ERDF — UNICAEN — Alloc cofin — Julie SCHWARTZ (Q3673322)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3673322 in France
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ERDF — UNICAEN — Alloc cofin — Julie SCHWARTZ |
Project Q3673322 in France |
Statements
43,092.0 Euro
0 references
86,184.02 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
1 November 2015
0 references
30 April 2019
0 references
UNIVERSITE DE CAEN NORMANDIE
0 references
14032
0 references
La séquence du génome d'un organisme constitue une base de données incontournable pour le développement dune aquaculture moderne. En effet, par la mise en oeuvre de méthodologies de génomique fonctionnelle, l'exploitation de ces données offre l'opportunité d'explorer au niveau moléculaire les fonctions physiologiques dun organisme et de comprendre sa capacité à être adapté à son milieu et à réagir à ses modifications. L'émergence récente de données transcriptomiques (Fleury et al, 2009) et la publication de la séquence de son génome (Zhang et al, 2012) positionne l'huitre creuse Crassostrea gigas parmi les quelques espèces de non vertébrés d'intérêt aquacole pour lesquelles une approche fonctionnelle peut être envisagée.Chez les métazoaires, les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) régulent à l'échelle de l'organisme l'ensemble des fonctions biologiques comme la reproduction, la nutrition, la croissance, le stress, limmunité et les métabolismes. L'identification de leur ligand spécifique constitue donc non seulement un moyen d'identifier de nouveaux facteurs endocriniens mais aussi de disposer de marqueurs de l'état physiologique de l'animal.Le génome de l'huitre code 498 RCPGs orphelins. Dans un contexte favorable, où nous disposons de la méthodologie dendocrinologie inverse pour identifier des ligands de récepteurs orphelins (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) en éprouvant l'activité d'un panel de ligands potentiels disponibles suite à la caractérisation du neuropeptidome de l'huitre (Stewart et al, 2014), la mise en oeuvre de cette approche permettra d'identifier de nouveaux régulateurs clé de la physiologie de l'huitre dont la connaissance constitue un atout pour la maitrise des cycles de vie dans un contexte d'aquaculture. En offrant l'opportunité d'examiner la nature des couples ligand/récepteur chez un Lophotrochozoaire, cette étude s'appuyant également sur les connaissances acquises chez les modèles vertébrés et insectes contribuera à nourrir des hypothèses sur l'évolution des systèmes endocriniens au sein des animaux bilatériens. (French)
0 references
The sequence of an organism’s genome is an indispensable database for the development of modern aquaculture. By implementing functional genomics methodologies, the exploitation of these data offers the opportunity to explore at the molecular level the physiological functions of an organism and to understand its ability to be adapted to its environment and to react to its modifications. The recent emergence of transcriptomic data (Fleury et al, 2009) and the publication of the sequence of its genome (Zhang et al, 2012) position the hollow otter Crassostrea gigas among the few species of non-vertebrates of aquaculture interest for which a functional approach can be considered.In metazoa, G-protein receptors (RCPG) regulate all biological functions such as reproduction, nutrition, growth, stress, immunity and metabolism. The identification of their specific ligand is therefore not only a means of identifying new endocrine factors, but also of having markers of the physiological state of the animal.The genome of the oorious code 498 RCPGs orphans. In a favourable context, where we have the reverse dendocrinology methodology for identifying orphan receptor ligands (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) by testing the activity of a panel of potential ligands available following the characterisation of oyster neuropeptidoma (Stewart et al, 2014), the implementation of this approach will enable the identification of new key regulators of oyster physiology whose knowledge is an asset for mastering life cycles in an aquaculture context. By offering the opportunity to examine the nature of ligand/receptor pairs in a lophotrochozoa, this study also builds on the knowledge gained in vertebrate and insect models will contribute to hypothesising the evolution of endocrine systems in bilaterian animals. (English)
18 November 2021
0.1524045208832369
0 references
Die Genomsequenz eines Organismus ist eine unverzichtbare Datenbank für die Entwicklung einer modernen Aquakultur. Durch die Anwendung von Methoden der funktionellen Genomik bietet die Auswertung dieser Daten die Gelegenheit, auf molekularer Ebene die physiologischen Funktionen eines Organismus zu erforschen und seine Fähigkeit zu verstehen, sich an seine Umgebung anzupassen und auf seine Veränderungen zu reagieren. Die jüngste Entstehung von Transkriptom-Daten (Fleury et al., 2009) und die Veröffentlichung der Sequenz seines Genoms (Zhang et al, 2012) positionieren das Crassostrea gigas-Hohlöl als eine der wenigen Arten von Nichtwirbeltieren von Aquakulturinteresse, für die ein funktioneller Ansatz in Betracht gezogen werden kann.Bei Metazoen, G-Protein-gekoppelten Rezeptoren (RCPG) regulieren alle biologischen Funktionen wie Fortpflanzung, Ernährung, Wachstum, Stress, Immunität und Stoffwechsel auf körperweiter Ebene. Die Identifizierung ihres spezifischen Ligands ist daher nicht nur ein Mittel, um neue endokrine Faktoren zu identifizieren, sondern auch, um über Markierungen des physiologischen Zustands des Tieres zu verfügen.Das Genom des