Complete sequencing of tuberculosis genome for use in a Latvian clinic: Design and evaluation of the concept. (Q3056504)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3056504 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Complete sequencing of tuberculosis genome for use in a Latvian clinic: Design and evaluation of the concept. |
Project Q3056504 in Latvia |
Statements
444,810.81 Euro
0 references
540,540.54 Euro
0 references
82.29 percent
0 references
1 January 2021
0 references
30 November 2023
0 references
Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
0 references
56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
0 references
Tuberkuloze joprojām ir viena no postošākajām slimībām, kas skar visa vecuma cilvēkus visā pasaulē. Šī slimība ieņem vienu no top 10 nāves iemesliem pasaulē un raksturojas ar lielu ekonomisku nozīmi. M. tuberculosis zāļu rezistento celmu prevalence un izplatīšanos ir viens no galveniem iemesliem kas apgrūtina slimības apkarošanu. Pacientus, kas ir inficēti ar zāļu rezistentām mikobaktērijām, ir grūti vai pat neiespējami izārstēt, un viņiem nepieciešamā terapija ir toksiskāka un dārgāka. Latvijā daudzzāļu rezistentā tuberkuloze ir nopietna sabiedrības veselības problēma: 2017. gadā gandrīz 8% no visiem tuberkulozes saslimšanas gadījumiem izraisīja zāļu rezistentie M. tuberculosis celmi. M. tuberculosis laikietilpīga un darbietilpīga diagnostika rada novēlotās ārstēšanas risku. Pilna genoma sekvenēšana (whole genome sequencing, WGS) piedāvā mūsdienīgu un ātru diagnostikas risinājumu, un tiek virzīta no zinātniskām laboratorijām uz ikdienas pielietojumu klīnikās.Projekta mērķis ir izveidot un izvērtēt konceptu M. tuberculosis pilna genoma sekvenēšanas iekļaušanai klīniskā praksē Latvijā.Šī kompleksā mērķa sasniegšanai sadarbības projekta ietvaros ir plānoti rūpnieciski, starpdisciplināri pētījumi iesaistot pieredzējušos zinātniekus no Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centra (BMC) un SIA GenEra, kam ir kompetence molekulārās bioloģijas, biomedicīnas un medicīnas zinātnes nozarēs. Projekts atbilst 3.5. “Cita medicīnas zinātne” (Biomedicīna) un 3.2. “Klīniskā medicīna” zinātnes nozarēm un nav saistīts ar saimniecisku darbību. Projekta īstenošanas jomai (tautsaimniecības nozarei) un sagaidāmajiem rezultātiem atbilstošais saimniecisko darbību statistiskās klasifikācijas (NACE 2. red.) kods- 86 - Veselības aizsardzība, t.sk. 86.10 - Slimnīcu darbība.Projekta izmaksas: 540 540,54 EUR (ERAF atbalsta apjoms: 444 810,81 EUR). Projekta ilgums: 35 mēneši (01.01.2021 – 30.11.2023.).Projekta ietvaros mērķa sasniegšanai ir paredzētas trīs, savā starpā saistītās aktivitātes:1. WGS piemērotības izvērtēšana dažādos klīniskas prakses laika punktos.2. Protokola izstrādāšana M. tuberculosis WGS ieviešanai klīniskā praksē.3. WGS koncepta izvērtēšana salīdzinājumā ar esošo klīnisko praksi.Šī projekta ietvaros tiek apvienoti molekulāri, mikrobioloģijas un epidemioloģijas pētījumi, un tiks veikta klīnikas vajadzībām piemērotās WGS darbplūsmas izstrādāšana un izvērtēšana.Projekta realizēšana dos ieguldījumu tuberkulozes infekcijas riska samazināšanai. Tiks veicināta laboratoriju attīstība, molekulārās diagnostikas pakalpojumu kapacitātes palielināšana un jaunu speciālistu apmācība, kas ir īpaši svarīgi tādu jaunu veselības apdraudējumu gadījumā kā COVID-19. Turklāt, M.tuberculosis zāļu rezistento celmu pilna genoma sekvenēšanas datu iegūšanai ir starptautiskā nozīme zāļu rezistences un epidemioloģisku pētījumu vajadzībām.Atslēgas vārdi: daudzzāļu rezistentā tuberkuloze, pilna genoma sekvenēšana, molekulārā diagnostika. (Latvian)
0 references
Tuberculosis remains one of the most devastating diseases affecting people of all ages around the world. This disease occupies one of the top 10 causes of death in the world and is characterised by great economic significance. The prevalence and spread of resistant strains of M. tuberculosis drugs are one of the main causes of disease control. Patients infected with drug-resistant mycobacteria are difficult, if not impossible, to cure, and the treatment they need is more toxic and more expensive. In Latvia, multidrug resistant tuberculosis is a serious public health problem: In 2017, almost 8 % of all tuberculosis cases were caused by drug resistant strains of M. tuberculosis. Time-consuming and laborious diagnosis of M. tuberculosis poses a risk of delayed treatment. Full genome sequencing (WGS) offers a modern and fast diagnostic solution and is directed from scientific laboratories to daily applications in clinics.The aim of the project is to develop and evaluate the concept of inclusion of full genome sequencing of M. tuberculosis in clinical practice in Latvia.In order to achieve this complex goal, within the framework of the cooperation project, industrial, interdisciplinary research involving experienced scientists from the Latvian Biomedical Research and Study Centre (BMC) and biomedical fields are planned within the framework of the cooperation project. The project is in line with 3.5. “Other medical science” (Biomedicine) and 3.2. “Clinical medicine” scientific fields and do not involve economic activity. Code of the statistical classification of economic activities (NACE Rev. 2) – 86 – Health protection, corresponding to the scope of the project (farm sector) and expected results. 86.10 – Hospital activities.Project costs: EUR 540540,54 (the amount of the aid from the ERDF: EUR 444810,81). Duration of the project: 35 months (01.01.2021-30.11.2023).Within the project, three related activities are planned to achieve the goal:1. Evaluation of the suitability of WGS at various time points in clinical practice.2. Development of protocol for the implementation of M. tuberculosis WGS in clinical practice.3. The WGS concept is evaluated against current clinical practice.This project combines molecular, microbiology and epidemiology studies, and will perform the development and evaluation of WGS workflow appropriate to the clinic’s needs. Laboratory development, capacity building of molecular diagnostic services and training of young professionals will be encouraged, which is particularly important in the case of new health threats such as COVID-19. In addition, the collection of data on genome sequencing of resistant strains of M.tuberculosis is of international significance for drug resistance and epidemiological studies. Multidrug resistant tuberculosis, complete genome sequencing, molecular diagnosis. (English)
15 July 2021
0.8449767461281965
0 references
La tuberculose demeure l’une des maladies les plus dévastatrices touchant les personnes de tous âges dans le monde. Cette maladie occupe l’une des 10 principales causes de décès dans le monde et se caractérise par une grande importance économique. La prévalence et la propagation des souches résistantes à la tuberculose sont l’une des principales raisons pour lesquelles il est plus difficile de lutter contre la maladie. Les patients infectés par des mycobactéries résistantes aux médicaments sont difficiles, voire impossibles à guérir, et le traitement dont ils ont besoin est plus toxique et plus coûteux. En Lettonie, la tuberculose multirésistante est un grave problème de santé publique: En 2017, près de 8 % de tous les cas de tuberculose étaient causés par des souches pharmacorésistantes de M. tuberculosis. Le diagnostic fastidieux et laborieux de M. tuberculosis présente un risque de retard de traitement. Le séquençage complet du génome (séquençage du génome entier, WGS) offre une solution de diagnostic moderne et rapide et est dirigé de laboratoires scientifiques à une utilisation quotidienne dans les cliniques. L’objectif du projet est de créer et d’évaluer le concept d’intégration du séquençage complet du génome de M. tuberculosis dans la pratique clinique en Lettonie. Afin d’atteindre cet objectif complexe, des recherches industrielles et interdisciplinaires impliquant des scientifiques expérimentés du Centre letton de recherche et d’études biomédicales (BMC) et Genra Ltd., qui possède des compétences en biologie moléculaire, biomédicale et médicale, sont prévues. Le projet correspond à 3.5. «Autres sciences médicales» (Byomedicine) et 3.2. «Médecine clinique» pour les disciplines scientifiques et n’est pas liée à l’activité économique. Code de la nomenclature statistique des activités économiques (NACE Rév. 2) correspondant au domaine d’exécution du projet (pour le secteur économique) et résultats escomptés — 86 — Santé, dont: 86.10 — Activités hospitalières.Coûts du projet: 540 540,54 EUR (montant de l’aide du FEDER: 444 810,81 EUR). Durée du projet: 35 mois (01.01.2021-30.11.2023).Dans le cadre du projet, trois activités connexes sont prévues pour atteindre l’objectif:1. Évaluation de l’adéquation du WGS à différents moments de la pratique clinique.2. Élaboration d’un protocole pour la mise en œuvre de M. tuberculosis WGS dans la pratique clinique.3. Évaluation du concept WGS par rapport à la pratique clinique existante. Ce projet combine des études moléculaires, microbiologiques et épidémiologiques et réalisera l’élaboration et l’évaluation du flux de travail WGS adapté aux besoins de la clinique. La mise en œuvre du projet contribuera à réduire le risque d’infection par la tuberculose. Le développement de laboratoires, le renforcement des capacités des services de diagnostic moléculaire et la formation de jeunes professionnels seront encouragés, ce qui est particulièrement important pour les menaces sanitaires émergentes telles que la COVID-19. De plus, l’obtention de données complètes sur le séquençage du génome pour les souches résistantes aux médicaments M.tuberculosis est d’une importance internationale à des fins de recherche épidémiologique et de résistance aux médicaments. tuberculose résistante aux médicaments multiples, séquençage du génome complet, diagnostic moléculaire. (French)
