APPLICATION OF ELECTROSPRAY MASS IONISATION SPECTROMETRY FOR RAPID IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF FOOD PATHOGENS (Q3151710): Difference between revisions
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L’AUGMENTATION DES MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, AVEC L’ÉMERGENCE SPÉCIALE DE MICROORGANISMES PATHOGÈNES TELS QUE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, A ACCRU LES PRÉOCCUPATIONS AU SUJET DE LA SALUBRITÉ DES ALIMENTS TANT AU SEIN DES AUTORITÉS QUE DANS LE SECTEUR PRODUCTIF ET CHEZ LES CONSOMMATEURS. LES AGENTS PATHOGÈNES ALIMENTAIRES NE PEUVENT PAS ÊTRE COMPLÈTEMENT ÉLIMINÉS À TOUS LES STADES DE LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. EN OUTRE, SELON LE TRAITEMENT SUBI PAR L’ALIMENT, LE MICROBIOTE PRÉSENT PEUT VARIER. IL EXISTE DE NOMBREUX AGENTS PATHOGÈNES QUE L’ENTREPRISE DE TRANSFORMATION PEUT ÊTRE TENUE D’ANALYSER POUR DÉTERMINER L’INNOCUITÉ RELATIVE DE VOTRE PRODUIT. LES MÉTHODES DE DÉTECTION ET D’IDENTIFICATION RAPIDE ACTUELLEMENT MISES EN ŒUVRE ONT L’INCONVÉNIENT D’ÊTRE LIMITÉES À QUELQUES ESPÈCES (PCR EN TEMPS RÉEL), NÉCESSITANT UN TRAITEMENT LONG (SÉQUENCE, N’EST-CE PAS), NON QUANTITATIVES (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), NE PERMETTENT PAS LA DÉTECTION DANS DES MÉLANGES COMPLEXES TELS QUE LES ALIMENTS (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), ET PRATIQUEMENT TOUTES ONT BESOIN D’UN SEMIS À PLAQUES. C’EST POURQUOI IL EST NÉCESSAIRE DE METTRE EN ŒUVRE DES MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER RAPIDEMENT ET AVEC PRÉCISION LES ESPÈCES CONTAMINÉES DANS LES ALIMENTS AINSI QUE LA QUANTIFICATION DIRECTEMENT DANS UN ÉCHANTILLON ALIMENTAIRE. C’EST LE CAS DE LA MÉTHODOLOGIE PROPOSÉE DANS CE PROJET: LA DÉFINITION DES PEPTIDES DE MARQUAGE BIOLOGIQUE DES ESPÈCES PATHOGÈNES ET BIOGÈNES PRODUCTRICES D’AMINES DANS LES ALIMENTS ET LA MISE EN ŒUVRE ULTÉRIEURE DE L’APPLICATION DE CES PEPTIDES POUR LA DÉTECTION DANS LES ÉCHANTILLONS D’ALIMENTS. La cromatographie LIQUIDE ACOPLATE À SPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM DANS un ÉQUIPEMENT ET COMPARATION D’ÉQUIPEMENT IONIQUE D’Électro-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) et ANALISIS Medient Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION AVEC les sécutions aminoacides déposées dans DATA BASES._x000D_ afin de conduire au dépôt de peptidés biomarqueurs, il est nécessaire de prévoir une gamme complète de LCPEs BACTERIAAN pour prendre en charge les analyses. LES ESPÈCES BACTÉRIENNES INCLUSES DANS L’ÉTUDE COMPRENDRONT CELLES QUI SONT LE PLUS SOUVENT ISOLÉES DANS DES PRODUITS ALIMENTAIRES, COMME DÉCRIT DANS LA LITTÉRATURE, ET COMPRENDRONT LA FAMILLE DES ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIF STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ET C. BOTULINUM TYPES E ET B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ET B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ET YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ET PAENIBACILLUS SPP. NOTRE LABORATOIRE DISPOSE D’UNE VASTE COLLECTION DE SOUCHES BACTÉRIENNES ISOLÉES DE DIVERS ALIMENTS (VIANDE, POISSON, TRAITEMENT MINIMAL ET PRÊT À LA CONSOMMATION, LAIT, ETC.). TOUTES ONT ÉTÉ CARACTÉRISÉES PAR DIFFÉRENTES