ECOLOGY OF MARINE MICROORGANISMS: BIODIVERSITY, GENOMIC AND METAGENOMIC (Q3165618): Difference between revisions
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ECOLOGIA DEI MICRORGANISMI MARINI: BIODIVERSITÀ, GENOMICA E METAGENOMICA | |||||||||||||||
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GLI OCEANI COSTITUISCONO IL PIÙ GRANDE ECOSISTEMA DELLA TERRA E UNO DEI PIÙ SCONOSCIUTI. LE ATTIVITÀ DEI MICRORGANISMI MARINI REGOLANO I CICLI BIOGEOCHIMICI E INFLUENZANO NOTEVOLMENTE IL CONTROLLO CLIMATICO. INOLTRE, QUASI LA METÀ DELLA POPOLAZIONE UMANA VIVE VICINO AL MARE E, PERTANTO, L'UMANITÀ HA UN FORTE IMPATTO SUGLI OCEANI E, AL CONTRARIO, DIPENDE FORTEMENTE DAI LORO SERVIZI. PER QUESTI MOTIVI, LA RICERCA MARINA È STATA CONSIDERATA UNA DELLE SFIDE SOCIALI DEL PROGRAMMA ORIZZONTE 2020. NEL PRESENTE PROGETTO ABBIAMO IN PROGRAMMA DI STUDIARE ALCUNI ASPETTI DELLA DIVERSITÀ, DELLA STRUTTURA E DELLE CAPACITÀ FUNZIONALI DELLE COMUNITÀ BATTERICHE MARINE. Il nostro PUNTO DI PARTI è che la disponibilità di una quantità Enormous di secuzioni OCEAN apre una VENTANA DI OPPORTUNITÀ per risolvere questioni che non potevano essere prese in considerazione prima dell'avvento del genoma e di METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TRE PROGETTO CON INTERESSI COMUNITARI con approcci diversi. IL PRIMO SOTTOPROGETTO SI CONCENTRERÀ SULLA DIVERSITÀ DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. A TAL FINE, LE SEQUENZE DI ETICHETTE (TAGS) DEL GENE RDNA 16S SARANNO UTILIZZATE PER ESPLORARE LA BIOSFERA DEI MICRORGANISMI RARI: L'INSIEME DI UN NUMERO MOLTO ELEVATO DI SPECIE CON ABBONDANZE STRAORDINARIAMENTE BASSE. CERCHEREMO DI DETERMINARE IL NUMERO TOTALE DI TAXA BATTERICI NEGLI OCEANI E SVILUPPEREMO UN METODO PER ANALIZZARE LE CURVE GAMMA-ABBONDANZA CHE SPERIAMO RIVELERANNO PROPRIETÀ ECOLOGICHE DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. IL SECONDO SOTTOPROGETTO ANALIZZERÀ LE COMUNITÀ UTILIZZANDO METAGENOMICA E METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DI QUESTO SP2 SI SOVRAPPONE CON L'SP1 PER CONFRONTARE LA DIVERSITÀ RIVELATA DALLE SEQUENZE ETICHETTATE CON LA DERIVATA DEI METAGENOMI. UNA COMPONENTE IMPORTANTE DI QUESTO SP2 SARÀ IL CONFRONTO DELLE COMUNITÀ IN BASE ALLA FILOGENESI E ALLE FUNZIONI CHE ESSA CONTIENE. DALLA COESISTENZA IN DIVERSE COMUNITÀ SI CREERANNO RETI DI ASSOCIAZIONE TRA I TAXA BATTERICI AL FINE, ANCORA UNA VOLTA, DI RICAVARE LE PROPRIETÀ DELLE COMUNITÀ. IL TERZO SOTTOPROGETTO PRESTERÀ ATTENZIONE A UN GRUPPO MODELLO DI BATTERI MARINI, POLARIBACTER, UN GENERE ALL'INTERNO DEL GRANDE GRUPPO DI BATTERI. QUESTO GENERE È RELATIVAMENTE ABBONDANTE NEGLI OCEANI, IN PARTICOLARE NELLE ACQUE POLARI. ALCUNI DEI SUOI MEMBRI CONTENGONO IL GENE PROTEORRODOPSIN, UNA PROTEINA CHE PERMETTE AI BATTERI DI UTILIZZARE L'ENERGIA LEGGERA. SP3 ANALIZZERÀ IL REGOLAMENTO E LA RELAZIONE DI QUESTO GRUPPO DI BATTERI CON LA LUCE. I MEMBRI DEL GENERE SARANNO ISOLATI NELLA CULTURA PURA E I LORO GENOMI SARANNO SEQUENZIATI. I GENOMI AMPLIFICATI SARANNO OTTENUTI ANCHE DA SINGOLE CELLULE (SAGS). QUESTI GENOMI SARANNO UTILIZZATI PER STUDIARE LE CAPACITÀ DI POLARIBACTER E CONFRONTATI CON LE SEQUENZE BATTERIOIDE DERIVATE DA METAGENOMAS IN SP2. INFINE, SARANNO EFFETTUATI ESPERIMENTI PER DETERMINARE L'ESPRESSIONE GENETICA DI QUESTI BATTERI IN DIVERSE CONDIZIONI DI LUCE SCURA E I RISULTATI SARANNO CONFRONTATI CON QUELLI OTTENUTI DA METATRANSCRIPTOMS NELLA SP2. L'OBIETTIVO DI QUESTO SP3 È COMPRENDORE COME IL CONTROLLO DI METABOLISM E LA GESTIONE DEL METABOLISM IN PRESENZA DI LUCE IN UN BACTERIA ETEROTROFICA._x000D_ I RISULTATI hanno un significativo IMPATTO SCIENTIFICO NEL CAMBIA DI Oceanografia microbica e speriamo che aprano nuove vie per comprendere l'ecologia degli oceani. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: GLI OCEANI COSTITUISCONO IL PIÙ GRANDE ECOSISTEMA DELLA TERRA E UNO DEI PIÙ SCONOSCIUTI. LE ATTIVITÀ DEI MICRORGANISMI MARINI REGOLANO I CICLI BIOGEOCHIMICI E INFLUENZANO NOTEVOLMENTE IL CONTROLLO CLIMATICO. INOLTRE, QUASI LA METÀ DELLA POPOLAZIONE UMANA VIVE VICINO AL MARE E, PERTANTO, L'UMANITÀ HA UN FORTE IMPATTO SUGLI OCEANI E, AL CONTRARIO, DIPENDE FORTEMENTE DAI LORO SERVIZI. PER QUESTI MOTIVI, LA RICERCA MARINA È STATA CONSIDERATA UNA DELLE SFIDE SOCIALI DEL PROGRAMMA ORIZZONTE 2020. NEL PRESENTE PROGETTO ABBIAMO IN PROGRAMMA DI STUDIARE ALCUNI ASPETTI DELLA DIVERSITÀ, DELLA STRUTTURA E DELLE CAPACITÀ FUNZIONALI DELLE COMUNITÀ BATTERICHE MARINE. Il nostro PUNTO DI PARTI è che la disponibilità di una quantità Enormous di secuzioni OCEAN apre una VENTANA DI OPPORTUNITÀ per risolvere questioni che non potevano essere prese in considerazione prima dell'avvento del genoma e di METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TRE PROGETTO CON INTERESSI COMUNITARI con approcci diversi. IL PRIMO SOTTOPROGETTO SI CONCENTRERÀ SULLA DIVERSITÀ DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. A TAL FINE, LE SEQUENZE DI ETICHETTE (TAGS) DEL GENE RDNA 16S SARANNO UTILIZZATE PER ESPLORARE LA BIOSFERA DEI MICRORGANISMI RARI: L'INSIEME DI UN NUMERO MOLTO ELEVATO DI SPECIE CON ABBONDANZE STRAORDINARIAMENTE BASSE. CERCHEREMO DI DETERMINARE IL NUMERO TOTALE DI TAXA BATTERICI NEGLI OCEANI E SVILUPPEREMO UN METODO PER ANALIZZARE LE CURVE GAMMA-ABBONDANZA CHE SPERIAMO RIVELERANNO PROPRIETÀ ECOLOGICHE DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. IL SECONDO SOTTOPROGETTO ANALIZZERÀ LE COMUNITÀ UTILIZZANDO METAGENOMICA E METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DI QUESTO SP2 SI SOVRAPPONE CON L'SP1 PER CONFRONTARE LA DIVERSITÀ RIVELATA DALLE SEQUENZE ETICHETTATE CON LA DERIVATA DEI METAGENOMI. UNA COMPONENTE IMPORTANTE DI QUESTO SP2 SARÀ IL CONFRONTO DELLE COMUNITÀ IN BASE ALLA FILOGENESI E ALLE FUNZIONI CHE ESSA CONTIENE. DALLA COESISTENZA IN DIVERSE COMUNITÀ SI CREERANNO RETI DI ASSOCIAZIONE TRA I TAXA BATTERICI AL FINE, ANCORA UNA VOLTA, DI RICAVARE LE PROPRIETÀ DELLE COMUNITÀ. IL TERZO SOTTOPROGETTO PRESTERÀ ATTENZIONE A UN GRUPPO MODELLO DI BATTERI MARINI, POLARIBACTER, UN GENERE ALL'INTERNO DEL GRANDE GRUPPO DI BATTERI. QUESTO GENERE È RELATIVAMENTE ABBONDANTE NEGLI OCEANI, IN PARTICOLARE NELLE ACQUE POLARI. ALCUNI DEI SUOI MEMBRI CONTENGONO IL GENE PROTEORRODOPSIN, UNA PROTEINA CHE PERMETTE AI BATTERI DI UTILIZZARE L'ENERGIA LEGGERA. SP3 ANALIZZERÀ IL REGOLAMENTO E LA RELAZIONE DI QUESTO GRUPPO DI BATTERI CON LA LUCE. I MEMBRI DEL GENERE SARANNO ISOLATI NELLA CULTURA PURA E I LORO GENOMI SARANNO SEQUENZIATI. I GENOMI AMPLIFICATI SARANNO OTTENUTI ANCHE DA SINGOLE CELLULE (SAGS). QUESTI GENOMI SARANNO UTILIZZATI PER STUDIARE LE CAPACITÀ DI POLARIBACTER E CONFRONTATI CON LE SEQUENZE BATTERIOIDE DERIVATE DA METAGENOMAS IN SP2. INFINE, SARANNO EFFETTUATI ESPERIMENTI PER DETERMINARE L'ESPRESSIONE GENETICA DI QUESTI BATTERI IN DIVERSE CONDIZIONI DI LUCE SCURA E I RISULTATI SARANNO CONFRONTATI CON QUELLI OTTENUTI DA METATRANSCRIPTOMS NELLA SP2. L'OBIETTIVO DI QUESTO SP3 È COMPRENDORE COME IL CONTROLLO DI METABOLISM E LA GESTIONE DEL METABOLISM IN PRESENZA DI LUCE IN UN BACTERIA ETEROTROFICA._x000D_ I RISULTATI hanno un significativo IMPATTO SCIENTIFICO NEL CAMBIA DI Oceanografia microbica e speriamo che aprano nuove vie per comprendere l'ecologia degli oceani. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: GLI OCEANI COSTITUISCONO IL PIÙ GRANDE ECOSISTEMA DELLA TERRA E UNO DEI PIÙ SCONOSCIUTI. LE ATTIVITÀ DEI MICRORGANISMI MARINI REGOLANO I CICLI BIOGEOCHIMICI E INFLUENZANO NOTEVOLMENTE IL CONTROLLO CLIMATICO. INOLTRE, QUASI LA METÀ DELLA POPOLAZIONE UMANA VIVE VICINO AL MARE E, PERTANTO, L'UMANITÀ HA UN FORTE IMPATTO SUGLI OCEANI E, AL CONTRARIO, DIPENDE FORTEMENTE DAI LORO SERVIZI. PER QUESTI MOTIVI, LA RICERCA MARINA È STATA CONSIDERATA UNA DELLE SFIDE SOCIALI DEL PROGRAMMA ORIZZONTE 2020. NEL PRESENTE PROGETTO ABBIAMO IN PROGRAMMA DI STUDIARE ALCUNI ASPETTI DELLA DIVERSITÀ, DELLA STRUTTURA E DELLE CAPACITÀ FUNZIONALI DELLE COMUNITÀ BATTERICHE MARINE. Il nostro PUNTO DI PARTI è che la disponibilità di una quantità Enormous di secuzioni OCEAN apre una VENTANA DI OPPORTUNITÀ per risolvere questioni che non potevano essere prese in considerazione prima dell'avvento del genoma e di METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TRE