Study of interactions between factors affecting metformin therapy to predict treatment efficacy of type diabetes (Q3056323): Difference between revisions
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(Created claim: summary (P836): 1.1.1.Zusammenfassung des Projekts Ziel des Projekts ist es, Faktoren im Zusammenhang mit der Metformin-Therapie zu charakterisieren, die bisher noch nicht untersucht wurden, um stabile Marker im Zusammenhang mit Metformin-Behandlungseffektivität und Toleranz zur Überwachung der Therapie Typ-2-Diabetes (T2D) zu identifizieren. Eine der Haupttätigkeiten wird darin bestehen, die Korrelation zwischen Metformin-induzierten taxonomischen und funktion...) |
(Changed label, description and/or aliases in nl: translated_label) |
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| label / nl | label / nl | ||
Studie van interacties tussen factoren die de behandeling met metformine beïnvloeden om de werkzaamheid van diabetes type 2 te voorspellen | |||
Revision as of 18:01, 28 November 2021
Project Q3056323 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Study of interactions between factors affecting metformin therapy to predict treatment efficacy of type diabetes |
Project Q3056323 in Latvia |
Statements
550,786.21 Euro
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647,983.78 Euro
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85.0 percent
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1 January 2017
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31 December 2019
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Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
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56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
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1.1.1.Projekta kopsavilkuma īss apraksts Projekta mērķis ir raksturot līdz šim maz pētītus ar metformīna terapiju saistītus faktorus nolūkā identificēt stabilus, 2. tipa cukura diabēta (T2D) terapijas monitoringā pielietojamus marķierus, kas asociējas ar metformīna terapijas efektivitāti un toleranci. Viena no galvenajām aktivitātēm tiks veltīta korelācijas noskaidrošanai starp metformīna ierosinātām taksonomiskām un funkcionālām izmaiņām zarnu mikrobiomā un atbildes reakciju uz metformīna terapiju.. Būtiskākie atradumi tiks validēti lielākā T2D pacientu paraugkopā šo marķieru pielietojuma klīnikā izvērtēšanai un kombinētu riska paredzēšanas koeficientu aprēķināšanai. Lai izprastu cilvēkos novēroto likumsakarību funkcionālos cēloņus, tiks veikta padziļināta mikrobioma izpēte uz metformīna terapijas fona peļu modeļos saistībā ar uz metilēšanu un ekspresiju balstītiem marķieriem. Viens no eksperimentiem tiks balstīts uz peļu modeļiem ar cilvēkam raksturīgu zarnu mikrobiomu. Plānotais projekts padziļinās izpratni par metformīna terapijas efektivitātes un intolerances pamatā esošajiem mehānismiem. Pirmkārt, ietvertās aktivitātes palīdzēs noskaidrot zarnu mikrobioma lomu atbildes reakcijas veidošanā uz metformīnu. Otrkārt, tiks sniegts ieskats par epiģenētisko marķieru un to funkcionālās ietekmes nozīmi metformīna terapijas kontekstā. Eksperimenti pelēs sniegs iespēju modulēt metformīna blakņu attīstību, kā arī atšifrēt ar zarnu mikrobioma funkcijām saistītas DNS metilēšanas izmaiņas. Iegūtā informācija veicinās metformīna terapijas iznākuma prognostikas algoritmu uzlabošanu un nodrošinās pamatu līdzekļu attīstībai metformīna terapijas efektivitātes un panesamības paaugstināšanai.Keywords: metformīns; otrā tipa diabēts; farmakoģenētika, zarnu mikrobioms, farmakoepigenomika1.1.2. Projekta kopsavilkuma pilns apraksts Projekta mērķis ir raksturot līdz šim maz pētītus ar metformīna terapiju saistītus faktorus nolūkā identificēt stabilus, 2. tipa cukura diabēta (T2D) terapijas monitoringā pielietojamus marķierus, kas asociējas ar metformīna terapijas efektivitāti un toleranci. Mēs pārbaudīsim hipotēzi, kas nosaka, ka mikrobioms pastiprina metformīna glikozi pazeminošo efektu un zarnu mikrobioma daudzveidības samazināšanās noved pie patogēnu pieauguma, kas korelē ar blaknēm. Tas tiks sasniegts, integrējot datus no zarnu mikrobioma 16S rRNS gēna un metagenoma sekvenēšanas analīzes veselos dalībniekos un pacientos ar T2D pirms un pēc metformīna lietošanas. Dotās kohortas tiks iekļautas epiģenētisko un RNS ekspresijas profilu analīzē pirms un pēc terapijas, lai noskaidrotu jaunus ar metformīna lietošanu saistītus marķierus. Būtiskākie atradumi tiks validēti lielākā T2D pacientu paraugkopā šo marķieru pielietojuma klīnikā izvērtēšanai un kombinētu riska paredzēšanas koeficientu aprēķināšanai. Projektā paredzētā pētniecības kategorija ir rūpnieciskais pētījums. Projekts atbilst medicīnas un veselības zinātņu 3.1 Bāzes medicīna un 3.4 Medicīnas biotehnoloģijas nozarēm. Projekts nav saistīts ar