MÉTHODES, À LA FOIS CLASSIQUES ET GÉNOMIQUES ET PROTÉOMIQUES (MALDI-TOF). Ces SPECIES RELATIVES AVEC VOTRE SPECIFIQUE MALDI-TOF SPECIFIQUE ET LA SÉCURITÉ GÉNOMIQUE DU GEN 16 sont déposées à la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ainsi qu’à la BASE DES DONNÉES GEN (NCBI) (seulement la secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology AND RESULTS elles leur permettront d’élargir le SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), développée dans notre laboratoire et constituant la base de données internationale la plus élevée d’accès. (French) | |||||||||||||||
| Property / summary: L’AUGMENTATION DES MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, AVEC L’ÉMERGENCE SPÉCIALE DE MICROORGANISMES PATHOGÈNES TELS QUE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, A ACCRU LES PRÉOCCUPATIONS AU SUJET DE LA SALUBRITÉ DES ALIMENTS TANT AU SEIN DES AUTORITÉS QUE DANS LE SECTEUR PRODUCTIF ET CHEZ LES CONSOMMATEURS. LES AGENTS PATHOGÈNES ALIMENTAIRES NE PEUVENT PAS ÊTRE COMPLÈTEMENT ÉLIMINÉS À TOUS LES STADES DE LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. EN OUTRE, SELON LE TRAITEMENT SUBI PAR L’ALIMENT, LE MICROBIOTE PRÉSENT PEUT VARIER. IL EXISTE DE NOMBREUX AGENTS PATHOGÈNES QUE L’ENTREPRISE DE TRANSFORMATION PEUT ÊTRE TENUE D’ANALYSER POUR DÉTERMINER L’INNOCUITÉ RELATIVE DE VOTRE PRODUIT. LES MÉTHODES DE DÉTECTION ET D’IDENTIFICATION RAPIDE ACTUELLEMENT MISES EN ŒUVRE ONT L’INCONVÉNIENT D’ÊTRE LIMITÉES À QUELQUES ESPÈCES (PCR EN TEMPS RÉEL), NÉCESSITANT UN TRAITEMENT LONG (SÉQUENCE, N’EST-CE PAS), NON QUANTITATIVES (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), NE PERMETTENT PAS LA DÉTECTION DANS DES MÉLANGES COMPLEXES TELS QUE LES ALIMENTS (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), ET PRATIQUEMENT TOUTES ONT BESOIN D’UN SEMIS À PLAQUES. C’EST POURQUOI IL EST NÉCESSAIRE DE METTRE EN ŒUVRE DES MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER RAPIDEMENT ET AVEC PRÉCISION LES ESPÈCES CONTAMINÉES DANS LES ALIMENTS AINSI QUE LA QUANTIFICATION DIRECTEMENT DANS UN ÉCHANTILLON ALIMENTAIRE. C’EST LE CAS DE LA MÉTHODOLOGIE PROPOSÉE DANS CE PROJET: LA DÉFINITION DES PEPTIDES DE MARQUAGE BIOLOGIQUE DES ESPÈCES PATHOGÈNES ET BIOGÈNES PRODUCTRICES D’AMINES DANS LES ALIMENTS ET LA MISE EN ŒUVRE ULTÉRIEURE DE L’APPLICATION DE CES PEPTIDES POUR LA DÉTECTION DANS LES ÉCHANTILLONS D’ALIMENTS. La cromatographie LIQUIDE ACOPLATE À SPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM DANS un ÉQUIPEMENT ET COMPARATION D’ÉQUIPEMENT IONIQUE D’Électro-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) et ANALISIS Medient Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION AVEC les sécutions aminoacides déposées dans DATA BASES._x000D_ afin de conduire au dépôt de peptidés biomarqueurs, il est nécessaire de prévoir une gamme complète de LCPEs BACTERIAAN pour prendre en charge les analyses. LES ESPÈCES BACTÉRIENNES INCLUSES DANS L’ÉTUDE COMPRENDRONT CELLES QUI SONT LE PLUS SOUVENT ISOLÉES DANS DES PRODUITS ALIMENTAIRES, COMME DÉCRIT DANS LA LITTÉRATURE, ET COMPRENDRONT LA FAMILLE DES ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIF STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ET C. BOTULINUM TYPES E ET