Determinants of resistance, virulence and population structure of invasive and non-invasive uropathogen E. coli and relation to the clinical-epidemiological characteristics of urinary infection (Q3161685)
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Project Q3161685 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Determinants of resistance, virulence and population structure of invasive and non-invasive uropathogen E. coli and relation to the clinical-epidemiological characteristics of urinary infection |
Project Q3161685 in Spain |
Statements
24,875.0 Euro
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49,750.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2014
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30 September 2018
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FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
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40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W
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28079
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Escherichia coli (Ec) es el agente causal más frecuente de infección del tracto urinario (ITU). Nuestras participación en un estudio multicéntrico promovido por el Grupo de Estudio de Infección Hospitalaria de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica, y en el proyecto europeo del 7º Programa Marco R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) nos ha permitido conseguir una colección de más de 500 aislados de Ec uropatógeno causantes de bacteriemias de origen urinario (aislados invasivos de hemocultivos) e ITU no complicadas en la comunidad (aislados no invasivos de urocultivos) procedentes de diferentes áreas y asociados con variables epidemiológicas y clínicas bien estudiadas. El objetivo del proyecto es caracterizar microbiológicamente esta colección, describiendo las tasas de resistencia y sus bases genéticas, los determinantes de virulencia y su expresión, y la presencia de clones de alto riesgo (CAR) multirresistentes con alto potencial epidémico, empleando técnicas de microbiología molecular de última generación y herramientas bioinformáticas. El análisis de los resultados microbiológicos en relación con variables epidemiológicas y clínicas permitirá identificar los pacientes con mayor riesgo de presentar ITU por CAR y definir el pronóstico de gravedad asociado. Esta propuesta constituye un ejemplo de investigación traslacional mediante la aplicación de conocimientos de genética poblacional, resistencias a los antibióticos y virulencia a una entidad infecciosa frecuente en el ámbito sanitario como es la ITU. Los resultados ayudarán a diseñar estrategias que optimicen y mejoren el manejo clínico y la terapia empírica de la ITU en España. Finalmente, dos proyectos ya consolidados convergen de forma sinérgica en esta propuesta, permitiendo la continuidad de esta línea de investigación. (Spanish)
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Escherichia coli (Ec) is the most common causal agent of urinary tract infection (UTI). Our participation in a multicenter study promoted by the Hospital Infection Study Group of the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology, and in the European project of the 7th Framework Programme R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) has enabled us to obtain a collection of more than 500 isolates of uropathogenic bacteria that cause urinary bacteremias (invasive hemoculture isolates) and ITU uncomplicated in the community (non-invasive urocultural isolations) from different areas and associated with epidemiological variables and well studied clinics. The objective of the project is to characterise this collection microbiologically, describing the resistance rates and their genetic bases, the determinants of virulence and their expression, and the presence of multi-resistant high-risk clones (CAR) with high epidemic potential, using state-of-the-art molecular microbiology techniques and bioinformatics tools. The analysis of the microbiological results in relation to epidemiological and clinical variables will allow the identification of patients with the highest risk of developing CAR UTIs and the definition of the associated severity prognosis. This proposal is an example of translational research through the application of knowledge of population genetics, antibiotic resistance and virulence to a frequent infectious entity in the health field such as UTI. The results will help to design strategies that optimise and improve clinical management and empirical therapy of UTI in Spain. Finally, two already consolidated projects converge synergistically in this proposal, allowing the continuity of this line of research. (English)
12 October 2021
