Development of nanosensory photonic systems for rapid detection of viruses using controlled evolution methods of protein platforms: case SARS-CoV-2 (Q3107859)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3107859 in Slovakia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Development of nanosensory photonic systems for rapid detection of viruses using controlled evolution methods of protein platforms: case SARS-CoV-2 |
Project Q3107859 in Slovakia |
Statements
1,935,624.64 Euro
0 references
3,060,199.77 Euro
0 references
63.25 percent
0 references
1 January 2021
0 references
6 January 2023
0 references
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach
0 references
48°43'20.53"N, 21°15'25.20"E
0 references
Súčasná pandémia koronovírusu vo svete poukázala na naliehavú potrebu rýchlej a ekonomicky efektívnej detekcie vírusov. Univerzita P. J. Šafárika v Košiciach v spolupráci so spoločnosťami SAFTRA Photonics s.r.o. a AUSYS s.r.o, navrhuje vyvinúť metodiku na rýchlu, selektívnu a vysoko citlivú detekciu vírusov SARS-CoV-2, ktoré budú zachytené špecificky na povrch fotonických nanoštruktúrnych čipov. V rámci projektu bude povrch čipu funkcionalizovaný nanovrstvou molekúl špecifických proteínov vyvinutých metódou riadenej evolúcie vybraných proteínových platforiem. Tvorba nanovrstiev proteínov na detekčnom čipe bude prebiehať pomocou kontrolovanej špecifickej chemickej konjugácie, čim dosiahneme optimálnu efektivitu viazania a reprodukovateľnosť detekčných vlastností. Po nanesení vzorky inaktivovaného vírusu na funkcionalizovaný čip bude prítomnosť vírusu detegovaná na základe zosilneného ramanovského spektra povrchovými plazmónmi. Na detekciu signálu z funkcionalizovaných čipov bude vyvinutý detekčný systém bioRAMASCOPE. bioRAMASCOPE bude spĺňať špecifické požiadavky týkajúce sa požadovaných detekčných limitov a spoľahlivosti prevádzky vyžadovaných pre detekciu vírusu SARS-CoV-2. V paralelnej línií budeme pomocou moderných selekčných metód proteínového inžinierstva vyvíjať artificiálne proteíny ako nové biologické entity s novou väzobnou funkciou, ktorá sa špecializuje na špecifické viazanie inaktivovaných vírusov. Na základe kombinácie viazania rôznych epitopov plánujeme, že táto molekulová platforma dosiahne vysokú citlivosť a špecificitu voči rôznym typom vírusov, vrátane SARS-CoV-2. Tento projekt, ktorý bude realizovaný v Košiciach, povedie k vedeckým publikáciám, “proof of concept” a patentu, konkrétne: i) „proof of concept“ metodiky selektívnej, rýchlej, lacnej a in situ vykonateľnej detekcie SARS-CoV-2 s okamžitým zaslaním výsledku do príslušnej databázy, ii) funkčný laboratórny prototyp detekčného systému rôznych typov vírusov, vrátane vírusu SARS-CoV-2. (Slovak)
0 references
The current coronovirus pandemic around the world has highlighted the urgent need for rapid and economically efficient virus detection. P. J. Šafárik University in Košice, in cooperation with SAFTRA Photonics s.r.o. and AUSYS s.r.o., proposes to develop a methodology for rapid, selective and highly sensitive detection of SARS-CoV-2 viruses, which will be captured specifically on the surface of photonic nanostructure chips. Within the project, the chip surface will be functionalised by nanolayering of molecules of specific proteins developed by the method of controlled evolution of selected protein platforms. The formation of nanolayers of proteins on the detection chip will be carried out by means of controlled specific chemical conjugation to achieve optimal binding efficiency and reproducibility of detection properties. Once a sample of the inactivated virus has been applied to the functionalised chip, the presence of the virus will be detected on the basis of the increased ramanovsky spectrum by surface plasmamones. BioRAMASCOPE will be developed to detect the signal from functionalised chips. BioRAMASCOPE will meet the specific requirements regarding the required detection limits and operational reliability required for the detection of SARS-CoV-2 virus. In parallel lines, using advanced selection methods of protein engineering, we will develop artificial proteins as new biological entities with a new binding function that specialises in the specific binding of inactivated viruses. Based on the combination of binding different epitopes, we plan that this molecular platform will achieve high sensitivity and specificity to various types of viruses, including SARS-CoV-2. This project, which will be implemented in Košice, will lead to scientific publications, “proof of concept” and patent, namely: I) “proof of concept” methodology of selective, rapid, inexpensive and in-situ detection of SARS-CoV-2 with immediate transmission of the result to the relevant database, (ii) functional laboratory prototype of detection system of various types of viruses, including SARS-CoV-2 virus. (English)
28 September 2021
0.9560147188249914
0 references
La pandémie actuelle de coronovirus dans le monde a mis en évidence la nécessité urgente d’une détection rapide et efficace du virus. L’Université P. J. Šafárik de Košice, en coopération avec SAFTRA Photonics s.r.o. et AUSYS s.r.o., propose de développer une méthodologie de détection rapide, sélective et hautement sensible des virus SARS-CoV-2, qui seront capturés spécifiquement à la surface des puces de nanostructure photonique. Dans le cadre du projet, la surface de la puce sera fonctionnalisée par nanolayage de molécules de protéines spécifiques développées par la méthode d’évolution contrôlée de plates-formes protéiques sélectionnées. La formation de nanocouches de protéines sur la puce de détection sera réalisée au moyen d’une conjugaison chimique spécifique contrôlée afin d’obtenir une efficacité de liaison optimale et une reproductibilité des propriétés de détection. Une fois qu’un échantillon du virus inactivé a été appliqué à la puce fonctionnelle, la présence du virus sera détectée sur la base du spectre ramanovsky accru par les plasmamones de surface. BioRAMASCOPE sera développé pour détecter le signal provenant de puces fonctionnelles. BioRAMASCOPE répondra aux exigences spécifiques concernant les limites de détection et la fiabilité opérationnelle requises pour la détection du virus SARS-CoV-2. En parallèle, en utilisant des méthodes de sélection avancées de l’ingénierie des protéines, nous allons développer des protéines artificielles en tant que nouvelles entités biologiques avec une nouvelle fonction de liaison qui se spécialise dans la liaison spécifique des virus inactivés. En se basant sur la combinaison de liaison de différents épitopes, nous prévoyons que cette plate-forme moléculaire atteindra une sensibilité et une spécificité élevées à divers types de virus, y compris le SARS-CoV-2. Ce projet, qui sera mis en œuvre à Košice, débouchera sur des publications scientifiques, des «preuves de concept» et des brevets, à savoir: I) méthode de «preuve du concept» de détection sélective, rapide, peu coûteuse et in situ du SRAS-CoV-2 avec transmission immédiate du résultat à la base de données pertinente, (ii) prototype de laboratoire fonctionnel de système de détection de divers types de virus, y compris le virus SARS-CoV-2. (French)