B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ET B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ET YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ET PAENIBACILLUS SPP. NOTRE LABORATOIRE DISPOSE D’UNE VASTE COLLECTION DE SOUCHES BACTÉRIENNES ISOLÉES DE DIVERS ALIMENTS (VIANDE, POISSON, TRAITEMENT MINIMAL ET PRÊT À LA CONSOMMATION, LAIT, ETC.). TOUTES ONT ÉTÉ CARACTÉRISÉES PAR DIFFÉRENTES MÉTHODES, À LA FOIS CLASSIQUES ET GÉNOMIQUES ET PROTÉOMIQUES (MALDI-TOF). Ces SPECIES RELATIVES AVEC VOTRE SPECIFIQUE MALDI-TOF SPECIFIQUE ET LA SÉCURITÉ GÉNOMIQUE DU GEN 16 sont déposées à la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ainsi qu’à la BASE DES DONNÉES GEN (NCBI) (seulement la secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology AND RESULTS elles leur permettront d’élargir le SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), développée dans notre laboratoire et constituant la base de données internationale la plus élevée d’accès. (French) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: L’AUGMENTATION DES MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, AVEC L’ÉMERGENCE SPÉCIALE DE MICROORGANISMES PATHOGÈNES TELS QUE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, A ACCRU LES PRÉOCCUPATIONS AU SUJET DE LA SALUBRITÉ DES ALIMENTS TANT AU SEIN DES AUTORITÉS QUE DANS LE SECTEUR PRODUCTIF ET CHEZ LES CONSOMMATEURS. LES AGENTS PATHOGÈNES ALIMENTAIRES NE PEUVENT PAS ÊTRE COMPLÈTEMENT ÉLIMINÉS À TOUS LES STADES DE LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. EN OUTRE, SELON LE TRAITEMENT SUBI PAR L’ALIMENT, LE MICROBIOTE PRÉSENT PEUT VARIER. IL EXISTE DE NOMBREUX AGENTS PATHOGÈNES QUE L’ENTREPRISE DE TRANSFORMATION PEUT ÊTRE TENUE D’ANALYSER POUR DÉTERMINER L’INNOCUITÉ RELATIVE DE VOTRE PRODUIT. LES MÉTHODES DE DÉTECTION ET D’IDENTIFICATION RAPIDE ACTUELLEMENT MISES EN ŒUVRE ONT L’INCONVÉNIENT D’ÊTRE LIMITÉES À QUELQUES ESPÈCES (PCR EN TEMPS RÉEL), NÉCESSITANT UN TRAITEMENT LONG (SÉQUENCE, N’EST-CE PAS), NON QUANTITATIVES (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), NE PERMETTENT PAS LA DÉTECTION DANS DES MÉLANGES COMPLEXES TELS QUE LES ALIMENTS (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), ET PRATIQUEMENT TOUTES ONT BESOIN D’UN SEMIS À PLAQUES. C’EST POURQUOI IL EST NÉCESSAIRE DE METTRE EN ŒUVRE DES MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER RAPIDEMENT ET AVEC PRÉCISION LES ESPÈCES CONTAMINÉES DANS LES ALIMENTS AINSI QUE LA QUANTIFICATION DIRECTEMENT DANS UN ÉCHANTILLON ALIMENTAIRE. C’EST LE CAS DE LA MÉTHODOLOGIE PROPOSÉE DANS CE PROJET: LA DÉFINITION DES PEPTIDES DE MARQUAGE BIOLOGIQUE DES ESPÈCES PATHOGÈNES ET BIOGÈNES PRODUCTRICES D’AMINES DANS LES ALIMENTS ET LA MISE EN ŒUVRE ULTÉRIEURE DE L’APPLICATION DE CES PEPTIDES POUR LA DÉTECTION DANS LES ÉCHANTILLONS D’ALIMENTS. La cromatographie LIQUIDE ACOPLATE À SPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM DANS un ÉQUIPEMENT ET COMPARATION D’ÉQUIPEMENT IONIQUE D’Électro-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) et ANALISIS Medient Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION AVEC les sécutions aminoacides déposées dans DATA BASES._x000D_ afin de conduire au dépôt de peptidés biomarqueurs, il est nécessaire de prévoir une gamme complète de