Hummers 498 RCPGs-Orphan-Code. In einem günstigen Umfeld, in dem wir über die umgekehrte Dendocrinologie-Methodik verfügen, um Orphan-Rezeptor-Liganden zu identifizieren (Beets et al., 2012, Bigot et al, 2014), indem wir die Aktivität eines Panels potenzieller Liganden testen, die nach der Charakterisierung des Neuropeptidoms des Austerns verfügbar sind (Stewart et al, 2014), wird die Umsetzung dieses Ansatzes dazu beitragen, neue Schlüsselregulatoren für die Physiologie des Öls zu ermitteln, deren Kenntnis ein Plus für die Kontrolle der Lebenszyklen in Aquakultur darstellt. Indem sie die Möglichkeit bietet, die Art von Ligan/Rezeptor-Paaren bei einem Lophotrochozoar zu untersuchen, wird diese Studie auch auf Erkenntnissen aus Wirbeltier- und Insektenmodellen aufbauen, um Hypothesen über die Entwicklung der endokrinen Systeme bei bilateralen Tieren zu nähren. (German)
1 December 2021
0 references
De sequentie van het genoom van een organisme is een onmisbare databank voor de ontwikkeling van de moderne aquacultuur. Door functionele genomicamethodologieën toe te passen, biedt de exploitatie van deze gegevens de mogelijkheid om op moleculair niveau de fysiologische functies van een organisme te onderzoeken en te begrijpen dat het in staat is zich aan zijn omgeving aan te passen en te reageren op de wijzigingen ervan. De recente opkomst van transcriptomische gegevens (Fleury et al, 2009) en de publicatie van de sequentie van het genoom (Zhang et al, 2012) positioneren de holle otter Crassostrea gigas onder de weinige soorten niet-gewervelde aquacultuursoorten waarvoor een functionele aanpak kan worden overwogen.In metazoa reguleren G-eiwitreceptoren (RCPG) alle biologische functies zoals voortplanting, voeding, groei, stress, immuniteit en metabolisme. De identificatie van hun specifieke ligand is daarom niet alleen een middel om nieuwe endocriene factoren te identificeren, maar ook om merkers te hebben van de fysiologische toestand van het dier.Het genoom van de oorious code 498 RCPGs weeskinderen. In een gunstige context, waar we de omgekeerde dendocrinologiemethode hebben voor het identificeren van weesreceptor ligands (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) door de activiteit van een panel van potentiële liganden te testen na de karakterisering van oester neuropeptidoma (Stewart et al, 2014), zal de toepassing van deze aanpak de identificatie mogelijk maken van nieuwe belangrijke regelgevers van oesterfysiologie waarvan de kennis een troef is voor het beheersen van levenscyclusen in een aquacultuurcontext. Door de mogelijkheid te bieden om de aard van ligand/receptorparen in een lophotrochozoa te onderzoeken, bouwt deze studie ook voort op de kennis die is opgedaan in gewervelde en insectenmodellen zal bijdragen aan het hypothesen van de evolutie van endocriene systemen bij bilaterische dieren. (Dutch)
6 December 2021
0 references
La sequenza del genoma di un organismo è una banca dati indispensabile per lo sviluppo dell'acquacoltura moderna. Implementando metodologie di genomica funzionale, lo sfruttamento di questi dati offre l'opportunità di esplorare a livello molecolare le funzioni fisiologiche di un organismo e di comprendere la sua capacità di adattarsi al suo ambiente e di reagire alle sue modifiche. La recente comparsa di dati trascrittimici (Fleury et al, 2009) e la pubblicazione della sequenza del suo genoma (Zhang et al, 2012) collocano la lontra cava Crassostrea gigas tra le poche specie di non-vertebrati di interesse per l'acquacoltura per cui si può considerare un approccio funzionale.In metazoa, i recettori delle proteine G (RCPG) regolano tutte le funzioni biologiche quali la riproduzione, la nutrizione, la crescita, lo stress, l'immunità e il metabolismo. L'identificazione del loro specifico ligand è quindi non solo un mezzo per identificare nuovi fattori endocrini, ma anche di avere marcatori dello stato fisiologico dell'animale.Il genoma del codice ooristico 498 RCPGs orfani. In un contesto favorevole, dove abbiamo la metodologia di dendocrinologia inversa per l'identificazione dei ligandi dei recettori orfani (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) testando l'attività di un gruppo di potenziali ligandi disponibili a seguito della caratterizzazione del neuropeptidoma dell'ostrica (Stewart et al, 2014), l'attuazione di questo approccio consentirà di individuare nuovi regolatori chiave della fisiologia delle ostriche la cui conoscenza è un bene per padroneggiare i cicli di vita in un contesto di acquacoltura. Offrendo l'opportunità di esaminare la natura delle coppie di ligando/recettore in un lophotrochozoa, questo studio si basa anche sulle conoscenze acquisite nei modelli di vertebrati e insetti contribuirà a ipotizzare l'evoluzione dei sistemi endocrini negli animali bilateri. (Italian)
13 January 2022
0 references
