Role of DNA (hydroxy)methylation in the regulation of long non-coding RNAs in Multiple Myeloma (Q3180817)
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Project Q3180817 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Role of DNA (hydroxy)methylation in the regulation of long non-coding RNAs in Multiple Myeloma |
Project Q3180817 in Spain |
Statements
28,750.0 Euro
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57,500.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2014
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31 March 2017
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FUNDACION PARA LA INVESTIGACION MEDICA APLICADA
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42°49'6.42"N, 1°38'39.34"W
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31201
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El Mieloma múltiple (MM) es una neoplasia hematológica con una muy baja tasa de curación. Junto a las alteraciones genéticas, cada vez es más evidente que tanto las alteraciones epigenéticas como los RNAs no-codificantes pueden jugar un papel importante en la patogénesis del MM. El objetivo general de este proyecto es analizar el (hidroxi)metiloma del DNA completo y conocer su papel en la regulación del transcriptoma, especialmente de los RNAs largos no-codificantes (lncRNAs), determinar si los lncRNAs están involucrados en la patogénesis y el pronóstico del MM y diseñar nuevas moléculas frente a estos lncRNAs que mejoren el tratamiento de los pacientes con MM. El (hidroxi)metiloma se analizará mediante Bis-seq, TET-seq y arrays de metilación y el transcriptoma mediante RNA-seq. La implicación de la expresión alterada o la metilación en el pronóstico del MM se estudiará mediante Q-RT-PCR y pirosecuenciación o MSP en una serie de 200 muestras de pacientes MM. De los lncRNAs que presenten una mayor alteración se analizará su funcionalidad en cuanto a su implicación en la patogénesis del MM (proliferación, ciclo celular, apoptosis) tanto in vitro como in vivo. Por último diseñaremos siAptameros o pequeñas moléculas frente a los dos lncRNAs más relevantes en el MM. Mediante este estudio en este proyecto descifraremos el (hidroxi)metiloma del MM, los lncRNAs desregulados y con una clara funcionalidad en el desarrollo y pronóstico del MM y por último diseñaremos nuevas estrategias dirigidas a los lncRNAs para mejorar el tratamiento y la calidad de vida de estos pacientes. (Spanish)
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Multiple myeloma (MM) is a haematological neoplasia with a very low healing rate. Along with genetic alterations, it is increasingly evident that both epigenetic alterations and non-coding RNAs can play an important role in the pathogenesis of MM. The overall objective of this project is to analyse the (hydroxy)methyloma of the complete DNA and to know its role in the regulation of transcriptome, especially of long non-coding RNAs (lncRNAs), determine whether lncRNAs are involved in the pathogenesis and prognosis of MM, and design new molecules against these lncRNAs that improve the treatment of MM patients. The (hydroxy)methyloma shall be analysed by Bis-seq, TET-seq and methylation arrays and transcriptoma by RNA-seq. The implication of altered expression or methylation in the prognosis of MM will be studied by Q-RT-PCR and pyrossequencing or MSP in a series of 200 samples of MM patients. Of the most altered lncRNAs, their functionality will be analysed in terms of their involvement in the pathogenesis of MM (proliferation, cell cycle, apoptosis) both in vitro and in vivo. Finally we will design ifAptameros or small molecules against the two most relevant lncRNAs in the MM. Through this study in this project we will decipher the (hydroxy)methyloma of the MM, the deregulated lncRNAs and with a clear functionality in the development and prognosis of the MM and finally we will design new strategies aimed at lncRNAs to improve the treatment and quality of life of these patients. (English)
12 October 2021
