Identification of vulnerabilities in triple-negative breast cancer: analysis of clonal heterogeneity of tumor subpopulations (Q3137700)
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Project Q3137700 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Identification of vulnerabilities in triple-negative breast cancer: analysis of clonal heterogeneity of tumor subpopulations |
Project Q3137700 in Spain |
Statements
94,000.0 Euro
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117,500.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2017
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31 March 2020
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SECRETARIA GENERAL DEL SERVICIO DE SALUD DE CASTILLA-LA MANCHA
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38°59'42.32"N, 1°51'21.31"W
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02003
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En la actualidad, un alto porcentaje de pacientes con cáncer de mama no se cura, lo que hace necesario el descubrimiento de nuevas alteraciones moleculares que puedan ser inhibidas farmacológicamente. En estudios preliminares usando análisis transcriptomico funcional, nuestro grupo ha identificado genes relevantes en cáncer de mama triple negativo, como son algunos factores de transcripción (LM04, DEPDC, FOXM1) o quinasas implicadas en mitosis (NIMA y CDCA3). En este proyecto queremos profundizar en el mecanismo de acción de estos genes en relación a su contribución oncogénica. Objetivos: 1. Estudiar la función oncogénica de los factores de transcripción LM04, DEPDC, FOXM1. 2. Estudiar la función oncogénica de las quinasas de mitosis NIMA y CDCA3. 3. Identificar compuestos que inhiban la función de los productos de estos genes. 4. Identificar mecanismos de synthetic lethality en modelos con expresión reducida de estos genes. 5. Identificar modelos de resistencia primaria y crear modelos de resistencia secundaria a inhibidores de bromodomain. Metodología: siRNA de LM04, DEPDC, FOXM1, NIMA y CDCA3. Estudios de proliferación, migración, western-blot, librerías farmacológicas, análisis transcriptómico, generación modelos resistentes, modelos in vivo, etc. A high percentage of breast cancer patients are not currently cured, what forces the discovery of new molecular alterations that can be inhibited pharmacologically. In preliminary studies using transcriptomic analyses, our group have identified relevant genes in triple negative breast cancer, some are transcription factors (LM04, DEPDC, FOXM1) or kinases implicated in mitosis (NIMA y CDCA3). In this project we pretend to evaluate the mechanism of action of these genes in relation to their role in the oncogenesis of triple negative breast cancer. Objectives: 1. To study the function of oncogenic transcription factors (LM04, DEPDC, FOXM1). 2. To study the function of kinases involved in mitosis (NIMA y CDCA3). (Spanish)
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Currently, a high percentage of patients with breast cancer is not cured, which makes it necessary to discover new molecular alterations that can be pharmacologically inhibited. In preliminary studies using functional transcriptomic analysis, our group has identified relevant genes in triple-negative breast cancer, such as some transcription factors (LM04, DEPDC, FOXM1) or kinases involved in mitosis (NIMA and CDCA3). In this project we want to deepen the mechanism of action of these genes in relation to their oncogenic contribution. Objectives: 1. Study the oncogenic function of transcription factors LM04, DEPDC, FOXM1. 2. Study the oncogenic function of NIMA and CDCA3 mitosis kinases. 3. Identify compounds that inhibit the function of the products of these genes. 4. Identify mechanisms of synthetic Lethality in models with reduced expression of these genes. 5. Identify primary resistance models and create models of secondary resistance to bromodomain inhibitors. Methodology: siRNA of LM04, DEPDC, FOXM1, NIMA and CDCA3. Proliferation studies, migration, western-blot, pharmacological libraries, transcriptomic analysis, generation resistant models, in vivo models, etc. A high percentage of breast cancer patients are not currently cured, what forces the discovery of new molecular alterations that can be inhibited pharmacologically. In preliminary studies using transcriptomic analyses, our group have identified relevant genes in triple negative breast cancer, some are transcription factors (LM04, DEPDC, FOXM1) or kinases implicated in mitosis (NIMA and CDCA3). In this project we intend to evaluate the mechanism of action of these genes in relation to their role in the oncogenesis of triple negative breast cancer. Objectives: 1. To study the function of oncogenic transcription factors (LM04, DEPDC, FOXM1). 2. To study the function of kinases involved in mitosis (NIMA and CDCA3). (English)
