Reclassification of variants of uncertain meaning in Hypertrophic Myocardiopathy: genetic variation in a cohort control and transcriptome analysis. (Q3165582)

From EU Knowledge Graph
Revision as of 09:40, 11 October 2024 by DG Regio (talk | contribs) (‎Changed label, description and/or aliases in pt)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to navigation Jump to search
Project Q3165582 in Spain
Language Label Description Also known as
English
Reclassification of variants of uncertain meaning in Hypertrophic Myocardiopathy: genetic variation in a cohort control and transcriptome analysis.
Project Q3165582 in Spain

    Statements

    0 references
    33,759.0 Euro
    0 references
    62,000.0 Euro
    0 references
    54.45 percent
    0 references
    1 January 2019
    0 references
    31 March 2022
    0 references
    FUNDACION PARA LA INVESTIGACION E INNOVACION BIOSANITARIA EN EL PRINCIPADO DE ASTURIAS
    0 references
    0 references

    43°21'37.51"N, 5°50'42.18"W
    0 references
    Las variantes de significado incierto (VSI) son el mayor problema para precisar el diagnóstico en la Miocardiopatía Hipertrófica. Actualmente son un callejón sin salida que bloquea el consejo genético en los sujetos genotipo+/fenotipo+. Necesitamos: 1.Datos genético-poblacionales de la población general accesible a validación de variantes raras, más allá de los datos crudos de bases exónicas anonimizadas (proponemos caracterizar una cohorte controlada de más de mil sujetos). 2.Implementación del significado de muchas VSI mediante técnicas de imagen finas como la resonancia, que faciliten la reclasificación del espectro de variación sarcomérica en la MCH. 3. Desarrollar un procedimiento experimental que permite definir funcionalmente estas VSI, y vaya más allá del tejido cardiaco no disponible en muchos pacientes: proponemos analizar el efecto de las variantes candidatas sobre la expresión y el desbalance alélico en cultivos leucocitarios primarios. Nuestro objetivo es pues implementar la reclasificación de las VSI en la MCH mediante datos genético-poblacionales propios, técnicas de imagen aplicables los familiares G+/F-, y estudio del transcriptoma sarcomérico. (Spanish)
    0 references
    Variants of uncertain meaning (ISV) are the biggest problem in determining the diagnosis in Hypertrophic Myocardiopathy. They are currently a dead end that blocks genetic advice in genotype+/phenotype+ subjects. We need to: 1.Genetic-population data of the general population accessible to validation of rare variants, beyond raw data from anonymised exonic bases (we propose to characterise a controlled cohort of more than a thousand subjects). 2.Implementation of the meaning of many VSIs using fine imaging techniques such as resonance, which facilitate the reclassification of the sarcomeric variation spectrum in MCH. 3. Develop an experimental procedure that allows functional definition of these ISVs, and goes beyond the heart tissue not available in many patients: we propose to analyse the effect of candidate variants on expression and allelic imbalance in primary leukocyte crops. Our objective is therefore to implement the reclassification of ISVs in HCM through own genetic-population data, imaging techniques applicable to G+/F- family members, and study of sarcomeric transcriptoma. (English)
    12 October 2021
    0.2844376012308927
    0 references
