APPLICATION OF ELECTROSPRAY MASS IONISATION SPECTROMETRY FOR RAPID IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF FOOD PATHOGENS (Q3151710)
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Project Q3151710 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | APPLICATION OF ELECTROSPRAY MASS IONISATION SPECTROMETRY FOR RAPID IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF FOOD PATHOGENS |
Project Q3151710 in Spain |
Statements
106,480.0 Euro
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133,100.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2014
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30 June 2017
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UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
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43°2'46.39"N, 7°28'26.36"W
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27028
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EL INCREMENTO DE LAS ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR LOS ALIMENTOS EN LOS ULTIMOS AÑOS, CON UNA ESPECIAL EMERGENCIA DE MICROORGANISMOS PATOGENOS COMO LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, O ESCHERICHIA COLI, HA AUMENTADO LA PREOCUPACION SOBRE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA TANTO ENTRE LAS AUTORIDADES COMO EN EL SECTOR PRODUCTIVO Y ENTRE LOS CONSUMIDORES. LOS PATOGENOS ALIMENTARIOS NO PUEDEN SER ELIMINADOS COMPLETAMENTE DE TODOS LOS ESTADIOS DE LA CADENA ALIMENTARIA. ADEMAS, SEGUN EL TRATAMIENTO SUFRIDO POR EL ALIMENTO, LA MICROBIOTA PRESENTE PUEDE VARIAR. EXISTEN NUMEROSOS PATOGENOS QUE SE PUEDE REQUERIR A LA EMPRESA PROCESADORA QUE ANALICE PARA DETERMINAR LA RELATIVA SEGURIDAD DE SU PRODUCTO. LOS METODOS DE DETECCION E IDENTIFICACION RAPIDA IMPLEMENTADOS EN LA ACTUALIDAD PRESENTAN LA DESVENTAJA DE ESTAR LIMITADOS A UNAS CUANTAS ESPECIES (PCR EN TIEMPO REAL), NECESITAR UN PROCESADO LARGO (SECUENCIACION,¿), NO SER CUANTITATIVOS (SECUENCIACION, MALDI-TOF), NO PERMITIR LA DETECCION EN MEZCLAS COMPLEJAS COMO LOS ALIMENTOS (SECUENCIACION, MALDI-TOF), Y PRACTICAMENTE TODOS ELLOS NECESITAR PREVIAMENTE LA SIEMBRA EN PLACA. ES POR ELLO QUE SE HACE NECESARIA LA IMPLEMENTACION DE METODOLOGIAS QUE PERMITAN LA DETECCION RAPIDA Y PRECISA DE LAS ESPECIES CONTAMINANTES EN EL ALIMENTO ASI COMO LA CUANTIFICACION DIRECTAMENTE EN UNA MUESTRA DE ALIMENTO. ESTE ES EL CASO DE LA METODOLOGIA QUE SE PROPONE EN EL PRESENTE PROYECTO: LA DEFINICION DE PEPTIDOS BIOMARCADORES DE ESPECIES PATOGENAS Y PRODUCTORAS DE AMINAS BIOGENAS EN ALIMENTOS Y LA POSTERIOR IMPLEMENTACION DE LA APLICACION DE DICHOS PEPTIDOS PARA LA DETECCION EN MUESTRAS ALIMENTARIAS. PARA ELLO SE UTILIZARA LA CROMATOGRAFIA LIQUIDA CAPILAR ACOPLADA A ESPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM EN UN EQUIPO ELECTROSPRAY-TRAMPA IONICA (LC-ESI-IT-MS/MS) Y POSTERIOR ANALISIS MEDIANTE DIFERENTES SOFTWARE Y COMPARACION CON LAS SECUENCIAS AMINOACIDICAS DEPOSITADAS EN BASES DE DATOS._x000D_ PARA LLEVAR A CABO LA DEFINICION DE PEPTIDOS BIOMARCADORES ES NECESARIO DISPONER DE UN AMPLIO NUMERO DE CEPAS BACTERIANAS PARA