Translational study of Hepatoblastoma: from integral omic analysis to the identification, validation and therapeutic application of prognostic biomarkers for incorporation into clinical practice. (Q3155151): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed label, description and/or aliases in nl, and other parts: Adding Dutch translations) |
(Changed label, description and/or aliases in it, and other parts: Adding Italian translations) |
||||||||||||||
| label / it | label / it | ||||||||||||||
Studio traslazionale di Hepatoblastoma: Dall'analisi omica integrale all'identificazione, convalida e applicazione terapeutica dei biomarcatori prognostici per l'incorporazione nella pratica clinica. | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Hepatoblastoma (HB) è il tumore maligno principale del fegato nell'infanzia. Il trattamento curativo si ottiene combinando chemioterapia e chirurgia. Tuttavia, il 20 % dei bambini non sopravvive alla malattia e coloro che sopravvivono possono soffrire di gravi sequele a vita. L'obiettivo di questo progetto è (i) caratterizzare e identificare nuovi marcatori prognostici delle forme più aggressive di BH da uno studio integrale trascrittonomico, genomico e proteomico molecolare, (ii) generare un insieme altamente convalidato di biomarcatori e (iii) valutare il loro valore teorico, con l'obiettivo generale di migliorare la gestione clinica e la sopravvivenza dei pazienti affetti da BH. Di conseguenza, abbiamo creato una delle più grandi collezioni al mondo di campioni HB, che comprende forme molto aggressive e scarsamente studiate. La caratterizzazione di questi tumori sarà eseguita a livello trascrittomico (RNA-Seq) e genomico (esome sequenziamento e array SNP). I dati generati saranno integrati con dati clinici, proteomici e di espressione genica precedentemente ottenuti, utilizzando diversi programmi di bioinformatica. La convalida del biomarcatore deve essere effettuata mediante qPCR, sequenziamento, immunoistochimica e FISH a >200 HB. Infine, l'utilità terapeutica di alcuni biomarcatori sarà studiata in xenografi stabiliti da HB umano e linee cellulari da essi derivate. Si tratta di uno studio altamente traslazionale, in quanto i risultati ottenuti saranno inclusi nei prossimi studi clinici condotti dal gruppo internazionale SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Inoltre, sebbene l'HB sia un tumore raro, dati precedenti indicano che i risultati possono essere estrapolati ad altri tumori più frequenti, come l'epatocarcinoma. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Hepatoblastoma (HB) è il tumore maligno principale del fegato nell'infanzia. Il trattamento curativo si ottiene combinando chemioterapia e chirurgia. Tuttavia, il 20 % dei bambini non sopravvive alla malattia e coloro che sopravvivono possono soffrire di gravi sequele a vita. L'obiettivo di questo progetto è (i) caratterizzare e identificare nuovi marcatori prognostici delle forme più aggressive di BH da uno studio integrale trascrittonomico, genomico e proteomico molecolare, (ii) generare un insieme altamente convalidato di biomarcatori e (iii) valutare il loro valore teorico, con l'obiettivo generale di migliorare la gestione clinica e la sopravvivenza dei pazienti affetti da BH. Di conseguenza, abbiamo creato una delle più grandi collezioni al mondo di campioni HB, che comprende forme molto aggressive e scarsamente studiate. La caratterizzazione di questi tumori sarà eseguita a livello trascrittomico (RNA-Seq) e genomico (esome sequenziamento e array SNP). I dati generati saranno integrati con dati clinici, proteomici e di espressione genica precedentemente ottenuti, utilizzando diversi programmi di bioinformatica. La convalida del biomarcatore deve essere effettuata mediante qPCR, sequenziamento, immunoistochimica e FISH a >200 HB. Infine, l'utilità terapeutica di alcuni biomarcatori sarà studiata in xenografi stabiliti da HB umano e linee cellulari da essi derivate. Si tratta di uno studio altamente traslazionale, in quanto i risultati ottenuti saranno inclusi nei prossimi studi clinici condotti dal gruppo internazionale SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Inoltre, sebbene l'HB sia un tumore raro, dati precedenti indicano che i risultati possono essere estrapolati ad altri tumori più frequenti, come l'epatocarcinoma. (Italian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Hepatoblastoma (HB) è il tumore maligno principale del fegato nell'infanzia. Il trattamento