saimniecisko darbību. Rezultātā tiks izstrādātas trīs publikācijas augsta līmeņa zinātniskajos žurnālos, izveidotas būtisku molekulāro informāciju saturošas datubāzes, izstrādātas molekulārās testēšanas metodes un metformīna efektivitātes un blakņu prognozēšanas algoritms.Plānotais projekta ilgums ir 36 mēneši, un tiek paredzēts, ka lielākā daļa ar veseliem dalībniekiem un T2D pacientiem saistīto eksperimentu tiks pabeigta līdz otrā gada beigām. Trešais gads pamatā tiks veltīts dzīvniekos veicamo eksperimentu daļai. Kopējās izmaksas būs sekojošas: 648 235.48 EUR, kas ietvers vadības izmaksas 111 916.74 EUR (17.26% no kopējā), personāla izmaksas 292 166.97 EUR (ieskaitot nodokļus un komandējumus), eksperimentiem nepieciešamo reaģentu un materiālu izmaksas 155 500.00 (ieskaitot VAT), 56 240.00 EUR ārpakalpojumiem, kas iekļauj metilēšanas analīzi, un ieguldījumu natūrā 32 411.77 EUR. (Latvian)
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1.1.1. Brief description of the project summary The aim of the project is to characterise metformin-related factors that have not been studied so far in order to identify stable markers for monitoring type 2 diabetes (T2D) therapy that are associated with metformin therapy efficacy and tolerance. One of the main activities will be to find a correlation between metformin-induced taxonomic and functional changes in intestinal microbiome and response to metformin therapy. The most relevant findings will be validated in a larger sample of T2D patients for evaluation of the application of these markers and the calculation of combined risk predictive factors. In order to understand the functional causes of patterns observed in humans, an in-depth microbiome study will be conducted on a background of metformin therapy in mouse models related to markers based on methylation and expression. One of the experiments will be based on mouse models with human characteristic intestinal microbiome. The planned project will raise awareness of the mechanisms underlying the efficacy and intolerance of metformin therapy. First, the activities included will help to clarify the role of intestinal microbiome in the response to metformin. Secondly, an insight into the relevance of the epigenetic markers and their functional effects in the context of metformin therapy will be provided. Experiments in mice will provide an opportunity to modulate the development of metformin adverse reactions, as well as to decipher changes in DNA methylation related to intestinal microbiome functions. The information provided will contribute to the improvement of prognostic algorithms for the outcome of metformin therapy and will provide a basis for the development of tools to increase the efficacy and tolerability of metformin therapy. Metformin; Type diabetes Pharmacogenetics, intestinal microbiome, pharmacoepigenomics1.1.2. Full summary of the project The purpose of the project is to characterise metformin treatment related factors that have not been studied so far in order to identify stable markers of type 2 diabetes (T2D) therapy that are associated with metformin efficacy and tolerance. We will examine the hypothesis that microbiome enhances the metformin glucose lowering effect and the decline in the diversity of intestinal microbiome leads to an increase in pathogens that correlate with side effects. This will be achieved by integrating data from the intestinal microbiome 16S rRNA gene and metagenoma sequencing in healthy subjects and patients with T2D before and after metformin. These cohorts will be included in the epigenetic and RNA expression profile analysis before and after treatment to investigate new metformin related markers. The most relevant findings will be validated in a larger sample of T2D patients for evaluation of the application of these markers and the calculation of combined risk predictive factors. The research category envisaged by the project is industrial research. The project complies with the medical and health sciences 3.1 Base medicine and 3.4 Medical biotechnology sectors. The project does not involve any economic activity. As a result, three publications in high-level scientific journals will be developed, databases containing relevant molecular information will be created, molecular testing methods developed and an algorithm for metformin efficiency and adverse events prediction.The planned duration of the project is 36 months, and it is expected that most of the experiments related to healthy participants and T2D patients will be completed by the end of the second year. The third year will basically be devoted to the part of experiments carried out in animals. The total costs will be as follows: EUR 648235.48, which will include management costs EUR 111916.74 (17.26 % of the total), personnel costs EUR 292166.97 (including taxes and travel), reagents and materials required for experiments 155 500.00 (including VAT), EUR 56240.00 for outsourcing, which includes methylation analysis, and investment in kind EUR 32411.77. (English)