LLEVAR A CABO EL ANALISIS. LAS ESPECIES BACTERIANAS QUE SE INCLUIRAN EN EL ESTUDIO COMPRENDERAN AQUELLAS QUE SE AISLAN MAS FRECUENTEMENTE EN PRODUCTOS ALIMENTARIOS, SEGUN LO DESCRITO EN LA LITERATURA, E INCLUYEN LA FAMILIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, ESTAFILOCOCOS COAGULASA-POSITIVOS; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, Y C. BOTULINUM TIPOS E Y B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS Y B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES Y YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP Y PAENIBACILLUS SPP. NUESTRO LABORATORIO DISPONE DE UNA AMPLIA COLECCION DE CEPAS BACTERIANAS AISLADAS DE DIVERSOS ALIMENTOS (CARNICOS, PESCADO, MINIMAMENTE PROCESADO Y LISTOS PARA EL CONSUMO, LACTEOS,¿). TODAS ELLAS HAN SIDO CARACTERIZADAS MEDIANTE DIFERENTES METODOLOGIAS TANTO CLASICAS COMO GENOMICAS Y PROTEOMICAS (MALDI-TOF). DICHA RELACION DE ESPECIES CON SUS CORRESPONDIENTES ESPECTROS DE MALDI-TOF Y SECUENCIA GENOMICA DEL GEN 16S RRNA ESTAN DEPOSITADAS EN LA BASE DE DATOS SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG) ASI COMO EN LA BASE DE DATOS DEL GENBANK (NCBI) (SOLO LA SECUENCIA DEL GEN 16S RRNA)._x000D_ LA METODOLOGIA Y RESULTADOS OBTENIDOS PERMITIRAN ASIMISMO AMPLIAR LA BASE DE DATOS SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG), DESARROLLADA EN NUESTRO LABORATORIO Y QUE CONSTITUIRA LA MAYOR BASE DE DATOS INTERNACIONAL DE ACCESO (Spanish)
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THE INCREASE IN FOOD-BORNE DISEASES OVER THE LAST FEW YEARS, WITH A SPECIAL EMERGENCE OF PATHOGENIC MICROORGANISMS SUCH AS LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, OR ESCHERICHIA COLI, HAS INCREASED CONCERNS ABOUT FOOD SAFETY BOTH AMONG AUTHORITIES AND IN THE PRODUCTIVE SECTOR AND AMONG CONSUMERS. FOOD PATHOGENS CANNOT BE COMPLETELY ELIMINATED FROM ALL STAGES OF THE FOOD CHAIN. IN ADDITION, ACCORDING TO THE TREATMENT SUFFERED BY THE FOOD, THE MICROBIOTA PRESENT MAY VARY. THERE ARE NUMEROUS PATHOGENS THAT THE PROCESSING COMPANY MAY BE REQUIRED TO ANALYSE TO DETERMINE THE RELATIVE SAFETY OF YOUR PRODUCT. THE DETECTION AND RAPID IDENTIFICATION METHODS CURRENTLY IMPLEMENTED PRESENTLY HAVE THE DISADVANTAGE OF BEING LIMITED TO A FEW SPECIES (REAL-TIME PCR), NEEDING LONG PROCESSING (SEQUENCE, DO), NOT BE QUANTITATIVE (SEQUENCING, MALDI-TOF), DO NOT ALLOW DETECTION IN COMPLEX MIXTURES SUCH AS FOOD (SEQUENCING, MALDI-TOF), AND PRACTICALLY ALL OF THEM NEED PREVIOUSLY PLATE SOWING. THAT IS WHY IT IS NECESSARY TO IMPLEMENT METHODS THAT ALLOW THE RAPID AND ACCURATE DETECTION OF CONTAMINATING SPECIES IN THE FOOD AS WELL AS THE QUANTIFICATION DIRECTLY IN A FOOD SAMPLE. THIS IS THE CASE WITH THE METHODOLOGY PROPOSED IN THIS PROJECT: THE DEFINITION OF BIOMARKING PEPTIDES OF PATHOGENOUS AND BIOGENOUS AMINE-PRODUCING SPECIES IN FOOD AND THE SUBSEQUENT IMPLEMENTATION OF THE APPLICATION OF THESE PEPTIDES FOR DETECTION IN FOOD SAMPLES. The LIQUID CROMATOGRAPHY ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM IN an electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) and POSTERIOR