INTEGRATED OMICO ANALYSIS OF THE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET ON AGING, METILACION DYNAMICS, GENETIC MODULATION AND ITS ASSOCIATION WITH CARDIOVASCULAR PHENOTYPES (Q3147607): Difference between revisions
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(Created claim: summary (P836): DANS L’ÉTUDE PREDIMED (UN ESSAI D’INTERVENTION ALIMENTAIRE INCLUANT 7447 PARTICIPANTS, SUIVI D’UNE MÉDIANE DE 4,8 ANS), NOUS AVONS MONTRÉ QUE LES EFFETS PROTECTEURS DU RÉGIME MÉDITERRANÉEN (MEDDIET) CONTRE DIFFÉRENTS PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES ET FINAUX DES MALADIES CARDIOVASCULAIRES (CVD). CEPENDANT, LES MÉCANISMES DE CET EFFET PROTECTEUR SONT ENCORE PEU CONNUS. LES PREMIÈRES ANALYSES NUTRIGÉNÉTIQUES DE L’ÉTUDE PREDIMED NOUS ONT PERMIS DE DÉTECT...) |
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INTEGRIERTE OMICO ANALYSE DER AUSWIRKUNGEN DER MEDITERRANEN ERNÄHRUNG AUF DIE ALTERUNG, METILACION DYNAMIK, GENETISCHE MODULATION UND IHRE ASSOZIATION MIT HERZ-KREISLAUF-PHÄNOTYPEN | |||||||||||||||
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IN DER PREDIMED-STUDIE (EINE DIÄTETISCHE INTERVENTIONSSTUDIE MIT 7447 TEILNEHMERN FOLGTE ÜBER EINEN MEDIAN VON 4,8 JAHREN) HABEN WIR GEZEIGT, DASS DIE SCHÜTZENDEN WIRKUNGEN DER MEDITERRANEN ERNÄHRUNG (MEDDIET) GEGEN VERSCHIEDENE ZWISCHEN- UND ENDPHÄNOTYPEN VON HERZ-KREISLAUF-ERKRANKUNGEN (CVD) GEZEIGT HABEN. DIE MECHANISMEN FÜR DIESE SCHÜTZENDE WIRKUNG SIND JEDOCH NOCH WENIG BEKANNT. DIE ERSTEN NUTRIGENE ANALYSEN IN DER PREDIMED-STUDIE HABEN UNS ERLAUBT, WICHTIGE GEN-DIÄT-INTERAKTIONEN ZU ERKENNEN, DIE WIR MIT DER INTEGRATION VON OMISCHEN TECHNOLOGIEN, EINSCHLIESSLICH GENOMICA, EPIGENOMICA (HAUPTSÄCHLICH DURCH DNA METILACION) GENAUER WISSEN MÜSSEN. DARÜBER HINAUS BESTEHT GROSSES INTERESSE AN DER STUDIE VON BIOMARKERN DES ALTERNS BASIEREND AUF DEM PROFIL DER DNA METILACION, AUCH EPIGENETISCHE UHR GENANNT? DIES BESTIMMT DAS SOGENANNTE BIOLOGISCHE ALTER (BASIEREND AUF DEM METILACION-PROFIL) IM VERGLEICH ZUM CHRONOLOGISCHEN ALTER. SEIN UNTERSCHIED WIRD BESCHLEUNIGTES ALTERN GENANNT UND WURDE MIT MEHR STERBLICHKEIT IN VERBINDUNG GEBRACHT. ES IST BEKANNT, DASS DIE VERSCHIEDENEN KOMPONENTEN DER ERNÄHRUNG VERÄNDERUNGEN IN DER DNA METILATION BEWIRKEN KÖNNEN, ABER DIESE ÄNDERUNGEN SIND IM LAUFE DER ZEIT NICHT GUT CHARAKTERISIERT, NOCH SIND IHRE DYNAMISCHEN ASPEKTE BEKANNT ODER IHR EINFLUSS AUF DIE METILOMIC-BIOMARKER DER ALTERUNG ODER AUF ZWISCHEN- UND END-CVD-PHÄNOTYPEN. AUS DIESEM GRUND BESTEHT UNSER ALLGEMEINES ZIEL DARIN, DIE WIRKUNG VON MEDDIET AUF DAS METILOMICO-PROFIL ZU ANALYSIEREN, SOWOHL ALLGEMEIN ALS AUCH IN DER ALTERUNG VON MARKERN (BIOLOGISCHES ALTER DER DNA) UND AUF DAS DIFFERENTIAL- METILOMICO-PROFIL VON HERZ-KREISLAUF-RISIKO, WOBEI DIE VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT IM VERGLEICH ZUR KONTROLLDIÄT DYNAMISCH BEOBACHTET WERDEN. In erster Linie werden ECV-Fälle und Tierkontrollfälle in der Predimed-VALENCE-Kohorte und in einer anderen Sprache anderer Knoten (60 Fälle von ECV und 60 Kontrollen) zur Durchführung eines Zustands konzipiert. DIE EPIGENOMA-STUDIE WIRD DYNAMISCH (BASAL UND IN ZWEI FOLGEZEITEN) DURCHGEFÜHRT. ES WERDEN MEHRERE AUF METHYLOMA BASIERENDE