBJELJIVANJA U ODSUTNOSTI IZVORA DUŠIKA U USPOREDBI S DIVLJIM SOJEM. UTVRDIT ĆE SE I ZATO ŠTO MUTANTI KOJI NEMAJU GLUCOGENE SINTAZU, ALI SADRŽE ENZIM ADP-GLUKOZNU PIROFOSFORILAZU, NISU IZVEDIVI. _x000D_ 3. PERCEPCIJA METALA I REDOKS STATUSA. SUSTAV EKSPRESIJSKE RAZMJENE POSREDOVANIH BAKROM GENA PLASTOCIJANINA (PETE) I CITOKROMA C6 (PETJ) DEŠIFRIRA SE POMOĆU MUTANATA KOJI PREDSTAVLJAJU PROMJENU U SUSTAVU PERCEPCIJE BAKRA. TRENUTAČNO NEMA PODATAKA NA TEMELJU KOJIH BI SE ZAKLJUČILI UKLJUČENI TRANSKRIPCIJSKI ČIMBENICI ILI NJIHOVA PRIRODA AKTIVATORA/REPRESORA. OSIM TOGA, ANALIZIRAT ĆE SE SPECIFIČNOST OVOG SUSTAVA S OBZIROM NA PRISUTNOST DRUGIH METALA KOJI MIJENJAJU EKSPRESIJU TIH GENA. KONAČNO ĆEMO ODREDITI KAKO SUSTAV REAGIRA U UVJETIMA OKSIDATIVNOG STRESA POSREDOVANOG VODIKOVIM PEROKSIDOM. (Croatian)
17 August 2022
0 references
I DETTA PROJEKT KOMMER DET ATT TAS UPP HUR PROCESSERNA FÖR ASSIMILERING AV KVÄVE, KOL ELLER METALLER SOM KOPPAR KONDITIONERAS AV DEN INTERFERENS SOM PRODUCERAS I DEM AV CELLREFORMENS TILLSTÅND, GENOM SPECIFIKA METABOLISKA FÖRENINGAR, SÅSOM OXIACIDOS 2-OXOGLUTARAT ELLER PYRUVAT ELLER GENOM OXIDATION/REDUKTION AV VISSA PROTEINER SOM FÖRMEDLAR DENNA REGLERINGSPROCESS. FÖR ATT STUDERA DESSA PROCESSER ANVÄNDER VI ENCELLSCYANOBAKTERIER SYNECHOCYSTIS SP SOM EN MODELLORGANISM. PCC 6803. I FÖRHÅLLANDE TILL DET TIDIGARE PROJEKTET (BFU2010–15708) HAR DETTA FÖRSLAG KONTINUITETSASPEKTER OCH ANDRA SOM ÄR NYA. FÖR ATT GENOMFÖRA DENNA ARBETSPLAN BYGGDES ETT BATTERI AV MUTANTA STAMMAR AV DENNA CYANOBAKTERIER I DET TIDIGARE PROJEKTET. I DESSA KAN DETTA CELLULÄRA REDOX TILLSTÅND ÄNDRAS, ANTINGEN GENOM ETT LÄGRE FÖRSVAR MOT FÖRENINGAR SOM ORSAKAR OXIDATIV STRESS I CELLEN, GENOM FÖRÄNDRINGAR I PROCESSERNA FÖR ASSIMILERING AV KVÄVE ELLER KOL, ELLER I ANDRA FALL GENOM ATT PRESENTERA EN STÖRRE KÄNSLIGHET FÖR FÖREKOMSTEN AV METALLER. Projektet kommer att bli nästa:_x000D_ 1. INTERFERENS I 2-OXOGLUTARATNIVÅER, C/N STATE SENSORN KOMMER ATT BESTÄMMAS HUR GENERNA SOM ÄR INVOLVERADE I KVÄVE ASSIMILERING I SYNECHOCYSTIS PÅVERKAS AV EFFEKTEN AV OLIKA REAKTIVA SYREARTER, SÄRSKILT VÄTEPEROXID. TIDIGARE RESULTAT TYDER PÅ ATT DENNA FÖRENING ÄNDRAR NIVÅER AV 2-OXOGLUTARAT OCH DÄRMED STÖR