Discovery of new COMT inhibitors for Parkison treatment using chemo-informatics methodologies (Q2721020)
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Project Q2721020 in Cyprus
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Discovery of new COMT inhibitors for Parkison treatment using chemo-informatics methodologies |
Project Q2721020 in Cyprus |
Statements
169,999.38 Euro
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199,999.27 Euro
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85.0 percent
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20 January 2017
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1 March 2021
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NovaMechanics Ltd
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Σκοπός του έργου είναι η χρήση προηγμένων υπολογιστικών τεχνικών για τον προσδιορισμό ισχυρά δραστικών ενώσεων οι οποίες να μπορούν να χρησιμοποιηθούν στη θεραπεία της νόσου του Πάρκινσον (Parkison Disease - PD). Ειδικότερα, το έργο στοχεύει στον προσδιορισμό νέων αναστολέων της δράσης των ενζύμων COMT, δηλαδή στον προσδιορισμό μιας κατηγορίας ενώσεων που χρησιμοποιούνται συνήθως στη θεραπεία των συμπτωμάτων της PD, σε συνδυασμό με τις ενώσεις L-DOPA και carbidopa, και στοχεύει στην αύξηση της διαθεσιμότητας των φαρμάκων για την ανακούφιση των συμπτωμάτων της νόσου. Για την επίτευξη του στόχου αυτού, σκοπεύουμε να αναπτύξουμε τις απαραίτητες πειραματικές και υπολογιστικές μεθόδους και εργαλεία ώστε καταρχήν να εντοπιστούν οι ισχυροί αναστολείς COMT μεταξύ των ενώσεων που έχουν ήδη συντεθεί και έχουν καταχωρηθεί σε μεγάλες βάσεις δεδομένων και στη συνέχεια να επαναεξεταστούν τα ήδη υπάρχοντα φάρμακα που θα μπορούσαν να ενεργήσουν και αυτά ως COMT αναστολείς. Τα υπολογιστικά εργαλεία που πρόκειται να αναπτυχθούν στο πλαίσιο του παρόντος έργου θα στηρίζονται σε ligand- και structure- based τεχνικές και θα παρέχουν ισχυρές ενδείξεις ως προς τη δραστικότητα των ενώσεων και τη δυνατότητά τους να λειτουργήσουν ως αναστολείς COMT. Με βάση ένα in silico consensus σύστημα που θα αναπτυχθεί και θα περιλαμβάνει εκτός από τις προαναφερθείσες μεθόδους και επιπλέον φίλτρα (μεταξύ άλλων η in silico εκτίμηση της τοξικότητας, o κανόνας Lipinski rule-of-five, η εκτίμηση των ADME ιδιοτήτων, ο εντοπισμός PAINS κ.λπ.), θα προταθεί μια ιεραρχημένη λίστα με πιθανούς αναστολείς COMT. Μεταξύ αυτών, οι ενώσεις και τα επαναστοχευμένα φάρμακα που βρίσκονται πιο ψηλά στην κατάταξη, θα τροφοδοτήσουν πειράματα in vitro για πειραματικό έλεγχο της δραστικότητάς τους ως αναστολείς COMT. Οι πιο ελπιδοφόρες ενώσεις που θα εμφανίσουν ισχυρή ανασταλτική δράση, θα ελεγχθούν και σε πειράματα in vivo και θα συγκριθούν με το εμπορικά διαθέσιμο φάρμακο (entacapone). (Greek)
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The aim of the project is to use advanced computational techniques to identify strongly active compounds that can be used in the treatment of Parkinson’s disease (PD). In particular, the project aims to identify new inhibitors of the action of COMT enzymes, i.e. to identify a class of compounds commonly used in the treatment of symptoms of PD, in combination with L-DOPA and carbidopa compounds, and aims to increase the availability of medicines to alleviate the symptoms of the disease. To achieve this goal, we intend to develop the necessary experimental and computational methods and tools to identify in principle strong COMT inhibitors among compounds that have already been synthesised and registered in large databases and then to re-examine the existing medicines that could also act as COMT inhibitors. The computational tools to be developed in the framework of this project will be based on ligand- and structure-based techniques and will provide strong indications of the activity of compounds and their ability to act as COMT inhibitors. Based on an in silico consensus system that will develop and include in addition to the aforementioned methods and additional filters (including in silico toxicity assessment, Lipinski rule-of-five rule, ADME assessment, Pains detection, etc.), a hierarchical list of possible COMT inhibitors will be proposed. Among these, compounds and retarget drugs higher in classification will feed in vitro experiments to test their activity as COMT inhibitors. The most promising compounds that will exhibit a strong inhibitory effect will also be tested in in vivo experiments and compared to the commercially available drug (entacapone). (English)
31 May 2021