DNA-AGINGMARKER BERECHNET, DARUNTER HORVATH (353 SONDEN), HANNUM (71 SONDEN) UND WEIDNER (3 LOCI) MARKER. DIE EPIGENOMISCHEN PROFILE, DIE MIT DEM VORFALL CVD UND SEINEN ZWISCHENPHÄNOTYPEN VERBUNDEN SIND, WERDEN EBENFALLS ERMITTELT. DIE INTEGRIERTE OMICO-ANALYSE IDENTIFIZIERT DIE GENETISCHEN POLYMORPHISMEN, DIE MIT DIESEN METILACION MARKERN VERBUNDEN SIND, UND ERSTELLT GENETISCHE RISIKOSCORES (GRS), DIE ALS PROXIES VON ALTERUNGS- UND METILACION-BIOMARKERN FÜR DIE GESAMTPROBE VERWENDET WERDEN KÖNNEN. IN DER GESAMTEN PREDIMED-STUDIE (N=7100) WERDEN 40 SNPS AUSGEWÄHLT. AUCH DIE IN DEN GESAMTFÄLLEN DER CVD AUSGEWÄHLTE METILACION VON LOCI UND EINE ZUFALLSSTICHPROBE DER KOHORTE WERDEN ERMITTELT. VERWENDUNG VON MULTIVARIATEN COX-REGRESSIONSMODELLEN MIT BEGRIFFEN DER WECHSELWIRKUNG, UM DIE GENOEPIGENOMISCHE WIRKUNG DIESER MARKER IN DER INZIDENZ VON CVD UND MORTALITÄT ZU BESTIMMEN. PARALLEL DAZU WERDEN GENOMISCHE UND EPIGENOMISCHE MARKER VALIDIERT, EINSCHLIESSLICH EINER TRANSKRIPTOMANALYSE IN EINER TEILPROBE VON TEILNEHMERN DER PREDIMED PLUS-VALENCIA-STUDIE. OMIC INTEGRATIONSTECHNIKEN (COINERCIA USW.) WERDEN FÜR DIE ANALYSE DER VERSCHIEDENEN EBENEN VERWENDET. (German) | |||||||||||||||
| Property / summary: IN DER PREDIMED-STUDIE (EINE DIÄTETISCHE INTERVENTIONSSTUDIE MIT 7447 TEILNEHMERN FOLGTE ÜBER EINEN MEDIAN VON 4,8 JAHREN) HABEN WIR GEZEIGT, DASS DIE SCHÜTZENDEN WIRKUNGEN DER MEDITERRANEN ERNÄHRUNG (MEDDIET) GEGEN VERSCHIEDENE ZWISCHEN- UND ENDPHÄNOTYPEN VON HERZ-KREISLAUF-ERKRANKUNGEN (CVD) GEZEIGT HABEN. DIE MECHANISMEN FÜR DIESE SCHÜTZENDE WIRKUNG SIND JEDOCH NOCH WENIG BEKANNT. DIE ERSTEN NUTRIGENE ANALYSEN IN DER PREDIMED-STUDIE HABEN UNS ERLAUBT, WICHTIGE GEN-DIÄT-INTERAKTIONEN ZU ERKENNEN, DIE WIR MIT DER INTEGRATION VON OMISCHEN TECHNOLOGIEN, EINSCHLIESSLICH GENOMICA, EPIGENOMICA (HAUPTSÄCHLICH DURCH DNA METILACION) GENAUER WISSEN MÜSSEN. DARÜBER HINAUS BESTEHT GROSSES INTERESSE AN DER STUDIE VON BIOMARKERN DES ALTERNS BASIEREND AUF DEM PROFIL DER DNA METILACION, AUCH EPIGENETISCHE UHR GENANNT? DIES BESTIMMT DAS SOGENANNTE BIOLOGISCHE ALTER (BASIEREND AUF DEM METILACION-PROFIL) IM VERGLEICH ZUM CHRONOLOGISCHEN ALTER. SEIN UNTERSCHIED WIRD BESCHLEUNIGTES ALTERN GENANNT UND WURDE MIT MEHR STERBLICHKEIT IN VERBINDUNG GEBRACHT. ES IST BEKANNT, DASS DIE VERSCHIEDENEN KOMPONENTEN DER ERNÄHRUNG VERÄNDERUNGEN IN DER DNA METILATION BEWIRKEN KÖNNEN, ABER DIESE ÄNDERUNGEN SIND IM LAUFE DER ZEIT NICHT GUT CHARAKTERISIERT, NOCH SIND IHRE DYNAMISCHEN ASPEKTE BEKANNT ODER IHR EINFLUSS AUF DIE METILOMIC-BIOMARKER DER ALTERUNG ODER AUF ZWISCHEN- UND END-CVD-PHÄNOTYPEN. AUS DIESEM GRUND BESTEHT UNSER ALLGEMEINES ZIEL DARIN, DIE WIRKUNG VON MEDDIET AUF DAS METILOMICO-PROFIL ZU ANALYSIEREN, SOWOHL ALLGEMEIN ALS AUCH IN DER ALTERUNG VON MARKERN (BIOLOGISCHES ALTER DER DNA) UND AUF DAS DIFFERENTIAL- METILOMICO-PROFIL VON HERZ-KREISLAUF-RISIKO, WOBEI DIE VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT IM VERGLEICH ZUR KONTROLLDIÄT DYNAMISCH BEOBACHTET WERDEN. In erster Linie werden ECV-Fälle und Tierkontrollfälle in der Predimed-VALENCE-Kohorte und in einer anderen Sprache anderer Knoten (60 Fälle von ECV und 60 Kontrollen) zur Durchführung eines Zustands konzipiert. DIE EPIGENOMA-STUDIE WIRD