    Les variantes de signification incertaine (ISV) sont le plus gros problème dans la détermination du diagnostic dans la myocardiopathie hypertrophique. Ils sont actuellement une impasse qui bloque les conseils génétiques chez les sujets génotype+/phénotype+. Nous devons: 1.Données génétiques-population de la population générale accessibles à la validation de variantes rares, au-delà des données brutes provenant de bases exoniques anonymisées (nous proposons de caractériser une cohorte contrôlée de plus d’un millier de sujets). 2.Mise en oeuvre du sens de nombreux ISBC à l’aide de techniques d’imagerie fine telles que la résonance, ce qui facilite la reclassification du spectre des variations sarcomériques dans le MCH. 3. Développer une procédure expérimentale qui permet la définition fonctionnelle de ces ISV, et va au-delà du tissu cardiaque qui n’est pas disponible chez de nombreux patients: nous proposons d’analyser l’effet des variantes candidates sur l’expression et le déséquilibre allélique dans les cultures primaires de leucocytes. Notre objectif est donc de mettre en œuvre la reclassification des VSI dans la MHC à travers ses propres données génétiques-populations, les techniques d’imagerie applicables aux membres de la famille G+/F- et l’étude du transcriptome sarcomérique. (French)
    4 December 2021
    0 references
    Varianten von unsicherer Bedeutung (ISV) sind das größte Problem bei der Bestimmung der Diagnose in der Hypertrophen Myokardopathie. Sie sind derzeit eine Sackgasse, die genetische Beratung bei Genotyp+/Phänotyp+ Probanden blockiert. Wir müssen: 1.Genetische Bevölkerungsdaten der allgemeinen Bevölkerung, die für die Validierung seltener Varianten zugänglich sind, über Rohdaten aus anonymisierten Exonenbasen hinaus (wir schlagen vor, eine kontrollierte Kohorte von mehr als tausend Probanden zu charakterisieren). 2.Implementierung der Bedeutung vieler VSI mit feinen bildgebenden Techniken wie Resonanz, die die Neuklassifizierung des sarkomerischen Variationsspektrums in MCH erleichtern. 3. Entwickeln Sie ein experimentelles Verfahren, das eine funktionale Definition dieser ISV ermöglicht und über das Herzgewebe hinausgeht, das bei vielen Patienten nicht verfügbar ist: wir schlagen vor, die Auswirkungen von Kandidatenvariationen auf die Expression und allelische Ungleichgewichte bei Primärleukozytenkulturen zu analysieren. Unser Ziel ist es daher, die Neuklassifizierung von ISVs in HCM durch eigene genetische Populationsdaten, bildgebende Techniken für G+/F-Familienmitglieder und das Studium des sarkomerischen Transkriptoms umzusetzen. (German)
    9 December 2021
    0 references
    Varianten van onzekere betekenis (ISV) zijn het grootste probleem bij het bepalen van de diagnose bij hypertrofische myocardiopathie. Ze zijn momenteel een doodlopende weg die genetisch advies blokkeert bij genotype+/fenotype±personen. We moeten: 1.Genetic-populatie gegevens van de algemene bevolking toegankelijk voor validatie van zeldzame varianten, verder dan ruwe gegevens van geanonimiseerde exonic bases (wij stellen voor om een gecontroleerde cohort van meer dan duizend proefpersonen te karakteriseren). 2.Implementation van de betekenis van vele VSI’s die fijne beeldvormingstechnieken zoals resonantie gebruiken, die de herclassificatie van het sarcomeric variatiespectrum in MCH vergemakkelijken. 3. Ontwikkel een experimentele procedure die functionele definitie van deze ISV’s mogelijk maakt, en gaat verder dan het hartweefsel dat bij veel patiënten niet beschikbaar is: we stellen voor om het effect van kandidaat-varianten op expressie en allelic disbalans in primaire leukocytengewassen te analyseren. Ons doel is daarom de herclassificatie van ISV’s in HCM te implementeren door middel van eigen genetische-populatiegegevens, beeldvormingstechnieken die van toepassing zijn op G+/F- familieleden, en studie van sarcomerisch transcriptoom. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    Varianti di significato incerto (ISV) sono il più grande problema nel determinare la diagnosi nella miocardiopatia ipertrofica. Attualmente sono un vicolo cieco che blocca la consulenza genetica nei soggetti genotipo+/fenotipo+. Dobbiamo: 1.Genetico-popolazione dati della popolazione generale accessibile alla convalida di varianti rare, al di là dei dati grezzi da basi esoniche anonime (si propone di caratterizzare una coorte controllata di più di mille soggetti). 2.Implementazione del significato di molti VSI utilizzando tecniche di imaging fine come la risonanza, che facilitano la riclassificazione dello spettro di variazione sarcomerica in MCH. 3. Sviluppare una procedura sperimentale che consenta la definizione funzionale di questi ISV e vada oltre il tessuto cardiaco non disponibile in molti pazienti: proponiamo di analizzare l'effetto delle varianti candidate sull'espressione e lo squilibrio allelico nelle colture primarie di leucociti. Il nostro obiettivo è quindi quello di implementare la riclassificazione di ISV in HCM attraverso i propri dati genetici-popolazione, tecniche di imaging applicabili ai membri della famiglia G+/F, e lo studio di trascrizione sarcomerica. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    Ebamäärase tähendusega variandid (ISV) on suurim probleem hüpertroofilise müokardiopaatia diagnoosi määramisel. Need on praegu tupik, mis blokeerib geneetilisi nõuandeid genotüübi+/fenotüübi+ uuringus osalejate puhul. Me peame: 1.Üldpopulatsiooni geneetika-populatsiooni andmed, mis on kättesaadavad haruldaste variantide valideerimiseks, lisaks anonüümitud eksooniliste aluste töötlemata andmetele (me teeme ettepaneku iseloomustada kontrollitud kohorti, mis koosneb rohkem kui tuhandest uuritavast). 2. Paljude VSIde tähenduse rakendamine, kasutades peeneid pildistamismeetodeid, nagu resonants, mis hõlbustab sarkomeersete variatsioonispektri ümberliigitamist MCH-s. 3. Töötada välja eksperimentaalne protseduur, mis võimaldab neid ISV-d funktsionaalselt määratleda ja mis läheb kaugemale kui paljudel patsientidel puudub südamekude: teeme ettepaneku analüüsida kandidaatvariantide mõju ekspressioonile ja alleelilisele tasakaalustamatusele primaarsete leukotsüütide põllukultuurides. Seetõttu on meie eesmärk rakendada ISVde ümberliigitamist HCM-i oma geneetilise populatsiooni andmete, G+/F- pereliikmetele kohaldatavate pildistamise meetodite ja sarkomeerilise transkriptoomi uurimise kaudu. (Estonian)
    4 August 2022
    0 references
    Neaiškios prasmės variantai (ISV) yra didžiausia problema nustatant hipertrofinės miokardiopatijos diagnozę. Šiuo metu jie yra aklavietė, kuri blokuoja genetinius patarimus genotipo+/fenotipo+ tiriamiesiems. Turime: 1.Genetinės populiacijos duomenys, prieinami retų variantų patvirtinimui, be neapdorotų duomenų iš anoniminių egzoninių bazių (siūlome apibūdinti kontroliuojamą kohortą, kurį sudaro daugiau nei tūkstantis tiriamųjų). 2.Įgyvendinant daugelio VSI reikšmę, naudojant smulkius vaizdo gavimo metodus, tokius kaip rezonansas, kurie palengvina sarkomerinio variacijos spektro perklasifikavimą MCH. 3. Sukurti eksperimentinę procedūrą, kuri leistų funkciškai apibrėžti šias TPP ir apimtų daugiau nei širdies audinį, kurio nėra daugeliui pacientų: siūlome analizuoti potencialių variantų poveikį išraiškai ir alelio disbalansui pirminiuose leukocitų pasėliuose. Todėl mūsų tikslas yra įgyvendinti ISV perklasifikavimą HCM naudojant savo genetinės populiacijos duomenis, G+/F šeimos nariams taikomus vizualizavimo metodus ir sarkomerinės transkriptomos tyrimus. (Lithuanian)
    4 August 2022
    0 references