25 November 2021
0 references
Tuberkulose ist nach wie vor eine der verheerendsten Krankheiten, die Menschen jeden Alters auf der ganzen Welt betreffen. Diese Krankheit nimmt eine der Top 10 Todesursachen der Welt ein und zeichnet sich durch eine große wirtschaftliche Bedeutung aus. Die Prävalenz und Ausbreitung von M. tuberkuloseresistenten Stämmen ist einer der Hauptgründe dafür, dass es schwieriger wird, die Krankheit zu bekämpfen. Patienten, die mit arzneimittelresistenten Mykobakterien infiziert sind, sind schwierig oder gar unmöglich zu heilen, und die Behandlung, die sie benötigen, ist giftiger und teurer. In Lettland stellt die Multiple-Drogen-resistente Tuberkulose ein ernstes Problem der öffentlichen Gesundheit dar: Im Jahr 2017 wurden fast 8 % aller Tuberkulosefälle durch medikamentöse Tuberkulose-Stämme verursacht. Die zeitaufwändige und mühsame Diagnose von M. Tuberkulose birgt das Risiko einer verzögerten Behandlung. Die vollständige Genomsequenzierung (vollständige Genomsequenzierung, WGS) bietet eine moderne und schnelle diagnostische Lösung und wird von wissenschaftlichen Laboren bis zum täglichen Einsatz in Kliniken geleitet. Ziel des Projekts ist es, das Konzept der Integration der vollständigen Genomsequenzierung von M. Tuberkulose in die klinische Praxis in Lettland zu entwickeln und zu bewerten. Um dieses komplexe Ziel zu erreichen, ist die industrielle, interdisziplinäre Forschung unter Beteiligung erfahrener Wissenschaftler des lettischen Biomedizinischen Forschungs- und Studienzentrums (BMC) und der Genera Ltd. mit Kompetenz in Molekularbiologie, biomedizinischer und medizinischer Wissenschaft geplant. Das Projekt entspricht 3.5. „Sonstige Medizinwissenschaft“ (Byomedicin) und 3.2. „Klinische Medizin“ für wissenschaftliche Disziplinen und ist nicht mit der wirtschaftlichen Tätigkeit verbunden. Code der statistischen Systematik der Wirtschaftszweige (NACE Rev. 2) entsprechend dem Durchführungsbereich des Projekts (für den Wirtschaftszweig) und erwartete Ergebnisse – 86 – Gesundheit, davon: 86.10 – Krankenhausaktivitäten. Projektkosten: 540 540,54 EUR (EFRE-Beihilfebetrag: 444 810,81 EUR). Laufzeit des Projekts: 35 Monate (01.01.2021-30.11.2023).Im Rahmen des Projekts sind drei damit zusammenhängende Aktivitäten vorgesehen, um das Ziel zu erreichen:1. Bewertung der Eignung von WGS zu verschiedenen Zeitpunkten der klinischen Praxis.2. Entwicklung eines Protokolls zur Implementierung von M. Tuberkulose WGS in der klinischen Praxis.3. Bewertung des WGS-Konzepts im Vergleich zur bestehenden klinischen Praxis. Dieses Projekt kombiniert molekulare, mikrobiologische und epidemiologische Studien und führt die Entwicklung und Evaluierung des WGS-Workflows für die Bedürfnisse der Klinik durch. Die Umsetzung des Projekts wird zur Verringerung des Risikos einer Tuberkuloseinfektion beitragen. Die Entwicklung von Labors, der Aufbau von Kapazitäten für molekulare Diagnostikdienste und die Ausbildung junger Fachkräfte werden gefördert, was für neu auftretende Gesundheitsgefahren wie COVID-19 von besonderer Bedeutung ist. Darüber hinaus ist die Gewinnung vollständiger Genomsequenzierungsdaten für M.tuberkulose-Drogenresistente Stämme von internationaler Bedeutung für Drogenresistenz und epidemiologische Forschungszwecke. Multiple-Drug-resistente Tuberkulose, vollständige Genomsequenzierung, molekulare Diagnostik. (German)
28 November 2021
0 references
Tuberculose blijft een van de meest verwoestende ziekten die mensen van alle leeftijden over de hele wereld treffen. Deze ziekte bezet een van de top 10 doodsoorzaken in de wereld en wordt gekenmerkt door grote economische betekenis. De prevalentie en verspreiding van M. tuberculose-resistente stammen is een van de belangrijkste redenen om het moeilijker te maken om de ziekte te bestrijden. Patiënten die besmet zijn met geneesmiddelresistente mycobacteriën zijn moeilijk of zelfs onmogelijk te genezen, en de behandeling die ze nodig hebben is giftiger en duurder. In Letland is multiresistente tuberculose een ernstig probleem voor de volksgezondheid: In 2017 werd bijna 8 % van alle gevallen van tuberculose veroorzaakt door geneesmiddelresistente M. tuberculosis-stammen. De tijdrovende en moeizame diagnose van M. tuberculosis vormt een risico op vertraagde behandeling. Het volledige genoomsequencing (het gehele genoom rangschikken, WGS) biedt een moderne en snelle diagnostische oplossing en is gericht van wetenschappelijke laboratoria aan dagelijks gebruik in klinieken. Het doel van het project is het creëren en evalueren van het concept van integratie van volledige genoomsequencing van M. tuberculosis in de klinische praktijk in Letland. Om dit complexe doel te bereiken, is industrieel, interdisciplinair onderzoek waarbij ervaren wetenschappers van het Letse Biomedisch Onderzoeks- en Studiecentrum (BMC) en genera Ltd., die competentie in moleculaire biologie, biomedische en medische wetenschap betrokken zijn, gepland. Het project komt overeen met 3.5. „Overige medische wetenschap” (Byomedicine) en 3.2. „Klinische geneeskunde” voor wetenschappelijke disciplines en houdt geen verband met economische activiteit. Code van de statistische classificatie van economische activiteiten (NACE Rev. 2) die betrekking heeft op het gebied van de uitvoering van het project (voor de economische sector) en verwachte resultaten — 86 — Gezondheid, waarvan: 86.10 — Ziekenhuisactiviteiten.Projectkosten: 540 540,54 EUR (steun uit het EFRO: 444 810,81 EUR). Duur van het project: 35 maanden (01.01.2021-30.11.2023).In het kader van het project zijn drie gerelateerde activiteiten gepland om het doel te bereiken:1. Beoordeling van de geschiktheid van WGS op verschillende tijdstippen van de klinische praktijk.2. Ontwikkeling van een protocol voor de toepassing van M. tuberculosis WGS in de klinische praktijk.3. Evaluatie van het WGS-concept in vergelijking met bestaande klinische praktijk. Dit project combineert moleculaire, microbiologie- en epidemiologische studies en zal de ontwikkeling en evaluatie van de WGS-workflow uitvoeren die geschikt is voor de behoeften van de kliniek. De uitvoering van het project zal bijdragen aan het verminderen van het risico op tuberculoseinfectie. De ontwikkeling van laboratoria, de capaciteitsopbouw van moleculaire diagnostische diensten en de opleiding van jonge professionals zullen worden bevorderd, wat met name van belang is voor nieuwe gezondheidsbedreigingen zoals COVID-19. Bovendien is het verkrijgen van volledige genoomsequencing gegevens voor M.tuberculosis drug resistente stammen van internationaal belang voor drugresistentie en epidemiologische onderzoeksdoeleinden. multiple-drug resistente tuberculose, volledige genoom sequencing, moleculaire diagnostiek. (Dutch)
28 November 2021
0 references
La tubercolosi rimane una delle malattie più devastanti che colpiscono le persone di tutte le età in tutto il mondo. Questa malattia occupa una delle 10 principali cause di morte nel mondo ed è caratterizzata da un grande significato economico. La prevalenza e la diffusione di ceppi resistenti alla tubercolosi di M. è uno dei motivi principali per cui è più difficile combattere la malattia. I pazienti infettati da micobatteri resistenti alla droga sono difficili o addirittura impossibili da curare e il trattamento di cui hanno bisogno è più tossico e costoso. In Lettonia, la tubercolosi multifarmaco resistente è un grave problema di salute pubblica: Nel 2017, quasi l'8 % di tutti i casi di tubercolosi è stato causato da ceppi di M. tuberculosis resistenti ai farmaci. La diagnosi laboriosa e dispendiosa di M. tuberculosis comporta il rischio di un trattamento ritardato. Il sequenziamento completo del genoma (sequenziamento del genoma intero, WGS) offre una soluzione diagnostica moderna e veloce ed è diretto dai laboratori scientifici all'uso quotidiano nelle cliniche. L'obiettivo del progetto è quello di creare e valutare il concetto di integrazione del sequenziamento genoma completo della M. tubercolosi nella pratica clinica in Lettonia. Al fine di raggiungere questo obiettivo complesso, è prevista una ricerca industriale e interdisciplinare che