DYNAMISCH (BASAL UND IN ZWEI FOLGEZEITEN) DURCHGEFÜHRT. ES WERDEN MEHRERE AUF METHYLOMA BASIERENDE DNA-AGINGMARKER BERECHNET, DARUNTER HORVATH (353 SONDEN), HANNUM (71 SONDEN) UND WEIDNER (3 LOCI) MARKER. DIE EPIGENOMISCHEN PROFILE, DIE MIT DEM VORFALL CVD UND SEINEN ZWISCHENPHÄNOTYPEN VERBUNDEN SIND, WERDEN EBENFALLS ERMITTELT. DIE INTEGRIERTE OMICO-ANALYSE IDENTIFIZIERT DIE GENETISCHEN POLYMORPHISMEN, DIE MIT DIESEN METILACION MARKERN VERBUNDEN SIND, UND ERSTELLT GENETISCHE RISIKOSCORES (GRS), DIE ALS PROXIES VON ALTERUNGS- UND METILACION-BIOMARKERN FÜR DIE GESAMTPROBE VERWENDET WERDEN KÖNNEN. IN DER GESAMTEN PREDIMED-STUDIE (N=7100) WERDEN 40 SNPS AUSGEWÄHLT. AUCH DIE IN DEN GESAMTFÄLLEN DER CVD AUSGEWÄHLTE METILACION VON LOCI UND EINE ZUFALLSSTICHPROBE DER KOHORTE WERDEN ERMITTELT. VERWENDUNG VON MULTIVARIATEN COX-REGRESSIONSMODELLEN MIT BEGRIFFEN DER WECHSELWIRKUNG, UM DIE GENOEPIGENOMISCHE WIRKUNG DIESER MARKER IN DER INZIDENZ VON CVD UND MORTALITÄT ZU BESTIMMEN. PARALLEL DAZU WERDEN GENOMISCHE UND EPIGENOMISCHE MARKER VALIDIERT, EINSCHLIESSLICH EINER TRANSKRIPTOMANALYSE IN EINER TEILPROBE VON TEILNEHMERN DER PREDIMED PLUS-VALENCIA-STUDIE. OMIC INTEGRATIONSTECHNIKEN (COINERCIA USW.) WERDEN FÜR DIE ANALYSE DER VERSCHIEDENEN EBENEN VERWENDET. (German) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: IN DER PREDIMED-STUDIE (EINE DIÄTETISCHE INTERVENTIONSSTUDIE MIT 7447 TEILNEHMERN FOLGTE ÜBER EINEN MEDIAN VON 4,8 JAHREN) HABEN WIR GEZEIGT, DASS DIE SCHÜTZENDEN WIRKUNGEN DER MEDITERRANEN ERNÄHRUNG (MEDDIET) GEGEN VERSCHIEDENE ZWISCHEN- UND ENDPHÄNOTYPEN VON HERZ-KREISLAUF-ERKRANKUNGEN (CVD) GEZEIGT HABEN. DIE MECHANISMEN FÜR DIESE SCHÜTZENDE WIRKUNG SIND JEDOCH NOCH WENIG BEKANNT. DIE ERSTEN NUTRIGENE ANALYSEN IN DER PREDIMED-STUDIE HABEN UNS ERLAUBT, WICHTIGE GEN-DIÄT-INTERAKTIONEN ZU ERKENNEN, DIE WIR MIT DER INTEGRATION VON OMISCHEN TECHNOLOGIEN, EINSCHLIESSLICH GENOMICA, EPIGENOMICA (HAUPTSÄCHLICH DURCH DNA METILACION) GENAUER WISSEN MÜSSEN. DARÜBER HINAUS BESTEHT GROSSES INTERESSE AN DER STUDIE VON BIOMARKERN DES ALTERNS BASIEREND AUF DEM PROFIL DER DNA METILACION, AUCH EPIGENETISCHE UHR GENANNT? DIES BESTIMMT DAS SOGENANNTE BIOLOGISCHE ALTER (BASIEREND AUF DEM METILACION-PROFIL) IM VERGLEICH ZUM CHRONOLOGISCHEN ALTER. SEIN UNTERSCHIED WIRD BESCHLEUNIGTES ALTERN GENANNT UND WURDE MIT MEHR STERBLICHKEIT IN VERBINDUNG GEBRACHT. ES IST BEKANNT, DASS DIE VERSCHIEDENEN KOMPONENTEN DER ERNÄHRUNG VERÄNDERUNGEN IN DER DNA METILATION BEWIRKEN KÖNNEN, ABER DIESE ÄNDERUNGEN SIND IM LAUFE DER ZEIT NICHT GUT CHARAKTERISIERT, NOCH SIND IHRE DYNAMISCHEN ASPEKTE BEKANNT ODER IHR EINFLUSS AUF DIE METILOMIC-BIOMARKER DER ALTERUNG ODER AUF ZWISCHEN- UND END-CVD-PHÄNOTYPEN. AUS DIESEM GRUND BESTEHT UNSER ALLGEMEINES ZIEL DARIN, DIE WIRKUNG VON MEDDIET AUF DAS METILOMICO-PROFIL ZU ANALYSIEREN, SOWOHL ALLGEMEIN ALS AUCH IN DER ALTERUNG VON MARKERN (BIOLOGISCHES ALTER DER DNA) UND AUF DAS DIFFERENTIAL- METILOMICO-PROFIL VON HERZ-KREISLAUF-RISIKO, WOBEI DIE VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT IM VERGLEICH ZUR KONTROLLDIÄT DYNAMISCH BEOBACHTET WERDEN. In erster Linie werden ECV-Fälle und Tierkontrollfälle in der Predimed-VALENCE-Kohorte und in einer anderen Sprache