ANALISIS MEDIENT DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION WITH AMINOACIDIC SECUTIONS deposited in DATA BASES._x000D_ in order to lead to the deposition of bio-marker PEPTIDs, it is necessary to provide for a full range of BACTERIAAN CEPAS to take over the Analyses. THE BACTERIAL SPECIES INCLUDED IN THE STUDY WILL INCLUDE THOSE THAT ARE MOST FREQUENTLY ISOLATED IN FOOD PRODUCTS, AS DESCRIBED IN THE LITERATURE, AND INCLUDE THE FAMILY ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIVE STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, AND C. BOTULINUM TYPES E AND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS AND B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES AND YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP AND PAENIBACILLUS SPP. OUR LABORATORY HAS A WIDE COLLECTION OF BACTERIAL STRAINS ISOLATED FROM VARIOUS FOODS (MEAT, FISH, MINIMALLY PROCESSED AND READY FOR CONSUMPTION, MILK, ETC.). ALL OF THEM HAVE BEEN CHARACTERISED BY DIFFERENT METHODS, BOTH CLASSICAL AND GENOMIC AND PROTEOMIC (MALDI-TOF). Such RELATED SPECIES WITH YOUR SPECIFIC MALDI-TOF SPECTIVES AND GENOMIC SECUCE OF GEN 16 are deposited at the SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) as well as in the GENBANK DATA BASE (NCBI) (only the SECUENCE OF GEN 16S rRNA)._x000D_ METODOLOGY AND RESULTS they will allow them to expand the SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), developed in our laboratorium and constituting the highest international data base of access (English)
12 October 2021
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L’AUGMENTATION DES MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, AVEC L’ÉMERGENCE SPÉCIALE DE MICROORGANISMES PATHOGÈNES TELS QUE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, A ACCRU LES PRÉOCCUPATIONS AU SUJET DE LA SALUBRITÉ DES ALIMENTS TANT AU SEIN DES AUTORITÉS QUE DANS LE SECTEUR PRODUCTIF ET CHEZ LES CONSOMMATEURS. LES AGENTS PATHOGÈNES ALIMENTAIRES NE PEUVENT PAS ÊTRE COMPLÈTEMENT ÉLIMINÉS À TOUS LES STADES DE LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. EN OUTRE, SELON LE TRAITEMENT SUBI PAR L’ALIMENT, LE MICROBIOTE PRÉSENT PEUT VARIER. IL EXISTE DE NOMBREUX AGENTS PATHOGÈNES QUE L’ENTREPRISE DE TRANSFORMATION PEUT ÊTRE TENUE D’ANALYSER POUR DÉTERMINER L’INNOCUITÉ RELATIVE DE VOTRE PRODUIT. LES MÉTHODES DE DÉTECTION ET D’IDENTIFICATION RAPIDE ACTUELLEMENT MISES EN ŒUVRE ONT L’INCONVÉNIENT D’ÊTRE LIMITÉES À QUELQUES ESPÈCES (PCR EN TEMPS RÉEL), NÉCESSITANT UN TRAITEMENT LONG (SÉQUENCE, N’EST-CE PAS), NON QUANTITATIVES (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), NE PERMETTENT PAS LA DÉTECTION DANS DES MÉLANGES COMPLEXES TELS QUE LES ALIMENTS (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), ET PRATIQUEMENT TOUTES ONT BESOIN D’UN SEMIS À PLAQUES. C’EST POURQUOI IL EST NÉCESSAIRE DE METTRE EN ŒUVRE DES MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER RAPIDEMENT ET AVEC PRÉCISION LES ESPÈCES CONTAMINÉES DANS LES ALIMENTS AINSI QUE LA QUANTIFICATION DIRECTEMENT DANS UN ÉCHANTILLON ALIMENTAIRE. C’EST LE CAS DE LA