LCPEs BACTERIAAN pour prendre en charge les analyses. LES ESPÈCES BACTÉRIENNES INCLUSES DANS L’ÉTUDE COMPRENDRONT CELLES QUI SONT LE PLUS SOUVENT ISOLÉES DANS DES PRODUITS ALIMENTAIRES, COMME DÉCRIT DANS LA LITTÉRATURE, ET COMPRENDRONT LA FAMILLE DES ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIF STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ET C. BOTULINUM TYPES E ET B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ET B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ET YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ET PAENIBACILLUS SPP. NOTRE LABORATOIRE DISPOSE D’UNE VASTE COLLECTION DE SOUCHES BACTÉRIENNES ISOLÉES DE DIVERS ALIMENTS (VIANDE, POISSON, TRAITEMENT MINIMAL ET PRÊT À LA CONSOMMATION, LAIT, ETC.). TOUTES ONT ÉTÉ CARACTÉRISÉES PAR DIFFÉRENTES MÉTHODES, À LA FOIS CLASSIQUES ET GÉNOMIQUES ET PROTÉOMIQUES (MALDI-TOF). Ces SPECIES RELATIVES AVEC VOTRE SPECIFIQUE MALDI-TOF SPECIFIQUE ET LA SÉCURITÉ GÉNOMIQUE DU GEN 16 sont déposées à la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ainsi qu’à la BASE DES DONNÉES GEN (NCBI) (seulement la secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology AND RESULTS elles leur permettront d’élargir le SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), développée dans notre laboratoire et constituant la base de données internationale la plus élevée d’accès. (French) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 2 December 2021
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Revision as of 16:48, 2 December 2021
Project Q3151710 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
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| English | APPLICATION OF ELECTROSPRAY MASS IONISATION SPECTROMETRY FOR RAPID IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF FOOD PATHOGENS |
Project Q3151710 in Spain |
Statements
106,480.0 Euro
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133,100.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2014
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30 June 2017
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UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
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43°2'46.39"N, 7°28'26.36"W
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27028
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EL INCREMENTO DE LAS ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR LOS ALIMENTOS EN LOS ULTIMOS AÑOS, CON UNA ESPECIAL EMERGENCIA DE MICROORGANISMOS PATOGENOS COMO LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, O ESCHERICHIA COLI, HA AUMENTADO LA PREOCUPACION SOBRE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA TANTO ENTRE LAS AUTORIDADES COMO EN EL SECTOR PRODUCTIVO Y ENTRE LOS CONSUMIDORES. LOS PATOGENOS ALIMENTARIOS NO PUEDEN SER ELIMINADOS COMPLETAMENTE DE TODOS LOS ESTADIOS DE LA CADENA ALIMENTARIA. ADEMAS, SEGUN EL TRATAMIENTO SUFRIDO POR EL ALIMENTO, LA MICROBIOTA PRESENTE PUEDE VARIAR. EXISTEN NUMEROSOS PATOGENOS QUE SE PUEDE REQUERIR A LA EMPRESA PROCESADORA QUE ANALICE PARA DETERMINAR LA RELATIVA SEGURIDAD DE SU PRODUCTO. LOS METODOS DE DETECCION E IDENTIFICACION RAPIDA IMPLEMENTADOS EN LA ACTUALIDAD PRESENTAN LA DESVENTAJA DE ESTAR LIMITADOS A UNAS CUANTAS