15 July 2021
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1.1.1.Résumé du projet L’objectif du projet est de caractériser les facteurs liés au traitement par la metformine qui n’ont pas encore été étudiés afin d’identifier des marqueurs stables associés à l’efficacité et à la tolérance du traitement par la metformine pour surveiller le traitement du diabète de type 2 (T2D). L’une des principales activités consistera à étudier la corrélation entre les changements taxonomiques induits par la metformine et les changements fonctionnels du microbiome intestinal et la réponse au traitement par la metformine. Les principales constatations seront validées dans un échantillon plus vaste de patients atteints de T2D dans l’utilisation clinique de ces marqueurs et pour le calcul des facteurs d’anticipation des risques combinés. Afin de comprendre les causes fonctionnelles des patrons observés chez l’homme, une étude en profondeur du microbiome sera réalisée sur le fond de la thérapie par la metformine chez des modèles de souris liés à la méthylation et aux marqueurs basés sur l’expression. L’une des expériences sera basée sur des modèles de souris avec un microbiome intestinal spécifique à l’homme. Le projet prévu permettra de mieux faire connaître les mécanismes sous-jacents à l’efficacité et à l’intolérance du traitement par la metformine. Premièrement, les activités incluses aideront à clarifier le rôle du microbiome intestinal dans l’élaboration de la réponse à la metformine. Deuxièmement, il sera tenu compte de l’importance des marqueurs épigénétiques et de leurs effets fonctionnels dans le contexte du traitement par la metformine. Des expériences sur des souris seront l’occasion de moduler le développement d’effets indésirables de la metformine, ainsi que de déchiffrer les modifications de la méthylation de l’ADN associées à la fonction du microbiome intestinal. L’information obtenue contribuera à améliorer les algorithmes prédictifs des résultats du traitement par la metformine et fournira une base pour la mise au point de moyens permettant d’accroître l’efficacité et la tolérance du traitement par la metformine. metformine; diabète de type 2; pharmacogénétique, microbiome intestinal, pharmacoépigénomique1.1.2. L’objectif du projet est de caractériser les facteurs associés au traitement par la metformine qui n’ont pas encore été étudiés afin d’identifier des marqueurs stables associés à l’efficacité et à la tolérance du traitement par la metformine pour surveiller le traitement du diabète de type 2 (T2D). Nous examinerons l’hypothèse qui détermine que le microbiome améliore l’effet hypoglycémiant de la metformine, et une diminution de la diversité du microbiome intestinal conduit à une augmentation des agents pathogènes corrélés avec des effets secondaires. Pour ce faire, on intégrera les données du gène de l’ARNr 16S du microbiome intestinal et de l’analyse du séquençage des métagénomes chez les participants sains et les patients atteints de T2D avant et après la metformine. Ces cohortes seront incluses dans l’analyse des profils épigénétiques et d’expression de l’ARN avant et après le traitement afin d’identifier de nouveaux marqueurs associés à la metformine. Les principales constatations seront validées dans un échantillon plus vaste de patients atteints de T2D dans l’utilisation clinique de ces marqueurs et pour le calcul des facteurs d’anticipation des risques combinés. La catégorie de recherche envisagée par le projet est la recherche industrielle. Le projet correspond aux sciences médicales et de la santé 3.1 Médecine de base et 3.4 Industries de la biotechnologie médicale. Le projet n’est pas lié à l’activité économique. Par conséquent, trois publications seront produites dans des revues scientifiques de haut niveau, des bases de données contenant des informations moléculaires pertinentes ont été élaborées, des méthodes d’essai moléculaire ont été mises au point et des algorithmes d’efficacité de la metformine et de prédiction des effets indésirables ont été élaborés. La durée prévue du projet est de 36 mois et la plupart des expériences portant sur des participants en bonne santé et des patients atteints de T2D devraient être achevées d’ici la fin de la deuxième année. La troisième année sera essentiellement consacrée à la partie des expériences animales. Le coût total sera le suivant: 648 235,48 EUR, qui comprend les frais de gestion 111 916,74 EUR (17,26 % du total), 292 166,97 EUR (taxes et missions comprises), les coûts des réactifs et des matériaux pour les expériences 155 500,00 (TVA incluse), 56 240,00 EUR pour les services externalisés, y compris l’analyse de la méthylation, et 32 411,77 EUR pour les contributions en nature. (French)