MÉTHODOLOGIE PROPOSÉE DANS CE PROJET: LA DÉFINITION DES PEPTIDES DE MARQUAGE BIOLOGIQUE DES ESPÈCES PATHOGÈNES ET BIOGÈNES PRODUCTRICES D’AMINES DANS LES ALIMENTS ET LA MISE EN ŒUVRE ULTÉRIEURE DE L’APPLICATION DE CES PEPTIDES POUR LA DÉTECTION DANS LES ÉCHANTILLONS D’ALIMENTS. La cromatographie LIQUIDE ACOPLATE À SPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM DANS un ÉQUIPEMENT ET COMPARATION D’ÉQUIPEMENT IONIQUE D’Électro-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) et ANALISIS Medient Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION AVEC les sécutions aminoacides déposées dans DATA BASES._x000D_ afin de conduire au dépôt de peptidés biomarqueurs, il est nécessaire de prévoir une gamme complète de LCPEs BACTERIAAN pour prendre en charge les analyses. LES ESPÈCES BACTÉRIENNES INCLUSES DANS L’ÉTUDE COMPRENDRONT CELLES QUI SONT LE PLUS SOUVENT ISOLÉES DANS DES PRODUITS ALIMENTAIRES, COMME DÉCRIT DANS LA LITTÉRATURE, ET COMPRENDRONT LA FAMILLE DES ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIF STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ET C. BOTULINUM TYPES E ET B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ET B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ET YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ET PAENIBACILLUS SPP. NOTRE LABORATOIRE DISPOSE D’UNE VASTE COLLECTION DE SOUCHES BACTÉRIENNES ISOLÉES DE DIVERS ALIMENTS (VIANDE, POISSON, TRAITEMENT MINIMAL ET PRÊT À LA CONSOMMATION, LAIT, ETC.). TOUTES ONT ÉTÉ CARACTÉRISÉES PAR DIFFÉRENTES MÉTHODES, À LA FOIS CLASSIQUES ET GÉNOMIQUES ET PROTÉOMIQUES (MALDI-TOF). Ces SPECIES RELATIVES AVEC VOTRE SPECIFIQUE MALDI-TOF SPECIFIQUE ET LA SÉCURITÉ GÉNOMIQUE DU GEN 16 sont déposées à la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ainsi qu’à la BASE DES DONNÉES GEN (NCBI) (seulement la secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology AND RESULTS elles leur permettront d’élargir le SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), développée dans notre laboratoire et constituant la base de données internationale la plus élevée d’accès. (French)
2 December 2021
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DIE ZUNAHME LEBENSMITTELBEDINGTER KRANKHEITEN IN DEN LETZTEN JAHREN MIT EINER BESONDEREN ENTSTEHUNG PATHOGENER MIKROORGANISMEN WIE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ODER ESCHERICHIA COLI HAT SOWOHL BEI BEHÖRDEN ALS AUCH IM PRODUKTIVEN SEKTOR UND BEI DEN VERBRAUCHERN BEDENKEN HINSICHTLICH DER LEBENSMITTELSICHERHEIT VERSTÄRKT. LEBENSMITTELERREGER KÖNNEN NICHT IN ALLEN PHASEN DER LEBENSMITTELKETTE VOLLSTÄNDIG BESEITIGT WERDEN. DARÜBER HINAUS KANN JE NACH DER BEHANDLUNG DES LEBENSMITTELS DIE MIKROBIOTA VORHANDEN VARIIEREN. ES GIBT ZAHLREICHE KRANKHEITSERREGER, DIE DAS VERARBEITUNGSUNTERNEHMEN MÖGLICHERWEISE ZUR ANALYSE DER RELATIVEN SICHERHEIT IHRES PRODUKTS BENÖTIGT. DIE DERZEIT ANGEWANDTEN NACHWEIS- UND SCHNELLERKENNUNGSMETHODEN HABEN DEN NACHTEIL, SICH AUF EINIGE WENIGE ARTEN (ECHTZEIT-PCR) ZU BESCHRÄNKEN, DIE LANGE VERARBEITUNG (SEQUENZ, TUN), NICHT QUANTITATIV (SEQUENZIERUNG, MALDI-TOF) ERFORDERN, NICHT