I GENIC UTTRYCK GENOM NTCA-MEDIERAD SKYLTNING. NIVÅER AV OLIKA METABOLITER OCH ENZYMNIVÅER SÅSOM GLUTAMINSYNTETAS KOMMER ATT FUNGERA SOM REFERENS FÖR INTERFERENS. DEN KOMMER OCKSÅ ATT ANALYSERA EFFEKTERNA AV DEN CELLULÄRA REDOXSTATEN PÅ DE PROCESSER SOM HÄRRÖR FRÅN BRISTEN PÅ KVÄVEKÄLLA, SÄRSKILT ÅTERVINNINGEN AV KVÄVE SOM INGÅR I FICOBILIPROTEINS, EN PROCESS SOM KALLAS BLEKNING. _x000D_ 2. ÄNDRING AV KOLACKUMULERING. MED HJÄLP AV DE OLIKA MUTANTER SOM KONSTRUERATS UTAN GLUCOGENE I SYNECHOCYSTIS, KOMMER DET ATT ANALYSERAS MED DET KOL SOM ÄR FAST I DESSA MUTANTER, UNDER NORMALA ODLINGSFÖRHÅLLANDEN KONTRA KVÄVEBRISTFÖRHÅLLANDEN. VI KOMMER ATT ANALYSERA HUR REDOXSTATEN PÅVERKAR ACKUMULERINGEN AV FAST KOL, MED HJÄLP AV MUTANTER SOM INTE KAN SYNTETISERA GLUCOGENE. DEN KOMMER ATT ANALYSERAS EFTERSOM DESSA MUTANTER INTE KAN UTFÖRA BLEKNINGSPROCESSEN I AVSAKNAD AV EN KVÄVEKÄLLA JÄMFÖRT MED DEN VILDA STAMMEN. DET KOMMER OCKSÅ ATT FASTSTÄLLAS EFTERSOM MUTANTER SOM SAKNAR GLUCOGENE-SYNTAS, MEN SOM INNEHÅLLER ENZYMET ADP-GLUKOSPYROFOSFORYLAS, INTE ÄR GENOMFÖRBARA. _x000D_ 3. UPPFATTNING AV METALLER OCH REDOXSTATUS. DET KOPPARMEDIERADE EXPRESSIONSUTBYTESSYSTEMET FÖR GENERNA AV PLASTOCYANIN (PETE) OCH CYTOKROM C6 (PETJ) DECHIFFRERAS MED MUTANTER SOM UTGÖR EN FÖRÄNDRING I KOPPARUPPFATTNINGSSYSTEMET. DET FINNS FÖR NÄRVARANDE INGA UPPGIFTER SOM GÖR DET MÖJLIGT ATT DRA SLUTSATSER OM DE TRANSKRIPTIONELLA FAKTORERNA ELLER DERAS KARAKTÄR SOM AKTIVATORER/REPRESSORER. DESSUTOM ANALYSERAS SYSTEMETS SPECIFICITET NÄR DET GÄLLER FÖREKOMSTEN AV ANDRA METALLER SOM FÖRÄNDRAR UTTRYCKEN FÖR DESSA GENER. SLUTLIGEN KOMMER VI ATT AVGÖRA HUR SYSTEMET REAGERAR UNDER FÖRHÅLLANDEN AV OXIDATIV STRESS MEDIERAD AV VÄTEPEROXID. (Swedish)
17 August 2022
0 references
ÎN CADRUL ACESTUI PROIECT SE VA ABORDA MODUL ÎN CARE PROCESELE DE ASIMILARE A AZOTULUI, CARBONULUI SAU METALELOR, CUM AR FI CUPRUL, SUNT CONDIȚIONATE DE INTERFERENȚA PRODUSĂ ÎN ACESTEA DE CĂTRE STAREA REDOX CELULARĂ, PRIN COMPUȘI METABOLICI SPECIFICI, CUM AR FI OXIACIDOS 2-OXOGLUTARAT SAU PIRUVAT SAU PRIN OXIDAREA/REDUCEREA UNOR PROTEINE CARE MEDIAZĂ ACEST PROCES DE REGLEMENTARE. PENTRU A STUDIA ACESTE PROCESE FOLOSIM CIANOBACTERIILE MONOCELULARE