No label defined (Q3145822)
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Project Q3145822 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | No label defined |
Project Q3145822 in Spain |
Statements
302,500.0 Euro
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605,000.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2015
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31 December 2018
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INSTITUTO DE INVESTIGACION BIOMEDICA DE BELLVITGE
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08101
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LA MAYORIA DE LA INVESTIGACION BIOLOGICA Y MEDICA DIRIGIDA A LAS REGIONES REGULADORAS DE NUESTRO GENOMA SE HAN REDUCIDO A LA PEQUEÑA REGION DEL ADN QUE RODEA EL PRINCIPAL INICIO DE TRANSCRIPCION DE LOS GENES (PROMOTOR MINIMO). EN ESTE SENTIDO, HEMOS OBVIADO O OLVIDADO, OTRAS SECUENCIAS MAS DISTANTES DEL GENOMA, CON LAS HONROSAS EXCEPCIONES DE LAS BUENA INVESTIGACIONES DESARROLLADAS EN ENHANCERS E INSULADORES. PERO OTRAS REGIONES HAN SIDO IGNORADAS Y EXISTE UNA NECESIDAD DE OBTENER ESTE CONOCIMIENTO PARA LAS REGIONES "HUERFANAS" DEL GENOMA, ASI COMO PARA ENTENDER SUS POSIBLES ALTERACIONES EN CANCER. EN ESTE CONTEXTO, SABEMOS QUE LA METILACION ABERRANTE DE DINUCLEOTIDOS CPG LOCALIZADOS EN PROMOTORES DE GENES SUPRESORES TUMORALES OCURRE EN LA HISTORIA NATURAL DEL CANCER, PERO IGNORAMOS QUE SUCEDE EN SECUENCIAS NO TAN CARACTERIZADAS. EL PRESENTE PROYECTO BUSCA ANALIZAR LOS PATRONES DE METILACION DEL ADN Y SUS CONSECUENCIAS FUNCIONALES EN CELULAS Y TEJIDOS NORMALES Y TRANSFORMADOS PARA CUATRO COMPARTIMENTOS "EXTRAORDINARIOS" DE NUESTRO GENOMA: SUPER-ENHANCERS, SECUENCIAS IMPLICADAS EN LOS BUCLES DE CROMATINA, DUONES Y, PROMOTORES ALTERNATIVOS. CONOZCAMOLOS AUNQUE SEA BREVEMENTE. EN LA PRIMAVERA DE 2013 HUBO LA IRRUPCION DE LOS PRIMEROS ESTUDIOS SERIOS SOBRE LOS "SUPER-ENHANCERS", GRANDES CLUSTERS DE ENHANCER TRANSCRIPCIONALES QUE CONTROLAN LA EXPRESION DE GENES CLAVES PARA LA IDENTIDAD CELULAR DESDE UNA LARGA DISTANCIA. PERO PARALELAMENTE AHORA SABEMOS, DEBIDO A LOS ESTUDIOS DE ULTRASECUENCIACION GENOMICA 3C (HI-C), QUE SE PRODUCEN OTROS BUCLES ENTRE SECUENCIAS DEL ADN ALEJADAS PARA CONTROLAR LA ACTIVIDAD GENICA. Y EL AÑO PASADO, SE PRODUJO OTRA VUELTA DE TUERCA EXCITANTE A LA REGULACION INEXPLORADA DEL GENOMA QUE NOS VINO DADA POR EL CONCEPTO DE LOS "DUONES": CODONES QUE TIENEN UN ROL DUAL, SIENDO CAPACES DE DETERMINAR AMINOACIDOS Y A LA VEZ ACTUANDO COMO SECUENCIAS REGULADORAS AL PERMITIR LA UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION. FINALMENTE, HOY EXISTE LA ACEPTACION DE QUE CASI TODOS NUESTROS GENES ORIGINAN TRANSCRITOS DE ARN ALTERNATIVOS AL "PRINCIPAL", SIENDO MUCHOS DE ELLOS INICIADOS A PARTIR DE PROMOTORES INTERNOS DEL GEN EN CUESTION Y TENIENDO UNA REGULACION DESCONOCIDA Y AUN POR EXPLORAR. EN EL PRESENTE ESTUDIO NOS PROPONEMOS ANALIZAR EL PAPEL DE UNA MARCA EPIGENETICA, LA METILACION DEL ADN, EN EL CONTEXTO DE LOS CUATRO TIPOS DE SECUENCIAS DESCRITAS. TAMBIEN DETERMINAREMOS SI LOS PATRONES DE METILACION DEL ADN DE ESTA SECUENCIAS REGULADORAS "EXTRAORDINARIAS" SE ENCUENTRA DISTORSIONADO EN CANCER HUMANO. PARA CONSEGUIR ESTOS OBJETIVOS USAREMOS UNA COMBINACION DE LINEAS CELULARES DE CANCER ASI COMO TUMORES PRIMARIOS QUE SERAN "INTERROGADOS" MEDIANTE ACERCAMIENTOS EPIGENOMICOS (WHOLE GENOME BISULFITE SEQUENCING, 450K DNA METHYLATION MICROARRAY Y HI-C CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE) Y TRANSCRIPTOMICOS (RNA-SEQ, EXPRESSION MICROARRAYS Y RASL-SEQ). LAS SECUENCIAS CANDIDATAS SERAN FINALMENTE FUNCIONALMENTE ANALIZADAS EN MODELOS CELULARES Y MURINOS; ASI COMO SE PROCEDERA A ESTUDIAR SU VALOR TRANSLACIONAL EN ESTUDIOS CLINICOPATOLOGICOS DE TUMORES HUMANOS. (Spanish)
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Hospitalet de Llobregat, L'
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Identifiers
SAF2014-55000-R
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