Multiomics, Microbiotes and Microorganisms Intetinal Colonisers Potentially Invasive: from microecology to Personalised-Predictive Genomics of Infection. (Q3144383): Difference between revisions
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Multiomica, microbioti e microrganismi Colonizzatori intestinali potenzialmente invasivi: dalla microecologia alla genomica personalizzata-preditiva dell'infezione. | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
La genomica della salute predittiva è una disciplina emergente basata sull'idea di migliorare la medicina personalizzata integrando le informazioni sul genoma e altri tipi di dati genomici (ad esempio trascrizionemi e metilomi) analizzati longitudinalmente, insieme ai dati demografici (stili di vita, stato clinico). Questa disciplina ha acquisito grande rilevanza nella salute umana, ma limitazioni tecniche impediscono la sua applicazione nelle malattie batteriche. Questo progetto applica strumenti per analizzare i cambiamenti qualitativi e quantitativi che si verificano nel microbiota degli individui nel tempo e per identificare i meccanismi di selezione e squilibrio osservati. Il progetto utilizza anche un approccio multidisciplinare che combina tecniche molecolari, cellulari ed omiche di ultima generazione sia a livello di microrganismo che ospite e nasce con l'intenzione di essere un test di principio che fornisce dati chiave per la futura analisi dell'ecologia microbica nella medicina personalizzata. Il nostro sistema sperimentale si basa su studi sulla diversità delle popolazioni dei principali patogeni opportunistici nel tratto GI (enterococcus ed E. coli) nell'ambiente ospedaliero e comunitario ottenuti in studi precedenti (FIS (PI12-01581). Nel nostro progetto vengono applicati marcatori metagenomici per studiare le cause e le conseguenze della persistenza di questi opportunisti nel microbiota intestinale. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: La genomica della salute predittiva è una disciplina emergente basata sull'idea di migliorare la medicina personalizzata integrando le informazioni sul genoma e altri tipi di dati genomici (ad esempio trascrizionemi e metilomi) analizzati longitudinalmente, insieme ai dati demografici (stili di vita, stato clinico). Questa disciplina ha acquisito grande rilevanza nella salute umana, ma limitazioni tecniche impediscono la sua applicazione nelle malattie batteriche. Questo progetto applica strumenti per analizzare i cambiamenti qualitativi e quantitativi che si verificano nel microbiota degli individui nel tempo e per identificare i meccanismi di selezione e squilibrio osservati. Il progetto utilizza anche un approccio multidisciplinare che combina tecniche molecolari, cellulari ed omiche di ultima generazione sia a livello di microrganismo che ospite e nasce con l'intenzione di essere un test di principio che fornisce dati chiave per la futura analisi dell'ecologia microbica nella medicina personalizzata. Il nostro sistema sperimentale si basa su studi sulla diversità delle popolazioni dei principali patogeni opportunistici nel tratto GI (enterococcus ed E. coli) nell'ambiente ospedaliero e comunitario ottenuti in studi precedenti (FIS (PI12-01581). Nel nostro progetto vengono applicati marcatori metagenomici per studiare le cause e le conseguenze della persistenza di questi opportunisti nel microbiota intestinale. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: La genomica della salute predittiva è una disciplina emergente basata sull'idea di migliorare la medicina personalizzata integrando le informazioni sul genoma e altri tipi di dati genomici (ad esempio trascrizionemi e metilomi) analizzati longitudinalmente, insieme ai dati demografici (stili di vita, stato clinico). Questa disciplina ha acquisito grande rilevanza nella salute umana, ma limitazioni tecniche impediscono la sua applicazione nelle malattie batteriche. Questo progetto applica strumenti per analizzare i cambiamenti qualitativi e quantitativi che si verificano nel microbiota degli individui nel tempo e per identificare i meccanismi di selezione e squilibrio osservati. Il progetto utilizza anche un approccio multidisciplinare che combina tecniche molecolari, cellulari ed omiche di ultima generazione sia a livello di microrganismo che ospite e nasce con l'intenzione di essere un test di principio che fornisce dati chiave per la futura analisi dell'ecologia microbica nella medicina personalizzata. Il nostro sistema sperimentale si basa su studi sulla diversità delle popolazioni dei principali patogeni opportunistici nel tratto GI (enterococcus ed E. coli) nell'ambiente ospedaliero e comunitario ottenuti in studi precedenti (FIS (PI12-01581). Nel nostro progetto vengono applicati marcatori metagenomici per studiare le cause e le conseguenze della persistenza di questi opportunisti nel microbiota intestinale. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 11:23, 16 January 2022
Project Q3144383 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Multiomics, Microbiotes and Microorganisms Intetinal Colonisers Potentially Invasive: from microecology to Personalised-Predictive Genomics of Infection. |