    Varijante neizvjesnog značenja (ISV) najveći su problem u određivanju dijagnoze hipertrofične miokardiopatije. One su trenutačno slijepa ulica koja blokira genetsko savjetovanje u ispitanika genotipa+/fenotipa+. Moramo: 1. Genetičko-populacijski podaci opće populacije dostupni validaciji rijetkih varijanti, osim neobrađenih podataka iz anonimiziranih egzonskih baza (predlažemo da se okarakterizira kontrolirana skupina od više od tisuću ispitanika). 2.Provedba značenja mnogih VSI-jeva pomoću finih tehnika snimanja, kao što je rezonancija, koje olakšavaju reklasifikaciju spektra sarkomerskih varijacija u MCH-u. 3. Razviti eksperimentalni postupak koji omogućuje funkcionalnu definiciju tih ISV-ova i nadilazi srčano tkivo koje nije dostupno u mnogih bolesnika: predlažemo analizu utjecaja varijanti kandidata na izražavanje i aleličnu neravnotežu u primarnim kulturama leukocita. Naš je cilj stoga provesti reklasifikaciju ISV-a u HCM putem vlastitih podataka o genetskoj populaciji, tehnikama snimanja koje se primjenjuju na članove G+/F- obitelji te proučavanju sarkomeričkog transkriptoma. (Croatian)
    4 August 2022
    0 references
    Παραλλαγές αβέβαιης έννοιας (ISV) είναι το μεγαλύτερο πρόβλημα στον προσδιορισμό της διάγνωσης στην υπερτροφική μυοκαρδιοπάθεια. Επί του παρόντος είναι αδιέξοδο που εμποδίζει τις γενετικές συμβουλές σε άτομα γονότυπου+/φαινοτύπου+. Πρέπει: 1.Γενετικά-πληθυσμιακά δεδομένα του γενικού πληθυσμού προσβάσιμα για την επικύρωση σπάνιων παραλλαγών, πέρα από τα ανεπεξέργαστα δεδομένα από ανωνυμοποιημένες εξωτικές βάσεις (προτείνουμε να χαρακτηρίσουμε μια ελεγχόμενη ομάδα περισσότερων από χίλιων ατόμων). 2.Εφαρμογή της έννοιας πολλών VSI χρησιμοποιώντας τεχνικές λεπτής απεικόνισης όπως ο συντονισμός, οι οποίες διευκολύνουν την αναταξινόμηση του σαρκομερούς φάσματος διακύμανσης στο MCH. 3. Ανάπτυξη μιας πειραματικής διαδικασίας που επιτρέπει τον λειτουργικό ορισμό αυτών των ΕΦΚ και υπερβαίνει τον καρδιακό ιστό που δεν είναι διαθέσιμος σε πολλούς ασθενείς: προτείνουμε να αναλυθεί η επίδραση των υποψήφιων παραλλαγών στην έκφραση και την αλλελική ανισορροπία στις πρωτογενείς καλλιέργειες λευκοκυττάρων. Ως εκ τούτου, στόχος μας είναι να εφαρμόσουμε την αναταξινόμηση των ISV σε HCM με δικά δεδομένα γενετικού πληθυσμού, τεχνικές απεικόνισης που εφαρμόζονται στα μέλη της οικογένειας G+/F, και μελέτη του σαρκομερούς μεταγραφήματος. (Greek)
    4 August 2022
    0 references
    Varianty neistého významu (ISV) sú najväčším problémom pri určovaní diagnózy pri hypertrofickej myokardu. V súčasnosti sú slepou uličkou, ktorá blokuje genetické rady u pacientov s genotypom+/fenotypom+. Musíme: 1.Geneticko-populačné údaje bežnej populácie dostupné na validáciu vzácnych variantov nad rámec nespracovaných údajov z anonymizovaných exonických báz (navrhujeme charakterizovať kontrolovanú kohortu viac ako tisíc jedincov). 2.Vykonávanie významu mnohých VSI s použitím jemných zobrazovacích techník, ako je rezonancia, ktoré uľahčujú reklasifikáciu sarkomerického variačného spektra v MCH. 3. Vyvinúť experimentálny postup, ktorý umožňuje funkčné definície týchto ISV, a ide nad rámec srdcového tkaniva nie je k dispozícii u mnohých pacientov: navrhujeme analyzovať vplyv kandidátskych variantov na expresiu a alelickú nerovnováhu v primárnych leukocytových plodinách. Naším cieľom je preto zaviesť reklasifikáciu ISV v HCM prostredníctvom vlastných genetických údajov o populácii, zobrazovacích techník použiteľných pre členov rodiny G+/F a štúdia sarkérického transkriptómu. (Slovak)
    4 August 2022
    0 references
    Epämääräisen merkityksen variantit (ISV) ovat suurin ongelma määritettäessä diagnoosin hypertrofinen sydänlihassairaus. Ne ovat tällä hetkellä umpikuja, joka estää geneettisen neuvonnan genotyypin+/fenotyypin+ tutkittavilla. Meidän on 1.Yleisen väestön geneettiset populaatiotiedot, jotka ovat saatavilla harvinaisten varianttien validointiin, lukuun ottamatta anonymisoiduista eksonisista emäksistä saatuja raakatietoja (ehdotamme yli tuhannen tutkittavan kontrolloidun kohortin karakterisointia). 