27 November 2021
0 references
Die derzeitige Coronavirus-Pandemie auf der ganzen Welt hat die dringende Notwendigkeit einer raschen und wirtschaftlich effizienten Virenerkennung deutlich gemacht. Die Universität P. J. Šafárik in Košice schlägt in Zusammenarbeit mit SAFTRA Photonics s.r.o. und AUSYS s.r.o. vor, eine Methodik für den schnellen, selektiven und hochempfindlichen Nachweis von SARS-CoV-2-Viren zu entwickeln, die speziell auf der Oberfläche von photonischen Nanostrukturchips erfasst werden. Innerhalb des Projekts wird die Chipoberfläche durch Nanoschichten von Molekülen spezifischer Proteine, die durch die Methode der kontrollierten Evolution ausgewählter Proteinplattformen entwickelt wurden, funktionalisiert. Die Bildung von Nanoschichten von Proteinen auf dem Detektionschip erfolgt mittels kontrollierter chemischer Konjugation, um eine optimale Bindungseffizienz und Reproduzierbarkeit der Nachweiseigenschaften zu erreichen. Sobald eine Probe des inaktivierten Virus auf den funktionalisierten Chip aufgetragen wurde, wird das Vorhandensein des Virus auf der Grundlage des erhöhten Ramanowski-Spektrums durch Oberflächenplasmamone nachgewiesen. BioRAMASCOPE wird entwickelt, um das Signal von funktionalisierten Chips zu erkennen. BioRAMASCOPE wird die spezifischen Anforderungen an die erforderlichen Nachweisgrenzen und die Betriebssicherheit erfüllen, die für den Nachweis des SARS-CoV-2 Virus erforderlich sind. Parallel dazu entwickeln wir mittels fortschrittlicher Auswahlmethoden der Proteintechnik künstliche Proteine als neue biologische Einheiten mit einer neuen Bindungsfunktion, die sich auf die spezifische Bindung von inaktivierten Viren spezialisiert hat. Basierend auf der Kombination der Bindung verschiedener Epitope planen wir, dass diese molekulare Plattform eine hohe Empfindlichkeit und Spezifität für verschiedene Virenarten, einschließlich SARS-CoV-2, erreichen wird. Dieses Projekt, das in Košice umgesetzt wird, führt zu wissenschaftlichen Veröffentlichungen, „Beweis von Konzept“ und Patenten, und zwar: I) Methode des selektiven, schnellen, kostengünstigen und in-situ-Erkennens von SARS-CoV-2 mit sofortiger Übertragung des Ergebnisses an die entsprechende Datenbank, ii) funktionaler Laborprototyp des Nachweissystems verschiedener Virenarten, einschließlich des SARS-CoV-2-Virus. (German)
30 November 2021
0 references
De huidige coronoviruspandemie over de hele wereld heeft duidelijk gemaakt dat er dringend behoefte is aan snelle en economisch efficiënte opsporing van virussen. P. J. Šafárik University in Košice, in samenwerking met SAFTRA Photonics s.r.o. en AUSYS s.r.o., stelt voor om een methodologie te ontwikkelen voor snelle, selectieve en zeer gevoelige detectie van SARS-CoV-2-virussen, die specifiek op het oppervlak van fotonische nanostructuurchips zal worden vastgelegd. Binnen het project zal het chipoppervlak worden gefunctionaliseerd door nanolayering van moleculen van specifieke eiwitten ontwikkeld door de methode van gecontroleerde evolutie van geselecteerde eiwitplatforms. De vorming van nanolagen van eiwitten op de detectiechip zal worden uitgevoerd door middel van gecontroleerde specifieke chemische vervoeging om optimale bindingsefficiëntie en reproduceerbaarheid van detectie-eigenschappen te bereiken. Zodra een monster van het geïnactiveerde virus is toegepast op de gefunctionaliseerde chip, zal de aanwezigheid van het virus worden gedetecteerd op basis van het verhoogde ramanovsky spectrum door oppervlakteplasmamonen. BioRAMASCOPE zal worden ontwikkeld om het signaal van gefunctionaliseerde chips te detecteren. BioRAMASCOPE zal voldoen aan de specifieke eisen met betrekking tot de vereiste detectielimieten en operationele betrouwbaarheid die vereist zijn voor de detectie van SARS-CoV-2-virus. In parallelle lijnen, met behulp van geavanceerde selectiemethoden van eiwittechniek, zullen we kunstmatige eiwitten ontwikkelen als nieuwe biologische entiteiten met een nieuwe bindingsfunctie die gespecialiseerd is in de specifieke binding van geïnactiveerde virussen. Op basis van de combinatie van binding van verschillende epitopen, plannen we dat dit moleculaire platform een hoge gevoeligheid en specificiteit zal bereiken voor verschillende soorten virussen, waaronder SARS-CoV-2. Dit project, dat in Košice zal worden uitgevoerd, zal leiden tot wetenschappelijke publicaties, „proof of concept” en octrooien, namelijk: I) „proof of concept”-methodologie van selectieve, snelle, goedkope en in-situ detectie van SARS-CoV-2 met onmiddellijke overdracht van het resultaat naar de relevante databank, ii) functioneel laboratoriumprototype van detectiesysteem van verschillende soorten virussen, waaronder SARS-CoV-2-virus. (Dutch)
4 December 2021
0 references
L'attuale pandemia di coronovirus in tutto il mondo ha evidenziato l'urgente necessità di un rilevamento rapido ed economicamente efficiente del virus. L'Università P. J. Šafárik di Košice, in collaborazione con SAFTRA Photonics s.r.o. e AUSYS s.r.o., propone di sviluppare una metodologia per la rilevazione rapida, selettiva e altamente sensibile dei virus SARS-CoV-2, che saranno catturati specificamente sulla superficie dei chip fotonici nanostrutturali. All'interno del progetto, la superficie del chip sarà funzionale mediante nanostrato di molecole di proteine specifiche sviluppate con il metodo di evoluzione controllata di piattaforme proteiche selezionate. La formazione di nanostrati di proteine sul chip di rilevazione sarà effettuata mediante coniugazione chimica specifica controllata per ottenere un'efficienza di legame ottimale e riproducibilità delle proprietà di rilevamento. Una volta che un campione del virus inattivato è stato applicato al chip funzionalizzato, la presenza del virus sarà rilevata sulla base dell'aumento dello spettro di ramanovsky dai plasmamoni di superficie. BioRAMASCOPE sarà sviluppato per rilevare il