INTEGRATED OMICO ANALYSIS OF THE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET ON AGING, METILACION DYNAMICS, GENETIC MODULATION AND ITS ASSOCIATION WITH CARDIOVASCULAR PHENOTYPES (Q3147607)
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Project Q3147607 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | INTEGRATED OMICO ANALYSIS OF THE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET ON AGING, METILACION DYNAMICS, GENETIC MODULATION AND ITS ASSOCIATION WITH CARDIOVASCULAR PHENOTYPES |
Project Q3147607 in Spain |
Statements
48,400.0 Euro
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96,800.0 Euro
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50.0 percent
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30 December 2016
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31 December 2020
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UNIVERSIDAD DE VALENCIA
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39°30'32.62"N, 0°24'39.10"W
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46078
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EN EL ESTUDIO PREDIMED (ENSAYO DE INTERVENCION DIETETICA INCLUYENDO 7447 PARTICIPANTES SEGUIDOS DURANTE UNA MEDIANA DE 4,8 AÑOS) HEMOS DEMOSTRADO QUE LOS EFECTOS PROTECTORES DE LA DIETA MEDITERRANEA (MEDDIET) FRENTE A DISTINTOS FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES DE ENFERMEDAD CARDIOVASCULAR (ECV). SIN EMBARGO SON TODAVIA POCO CONOCIDOS LOS MECANISMOS PARA ESTE EFECTO PROTECTOR. LOS PRIMEROS ANALISIS NUTRIGENETICOS EN EL ESTUDIO PREDIMED NOS HAN PERMITIDO DETECTAR IMPORTANTES INTERACCIONES GEN-DIETA QUE ES NECESARIO CONOCER CON MAS PROFUNDIDAD CON LA INTEGRACION DE TECNOLOGIAS OMICAS INCLUYENDO GENOMICA, EPIGENOMICA (FUNDAMENTALMENTE A TRAVES DE ESTUDIOS DE METILACION DEL ADN). ADEMAS, EXISTE GRAN INTERES EN EL ESTUDIO DE BIOMARCADORES DE ENVEJECIMIENTO BASADOS EN EL PERFIL DE METILACION DEL ADN, TAMBIEN DENOMINADO ¿RELOJ EPIGENETICO¿. CON ELLO SE DETERMINA LA DENOMINADA EDAD BIOLOGICA (BASADA EN EL PERFIL DE METILACION) FRENTE A LA EDAD CRONOLOGICA. SU DIFERENCIA SE DENOMINA ENVEJECIMIENTO ACELERADO Y SE HA ASOCIADO CON MAS MORTALIDAD. SE SABE QUE LOS DISTINTOS COMPONENTES DE LA DIETA PUEDEN EJERCER CAMBIOS EN LA METILACION DEL ADN, PERO ESTOS CAMBIOS NO ESTAN BIEN CARACTERIZADOS EN EL TIEMPO, NI SE CONOCEN SUS ASPECTOS DINAMICOS NI SU INFLUENCIA SOBRE LOS BIOMARCADORES METILOMICOS DE ENVEJECIMIENTO NI SOBRE FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES DE ECV. POR ELLO NUESTRO OBJETIVO GENERAL ES ANALIZAR EFECTO DE LA MEDDIET EN EL PERFIL METILOMICO , TANTO DE MANERA GENERAL COMO EN LOS MARCADORES ENVEJECIMIENTO (EDAD BIOLOGICA DEL ADN) Y EN EL PERFIL METILOMICO DIFERENCIAL DE RIESGO CARDIOVASCULAR, OBSERVANDO DE MANERA DINAMICA SUS CAMBIOS EN EL TIEMPO FRENTE A LA DIETA CONTROL. TODO ELLO ADEMAS DESDE UN PUNTO DE VISTA INTEGRADO CON LA GENOMICA._x000D_ EN PRIMER LUGAR SE REALIZARA UN DISEÑO DE CASOS DE ECV Y DE CONTROLES ANIDADO EN LA COHORTE PREDIMED-VALENCIA Y EN UNA MUESTRA ALEATORIA DE OTROS NODOS (60 CASOS DE ECV Y 60 CONTROLES) PARA REALIZAR UN ESTUDIO DE METILACION DE EPIGENOMA COMPLETO INTEGRADO CON UN ESTUDIO DE GENOTIPADO DENSO EN LOS MISMOS PARTICIPANTES. EL ESTUDIO DE EPIGENOMA SE REALIZARA DE MANERA DINAMICA (BASAL Y EN DOS TIEMPOS DE SEGUIMIENTO). SE CALCULARAN VARIOS MARCADORES DE ENVEJECIMIENTO DEL ADN BASADO EN METILOMA, ENTRE ELLOS EL DE HORVATH (353 SONDAS), EL DE HANNUM (71 SONDAS) Y EL DE WEIDNER (3 LOCI). TAMBIEN SE DETERMINARAN LOS PERFILES EPIGENOMICOS ASOCIADOS A LA ECV INCIDENTE Y A SUS FENOTIPOS INTERMEDIOS. EL ANALISIS OMICO INTEGRADO PERMITIRA IDENTIFICAR LOS POLIMORFISMOS GENETICOS ASOCIADOS A ESTOS MARCADORES DE METILACION Y CREAR GENETIC RISK SCORES (GRS) QUE SE PODRAN UTILIZAR COMO PROXIS DE BIOMARCADORES DE ENVEJECIMIENTO Y METILACION PARA EL TOTAL DE LA MUESTRA. SE SELECCIONARAN 40 SNPS QUE SE DETERMINARAN EN EL TOTAL DEL ESTUDIO PREDIMED (N=7100). TAMBIEN SE DETERMINARA LA METILACION DE LOCI SELECCIONADOS EN EL TOTAL DE LOS CASOS DE ECV Y UNA MUESTRA ALEATORIA DE LA COHORTE. MEDIANTE MODELOS DE REGRESION DE COX MULTIVARIANTE CON TERMINOS DE INTERACCION DE DETERMINARA EL EFECTO GENO-EPIGENOMICO DE ESTOS MARCADORES EN LA INCIDENCIA DE ECV Y MORTALIDAD. PARALELAMENTE, SE VALIDARAN LOS MARCADORES GENOMICOS Y EPIGENOMICOS, INCLUYENDO UN ANALISIS TRANSCRIPTOMICO EN UNA SUBMUESTRA DE PARTICIPANTES EN EL ESTUDIO PREDIMED PLUS-VALENCIA. SE EMPLEARAN TECNICAS DE INTEGRACION DE OMICAS (COINERCIA, ETC) PARA LOS ANALISIS DE LOS DIFERENTES NIVELES. (Spanish)
