EpiARN: Structure, dynamics and regulation of ribonucleoproteic and epitranscriptome complexes: impact on environmental adaptation, human pathologies and host-pathogen interactions (Q3712207)
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Project Q3712207 in France
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EpiARN: Structure, dynamics and regulation of ribonucleoproteic and epitranscriptome complexes: impact on environmental adaptation, human pathologies and host-pathogen interactions |
Project Q3712207 in France |
Statements
320,000.0 Euro
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800,000.0 Euro
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40.0 percent
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1 January 2019
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31 December 2021
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Centre National de la Recherche Scientifique
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L'objectif du projet EpiARN est d'étudier les mécanismes moléculaires impliqués dans les modifications d'ARN en analysant la relation entre structure et fonction de complexes ribonucléoprotéiques (complexes RNP) en lien avec plusieurs ARN dont dépendent les mécanique de traduction génétique (rRNA, tRNA, snoRNA) ou les ARN régulateurs. L'analyse des dynamiques et des propriétés de reconnaissance des RNP qui impliquent notamment des interactions transitoires constituera l'un des défis à relever. Pour cette raison, le projet nécessite une approche pluridisciplinaire (biochimie, biophysique, génétique, biologie structurelle, etc.) et le développement de technique d'extraction à haut débit (analyse épitranscriptomique, purification des RNP), d'où la nécessité d'investir dans les équipements appropriés et de mettre en place une synergie forte entre les laboratoire, reconnus sur le plan international, à la pointe dans ce domaine (IBMC/IBMP à Strasbourg, CBI/IGBMC et LBP à Illkirch, IMoPA et NGERE à Nancy et LNIO à Troyes). Les équipements acquis dans le cadre du projet sont : - un microscope électronique qui sera installé dans les locaux de l'IBMC/IBMP (pour permettre d'effectuer les analyses cryo-EM dans des conditions expérimentales optimales) ; - une caméra haute-sensibilité de dernière génération GATAN K3 qui constituera une amélioration du matériel cryo-EM du CBI, qui accueille déjà les infrastructures FRISBI et Instruct. (French)
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The objective of the EpiRNA project is to study the molecular mechanisms involved in RNA modifications by analysing the relationship between structure and function of ribonucleoproteic complexes (RNP complexes) in relation to several RNAs on which genetic translation mechanics (rRNA, tRNA, snoRNA) or regulatory RNA depend. An analysis of the dynamics and recognition properties of RNPs that involve, inter alia, transient interactions will be one of the challenges to be addressed. For this reason, the project requires a multidisciplinary approach (biochemistry, biophysics, genetics, structural biology, etc.) and the development of high-throughput extraction techniques (epitranscriptomic analysis, purification of RNPs), hence the need to invest in the appropriate equipment and to establish a strong synergy between internationally recognised laboratories at the forefront in this field (IBMC/IBMP in Strasbourg, CBI/IGBMC and LBP in Illkirch, IMOPA and Ngere in Nancy and LNIO in Troyes). The equipment acquired under the project is: an electron microscope to be installed in the IBMC/IBMP premises (to enable cryo-EM analyses under optimal experimental conditions); — a latest generation Gatan K3 high-sensitivity camera that will be an improvement of CBI cryo-EM equipment, which already hosts the Frisbi and Instruct infrastructures. (English)
22 November 2021
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Ziel des EpiARN-Projekts ist es, die molekularen Mechanismen zu untersuchen, die an RNA-Änderungen beteiligt sind, indem die Beziehung zwischen Struktur und Funktion von Ribonnukleoproteinkomplexen (RNP-Komplexen) in Verbindung mit mehreren RNA, von denen die genetische Übersetzungsmechanik (rRNA, tRNA, snoRNA) oder RegulierungsrNA abhängig ist, analysiert wird. Eine der Herausforderungen ist die Analyse der Dynamiken und Erkennungseigenschaften von RNP, die insbesondere vorübergehende Interaktionen mit sich bringen. Aus diesem Grund erfordert das Projekt einen multidisziplinären Ansatz (Biochemie, Biophysik, Genetik, Strukturbiologie usw.) und die Entwicklung von Hochgeschwindigkeitsextraktionstechniken (Epitranskriptomanalyse, Reinigung von RNP), weshalb Investitionen in die geeignete Ausrüstung und eine starke Synergie zwischen den international anerkannten Labors (IBMC/IBMP in Straßburg, CBI/IGBMC und LBP in Illkirch, IMOPA und Ngere in Nancy und LNIO in Troyes) erforderlich sind. Die im Rahmen des Projekts erworbenen Ausrüstungen sind: — ein Elektronenmikroskop, das in den Räumlichkeiten des IBMC/IBMP installiert wird (zur Durchführung von Kryo-EM-Analysen unter optimalen Versuchsbedingungen); — eine hochempfindliche Kamera der neuesten Generation Gatan K3, die eine Verbesserung der CBI-Kryo-EM-Hardware darstellt, die bereits die Infrastruktur von Frisbi und Instruct beherbergt. (German)