PROGETTO CON INTERESSI COMUNITARI con approcci diversi. IL PRIMO SOTTOPROGETTO SI CONCENTRERÀ SULLA DIVERSITÀ DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. A TAL FINE, LE SEQUENZE DI ETICHETTE (TAGS) DEL GENE RDNA 16S SARANNO UTILIZZATE PER ESPLORARE LA BIOSFERA DEI MICRORGANISMI RARI: L'INSIEME DI UN NUMERO MOLTO ELEVATO DI SPECIE CON ABBONDANZE STRAORDINARIAMENTE BASSE. CERCHEREMO DI DETERMINARE IL NUMERO TOTALE DI TAXA BATTERICI NEGLI OCEANI E SVILUPPEREMO UN METODO PER ANALIZZARE LE CURVE GAMMA-ABBONDANZA CHE SPERIAMO RIVELERANNO PROPRIETÀ ECOLOGICHE DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. IL SECONDO SOTTOPROGETTO ANALIZZERÀ LE COMUNITÀ UTILIZZANDO METAGENOMICA E METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DI QUESTO SP2 SI SOVRAPPONE CON L'SP1 PER CONFRONTARE LA DIVERSITÀ RIVELATA DALLE SEQUENZE ETICHETTATE CON LA DERIVATA DEI METAGENOMI. UNA COMPONENTE IMPORTANTE DI QUESTO SP2 SARÀ IL CONFRONTO DELLE COMUNITÀ IN BASE ALLA FILOGENESI E ALLE FUNZIONI CHE ESSA CONTIENE. DALLA COESISTENZA IN DIVERSE COMUNITÀ SI CREERANNO RETI DI ASSOCIAZIONE TRA I TAXA BATTERICI AL FINE, ANCORA UNA VOLTA, DI RICAVARE LE PROPRIETÀ DELLE COMUNITÀ. IL TERZO SOTTOPROGETTO PRESTERÀ ATTENZIONE A UN GRUPPO MODELLO DI BATTERI MARINI, POLARIBACTER, UN GENERE ALL'INTERNO DEL GRANDE GRUPPO DI BATTERI. QUESTO GENERE È RELATIVAMENTE ABBONDANTE NEGLI OCEANI, IN PARTICOLARE NELLE ACQUE POLARI. ALCUNI DEI SUOI MEMBRI CONTENGONO IL GENE PROTEORRODOPSIN, UNA PROTEINA CHE PERMETTE AI BATTERI DI UTILIZZARE L'ENERGIA LEGGERA. SP3 ANALIZZERÀ IL REGOLAMENTO E LA RELAZIONE DI QUESTO GRUPPO DI BATTERI CON LA LUCE. I MEMBRI DEL GENERE SARANNO ISOLATI NELLA CULTURA PURA E I LORO GENOMI SARANNO SEQUENZIATI. I GENOMI AMPLIFICATI SARANNO OTTENUTI ANCHE DA SINGOLE CELLULE (SAGS). QUESTI GENOMI SARANNO UTILIZZATI PER STUDIARE LE CAPACITÀ DI POLARIBACTER E CONFRONTATI CON LE SEQUENZE BATTERIOIDE DERIVATE DA METAGENOMAS IN SP2. INFINE, SARANNO EFFETTUATI ESPERIMENTI PER DETERMINARE L'ESPRESSIONE GENETICA DI QUESTI BATTERI IN DIVERSE CONDIZIONI DI LUCE SCURA E I RISULTATI SARANNO CONFRONTATI CON QUELLI OTTENUTI DA METATRANSCRIPTOMS NELLA SP2. L'OBIETTIVO DI QUESTO SP3 È COMPRENDORE COME IL CONTROLLO DI METABOLISM E LA GESTIONE DEL METABOLISM IN PRESENZA DI LUCE IN UN BACTERIA ETEROTROFICA._x000D_ I RISULTATI hanno un significativo IMPATTO SCIENTIFICO NEL CAMBIA DI Oceanografia microbica e speriamo che aprano nuove vie per comprendere l'ecologia degli oceani. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 13:32, 16 January 2022
Project Q3165618 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ECOLOGY OF MARINE MICROORGANISMS: BIODIVERSITY, GENOMIC AND METAGENOMIC |
Project Q3165618 in Spain |
Statements
92,565.0 Euro
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108,900.0 Euro
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85.0 percent
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1 January 2014
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31 December 2017
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UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA
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28°29'8.77"N, 16°18'57.38"W
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38023
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LOS OCEANOS CONSTITUYEN EL ECOSISTEMA MAS GRANDE DE LA TIERRA Y UNO DE LOS MAS DESCONOCIDOS. LAS ACTIVIDADES DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS REGULAN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS Y TIENEN UNA GRAN INFLUENCIA EN EL CONTROL DE CLIMA. ADEMAS, CASI LA MITAD DE LA POBLACION HUMANA VIVE CERCA DEL MAR Y, POR TANTO, LA HUMANIDAD EJERCE UN FUERTE IMPACTO SOBRE LOS OCEANOS Y, AL CONTRARIO, DEPENDE EN GRAN MEDIDA DE SUS SERVICIOS. POR ESTAS RAZONES LA INVESTIGACION MARINA HA SIDO CONSIDERADA UNO DE LOS RETOS SOCIALES EN EL PROGRAMA HORIZONTE 2020. EN EL PROYECTO PRESENTE PLANEAMOS ESTUDIAR ALGUNOS ASPECTOS DE LA DIVERSIDAD, LA ESTRUCTURA Y LAS CAPACIDADES FUNCIONALES DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS MARINAS. NUESTRO PUNTO DE