Differential genetic expression analysis in organisms exposed to different types of environmental stress. (Q3177933): Difference between revisions
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Analisi differenziale dell'espressione genetica in organismi esposti a diversi tipi di stress ambientale. | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Una scansione microarrays è richiesta per l'analisi dell'espressione genica differenziale (transcriptomics). Questa tecnica permette di rilevare l'espressione differenziale di migliaia di geni o frammenti di DNA simultaneamente in individui soggetti a condizioni diverse (ambientali o sperimentali). L'alterazione dell'espressione genica è un mezzo precoce, rapido e sensibile per rilevare la risposta allo stress. Analizzando contemporaneamente migliaia di geni coinvolti in diverse reti o vie metaboliche dell'organismo colpito, sarà possibile identificare modalità di azione (MOAS) specifiche per i diversi contaminanti. La successiva integrazione dei dati sui livelli di concentrazione, bioaccumulazione e effetti molecolari e ad un livello più elevato di organizzazione attraverso la bioinformatica consentirà l'attribuzione di effetti biologici e lo sviluppo di nuove strategie di valutazione del rischio ambientale (ERA) basate sulla modellizzazione e previsione di tossicità per altri composti di struttura simile non studiati. L'obiettivo è quindi quello di ridurre i conflitti pratici ed etici sulla sperimentazione in vivo in futuro, come proposto in diverse relazioni europee e internazionali (ECETOC, OCSE, US EPA). Inoltre, l'apparecchiatura richiesta può essere utilizzata per qualsiasi studio di espressione genica differenziale, come gli effetti molecolari causati dall'aumento della temperatura, dalla variazione del pH o dall'ossigeno disciolto in relazione al cambiamento globale, tra gli altri. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Una scansione microarrays è richiesta per l'analisi dell'espressione genica differenziale (transcriptomics). Questa tecnica permette di rilevare l'espressione differenziale di migliaia di geni o frammenti di DNA simultaneamente in individui soggetti a condizioni diverse (ambientali o sperimentali). L'alterazione dell'espressione genica è un mezzo precoce, rapido e sensibile per rilevare la risposta allo stress. Analizzando contemporaneamente migliaia di geni coinvolti in diverse reti o vie metaboliche dell'organismo colpito, sarà possibile identificare modalità di azione (MOAS) specifiche per i diversi contaminanti. La successiva integrazione dei dati sui livelli di concentrazione, bioaccumulazione e effetti molecolari e ad un livello più elevato di organizzazione attraverso la bioinformatica consentirà l'attribuzione di effetti biologici e lo sviluppo di nuove strategie di valutazione del rischio ambientale (ERA) basate sulla modellizzazione e previsione di tossicità per altri composti di struttura simile non studiati. L'obiettivo è quindi quello di ridurre i conflitti pratici ed etici sulla sperimentazione in vivo in futuro, come proposto in diverse relazioni europee e internazionali (ECETOC, OCSE, US EPA). Inoltre, l'apparecchiatura richiesta può essere utilizzata per qualsiasi studio di espressione genica differenziale, come gli effetti molecolari causati dall'aumento della temperatura, dalla variazione del pH o dall'ossigeno disciolto in relazione al cambiamento globale, tra gli altri. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: Una scansione microarrays è richiesta per l'analisi dell'espressione genica differenziale (transcriptomics). Questa tecnica permette di rilevare l'espressione differenziale di migliaia di geni o frammenti di DNA simultaneamente in individui soggetti a condizioni diverse (ambientali o sperimentali). L'alterazione dell'espressione genica è un mezzo precoce, rapido e sensibile per rilevare la risposta allo stress. Analizzando contemporaneamente migliaia di geni coinvolti in diverse reti o vie metaboliche dell'organismo colpito, sarà possibile identificare modalità di azione (MOAS) specifiche per i diversi contaminanti. La successiva integrazione dei dati sui livelli di concentrazione, bioaccumulazione e effetti molecolari e ad un livello più elevato di organizzazione attraverso la bioinformatica consentirà l'attribuzione di effetti biologici e lo sviluppo di nuove strategie di valutazione del rischio ambientale (ERA) basate sulla modellizzazione e previsione di tossicità per altri composti di struttura simile non studiati. L'obiettivo è quindi quello di ridurre i conflitti pratici ed etici sulla sperimentazione in vivo in futuro, come proposto in diverse relazioni europee e internazionali (ECETOC, OCSE, US EPA). Inoltre, l'apparecchiatura richiesta può essere utilizzata per qualsiasi studio di espressione genica differenziale, come gli effetti molecolari causati dall'aumento della temperatura, dalla variazione del pH o dall'ossigeno disciolto in relazione al cambiamento globale, tra gli altri. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 14:41, 16 January 2022
Project Q3177933 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Differential genetic expression analysis in organisms exposed to different types of environmental stress. |