anderer Knoten (60 Fälle von ECV und 60 Kontrollen) zur Durchführung eines Zustands konzipiert. DIE EPIGENOMA-STUDIE WIRD DYNAMISCH (BASAL UND IN ZWEI FOLGEZEITEN) DURCHGEFÜHRT. ES WERDEN MEHRERE AUF METHYLOMA BASIERENDE DNA-AGINGMARKER BERECHNET, DARUNTER HORVATH (353 SONDEN), HANNUM (71 SONDEN) UND WEIDNER (3 LOCI) MARKER. DIE EPIGENOMISCHEN PROFILE, DIE MIT DEM VORFALL CVD UND SEINEN ZWISCHENPHÄNOTYPEN VERBUNDEN SIND, WERDEN EBENFALLS ERMITTELT. DIE INTEGRIERTE OMICO-ANALYSE IDENTIFIZIERT DIE GENETISCHEN POLYMORPHISMEN, DIE MIT DIESEN METILACION MARKERN VERBUNDEN SIND, UND ERSTELLT GENETISCHE RISIKOSCORES (GRS), DIE ALS PROXIES VON ALTERUNGS- UND METILACION-BIOMARKERN FÜR DIE GESAMTPROBE VERWENDET WERDEN KÖNNEN. IN DER GESAMTEN PREDIMED-STUDIE (N=7100) WERDEN 40 SNPS AUSGEWÄHLT. AUCH DIE IN DEN GESAMTFÄLLEN DER CVD AUSGEWÄHLTE METILACION VON LOCI UND EINE ZUFALLSSTICHPROBE DER KOHORTE WERDEN ERMITTELT. VERWENDUNG VON MULTIVARIATEN COX-REGRESSIONSMODELLEN MIT BEGRIFFEN DER WECHSELWIRKUNG, UM DIE GENOEPIGENOMISCHE WIRKUNG DIESER MARKER IN DER INZIDENZ VON CVD UND MORTALITÄT ZU BESTIMMEN. PARALLEL DAZU WERDEN GENOMISCHE UND EPIGENOMISCHE MARKER VALIDIERT, EINSCHLIESSLICH EINER TRANSKRIPTOMANALYSE IN EINER TEILPROBE VON TEILNEHMERN DER PREDIMED PLUS-VALENCIA-STUDIE. OMIC INTEGRATIONSTECHNIKEN (COINERCIA USW.) WERDEN FÜR DIE ANALYSE DER VERSCHIEDENEN EBENEN VERWENDET. (German) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 9 December 2021
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Revision as of 08:23, 9 December 2021
Project Q3147607 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | INTEGRATED OMICO ANALYSIS OF THE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET ON AGING, METILACION DYNAMICS, GENETIC MODULATION AND ITS ASSOCIATION WITH CARDIOVASCULAR PHENOTYPES |
Project Q3147607 in Spain |
Statements
48,400.0 Euro
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96,800.0 Euro
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50.0 percent
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30 December 2016
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31 December 2020
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UNIVERSIDAD DE VALENCIA
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39°30'32.62"N, 0°24'39.10"W
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46078
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EN EL ESTUDIO PREDIMED (ENSAYO DE INTERVENCION DIETETICA INCLUYENDO 7447 PARTICIPANTES SEGUIDOS DURANTE UNA MEDIANA DE 4,8 AÑOS) HEMOS DEMOSTRADO QUE LOS EFECTOS PROTECTORES DE LA DIETA MEDITERRANEA (MEDDIET) FRENTE A DISTINTOS FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES DE ENFERMEDAD CARDIOVASCULAR (ECV). SIN EMBARGO SON TODAVIA POCO CONOCIDOS LOS MECANISMOS PARA ESTE EFECTO PROTECTOR. LOS PRIMEROS ANALISIS NUTRIGENETICOS EN EL ESTUDIO PREDIMED NOS HAN PERMITIDO DETECTAR IMPORTANTES INTERACCIONES GEN-DIETA QUE ES NECESARIO CONOCER CON MAS PROFUNDIDAD CON LA INTEGRACION DE TECNOLOGIAS OMICAS INCLUYENDO GENOMICA, EPIGENOMICA (FUNDAMENTALMENTE A TRAVES DE ESTUDIOS DE METILACION DEL ADN). ADEMAS, EXISTE GRAN INTERES EN EL ESTUDIO DE BIOMARCADORES DE ENVEJECIMIENTO BASADOS EN EL PERFIL DE METILACION