TRANSMISSION SOURCES OF ESCHERICHIA COLI PANDEMIC CLONAL GROUP ST131. MOLECULAR CHARACTERISATION OF THE PATHOGEN AND ITS VIRULENCE IN VIVO, RISK ASSESSMENT AND CONTROL (Q3136046)

From EU Knowledge Graph
Revision as of 09:34, 10 October 2024 by DG Regio (talk | contribs) (‎Changed label, description and/or aliases in pt)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to navigation Jump to search
Project Q3136046 in Spain
Language Label Description Also known as
English
TRANSMISSION SOURCES OF ESCHERICHIA COLI PANDEMIC CLONAL GROUP ST131. MOLECULAR CHARACTERISATION OF THE PATHOGEN AND ITS VIRULENCE IN VIVO, RISK ASSESSMENT AND CONTROL
Project Q3136046 in Spain

    Statements

    0 references
    62,590.27 Euro
    0 references
    114,950.0 Euro
    0 references
    54.45 percent
    0 references
    1 January 2014
    0 references
    30 June 2017
    0 references
    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
    0 references

    43°0'22.21"N, 7°33'0.83"W
    0 references
    27002
    0 references
    EL ESTUDIO DE INVESTIGACION PROPUESTO EN LA PRESENTE SOLICITUD SE ENMARCA DENTRO DEL RETO "SEGURIDAD Y CALIDAD ALIMENTARIA". EL GRUPO CLONAL DE E. COLI ST131 ROMPE EL PARADIGMA DE LA INCOMPATIBILIDAD DE LOS GENES DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS Y LOS DE VIRULENCIA EN LOS DE E. COLI PATOGENOS EXTRAINTESTINALES (EXPEC). DESDE SU IDENTIFICACION A NIVEL INTERCONTINENTAL, EN EL AÑO 2008, ESTE GRUPO CLONAL HA TENIDO UNA EXPANSION ESPECTACULAR, REPRESENTANDO EN LA ACTUALIDAD MAS DEL 50% DE LAS CEPAS PRODUCTORAS DE BETA LACTAMASAS DE ESPECTRO EXTENDIDO (ESBL) Y MAS DEL 30% DE LAS CEPAS DE EXPEC MULTIRRESISTENTES. EN EL PRESENTE PROYECTO QUEREMOS DEFINIR CLARAMENTE CUALES SON LAS RUTAS Y FUENTES DE TRANSMISION DEL GRUPO CLONAL ST131, SI EXISTE RIESGO, Y QUE GRADO DE RIESGO EN EL CONSUMO DE CARNE DE ANIMALES DE PRODUCCION, Y QUE MEDIDAS DE CONTROL SE PUEDEN APLICAR EN LA CADENA ALIMENTARIA. QUEREMOS ANALIZAR TAMBIEN EL PAPEL DE LA FAUNA SILVESTRE EN EL MANTENIMIENTO Y DISEMINACION DE CEPAS ST131. CONCRETAMENTE ESTUDIAREMOS AVES SILVESTRES, ZORROS Y JABALIES, QUE POR SU EXPLOSION DEMOGRAFICA MANTIENEN ACTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTACTO CON ANIMALES DE PRODUCCION Y ASENTAMIENTOS HUMANOS. SEGUN NUESTROS DATOS ES LA PRIMERA VEZ SE INVESTIGAN LOS ZORROS Y LOS JABALIES COMO PORTADORES DE CEPAS ST131, Y AUNQUE SI SE HAN AISLADO CEPAS ST131 DE AVES SILVESTRES EN VARIOS PAISES, NO SE HAN ESTABLECIDO SUS VIROTIPOS NI SE HAN COMPARADO CON LAS CEPAS RESPONSABLES DE INFECCIONES EN SERES HUMANOS. VAMOS A REALIZAR UNA DETALLADA CARACTERIZACION MOLECULAR (MLST, PFGE, SECUENCIACION COMPLETA DEL GENOMA PARA DEFINIR GENES DE VIRULENCIA E ISLAS DE PATOGENICIDAD) DE LAS CEPAS ST131 AISLADAS DE ALIMENTOS Y ANIMALES, Y DETERMINAREMOS SU VIRULENCIA IN VIVO EN UN MODELO DE SEPSIS MURINO. COMPARAREMOS LOS DATOS OBTENIDOS CON LOS DE LAS CEPAS ST131 CAUSANTES DE PATOLOGIA EN SERES HUMANOS. EL OBJETIVO ES QUE LOS RESULTADOS REPERCUTAN EN LA SALUD PUBLICA Y LA SEGURIDAD ALIMENTARIA A TRAVES DE UN MAYOR CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS QUE HACEN EXITOSO A ESTE GRUPO CLONAL DESDE EL PUNTO DE VISTA DE LA VIRULENCIA Y LA DISEMINACION. EL IMPACTO CIENTIFICO DE LOS RESULTADOS ESTA TOTALMENTE ASEGURADO Y ACREDITADO POR EL ELEVADO INDICE DE IMPACTO DE LAS PUBLICACIONES QUE VENIMOS REALIZADO DESDE QUE EN EL AÑO 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORCIO INTERNACIONAL QUE EVIDENCIO LA DISTRIBUCION INTERCONTINENTAL DEL GRUPO CLONAL ST131. (Spanish)
    0 references
    THE RESEARCH STUDY PROPOSED IN THIS APPLICATION FALLS WITHIN THE “FOOD SAFETY AND QUALITY” CHALLENGE. THE CLONAL GROUP OF E. COLI ST131 BREAKS THE PARADIGM OF THE INCOMPATIBILITY OF ANTIBIOTIC RESISTANCE GENES AND THOSE OF VIRULENCE IN THOSE OF E. COLI EXTRAINTESTINAL PATHOGENS (EXPEC). SINCE ITS IDENTIFICATION AT THE INTERCONTINENTAL LEVEL, IN 2008, THIS CLONAL GROUP HAS HAD A SPECTACULAR EXPANSION, CURRENTLY ACCOUNTING FOR MORE THAN 50 % OF THE BETA-PRODUCING STRAINS OF EXTENDED SPECTRUM LACTAMASES (ESBL) AND MORE THAN 30 % OF MULTIDRUG RESISTANT EXPEC STRAINS. IN THIS PROJECT WE WANT TO CLEARLY DEFINE THE ROUTES AND SOURCES OF TRANSMISSION OF THE CLONAL GROUP ST131, IF THERE IS A RISK, AND WHAT DEGREE OF RISK IN THE CONSUMPTION OF MEAT FROM PRODUCTION ANIMALS, AND WHICH CONTROL MEASURES CAN BE APPLIED IN THE FOOD CHAIN. WE ALSO WANT TO ANALYSE THE ROLE OF WILDLIFE IN THE MAINTENANCE AND DISSEMINATION OF ST131 STRAINS. SPECIFICALLY WE WILL STUDY WILD BIRDS, FOXES AND JABALIES, WHICH DUE TO THEIR DEMOGRAPHIC EXPLOSION CURRENTLY MAINTAIN IMPORTANT CONTACT WITH ANIMALS OF PRODUCTION AND HUMAN SETTLEMENTS. ACCORDING TO OUR DATA THIS IS THE FIRST TIME FOXES AND JABALIES ARE INVESTIGATED AS CARRIERS OF STRAINS ST131, AND ALTHOUGH IF ST131 STRAINS OF WILD BIRDS HAVE BEEN ISOLATED IN SEVERAL COUNTRIES, THEIR VIROTIPOS HAVE NOT BEEN ESTABLISHED NOR COMPARED TO THE STRAINS RESPONSIBLE FOR INFECTIONS IN HUMANS. WE WILL PERFORM A DETAILED MOLECULAR CHARACTERISATION (MLST, PFGE, COMPLETE GENOME SEQUENCING TO DEFINE VIRULENCE GENES AND ISLANDS OF PATHOGENICITY) OF ST131 STRAINS ISOLATED FROM FOOD AND ANIMALS, AND WE WILL DETERMINE THEIR VIRULENCE IN VIVO IN A MODEL OF MURINE SEPSIS. WE WILL COMPARE THE DATA OBTAINED WITH THOSE OF THE ST131 STRAINS CAUSING PATHOLOGY IN HUMANS. THE OBJECTIVE IS THAT THE RESULTS HAVE AN IMPACT ON PUBLIC HEALTH AND FOOD SAFETY THROUGH GREATER KNOWLEDGE OF THE MECHANISMS THAT MAKE THIS CLONAL GROUP SUCCESSFUL FROM THE POINT OF VIEW OF VIRULENCE AND DISSEMINATION. THE SCIENTIFIC IMPACT OF THE RESULTS IS FULLY ASSURED AND ACCREDITED BY THE HIGH IMPACT INDEX OF THE PUBLICATIONS THAT WE HAVE PRODUCED SINCE 2008 FORMASEMOS PART OF THE INTERNATIONAL CONSORTIUM THAT DEMONSTRATED THE INTERCONTINENTAL DISTRIBUTION OF THE CLONAL GROUP ST131. (English)