12 October 2021
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Actuellement, un pourcentage élevé de patients atteints d’un cancer du sein n’est pas guéri, ce qui rend nécessaire de découvrir de nouvelles altérations moléculaires qui peuvent être inhibées sur le plan pharmacologique. Dans des études préliminaires utilisant l’analyse transcriptomique fonctionnelle, notre groupe a identifié des gènes pertinents dans le cancer du sein triple négatif, comme certains facteurs de transcription (LM04, DEPDC, FOXM1) ou les kinases impliquées dans la mitose (NIMA et CDCA3). Dans ce projet, nous voulons approfondir le mécanisme d’action de ces gènes par rapport à leur contribution oncogénique. Objectifs: 1. Étudier la fonction oncogénique des facteurs de transcription LM04, DEPDC, FOXM1. 2. Étudier la fonction oncogénique des mitoses kinases NIMA et CDCA3. 3. Identifier les composés qui inhibent la fonction des produits de ces gènes. 4. Identifier les mécanismes de la létalité synthétique dans les modèles avec une expression réduite de ces gènes. 5. Identifier les modèles primaires de résistance et créer des modèles de résistance secondaire aux inhibiteurs de la bromodomaine. Méthodologie: siRNA de LM04, DEPDC, FOXM1, NIMA et CDCA3. Études de prolifération, migration, Western-blot, bibliothèques pharmacologiques, analyse transcriptomique, modèles résistants à la génération, modèles in vivo, etc. Un pourcentage élevé de patients atteints de cancer du sein ne sont pas guéris, ce qui force la découverte de nouvelles altérations moléculaires qui peuvent être inhibées sur le plan pharmacologique. Dans les études préliminaires utilisant des analyses transcriptomiques, notre groupe a identifié des gènes pertinents dans le cancer du sein triple négatif, certains sont des facteurs de transcription (LM04, DEPDC, FOXM1) ou des kinases impliquées dans la mitose (NIMA et CDCA3). Dans ce projet, nous avons l’intention d’évaluer le mécanisme d’action de ces gènes par rapport à leur rôle dans l’oncogenèse du cancer du sein triple négatif. Objectifs: 1. Étudier la fonction des facteurs de transcription oncogéniques (LM04, DEPDC, FOXM1). 2. Étudier la fonction des kinases impliquées dans la mitose (NIMA et CDCA3). (French)
2 December 2021
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Derzeit wird ein hoher Prozentsatz der Patienten mit Brustkrebs nicht geheilt, was es notwendig macht, neue molekulare Veränderungen zu entdecken, die pharmakologisch hemmen werden können. In Vorstudien mit funktioneller Transkriptom-Analyse hat unsere Gruppe relevante Gene bei dreinegativen Brustkrebs identifiziert, wie z. B. einige Transkriptionsfaktoren (LM04, DEPDC, FOXM1) oder Kinasen, die an Mitose (NIMA und CDCA3) beteiligt sind. In diesem Projekt wollen wir den Wirkmechanismus dieser Gene in Bezug auf ihren onkogenen Beitrag vertiefen. Ziele: 1. Untersuchung der onkogenen Funktion von Transkriptionsfaktoren LM04, DEPDC, FOXM1. 2. Untersuchung der onkogenen Funktion von NIMA und CDCA3 Mitose-Kinasen. 3. Identifizieren Sie Verbindungen, die die Funktion der Produkte dieser Gene hemmen. 4. Identifizieren Sie Mechanismen der synthetischen Lethalität in Modellen mit reduzierter Expression dieser Gene. 5. Identifizieren Sie primäre Widerstandsmodelle und erstellen Sie Modelle der sekundären Resistenz gegen Bromodomain-Inhibitoren. Methodik: siRNA von LM04, DEPDC, FOXM1, NIMA und CDCA3. Proliferationsstudien, Migration, Westernblot, pharmakologische Bibliotheken, transkriptomische Analysen, generationenresistente Modelle, In-vivo-Modelle usw. Ein hoher Prozentsatz von Brustkrebspatienten wird derzeit nicht geheilt, was die Entdeckung neuer molekularer Veränderungen, die pharmakologisch hemmen können, zwingt. In Vorstudien mit transcriptomischen Analysen haben unsere Gruppe relevante Gene bei dreifach negativem Brustkrebs identifiziert, einige Transkriptionsfaktoren (LM04, DEPDC, FOXM1) oder Kinasen, die an Mitose (NIMA und CDCA3) beteiligt sind. In diesem Projekt wollen wir den Wirkmechanismus dieser Gene in Bezug auf ihre Rolle bei der Onkogenese von drei negativen Brustkrebs bewerten. Ziele: 1. Untersuchung der Funktion von onkogenen Transkriptionsfaktoren (LM04, DEPDC, FOXM1). 2. Untersuchung der Funktion von Kinasen, die an Mitose beteiligt sind (NIMA und CDCA3). (German)