PARTIDA ES QUE LA DISPONIBILIDAD DE UNA CANTIDAD ENORME DE SECUENCIAS DE LOS OCEANOS ABRE UNA VENTANA DE OPORTUNIDAD PARA RESOLVER CUESTIONES QUE NO PODRIA SER ANALIZADAS ANTES DEL ADVENIMIENTO DE LA GENOMICA Y LA METAGENOMICA._x000D_ EL PROYECTO COORDINA TRES SUBPROYECTOS CON INTERESES COMUNES PERO CON APROXIMACIONES DIFERENTES. EL PRIMER SUBPROYECTO SE DEDICARA A LA DIVERSIDAD DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS. PARA ESTE FIN, SE UTILIZARAN SECUENCIAS ETIQUETA (TAGS) DEL GEN 16S RDNA PARA EXPLORAR LA BIOSFERA DE LOS MICROORGANISMOS RAROS: EL CONJUNTO DE UN NUMERO MUY ELEVADO DE ESPECIES CON ABUNDANCIAS EXTRAORDINARIAMENTE BAJAS. INTENTAREMOS DETERMINAR EL NUMERO TOTAL DE TAXONES BACTERIANOS EN LOS OCEANOS Y PONDREMOS A PUNTO UN METODO PARA ANALIZAR LAS CURVAS RANGO-ABUNDANCIA QUE ESPERAMOS REVELARA PROPIEDADES ECOLOGICAS DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS. EL SEGUNDO SUBPROYECTO ANALIZARA LAS COMUNIDADES UTILIZANDO LA METAGENOMICA Y LA METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DE ESTE SP2 SE SOLAPARA CON EL SP1 PARA COMPARAR LA DIVERSIDAD REVELADA POR LAS SECUENCIAS ETIQUETA CON LA DERIVADA DE LOS METAGENOMAS. UN COMPONENTE IMPORTANTE DE ESTE SP2 SERA LA COMPARACION DE COMUNIDADES BASANDOSE EN LA FILOGENIA Y EN LAS FUNCIONES QUE CONTIENE. A PARTIR DE LA COEXISTENCIA EN DISTINTAS COMUNIDADES, SE ESTABLECERAN REDES DE ASOCIACION ENTRE TAXONES BACTERIANOS CON EL FIN, NUEVAMENTE, DE DERIVAR PROPIEDADES DE LAS COMUNIDADES. EL TERCER SUBPROYECTO PRESTARA ATENCION A UN GRUPO MODELO DE BACTERIAS MARINAS, POLARIBACTER, UN GENERO DENTRO DEL GRAN GRUPO DE LOS BACTEROIDETES. ESTE GENERO ES RELATIVAMENTE ABUNDANTE EN LOS OCEANOS, PARTICULARMENTE EN AGUAS POLARES. ALGUNOS DE SUS MIEMBROS CONTIENEN EL GEN DE LA PROTEORRODOPSINA, UNA PROTEINA QUE PERMITE A LAS BACTERIAS UTILIZAR ENERGIA DE LA LUZ. SP3 ANALIZARA LA REGULACION Y LA RELACION DE ESTE GRUPO DE BACTERIAS CON LA LUZ. SE AISLARAN MIEMBROS DEL GENERO EN CULTIVO PURO Y SE SECUENCIARAN SUS GENOMAS. TAMBIEN SE OBTENDRAN GENOMAS AMPLIFICADOS A PARTIR DE CELULAS INDIVIDUALES (SAGS). ESTOS GENOMAS SE UTILIZARAN PARA ESTUDIAR LAS CAPACIDADES DE POLARIBACTER Y SE COMPARARAN CON LAS SECUENCIAS DE BACTEROIDETES DERIVADAS DE METAGENOMAS EN EL SP2. FINALMENTE, SE LLEVARAN A CABO EXPERIMENTOS PARA DETERMINAR LA EXPRESION GENICA DE ESTAS BACTERIAS BAJO DIFERENTES CONDICIONES DE LUZ OSCURIDAD Y LOS RESULTADOS SE COMPARARAN CON LOS OBTENIDOS A PARTIR DE METATRANSCRIPTOMAS EN EL SP2. EL OBJETIVO DE ESTE SP3 ES COMPRENDER COMO FUNCIONA EL CONTROL DEL METABOLISMO Y LA GESTION DEL METABOLISMO EN PRESENCIA DE LA LUZ EN UNA BACTERIA HETEROTROFICA._x000D_ LOS RESULTADOS TENDRAN UN IMPACTO CIENTIFICO SIGNIFICATIVO EN EL CAMPO DE LA OCEANOGRAFIA MICROBIANA Y ESPERAMOS QUE ABRAN NUEVAS VIAS PARA COMPRENDER LA ECOLOGIA DE LOS OCEANOS. (Spanish)
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THE OCEANS CONSTITUTE THE LARGEST ECOSYSTEM ON EARTH AND ONE OF THE MOST UNKNOWN. THE ACTIVITIES OF MARINE MICROORGANISMS REGULATE BIOGEOCHEMICAL CYCLES AND HAVE A MAJOR INFLUENCE ON CLIMATE CONTROL. MOREOVER, ALMOST HALF OF THE HUMAN POPULATION LIVES NEAR THE SEA AND, THEREFORE, HUMANITY HAS A STRONG IMPACT ON THE OCEANS AND, ON THE CONTRARY, DEPENDS HEAVILY ON THEIR SERVICES. FOR THESE REASONS, MARINE RESEARCH HAS BEEN CONSIDERED ONE OF THE SOCIAL CHALLENGES IN THE HORIZON 2020 PROGRAMME. IN THE PRESENT PROJECT WE PLAN TO STUDY SOME ASPECTS OF THE DIVERSITY, STRUCTURE AND FUNCTIONAL CAPABILITIES OF MARINE BACTERIAL COMMUNITIES. Our PARTY POINT is that the Availability of an Enormous Quantity of OCEAN SECUTIONS opens a VENTANA OF OPPORTUNITY to resolve questions that could not be considered before the advent of Genome and METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT WITH COMMUNITY INTERESTS WITH DIFFERENT approaches. THE FIRST SUB-PROJECT WILL FOCUS ON THE DIVERSITY OF BACTERIAL COMMUNITIES. FOR THIS PURPOSE, LABEL SEQUENCES (TAGS) OF THE 16S RDNA GENE WILL BE USED TO EXPLORE THE BIOSPHERE OF RARE MICROORGANISMS: THE SET OF A VERY HIGH NUMBER OF SPECIES WITH EXTRAORDINARILY