Develop a new method for the identification and identification of bacterial colonies using neural networks and Machine Learning (Machine Learning) algorithms. (Q77597)
Jump to navigation
Jump to search
Project in Poland financed by DG Regio
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Develop a new method for the identification and identification of bacterial colonies using neural networks and Machine Learning (Machine Learning) algorithms. |
Project in Poland financed by DG Regio |
Statements
1,850,331.93 zloty
0 references
2,437,811.1 zloty
0 references
75.9 percent
0 references
1 July 2018
0 references
30 October 2020
0 references
NEUROSYS SPÓŁKA Z OGRANICZONĄ ODPOWIEDZIALNOŚCIĄ
0 references
51°7'34.7"N, 16°58'41.5"E
0 references
Numer_referencyjny_programu_pomocowego: SA.41471(2015/X) Przeznaczenie_pomocy_publicznej: art. 25 rozporządzenia KE nr 651/2014 z dnia 17 czerwca 2014 r. uznające niektóre rodzaje pomocy za zgodne z rynkiem wewnętrznym w stosowaniu art. 107 i 108 Traktatu (Dz. Urz. UE L 187/1 z 26.06.2014). Celem projektu jest opracowanie algorytmów umożliwiających zautomatyzowanie analizy posiewów hodowli bakteryjnych na szalkach Petriego, w szczególności klasyfikacji rodzaju posianych bakterii oraz określenie liczby kolonii bakteryjnych. Algorytmy zostaną przygotowane w oparciu o metody uczenia głębokiego (ang. deep learning), które wg aktualnej wiedzy naukowej najlepiej sprawdzają się przy rozpoznawaniu obrazów i w naturalny sposób mogą być wykorzystane do identyfikowania kluczowych cech morfologicznych kolonii bakteryjnych. We współpracy z ekspertem z zakresu mikrobiologii zostanie przygotowana baza danych treningowych, potrzebnych do dopasowania parametrów sztucznych sieci neuronowych. Zawierać będzie ona dokładnie opisane zdjęcia szalek Petriego, na których zostały wysiane ściśle określone szczepy bakteryjne, a które będzie można wykorzystać w procesie uczenia nadzorowanego (ang. supervised learning). Dodatkowych informacji na temat próbek dostarczy analiza widma (spektralna) oraz trójwymiarowa mapa wierzchołków wykonana metodą skanowania laserowego. Do klasyfikacji próbek zostaną wykorzystane konwolucyjne sieci neuronowe (ang. convolutional neural networks), których hiperparametry zostaną dobrane pod rozważany problem, a ich optymalne wartości znalezione metodą sprawdzianu krzyżowego, co pozwoli uniknąć problemów z "niedouczeniem" (ang. underfitting) lub "przeuczeniem" (ang. overfitting) modelu. Zostanie wykonana analiza porównawcza wyników otrzymanych z lub bez uwzględnienia dodatkowych danych spektralnych. Ostatecznym produktem będzie specjalistyczne oprogramowanie wykorzystujące stworzone algorytmy do analizy posiewów bakteryjnych. (Polish)
0 references
Identifiers
POIR.01.01.01-00-0040/18
0 references