ESPECIES (PCR EN TIEMPO REAL), NECESITAR UN PROCESADO LARGO (SECUENCIACION,¿), NO SER CUANTITATIVOS (SECUENCIACION, MALDI-TOF), NO PERMITIR LA DETECCION EN MEZCLAS COMPLEJAS COMO LOS ALIMENTOS (SECUENCIACION, MALDI-TOF), Y PRACTICAMENTE TODOS ELLOS NECESITAR PREVIAMENTE LA SIEMBRA EN PLACA. ES POR ELLO QUE SE HACE NECESARIA LA IMPLEMENTACION DE METODOLOGIAS QUE PERMITAN LA DETECCION RAPIDA Y PRECISA DE LAS ESPECIES CONTAMINANTES EN EL ALIMENTO ASI COMO LA CUANTIFICACION DIRECTAMENTE EN UNA MUESTRA DE ALIMENTO. ESTE ES EL CASO DE LA METODOLOGIA QUE SE PROPONE EN EL PRESENTE PROYECTO: LA DEFINICION DE PEPTIDOS BIOMARCADORES DE ESPECIES PATOGENAS Y PRODUCTORAS DE AMINAS BIOGENAS EN ALIMENTOS Y LA POSTERIOR IMPLEMENTACION DE LA APLICACION DE DICHOS PEPTIDOS PARA LA DETECCION EN MUESTRAS ALIMENTARIAS. PARA ELLO SE UTILIZARA LA CROMATOGRAFIA LIQUIDA CAPILAR ACOPLADA A ESPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM EN UN EQUIPO ELECTROSPRAY-TRAMPA IONICA (LC-ESI-IT-MS/MS) Y POSTERIOR ANALISIS MEDIANTE DIFERENTES SOFTWARE Y COMPARACION CON LAS SECUENCIAS AMINOACIDICAS DEPOSITADAS EN BASES DE DATOS._x000D_ PARA LLEVAR A CABO LA DEFINICION DE PEPTIDOS BIOMARCADORES ES NECESARIO DISPONER DE UN AMPLIO NUMERO DE CEPAS BACTERIANAS PARA LLEVAR A CABO EL ANALISIS. LAS ESPECIES BACTERIANAS QUE SE INCLUIRAN EN EL ESTUDIO COMPRENDERAN AQUELLAS QUE SE AISLAN MAS FRECUENTEMENTE EN PRODUCTOS ALIMENTARIOS, SEGUN LO DESCRITO EN LA LITERATURA, E INCLUYEN LA FAMILIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, ESTAFILOCOCOS COAGULASA-POSITIVOS; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, Y C. BOTULINUM TIPOS E Y B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS Y B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES Y YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP Y PAENIBACILLUS SPP. NUESTRO LABORATORIO DISPONE DE UNA AMPLIA COLECCION DE CEPAS BACTERIANAS AISLADAS DE DIVERSOS ALIMENTOS (CARNICOS, PESCADO, MINIMAMENTE PROCESADO Y LISTOS PARA EL CONSUMO, LACTEOS,¿). TODAS ELLAS HAN SIDO CARACTERIZADAS MEDIANTE DIFERENTES METODOLOGIAS TANTO CLASICAS COMO GENOMICAS Y PROTEOMICAS (MALDI-TOF). DICHA RELACION DE ESPECIES CON SUS CORRESPONDIENTES ESPECTROS DE MALDI-TOF Y SECUENCIA GENOMICA DEL GEN 16S RRNA ESTAN DEPOSITADAS EN LA BASE DE DATOS SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG) ASI COMO EN LA BASE DE DATOS DEL GENBANK (NCBI) (SOLO LA SECUENCIA DEL GEN 16S RRNA)._x000D_ LA METODOLOGIA Y RESULTADOS OBTENIDOS PERMITIRAN ASIMISMO AMPLIAR LA BASE DE DATOS SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG), DESARROLLADA EN NUESTRO LABORATORIO Y QUE CONSTITUIRA LA MAYOR BASE DE DATOS INTERNACIONAL DE ACCESO (Spanish)
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THE INCREASE IN FOOD-BORNE DISEASES OVER THE LAST FEW YEARS, WITH A SPECIAL EMERGENCE OF PATHOGENIC MICROORGANISMS SUCH AS LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, OR ESCHERICHIA COLI, HAS INCREASED CONCERNS ABOUT FOOD SAFETY BOTH AMONG AUTHORITIES AND IN THE PRODUCTIVE SECTOR AND AMONG CONSUMERS. FOOD PATHOGENS CANNOT BE COMPLETELY ELIMINATED FROM ALL STAGES OF THE FOOD CHAIN. IN ADDITION, ACCORDING TO THE TREATMENT SUFFERED BY THE FOOD, THE MICROBIOTA PRESENT MAY VARY. THERE ARE NUMEROUS