ZULASSEN, DASS KOMPLEXE GEMISCHE WIE Z. B. LEBENSMITTEL (SEQUENZIERUNG, MALDI-TOF) DETEKTIERT WERDEN, UND PRAKTISCH ALLE BRAUCHEN VORHER PLATTENSAATEN. DESHALB IST ES NOTWENDIG, METHODEN ZU IMPLEMENTIEREN, DIE DEN SCHNELLEN UND GENAUEN NACHWEIS KONTAMINIERENDER ARTEN IM LEBENSMITTEL SOWIE DIE QUANTIFIZIERUNG DIREKT IN EINER LEBENSMITTELPROBE ERMÖGLICHEN. DIES IST BEI DER IN DIESEM PROJEKT VORGESCHLAGENEN METHODIK DER FALL: DIE DEFINITION DES BIOMARKING PEPTIDES PATHOGENER UND BIOGENER AMINE-PRODUZIERENDEN ARTEN IN LEBENSMITTELN UND DIE ANSCHLIESSENDE ANWENDUNG DIESER PEPTIDE ZUM NACHWEIS IN LEBENSMITTELPROBEN. Die LIQUID-Kromatographie ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM IN einer elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) und posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE UND COMPARATION MIT Aminoacidic Secutions in DATA BASES._x000D_um die Ablagerung von Biomarker-Peptiden zu führen, ist es notwendig, eine vollständige Palette von BACTERIAAN CEPAS über die Analysen zu führen. DIE IN DER STUDIE ENTHALTENEN BAKTERIELLEN ARTEN UMFASSEN DIEJENIGEN, DIE AM HÄUFIGSTEN IN LEBENSMITTELN ISOLIERT SIND, WIE IN DER LITERATUR BESCHRIEBEN, UND UMFASSEN DIE FAMILIE ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULASE-POSITIVE STAPHYLOKOKKEN; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS UND C. BOTULINUM TYPES E UND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS UND B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES UND YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP UND PAENIBACILLUS SPP. UNSER LABOR VERFÜGT ÜBER EINE BREITE SAMMLUNG VON BAKTERIENSTÄMMEN, DIE AUS VERSCHIEDENEN LEBENSMITTELN ISOLIERT SIND (FLEISCH, FISCH, MINIMAL VERARBEITET UND KONSUMFERTIG, MILCH USW.). ALLE VON IHNEN WURDEN DURCH VERSCHIEDENE METHODEN GEKENNZEICHNET, SOWOHL KLASSISCH ALS AUCH GENOMISCH UND PROTEOMISCH (MALDI-TOF). Solche RELATED SPECIES MIT IHRE SPEZIFISCHE MALDI-TOF-Spezifikationen UND GENOMISCHE SECUCE von GEN 16 werden bei der SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) sowie in der GENBANK DATA BASE (NCBI) (nur die secuence OF GEN 16S rRNA) hinterlegt._x000D_ Metodologie UND RESULTS ermöglichen es ihnen, den SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) zu erweitern, der in unserem Laboratorium entwickelt wurde und die höchste internationale Datenbank für den Zugang bildet. (German)
9 December 2021
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DE TOENAME VAN DOOR VOEDSEL OVERGEDRAGEN ZIEKTEN IN DE AFGELOPEN JAREN, MET EEN SPECIALE OPKOMST VAN PATHOGENE MICRO-ORGANISMEN ZOALS LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OF ESCHERICHIA COLI, HEEFT ZOWEL BIJ DE AUTORITEITEN ALS BIJ DE PRODUCTIEVE SECTOR EN BIJ DE CONSUMENTEN DE BEZORGDHEID OVER DE VOEDSELVEILIGHEID VERGROOT. VOEDSELPATHOGENEN KUNNEN NIET VOLLEDIG UIT ALLE STADIA VAN DE VOEDSELKETEN WORDEN GEËLIMINEERD. BOVENDIEN, AFHANKELIJK VAN DE BEHANDELING DOOR HET VOEDSEL, KAN DE AANWEZIGE MICROBIOTA VARIËREN. ER ZIJN TAL VAN ZIEKTEVERWEKKERS DIE HET VERWERKINGSBEDRIJF NODIG KAN HEBBEN OM DE RELATIEVE