Point-of-care kit for detection of antimicrobial resistencies (RES-KIT) (Q3216410)

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Project Q3216410 in Spain
Language Label Description Also known as
English
Point-of-care kit for detection of antimicrobial resistencies (RES-KIT)
Project Q3216410 in Spain

    Statements

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    8,125.0 Euro
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    16,250.0 Euro
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    50.0 percent
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    1 January 2020
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    30 June 2021
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    INSTITUTO DE INVESTIGACION Y TECNOLOGIA AGROALIMENTARIAS
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    41°37'56.17"N, 2°10'3.50"E
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    08033
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    En Europa, 25.000 muertes anuales se deben a bacterias resistentes a los antimicrobianos (AMR), lo que representa la principal amenaza para la salud en los próximos años. El problema se ha originado principalmente por el uso indebido de antibióticos y una prescripción sin un diagnóstico adecuado (tanto en humanos como en animales). Por lo tanto, tener información oportuna de la susceptibilidad microbiana a los antibióticos en cada caso de infección es una parte clave de la solución. Hasta la fecha, el diagnóstico de infecciones AMR en la salud animal es lento, costoso y centralizado (las muestras deben enviarse a un laboratorio externo). Como resultado, los facultativos tienen que esperar un mínimo de 36 horas para obtener los resultados de laboratorio y saber qué antibióticos son efectivos para comenzar el tratamiento._x000D_ Las tecnologías alternativas de diagnóstico rápido recientemente lanzadas al mercado o en desarrollo no son capaces de una cuantificación precisa (por ejemplo, reacción en cadena de la polimerasa), o no son susceptibles de pruebas en el sitio (por ejemplo, MALDI-TOF), o son demasiado caras para un uso generalizado (por ejemplo, Secuenciación de próxima generación)._x000D_ En los últimos años, la detección de ARN ribosomal se ha propuesto como un medio para cuantificar e identificar bacterias mediante sus secuencias de ARNr 16S. Estas moléculas de ARNr están en alta concentración dentro de las células (~ 10.000 copias), por lo que pueden detectarse sin necesidad de amplificación por PCR._x000D_ En un trabajo preliminar, utilizando nuestra nueva tecnología de microfluidos, hemos demostrado la cuantificación de una secuencia de oligonucleótidos con un ensayo tipo sándwich similar a ELISA realizado en la superficie de las microperlas. Nuestros diseños de laboratorio en un chip permiten implementar un protocolo de ensayo completo que incluye pasos de lavado y bloqueo de forma automatizada. La alta relación superficie / volumen de un ensayo de microperlas dentro de los microcanales produce una mayor sensibilidad en comparación con el ELISA tradicional. La disponibilidad de un gran número de válvulas dentro de esta nueva tecnología de microfluidos proporciona una alta capacidad de multiplexación._x000D_ Con esta tecnología desarrollaremos un kit de prueba rápida (RES-KIT) para la cuantificación, identificación y prueba de susceptibilidad antimicrobiana para el tratamiento de infecciones. La cistitis en mascotas será el primer objetivo a corto plazo de RES-KIT. La orina es una muestra fácil de trabajar y el acceso al mercado veterinario es rápido gracias a la falta de regulación. 9 millones de mascotas en España son susceptibles de sufrir cistitis. A largo plazo, los productos también serán certificados para uso humano (Spanish)