SYNECHOCYSTIS SP CA UN ORGANISM MODEL. PCC 6803. ÎN CEEA CE PRIVEȘTE PROIECTUL ANTERIOR (BFU2010-15708) PREZENTA PROPUNERE ARE ASPECTE LEGATE DE CONTINUITATE, IAR ALTELE SUNT NOI. PENTRU A REALIZA ACEST PLAN DE LUCRU, ÎN PROIECTUL ANTERIOR AU FOST CONSTRUITE O BATERIE DE TULPINI MUTANTE ALE ACESTEI CIANOBACTERII. ÎN ACESTEA, ACEASTĂ STARE DE REDOX CELULAR POATE FI MODIFICATĂ, FIE PRINTR-O APĂRARE MAI MICĂ ÎMPOTRIVA COMPUȘILOR CARE PROVOACĂ STRES OXIDATIV ÎN CELULĂ, PRIN MODIFICĂRI ALE PROCESELOR DE ASIMILARE A AZOTULUI SAU A CARBONULUI, FIE ÎN ALTE CAZURI PRIN PREZENTAREA UNEI SENSIBILITĂȚI MAI MARI LA PREZENȚA METALELOR. Obiectivele proiectului vor fi următoarele:_x000D_ 1. INTERFERENȚA ÎN NIVELURILE DE 2-OXOGLUTARAT, SENZORUL DE STARE C/N VA FI DETERMINAT MODUL ÎN CARE GENELE IMPLICATE ÎN ASIMILAREA AZOTULUI ÎN SYNECHOCYSTIS SUNT AFECTATE DE ACȚIUNEA DIFERITELOR SPECII REACTIVE DE OXIGEN, ÎN SPECIAL PEROXIDUL DE HIDROGEN. REZULTATELE ANTERIOARE SUGEREAZĂ CĂ ACEST COMPUS MODIFICĂ NIVELURILE DE 2-OXOGLUTARAT ȘI, PRIN URMARE, INTERFEREAZĂ ÎN EXPRIMAREA GENICĂ PRIN SEMNALIZARE MEDIATĂ DE NTCA. NIVELURILE DIFERIȚILOR METABOLIȚI ȘI NIVELURI ENZIMATICE, CUM AR FI GLUTAMINA SINTETAZA, VOR SERVI CA REFERINȚĂ PENTRU INTERFERENȚĂ. DE ASEMENEA, VA ANALIZA EFECTUL STĂRII REDOX CELULARE ASUPRA PROCESELOR DERIVATE DIN LIPSA SURSEI DE AZOT, ÎN SPECIAL RECICLAREA AZOTULUI CONȚINUT ÎN FICOBILIPROTEINS, UN PROCES CUNOSCUT SUB NUMELE DE ALBIRE. _x000D_ 2. MODIFICAREA ACUMULĂRII DE CARBON. FOLOSIND DIFERIȚI MUTANȚI CONSTRUIȚI FĂRĂ GLUCOGENE ÎN SYNECHOCYSTIS, SE VA ANALIZA CARE APARE CU CARBONUL FIXAT ÎN ACEȘTI MUTANȚI, ÎN CONDIȚII NORMALE DE CULTIVARE FAȚĂ DE CONDIȚIILE DE DEFICIT DE AZOT. VOM ANALIZA MODUL ÎN CARE STATUL REDOX INTERFEREAZĂ ÎN ACUMULAREA DE CARBON FIX, FOLOSIND MUTANȚI CARE NU POT SINTETIZA GLUCOGENE. ACESTA VA FI ANALIZAT DEOARECE ACEȘTI MUTANȚI NU POT EFECTUA PROCESUL DE ALBIRE ÎN ABSENȚA UNEI SURSE DE AZOT ÎN COMPARAȚIE CU TULPINA SĂLBATICĂ. ACESTA VA FI, DE ASEMENEA, DETERMINAT DEOARECE MUTANȚII LIPSIȚI DE GLUCOGENE SINTAZĂ, DAR CARE CONȚIN ENZIMA ADP-GLUCOZĂ PIROFOSFORILAZĂ, NU SUNT FEZABILI. _x000D_ 3. PERCEPȚIA METALELOR ȘI STATUTUL REDOX. SISTEMUL DE SCHIMB DE EXPRESIE