coinvolga scienziati esperti del Centro di ricerca e studio biomedico lettone (BMC) e generi Ltd., che ha competenze in biologia molecolare, biomedica e scienze mediche. Il progetto corrisponde al punto 3.5. "Altre scienze mediche" (Byomedicina) e 3.2. La "medicina clinica" per le discipline scientifiche e non è correlata all'attività economica. Codice della classificazione statistica delle attività economiche (NACE Rev. 2) corrispondente al campo di attuazione del progetto (per il settore economico) e risultati attesi — 86 — Salute, di cui: 86.10 — Attività ospedaliere. Costi del progetto: 540 540,54 EUR (importo dell'aiuto del FESR: 444 810,81 EUR). Durata del progetto: 35 mesi (01.01.2021-30.11.2023).Nel quadro del progetto sono previste tre attività correlate per raggiungere l'obiettivo:1. Valutazione dell'idoneità del WGS in diversi momenti della pratica clinica.2. Sviluppo di un protocollo per l'attuazione della M. tubercolosi WGS nella pratica clinica.3. Valutazione del concetto di WGS rispetto alla pratica clinica esistente. Questo progetto combina studi molecolari, microbiologici ed epidemiologici e realizzerà lo sviluppo e la valutazione del flusso di lavoro WGS adatto alle esigenze della clinica. L'attuazione del progetto contribuirà a ridurre il rischio di infezione da tubercolosi. Saranno promossi lo sviluppo di laboratori, lo sviluppo delle capacità dei servizi diagnostici molecolari e la formazione dei giovani professionisti, il che è particolarmente importante per le minacce sanitarie emergenti come la COVID-19. Inoltre, ottenere dati completi di sequenziamento del genoma per ceppi resistenti ai farmaci M.tuberculosis è di importanza internazionale per la resistenza ai farmaci e per la ricerca epidemiologica. tubercolosi multi-farmaco resistente, sequenziamento completo del genoma, diagnostica molecolare. (Italian)
11 January 2022
0 references
La tuberculosis sigue siendo una de las enfermedades más devastadoras que afectan a personas de todas las edades en todo el mundo. Esta enfermedad ocupa una de las 10 principales causas de muerte en el mundo y se caracteriza por una gran importancia económica. La prevalencia y propagación de cepas resistentes a la tuberculosis por M. es una de las principales razones para dificultar la lucha contra la enfermedad. Los pacientes infectados con micobacterias resistentes a los medicamentos son difíciles o incluso imposibles de curar, y el tratamiento que necesitan es más tóxico y caro. En Letonia, la tuberculosis resistente a múltiples drogas es un grave problema de salud pública: En 2017, casi el 8 % de todos los casos de tuberculosis fueron causados por cepas de M. tuberculosis resistentes a los medicamentos. El diagnóstico lento y laborioso de M. tuberculosis plantea un riesgo de retraso en el tratamiento. La secuenciación completa del genoma (secuenciación completa del genoma, WGS) ofrece una solución diagnóstica moderna y rápida y se dirige desde los laboratorios científicos a su uso diario en las clínicas. El objetivo del proyecto es crear y evaluar el concepto de integración de la secuenciación completa del genoma de M. tuberculosis en la práctica clínica en Letonia. Con el fin de lograr este objetivo complejo, se planea la investigación industrial e interdisciplinaria en la que participan científicos experimentados del Centro de Investigación y Estudio Biomédico de Letonia (BMC) y géneros Ltd., que tiene competencia en biología molecular, biomédica y ciencias médicas. El proyecto corresponde a 3.5. «Otras ciencias médicas» (biomedicina) y 3.2. «Medicina clínica» para disciplinas científicas y no está relacionada con la actividad económica. Código de la nomenclatura estadística de actividades económicas (NACE Rev. 2) correspondiente al ámbito de ejecución del proyecto (para el sector económico) y resultados esperados — 86 — Salud, de los cuales: 86.10 — Actividades hospitalarias.Gastos del proyecto: 540 540,54 EUR (importe de ayuda del FEDER: 444 810,81 EUR). Duración del proyecto: 35 meses (01.01.2021-30.11.2023).En el marco del proyecto, se prevén tres actividades conexas para alcanzar el objetivo:1. Evaluación de la idoneidad de WGS en diferentes momentos de la práctica clínica.2. Desarrollo de un protocolo para la implementación de M. tuberculosis WGS en la práctica clínica.3. Evaluación del concepto WGS en comparación con la práctica clínica existente. Este proyecto combina estudios moleculares, microbiológicos y epidemiológicos y llevará a cabo el desarrollo y evaluación del flujo de trabajo de WGS adecuado a las necesidades de la clínica. La implementación del proyecto contribuirá a reducir el riesgo de infección por tuberculosis. Se promoverá el desarrollo de laboratorios, el desarrollo de capacidades de los servicios de diagnóstico molecular y la formación de jóvenes profesionales, lo que es especialmente importante para las amenazas emergentes para la salud, como la COVID-19. Además, la obtención de datos completos de secuenciación del genoma para cepas resistentes a M.tuberculosis es de importancia internacional para fines de investigación epidemiológica y de resistencia a los medicamentos. tuberculosis resistente a múltiples fármacos, secuenciación completa del genoma, diagnóstico molecular. (Spanish)
12 January 2022
0 references
Tuberkuloos on jätkuvalt üks kõige laastavamaid haigusi, mis mõjutavad igas vanuses inimesi kogu maailmas. See haigus on üks kümnest peamisest surmapõhjusest maailmas ja seda iseloomustab suur majanduslik tähtsus. M. tuberculosis’e ravimite resistentsete tüvede levimus ja levik on üks peamisi haigustõrje põhjuseid. Ravimiresistentsete mükobakteritega nakatunud patsiente on raske ravida, kui mitte võimatu, ning ravi, mida nad vajavad, on toksilisem ja kallim. Lätis on multiresistentne tuberkuloos tõsine rahvatervise probleem: 2017. aastal põhjustasid peaaegu 8 % kõigist tuberkuloosijuhtudest ravimiresistentsed M. tuberculosis’i tüved. Aeganõudev ja töömahukas M. tuberculosis’i diagnoos põhjustab ravi hilinemise riski. Täielik genoomi sekveneerimine (WGS) pakub kaasaegset ja kiiret diagnostilist lahendust ning on suunatud teaduslaboritest igapäevastesse rakendustesse kliinikutes. Projekti eesmärk on arendada ja hinnata M. tuberculosis’i täieliku genoomi sekveneerimise kontseptsiooni Läti kliinilises praktikas. Selle keerulise eesmärgi saavutamiseks kavandatakse koostööprojekti raames tööstuslikke ja interdistsiplinaarseid uuringuid, mis hõlmavad Läti biomeditsiiniuuringute ja -uuringute keskuse (BMC) ja biomeditsiini valdkonna kogenud teadlasi. Projekt on kooskõlas punktiga 3.5. „Muu meditsiiniteadus“ (biomeditsiin) ja 3.2. „Kliinilise meditsiini“ teadusvaldkonnad ja need ei hõlma majandustegevust. Majanduse tegevusalade statistilise klassifikaatori kood (NACE Rev. 2) – 86 – Tervisekaitse, mis vastab projekti ulatusele (põllumajandussektor) ja oodatavatele tulemustele. 86.10 – Haigla tegevus.Projekti kulud: 540540,54 eurot (ERFist antava abi summa: 444810,81 EUROT). Projekti kestus: 35 kuud (01.01.2021–30.11.2023).Projekti raames on eesmärgi saavutamiseks kavandatud kolm seotud tegevust:1. WGSi sobivuse hindamine kliinilise tava eri ajahetkedel.2. Kliinilises praktikas M. tuberculosis WGS’i rakendamise protokolli väljatöötamine.3. WGS kontseptsiooni hinnatakse praeguse kliinilise praktika alusel.See projekt ühendab molekulaar-, mikrobioloogia- ja epidemioloogiauuringud ning viib läbi kliiniku vajadustele vastava WGS-i töövoo arendamise ja hindamise. Soodustatakse laborite arendamist, molekulaardiagnostikateenuste suutlikkuse suurendamist ja noorte spetsialistide koolitamist, mis on eriti oluline uute terviseohtude puhul, nagu COVID-19. Lisaks on ravimiresistentsuse ja epidemioloogiliste uuringute seisukohalt rahvusvahelise tähtsusega andmete kogumine M.tuberculosis’e resistentsete tüvede genoomi järjestuse kohta. Multiresistentne tuberkuloos, täielik genoomi sekveneerimine, molekulaarne diagnoos. (Estonian)
3 August 2022
0 references