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    In Europe, 25,000 deaths per year are due to Antimicrobial Resistant (AMR) bacteria, representing the major health threat for the next years. The problem was originated mainly by antibiotics misuse like prescription without proper diagnosis (both in humans and animals). Therefore, having timely information of the microbial susceptibility to antibiotics in each case of infection would be key part of the solution. Up to date, the diagnosis of AMR infections in animal health is slow, time-consuming, expensive and centralized (samples must be sent to an external lab). As a result, clinicians have to wait for a minimum of 36 hours to obtain the laboratory results and to know which antibiotics are effective to start the treatment._x000D_ _x000D_ Alternative rapid diagnostic technologies recently released to the market or under development are either not capable of precise quantification (e.g. Polymerase Chain Reaction), or not amenable for on-site testing (e.g. MALDI-TOF), or too expensive for a generalized use (e.g. Next Generation Sequencing)._x000D_ _x000D_ In recent years, detection of ribosomal RNA has been proposed as a means to quantify and identify bacteria by their 16S rRNA sequences. These rRNA molecules are in high concentration inside the cells (~10.000 copies), so that they can be detected without the need of PCR amplification. _x000D_ _x000D_ In a preliminary work, using our new microfluidic technology, we have demonstrated quantification of an oligonucleotide sequence with an ELISA-like sandwich assay performed on the surface of microbeads. Our lab-on-a-chip designs allow implementing a complete assay protocol including washing and blocking steps in an automated fashion. The high surface to volume ratio of a microbead assay inside microchannels yields increased sensitivity compared to traditional ELISA. Availability of large number of valves within this new microfluidic technology provides high multiplexing capability._x000D_ _x000D_ With this technology we will develop a rapid test kit (RES-KIT) for quantification, identification, and antimicrobial susceptibility test (AST) for the treatment of infections. Cystitis in pets will be the first RES-KIT short-term target. Urine is an easy sample to work with and access to veterinary market is rapid thanks to lack of regulation. 9 million pets in Spain are susceptible of suffering cystitis. In the long term the products will also be certified for human use. (English)
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    En Europe, 25 000 décès par an sont dus à des bactéries résistantes aux antimicrobiens (MRA), qui représentent la principale menace pour la santé dans les années à venir. Le problème est principalement dû à l’utilisation abusive d’antibiotiques et à une prescription sans diagnostic approprié (tant chez l’homme que chez l’animal). Par conséquent, l’information en temps opportun sur la sensibilité microbienne aux antibiotiques dans chaque cas d’infection est un élément clé de la solution. À ce jour, le diagnostic des infections de la RAM en santé animale est lent, coûteux et centralisé (les échantillons doivent être envoyés à un laboratoire externe). Par conséquent, les médecins doivent attendre au moins 36 heures pour obtenir des résultats de laboratoire et savoir quels antibiotiques sont efficaces au début du traitement._x000D_ Les nouvelles technologies de diagnostic rapide ou mises au point ne sont pas capables de quantifier avec précision (p. ex., réaction en chaîne par polymérase) ou ne sont pas susceptibles d’être testées sur place (p. ex. MALDI-TOF) ou elles sont trop coûteuses pour une utilisation généralisée (p. ex. séquençage de nouvelle génération)._x000D_ Ces dernières années, la détection de l’ARN ribosomique a été proposée comme moyen de quantifier et d’identifier les bactéries à travers leurs séquences 16SrNA. Ces molécules d’ARNr sont en forte concentration à l’intérieur des cellules (~10 000 copies), de sorte qu’elles peuvent être détectées sans qu’il soit nécessaire d’amplifier la PCR._x000D_ Dans un travail préliminaire, à l’aide de notre nouvelle technologie microfluide, nous avons démontré la quantification d’une séquence d’oligonucléotides avec un test sandwich de type ELISA effectué à la surface des microperles. Nos conceptions de laboratoire à puce unique vous permettent de mettre en œuvre un protocole de test complet comprenant des étapes de lavage et de verrouillage de manière automatisée. Le rapport surface/volume élevé d’un essai microperle dans les microcanaux produit une plus grande sensibilité par rapport au test ELISA traditionnel. La disponibilité d’un grand nombre de vannes au sein de cette nouvelle technologie de microfluides offre une capacité de multiplexage élevée._x000D_ Grâce à cette technologie, nous allons développer un kit de test rapide (RES-KIT) pour la quantification, l’identification et le contrôle de la sensibilité aux antimicrobiens pour le traitement des infections. La cystite animale sera le premier objectif à court terme de RES-KIT. L’urine est un échantillon facile à travailler et l’accès au marché vétérinaire est rapide grâce à l’absence de réglementation. 9 millions d’animaux de compagnie en Espagne sont sensibles à la cystite. À long terme, les produits seront également certifiés pour un usage humain (French)