LOW ABUNDANCES. WE WILL TRY TO DETERMINE THE TOTAL NUMBER OF BACTERIAL TAXA IN THE OCEANS AND WE WILL DEVELOP A METHOD TO ANALYSE THE RANGE-ABUNDANCE CURVES THAT WE HOPE WILL REVEAL ECOLOGICAL PROPERTIES OF BACTERIAL COMMUNITIES. THE SECOND SUB-PROJECT WILL ANALYSE COMMUNITIES USING METAGENOMICA AND METATRANSCRIPTOMICA. A PART OF THIS SP2 OVERLAPS WITH THE SP1 TO COMPARE THE DIVERSITY REVEALED BY THE LABELED SEQUENCES WITH THE DERIVATIVE OF THE METAGENOMES. AN IMPORTANT COMPONENT OF THIS SP2 WILL BE THE COMPARISON OF COMMUNITIES BASED ON THE PHYLOGENY AND THE FUNCTIONS IT CONTAINS. FROM THE COEXISTENCE IN DIFFERENT COMMUNITIES, NETWORKS OF ASSOCIATION BETWEEN BACTERIAL TAXA WILL BE ESTABLISHED IN ORDER, AGAIN, TO DERIVE PROPERTIES OF THE COMMUNITIES. THE THIRD SUBPROJECT WILL PAY ATTENTION TO A MODEL GROUP OF MARINE BACTERIA, POLARIBACTER, A GENUS WITHIN THE LARGE GROUP OF BACTEROIDS. THIS GENUS IS RELATIVELY ABUNDANT IN OCEANS, PARTICULARLY IN POLAR WATERS. SOME OF ITS MEMBERS CONTAIN THE PROTEORRODOPSIN GENE, A PROTEIN THAT ALLOWS BACTERIA TO USE LIGHT ENERGY. SP3 WILL ANALYSE THE REGULATION AND RELATIONSHIP OF THIS GROUP OF BACTERIA TO LIGHT. MEMBERS OF THE GENUS WILL BE ISOLATED IN PURE CULTURE AND THEIR GENOMES WILL BE SEQUENCED. AMPLIFIED GENOMES WILL ALSO BE OBTAINED FROM INDIVIDUAL CELLS (SAGS). THESE GENOMES WILL BE USED TO STUDY POLARIBACTER’S CAPABILITIES AND COMPARED TO BACTEROID SEQUENCES DERIVED FROM METAGENOMAS IN SP2. FINALLY, EXPERIMENTS WILL BE CARRIED OUT TO DETERMINE THE GENIC EXPRESSION OF THESE BACTERIA UNDER DIFFERENT DARK LIGHT CONDITIONS AND THE RESULTS WILL BE COMPARED WITH THOSE OBTAINED FROM METATRANSCRIPTOMS IN THE SP2. The OBJECTIVE OF THIS SP3 IS COMPRENDER AS THE CONTROL OF METABOLISM AND THE MANAGEMENT OF METABOLISM IN PRESENCE OF LIGHT IN A HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS have a SIGNIFICATIVE SCIENTIFIC IMPACT IN THE CHANGE OF MICROBIAN Oceanografia and we hope that they open new paths to understand the ecology of the oceans. (English)
12 October 2021
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LES OCÉANS CONSTITUENT LE PLUS GRAND ÉCOSYSTÈME TERRESTRE ET L’UN DES PLUS INCONNUS. LES ACTIVITÉS DES MICRO-ORGANISMES MARINS RÉGULENT LES CYCLES BIOGÉOCHIMIQUES ET ONT UNE INFLUENCE MAJEURE SUR LE CONTRÔLE CLIMATIQUE. EN OUTRE, PRÈS DE LA MOITIÉ DE LA POPULATION HUMAINE VIT PRÈS DE LA MER ET, PAR CONSÉQUENT, L’HUMANITÉ A UN FORT IMPACT SUR LES OCÉANS ET, AU CONTRAIRE, DÉPEND FORTEMENT DE SES SERVICES. POUR CES RAISONS, LA RECHERCHE MARINE A ÉTÉ CONSIDÉRÉE COMME L’UN DES DÉFIS SOCIAUX DU PROGRAMME HORIZON 2020. DANS LE CADRE DU PRÉSENT PROJET, NOUS PRÉVOYONS ÉTUDIER CERTAINS ASPECTS DE LA DIVERSITÉ, DE LA STRUCTURE ET DES CAPACITÉS FONCTIONNELLES DES COMMUNAUTÉS BACTÉRIENNES MARINES. Notre POINT PARTIE est que la disponibilité d’une quantité considérable de sécutions OCEAN ouvre une VENTANIE D’OPPORTUNITÉ pour résoudre des questions qui n’ont pas pu être examinées avant l’avènement de Génome et METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TROIS PROJECT AVEC INTERESTS COMMUNAUTAIRES AVEC des approches DIFFÉRENTES. LE PREMIER SOUS-PROJET SERA AXÉ SUR LA DIVERSITÉ DES COMMUNAUTÉS BACTÉRIENNES. À CETTE FIN, DES SÉQUENCES D’ÉTIQUETTES (TAGS) DU GÈNE DE L’ADNR 16S SERONT UTILISÉES POUR EXPLORER LA BIOSPHÈRE DE MICRO-ORGANISMES RARES: L’ENSEMBLE D’UN TRÈS GRAND NOMBRE D’ESPÈCES AVEC DES ABONDANCES EXTRAORDINAIREMENT FAIBLES. NOUS TENTERONS DE DÉTERMINER LE NOMBRE TOTAL DE TAXONS BACTÉRIENS DANS LES OCÉANS ET NOUS ALLONS METTRE AU POINT UNE MÉTHODE POUR ANALYSER LES COURBES D’ABONDANCE DE L’AIRE DE RÉPARTITION QUI, NOUS L’ESPÉRONS, RÉVÉLERONT LES PROPRIÉTÉS ÉCOLOGIQUES DES COMMUNAUTÉS BACTÉRIENNES. LE DEUXIÈME SOUS-PROJET ANALYSERA LES COMMUNAUTÉS EN UTILISANT METAGENOMICA ET METATRANSCRIPTOMICA. UNE PARTIE DE CETTE SP2 SE CHEVAUCHE AVEC LA SP1 POUR COMPARER LA DIVERSITÉ RÉVÉLÉE PAR LES SÉQUENCES ÉTIQUETÉES AVEC LE DÉRIVÉ DES MÉTAGÉNOMES. UNE COMPOSANTE IMPORTANTE DE CE SP2 SERA LA COMPARAISON DES COMMUNAUTÉS SUR LA BASE DE LA PHYLOGÉNIE ET DES FONCTIONS QU’ELLE CONTIENT. À PARTIR DE LA