MEDIATĂ DE CUPRU AL GENELOR PLASTOCIANINEI (PETE) ȘI CITOCROMULUI C6 (PETJ) ESTE DESCIFRAT FOLOSIND MUTANȚI CARE PREZINTĂ O MODIFICARE A SISTEMULUI DE PERCEPȚIE A CUPRULUI. ÎN PREZENT, NU EXISTĂ DATE CARE SĂ DEDUCĂ FACTORII TRANSCRIPȚIONALI IMPLICAȚI SAU NATURA LOR DE ACTIVATORI/REPRESOARE. ÎN PLUS, VA FI ANALIZATĂ SPECIFICITATEA ACESTUI SISTEM ÎN CEEA CE PRIVEȘTE PREZENȚA ALTOR METALE CARE MODIFICĂ EXPRESIA ACESTOR GENE. ÎN CELE DIN URMĂ VOM DETERMINA MODUL ÎN CARE SISTEMUL RĂSPUNDE ÎN CONDIȚII DE STRES OXIDATIV MEDIAT DE PEROXID DE HIDROGEN. (Romanian)
17 August 2022
0 references
V TEM PROJEKTU BO OBRAVNAVANO, KAKO SO PROCESI ASIMILACIJE DUŠIKA, OGLJIKA ALI KOVIN, KOT JE BAKER, POGOJENI Z MOTNJAMI, KI JIH V NJIH POVZROČA CELIČNO REDOKSNO STANJE, S SPECIFIČNIMI METABOLNIMI SPOJINAMI, KOT JE OXIACIDOS 2-OKSOGLUTARAT ALI PIRUVAT, ALI Z OKSIDACIJO/ZMANJŠANJEM NEKATERIH BELJAKOVIN, KI POSREDUJEJO TA PROCES UREDBE. ZA PREUČEVANJE TEH PROCESOV UPORABLJAMO ENOCELIČNO CIANOBAKTERIJE SYNECHOCYSTIS SP KOT MODELNI ORGANIZEM. PCC 6803. V ZVEZI S PREJŠNJIM PROJEKTOM (BFU2010–15708) IMA TA PREDLOG VIDIKE KONTINUITETE IN DRUGE, KI SO NOVI. ZA IZVEDBO TEGA DELOVNEGA NAČRTA JE BILA V PREJŠNJEM PROJEKTU ZGRAJENA BATERIJA MUTANTNIH SEVOV TE CIANOBAKTERIJE. V TEH SE LAHKO TO CELIČNO REDOKS STANJE SPREMENI BODISI Z NIŽJO OBRAMBO PRED SPOJINAMI, KI POVZROČAJO OKSIDATIVNI STRES V CELICI, S SPREMEMBAMI V PROCESIH ASIMILACIJE DUŠIKA ALI OGLJIKA ALI V DRUGIH PRIMERIH Z VEČJO OBČUTLJIVOSTJO NA PRISOTNOST KOVIN. Projekt OBJEKTI Z NEXT:_x000D_ 1. MOTNJE V 2-OKSOGLUTARATNIH RAVNEH, SENZOR C/N STATE BO DOLOČEN, KAKO NA GENE, KI SODELUJEJO PRI ASIMILACIJI DUŠIKA V SYNECHOCYSTIS, VPLIVA DELOVANJE RAZLIČNIH REAKTIVNIH KISIKOVIH VRST, ZLASTI VODIKOVEGA PEROKSIDA. PREJŠNJI REZULTATI KAŽEJO, DA TA SPOJINA SPREMINJA RAVNI 2-OKSOGLUTARATA IN TAKO VPLIVA NA GENSKO IZRAŽANJE PREK OZNAK, KI JIH POSREDUJE NTCA. RAVNI RAZLIČNIH METABOLITOV IN RAVNI ENCIMOV, KOT JE GLUTAMIN-SINTETAZA, BODO SLUŽILE KOT REFERENCA ZA MOTNJE. ANALIZIRALA BO TUDI UČINEK CELIČNEGA REDOKSA NA PROCESE, KI IZHAJAJO IZ POMANJKANJA DUŠIKOVEGA VIRA, ZLASTI NA RECIKLIRANJE DUŠIKA, KI GA VSEBUJE FICOBILIPROTEINS, PROCES, ZNAN KOT BELJENJE. _x000D_ 