2.Toteutetaan monien VSI-laitteiden merkitys käyttäen hienoja kuvantamistekniikoita, kuten resonanssia, jotka helpottavat sarkomeerivaihteluspektrin uudelleenluokittelua MCH: ssä. 3. Kehitetään kokeellinen menettely, joka mahdollistaa näiden ISV-aineiden toiminnallisen määritelmän ja ylittää sen sydänkudoksen, jota ei ole saatavilla monilla potilailla: ehdotamme, että analysoidaan ehdokasmuunnelmien vaikutusta primaaristen leukosyyttikasvien ilmentymiseen ja alleaaliseen epätasapainoon. Tavoitteenamme on siis toteuttaa ISV-aineiden uudelleenluokittelu HCM:ään omien geneettisten tietojen, G+/F-perheeseen sovellettavien kuvantamistekniikoiden ja sarkomeerisen transkriptooman tutkimuksen avulla. (Finnish)
    4 August 2022
    0 references
    Warianty niepewnego znaczenia (ISV) są największym problemem w określaniu diagnozy w miokardiopatii hipertroficznej. Są one obecnie ślepym zaułkiem, który blokuje porady genetyczne u pacjentów z genotypem+/fenotypem+. Musimy: 1. Dane genetyczne populacji ogólnej dostępne do walidacji rzadkich wariantów, poza surowymi danymi z anonimowych podstaw egzoicznych (proponujemy scharakteryzować kontrolowaną kohortę składającą się z ponad tysiąca badanych). 2. Wdrożenie znaczenia wielu VSI przy użyciu precyzyjnych technik obrazowania, takich jak rezonans, które ułatwiają reklasyfikację widma zmienności sarcomeric w MCH. 3. Opracowanie procedury eksperymentalnej, która umożliwia funkcjonalną definicję tych ISV i wykracza poza tkankę serca niedostępną u wielu pacjentów: proponujemy analizę wpływu proponowanych wariantów na ekspresję i zaburzenia równowagi w pierwotnych uprawach leukocytów. Naszym celem jest zatem wdrożenie przeklasyfikowania ISV do HCM za pomocą własnych danych genetycznych dotyczących populacji, technik obrazowania mających zastosowanie do członków rodziny G+/F oraz badania transkryptoma mięsaka. (Polish)
    4 August 2022
    0 references
    A bizonytalan jelentésű változatok (ISV) jelentik a legnagyobb problémát a hypertrophiás myocardiopathia diagnózisának meghatározásában. Jelenleg zsákutca, amely gátolja a genetikai tanácsadást a+/fenotípus+ alanyoknál. Meg kell tennünk: 1.Az általános népesség genetikai-populációs adatai, amelyek a ritka variánsok validálásához hozzáférhetők, az anonimizált exonikus bázisokból származó nyers adatokon túl (a több mint ezer alany kontrollált kohorszának jellemzését javasoljuk). 2. Számos VSI jelentésének végrehajtása finom képalkotó technikák, például rezonancia alkalmazásával, amelyek megkönnyítik az MCH szarkomerikus variációs spektrumának átsorolását. 3. Dolgozzon ki egy kísérleti eljárást, amely lehetővé teszi ezeknek az ISV-knek a funkcionális meghatározását, és túlmutat a sok betegnél nem elérhető szívszöveten: javasoljuk, hogy elemezzék a jelölt variánsok expresszióra és allélegyensúlyra gyakorolt hatását az elsődleges leukocita növényekben. Célunk tehát, hogy megvalósítsuk az ISV-k HCM-be történő átsorolását saját genetikai-populációs adatok, a G+/F-családtagokra alkalmazható képalkotó technikák és a szarkomer transzkriptóma tanulmányozása révén. (Hungarian)
    4 August 2022
    0 references
    Varianty nejistého významu (ISV) jsou největším problémem při stanovení diagnózy u hypertrofické myokardiopatie. V současné době jsou slepou uličkou, která blokuje genetické poradenství u subjektů genotypu+/fenotypu+. Musíme: 1.Genetic-populační údaje obecné populace přístupné validaci vzácných variant, nad rámec nezpracovaných dat z anonymizovaných exonic bází (navrhujeme charakterizovat kontrolovanou kohortu více než tisíc subjektů). 2.Provádění významu mnoha VSI pomocí jemných zobrazovacích technik, jako je rezonance, které usnadňují reklasifikaci sarkoerického variačního spektra v MCH. 3. Vyvinout experimentální postup, který umožňuje funkční definici těchto ISV, a jde nad rámec srdeční tkáně, která není k dispozici u mnoha pacientů: navrhujeme analyzovat vliv kandidátských variant na expresi a alelickou nerovnováhu v primárních leukocytových plodinách. Naším cílem je proto implementovat reklasifikaci ISV v HCM prostřednictvím vlastních genetických údajů o populaci, zobrazovacích technik použitelných pro členy rodiny G+/F a studia sarkomerického transkriptomu. (Czech)
