OPTICAL ANALYSIS OF REPRODUCTIVE CHARACTERS IN A DIAELICO CROSSING BETWEEN THREE IBERICO PORK STRAINS (Q3146621)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3146621 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | OPTICAL ANALYSIS OF REPRODUCTIVE CHARACTERS IN A DIAELICO CROSSING BETWEEN THREE IBERICO PORK STRAINS |
Project Q3146621 in Spain |
Statements
105,415.2 Euro
0 references
193,600.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
30 December 2016
0 references
29 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA
0 references
8193
0 references
EL PRESENTE PROYECTO SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LA EFICIENCIA REPRODUCTIVA DE LAS CERDAS IBERICAS, PARTIENDO DE UN DISEÑO EXPERIMENTAL QUE INTEGRA TRES ESTIRPES DISTINTAS (RETINTAS, ENTREPELADA Y TORBISCAL), ASI COMO SUS CRUCES F1, DENTRO DE UNA POBLACION COMERCIAL GESTIONADA POR LA EMPRESA INGA FOOD SA. EL PROYECTO PREVE USAR LA INFORMACION TANTO GENEALOGICA COMO PRODUCTIVA/REPRODUCTIVA DE LOS ANIMALES DESDE LA FUNDACION DE LA POBLACION (AÑO 2010), E GENERAR INFORMACION ADICIONAL DE TIPO GENOMICO (GENOTIPADO DE 1.200 INDIVIDUOS CON EL CHIP COMERCIAL DE 60.000 MARCADORES SNP), METABOLOMICO (ESPECTROSCOPIA DE INFRARROJO CERCANO PARA 1.500 MUESTRAS DE SUERO SANGUINEO TOMADAS ALREDEDOR DE LA INSEMINACION/IMPLANTACION), Y MICROBIOMICO (SECUENCIACION MASIVA PARA EL GEN 16S RRNA DE 300 MUESTRAS DE MICROBIOMA VAGINAL TOMADAS EN EL MOMENTO DE LA INSEMINACION DE LAS CERDAS). UNA VEZ OBTENIDA TODA LA INFORMACION, SE REALIZARA UN PRIMER PASO ENFOCADO A ANALIZAR Y CARACTERIZAR LA DIVERSIDAD GENETICA DE LAS ESTIRPES UTILIZADAS, ASI COMO DETERMINAR LA PRESENCIA DE HUELLA DE SELECCION EN LAS MISMAS. EN SEGUNDO LUGAR SE REALIZARAN ANALISIS ¿OMICOS¿ DE ASOCIACION SOBRE CARACTERES REPRODUCTIVOS COMO LA EDAD A LA PRIMERA INSEMINACION O AL PRIMER PARTO, LA FERTILIDAD DE LAS CERDAS (GESTANTE O NO GESTANTE), O LA PROLIFICIDAD EN TERMINOS DE LECHONES NACIDOS VIVOS, MUERTOS O LECHONES DESTETADOS. EN ESTE CASO SE ESTUDIARAN LAS POSIBLES ASOCIACIONES ENTRE ESTOS CARACTERES REPRODUCTIVOS Y LOS DISTINTAS FUENTES DE INFORMACION ¿OMICA¿ POR SEPARADO (GENOMA, METABOLOMA Y MICROBIOMA), PLANTEANDO TAMBIEN EL ESTUDIO DEL POSIBLE IMPACTO DE LA CONSANGUINIDAD SOBRE LOS MISMOS. EN UN SIGUIENTE PASO, SE PROFUNDIZARA EN LOS MODELOS DE EVALUACION GENOMICA, PONIENDO UN ENFASIS ESPECIAL EN LA PONDERACION DE LA INFORMACION TANTO GENOMICA COMO FENOTIPICA, ASI COMO LA MAS QUE POSIBLE INTERACCION ENTRE EL GENOMA Y EL METABOLOMA. FINALMENTE, Y SIENDO ESTE UNO DE LOS HITOS MAS RELEVANTES DEL PROYECTO, SE PRETENDE ANALIZAR DE MANERA INTEGRADA TODAS LAS FUENTES DE INFORMACION DISPONIBLES, CON EL OBJETIVO DE CREAR REDES BIOLOGICAS QUE INTEGREN LAS DISTINTAS CAPAS DE INFORMACION Y APORTEN UNA CARACTERIZACION MAS COMPLETA Y REALISTA DE LOS MECANISMOS BIOLOGICOS IMPLICADOS EN LA REGULACION DE LA REPRODUCCION (Y SU EFICIENCIA) EN EL PORCINO EN GENERAL, Y EN LAS CERDAS IBERICAS EN PARTICULAR. EN CONJUNTO, SE PLANTEA UNA INICIATIVA NOVEDOSA Y AMBICIOSA, RELEVANTE TANTO PARA LA INDUSTRIA PORCINA COMO PARA LA COMUNIDAD CIENTIFICA, E IMPLICANDO UN EQUIPO DE INVESTIGADORES DE RECONOCIDO PRESTIGIO INTERNACIONAL QUE GARANTIZA LA VIABILIDAD DE PROYECTO Y LA CONSECUCION DE LOS OBJETIVOS MARCADOS. (Spanish)
0 references
THIS PROJECT FOCUSES ON THE STUDY OF THE REPRODUCTIVE EFFICIENCY OF IBERIAN BRISTLES, BASED ON AN EXPERIMENTAL DESIGN THAT INTEGRATES THREE DIFFERENT STRAINS (RETINTAS, ENTREPELADA AND TORBISCAL), AS WELL AS THEIR F1 CROSSES, WITHIN A COMMERCIAL POPULATION MANAGED BY INGA FOOD SA. THE PROJECT PLANS TO USE BOTH GENEALOGIC AND PRODUCTIVE/REPRODUCTIVE INFORMATION OF ANIMALS FROM THE POPULATION FOUNDATION (YEAR 2010), AND GENERATE ADDITIONAL INFORMATION OF GENOMIC TYPE (GENOTYPING OF 1,200 INDIVIDUALS WITH THE COMMERCIAL CHIP OF 60,000 SNP MARKERS), METABOLOMICO (NEAR INFRARED SPECTROSCOPY FOR 1,500 BLOOD SERUM SAMPLES TAKEN AROUND THE INSEMINATION/IMPLANTATION), AND MICROBIOMICO (MASSIVE SEQUENCING FOR THE 16S RRNA GENE OF 300 SAMPLES OF VAGINAL MICROBIOME TAKEN AT THE TIME OF THE INSEMINATION OF THE SOWS). ONCE ALL THE INFORMATION IS OBTAINED, A FIRST STEP WILL BE MADE FOCUSED ON ANALYSING AND CHARACTERISING THE GENETIC DIVERSITY OF THE STRAINS USED, AS WELL AS DETERMINING THE PRESENCE OF A SELECTION FOOTPRINT IN THEM. SECOND, WILL BE PERFORMED ANOMALY OF ASSOCIATION ON REPRODUCTIVE CHARACTERS SUCH AS AGE AT FIRST INSEMINATION OR FIRST DELIVERY, FERTILITY OF SOWS (GESTANT OR NON-PREGNANT), OR PROLIFICITY IN TERMS OF PIGLETS BORN ALIVE, DEAD OR WEANED PIGLETS. IN THIS CASE THE POSSIBLE ASSOCIATIONS BETWEEN THESE REPRODUCTIVE CHARACTERS AND THE DIFFERENT SOURCES OF INFORMATION WILL BE STUDIED SEPARATELY (GENOME, METABOLOMA AND MICROBIOME), ALSO PROPOSING THE STUDY OF THE POSSIBLE IMPACT OF CONSANGUINITY ON THEM. IN A NEXT STEP, IT WILL DEEPEN THE MODELS OF GENOMIC EVALUATION, PUTTING A SPECIAL EMPHASIS ON THE WEIGHTING OF BOTH GENOMIC AND PHENOTYPIC INFORMATION, AS WELL AS THE MORE THAN POSSIBLE INTERACTION BETWEEN THE GENOME AND THE METABOLOMA. FINALLY, BEING ONE OF THE MOST RELEVANT MILESTONES OF THE PROJECT, THE AIM IS TO ANALYSE IN AN INTEGRATED WAY ALL AVAILABLE SOURCES OF INFORMATION, WITH THE AIM OF CREATING BIOLOGICAL NETWORKS THAT INTEGRATE THE DIFFERENT LAYERS OF INFORMATION AND PROVIDE A MORE COMPLETE AND REALISTIC CHARACTERISATION OF THE BIOLOGICAL MECHANISMS INVOLVED IN THE REGULATION OF REPRODUCTION (AND THEIR EFFICIENCY) IN THE PIGS IN GENERAL, AND IBERIAN SOWS IN PARTICULAR. ON THE WHOLE, A NEW AND AMBITIOUS INITIATIVE IS PROPOSED, RELEVANT TO BOTH THE PIG INDUSTRY AND THE SCIENTIFIC COMMUNITY, AND INVOLVING A TEAM OF RESEARCHERS OF RECOGNISED INTERNATIONAL STANDING THAT GUARANTEES THE VIABILITY OF THE PROJECT AND THE ACHIEVEMENT OF THE OBJECTIVES SET. (English)
12 October 2021
0.3463947514935416
0 references
CE PROJET SE CONCENTRE SUR L’ÉTUDE DE L’EFFICACITÉ REPRODUCTRICE DES SOIES IBÉRIQUES, BASÉE SUR UNE CONCEPTION EXPÉRIMENTALE QUI INTÈGRE TROIS SOUCHES DIFFÉRENTES (RETINTAS, ENTREPELADA ET TORBISCAL), AINSI QUE LEURS CROISEMENTS F1, AU SEIN D’UNE POPULATION COMMERCIALE GÉRÉE PAR INGA FOOD SA. LE PROJET PRÉVOIT D’UTILISER DES INFORMATIONS GÉNÉALOGIQUES ET PRODUCTIVES/REPRODUCTRICES SUR LES ANIMAUX DE LA FONDATION DE LA POPULATION (ANNÉE 2010), ET DE GÉNÉRER DES INFORMATIONS SUPPLÉMENTAIRES DE TYPE GÉNOMIQUE (GÉNOTAGE DE 1 200 INDIVIDUS AVEC LA PUCE COMMERCIALE DE 60 000 MARQUEURS SNP), METABOLOMICO (SPECTROSCOPIE INFRAROUGE PROCHE DE 1500 ÉCHANTILLONS DE SÉRUM SANGUIN PRÉLEVÉS AUTOUR DE L’INSÉMINATION/IMPLANTATION) ET MICROBIOMICO (SÉQUENÇAGE MASSIF DU GÈNE 16S DE L’ARNR 16S DE 300 ÉCHANTILLONS DE MICROBIOME VAGINAL PRÉLEVÉS AU MOMENT DE L’INSÉMINATION DES TRUIES). UNE FOIS TOUTES LES INFORMATIONS OBTENUES, UNE PREMIÈRE ÉTAPE SERA FAITE POUR ANALYSER ET CARACTÉRISER LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE DES SOUCHES UTILISÉES, AINSI QUE POUR DÉTERMINER LA PRÉSENCE D’UNE EMPREINTE DE SÉLECTION DANS CELLES-CI. DEUXIÈMEMENT, UNE ANOMALIE D’ASSOCIATION SERA RÉALISÉE SUR DES CARACTÈRES REPRODUCTIFS TELS QUE L’ÂGE AU DÉBUT DE L’INSÉMINATION OU DE LA PREMIÈRE ACCOUCHEMENT, LA FERTILITÉ DES TRUIES (GESTANT OU NON ENCEINTE) OU LA PROLIFICITÉ EN TERMES DE PORCELETS NÉS VIVANTS, MORTS OU SEVRÉS. DANS CE CAS, LES ASSOCIATIONS POSSIBLES ENTRE CES CARACTÈRES REPRODUCTEURS ET LES DIFFÉRENTES SOURCES D’INFORMATION SERONT ÉTUDIÉES SÉPARÉMENT (GÉNOME, METABOLOMA ET MICROBIOME), EN PROPOSANT ÉGALEMENT L’ÉTUDE DE L’IMPACT POSSIBLE DE LA CONSANGUINITÉ SUR EUX. DANS UNE PROCHAINE ÉTAPE, IL APPROFONDIRA LES MODÈLES D’ÉVALUATION GÉNOMIQUE, EN METTANT PARTICULIÈREMENT L’ACCENT SUR LA PONDÉRATION DE L’INFORMATION GÉNOMIQUE ET PHÉNOTYPIQUE, AINSI QUE SUR L’INTERACTION PLUS QUE POSSIBLE ENTRE LE GÉNOME ET LE METABOLOMA. ENFIN, ÉTANT L’UNE DES ÉTAPES LES PLUS IMPORTANTES DU PROJET, L’OBJECTIF EST D’ANALYSER DE MANIÈRE INTÉGRÉE TOUTES LES SOURCES D’INFORMATION DISPONIBLES, DANS LE BUT DE CRÉER DES RÉSEAUX BIOLOGIQUES QUI INTÈGRENT LES DIFFÉRENTES COUCHES D’INFORMATION ET FOURNISSENT UNE CARACTÉRISATION PLUS COMPLÈTE ET PLUS RÉALISTE DES MÉCANISMES BIOLOGIQUES IMPLIQUÉS DANS LE RÈGLEMENT DE LA REPRODUCTION (ET DE LEUR EFFICACITÉ) CHEZ LES PORCS EN GÉNÉRAL, ET LES TRUIES IBÉRIQUES EN PARTICULIER. DANS L’ENSEMBLE, UNE INITIATIVE NOUVELLE ET AMBITIEUSE EST PROPOSÉE, QUI CONCERNE À LA FOIS L’INDUSTRIE PORCINE ET LA COMMUNAUTÉ SCIENTIFIQUE, ET QUI ASSOCIE UNE ÉQUIPE DE CHERCHEURS AYANT UNE RÉPUTATION INTERNATIONALE RECONNUE QUI GARANTIT LA VIABILITÉ DU PROJET ET LA RÉALISATION DES OBJECTIFS FIXÉS. (French)
