Study of interactions between factors affecting metformin therapy to predict treatment efficacy of type diabetes (Q3056323): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed an Item: modifying co-finance rate with the percentage) |
(Changed label, description and/or aliases in fr: translated_label) |
||
| label / fr | label / fr | ||
Étude des interactions entre les facteurs influençant le traitement par la metformine pour prédire l’efficacité du diabète de type 2 | |||
Revision as of 19:33, 25 November 2021
Project Q3056323 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Study of interactions between factors affecting metformin therapy to predict treatment efficacy of type diabetes |
Project Q3056323 in Latvia |
Statements
550,786.21 Euro
0 references
647,983.78 Euro
0 references
85.0 percent
0 references
1 January 2017
0 references
31 December 2019
0 references
Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
0 references
56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
0 references
1.1.1.Projekta kopsavilkuma īss apraksts Projekta mērķis ir raksturot līdz šim maz pētītus ar metformīna terapiju saistītus faktorus nolūkā identificēt stabilus, 2. tipa cukura diabēta (T2D) terapijas monitoringā pielietojamus marķierus, kas asociējas ar metformīna terapijas efektivitāti un toleranci. Viena no galvenajām aktivitātēm tiks veltīta korelācijas noskaidrošanai starp metformīna ierosinātām taksonomiskām un funkcionālām izmaiņām zarnu mikrobiomā un atbildes reakciju uz metformīna terapiju.. Būtiskākie atradumi tiks validēti lielākā T2D pacientu paraugkopā šo marķieru pielietojuma klīnikā izvērtēšanai un kombinētu riska paredzēšanas koeficientu aprēķināšanai. Lai izprastu cilvēkos novēroto likumsakarību funkcionālos cēloņus, tiks veikta padziļināta mikrobioma izpēte uz metformīna terapijas fona peļu modeļos saistībā ar uz metilēšanu un ekspresiju balstītiem marķieriem. Viens no eksperimentiem tiks balstīts uz peļu modeļiem ar cilvēkam raksturīgu zarnu mikrobiomu. Plānotais projekts padziļinās izpratni par metformīna terapijas efektivitātes un intolerances pamatā esošajiem mehānismiem. Pirmkārt, ietvertās aktivitātes palīdzēs noskaidrot zarnu mikrobioma lomu atbildes reakcijas veidošanā uz metformīnu. Otrkārt, tiks sniegts ieskats par epiģenētisko marķieru un to funkcionālās ietekmes nozīmi metformīna terapijas kontekstā. Eksperimenti pelēs sniegs iespēju modulēt metformīna blakņu attīstību, kā arī atšifrēt ar zarnu mikrobioma funkcijām saistītas DNS metilēšanas izmaiņas. Iegūtā informācija veicinās metformīna terapijas iznākuma prognostikas algoritmu uzlabošanu un nodrošinās pamatu līdzekļu attīstībai metformīna terapijas efektivitātes un panesamības paaugstināšanai.Keywords: metformīns; otrā tipa diabēts; farmakoģenētika, zarnu mikrobioms, farmakoepigenomika1.1.2. Projekta kopsavilkuma pilns apraksts Projekta mērķis ir raksturot līdz šim maz pētītus ar metformīna terapiju saistītus faktorus nolūkā identificēt stabilus, 2. tipa cukura diabēta (T2D) terapijas monitoringā pielietojamus marķierus, kas asociējas ar metformīna terapijas efektivitāti un toleranci. Mēs pārbaudīsim hipotēzi, kas nosaka, ka mikrobioms pastiprina metformīna glikozi pazeminošo efektu un zarnu mikrobioma daudzveidības samazināšanās noved pie patogēnu pieauguma, kas korelē ar blaknēm. Tas tiks sasniegts, integrējot datus no zarnu mikrobioma 16S rRNS gēna un metagenoma sekvenēšanas analīzes veselos dalībniekos un pacientos ar T2D pirms un pēc metformīna lietošanas. Dotās kohortas tiks iekļautas epiģenētisko un RNS ekspresijas profilu analīzē pirms un pēc terapijas, lai noskaidrotu jaunus ar metformīna lietošanu saistītus marķierus. Būtiskākie atradumi tiks validēti lielākā T2D pacientu paraugkopā šo marķieru pielietojuma klīnikā izvērtēšanai un kombinētu riska paredzēšanas koeficientu aprēķināšanai. Projektā paredzētā pētniecības kategorija ir rūpnieciskais pētījums. Projekts atbilst medicīnas un veselības zinātņu 3.1 Bāzes medicīna un 3.4 Medicīnas biotehnoloģijas nozarēm. Projekts nav saistīts ar saimniecisko darbību. Rezultātā tiks izstrādātas trīs publikācijas augsta līmeņa zinātniskajos žurnālos, izveidotas būtisku molekulāro informāciju saturošas datubāzes, izstrādātas molekulārās testēšanas metodes un metformīna efektivitātes un blakņu prognozēšanas algoritms.Plānotais projekta ilgums ir 36 mēneši, un tiek paredzēts, ka lielākā daļa ar veseliem dalībniekiem un T2D pacientiem saistīto eksperimentu tiks pabeigta līdz otrā gada beigām. Trešais gads pamatā tiks veltīts dzīvniekos veicamo eksperimentu daļai. Kopējās izmaksas būs sekojošas: 648 235.48 EUR, kas ietvers vadības izmaksas 111 916.74 EUR (17.26% no kopējā), personāla izmaksas 292 166.97 EUR (ieskaitot nodokļus un komandējumus), eksperimentiem nepieciešamo reaģentu un materiālu izmaksas 155 500.00 (ieskaitot VAT), 56 240.00 EUR ārpakalpojumiem, kas iekļauj metilēšanas analīzi, un ieguldījumu natūrā 32 411.77 EUR. (Latvian)