    12 October 2021
    0.3009862948887287
    0 references
    L’ÉTUDE DE RECHERCHE PROPOSÉE DANS LA PRÉSENTE DEMANDE RELÈVE DU DÉFI DE LA «SÉCURITÉ ET DE LA QUALITÉ DES ALIMENTS». LE GROUPE CLONAL D’E. COLI ST131 ROMPT LE PARADIGME DE L’INCOMPATIBILITÉ DES GÈNES DE RÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES ET CEUX DE LA VIRULENCE CHEZ LES PATHOGÈNES EXTRA-INTESTINAUX D’E. COLI (EXPEC). DEPUIS SON IDENTIFICATION AU NIVEAU INTERCONTINENTAL, EN 2008, CE GROUPE CLONAL A CONNU UNE EXPANSION SPECTACULAIRE, REPRÉSENTANT ACTUELLEMENT PLUS DE 50 % DES SOUCHES PRODUCTRICES DE LACTAMASES À SPECTRE ÉTENDU (ESBL) ET PLUS DE 30 % DES SOUCHES EXPEC MULTIRÉSISTANTES. DANS CE PROJET, NOUS VOULONS DÉFINIR CLAIREMENT LES VOIES ET LES SOURCES DE TRANSMISSION DU GROUPE CLONAL ST131, S’IL Y A UN RISQUE, ET QUEL DEGRÉ DE RISQUE DANS LA CONSOMMATION DE VIANDE PROVENANT D’ANIMAUX DE PRODUCTION, ET QUELLES MESURES DE CONTRÔLE PEUVENT ÊTRE APPLIQUÉES DANS LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. NOUS VOULONS ÉGALEMENT ANALYSER LE RÔLE DE LA FAUNE DANS L’ENTRETIEN ET LA DIFFUSION DES SOUCHES ST131. PLUS PRÉCISÉMENT, NOUS ÉTUDIERONS LES OISEAUX SAUVAGES, LES RENARDS ET LES JABALIES, QUI, EN RAISON DE LEUR EXPLOSION DÉMOGRAPHIQUE, ENTRETIENNENT ACTUELLEMENT DES CONTACTS IMPORTANTS AVEC LES ANIMAUX DE PRODUCTION ET LES ÉTABLISSEMENTS HUMAINS. SELON NOS DONNÉES, C’EST LA PREMIÈRE FOIS QUE LES RENARDS ET LES JABALIES SONT ÉTUDIÉS COMME PORTEURS DES SOUCHES ST131, ET BIEN QUE SI DES SOUCHES ST131 D’OISEAUX SAUVAGES AIENT ÉTÉ ISOLÉES DANS PLUSIEURS PAYS, LEUR VIROTIPOS N’A PAS ÉTÉ ÉTABLI NI COMPARÉ AUX SOUCHES RESPONSABLES DES INFECTIONS CHEZ L’HOMME. NOUS EFFECTUERONS UNE CARACTÉRISATION MOLÉCULAIRE DÉTAILLÉE (MLST, PFGE, SÉQUENÇAGE COMPLET DU GÉNOME POUR DÉFINIR LES GÈNES DE VIRULENCE ET LES ÎLES DE PATHOGÉNICITÉ) DES SOUCHES ST131 ISOLÉES DES ALIMENTS ET DES ANIMAUX, ET NOUS DÉTERMINERONS LEUR VIRULENCE IN VIVO DANS UN MODÈLE DE SEPSIS MURINE. NOUS COMPARERONS LES DONNÉES OBTENUES AVEC CELLES DES SOUCHES ST131 CAUSANT UNE PATHOLOGIE CHEZ L’HOMME. L’OBJECTIF EST QUE LES RÉSULTATS AIENT UN IMPACT SUR LA SANTÉ PUBLIQUE ET LA SÉCURITÉ ALIMENTAIRE GRÂCE À UNE MEILLEURE CONNAISSANCE DES MÉCANISMES QUI PERMETTENT À CE GROUPE CLONAL DE RÉUSSIR DU POINT DE VUE DE LA VIRULENCE ET DE LA DIFFUSION. L’IMPACT SCIENTIFIQUE DES RÉSULTATS EST PLEINEMENT ASSURÉ ET ACCRÉDITÉ PAR L’INDICE D’IMPACT ÉLEVÉ DES PUBLICATIONS QUE NOUS AVONS PRODUITES DEPUIS 2008 FORMASEMOS FAISANT PARTIE DU CONSORTIUM INTERNATIONAL QUI A DÉMONTRÉ LA DISTRIBUTION INTERCONTINENTALE DU GROUPE CLONAL ST131. (French)
    2 December 2021
    0 references
    DIE IN DIESER ANWENDUNG VORGESCHLAGENE FORSCHUNGSSTUDIE FÄLLT UNTER DIE HERAUSFORDERUNG „LEBENSMITTELSICHERHEIT UND -QUALITÄT“. DIE KLONALE GRUPPE VON E. COLI ST131 BRICHT DAS PARADIGMA DER INKOMPATIBILITÄT VON ANTIBIOTIKARESISTENZGENEN UND DER VIRULENZ IN DENEN VON E. COLI EXTRAINTESTINALEN KRANKHEITSERREGERN (EXPEC). SEIT IHRER IDENTIFIZIERUNG AUF INTERKONTINENTALER EBENE IM JAHR 2008 HAT DIESE KLONALE GRUPPE EINE SPEKTAKULÄRE EXPANSION VERZEICHNET, AUF DIE DERZEIT MEHR ALS 50 % DER BETA-PRODUZIERENDEN STÄMME VON VERLÄNGERTEN SPEKTRUMS LAKTAMASEN (ESBL) UND MEHR ALS 30 % DER MULTIRESISTENTEN EXPEC-STÄMME ENTFALLEN. IN DIESEM PROJEKT WOLLEN WIR DIE WEGE UND QUELLEN DER ÜBERTRAGUNG DER KLONGRUPPE ST131 KLAR DEFINIEREN, WENN EIN RISIKO BESTEHT UND WELCHES RISIKO BEIM VERZEHR VON FLEISCH VON NUTZTIEREN BESTEHT UND WELCHE KONTROLLMASSNAHMEN IN DER LEBENSMITTELKETTE ANGEWENDET WERDEN KÖNNEN. WIR WOLLEN AUCH DIE ROLLE VON WILDTIEREN BEI DER ERHALTUNG UND VERBREITUNG VON ST131-STÄMMEN ANALYSIEREN. SPEZIELL WERDEN WIR WILDVÖGEL, FÜCHSE UND JABALIES UNTERSUCHEN, DIE AUFGRUND IHRER DEMOGRAFISCHEN EXPLOSION DERZEIT EINEN WICHTIGEN KONTAKT MIT NUTZTIEREN UND MENSCHLICHEN SIEDLUNGEN HABEN. NACH UNSEREN DATEN SIND DIES DAS ERSTE MAL, DASS FÜCHSE UND JABALIES ALS TRÄGER VON STÄMMEN ST131 UNTERSUCHT WERDEN UND OBWOHL ST131 STÄMME VON WILDVÖGELN IN MEHREREN LÄNDERN ISOLIERT WURDEN, IHRE VIROTIPOS WEDER NACHGEWIESEN NOCH MIT DEN STÄMMEN VERGLICHEN WURDEN, DIE FÜR INFEKTIONEN BEIM MENSCHEN VERANTWORTLICH SIND. WIR WERDEN EINE DETAILLIERTE MOLEKULARE CHARAKTERISIERUNG (MLST, PFGE, KOMPLETTE GENOMSEQUENZIERUNG ZUR DEFINITION VON VIRULENZGENEN UND INSELN DER PATHOGENITÄT) VON ST131 STÄMMEN DURCHFÜHREN, DIE VON LEBENSMITTELN UND TIEREN ISOLIERT SIND, UND WIR WERDEN IHRE VIRULENZ IN VIVO IN EINEM MODELL DER MURINE SEPSIS BESTIMMEN. WIR WERDEN DIE GEWONNENEN DATEN MIT DENEN DER ST131-STÄMME VERGLEICHEN, DIE PATHOLOGIE BEIM MENSCHEN VERURSACHEN. ZIEL IST, DASS SICH DIE ERGEBNISSE AUF DIE ÖFFENTLICHE GESUNDHEIT UND DIE LEBENSMITTELSICHERHEIT AUSWIRKEN, INDEM SIE BESSER ÜBER DIE MECHANISMEN INFORMIERT WERDEN, DIE DIESE KLONGRUPPE UNTER DEM GESICHTSPUNKT DER VIRULENZ UND VERBREITUNG ERFOLGREICH MACHEN. DIE WISSENSCHAFTLICHE WIRKUNG DER ERGEBNISSE WIRD DURCH DEN HOHEN WIRKUNGSINDEX DER PUBLIKATIONEN, DIE WIR SEIT 2008 PRODUZIERT HABEN, VOLLSTÄNDIG GESICHERT UND AKKREDITIERT. FORMASEMOS TEIL DES INTERNATIONALEN KONSORTIUMS, DAS DIE INTERKONTINENTALE VERTEILUNG DER KLONGRUPPE ST131 DEMONSTRIERTE. (German)