2 December 2021
0 references
DAS PROJEKT KONZENTRIERT SICH AUF DIE UNTERSUCHUNG DER REPRODUKTIONSEFFIZIENZ VON IBERISCHEN BORSTEN, BASIEREND AUF EINEM EXPERIMENTELLEN DESIGN, DAS DREI VERSCHIEDENE STÄMME (RETINTAS, ENTREPELADA UND TORBISCAL) SOWIE DEREN F1-KREUZE IN EINE VON INGA FOOD SA VERWALTETE KOMMERZIELLE BEVÖLKERUNG INTEGRIERT. DAS PROJEKT PLANT, SOWOHL GENEALOGISCHE ALS AUCH PRODUKTIVE/REPRODUKTIVE INFORMATIONEN VON TIEREN DER POPULATIONSSTIFTUNG (JAHR 2010) ZU NUTZEN UND ZUSÄTZLICHE INFORMATIONEN ÜBER DEN GENOMISCHEN TYP ZU GENERIEREN (GENOTYPISIERUNG VON 1.200 PERSONEN MIT DEM KOMMERZIELLEN CHIP VON 60.000 SNP-MARKERN), METABOLOMICO (NAHE INFRAROTSPEKTROSKOPIE FÜR 1.500 BLUTSERUMPROBEN, DIE UM DIE INSEMINATION/IMPLANTATION ENTNOMMEN WURDEN) UND MICROBIOMICO (MASSIVE SEQUENZIERUNG FÜR DAS 16S RRNA-GEN VON 300 PROBEN VAGINALEM MIKROBIOM, DIE ZUM ZEITPUNKT DER INSEMINATION DER SAUEN ENTNOMMEN WURDEN). SOBALD ALLE INFORMATIONEN VORLIEGEN, WIRD EIN ERSTER SCHRITT AUF DIE ANALYSE UND CHARAKTERISIERUNG DER GENETISCHEN VIELFALT DER VERWENDETEN STÄMME SOWIE AUF DIE BESTIMMUNG DES VORHANDENSEINS EINES AUSWAHLFUSSABDRUCKS IN IHNEN AUSGERICHTET. ZWEITENS WIRD EINE ANOMALIE DER VEREINIGUNG ÜBER FORTPFLANZUNGSCHARAKTERE WIE ALTER BEI DER ERSTEN BESAMUNG ODER ERSTLIEFERUNG, FRUCHTBARKEIT VON SAUEN (GESTANT ODER NICHT-SCHWANGER) ODER FRUCHTBARKEIT IN BEZUG AUF LEBENDE FERKEL, TOTE ODER ENTWÖHNTE FERKEL DURCHGEFÜHRT. IN DIESEM FALL WERDEN DIE MÖGLICHEN ASSOZIATIONEN ZWISCHEN DIESEN REPRODUKTIONSCHARAKTEREN UND DEN VERSCHIEDENEN INFORMATIONSQUELLEN GETRENNT UNTERSUCHT (GENOM, METABOLOMA UND MIKROBIOM), UND SCHLÄGT AUCH VOR, DIE MÖGLICHEN AUSWIRKUNGEN VON KONANGUINITÄT AUF SIE ZU UNTERSUCHEN. IN EINEM NÄCHSTEN SCHRITT WIRD ES DIE MODELLE DER GENOMISCHEN BEWERTUNG VERTIEFEN, WOBEI EIN BESONDERER SCHWERPUNKT AUF DER GEWICHTUNG SOWOHL GENOMISCHER ALS AUCH PHÄNOTYPISCHER INFORMATIONEN SOWIE DIE MEHR ALS MÖGLICHE WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN GENOM UND METABOLOMA GELEGT WIRD. ALS EINER DER WICHTIGSTEN MEILENSTEINE DES PROJEKTS SCHLIESSLICH SOLLEN ALLE VERFÜGBAREN INFORMATIONSQUELLEN IN INTEGRIERTER WEISE ANALYSIERT WERDEN, UM BIOLOGISCHE NETZWERKE ZU SCHAFFEN, DIE DIE VERSCHIEDENEN INFORMATIONSSCHICHTEN INTEGRIEREN UND EINE UMFASSENDERE UND REALISTISCHERE CHARAKTERISIERUNG DER BIOLOGISCHEN MECHANISMEN ERMÖGLICHEN, DIE AN DER VERORDNUNG ÜBER DIE FORTPFLANZUNG (UND DEREN EFFIZIENZ) AN SCHWEINEN IM ALLGEMEINEN UND IM BESONDEREN IBERISCHEN SAUEN BETEILIGT SIND. INSGESAMT WIRD EINE NEUE UND EHRGEIZIGE INITIATIVE VORGESCHLAGEN, DIE SOWOHL FÜR DIE SCHWEINEINDUSTRIE ALS AUCH FÜR DIE WISSENSCHAFTLICHE GEMEINSCHAFT RELEVANT IST UND EIN TEAM VON FORSCHERN MIT ANERKANNTER INTERNATIONALER STELLUNG EINBEZIEHT, DIE DIE LEBENSFÄHIGKEIT DES PROJEKTS UND DIE ERREICHUNG DER GESETZTEN ZIELE GEWÄHRLEISTEN. (German)
9 December 2021
0 references
DIT PROJECT RICHT ZICH OP DE STUDIE VAN DE REPRODUCTIEVE EFFICIËNTIE VAN IBERISCHE BORSTELHAREN, GEBASEERD OP EEN EXPERIMENTEEL ONTWERP DAT DRIE VERSCHILLENDE STAMMEN (RETINTAS, ENTREPELADA EN TORBISCAL) INTEGREERT, EVENALS HUN F1 KRUISEN, BINNEN EEN COMMERCIËLE POPULATIE BEHEERD DOOR INGA FOOD SA. HET PROJECT IS VAN PLAN OM ZOWEL GENEALOGISCHE ALS PRODUCTIEVE/REPRODUCTIEVE INFORMATIE VAN DIEREN UIT DE POPULATIESTICHTING (JAAR 2010) TE GEBRUIKEN EN AANVULLENDE INFORMATIE TE GENEREREN VAN GENOMISCH TYPE (GENOTYPERING VAN 1.200 INDIVIDUEN MET DE COMMERCIËLE CHIP VAN 60.000 SNP-MARKERS), METABOLOMICO (BIJNA INFRAROODSPECTROSCOPIE VOOR 1.500 BLOEDSERUMMONSTERS DIE ZIJN GENOMEN ROND DE INSEMINATIE/IMPLANTATIE), EN MICROBIOMICO (MASSAGE SEQUENCING VOOR HET 16S RRNA-GEN VAN 300 MONSTERS VAGINALE MICROBIOME GENOMEN OP HET MOMENT VAN INSEMINATIE VAN DE ZEUGEN). ZODRA ALLE INFORMATIE IS VERKREGEN, ZAL EEN EERSTE STAP WORDEN GEZET GERICHT OP HET ANALYSEREN EN KARAKTERISEREN VAN DE GENETISCHE DIVERSITEIT VAN DE GEBRUIKTE STAMMEN, EVENALS HET BEPALEN VAN DE AANWEZIGHEID VAN EEN SELECTIEVOETAFDRUK ERIN. TEN TWEEDE, ZAL WORDEN UITGEVOERD ANOMALIE VAN ASSOCIATIE OP REPRODUCTIEVE TEKENS ZOALS LEEFTIJD BIJ EERSTE INSEMINATIE OF EERSTE BEVALLING, VRUCHTBAARHEID VAN ZEUGEN (GESTANT OF NIET-ZWANGER), OF PROLIFICITEIT IN TERMEN VAN BIGGEN GEBOREN LEVEND, DOOD OF GESPEENDE BIGGEN. IN DIT GEVAL ZULLEN DE MOGELIJKE ASSOCIATIES TUSSEN DEZE VOORTPLANTINGSKARAKTERS EN DE VERSCHILLENDE INFORMATIEBRONNEN AFZONDERLIJK WORDEN ONDERZOCHT (GENOOM, METABOLOMA EN MICROBIOME), WAARBIJ OOK WORDT VOORGESTELD DE MOGELIJKE IMPACT VAN BLOEDVERWANTSCHAP OP HEN TE ONDERZOEKEN. IN EEN VOLGENDE STAP ZAL HET DE MODELLEN VAN GENOMIC EVALUATIE VERDIEPEN, WAARBIJ EEN SPECIALE NADRUK WORDT GELEGD OP DE WEGING VAN ZOWEL GENOMIC ALS FENOTYPISCHE INFORMATIE, EVENALS DE MEER DAN MOGELIJKE INTERACTIE TUSSEN HET GENOOM EN HET METABOLOMA. ALS EEN VAN DE MEEST RELEVANTE MIJLPALEN VAN HET PROJECT IS HET DOEL TEN SLOTTE OM OP GEÏNTEGREERDE WIJZE ALLE BESCHIKBARE INFORMATIEBRONNEN TE ANALYSEREN, MET ALS DOEL BIOLOGISCHE NETWERKEN TOT STAND TE BRENGEN DIE DE VERSCHILLENDE LAGEN VAN INFORMATIE INTEGREREN EN EEN VOLLEDIGER EN REALISTISCHER KARAKTERISERING VAN DE BIOLOGISCHE MECHANISMEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE VERORDENING INZAKE DE VOORTPLANTING (EN HUN EFFICIËNTIE) IN DE VARKENS IN HET ALGEMEEN, EN IBERISCHE ZEUGEN IN HET BIJZONDER. OVER HET GEHEEL GENOMEN WORDT EEN NIEUW EN AMBITIEUS INITIATIEF VOORGESTELD, DAT ZOWEL VOOR DE VARKENSINDUSTRIE ALS VOOR DE WETENSCHAPPELIJKE GEMEENSCHAP VAN BELANG IS, WAARBIJ EEN TEAM VAN ERKENDE INTERNATIONALE ONDERZOEKERS WORDT BETROKKEN DAT DE LEVENSVATBAARHEID VAN HET PROJECT EN DE VERWEZENLIJKING VAN DE GESTELDE DOELSTELLINGEN WAARBORGT. (Dutch)
17 December 2021
0 references
QUESTO PROGETTO SI CONCENTRA SULLO STUDIO DELL'EFFICIENZA RIPRODUTTIVA DELLE SETOLE IBERICHE, BASATO SU UN PROGETTO SPERIMENTALE CHE INTEGRA TRE CEPPI DIVERSI (RETINTAS, ENTREPELADA E TORBISCAL), NONCHÉ I LORO CROCI F1, ALL'INTERNO DI UNA POPOLAZIONE COMMERCIALE GESTITA DA INGA FOOD SA. IL PROGETTO PREVEDE DI UTILIZZARE SIA LE INFORMAZIONI GENEALOGICHE CHE PRODUTTIVE/RIPRODUTTIVE DI ANIMALI DELLA FONDAZIONE POPOLAZIONE (ANNO 2010), E GENERARE ULTERIORI INFORMAZIONI DI TIPO GENOMICO (GENOTIPIZZAZIONE DI 1.200 INDIVIDUI CON IL CHIP COMMERCIALE DI 60.000 MARCATORI SNP), METABOLOMICO (QUASI SPETTROSCOPIA INFRAROSSA PER 1.500 CAMPIONI DI SIERO DI SANGUE PRELEVATI INTORNO ALL'INSEMINAZIONE/IMPIANTO) E MICROBIOMICO (SEQUENZIAMENTO MASSIVO PER IL GENE 16S RRNA DI 300 CAMPIONI DI MICROBIOMA VAGINALE PRELEVATI AL MOMENTO DELL'INSEMINAZIONE DELLE SCROFE). UNA VOLTA OTTENUTE TUTTE LE INFORMAZIONI, UN PRIMO PASSO SARÀ INCENTRATO SULL'ANALISI E LA CARATTERIZZAZIONE DELLA DIVERSITÀ GENETICA DEI CEPPI UTILIZZATI, NONCHÉ SULLA DETERMINAZIONE DELLA PRESENZA DI UN'IMPRONTA DI SELEZIONE IN ESSI. IN SECONDO LUOGO, VERRÀ ESEGUITA UN'ANOMALIA DELL'ASSOCIAZIONE SU CARATTERI RIPRODUTTIVI COME L'ETÀ ALLA PRIMA INSEMINAZIONE O PRIMO PARTO, LA FERTILITÀ DELLE SCROFE (GESTANT O NON INCINTA), O LA PROLIFICITÀ IN TERMINI DI SUINETTI NATI VIVI, MORTI O SVEZZATI. IN QUESTO CASO VERRANNO STUDIATE SEPARATAMENTE LE POSSIBILI ASSOCIAZIONI TRA QUESTI CARATTERI RIPRODUTTIVI E LE DIVERSE FONTI DI INFORMAZIONE (GENOMO, METABOLOMA E MICROBIOME), PROPONENDO ANCHE LO STUDIO DEL POSSIBILE IMPATTO DELLA CONSANGUINEITÀ SU DI ESSI. IN UNA FASE SUCCESSIVA, APPROFONDIRÀ I MODELLI DI VALUTAZIONE GENOMICA, PONENDO PARTICOLARE ENFASI SULLA PONDERAZIONE DELLE INFORMAZIONI SIA GENOMICHE CHE FENOTIPICHE, NONCHÉ SULLA PIÙ CHE POSSIBILE INTERAZIONE TRA IL GENOMA E IL METABOLOMA. INFINE, ESSENDO UNA DELLE TAPPE PIÙ RILEVANTI DEL PROGETTO, L'OBIETTIVO È QUELLO DI ANALIZZARE IN MODO INTEGRATO TUTTE LE FONTI DI INFORMAZIONE DISPONIBILI, CON L'OBIETTIVO DI CREARE RETI BIOLOGICHE CHE INTEGRINO I DIVERSI LIVELLI DI INFORMAZIONE E FORNISCANO UNA CARATTERIZZAZIONE PIÙ COMPLETA E REALISTICA DEI MECCANISMI BIOLOGICI COINVOLTI NELLA REGOLAZIONE DELLA RIPRODUZIONE (E DELLA LORO EFFICIENZA) NEI SUINI IN GENERALE E NELLE SCROFE IBERICHE IN PARTICOLARE. NEL COMPLESSO, VIENE PROPOSTA UNA NUOVA E AMBIZIOSA INIZIATIVA, PERTINENTE SIA ALL'INDUSTRIA SUINA CHE ALLA COMUNITÀ SCIENTIFICA, CHE COINVOLGA UN GRUPPO DI RICERCATORI DI RICONOSCIUTA FAMA INTERNAZIONALE CHE GARANTISCA LA FATTIBILITÀ DEL PROGETTO E IL CONSEGUIMENTO DEGLI OBIETTIVI FISSATI. (Italian)