0 references
1.1.1. Brief description of the project summary The aim of the project is to characterise metformin-related factors that have not been studied so far in order to identify stable markers for monitoring type 2 diabetes (T2D) therapy that are associated with metformin therapy efficacy and tolerance. One of the main activities will be to find a correlation between metformin-induced taxonomic and functional changes in intestinal microbiome and response to metformin therapy. The most relevant findings will be validated in a larger sample of T2D patients for evaluation of the application of these markers and the calculation of combined risk predictive factors. In order to understand the functional causes of patterns observed in humans, an in-depth microbiome study will be conducted on a background of metformin therapy in mouse models related to markers based on methylation and expression. One of the experiments will be based on mouse models with human characteristic intestinal microbiome. The planned project will raise awareness of the mechanisms underlying the efficacy and intolerance of metformin therapy. First, the activities included will help to clarify the role of intestinal microbiome in the response to metformin. Secondly, an insight into the relevance of the epigenetic markers and their functional effects in the context of metformin therapy will be provided. Experiments in mice will provide an opportunity to modulate the development of metformin adverse reactions, as well as to decipher changes in DNA methylation related to intestinal microbiome functions. The information provided will contribute to the improvement of prognostic algorithms for the outcome of metformin therapy and will provide a basis for the development of tools to increase the efficacy and tolerability of metformin therapy. Metformin; Type diabetes Pharmacogenetics, intestinal microbiome, pharmacoepigenomics1.1.2. Full summary of the project The purpose of the project is to characterise metformin treatment related factors that have not been studied so far in order to identify stable markers of type 2 diabetes (T2D) therapy that are associated with metformin efficacy and tolerance. We will examine the hypothesis that microbiome enhances the metformin glucose lowering effect and the decline in the diversity of intestinal microbiome leads to an increase in pathogens that correlate with side effects. This will be achieved by integrating data from the intestinal microbiome 16S rRNA gene and metagenoma sequencing in healthy subjects and patients with T2D before and after metformin. These cohorts will be included in the epigenetic and RNA expression profile analysis before and after treatment to investigate new metformin related markers. The most relevant findings will be validated in a larger sample of T2D patients for evaluation of the application of these markers and the calculation of combined risk predictive factors. The research category envisaged by the project is industrial research. The project complies with the medical and health sciences 3.1 Base medicine and 3.4 Medical biotechnology sectors. The project does not involve any economic activity. As a result, three publications in high-level scientific journals will be developed, databases containing relevant molecular information will be created, molecular testing methods developed and an algorithm for metformin efficiency and adverse events prediction.The planned duration of the project is 36 months, and it is expected that most of the experiments related to healthy participants and T2D patients will be completed by the end of the second year. The third year will basically be devoted to the part of experiments carried out in animals. The total costs will be as follows: EUR 648235.48, which will include management costs EUR 111916.74 (17.26 % of the total), personnel costs EUR 292166.97 (including taxes and travel), reagents and materials required for experiments 155 500.00 (including VAT), EUR 56240.00 for outsourcing, which includes methylation analysis, and investment in kind EUR 32411.77. (English)
15 July 2021
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Identifiers
1.1.1.1/16/A/091
0 references