Project Q3177933 in Spain |
Statements
107,258.4 Euro
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134,073.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2016
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30 June 2018
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UNIVERSIDAD DE CADIZ
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36°31'43.28"N, 6°11'24.79"W
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11028
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Se solicita un escaner de microarrays para el análisis de expresión génica diferencial (transcriptómica). Esta técnica permite detectar la expresión diferencial de miles de genes o fragmentos de ADN simultáneamente en individuos sometidos a distintas condiciones (ambientales o experimentales). La alteración de la expresión génica es un medio temprano, rápido y sensible para la detección de la respuesta al estrés. Al analizar simultáneamente miles de genes involucrados en diferentes redes o rutas metabólicas del organismo afectado, será posible identificar modos de acción (MoAs) específicos de los diferentes contaminantes. La posterior integración de datos de niveles de concentración, bioacumulación y efectos moleculares y a mayor nivel de organización mediante métodos bioinformáticos permitirá atribuir efectos biológicos y el desarrollo de nuevas estrategias de evaluación del riesgo ambiental (ERAs) basadas en la modelización y predicción de toxicidades para otros compuestos de estructura similar no estudiados. Así, se pretende reducir en un futuro conflictos prácticos y éticos acerca de la experimentación in vivo, tal como se propone en diferentes informes europeos e internacionales (ECETOC, OECD, US EPA). Además, el equipo solicitado se puede emplear para cualquier estudio de expresión génica diferencial, como p. ej. los efectos moleculares producidos por el aumento de temperatura, variación de pH o oxígeno disuelto relacionados con el cambio global, entre otros. (Spanish)
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A microarrays scan is requested for differential gene expression analysis (transcriptomics). This technique allows detecting the differential expression of thousands of genes or DNA fragments simultaneously in individuals subject to different conditions (environmental or experimental). Alteration of gene expression is an early, rapid and sensitive means of detecting the response to stress. By simultaneously analysing thousands of genes involved in different networks or metabolic pathways of the affected organism, it will be possible to identify modes of action (MOAS) specific to the different contaminants. The subsequent integration of data on concentration levels, bioaccumulation and molecular effects and at a higher level of organisation through bioinformatics will allow the attribution of biological effects and the development of new environmental risk assessment (ERAs) strategies based on the modelling and prediction of toxicities for other compounds of similar structure not studied. Thus, the aim is to reduce practical and ethical conflicts about in vivo experimentation in the future, as proposed in different European and international reports (ECETOC, OECD, US EPA). In addition, the requested equipment can be used for any differential gene expression study, such as molecular effects caused by temperature increase, pH variation or dissolved oxygen related to global change, among others. (English)
12 October 2021
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Une analyse par microréseaux est demandée pour l’analyse différentielle de l’expression génique (transcriptomics). Cette technique permet de détecter l’expression différentielle de milliers de gènes ou de fragments d’ADN simultanément chez des individus soumis à des conditions différentes (environnementale ou expérimentale). L’altération de l’expression génique est un moyen précoce, rapide et sensible de détecter la réponse au stress. En analysant simultanément des milliers de gènes impliqués dans différents réseaux ou voies métaboliques de l’organisme touché, il sera possible d’identifier des modes d’action (MOAS) propres aux différents contaminants. L’intégration ultérieure des données sur les concentrations, la bioaccumulation et les effets moléculaires et à un niveau plus élevé d’organisation grâce à la bioinformatique permettra d’attribuer les effets biologiques et d’élaborer de nouvelles stratégies d’évaluation des risques environnementaux (EER) fondées sur la modélisation et la prévision des toxicités pour d’autres composés de structure similaire non étudiés. Ainsi, l’objectif est de réduire les conflits pratiques et éthiques concernant l’expérimentation in vivo à l’avenir, comme le proposent différents rapports européens et internationaux (ECETOC, OCDE, US EPA). En outre, l’équipement demandé peut être utilisé pour toute étude d’expression génique différentielle, comme les effets moléculaires causés par l’augmentation de la température, la variation du pH ou l’oxygène dissous liés, entre autres, au changement global. (French)