COEXISTENCE DANS LES DIFFÉRENTES COMMUNAUTÉS, DES RÉSEAUX D’ASSOCIATION ENTRE TAXONS BACTÉRIENS SERONT ÉTABLIS AFIN, ENCORE UNE FOIS, D’OBTENIR DES PROPRIÉTÉS DES COMMUNAUTÉS. LE TROISIÈME SOUS-PROJET PORTERA SUR UN GROUPE MODÈLE DE BACTÉRIES MARINES, POLARIBACTER, UN GENRE AU SEIN DU GRAND GROUPE DE BACTÉRIOÏDES. CE GENRE EST RELATIVEMENT ABONDANT DANS LES OCÉANS, EN PARTICULIER DANS LES EAUX POLAIRES. CERTAINS DE SES MEMBRES CONTIENNENT LE GÈNE PROTEORRODOPSIN, UNE PROTÉINE QUI PERMET AUX BACTÉRIES D’UTILISER L’ÉNERGIE LUMINEUSE. SP3 ANALYSERA LA RÉGLEMENTATION ET LA RELATION DE CE GROUPE DE BACTÉRIES AVEC LA LUMIÈRE. LES MEMBRES DU GENRE SERONT ISOLÉS EN CULTURE PURE ET LEURS GÉNOMES SERONT SÉQUENCÉS. DES GÉNOMES AMPLIFIÉS SERONT ÉGALEMENT OBTENUS À PARTIR DE CELLULES INDIVIDUELLES (SAGS). CES GÉNOMES SERVIRONT À ÉTUDIER LES CAPACITÉS DE POLARIBACTER ET SERONT COMPARÉS AUX SÉQUENCES BACTÉRIOÏDES DÉRIVÉES DE METAGENOMAS DANS SP2. ENFIN, DES EXPÉRIENCES SERONT MENÉES POUR DÉTERMINER L’EXPRESSION GÉNIQUE DE CES BACTÉRIES SOUS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE LUMIÈRE FONCÉE ET LES RÉSULTATS SERONT COMPARÉS À CEUX OBTENUS PAR METATRANSCRIPTOMS DANS LE SP2. L’OBJECTIVE DE CETTE SP3 est COMPRENDER comme le CONTRÔLE DU METABOLISME ET LA GESTION DU METABOLISME EN PRESENCE DE LUMIÈRE DANS UNE BACTERIE HETEROTROFICALE._x000D_ RESULTS ont une IMPACT SCIENTIFIQUE DANS LE CHANGE DE L’Océanografie microbienne et nous espérons qu’ils ouvrent de nouvelles voies pour comprendre l’écologie des océans. (French)
4 December 2021
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DIE OZEANE BILDEN DAS GRÖSSTE ÖKOSYSTEM DER ERDE UND EINES DER UNBEKANNTSTEN. DIE AKTIVITÄTEN VON MEERESMIKROORGANISMEN REGULIEREN BIOGEOCHEMISCHE ZYKLEN UND HABEN EINEN GROSSEN EINFLUSS AUF DIE KLIMAKONTROLLE. DARÜBER HINAUS LEBT FAST DIE HÄLFTE DER MENSCHLICHEN BEVÖLKERUNG IN DER NÄHE DES MEERES UND DAHER HAT DIE MENSCHHEIT EINEN STARKEN EINFLUSS AUF DIE OZEANE UND IST IM GEGENTEIL STARK VON IHREN DIENSTEN ABHÄNGIG. AUS DIESEN GRÜNDEN WURDE DIE MEERESFORSCHUNG ALS EINE DER SOZIALEN HERAUSFORDERUNGEN DES PROGRAMMS HORIZONT 2020 BETRACHTET. IM VORLIEGENDEN PROJEKT WOLLEN WIR EINIGE ASPEKTE DER VIELFALT, STRUKTUR UND FUNKTIONSFÄHIGKEIT VON MARINEN BAKTERIENGEMEINSCHAFTEN UNTERSUCHEN. Unser PARTY POINT ist, dass die Verfügbarkeit einer riesigen Menge von OCEAN-Secutions eine VENTANA OF OPPORTUNITY öffnet, um Fragen zu lösen, die vor dem Aufkommen von Genom und METAGENOMIC nicht berücksichtigt werden konnten._x000D_ COORDINA PROJECT PROJECT MIT GEMEINSCHAFT INTERESTEN MIT DIFFERENTEN Ansätzen. DAS ERSTE TEILPROJEKT KONZENTRIERT SICH AUF DIE VIELFALT BAKTERIELLER GEMEINSCHAFTEN. ZU DIESEM ZWECK WERDEN ETIKETTENSEQUENZEN (TAGS) DES 16S RDNA-GENS VERWENDET, UM DIE BIOSPHÄRE SELTENER MIKROORGANISMEN ZU ERFORSCHEN: DAS SET VON EINER SEHR HOHEN ANZAHL VON ARTEN MIT AUSSERGEWÖHNLICH NIEDRIGEN MENGEN. WIR WERDEN VERSUCHEN, DIE GESAMTZAHL DER BAKTERIELLEN TAXA IN DEN OZEANEN ZU BESTIMMEN, UND WIR WERDEN EINE METHODE ENTWICKELN, UM DIE RANGE-ABUNDANZKURVEN ZU ANALYSIEREN, DIE WIR HOFFEN, ÖKOLOGISCHE EIGENSCHAFTEN BAKTERIELLER GEMEINSCHAFTEN ZU OFFENBAREN. IM ZWEITEN TEILPROJEKT WERDEN GEMEINSCHAFTEN UNTER VERWENDUNG VON METAGENOMICA UND METATRANSCRIPTOMICA ANALYSIERT. EIN TEIL DIESES SP2 ÜBERSCHNEIDET SICH MIT DEM SP1, UM DIE VIELFALT DER MARKIERTEN SEQUENZEN MIT DEM DERIVAT DER METAGENOME ZU VERGLEICHEN. EIN WICHTIGER BESTANDTEIL DIESES SP2 IST DER VERGLEICH DER GEMEINSCHAFTEN AUF DER GRUNDLAGE DER PHYLOGENIE UND DER DARIN ENTHALTENEN FUNKTIONEN. VON DER KOEXISTENZ IN VERSCHIEDENEN GEMEINSCHAFTEN AUS WERDEN NETZWERKE DER ASSOZIATION ZWISCHEN BAKTERIELLEN TAXA GESCHAFFEN, UM WIEDER EIGENSCHAFTEN DER GEMEINSCHAFTEN ABZULEITEN. DAS DRITTE TEILPROJEKT WIRD AUF EINE MODELLGRUPPE VON MEERESBAKTERIEN, POLARIBACTER, EINE GATTUNG INNERHALB DER GROSSEN GRUPPE VON BAKTEROIDEN ACHTEN. DIESE GATTUNG IST RELATIV HÄUFIG IN OZEANEN, VOR ALLEM IN POLAREN GEWÄSSERN. EINIGE SEINER MITGLIEDER ENTHALTEN DAS PROTEORRODOPSIN-GEN, EIN PROTEIN, DAS ES BAKTERIEN ERMÖGLICHT, LICHTENERGIE ZU NUTZEN. SP3 WIRD DIE REGELUNG