curativo si ottiene combinando chemioterapia e chirurgia. Tuttavia, il 20 % dei bambini non sopravvive alla malattia e coloro che sopravvivono possono soffrire di gravi sequele a vita. L'obiettivo di questo progetto è (i) caratterizzare e identificare nuovi marcatori prognostici delle forme più aggressive di BH da uno studio integrale trascrittonomico, genomico e proteomico molecolare, (ii) generare un insieme altamente convalidato di biomarcatori e (iii) valutare il loro valore teorico, con l'obiettivo generale di migliorare la gestione clinica e la sopravvivenza dei pazienti affetti da BH. Di conseguenza, abbiamo creato una delle più grandi collezioni al mondo di campioni HB, che comprende forme molto aggressive e scarsamente studiate. La caratterizzazione di questi tumori sarà eseguita a livello trascrittomico (RNA-Seq) e genomico (esome sequenziamento e array SNP). I dati generati saranno integrati con dati clinici, proteomici e di espressione genica precedentemente ottenuti, utilizzando diversi programmi di bioinformatica. La convalida del biomarcatore deve essere effettuata mediante qPCR, sequenziamento, immunoistochimica e FISH a >200 HB. Infine, l'utilità terapeutica di alcuni biomarcatori sarà studiata in xenografi stabiliti da HB umano e linee cellulari da essi derivate. Si tratta di uno studio altamente traslazionale, in quanto i risultati ottenuti saranno inclusi nei prossimi studi clinici condotti dal gruppo internazionale SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Inoltre, sebbene l'HB sia un tumore raro, dati precedenti indicano che i risultati possono essere estrapolati ad altri tumori più frequenti, come l'epatocarcinoma. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
| |||||||||||||||
Revision as of 12:33, 16 January 2022
Project Q3155151 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Translational study of Hepatoblastoma: from integral omic analysis to the identification, validation and therapeutic application of prognostic biomarkers for incorporation into clinical practice. |
Project Q3155151 in Spain |
Statements
33,125.0 Euro
0 references
66,250.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 March 2017
0 references
FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION EN CIENCIAS DE LA SALUD GERMANS TRIAS I PUJOL
0 references
41°26'57.66"N, 2°14'53.70"E
0 references
08015
0 references
El Hepatoblastoma (HB) es el principal tumor maligno del hígado en la infancia. El tratamiento curativo se consigue combinando quimioterapia y cirugía. No obstante, un 20% de los niños no sobreviven a la enfermedad y los que sobreviven pueden sufrir secuelas graves de por vida. El presente proyecto tiene como objetivo (i) caracterizar e identificar nuevos marcadores pronóstico de las formas más agresivas de HB a partir de un estudio molecular integral transcriptómico, genómico y proteómico, (ii) generar un conjunto altamente validado de biomarcadores y (iii) evaluar su valor teranóstico, con el objetivo global de mejorar el manejo clínico y la supervivencia de los pacientes con HB. En consecuencia, hemos creado una de las mayores colecciones mundiales de muestras de HB, que incluye formas muy agresivas y poco estudiadas. La caracterización de estos tumores se realizará a nivel transcriptómico (RNA-Seq) y genómico (Exome sequencing y arrays de SNP). Los datos generados se integrarán con datos clínicos, proteómicos y de expresión génica obtenidos previamente, utilizando distintos programas bioinformáticos. La validación de los biomarcadores se realizará mediante qPCR, secuenciación, inmunohistoquímica y FISH en >200 HBs. Finalmente, la utilidad terapéutica de determinados biomarcadores se estudiará en xenografts establecidos a partir de HB humano y líneas celulares derivadas de los mismos. Este es un estudio altamente traslacional, puesto que los resultados obtenidos se incluirán en próximos ensayos clínicos dirigidos por el grupo internacional SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Además, aunque el HB sea un tumor raro, datos previos indican que los resultados podrían ser extrapolables a otros cánceres más frecuentes, como el hepatocarcinoma. (Spanish)
0 references