4 December 2021
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Für die Analyse der Differentialgenexpression (Transcriptomics) wird ein Mikroarrays-Scan beantragt. Diese Technik ermöglicht es, die Differentialexpression von Tausenden von Genen oder DNA-Fragmenten gleichzeitig bei Individuen unter unterschiedlichen Bedingungen (Umwelt oder Experimental) zu erkennen. Die Veränderung der Genexpression ist ein frühes, schnelles und empfindliches Mittel, um die Reaktion auf Stress zu erkennen. Durch die gleichzeitige Analyse von Tausenden von Genen, die an verschiedenen Netzwerken oder Stoffwechselwegen des betroffenen Organismus beteiligt sind, wird es möglich sein, spezifische Wirkungsmodi (MOAS) für die verschiedenen Schadstoffe zu identifizieren. Die anschließende Integration von Daten über Konzentrationsniveaus, Bioakkumulation und molekulare Wirkungen und auf einer höheren Organisationsebene durch Bioinformatik wird die Zuordnung biologischer Wirkungen und die Entwicklung neuer Strategien für die Umweltverträglichkeitsprüfung (ERAs) ermöglichen, die auf der Modellierung und Vorhersage von Toxizitäten für andere nicht untersuchte Verbindungen ähnlicher Struktur beruhen. Ziel ist es daher, in Zukunft praktische und ethische Konflikte über In-vivo-Experimente zu verringern, wie sie in verschiedenen europäischen und internationalen Berichten (ECETOC, OECD, US-WPA) vorgeschlagen werden. Darüber hinaus können die angeforderten Geräte für jede Differentialgenexpressionsstudie verwendet werden, wie z. B. molekulare Effekte, die durch Temperaturanstieg, pH-Variation oder gelösten Sauerstoff im Zusammenhang mit globalen Veränderungen verursacht werden. (German)
9 December 2021
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Een microarraysscan wordt gevraagd voor differentiële genexpressieanalyse (transcriptomics). Deze techniek maakt het mogelijk om de differentiële expressie van duizenden genen of DNA-fragmenten tegelijkertijd te detecteren in individuen die aan verschillende (milieu- of experimentele) voorwaarden zijn onderworpen. Verandering van genuitdrukking is een vroeg, snel en gevoelig middel om de reactie op stress te detecteren. Door tegelijkertijd duizenden genen te analyseren die betrokken zijn bij verschillende netwerken of metabolische routes van het aangetaste organisme, zal het mogelijk zijn om werkingswijzen (MOAS) te identificeren die specifiek zijn voor de verschillende verontreinigende stoffen. De daaropvolgende integratie van gegevens over concentratieniveaus, bioaccumulatie en moleculaire effecten en op een hoger niveau van organisatie door middel van bio-informatica zal het mogelijk maken biologische effecten toe te wijzen en nieuwe strategieën voor milieurisicobeoordeling (EOR’s) te ontwikkelen op basis van de modellering en voorspelling van toxiciteiten voor andere verbindingen van vergelijkbare structuur die niet zijn onderzocht. Het doel is dus praktische en ethische conflicten over in vivo experimenten in de toekomst te verminderen, zoals voorgesteld in verschillende Europese en internationale verslagen (ECETOC, OESO, US EPA). Bovendien kan de gevraagde apparatuur worden gebruikt voor een differentiële genexpressiestudie, zoals moleculaire effecten veroorzaakt door temperatuurstijging, pH-variatie of opgeloste zuurstof in verband met onder andere globale veranderingen. (Dutch)
17 December 2021
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Una scansione microarrays è richiesta per l'analisi dell'espressione genica differenziale (transcriptomics). Questa tecnica permette di rilevare l'espressione differenziale di migliaia di geni o frammenti di DNA simultaneamente in individui soggetti a condizioni diverse (ambientali o sperimentali). L'alterazione dell'espressione genica è un mezzo precoce, rapido e sensibile per rilevare la risposta allo stress. Analizzando contemporaneamente migliaia di geni coinvolti in diverse reti o vie metaboliche dell'organismo colpito, sarà possibile identificare modalità di azione (MOAS) specifiche per i diversi contaminanti. La successiva integrazione dei dati sui livelli di concentrazione, bioaccumulazione e effetti molecolari e ad un livello più elevato di organizzazione attraverso la bioinformatica consentirà l'attribuzione di effetti biologici e lo sviluppo di nuove strategie di valutazione del rischio ambientale (ERA) basate sulla modellizzazione e previsione di tossicità per altri composti di struttura simile non studiati. L'obiettivo è quindi quello di ridurre i conflitti pratici ed etici sulla sperimentazione in vivo in futuro, come proposto in diverse relazioni europee e internazionali (ECETOC, OCSE, US EPA). Inoltre, l'apparecchiatura richiesta può essere utilizzata per qualsiasi studio di espressione genica differenziale, come gli effetti molecolari causati dall'aumento della temperatura, dalla variazione del pH o dall'ossigeno disciolto in relazione al cambiamento globale, tra gli altri. (Italian)
16 January 2022
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Puerto Real
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Identifiers
UNCA15-CE-3375
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