9 December 2021
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Momenteel wordt een hoog percentage patiënten met borstkanker niet genezen, wat het noodzakelijk maakt om nieuwe moleculaire veranderingen te ontdekken die farmacologisch kunnen worden geremd. In vooronderzoek met behulp van functionele transcriptomische analyse heeft onze groep relevante genen geïdentificeerd in triple-negatieve borstkanker, zoals sommige transcriptiefactoren (LM04, DEPDC, FOXM1) of kinasen die betrokken zijn bij mitose (NIMA en CDCA3). In dit project willen we het werkingsmechanisme van deze genen verdiepen in relatie tot hun oncogene bijdrage. Doelstellingen: 1. Bestudeer de oncogene functie van transcriptiefactoren LM04, DEPDC, FOXM1. 2. Bestudeer de oncogene functie van NIMA en CDCA3-mitosekinases. 3. Identificeer verbindingen die de functie van de producten van deze genen remmen. 4. Identificeer mechanismen van synthetische Lethaliteit in modellen met verminderde expressie van deze genen. 5. Identificeer primaire weerstandsmodellen en creëer modellen van secundaire weerstand tegen bromodomainremmers. Methodologie: siRNA van LM04, DEPDC, FOXM1, NIMA en CDCA3. Proliferatiestudies, migratie, westerse-blot, farmacologische bibliotheken, transcriptomische analyse, generatiebestendige modellen, in vivo modellen, enz. Een hoog percentage borstkankerpatiënten wordt momenteel niet genezen, wat de ontdekking van nieuwe moleculaire veranderingen die farmacologisch kunnen worden geremd, veroorzaakt. In vooronderzoek met transcriptomische analyses heeft onze groep relevante genen geïdentificeerd in drievoudige negatieve borstkanker, sommige zijn transcriptiefactoren (LM04, DEPDC, FOXM1) of kinasen betrokken bij mitose (NIMA en CDCA3). In dit project willen we het werkingsmechanisme van deze genen evalueren in relatie tot hun rol in de oncogenese van drievoudige negatieve borstkanker. Doelstellingen: 1. Om de functie van oncogene transcriptiefactoren (LM04, DEPDC, FOXM1) te bestuderen. 2. Het bestuderen van de functie van kinasen die betrokken zijn bij mitose (NIMA en CDCA3). (Dutch)
17 December 2021
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Attualmente, un'alta percentuale di pazienti con cancro al seno non viene curata, il che rende necessario scoprire nuove alterazioni molecolari che possono essere farmacologicamente inibite. In studi preliminari che utilizzano l'analisi trascrittamica funzionale, il nostro gruppo ha identificato geni rilevanti nel carcinoma mammario triplo negativo, come alcuni fattori di trascrizione (LM04, DEPDC, FOXM1) o chinasi coinvolti nella mitosi (NIMA e CDCA3). In questo progetto vogliamo approfondire il meccanismo d'azione di questi geni in relazione al loro contributo oncogenico. Obiettivi: 1. Studiare la funzione oncogenica dei fattori di trascrizione LM04, DEPDC, FOXM1. 2. Studia la funzione oncogenica delle mitosi chinasi NIMA e CDCA3. 3. Identificare i composti che inibiscono la funzione dei prodotti di questi geni. 4. Identificare i meccanismi di Lethality sintetica nei modelli con l'espressione ridotta di questi geni. 5. Identificare modelli di resistenza primaria e creare modelli di resistenza secondaria agli inibitori bromodomain. Metodologia: siRNA di LM04, DEPDC, FOXM1, NIMA e CDCA3. Studi di proliferazione, migrazione, western-blot, biblioteche farmacologiche, analisi trascrittomica, modelli resistenti alla generazione, modelli in vivo, ecc. Un'alta percentuale di pazienti affetti da cancro al seno non è attualmente curata, ciò che costringe la scoperta di nuove alterazioni molecolari che possono essere inibite farmacologicamente. In studi preliminari che utilizzano analisi trascrittomiche, il nostro gruppo ha identificato geni rilevanti nel cancro al seno triplo negativo, alcuni sono fattori di trascrizione (LM04, DEPDC, FOXM1) o chinasi coinvolti nella mitosi (NIMA e CDCA3). In questo progetto intendiamo valutare il meccanismo d'azione di questi geni in relazione al loro ruolo nella oncogenesi del cancro al seno triplo negativo. Obiettivi: 1. Per studiare la funzione dei fattori di trascrizione oncogenica (LM04, DEPDC, FOXM1). 2. Studiare la funzione delle chinasi coinvolte nella mitosi (NIMA e CDCA3). (Italian)
16 January 2022
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Albacete
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Identifiers
PI16_01121
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