2. SPREMEMBA KOPIČENJA OGLJIKA. Z UPORABO RAZLIČNIH MUTANTOV, IZDELANIH BREZ GLUCOGENA V SYNECHOCYSTISU, SE BO ANALIZIRALO, KI SE POJAVI Z OGLJIKOM, FIKSIRANIM V TEH MUTANTIH, V NORMALNIH POGOJIH GOJENJA V PRIMERJAVI S POMANJKANJEM DUŠIKA. ANALIZIRALI BOMO, KAKO SE DRŽAVA REDOX VMEŠAVA V KOPIČENJE FIKSNEGA OGLJIKA Z UPORABO MUTANTOV, KI NE MOREJO SINTETIZIRATI GLUCOGENA. ANALIZIRAN BO, KER TI MUTANTI NE MOREJO IZVESTI PROCESA BELJENJA V ODSOTNOSTI VIRA DUŠIKA V PRIMERJAVI Z DIVJIM SEVOM. PRAV TAKO BO DOLOČEN, KER MUTANTI BREZ GLUCOGENE SINTAZE, KI VSEBUJEJO ENCIM ADP-GLUKOZNA PIROFOSFORILAZA, NISO IZVEDLJIVI. _x000D_ 3. ZAZNAVANJE KOVIN IN STATUS REDOKS. BAKROV SISTEM IZMENJAVE IZRAZOV GENOV PLASTOCIANINA (PETE) IN CITOKROMA C6 (PETJ) SE DEŠIFRIRA Z UPORABO MUTANTOV, KI PREDSTAVLJAJO SPREMEMBO V SISTEMU ZAZNAVANJA BAKRA. TRENUTNO NI PODATKOV, NA PODLAGI KATERIH BI LAHKO SKLEPALI O VKLJUČENIH TRANSKRIPCIJSKIH DEJAVNIKIH ALI NJIHOVI NARAVI KOT AKTIVATORJI/REPRESIVI. POLEG TEGA SE BO ANALIZIRALA SPECIFIČNOST TEGA SISTEMA V ZVEZI S PRISOTNOSTJO DRUGIH KOVIN, KI SPREMINJAJO IZRAŽANJE TEH GENOV. KONČNO BOMO UGOTOVILI, KAKO SE SISTEM ODZIVA V RAZMERAH OKSIDATIVNEGA STRESA, KI GA POSREDUJE VODIKOV PEROKSID. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
W TYM PROJEKCIE ZOSTANIE OMÓWIONE, W JAKI SPOSÓB PROCESY ASYMILACJI AZOTU, WĘGLA LUB METALI, TAKICH JAK MIEDŹ, SĄ UWARUNKOWANE ZAKŁÓCENIAMI WYTWARZANYMI W NICH PRZEZ STAN REDOKS KOMÓRKOWYCH, POPRZEZ SPECYFICZNE ZWIĄZKI METABOLICZNE, TAKIE JAK 2-OKSOGLUTARIAN OXIACIDOS LUB PIROGRONIAN LUB POPRZEZ UTLENIANIE/REDUKCJĘ NIEKTÓRYCH BIAŁEK, KTÓRE POŚREDNICZĄ W TYM PROCESIE REGULACJI. DO BADANIA TYCH PROCESÓW UŻYWAMY JEDNOKOMÓRKOWEJ CYJANOBAKTERII SYNECHOCYSTIS SP JAKO ORGANIZMU MODELOWEGO. PCC 6803. W ODNIESIENIU DO POPRZEDNIEGO PROJEKTU (BFU2010-15708) NINIEJSZY WNIOSEK MA ASPEKTY CIĄGŁOŚCI I INNE, KTÓRE SĄ NOWATORSKIE. ABY ZREALIZOWAĆ TEN PLAN PRAC, W POPRZEDNIM PROJEKCIE ZBUDOWANO BATERIĘ ZMUTOWANYCH SZCZEPÓW TEJ CYJANOBAKTERII. W TYCH, TEN STAN REDOKS KOMÓRKOWY MOŻE BYĆ ZMIENIANY PRZEZ DOLNĄ OBRONĘ PRZED ZWIĄZKAMI, KTÓRE POWODUJĄ STRES OKSYDACYJNY W KOMÓRCE, PRZEZ ZMIANY W PROCESACH ASYMILACJI AZOTU LUB WĘGLA, LUB W INNYCH