Tuberkuliozė išlieka viena iš labiausiai niokojančių ligų, kuriomis serga įvairaus amžiaus žmonės visame pasaulyje. Ši liga užima vieną iš dešimties mirties priežasčių pasaulyje ir pasižymi didele ekonomine svarba. Atsparių M. tuberkuliozės padermių vaistų paplitimas ir plitimas yra viena iš pagrindinių ligų kontrolės priežasčių. Pacientams, užsikrėtusiems vaistams atspariomis mikobakterijomis, sunku, jei neįmanoma, išgydyti, o jiems reikalingas gydymas yra nuodingesnis ir brangesnis. Latvijoje daugeliui vaistų atspari tuberkuliozė yra rimta visuomenės sveikatos problema: 2017 m. beveik 8 % visų tuberkuliozės atvejų atsirado dėl vaistams atsparių M. tuberculosis padermių. Daug laiko reikalaujanti ir sunki M. tuberkuliozės diagnozė kelia riziką, kad gydymas bus atidėtas. Pilnas genomo sekos nustatymas (WGS) siūlo modernų ir greitą diagnostinį sprendimą, nukreiptą iš mokslo laboratorijų į kasdienį taikymą klinikose. Projekto tikslas – sukurti ir įvertinti visiško M.tuberkuliozės genomo sekos įtraukimo į klinikinę praktiką Latvijoje koncepciją. Siekiant šio sudėtingo tikslo, bendradarbiavimo projekto metu planuojami pramoniniai, tarpdisciplininiai tyrimai, kuriuose dalyvauja patyrę Latvijos biomedicininių tyrimų ir studijų centro (BMC) ir biomedicinos sričių mokslininkai. Projektas atitinka 3.5 punktą. „Kiti medicinos mokslai“ (biomedicina) ir 3.2. „Klinikinės medicinos“ mokslo sritys, nesusijusios su ekonomine veikla. Statistinio ekonominės veiklos rūšių klasifikatoriaus (NACE 2 red.) kodas – 86 – Sveikatos apsauga, atitinkantis projekto apimtį (ūkio sektorius) ir numatomus rezultatus. 86.10 – Ligoninių veikla.Projekto išlaidos: 540 540,54 EUR (iš ERPF skiriamos pagalbos suma: 444 810,81 EUR). Projekto trukmė: 35 mėnesiai (2021 m. sausio 1 d.-2023 m. lapkričio 30 d.).Projekte numatyta trys susijusios veiklos, kad būtų pasiektas tikslas:1. WGS tinkamumo vertinimas įvairiais klinikinės praktikos laiko momentais.2. M. tuberculosis WGS įgyvendinimo klinikinėje praktikoje protokolo parengimas.3. WGS koncepcija vertinama pagal dabartinę klinikinę praktiką. Šis projektas sujungia molekulinius, mikrobiologijos ir epidemiologijos tyrimus ir atliks WGS darbo eigos, atitinkančios klinikos poreikius, kūrimą ir vertinimą. Bus skatinamas laboratorijų kūrimas, molekulinės diagnostikos paslaugų gebėjimų stiprinimas ir jaunų specialistų mokymas, o tai ypač svarbu kilus naujoms grėsmėms sveikatai, pvz., COVID-19. Be to, duomenų apie atsparių M.tuberculozės padermių genomo seką rinkimas turi tarptautinę reikšmę atsparumui vaistams ir epidemiologiniams tyrimams. Daugeliui vaistų atspari tuberkuliozė, visiškas genomo sekos nustatymas, molekulinė diagnostika. (Lithuanian)
3 August 2022
0 references
Tuberkuloza je i dalje jedna od najrazornijih bolesti koje pogađaju ljude svih dobnih skupina diljem svijeta. Ova bolest zauzima jedan od top 10 uzroka smrti u svijetu i karakterizira je veliki gospodarski značaj. Prevalencija i širenje rezistentnih sojeva M. tuberculosis lijekova jedan su od glavnih uzroka kontrole bolesti. Pacijenti zaraženi mikobakterijama rezistentnima na lijekove teško je, ako ne i nemoguće, izliječiti, a liječenje im je potrebno otrovnije i skuplje. U Latviji je tuberkuloza otporna na više lijekova ozbiljan javnozdravstveni problem: U 2017. gotovo 8 % svih slučajeva tuberkuloze bilo je uzrokovano sojevima M. tuberculosis rezistentnima na lijekove. Dugotrajna i naporna dijagnoza M. tuberculosis predstavlja rizik od odgođenog liječenja. Kompletno sekvenciranje genoma (WGS) nudi moderno i brzo dijagnostičko rješenje i usmjereno je iz znanstvenih laboratorija na svakodnevne primjene u klinikama. Cilj projekta je razviti i ocijeniti koncept uključivanja potpunog sekvenciranja genoma M. tuberculosis u kliničku praksu u Latviji. Kako bi se postigao ovaj složeni cilj, u okviru projekta suradnje planira se industrijsko, interdisciplinarno istraživanje koje uključuje iskusne znanstvenike iz Latvijskog centra za biomedicinska istraživanja i studije (BMC) i biomedicinskih područja. Projekt je u skladu s točkom 3.5. „Druga medicinska znanost” (biomedicina) i 3.2. Znanstvena područja „kliničke medicine” i ne uključuju gospodarsku djelatnost. Oznaka statističke klasifikacije gospodarskih djelatnosti (NACE Rev. 2) – 86 – Zaštita zdravlja, koja odgovara opsegu projekta (sektor poljoprivrednog gospodarstva) i očekivanim rezultatima. 86.10 – Bolničke djelatnosti. Troškovi projekta: 540 540,54 EUR (iznos potpore iz EFRR-a: 444 810,81 EUR). Trajanje projekta: 35 mjeseci (01.01.2021 – 30.11.2023).U okviru projekta planiraju se tri povezane aktivnosti za postizanje cilja:1. Procjena prikladnosti WGS-a u različitim vremenskim točkama u kliničkoj praksi.2. Razvoj protokola za provedbu WGS-a M. tuberculosis u kliničkoj praksi.3. Koncept WGS procjenjuje se u odnosu na trenutnu kliničku praksu. Ovaj projekt kombinira molekularne, mikrobiološke i epidemiološke studije te će obavljati razvoj i procjenu tijeka rada WGS-a koji odgovara potrebama klinike. Poticat će se razvoj laboratorija, izgradnja kapaciteta usluga molekularne dijagnostike i osposobljavanje mladih stručnjaka, što je posebno važno u slučaju novih prijetnji zdravlju kao što je COVID-19. Osim toga, prikupljanje podataka o sekvenciranju genoma rezistentnih sojeva M.tuberculosis od međunarodnog je značaja za otpornost na lijekove i epidemiološka ispitivanja. Tuberkuloza otporna na više lijekova, potpuna sekvenciranje genoma, molekularna dijagnoza. (Croatian)
3 August 2022
0 references
Η φυματίωση παραμένει μία από τις πιο καταστροφικές ασθένειες που πλήττουν άτομα όλων των ηλικιών σε όλο τον κόσμο. Αυτή η ασθένεια καταλαμβάνει μία από τις 10 πρώτες αιτίες θανάτου στον κόσμο και χαρακτηρίζεται από μεγάλη οικονομική σημασία. Ο επιπολασμός και η εξάπλωση ανθεκτικών στελεχών των φαρμάκων M. tuberculosis είναι μία από τις κύριες αιτίες του ελέγχου της νόσου. Οι ασθενείς που έχουν μολυνθεί από ανθεκτικά στα φάρμακα μυκοβακτήρια είναι δύσκολο, αν όχι αδύνατο, να θεραπεύσουν, και η θεραπεία που χρειάζονται είναι πιο τοξική και ακριβότερη. Στη Λετονία, η πολυανθεκτική φυματίωση αποτελεί σοβαρό πρόβλημα δημόσιας υγείας: Το 2017, σχεδόν το 8 % όλων των κρουσμάτων φυματίωσης προκλήθηκαν από ανθεκτικά στα φάρμακα στελέχη της Μ. φυματίωσης. Η χρονοβόρα και επίπονη διάγνωση της M. tuberculosis ενέχει κίνδυνο καθυστερημένης θεραπείας. Η πλήρης αλληλουχία γονιδιώματος (WGS) προσφέρει μια σύγχρονη και γρήγορη διαγνωστική λύση και κατευθύνεται από επιστημονικά εργαστήρια σε καθημερινές εφαρμογές σε κλινικές. Σκοπός του έργου είναι η ανάπτυξη και αξιολόγηση της έννοιας της ένταξης της πλήρους γονιδιωματικής αλληλουχίας της Μ. φυματίωσης στην κλινική πρακτική στη Λετονία. Προκειμένου να επιτευχθεί αυτός ο σύνθετος στόχος, στο πλαίσιο του προγράμματος συνεργασίας, σχεδιάζεται στο πλαίσιο του προγράμματος συνεργασίας βιομηχανική, διεπιστημονική έρευνα με τη συμμετοχή έμπειρων επιστημόνων από το Κέντρο Βιοϊατρικής Έρευνας και Μελέτης της Λετονίας (BMC) και βιοϊατρικά πεδία. Το έργο είναι σύμφωνο με το σημείο 3.5. «Άλλες ιατρικές επιστήμες» (Βιομεδίνη) και 3.2. Οι επιστημονικοί τομείς της «κλινικής ιατρικής» και δεν αφορούν οικονομική δραστηριότητα. Κωδικός της στατιστικής ταξινόμησης των οικονομικών δραστηριοτήτων (NACE αναθ. 2) — 86 — Προστασία της υγείας, που αντιστοιχεί στο πεδίο εφαρμογής του σχεδίου (γεωργικός τομέας) και τα αναμενόμενα αποτελέσματα. 86.10 — Δραστηριότητες νοσοκομείων.Δαπάνες έργου: 540 540,54 EUR (το ποσό της ενίσχυσης από το ΕΤΠΑ: 444 810,81 EUR). Διάρκεια του σχεδίου: 35 μήνες (01.01.2021-30.11.2023).Στο πλαίσιο του έργου, προγραμματίζονται τρεις σχετικές δραστηριότητες για την επίτευξη του στόχου:1. Αξιολόγηση της καταλληλότητας του WGS σε διάφορα χρονικά σημεία της κλινικής πρακτικής.2. Ανάπτυξη πρωτοκόλλου για την εφαρμογή του M. tuberculosis WGS στην κλινική πρακτική.3. Η έννοια του WGS αξιολογείται με βάση την τρέχουσα κλινική πρακτική. Αυτό το έργο συνδυάζει μοριακές, μικροβιολογικές και επιδημιολογικές μελέτες και θα εκτελέσει την ανάπτυξη και αξιολόγηση της ροής εργασίας του WGS κατάλληλη για τις ανάγκες της κλινικής. Θα ενθαρρυνθεί η ανάπτυξη εργαστηρίων, η ανάπτυξη ικανοτήτων μοριακών διαγνωστικών υπηρεσιών και η κατάρτιση νέων επαγγελματιών, κάτι που είναι ιδιαίτερα σημαντικό στην περίπτωση νέων απειλών για την υγεία, όπως η νόσος COVID-19. Επιπλέον, η συλλογή δεδομένων σχετικά με την αλληλουχία του γονιδιώματος των ανθεκτικών στελεχών της M.tuberculosis έχει διεθνή σημασία για την αντοχή στα φάρμακα και τις επιδημιολογικές μελέτες. Πολυανθεκτική φυματίωση, πλήρης αλληλουχία γονιδιώματος, μοριακή διάγνωση. (Greek)
3 August 2022
0 references
Tuberkulóza zostáva jednou z najničivejších chorôb, ktoré postihujú ľudí všetkých vekových kategórií na celom svete. Táto choroba zaberá jednu z 10 najlepších príčin smrti na svete a je charakterizovaná veľkým hospodárskym významom. Prevalencia a šírenie rezistentných kmeňov M. tuberculosis liekov sú jednou z hlavných príčin kontroly chorôb. Pacienti infikovaní mykobaktériami rezistentnými voči liekom je ťažké, ak nie nemožné, vyliečiť a liečba, ktorú potrebujú, je toxickejšia a drahšia. V Lotyšsku je viacrezistentná tuberkulóza závažným problémom v oblasti verejného zdravia: V roku 2017 bolo takmer 8 % všetkých prípadov tuberkulózy zapríčinených kmeňmi M. tuberculosis rezistentnými voči liekom. Časovo náročná a pracná diagnóza M. tuberculosis predstavuje riziko oneskorenej liečby. Úplné sekvenovanie genómu (WGS) ponúka moderné a rýchle diagnostické riešenie a je zamerané z vedeckých laboratórií na každodenné aplikácie na kliniky. Cieľom projektu je rozvíjať a hodnotiť koncepciu začlenenia úplnej sekvenovania genómu M. tuberkulózy do klinickej praxe v Lotyšsku.Na dosiahnutie tohto komplexného cieľa sa v rámci projektu spolupráce plánuje priemyselný, interdisciplinárny výskum zahŕňajúci skúsených vedcov z lotyšského biomedicínskeho výskumného a študijného centra (BMC) a biomedicínskych oblastí. Projekt je v súlade s bodom 3.5. „Iná lekárska veda“ (Biomedicína) a 3.2. Vedecké oblasti „klinickej medicíny“ a nezahŕňajú hospodársku činnosť. Kód štatistickej klasifikácie ekonomických činností (NACE Rev. 2) – 86 – Ochrana zdravia, ktorá zodpovedá rozsahu projektu (poľnohospodársky sektor) a očakávaným výsledkom. 86.10 – Nemocničné činnosti.Náklady na projekt: 540 540,54 EUR (výška pomoci z EFRR: 444 810,81 EUR). Trvanie projektu: 35 mesiacov (01.01.2021 – 30.11.2023).V rámci projektu sú naplánované tri súvisiace činnosti na dosiahnutie cieľa:1. Hodnotenie vhodnosti WGS v rôznych časových bodoch klinickej praxe.2. Vypracovanie protokolu na implementáciu WGS M. tuberculosis v klinickej praxi.3. Koncept WGS je hodnotený na základe súčasnej klinickej praxe.Tento projekt kombinuje molekulárne, mikrobiologické a epidemiologické štúdie a bude vykonávať vývoj a hodnotenie pracovného postupu WGS zodpovedajúce potrebám kliniky. Bude sa podporovať rozvoj laboratórií, budovanie kapacít služieb molekulárnej diagnostiky a odborná príprava mladých odborníkov, čo je obzvlášť dôležité v prípade nových zdravotných hrozieb, ako je ochorenie COVID-19. Okrem toho má zber údajov o sekvenovaní genómov rezistentných kmeňov M. tuberkulózy medzinárodný význam pre rezistenciu na lieky a epidemiologické štúdie. Multirezistentná tuberkulóza, úplné sekvenovanie genómov, molekulárna diagnóza. (Slovak)