La secuencia del genoma de un organismo es una base de datos indispensable para el desarrollo de la acuicultura moderna. Mediante la aplicación de metodologías de genómica funcional, la explotación de estos datos ofrece la oportunidad de explorar a nivel molecular las funciones fisiológicas de un organismo y comprender su capacidad de adaptarse a su entorno y de reaccionar a sus modificaciones. La reciente aparición de datos transcriptómicos (Fleury et al, 2009) y la publicación de la secuencia de su genoma (Zhang et al, 2012) posicionan la nutria hueca Crassostrea gigas entre las pocas especies de novertebrados de interés acuícola para las que se puede considerar un enfoque funcional.En metazoos, los receptores de proteína G (RCPG) regulan todas las funciones biológicas como la reproducción, nutrición, crecimiento, estrés, inmunidad y metabolismo. Por lo tanto, la identificación de su ligando específico no es solo un medio para identificar nuevos factores endocrinos, sino también para tener marcadores del estado fisiológico del animal. El genoma del oorious código 498 RCPG huérfanos. En un contexto favorable, donde tenemos la metodología de dendocrinología inversa para la identificación de ligandos receptores huérfanos (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) mediante el ensayo de la actividad de un panel de ligandos potenciales disponibles tras la caracterización del neuropeptidoma de ostras (Stewart et al, 2014), la implementación de este enfoque permitirá la identificación de nuevos reguladores clave de la fisiología de las ostras cuyo conocimiento es un activo para dominar los ciclos de vida en un contexto acuícola. Al ofrecer la oportunidad de examinar la naturaleza de los pares ligando/receptor en un lophotrochozoa, este estudio también se basa en los conocimientos adquiridos en modelos de vertebrados e insectos contribuirá a la hipótesis de la evolución de los sistemas endocrinos en animales bilatarios. (Spanish)
14 January 2022
0 references
Organismi genoomi järjestus on asendamatu andmebaas kaasaegse vesiviljeluse arendamiseks. Funktsionaalsete genoomikameetodite rakendamisega annab nende andmete kasutamine võimaluse uurida molekulaartasandil organismi füsioloogilisi funktsioone ja mõista selle võimet kohaneda keskkonnaga ja reageerida selle muudatustele. Hiljutine transkriptnoomiliste andmete tekkimine (Fleury et al, 2009) ja selle genoomi järjestuse avaldamine (Zhang et al, 2012) asetavad õõnsa saarma Crassostrea gigas väheste vesiviljelust huvitavate mitteselgrootute liikide seas, mille puhul võib kaaluda funktsionaalset lähenemisviisi. metasoodes reguleerivad G-valgu retseptorid (RCPG) kõiki bioloogilisi funktsioone, nagu paljunemine, toitumine, kasv, stress, immuunsus ja ainevahetus. Seetõttu ei ole nende konkreetse ligandi identifitseerimine mitte ainult vahend uute endokriinsete tegurite kindlakstegemiseks, vaid ka looma füsioloogilise seisundi markerite olemasoluks.Seega genoomi genoomi sees kood 498 RCPGs orvud. Soodsas kontekstis, kus meil on orbretseptori ligandi kindlakstegemiseks kasutatav pöörddedodokrinoloogiline metoodika (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014), katsetades võimalike ligandite paneeli tegevust pärast austri neuropeptidoomi iseloomustamist (Stewart et al, 2014), võimaldab selle lähenemisviisi rakendamine kindlaks teha uued austri füsioloogia peamised reguleerijad, kelle teadmised aitavad omandada elutsükliid vesiviljeluse kontekstis. Pakkudes võimalust uurida ligandi/retseptori paaride olemust lophotrochozoas, tugineb see uuring ka selgroogsete ja putukamudelitega saadud teadmistele, mis aitavad hüpoteesida bilaterialoomade endokriinsüsteemide arengut. (Estonian)
11 August 2022
0 references
Organizmo genomo seka yra būtina šiuolaikinės akvakultūros plėtros duomenų bazė. Taikant funkcinės genomikos metodikas, šių duomenų panaudojimas suteikia galimybę molekuliniu lygmeniu ištirti organizmo fiziologines funkcijas ir suprasti jo gebėjimą prisitaikyti prie aplinkos ir reaguoti į jo modifikacijas. Dėl neseniai atsiradusių transkriptografinių duomenų (Fleury et al, 2009) ir jo genomo sekos paskelbimo (Zhang et al, 2012) tuščiavidurė ūdra Crassostrea gigas yra viena iš nedaugelio akvakultūros interesų nestuburinių rūšių, kurioms gali būti taikomas funkcinis metodas. Metazoa G baltymų receptoriai (RCPG) reguliuoja visas biologines funkcijas, tokias kaip dauginimasis, mityba, augimas, stresas, imunitetas ir medžiagų apykaita. Todėl jų specifinio ligando identifikavimas yra ne tik priemonė nustatyti naujus endokrininius veiksnius, bet ir gyvūno fiziologinės būklės žymenys.Pakvaišusio kodo 498 RCPG genomas našlaičiai. Palankiomis aplinkybėmis, kai turime atvirkštinę dendokrinologijos metodiką, skirtą retųjų receptorių ligandų nustatymui (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014), išbandydami galimų ligandų grupės veiklą po austrių neuropeptidomos apibūdinimo (Stewart et al, 2014), šio metodo įgyvendinimas leis nustatyti naujas pagrindines austrių fiziologijos reguliatorius, kurių žinios yra privalumas įsisavinant gyvenimo ciklus akvakultūros kontekste. Šis tyrimas, suteikiantis galimybę ištirti ligandų/receptorių porų pobūdį lofotrochozoa, taip pat remiasi žiniomis, įgytomis stuburinių ir vabzdžių modeliuose, padės hipotezuoti endokrininių sistemų raidą bilaterijos gyvūnų organizme. (Lithuanian)
11 August 2022
0 references
Slijed genoma organizma nezamjenjiv je baza podataka za razvoj moderne akvakulture. Primjenom funkcionalnih genomskih metodologija, iskorištavanje tih podataka pruža mogućnost da se na molekularnoj razini istraže fiziološke funkcije organizma i da se razumije njegova sposobnost prilagodbe okolišu i reagiranja na njegove modifikacije. Nedavna pojava transkriptomskih podataka (Fleury et al, 2009) i objavljivanje slijeda njegovog genoma (Zhang et al., 2012.) pozicioniraju šuplju vidru Crassostrea gigas među nekoliko vrsta nekralježnjaka od interesa akvakulture za koje se može razmotriti funkcionalan pristup.U metazoi, G-protein receptori (RCPG) reguliraju sve biološke funkcije kao što su razmnožavanje, prehrana, rast, stres, imunitet i metabolizam. Identifikacija njihovog specifičnog liganda stoga nije samo sredstvo za prepoznavanje novih endokrinih čimbenika, već i markere fiziološkog stanja životinje.Ganom zloglasnog koda 498 RCPGs siročadi. U povoljnom kontekstu, gdje imamo obrnutu metodologiju dendokrinologije za identifikaciju liganda receptora siročadi (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) testiranjem aktivnosti panela potencijalnih liganda dostupnih nakon karakterizacije neuropeptidome kamenica (Stewart et al., 2014.), provedba ovog pristupa omogućit će identifikaciju novih ključnih regulatora fiziologije kamenica čije je znanje sredstvo za savladavanje životnog ciklusa u akvakulturnom kontekstu. Nudeći mogućnost ispitivanja prirode parova ligand/receptora u lophotrochozoa, ova studija se također temelji na znanju stečenom u modelima kralježnjaka i insekata doprinijet će hipoteziizaciji evolucije endokrinih sustava kod životinja bioterijana. (Croatian)