PRZYPADKACH POPRZEZ WYKAZANIE WIĘKSZEJ WRAŻLIWOŚCI NA OBECNOŚĆ METALI. Cele projektu będą NEXT:_x000D_ 1. INGERENCJA W POZIOM 2-OKSOGLUTARANU, CZUJNIK STANU C/N ZOSTANIE OKREŚLONY, W JAKI SPOSÓB GENY BIORĄCE UDZIAŁ W ASYMILACJI AZOTU W SYNECHOCYSTIS SĄ DOTKNIĘTE DZIAŁANIEM RÓŻNYCH REAKTYWNYCH GATUNKÓW TLENU, ZWŁASZCZA NADTLENKU WODORU. POPRZEDNIE WYNIKI SUGERUJĄ, ŻE ZWIĄZEK TEN ZMIENIA POZIOM 2-OKSOGLUTARANU, A TYM SAMYM ZAKŁÓCA EKSPRESJĘ GENICZNĄ POPRZEZ OZNAKOWANIE NTCA. POZIOMY RÓŻNYCH METABOLITÓW I POZIOMÓW ENZYMÓW, TAKICH JAK SYNTETAZA GLUTAMINY, BĘDĄ SŁUŻYĆ ZA PUNKT ODNIESIENIA DLA ZAKŁÓCEŃ. PRZEANALIZUJE RÓWNIEŻ WPŁYW STANU REDOKS KOMÓRKOWYCH NA PROCESY WYNIKAJĄCE Z BRAKU ŹRÓDŁA AZOTU, W SZCZEGÓLNOŚCI RECYKLING AZOTU ZAWARTEGO W FICOBILIPROTEINS, PROCES ZNANY JAKO BIELENIE. _x000D_ 2. ZMIANA AKUMULACJI WĘGLA. PRZY UŻYCIU RÓŻNYCH MUTANTÓW ZBUDOWANYCH BEZ GLUCOGENE W SYNECHOCYSTIS, ZOSTANIE PRZEANALIZOWANY, KTÓRY WYSTĘPUJE Z WĘGLEM OSADZONYM W TYCH MUTACJACH, W NORMALNYCH WARUNKACH UPRAWY W WARUNKACH NIEDOBORU AZOTU. PRZEANALIZUJEMY, W JAKI SPOSÓB PAŃSTWO REDOX INGERUJE W AKUMULACJĘ WĘGLA STAŁEGO, UŻYWAJĄC MUTANTÓW NIEZDOLNYCH DO SYNTEZY GLUCOGENE. ZOSTANIE ON PODDANY ANALIZIE, PONIEWAŻ MUTANTY TE NIE SĄ W STANIE WYKONAĆ PROCESU WYBIELANIA W PRZYPADKU BRAKU ŹRÓDŁA AZOTU W PORÓWNANIU ZE SZCZEPEM DZIKIM. ZOSTANIE RÓWNIEŻ OZNACZONY, PONIEWAŻ MUTANTY POZBAWIONE SYNTAZY GLUCOGENE, ALE ZAWIERAJĄCE ENZYM ADP-GLUKOZA PIROFOSFORYLAZY, NIE SĄ WYKONALNE. _x000D_ 3. POSTRZEGANIE METALI I STATUS REDOX. MIEDZIANY SYSTEM WYMIANY EKSPRESJI GENÓW PLASTOCYJANINY (PETE) I CYTOCHROMU C6 (PETJ) JEST ODSZYFROWYWANY PRZY UŻYCIU MUTANTÓW, KTÓRE PRZEDSTAWIAJĄ ZMIANĘ W UKŁADZIE POSTRZEGANIA MIEDZI. OBECNIE BRAK JEST DANYCH POZWALAJĄCYCH NA WYWNIOSKOWANIE CZYNNIKÓW TRANSKRYPCYJNYCH LUB ICH CHARAKTERU JAKO AKTYWATORÓW/REPRESORÓW. PONADTO ZBADANA ZOSTANIE SPECYFIKA TEGO SYSTEMU W ODNIESIENIU DO OBECNOŚCI INNYCH METALI, KTÓRE ZMIENIAJĄ EKSPRESJĘ TYCH GENÓW. WRESZCIE USTALIMY, W JAKI SPOSÓB SYSTEM REAGUJE W WARUNKACH STRESU OKSYDACYJNEGO ZA POŚREDNICTWEM NADTLENKU WODORU. (Polish)
17 August 2022
0 references
Sevilla
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2013-41712-P
0 references