Point-of-care kit for detection of antimicrobial resistencies (RES-KIT) (Q3216410)

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Project Q3216410 in Spain
Language Label Description Also known as
English
Point-of-care kit for detection of antimicrobial resistencies (RES-KIT)
Project Q3216410 in Spain

    Statements

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    8,125.0 Euro
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    16,250.0 Euro
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    50.0 percent
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    1 January 2020
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    30 June 2021
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    INSTITUTO DE INVESTIGACION Y TECNOLOGIA AGROALIMENTARIAS
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    41°37'56.17"N, 2°10'3.50"E
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    08033
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    En Europa, 25.000 muertes anuales se deben a bacterias resistentes a los antimicrobianos (AMR), lo que representa la principal amenaza para la salud en los próximos años. El problema se ha originado principalmente por el uso indebido de antibióticos y una prescripción sin un diagnóstico adecuado (tanto en humanos como en animales). Por lo tanto, tener información oportuna de la susceptibilidad microbiana a los antibióticos en cada caso de infección es una parte clave de la solución. Hasta la fecha, el diagnóstico de infecciones AMR en la salud animal es lento, costoso y centralizado (las muestras deben enviarse a un laboratorio externo). Como resultado, los facultativos tienen que esperar un mínimo de 36 horas para obtener los resultados de laboratorio y saber qué antibióticos son efectivos para comenzar el tratamiento._x000D_ Las tecnologías alternativas de diagnóstico rápido recientemente lanzadas al mercado o en desarrollo no son capaces de una cuantificación precisa (por ejemplo, reacción en cadena de la polimerasa), o no son susceptibles de pruebas en el sitio (por ejemplo, MALDI-TOF), o son demasiado caras para un uso generalizado (por ejemplo, Secuenciación de próxima generación)._x000D_ En los últimos años, la detección de ARN ribosomal se ha propuesto como un medio para cuantificar e identificar bacterias mediante sus secuencias de ARNr 16S. Estas moléculas de ARNr están en alta concentración dentro de las células (~ 10.000 copias), por lo que pueden detectarse sin necesidad de amplificación por PCR._x000D_ En un trabajo preliminar, utilizando nuestra nueva tecnología de microfluidos, hemos demostrado la cuantificación de una secuencia de oligonucleótidos con un ensayo tipo sándwich similar a ELISA realizado en la superficie de las microperlas. Nuestros diseños de laboratorio en un chip permiten implementar un protocolo de ensayo completo que incluye pasos de lavado y bloqueo de forma automatizada. La alta relación superficie / volumen de un ensayo de microperlas dentro de los microcanales produce una mayor sensibilidad en comparación con el ELISA tradicional. La disponibilidad de un gran número de válvulas dentro de esta nueva tecnología de microfluidos proporciona una alta capacidad de multiplexación._x000D_ Con esta tecnología desarrollaremos un kit de prueba rápida (RES-KIT) para la cuantificación, identificación y prueba de susceptibilidad antimicrobiana para el tratamiento de infecciones. La cistitis en mascotas será el primer objetivo a corto plazo de RES-KIT. La orina es una muestra fácil de trabajar y el acceso al mercado veterinario es rápido gracias a la falta de regulación. 9 millones de mascotas en España son susceptibles de sufrir cistitis. A largo plazo, los productos también serán certificados para uso humano (Spanish)
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    In Europe, 25,000 deaths per year are due to Antimicrobial Resistant (AMR) bacteria, representing the major health threat for the next years. The problem was originated mainly by antibiotics misuse like prescription without proper diagnosis (both in humans and animals). Therefore, having timely information of the microbial susceptibility to antibiotics in each case of infection would be key part of the solution. Up to date, the diagnosis of AMR infections in animal health is slow, time-consuming, expensive and centralized (samples must be sent to an external lab). As a result, clinicians have to wait for a minimum of 36 hours to obtain the laboratory results and to know which antibiotics are effective to start the treatment._x000D_ _x000D_ Alternative rapid diagnostic technologies recently released to the market or under development are either not