2 December 2021
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Het doel van het EpiRNA project is het bestuderen van de moleculaire mechanismen betrokken bij RNA modificaties door het analyseren van de relatie tussen structuur en functie van ribonucleoproteic complexen (RNP complexen) in relatie tot verschillende RNA’s waarop genetische vertaling mechanica (rRNA, tRNA, snoRNA) of regulerend RNA afhankelijk zijn. Een analyse van de dynamiek en herkenningseigenschappen van RNP’s die onder meer voorbijgaande interacties omvatten, zal een van de uitdagingen zijn die moeten worden aangepakt. Om deze reden vereist het project een multidisciplinaire aanpak (biochemie, biofysica, genetica, structurele biologie, enz.) en de ontwikkeling van technieken voor de extractie van hoge-productiecapaciteit (epitranscriptomische analyse, zuivering van RNP’s), vandaar de noodzaak om te investeren in de juiste apparatuur en een sterke synergie tot stand te brengen tussen internationaal erkende laboratoria op dit gebied (IBMC/IBMP in Straatsburg, CBI/IGBMC en LBP in Illkirch, IMOPA en ngere in Nancy en LNIO in Troyes). De in het kader van het project verworven uitrusting is: een elektronenmicroscoop die in het IBMC/IBMP-gebouw moet worden geïnstalleerd (om cryo-EM-analyses onder optimale experimentele omstandigheden mogelijk te maken); — een nieuwste generatie Gatan K3 high-sensitivity camera die een verbetering zal zijn van CBI cryo-EM apparatuur, die al beschikt over de Frisbi en Instruct infrastructuren. (Dutch)
7 December 2021
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L'obiettivo del progetto EpiRNA è quello di studiare i meccanismi molecolari coinvolti nelle modifiche dell'RNA analizzando la relazione tra struttura e funzione dei complessi ribonucleoproteici (complessi RRNP) in relazione a diversi RNA da cui dipendono la meccanica della traduzione genetica (rRNA, tRNA, snoRNA) o l'RNA regolamentare. Un'analisi delle dinamiche e delle proprietà di riconoscimento degli RNP che comportano, tra l'altro, interazioni transitorie sarà una delle sfide da affrontare. Per questo motivo, il progetto richiede un approccio multidisciplinare (biochimica, biofisica, genetica, biologia strutturale, ecc.) e lo sviluppo di tecniche di estrazione ad alto rendimento (analisi epitranscriptomica, purificazione dei RNP), da qui la necessità di investire nelle attrezzature appropriate e di instaurare una forte sinergia tra laboratori riconosciuti a livello internazionale in questo campo (IBMC/IBMP a Strasburgo, CBI/IGBMC e LBP a Illkirch, IMOPA e ngere a Nancy e LNIO a Troyes). Le attrezzature acquistate nell'ambito del progetto sono: un microscopio elettronico da installare nei locali dell'IBMC/IBMP (per consentire analisi crio-EM in condizioni sperimentali ottimali); — una telecamera ad alta sensibilità Gatan K3 di ultima generazione che sarà un miglioramento delle apparecchiature CBI crio-EM, che ospita già le infrastrutture Frisbi e Instruct. (Italian)
13 January 2022
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El objetivo del proyecto EpiRNA es estudiar los mecanismos moleculares involucrados en las modificaciones del ARN mediante el análisis de la relación entre estructura y función de los complejos ribonucleoproteicos (complejos RNP) en relación a varios ARNs de los que dependen la mecánica de la traducción genética (ARRN, ARNt, SnoRNA) o ARN regulatorio. Uno de los retos a abordar será el análisis de la dinámica y las propiedades de reconocimiento de los PNR que impliquen, entre otras cosas, interacciones transitorias. Por esta razón, el proyecto requiere un enfoque multidisciplinar (bioquímica, biofísica, genética, biología estructural, etc.) y el desarrollo de técnicas de extracción de alto rendimiento (análisis epitranscriptómico, purificación de RNPs), de ahí la necesidad de invertir en el equipo adecuado y de establecer una fuerte sinergia entre laboratorios reconocidos internacionalmente a la vanguardia en este campo (IBMC/IBMP en Estrasburgo, CBI/IGBMC y LBP en Illkirch, IMOPA y ngere en Nancy y LNIO en Troyes). El equipo adquirido en el marco del proyecto es: un microscopio electrónico que se instalará en los locales IBMC/IBMP (para permitir los análisis crioEM en condiciones experimentales óptimas); — una cámara de alta sensibilidad Gatan K3 de última generación que será una mejora de los equipos CBI cryo-EM, que ya alberga las infraestructuras Frisbi e Instruct. (Spanish)
14 January 2022
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Identifiers
AL0024408
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