11 August 2022
0 references
Η αλληλουχία του γονιδιώματος ενός οργανισμού αποτελεί απαραίτητη βάση δεδομένων για την ανάπτυξη της σύγχρονης υδατοκαλλιέργειας. Με την εφαρμογή λειτουργικών μεθοδολογιών γονιδιωματικής, η αξιοποίηση αυτών των δεδομένων προσφέρει την ευκαιρία να διερευνηθούν σε μοριακό επίπεδο οι φυσιολογικές λειτουργίες ενός οργανισμού και να κατανοηθεί η ικανότητά του να προσαρμόζεται στο περιβάλλον του και να αντιδρά στις τροποποιήσεις του. Η πρόσφατη εμφάνιση μεταγραφικών δεδομένων (Fleury et al, 2009) και η δημοσίευση της ακολουθίας του γονιδιώματος (Zhang et al, 2012) τοποθετούν την κοίλη ενυδρίδα Crassostrea gigas μεταξύ των λίγων ειδών μη σπονδυλωτών υδατοκαλλιέργειας για τα οποία μπορεί να εξεταστεί μια λειτουργική προσέγγιση.Σε μεταζωα, οι υποδοχείς G-πρωτεϊνών (RCPG) ρυθμίζουν όλες τις βιολογικές λειτουργίες όπως η αναπαραγωγή, η διατροφή, η ανάπτυξη, το στρες, η ανοσία και ο μεταβολισμός. Ως εκ τούτου, ο προσδιορισμός του ειδικού συνδέσμου τους δεν αποτελεί μόνο μέσο για τον προσδιορισμό νέων ενδοκρινικών παραγόντων, αλλά και για την ύπαρξη δεικτών της φυσιολογικής κατάστασης του ζώου.Το γονιδίωμα του προοριώδους κωδικού 498 RCPGs ορφανά. Σε ένα ευνοϊκό πλαίσιο, όπου έχουμε τη μεθοδολογία αντίστροφης δεδοκρινολογίας για τον προσδιορισμό των ορφανών υποδοχέων (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) μέσω της δοκιμής της δραστηριότητας μιας ομάδας πιθανών συνδέσμων που διατίθενται μετά τον χαρακτηρισμό του νευροπεπτιδώματος των στρειδιών (Stewart et al, 2014), η εφαρμογή αυτής της προσέγγισης θα επιτρέψει τον εντοπισμό νέων βασικών ρυθμιστών της φυσιολογίας των στρειδιών, των οποίων οι γνώσεις αποτελούν πλεονέκτημα για τον έλεγχο των κύκλων ζωής σε ένα πλαίσιο υδατοκαλλιέργειας. Προσφέροντας την ευκαιρία να εξεταστεί η φύση των ζευγών δεσίματος/υποδοχέα σε lophotrochozoa, η μελέτη αυτή βασίζεται επίσης στη γνώση που αποκτήθηκε σε μοντέλα σπονδυλωτών και εντόμων, θα συμβάλει στην υπόθεση της εξέλιξης των ενδοκρινικών συστημάτων στα ζώα της βιλατρίας. (Greek)
11 August 2022
0 references
Postupnosť genómu organizmu je nevyhnutnou databázou pre rozvoj modernej akvakultúry. Zavedením funkčných genomických metodík ponúka využívanie týchto údajov príležitosť preskúmať na molekulárnej úrovni fyziologické funkcie organizmu a pochopiť jeho schopnosť prispôsobiť sa jeho prostrediu a reagovať na jeho modifikácie. Nedávny výskyt transkriptomických údajov (Fleury et al., 2009) a uverejnenie sekvencie jeho genómu (Zhang et al., 2012) umiestnia dutú vydru Crassostrea gigas medzi niekoľko druhov bezstavovcov záujmu akvakultúry, pre ktoré je možné zvážiť funkčný prístup.V metazoa, G-proteínové receptory (RCPG) regulujú všetky biologické funkcie, ako je reprodukcia, výživa, rast, stres, imunita a metabolizmus. Identifikácia ich špecifického ligandu preto nie je len prostriedkom identifikácie nových endokrinných faktorov, ale aj znakmi fyziologického stavu zvieraťa.Genom kód 498 RCPG siroty. V priaznivom kontexte, kde máme metódu reverznej dendocrinológie na identifikáciu ligandov receptorov na ojedinelé ochorenia (Beets et al, 2012, Bigot et al., 2014) testovaním činnosti panelu potenciálnych ligandov dostupných po charakterizácii neuropeptidómu ustríc (Stewart a kol., 2014), implementácia tohto prístupu umožní identifikáciu nových kľúčových regulátorov fyziológie ustríc, ktorých vedomosti sú prínosom pre zvládnutie životných cyklov v akvakultúre. Tým, že táto štúdia ponúka príležitosť preskúmať povahu párov ligandov/receptorov v lophotrochozoa, stavia aj na poznatkoch získaných v modeloch stavovcov a hmyzu, prispeje k hypotéze vývoja endokrinných systémov u bilaterských zvierat. (Slovak)
11 August 2022
0 references
Organismin genomin sekvenssi on välttämätön tietokanta nykyaikaisen vesiviljelyn kehittämiseksi. Käyttämällä funktionaalisia genomiikkamenetelmiä näiden tietojen hyödyntäminen tarjoaa mahdollisuuden tutkia molekyylitasolla organismin fysiologisia toimintoja ja ymmärtää sen kykyä sopeutua ympäristöönsä ja reagoida sen muutoksiin. Äskettäin ilmestynyt transcriptomic data (Fleury et al, 2009) ja sen genomin sekvenssin (Zhang et al, 2012) julkaiseminen asettaa ontto saukko Crassostrea gigas niiden harvojen muiden kuin selkärangattomien vesiviljelyyn liittyvien lajien joukkoon, joihin voidaan harkita toiminnallista lähestymistapaa. Metazooissa G-proteiinireseptorit (RCPG) säätelevät kaikkia biologisia toimintoja, kuten lisääntymistä, ravitsemusta, kasvua, stressiä, immuniteettia ja aineenvaihduntaa. Sen vuoksi niiden erityisen ligandin tunnistaminen ei ole ainoastaan keino tunnistaa uusia hormonitoimintaa koskevia tekijöitä vaan myös eläimen fysiologisen tilan merkkiaineita.Horious code 498 RCPGs orpojen genomi. Suotuisassa tilanteessa, jossa meillä on käänteisen dendocrinologian menetelmä orporeseptoriligandien tunnistamiseksi (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) testaamalla osster neuropeptidoman (Stewart et al, 2014) luonnehdinnan jälkeen saatavilla olevien mahdollisten ligandien paneelin toimintaa, tämän lähestymistavan täytäntöönpano mahdollistaa uusien keskeisten ossterifysiologian sääntelyelinten tunnistamisen, joiden tietämys on voimavara elinkaarten hallitsemiseksi vesiviljelyalalla. Tarjoamalla mahdollisuuden tutkia lophotrochozoan ligan/reseptoriparien luonnetta tämä tutkimus perustuu myös selkärankaisten ja hyönteisten malleista saatuun tietoon, mikä edistää bilaterian eläinten endokriinisten järjestelmien kehityksen hypoteesia. (Finnish)