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Le but du projet est d’utiliser des techniques informatiques avancées pour identifier les composés actifs puissants qui peuvent être utilisés dans le traitement de la maladie de Parkison (PD). En particulier, le projet vise à identifier de nouveaux inhibiteurs de l’activité des enzymes COMT, c’est-à-dire à identifier une classe de composés couramment utilisés dans le traitement des symptômes de la maladie, en association avec des composés L-DOPA et carbidopa, et vise à accroître la disponibilité de médicaments pour soulager les symptômes de la maladie. Pour atteindre cet objectif, nous avons l’intention de développer les méthodes et outils expérimentaux et informatiques nécessaires pour identifier, en principe, de puissants inhibiteurs de COMT parmi les composés déjà synthétisés et enregistrés dans de grandes bases de données, puis de réexaminer les médicaments existants qui pourraient également agir en tant qu’inhibiteurs de COMT. Les outils informatiques qui seront développés dans le cadre de ce projet seront basés sur des techniques basées sur le ligand et la structure et fourniront des indications solides sur l’activité des composés et leur capacité à agir en tant qu’inhibiteurs de COMT. Sur la base d’un système de consensus in silico qui sera mis au point et qui comprendra des filtres supplémentaires en plus des méthodes susmentionnées (y compris dans l’estimation silico de la toxicité, la règle Lipinski règle des cinq, l’évaluation ADME, la détection de pains, etc.), une liste hiérarchique des inhibiteurs potentiels de la COMT sera proposée. Parmi eux, les composés et les médicaments reciblés qui sont plus élevés dans le classement alimenteront des expériences in vitro pour tester leur activité en tant qu’inhibiteurs de COMT. Les composés les plus prometteurs qui présenteront un fort effet inhibiteur seront également testés dans des expériences in vivo et comparés au médicament disponible dans le commerce (entacapone). (French)
27 November 2021
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Ziel des Projekts ist es, fortgeschrittene Rechentechniken zu verwenden, um starke Wirkstoffe zu identifizieren, die bei der Behandlung von Parkison-Krankheit (PD) verwendet werden können. Das Projekt zielt insbesondere darauf ab, neue Hemmstoffe für die Aktivität von COMT-Enzymen zu identifizieren, d. h. eine Gruppe von Verbindungen zu identifizieren, die üblicherweise zur Behandlung von Symptomen von PD in Kombination mit L-DOPA und Carbidopaverbindungen verwendet werden, und zielt darauf ab, die Verfügbarkeit von Arzneimitteln zur Linderung der Symptome der Krankheit zu erhöhen. Um dieses Ziel zu erreichen, beabsichtigen wir, die notwendigen experimentellen und computergestützten Methoden und Werkzeuge zu entwickeln, um im Prinzip starke COMT-Inhibitoren unter den bereits synthetisierten und in großen Datenbanken registrierten Verbindungen zu identifizieren und dann bestehende Arzneimittel, die auch als COMT-Inhibitoren fungieren könnten, zu überprüfen. Die im Rahmen dieses Projekts zu entwickelnden Recheninstrumente werden auf ligand- und strukturbasierten Techniken basieren und starke Hinweise auf die Aktivität der Verbindungen und ihre Fähigkeit, als COMT-Hemmer zu agieren, liefern. Basierend auf einem in silico Konsenssystem, das zusätzlich zu den oben genannten Methoden entwickelt und zusätzliche Filter enthalten wird (einschließlich Silico-Schätzung der Toxizität, Lipinski-Regel-of-fünf-Regel, ADME-Bewertung, Nachweis von Schmerzen usw.), wird eine hierarchische Liste potenzieller COMT-Hemmer vorgeschlagen. Unter ihnen werden Verbindungen und retargetierte Medikamente, die im Ranking höher sind, in vitro-Experimente füttern, um ihre Aktivität als COMT-Inhibitoren zu testen. Die vielversprechendsten Verbindungen, die eine starke hemmende Wirkung zeigen, werden auch in In-vivo-Experimenten getestet und mit dem handelsüblichen Medikament (entacapon) verglichen. (German)
29 November 2021
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Het doel van het project is het gebruik van geavanceerde computertechnieken om sterke actieve verbindingen te identificeren die kunnen worden gebruikt bij de behandeling van Parkison Disease (PD). Het project is met name gericht op het identificeren van nieuwe remmers van de activiteit van COMT-enzymen, d.w.z. het identificeren van een klasse van verbindingen die algemeen worden gebruikt bij de behandeling van symptomen van PD, in combinatie met L-DOPA- en carbidopaverbindingen, en heeft tot doel de beschikbaarheid van geneesmiddelen ter verlichting van de symptomen van de ziekte te vergroten. Om dit doel te bereiken, zijn wij van plan de nodige experimentele en computationele methoden en instrumenten te ontwikkelen om in principe sterke COMT-remmers te identificeren onder de verbindingen die reeds zijn gesynthetiseerd en geregistreerd in grote databanken, en vervolgens bestaande geneesmiddelen die ook als COMT-remmers kunnen fungeren, opnieuw te onderzoeken. De in het kader van dit project te ontwikkelen rekeninstrumenten zullen gebaseerd zijn op op ligand- en structuur gebaseerde technieken en zullen sterke indicaties geven van de activiteit van verbindingen