    4 August 2022
    0 references
    Neskaidras nozīmes varianti (ISV) ir lielākā problēma, nosakot hipertrofiskās miokardiopātijas diagnozi. Tie pašlaik ir strupceļš, kas bloķē ģenētiskos padomus genotipa+/fenotipa+ pētāmajām personām. Mums ir: 1. Ģenētiskie populācijas dati par vispārējo populāciju, kas pieejami retu variantu apstiprināšanai, papildus neapstrādātiem datiem no anonimizētām eksoniskām bāzēm (mēs ierosinām raksturot kontrolēto kohortu, kas ir vairāk nekā tūkstotis subjektu). 2. Daudzu VSI nozīmes īstenošana, izmantojot tādas smalkas attēlveidošanas metodes kā rezonanse, kas atvieglo sarkomēru variāciju spektra pārklasificēšanu MCH. 3. Izstrādāt eksperimentālu procedūru, kas ļauj funkcionāli definēt šos ISV un pārsniedz sirds audus, kas nav pieejami daudziem pacientiem: mēs ierosinām analizēt potenciālo variantu ietekmi uz izteiksmi un alerģisko nelīdzsvarotību primārajos leikocītu kultūrās. Tāpēc mūsu mērķis ir īstenot ISV pārklasificēšanu HCM, izmantojot savus ģenētiskos populācijas datus, attēlveidošanas paņēmienus, kas piemērojami G+/F ģimenes locekļiem, un sarkomēru transkriptomas izpēti. (Latvian)
    4 August 2022
    0 references
    Is iad na hathraithigh de chiall neamhchinnte (ISV) an fhadhb is mó maidir leis an diagnóis a chinneadh i Myocardiopathy Hypertrophic. Is críoch marbh iad faoi láthair a chuireann bac ar chomhairle ghéiniteach in ábhair géinitíopa+/feinitíopa+. Ní mór dúinn: 1.Sonraí daonra-ghéiniteacha an phobail i gcoitinne a bhfuil rochtain acu ar athraithigh neamhchoitianta a bhailíochtú, thar shonraí loma ó bhoinn eacsanacha anaithnidithe (molaimid cohórt rialaithe de níos mó ná míle ábhar a thréithriú). 2.Cur chun feidhme bhrí go leor VSIanna ag baint úsáide as teicnící íomháithe fíneáil amhail athshondas, rud a éascaíonn athaicmiú an speictrim éagsúlachta sarcomeric in MCH. 3. Nós imeachta turgnamhach a fhorbairt a cheadaíonn sainmhíniú feidhmiúil ar na ISVanna seo, agus a théann thar an bhfíochán croí nach bhfuil ar fáil in go leor othar: molaimid anailís a dhéanamh ar éifeacht na n-athraitheacha iarrthóra ar léiriú agus éagothroime allelic i mbarra leukocyte príomhúla. Is é an cuspóir atá againn, dá bhrí sin, athaicmiú ISVanna i HCM a chur i bhfeidhm trí shonraí géiniteacha-population féin, teicnící íomháithe is infheidhme maidir le baill teaghlaigh G+/F, agus staidéar a dhéanamh ar thras-scríbhinn sarcomeric. (Irish)
    4 August 2022
    0 references
    Različice negotovega pomena (ISV) so največji problem pri določanju diagnoze pri hipertrofični miokardiopatiji. Trenutno so slepa ulica, ki blokira genetske nasvete pri preiskovancih genotipa+/fenotipa+. Moramo: 1.Genetic-populacijski podatki splošne populacije, dostopni za validacijo redkih variant, ki presegajo neobdelane podatke iz anonimiziranih eksonskih baz (predlagamo, da se označi kontrolirana kohorta več kot tisoč oseb). 2.Izvajanje pomena številnih VSI-jev z uporabo finih tehnik slikanja, kot je resonanca, ki olajšajo prerazvrstitev sarkomeričnega variacijskega spektra v MCH. 3. Razviti eksperimentalni postopek, ki omogoča funkcionalno opredelitev teh ISV in presega srčno tkivo, ki ni na voljo pri mnogih bolnikih: predlagamo analizo učinka kandidatnih variant na ekspresijo in alelično neravnovesje v primarnih pridelkih levkocitov. Naš cilj je torej izvesti prerazvrstitev ISV v HCM z lastnimi genetskimi podatki o populaciji, tehnikami slikanja, ki se uporabljajo za člane družine G+/F, in preučevanjem sarkomeričnega transkriptoma. (Slovenian)