UND DAS VERHÄLTNIS DIESER BAKTERIENGRUPPE ZUM LICHT ANALYSIEREN. MITGLIEDER DER GATTUNG WERDEN IN DER REINEN KULTUR ISOLIERT UND IHRE GENOME WERDEN SEQUENZIERT. VERSTÄRKTE GENOME WERDEN AUCH VON EINZELNEN ZELLEN (SAGS) GEWONNEN. DIESE GENOME WERDEN VERWENDET, UM DIE FÄHIGKEITEN VON POLARIBACTER ZU UNTERSUCHEN UND MIT BAKTEROIDSEQUENZEN AUS METAGENOMAS IN SP2 ZU VERGLEICHEN. SCHLIESSLICH WERDEN EXPERIMENTE DURCHGEFÜHRT, UM DIE GENEXPRESSION DIESER BAKTERIEN UNTER UNTERSCHIEDLICHEN DUNKLEN LICHTVERHÄLTNISSEN ZU BESTIMMEN UND DIE ERGEBNISSE MIT DEN ERGEBNISSEN VON METATRANSCRIPTOMS IM SP2 ZU VERGLEICHEN. Das OBJECTIVE OF THIS SP3 ist als die KONTROLLE VON METABOLISMITÄS UND DER METABOLISMITÄT IN PRESENCE OF LIGHT in einer HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS haben einen signifikanten SCIENTIFISCHE IMPACT IN THE CHANGE OF microbian Oceanografia und wir hoffen, dass sie neue Wege öffnen, um die Ökologie der Ozeane zu verstehen. (German)
9 December 2021
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DE OCEANEN VORMEN HET GROOTSTE ECOSYSTEEM OP AARDE EN EEN VAN DE MEEST ONBEKENDE. DE ACTIVITEITEN VAN MARIENE MICRO-ORGANISMEN REGELEN BIOGEOCHEMISCHE CYCLI EN HEBBEN EEN GROTE INVLOED OP DE KLIMAATBEHEERSING. BOVENDIEN WOONT BIJNA DE HELFT VAN DE MENSEN IN DE BUURT VAN DE ZEE, WAARDOOR DE MENSHEID EEN GROTE IMPACT HEEFT OP DE OCEANEN EN INTEGENDEEL STERK AFHANKELIJK IS VAN HUN DIENSTEN. OM DEZE REDENEN IS MARIEN ONDERZOEK BESCHOUWD ALS EEN VAN DE SOCIALE UITDAGINGEN IN HET HORIZON 2020-PROGRAMMA. IN DIT PROJECT ZIJN WE VAN PLAN ENKELE ASPECTEN VAN DE DIVERSITEIT, STRUCTUUR EN FUNCTIONELE MOGELIJKHEDEN VAN MARIENE BACTERIËLE GEMEENSCHAPPEN TE BESTUDEREN. Onze PARTY POINT is dat de beschikbaarheid van een Enorme hoeveelheid OCEAN secutions een VENTANA VAN OPPORTUNITEIT opent om vragen op te lossen die niet konden worden overwogen vóór de komst van Genome en METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT MET COMMUNITY INTERESTS MET DIFFERENTe benaderingen. HET EERSTE DEELPROJECT ZAL ZICH RICHTEN OP DE DIVERSITEIT VAN BACTERIËLE GEMEENSCHAPPEN. DAARTOE ZULLEN ETIKETSEQUENTIES (TAGS) VAN HET 16S RDNA-GEN WORDEN GEBRUIKT OM DE BIOSFEER VAN ZELDZAME MICRO-ORGANISMEN TE VERKENNEN: DE SET VAN EEN ZEER GROOT AANTAL SOORTEN MET BUITENGEWOON LAGE OVERVLOED. WE ZULLEN PROBEREN HET TOTALE AANTAL BACTERIËLE TAXA IN DE OCEANEN TE BEPALEN EN WE ZULLEN EEN METHODE ONTWIKKELEN OM DE BEREIKABUNDANTIECURVES TE ANALYSEREN WAARVAN WE HOPEN DAT ZE DE ECOLOGISCHE EIGENSCHAPPEN VAN BACTERIËLE GEMEENSCHAPPEN ZULLEN ONTHULLEN. HET TWEEDE SUBPROJECT ZAL GEMEENSCHAPPEN ANALYSEREN MET BEHULP VAN METAGENOMICA EN METATRANSCRIPTOMICA. EEN DEEL VAN DEZE SP2 OVERLAPT MET DE SP1 OM DE DIVERSITEIT VAN DE GELABELDE SEQUENTIES TE VERGELIJKEN MET DE AFGELEIDE VAN DE METAGENOMEN. EEN BELANGRIJK ONDERDEEL VAN DEZE SP2 IS DE VERGELIJKING VAN GEMEENSCHAPPEN OP BASIS VAN DE FYLOGENIE EN DE FUNCTIES ERVAN. UIT DE COËXISTENTIE IN VERSCHILLENDE GEMEENSCHAPPEN ZULLEN NETWERKEN VAN ASSOCIATIE TUSSEN BACTERIËLE TAXA TOT STAND WORDEN GEBRACHT OM OPNIEUW DE EIGENSCHAPPEN VAN DE GEMEENSCHAPPEN AF TE LEIDEN. HET DERDE SUBPROJECT ZAL AANDACHT BESTEDEN AAN EEN MODELGROEP VAN MARIENE BACTERIËN, POLARIBACTER, EEN GESLACHT BINNEN DE GROTE GROEP VAN BACTEROÏDEN. DIT GESLACHT IS RELATIEF OVERVLOEDIG IN OCEANEN, VOORAL IN POLAIRE WATEREN. SOMMIGE LEDEN BEVATTEN HET PROTEORRODOPSIN GEN, EEN EIWIT WAARMEE BACTERIËN LICHTENERGIE KUNNEN GEBRUIKEN. SP3 ZAL DE VERORDENING EN DE RELATIE VAN DEZE GROEP BACTERIËN MET LICHT ANALYSEREN. LEDEN VAN HET GESLACHT WORDEN GEÏSOLEERD IN PURE CULTUUR EN HUN GENOMEN ZAL WORDEN GERANGSCHIKT. GEAMPLIFICEERDE GENOOM ZAL OOK WORDEN VERKREGEN UIT INDIVIDUELE CELLEN (SAGS). DEZE GENOOM ZAL WORDEN GEBRUIKT OM DE MOGELIJKHEDEN VAN POLARIBACTER TE BESTUDEREN EN TE VERGELIJKEN MET BACTEROÏDE SEQUENTIES AFGELEID VAN METAGENOMAS IN SP2. TEN SLOTTE ZULLEN EXPERIMENTEN WORDEN UITGEVOERD OM DE GENIC EXPRESSIE VAN DEZE BACTERIËN ONDER VERSCHILLENDE DONKERE LICHTOMSTANDIGHEDEN TE BEPALEN EN DE RESULTATEN ZULLEN WORDEN VERGELEKEN MET DIE VERKREGEN UIT METATRANSCRIPTOMS IN DE SP2. De OBJECTIE VAN DEZE SP3 IS COMPRENDER ALS DE CONTROL VAN METABOLISM EN DE MANAGEMENT VAN METABOLISM IN PRESENCE VAN LICHT IN A HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS hebben een significante SCIENTIFIC IMPACT IN DE VERANDERING van microbische Oceanografia en we hopen dat ze nieuwe wegen openen om de ecologie van de oceanen te begrijpen. (Dutch)