16 January 2022
0 references
SEE PROJEKT KESKENDUB IBEERIA HARJASTE PALJUNEMISEFEKTIIVSUSE UURINGULE, MIS PÕHINEB EKSPERIMENTAALSEL DISAINIL, MIS ÜHENDAB KOLM ERINEVAT TÜVE (RETINTAS, ENTREPELADA JA TORBISCAL) NING NENDE F1 RISTANDID INGA FOOD SA HALLATAVA KOMMERTSPOPULATSIOONI RAAMES. PROJEKTIS ON KAVAS KASUTADA POPULATSIOONI SIHTASUTUSE LOOMADE GENEALOOGILIST JA PRODUKTIIVSET/REPRODUKTIIVSET TEAVET (2010. AASTA) NING KOGUDA TÄIENDAVAT TEAVET GENOOMITÜÜBI KOHTA (1200 ISENDI GENOTÜPISEERIMINE 60 000 SNP MARKERIGA KAUBANDUSLIKU KIIBIGA), METABOLOMICO (INFRAPUNASPEKTROSKOOPIA 1500 VERESEERUMIPROOVI JAOKS, MIS ON VÕETUD SEEMENDAMISE/IMPLANTATSIOONI ÜMBER) JA MICROBIOMICO (EMISTE SEEMENDAMISE AJAL VÕETUD 300 TUPE MIKROBIOOMI PROOVI MASSILINE SEKVENEERIMINE 16S RRNA GEENI JAOKS). KUI KOGU TEAVE ON SAADUD, KESKENDUTAKSE ESIMESE SAMMUNA KASUTATAVATE TÜVEDE GENEETILISE MITMEKESISUSE ANALÜÜSILE JA ISELOOMUSTAMISELE NING VALIKUJALAJÄLJE KINDLAKSTEGEMISELE. TEISEKS TEHAKSE SEOSE ANOMAALIA SELLISTE PALJUNEMISTUNNUSTEGA NAGU VANUS ESIMESEL SEEMENDAMISEL VÕI ESMAKORDSEL SÜNNITUSEL, EMISTE VILJAKUS (GESTANT VÕI MITTERASEDAD) VÕI VILJAKUS ELUSATE, SURNUD VÕI VÕÕRUTATUD PÕRSASTE OSAS. SEL JUHUL UURITAKSE NENDE REPRODUKTIIVSETE OMADUSTE JA ERINEVATE TEABEALLIKATE VÕIMALIKKE SEOSEID ERALDI (GENOOMID, METABOLOMA JA MIKROBIOOM), SAMUTI TEHAKSE ETTEPANEK UURIDA VERESOONKONNA VÕIMALIKKU MÕJU NEILE. JÄRGMISE SAMMUNA SÜVENDAB SEE GENOOMILISE HINDAMISE MUDELEID, PÖÖRATES ERILIST TÄHELEPANU NII GENOOMI KUI KA FENOTÜÜBILISE TEABE KAALUMISELE NING GENOOMI JA METABOLOMA VÕIMALIKULE KOOSTOIMELE. PROJEKTI ÜHEKS KÕIGE OLULISEMAKS VERSTAPOSTIKS ON EESMÄRK ANALÜÜSIDA INTEGREERITULT KÕIKI KÄTTESAADAVAID TEABEALLIKAID, ET LUUA BIOLOOGILISED VÕRGUSTIKUD, MIS INTEGREERIKSID ERI TEABEKIHID NING KIRJELDAKSID TERVIKLIKUMALT JA REALISTLIKUMALT BIOLOOGILISI MEHHANISME, MIS ON SEOTUD SIGIMISE (JA NENDE TÕHUSUSE) MÄÄRUSEGA SIGADEL ÜLDISELT JA EELKÕIGE PÜRENEE POOLSAARE EMISTEL. ÜLDISELT TEHAKSE ETTEPANEK UUE JA AMBITSIOONIKA ALGATUSE KOHTA, MIS ON OLULINE NII SEATÖÖSTUSELE KUI KA TEADUSRINGKONDADELE NING MILLESSE ON KAASATUD TUNNUSTATUD RAHVUSVAHELISELT TUNNUSTATUD TEADLASTE RÜHM, MIS TAGAB PROJEKTI ELUJÕULISUSE JA SEATUD EESMÄRKIDE SAAVUTAMISE. (Estonian)
4 August 2022
0 references
ŠIS PROJEKTAS ORIENTUOTAS Į IBERIJOS ŠERIŲ REPRODUKCINIO EFEKTYVUMO TYRIMĄ, PAGRĮSTĄ EKSPERIMENTINIU DIZAINU, APIMANČIU TRIS SKIRTINGAS PADERMES (RETINTAS, ENTREPELADA IR TORBISCAL), TAIP PAT JŲ F1 KRYŽIUS, PRIKLAUSANČIUS KOMERCINEI POPULIACIJAI, KURIAI VADOVAUJA INGA FOOD SA. PROJEKTE PLANUOJAMA NAUDOTI TIEK GENEALOGINĘ, TIEK PRODUKTYVIĄ IR (ARBA) REPRODUKCINĘ INFORMACIJĄ APIE GYVŪNUS IŠ POPULIACIJŲ FONDO (2010 M.) IR GAUTI PAPILDOMOS GENOMINIO TIPO INFORMACIJOS (GENOTIPŲ NUSTATYMAS 1 200 ASMENŲ, KURIŲ KOMERCINIS LUSTAS YRA 60 000 SNP ŽYMENŲ), METABOLOMICO (BEVEIK INFRARAUDONŲJŲ SPINDULIŲ SPEKTROSKOPIJA 1 500 KRAUJO SERUMO MĖGINIŲ, PAIMTŲ APLINK SĖKLINIMĄ/IMPLANTACIJĄ) IR MICROBIOMICO (MASINĖ 16S RRNR GENO SEKOS NUSTATYMAS IŠ 300 MAKŠTIES MIKROBIOMŲ MĖGINIŲ, PAIMTŲ PARŠAVEDŽIŲ SĖKLINIMO METU). KAI VISA INFORMACIJA BUS GAUTA, PIRMIAUSIA BUS SIEKIAMA ANALIZUOTI IR APIBŪDINTI NAUDOJAMŲ ŠTAMŲ GENETINĘ ĮVAIROVĘ, TAIP PAT NUSTATYTI, AR JOSE YRA ATRANKOS PĖDSAKAS. ANTRA, BUS ATLIEKAMA ASOCIACIJOS ANOMALIJA DĖL REPRODUKCINIŲ SAVYBIŲ, TOKIŲ KAIP AMŽIUS PIRMOJO APVAISINIMO AR PIRMOJO GIMDYMO METU, PARŠAVEDŽIŲ VAISINGUMAS (GESTANT ARBA NE NĖŠČIOS), ARBA PRODUKTYVUMAS, KALBANT APIE PARŠELIUS, GIMUSIUS GYVUS, NEGYVUS AR NUJUNKYTUS PARŠELIUS. ŠIUO ATVEJU BUS ATSKIRAI TIRIAMOS GALIMOS ŠIŲ REPRODUKCINIŲ SAVYBIŲ IR ĮVAIRIŲ INFORMACIJOS ŠALTINIŲ (GENOMOS, METABOLOMA IR MIKROBIOMO) SĄSAJOS, TAIP PAT SIŪLOMA IŠTIRTI GALIMĄ SĄMONINGUMO POVEIKĮ JIEMS. KITAME ETAPE JI PAGILINS GENOMINIO VERTINIMO MODELIUS, YPATINGĄ DĖMESĮ SKIRDAMA TIEK GENOMINĖS, TIEK FENOTIPINĖS INFORMACIJOS SVORIUI, TAIP PAT DAUGIAU NEI GALIMAI GENOMO IR METABOLOMA SĄVEIKAI. GALIAUSIAI, KADANGI ŠIS PROJEKTAS YRA VIENAS IŠ SVARBIAUSIŲ PROJEKTO ETAPŲ, JUO SIEKIAMA INTEGRUOTAI IŠANALIZUOTI VISUS TURIMUS INFORMACIJOS ŠALTINIUS, SIEKIANT SUKURTI BIOLOGINIUS TINKLUS, KURIE APIMTŲ SKIRTINGUS INFORMACIJOS SLUOKSNIUS IR SUTEIKTŲ IŠSAMESNĮ IR REALESNĮ BIOLOGINIŲ MECHANIZMŲ, SUSIJUSIŲ SU KIAULIŲ DAUGINIMOSI (IR JŲ VEIKSMINGUMO) REGLAMENTAVIMU APSKRITAI, IR YPAČ IBERIJOS PARŠAVEDŽIŲ, APIBŪDINIMĄ. APSKRITAI SIŪLOMA NAUJA PLATAUS UŽMOJO INICIATYVA, SUSIJUSI TIEK SU KIAULIŲ PRAMONE, TIEK SU MOKSLO BENDRUOMENE, ĮTRAUKIANT PRIPAŽINTŲ TARPTAUTINIŲ MOKSLININKŲ GRUPĘ, KURI GARANTUOTŲ PROJEKTO GYVYBINGUMĄ IR NUSTATYTŲ TIKSLŲ ĮGYVENDINIMĄ. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
OVAJ PROJEKT USMJEREN JE NA PROUČAVANJE REPRODUKTIVNE UČINKOVITOSTI IBERIJSKIH ČEKINJA, NA TEMELJU EKSPERIMENTALNOG DIZAJNA KOJI OBJEDINJUJE TRI RAZLIČITA SOJA (RETINTAS, ENTREPELADA I TORBISKA), KAO I NJIHOVE F1 KRIŽEVE, UNUTAR KOMERCIJALNE POPULACIJE KOJOM UPRAVLJA INGA FOOD SA. PROJEKTOM SE PLANIRAJU KORISTITI I GENEALOŠKI I PRODUKTIVNI/REPRODUKTIVNI PODACI O ŽIVOTINJAMA IZ ZAKLADE POPULACIJE (2010.), TE GENERIRATI DODATNE INFORMACIJE GENOMSKOG TIPA (GENOTIPIZACIJA 1200 OSOBA S KOMERCIJALNIM ČIPOM OD 60.000 SNP MARKERA), METABOLOMICO (GOTOV INFRACRVENI SPEKTROSKOPIJA ZA 1500 UZORAKA SERUMA KRVI UZETIH OKO OPLODNJE/IMPLANTACIJE) I MICROBIOMICO (MASIVNA SEKVENCIRANJE GENA 16S RRNA OD 300 UZORAKA VAGINALNOG MIKROBIOMA UZETIH U VRIJEME OPLODNJE KRMAČA). NAKON DOBIVANJA SVIH INFORMACIJA, PRVI KORAK BIT ĆE USMJEREN NA ANALIZU I KARAKTERIZACIJU GENETSKE RAZNOLIKOSTI KORIŠTENIH SOJEVA, KAO I NA UTVRĐIVANJE PRISUTNOSTI SELEKCIJSKOG OTISKA U NJIMA. DRUGO, IZVODIT ĆE SE ANOMALIJA UDRUGE NA REPRODUKTIVNIM ZNAKOVIMA KAO ŠTO SU DOB PRI PRVOJ OSJEMENJIVANJU ILI PRVA ISPORUKA, PLODNOST KRMAČA (GESTANT ILI NETRUDNA) ILI ZNANJE U POGLEDU PRASADI ROĐENE ŽIVE, MRTVE ILI ODBIJENE PRASADI. U TOM ĆE SE SLUČAJU ZASEBNO PROUČITI MOGUĆE VEZE IZMEĐU TIH REPRODUKTIVNIH ZNAKOVA I RAZLIČITIH IZVORA INFORMACIJA (GENOM, METABOLOMA I MIKROBIOM), UZ PREDLAGANJE STUDIJE O MOGUĆEM UTJECAJU KONANGUNOSTI NA NJIH. U SLJEDEĆEM ĆE KORAKU PRODUBITI MODELE GENOMSKE PROCJENE, STAVLJAJUĆI POSEBAN NAGLASAK NA PONDERIRANJE GENOMSKIH I FENOTIPSKIH INFORMACIJA, KAO I NA VIŠE NEGO MOGUĆE INTERAKCIJE IZMEĐU GENOMA I METABOLOMA. NAPOSLJETKU, KAO JEDNA OD NAJVAŽNIJIH KLJUČNIH ETAPA PROJEKTA, CILJ JE NA INTEGRIRAN NAČIN ANALIZIRATI SVE DOSTUPNE IZVORE INFORMACIJA S CILJEM STVARANJA BIOLOŠKIH MREŽA KOJE INTEGRIRAJU RAZLIČITE SLOJEVE INFORMACIJA I PRUŽAJU POTPUNIJU I REALISTIČNIJU KARAKTERIZACIJU BIOLOŠKIH MEHANIZAMA UKLJUČENIH U UREDBU O REPRODUKCIJI (I NJIHOVOJ UČINKOVITOSTI) U SVINJAMA OPĆENITO, A POSEBNO IBERIJSKIM KRMAČAMA. U CJELINI, PREDLAŽE SE NOVA I AMBICIOZNA INICIJATIVA KOJA JE RELEVANTNA I ZA SVINJOGOJSKU INDUSTRIJU I ZA ZNANSTVENU ZAJEDNICU TE UKLJUČUJE TIM ISTRAŽIVAČA S PRIZNATIM MEĐUNARODNIM UGLEDOM KOJI JAMČI ODRŽIVOST PROJEKTA I POSTIZANJE POSTAVLJENIH CILJEVA. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΕΠΙΚΕΝΤΡΏΝΕΤΑΙ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΗΣ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΙΚΉΣ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΤΩΝ ΙΒΗΡΙΚΏΝ ΤΡΙΧΏΝ, ΜΕ ΒΆΣΗ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΌ ΣΧΕΔΙΑΣΜΌ ΠΟΥ ΕΝΣΩΜΑΤΏΝΕΙ ΤΡΊΑ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΣΤΕΛΈΧΗ (RETINTAS, ENTREPELADA ΚΑΙ TORBISCAL), ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΟΥΣ ΣΤΑΥΡΟΎΣ F1 ΤΟΥΣ, ΣΕ ΕΜΠΟΡΙΚΌ ΠΛΗΘΥΣΜΌ ΠΟΥ ΔΙΑΧΕΙΡΊΖΕΤΑΙ Η INGA FOOD SA. ΤΟ ΈΡΓΟ ΣΧΕΔΙΆΖΕΙ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΕΙ ΤΌΣΟ ΓΕΝΕΑΛΟΓΙΚΈΣ ΌΣΟ ΚΑΙ ΠΑΡΑΓΩΓΙΚΈΣ/ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΙΚΈΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΤΩΝ ΖΏΩΝ ΑΠΌ ΤΟ ΊΔΡΥΜΑ ΠΛΗΘΥΣΜΟΎ (ΈΤΟΣ 2010), ΚΑΙ ΝΑ ΔΗΜΙΟΥΡΓΉΣΕΙ ΠΡΌΣΘΕΤΕΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΟΎ ΤΎΠΟΥ (ΓΕΝΟΤΥΠΟΠΟΊΗΣΗ 1.200 ΑΤΌΜΩΝ ΜΕ ΕΜΠΟΡΙΚΌ ΤΣΙΠ 60.000 ΔΕΙΚΤΏΝ SNP), ΜΕΤΑΒΟΛΟΜΙΚΟ (ΚΟΝΤΆ ΣΤΗΝ ΥΠΈΡΥΘΡΗ ΦΑΣΜΑΤΟΣΚΟΠΊΑ ΓΙΑ 1.500 ΔΕΊΓΜΑΤΑ ΟΡΟΎ ΑΊΜΑΤΟΣ ΠΟΥ ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΓΎΡΩ ΑΠΌ ΤΗ ΓΟΝΙΜΟΠΟΊΗΣΗ/ΕΜΦΎΤΕΥΣΗ) ΚΑΙ MICROBIOMICO (ΜΑΖΙΚΉ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΓΙΑ ΤΟ ΓΟΝΊΔΙΟ 16S RRNA 300 ΔΕΙΓΜΆΤΩΝ ΚΟΛΠΙΚΟΎ ΜΙΚΡΟΒΙΏΜΑΤΟΣ ΠΟΥ ΕΛΉΦΘΗΣΑΝ ΚΑΤΆ ΤΗ ΣΤΙΓΜΉ ΤΗΣ ΓΟΝΙΜΟΠΟΊΗΣΗΣ ΤΩΝ ΣΠΕΡΜΆΤΩΝ). ΜΌΛΙΣ ΛΗΦΘΟΎΝ ΌΛΕΣ ΟΙ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ, ΘΑ ΓΊΝΕΙ ΈΝΑ ΠΡΏΤΟ ΒΉΜΑ ΜΕ ΕΠΊΚΕΝΤΡΟ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΚΑΙ ΤΟΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑΣ ΤΩΝ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΜΕΝΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΠΑΡΟΥΣΊΑΣ ΕΝΌΣ ΑΠΟΤΥΠΏΜΑΤΟΣ ΕΠΙΛΟΓΉΣ ΣΕ ΑΥΤΆ. ΔΕΎΤΕΡΟΝ, ΘΑ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΗΘΕΊ ΑΝΩΜΑΛΊΑ ΤΟΥ ΣΥΝΔΈΣΜΟΥ ΣΕ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΙΚΟΎΣ ΧΑΡΑΚΤΉΡΕΣ, ΌΠΩΣ ΗΛΙΚΊΑ ΚΑΤΆ ΤΗΝ ΠΡΏΤΗ ΓΟΝΙΜΟΠΟΊΗΣΗ Ή ΤΗΝ ΠΡΏΤΗ ΤΟΚΕΤΌ, ΓΟΝΙΜΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΧΟΙΡΟΜΗΤΈΡΩΝ (GESTANT Ή ΜΗ ΕΓΚΎΟΥΣ), Ή ΠΑΡΑΓΩΓΙΚΌΤΗΤΑ ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΑ ΧΟΙΡΊΔΙΑ ΠΟΥ ΓΕΝΝΙΟΎΝΤΑΙ ΖΩΝΤΑΝΆ, ΝΕΚΡΆ Ή ΑΠΟΓΑΛΑΚΤΙΣΜΈΝΑ ΧΟΙΡΊΔΙΑ. ΣΤΗΝ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ ΑΥΤΉ, ΟΙ ΠΙΘΑΝΈΣ ΣΥΣΧΕΤΊΣΕΙΣ ΜΕΤΑΞΎ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΙΚΏΝ ΧΑΡΑΚΤΉΡΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΠΗΓΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΘΑ ΜΕΛΕΤΗΘΟΎΝ ΧΩΡΙΣΤΆ (ΓΟΝΙΔΊΩΜΑ, ΜΕΤΑΒΟΛΟΜΑ ΚΑΙ ΜΙΚΡΟΒΙΟΜΉΧΑΝΟ), ΠΡΟΤΕΊΝΟΝΤΑΣ ΕΠΊΣΗΣ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΟΥ ΠΙΘΑΝΟΎ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟΥ ΤΗΣ ΣΥΝΑΓΓΕΙΌΤΗΤΑΣ ΣΕ ΑΥΤΟΎΣ. ΣΕ ΈΝΑ ΕΠΌΜΕΝΟ ΒΉΜΑ, ΘΑ ΕΜΒΑΘΎΝΕΙ ΤΑ ΜΟΝΤΈΛΑ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΑΞΙΟΛΌΓΗΣΗΣ, ΔΊΝΟΝΤΑΣ ΙΔΙΑΊΤΕΡΗ ΈΜΦΑΣΗ ΣΤΗ ΣΤΆΘΜΙΣΗ ΤΌΣΟ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ ΌΣΟ ΚΑΙ ΤΩΝ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΣΤΗ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΑΠΌ ΔΥΝΑΤΉ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΜΕΤΑΒΟΛΟΜΑ. ΤΈΛΟΣ, ΩΣ ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΤΕΡΑ ΟΡΌΣΗΜΑ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ, ΣΤΌΧΟΣ ΕΊΝΑΙ ΝΑ ΑΝΑΛΥΘΟΎΝ ΜΕ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΟ ΤΡΌΠΟ ΌΛΕΣ ΟΙ ΔΙΑΘΈΣΙΜΕΣ ΠΗΓΈΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ, ΜΕ ΣΤΌΧΟ ΤΗ ΔΗΜΙΟΥΡΓΊΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΔΙΚΤΎΩΝ ΠΟΥ ΕΝΣΩΜΑΤΏΝΟΥΝ ΤΑ ΔΙΆΦΟΡΑ ΕΠΊΠΕΔΑ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΚΑΙ ΠΑΡΈΧΟΥΝ ΈΝΑΝ ΠΛΗΡΈΣΤΕΡΟ ΚΑΙ ΡΕΑΛΙΣΤΙΚΌΤΕΡΟ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ ΤΩΝ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΟΝ ΚΑΝΟΝΙΣΜΌ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉ (ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΆ ΤΟΥΣ) ΣΤΟΥΣ ΧΟΊΡΟΥΣ ΕΝ ΓΈΝΕΙ, ΚΑΙ ΕΙΔΙΚΌΤΕΡΑ ΣΤΙΣ ΙΒΗΡΙΚΈΣ ΧΟΙΡΟΜΗΤΈΡΕΣ. ΣΥΝΟΛΙΚΆ, ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ ΜΙΑ ΝΈΑ ΚΑΙ ΦΙΛΌΔΟΞΗ ΠΡΩΤΟΒΟΥΛΊΑ, ΣΧΕΤΙΚΉ ΤΌΣΟ ΓΙΑ ΤΗΝ ΧΟΙΡΟΤΡΟΦΊΑ ΌΣΟ ΚΑΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΉ ΚΟΙΝΌΤΗΤΑ, ΜΕ ΤΗ ΣΥΜΜΕΤΟΧΉ ΟΜΆΔΑΣ ΕΡΕΥΝΗΤΏΝ ΑΝΑΓΝΩΡΙΣΜΈΝΗΣ ΔΙΕΘΝΟΎΣ ΚΎΡΟΥΣ ΠΟΥ ΕΓΓΥΆΤΑΙ ΤΗ ΒΙΩΣΙΜΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΠΊΤΕΥΞΗ ΤΩΝ ΣΤΌΧΩΝ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΤΕΘΕΊ. (Greek)
4 August 2022
0 references
TENTO PROJEKT SA ZAMERIAVA NA ŠTÚDIU REPRODUKČNEJ ÚČINNOSTI IBERSKÝCH ŠTETÍN NA ZÁKLADE EXPERIMENTÁLNEHO DIZAJNU, KTORÝ INTEGRUJE TRI RÔZNE KMENE (RETINTAS, ENTREPELADA A TORBISCAL), AKO AJ ICH KRÍŽENIE F1 V RÁMCI KOMERČNEJ POPULÁCIE RIADENEJ INGA FOOD SA. PROJEKT PLÁNUJE POUŽIŤ GENEALOGICKÉ AJ PRODUKTÍVNE/REPRODUKTÍVNE INFORMÁCIE O ZVIERATÁCH Z NADÁCIE POPULÁCIE (ROK 2010) A ZÍSKAŤ DODATOČNÉ INFORMÁCIE O GENÓMOVOM TYPE (GENOTYPIZÁCIA 1 200 JEDINCOV S KOMERČNÝM ČIPOM 60 000 MARKEROV SNP), METABOLOMICO (BLÍZKA INFRAČERVENÁ SPEKTROSKOPIA PRE 1500 VZORIEK KRVNÉHO SÉRA ODOBRATÝCH OKOLO INSEMINÁCIE/IMPLANTÁCIE) A MICROBIOMICO (MASÍVNE SEKVENOVANIE GÉNU 16S RRNA 300 VZORIEK VAGINÁLNEHO MIKROBIÓMU ODOBRATÝCH V ČASE INSEMINÁCIE PRASNÍC). PO ZÍSKANÍ VŠETKÝCH INFORMÁCIÍ SA VYKONÁ PRVÝ KROK ZAMERANÝ NA ANALÝZU A CHARAKTERIZÁCIU GENETICKEJ ROZMANITOSTI POUŽITÝCH KMEŇOV, AKO AJ NA URČENIE PRÍTOMNOSTI SELEKTÍVNEJ STOPY V NICH. PO DRUHÉ, VYKONÁ SA ANOMÁLIA ASOCIÁCIE O REPRODUKČNÝCH CHARAKTEROCH, AKO JE VEK PRI PRVEJ INSEMINÁCII ALEBO PRVOM PÔRODE, PLODNOSŤ PRASNÍC (GESTANT ALEBO NEGRAVIDNÉ) ALEBO PLODNOSŤ, POKIAĽ IDE O PRASIATKA NARODENÉ ŽIVÉ, MŔTVE ALEBO ODSTAVENÉ PRASIATKA. V TOMTO PRÍPADE SA BUDÚ OSOBITNE SKÚMAŤ MOŽNÉ SÚVISLOSTI MEDZI TÝMITO REPRODUKČNÝMI POSTAVAMI A RÔZNYMI ZDROJMI INFORMÁCIÍ (GENÓM, METABOLOMA A MIKROBIOM), PRIČOM SA NAVRHNE AJ ŠTÚDIA MOŽNÉHO VPLYVU KONSANGUINITY NA NE. V ĎALŠOM KROKU PREHĹBI MODELY GENÓMOVÉHO HODNOTENIA, PRIČOM BUDE KLÁSŤ OSOBITNÝ DÔRAZ NA VÁŽENIE GENOMICKÝCH AJ FENOTYPOVÝCH INFORMÁCIÍ, AKO AJ NA VIAC NEŽ MOŽNÚ INTERAKCIU MEDZI GENÓMOM A METABOLOMA. NAPOKON, KEĎŽE IDE O JEDEN Z NAJDÔLEŽITEJŠÍCH MÍĽNIKOV PROJEKTU, CIEĽOM JE INTEGROVANÝM SPÔSOBOM ANALYZOVAŤ VŠETKY DOSTUPNÉ ZDROJE INFORMÁCIÍ S CIEĽOM VYTVORIŤ BIOLOGICKÉ SIETE, KTORÉ INTEGRUJÚ RÔZNE ÚROVNE INFORMÁCIÍ A POSKYTUJÚ ÚPLNEJŠIU A REALISTICKEJŠIU CHARAKTERIZÁCIU BIOLOGICKÝCH MECHANIZMOV ZAHRNUTÝCH DO REGULÁCIE REPRODUKCIE (A ICH ÚČINNOSTI) U OŠÍPANÝCH VO VŠEOBECNOSTI A NAJMÄ U IBERSKÝCH PRASNÍC. CELKOVO SA NAVRHUJE NOVÁ A AMBICIÓZNA INICIATÍVA, KTORÁ SA TÝKA TAK ODVETVIA CHOVU OŠÍPANÝCH, AKO AJ VEDECKÉHO SPOLOČENSTVA A KTORÁ ZAHŔŇA TÍM VÝSKUMNÍKOV S UZNÁVANÝM MEDZINÁRODNÝM POSTAVENÍM, KTORÝ ZARUČÍ ŽIVOTASCHOPNOSŤ PROJEKTU A DOSIAHNUTIE STANOVENÝCH CIEĽOV. (Slovak)
4 August 2022
0 references