PATHOGENS THAT THE PROCESSING COMPANY MAY BE REQUIRED TO ANALYSE TO DETERMINE THE RELATIVE SAFETY OF YOUR PRODUCT. THE DETECTION AND RAPID IDENTIFICATION METHODS CURRENTLY IMPLEMENTED PRESENTLY HAVE THE DISADVANTAGE OF BEING LIMITED TO A FEW SPECIES (REAL-TIME PCR), NEEDING LONG PROCESSING (SEQUENCE, DO), NOT BE QUANTITATIVE (SEQUENCING, MALDI-TOF), DO NOT ALLOW DETECTION IN COMPLEX MIXTURES SUCH AS FOOD (SEQUENCING, MALDI-TOF), AND PRACTICALLY ALL OF THEM NEED PREVIOUSLY PLATE SOWING. THAT IS WHY IT IS NECESSARY TO IMPLEMENT METHODS THAT ALLOW THE RAPID AND ACCURATE DETECTION OF CONTAMINATING SPECIES IN THE FOOD AS WELL AS THE QUANTIFICATION DIRECTLY IN A FOOD SAMPLE. THIS IS THE CASE WITH THE METHODOLOGY PROPOSED IN THIS PROJECT: THE DEFINITION OF BIOMARKING PEPTIDES OF PATHOGENOUS AND BIOGENOUS AMINE-PRODUCING SPECIES IN FOOD AND THE SUBSEQUENT IMPLEMENTATION OF THE APPLICATION OF THESE PEPTIDES FOR DETECTION IN FOOD SAMPLES. The LIQUID CROMATOGRAPHY ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM IN an electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) and POSTERIOR ANALISIS MEDIENT DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION WITH AMINOACIDIC SECUTIONS deposited in DATA BASES._x000D_ in order to lead to the deposition of bio-marker PEPTIDs, it is necessary to provide for a full range of BACTERIAAN CEPAS to take over the Analyses. THE BACTERIAL SPECIES INCLUDED IN THE STUDY WILL INCLUDE THOSE THAT ARE MOST FREQUENTLY ISOLATED IN FOOD PRODUCTS, AS DESCRIBED IN THE LITERATURE, AND INCLUDE THE FAMILY ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIVE STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, AND C. BOTULINUM TYPES E AND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS AND B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES AND YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP AND PAENIBACILLUS SPP. OUR LABORATORY HAS A WIDE COLLECTION OF BACTERIAL STRAINS ISOLATED FROM VARIOUS FOODS (MEAT, FISH, MINIMALLY PROCESSED AND READY FOR CONSUMPTION, MILK, ETC.). ALL OF THEM HAVE BEEN CHARACTERISED BY DIFFERENT METHODS, BOTH CLASSICAL AND GENOMIC AND PROTEOMIC (MALDI-TOF). Such RELATED SPECIES WITH YOUR SPECIFIC MALDI-TOF SPECTIVES AND GENOMIC SECUCE OF GEN 16 are deposited at the SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) as well as in the GENBANK DATA BASE (NCBI) (only the SECUENCE OF GEN 16S rRNA)._x000D_ METODOLOGY AND RESULTS they will allow them to expand the SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), developed in our laboratorium and constituting the highest international data base of access (English)
12 October 2021
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L’AUGMENTATION DES MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, AVEC L’ÉMERGENCE SPÉCIALE DE MICROORGANISMES PATHOGÈNES TELS QUE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, A ACCRU LES PRÉOCCUPATIONS AU SUJET DE LA SALUBRITÉ DES ALIMENTS TANT AU SEIN DES AUTORITÉS QUE DANS LE SECTEUR PRODUCTIF ET CHEZ LES CONSOMMATEURS. LES AGENTS PATHOGÈNES ALIMENTAIRES NE PEUVENT PAS ÊTRE COMPLÈTEMENT ÉLIMINÉS À TOUS LES STADES DE LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. EN OUTRE, SELON LE TRAITEMENT SUBI PAR L’ALIMENT, LE MICROBIOTE