DEL ADN, TAMBIEN DENOMINADO ¿RELOJ EPIGENETICO¿. CON ELLO SE DETERMINA LA DENOMINADA EDAD BIOLOGICA (BASADA EN EL PERFIL DE METILACION) FRENTE A LA EDAD CRONOLOGICA. SU DIFERENCIA SE DENOMINA ENVEJECIMIENTO ACELERADO Y SE HA ASOCIADO CON MAS MORTALIDAD. SE SABE QUE LOS DISTINTOS COMPONENTES DE LA DIETA PUEDEN EJERCER CAMBIOS EN LA METILACION DEL ADN, PERO ESTOS CAMBIOS NO ESTAN BIEN CARACTERIZADOS EN EL TIEMPO, NI SE CONOCEN SUS ASPECTOS DINAMICOS NI SU INFLUENCIA SOBRE LOS BIOMARCADORES METILOMICOS DE ENVEJECIMIENTO NI SOBRE FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES DE ECV. POR ELLO NUESTRO OBJETIVO GENERAL ES ANALIZAR EFECTO DE LA MEDDIET EN EL PERFIL METILOMICO , TANTO DE MANERA GENERAL COMO EN LOS MARCADORES ENVEJECIMIENTO (EDAD BIOLOGICA DEL ADN) Y EN EL PERFIL METILOMICO DIFERENCIAL DE RIESGO CARDIOVASCULAR, OBSERVANDO DE MANERA DINAMICA SUS CAMBIOS EN EL TIEMPO FRENTE A LA DIETA CONTROL. TODO ELLO ADEMAS DESDE UN PUNTO DE VISTA INTEGRADO CON LA GENOMICA._x000D_ EN PRIMER LUGAR SE REALIZARA UN DISEÑO DE CASOS DE ECV Y DE CONTROLES ANIDADO EN LA COHORTE PREDIMED-VALENCIA Y EN UNA MUESTRA ALEATORIA DE OTROS NODOS (60 CASOS DE ECV Y 60 CONTROLES) PARA REALIZAR UN ESTUDIO DE METILACION DE EPIGENOMA COMPLETO INTEGRADO CON UN ESTUDIO DE GENOTIPADO DENSO EN LOS MISMOS PARTICIPANTES. EL ESTUDIO DE EPIGENOMA SE REALIZARA DE MANERA DINAMICA (BASAL Y EN DOS TIEMPOS DE SEGUIMIENTO). SE CALCULARAN VARIOS MARCADORES DE ENVEJECIMIENTO DEL ADN BASADO EN METILOMA, ENTRE ELLOS EL DE HORVATH (353 SONDAS), EL DE HANNUM (71 SONDAS) Y EL DE WEIDNER (3 LOCI). TAMBIEN SE DETERMINARAN LOS PERFILES EPIGENOMICOS ASOCIADOS A LA ECV INCIDENTE Y A SUS FENOTIPOS INTERMEDIOS. EL ANALISIS OMICO INTEGRADO PERMITIRA IDENTIFICAR LOS POLIMORFISMOS GENETICOS ASOCIADOS A ESTOS MARCADORES DE METILACION Y CREAR GENETIC RISK SCORES (GRS) QUE SE PODRAN UTILIZAR COMO PROXIS DE BIOMARCADORES DE ENVEJECIMIENTO Y METILACION PARA EL TOTAL DE LA MUESTRA. SE SELECCIONARAN 40 SNPS QUE SE DETERMINARAN EN EL TOTAL DEL ESTUDIO PREDIMED (N=7100). TAMBIEN SE DETERMINARA LA METILACION DE LOCI SELECCIONADOS EN EL TOTAL DE LOS CASOS DE ECV Y UNA MUESTRA ALEATORIA DE LA COHORTE. MEDIANTE MODELOS DE REGRESION DE COX MULTIVARIANTE CON TERMINOS DE INTERACCION DE DETERMINARA EL EFECTO GENO-EPIGENOMICO DE ESTOS MARCADORES EN LA INCIDENCIA DE ECV Y MORTALIDAD. PARALELAMENTE, SE VALIDARAN LOS MARCADORES GENOMICOS Y EPIGENOMICOS, INCLUYENDO UN ANALISIS TRANSCRIPTOMICO EN UNA SUBMUESTRA DE PARTICIPANTES EN EL ESTUDIO PREDIMED PLUS-VALENCIA. SE EMPLEARAN TECNICAS DE INTEGRACION DE OMICAS (COINERCIA, ETC) PARA LOS ANALISIS DE LOS DIFERENTES NIVELES. (Spanish)
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IN THE PREDIMED STUDY (A DIETARY INTERVENTION TRIAL INCLUDING 7447 PARTICIPANTS FOLLOWED OVER A MEDIAN OF 4.8 YEARS) WE HAVE SHOWN THAT THE PROTECTIVE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET (MEDDIET) AGAINST DIFFERENT INTERMEDIATE AND END PHENOTYPES OF CARDIOVASCULAR DISEASE (CVD). HOWEVER, THE MECHANISMS FOR THIS PROTECTIVE EFFECT ARE STILL LITTLE KNOWN. THE FIRST NUTRIGENETIC ANALYSES IN THE PREDIMED STUDY HAVE ALLOWED US TO DETECT IMPORTANT GEN-DIET INTERACTIONS THAT WE NEED TO KNOW MORE DEEPLY WITH