TÄSSÄ HANKKEESSA KESKITYTÄÄN IBERIANHARJASTEN LISÄÄNTYMISTEHOKKUUDEN TUTKIMUKSEEN, JOKA PERUSTUU KOKEELLISEEN SUUNNITTELUUN, JOSSA YHDISTYVÄT KOLME ERI KANTAA (RETINTAS, ENTREPELADA JA TORBISCAL) SEKÄ NIIDEN F1-RISTIT INGA FOOD SA:N HALLINNOIMASSA KAUPALLISESSA VÄESTÖSSÄ. HANKKEESSA ON TARKOITUS KÄYTTÄÄ SEKÄ GENEALOGISTA ETTÄ TUOTTAVAA/LISÄÄNTYVÄÄ TIETOA POPULAATIOSÄÄTIÖN ELÄIMISTÄ (VUOSI 2010) JA TUOTTAA GENOMITYYPPISTÄ LISÄTIETOA (1 200 YKSILÖÄ, JOIDEN KAUPALLINEN SIRU ON 60 000 SNP-MERKKIÄ), METABOLOMICO (LÄHES INFRAPUNASPEKTROSKOPIAA 1 500 VERISEERUMINÄYTTEESTÄ, JOTKA ON OTETTU KEINOSIEMENNYKSEN/ISTUTUKSEN YMPÄRILLÄ) JA MICROBIOMICO (MASSASEKVENSOINTI 16S RRNA-GEENILLE, JOKA ON 300 EMÄTTIMEN MIKROBIOMIN NÄYTETTÄ EMAKOIDEN INSEMINAATIOHETKELLÄ). KUN KAIKKI TIEDOT ON SAATU, ENSIMMÄISESSÄ VAIHEESSA KESKITYTÄÄN ANALYSOIMAAN JA LUONNEHTIMAAN KÄYTETTYJEN KANTOJEN GENEETTISTÄ MONIMUOTOISUUTTA SEKÄ MÄÄRITTÄMÄÄN VALIKOINTIJALANJÄLKI. TOISEKSI TEHDÄÄN YHDISTYSPOIKKEAMIA LISÄÄNTYMISOMINAISUUKSISTA, KUTEN IÄSTÄ ENSIMMÄISEN HEDELMÖITYKSEN TAI ENSIMMÄISEN SYNNYTYKSEN YHTEYDESSÄ, EMAKOIDEN HEDELMÄLLISYYDESTÄ (GESTANT TAI EI-RASKAANA) TAI HEDELMÄLLISYYDESTÄ ELÄVIEN, KUOLLEIDEN TAI VIEROITETTUJEN PORSAIDEN OSALTA. TÄSSÄ TAPAUKSESSA NÄIDEN LISÄÄNTYMISHAHMOJEN JA ERI TIETOLÄHTEIDEN (GENOME, METABOLOMA JA MIKROBIOMI) VÄLISIÄ MAHDOLLISIA YHTEYKSIÄ TUTKITAAN ERIKSEEN. LISÄKSI EHDOTETAAN TUTKIMUSTA SIITÄ, MILLAISIA VAIKUTUKSIA SILLÄ VOI OLLA NIIHIN. SEURAAVASSA VAIHEESSA SE SYVENTÄÄ GENOMIARVIOINTIMALLEJA KOROSTAEN ERITYISESTI SEKÄ GENOMI- ETTÄ FENOTYYPPITIETOJEN PAINOTUSTA SEKÄ GENOMIN JA METABOLOMAN VÄLISTÄ VUOROVAIKUTUSTA KUIN MAHDOLLISTA. YHTENÄ HANKKEEN MERKITTÄVIMMISTÄ VIRSTANPYLVÄISTÄ TAVOITTEENA ON ANALYSOIDA INTEGROIDUSTI KAIKKIA SAATAVILLA OLEVIA TIETOLÄHTEITÄ, JOTTA VOIDAAN LUODA BIOLOGISET VERKOSTOT, JOTKA YHDISTÄVÄT ERI TIETOTASOT JA JOIDEN AVULLA VOIDAAN KUVATA KATTAVAMMIN JA REALISTISEMMIN BIOLOGISET MEKANISMIT, JOTKA LIITTYVÄT SIKOJEN LISÄÄNTYMISTÄ (JA NIIDEN TEHOKKUUTTA) KOSKEVAAN ASETUKSEEN YLEENSÄ JA ERITYISESTI IBERIAN EMAKKOIHIN. KAIKEN KAIKKIAAN EHDOTETAAN UUTTA JA KUNNIANHIMOISTA ALOITETTA, JOKA KOSKEE SEKÄ SIKATEOLLISUUTTA ETTÄ TIEDEYHTEISÖÄ JA JOHON OSALLISTUU KANSAINVÄLISESTI TUNNUSTETTU TUTKIJARYHMÄ, JOKA TAKAA HANKKEEN ELINKELPOISUUDEN JA ASETETTUJEN TAVOITTEIDEN SAAVUTTAMISEN. (Finnish)
4 August 2022
0 references
PROJEKT TEN KONCENTRUJE SIĘ NA BADANIU SKUTECZNOŚCI REPRODUKCYJNEJ WŁOSIA IBERYJSKIEGO, W OPARCIU O EKSPERYMENTALNY PROJEKT ŁĄCZĄCY TRZY RÓŻNE SZCZEPY (RETINTAS, ENTREPELADA I TORBISCAL), A TAKŻE ICH KRZYŻE F1, W RAMACH POPULACJI KOMERCYJNEJ ZARZĄDZANEJ PRZEZ INGA FOOD SA. PROJEKT PRZEWIDUJE WYKORZYSTANIE ZARÓWNO GENEALOGICZNYCH, JAK I PRODUKCYJNYCH/ROZRODCZYCH INFORMACJI O ZWIERZĘTACH Z FUNDACJI POPULACYJNEJ (ROK 2010) ORAZ WYGENEROWANIE DODATKOWYCH INFORMACJI O TYPIE GENOMOWYM (GENOTYPOWANIE 1200 OSOBNIKÓW Z CHIPEM HANDLOWYM 60 000 MARKERÓW SNP), METABOLOMICO (W POBLIŻU SPEKTROSKOPII PODCZERWIENI DLA 1500 PRÓBEK SUROWICY KRWI POBRANYCH WOKÓŁ INSEMINACJI/IMPLANTACJI) ORAZ MICROBIOMICO (MASOWA SEKWENCJA GENU 16S RRNA 300 PRÓBEK MIKROBIOMU POCHWY POBRANYCH W CZASIE INSEMINACJI LOCH). PO UZYSKANIU WSZYSTKICH INFORMACJI, PIERWSZY KROK BĘDZIE SKONCENTROWANY NA ANALIZIE I SCHARAKTERYZOWANIU RÓŻNORODNOŚCI GENETYCZNEJ WYKORZYSTANYCH SZCZEPÓW, A TAKŻE NA OKREŚLENIU OBECNOŚCI ŚLADU SELEKCYJNEGO W NICH. PO DRUGIE, ZOSTANIE PRZEPROWADZONA ANOMALIA STOWARZYSZENIA NA POSTACI REPRODUKCYJNE, TAKIE JAK WIEK W PIERWSZYM UNASIENNIANIU LUB PIERWSZEJ PORODZIE, PŁODNOŚĆ LOCH (GESTANT LUB NIE CIĄŻY) LUB PŁODNOŚĆ W ODNIESIENIU DO PROSIĄT URODZONYCH ŻYWYCH, MARTWYCH LUB ODSTAWIONYCH OD MACIORY PROSIĄT. W TYM PRZYPADKU MOŻLIWE POWIĄZANIA MIĘDZY TYMI POSTACIAMI REPRODUKCYJNYMI A RÓŻNYMI ŹRÓDŁAMI INFORMACJI ZOSTANĄ ZBADANE ODDZIELNIE (GENOM, METABOLOMA I MIKROBIOM), PROPONUJĄC RÓWNIEŻ BADANIE MOŻLIWEGO WPŁYWU NA NIE POKREWIEŃSTWA. W KOLEJNYM KROKU POGŁĘBI MODELE OCENY GENOMOWEJ, KŁADĄC SZCZEGÓLNY NACISK NA WAGĘ ZARÓWNO INFORMACJI GENOMOWYCH, JAK I FENOTYPOWYCH, A TAKŻE NA BARDZIEJ NIŻ MOŻLIWE INTERAKCJĘ MIĘDZY GENOMEM A METABOLOMA. WRESZCIE, JAKO JEDEN Z NAJISTOTNIEJSZYCH CELÓW POŚREDNICH PROJEKTU, CELEM JEST PRZEPROWADZENIE W ZINTEGROWANY SPOSÓB ANALIZY WSZYSTKICH DOSTĘPNYCH ŹRÓDEŁ INFORMACJI W CELU STWORZENIA SIECI BIOLOGICZNYCH ŁĄCZĄCYCH RÓŻNE WARSTWY INFORMACJI I ZAPEWNIAJĄCYCH BARDZIEJ KOMPLETNĄ I REALISTYCZNĄ CHARAKTERYSTYKĘ MECHANIZMÓW BIOLOGICZNYCH ZWIĄZANYCH Z ROZPORZĄDZENIEM W SPRAWIE REPRODUKCJI (I ICH SKUTECZNOŚCI) U ŚWIŃ W OGÓLE, A W SZCZEGÓLNOŚCI MACIOR IBERYJSKICH. OGÓLNIE PROPONUJE SIĘ NOWĄ I AMBITNĄ INICJATYWĘ, MAJĄCĄ ZNACZENIE ZARÓWNO DLA PRZEMYSŁU TRZODY CHLEWNEJ, JAK I WSPÓLNOTY NAUKOWEJ, OBEJMUJĄCĄ ZESPÓŁ NAUKOWCÓW O UZNANEJ POZYCJI MIĘDZYNARODOWEJ, KTÓRY GWARANTUJE RENTOWNOŚĆ PROJEKTU I OSIĄGNIĘCIE WYZNACZONYCH CELÓW. (Polish)
4 August 2022
0 references
EZ A PROJEKT AZ IBÉRIAI SÖRTÉK SZAPORODÁSI HATÉKONYSÁGÁNAK TANULMÁNYOZÁSÁRA ÖSSZPONTOSÍT, AMELY HÁROM KÜLÖNBÖZŐ TÖRZSET (RETINTAS, ENTREPELADA ÉS TORBISCAL), VALAMINT F1-KERESZTJEIKET INTEGRÁLÓ KÍSÉRLETI KIALAKÍTÁSON ALAPUL AZ INGA FOOD SA ÁLTAL KEZELT KERESKEDELMI POPULÁCIÓN BELÜL. A PROJEKT CÉLJA A POPULÁCIÓS ALAPÍTVÁNYTÓL SZÁRMAZÓ ÁLLATOKRÓL SZÁRMAZÓ GENEALÓGIAI ÉS PRODUKTÍV/REPRODUKTÍV INFORMÁCIÓK FELHASZNÁLÁSA (2010-ES ÉV), VALAMINT TOVÁBBI GENOMIKUS INFORMÁCIÓK (A 60 000 SNP MARKERBŐL ÁLLÓ KERESKEDELMI CHIPPEL RENDELKEZŐ 1200 EGYED GENOTÍPUSA), A METABOLOMICO (KÖZEL INFRAVÖRÖS SPEKTROSZKÓPIA A MEGTERMÉKENYÍTÉS/IMPLANTÁCIÓ KÖRÜL VETT 1500 VÉRSZÉRUM-MINTA ESETÉBEN) ÉS A MICROBIOMICO (A KOCÁK MEGTERMÉKENYÍTÉSEKOR VETT 300 HÜVELYI MIKROBIÓM MINTÁBÓL VETT, 16S RRNS GÉN MASSZÍV SZEKVENÁLÁSA). AZ ÖSSZES INFORMÁCIÓ MEGSZERZÉSÉT KÖVETŐEN AZ ELSŐ LÉPÉS A FELHASZNÁLT TÖRZSEK GENETIKAI SOKFÉLESÉGÉNEK ELEMZÉSÉRE ÉS JELLEMZÉSÉRE, VALAMINT A SZELEKCIÓS LÁBNYOM JELENLÉTÉNEK MEGHATÁROZÁSÁRA ÖSSZPONTOSÍT. MÁSODSZOR, AKKOR VÉGRE ANOMÁLIA ASSZOCIÁCIÓS KARAKTEREK, MINT AZ ÉLETKOR ELSŐ MEGTERMÉKENYÍTÉS VAGY ELSŐ SZÜLÉS, TERMÉKENYSÉG KOCÁK (GESTANT VAGY NEM TERHES), VAGY TERMÉKENYSÉG SZEMPONTJÁBÓL SZÜLETETT MALACOK ÉLVE, ELHULLOTT VAGY ELVÁLASZTOTT MALACOK. EBBEN AZ ESETBEN AZ E REPRODUKTÍV KARAKTEREK ÉS A KÜLÖNBÖZŐ INFORMÁCIÓFORRÁSOK (GENOME, METABOLOMA ÉS MIKROBIOME) KÖZÖTTI LEHETSÉGES ÖSSZEFÜGGÉSEKET KÜLÖN TANULMÁNYOZZÁK, ÉS JAVASLATOT TESZNEK A KONANGUINITÁS EZEKRE GYAKOROLT LEHETSÉGES HATÁSÁNAK TANULMÁNYOZÁSÁRA IS. A KÖVETKEZŐ LÉPÉSBEN ELMÉLYÍTI A GENOMIKAI ÉRTÉKELÉS MODELLJEIT, KÜLÖNÖS HANGSÚLYT FEKTETVE MIND A GENOMIKUS, MIND A FENOTÍPUSOS INFORMÁCIÓK SÚLYOZÁSÁRA, VALAMINT A GENOM ÉS A METABOLOMA KÖZÖTTI KÖLCSÖNHATÁSRA. VÉGÜL, MIVEL A PROJEKT EGYIK LEGFONTOSABB MÉRFÖLDKÖVE, A CÉL AZ, HOGY INTEGRÁLT MÓDON ELEMEZZÉK AZ ÖSSZES RENDELKEZÉSRE ÁLLÓ INFORMÁCIÓFORRÁST, HOGY OLYAN BIOLÓGIAI HÁLÓZATOKAT HOZZANAK LÉTRE, AMELYEK INTEGRÁLJÁK A KÜLÖNBÖZŐ INFORMÁCIÓRÉTEGEKET, ÉS AMELYEK TELJESEBB ÉS REÁLISABB JELLEMZÉST BIZTOSÍTANAK A SZAPORODÁSI SZABÁLYOZÁSBAN (ÉS HATÉKONYSÁGUKBAN) ÁLTALÁBAN A SERTÉSEKBEN, ÉS KÜLÖNÖSEN AZ IBÉRIAI KOCÁKBAN. ÖSSZESSÉGÉBEN ÚJ ÉS AMBICIÓZUS KEZDEMÉNYEZÉST JAVASOLNAK, AMELY MIND A SERTÉSÁGAZAT, MIND A TUDOMÁNYOS KÖZÖSSÉG SZÁMÁRA RELEVÁNS, ÉS AMELY EGY ELISMERT NEMZETKÖZI ELISMERT KUTATÓCSOPORTOT FOGLAL MAGÁBAN, AMELY GARANTÁLJA A PROJEKT ÉLETKÉPESSÉGÉT ÉS A KITŰZÖTT CÉLOK ELÉRÉSÉT. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
TENTO PROJEKT SE ZAMĚŘUJE NA STUDIUM REPRODUKČNÍ ÚČINNOSTI IBERSKÝCH ŠTĚTIN NA ZÁKLADĚ EXPERIMENTÁLNÍHO NÁVRHU, KTERÝ INTEGRUJE TŘI RŮZNÉ KMENY (RETINTAS, ENTREPELADA A TORBISCAL) A JEJICH KŘÍŽE F1 V KOMERČNÍ POPULACI ŘÍZENÉ SPOLEČNOSTÍ INGA FOOD SA. PROJEKT PLÁNUJE VYUŽÍT GENEALOGICKÉ I PRODUKTIVNÍ/REPRODUKČNÍ INFORMACE O ZVÍŘATECH Z POPULACE FOUNDATION (ROK 2010) A ZÍSKAT DALŠÍ INFORMACE O GENOMICKÉM TYPU (GENOTYPOVÁNÍ 1 200 JEDINCŮ S KOMERČNÍM ČIPEM 60 000 SNP MARKERŮ), METABOLOMICO (BLÍZKÁ INFRAČERVENÁ SPEKTROSKOPIE PRO 1500 VZORKŮ KREVNÍHO SÉRA ODEBRANÝCH KOLEM INSEMINACE/IMPLANTACE) A MICROBIOMICO (MASIVNÍ SEKVENOVÁNÍ GENU 16S RRNA 300 VZORKŮ VAGINÁLNÍHO MIKROBIOMU ODEBRANÝCH V DOBĚ INSEMINACE PRASNIC). JAKMILE BUDOU VŠECHNY INFORMACE ZÍSKÁNY, BUDE UČINĚN PRVNÍ KROK ZAMĚŘENÝ NA ANALÝZU A CHARAKTERIZACI GENETICKÉ ROZMANITOSTI POUŽITÝCH KMENŮ, JAKOŽ I NA URČENÍ PŘÍTOMNOSTI SELEKTIVNÍ STOPY V NICH. ZA DRUHÉ, BUDE PROVEDENA ANOMÁLIE ASOCIACE U REPRODUKČNÍCH ZNAKŮ, JAKO JE VĚK PŘI PRVNÍ INSEMINACI NEBO PRVNÍ POROD, PLODNOST PRASNIC (GESTANT NEBO NETĚHOTNÁ) NEBO PLODNOST, POKUD JDE O SELATA NAROZENÁ ŽIVÁ, MRTVÁ NEBO ODSTAVENÁ SELATA. V TOMTO PŘÍPADĚ BUDOU ZKOUMÁNY MOŽNÉ VAZBY MEZI TĚMITO REPRODUKČNÍMI ZNAKY A RŮZNÝMI ZDROJI INFORMACÍ (GENOM, METABOLOMA A MIKROBIOM), PŘIČEMŽ BUDE ROVNĚŽ NAVRŽENA STUDIE MOŽNÉHO DOPADU KONANGUINITY NA NĚ. V DALŠÍM KROKU PROHLOUBÍ MODELY GENOMICKÉHO HODNOCENÍ A KLADE ZVLÁŠTNÍ DŮRAZ NA VÁŽENÍ GENOMICKÝCH A FENOTYPOVÝCH INFORMACÍ, STEJNĚ JAKO NA VÍCE NEŽ MOŽNÉ INTERAKCE MEZI GENOMEM A METABOLOMA. A KONEČNĚ, JE JEDNÍM Z NEJDŮLEŽITĚJŠÍCH MILNÍKŮ PROJEKTU, CÍLEM JE INTEGROVANĚ ANALYZOVAT VŠECHNY DOSTUPNÉ ZDROJE INFORMACÍ S CÍLEM VYTVOŘIT BIOLOGICKÉ SÍTĚ, KTERÉ INTEGRUJÍ RŮZNÉ VRSTVY INFORMACÍ A POSKYTUJÍ ÚPLNĚJŠÍ A REALISTIČTĚJŠÍ CHARAKTERIZACI BIOLOGICKÝCH MECHANISMŮ ZAHRNUTÝCH DO NAŘÍZENÍ O REPRODUKCI (A JEJICH ÚČINNOSTI) U PRASAT OBECNĚ, A ZEJMÉNA IBERSKÝCH PRASNIC. CELKOVĚ JE NAVRŽENA NOVÁ A AMBICIÓZNÍ INICIATIVA, KTERÁ SE BUDE TÝKAT JAK VEPŘOVÉHO PRŮMYSLU, TAK VĚDECKÉHO SPOLEČENSTVÍ A BUDE ZAHRNOVAT TÝM VÝZKUMNÝCH PRACOVNÍKŮ S UZNÁVANÝM MEZINÁRODNÍM POSTAVENÍM, KTERÝ ZARUČÍ ŽIVOTASCHOPNOST PROJEKTU A DOSAŽENÍ STANOVENÝCH CÍLŮ. (Czech)