PRÉSENT PEUT VARIER. IL EXISTE DE NOMBREUX AGENTS PATHOGÈNES QUE L’ENTREPRISE DE TRANSFORMATION PEUT ÊTRE TENUE D’ANALYSER POUR DÉTERMINER L’INNOCUITÉ RELATIVE DE VOTRE PRODUIT. LES MÉTHODES DE DÉTECTION ET D’IDENTIFICATION RAPIDE ACTUELLEMENT MISES EN ŒUVRE ONT L’INCONVÉNIENT D’ÊTRE LIMITÉES À QUELQUES ESPÈCES (PCR EN TEMPS RÉEL), NÉCESSITANT UN TRAITEMENT LONG (SÉQUENCE, N’EST-CE PAS), NON QUANTITATIVES (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), NE PERMETTENT PAS LA DÉTECTION DANS DES MÉLANGES COMPLEXES TELS QUE LES ALIMENTS (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), ET PRATIQUEMENT TOUTES ONT BESOIN D’UN SEMIS À PLAQUES. C’EST POURQUOI IL EST NÉCESSAIRE DE METTRE EN ŒUVRE DES MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER RAPIDEMENT ET AVEC PRÉCISION LES ESPÈCES CONTAMINÉES DANS LES ALIMENTS AINSI QUE LA QUANTIFICATION DIRECTEMENT DANS UN ÉCHANTILLON ALIMENTAIRE. C’EST LE CAS DE LA MÉTHODOLOGIE PROPOSÉE DANS CE PROJET: LA DÉFINITION DES PEPTIDES DE MARQUAGE BIOLOGIQUE DES ESPÈCES PATHOGÈNES ET BIOGÈNES PRODUCTRICES D’AMINES DANS LES ALIMENTS ET LA MISE EN ŒUVRE ULTÉRIEURE DE L’APPLICATION DE CES PEPTIDES POUR LA DÉTECTION DANS LES ÉCHANTILLONS D’ALIMENTS. La cromatographie LIQUIDE ACOPLATE À SPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM DANS un ÉQUIPEMENT ET COMPARATION D’ÉQUIPEMENT IONIQUE D’Électro-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) et ANALISIS Medient Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION AVEC les sécutions aminoacides déposées dans DATA BASES._x000D_ afin de conduire au dépôt de peptidés biomarqueurs, il est nécessaire de prévoir une gamme complète de LCPEs BACTERIAAN pour prendre en charge les analyses. LES ESPÈCES BACTÉRIENNES INCLUSES DANS L’ÉTUDE COMPRENDRONT CELLES QUI SONT LE PLUS SOUVENT ISOLÉES DANS DES PRODUITS ALIMENTAIRES, COMME DÉCRIT DANS LA LITTÉRATURE, ET COMPRENDRONT LA FAMILLE DES ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIF STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ET C. BOTULINUM TYPES E ET B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ET B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ET YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ET PAENIBACILLUS SPP. NOTRE LABORATOIRE DISPOSE D’UNE VASTE COLLECTION DE SOUCHES BACTÉRIENNES ISOLÉES DE DIVERS ALIMENTS (VIANDE, POISSON, TRAITEMENT MINIMAL ET PRÊT À LA CONSOMMATION, LAIT, ETC.). TOUTES ONT ÉTÉ CARACTÉRISÉES PAR DIFFÉRENTES MÉTHODES, À LA FOIS CLASSIQUES ET GÉNOMIQUES ET PROTÉOMIQUES (MALDI-TOF). Ces SPECIES RELATIVES AVEC VOTRE SPECIFIQUE MALDI-TOF SPECIFIQUE ET LA SÉCURITÉ GÉNOMIQUE DU GEN 16 sont déposées à la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ainsi qu’à la BASE DES DONNÉES GEN (NCBI) (seulement la secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology AND RESULTS elles leur permettront d’élargir le SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), développée dans notre laboratoire et constituant la base de données internationale la plus élevée d’accès. (French)
2 December 2021
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Lugo
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Identifiers
AGL2013-48244-R
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