3 August 2022
0 references
Tuberkuloosi on edelleen yksi tuhoisimmista sairauksista, jotka vaikuttavat kaikenikäisiin ihmisiin ympäri maailmaa. Tämä tauti on yksi maailman kymmenestä tärkeimmästä kuolinsyystä, ja sille on ominaista suuri taloudellinen merkitys. M. tuberculosis -lääkkeiden resistenttien kantojen esiintyvyys ja leviäminen ovat yksi tärkeimmistä tautien torjunnan syistä. Potilaille, joilla on lääkeresistentti mykobakteerit, on vaikeaa, ellei mahdotonta, parantaa, ja heidän tarvitsemansa hoito on myrkyllisempää ja kalliimpaa. Latviassa monilääkeresistentti tuberkuloosi on vakava kansanterveydellinen ongelma: Vuonna 2017 lähes 8 prosenttia kaikista tuberkuloositapauksista johtui M. tuberculosis -bakteerin lääkeresistentistä kannoista. Aikaa vievä ja työläs M. tuberculosis -diagnoosi aiheuttaa hoidon viivästymisen riskin. Täydellinen genomin sekvensointi (WGS) tarjoaa modernin ja nopean diagnostisen ratkaisun, joka on suunnattu tieteellisistä laboratorioista päivittäisiin sovelluksiin klinikoilla. Hankkeen tavoitteena on kehittää ja arvioida M. tuberculosis -tuberkuloosin täysimääräisen genomin sekvensoinnin käsitettä kliinisessä käytännössä Latviassa. Tämän monimutkaisen tavoitteen saavuttamiseksi yhteistyöhankkeen puitteissa suunnitellaan teollista, tieteidenvälistä tutkimusta, johon osallistuu Latvian biolääketieteellisen tutkimuskeskuksen (BMC) kokeneita tutkijoita ja biolääketieteen aloja. Hanke on 3.5 kohdan mukainen. ”Muu lääketiede” (biomedicine) ja 3.2. ”Kliinisen lääketieteen” tieteenalat, joihin ei liity taloudellista toimintaa. Tilastollisen toimialaluokituksen (NACE Rev. 2) koodi – 86 – Terveyden suojelu, joka vastaa hankkeen soveltamisalaa (maatilasektori) ja odotettuja tuloksia. 86.10 – Sairaalatoiminta.Projektin kustannukset: 540540,54 euroa (EAKR:n tuen määrä: 444810,81 EUROA). Hankkeen kesto: 35 kuukautta (01.01.2021–30.11.2023). Hankkeen aikana suunnitellaan kolme asiaan liittyvää toimea tavoitteen saavuttamiseksi:1. WGS:n soveltuvuuden arviointi kliinisen käytännön eri ajankohtina.2. Tutkimussuunnitelman laatiminen M. tuberculosis WGS:n toteuttamiseksi kliinisessä käytännössä.3. WGS-konseptia arvioidaan nykyisen kliinisen käytännön perusteella. Tässä hankkeessa yhdistyvät molekyyli-, mikrobiologia- ja epidemiologiatutkimukset ja toteutetaan WGS-työnkulun kehittäminen ja arviointi klinikan tarpeiden mukaisesti. Laboratorioiden kehittämistä, molekyylidiagnoosipalvelujen valmiuksien kehittämistä ja nuorten ammattilaisten koulutusta kannustetaan, mikä on erityisen tärkeää uusien terveysuhkien, kuten covid-19:n, tapauksessa. Lisäksi M.tuberculosis-resistenttien kantojen genomin sekvensointia koskevien tietojen keräämisellä on kansainvälistä merkitystä lääkeresistenssin ja epidemiologisten tutkimusten kannalta. Monilääkeresistentti tuberkuloosi, täydellinen genomin sekvensointi, molekyylidiagnoosi. (Finnish)
3 August 2022
0 references
Gruźlica pozostaje jedną z najbardziej niszczycielskich chorób dotykających ludzi w każdym wieku na całym świecie. Choroba ta zajmuje jedną z 10 najlepszych przyczyn zgonu na świecie i charakteryzuje się dużym znaczeniem ekonomicznym. Częstość występowania i rozprzestrzenianie się opornych szczepów leków M. tuberculosis są jedną z głównych przyczyn zwalczania choroby. Pacjenci zarażeni lekoopornymi mykobakterie są trudne, jeśli nie niemożliwe, do wyleczenia, a leczenie, którego potrzebują jest bardziej toksyczne i droższe. Na Łotwie gruźlica wielolekooporna stanowi poważny problem w zakresie zdrowia publicznego: W 2017 r. prawie 8 % wszystkich przypadków gruźlicy było spowodowanych szczepami M. gruźlicy opornymi na leki. Czasochłonna i pracochłonna diagnoza M. gruźlicy stwarza ryzyko opóźnionego leczenia. Pełna sekwencjonowanie genomów (WGS) oferuje nowoczesne i szybkie rozwiązanie diagnostyczne i jest kierowane od laboratoriów naukowych do codziennych zastosowań w klinice.Celem projektu jest opracowanie i ocena koncepcji włączenia pełnego genomu sekwencjonowania M. gruźlicy do praktyki klinicznej na Łotwie.Aby osiągnąć ten złożony cel, w ramach projektu współpracy planowane są badania przemysłowe, interdyscyplinarne z udziałem doświadczonych naukowców z łotewskiego centrum badań i badań biomedycznych (BMC) oraz dziedzin biomedycznych w ramach projektu współpracy. Projekt jest zgodny z 3.5. „Inna nauka medyczna” (Biomedycyna) i 3.2. „Medycyna kliniczna” dziedzin naukowych i nie obejmuje działalności gospodarczej. Kod statystycznej klasyfikacji działalności gospodarczej (NACE Rev. 2) – 86 – Ochrona zdrowia, odpowiadający zakresowi projektu (sektor gospodarstw rolnych) i oczekiwanym rezultatom. 86.10 – Działalność szpitalna.Koszty projektu: 540 540,54 EUR (kwota pomocy z EFRR: 444 810,81 EUR). Czas trwania projektu: 35 miesięcy (01.01.2021-30.11.2023).W ramach projektu planuje się trzy powiązane działania, aby osiągnąć cel:1. Ocena przydatności WGS w różnych punktach czasowych w praktyce klinicznej.2. Opracowanie protokołu wdrażania M. gruźlicy WGS w praktyce klinicznej.3. Koncepcja WGS jest oceniana w oparciu o obecną praktykę kliniczną. Projekt ten łączy badania molekularne, mikrobiologiczne i epidemiologiczne oraz przeprowadzi opracowanie i ocenę przepływu pracy WGS stosownie do potrzeb kliniki. Zachęca się do rozwoju laboratoriów, budowania zdolności w zakresie usług diagnostyki molekularnej oraz szkolenia młodych specjalistów, co jest szczególnie ważne w przypadku nowych zagrożeń dla zdrowia, takich jak COVID-19. Ponadto gromadzenie danych na temat sekwencjonowania genomów opornych szczepów M.tuberculosis ma międzynarodowe znaczenie dla oporności na leki i badań epidemiologicznych. Gruźlica wielolekooporna, kompletne sekwencjonowanie genomów, diagnostyka molekularna. (Polish)
3 August 2022
0 references
A tuberkulózis továbbra is az egyik legpusztítóbb betegség, amely a világ minden korosztályát érinti. Ez a betegség a világ 10 halálozási okának egyikét foglalja el, és nagy gazdasági jelentőséggel bír. Az M. tuberculosis gyógyszerek rezisztens törzseinek prevalenciája és terjedése a járványvédelem egyik fő oka. A gyógyszerrezisztens mikobaktériumokkal fertőzött betegeket nehéz, ha nem lehetetlen gyógyítani, és a szükséges kezelés mérgezőbb és drágább. Lettországban a multirezisztens tuberkulózis súlyos közegészségügyi problémát jelent: 2017-ben a tuberkulózisos esetek közel 8%-át az M. tuberculosis gyógyszerrezisztens törzsei okozták. Az M. tuberculosis időigényes és fáradságos diagnózisa a késleltetett kezelés kockázatát hordozza. A teljes genomszekvenálás (WGS) modern és gyors diagnosztikai megoldást kínál, és a tudományos laboratóriumoktól a klinikák napi alkalmazásai felé irányítja. A projekt célja az M. tuberculosis teljes genomszekvenálásának Lettországban a klinikai gyakorlatba való felvételének fejlesztése és értékelése. Ennek az összetett célnak az elérése érdekében az együttműködési projekt keretében ipari, interdiszciplináris kutatást terveznek, amelyben a lett Biomedical Research and Study Centre (BMC) és az orvosbiológiai területek tapasztalt tudósai vesznek részt az együttműködési projekt keretében. A projekt összhangban van a 3.5. ponttal. „Egyéb orvostudomány” (biomedicin) és 3.2. „Klinikai orvostudomány” tudományos területek, amelyek nem foglalnak magukban gazdasági tevékenységet. A gazdasági tevékenységek statisztikai osztályozásának kódja (NACE Rev. 2) – 86 – Egészségvédelem, amely megfelel a projekt hatókörének (gazdasági ágazat) és a várt eredményeknek. 86.10 – Kórházi tevékenységek.Projektköltségek: 540 540,54 EUR (az ERFA-ból nyújtott támogatás összege: 444 810,81 EUR). A projekt időtartama: 35 hónap (2021.01.01. – 23.11.30).A projekt során három kapcsolódó tevékenységet terveznek a cél elérése érdekében:1. A WGS alkalmasságának értékelése a klinikai gyakorlatban különböző időpontokban.2. Az M. tuberculosis WGS klinikai gyakorlatban történő alkalmazására vonatkozó protokoll kidolgozása.3. A WGS koncepciót a jelenlegi klinikai gyakorlat alapján értékelik.Ez a projekt egyesíti a molekuláris, mikrobiológiai és epidemiológiai tanulmányokat, és elvégzi a WGS munkafolyamat fejlesztését és értékelését a klinika igényeinek megfelelően. Ösztönözni kell a laboratóriumi fejlesztést, a molekuláris diagnosztikai szolgáltatások kapacitásépítését és a fiatal szakemberek képzését, ami különösen fontos az olyan új egészségügyi veszélyek esetében, mint a Covid19. Emellett az M.tuberculosis rezisztens törzseinek genomszekvenálására vonatkozó adatok gyűjtése nemzetközi jelentőségű a gyógyszerrezisztencia és epidemiológiai vizsgálatok szempontjából. Multirezisztens tuberkulózis, teljes genomszekvenálás, molekuláris diagnózis. (Hungarian)