11 August 2022
0 references
Sekwencja genomu organizmu jest niezbędną bazą danych dla rozwoju nowoczesnej akwakultury. Wykorzystanie tych danych dzięki wdrożeniu metodologii genomiki funkcjonalnej daje możliwość zbadania na poziomie molekularnym funkcji fizjologicznych organizmu i zrozumienia jego zdolności do dostosowania się do środowiska i reagowania na jego modyfikacje. Niedawne pojawienie się danych transkryptomicznych (Fleury i in., 2009) oraz publikacja sekwencji genomu (Zhang et al, 2012) umieszczają wydrążoną wydry Crassostrea gigas wśród nielicznych gatunków niekręgowców będących przedmiotem zainteresowania akwakultury, dla których można rozważyć podejście funkcjonalne.W metazoa receptory białka G (RCPG) regulują wszystkie funkcje biologiczne, takie jak rozmnażanie, odżywianie, wzrost, stres, odporność i metabolizm. Identyfikacja ich specyficznego ligandu jest zatem nie tylko sposobem identyfikacji nowych czynników endokrynologicznych, ale także obecności markerów stanu fizjologicznego zwierzęcia. genom owczego kodu 498 RCPGs sieroty. W korzystnym kontekście, w którym mamy metodologię odwrotnej denokrynologii identyfikacji ligandów receptorów sierocych (Beets et al, 2012, Bigot i in., 2014) poprzez testowanie aktywności panelu potencjalnych ligandów dostępnych po charakteryzacji neuropeptidoma ostryg (Stewart i in., 2014), wdrożenie tego podejścia umożliwi identyfikację nowych kluczowych regulatorów fizjologii ostryg, których wiedza jest atutem do opanowania cykli życia w kontekście akwakultury. Oferując możliwość zbadania charakteru par ligand/receptor w lophotrochozoa, badanie to opiera się również na wiedzy zdobytej w modelach kręgowców i owadów przyczyni się do hipotezy ewolucji układów hormonalnych u zwierząt bilateryjskich. (Polish)
11 August 2022
0 references
A szervezet genomjának szekvenciája nélkülözhetetlen adatbázis a modern akvakultúra fejlődéséhez. A funkcionális genomikai módszerek alkalmazásával ezen adatok hasznosítása lehetőséget kínál a szervezet élettani funkcióinak molekuláris szinten történő feltárására, valamint annak megértésére, hogy képes-e alkalmazkodni a környezetéhez és reagálni a változásokra. A transzkriptomikus adatok közelmúltbeli megjelenése (Fleury et al, 2009) és genomja sorrendjének közzététele (Zhang et al, 2012) a Crassostrea gigas üreges vidra azon kevés faja közé tartozik, amelyek nem gerinctelenek, amelyek esetében funkcionális megközelítést lehet figyelembe venni. A metazoa esetében a G-protein receptorok (RCPG) szabályozzák az összes biológiai funkciót, például a szaporodást, a táplálkozást, a növekedést, a stresszt, az immunitást és az anyagcserét. Az egyedi ligandjuk azonosítása ezért nem csak az új endokrin tényezők azonosításának eszköze, hanem az állat élettani állapotának markerei is. A 498 RCPG árvák ördögi kódjának genomja. Kedvező környezetben, ahol az osztriga neuropeptidoma (Stewart et al, 2014) jellemzését követően rendelkezésre álló potenciális ligandok (Stewart et al, 2014) jellemzését követően rendelkezésre álló lehetséges liganduszok paneljének (Stewart et al, 2014) aktivitásának vizsgálatával fordított dendokrinológiai módszertannal rendelkezünk a gazdátlan receptorok azonosítására (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014), e megközelítés alkalmazása lehetővé teszi az osztrigafiziológia új kulcsfontosságú szabályozóinak azonosítását, amelyek tudása hasznos az akvakultúra-környezetben az életciklusok elsajátításához. Azáltal, hogy lehetőséget kínál a lophotrochozoa-ban lévő ligand/receptor párok természetének vizsgálatára, ez a tanulmány a gerinces és rovarmodellekben szerzett ismeretekre is épít, hozzájárul a bilateriai állatok endokrin rendszereinek kialakulásához. (Hungarian)
11 August 2022
0 references
Sekvence genomu organismu je nepostradatelnou databází pro rozvoj moderní akvakultury. Zavedením metod funkční genomiky nabízí využití těchto údajů příležitost prozkoumat na molekulární úrovni fyziologické funkce organismu a pochopit jeho schopnost přizpůsobit se jeho prostředí a reagovat na jeho modifikace. Nedávný výskyt transkriptomických údajů (Fleury et al, 2009) a zveřejnění sekvence jeho genomu (Zhang et al, 2012) řadí dutou vydru Crassostrea gigas mezi málo druhů bezobratlých v akvakultuře, u nichž lze uvažovat o funkčním přístupu.V metazoa receptory G-protein (RCPG) regulují všechny biologické funkce, jako je rozmnožování, výživa, růst, stres, imunita a metabolismus. Identifikace jejich specifického ligandu proto není jen prostředkem k identifikaci nových endokrinních faktorů, ale také markery fyziologického stavu zvířete. Genomu sirotků chorózního kódu 498 RCPG. V příznivém kontextu, kde máme reverzní dendocrinologickou metodiku pro identifikaci osiřelých receptorových ligandů (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) testováním aktivity panelu potenciálních ligandů, které jsou k dispozici po charakterizaci neuropeptidomu ústřic (Stewart et al, 2014), umožní zavedení tohoto přístupu identifikaci nových klíčových regulátorů fyziologie ústřic, jejichž znalosti jsou přínosem pro zvládnutí životního cyklu v akvakultuře. Tím, že tato studie nabízí možnost prozkoumat povahu ligandových/receptorových párů v lofotrochozoa, vychází také z poznatků získaných v modelech obratlovců a hmyzu přispěje k hypotéze vývoje endokrinních systémů u bilateřských zvířat. (Czech)