    9 December 2021
    0 references
    DE IN DEZE AANVRAAG VOORGESTELDE STUDIE VALT ONDER DE UITDAGING „VOEDSELVEILIGHEID EN -KWALITEIT”. DE CLONALE GROEP VAN E. COLI ST131 BREEKT HET PARADIGMA VAN DE ONVERENIGBAARHEID VAN ANTIBIOTICARESISTENTIEGENEN EN DIE VAN VIRULENTIE IN DIE VAN E. COLI EXTRA-INTESTINALE PATHOGENEN (EXPEC). SINDS DE IDENTIFICATIE OP INTERCONTINENTAAL NIVEAU, IN 2008, HEEFT DEZE KLOONGROEP EEN SPECTACULAIRE EXPANSIE GEHAD, DIE MOMENTEEL GOED IS VOOR MEER DAN 50 % VAN DE BÈTAPRODUCERENDE STAMMEN VAN UITGEBREIDE SPECTRUMLACTAMASEN (ESBL) EN MEER DAN 30 % VAN MULTIDRUG RESISTENTE EXPEC STAMMEN. IN DIT PROJECT WILLEN WE DUIDELIJK DE ROUTES EN BRONNEN VAN OVERDRACHT VAN DE KLONALE GROEP ST131 DEFINIËREN, ALS ER EEN RISICO IS, EN WELKE MATE VAN RISICO BIJ DE CONSUMPTIE VAN VLEES VAN PRODUCTIEDIEREN, EN WELKE CONTROLEMAATREGELEN IN DE VOEDSELKETEN KUNNEN WORDEN TOEGEPAST. WE WILLEN OOK DE ROL VAN WILDE DIEREN IN HET ONDERHOUD EN DE VERSPREIDING VAN ST131 STAMMEN ANALYSEREN. IN HET BIJZONDER BESTUDEREN WE WILDE VOGELS, VOSSEN EN JABALIES, DIE DOOR HUN DEMOGRAFISCHE EXPLOSIE MOMENTEEL EEN BELANGRIJK CONTACT ONDERHOUDEN MET PRODUCTIEVE DIEREN EN MENSELIJKE NEDERZETTINGEN. VOLGENS ONZE GEGEVENS IS DIT DE EERSTE KEER DAT VOSSEN EN JABALIES WORDEN ONDERZOCHT ALS DRAGERS VAN STAMMEN ST131, EN HOEWEL ALS ST131 STAMMEN VAN WILDE VOGELS IN VERSCHILLENDE LANDEN ZIJN GEÏSOLEERD, HUN VIROTIPOS NIET ZIJN VASTGESTELD NOCH VERGELEKEN MET DE STAMMEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR INFECTIES BIJ MENSEN. WE ZULLEN EEN GEDETAILLEERDE MOLECULAIRE KARAKTERISERING UITVOEREN (MLST, PFGE, VOLLEDIGE GENOOMSEQUENCING OM VIRULENTIEGENEN EN EILANDEN VAN PATHOGENITEIT TE DEFINIËREN) VAN ST131 STAMMEN GEÏSOLEERD VAN VOEDSEL EN DIEREN, EN WE ZULLEN HUN VIRULENTIE IN VIVO BEPALEN IN EEN MODEL VAN MURINE SEPSIS. WE ZULLEN DE VERKREGEN GEGEVENS VERGELIJKEN MET DIE VAN DE ST131 STAMMEN DIE PATHOLOGIE BIJ MENSEN VEROORZAKEN. HET DOEL IS DAT DE RESULTATEN GEVOLGEN HEBBEN VOOR DE VOLKSGEZONDHEID EN DE VOEDSELVEILIGHEID DOOR EEN BETERE KENNIS VAN DE MECHANISMEN DIE DEZE KLONALE GROEP SUCCESVOL MAKEN VANUIT HET OOGPUNT VAN VIRULENTIE EN VERSPREIDING. DE WETENSCHAPPELIJKE IMPACT VAN DE RESULTATEN IS VOLLEDIG VERZEKERD EN GEACCREDITEERD DOOR DE HIGH IMPACT INDEX VAN DE PUBLICATIES DIE WE SINDS 2008 HEBBEN GEPRODUCEERD FORMASEMOS ONDERDEEL VAN HET INTERNATIONALE CONSORTIUM DAT DE INTERCONTINENTALE DISTRIBUTIE VAN DE KLONALE GROEP ST131 DEMONSTREERDE. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    LO STUDIO DI RICERCA PROPOSTO IN QUESTA APPLICAZIONE RIENTRA NELLA SFIDA "SICUREZZA E QUALITÀ DEGLI ALIMENTI". IL GRUPPO CLONALE DI E. COLI ST131 ROMPE IL PARADIGMA DELL'INCOMPATIBILITÀ DEI GENI DELLA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI E QUELLI DELLA VIRULENZA IN QUELLI DEI PATOGENI EXTRAINTESTINALI DI E. COLI (PREVEDI). SIN DALLA SUA IDENTIFICAZIONE A LIVELLO INTERCONTINENTALE, NEL 2008, QUESTO GRUPPO CLONALE HA AVUTO UNA SPETTACOLARE ESPANSIONE, ATTUALMENTE RAPPRESENTANDO OLTRE IL 50 % DEI CEPPI DI LATTAMASI A SPETTRO ESTESO (ESBL) CHE PRODUCONO BETA E OLTRE IL 30 % DEI CEPPI DI EXPEC RESISTENTI AI FARMACI. IN QUESTO PROGETTO VOGLIAMO DEFINIRE CHIARAMENTE LE VIE E LE FONTI DI TRASMISSIONE DEL GRUPPO CLONALE ST131, SE ESISTE UN RISCHIO, E QUALE GRADO DI RISCHIO NEL CONSUMO DI CARNE PROVENIENTE DA ANIMALI DA PRODUZIONE E QUALI MISURE DI CONTROLLO POSSONO ESSERE APPLICATE NELLA CATENA ALIMENTARE. VOGLIAMO ANCHE ANALIZZARE IL RUOLO DELLA FAUNA SELVATICA NELLA MANUTENZIONE E NELLA DIFFUSIONE DEI CEPPI ST131. NELLO SPECIFICO STUDIEREMO UCCELLI SELVATICI, VOLPI E GIABALIE, CHE A CAUSA DELLA LORO ESPLOSIONE DEMOGRAFICA MANTENGONO ATTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTATTO CON GLI ANIMALI DI PRODUZIONE E GLI INSEDIAMENTI UMANI. SECONDO I NOSTRI DATI QUESTA È LA PRIMA VOLTA CHE VOLPI E JABALIES SONO INDAGATI COME PORTATORI DI CEPPI ST131, E ANCHE SE SE ST131 CEPPI DI UCCELLI SELVATICI SONO STATI ISOLATI IN DIVERSI PAESI, I LORO VIROTIPOS NON SONO STATI STABILITI NÉ CONFRONTATI CON I CEPPI RESPONSABILI DELLE INFEZIONI NELL'UOMO. ESEGUIREMO UNA DETTAGLIATA CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE (MLST, PFGE, SEQUENZIAMENTO COMPLETO DEL GENOMA PER DEFINIRE I GENI DELLA VIRULENZA E LE ISOLE DI PATOGENICITÀ) DEI CEPPI ST131 ISOLATI DAL CIBO E DAGLI ANIMALI, E DETERMINEREMO LA LORO VIRULENZA IN VIVO IN UN MODELLO DI SEPSI MURINA. CONFRONTIAMO I DATI OTTENUTI CON QUELLI DEI CEPPI ST131 CHE CAUSANO PATOLOGIA NELL'UOMO. L'OBIETTIVO È CHE I RISULTATI ABBIANO UN IMPATTO SULLA SALUTE PUBBLICA E SULLA SICUREZZA ALIMENTARE ATTRAVERSO UNA MAGGIORE CONOSCENZA DEI MECCANISMI CHE RENDONO QUESTO GRUPPO CLONALE EFFICACE DAL PUNTO DI VISTA DELLA VIRULENZA E DELLA DIFFUSIONE. L'IMPATTO SCIENTIFICO DEI RISULTATI È PIENAMENTE GARANTITO E ACCREDITATO DALL'INDICE AD ALTO IMPATTO DELLE PUBBLICAZIONI CHE ABBIAMO PRODOTTO DAL 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORZIO INTERNAZIONALE CHE HA DIMOSTRATO LA DISTRIBUZIONE INTERCONTINENTALE DEL GRUPPO CLONALE ST131. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    Η ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΜΕΛΈΤΗ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ ΣΤΗΝ ΠΑΡΟΎΣΑ ΑΊΤΗΣΗ ΕΜΠΊΠΤΕΙ ΣΤΗΝ ΠΡΌΚΛΗΣΗ «ΑΣΦΆΛΕΙΑ ΚΑΙ ΠΟΙΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΤΡΟΦΊΜΩΝ». Η ΚΛΩΝΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΤΟΥ E. COLI ST131 ΣΠΆΕΙ ΤΟ ΠΑΡΆΔΕΙΓΜΑ ΤΗΣ ΑΣΥΜΒΑΤΌΤΗΤΑΣ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΑΝΤΟΧΉΣ ΣΤΑ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ ΚΑΙ ΕΚΕΊΝΩΝ ΤΗΣ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ ΣΕ ΕΚΕΊΝΑ ΤΩΝ ΕΞΩΕΝΤΕΡΙΚΏΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΤΟΥ E. COLI (EXPEC). ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΝΑΓΝΏΡΙΣΉ ΤΗΣ ΣΕ ΔΙΗΠΕΙΡΩΤΙΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ, ΤΟ 2008, ΑΥΤΉ Η ΚΛΩΝΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΠΑΡΟΥΣΊΑΣΕ ΘΕΑΜΑΤΙΚΉ ΕΠΈΚΤΑΣΗ, ΑΝΤΙΠΡΟΣΩΠΕΎΟΝΤΑΣ ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ ΠΆΝΩ ΑΠΌ ΤΟ 50 % ΤΩΝ Β-ΠΑΡΑΓΩΓΙΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΤΩΝ ΛΑΚΤΆΜΑΣΕΣ ΕΚΤΕΤΑΜΈΝΟΥ ΦΆΣΜΑΤΟΣ (ESBL) ΚΑΙ ΠΆΝΩ ΑΠΌ ΤΟ 30 % ΤΩΝ ΠΟΛΥΑΝΘΕΚΤΙΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ EXPEC. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΈΛΟΥΜΕ ΝΑ ΚΑΘΟΡΊΣΟΥΜΕ ΜΕ ΣΑΦΉΝΕΙΑ ΤΙΣ ΟΔΟΎΣ ΚΑΙ ΤΙΣ ΠΗΓΈΣ ΜΕΤΆΔΟΣΗΣ ΤΗΣ ΚΛΩΝΙΚΉΣ ΟΜΆΔΑΣ ST131, ΕΆΝ ΥΠΆΡΧΕΙ ΚΊΝΔΥΝΟΣ, ΚΑΙ ΤΟΝ ΒΑΘΜΌ ΚΙΝΔΎΝΟΥ ΣΤΗΝ ΚΑΤΑΝΆΛΩΣΗ ΚΡΈΑΤΟΣ ΑΠΌ ΖΏΑ ΠΑΡΑΓΩΓΉΣ, ΚΑΙ ΠΟΙΑ ΜΈΤΡΑ ΕΛΈΓΧΟΥ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΕΦΑΡΜΟΣΤΟΎΝ ΣΤΗΝ ΤΡΟΦΙΚΉ ΑΛΥΣΊΔΑ. ΘΈΛΟΥΜΕ ΕΠΊΣΗΣ ΝΑ ΑΝΑΛΎΣΟΥΜΕ ΤΟΝ ΡΌΛΟ ΤΗΣ ΆΓΡΙΑΣ ΠΑΝΊΔΑΣ ΣΤΗ ΔΙΑΤΉΡΗΣΗ ΚΑΙ ΤΗ ΔΙΆΔΟΣΗ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ST131. ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΑ ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΆΓΡΙΑ ΠΤΗΝΆ, ΑΛΕΠΟΎΔΕΣ ΚΑΙ JABALIES, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΔΗΜΟΓΡΑΦΙΚΉΣ ΤΟΥΣ ΈΚΡΗΞΗΣ ΔΙΑΤΗΡΟΎΝ ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΉ ΕΠΑΦΉ ΜΕ ΖΏΑ ΠΑΡΑΓΩΓΉΣ ΚΑΙ ΑΝΘΡΏΠΙΝΟΥΣ ΟΙΚΙΣΜΟΎΣ. ΣΎΜΦΩΝΑ ΜΕ ΤΑ ΣΤΟΙΧΕΊΑ ΜΑΣ, ΑΥΤΉ ΕΊΝΑΙ Η ΠΡΏΤΗ ΦΟΡΆ ΠΟΥ ΟΙ ΑΛΕΠΟΎΔΕΣ ΚΑΙ ΤΑ JABALIES ΔΙΕΡΕΥΝΏΝΤΑΙ ΩΣ ΦΟΡΕΊΣ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ST131, ΚΑΙ ΑΝ ΚΑΙ ΑΝ ΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ ST131 ΤΩΝ ΆΓΡΙΩΝ ΠΤΗΝΏΝ ΈΧΟΥΝ ΑΠΟΜΟΝΩΘΕΊ ΣΕ ΑΡΚΕΤΈΣ ΧΏΡΕΣ, ΤΟ VIROTIPOS ΤΟΥΣ ΔΕΝ ΈΧΕΙ ΤΕΚΜΗΡΙΩΘΕΊ ΟΎΤΕ ΣΥΓΚΡΙΘΕΊ ΜΕ ΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ ΠΟΥ ΕΥΘΎΝΟΝΤΑΙ ΓΙΑ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ ΣΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ. ΘΑ ΕΚΤΕΛΈΣΟΥΜΕ ΈΝΑΝ ΛΕΠΤΟΜΕΡΉ ΜΟΡΙΑΚΌ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ (MLST, PFGE, ΠΛΉΡΗΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΓΙΑ ΝΑ ΟΡΊΣΟΥΜΕ ΓΟΝΊΔΙΑ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ ΚΑΙ ΝΗΣΙΆ ΠΑΘΟΓΟΝΙΚΌΤΗΤΑΣ) ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ST131 ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΑΠΟΜΟΝΩΘΕΊ ΑΠΌ ΤΡΌΦΙΜΑ ΚΑΙ ΖΏΑ, ΚΑΙ ΘΑ ΚΑΘΟΡΊΣΟΥΜΕ ΤΗ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΤΗΤΆ ΤΟΥΣ IN VIVO ΣΕ ΈΝΑ ΜΟΝΤΈΛΟ ΣΉΨΗΣ ΤΩΝ ΜΥΏΝ. ΘΑ ΣΥΓΚΡΊΝΟΥΜΕ ΤΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΠΟΥ ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΜΕ ΕΚΕΊΝΑ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ST131 ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΎΝ ΠΑΘΟΛΟΓΊΑ ΣΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ. ΣΤΌΧΟΣ ΕΊΝΑΙ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΝΑ ΈΧΟΥΝ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟ ΣΤΗ ΔΗΜΌΣΙΑ ΥΓΕΊΑ ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΣΦΆΛΕΙΑ ΤΩΝ ΤΡΟΦΊΜΩΝ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗΣ ΓΝΏΣΗΣ ΤΩΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΠΟΥ ΚΑΘΙΣΤΟΎΝ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΚΛΩΝΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΕΠΙΤΥΧΉ ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΠΟΨΗ ΤΗΣ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΔΙΆΔΟΣΗΣ. Ο ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΌΣ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟΣ ΤΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΕΊΝΑΙ ΠΛΉΡΩΣ ΕΞΑΣΦΑΛΙΣΜΈΝΟΣ ΚΑΙ ΔΙΑΠΙΣΤΕΥΜΈΝΟΣ ΑΠΌ ΤΟΝ ΔΕΊΚΤΗ ΥΨΗΛΟΎ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟΥ ΤΩΝ ΔΗΜΟΣΙΕΎΣΕΩΝ ΠΟΥ ΈΧΟΥΜΕ ΠΑΡΑΓΆΓΕΙ ΑΠΌ ΤΟ 2008 ΤΟ FORMASEMOS ΜΈΡΟΣ ΤΗΣ ΔΙΕΘΝΟΎΣ ΚΟΙΝΟΠΡΑΞΊΑΣ ΠΟΥ ΚΑΤΈΔΕΙΞΕ ΤΗ ΔΙΗΠΕΙΡΩΤΙΚΉ ΚΑΤΑΝΟΜΉ ΤΗΣ ΚΛΩΝΙΚΉΣ ΟΜΆΔΑΣ ST131. (Greek)
    17 August 2022
    0 references