3 August 2022
0 references
Tuberkulóza zůstává jednou z nejničivějších onemocnění postihujících lidi všech věkových kategorií na celém světě. Tato nemoc zabírá jednu z 10 hlavních příčin smrti na světě a je charakterizována velkým hospodářským významem. Prevalence a šíření rezistentních kmenů M. tuberkulózy jsou jednou z hlavních příčin kontroly onemocnění. Pacienti infikovaní mykobakterií rezistentní vůči lékům je obtížné, ne-li nemožné, vyléčit a léčba, kterou potřebují, je toxikičtější a dražší. V Lotyšsku představuje multirezistentní tuberkulóza vážný problém v oblasti veřejného zdraví: V roce 2017 bylo téměř 8 % všech případů tuberkulózy způsobeno léky rezistentními kmeny M. tuberkulózy. Časově náročná a pracná diagnóza M. tuberkulózy představuje riziko opožděné léčby. Kompletní sekvenování genomu (WGS) nabízí moderní a rychlé diagnostické řešení a je zaměřeno z vědeckých laboratoří na každodenní aplikace v klinikách.Cílem projektu je vyvinout a vyhodnotit koncepci začlenění plného sekvenování genomu M. tuberkulózy do klinické praxe v Lotyšsku.Pro dosažení tohoto komplexního cíle jsou v rámci projektu spolupráce plánovány průmyslový, interdisciplinární výzkum zahrnující zkušené vědce z lotyšského biomedicínského výzkumného a studijního centra (BMC) a biomedicínského oboru. Projekt je v souladu s bodem 3.5. „Ostatní lékařská věda“ (biomedicína) a 3.2. Vědecké oblasti „klinické medicíny“ a nezahrnují hospodářskou činnost. Kód statistické klasifikace ekonomických činností (NACE Rev. 2) – 86 – Ochrana zdraví, odpovídající rozsahu projektu (odvětví zemědělských podniků) a očekávaným výsledkům. 86.10 – Činnosti nemocnic. Náklady na projekt: 540 540,54 EUR (výše podpory z EFRR: 444 810,81 EUR). Doba trvání projektu: 35 měsíců (01.01.2021–30.11.2023).V rámci projektu jsou plánovány tři související činnosti k dosažení cíle:1. Vyhodnocení vhodnosti WGS v různých časových bodech klinické praxe.2. Vývoj protokolu pro implementaci M. tuberkulózy WGS v klinické praxi.3. Koncept WGS je hodnocen podle současné klinické praxe.Tento projekt kombinuje molekulární, mikrobiologické a epidemiologické studie a provede vývoj a hodnocení pracovního postupu WGS odpovídající potřebám kliniky. Bude podporován rozvoj laboratoří, budování kapacit v oblasti služeb molekulární diagnostiky a odborná příprava mladých odborníků, což je obzvláště důležité v případě nových zdravotních hrozeb, jako je COVID-19. Kromě toho má shromažďování údajů o sekvenování genomu rezistentních kmenů M.tuberkulózy mezinárodní význam pro rezistenci vůči léčivům a epidemiologické studie. Multirezistentní tuberkulóza, kompletní sekvenování genomu, molekulární diagnóza. (Czech)
3 August 2022
0 references
Tá eitinn fós ar cheann de na galair is tubaisteacha a théann i bhfeidhm ar dhaoine de gach aois ar fud an domhain. Tá an galar seo ar cheann de na 10 cúiseanna is fearr le bás ar fud an domhain agus tá tábhacht mhór eacnamaíoch ann. Tá leitheadúlacht agus scaipeadh tréithchineálacha frithsheasmhacha drugaí M. tuberculosis ar cheann de na príomhchúiseanna le rialú galar. Tá othair atá ionfhabhtaithe le mycobacteria atá frithsheasmhach in aghaidh drugaí deacair, mura bhfuil sé dodhéanta, leigheas a dhéanamh, agus tá an chóireáil a theastaíonn uathu níos tocsaineach agus níos costasaí. Sa Laitvia, fadhb thromchúiseach sláinte poiblí is ea eitinn atá frithsheasmhach in aghaidh ildrugaí: In 2017, ba iad tréithchineálacha M. eitinn atá frithsheasmhach in aghaidh drugaí ba chúis le beagnach 8 % de na cásanna eitinne ar fad. Tá baol cóireála moillithe ag baint le diagnóis ama agus saothair M. tuberculosis. Cuireann seicheamhú géanóim (WGS) réiteach diagnóiseach nua-aimseartha agus tapa ar fáil agus treoraítear é ó shaotharlanna eolaíochta chuig iarratais laethúla i gclinicí.Is é is aidhm don tionscadal an coincheap a bhaineann le seicheamhú géanóim iomlán M. tuberculosis a fhorbairt agus a mheas i gcleachtas cliniciúil sa Laitvia.Chun an sprioc chasta sin a bhaint amach, laistigh de chreat an tionscadail chomhair, tá taighde tionsclaíoch, idirdhisciplíneach a bhaineann le heolaithe a bhfuil taithí acu ó Ionad Taighde agus Staidéir Bithleighis na Laitvia (BMC) agus ó réimsí bithleighis pleanáilte faoi chuimsiú an tionscadail chomhair. Tá an tionscadal ag teacht le 3.5. “Eolaíocht leighis eile” (Biomedicine) agus 3.2. Réimsí eolaíochta “leigheas cliniciúil” agus ní bhaineann gníomhaíocht eacnamaíoch leo. Cód aicmiúcháin staidrimh gníomhaíochtaí eacnamaíocha (NACE Rev. 2) — 86 — Cosaint sláinte, a chomhfhreagraíonn do raon feidhme an tionscadail (earnáil na feirme) agus na torthaí a bhfuiltear ag súil leo. 86.10 — Gníomhaíochtaí ospidéil. Costais tionscadail: EUR 540540,54 (méid na cabhrach ó CFRE: EUR 444810,81). Fad an tionscadail: 35 mhí (01.01.2021-30.11.2023). Laistigh den tionscadal, tá trí ghníomhaíocht ghaolmhara beartaithe chun an sprioc a bhaint amach: 1. Meastóireacht ar oiriúnacht WGS ag amphointí éagsúla sa chleachtas cliniciúil.2. Prótacal a fhorbairt chun M. tuberculosis WGS a chur chun feidhme i gcleachtas cliniciúil.3. Déantar measúnú ar choincheap an WGS in aghaidh an chleachtais chliniciúil atá ann faoi láthair. Spreagfar forbairt saotharlainne, fothú acmhainneachta seirbhísí diagnóiseacha móilíneacha agus oiliúint gairmithe óga, rud atá thar a bheith tábhachtach i gcás bagairtí nua sláinte amhail COVID-19. Ina theannta sin, tá tábhacht idirnáisiúnta ag baint le bailiú sonraí maidir le seicheamhú géanóim ar thréithchineálacha frithsheasmhacha M.tuberculosis maidir le friotaíocht drugaí agus staidéir eipidéimeolaíochta. Eitinn resistant multidrug, seicheamhú géanóim iomlán, diagnóis mhóilíneach. (Irish)
3 August 2022
0 references
Tuberkuloza ostaja ena najbolj uničujočih bolezni, ki prizadenejo ljudi vseh starosti po svetu. Ta bolezen zaseda enega izmed 10 najpogostejših vzrokov smrti na svetu in je značilna za velik gospodarski pomen. Razširjenost in širjenje odpornih sevov zdravil M. tuberculosis sta eden glavnih vzrokov za obvladovanje bolezni. Bolniki, okuženi z mikobakterijami, odpornimi na zdravila, so težko, če ne nemogoče, zdraviti, zdravljenje, ki ga potrebujejo, pa je bolj strupeno in dražje. V Latviji je tuberkuloza, odporna na več zdravil, resen problem javnega zdravja: Leta 2017 so skoraj 8 % vseh primerov tuberkuloze povzročili sevi M. tuberculosis, odporni na zdravila. Dolgotrajna in naporna diagnoza M. tuberculosis predstavlja tveganje za zapoznelo zdravljenje. Popolno sekvenciranje genoma (WGS) ponuja sodobno in hitro diagnostično rešitev in je usmerjeno iz znanstvenih laboratorijev do dnevnih aplikacij v klinikah. Cilj projekta je razviti in oceniti koncept vključitve popolnega genoma sekvenciranja M. tuberculosis v klinično prakso v Latviji.Da bi dosegli ta kompleksni cilj, so v okviru projekta sodelovanja načrtovane industrijske, interdisciplinarne raziskave, ki vključujejo izkušene znanstvenike iz latvijskega biomedicinskega raziskovalnega in študijskega centra (BMC) ter biomedicinskih področij. Projekt je v skladu s točko 3.5. „Druga medicina“ (Biomedicine) in 3.2. „Klinična medicina“ znanstvena področja in ne vključujejo gospodarske dejavnosti. Koda statistične klasifikacije gospodarskih dejavnosti (NACE Rev. 2) – 86 – Varstvo zdravja, ki ustreza obsegu projekta (kmetijski sektor) in pričakovanim rezultatom. 86.10 – Bolnišnične dejavnosti.Stroški projekta: 540 540,54 EUR (znesek pomoči iz ESRR: 444 810,81 EUR). Trajanje projekta: 35 mesecev (01.01.2021–30.11.2023).V okviru projekta so načrtovane tri povezane aktivnosti za dosego cilja:1. Ocena primernosti WGS v različnih časovnih točkah v klinični praksi.2. Razvoj protokola za izvajanje M. tuberculosis WGS v klinični praksi.3. Koncept WGS se ocenjuje glede na trenutno klinično prakso. Ta projekt združuje molekularne, mikrobiološke in epidemiološke študije ter bo izvajal razvoj in vrednotenje delovnega toka WGS, ki ustreza potrebam klinike. Spodbujali se bodo laboratorijski razvoj, krepitev zmogljivosti storitev molekularne diagnostike in usposabljanje mladih strokovnjakov, kar je zlasti pomembno v primeru novih nevarnosti za zdravje, kot je COVID-19. Poleg tega je zbiranje podatkov o zaporedju genoma odpornih sevov M.tuberkuloze mednarodnega pomena za odpornost na zdravila in epidemiološke študije. Tuberkuloza, odporna na več zdravil, popolno sekvenciranje genoma, molekularna diagnoza. (Slovenian)