    4 August 2022
    0 references
    Варианти с несигурно значение (ISV) са най-големият проблем при определяне на диагнозата при хипертрофична миокардиопатия. В момента те са задънена улица, която блокира генетичните съвети при генотип+/фенотип+ субекти. Трябва да: 1. Генетично-популационни данни на населението като цяло, достъпни за валидиране на редки варианти, извън необработените данни от анонимизирани екзонични бази (предлагаме да се характеризира контролирана кохорта от повече от хиляда субекта). 2.Изпълнение на значението на много VSI, като се използват фини техники за изобразяване, като например резонанс, които улесняват прекласифицирането на спектъра на саркомерната вариация в MCH. 3. Разработване на експериментална процедура, която позволява функционално определяне на тези ИВВ и излиза извън рамките на сърдечната тъкан, която не е налична при много пациенти: предлагаме да се анализира въздействието на кандидат-вариантите върху експресията и алелния дисбаланс в първичните левкоцитни култури. Следователно нашата цел е да приложим прекласификацията на ISV в HCM чрез собствени данни за генетичното население, техниките за изобразяване, приложими за членовете на семейството G+/F, и изучаването на саркомерната транскриптома. (Bulgarian)
    4 August 2022
    0 references
    Varjanti ta’ tifsira inċerta (ISV) huma l-akbar problema fid-determinazzjoni tad-dijanjosi f’mijokardjopatija Ipertrofika. Bħalissa huma tarf mejjet li jimblokka l-parir ġenetiku f’individwi ta’ ġenotip+/fenotip+. Jeħtieġ li: 1.Data tal-popolazzjoni ġenetika tal-popolazzjoni ġenerali aċċessibbli għall-validazzjoni ta’ varjanti rari, lil hinn mid-data mhux ipproċessata minn bażijiet eżonika anonimizzati (nipproponu li nikkaratterizzaw koorti kkontrollat ta’ aktar minn elf suġġett). 2.Implimentazzjoni tat-tifsira ta ‘ħafna VSIs li jużaw tekniki ta’ immaġni fina bħar-reżonanza, li jiffaċilitaw ir-riklassifikazzjoni tal-ispettru ta ‘varjazzjoni sarcomeric fl-MCH. 3. Tiżviluppa proċedura sperimentali li tippermetti definizzjoni funzjonali ta’ dawn l-ISVs, u tmur lil hinn mit-tessut tal-qalb mhux disponibbli f’ħafna pazjenti: aħna nipproponu li jiġi analizzat l-effett tal-varjanti kandidati fuq l-iżbilanċ tal-espressjoni u tal-alleliku fl-għelejjel primarji tal-lewkoċiti. L-għan tagħna huwa għalhekk li nimplimentaw ir-riklassifikazzjoni tal-ISVs fl-HCM permezz ta’ data dwar il-popolazzjoni ġenetika, tekniki ta’ immaġni applikabbli għall-membri tal-familja G+/F-, u studju tat-traskrizzjoni tas-sarkoma. (Maltese)
    4 August 2022
    0 references
    Variantes de significado incerto (VSI) são o maior problema na determinação do diagnóstico em miocardiopatia hipertrófica. Atualmente, são um beco sem saída que bloqueia o aconselhamento genético em indivíduos com genótipo+/fenótipo+. Temos de: 1.Dados genéticos-populacionais da população geral acessíveis à validação de variantes raras, para além dos dados brutos de bases exónicas anonimizadas (propomos caracterizar uma coorte controlada de mais de mil indivíduos). 2.Implementação do significado de muitos VSIs utilizando técnicas de imagem finas, como a ressonância, que facilitam a reclassificação do espectro de variação sarcomérica no MCH. 3. Desenvolver um procedimento experimental que permita a definição funcional destas VCI, e que vá além do tecido cardíaco não disponível em muitos doentes: Propomos analisar o efeito das variantes candidatas na expressão e no desequilíbrio alélico nas culturas primárias de leucócitos. Portanto, nosso objetivo é implementar a reclassificação de DVIs na CMH por meio de dados genético-populacionais próprios, técnicas de imagem aplicáveis aos membros da família G+/F- e estudo do transcriptoma sarcomérico. (Portuguese)