4 August 2022
0 references
ŠIS PROJEKTS IR VĒRSTS UZ IBĒRIJAS SARU REPRODUKTĪVĀS EFEKTIVITĀTES PĒTĪJUMU, KURA PAMATĀ IR EKSPERIMENTĀLA KONSTRUKCIJA, KAS APVIENO TRĪS DAŽĀDUS CELMUS (RETINTAS, ENTREPELADA UN TORBISCAL), KĀ ARĪ TO F1 KRUSTOJUMUS KOMERCIĀLĀ POPULĀCIJĀ, KO PĀRVALDA INGA FOOD SA. PROJEKTĀ PLĀNOTS IZMANTOT GAN ĢENEALOĢISKU, GAN PRODUKTĪVU/REPRODUKTĪVU INFORMĀCIJU PAR DZĪVNIEKIEM NO POPULĀCIJAS FONDA (2010. GADS), KĀ ARĪ IEGŪT PAPILDU INFORMĀCIJU PAR GENOMA TIPU (GENOTYPING 1200 PERSONĀM AR KOMERCIĀLO MIKROSHĒMU 60 000 SNP MARĶIERU), METABOLOMICO (NETĀLU INFRASARKANO SPEKTROSKOPIJU 1500 ASINS SERUMA PARAUGIEM, KAS ŅEMTI AP APSĒKLOŠANU/IMPLANTĀCIJU) UN MICROBIOMICO (MASVEIDA SECĪBA 16S RRNA GĒNAM 300 VAGINĀLĀ MIKROBIOMA PARAUGIEM, KAS ŅEMTI APSĒKLOŠANAS LAIKĀ). KAD VISA INFORMĀCIJA BŪS IEGŪTA, PIRMAIS SOLIS TIKS VĒRSTS UZ IZMANTOTO CELMU ĢENĒTISKĀS DAUDZVEIDĪBAS ANALĪZI UN RAKSTUROŠANU, KĀ ARĪ ATLASES PĒDAS KLĀTBŪTNES NOTEIKŠANU TAJOS. OTRKĀRT, TIKS VEIKTA ANOMĀLIJA ASOCIĀCIJAS AR REPRODUKTĪVAJĀM ĪPAŠĪBĀM, PIEMĒRAM, VECUMS PIRMAJĀ APSĒKLOŠANAS VAI PIRMĀS DZEMDĪBAS, AUGLĪBU SIVĒNMĀTĒM (GESTANT VAI NAV GRŪSNĪBAS), VAI PROLIFICITY ZIŅĀ ATTIECĪBĀ UZ SIVĒNIEM, KAS DZIMUŠI DZĪVI, MIRUŠI VAI ATŠĶIRTI SIVĒNI. ŠAJĀ GADĪJUMĀ IESPĒJAMĀS SAIKNES STARP ŠĪM REPRODUKTĪVAJĀM ĪPAŠĪBĀM UN DAŽĀDIEM INFORMĀCIJAS AVOTIEM TIKS PĒTĪTAS ATSEVIŠĶI (GENOME, METABOLOMA UN MIKROBIOMS), IEROSINOT ARĪ PĒTĪJUMU PAR IESPĒJAMO KONSANGUINITĀTES IETEKMI UZ TĀM. NĀKAMAJĀ POSMĀ TĀ PADZIĻINĀS GENOMA NOVĒRTĒŠANAS MODEĻUS, ĪPAŠU UZMANĪBU PIEVĒRŠOT GAN GENOMISKĀS, GAN FENOTIPISKĀS INFORMĀCIJAS SVĒRUMAM, KĀ ARĪ LIELĀKAI NEKĀ IESPĒJAMAI MIJIEDARBĪBAI STARP GENOMU UN METABOLOMA. VISBEIDZOT, TĀ KĀ TAS IR VIENS NO BŪTISKĀKAJIEM PROJEKTA ATSKAITES PUNKTIEM, MĒRĶIS IR INTEGRĒTI ANALIZĒT VISUS PIEEJAMOS INFORMĀCIJAS AVOTUS, LAI IZVEIDOTU BIOLOĢISKOS TĪKLUS, KAS INTEGRĒ DAŽĀDUS INFORMĀCIJAS SLĀŅUS UN SNIEDZ PILNĪGĀKU UN REĀLĀKU TO BIOLOĢISKO MEHĀNISMU RAKSTUROJUMU, KAS SAISTĪTI AR REPRODUKCIJAS (UN TO EFEKTIVITĀTES) REGULU CŪKĀM KOPUMĀ UN JO ĪPAŠI IBĒRIJAS SIVĒNMĀTĒM. KOPUMĀ IR IEROSINĀTA JAUNA UN VĒRIENĪGA INICIATĪVA, KAS ATTIECAS GAN UZ CŪKGAĻAS NOZARI, GAN ZINĀTNISKO KOPIENU UN KURĀ IESAISTĪTA STARPTAUTISKI ATZĪTA PĒTNIEKU GRUPA, KAS GARANTĒ PROJEKTA DZĪVOTSPĒJU UN IZVIRZĪTO MĒRĶU SASNIEGŠANU. (Latvian)
4 August 2022
0 references
DÍRÍONN AN TIONSCADAL SEO AR STAIDÉAR A DHÉANAMH AR ÉIFEACHTÚLACHT ATÁIRGTHE GUAIRÍ IBERIAN, BUNAITHE AR DHEARADH TURGNAMHACH A CHOMHTHÁTHAÍONN TRÍ THRÉITHCHINEÁLACHA ÉAGSÚLA (RETINTAS, ENTREPELADA AGUS TORBISCAL), CHOMH MAITH LENA DTRASNAÍONN F1, LAISTIGH DE DHAONRA TRÁCHTÁLA ARNA BHAINISTIÚ AG INGA FOOD SA. TÁ SÉ BEARTAITHE AG AN TIONSCADAL FAISNÉIS GHINEALAÍOCH AGUS THÁIRGIÚIL/THÁIRGTHE ARAON A ÚSÁID MAIDIR LE HAINMHITHE ÓN BHFONDÚIREACHT DAONRA (AN BHLIAIN 2010), AGUS FAISNÉIS BHREISE DE CHINEÁL GÉANÓMAÍOCH A GHINIÚINT (GÉINEÁIL 1,200 DUINE LE SLISEANNA TRÁCHTÁLA 60,000 MARCÓIRÍ SNP), METABOLOMICO (SPEICTREASCÓPACHT INFRIDHEARG INFRIDHEARG LE HAGHAIDH 1,500 SAMPLA SERUM FOLA A TÓGADH TIMPEALL AN INSEAMHNAITHE/IONCHLANNAITHE), AGUS MICROBIOMICO (SEICHEAMH OLLMHÓR DON GHÉIN 16S RRNA DE 300 SAMPLA DE MHICREABHITHÉ FAIGHNE A TÓGADH TRÁTH INSEAMHNAITHE NA N-ÉAN). A LUAITHE A GHEOFAR AN FHAISNÉIS GO LÉIR, BEIDH AN CHÉAD CHÉIM DÍRITHE AR ANAILÍS AGUS TRÉITHRIÚ A DHÉANAMH AR ÉAGSÚLACHT GHÉINITEACH NA DTRÉITHCHINEÁLACHA A ÚSÁIDTEAR, CHOMH MAITH LE LORG ROGHNÚCHÁIN A CHINNEADH IONTU. AR AN DARA DUL SÍOS, DÉANFAR AIMHRIALTACHT ASSOCIATION AR CHARACHTAIR ATÁIRGTHE AR NÓS AOIS AG AN GCÉAD INSEAMHNÚ NÓ AG AN GCÉAD SEACHADADH, TORTHÚLACHT CRÁNACHA (GAISEACH NÓ NEAMHTHUARTHA), NÓ BISIÚLACHT Ó THAOBH BAINBH A RUGADH BEO, MARBH NÓ BAINTE DE BAINBH. SA CHÁS SEO DÉANFAR STAIDÉAR AR LEITHLIGH AR NA CUMAINN A D’FHÉADFADH A BHEITH ANN IDIR NA CARACHTAIR ATÁIRGTHE SEO AGUS NA FOINSÍ ÉAGSÚLA FAISNÉISE (GENOME, METABOLOMA AGUS MICROBIOME), AG MOLADH FREISIN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN TIONCHAR A D’FHÉADFADH A BHEITH AG CONSANGUINITY ORTHU. SA CHÉAD CHÉIM EILE, DÉANFAIDH SÉ SAMHLACHA MEASTÓIREACHTA GÉANÓMAÍOCHTA A DHOIMHNIÚ, AGUS BÉIM AR LEITH Á LEAGAN AR UALÚ FAISNÉISE GÉANÓMAÍOCH AGUS FEINITÍOPACH ARAON, CHOMH MAITH LEIS AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT NÍOS MÓ NÁ IS FÉIDIR IDIR AN GÉANÓM AGUS METABOLOMA. AR DEIREADH, ÓS RUD É GO BHFUIL SÉ AR CHEANN DE NA GARSPRIOCANNA IS ÁBHARTHA DEN TIONSCADAL, IS É AN AIDHM ANAILÍS A DHÉANAMH AR BHEALACH COMHTHÁITE AR NA FOINSÍ FAISNÉISE UILE ATÁ AR FÁIL, AGUS É MAR AIDHM LÍONRAÍ BITHEOLAÍOCHA A CHRUTHÚ LENA GCOMHTHÁTHAÍTEAR NA SRAITHEANNA ÉAGSÚLA FAISNÉISE AGUS LENA SOLÁTHRAÍTEAR TRÉITHRIÚ NÍOS IOMLÁINE AGUS NÍOS RÉADÚLA AR NA SÁSRAÍ BITHEOLAÍOCHA A BHAINEANN LEIS AN RIALACHÁN MAIDIR LE HATÁIRGEADH (AGUS A N-ÉIFEACHTÚLACHT) SNA MUCA I GCOITINNE, AGUS GO HÁIRITHE MAIDIR LE CRÁNACHA IBÉARACHA. AR AN IOMLÁN, TÁ TIONSCNAMH NUA UAILLMHIANACH BEARTAITHE, A BHAINEANN LE TIONSCAL NA MUC AGUS LEIS AN BPOBAL EOLAÍOCHTA ARAON, AGUS INA BHFUIL FOIREANN TAIGHDEOIRÍ A BHFUIL SEASAMH IDIRNÁISIÚNTA AITHEANTA ACU A RÁTHAÍONN INMHARTHANACHT AN TIONSCADAIL AGUS BAINT AMACH NA GCUSPÓIRÍ ATÁ LEAGTHA SÍOS. (Irish)
4 August 2022
0 references
PROJEKT SE OSREDOTOČA NA ŠTUDIJO REPRODUKTIVNE UČINKOVITOSTI IBERSKIH ŠČETIN, KI TEMELJI NA EKSPERIMENTALNI ZASNOVI, KI ZDRUŽUJE TRI RAZLIČNE SEVE (RETINTAS, ENTREPELADA IN TORBISCAL) TER NJIHOVE KRIŽE F1, ZNOTRAJ KOMERCIALNE POPULACIJE, KI JO UPRAVLJA INGA FOOD SA. PROJEKT NAMERAVA UPORABITI GENEALOŠKE IN PRODUKTIVNE/REPRODUKTIVNE INFORMACIJE O ŽIVALIH IZ POPULACIJSKE FUNDACIJE (LETO 2010) IN USTVARITI DODATNE INFORMACIJE GENOMSKEGA TIPA (GENOTIPIZACIJA 1,200 POSAMEZNIKOV S KOMERCIALNIM ČIPOM 60.000 SNP OZNAČEVALCEV), METABOLOMICO (BLIZU INFRARDEČE SPEKTROSKOPIJE ZA 1500 VZORCEV KRVNEGA SERUMA, ODVZETIH OKOLI OSEMENITVE/IMPLANTACIJE) IN MICROBIOMICO (MASIVNO SEKVENCIRANJE ZA 16S RRNA GEN 300 VZORCEV VAGINALNEGA MIKROBIOMA, ODVZETIH V ČASU OSEMENITVE SVINJ). KO BODO PRIDOBLJENE VSE INFORMACIJE, SE BO PRVI KORAK OSREDOTOČIL NA ANALIZO IN OPREDELITEV GENSKE RAZNOVRSTNOSTI UPORABLJENIH SEVOV TER NA UGOTAVLJANJE PRISOTNOSTI SELEKCIJSKEGA ODTISA V NJIH. DRUGIČ, IZVEDLA SE BO ANOMALIJA ZDRUŽENJA GLEDE REPRODUKTIVNIH ZNAKOV, KOT SO STAROST OB PRVI OSEMENITVI ALI PRVI PORODU, PLODNOST SVINJ (GESTANT ALI NE-NOSEČE) ALI PLODNOST V SMISLU ŽIVIH PUJSKOV, MRTVIH ALI ODSTAVLJENIH PUJSKOV. V TEM PRIMERU BODO MOŽNE POVEZAVE MED TEMI REPRODUKTIVNIMI ZNAKI IN RAZLIČNIMI VIRI INFORMACIJ PREUČENE LOČENO (GENOM, METABOLOMA IN MIKROBIOM), PRI ČEMER BO PREDLAGANA TUDI ŠTUDIJA O MOŽNEM VPLIVU KONZUMNOSTI NANJE. V NASLEDNJEM KORAKU BO POGLOBILA MODELE GENOMSKEGA OCENJEVANJA, PRI ČEMER BO POSEBEN POUDAREK NAMENILA PONDERIRANJU GENOMSKIH IN FENOTIPSKIH INFORMACIJ, PA TUDI VEČ KOT MOGOČE INTERAKCIJE MED GENOMOM IN METABOLOMA. KOT EDEN NAJPOMEMBNEJŠIH MEJNIKOV PROJEKTA JE CILJ CELOVITO ANALIZIRATI VSE RAZPOLOŽLJIVE VIRE INFORMACIJ, DA BI USTVARILI BIOLOŠKE MREŽE, KI BI POVEZOVALE RAZLIČNE PLASTI INFORMACIJ TER ZAGOTOVILE CELOVITEJŠO IN BOLJ REALISTIČNO OPREDELITEV BIOLOŠKIH MEHANIZMOV, VKLJUČENIH V UREDITEV RAZMNOŽEVANJA (IN NJIHOVE UČINKOVITOSTI) PRI PRAŠIČIH NA SPLOŠNO IN ZLASTI IBERSKIH SVINJAH. NA SPLOŠNO SE PREDLAGA NOVA IN AMBICIOZNA POBUDA, KI JE POMEMBNA TAKO ZA PRAŠIČJO INDUSTRIJO KOT ZA ZNANSTVENO SKUPNOST IN VKLJUČUJE SKUPINO RAZISKOVALCEV S PRIZNANIM MEDNARODNIM UGLEDOM, KI ZAGOTAVLJA IZVEDLJIVOST PROJEKTA IN DOSEGANJE ZASTAVLJENIH CILJEV. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