3 August 2022
0 references
Туберкулозата остава едно от най-опустошителните заболявания, засягащи хората от всички възрасти по света. Това заболяване заема една от 10-те най-големи причини за смърт в света и се характеризира с голямо икономическо значение. Разпространението и разпространението на резистентни щамове на М. туберкулоза лекарства са една от основните причини за контрол на заболяванията. Пациентите, заразени с резистентни към лекарства микобактерии, са трудни, ако не и невъзможно, за лечение, а лечението, от което се нуждаят, е по-токсично и по-скъпо. В Латвия мултирезистентната туберкулоза е сериозен проблем за общественото здраве: През 2017 г. почти 8 % от всички случаи на туберкулоза са причинени от резистентни към лекарства щамове на M. tuberculosis. Продължителното и трудоемко диагностициране на М. туберкулоза представлява риск от забавяне на лечението. Пълно геномно секвениране (WGS) предлага модерно и бързо диагностично решение и е насочено от научни лаборатории към ежедневни приложения в клиниките.Целта на проекта е да се разработи и оцени концепцията за включване на пълна генома секвениране на М. туберкулоза в клиничната практика в Латвия.За да се постигне тази сложна цел, в рамките на проекта за сътрудничество, в рамките на проекта за сътрудничество се планират индустриални, интердисциплинарни изследвания с участието на опитни учени от Латвийския център за биомедицински изследвания и биомедицински области. Проектът е в съответствие с точка 3.5. „Други медицински науки“ (биомедицина) и 3.2. Научните области на „клиничната медицина“ и не включват икономическа дейност. Код на статистическата класификация на икономическите дейности (NACE Rev. 2) — 86 — Здравна защита, съответстваща на обхвата на проекта (сектор „Земеделие“) и очакваните резултати. 86.10 — Болнични дейности. Разходи за проект: 540 540,54 EUR (размерът на помощта от ЕФРР: 444 810,81 EUR). Продължителност на проекта: 35 месеца (01.01.2021—30.11.2023).В рамките на проекта са планирани три свързани дейности за постигане на целта:1. Оценка на пригодността на WGS в различни моменти от клиничната практика.2. Разработване на протокол за прилагане на M. tuberculosis WGS в клиничната практика.3. Концепцията на WGS се оценява спрямо текущата клинична практика.Този проект съчетава молекулярни, микробиологични и епидемиологични проучвания и ще извърши разработването и оценката на работния процес на WGS, съобразен с нуждите на клиниката. Ще се насърчава развитието на лабораториите, изграждането на капацитет за услуги за молекулярна диагностика и обучението на млади специалисти, което е особено важно в случай на нови заплахи за здравето, като например COVID-19. Освен това събирането на данни за геномната секвенация на резистентни щамове на M.tuberculosis е от международно значение за лекарствената резистентност и епидемиологичните изследвания. Мултирезистентна туберкулоза, пълно геномно секвениране, молекулярна диагноза. (Bulgarian)
3 August 2022
0 references
It-tuberkulożi tibqa’ waħda mill-aktar mard devastanti li jaffettwa lill-persuni ta’ kull età madwar id-dinja. Din il-marda tokkupa waħda mill-ewwel 10 kawżi ta’ mewt fid-dinja u hija kkaratterizzata minn sinifikat ekonomiku kbir. Il-prevalenza u t-tixrid ta’ razez reżistenti ta’ mediċini M. tuberculosis huma waħda mill-kawżi ewlenin tal-kontroll tal-mard. Pazjenti infettati b’mikobatterji reżistenti għall-mediċina huma diffiċli, jekk mhux impossibbli, biex ifejqu, u t-trattament li jeħtieġu huwa aktar tossiku u aktar għali. Fil-Latvja, it-tuberkulożi reżistenti għal ħafna mediċini hija problema serja tas-saħħa pubblika: Fl-2017, kważi 8 % tal-każijiet kollha ta’ tuberkolożi kienu kkawżati minn razez reżistenti għall-mediċini ta’ M. tuberculosis. Dijanjosi impenjattiva u li tieħu ħafna ħin ta’ M. tuberculosis toħloq riskju ta’ kura mdewma. Is-sekwenzjar sħiħ tal-ġenoma (WGS) joffri soluzzjoni dijanjostika moderna u rapida u huwa dirett minn laboratorji xjentifiċi għal applikazzjonijiet ta’ kuljum fil-kliniki. L-għan tal-proġett huwa li jiżviluppa u jevalwa l-kunċett ta’ inklużjoni ta’ sekwenzjar sħiħ tal-ġenoma ta’ M. tuberculosis fil-prattika klinika fil-Latvja. Sabiex jintlaħaq dan l-għan kumpless, fil-qafas tal-proġett ta’ kooperazzjoni, ir-riċerka industrijali u interdixxiplinari li tinvolvi xjentisti b’esperjenza miċ-Ċentru Latvjan tar-Riċerka u l-Istudju Bijomediku (BMC) u l-oqsma bijomediċi huma ppjanati fil-qafas tal-proġett ta’ kooperazzjoni. Il-proġett huwa konformi ma’ 3.5. “Xjenza medika oħra” (Bijomediċina) u 3.2. “Mediċina klinika” oqsma xjentifiċi u ma jinvolvux attività ekonomika. Kodiċi tal-klassifikazzjoni statistika tal-attivitajiet ekonomiċi (NACE Rev. 2) — 86 — Protezzjoni tas-saħħa, li tikkorrispondi għall-ambitu tal-proġett (settur tal-biedja) u r-riżultati mistennija. 86.10 — Attivitajiet tal-isptar.Spejjeż tal-proġett: EUR 540540,54 (l-ammont tal-għajnuna mill-FEŻR: EUR 444810,81). Tul ta’ żmien tal-proġett: 35 xahar (01.01.2021–30.11.2023). Fi ħdan il-proġett, tliet attivitajiet relatati huma ppjanati biex jintlaħaq l-għan:1. Evalwazzjoni tal-adattabilità ta’ WGS f’diversi punti ta’ żmien fil-prattika klinika.2. Żvilupp ta’ protokoll għall-implimentazzjoni ta’ M. tuberculosis WGS fil-prattika klinika.3. Il-kunċett ta’ WGS huwa evalwat skont il-prattika klinika attwali. Dan il-proġett jgħaqqad studji molekulari, mikrobijoloġiċi u epidemjoloġiċi, u se jwettaq l-iżvilupp u l-evalwazzjoni tal-fluss tax-xogħol WGS xieraq għall-ħtiġijiet tal-klinika. L-iżvilupp tal-laboratorji, il-bini tal-kapaċità ta’ servizzi dijanjostiċi molekulari u t-taħriġ ta’ professjonisti żgħażagħ se jiġu mħeġġa, li huwa partikolarment importanti fil-każ ta’ theddid ġdid għas-saħħa bħall-COVID-19. Barra minn hekk, il-ġbir ta’ dejta dwar is-sekwenzjar tal-ġenoma ta’ razez reżistenti ta’ M.tuberkulosi huwa ta’ sinifikat internazzjonali għar-reżistenza għall-mediċini u għall-istudji epidemjoloġiċi. Tuberkulosi reżistenti għal ħafna mediċini, sekwenzar sħiħ tal-ġenoma, dijanjosi molekulari. (Maltese)
3 August 2022
0 references
A tuberculose continua a ser uma das doenças mais devastadoras que afetam pessoas de todas as idades em todo o mundo. Esta doença ocupa uma das 10 principais causas de morte no mundo e é caracterizada por grande significado econômico. A prevalência e disseminação de cepas resistentes de M. tuberculosis são uma das principais causas de controle da doença. Pacientes infetados com micobactérias resistentes a medicamentos são difíceis, se não impossíveis, de curar, e o tratamento de que precisam é mais tóxico e mais caro. Na Letónia, a tuberculose multirresistente é um grave problema de saúde pública: Em 2017, quase 8 % de todos os casos de tuberculose foram causados por estirpes resistentes a medicamentos de M. tuberculosis. O diagnóstico demorado e laborioso de M. tuberculosis apresenta risco de atraso no tratamento. O sequenciamento completo do genoma (WGS) oferece uma solução de diagnóstico moderna e rápida e é direcionado de laboratórios científicos para aplicações diárias em clínicas.O objetivo do projeto é desenvolver e avaliar o conceito de inclusão da sequenciação completa do genoma de M. tuberculosis na prática clínica na Letónia.A fim de alcançar este objetivo complexo, no âmbito do projeto de cooperação, a pesquisa industrial e interdisciplinar envolvendo cientistas experientes do Centro de Pesquisa e Estudos Biomédicos da Letónia (BMC) e áreas biomédicas são planejadas no âmbito do projeto de cooperação. O projeto está em conformidade com o ponto 3.5. «Outras ciências médicas» (Biomedicina) e 3.2. «Medicina clínica» campos científicos e não envolvem atividade econômica. Código da nomenclatura estatística das atividades económicas (NACE Rev. 2) — 86 — Proteção sanitária, correspondente ao âmbito do projeto (setor agrícola) e resultados esperados. 86.10 — Atividades hospitalares.Despesas do projeto: 540 540,54 EUR (montante da ajuda do FEDER: 444 810,81 EUR). Duração do projeto: 35 meses (01.01.2021 — 30.11.2023).No âmbito do projeto, estão previstas três atividades conexas para atingir o objetivo:1. Avaliação da adequação da WGS em vários momentos da prática clínica.2. Desenvolvimento de protocolo para implementação de M. tuberculosis WGS na prática clínica.3. O conceito WGS é avaliado em relação à prática clínica atual. Este projeto combina estudos moleculares, microbiologia e epidemiologia, e realizará o desenvolvimento e avaliação do fluxo de trabalho da WGS adequado às necessidades da clínica. Serão incentivados o desenvolvimento laboratorial, o reforço das capacidades dos serviços de diagnóstico molecular e a formação de jovens profissionais, o que é particularmente importante no caso de novas ameaças para a saúde, como a COVID-19. Além disso, a coleta de dados sobre sequenciamento genoma de cepas resistentes de M.tuberculose é de importância internacional para a resistência a medicamentos e estudos epidemiológicos. Tuberculose multirresistente, sequenciamento completo do genoma, diagnóstico molecular. (Portuguese)