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IN THE PREDIMED STUDY (A DIETARY INTERVENTION TRIAL INCLUDING 7447 PARTICIPANTS FOLLOWED OVER A MEDIAN OF 4.8 YEARS) WE HAVE SHOWN THAT THE PROTECTIVE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET (MEDDIET) AGAINST DIFFERENT INTERMEDIATE AND END PHENOTYPES OF CARDIOVASCULAR DISEASE (CVD). HOWEVER, THE MECHANISMS FOR THIS PROTECTIVE EFFECT ARE STILL LITTLE KNOWN. THE FIRST NUTRIGENETIC ANALYSES IN THE PREDIMED STUDY HAVE ALLOWED US TO DETECT IMPORTANT GEN-DIET INTERACTIONS THAT WE NEED TO KNOW MORE DEEPLY WITH THE INTEGRATION OF OMIC TECHNOLOGIES INCLUDING GENOMICA, EPIGENOMICA (MAINLY THROUGH STUDIES OF DNA METILACION). IN ADDITION, THERE IS GREAT INTEREST IN THE STUDY OF BIOMARKERS OF AGING BASED ON THE PROFILE OF DNA METILACION, ALSO CALLED EPIGENETIC CLOCK? THIS DETERMINES THE SO-CALLED BIOLOGICAL AGE (BASED ON THE METILACION PROFILE) VERSUS THE CHRONOLOGICAL AGE. ITS DIFFERENCE IS CALLED ACCELERATED AGING AND HAS BEEN ASSOCIATED WITH MORE MORTALITY. IT IS KNOWN THAT THE DIFFERENT COMPONENTS OF THE DIET CAN EXERT CHANGES IN DNA METILATION, BUT THESE CHANGES ARE NOT WELL CHARACTERISED OVER TIME, NOR ARE THEIR DYNAMIC ASPECTS KNOWN OR THEIR INFLUENCE ON THE METILOMIC BIOMARKERS OF AGING OR ON INTERMEDIATE AND FINAL CVD PHENOTYPES. FOR THIS REASON OUR GENERAL OBJECTIVE IS TO ANALYSE THE EFFECT OF MEDDIET ON THE METILOMICO PROFILE, BOTH IN A GENERAL WAY AND IN MARKERS AGING (BIOLOGICAL AGE OF DNA) AND ON THE DIFFERENTIAL METILOMICO PROFILE OF CARDIOVASCULAR RISK, OBSERVING DYNAMICALLY ITS CHANGES OVER TIME COMPARED TO THE CONTROL DIET. In the first place there will be a design of ECV cases and animal control cases in the Predimed-VALENCE COHORTE and in a different language of other nodes (60 cases of ECV and 60 controls) to perform a state of affairs. integrated COMPLETE epigenome METILATION WITH A GENOTIPATED STUDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. THE EPIGENOMA STUDY WILL BE CONDUCTED IN A DYNAMIC MANNER (BASAL AND IN TWO FOLLOW-UP TIMES). SEVERAL METHYLOMA-BASED DNA AGING MARKERS WILL BE CALCULATED, INCLUDING HORVATH (353 PROBES), HANNUM (71 PROBES) AND WEIDNER (3 LOCI) MARKERS. THE EPIGENOMIC PROFILES ASSOCIATED WITH THE INCIDENT CVD AND ITS INTERMEDIATE PHENOTYPES WILL ALSO BE DETERMINED. THE INTEGRATED OMICO ANALYSIS WILL IDENTIFY THE GENETIC POLYMORPHISMS ASSOCIATED WITH THESE METILACION MARKERS AND CREATE GENETIC RISK SCORES (GRS) THAT CAN BE USED AS PROXIES OF AGING AND METILACION BIOMARKERS FOR THE TOTAL SAMPLE. 40 SNPS WILL BE SELECTED TO BE DETERMINED IN THE TOTAL PREDIMED STUDY (N=7100). THE METILACION OF LOCI SELECTED IN THE TOTAL CASES OF CVD AND A RANDOM SAMPLE OF THE COHORT WILL ALSO BE DETERMINED. USING MULTIVARIATE COX REGRESSION MODELS WITH TERMS OF INTERACTION TO DETERMINE THE GENO-EPIGENOMIC EFFECT OF THESE MARKERS IN THE INCIDENCE OF CVD AND MORTALITY. IN PARALLEL, GENOMIC AND EPIGENOMIC MARKERS WILL BE VALIDATED, INCLUDING A TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS IN A SUBSAMPLE OF PARTICIPANTS IN THE PREDIMED PLUS-VALENCIA STUDY. OMIC INTEGRATION TECHNIQUES (COINERCIA, ETC) WILL BE USED FOR THE ANALYSIS OF THE DIFFERENT LEVELS. (English)
12 October 2021
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Burjassot
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Identifiers
SAF2016-80532-R
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