Towards the development of GPU accelerating ENALOS+ nodes (Q2720951)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q2720951 in Cyprus
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Towards the development of GPU accelerating ENALOS+ nodes |
Project Q2720951 in Cyprus |
Statements
21,241.5 Euro
0 references
24,990.0 Euro
0 references
85.0 percent
0 references
7 July 2017
0 references
1 February 2019
0 references
NovaMechanics Ltd
0 references
Η επιτυχία της ανακάλυψης νέων φαρμάκων, καθώς επίσης και του σχεδιασμού νέων υλικών με τη βοήθεια της χημειοπληροφορικής, εξαρτώνται σε μεγάλο βαθμό από την επιτυχία των υπολογιστικών μεθόδων και των εργαλείων που χρησιμοποιούνται για την επεξεργασία, την ανάλυση και την ερμηνεία των χημικών και βιολογικών δεδομένων και ιδιοτήτων. Η ανάγκη για αποτελεσματική εξόρυξη και ανάλυση δεδομένων είναι πλέον ιδιαίτερα έντονη, κυρίως λόγω του συνεχώς αυξανόμενου όγκου των δεδομένων που παράγονται από τις πειραματικές μεθόδους υψηλής απόδοσης και μαζικής πειραματικής αξιολόγησης δειγμάτων - High Throughput Screening (HTS). Για την αντιμετώπιση της αναδυόμενης αυτής ανάγκης, η εταιρία NovaMechanis Ltd έχει αναπτύξει και ενσωματώσει στην εργαλειοθήκη ?Enalos+? ένα ευρύ φάσμα κόμβων, λειτουργικών στο πλαίσιο της ηλεκτρονικής πλατφόρμας ΚΝΙΜΕ, οι οποίοι προσφέρουν την δυνατότητα χημειοπληροφορικής ανάλυσης δεδομένων και τον προσδιορισμό της δραστικότητας και ιδιοτήτων χημικών ενώσεων. Το πρόγραμμα EnalosGPU θα βασιστεί στη υπάρχουσα τεχνογνωσία και θα διερευνήσει-επαληθεύσει το πλεονέκτημα των υπολογισμών σε GPU σε μια προσπάθεια να: i. Επιτραπεί η ανάλυση μεγάλου όγκου δεδομένων στο ΚΝΜΕ μέσω των κόμβων Enalos+ ii. Επιταχυνθούν οι υπολογισμοί που πραγματοποιούνται στο ΚΝΙΜΕ μέσω των κόμβων Enalos+ iii. Προτείνει νέους, χρονικά και οικονομικά αποδοτικούς κόμβους, οι οποίοι θα ενσωματωθούν στην εργαλειοθήκη Enalos+ Πρόσφατες έρευνες έχουν επισημάνει τα πλεονεκτήματα των υπολογισμών σε GPU έναντι αυτών σε CPU. Αυτή η προσέγγιση θεωρείται κρίσιμη για την επιτάχυνση των υπολογισμών μέσω των κόμβων Enalos+, κυρίως λόγω του αυξανόμενου όγκου δεδομένων, της απαίτησης για χρονικά και οικονομικά αποδοτική επεξεργασία τους, που θα επιταχύνει τους υπολογισμούς και της ανάγκης για εκμετάλλευση των συνεχώς αυξανόμενων δυνατοτήτων των διαθέσιμων υπέρ-υπολογιστών, οι οποίοι είναι πλέον εύκολα προσβάσιμοι στο ευρύ κοινό. Οι κύριοι στόχοι του προγράμματος EnalosGPU συνοψίζονται ως εξής: i. Διερ (Greek)
0 references
The success of the discovery of new drugs, as well as the design of new materials with the help of cheminformatics, depend largely on the success of the computational methods and tools used for the processing, analysis and interpretation of chemical and biological data and properties. The need for efficient data mining and analysis is now particularly pronounced, mainly due to the ever-increasing volume of data produced by high-performance experimental methods and mass experimental sample evaluation – High Throughput Screening (HTS). To address this emerging need, NovaMechanis Ltd has developed and integrated into the toolkit?Enalos+; a wide range of nodes, functional within the framework of the KNIME electronic platform, which offer the possibility of chemo-informatic data analysis and the determination of the activity and properties of chemical compounds. The EnalosGPU project will build on existing know-how and explore-verify the advantage of GPU calculations in an effort to: I. A large volume of data can be analysed in the CPU via Enalos+ ii nodes. Accelerate the calculations carried out in the KNIME via Enalos+ iii nodes. It proposes new, time-effective and cost-effective nodes, which will be integrated into the Enalos+ toolkit Recent research has highlighted the advantages of GPU calculations over those in CPUs. This approach is considered crucial for accelerating calculations through Enalos+ knots, mainly due to the increasing volume of data, the requirement for time and cost-effective processing, which will accelerate calculations and the need to exploit the ever-increasing potential of available supercomputers, which are now easily accessible to the general public. The main objectives of the EnalosGPU project are summarised as follows: I. dir (English)
31 May 2021
0 references
*Δεν έχει γεωγραφική διάσταση*
0 references
Identifiers
34430
0 references