3 August 2022
0 references
Tuberkulose er fortsat en af de mest ødelæggende sygdomme, der rammer mennesker i alle aldre rundt om i verden. Denne sygdom indtager en af de 10 største dødsårsager i verden og er kendetegnet ved stor økonomisk betydning. Prævalensen og spredningen af resistente stammer af lægemidler mod M. tuberkulose er en af hovedårsagerne til sygdomsbekæmpelse. Patienter inficeret med lægemiddelresistente mykobakterier er vanskelige, hvis ikke umulige, at helbrede, og den behandling, de har brug for, er mere giftig og dyrere. I Letland er multiresistent tuberkulose et alvorligt folkesundhedsproblem: I 2017 var næsten 8 % af alle tuberkulosetilfælde forårsaget af lægemiddelresistente stammer af M. tuberculosis. Tidskrævende og besværlig diagnose af M. tuberkulose udgør en risiko for forsinket behandling. Full genom sekventering (WGS) tilbyder en moderne og hurtig diagnostisk løsning og er rettet fra videnskabelige laboratorier til daglige applikationer i klinikker.Formålet med projektet er at udvikle og evaluere begrebet inddragelse af fuld genom sekventering af M. tuberculosis i klinisk praksis i Letland.For at nå dette komplekse mål, inden for rammerne af samarbejdsprojektet, industriel, tværfaglig forskning, der involverer erfarne forskere fra Letlands Biomedicinsk Forsknings- og Undersøgelsescenter (BMC) og biomedicinske områder er planlagt inden for rammerne af samarbejdsprojektet. Projektet er i overensstemmelse med 3.5. "Anden lægevidenskab" (biomedicin) og 3.2. "Klinisk medicin" videnskabelige områder og omfatter ikke økonomisk aktivitet. Kode for den statistiske nomenklatur for økonomiske aktiviteter (NACE rev. 2) — 86 — Sundhedsbeskyttelse, svarende til projektets omfang (landbrugssektoren) og forventede resultater. 86.10 — Sygehusaktiviteter.Projektudgifter: 540 540,54 EUR (støtte fra EFRU: 444 810,81 EUR). Projektets varighed: 35 måneder (01.01.2021-30.11.2023).I projektet er der planlagt tre relaterede aktiviteter for at nå målet:1. Vurdering af egnetheden af WGS på forskellige tidspunkter i klinisk praksis.2. Udvikling af protokol for gennemførelse af M. tuberculosis WGS i klinisk praksis.3. WGS konceptet evalueres i forhold til nuværende klinisk praksis. Dette projekt kombinerer molekylær, mikrobiologi og epidemiologi undersøgelser, og vil udføre udvikling og evaluering af WGS workflow, der passer til klinikkens behov. Laboratorieudvikling, kapacitetsopbygning inden for molekylærdiagnosetjenester og uddannelse af unge fagfolk vil blive fremmet, hvilket er særlig vigtigt i tilfælde af nye sundhedstrusler såsom covid-19. Desuden er indsamlingen af data om genomsekventering af resistente stammer af M.tuberkulose af international betydning for lægemiddelresistens og epidemiologiske undersøgelser. Multidrug resistent tuberkulose, komplet genom sekventering, molekylær diagnose. (Danish)
3 August 2022
0 references
Tuberculoza rămâne una dintre cele mai devastatoare boli care afectează oameni de toate vârstele din întreaga lume. Această boală ocupă una dintre primele 10 cauze de deces din lume și se caracterizează printr-o mare semnificație economică. Prevalența și răspândirea tulpinilor rezistente ale medicamentelor M. tuberculoză sunt una dintre principalele cauze ale controlului bolilor. Pacienții infectați cu micobacterii rezistente la medicamente sunt dificil, dacă nu imposibil, să vindece, iar tratamentul de care au nevoie este mai toxic și mai scump. În Letonia, tuberculoza multirezistentă reprezintă o problemă gravă de sănătate publică: În 2017, aproape 8 % din toate cazurile de tuberculoză au fost cauzate de tulpini rezistente la medicamente de M. tuberculosis. Diagnosticul consumatoare de timp și laborios al tuberculozei M. prezintă un risc de întârziere a tratamentului. Secvențierea completă a genomului (WGS) oferă o soluție modernă și rapidă de diagnosticare și este direcționată de la laboratoare științifice la aplicații zilnice în clinici. Scopul proiectului este de a dezvolta și evalua conceptul de includere a secvențierii complete a genomului M. tuberculosis în practica clinică din Letonia.Pentru a atinge acest obiectiv complex, în cadrul proiectului de cooperare, sunt planificate cercetări industriale, interdisciplinare care implică oameni de știință cu experiență din cadrul Centrului de Cercetare și Studiu Biomedical din Letonia (BMC) și domenii biomedicale. Proiectul este în conformitate cu 3.5. „Alte științe medicale” (Biomedicină) și 3.2. Domeniile științifice „medicina clinică” și nu implică activitate economică. Codul nomenclatorului statistic al activităților economice (NACE Rev. 2)-86 – Protecția sănătății, care corespunde domeniului de aplicare al proiectului (sectorul agricol) și rezultatelor preconizate. 86.10 – Activități spitalicești. Costuri de proiect: 540 540,54 EUR (valoarea ajutorului din FEDR: 444 810,81 EUR). Durata proiectului: 35 luni (01.01.2021-30.11.2023).În cadrul proiectului, sunt planificate trei activități conexe pentru atingerea obiectivului:1. Evaluarea adecvării WGS în diferite momente ale practicii clinice.2. Elaborarea protocolului de implementare a M. tuberculosis WGS în practica clinică.3. Conceptul WGS este evaluat în raport cu practica clinică actuală. Acest proiect combină studii moleculare, microbiologice și epidemiologice și va efectua dezvoltarea și evaluarea fluxului de lucru WGS adecvat nevoilor clinicii. Vor fi încurajate dezvoltarea laboratoarelor, consolidarea capacităților serviciilor de diagnosticare moleculară și formarea tinerilor profesioniști, ceea ce este deosebit de important în cazul unor noi amenințări la adresa sănătății, cum ar fi COVID-19. În plus, colectarea datelor privind secvențierea genomului tulpinilor rezistente de M.tuberculoză este de importanță internațională pentru rezistența la medicamente și studiile epidemiologice. Tuberculoză multidrog rezistentă, secvențiere completă a genomului, diagnostic molecular. (Romanian)
3 August 2022
0 references
Tuberkulos är fortfarande en av de mest förödande sjukdomar som drabbar människor i alla åldrar runt om i världen. Denna sjukdom upptar en av de tio främsta dödsorsakerna i världen och kännetecknas av stor ekonomisk betydelse. Prevalensen och spridningen av resistenta stammar av M. tuberculosis-läkemedel är en av de främsta orsakerna till sjukdomsbekämpning. Patienter infekterade med läkemedelsresistenta mykobakterier är svåra, om inte omöjliga, att bota, och den behandling de behöver är giftigare och dyrare. I Lettland är multiresistent tuberkulos ett allvarligt folkhälsoproblem: Under 2017 orsakades nästan 8 % av alla tuberkulosfall av läkemedelsresistenta stammar av M. tuberculosis. Tidskrävande och mödosam diagnos av M. tuberculosis innebär en risk för fördröjd behandling. Full genomsekvensering (WGS) erbjuder en modern och snabb diagnostisk lösning och är riktad från vetenskapliga laboratorier till dagliga tillämpningar i kliniker.Syftet med projektet är att utveckla och utvärdera begreppet inkludering av fullständig genomsekvensering av M. tuberculosis i klinisk praxis i Lettland.För att uppnå detta komplexa mål, inom ramen för samarbetsprojektet, planeras industriell, tvärvetenskaplig forskning med erfarna forskare från Lettlands biomedicinska forsknings- och studiecenter (BMC) och biomedicinska områden inom ramen för samarbetsprojektet. Projektet ligger i linje med 3.5. ”Annan medicinsk vetenskap” (biomedicin) och 3.2. ”Klinisk medicin” vetenskapliga områden och omfattar inte ekonomisk verksamhet. Kod för den statistiska näringsgrensindelningen (Nace rev. 2) – 86 – Hälsoskydd, som motsvarar projektets omfattning (jordbrukssektorn) och förväntade resultat. 86.10 – Sjukhusverksamhet.Projektkostnader: 540 540,54 EUR (stödet från ERUF: 444 810,81 EUR). Projektets varaktighet: 35 månader (01.01.2021–30.11.2023). Inom projektet planeras tre relaterade aktiviteter för att uppnå målet:1. Utvärdering av WGS:s lämplighet vid olika tidpunkter i klinisk praxis.2. Utveckling av protokoll för genomförande av M. tuberculosis WGS i klinisk praxis.3. WGS-konceptet utvärderas mot aktuell klinisk praxis. Detta projekt kombinerar molekylära, mikrobiologi- och epidemiologiska studier och kommer att utföra utveckling och utvärdering av WGS arbetsflöde som är anpassat till klinikens behov. Laboratorieutveckling, kapacitetsuppbyggnad av tjänster för molekylär diagnostik och utbildning av unga yrkesverksamma kommer att uppmuntras, vilket är särskilt viktigt vid nya hälsohot som covid-19. Dessutom är insamlingen av data om genomsekvensering av resistenta stammar av M.tuberkulos av internationell betydelse för läkemedelsresistens och epidemiologiska studier. Multiresistent tuberkulos, komplett genomsekvensering, molekylär diagnos. (Swedish)
3 August 2022
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Identifiers
1.1.1.1/20/A/046
0 references