capable of precise quantification (e.g. Polymerase Chain Reaction), or not amenable for on-site testing (e.g. MALDI-TOF), or too expensive for a generalized use (e.g. Next Generation Sequencing)._x000D_ _x000D_ In recent years, detection of ribosomal RNA has been proposed as a means to quantify and identify bacteria by their 16S rRNA sequences. These rRNA molecules are in high concentration inside the cells (~10.000 copies), so that they can be detected without the need of PCR amplification. _x000D_ _x000D_ In a preliminary work, using our new microfluidic technology, we have demonstrated quantification of an oligonucleotide sequence with an ELISA-like sandwich assay performed on the surface of microbeads. Our lab-on-a-chip designs allow implementing a complete assay protocol including washing and blocking steps in an automated fashion. The high surface to volume ratio of a microbead assay inside microchannels yields increased sensitivity compared to traditional ELISA. Availability of large number of valves within this new microfluidic technology provides high multiplexing capability._x000D_ _x000D_ With this technology we will develop a rapid test kit (RES-KIT) for quantification, identification, and antimicrobial susceptibility test (AST) for the treatment of infections. Cystitis in pets will be the first RES-KIT short-term target. Urine is an easy sample to work with and access to veterinary market is rapid thanks to lack of regulation. 9 million pets in Spain are susceptible of suffering cystitis. In the long term the products will also be certified for human use. (English)
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    En Europe, 25 000 décès par an sont dus à des bactéries résistantes aux antimicrobiens (MRA), qui représentent la principale menace pour la santé dans les années à venir. Le problème est principalement dû à l’utilisation abusive d’antibiotiques et à une prescription sans diagnostic approprié (tant chez l’homme que chez l’animal). Par conséquent, l’information en temps opportun sur la sensibilité microbienne aux antibiotiques dans chaque cas d’infection est un élément clé de la solution. À ce jour, le diagnostic des infections de la RAM en santé animale est lent, coûteux et centralisé (les échantillons doivent être envoyés à un laboratoire externe). Par conséquent, les médecins doivent attendre au moins 36 heures pour obtenir des résultats de laboratoire et savoir quels antibiotiques sont efficaces au début du traitement._x000D_ Les nouvelles technologies de diagnostic rapide ou mises au point ne sont pas capables de quantifier avec précision (p. ex., réaction en chaîne par polymérase) ou ne sont pas susceptibles d’être testées sur place (p. ex. MALDI-TOF) ou elles sont trop coûteuses pour une utilisation généralisée (p. ex. séquençage de nouvelle génération)._x000D_ Ces dernières années, la détection de l’ARN ribosomique a été proposée comme moyen de quantifier et d’identifier les bactéries à travers leurs séquences 16SrNA. Ces molécules d’ARNr sont en forte concentration à l’intérieur des cellules (~10 000 copies), de sorte qu’elles peuvent être détectées sans qu’il soit nécessaire d’amplifier la PCR._x000D_ Dans un travail préliminaire, à l’aide de notre nouvelle technologie microfluide, nous avons démontré la quantification d’une séquence d’oligonucléotides avec un test sandwich de type ELISA effectué à la surface des microperles. Nos conceptions de laboratoire à puce unique vous permettent de mettre en œuvre un protocole de test complet comprenant des étapes de lavage et de verrouillage de manière automatisée. Le rapport surface/volume élevé d’un essai microperle dans les microcanaux produit une plus grande sensibilité par rapport au test ELISA traditionnel. La disponibilité d’un grand nombre de vannes au sein de cette nouvelle technologie de microfluides offre une capacité de multiplexage élevée._x000D_ Grâce à cette technologie, nous allons développer un kit de test rapide (RES-KIT) pour la quantification, l’identification et le contrôle de la sensibilité aux antimicrobiens pour le traitement des infections. La cystite animale sera le premier objectif à court terme de RES-KIT. L’urine est un échantillon facile à travailler et l’accès au marché vétérinaire est rapide grâce à l’absence de réglementation. 9 millions d’animaux de compagnie en Espagne sont sensibles à la cystite. À long terme, les produits seront également certifiés pour un usage humain (French)
    5 December 2021
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    Caldes de Montbui
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    Identifiers

    IU68-016970
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