11 August 2022
0 references
Organisma genoma secība ir neaizstājama datu bāze mūsdienu akvakultūras attīstībai. Īstenojot funkcionālās genomikas metodoloģijas, šo datu izmantošana sniedz iespēju molekulārā līmenī izpētīt organisma fizioloģiskās funkcijas un izprast tā spēju pielāgoties videi un reaģēt uz tā modifikācijām. Nesenie transkriptomiskie dati (Fleury et al, 2009) un tās genoma sekvences publicēšana (Zhang et al, 2012) novieto dobo ūdru Crassostrea gigas starp dažām akvakultūras interešu bezmugurkaulnieku sugām, attiecībā uz kurām var apsvērt funkcionālu pieeju. metazoos G-proteīnu receptori (RCPG) regulē visas bioloģiskās funkcijas, piemēram, vairošanos, uzturu, augšanu, stresu, imunitāti un vielmaiņu. Tāpēc to specifiskā liganda identifikācija ir ne tikai līdzeklis jaunu endokrīnās sistēmas faktoru identificēšanai, bet arī dzīvnieka fizioloģiskā stāvokļa marķieriem. Smagā koda 498 RCPG bāreņiem genoms. Labvēlīgā kontekstā, kur mums ir reversās dendokrinoloģijas metodika reti sastopamu slimību ārstēšanai paredzētu receptoru ligandu identificēšanai (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014), testējot potenciālo ligandu paneļa darbību, kas pieejama pēc austeru neiropeptidomas raksturošanas (Stewart et al, 2014), šīs pieejas īstenošana ļaus identificēt jaunus galvenos austeru fizioloģijas regulatorus, kuru zināšanas ir aktīvs dzīves ciklu apguvei akvakultūras kontekstā. Piedāvājot iespēju izpētīt liganda/receptoru pāru raksturu lophotrochozos, šis pētījums balstās arī uz zināšanām, kas iegūtas mugurkaulnieku un kukaiņu modeļos, veicinās hipotēzi par endokrīnās sistēmas attīstību bilaterijas dzīvniekiem. (Latvian)
11 August 2022
0 references
Is bunachar sonraí fíor-riachtanach é seicheamh géanóim orgánach chun dobharshaothrú nua-aimseartha a fhorbairt. Trí mhodheolaíochtaí feidhmiúla géanómaíocha a chur i bhfeidhm, tugann saothrú na sonraí seo deis iniúchadh a dhéanamh ar an leibhéal móilíneach ar fheidhmeanna fiseolaíocha an orgánaigh agus tuiscint a fháil ar a chumas a bheith oiriúnaithe dá thimpeallacht agus freagairt dá mhodhnuithe. An teacht chun cinn le déanaí na sonraí transcriptomic (Fleury et al, 2009) agus foilsiú an t-ord a genome (Zhang et al, 2012) seasamh an otter log Crassostrea gigas i measc na speiceas beag neamh-veirteabrach de leas dobharshaothraithe ar féidir cur chuige feidhmiúil a chur san áireamh.I metazoa, gabhdóirí G-próitéin (RCPG) rialáil gach feidhm bhitheolaíoch cosúil le atáirgeadh, cothú, fás, strus, díolúine agus meitibileacht. Dá bhrí sin, ní hamháin gur bealach é a gcuid ligand sonrach a shainaithint chun tosca inchríneacha nua a aithint, ach freisin chun marcóirí de staid fhiseolaíoch an ainmhí a bheith acu. I gcomhthéacs fabhrach, áit a bhfuil an mhodheolaíocht dendocrinology droim ar ais againn chun ligands gabhdóra dílleachta a shainaithint (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) trí thástáil a dhéanamh ar ghníomhaíocht painéil ligands féideartha atá ar fáil tar éis tréithriú neuropeptidoma oisrí (Stewart et al, 2014), cumasóidh cur chun feidhme an chur chuige seo príomhrialaitheoirí nua fiseolaíochta oisrí a shainaithint a bhfuil eolas acu ar shócmhainn chun saolré a mháistir i gcomhthéacs dobharshaothraithe. Trí dheis a thairiscint chun scrúdú a dhéanamh ar nádúr na bpéirí ligand/ceaptha i Lophotrochozoa, tógann an staidéar seo freisin ar an eolas a fuarthas i samhlacha veirteabracha agus feithidí cuirfidh sé le héabhlóid na gcóras inchríneacha in ainmhithe bilaterian a hipitéisiú. (Irish)
11 August 2022
0 references
Zaporedje genoma organizma je nepogrešljiva baza podatkov za razvoj sodobnega ribogojstva. Z izvajanjem funkcionalnih genomskih metodologij je izkoriščanje teh podatkov priložnost za raziskovanje fizioloških funkcij organizma na molekularni ravni in razumevanje njegove sposobnosti, da se prilagodi okolju in se odzove na njegove spremembe. Nedavni pojav transkriptomskih podatkov (Fleury et al, 2009) in objava zaporedja genoma (Zhang et al, 2012) uvrščata votlo vidro Crassostrea gigas med redke vrste nevretenčarjev, ki so zanimive za akvakulturo in za katere je mogoče upoštevati funkcionalni pristop.V metazoji receptorji G-protein (RCPG) urejajo vse biološke funkcije, kot so razmnoževanje, prehrana, rast, stres, imunost in presnova. Identifikacija njihovega specifičnega liganda zato ni le sredstvo za prepoznavanje novih endokrinih dejavnikov, ampak tudi za označevanje fiziološkega stanja živali.Genom razvpite kode 498 RCPG sirot. V ugodnem kontekstu, kjer imamo obratno dendokrinološko metodologijo za identifikacijo ligandov sirot (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) s testiranjem aktivnosti plošče potencialnih ligandov, ki so na voljo po karakterizaciji nevropeptidoma ostrig (Stewart et al, 2014), bo izvajanje tega pristopa omogočilo identifikacijo novih ključnih regulatorjev fiziologije ostrig, katerih znanje je sredstvo za obvladovanje življenjskih ciklov v ribogojstvu. Ta študija s tem, da ponuja priložnost za preučitev narave parov ligandov/receptorjev v lophotrochozoji, gradi tudi na znanju, pridobljenem v modelih vretenčarjev in žuželk, bo prispevala k hipoteziranju razvoja endokrinih sistemov pri bilterijanskih živalih. (Slovenian)
11 August 2022
0 references