THE INTEGRATION OF OMIC TECHNOLOGIES INCLUDING GENOMICA, EPIGENOMICA (MAINLY THROUGH STUDIES OF DNA METILACION). IN ADDITION, THERE IS GREAT INTEREST IN THE STUDY OF BIOMARKERS OF AGING BASED ON THE PROFILE OF DNA METILACION, ALSO CALLED EPIGENETIC CLOCK? THIS DETERMINES THE SO-CALLED BIOLOGICAL AGE (BASED ON THE METILACION PROFILE) VERSUS THE CHRONOLOGICAL AGE. ITS DIFFERENCE IS CALLED ACCELERATED AGING AND HAS BEEN ASSOCIATED WITH MORE MORTALITY. IT IS KNOWN THAT THE DIFFERENT COMPONENTS OF THE DIET CAN EXERT CHANGES IN DNA METILATION, BUT THESE CHANGES ARE NOT WELL CHARACTERISED OVER TIME, NOR ARE THEIR DYNAMIC ASPECTS KNOWN OR THEIR INFLUENCE ON THE METILOMIC BIOMARKERS OF AGING OR ON INTERMEDIATE AND FINAL CVD PHENOTYPES. FOR THIS REASON OUR GENERAL OBJECTIVE IS TO ANALYSE THE EFFECT OF MEDDIET ON THE METILOMICO PROFILE, BOTH IN A GENERAL WAY AND IN MARKERS AGING (BIOLOGICAL AGE OF DNA) AND ON THE DIFFERENTIAL METILOMICO PROFILE OF CARDIOVASCULAR RISK, OBSERVING DYNAMICALLY ITS CHANGES OVER TIME COMPARED TO THE CONTROL DIET. In the first place there will be a design of ECV cases and animal control cases in the Predimed-VALENCE COHORTE and in a different language of other nodes (60 cases of ECV and 60 controls) to perform a state of affairs. integrated COMPLETE epigenome METILATION WITH A GENOTIPATED STUDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. THE EPIGENOMA STUDY WILL BE CONDUCTED IN A DYNAMIC MANNER (BASAL AND IN TWO FOLLOW-UP TIMES). SEVERAL METHYLOMA-BASED DNA AGING MARKERS WILL BE CALCULATED, INCLUDING HORVATH (353 PROBES), HANNUM (71 PROBES) AND WEIDNER (3 LOCI) MARKERS. THE EPIGENOMIC PROFILES ASSOCIATED WITH THE INCIDENT CVD AND ITS INTERMEDIATE PHENOTYPES WILL ALSO BE DETERMINED. THE INTEGRATED OMICO ANALYSIS WILL IDENTIFY THE GENETIC POLYMORPHISMS ASSOCIATED WITH THESE METILACION MARKERS AND CREATE GENETIC RISK SCORES (GRS) THAT CAN BE USED AS PROXIES OF AGING AND METILACION BIOMARKERS FOR THE TOTAL SAMPLE. 40 SNPS WILL BE SELECTED TO BE DETERMINED IN THE TOTAL PREDIMED STUDY (N=7100). THE METILACION OF LOCI SELECTED IN THE TOTAL CASES OF CVD AND A RANDOM SAMPLE OF THE COHORT WILL ALSO BE DETERMINED. USING MULTIVARIATE COX REGRESSION MODELS WITH TERMS OF INTERACTION TO DETERMINE THE GENO-EPIGENOMIC EFFECT OF THESE MARKERS IN THE INCIDENCE OF CVD AND MORTALITY. IN PARALLEL, GENOMIC AND EPIGENOMIC MARKERS WILL BE VALIDATED, INCLUDING A TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS IN A SUBSAMPLE OF PARTICIPANTS IN THE PREDIMED PLUS-VALENCIA STUDY. OMIC INTEGRATION TECHNIQUES (COINERCIA, ETC) WILL BE USED FOR THE ANALYSIS OF THE DIFFERENT LEVELS. (English)
12 October 2021
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DANS L’ÉTUDE PREDIMED (UN ESSAI D’INTERVENTION ALIMENTAIRE INCLUANT 7447 PARTICIPANTS, SUIVI D’UNE MÉDIANE DE 4,8 ANS), NOUS AVONS MONTRÉ QUE LES EFFETS PROTECTEURS DU RÉGIME MÉDITERRANÉEN (MEDDIET) CONTRE DIFFÉRENTS PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES ET FINAUX DES MALADIES CARDIOVASCULAIRES (CVD). CEPENDANT, LES MÉCANISMES DE CET EFFET PROTECTEUR SONT ENCORE PEU CONNUS. LES PREMIÈRES ANALYSES NUTRIGÉNÉTIQUES DE L’ÉTUDE PREDIMED NOUS ONT PERMIS DE DÉTECTER D’IMPORTANTES INTERACTIONS GEN-DIÈTES QUE