segnale da chip funzionalizzati. BioRAMASCOPE soddisfa i requisiti specifici relativi ai limiti di rilevamento richiesti e all'affidabilità operativa necessaria per il rilevamento del virus SARS-CoV-2. In linee parallele, utilizzando metodi di selezione avanzati di ingegneria proteica, svilupperemo proteine artificiali come nuove entità biologiche con una nuova funzione di legame specializzata nello specifico legame dei virus inattivati. Sulla base della combinazione di leganti diversi epitopi, pianifichiamo che questa piattaforma molecolare raggiungerà alta sensibilità e specificità a vari tipi di virus, tra cui SARS-CoV-2. Questo progetto, che sarà attuato a Košice, porterà a pubblicazioni scientifiche, "prove di concetto" e brevetti, vale a dire: I) metodologia "prova del concetto" di rilevamento selettivo, rapido, economico e in situ di SARS-CoV-2 con trasmissione immediata del risultato alla banca dati pertinente, ii) prototipo funzionale di laboratorio di sistema di rilevazione di vari tipi di virus, compreso il virus SARS-CoV-2. (Italian)
12 January 2022
0 references
La actual pandemia del coronovirus en todo el mundo ha puesto de relieve la urgente necesidad de una detección rápida y económicamente eficiente del virus. La Universidad P. J. Šafárik de Košice, en colaboración con SAFTRA Photonics s.r.o. y AUSYS s.r.o., propone desarrollar una metodología para la detección rápida, selectiva y altamente sensible de virus SARS-CoV-2, que se capturarán específicamente en la superficie de chips de nanoestructura fotónica. Dentro del proyecto, la superficie del chip será funcionalizada por nanocapa de moléculas de proteínas específicas desarrolladas por el método de evolución controlada de plataformas de proteínas seleccionadas. La formación de nanocapas de proteínas en el chip de detección se llevará a cabo mediante conjugación química específica controlada para lograr una óptima eficiencia de unión y reproducibilidad de las propiedades de detección. Una vez aplicada una muestra del virus inactivado al chip funcionalizado, la presencia del virus se detectará sobre la base del aumento del espectro ramanovsky por plasmamonas superficiales. BioRAMASCOPE se desarrollará para detectar la señal de chips funcionalizados. BioRAMASCOPE cumplirá con los requisitos específicos relativos a los límites de detección requeridos y la fiabilidad operativa requerida para la detección del virus SARS-CoV-2. En líneas paralelas, utilizando métodos avanzados de selección de ingeniería proteica, desarrollaremos proteínas artificiales como nuevas entidades biológicas con una nueva función de unión que se especializa en la unión específica de virus inactivados. Sobre la base de la combinación de diferentes epítopos de unión, planeamos que esta plataforma molecular logrará una alta sensibilidad y especificidad a varios tipos de virus, incluyendo SARS-CoV-2. Este proyecto, que se ejecutará en Košice, dará lugar a publicaciones científicas, «pruebas de concepto» y patentes, a saber: I) metodología de «prueba de concepto» de detección selectiva, rápida, económica e in situ del SARS-CoV-2 con transmisión inmediata del resultado a la base de datos pertinente, ii) prototipo funcional de laboratorio del sistema de detección de diversos tipos de virus, incluido el virus SARS-CoV-2. (Spanish)
13 January 2022
0 references
Praegune konoviiruse pandeemia kogu maailmas on toonud esile pakilise vajaduse viiruse kiire ja majanduslikult tõhusa avastamise järele. P. J. Šafáriki ülikool Košices teeb koostöös ettevõtjatega SAFTRA Photonics s.r.o. ja AUSYS s.r.o. ettepaneku töötada välja metoodika SARS-CoV-2 viiruste kiireks, selektiivseks ja väga tundlikuks avastamiseks, mis jäädvustatakse spetsiaalselt fotooniliste nanostruktuurikiipide pinnal. Projekti raames funktsioneeritakse kiibi pinda konkreetsete valkude molekulide nanokihistamisel, mis on välja töötatud valitud valguplatvormide kontrollitud evolutsiooni meetodil. Valgu nanokihtide moodustumine avastamiskiibil toimub kontrollitud spetsiifilise keemilise konjugeerimise abil, et saavutada optimaalne seondumisefektiivsus ja avastamisomaduste korratavus. Kui inaktiveeritud viiruse proov on funktsionaalsele kiibile kantud, avastatakse viiruse esinemine ramnovski spektri suurenemise alusel pinnaplasmmoonide abil. BioRAMASCOPE töötatakse välja, et avastada signaali funktsioneeritud kiibid. BioRAMASCOPE vastab erinõuetele seoses SARS-CoV-2 viiruse avastamiseks nõutavate avastamispiiride ja töökindlusega. Paralleelselt ridadega, kasutades täiustatud valikumeetodeid valgutehnika, arendame kunstlikke valke uute bioloogiliste üksustena, millel on uus seondumisfunktsioon, mis on spetsialiseerunud inaktiveeritud viiruste spetsiifilisele seondumisele. Tuginedes erinevate epitoopide kombinatsioonile, plaanime, et see molekulaarne platvorm saavutab suure tundlikkuse ja spetsiifilisuse eri tüüpi viiruste, sealhulgas SARS-CoV-2 suhtes. See Košices rakendatav projekt toob kaasa teaduspublikatsioonide, kontseptsiooni tõestamise ja patendi, nimelt: I) SARS-CoV-2 selektiivse, kiire, odava ja in situ tuvastamise kontseptsiooni tõestamise metoodika koos tulemuse kohese edastamisega asjaomasesse andmebaasi, ii) eri tüüpi viiruste, sealhulgas SARS-CoV-2 viiruse funktsionaalne laboris tuvastamise süsteemi prototüüp. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Dabartinė koronovirusų pandemija visame pasaulyje parodė, kad skubiai reikia greitai ir ekonomiškai efektyviai nustatyti virusus. P. J. Šafįrik universitetas Košice, bendradarbiaudamas su SAFTRA Photonics s.r.o. ir AUSYS s.r.o., siūlo sukurti greito, selektyvaus ir labai jautrio SARS-CoV-2 virusų aptikimo metodiką, kuri bus užfiksuota specialiai fotoninės nanostruktūros lustų paviršiuje. Projekto metu lusto paviršius bus funkcionalizuotas nanosluoksniavimu specifinių baltymų molekulių, sukurtų kontroliuojamos tam tikrų baltymų platformų evoliucijos metodu. Baltymų nanosluoksnių susidarymas aptikimo luste bus atliekamas naudojant kontroliuojamą specifinę cheminę konjugaciją, kad būtų pasiektas optimalus surišimo efektyvumas ir aptikimo savybių atkuriamumas. Uždėjus inaktyvuoto viruso mėginį į funkcionuotą lustą, viruso buvimas nustatomas remiantis padidėjusiu ramanovskio spektru paviršiniais plazmamonais. BioRAMASCOPE bus sukurta aptikti signalą iš funkcionalizuotų lustų. BioRAMASCOPE atitiks konkrečius reikalavimus dėl reikalaujamų aptikimo ribų ir veikimo patikimumo, būtino SARS-CoV-2 virusui aptikti. Lygiagrečiose linijose, naudojant pažangius baltymų inžinerijos atrankos metodus, mes kursime dirbtinius baltymus kaip naujus biologinius objektus su nauja rišamąja funkcija, kuri specializuojasi specifinio inaktyvintų virusų jungimosi srityje. Remdamiesi skirtingų epitopų sujungimu, planuojame, kad ši molekulinė platforma pasiektų didelį jautrumą ir specifiškumą įvairių tipų virusams, įskaitant SARS-CoV-2. Šis projektas, kuris bus įgyvendinamas Košicėje, leis rengti mokslines publikacijas, „koncepcijos įrodymą“ ir patentą, būtent: I) atrankinio, greito, nebrangaus ir in situ SARS-CoV-2 aptikimo atrankinio, greito, nebrangaus ir in situ aptikimo metodo metodika, nedelsiant perduodant rezultatą į atitinkamą duomenų bazę, ii) įvairių tipų virusų, įskaitant SARS-CoV-2 virusą, aptikimo sistemos funkcinis laboratorinis prototipas. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Trenutačna pandemija koronavirusa diljem svijeta ukazala je na hitnu potrebu za brzim i gospodarski učinkovitim otkrivanjem virusa. Sveučilište P. J. Šafárik u Košicama, u suradnji sa SAFTRA Photonics s.r.o. i AUSYS s.r.o., predlaže razvoj metodologije za brzo, selektivno i vrlo osjetljivo otkrivanje virusa SARS-CoV-2, koje će biti snimljene posebno na površini fotonanostrukturnih čipova. Unutar projekta, površina čipa će biti funkcionalizirana nanoslojom molekula specifičnih proteina razvijenih metodom kontrolirane evolucije odabranih proteinskih platformi. Stvaranje nanoslojeva proteina na detekcijskom čipu provodit će se kontroliranim specifičnim kemijskim konjugacijama kako bi se postigla optimalna učinkovitost vezanja i obnovljivost svojstava detekcije. Nakon što se uzorak inaktiviranog virusa primijeni na funkcionalizirani čip, prisutnost virusa bit će otkrivena na temelju povećanog spektra ramanovskog pomoću površinskih plazmamona. BioRAMASCOPE će biti razvijen za otkrivanje signala iz funkcionaliziranih čipova. BioRAMASCOPE će ispuniti posebne zahtjeve u pogledu potrebnih granica detekcije i operativne pouzdanosti potrebne za otkrivanje virusa SARS-CoV-2. U paralelnim linijama, koristeći napredne metode odabira proteinskog inženjeringa, razvijat ćemo umjetne proteine kao nove biološke entitete s novom veznom funkcijom koja je specijalizirana za specifično vezivanje inaktiviranih virusa. Na temelju kombinacije vezanja različitih epitopa, planiramo da će ova molekularna platforma postići visoku osjetljivost i specifičnost na različite vrste virusa, uključujući SARS-CoV-2. Ovaj će projekt, koji će se provoditi u Košicama, dovesti do znanstvenih publikacija, „dokaza koncepta” i patenta, odnosno: I) „dokaz koncepta” metodologija selektivnog, brzog, jeftinog i in situ otkrivanja virusa SARS-CoV-2 s trenutačnim prijenosom rezultata u relevantnu bazu podataka, ii. funkcionalni laboratorijski prototip sustava otkrivanja različitih vrsta virusa, uključujući virus SARS-CoV-2. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η τρέχουσα πανδημία του στεονοϊού ανά τον κόσμο ανέδειξε την επείγουσα ανάγκη για ταχεία και οικονομικά αποτελεσματική ανίχνευση του ιού. Το Πανεπιστήμιο P. J. Šafárik στο Košice, σε συνεργασία με την SAFTRA Photonics s.r.o. και την AUSYS s.r.o., προτείνει την ανάπτυξη μεθοδολογίας για την ταχεία, επιλεκτική και εξαιρετικά ευαίσθητη ανίχνευση των ιών SARS-CoV-2, η οποία θα αποτυπωθεί ειδικά στην επιφάνεια των τσιπ φωτονικών νανοδομών. Στο πλαίσιο του έργου, η επιφάνεια του τσιπ θα λειτουργήσει με τη νανοστρωμάτωση μορίων συγκεκριμένων πρωτεϊνών που αναπτύχθηκαν με τη μέθοδο ελεγχόμενης εξέλιξης επιλεγμένων πλατφορμών πρωτεϊνών. Ο σχηματισμός νανοστρωμάτων πρωτεϊνών στο τσιπ ανίχνευσης θα πραγματοποιηθεί μέσω ελεγχόμενης ειδικής χημικής σύζευξης για την επίτευξη βέλτιστης απόδοσης δέσμευσης και αναπαραγωγιμότητας των ιδιοτήτων ανίχνευσης. Μόλις ένα δείγμα του αδρανοποιημένου ιού εφαρμοστεί στο λειτουργικό τσιπ, η παρουσία του ιού θα ανιχνευθεί με βάση το αυξημένο φάσμα ramanovsky από επιφανειακούς πλάσματος. Η BioRAMASCOPE θα αναπτυχθεί για την ανίχνευση του σήματος από λειτουργικά τσιπ. Το BioRAMASCOPE θα πληροί τις ειδικές απαιτήσεις όσον αφορά τα απαιτούμενα όρια ανίχνευσης και την επιχειρησιακή αξιοπιστία που απαιτούνται για την ανίχνευση του ιού SARS-CoV-2. Παράλληλα, χρησιμοποιώντας προηγμένες μεθόδους επιλογής της πρωτεϊνικής μηχανικής, θα αναπτύξουμε τεχνητές πρωτεΐνες ως νέες βιολογικές οντότητες με μια νέα δεσμευτική λειτουργία που ειδικεύεται στην ειδική δέσμευση αδρανοποιημένων ιών. Με βάση το συνδυασμό της δέσμευσης διαφορετικών επιτόπων, σχεδιάζουμε ότι αυτή η μοριακή πλατφόρμα θα επιτύχει υψηλή ευαισθησία και εξειδίκευση σε διάφορους τύπους ιών, συμπεριλαμβανομένου του SARS-CoV-2. Το έργο αυτό, το οποίο θα υλοποιηθεί στο Košice, θα οδηγήσει σε επιστημονικές δημοσιεύσεις, «απόδειξη της έννοιας» και δίπλωμα ευρεσιτεχνίας, και συγκεκριμένα: I) μεθοδολογία «απόδειξης της έννοιας» της επιλεκτικής, ταχείας, φθηνής και επιτόπιας ανίχνευσης του SARS-CoV-2 με άμεση μετάδοση του αποτελέσματος στη σχετική βάση δεδομένων, (ii) λειτουργικό εργαστηριακό πρωτότυπο του συστήματος ανίχνευσης διαφόρων τύπων ιών, συμπεριλαμβανομένου του ιού SARS-CoV-2. (Greek)
4 August 2022
0 references
Nykyinen koronoviruspandemia eri puolilla maailmaa on korostanut kiireellistä tarvetta nopeaan ja taloudellisesti tehokkaaseen virusten havaitsemiseen. P. J. Šafárik University Košicessa, yhteistyössä SAFTRA Photonics s.r.o:n ja AUSYS s.r.o:n kanssa, ehdottaa, että kehitetään menetelmä SARS-CoV-2-virusten nopeaa, valikoivaa ja erittäin herkkää havaitsemista varten, joka kaapataan erityisesti fotonisten nanorakennesirujen pinnalle. Projektissa sirun pinta on toiminnallisesti tiettyjen proteiinien molekyylien nanokerros, joka on kehitetty valitun proteiinialustan hallitun kehityksen menetelmällä. Proteiinien nanokerrosten muodostuminen detektiosirussa tapahtuu valvotulla kemiallisella konjugaatiolla optimaalisen sitoutumistehokkuuden ja havaitsemisominaisuuksien uusittavuuden saavuttamiseksi. Kun näyte inaktivoidusta viruksesta on levitetty funktionaaliseen siruun, viruksen esiintyminen havaitaan pintaplasmamonien lisääntyneen ramanovskispektrin perusteella. BioRAMASCOPE kehitetään havaitsemaan signaali toiminnallistetuista siruista. BioRAMASCOPE täyttää SARS-CoV-2-viruksen toteamiseksi vaadittavia havaitsemisrajoja ja toiminnan luotettavuutta koskevat erityisvaatimukset. Rinnakkaisissa linjoissa, käyttäen kehittyneitä valintamenetelmiä proteiinitekniikan, kehitämme keinotekoisia proteiineja uutena biologisina yksikköinä, joilla on uusi sitova tehtävä, joka on erikoistunut inaktivoitujen virusten erityissitoutumiseen. Eri epitooppien yhdistelmän perusteella suunnittelemme, että tällä molekyylialustalla saavutetaan suuri herkkyys ja spesifisyys erityyppisille viruksille, kuten SARS-CoV-2-viruksille. Tämä Košicessa toteutettava hanke johtaa tieteellisiin julkaisuihin, konseptin todistamiseen ja patenttiin: I) SARS-CoV-2-viruksen selektiivinen, nopea, edullinen ja in situ -määritysmenetelmä, jossa tulokset välitetään välittömästi asianomaiseen tietokantaan, ii) laboratorion toiminnallinen prototyyppi eri virustyyppien, kuten SARS-CoV-2-viruksen, osoittamiseen. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Obecna pandemia koronowirusów na całym świecie uwypukliła pilną potrzebę szybkiego i efektywnego ekonomicznie wykrywania wirusów. Uniwersytet im. P. J. Šafárika w Koszycach, we współpracy z SAFTRA Photonics s.r.o. i AUSYS s.r.o., proponuje opracowanie metodologii szybkiego, selektywnego i wysoce wrażliwego wykrywania wirusów SARS-CoV-2, które zostaną uchwycone specjalnie na powierzchni fotonicznych chipów nanostruktury. W ramach projektu powierzchnia chipa zostanie funkcjonalna poprzez nanowarstwowanie cząsteczek określonych białek opracowanych metodą kontrolowanej ewolucji wybranych platform białkowych. Tworzenie nanowarstw białek na chipie detekcji będzie prowadzone za pomocą kontrolowanego specyficznego sprzężenia chemicznego w celu osiągnięcia optymalnej skuteczności wiązania i odtwarzalności właściwości wykrywania. Po nałożeniu próbki inaktywowanego wirusa na funkcjonalizowany chip, obecność wirusa zostanie wykryta na podstawie zwiększonego spektrum ramanovsky’ego przez plazmony powierzchniowe. BioRAMASCOPE zostanie opracowany w celu wykrycia sygnału z funkcjonalizowanych chipów. BioRAMASCOPE spełni szczególne wymagania dotyczące wymaganych granic wykrywalności i niezawodności operacyjnej wymaganych do wykrycia wirusa SARS-CoV-2. W równoległych liniach, wykorzystując zaawansowane metody doboru białek, będziemy rozwijać sztuczne białka jako nowe jednostki biologiczne z nową funkcją wiązania, która specjalizuje się w specyficznym wiązaniu inaktywowanych wirusów. Opierając się na połączeniu wiązania różnych epitopów, planujemy, że ta platforma molekularna osiągnie wysoką czułość i swoistość dla różnych typów wirusów, w tym SARS-CoV-2. Projekt ten, który będzie realizowany w Koszycach, doprowadzi do publikacji naukowych, „dowodu koncepcji” i patentu, a mianowicie: I) metodologia „dowodu koncepcji” selektywnego, szybkiego, niedrogiego i in situ wykrywania SARS-CoV-2 z natychmiastowym przekazaniem wyników do odpowiedniej bazy danych, (ii) funkcjonalny prototyp laboratoryjny systemu wykrywania różnych typów wirusów, w tym wirusa SARS-CoV-2. (Polish)
4 August 2022
0 references
A világ jelenlegi coronovírus-világjárványa rávilágított arra, hogy sürgősen szükség van a vírus gyors és gazdaságilag hatékony felderítésére. A kassai P. J. Šafárik Egyetem a SAFTRA Photonics s.r.o.-val és az AUSYS s.r.o.-val együttműködésben módszertant javasol a SARS-CoV-2 vírusok gyors, szelektív és rendkívül érzékeny kimutatására, amelyeket kifejezetten a fotonikus nanoszerkezet-chipek felszínén rögzítenek. A projekten belül a chip felületét a kiválasztott fehérjeplatformok ellenőrzött evolúciójának módszerével kifejlesztett specifikus fehérjék molekuláinak nanorétegezésével fogják működésbe hozni. A fehérjék nanorétegeinek a detektáló chipen történő képződése ellenőrzött specifikus kémiai konjugációval történik az optimális kötési hatékonyság és a detektálási tulajdonságok reprodukálhatóságának elérése érdekében. Amint az inaktivált vírusból mintát alkalmaztak a funkcionális chipen, a vírus jelenlétét a felszíni plazmamonok megnövelt ramanovsky spektruma alapján észlelik. A BioRAMASCOPE-t a funkcionális chipek jelének észlelésére fejlesztik ki. A BioRAMASCOPE megfelel a SARS-CoV-2 vírus kimutatásához szükséges kimutatási határértékekre és működési megbízhatóságra vonatkozó egyedi követelményeknek. Ezzel párhuzamosan, a fehérjetervezés fejlett szelekciós módszereit alkalmazva mesterséges fehérjéket fejlesztünk ki új biológiai entitásokként, amelyek új kötőfunkcióval rendelkeznek, amely az inaktivált vírusok specifikus kötődésére specializálódott. A kötő különböző epitópok kombinációja alapján tervezzük, hogy ez a molekuláris platform nagy érzékenységet és specificitást ér el a különböző vírustípusokra, köztük a SARS-CoV-2-ra. Ez a projekt, amelyet Kassán hajtanak végre, tudományos publikációkhoz, „koncepciós igazoláshoz” és szabadalomhoz fog vezetni, nevezetesen: I) a SARS-CoV-2 szelektív, gyors, olcsó és lokális kimutatásának „koncepciós” módszere az eredménynek a megfelelő adatbázisba történő azonnali továbbításával, ii. a különböző típusú vírusok, köztük a SARS-CoV-2 vírus kimutatási rendszerének funkcionális laboratóriumi prototípusa. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Současná pandemie koronaviru na celém světě poukázala na naléhavou potřebu rychlé a ekonomicky účinné detekce viru. Univerzita P. J. Šafárika v Košicích ve spolupráci se společnostmi SAFTRA Photonics s.r.o. a AUSYS s.r.o. navrhuje vyvinout metodiku pro rychlou, selektivní a vysoce citlivou detekci virů SARS-CoV-2, které budou zachyceny specificky na povrchu fotonických nanostrukturních čipů. V rámci projektu bude povrch čipu zprovozněn nanovrstvou molekul specifických proteinů vyvinutých metodou řízené evoluce vybraných proteinových platforem. Tvorba nanovrstvy proteinů na detekčním čipu bude prováděna pomocí řízené specifické chemické konjugace, aby se dosáhlo optimální účinnosti vazby a reprodukovatelnosti detekčních vlastností. Po aplikaci vzorku inaktivovaného viru na funkcionalizovaný čip bude přítomnost viru zjištěna na základě zvýšeného ramanovského spektra povrchovými plazmatemi. BioRAMASCOPE bude vyvinut tak, aby detekoval signál z funkcionalizovaných čipů. BioRAMASCOPE splní specifické požadavky týkající se požadovaných detekčních limitů a provozní spolehlivosti požadované pro detekci viru SARS-CoV-2. V paralelních liniích, pomocí pokročilých metod selekce proteinového inženýrství, budeme vyvíjet umělé proteiny jako nové biologické entity s novou vazebnou funkcí, která se specializuje na specifickou vazbu inaktivovaných virů. Na základě kombinace vazebných různých epitopů plánujeme, že tato molekulární platforma dosáhne vysoké citlivosti a specifičnosti na různé typy virů, včetně SARS-CoV-2. Tento projekt, který bude realizován v Košicích, povede k vědeckým publikacím, „průkazu koncepce“ a patentu, konkrétně: I) metodika „prokazování koncepce“ selektivní, rychlé, levné a in situ detekce SARS-CoV-2 s okamžitým přenosem výsledku do příslušné databáze, ii) funkční laboratorní prototyp detekčního systému různých typů virů, včetně viru SARS-CoV-2. (Czech)