Последователността на генома на организма е незаменима база данни за развитието на модерна аквакултура. Чрез прилагане на методики за функционална геномика използването на тези данни дава възможност да се изследват на молекулярно ниво физиологичните функции на организма и да се разбере способността му да се адаптира към околната среда и да реагира на неговите модификации. Неотдавнашната поява на транскриптомни данни (Fleury et al, 2009) и публикуването на последователността на неговия геном (Zhang et al, 2012) позиционират кухата видра Crassostrea gigas сред малкото видове безгръбначни от интерес за аквакултури, за които може да се обмисли функционален подход.В метазоите, G-протеиновите рецептори (RCPG) регулират всички биологични функции като репродукция, хранене, растеж, стрес, имунитет и метаболизъм. Идентифицирането на техните специфични лиганд следователно е не само средство за идентифициране на нови ендокринни фактори, но също така и на наличието на маркери на физиологичното състояние на животното.Геномът на злобните код 498 RCPGs сираци. В благоприятен контекст, когато разполагаме с обратната дендокринологична методология за идентифициране на лигандите на рецепторите сираци (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014 г.) чрез изпитване на дейността на група от потенциални лиганди, които са на разположение след характеризирането на невропептидома на стридите (Stewart et al, 2014 г.), прилагането на този подход ще даде възможност за идентифициране на нови ключови регулатори на физиологията на стридите, чиито знания са актив за овладяване на жизнения цикъл в контекста на аквакултурите. Като предлага възможност да се проучи естеството на двойките лиганд/рецептори в лофотрохозоата, това проучване също така се основава на знанията, придобити при моделите на гръбначни и насекоми, ще допринесе за хипотетичното развитие на ендокринната система при билатерните животни. (Bulgarian)
11 August 2022
0 references
Is-sekwenza tal-ġenoma ta’ organiżmu hija bażi tad-data indispensabbli għall-iżvilupp tal-akkwakultura moderna. Bl-implimentazzjoni tal-metodoloġiji ġenomiċi funzjonali, l-isfruttament ta’ din id-data joffri l-opportunità li jiġu esplorati fil-livell molekulari l-funzjonijiet fiżjoloġiċi ta’ organiżmu u li tiġi mifhuma l-kapaċità tiegħu li jiġi adattat għall-ambjent tiegħu u li jirreaġixxi għall-modifiki tiegħu. L-emerġenza reċenti ta’ dejta traskristomika (Fleury et al, 2009) u l-pubblikazzjoni tas-sekwenza tal-ġenoma tiegħu (Zhang et al, 2012) ipoġġu l-otter Crassostrea gigas vojt fost il-ftit speċijiet ta’ nonvertebrati ta’ interess għall-akkwakultura li għalihom jista’ jiġi kkunsidrat approċċ funzjonali.Fil-metażoa, ir-riċetturi tal-proteina G (RCPG) jirregolaw il-funzjonijiet bijoloġiċi kollha bħar-riproduzzjoni, in-nutrizzjoni, it-tkabbir, l-istress, l-immunità u l-metaboliżmu. L-identifikazzjoni tal-ligand speċifiku tagħhom għalhekk mhijiex biss mezz biex jiġu identifikati fatturi endokrinali ġodda, iżda wkoll biex ikun hemm markaturi tal-istat fiżjoloġiku tal-annimal.Il-ġenoma tal-kodiċi oorjuż 498 orfni RCPG. F’kuntest favorevoli, fejn għandna l-metodoloġija tad-dendokrinoloġija inversa għall-identifikazzjoni tal-ligandi tar-riċetturi orfni (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) billi tiġi ttestjata l-attività ta’ bord ta’ ligandi potenzjali disponibbli wara l-karatterizzazzjoni tan-newropeptidoma tal-gajdri (Stewart et al, 2014), l-implimentazzjoni ta’ dan l-approċċ se tippermetti l-identifikazzjoni ta’ regolaturi ewlenin ġodda tal-fiżjoloġija tal-gajdri li l-għarfien tagħhom huwa vantaġġ għall-kontroll taċ-ċikli tal-ħajja f’kuntest tal-akkwakultura. Billi joffri l-opportunità li tiġi eżaminata n-natura tal-pari tal-ligand/riċetturi f’lophotrochozoa, dan l-istudju jibni wkoll fuq l-għarfien miksub fil-mudelli tal-vertebrati u tal-insetti se jikkontribwixxi biex tiġi ipotizzata l-evoluzzjoni tas-sistemi endokrinali fl-annimali bilaterjani. (Maltese)
11 August 2022
0 references
A sequência do genoma de um organismo é uma base de dados indispensável para o desenvolvimento da aquicultura moderna. Ao implementar metodologias de genómica funcional, a exploração destes dados oferece a oportunidade de explorar a nível molecular as funções fisiológicas de um organismo e compreender a sua capacidade de se adaptar ao seu ambiente e de reagir às suas modificações. A recente emergência de dados transcriptómicos (Fleury et al, 2009) e a publicação da sequência do seu genoma (Zhang et al, 2012) posicionam a lontra oca Crassostrea gigas entre as poucas espécies de não vertebrados de interesse aquícola para as quais pode ser considerada uma abordagem funcional.Nos metazoários, os recetores da proteína G (RCPG) regulam todas as funções biológicas, como a reprodução, a nutrição, o crescimento, o stress, a imunidade e o metabolismo. A identificação do seu ligante específico é, portanto, não só um meio de identificar novos factores endócrinos, mas também de ter marcadores do estado fisiológico do animal. Num contexto favorável, em que temos a metodologia de dendocrinologia inversa para identificar ligantes recetores órfãos (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) testando a atividade de um painel de potenciais ligantes disponíveis na sequência da caracterização do neuropeptidoma da ostra (Stewart et al, 2014), a implementação desta abordagem permitirá a identificação de novos reguladores-chave da fisiologia da ostra cujo conhecimento é uma mais-valia para o domínio dos ciclos de vida num contexto de aquicultura. Ao oferecer a oportunidade de examinar a natureza dos pares ligante/receptor em um lofotrochozoa, este estudo também se baseia no conhecimento adquirido em modelos de vertebrados e insetos que contribuirão para a hipótese da evolução dos sistemas endócrinos em animais bilaterianos. (Portuguese)
11 August 2022
0 references