    5 December 2021
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    In Europa sind 25.000 Todesfälle pro Jahr auf antimikrobielle Bakterien (AMRs) zurückzuführen, die in den kommenden Jahren die wichtigste gesundheitliche Bedrohung darstellen. Das Problem ist vor allem aus dem Missbrauch von Antibiotika und einer Verordnung ohne richtige Diagnose (sowohl beim Menschen als auch bei Tieren) entstanden. Daher ist die rechtzeitige Information über die mikrobiellen Empfindlichkeit gegenüber Antibiotika bei jedem Infektionsfall ein wesentlicher Bestandteil der Lösung. Bis heute ist die Diagnose von AMR-Infektionen bei der Tiergesundheit langsam, kostspielig und zentral (Beispiele müssen an ein externes Labor geschickt werden). Als Ergebnis müssen Ärzte mindestens 36 Stunden warten, um Laborergebnisse zu erzielen und zu wissen, welche Antibiotika am Beginn der Behandlung wirksam sind._x000D_ Neu freigesetzt oder entwickeln alternative Schnelldiagnosetechnologien sind nicht in der Lage, genaue Quantifizierung (z. B. Polymerase-Kettenreaktion) oder sind nicht anfällig für Vor-Ort-Tests (z. B. MALDI-TOF). oder sie sind zu teuer für weit verbreitete Anwendung (z. B. Next Generation Sequencing)._x000D_ In den letzten Jahren, der ribosomale RNA-Detektion wurde als Mittel zur Quantifizierung und Identifizierung von Bakterien durch ihre 16SrRNA-Sequenzen vorgeschlagen. Diese rRNA-Moleküle befinden sich in hoher Konzentration innerhalb der Zellen (~ 10.000 Kopien), so dass sie ohne die Notwendigkeit einer PCR-Amplifikation erkannt werden können._x000D_ In einer Vorarbeit haben wir mit Hilfe unserer neuen Mikrofluid-Technologie die Quantifizierung einer Oligonukleotidsequenz mit einem ELISA-ähnlichen Sandwichtest auf der Oberfläche der Mikropearlen demonstriert. Mit unseren One-Chip-Labor-Designs können Sie ein komplettes Testprotokoll implementieren, das Wasch- und Schließschritte automatisiert umfasst. Das hohe Oberflächen-Volumen-Verhältnis eines Mikro-Perlen-Tests innerhalb der Mikrokanäle erzeugt im Vergleich zu herkömmlichen ELISA eine größere Empfindlichkeit. Die Verfügbarkeit einer großen Anzahl von Ventilen innerhalb dieser neuen Mikrofluid-Technologie bietet eine hohe Multiplexfähigkeit._x000D_ Mit dieser Technologie werden wir ein Rapid Test Kit (RES-KIT) zur Quantifizierung, Identifizierung und Erprobung der antimikrobiellen Anfälligkeit für die Behandlung von Infektionen entwickeln. PET-Zystitis wird das erste kurzfristige Ziel von RES-KIT sein. Urin ist eine einfach zu arbeitende Probe und der Zugang zum Veterinärmarkt ist dank fehlender Regulierung schnell möglich. 9 Millionen Haustiere in Spanien sind anfällig für Zystitis. Langfristig werden die Produkte auch für den menschlichen Gebrauch zertifiziert (German)
    10 December 2021
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    In Europa zijn 25 000 sterfgevallen per jaar te wijten aan antimicrobiële resistente bacteriën (AMR’s), die de komende jaren de grootste bedreiging voor de gezondheid vormen. Het probleem is vooral ontstaan door het misbruik van antibiotica en een recept zonder de juiste diagnose (zowel bij mensen als bij dieren). Daarom is het hebben van tijdige informatie over microbiële gevoeligheid voor antibiotica in elk geval van infectie een essentieel onderdeel van de oplossing. Tot op heden is de diagnose van AMR-infecties in de diergezondheid traag, duur en gecentraliseerd (monsters moeten naar een extern laboratorium worden gestuurd). Als gevolg daarvan moeten artsen minimaal 36 uur wachten om laboratoriumresultaten te verkrijgen en weten welke antibiotica effectief zijn bij het starten van de behandeling._x000D_ Nieuw vrijgegeven of ontwikkelen van alternatieve snelle diagnostische technologieën zijn niet in staat tot nauwkeurige kwantificering (bv. polymerasekettingreactie), of zijn niet vatbaar voor tests ter plaatse (bv. MALDI-TOF). of ze zijn te duur voor wijdverspreid gebruik (bv. Next Generation Sequencing)._x000D_ De afgelopen jaren is ribosomale RNA-detectie voorgesteld als middel om bacteriën te kwantificeren en