4 August 2022
0 references
Pašreizējā koronovīrusa pandēmija visā pasaulē ir uzsvērusi steidzamo nepieciešamību ātri un ekonomiski efektīvi atklāt vīrusus. P. J. Šafárik University Košice sadarbībā ar SAFTRA Photonics s.r.o. un AUSYS s.r.o. ierosina izstrādāt metodoloģiju ātrai, selektīvai un ļoti jutīgai SARS-CoV-2 vīrusu atklāšanai, kas tiks uztverta tieši uz fotonisko nanostruktūru mikroshēmu virsmas. Projekta ietvaros mikroshēmas virsma tiks funkcionalizēta, izmantojot noteiktu proteīnu molekulu nanoslāni, kas izstrādāti, izmantojot izvēlēto olbaltumvielu platformu kontrolētas attīstības metodi. Proteīnu nanoslāņu veidošanās noteikšanas mikroshēmā tiks veikta, izmantojot kontrolētu specifisku ķīmisko konjugāciju, lai panāktu optimālu saistīšanās efektivitāti un noteikšanas īpašību reproducējamību. Kad inaktivētā vīrusa paraugs ir uzklāts uz funkcionalizētās mikroshēmas, vīrusa klātbūtne tiks noteikta, pamatojoties uz virsmas plazmamonu palielināto ramanovska spektru. BioRAMASCOPE tiks izstrādāts, lai noteiktu signālu no funkcionālām mikroshēmām. BioRAMASCOPE atbildīs īpašajām prasībām attiecībā uz SARS-CoV-2 vīrusa atklāšanai nepieciešamajām atklāšanas robežām un darbības uzticamību. Paralēli, izmantojot progresīvas atlases metodes proteīnu inženierijā, mēs izstrādāsim mākslīgos proteīnus kā jaunas bioloģiskas vienības ar jaunu saistīšanās funkciju, kas specializējas inaktivētu vīrusu specifiskā saistīšanās procesā. Pamatojoties uz dažādu epitopu kombināciju, mēs plānojam, ka šī molekulārā platforma nodrošinās augstu jutību un specifiskumu pret dažāda veida vīrusiem, tostarp SARS-CoV-2. Šis projekts, kas tiks īstenots Košicē, radīs zinātniskas publikācijas, “koncepcijas apliecinājumu” un patentu, proti: I) SARS-CoV-2 selektīvās, ātras, lētas un in situ noteikšanas metodes “koncepcijas pierādījums” ar tūlītēju rezultātu pārnešanu uz attiecīgo datubāzi, ii) dažādu vīrusu, tostarp SARS-CoV-2 vīrusa, atklāšanas sistēmas funkcionālais laboratorijas prototips. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Leis an bpaindéim coróinvíris atá ann faoi láthair ar fud an domhain, léiríodh a phráinní atá sé víreas a bhrath go tapa agus go héifeachtúil ó thaobh an gheilleagair de. Molann P. J. Šafárik in Košice, i gcomhar le Fótónaic SAFTRA s.r.o. agus AUSYS s.r.o., modheolaíocht a fhorbairt chun víris SARS-CoV-2 a bhrath go tapa, go roghnaíoch agus an-íogair, a ghabhfar go sonrach ar dhromchla sceallóga nanastruchtúir fótónaice. Laistigh den tionscadal, déanfar dromchla na sliseanna a fheidhmiú trí nanalayering a dhéanamh ar mhóilíní de phróitéiní sonracha arna bhforbairt ag modh éabhlóid rialaithe na n-ardán próitéine roghnaithe. Déanfar foirmiú nanasraitheanna próitéiní ar an tslis bhraite trí chomhchuingiú ceimiceach sonrach rialaithe chun éifeachtúlacht cheangailteach agus in-atáirgtheacht na n-airíonna braite a bhaint amach. Nuair a bheidh sampla den víreas díghníomhaithe curtha i bhfeidhm ar an tslis fheidhmiúil, aimseofar láithreacht an víris ar bhonn an speictrim ramanovsky méadaithe trí phlasmóin dhromchla. Forbrófar BioRAMASCOPE chun an comhartha a bhrath ó sceallóga feidhmiúla. Comhlíonfaidh BioRAMASCOPE na ceanglais shonracha maidir leis na teorainneacha braite agus an iontaofacht oibríochtúil is gá chun víreas SARS-CoV-2 a bhrath. I línte comhthreomhara, ag baint úsáide as ardmhodhanna roghnúcháin innealtóireachta próitéine, forbróimid próitéiní saorga mar eintitis bhitheolaíocha nua a bhfuil feidhm cheangailteach nua acu a speisialtóireacht i gceangal sonrach víris dhíghníomhaithe. Bunaithe ar an teaglaim d’eipeatóipí ceangailteacha éagsúla, tá sé beartaithe againn go mbainfidh an t-ardán móilíneach seo ardíogaireacht agus sainiúlacht amach do chineálacha éagsúla víreas, lena n-áirítear SARS-CoV-2. Mar thoradh ar an tionscadal seo, a chuirfear i bhfeidhm i Košice, beidh foilseacháin eolaíocha, “cruthúnas coincheapa” agus paitinn, eadhon: I) modheolaíocht “cruthúnas coincheapa” maidir le brath roghnach, tapa, neamhchostasach agus in situ SARS-CoV-2 le tarchur láithreach an toradh chuig an mbunachar sonraí ábhartha, (ii) fréamhshamhail saotharlainne fheidhmiúil de chóras braite cineálacha éagsúla víreas, lena n-áirítear víreas SARS-CoV-2. (Irish)
4 August 2022
0 references
Sedanja pandemija koronovirusa po svetu je poudarila nujno potrebo po hitrem in gospodarsko učinkovitem odkrivanju virusov. P. J. Šafárik University v Košicah, v sodelovanju s SAFTRA Photonics s.r.o. in AUSYS s.r.o., predlaga razvoj metodologije za hitro, selektivno in zelo občutljivo odkrivanje virusov SARS-CoV-2, ki bodo zajeti posebej na površini fotonskih nanostrukturnih čipov. V okviru projekta bo površina čipa funkcionalizirana z nanoplastitvijo molekul specifičnih beljakovin, razvitih z metodo nadzorovanega razvoja izbranih proteinskih platform. Nastajanje nanoplastov beljakovin na čipu za detekcijo se bo izvajalo z nadzorovano specifično kemično konjugacijo, da se doseže optimalna učinkovitost vezave in ponovljivost lastnosti odkrivanja. Ko se na funkcionaliziran čip nanese vzorec inaktiviranega virusa, se prisotnost virusa odkrije na podlagi povečanega spektra ramanovskega s površinskimi plazemskimi mononi. BioRAMASCOPE bo razvit za odkrivanje signala iz funkcionalnih čipov. BioRAMASCOPE bo izpolnjeval posebne zahteve v zvezi z zahtevanimi mejami zaznavnosti in operativno zanesljivostjo, ki sta potrebni za odkrivanje virusa SARS-CoV-2. V vzporednih linijah, z uporabo naprednih selekcijskih metod proteinskega inženiringa, bomo razvili umetne beljakovine kot nove biološke entitete z novo vezavo, ki je specializirana za specifično vezavo inaktiviranih virusov. Na podlagi kombinacije vezanih različnih epitopov načrtujemo, da bo ta molekularna platforma dosegla visoko občutljivost in specifičnost za različne vrste virusov, vključno s SARS-CoV-2. Projekt, ki se bo izvajal v Košicah, bo vodil k znanstvenim publikacijam, „dokazu koncepta“ in patentu, in sicer: I) metodologija „dokazovanja koncepta“ za selektivno, hitro, poceni in in-situ odkrivanje SARS-CoV-2 s takojšnjim prenosom rezultatov v ustrezno zbirko podatkov, (ii) funkcionalni laboratorijski prototip sistema za odkrivanje različnih vrst virusov, vključno z virusom SARS-CoV-2. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Настоящата пандемия от коронавирус по света подчерта спешната необходимост от бързо и икономически ефективно откриване на вируси. P. J. Šafárik University в Košice, в сътрудничество със SAFTRA Photonics s.r.o. и AUSYS s.r.o., предлага да се разработи методология за бързо, селективно и силно чувствително откриване на вируси SARS-CoV-2, които ще бъдат уловени специално на повърхността на фотонни чипове наноструктура. В рамките на проекта повърхността на чипа ще бъде функционализирана чрез нанослояване на молекули на специфични протеини, разработени чрез метода на контролирана еволюция на избрани протеинови платформи. Образуването на нанослоеве от протеини върху чипа за откриване ще се извършва посредством контролирана специфична химическа конюгация, за да се постигне оптимална ефективност на свързване и възпроизводимост на детекторните свойства. След като върху функционалния чип бъде приложена проба от инактивирания вирус, присъствието на вируса ще бъде открито въз основа на повишения спектър на Рамановски от повърхностни плазмени монии. BioRAMASCOPE ще бъде разработен за откриване на сигнала от функционални чипове. BioRAMASCOPE ще отговаря на специфичните изисквания по отношение на изискваните граници на откриване и оперативна надеждност, необходими за откриване на SARS-CoV-2 вирус. В паралелни линии, използвайки усъвършенствани методи за подбор на протеиновия инженеринг, ние ще разработим изкуствени протеини като нови биологични единици с нова свързваща функция, която се специализира в специфичното свързване на инактивирани вируси. Въз основа на комбинацията от свързване на различни епитопи, ние планираме, че тази молекулярна платформа ще постигне висока чувствителност и специфичност към различни видове вируси, включително SARS-CoV-2. Този проект, който ще бъде реализиран в Кошице, ще доведе до научни публикации, „доказване на концепцията“ и патент, а именно: I) методология за „доказване на концепцията“ за селективно, бързо, евтино и in situ откриване на SARS-CoV-2 с незабавно предаване на резултата в съответната база данни, ii) функционален лабораторен прототип на система за откриване на различни видове вируси, включително SARS-CoV-2 вирус. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Il-pandemija attwali tal-koronovirus madwar id-dinja enfasizzat il-ħtieġa urġenti għal detezzjoni rapida u ekonomikament effiċjenti tal-virus. P. J. Šafárik University f’Košice, f’kooperazzjoni ma’ SAFTRA Photonics s.r.o. u AUSYS s.r.o., jipproponi li tiġi żviluppata metodoloġija għal detezzjoni rapida, selettiva u sensittiva ħafna tal-viruses SARS-CoV-2, li se jinqabdu speċifikament fuq il-wiċċ taċ-ċipep tan-nanostruttura fotonika. Fi ħdan il-proġett, is-superfiċje taċ-ċippa se tiġi funzjonalizzata permezz tan-nanosaffi ta’ molekuli ta’ proteini speċifiċi żviluppati bil-metodu ta’ evoluzzjoni kkontrollata ta’ pjattaformi ta’ proteini magħżula. Il-formazzjoni ta’ nanosaffi ta’ proteini fuq iċ-ċippa ta’ detezzjoni se titwettaq permezz ta’ konjugazzjoni kimika speċifika kkontrollata biex tinkiseb l-aħjar effiċjenza ta’ rbit u riproduċibbiltà tal-proprjetajiet ta’ detezzjoni. Ladarba kampjun tal-virus inattivat ikun ġie applikat fuq iċ-ċippa funzjonalizzata, il-preżenza tal-virus tiġi individwata fuq il-bażi taż-żieda fl-ispettru ramanovsky mill-plasmoni tal-wiċċ. BioRAMASCOPE ser jiġi żviluppat biex jidentifika s-sinjal minn ċipep funzjonalizzati. BioRAMASCOPE għandu jissodisfa r-rekwiżiti speċifiċi rigward il-limiti ta’ detezzjoni meħtieġa u l-affidabbiltà operattiva meħtieġa għad-detezzjoni tal-virus tas-SARS-CoV-2. F’linji paralleli, bl-użu ta ‘metodi avvanzati ta’ għażla ta ‘inġinerija tal-proteini, aħna se niżviluppaw proteini artifiċjali bħala entitajiet bijoloġiċi ġodda b’funzjoni ta’ rabta ġdida li tispeċjalizza fl-irbit speċifiku ta ‘viruses inattivati. Abbażi tal-kombinazzjoni ta’ epitopi differenti li jorbtu, qed nippjanaw li din il-pjattaforma molekulari tikseb sensittività u speċifiċità għolja għal diversi tipi ta’ virusijiet, inkluż SARS-CoV-2. Dan il-proġett, li se jiġi implimentat f’Košice, se jwassal għal pubblikazzjonijiet xjentifiċi, “prova tal-kunċett” u privattiva, jiġifieri: I) metodoloġija ta’ “prova tal-kunċett” ta’ detezzjoni selettiva, rapida, mhux għalja u in situ tas-SARS-CoV-2 bi trażmissjoni immedjata tar-riżultat lill-bażi tad-data rilevanti, (ii) prototip funzjonali tal-laboratorju ta’ sistema ta’ detezzjoni ta’ diversi tipi ta’ viruses, inkluż il-virus SARS-CoV-2. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A atual pandemia de coronovírus em todo o mundo pôs em evidência a necessidade urgente de uma deteção rápida e economicamente eficiente do vírus. A Universidade P. J. Šafárik em Košice, em cooperação com a SAFTRA Photonics s.r.o. e a AUSYS s.r.o., propõe desenvolver uma metodologia para a deteção rápida, seletiva e altamente sensível dos vírus SARS-CoV-2, que serão capturados especificamente na superfície dos chips de nanoestrutura fotónica. No âmbito do projeto, a superfície do chip será funcionalizada através da nanocamada de moléculas de proteínas específicas desenvolvidas pelo método de evolução controlada de plataformas de proteínas selecionadas. A formação de nanocamadas de proteínas no chip de detecção será realizada por meio de conjugação química específica controlada para alcançar a eficiência de ligação ideal e a reprodutibilidade das propriedades de detecção. Uma vez aplicada uma amostra do vírus inativado no chip funcionalizado, a presença do vírus será detetada com base no aumento do espetro de ramanovsky por plasmamonas de superfície. O BioRAMASCOPE será desenvolvido para detetar o sinal dos circuitos integrados funcionalizados. A BioRAMASCOPE cumprirá os requisitos específicos relativos aos limites de deteção exigidos e à fiabilidade operacional exigida para a deteção do vírus SARS-CoV-2. Em linhas paralelas, usando métodos avançados da selecção da engenharia da proteína, nós desenvolveremos proteínas artificiais como entidades biológicas novas com uma função de ligação nova que se especialize na ligação específica de vírus inactivated. Com base na combinação de diferentes epítopos de ligação, planeamos que esta plataforma molecular atinja alta sensibilidade e especificidade a vários tipos de vírus, incluindo o SARS-CoV-2. Este projeto, que será executado em Košice, dará origem a publicações científicas, «prova de conceito» e patentes, nomeadamente: I) metodologia de «prova de conceito» de deteção seletiva, rápida, barata e in situ do SARS-CoV-2, com transmissão imediata do resultado à base de dados pertinente, ii) protótipo laboratorial funcional do sistema de deteção de vários tipos de vírus, incluindo o vírus SARS-CoV-2. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Den nuværende koronaviruspandemi rundt om i verden har understreget det presserende behov for hurtig og økonomisk effektiv påvisning af virus. P. J. Šafárik University i Košice, i samarbejde med SAFTRA Photonics s.r.o. og AUSYS s.r.o., foreslår at udvikle en metode til hurtig, selektiv og meget følsom påvisning af SARS-CoV-2 virus, som vil blive fanget specifikt på overfladen af fotoniske nanostruktur chips. Inden for projektet vil chipoverfladen blive funktionelt ved nanolægning af molekyler af specifikke proteiner udviklet ved metoden til kontrolleret udvikling af udvalgte proteinplatforme. Dannelsen af nanolag af proteiner på detektionschip sker ved hjælp af kontrolleret specifik kemisk konjugation for at opnå optimal bindingseffektivitet og reproducerbarhed af detektionsegenskaber. Når en prøve af det inaktiverede virus er blevet anvendt på den funktionelle chip, vil tilstedeværelsen af virus blive påvist på grundlag af det øgede ramanovsky-spektrum af overfladeplasmamoner. BioRAMASCOPE vil blive udviklet til at detektere signalet fra funktionaliserede chips. BioRAMASCOPE vil opfylde de specifikke krav vedrørende de krævede detektionsgrænser og driftssikkerhed, der kræves til påvisning af SARS-CoV-2-virus. Parallelt hermed vil vi ved hjælp af avancerede udvælgelsesmetoder inden for proteinteknik udvikle kunstige proteiner som nye biologiske enheder med en ny bindingsfunktion, der specialiserer sig i den specifikke binding af inaktiverede vira. Baseret på kombinationen af binding af forskellige epitoper planlægger vi, at denne molekylære platform vil opnå høj følsomhed og specificitet for forskellige typer vira, herunder SARS-CoV-2. Dette projekt, som vil blive gennemført i Košice, vil føre til videnskabelige publikationer, "proof of concept" og patent, nemlig: I) "proof of concept"-metodologi til selektiv, hurtig, billig og in situ påvisning af SARS-CoV-2 med øjeblikkelig overførsel af resultatet til den relevante database, ii) funktionel laboratorieprototype til påvisningssystem af forskellige typer virus, herunder SARS-CoV-2-virus. (Danish)
4 August 2022
0 references
Actuala pandemie a virusului coronovirusului din întreaga lume a evidențiat nevoia urgentă de depistare rapidă și eficientă din punct de vedere economic a virusului. Universitatea P. J. Šafárik din Košice, în cooperare cu SAFTRA Photonics s.r.o. și AUSYS s.r.o., propune dezvoltarea unei metodologii pentru detectarea rapidă, selectivă și extrem de sensibilă a virusurilor SARS-CoV-2, care vor fi captate în mod specific pe suprafața cipurilor nanostructurii fotonice. În cadrul proiectului, suprafața cipului va fi funcționalizată prin nanostratificarea moleculelor de proteine specifice dezvoltate prin metoda evoluției controlate a platformelor proteice selectate. Formarea nanostraturilor de proteine pe cipul de detectare se va realiza prin conjugare chimică specifică controlată pentru a obține o eficiență optimă de legare și reproductibilitate a proprietăților de detecție. Odată ce un eșantion de virus inactivat a fost aplicat pe cipul funcțional, prezența virusului va fi detectată pe baza spectrului ramanovsky crescut de plasma de suprafață. BioRAMASCOPE va fi dezvoltat pentru a detecta semnalul de la chips-uri funcționale. BioRAMASCOPE va îndeplini cerințele specifice privind limitele de detecție și fiabilitatea operațională necesare pentru detectarea virusului SARS-CoV-2. În linii paralele, folosind metode avansate de selecție a ingineriei proteinelor, vom dezvolta proteine artificiale ca noi entități biologice cu o nouă funcție de legare care este specializată în legarea specifică a virusurilor inactivate. Pe baza combinației de diferite epitopi legați, planificăm că această platformă moleculară va atinge o sensibilitate ridicată și specificitate la diferite tipuri de virusuri, inclusiv SARS-CoV-2. Acest proiect, care va fi implementat în Košice, va conduce la publicații științifice, „dovada conceptului” și brevet, și anume: I) metodologia „dovada conceptului” de detectare selectivă, rapidă, necostisitoare și in situ a SARS-CoV-2 cu transmiterea imediată a rezultatului către baza de date relevantă, (ii) prototip funcțional de laborator al sistemului de detectare a diferitelor tipuri de virusuri, inclusiv virusul SARS-CoV-2. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Den pågående coronapandemin runt om i världen har visat på det akuta behovet av snabb och ekonomiskt effektiv virusdetektering. P. J. Šafárik University i Košice, i samarbete med SAFTRA Photonics s.r.o. och AUSYS s.r.o., föreslår att utveckla en metod för snabb, selektiv och mycket känslig detektion av SARS-CoV-2 virus, som kommer att fångas specifikt på ytan av fotonisk nanostruktur chips. Inom projektet kommer chipytan att funktionaliseras genom nanolayering av molekyler av specifika proteiner som utvecklats genom metoden för kontrollerad evolution av utvalda proteinplattformar. Bildandet av nanolager av proteiner på detektionschipet kommer att utföras med hjälp av kontrollerad specifik kemisk konjugation för att uppnå optimal bindningseffektivitet och reproducerbarhet för detektionsegenskaper. När ett prov av det inaktiverade viruset har applicerats på det funktionaliserade chippet kommer förekomsten av viruset att upptäckas på grundval av det ökade ramanovskyspektret med hjälp av ytplasmamoner. BioRAMASCOPE kommer att utvecklas för att upptäcka signalen från funktionaliserade chips. BioRAMASCOPE kommer att uppfylla de särskilda kraven på de detektionsgränser och driftsäkerhet som krävs för påvisande av SARS-CoV-2-virus. I parallella linjer, med hjälp av avancerade urvalsmetoder för proteinteknik, kommer vi att utveckla artificiella proteiner som nya biologiska enheter med en ny bindningsfunktion som specialiserat sig på den specifika bindningen av inaktiverade virus. Baserat på kombinationen av bindande olika epitoper planerar vi att denna molekylära plattform kommer att uppnå hög känslighet och specificitet för olika typer av virus, inklusive SARS-CoV-2. Detta projekt, som kommer att genomföras i Košice, kommer att leda till vetenskapliga publikationer, ”koncepttest” och patent, nämligen: I) metod för ”koncepttest” för selektiv, snabb, billig och på plats detektion av SARS-CoV-2 med omedelbar överföring av resultatet till den relevanta databasen, ii) funktionell laboratorieprototyp av detektionssystem för olika typer av virus, inklusive SARS-CoV-2-virus. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Identifiers
313011AUW6
0 references