    DEN FORSKNINGSUNDERSØGELSE, DER FORESLÅS I DENNE ANSØGNING, FALDER IND UNDER UDFORDRINGEN "FØDEVARESIKKERHED OG -KVALITET". DEN KLONEDE GRUPPE E. COLI ST131 BRYDER PARADIGMET OM UFORENELIGHED MELLEM ANTIBIOTIKARESISTENSGENER OG VIRULENSGENER HOS E. COLI EKSTRAINTESTINALE PATOGENER (EXPEC). SIDEN IDENTIFIKATIONEN PÅ INTERKONTINENTAL NIVEAU HAR DENNE KLONGRUPPE I 2008 HAFT EN SPEKTAKULÆR EKSPANSION, DER I ØJEBLIKKET TEGNER SIG FOR MERE END 50 % AF DE BETAPRODUCERENDE STAMMER AF UDVIDEDE SPEKTRUMLAKTAMASER (ESBL) OG MERE END 30 % AF MULTIRESISTENTE EXPEC-STAMMER. I DETTE PROJEKT ØNSKER VI KLART AT DEFINERE SPREDNINGSVEJE OG -KILDER FOR KLONGRUPPE ST131, HVIS DER ER EN RISIKO, OG HVILKEN RISIKO I FORBRUGET AF KØD FRA PRODUKTIONSDYR, OG HVILKE KONTROLFORANSTALTNINGER DER KAN ANVENDES I FØDEVAREKÆDEN. VI ØNSKER OGSÅ AT ANALYSERE DYRELIVETS ROLLE I VEDLIGEHOLDELSEN OG UDBREDELSEN AF ST131-STAMMER. SPECIFIKT VIL VI STUDERE VILDE FUGLE, RÆVE OG JABALIES, SOM PÅ GRUND AF DERES DEMOGRAFISKE EKSPLOSION I ØJEBLIKKET OPRETHOLDER VIGTIG KONTAKT MED DYR I PRODUKTION OG BEBYGGELSER. IFØLGE VORES DATA ER DETTE FØRSTE GANG RÆVE OG JABALIES UNDERSØGES SOM BÆRERE AF STAMMER ST131, OG SELVOM HVIS ST131-STAMMER AF VILDE FUGLE ER BLEVET ISOLERET I FLERE LANDE, ER DERES VIROTIPOS IKKE BLEVET FASTLAGT ELLER SAMMENLIGNET MED DE STAMMER, DER ER ANSVARLIGE FOR INFEKTIONER HOS MENNESKER. VI VIL UDFØRE EN DETALJERET MOLEKYLÆR KARAKTERISERING (MLST, PFGE, KOMPLET GENOM SEKVENSERING FOR AT DEFINERE VIRULENS GENER OG ØER AF PATOGENICITET) AF ST131-STAMMER ISOLERET FRA FØDEVARER OG DYR, OG VI VIL BESTEMME DERES VIRULENS IN VIVO I EN MODEL AF MURINE SEPSIS. VI VIL SAMMENLIGNE DE OPNÅEDE DATA MED DEM FRA ST131-STAMMERNE, DER FORÅRSAGER PATOLOGI HOS MENNESKER. MÅLET ER, AT RESULTATERNE HAR EN INDVIRKNING PÅ FOLKESUNDHEDEN OG FØDEVARESIKKERHEDEN GENNEM STØRRE VIDEN OM DE MEKANISMER, DER GØR DENNE KLONGRUPPE EN SUCCES SET UD FRA ET VIRULENS- OG SPREDNINGSSYNSPUNKT. DEN VIDENSKABELIGE VIRKNING AF RESULTATERNE ER FULDT UD SIKRET OG AKKREDITERET AF HØJ EFFEKT INDEKS FOR DE PUBLIKATIONER, SOM VI HAR PRODUCERET SIDEN 2008 FORMASEMOS DEL AF DET INTERNATIONALE KONSORTIUM, DER DEMONSTREREDE DEN INTERKONTINENTALE DISTRIBUTION AF CLONAL GRUPPE ST131. (Danish)
    17 August 2022
    0 references
    TÄSSÄ HAKEMUKSESSA EHDOTETTU TUTKIMUS KUULUU ELINTARVIKKEIDEN TURVALLISUUDEN JA LAADUN HAASTEESEEN. E. COLI ST131 -BAKTEERIN KLOONIRYHMÄ RIKKOO ANTIBIOOTTIRESISTENSSIGEENIEN YHTEENSOPIMATTOMUUDEN PARADIGMAA JA VIRULENSSIN PARADIGMAA E. COLIN EKSTRAINTESTINAALISTEN PATOGEENIEN (EXPEC) OSALTA. SEN JÄLKEEN, KUN TÄMÄ KLOONIRYHMÄ TUNNISTETTIIN MANNERTENVÄLISELLÄ TASOLLA VUONNA 2008, SE ON LAAJENTUNUT MERKITTÄVÄSTI, JA SEN OSUUS ON TÄLLÄ HETKELLÄ YLI 50 PROSENTTIA LAAJENNETUN SPEKTRILAKTAMAASIN (ESBL) BEETAA TUOTTAVISTA KANNOISTA JA YLI 30 PROSENTTIA MONILÄÄKERESISTENTEISTÄ EKSEC-KANNOISTA. TÄSSÄ HANKKEESSA HALUAMME MÄÄRITELLÄ SELKEÄSTI KLOONIRYHMÄN ST131 SIIRTOTIET JA -LÄHTEET, JOS ON OLEMASSA RISKI, JA KUINKA SUURI RISKI TUOTANTOELÄIMISTÄ PERÄISIN OLEVAN LIHAN KULUTUKSESSA ON JA MITÄ VALVONTATOIMENPITEITÄ VOIDAAN SOVELTAA ELINTARVIKEKETJUSSA. HALUAMME MYÖS ANALYSOIDA LUONNONVARAISTEN ELÄINTEN JA KASVIEN ROOLIA ST131-KANTOJEN YLLÄPIDOSSA JA LEVITTÄMISESSÄ. TUTKIMME ERITYISESTI LUONNONVARAISIA LINTUJA, KETTUJA JA JABALIES-LINTUJA, JOTKA VÄESTÖRAKENTEEN RÄJÄHDYSMÄISEN RÄJÄHDYKSENSÄ VUOKSI PITÄVÄT TÄLLÄ HETKELLÄ MERKITTÄVIÄ YHTEYKSIÄ TUOTANTOELÄIMIIN JA IHMISTEN SIIRTOKUNTIIN. TIETOJEMME MUKAAN TÄMÄ ON ENSIMMÄINEN KERTA, KUN KETTUJA JA JABALIESEJA TUTKITAAN KANTOJEN ST131 KANTAJINA, JA VAIKKA ST131-LUONNONVARAISTEN LINTUJEN KANTOJA ON ERISTETTY USEISSA MAISSA, NIIDEN VIROTIPOSIA EI OLE VAHVISTETTU EIKÄ NIITÄ OLE VERRATTU IHMISTEN TARTUNNOISTA VASTAAVIIN KANTOIHIN. SUORITAMME YKSITYISKOHTAISEN MOLEKYYLIKARAKTEROINNIN (MLST, PFGE, TÄYDELLINEN GENOMIN SEKVENSOINTI VIRULENSSIGEENIEN JA PATOGEENISYYSSAARIEN MÄÄRITTÄMISEKSI) ELINTARVIKKEISTA JA ELÄIMISTÄ ERISTETYISTÄ ST131-KANNOISTA, JA MÄÄRITTELEMME NIIDEN VIRULENSSIN IN VIVO HIIREN SEPSIKSEN MALLISSA. VERTAAMME SAATUJA TIETOJA ST131-KANTOJEN TIETOIHIN, JOTKA AIHEUTTAVAT PATOLOGIAA IHMISISSÄ. TAVOITTEENA ON, ETTÄ TULOKSET VAIKUTTAVAT KANSANTERVEYTEEN JA ELINTARVIKKEIDEN TURVALLISUUTEEN, SILLÄ NE LISÄÄVÄT TIETÄMYSTÄ MEKANISMEISTA, JOTKA TEKEVÄT KLOONIRYHMÄSTÄ MENESTYKSEKÄSTÄ VIRULENSSIN JA LEVITYKSEN KANNALTA. TULOSTEN TIETEELLINEN VAIKUTUS ON TÄYSIN VARMISTETTU JA AKKREDITOITU NIIDEN JULKAISUJEN KORKEALLA VAIKUTUSINDEKSILLÄ, JOITA OLEMME TUOTTANEET VUODESTA 2008 LÄHTIEN FORMASEMOS-OSASSA KANSAINVÄLISESSÄ KONSORTIOSSA, JOKA OSOITTI KLONAALIRYHMÄN ST131 MANNERTENVÄLISEN LEVINNEISYYDEN. (Finnish)
    17 August 2022
    0 references
    L-ISTUDJU TA’ RIĊERKA PROPOST F’DIN L-APPLIKAZZJONI JAQA’ TAĦT L-ISFIDA TAS-“SIKUREZZA U L-KWALITÀ TAL-IKEL”. IL-GRUPP KLONALI TA’ E. COLI ST131 JIKSER IL-PARADIGMA TAL-INKOMPATIBILITÀ TA’ ĠENI TA’ REŻISTENZA ANTIBIJOTIKA U DAWK TA’ VIRULENZA F’DAWK TA’ PATOĠENI EKSTRAINTESTINALI TA’ E. COLI (EXPEC). MILL-IDENTIFIKAZZJONI TIEGĦU FIL-LIVELL INTERKONTINENTALI, FL-2008, DAN IL-GRUPP KLONALI KELLU ESPANSJONI SPETTAKOLARI, LI BĦALISSA JAMMONTA GĦAL AKTAR MINN 50 % TAR-RAZEZ LI JIPPRODUĊU BETA TA’ LACTAMASES BI SPETTRU ESTIŻ (ESBL) U AKTAR MINN 30 % TA’ RAZEZ EXPEC REŻISTENTI GĦAL ĦAFNA MEDIĊINI. F’DAN IL-PROĠETT IRRIDU NIDDEFINIXXU B’MOD ĊAR IR-ROTOT U S-SORSI TA’ TRAŻMISSJONI TAL-GRUPP KLONALI ST131, JEKK HEMM RISKJU, U X’LIVELL TA’ RISKJU FIL-KONSUM TAL-LAĦAM MILL-ANNIMALI TAL-PRODUZZJONI, U LIEMA MIŻURI TA’ KONTROLL JISTGĦU JIĠU APPLIKATI FIL-KATINA ALIMENTARI. IRRIDU WKOLL NANALIZZAW IR-RWOL TAL-ORGANIŻMI SELVAĠĠI FIŻ-ŻAMMA U T-TIXRID TAL-VARJANTI ST131. B’MOD SPEĊIFIKU SE NISTUDJAW GĦASAFAR SELVAĠĠI, VOLPIJIET U JABALIES, LI MINĦABBA L-ISPLUŻJONI DEMOGRAFIKA TAGĦHOM BĦALISSA JŻOMMU KUNTATT IMPORTANTI MAL-ANNIMALI TAL-PRODUZZJONI U L-INSEDJAMENTI UMANI. SKONT