Project Q3144383 in Spain |
Statements
33,250.0 Euro
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66,500.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2016
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31 March 2020
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FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
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40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W
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28079
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La Genómica predictiva (Predictive Health Genomics) es una disciplina emergente basada en la idea de mejorar la medicina personalizada integrando información de genomas y otros tipos de datos genómicos (e.g.transcriptomas y metilomas) analizados longitudinalmente, junto con datos demográficos (estilos de vida, estado clínico). Esta disciplina ha adquirido gran relevancia en Salud humana pero las limitaciones técnicas impiden su aplicación en enfermedades bacterianas. Este proyecto aplica herramientas paraanalizar los cambios cualitativos y cuantitativos que se producen en la microbiota de individuos a lo largo del tiempo, e identificar los mecanismos de selección y desequilibrio observados. El proyecto utiliza además un abordaje multidisciplinar que combina técnicas moleculares, celulares, y omics de última generación tanto a nivel de microorganismo como de huésped y nace con la intención de ser una prueba de principio que aporte datos-clave para el futuro análisis de la ecología microbiana en medicina personalizada. Nuestro sistema experimental se basa en estudios de diversidad de las poblaciones de los principales patógenos oportunistas en el tracto GI (enterococos y E. coli) en el medio hospitalario y comunitario obtenidos en estudios previos (FIS (PI12-01581). En nuestro Proyecto se aplican marcadores metagenómicos para estudiar las causas y consecuencias de la persistencia de estos oportunistas en el la microbiota intestinal. (Spanish)
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Predictive Health Genomics is an emerging discipline based on the idea of improving personalised medicine by integrating genome information and other types of genomic data (e.g. transcriptomas and methylomas) analysed longitudinally, along with demographic data (lifestyles, clinical status). This discipline has acquired great relevance in Human Health but technical limitations prevent its application in bacterial diseases. This project applies tools to analyse the qualitative and quantitative changes that occur in the microbiota of individuals over time, and to identify the mechanisms of selection and imbalance observed. The project also uses a multidisciplinary approach that combines molecular, cellular, and omic techniques of the latest generation both at the level of microorganism and host and is born with the intention of being a test of principle that provides key data for the future analysis of microbial ecology in personalised medicine. Our experimental system is based on studies of the diversity of the populations of the main opportunistic pathogens in the GI tract (enterococcus and E. coli) in the hospital and community environment obtained in previous studies (FIS (PI12-01581). In our project, metagenomic markers are applied to study the causes and consequences of the persistence of these opportunists in the intestinal microbiota. (English)
12 October 2021
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La génomique de la santé prédictive est une discipline émergente fondée sur l’idée d’améliorer la médecine personnalisée en intégrant l’information sur le génome et d’autres types de données génomiques (par exemple, les transcriptomes et les méthylomas) analysés longitudinalement, ainsi que les données démographiques (styles de vie, statut clinique). Cette discipline a acquis une grande importance dans le domaine de la santé humaine, mais les limitations techniques empêchent son application dans les maladies bactériennes. Ce projet utilise des outils pour analyser les changements qualitatifs et quantitatifs qui se produisent dans le microbiote des individus au fil du temps et pour identifier les mécanismes de sélection et de déséquilibre observés. Le projet utilise également une approche multidisciplinaire qui combine les techniques moléculaires, cellulaires et omiques de la dernière génération tant au niveau du micro-organisme qu’à celui de l’hôte et est née avec l’intention d’être un test de principe qui fournit des données clés pour l’analyse future de l’écologie microbienne en médecine personnalisée. Notre système expérimental est basé sur des études sur la diversité des populations des principaux pathogènes opportunistes dans le tractus gastro-intestinal (entérocoque et E. coli) dans l’environnement hospitalier et communautaire, obtenues lors d’études antérieures (FIS (PI12-01581). Dans notre projet, des marqueurs métagénomiques sont appliqués pour étudier les causes et les conséquences de la persistance de ces opportunistes dans le microbiote intestinal. (French)