Hepatoblastoma (HB) is the main malignant tumor of the liver in childhood. Curative treatment is achieved by combining chemotherapy and surgery. However, 20 per cent of children do not survive the disease and those who survive may suffer severe lifetime sequelae. The objective of this project is (i) to characterise and identify new prognostic markers of the most aggressive forms of BH from an integral transcriptonomic, genomic and proteomic molecular study, (ii) to generate a highly validated set of biomarkers and (iii) to evaluate their theoretical value, with the overall objective of improving the clinical management and survival of patients with BH. As a result, we have created one of the world’s largest collections of HB samples, which includes very aggressive and poorly studied forms. The characterisation of these tumors will be performed at the transcriptomic (RNA-Seq) and genomic level (Exome sequencing and SNP arrays). The data generated will be integrated with previously obtained clinical, proteomic and gene expression data, using different bioinformatics programs. Biomarker validation shall be performed by qPCR, sequencing, immunohistochemistry and FISH at >200 HBs. Finally, the therapeutic usefulness of certain biomarkers will be studied in xenografts established from human HB and cell lines derived from them. This is a highly translational study, as the results obtained will be included in upcoming clinical trials led by the international SIOPEL group (Childhood Liver Tumours Strategy Group). In addition, although HB is a rare tumor, previous data indicate that the results may be extrapolated to other more frequent cancers, such as hepatocarcinoma. (English)
12 October 2021
0 references
L’hépatoblastome (HB) est la principale tumeur maligne du foie dans l’enfance. Le traitement curatif est obtenu en combinant chimiothérapie et chirurgie. Toutefois, 20 % des enfants ne survivent pas à la maladie et ceux qui survivent peuvent souffrir de séquelles sévères à vie. L’objectif de ce projet est (i) de caractériser et d’identifier de nouveaux marqueurs pronostiques des formes les plus agressives de BH à partir d’une étude moléculaire intégrale transcriptonomique, génomique et protéomique, (ii) de générer un ensemble de biomarqueurs hautement validés et (iii) d’évaluer leur valeur théorique, avec l’objectif global d’améliorer la prise en charge clinique et la survie des patients atteints de BH. En conséquence, nous avons créé l’une des plus grandes collections d’échantillons HB au monde, qui comprend des formes très agressives et mal étudiées. La caractérisation de ces tumeurs sera effectuée au niveau transcriptomique (ARN-Seq) et génomique (séquençage d’Exome et tableaux SNP). Les données générées seront intégrées aux données cliniques, protéomiques et d’expression génétique obtenues antérieurement, à l’aide de différents programmes de bioinformatique. La validation du biomarqueur est effectuée par qPCR, séquençage, immunohistochimie et FISH à plus de 200 HBs. Enfin, l’utilité thérapeutique de certains biomarqueurs sera étudiée dans les xénogreffes établies à partir de lignées humaines HB et de lignées cellulaires dérivées de celles-ci. Il s’agit d’une étude hautement translationnelle, car les résultats obtenus seront inclus dans les prochains essais cliniques menés par le groupe international SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). De plus, bien que le HB soit une tumeur rare, des données antérieures indiquent que les résultats peuvent être extrapolés à d’autres cancers plus fréquents, comme l’hépatocarcinome. (French)
2 December 2021
0 references
Hepatoblastom (HB) ist der wichtigste bösartige Tumor der Leber in der Kindheit. Kurative Behandlung wird durch die Kombination von Chemotherapie und Chirurgie erreicht. 20 Prozent der Kinder überleben die Krankheit jedoch nicht, und diejenigen, die überleben, können schwere Lebzeiten erleiden. Ziel dieses Projekts ist (i) die Charakterisierung und Identifizierung neuer prognostischer Marker der aggressivsten Formen von BH aus einer integralen transkriptonomischen, genomischen und proteomischen molekularen Studie, ii) eine hoch validierte Menge an Biomarkern zu erzeugen und iii) ihren theoretischen Wert zu bewerten, um das klinische Management und das Überleben von Patienten mit BH zu verbessern. Als Ergebnis haben wir eine der weltweit größten Sammlungen von HB-Proben erstellt, die sehr aggressiv und schlecht untersuchte Formen umfassen. Die Charakterisierung dieser Tumore erfolgt auf Transcriptomic (RNA-Seq) und genomischer Ebene (Exome Sequencing und SNP-Arrays). Die erzeugten Daten werden in zuvor erhaltene klinische, proteomische und Genexpressionsdaten unter Verwendung unterschiedlicher Bioinformatikprogramme integriert. Die Validierung des Biomarkers erfolgt durch qPCR, Sequenzierung, Immunhistochemie und FISH bei >200 HBs. Schließlich wird die therapeutische Nützlichkeit bestimmter Biomarker in Xenografts untersucht, die aus menschlichen HB- und Zelllinien hergestellt wurden. Dies ist eine hochübersetzte Studie, da die erzielten Ergebnisse in die kommenden klinischen Studien unter der Leitung der internationalen SIOPEL-Gruppe (Childhood Liver Tumours Strategy Group) einbezogen werden. Darüber hinaus, obwohl HB ein seltener Tumor ist, zeigen frühere Daten, dass die Ergebnisse auf andere häufigere Krebsarten wie Hepatokarzinom extrapoliert werden können. (German)