ID-DEJTA TAGĦNA DIN HIJA L-EWWEL DARBA LI L-VOLPIJIET U JABALIES JIĠU INVESTIGATI BĦALA TRASPORTATURI TAR-RAZEZ ST131, U GĦALKEMM JEKK IR-RAZEZ ST131 TA’ GĦASAFAR SELVAĠĠI ĠEW IŻOLATI F’DIVERSI PAJJIŻI, VIROTIPOS TAGĦHOM MA ĠEWX STABBILITI U LANQAS IMQABBLA MAR-RAZEZ RESPONSABBLI GĦALL-INFEZZJONIJIET FIL-BNEDMIN. AĦNA SE NWETTQU KARATTERIZZAZZJONI MOLEKULARI DETTALJATA (MLST, PFGE, SEKWENZJAR SĦIĦ TAL-ĠENOMA BIEX NIDDEFINIXXU ĠENI TA’ VIRULENZA U GŻEJJER TA’ PATOĠENIĊITÀ) TA’ RAZEZ ST131 IŻOLATI MILL-IKEL U L-ANNIMALI, U AĦNA SER NIDDETERMINAW IL-VIRULENZA TAGĦHOM IN VIVO F’MUDELL TA’ SEPSIS TAL-ĠRIEDEN. SE NQABBLU D-DEJTA MIKSUBA MA’ DIK TAR-RAZEZ ST131 LI JIKKAWŻAW PATOLOĠIJA FIL-BNEDMIN. L-GĦAN HUWA LI R-RIŻULTATI JKOLLHOM IMPATT FUQ IS-SAĦĦA PUBBLIKA U S-SIKUREZZA TAL-IKEL PERMEZZ TA’ GĦARFIEN AKBAR TAL-MEKKANIŻMI LI JWASSLU BIEX DAN IL-GRUPP KLONALI JIRNEXXI MIL-LAT TA’ VIRULENZA U TIXRID. L-IMPATT XJENTIFIKU TAR-RIŻULTATI HUWA ASSIGURAT U AKKREDITAT BIS-SĦIĦ MILL-INDIĊI TA’ IMPATT GĦOLI TAL-PUBBLIKAZZJONIJIET LI PPRODUĊEJNA SA MILL-2008 PARTI MILL-KONSORZJU INTERNAZZJONALI LI WERA D-DISTRIBUZZJONI INTERKONTINENTALI TAL-GRUPP KLONALI ST131. (Maltese)
    17 August 2022
    0 references
    ŠAJĀ PIETEIKUMĀ IEROSINĀTAIS PĒTĪJUMS IR SAISTĪTS AR “PĀRTIKAS NEKAITĪGUMA UN KVALITĀTES” PROBLĒMU. E. COLI ST131 KLONĀLĀ GRUPA IZJAUC ANTIBIOTIKU REZISTENCES GĒNU UN VIRULENCES GĒNU NESADERĪBU AR E. COLI EKSTRAINTESTINĀLIEM PATOGĒNIEM (EXPEC). KOPŠ TĀS NOTEIKŠANAS STARPKONTINENTĀLAJĀ LĪMENĪ 2008. GADĀ ŠAI KLONU GRUPAI IR BIJUSI IESPAIDĪGA PAPLAŠINĀŠANĀS, KAS PAŠLAIK VEIDO VAIRĀK NEKĀ 50 % NO BETA-PRODUCĒJOŠIEM PAPLAŠINĀTĀ LAKTAMĀŽU (ESBL) CELMIEM UN VAIRĀK NEKĀ 30 % NO MULTIREZISTENTAJIEM EKSPEC CELMIEM. ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS VĒLAMIES SKAIDRI DEFINĒT KLONĀLĀS GRUPAS ST131 PĀRNEŠANAS CEĻUS UN AVOTUS, JA PASTĀV RISKS UN KĀDA IR RISKA PAKĀPE GAĻAS PATĒRIŅĀ NO RAŽOJAMIEM DZĪVNIEKIEM, UN KĀDUS KONTROLES PASĀKUMUS VAR PIEMĒROT PĀRTIKAS ĶĒDĒ. MĒS ARĪ VĒLAMIES ANALIZĒT SAVVAĻAS DZĪVNIEKU LOMU ST131 CELMU UZTURĒŠANĀ UN IZPLATĪŠANĀ. ĪPAŠI MĒS PĒTĪSIM SAVVAĻAS PUTNUS, LAPSAS UN JABALIES, KAS TO DEMOGRĀFISKĀ SPRĀDZIENA DĒĻ PAŠLAIK UZTUR NOZĪMĪGU KONTAKTU AR RAŽOŠANAS DZĪVNIEKIEM UN CILVĒKU APDZĪVOTĀM VIETĀM. SASKAŅĀ AR MŪSU DATIEM ŠĪ IR PIRMĀ REIZE, KAD LAPSAS UN JABALIES TIEK PĒTĪTAS KĀ ST131 CELMU NESĒJI, UN, LAI GAN, JA ST131 SAVVAĻAS PUTNU CELMI IR IZOLĒTI VAIRĀKĀS VALSTĪS, TO VIROTIPOS NAV NE NOTEIKTAS, NE SALĪDZINĀTAS AR CELMIEM, KAS IZRAISA CILVĒKU INFEKCIJAS. MĒS VEIKSIM DETALIZĒTU NO PĀRTIKAS UN DZĪVNIEKIEM IZOLĒTU ST131 CELMU MOLEKULĀRO RAKSTUROJUMU (MLST, PFGE, PILNĪGA GENOMA SEKVENCĒŠANA VIRULENCES GĒNU UN PATOGENITĀTES SALU NOTEIKŠANAI), UN MĒS NOTEIKSIM TO VIRULENCI IN VIVO PEĻU SEPSES MODELĪ. MĒS SALĪDZINĀM IEGŪTOS DATUS AR DATIEM PAR ST131 CELMIEM, KAS IZRAISA PATOLOĢIJU CILVĒKIEM. MĒRĶIS IR PANĀKT, LAI REZULTĀTIEM BŪTU IETEKME UZ SABIEDRĪBAS VESELĪBU UN PĀRTIKAS NEKAITĪGUMU, UZLABOJOT ZINĀŠANAS PAR MEHĀNISMIEM, KAS PADARA ŠO KLONU GRUPU VEIKSMĪGU NO VIRULENCES UN IZPLATĪŠANAS VIEDOKĻA. REZULTĀTU ZINĀTNISKO IETEKMI PILNĪBĀ APLIECINA UN AKREDITĒ PUBLIKĀCIJU AUGSTAIS IETEKMES INDEKSS, KO ESAM SAGATAVOJUŠI KOPŠ 2008. GADA FORMASEMOS STARPTAUTISKĀ KONSORCIJA IETVAROS, KAS PARĀDĪJA KLONU GRUPAS ST131 IZPLATĪBU STARP KONTINENTIEM. (Latvian)
    17 August 2022
    0 references
    VÝSKUMNÁ ŠTÚDIA NAVRHNUTÁ V TEJTO ŽIADOSTI SPADÁ POD VÝZVU „BEZPEČNOSŤ A KVALITA POTRAVÍN“. KLONÁLNA SKUPINA E. COLI ST131 ROZBIJE PARADIGMU NEZLUČITEĽNOSTI GÉNOV REZISTENCIE VOČI ANTIBIOTIKÁM A VIRULENCIE V PRÍPADE EXTRAINTESTINÁLNYCH PATOGÉNOV E. COLI (EXPEC). OD JEJ IDENTIFIKÁCIE NA MEDZIKONTINENTÁLNEJ ÚROVNI V ROKU 2008 ZAZNAMENALA TÁTO KLONOVÁ SKUPINA VEĽKOLEPÚ EXPANZIU, KTORÁ V SÚČASNOSTI PREDSTAVUJE VIAC AKO 50 % BETA-PRODUKUJÚCICH KMEŇOV ROZŠÍRENÝCH SPEKTRÁLNYCH LAKTÁMÁZ (ESBL) A VIAC AKO 30 % EXPEC KMEŇOV REZISTENTNÝCH VOČI LIEKOM. V TOMTO PROJEKTE CHCEME JASNE DEFINOVAŤ SPÔSOBY A ZDROJE PRENOSU KLONOVEJ SKUPINY ST131, AK EXISTUJE RIZIKO, A AKÝ STUPEŇ RIZIKA PRI KONZUMÁCII MÄSA Z PRODUKČNÝCH ZVIERAT A AKÉ KONTROLNÉ OPATRENIA MOŽNO UPLATNIŤ V POTRAVINOVOM REŤAZCI. CHCEME TIEŽ ANALYZOVAŤ ÚLOHU VOĽNE ŽIJÚCICH ŽIVOČÍCHOV PRI UDRŽIAVANÍ A ŠÍRENÍ KMEŇOV ST131. KONKRÉTNE BUDEME ŠTUDOVAŤ VOĽNE ŽIJÚCE VTÁKY, LÍŠKY A JABALIES, KTORÉ VĎAKA ICH DEMOGRAFICKEJ EXPLÓZII V SÚČASNOSTI UDRŽIAVAJÚ DÔLEŽITÝ KONTAKT S PRODUKČNÝMI ZVIERATAMI A ĽUDSKÝMI OSADAMI. PODĽA NAŠICH ÚDAJOV JE TO PRVÝKRÁT, KEĎ SA LÍŠKY A JABALIES SKÚMAJÚ AKO NOSIČE KMEŇOV ST131, A HOCI AK BOLI KMENE ST131 IZOLOVANÉ V NIEKOĽKÝCH KRAJINÁCH, ICH VIROTIPOS NEBOL STANOVENÝ ANI POROVNANÝ S KMEŇMI ZODPOVEDNÝMI ZA INFEKCIE U ĽUDÍ. VYKONÁME PODROBNÚ MOLEKULÁRNU CHARAKTERIZÁCIU (MLST, PFGE, KOMPLETNÉ SEKVENOVANIE GENÓMOV NA DEFINOVANIE VIRULENTNÝCH GÉNOV A OSTROVOV PATOGENITY) KMEŇOV ST131 IZOLOVANÝCH Z POTRAVY A ZVIERAT A URČÍME ICH VIRULENCIU IN VIVO V MODELI MYŠEJ SEPSY. ZÍSKANÉ ÚDAJE POROVNÁME S ÚDAJMI KMEŇOV ST131, KTORÉ U ĽUDÍ SPÔSOBUJÚ PATOLÓGIU. CIEĽOM JE, ABY VÝSLEDKY MALI VPLYV NA VEREJNÉ ZDRAVIE A BEZPEČNOSŤ POTRAVÍN PROSTREDNÍCTVOM VÄČŠIEHO POZNANIA MECHANIZMOV, KTORÉ ROBIA TÚTO KLONOVÚ SKUPINU ÚSPEŠNOU Z HĽADISKA VIRULENCIE A ŠÍRENIA. VEDECKÝ DOPAD VÝSLEDKOV JE PLNE ZABEZPEČENÝ A AKREDITOVANÝ VYSOKÝM INDEXOM VPLYVU PUBLIKÁCIÍ, KTORÉ SME VYTVORILI OD ROKU 2008 FORMASEMOS SÚČASŤOU MEDZINÁRODNÉHO KONZORCIA, KTORÉ DEMONŠTROVALI MEDZIKONTINENTÁLNU DISTRIBÚCIU KLONOVEJ SKUPINY ST131. (Slovak)