ТОЗИ ПРОЕКТ СЕ ФОКУСИРА ВЪРХУ ПРОУЧВАНЕТО НА РЕПРОДУКТИВНАТА ЕФЕКТИВНОСТ НА ИБЕРИЙСКИТЕ ЧЕТИНИ, ВЪЗ ОСНОВА НА ЕКСПЕРИМЕНТАЛЕН ДИЗАЙН, КОЙТО ИНТЕГРИРА ТРИ РАЗЛИЧНИ ЩАМА (RETINTAS, ENTREPELADA И ТОРБИСКАЛ), КАКТО И ТЕХНИТЕ КРЪСТОСКИ F1, В РАМКИТЕ НА ТЪРГОВСКА ПОПУЛАЦИЯ, УПРАВЛЯВАНА ОТ INGA FOOD SA. ПРОЕКТЪТ ПРЕДВИЖДА ДА СЕ ИЗПОЛЗВА КАКТО ГЕНЕАЛОГИЧНА, ТАКА И ПРОДУКТИВНА/РЕПРОДУКТИВНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА ЖИВОТНИ ОТ ФОНДАЦИЯТА ЗА ПОПУЛАЦИЯТА (2010 Г.) И ДА СЕ ГЕНЕРИРА ДОПЪЛНИТЕЛНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА ГЕНОМНИЯ ТИП (ГЕНОТИРАНЕ НА 1 200 ИНДИВИДА С ТЪРГОВСКИ ЧИП ОТ 60 000 SNP МАРКЕРИ), METABOLOMICO (БЛИЗО ДО ИНФРАЧЕРВЕНАТА СПЕКТРОСКОПИЯ ЗА 1500 КРЪВНИ СЕРУМНИ ПРОБИ, ВЗЕТИ ОКОЛО ОСЕМЕНЯВАНЕТО/ИМПЛАНТАЦИЯТА) И MICROBIOMICO (МАСОВО СЕКВЕНИРАНЕ НА 16S RRNA ГЕН ОТ 300 ПРОБИ ОТ ВАГИНАЛЕН МИКРОБИОМ, ВЗЕТИ ПО ВРЕМЕ НА ОСЕМЕНЯВАНЕТО НА СВИНЕТЕ). СЛЕД КАТО БЪДЕ ПОЛУЧЕНА ЦЯЛАТА ИНФОРМАЦИЯ, ЩЕ БЪДЕ НАПРАВЕНА ПЪРВА СТЪПКА, НАСОЧЕНА КЪМ АНАЛИЗИРАНЕ И ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА ГЕНЕТИЧНОТО РАЗНООБРАЗИЕ НА ИЗПОЛЗВАНИТЕ ЩАМОВЕ, КАКТО И КЪМ ОПРЕДЕЛЯНЕ НА НАЛИЧИЕТО НА СЕЛЕКЦИОНЕН ОТПЕЧАТЪК В ТЯХ. ВТОРО, ЩЕ СЕ ИЗВЪРШИ АНОМАЛИЯ НА СДРУЖЕНИЕТО ПО ОТНОШЕНИЕ НА РЕПРОДУКТИВНИТЕ БЕЛЕЗИ КАТО ВЪЗРАСТ ПРИ ПЪРВО ОСЕМЕНЯВАНЕ ИЛИ ПЪРВА ДОСТАВКА, ФЕРТИЛИТЕТ НА СВИНЕ МАЙКИ (GESTANT ИЛИ НЕБРЕМЕННИ) ИЛИ ПЛОДОВИТОСТ ПО ОТНОШЕНИЕ НА ПРАСЕНЦА, РОДЕНИ ЖИВИ, МЪРТВИ ИЛИ ОТБИТИ ПРАСЕНЦА. В ТОЗИ СЛУЧАЙ ВЪЗМОЖНИТЕ ВРЪЗКИ МЕЖДУ ТЕЗИ РЕПРОДУКТИВНИ БЕЛЕЗИ И РАЗЛИЧНИТЕ ИЗТОЧНИЦИ НА ИНФОРМАЦИЯ ЩЕ БЪДАТ ПРОУЧЕНИ ОТДЕЛНО (ГЕНОМ, METABOLOMA И МИКРОБИОМ), КАТО СЪЩО ТАКА ЩЕ СЕ ПРЕДЛОЖИ ПРОУЧВАНЕ НА ВЪЗМОЖНОТО ВЪЗДЕЙСТВИЕ НА СЪЗРЯВАНЕТО ВЪРХУ ТЯХ. В СЛЕДВАЩАТА СТЪПКА ТЯ ЩЕ ЗАДЪЛБОЧИ МОДЕЛИТЕ НА ГЕНОМНА ОЦЕНКА, ПОСТАВЯЙКИ СПЕЦИАЛЕН АКЦЕНТ ВЪРХУ ПРЕТЕГЛЯНЕТО КАКТО НА ГЕНОМНАТА, ТАКА И НА ФЕНОТИПНАТА ИНФОРМАЦИЯ, КАКТО И НА ВЪЗМОЖНОТО ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МЕЖДУ ГЕНОМА И METABOLOMA. НАКРАЯ, КАТО ЕДИН ОТ НАЙ-ВАЖНИТЕ ЕТАПИ НА ПРОЕКТА, ЦЕЛТА Е ДА СЕ АНАЛИЗИРАТ ПО ИНТЕГРИРАН НАЧИН ВСИЧКИ НАЛИЧНИ ИЗТОЧНИЦИ НА ИНФОРМАЦИЯ С ЦЕЛ СЪЗДАВАНЕ НА БИОЛОГИЧНИ МРЕЖИ, КОИТО ИНТЕГРИРАТ РАЗЛИЧНИТЕ СЛОЕВЕ НА ИНФОРМАЦИЯ И ПРЕДОСТАВЯТ ПО-ПЪЛНА И РЕАЛИСТИЧНА ХАРАКТЕРИСТИКА НА БИОЛОГИЧНИТЕ МЕХАНИЗМИ, УЧАСТВАЩИ В РЕГУЛИРАНЕТО НА РАЗМНОЖАВАНЕТО (И ТЯХНАТА ЕФЕКТИВНОСТ) ПРИ СВИНЕТЕ КАТО ЦЯЛО, И ПО-СПЕЦИАЛНО ИБЕРИЙСКИТЕ СВИНЕ МАЙКИ. КАТО ЦЯЛО СЕ ПРЕДЛАГА НОВА И АМБИЦИОЗНА ИНИЦИАТИВА, КОЯТО Е ОТ ЗНАЧЕНИЕ КАКТО ЗА СВИНЕВЪДНАТА ПРОМИШЛЕНОСТ, ТАКА И ЗА НАУЧНАТА ОБЩНОСТ, С УЧАСТИЕТО НА ЕКИП ОТ ИЗСЛЕДОВАТЕЛИ С ПРИЗНАТ МЕЖДУНАРОДЕН АВТОРИТЕТ, КОЙТО ГАРАНТИРА ЖИЗНЕСПОСОБНОСТТА НА ПРОЕКТА И ПОСТИГАНЕТО НА ПОСТАВЕНИТЕ ЦЕЛИ. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
DAN IL-PROĠETT JIFFOKA FUQ L-ISTUDJU TAL-EFFIĊJENZA RIPRODUTTIVA TAL-LANŻIT IBERIKU, IBBAŻAT FUQ DISINN SPERIMENTALI LI JINTEGRA TLIET RAZEZ DIFFERENTI (RETINTAS, ENTREPELADA U TORBISCAL), KIF UKOLL IS-SLALEB F1 TAGĦHOM, FI ĦDAN POPOLAZZJONI KUMMERĊJALI ĠESTITA MINN INGA FOOD SA. IL-PROĠETT JIPPJANA LI JUŻA INFORMAZZJONI KEMM ĠENEALOĠIKA KIF UKOLL PRODUTTIVA/RIPRODUTTIVA TAL-ANNIMALI MILL-FONDAZZJONI TAL-POPOLAZZJONI (SENA 2010), U JIĠĠENERA INFORMAZZJONI ADDIZZJONALI TAT-TIP ĠENOMIKU (IL-GENOTYPING TA’ 1,200 INDIVIDWU B’ĊIPPA KUMMERĊJALI TA’ 60,000 MARKATUR SNP), METABOLOMICO (KWAŻI SPETTROSKOPIJA INFRAĦAMRA GĦAL 1,500 KAMPJUN TAS-SERUM TAD-DEMM MEĦUDA MADWAR L-INSEMINAZZJONI/IMPJANTAZZJONI), U MICROBIOMICO (SEKWENZJAR MASSIV GĦALL-ĠENE 16S RRNA TA’ 300 KAMPJUN TA’ MIKROBIJOMA VAĠINALI MEĦUDA FIŻ-ŻMIEN TAL-INSEMINAZZJONI TAL-ĦNIEŻER). LADARBA TINKISEB L-INFORMAZZJONI KOLLHA, L-EWWEL PASS SE JKUN IFFUKAT FUQ L-ANALIŻI U L-KARATTERIZZAZZJONI TAD-DIVERSITÀ ĠENETIKA TAR-RAZEZ UŻATI, KIF UKOLL FUQ ID-DETERMINAZZJONI TAL-PREŻENZA TA’ MARKA TAL-GĦAŻLA FIHOM. IT-TIENI, SE SSIR ANOMALIJA TA’ ASSOĊJAZZJONI DWAR KARATTRI RIPRODUTTIVI BĦALL-ETÀ FL-EWWEL INSEMINAZZJONI JEW L-EWWEL ĦLAS, IL-FERTILITÀ TAL-ĦNIEŻER NISA (GESTANT JEW MHUX TQAL), JEW IL-PROLIFITÀ F’TERMINI TA’ QŻIEQEŻ LI JITWIELDU ĦAJJIN, MEJTA JEW MIFTUMA. F’DAN IL-KAŻ L-ASSOĊJAZZJONIJIET POSSIBBLI BEJN DAWN IL-KARATTRI RIPRODUTTIVI U S-SORSI DIFFERENTI TA’ INFORMAZZJONI SE JIĠU STUDJATI SEPARATAMENT (ĠENOMA, METABOLOMA U MIKROBIJOMA), FILWAQT LI JIĠI PROPOST UKOLL L-ISTUDJU TAL-IMPATT POSSIBBLI TAL-KONSANĠINITÀ FUQHOM. FIL-PASS LI JMISS, SE TAPPROFONDIXXI L-MUDELLI TA’ EVALWAZZJONI ĠENOMIKA, B’ENFASI SPEĊJALI FUQ L-IPPEŻAR KEMM TA’ INFORMAZZJONI ĠENOMIKA KIF UKOLL FENOTIPIKA, KIF UKOLL L-INTERAZZJONI AKTAR MILLI POSSIBBLI BEJN IL-ĠENOMA U METABOLOMA. FL-AĦĦAR NETT, BĦALA WIEĦED MILL-ISTADJI L-AKTAR RILEVANTI TAL-PROĠETT, L-GĦAN HUWA LI JIĠU ANALIZZATI B’MOD INTEGRAT IS-SORSI KOLLHA TA’ INFORMAZZJONI DISPONIBBLI, BIL-GĦAN LI JINĦOLQU NETWERKS BIJOLOĠIĊI LI JINTEGRAW IS-SAFFI DIFFERENTI TA’ INFORMAZZJONI U JIPPROVDU KARATTERIZZAZZJONI AKTAR KOMPLETA U REALISTIKA TAL-MEKKANIŻMI BIJOLOĠIĊI INVOLUTI FIR-REGOLAMENT TAR-RIPRODUZZJONI (U L-EFFIĊJENZA TAGĦHOM) FIL-ĦNIEŻER B’MOD ĠENERALI, U B’MOD PARTIKOLARI L-ĦNIEŻER IBERIĊI. B’MOD ĠENERALI, QED TIĠI PROPOSTA INIZJATTIVA ĠDIDA U AMBIZZJUŻA, RILEVANTI KEMM GĦALL-INDUSTRIJA TAL-ĦNIEŻER KIF UKOLL GĦALL-KOMUNITÀ XJENTIFIKA, U LI TINVOLVI TIM TA’ RIĊERKATURI TA’ POŻIZZJONI INTERNAZZJONALI RIKONOXXUTA LI TIGGARANTIXXI L-VIJABBILTÀ TAL-PROĠETT U L-KISBA TAL-GĦANIJIET STABBILITI. (Maltese)
4 August 2022
0 references
O presente projecto centra-se no estudo da eficácia reprodutiva dos jovens irlandeses, com base numa concepção experimental que integra três diferentes estratos (retintas, enTREPELADAS e TORBISCAL), bem como a sua travessia da F1, no âmbito de uma população comercial gerida pela Inga Food SA. O PROJECTO DE PLANOS DE UTILIZAÇÃO DE INFORMAÇÕES GENELÓGICAS E DE PRODUÇÃO/REPRODUÇÃO DE ANIMAIS DA FUNDAÇÃO PARA A POPULAÇÃO (ANO 2010), E DE GERAÇÃO DE INFORMAÇÕES ADICIONAIS DE TIPO GENÓMICO (GENÓTICA DE 1200 INDIVIDUAIS COM O CHIP COMERCIAL DE 60 000 MARCADORES DE PENSOS), METABOLOMICO (ESPTROSCOPIA INFRARADA NENHUMA PARA 1500 AMOSTRAS DE SÉRMO DE SANGUE TOMADAS NA INSEMINAÇÃO/IMPLANTAÇÃO) E MICROBIOMICO (SEQUERÊNCIA MASSIVA PARA O GENO DE 16 RENOS DE 300 AMOSTRAS DE MICROBIOME VAGINAL TOMADAS NO MOMENTO DA INSEMINAÇÃO DAS POSES). Uma vez obtidas todas as informações, será dado um primeiro passo para a análise e caracterização da diversidade genética das estirpes utilizadas, bem como para a determinação da presença de uma coluna de selecção nas mesmas. Em segundo lugar, realizar-se-á anomaticamente uma associação de carácter reprodutivo, tal como a idade da primeira inspecção ou da primeira entrega, a fecundidade das marrãs (conservadoras ou não), ou a saliência em termos de galinhas nascidas vivas, mortas ou desmamadas. Neste caso, as associações possíveis entre estas características de reprodução e as diferentes fontes de informação serão fornecidas separadamente (genome, metaboloma e microbiome), propondo igualmente o estudo do possível impacto da consangüinidade sobre elas. Numa próxima etapa, aprofundará os modos de avaliação genética, colocando uma ênfase especial na ponderação das informações genéticas e fenotípicas, bem como na interacção mais do que possível entre o genoma e o metaboloma. Por último, tratando-se de uma das manifestações mais relevantes do projecto, o objectivo consiste em analisar de forma integrada todas as fontes de informação disponíveis, com o objectivo de criar redes biológicas que integrem as diferentes camadas de informação e proporcionem uma caracterização mais completa e realista dos meios biológicos envolvidos no regulamento da produção (e da sua eficácia) nos porcos em geral e, em particular, nos porcos irlandeses. No seu conjunto, propõe-se uma nova e ambiciosa iniciativa, pertinente tanto para a indústria dos suínos como para a comunidade científica, e que envolva uma equipa de investigadores de nível internacional reconhecido que garanta a viabilidade do projecto e a realização dos objectivos fixados. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