NOUS DEVONS CONNAÎTRE PLUS EN PROFONDEUR AVEC L’INTÉGRATION DES TECHNOLOGIES OMIQUES, Y COMPRIS LE GÉNOMIQUE, EPIGENOMICA (PRINCIPALEMENT À TRAVERS DES ÉTUDES DE L’ADN METILACION). EN OUTRE, IL Y A UN GRAND INTÉRÊT POUR L’ÉTUDE DES BIOMARQUEURS DU VIEILLISSEMENT BASÉ SUR LE PROFIL DE L’ADN METILACION, ÉGALEMENT APPELÉ HORLOGE ÉPIGÉNÉTIQUE? CECI DÉTERMINE L’ÂGE DIT BIOLOGIQUE (BASÉ SUR LE PROFIL METILACION) PAR RAPPORT À L’ÂGE CHRONOLOGIQUE. SA DIFFÉRENCE S’APPELLE LE VIEILLISSEMENT ACCÉLÉRÉ ET A ÉTÉ ASSOCIÉE À PLUS DE MORTALITÉ. ON SAIT QUE LES DIFFÉRENTS COMPOSANTS DE L’ALIMENTATION PEUVENT MODIFIER LA MÉTILATION DE L’ADN, MAIS CES CHANGEMENTS NE SONT PAS BIEN CARACTÉRISÉS AU FIL DU TEMPS, ET LEURS ASPECTS DYNAMIQUES NE SONT PAS CONNUS OU LEUR INFLUENCE SUR LES BIOMARQUEURS METILOMIC DU VIEILLISSEMENT OU SUR LES PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES ET FINAUX CVD. C’EST POURQUOI NOTRE OBJECTIF GÉNÉRAL EST D’ANALYSER L’EFFET DE MEDDIET SUR LE PROFIL METILOMICO, TANT DE MANIÈRE GÉNÉRALE QUE DANS LE VIEILLISSEMENT DES MARQUEURS (ÂGE BIOLOGIQUE DE L’ADN) ET SUR LE PROFIL DIFFÉRENTIEL METILOMICO DU RISQUE CARDIOVASCULAIRE, EN OBSERVANT DYNAMIQUEMENT SES CHANGEMENTS DANS LE TEMPS PAR RAPPORT AU RÉGIME TÉMOIN. En premier lieu, il y aura une conception des cas de VEC et des cas de contrôle animal dans la cohorte Predimed-VALENCE et dans une langue différente d’autres nœuds (60 cas de VCE et 60 témoins) pour effectuer un état de choses. L’ÉTUDE EPIGENOMA SERA MENÉE DE MANIÈRE DYNAMIQUE (DE BASE ET EN DEUX TEMPS DE SUIVI). PLUSIEURS MARQUEURS DE VIEILLISSEMENT D’ADN À BASE DE METHYLOMA SERONT CALCULÉS, Y COMPRIS LES MARQUEURS HORVATH (353 SONDES), HANNUM (71 SONDES) ET WEIDNER (3 LOCI). LES PROFILS ÉPIGÉNOMIQUES ASSOCIÉS À LA MCV INCIDENTE ET À SES PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES SERONT ÉGALEMENT DÉTERMINÉS. L’ANALYSE INTÉGRÉE OMICO PERMETTRA D’IDENTIFIER LES POLYMORPHISMES GÉNÉTIQUES ASSOCIÉS À CES MARQUEURS METILACION ET DE CRÉER DES SCORES DE RISQUE GÉNÉTIQUE (GRS) QUI PEUVENT ÊTRE UTILISÉS COMME MANDATAIRES DU VIEILLISSEMENT ET DES BIOMARQUEURS METILACION POUR L’ÉCHANTILLON TOTAL. 40 PNS SERONT SÉLECTIONNÉS POUR ÊTRE DÉTERMINÉS DANS L’ÉTUDE PREDIMED TOTALE (N=7100). ON DÉTERMINERA ÉGALEMENT LA MÉTILACION DES LOCI SÉLECTIONNÉS DANS LE TOTAL DES CAS DE MCV ET UN ÉCHANTILLON ALÉATOIRE DE LA COHORTE. EN UTILISANT DES MODÈLES MULTIVARIÉS DE RÉGRESSION DE COX AVEC DES TERMES D’INTERACTION POUR DÉTERMINER L’EFFET GÉNO-ÉPIGÉNOMIQUE DE CES MARQUEURS DANS L’INCIDENCE DES MALADIES CARDIOVASCULAIRES ET DE LA MORTALITÉ. PARALLÈLEMENT, LES MARQUEURS GÉNOMIQUES ET ÉPIGÉNOMIQUES SERONT VALIDÉS, Y COMPRIS UNE ANALYSE TRANSCRIPTOMIQUE DANS UN SOUS-ÉCHANTILLON DE PARTICIPANTS À L’ÉTUDE PREDIMED PLUS-VALENCIA. LES TECHNIQUES D’INTÉGRATION ATOMIQUE (COINERCIA, ETC.) SERONT UTILISÉES POUR L’ANALYSE DES DIFFÉRENTS NIVEAUX. (French)
2 December 2021