    17 August 2022
    0 references
    TAGANN AN STAIDÉAR TAIGHDE ATÁ BEARTAITHE SAN IARRATAS SEO LAISTIGH DEN DÚSHLÁN “SÁBHÁILTEACHT AGUS CÁILÍOCHT BIA”. BRISEANN AN GRÚPA CLONAL DE E. COLI ST131 PARAIDÍM NEAMH-CHOMHOIRIÚNACHTA NA NGÉINTE FRITHSHEASMHACHTA IN AGHAIDH ANTAIBHEATHACH AGUS NA NIMHNEACHT I BPATAIGINÍ EXTRAINTESTINAL E. COLI (EXPEC). Ó AITHNÍODH É AG AN LEIBHÉAL INTERCONTINENTAL, I 2008, TÁ LEATHNÚ IONTACH AG AN NGRÚPA CLÓNACH SEO, ARB IONANN É FAOI LÁTHAIR AGUS NÍOS MÓ NÁ 50 % DE NA TRÉITHCHINEÁLACHA BÉITE A THÁIRGEANN LACTAMASES SPEICTRIM LEATHNAITHE (ESBL) AGUS NÍOS MÓ NÁ 30 % DE THRÉITHCHINEÁLACHA EXPEC RESISTANT MULTIDRUG. SA TIONSCADAL SEO, BA MHAITH LINN BEALAÍ AGUS FOINSÍ TARCHUIR AN GHRÚPA CHLÓIN ST131 A SHAINIÚ GO SOILÉIR, MÁ TÁ RIOSCA ANN, AGUS CÉN LEIBHÉAL RIOSCA A BHAINEANN LE TOMHALTAS FEOLA Ó AINMHITHE TÁIRGTHE, AGUS CÉ NA BEARTA RIALAITHE IS FÉIDIR A CHUR I BHFEIDHM SA BHIASHLABHRA. BA MHAITH LINN FREISIN ANAILÍS A DHÉANAMH AR RÓL AN FHIADHÚLRA I GCOTHABHÁIL AGUS I SCAIPEADH TRÉITHCHINEÁLACHA ST131. DÉANFAIMID STAIDÉAR GO SONRACH AR ÉIN FHIÁINE, SIONNAIGH AGUS JABALIES, A CHOIMEÁDANN TEAGMHÁIL THÁBHACHTACH LE HAINMHITHE TÁIRGTHE AGUS LONNAÍOCHTAÍ DAONNA MAR GHEALL AR A BPLÉASC DÉIMEAGRAFACH FAOI LÁTHAIR. DE RÉIR ÁR SONRAÍ IS É SEO AN CHÉAD UAIR SIONNAIGH AGUS JABALIES IMSCRÚDÚ MAR IOMPRÓIRÍ TRÉITHCHINEÁLACHA ST131, AGUS CÉ MÁ TÁ TRÉITHCHINEÁLACHA ST131 D’ÉIN FHIÁINE SCOITE AMACH I ROINNT TÍORTHA, NÍOR BUNAÍODH A VIROTIPOS NÁ I GCOMPARÁID LEIS NA TRÉITHCHINEÁLACHA ATÁ FREAGRACH AS IONFHABHTUITHE I NDAOINE. DÉANFAIMID TRÉITHRIÚ MÓILÍNEACH MIONSONRAITHE (MLST, PFGE, SEICHEAMHÚ GÉANÓIM IOMLÁN CHUN GÉINTE NIMHNEACHTA AGUS OILEÁIN PATAIGINEACHTA A SHAINMHÍNIÚ) DE THRÉITHCHINEÁLACHA ST131 ATÁ SCOITE AMACH Ó BHIA AGUS AINMHITHE, AGUS DÉANFAIMID A N-NIMHNEACHT IN VIVO A CHINNEADH I MÚNLA DE SEPSIS MURINE. DÉANFAIMID COMPARÁID IDIR NA SONRAÍ A FHAIGHTEAR AGUS NA SONRAÍ DE THRÉITHCHINEÁLACHA ST131 IS CÚIS LE PAITEOLAÍOCHT I NDAOINE. IS É AN CUSPÓIR GO MBEIDH TIONCHAR AG NA TORTHAÍ AR SHLÁINTE PHOIBLÍ AGUS AR SHÁBHÁILTEACHT BIA TRÍ EOLAS NÍOS FEARR A FHÁIL AR NA MEICNÍOCHTAÍ A FHÁGANN GO N-ÉIREOIDH LEIS AN NGRÚPA CLÓNACH SIN Ó THAOBH NA NIMHNEACHTA AGUS AN SCAIPTHE DE. DÉANTAR TIONCHAR EOLAÍOCH NA DTORTHAÍ A DHEIMHNIÚ AGUS A CHREIDIÚNÚ GO HIOMLÁN LE HINNÉACS ARDTIONCHAIR NA BHFOILSEACHÁN ATÁ TÁIRGTHE AGAINN Ó 2008 I LEITH, AR CUID DEN CHUIBHREANNAS IDIRNÁISIÚNTA É A LÉIRIGH DÁILEADH INTERCONTINENTAL GROUP ST131. (Irish)
    17 August 2022
    0 references
    VÝZKUMNÁ STUDIE NAVRŽENÁ V TÉTO ŽÁDOSTI SPADÁ DO „BEZPEČNOSTI A KVALITY POTRAVIN“. KLONÁLNÍ SKUPINA E. COLI ST131 ROZBIJE PARADIGMA NESLUČITELNOSTI GENŮ REZISTENCE VŮČI ANTIBIOTIKŮM A GENŮ VIRULENCE U EXTRAINTESTINÁLNÍCH PATOGENŮ E. COLI (EXPEC). OD SVÉ IDENTIFIKACE NA MEZIKONTINENTÁLNÍ ÚROVNI MĚLA TATO KLONOVÁ SKUPINA V ROCE 2008 VELKOLEPOU EXPANZI, KTERÁ V SOUČASNÉ DOBĚ PŘEDSTAVUJE VÍCE NEŽ 50 % KMENŮ BETA PRODUKUJÍCÍCH LAKTAMÁZY S ROZŠÍŘENÝM SPEKTREM (ESBL) A VÍCE NEŽ 30 % MULTIREZISTENTNÍCH EXEKOVÝCH KMENŮ. V TOMTO PROJEKTU CHCEME JASNĚ DEFINOVAT CESTY A ZDROJE PŘENOSU KLONÁLNÍ SKUPINY ST131, POKUD EXISTUJE RIZIKO A JAKÝ STUPEŇ RIZIKA PŘI KONZUMACI MASA Z PRODUKČNÍCH ZVÍŘAT A JAKÁ KONTROLNÍ OPATŘENÍ LZE UPLATNIT V POTRAVINOVÉM ŘETĚZCI. CHCEME TAKÉ ANALYZOVAT ÚLOHU VOLNĚ ŽIJÍCÍCH ŽIVOČICHŮ PŘI UDRŽOVÁNÍ A ŠÍŘENÍ KMENŮ ST131. KONKRÉTNĚ BUDEME STUDOVAT VOLNĚ ŽIJÍCÍ PTÁKY, LIŠKY A JABALIES, KTERÉ DÍKY SVÉ DEMOGRAFICKÉ EXPLOZI V SOUČASNÉ DOBĚ UDRŽUJÍ DŮLEŽITÝ KONTAKT SE ZVÍŘATY V PRODUKCI A LIDSKÝMI OSADAMI. PODLE NAŠICH ÚDAJŮ SE JEDNÁ O POPRVÉ, CO JSOU LIŠKY A JABALIES VYŠETŘENY JAKO PŘENAŠEČI KMENŮ ST131, A AČKOLI POKUD BYLY KMENY ST131 VOLNĚ ŽIJÍCÍCH PTÁKŮ IZOLOVÁNY V NĚKOLIKA ZEMÍCH, JEJICH VIROTIPOS NEBYLY STANOVENY ANI POROVNÁNY S KMENY ODPOVĚDNÝMI ZA INFEKCE U LIDÍ. PROVEDEME PODROBNOU MOLEKULÁRNÍ CHARAKTERIZACI (MLST, PFGE, KOMPLETNÍ SEKVENOVÁNÍ GENŮ GENŮ VIRULENCE A OSTROVY PATOGENITY) KMENŮ ST131 IZOLOVANÝCH Z POTRAVY A ZVÍŘAT A URČÍME JEJICH VIRULENCE IN VIVO V MODELU MYŠÍ SEPSE. ZÍSKANÉ ÚDAJE POROVNÁME S ÚDAJI KMENŮ ST131, KTERÉ U LIDÍ ZPŮSOBUJÍ PATOLOGII. CÍLEM JE, ABY VÝSLEDKY MĚLY DOPAD NA VEŘEJNÉ ZDRAVÍ A BEZPEČNOST POTRAVIN DÍKY VĚTŠÍ ZNALOSTI MECHANISMŮ, KTERÉ ČINÍ TUTO KLONOVOU SKUPINU ÚSPĚŠNOU Z HLEDISKA VIRULENCE A ŠÍŘENÍ. VĚDECKÝ DOPAD VÝSLEDKŮ JE PLNĚ ZAJIŠTĚN A AKREDITOVÁN VYSOKÝM INDEXEM DOPADU PUBLIKACÍ, KTERÉ JSME OD ROKU 2008 VYTVOŘILI V RÁMCI MEZINÁRODNÍHO KONSORCIA FORMASEMOS, KTERÉ PROKÁZALO MEZIKONTINENTÁLNÍ DISTRIBUCI KLONÁLNÍ SKUPINY ST131. (Czech)
    17 August 2022
    0 references