en hun vermogen om als COMT-remmers op te treden. Op basis van een in silico consensussysteem dat zal worden ontwikkeld en extra filters zal bevatten in aanvulling op de bovengenoemde methoden (waaronder in silico schatting van toxiciteit, Lipinski regel-van-vijf regel, ADME beoordeling, detectie van pijn, enz.), zal een hiërarchische lijst van potentiële COMT-remmers worden voorgesteld. Onder hen zullen verbindingen en geretargeteerde geneesmiddelen die hoger zijn in de rangschikking in vitro experimenten voeden om hun activiteit als COMT-remmers te testen. De meest veelbelovende verbindingen die een sterk remmend effect zullen vertonen, zullen ook worden getest in in vivo-experimenten en vergeleken met het commercieel beschikbare geneesmiddel (entacapone). (Dutch)
29 November 2021
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Lo scopo del progetto è quello di utilizzare tecniche informatiche avanzate per identificare composti attivi forti che possono essere utilizzati nel trattamento della malattia di Parkison (PD). In particolare, il progetto mira a individuare nuovi inibitori dell'attività degli enzimi COMT, ossia identificare una classe di composti comunemente utilizzati nel trattamento dei sintomi della DP, in combinazione con i composti L-DOPA e carbidopa, e mira ad aumentare la disponibilità di medicinali per alleviare i sintomi della malattia. Per raggiungere questo obiettivo, intendiamo sviluppare i metodi e gli strumenti sperimentali e computazionali necessari per identificare, in linea di principio, forti inibitori COMT tra i composti già sintetizzati e registrati in grandi banche dati e poi riesaminare i medicinali esistenti che potrebbero anche fungere da inibitori COMT. Gli strumenti informatici da sviluppare nell'ambito di questo progetto si baseranno su tecniche basate sul ligando e sulla struttura e forniranno forti indicazioni sull'attività dei composti e sulla loro capacità di agire come inibitori del COMT. Sulla base di un sistema di consenso in silico che sarà sviluppato e che includerà filtri aggiuntivi oltre ai metodi summenzionati (tra cui la stima del silico della tossicità, la regola Lipinski-of-cinque, la valutazione dell'ADME, l'individuazione dei dolori, ecc.), verrà proposto un elenco gerarchico dei potenziali inibitori del COMT. Tra questi, composti e farmaci retargeted che sono più alti nella classifica nutriranno esperimenti in vitro per testare la loro attività come inibitori COMT. I composti più promettenti che mostreranno un forte effetto inibitorio saranno testati anche in esperimenti in vivo e confrontati con il farmaco disponibile in commercio (entacapone). (Italian)
11 January 2022
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El objetivo del proyecto es utilizar técnicas de computación avanzadas para identificar compuestos activos fuertes que se pueden utilizar en el tratamiento de la enfermedad de Parkison (PD). En particular, el proyecto tiene por objeto identificar nuevos inhibidores de la actividad de las enzimas COMT, es decir, identificar una clase de compuestos comúnmente utilizados en el tratamiento de los síntomas de la EP, en combinación con L-DOPA y compuestos de carbidopa, y tiene por objeto aumentar la disponibilidad de medicamentos para aliviar los síntomas de la enfermedad. Para alcanzar este objetivo, tenemos la intención de desarrollar los métodos y herramientas experimentales y computacionales necesarios para identificar, en principio, inhibidores de COMT fuertes entre los compuestos ya sintetizados y registrados en grandes bases de datos y luego reexaminar los medicamentos existentes que también podrían actuar como inhibidores de la COMT. Las herramientas informáticas que se desarrollarán en el marco de este proyecto se basarán en técnicas basadas en ligandos y estructuras y proporcionarán indicios sólidos de la actividad de los compuestos y su capacidad para actuar como inhibidores de la COMT. Sobre la base de un sistema de consenso in silico que se desarrollará e incluirá filtros adicionales además de los métodos antes mencionados (incluida la estimación silico de toxicidad, regla de Lipinski de los cinco, evaluación de ADME, detección de dolores, etc.), se propondrá una lista jerárquica de posibles inhibidores de la COMT. Entre ellos, compuestos y fármacos reorientados que son más altos en la clasificación alimentarán experimentos in vitro para probar su actividad como inhibidores de la COMT. Los compuestos más prometedores que mostrarán un fuerte efecto inhibidor también se probarán en experimentos in vivo y se compararán con el medicamento comercialmente disponible (entacapona). (Spanish)
12 January 2022
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*Δεν έχει γεωγραφική διάσταση*
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Identifiers
34665
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