2 December 2021
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Predictive Health Genomics ist eine aufstrebende Disziplin, die auf der Idee beruht, die personalisierte Medizin durch die Integration von Genominformationen und anderen Arten von genomischen Daten (z. B. Transkriptomen und Methylomas) zu verbessern, die in Längsrichtung analysiert werden, zusammen mit demografischen Daten (Lebensstilen, klinischer Status). Diese Disziplin hat große Bedeutung in der menschlichen Gesundheit erworben, aber technische Einschränkungen verhindern ihre Anwendung bei bakteriellen Krankheiten. Dieses Projekt verwendet Instrumente zur Analyse der qualitativen und quantitativen Veränderungen, die im Laufe der Zeit in der Mikrobiota von Individuen auftreten, und zur Ermittlung der Mechanismen der Selektion und des Ungleichgewichts, die beobachtet werden. Das Projekt verwendet auch einen multidisziplinären Ansatz, der molekulare, zelluläre und omic Techniken der neuesten Generation sowohl auf der Ebene des Mikroorganismus als auch des Wirts kombiniert und mit der Absicht geboren wird, ein Grundsatztest zu sein, der Schlüsseldaten für die zukünftige Analyse der mikrobiellen Ökologie in der personalisierten Medizin liefert. Unser experimentelles System basiert auf Studien über die Vielfalt der Populationen der wichtigsten opportunistischen Krankheitserreger im GI-Trakt (enterococcus und E. coli) in der Krankenhaus- und Gemeindeumgebung, die in früheren Studien (FIS (PI12-01581) gewonnen wurden. In unserem Projekt werden metagenomische Marker eingesetzt, um die Ursachen und Folgen der Persistenz dieser Opportunisten im Darmmikrobiota zu untersuchen. (German)
9 December 2021
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Predictive Health Genomics is een opkomende discipline gebaseerd op het idee om gepersonaliseerde geneeskunde te verbeteren door genoominformatie en andere soorten genomische gegevens (bv. transcriptomen en methylomen) te integreren die in de lengterichting worden geanalyseerd, samen met demografische gegevens (levensstijlen, klinische status). Deze discipline heeft grote relevantie verworven in de menselijke gezondheid, maar technische beperkingen voorkomen de toepassing ervan in bacteriële ziekten. Dit project gebruikt instrumenten om de kwalitatieve en kwantitatieve veranderingen te analyseren die zich voordoen in de microbiota van individuen in de loop van de tijd, en om de mechanismen van selectie en onevenwicht waargenomen te identificeren. Het project maakt ook gebruik van een multidisciplinaire aanpak die moleculaire, cellulaire en omische technieken van de nieuwste generatie combineert, zowel op het niveau van micro-organismen als gastheer en wordt geboren met de bedoeling een principetest te zijn die belangrijke gegevens levert voor de toekomstige analyse van microbiële ecologie in gepersonaliseerde geneeskunde. Ons experimentele systeem is gebaseerd op studies naar de diversiteit van de populaties van de belangrijkste opportunistische pathogenen in het GI-kanaal (enterococcus en E. coli) in het ziekenhuis en de omgeving van de gemeenschap, verkregen in eerdere studies (FIS (PI12-01581). In ons project worden metagenomic markers toegepast om de oorzaken en gevolgen van de persistentie van deze opportunisten in de darmmicrobiota te bestuderen. (Dutch)
17 December 2021
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La genomica della salute predittiva è una disciplina emergente basata sull'idea di migliorare la medicina personalizzata integrando le informazioni sul genoma e altri tipi di dati genomici (ad esempio trascrizionemi e metilomi) analizzati longitudinalmente, insieme ai dati demografici (stili di vita, stato clinico). Questa disciplina ha acquisito grande rilevanza nella salute umana, ma limitazioni tecniche impediscono la sua applicazione nelle malattie batteriche. Questo progetto applica strumenti per analizzare i cambiamenti qualitativi e quantitativi che si verificano nel microbiota degli individui nel tempo e per identificare i meccanismi di selezione e squilibrio osservati. Il progetto utilizza anche un approccio multidisciplinare che combina tecniche molecolari, cellulari ed omiche di ultima generazione sia a livello di microrganismo che ospite e nasce con l'intenzione di essere un test di principio che fornisce dati chiave per la futura analisi dell'ecologia microbica nella medicina personalizzata. Il nostro sistema sperimentale si basa su studi sulla diversità delle popolazioni dei principali patogeni opportunistici nel tratto GI (enterococcus ed E. coli) nell'ambiente ospedaliero e comunitario ottenuti in studi precedenti (FIS (PI12-01581). Nel nostro progetto vengono applicati marcatori metagenomici per studiare le cause e le conseguenze della persistenza di questi opportunisti nel microbiota intestinale. (Italian)
16 January 2022
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Madrid
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Identifiers
PI15_01307
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