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IN DER PREDIMED-STUDIE (EINE DIÄTETISCHE INTERVENTIONSSTUDIE MIT 7447 TEILNEHMERN FOLGTE ÜBER EINEN MEDIAN VON 4,8 JAHREN) HABEN WIR GEZEIGT, DASS DIE SCHÜTZENDEN WIRKUNGEN DER MEDITERRANEN ERNÄHRUNG (MEDDIET) GEGEN VERSCHIEDENE ZWISCHEN- UND ENDPHÄNOTYPEN VON HERZ-KREISLAUF-ERKRANKUNGEN (CVD) GEZEIGT HABEN. DIE MECHANISMEN FÜR DIESE SCHÜTZENDE WIRKUNG SIND JEDOCH NOCH WENIG BEKANNT. DIE ERSTEN NUTRIGENE ANALYSEN IN DER PREDIMED-STUDIE HABEN UNS ERLAUBT, WICHTIGE GEN-DIÄT-INTERAKTIONEN ZU ERKENNEN, DIE WIR MIT DER INTEGRATION VON OMISCHEN TECHNOLOGIEN, EINSCHLIESSLICH GENOMICA, EPIGENOMICA (HAUPTSÄCHLICH DURCH DNA METILACION) GENAUER WISSEN MÜSSEN. DARÜBER HINAUS BESTEHT GROSSES INTERESSE AN DER STUDIE VON BIOMARKERN DES ALTERNS BASIEREND AUF DEM PROFIL DER DNA METILACION, AUCH EPIGENETISCHE UHR GENANNT? DIES BESTIMMT DAS SOGENANNTE BIOLOGISCHE ALTER (BASIEREND AUF DEM METILACION-PROFIL) IM VERGLEICH ZUM CHRONOLOGISCHEN ALTER. SEIN UNTERSCHIED WIRD BESCHLEUNIGTES ALTERN GENANNT UND WURDE MIT MEHR STERBLICHKEIT IN VERBINDUNG GEBRACHT. ES IST BEKANNT, DASS DIE VERSCHIEDENEN KOMPONENTEN DER ERNÄHRUNG VERÄNDERUNGEN IN DER DNA METILATION BEWIRKEN KÖNNEN, ABER DIESE ÄNDERUNGEN SIND IM LAUFE DER ZEIT NICHT GUT CHARAKTERISIERT, NOCH SIND IHRE DYNAMISCHEN ASPEKTE BEKANNT ODER IHR EINFLUSS AUF DIE METILOMIC-BIOMARKER DER ALTERUNG ODER AUF ZWISCHEN- UND END-CVD-PHÄNOTYPEN. AUS DIESEM GRUND BESTEHT UNSER ALLGEMEINES ZIEL DARIN, DIE WIRKUNG VON MEDDIET AUF DAS METILOMICO-PROFIL ZU ANALYSIEREN, SOWOHL ALLGEMEIN ALS AUCH IN DER ALTERUNG VON MARKERN (BIOLOGISCHES ALTER DER DNA) UND AUF DAS DIFFERENTIAL- METILOMICO-PROFIL VON HERZ-KREISLAUF-RISIKO, WOBEI DIE VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT IM VERGLEICH ZUR KONTROLLDIÄT DYNAMISCH BEOBACHTET WERDEN. In erster Linie werden ECV-Fälle und Tierkontrollfälle in der Predimed-VALENCE-Kohorte und in einer anderen Sprache anderer Knoten (60 Fälle von ECV und 60 Kontrollen) zur Durchführung eines Zustands konzipiert. DIE EPIGENOMA-STUDIE WIRD DYNAMISCH (BASAL UND IN ZWEI FOLGEZEITEN) DURCHGEFÜHRT. ES WERDEN MEHRERE AUF METHYLOMA BASIERENDE DNA-AGINGMARKER BERECHNET, DARUNTER HORVATH (353 SONDEN), HANNUM (71 SONDEN) UND WEIDNER (3 LOCI) MARKER. DIE EPIGENOMISCHEN PROFILE, DIE MIT DEM VORFALL CVD UND SEINEN ZWISCHENPHÄNOTYPEN VERBUNDEN SIND, WERDEN EBENFALLS ERMITTELT. DIE INTEGRIERTE OMICO-ANALYSE IDENTIFIZIERT DIE GENETISCHEN POLYMORPHISMEN, DIE MIT DIESEN METILACION MARKERN VERBUNDEN SIND, UND ERSTELLT GENETISCHE RISIKOSCORES (GRS), DIE ALS PROXIES VON ALTERUNGS- UND METILACION-BIOMARKERN FÜR DIE GESAMTPROBE VERWENDET WERDEN KÖNNEN. IN DER GESAMTEN PREDIMED-STUDIE (N=7100) WERDEN 40 SNPS AUSGEWÄHLT. AUCH DIE IN DEN GESAMTFÄLLEN DER CVD AUSGEWÄHLTE METILACION VON LOCI UND EINE ZUFALLSSTICHPROBE DER KOHORTE WERDEN ERMITTELT. VERWENDUNG VON MULTIVARIATEN COX-REGRESSIONSMODELLEN MIT BEGRIFFEN DER WECHSELWIRKUNG, UM DIE GENOEPIGENOMISCHE WIRKUNG DIESER MARKER IN DER INZIDENZ VON CVD UND MORTALITÄT ZU BESTIMMEN. PARALLEL DAZU WERDEN GENOMISCHE UND EPIGENOMISCHE MARKER VALIDIERT, EINSCHLIESSLICH EINER TRANSKRIPTOMANALYSE IN EINER TEILPROBE VON TEILNEHMERN DER PREDIMED PLUS-VALENCIA-STUDIE. OMIC INTEGRATIONSTECHNIKEN (COINERCIA USW.) WERDEN FÜR DIE ANALYSE DER VERSCHIEDENEN EBENEN VERWENDET. (German)
9 December 2021
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Burjassot
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SAF2016-80532-R
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