Sekvensen af en organismes genom er en uundværlig database for udviklingen af moderne akvakultur. Ved at anvende funktionelle genomforskningsmetoder giver udnyttelsen af disse data mulighed for på molekylært plan at undersøge en organismes fysiologiske funktioner og forstå dens evne til at blive tilpasset dens miljø og til at reagere på dens modifikationer. Den seneste udvikling af transskriptomiske data (Fleury et al, 2009) og offentliggørelsen af sekvensen af dets genom (Zhang et al., 2012) placerer den hule odder Crassostrea gigas blandt de få arter af ikke-hvirvelløse dyr af akvakulturinteresse, for hvilke en funktionel tilgang kan overvejes.I metazoer regulerer G-proteinreceptorer (RCPG) alle biologiske funktioner såsom reproduktion, ernæring, vækst, stress, immunitet og metabolisme. Identifikationen af deres specifikke ligand er derfor ikke kun et middel til at identificere nye endokrine faktorer, men også til at have markører for dyrets fysiologiske tilstand. Genomet i den oorøse kode 498 RCPGs forældreløse. I en gunstig kontekst, hvor vi har den omvendte dendokrinologimetode til identifikation af forældreløse receptorligander (Beets et al., 2012, Bigot et al., 2014) ved at teste aktiviteten i et panel af potentielle ligander, der er til rådighed efter karakteriseringen af østersneuropeptidom (Stewart et al., 2014), vil gennemførelsen af denne tilgang gøre det muligt at identificere nye nøgleregulatorer for østersfysiologi, hvis viden er et aktiv for at mestre livscyklussen i akvakultursammenhæng. Ved at give mulighed for at undersøge arten af ligand/receptorpar i et lophotrochozoa vil denne undersøgelse også bygge på den viden, der er opnået inden for hvirveldyr og insektmodeller, bidrage til at hypotese om udviklingen af endokrine systemer hos bilateriske dyr. (Danish)
11 August 2022
0 references
Secvența genomului unui organism este o bază de date indispensabilă pentru dezvoltarea acvaculturii moderne. Prin implementarea metodologiilor genomice funcționale, exploatarea acestor date oferă posibilitatea de a explora la nivel molecular funcțiile fiziologice ale unui organism și de a înțelege capacitatea acestuia de a fi adaptat la mediul său și de a reacționa la modificările acestuia. Apariția recentă a datelor transcriptomice (Fleury et al, 2009) și publicarea secvenței genomului său (Zhang et al, 2012) poziționează vidra goală Crassostrea gigas printre puținele specii de nevertebrate de interes pentru acvacultură pentru care poate fi luată în considerare o abordare funcțională. În metazoa, receptorii proteinelor G (RCPG) reglementează toate funcțiile biologice, cum ar fi reproducerea, nutriția, creșterea, stresul, imunitatea și metabolismul. Identificarea ligandului specific nu este, prin urmare, doar un mijloc de identificare a noilor factori endocrini, ci și de a avea markeri ai stării fiziologice a animalului. Genomul codului oorios 498 RCPG orfani. Într-un context favorabil, în care avem metodologia de dendocrinologie inversă pentru identificarea ligandelor receptorilor orfani (Beets et al, 2012, Bigot et al, 2014) prin testarea activității unui grup de potențiale ligande disponibile în urma caracterizării neuropeptidomului stridiilor (Stewart et al, 2014), punerea în aplicare a acestei abordări va permite identificarea unor noi autorități de reglementare cheie ale fiziologiei stridiilor, ale căror cunoștințe reprezintă un avantaj pentru stăpânirea ciclurilor de viață în contextul acvaculturii. Oferind posibilitatea de a examina natura perechilor de liganzi/receptori într-o lophotrochozoa, acest studiu se bazează, de asemenea, pe cunoștințele dobândite în modelele vertebrate și insecte va contribui la ipoteza evoluției sistemelor endocrine la animalele bilatere. (Romanian)
11 August 2022
0 references
Sekvensen av en organisms genom är en oumbärlig databas för utvecklingen av modernt vattenbruk. Genom att tillämpa funktionella genomikmetoder ger utnyttjandet av dessa data en möjlighet att på molekylär nivå utforska en organisms fysiologiska funktioner och förstå dess förmåga att anpassas till dess omgivning och reagera på dess modifieringar. Den senaste tidens framväxt av transkriptomiska data (Fleury m.fl., 2009) och offentliggörandet av sekvensen av dess genom (Zhang et al, 2012) placerar den ihåliga uttern Crassostrea gigas bland de få arter av icke ryggradslösa djur av vattenbruksintresse för vilka ett funktionellt tillvägagångssätt kan övervägas.I metazoa reglerar G-proteinreceptorer (RCPG) alla biologiska funktioner såsom reproduktion, näring, tillväxt, stress, immunitet och metabolism. Identifieringen av deras specifika ligand är därför inte bara ett sätt att identifiera nya endokrina faktorer, utan också för att ha markörer för djurets fysiologiska tillstånd.Geet i den oorious Code 498 RCPGs föräldralösa. I ett gynnsamt sammanhang, där vi har den omvända dendokrinologiska metoden för att identifiera särläkemedelsligander (Beets et al, 2012, Bigot m.fl., 2014) genom att testa aktiviteten hos en panel av potentiella ligander tillgängliga efter karakteriseringen av ostronneuropeptidom (Stewart et al, 2014), kommer genomförandet av denna metod att göra det möjligt att identifiera nya viktiga regulatorer för ostronfysiologi vars kunskap är en tillgång för att behärska livscykler i ett vattenbrukssammanhang. Genom att erbjuda möjlighet att undersöka arten av ligand/receptorpar i en lophotrochozoa, bygger denna studie också på den kunskap som erhållits i ryggradsdjur och insektsmodeller kommer att bidra till att hypotesisera utvecklingen av endokrina system hos bilateriska djur. (Swedish)
11 August 2022
0 references
7 December 2023
0 references
Identifiers
15P03010
0 references