te identificeren via hun 16SrRNA-sequenties. Deze rRNA-moleculen zijn in hoge concentratie binnen de cellen (~ 10.000 kopieën), zodat ze kunnen worden gedetecteerd zonder de noodzaak van PCR-versterking._x000D_ In een voorbereidend werk, met behulp van onze nieuwe microvloeistoftechnologie, hebben we de kwantificering van een oligonucleotide-sequentie met een ELISA-achtige sandwichtest op het oppervlak van de microparels aangetoond. Met onze one-chip labontwerpen kunt u een volledig testprotocol implementeren dat op geautomatiseerde wijze wassen en vergrendelen omvat. De hoge oppervlakte/volumeverhouding van een micropareltest binnen de microkanalen zorgt voor een grotere gevoeligheid in vergelijking met traditionele ELISA. De beschikbaarheid van een groot aantal kleppen binnen deze nieuwe microvloeistoftechnologie biedt een hoge multiplexcapaciteit._x000D_ Met deze technologie ontwikkelen we een Rapid Test Kit (RES-KIT) voor het kwantificeren, identificeren en testen van antimicrobiële gevoeligheid voor de behandeling van infecties. PET cystitis zal de eerste kortetermijndoelstelling van RES-KIT zijn. Urine is een gemakkelijk te werken monster en de toegang tot de veterinaire markt is snel dankzij het gebrek aan regelgeving. 9 miljoen huisdieren in Spanje zijn gevoelig voor cystitis. Op lange termijn worden de producten ook gecertificeerd voor menselijk gebruik (Dutch)
    17 December 2021
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    In Europa, 25 000 decessi all'anno sono dovuti a batteri resistenti agli antimicrobici (AMR), che rappresentano la principale minaccia per la salute nei prossimi anni. Il problema è sorto principalmente dall'uso improprio di antibiotici e da una prescrizione senza una diagnosi adeguata (sia nell'uomo che negli animali). Pertanto, avere informazioni tempestive sulla suscettibilità microbica agli antibiotici in ogni caso di infezione è una parte fondamentale della soluzione. Ad oggi, la diagnosi delle infezioni da AMR nella salute degli animali è lenta, costosa e centralizzata (i campioni devono essere inviati a un laboratorio esterno). Di conseguenza, i medici devono attendere almeno 36 ore per ottenere i risultati di laboratorio e sapere quali antibiotici sono efficaci all'inizio del trattamento._x000D_ Il nuovo rilascio o lo sviluppo di tecnologie diagnostiche rapide alternative non sono in grado di quantificare con precisione (ad esempio reazione a catena della polimerasi), o non sono suscettibili a test in loco (ad esempio MALDI-TOF). o sono troppo costosi per un uso diffuso (ad esempio Next Generation Sequencing)._x000D_ Negli ultimi anni, la rilevazione ribosomica RNA è stata proposta come mezzo per quantificare e identificare i batteri attraverso le loro sequenze 16SrNA. Queste molecole di rRNA sono in alta concentrazione all'interno delle cellule (~ 10.000 copie), quindi possono essere rilevate senza la necessità di amplificazione PCR._x000D_ In un lavoro preliminare, utilizzando la nostra nuova tecnologia microfluid, abbiamo dimostrato la quantificazione di una sequenza di oligonucleotide con un test a sandwich simile a ELISA eseguito sulla superficie delle microperle. I nostri progetti di laboratorio con un chip consentono di implementare un protocollo di test completo che include le fasi di lavaggio e bloccaggio in modo automatizzato. L'elevato rapporto superficie/volume di un test di microperla all'interno dei microcanali produce una maggiore sensibilità rispetto a ELISA tradizionale. La disponibilità di un gran numero di valvole all'interno di questa nuova tecnologia microfluid fornisce un'elevata capacità di multiplexing._x000D_ Con questa tecnologia svilupperemo un Rapid Test Kit (RES-KIT) per la quantificazione, l'identificazione e il test della suscettibilità antimicrobica per il trattamento delle infezioni. La cistite da compagnia sarà il primo obiettivo a breve termine di RES-KIT. L'urina è un campione facile da lavorare e l'accesso al mercato veterinario è veloce grazie alla mancanza di regolamentazione. 9 milioni di animali domestici in Spagna sono sensibili alla cistite. A lungo termine, i prodotti saranno certificati anche per uso umano (Italian)
    16 January 2022
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    Caldes de Montbui
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    Identifiers

    IU68-016970
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