    4 August 2022
    0 references
    Varianter af usikker betydning (ISV) er det største problem med at bestemme diagnosen i hypertrofisk myokardiopati. De er i øjeblikket en blindgyde, der blokerer genetisk rådgivning i genotype+/phenotype+ emner. Vi er nødt til at: 1.Genetisk-populationsdata for den almindelige befolkning, der er tilgængelige for validering af sjældne varianter, ud over rådata fra anonymiserede exonic baser (vi foreslår at karakterisere en kontrolleret kohorte på mere end tusind forsøgspersoner). 2.Implementering af betydningen af mange VSI'er ved hjælp af fin billeddannelse teknikker såsom resonans, som letter omklassificering af det sarcomeriske variation spektrum i MCH. 3. Udvikle en eksperimentel procedure, der muliggør funktionel definition af disse ISV'er, og går ud over det hjertevæv, der ikke er tilgængeligt hos mange patienter: vi foreslår at analysere effekten af kandidatvarianter på ekspression og allelisk ubalance i primære leukocytafgrøder. Vores mål er derfor at gennemføre omklassificeringen af ISV'er i HCM ved hjælp af egne genetiske populationsdata, billeddannelsesteknikker, der gælder for G+/F- familiemedlemmer, og undersøgelse af sarcomerisk transkriptom. (Danish)
    4 August 2022
    0 references
    Variantele de semnificație incertă (ISV) sunt cea mai mare problemă în determinarea diagnosticului în miocardiopatia hipertrofică. Ele sunt în prezent o fundătură care blochează sfaturile genetice la subiecții genotip+/fenotip+. Trebuie să: 1.Date genetice-populație a populației generale accesibile validării variantelor rare, dincolo de datele brute din baze exonice anonimizate (vă propunem să caracterizăm o cohortă controlată de peste o mie de subiecți). 2.Implementarea semnificației multor VSI-uri folosind tehnici de imagistică fină, cum ar fi rezonanța, care facilitează reclasificarea spectrului de variație sarcomerică în MCH. 3. Dezvoltarea unei proceduri experimentale care să permită definirea funcțională a acestor DIV și care să depășească țesutul cardiac care nu este disponibil la mulți pacienți: ne propunem să analizăm efectul variantelor candidate asupra expresiei și dezechilibrului alelic în culturile primare de leucocite. Prin urmare, obiectivul nostru este de a implementa reclasificarea DIV în HCM prin intermediul datelor genetice-populației proprii, al tehnicilor de imagistică aplicabile membrilor familiei G+/F și al studiului transcrinomului sarcomeric. (Romanian)
    4 August 2022
    0 references
    Varianter av osäker betydelse (ISV) är det största problemet vid bestämning av diagnosen vid hypertrofisk myokardiopati. De är för närvarande en återvändsgränd som blockerar genetisk rådgivning hos genotyp+/fenotyp±patienter. Vi måste: 1.Genetic-population data från den allmänna populationen tillgängliga för validering av sällsynta varianter, utöver rådata från anonymiserade exoniska baser (vi föreslår att karakterisera en kontrollerad kohort på mer än tusen individer). 2.Genomförande av betydelsen av många VSI med hjälp av fina bildtekniker såsom resonans, vilket underlättar omklassificeringen av det sarkomeriska variationsspektrumet i MCH. 3. Utveckla ett experimentellt förfarande som möjliggör funktionell definition av dessa intervenienter, och går utöver den hjärtvävnad som inte finns tillgänglig hos många patienter: vi föreslår att man analyserar effekten av kandidatvarianter på uttryck och allelisk obalans i primära leukocytgrödor. Vårt mål är därför att genomföra omklassificeringen av ISV i HCM genom egna genetiska populationsdata, bildtekniker tillämpliga på G+/F- familjemedlemmar och studie av sarkomer transkriptom. (Swedish)
    4 August 2022
    0 references
    Oviedo
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    PI18_00719
    0 references