DETTE PROJEKT FOKUSERER PÅ UNDERSØGELSEN AF IBERISKE BØRSTERS REPRODUKTIONSEFFEKTIVITET BASERET PÅ ET EKSPERIMENTELT DESIGN, DER INTEGRERER TRE FORSKELLIGE STAMMER (RETINTAS, ENTREPELADA OG TORBISCAL) SAMT DERES F1-KRYDSNINGER INDEN FOR EN KOMMERCIEL BEFOLKNING, DER FORVALTES AF INGA FOOD SA. PROJEKTET PLANLÆGGER AT ANVENDE BÅDE GENEALOGISK OG PRODUKTIV/REPRODUKTIV INFORMATION OM DYR FRA POPULATIONSFONDEN (ÅR 2010) OG GENERERE YDERLIGERE OPLYSNINGER OM GENOMISK TYPE (GENOTYPEBESTEMMELSE AF 1.200 INDIVIDER MED KOMMERCIEL CHIP PÅ 60.000 SNP-MARKØRER), METABOLOMICO (NÆR INFRARØD SPEKTROSKOPI FOR 1.500 BLODPRØVER TAGET OMKRING INSEMINERING/IMPLANTATION) OG MICROBIOMICO (MASSIV SEKVENTERING FOR 16S RRNA-GENET MED 300 PRØVER AF VAGINAL MIKROBIOM TAGET PÅ TIDSPUNKTET FOR INSEMINERING AF SØERNE). NÅR ALLE OPLYSNINGER ER INDHENTET, VIL DER BLIVE TAGET ET FØRSTE SKRIDT MED FOKUS PÅ AT ANALYSERE OG KARAKTERISERE DEN GENETISKE MANGFOLDIGHED AF DE ANVENDTE STAMMER SAMT AT BESTEMME TILSTEDEVÆRELSEN AF ET UDVÆLGELSESFODAFTRYK I DEM. FOR DET ANDET VIL BLIVE UDFØRT ANOMALI AF ASSOCIATION PÅ REPRODUKTIVE KARAKTERER SÅSOM ALDER VED FØRSTE INSEMINATION ELLER FØRSTE LEVERING, FERTILITET AF SØER (GESTANT ELLER IKKE-GRAVID), ELLER FRUGTBARHED I FORM AF SMÅGRISE FØDT LEVENDE, DØDE ELLER FRAVÆNNEDE SMÅGRISE. I DETTE TILFÆLDE VIL DE MULIGE SAMMENHÆNGE MELLEM DISSE REPRODUKTIONSKARAKTERER OG DE FORSKELLIGE INFORMATIONSKILDER BLIVE UNDERSØGT SEPARAT (GENOM, METABOLOMA OG MIKROBIOME), OG DER VIL OGSÅ BLIVE FORESLÅET EN UNDERSØGELSE AF DEN MULIGE INDVIRKNING AF KONSANDINITET PÅ DEM. I ET NÆSTE SKRIDT VIL DET UDDYBE MODELLERNE FOR GENOMVURDERING OG LÆGGE SÆRLIG VÆGT PÅ VÆGTNINGEN AF BÅDE GENOM- OG FÆNOTYPISK INFORMATION SAMT DET MERE END MULIGE SAMSPIL MELLEM GENOMET OG METABOLOMA. ENDELIG ER MÅLET, DA DET ER EN AF PROJEKTETS MEST RELEVANTE MILEPÆLE, AT ANALYSERE ALLE TILGÆNGELIGE INFORMATIONSKILDER PÅ EN INTEGRERET MÅDE MED HENBLIK PÅ AT SKABE BIOLOGISKE NETVÆRK, DER INTEGRERER DE FORSKELLIGE LAG AF INFORMATION OG GIVER EN MERE FULDSTÆNDIG OG REALISTISK KARAKTERISERING AF DE BIOLOGISKE MEKANISMER, DER INDGÅR I REGULERINGEN AF REPRODUKTION (OG DERES EFFEKTIVITET) I SVINENE GENERELT OG IBERISKE SØER I SÆRDELESHED. GENERELT FORESLÅS DER ET NYT OG AMBITIØST INITIATIV, DER ER RELEVANT FOR BÅDE SVINEINDUSTRIEN OG DET VIDENSKABELIGE FÆLLESSKAB, OG SOM OMFATTER ET TEAM AF FORSKERE MED ANERKENDT INTERNATIONAL STATUS, SOM GARANTERER PROJEKTETS LEVEDYGTIGHED OG OPFYLDELSEN AF DE FASTSATTE MÅL. (Danish)
4 August 2022
0 references
ACEST PROIECT SE AXEAZĂ PE STUDIUL EFICIENȚEI REPRODUCTIVE A PĂRULUI IBERIC, BAZAT PE UN DESIGN EXPERIMENTAL CARE INTEGREAZĂ TREI TULPINI DIFERITE (RETINTAS, ENTREPELADA ȘI TORBISCAL), PRECUM ȘI CRUCILE LOR F1, ÎN CADRUL UNEI POPULAȚII COMERCIALE GESTIONATE DE INGA FOOD SA. PROIECTUL INTENȚIONEAZĂ SĂ UTILIZEZE ATÂT INFORMAȚIILE GENEALOGICE, CÂT ȘI CELE PRODUCTIVE/REPRODUCTIVE ALE ANIMALELOR DE LA POPULAȚIA FUNDAȚIEI (ANUL 2010) ȘI SĂ GENEREZE INFORMAȚII SUPLIMENTARE DE TIP GENOMIC (GENOTIPAREA A 1 200 DE PERSOANE CU CIP COMERCIAL DE 60.000 DE MARKERI SNP), METABOLOMICO (APROAPE SPECTROSCOPIE ÎN INFRAROȘU PENTRU 1.500 DE PROBE DE SER DE SÂNGE PRELEVATE ÎN JURUL INSEMINĂRII/IMPLANTĂRII) ȘI MICROBIOMICO (SECVENȚIE MASIVĂ PENTRU GENA 16S RRNA A 300 DE PROBE DE MICROBIOM VAGINALE PRELEVATE ÎN MOMENTUL INSEMINĂRII SCROAFELOR). ODATĂ CE TOATE INFORMAȚIILE VOR FI OBȚINUTE, UN PRIM PAS SE VA CONCENTRA PE ANALIZAREA ȘI CARACTERIZAREA DIVERSITĂȚII GENETICE A TULPINILOR UTILIZATE, PRECUM ȘI PE DETERMINAREA PREZENȚEI UNEI AMPRENTE DE SELECȚIE ÎN ACESTEA. ÎN AL DOILEA RÂND, SE VA EFECTUA O ANOMALIE A ASOCIAȚIEI PRIVIND CARACTERISTICILE REPRODUCTIVE, CUM AR FI VÂRSTA LA PRIMA INSEMINARE SAU LA PRIMA NAȘTERE, FERTILITATEA SCROAFELOR (GESTANT SAU NON-ÎNGRĂȘAT) SAU PROLIFICITATEA ÎN CEEA CE PRIVEȘTE PURCEII NĂSCUȚI VII, MORȚI SAU ÎNȚĂRCAȚI. ÎN ACEST CAZ, POSIBILELE ASOCIERI ÎNTRE ACESTE CARACTERE REPRODUCĂTOARE ȘI DIFERITELE SURSE DE INFORMAȚII VOR FI STUDIATE SEPARAT (GENOM, METABOLOMA ȘI MICROBIOM), PROPUNÂND, DE ASEMENEA, STUDIUL POSIBILULUI IMPACT AL CONSANGUINITĂȚII ASUPRA ACESTORA. ÎNTR-UN PAS URMĂTOR, VA APROFUNDA MODELELE DE EVALUARE GENOMICĂ, PUNÂND UN ACCENT DEOSEBIT PE PONDERAREA INFORMAȚIILOR GENOMICE ȘI FENOTIPICE, PRECUM ȘI PE INTERACȚIUNEA MAI MULT DECÂT POSIBILĂ DINTRE GENOM ȘI METABOLOMA. ÎN CELE DIN URMĂ, FIIND UNA DINTRE CELE MAI RELEVANTE ETAPE ALE PROIECTULUI, SCOPUL ESTE DE A ANALIZA ÎNTR-UN MOD INTEGRAT TOATE SURSELE DE INFORMAȚII DISPONIBILE, CU SCOPUL DE A CREA REȚELE BIOLOGICE CARE SĂ INTEGREZE DIFERITELE NIVELURI DE INFORMAȚII ȘI SĂ OFERE O CARACTERIZARE MAI COMPLETĂ ȘI MAI REALISTĂ A MECANISMELOR BIOLOGICE IMPLICATE ÎN REGULAMENTUL PRIVIND REPRODUCEREA (ȘI EFICIENȚA ACESTORA) LA PORCI ÎN GENERAL ȘI LA SCROAFELE IBERICE ÎN SPECIAL. ÎN ANSAMBLU, SE PROPUNE O INIȚIATIVĂ NOUĂ ȘI AMBIȚIOASĂ, RELEVANTĂ ATÂT PENTRU INDUSTRIA CĂRNII DE PORC, CÂT ȘI PENTRU COMUNITATEA ȘTIINȚIFICĂ, CARE SĂ IMPLICE O ECHIPĂ DE CERCETĂTORI CU STATUT INTERNAȚIONAL RECUNOSCUT, CARE SĂ GARANTEZE VIABILITATEA PROIECTULUI ȘI REALIZAREA OBIECTIVELOR STABILITE. (Romanian)
4 August 2022
0 references
DETTA PROJEKT FOKUSERAR PÅ STUDIEN AV REPRODUKTIONSEFFEKTIVITETEN HOS IBERISKA BORST, BASERAD PÅ EN EXPERIMENTELL DESIGN SOM INTEGRERAR TRE OLIKA STAMMAR (RETINTAS, ENTREPELADA OCH TORBISCAL), SAMT DERAS F1-KORS, INOM EN KOMMERSIELL POPULATION SOM FÖRVALTAS AV INGA FOOD SA. PROJEKTET PLANERAR ATT ANVÄNDA BÅDE GENEALOGISK OCH PRODUKTIV/REPRODUKTIV INFORMATION OM DJUR FRÅN POPULATIONSSTIFTELSEN (ÅR 2010) OCH GENERERA YTTERLIGARE INFORMATION AV GENOMISK TYP (GENOTYPNING AV 1 200 INDIVIDER MED KOMMERSIELLT CHIP MED 60 000 SNP-MARKÖRER), METABOLOMICO (NÄRA INFRARÖD SPEKTROSKOPI FÖR 1500 BLODSERUMPROV TAGNA RUNT INSEMINATIONEN/IMPLANTATIONEN) OCH MICROBIOMICO (MASSIV SEKVENSERING FÖR 16S RRNA-GENEN PÅ 300 PROVER AV VAGINAL MIKROBIOM SOM TOGS VID INSEMINATIONEN AV SUGGORNA). NÄR ALL INFORMATION HAR ERHÅLLITS KOMMER ETT FÖRSTA STEG ATT GÖRAS MED FOKUS PÅ ATT ANALYSERA OCH KARAKTERISERA DEN GENETISKA MÅNGFALDEN HOS DE STAMMAR SOM ANVÄNDS, SAMT PÅ ATT FASTSTÄLLA FÖREKOMSTEN AV ETT URVALSAVTRYCK I DEM. ANDRA, KOMMER ATT UTFÖRAS ANOMALI AV ASSOCIATION PÅ REPRODUKTIVA TECKEN SÅSOM ÅLDER VID FÖRSTA INSEMINATION ELLER FÖRSTA LEVERANS, FERTILITET HOS SUGGOR (GESTANT ELLER ICKE-GRAVID), ELLER PROLIFICITET I TERMER AV SMÅGRISAR FÖDDA LEVANDE, DÖDA ELLER AVVANDA SMÅGRISAR. I DETTA FALL KOMMER DE MÖJLIGA SAMBANDEN MELLAN DESSA REPRODUKTIONSTECKEN OCH DE OLIKA INFORMATIONSKÄLLORNA ATT STUDERAS SEPARAT (GENOM, METABOLOMA OCH MIKROBIOM), DÄR MAN OCKSÅ FÖRESLÅR EN UNDERSÖKNING AV EVENTUELLA EFFEKTER AV KONSANGUINITET PÅ DEM. I ETT NÄSTA STEG KOMMER DEN ATT FÖRDJUPA MODELLERNA FÖR GENOMISK UTVÄRDERING OCH LÄGGA SÄRSKILD VIKT VID VIKTNING AV BÅDE GENOMISK OCH FENOTYPISK INFORMATION, SAMT DEN MER ÄN MÖJLIGA INTERAKTIONEN MELLAN GENOMET OCH METABOLOMA. SOM EN AV PROJEKTETS VIKTIGASTE MILSTOLPAR ÄR MÅLET ATT PÅ ETT INTEGRERAT SÄTT ANALYSERA ALLA TILLGÄNGLIGA INFORMATIONSKÄLLOR I SYFTE ATT SKAPA BIOLOGISKA NÄTVERK SOM INTEGRERAR DE OLIKA INFORMATIONSSKIKTEN OCH GER EN MER FULLSTÄNDIG OCH REALISTISK KARAKTERISERING AV DE BIOLOGISKA MEKANISMER SOM INGÅR I FÖRORDNINGEN OM REPRODUKTION (OCH DERAS EFFEKTIVITET) HOS GRISARNA I ALLMÄNHET, OCH IBERISKA SUGGOR I SYNNERHET. PÅ DET HELA TAGET FÖRESLÅS ETT NYTT OCH AMBITIÖST INITIATIV, SOM ÄR RELEVANT FÖR BÅDE GRISINDUSTRIN OCH DEN VETENSKAPLIGA GEMENSKAPEN, OCH INVOLVERAR ETT FORSKARLAG MED ERKÄND INTERNATIONELL STATUS SOM GARANTERAR PROJEKTETS LIVSKRAFT OCH UPPNÅENDET AV DE FASTSTÄLLDA MÅLEN. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Cerdanyola del Vallès
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
CGL2016-80155-R
0 references