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Escherichia coli (Ec) est l’agent causal le plus fréquent de l’infection des voies urinaires (ITU). Notre participation à une étude multicentrique promue par le groupe d’étude sur les infections hospitalières de la Société espagnole des maladies infectieuses et de microbiologie clinique, et au projet européen du 7e programme-cadre R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) nous a permis d’obtenir une collection de plus de 500 isolats de bactéries uropathogènes qui causent des bactériémies urinaires (isolats d’hémoculture invasives) et de l’UIT non compliquées dans la communauté (isolements uroculturels non envahissants) de différentes régions et associées à des variables épidémiologiques et à des cliniques bien étudiées. L’objectif du projet est de caractériser cette collection sur le plan microbiologique, en décrivant les taux de résistance et leurs bases génétiques, les déterminants de la virulence et leur expression, ainsi que la présence de clones à haut risque multirésistants (CAR) à fort potentiel épidémique, à l’aide de techniques de microbiologie moléculaire et d’outils bioinformatiques de pointe. L’analyse des résultats microbiologiques par rapport aux variables épidémiologiques et cliniques permettra d’identifier les patients présentant le risque le plus élevé de développer des UTI CAR et de définir le pronostic de gravité associé. Cette proposition est un exemple de recherche translationnelle par l’application de connaissances sur la génétique des populations, la résistance aux antibiotiques et la virulence à une entité infectieuse fréquente dans le domaine de la santé comme l’ITU. Les résultats aideront à concevoir des stratégies qui optimisent et améliorent la prise en charge clinique et la thérapie empirique de l’IVU en Espagne. Enfin, deux projets déjà consolidés convergent de manière synergique dans cette proposition, permettant la continuité de cette ligne de recherche. (French)
4 December 2021
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Escherichia coli (Ec) ist das häufigste kausale Mittel der Harnwegsinfektion (UTI). Unsere Teilnahme an einer multizentrischen Studie, die von der Hospital Infection Study Group der Spanischen Gesellschaft für Infektionskrankheiten und klinische Mikrobiologie gefördert wird, und am europäischen Projekt des 7. Rahmenprogramms R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) ermöglichte es uns, eine Sammlung von mehr als 500 Isolate von uropathogenen Bakterien zu erhalten, die Harnbakterien verursachen (invasive Hämokulturisolate) und ITU in der Gemeinschaft (nichtinvasive urokulturelle Isolierungen) aus verschiedenen Gebieten und verbunden mit epidemiologischen Variablen und gut ausgebildeten Kliniken. Ziel des Projekts ist es, diese Sammlung mikrobiologisch zu charakterisieren und die Widerstandsraten und ihre genetischen Grundlagen, die Determinanten der Virulenz und deren Expression sowie das Vorhandensein von multiresistenten Hochrisiko-Klonen (CAR) mit hohem Epidemiepotenzial unter Verwendung modernster molekularer Mikrobiologie und bioinformatischer Werkzeuge zu beschreiben. Die Analyse der mikrobiologischen Ergebnisse in Bezug auf epidemiologische und klinische Variablen ermöglicht die Identifizierung von Patienten mit dem höchsten Risiko für die Entwicklung von CAR-UTIs und die Definition der damit verbundenen Schwereprognose. Dieser Vorschlag ist ein Beispiel für translationale Forschung durch die Anwendung von Wissen über Populationsgenetik, Antibiotikaresistenz und Virulenz auf eine häufig infektiöse Einheit im Gesundheitsbereich wie UTI. Die Ergebnisse werden dazu beitragen, Strategien zu entwickeln, die das klinische Management und die empirische Therapie von UTI in Spanien optimieren und verbessern. Schließlich konvergieren zwei bereits konsolidierte Projekte in diesem Vorschlag synergistisch und ermöglichen die Kontinuität dieser Forschungslinie. (German)
9 December 2021
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Escherichia coli (Ec) is het meest voorkomende oorzakelijke agens van urineweginfectie (UTI). Onze deelname aan een multicenter studie, gepromoot door de Hospital Infection Study Group van de Spaanse Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology, en aan het Europese project van het 7e Kaderprogramma R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) heeft ons in staat gesteld om een verzameling van meer dan 500 isolaten van uropathogene bacteriën te verkrijgen die urinebacteriën veroorzaken (invasieve hemocultuur isolaten) en ITU ongecompliceerd in de gemeenschap (niet-invasieve uroculturele isolaties) uit verschillende gebieden en geassocieerd met epidemiologische variabelen en goed bestudeerde klinieken. Het doel van het project is om deze collectie microbiologisch te karakteriseren, waarbij de resistentiepercentages en hun genetische basen worden beschreven, de determinanten van virulentie en hun expressie, en de aanwezigheid van multiresistente high-risk klonen (CAR) met een hoog epidemische potentieel, met behulp van state-of-the-art moleculaire microbiologietechnieken en bio-informatica-instrumenten. De analyse van de microbiologische resultaten met betrekking tot epidemiologische en klinische variabelen zal het mogelijk maken patiënten met het hoogste risico op het ontwikkelen van CAR UTI’s te identificeren en de bijbehorende ernstprognose te definiëren. Dit voorstel is een voorbeeld van translationeel onderzoek door de toepassing van kennis van populatiegenetica, antibioticaresistentie en virulentie op een frequente infectieuze entiteit op het gebied van gezondheid, zoals UTI. De resultaten zullen helpen bij het ontwerpen van strategieën die het klinisch beheer en empirische therapie van UTI in Spanje optimaliseren en verbeteren. Ten slotte convergeren twee reeds geconsolideerde projecten in dit voorstel synergetisch, waardoor de continuïteit van deze onderzoekslijn mogelijk is. (Dutch)
17 December 2021
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Madrid
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Identifiers
PI13_02092
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