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Le myélome multiple (MM) est une néoplasie hématologique avec un taux de guérison très faible. Avec les altérations génétiques, il est de plus en plus évident que les altérations épigénétiques et les ARN non codants peuvent jouer un rôle important dans la pathogenèse de MM. L’objectif général de ce projet est d’analyser le (hydroxy)méthylome de l’ADN complet et de connaître son rôle dans la régulation du transcriptome, en particulier des ARN longs non codants (ARNnc), de déterminer si les lncRNAs sont impliqués dans la pathogenèse et le pronostic de MM, et de concevoir de nouvelles molécules contre ces ARNc qui améliorent le traitement des patients atteints de MM. Le (hydroxy)méthylome doit être analysé par des réseaux Bis-seq, TET-seq et méthylation et par transcriptoma par RNA-seq. L’implication d’une altération de l’expression ou de la méthylation dans le pronostic de MM sera étudiée par Q-RT-PCR et pyrossequencing ou MSP dans une série de 200 échantillons de patients atteints de MM. Parmi les ARNc les plus altérés, leur fonctionnalité sera analysée en fonction de leur implication dans la pathogenèse de MM (prolifération, cycle cellulaire, apoptose) à la fois in vitro et in vivo. Enfin, nous allons concevoir siAptameros ou de petites molécules contre les deux lncRNAs les plus pertinents dans le MM. Grâce à cette étude dans ce projet, nous déchiffrons le (hydroxy)méthylome du MM, les ARNnc déréglementés et avec une fonctionnalité claire dans le développement et le pronostic du MM et, enfin, nous allons concevoir de nouvelles stratégies visant les ARNnc afin d’améliorer le traitement et la qualité de vie de ces patients. (French)
4 December 2021
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Multiples Myelom (MM) ist eine hämatologische Neoplasie mit einer sehr niedrigen Heilungsrate. Neben genetischen Veränderungen wird immer deutlicher, dass sowohl epigenetische Veränderungen als auch nichtkodierende RNAs eine wichtige Rolle bei der Pathogenese von MM spielen können. Übergeordnetes Ziel dieses Projekts ist es, das (Hydroxy-)Methylom der vollständigen DNA zu analysieren und seine Rolle bei der Regulierung von Transkriptom zu kennen, insbesondere von langen nichtkodierenden RNAs (lncRNAs), festzustellen, ob lncRNAs an der Pathogenese und Prognose von MM beteiligt sind, und neue Moleküle gegen diese LncRNAs zu entwerfen, die die Behandlung von MM-Patienten verbessern. Das (Hydroxy-)Methylom wird mittels Bis-seq, TET-seq und Methylierungsarrays und Transkriptom durch RNA-seq analysiert. Die Implikation einer veränderten Expression oder Methylierung in der Prognose von MM wird von Q-RT-PCR und Pyrossequenzierung oder MSP in einer Reihe von 200 MM-Patienten untersucht. Von den am meisten veränderten LncRNAs wird ihre Funktionalität im Hinblick auf ihre Beteiligung an der Pathogenese von MM (Proliferation, Zellzyklus, Apoptose) sowohl in vitro als auch in vivo analysiert. Schließlich werden wir, wennAptameros oder kleine Moleküle gegen die beiden relevantesten lncRNAs im MM entwerfen. Durch diese Studie in diesem Projekt werden wir das (Hydroxy-)Methylom des MM, die deregulierten LncRNAs und mit einer klaren Funktionalität in der Entwicklung und Prognose des MM entschlüsseln und schließlich werden wir neue Strategien für lncRNAs entwickeln, um die Behandlung und Lebensqualität dieser Patienten zu verbessern. (German)
9 December 2021
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Multipel myeloom (MM) is een hematologische neoplasie met een zeer lage genezingsgraad. Samen met genetische veranderingen, is het steeds duidelijker dat zowel epigenetische veranderingen als niet-coderende RNAs een belangrijke rol kunnen spelen in de pathogenese van MM. Het algemene doel van dit project is om het (hydroxy)methyloom van het volledige DNA te analyseren en zijn rol te kennen in de regulering van transcriptome, met name van lange niet-coderende RNA’s (lncRNAs), te bepalen of lncRNAs betrokken zijn bij de pathogenese en prognose van MM, en nieuwe moleculen te ontwerpen tegen deze lncRNAs die de behandeling van MM-patiënten verbeteren. Het (hydroxy)methyloom moet worden geanalyseerd met behulp van Bis-seq, TET-seq en methylation arrays en transcriptoom door middel van RNA-seq. De implicatie van veranderde expressie of methylatie in de prognose van MM zal worden onderzocht door Q-RT-PCR en pyrossequencing of MSP in een reeks van 200 MM-patiënten. Van de meest gewijzigde lncRNAs, zal hun functionaliteit worden geanalyseerd in termen van hun betrokkenheid bij de pathogenese van MM (proliferatie, celcyclus, apoptose) zowel in vitro als in vivo. Tot slot zullen we alsAptameros of kleine moleculen ontwerpen tegen de twee meest relevante lncRNAs in de MM. Door deze studie in dit project zullen we het (hydroxy)methyloom van de MM, de gedereguleerde lncRNAs en met een duidelijke functionaliteit in de ontwikkeling en prognose van de MM ontcijferen en ten slotte zullen we nieuwe strategieën ontwerpen gericht op lncRNAs om de behandeling en kwaliteit van leven van deze patiënten te verbeteren. (Dutch)
17 December 2021
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Pamplona/Iruña
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Identifiers
PI13_01469
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