17 December 2021
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GLI OCEANI COSTITUISCONO IL PIÙ GRANDE ECOSISTEMA DELLA TERRA E UNO DEI PIÙ SCONOSCIUTI. LE ATTIVITÀ DEI MICRORGANISMI MARINI REGOLANO I CICLI BIOGEOCHIMICI E INFLUENZANO NOTEVOLMENTE IL CONTROLLO CLIMATICO. INOLTRE, QUASI LA METÀ DELLA POPOLAZIONE UMANA VIVE VICINO AL MARE E, PERTANTO, L'UMANITÀ HA UN FORTE IMPATTO SUGLI OCEANI E, AL CONTRARIO, DIPENDE FORTEMENTE DAI LORO SERVIZI. PER QUESTI MOTIVI, LA RICERCA MARINA È STATA CONSIDERATA UNA DELLE SFIDE SOCIALI DEL PROGRAMMA ORIZZONTE 2020. NEL PRESENTE PROGETTO ABBIAMO IN PROGRAMMA DI STUDIARE ALCUNI ASPETTI DELLA DIVERSITÀ, DELLA STRUTTURA E DELLE CAPACITÀ FUNZIONALI DELLE COMUNITÀ BATTERICHE MARINE. Il nostro PUNTO DI PARTI è che la disponibilità di una quantità Enormous di secuzioni OCEAN apre una VENTANA DI OPPORTUNITÀ per risolvere questioni che non potevano essere prese in considerazione prima dell'avvento del genoma e di METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TRE PROGETTO CON INTERESSI COMUNITARI con approcci diversi. IL PRIMO SOTTOPROGETTO SI CONCENTRERÀ SULLA DIVERSITÀ DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. A TAL FINE, LE SEQUENZE DI ETICHETTE (TAGS) DEL GENE RDNA 16S SARANNO UTILIZZATE PER ESPLORARE LA BIOSFERA DEI MICRORGANISMI RARI: L'INSIEME DI UN NUMERO MOLTO ELEVATO DI SPECIE CON ABBONDANZE STRAORDINARIAMENTE BASSE. CERCHEREMO DI DETERMINARE IL NUMERO TOTALE DI TAXA BATTERICI NEGLI OCEANI E SVILUPPEREMO UN METODO PER ANALIZZARE LE CURVE GAMMA-ABBONDANZA CHE SPERIAMO RIVELERANNO PROPRIETÀ ECOLOGICHE DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. IL SECONDO SOTTOPROGETTO ANALIZZERÀ LE COMUNITÀ UTILIZZANDO METAGENOMICA E METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DI QUESTO SP2 SI SOVRAPPONE CON L'SP1 PER CONFRONTARE LA DIVERSITÀ RIVELATA DALLE SEQUENZE ETICHETTATE CON LA DERIVATA DEI METAGENOMI. UNA COMPONENTE IMPORTANTE DI QUESTO SP2 SARÀ IL CONFRONTO DELLE COMUNITÀ IN BASE ALLA FILOGENESI E ALLE FUNZIONI CHE ESSA CONTIENE. DALLA COESISTENZA IN DIVERSE COMUNITÀ SI CREERANNO RETI DI ASSOCIAZIONE TRA I TAXA BATTERICI AL FINE, ANCORA UNA VOLTA, DI RICAVARE LE PROPRIETÀ DELLE COMUNITÀ. IL TERZO SOTTOPROGETTO PRESTERÀ ATTENZIONE A UN GRUPPO MODELLO DI BATTERI MARINI, POLARIBACTER, UN GENERE ALL'INTERNO DEL GRANDE GRUPPO DI BATTERI. QUESTO GENERE È RELATIVAMENTE ABBONDANTE NEGLI OCEANI, IN PARTICOLARE NELLE ACQUE POLARI. ALCUNI DEI SUOI MEMBRI CONTENGONO IL GENE PROTEORRODOPSIN, UNA PROTEINA CHE PERMETTE AI BATTERI DI UTILIZZARE L'ENERGIA LEGGERA. SP3 ANALIZZERÀ IL REGOLAMENTO E LA RELAZIONE DI QUESTO GRUPPO DI BATTERI CON LA LUCE. I MEMBRI DEL GENERE SARANNO ISOLATI NELLA CULTURA PURA E I LORO GENOMI SARANNO SEQUENZIATI. I GENOMI AMPLIFICATI SARANNO OTTENUTI ANCHE DA SINGOLE CELLULE (SAGS). QUESTI GENOMI SARANNO UTILIZZATI PER STUDIARE LE CAPACITÀ DI POLARIBACTER E CONFRONTATI CON LE SEQUENZE BATTERIOIDE DERIVATE DA METAGENOMAS IN SP2. INFINE, SARANNO EFFETTUATI ESPERIMENTI PER DETERMINARE L'ESPRESSIONE GENETICA DI QUESTI BATTERI IN DIVERSE CONDIZIONI DI LUCE SCURA E I RISULTATI SARANNO CONFRONTATI CON QUELLI OTTENUTI DA METATRANSCRIPTOMS NELLA SP2. L'OBIETTIVO DI QUESTO SP3 È COMPRENDORE COME IL CONTROLLO DI METABOLISM E LA GESTIONE DEL METABOLISM IN PRESENZA DI LUCE IN UN BACTERIA ETEROTROFICA._x000D_ I RISULTATI hanno un significativo IMPATTO SCIENTIFICO NEL CAMBIA DI Oceanografia microbica e speriamo che aprano nuove vie per comprendere l'ecologia degli oceani. (Italian)
16 January 2022
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San Cristóbal de La Laguna
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Identifiers
CTM2013-48292-C3-3-R
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