VEILIGHEID VAN UW PRODUCT TE BEPALEN. DE MOMENTEEL TOEGEPASTE DETECTIE- EN SNELLE IDENTIFICATIEMETHODEN HEBBEN HET NADEEL DAT ZE BEPERKT ZIJN TOT ENKELE SOORTEN (REALTIME PCR), EEN LANGE VERWERKING NODIG HEBBEN (SEQUENTIE, NIET KWANTITATIEF), NIET KWANTITATIEF ZIJN (SEQUENCING, MALDI-TOF), HET NIET MOGELIJK MAKEN OM COMPLEXE MENGSELS ZOALS LEVENSMIDDELEN (SEQUENCING, MALDI-TOF) TE DETECTEREN, EN VRIJWEL ALLEMAAL MOETEN ZE EERDER WORDEN GEZAAID. DAAROM IS HET NOODZAKELIJK METHODEN TOE TE PASSEN DIE DE SNELLE EN NAUWKEURIGE DETECTIE VAN VERONTREINIGENDE SOORTEN IN HET LEVENSMIDDEL MOGELIJK MAKEN, ALSOOK DE KWANTIFICERING RECHTSTREEKS IN EEN LEVENSMIDDELMONSTER. DIT IS HET GEVAL MET DE IN DIT PROJECT VOORGESTELDE METHODOLOGIE: DE DEFINITIE VAN BIOMARKING VAN PEPTIDEN VAN PATHOGENE EN BIOGENE AMINEPRODUCERENDE SOORTEN IN LEVENSMIDDELEN EN DE DAAROPVOLGENDE TOEPASSING VAN DE TOEPASSING VAN DEZE PEPTIDEN VOOR DETECTIE IN VOEDSELMONSTERS. De LIQUID cromatografie ACOPLATE TO SPECTROMETRIA VAN MASAS IN TANDEM IN een elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) en achterste ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE EN COMPARATION MET aminozuur secutions gedeponeerd in DATA BASES._x000D_ om te leiden tot de depositie van bio-marker peptiden, is het noodzakelijk om te voorzien in een volledig bereik van BACTERIAAN CEPAS over de Analyses. DE IN HET ONDERZOEK OPGENOMEN BACTERIËLE SOORTEN OMVATTEN DE SOORTEN DIE HET VAAKST GEÏSOLEERD ZIJN IN LEVENSMIDDELEN, ZOALS BESCHREVEN IN DE LITERATUUR, EN OMVATTEN DE FAMILIE ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIEVE STAFYLOKOKKEN; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, EN C. BOTULINUM TYPES E EN B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS EN B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES EN YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP. EN PAENIBACILLUS SPP. HEEFT EEN BREDE VERZAMELING BACTERIËLE STAMMEN GEÏSOLEERD UIT VERSCHILLENDE VOEDINGSMIDDELEN (VLEES, VIS, MINIMAAL VERWERKT EN KLAAR VOOR CONSUMPTIE, MELK, ENZ.). ZE ZIJN ALLEMAAL GEKENMERKT DOOR VERSCHILLENDE METHODEN, ZOWEL KLASSIEK ALS GENOMISCH EN PROTEOMISCH (MALDI-TOF). Dergelijke gerelateerde SPECIES MET UW SPECIFIC MALDI-TOF spectives EN GENOMISCHE SECUCE VAN GEN 16 worden gedeponeerd bij de SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) en in de GENBANK DATA BASE (NCBI) (alleen de beveiliging van GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologie EN RESULTATEN zullen hen in staat stellen de SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), ontwikkeld in ons laboratorium uit te breiden en de hoogste internationale toegangsbasis te vormen. (Dutch)
17 December 2021