9 December 2021
0 references
Hepatoblastoma (HB) is de belangrijkste kwaadaardige tumor van de lever in de kindertijd. Curatieve behandeling wordt bereikt door chemotherapie en chirurgie te combineren. Echter, 20 procent van de kinderen overleven de ziekte niet en degenen die overleven kunnen ernstige levenslange gevolgen ondervinden. Het doel van dit project is (i) het karakteriseren en identificeren van nieuwe prognostische markers van de meest agressieve vormen van BH uit een integrale transcriptonomische, genomische en proteomische moleculaire studie, (ii) het genereren van een zeer gevalideerde set biomarkers en (iii) om hun theoretische waarde te evalueren, met als algemene doelstelling de klinische behandeling en overleving van patiënten met BH te verbeteren. Als gevolg hiervan hebben we een van ’s werelds grootste collecties van HB-stalen gecreëerd, waaronder zeer agressieve en slecht bestudeerde vormen. De karakterisering van deze tumoren zal worden uitgevoerd op het transcriptomische (RNA-Seq) en genomic niveau (Exome sequencing en SNP arrays). De gegenereerde gegevens zullen worden geïntegreerd met eerder verkregen klinische, proteomische en genexpressiegegevens, met behulp van verschillende bio-informaticaprogramma’s. De biomarkervalidatie wordt uitgevoerd door qPCR, sequencing, immunohistochemie en FISH bij >200 HBs. Ten slotte zal het therapeutische nut van bepaalde biomarkers worden bestudeerd in xenograften die zijn vastgesteld op basis van menselijke HB- en daaruit afgeleide cellijnen. Dit is een zeer translationeel onderzoek, aangezien de verkregen resultaten zullen worden opgenomen in komende klinische onderzoeken onder leiding van de internationale SIOPEL-groep (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Bovendien, hoewel HB een zeldzame tumor is, geven eerdere gegevens aan dat de resultaten kunnen worden geëxtrapoleerd naar andere vaker voorkomende kankers, zoals hepatocarcinoom. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Hepatoblastoma (HB) è il tumore maligno principale del fegato nell'infanzia. Il trattamento curativo si ottiene combinando chemioterapia e chirurgia. Tuttavia, il 20 % dei bambini non sopravvive alla malattia e coloro che sopravvivono possono soffrire di gravi sequele a vita. L'obiettivo di questo progetto è (i) caratterizzare e identificare nuovi marcatori prognostici delle forme più aggressive di BH da uno studio integrale trascrittonomico, genomico e proteomico molecolare, (ii) generare un insieme altamente convalidato di biomarcatori e (iii) valutare il loro valore teorico, con l'obiettivo generale di migliorare la gestione clinica e la sopravvivenza dei pazienti affetti da BH. Di conseguenza, abbiamo creato una delle più grandi collezioni al mondo di campioni HB, che comprende forme molto aggressive e scarsamente studiate. La caratterizzazione di questi tumori sarà eseguita a livello trascrittomico (RNA-Seq) e genomico (esome sequenziamento e array SNP). I dati generati saranno integrati con dati clinici, proteomici e di espressione genica precedentemente ottenuti, utilizzando diversi programmi di bioinformatica. La convalida del biomarcatore deve essere effettuata mediante qPCR, sequenziamento, immunoistochimica e FISH a >200 HB. Infine, l'utilità terapeutica di alcuni biomarcatori sarà studiata in xenografi stabiliti da HB umano e linee cellulari da essi derivate. Si tratta di uno studio altamente traslazionale, in quanto i risultati ottenuti saranno inclusi nei prossimi studi clinici condotti dal gruppo internazionale SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Inoltre, sebbene l'HB sia un tumore raro, dati precedenti indicano che i risultati possono essere estrapolati ad altri tumori più frequenti, come l'epatocarcinoma. (Italian)
16 January 2022
0 references
Badalona
0 references
Identifiers
PI13_02340
0 references