25 November 2021
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1.1.1.Zusammenfassung des Projekts Ziel des Projekts ist es, Faktoren im Zusammenhang mit der Metformin-Therapie zu charakterisieren, die bisher noch nicht untersucht wurden, um stabile Marker im Zusammenhang mit Metformin-Behandlungseffektivität und Toleranz zur Überwachung der Therapie Typ-2-Diabetes (T2D) zu identifizieren. Eine der Haupttätigkeiten wird darin bestehen, die Korrelation zwischen Metformin-induzierten taxonomischen und funktionellen Veränderungen des Darmmikrobioms und der Reaktion auf Metformintherapie zu untersuchen. Wichtige Erkenntnisse werden in einer größeren Stichprobe von T2D-Patienten bei der klinischen Verwendung dieser Marker und für die Berechnung kombinierter Risiko antizipationsfaktoren validiert. Um die funktionellen Ursachen der beim Menschen beobachteten Muster zu verstehen, wird eine eingehende Mikrobiomstudie auf dem Hintergrund der Metformin-Therapie in Mäusenmodellen im Zusammenhang mit Methylierung und Expression basierten Markern durchgeführt. Eines der Experimente basiert auf Mausmodellen mit einem humanspezifischen Darmmikrobiom. Das geplante Projekt soll das Bewusstsein für die Mechanismen schärfen, die der Wirksamkeit und Unverträglichkeit der Metformin-Therapie zugrunde liegen. Erstens werden die Maßnahmen dazu beitragen, die Rolle des intestinalen Mikrobioms bei der Gestaltung der Reaktion auf Metformin zu klären. Zweitens wird die Bedeutung epigenetischer Marker und ihre funktionellen Wirkungen im Rahmen der Metformin-Therapie berücksichtigt. Experimente an Mäusen bieten die Möglichkeit, die Entwicklung von Metformin-Ergänzungen zu modulieren und DNA-Methylierungsänderungen zu entschlüsseln, die mit der intestinalen Mikrobiomfunktion assoziiert sind. Die gewonnenen Informationen werden zur Verbesserung der prädiktiven Algorithmen der Metformin-Behandlungsergebnisse beitragen und eine Grundlage für die Entwicklung von Mitteln zur Steigerung der Wirksamkeit und Verträglichkeit der Metformin-Therapie bilden. Metformin; Typ-2-Diabetes; Pharmakogenetik, intestinales Mikrobiom, Pharmakoepigenomik1.1.2. Ziel des Projekts ist es, die mit der Metformin-Therapie verbundenen Faktoren zu charakterisieren, die bisher noch nicht untersucht wurden, um stabile Marker im Zusammenhang mit Metformin-Behandlungseffektivität und Toleranz zur Überwachung der Therapie Typ-2-Diabetes (T2D) zu identifizieren. Wir werden die Hypothese untersuchen, die bestimmt, dass das Mikrobiom die Glukose-Senkung von Metformin verbessert, und eine Abnahme der Vielfalt des Darmmikrobioms führt zu einer Zunahme von Krankheitserregern, die mit Nebenwirkungen korreliert. Dies wird durch die Integration von Daten aus dem intestinalen Mikrobiom 16S rRNA-Gen und Metagenom-Sequenzierungsanalysen bei gesunden Teilnehmern und Patienten mit T2D vor und nach Metformin erreicht. Diese Kohorten werden in die Analyse von epigenetischen und RNA-Expressionsprofilen vor und nach der Therapie aufgenommen, um neue Marker zu identifizieren, die mit Metformin assoziiert sind. Wichtige Erkenntnisse werden in einer größeren Stichprobe von T2D-Patienten bei der klinischen Verwendung dieser Marker und für die Berechnung kombinierter Risiko antizipationsfaktoren validiert. Die Forschungskategorie des Projekts ist die industrielle Forschung. Das Projekt entspricht Medizin- und Gesundheitswissenschaften 3.1 Basismedizin und 3.4 Medizintechnik. Das Projekt steht nicht im Zusammenhang mit der Wirtschaftstätigkeit. Als Ergebnis werden drei Publikationen in wissenschaftlichen Fachzeitschriften auf hoher Ebene erstellt, Datenbanken mit relevanten molekularen Informationen entwickelt, molekulare Testmethoden entwickelt und Metformin-Wirksamkeits- und Vorhersagealgorithmen entwickelt. Die geplante Projektlaufzeit beträgt 36 Monate und die meisten Experimente im Zusammenhang mit gesunden Teilnehmern und T2D-Patienten sollen bis Ende des zweiten Jahres abgeschlossen sein. Das dritte Jahr wird im Wesentlichen dem Teil der Tierversuche gewidmet sein. Die Gesamtkosten betragen wie folgt: 648 235,48 EUR, einschließlich Verwaltungskosten 111 916,74 EUR (17,26 % der Gesamtsumme), Personalkosten 292 166,97 EUR (einschließlich Steuern und Dienstreisen), Kosten für Reagenzien und Materialien für Experimente 155 500,00 (einschließlich MwSt), 56 240,00 EUR für ausgelagerte Dienstleistungen einschließlich Methylierungsanalyse und 32 411,77 EUR für Sachleistungen. (German)
28 November 2021
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Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
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Identifiers
1.1.1.1/16/A/091
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