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L'AUMENTO DELLE MALATTIE DI ORIGINE ALIMENTARE NEGLI ULTIMI ANNI, CON UNA PARTICOLARE COMPARSA DI MICRORGANISMI PATOGENI COME LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI O ESCHERICHIA COLI, HA ACCRESCIUTO LE PREOCCUPAZIONI PER LA SICUREZZA ALIMENTARE SIA TRA LE AUTORITÀ CHE NEL SETTORE PRODUTTIVO E TRA I CONSUMATORI. GLI AGENTI PATOGENI ALIMENTARI NON POSSONO ESSERE COMPLETAMENTE ELIMINATI DA TUTTE LE FASI DELLA CATENA ALIMENTARE. INOLTRE, SECONDO IL TRATTAMENTO SUBITO DAL CIBO, IL MICROBIOTA PRESENTE PUÒ VARIARE. CI SONO NUMEROSI AGENTI PATOGENI CHE L'AZIENDA DI TRASFORMAZIONE PUÒ ESSERE RICHIESTO DI ANALIZZARE PER DETERMINARE LA SICUREZZA RELATIVA DEL PRODOTTO. I METODI DI INDIVIDUAZIONE E DI IDENTIFICAZIONE RAPIDA ATTUALMENTE APPLICATI HANNO LO SVANTAGGIO DI ESSERE LIMITATI A POCHE SPECIE (PCR IN TEMPO REALE), CHE NECESSITANO DI UNA LUNGA LAVORAZIONE (SEQUENZA, FARE), NON SONO QUANTITATIVI (SEQUENZIAMENTO, MALDI-TOF), NON CONSENTONO IL RILEVAMENTO IN MISCELE COMPLESSE COME GLI ALIMENTI (SEQUENZIAMENTO, MALDI-TOF) E PRATICAMENTE TUTTI NECESSITANO DI SEMINA A PIASTRE. PER QUESTO MOTIVO È NECESSARIO APPLICARE METODI CHE CONSENTANO L'INDIVIDUAZIONE RAPIDA E ACCURATA DELLE SPECIE CONTAMINANTI NEGLI ALIMENTI E LA QUANTIFICAZIONE DIRETTAMENTE IN UN CAMPIONE ALIMENTARE. È IL CASO DELLA METODOLOGIA PROPOSTA NEL PRESENTE PROGETTO: LA DEFINIZIONE DI PEPTIDI BIOMARCANTI DELLE SPECIE DI AMMINE PATOGENE E BIOGENEE PRODUTTRICI DI AMMINE NEGLI ALIMENTI E LA SUCCESSIVA ATTUAZIONE DELL'APPLICAZIONE DI TALI PEPTIDI PER L'INDIVIDUAZIONE DI CAMPIONI ALIMENTARI. La cromatografia LIQUID ACOPLATO A SPECTROMETRIA DI MASAS IN TANDEM in un EQUIPMENTO elettrospruzzo-TRAMPA IONICA (LC-ESI-IT-MS/MS) e ANALISI posteriore DIFFERENT SOFTWARE E COMPARAZIONE CON secuzioni aminoacidi depositate in DATA BASES._x000D_ al fine di portare alla deposizione di peptidi biomarcatori, è necessario prevedere una gamma completa di CEPA BACTERIAAN per rilevare le analisi. LE SPECIE BATTERICHE INCLUSE NELLO STUDIO COMPRENDONO QUELLE CHE SONO PIÙ FREQUENTEMENTE ISOLATE NEI PRODOTTI ALIMENTARI, COME DESCRITTO NELLA LETTERATURA, E COMPRENDONO LA FAMIGLIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, STAFILOCOCCHI COAGULASI POSITIVI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS E C. BOTULINUM TYPES E AND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS E B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES E YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP E PAENIBACILLUS SPP. IL NOSTRO LABORATORIO DISPONE DI UN'AMPIA RACCOLTA DI CEPPI BATTERICI ISOLATI DA VARI ALIMENTI (CARNE, PESCE, MINIMAMENTE LAVORATI E PRONTI AL CONSUMO, LATTE, ECC.). TUTTI SONO STATI CARATTERIZZATI DA METODI DIVERSI, SIA CLASSICI CHE GENOMICI E PROTEOMICI (MALDI-TOF). Tali SPECIES RELATED CON IL TUO SPECIFICO MALDI-TOF spettuali e GENOMICI DI GEN 16 sono depositati presso la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) e nella GENBANK DATA BASE (NCBI) (solo la secuenza di GEN 16S rRNA)._x000D_ Metodologia E RISULTATI permetteranno loro di espandere la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), sviluppata nel nostro laboratorio e costituendo la più alta base di dati internazionali di accesso (Italian)
16 January 2022
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Lugo
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Identifiers
AGL2013-48244-R
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