    O ESTUDO DE INVESTIGAÇÃO PROPOSTO NO PRESENTE PEDIDO ENCONTRA-SE NO DESAFIO «SEGURANÇA E QUALIDADE DOS ALIMENTOS». O GRUPO CLONAL DE E. COLI ST131 QUEBRA O PARADIGMO DA INCOMPATIBILIDADE DOS GÉNEROS DE RESISTÊNCIA ANTIBIOTICA E DOS DE VIRULÊNCIA NOS DE E. COLI PATOGÉNIOS EXTRAINTESTINAIS (EXPEC). DESDE A SUA IDENTIFICAÇÃO A NÍVEL INTERCONTINENTAL, EM 2008, ESTE GRUPO CLONAL TEM UMA EXPANSÃO ESPECTACULAR, CONTABILIZADA ATUALMENTE POR MAIS DE 50 % DAS ENTRADAS DE PRODUÇÃO DE BETA DE LACTAMAS DE ESPECTRUM ALARGADO (ESBL) E POR MAIS DE 30 % DAS ENTRADAS DE EXPECTATIVAS RESISTENTES A MULTIDRUG. Neste projeto, pretendemos definir claramente as vias e as fontes de transmissão do grupo CLONAL ST131, se existir um risco, e qual o grau de risco no consumo de carne proveniente de animais de produção, e que medidas de controlo podem ser aplicadas na cadeia alimentar. Também queremos analisar o papel da vida selvagem na manutenção e divulgação das estirpes ST131. Especificamente, estudaremos aves selvagens, raposas e cabaças, que, devido à sua explosão demográfica, mantêm atualmente um contacto importante com animais de produção e estabelecimentos humanos. De acordo com os nossos dados, esta é a primeira vez que as raposas e jaulas são investigadas como transportadoras de estirpes ST131, e embora ST131 estirpes de aves selvagens tenham sido isoladas em vários países, os seus vírus não foram estabelecidos nem compatibilizados com as estirpes responsáveis por infecções em seres humanos. Vamos realizar uma caracterização molecular detalhada (MLST, PFGE, GENOME COMPLETO que seqüencia para DEFENDER GENES DE VIRULÊNCIA E ILHAS DE PATHOGENICIDADE) de ST131 estirpes isoladas de alimentos e animais, e vamos determinar a sua VIRULÊNCIA em VIVO em um modelo de exame de urina. Vamos comparar os dados obtidos com as estirpes ST131 que provocam a patologia em seres humanos. O objectivo é que os resultados tenham um impacto na saúde pública e na segurança alimentar através de um maior conhecimento dos mecanismos que tornam este grupo político bem sucedido do ponto de vista da violência e da difusão. O IMPACTO CIENTÍFICO DOS RESULTADOS É COMPLETAMENTE AVALIADO E ACREDITADO PELO ALTO ÍNDICE DE IMPACTO DAS PUBLICAÇÕES QUE PRODUZIRAMOS A PARTIR DE 2008 NO CONSÓRCIO INTERNACIONAL QUE DEMONSTROU A DISTRIBUIÇÃO INTERCONTINENTAL DO GRUPO CLONAL ST131. (Portuguese)
    17 August 2022
    0 references
    KÄESOLEVAS TAOTLUSES ESITATUD UURING ON SEOTUD TOIDUOHUTUSE JA -KVALITEEDIGA. E. COLI ST131 KLOONRÜHM MURRAB ANTIBIOOTIKUMIRESISTENTSUSE GEENIDE JA VIRULENTSUSE GEENIDE KOKKUSOBIMATUSE PARADIGMA E. COLI SOOLEVÄLISTE PATOGEENIDE PUHUL (EKSPEC). ALATES SELLE KINDLAKSTEGEMISEST KONTINENTIDEVAHELISEL TASANDIL 2008. AASTAL ON SEE KLOONRÜHM MÄRKIMISVÄÄRSELT LAIENENUD, MOODUSTADES PRAEGU ÜLE 50 % LAIENDATUD SPEKTRIGA LAKTAMAASIDE (ESBL) BEETAT TOOTVATEST TÜVEDEST JA ÜLE 30 % MULTIRESISTENTSETEST EKSPEC-TÜVEDEST. SELLES PROJEKTIS TAHAME SELGELT MÄÄRATLEDA KLOONIRÜHMA ST131 LEVIMISVIISID JA -ALLIKAD, KUI ON OLEMAS RISK, NING KUI SUUR ON OHT TOOTMISLOOMADE LIHA TARBIMISELE NING MILLISEID KONTROLLIMEETMEID SAAB TOIDUAHELAS RAKENDADA. SAMUTI TAHAME ANALÜÜSIDA ELUSLOODUSE ROLLI ST131 TÜVEDE SÄILITAMISEL JA LEVITAMISEL. TÄPSEMALT UURIME METSLINDE, REBASEID JA JABALIESI, KES TÄNU NENDE DEMOGRAAFILISELE PLAHVATUSELE SÄILITAVAD PRAEGU OLULISE KONTAKTI TOOTMISLOOMADE JA INIMASULATEGA. MEIE ANDMETEL ON SEE ESIMENE KORD, KUI REBASEID JA JABALIES’I UURITAKSE TÜVE ST131 KANDJATENA NING KUIGI KUI METSLINDUDE ST131 TÜVED ON MITMES RIIGIS ISOLEERITUD, EI OLE NENDE VIROTIPOS’T LEITUD EGA VÕRRELDUD INIMESTE NAKKUSTE EEST VASTUTAVATE TÜVEDEGA. TEOSTAME ÜKSIKASJALIKU MOLEKULAARSE ISELOOMUSTUSE (MLST, PFGE, TÄIELIK GENOOMI SEKVENEERIMINE, ET MÄÄRATLEDA VIRULENTSUSE GEENID JA PATOGEENSUSE SAARED) ST131 TÜVEDELE, MIS ON ERALDATUD TOIDUST JA LOOMADEST, NING ME MÄÄRAME NENDE VIRULENTSUSE IN VIVO HIIRE SEPSISE MUDELIS. VÕRDLEME SAADUD ANDMEID ST131 TÜVEDE ANDMETEGA, MIS PÕHJUSTAVAD INIMESTEL PATOLOOGIAT. EESMÄRK ON, ET TULEMUSED MÕJUTAKSID RAHVATERVIST JA TOIDUOHUTUST TÄNU PAREMATELE TEADMISTELE MEHHANISMIDE KOHTA, MIS MUUDAVAD SELLE KLOONIRÜHMA VIRULENTSUSE JA LEVITAMISE SEISUKOHAST EDUKAKS. TULEMUSTE TEADUSLIK MÕJU ON TÄIELIKULT TAGATUD JA AKREDITEERITUD NENDE VÄLJAANNETE SUURE MÕJUINDEKSIGA, MIDA OLEME KOOSTANUD ALATES 2008. AASTAST RAHVUSVAHELISE KONSORTSIUMI FORMASEMOS OSAS, MIS NÄITAS KLOONIRÜHMA ST131 KONTINENTIDEVAHELIST JAOTUMIST. (Estonian)
    17 August 2022
    0 references
    AZ EBBEN A KÉRELEMBEN JAVASOLT KUTATÁSI TANULMÁNY AZ „ÉLELMISZER-BIZTONSÁG ÉS -MINŐSÉG” KIHÍVÁS KÖRÉBE TARTOZIK. AZ E. COLI ST131 KLONÁLIS CSOPORTJA MEGTÖRI AZ ANTIBIOTIKUM-REZISZTENCIA GÉNEK ÉS A VIRULENCIA GÉNJEINEK INKOMPATIBILITÁSÁNAK PARADIGMÁJÁT AZ E. COLI EXTRAINTESTINTESZTINÁLIS KÓROKOZÓK (EXPEC) ESETÉBEN. AZ INTERKONTINENTÁLIS SZINTEN VALÓ AZONOSÍTÁSA ÓTA 2008-BAN EZ A KLÓNCSOPORT LÁTVÁNYOS BŐVÜLÉST MUTATOTT, AMELY JELENLEG A KITERJESZTETT SPEKTRUMÚ LAKTAMÁZOK (ESBL) BÉTATERMELŐ TÖRZSEINEK TÖBB MINT 50%-ÁT ÉS A MULTIDROGREZISZTENS EXPEC TÖRZSEK TÖBB MINT 30%-ÁT TESZI KI. EBBEN A PROJEKTBEN EGYÉRTELMŰEN MEG KÍVÁNJUK HATÁROZNI AZ ST131 KLÓNCSOPORT ÁTVITELÉNEK ÚTVONALAIT ÉS FORRÁSAIT, HA FENNÁLL A KOCKÁZAT, ÉS MILYEN MÉRTÉKŰ KOCKÁZATOT JELENT A TENYÉSZTETT ÁLLATOK HÚSÁNAK FOGYASZTÁSA, ÉS MILYEN ELLENŐRZÉSI INTÉZKEDÉSEKET LEHET ALKALMAZNI AZ ÉLELMISZERLÁNCBAN. AZT IS SZERETNÉNK ELEMEZNI, HOGY A VADON ÉLŐ ÁLLATOK MILYEN SZEREPET JÁTSZANAK AZ ST131 TÖRZSEK FENNTARTÁSÁBAN ÉS TERJESZTÉSÉBEN. KÜLÖNÖSEN A VADON ÉLŐ MADARAKAT, RÓKÁT ÉS JABALIES-T FOGJUK TANULMÁNYOZNI, AMELYEK DEMOGRÁFIAI ROBBANÁSUK MIATT JELENLEG FONTOS KAPCSOLATOT TARTANAK FENN A TERMELŐ ÁLLATOKKAL ÉS AZ EMBERI TELEPEKKEL. ADATAINK SZERINT EZ AZ ELSŐ ALKALOM, HOGY A RÓKÁT ÉS A JABALIES-T AZ ST131 TÖRZSEK HORDOZÓIKÉNT VIZSGÁLJÁK, ÉS BÁR HA AZ ST131 VADON ÉLŐ MADARAK TÖRZSEIT TÖBB ORSZÁGBAN IZOLÁLTÁK, VIROTIPOS-JUKAT NEM ÁLLAPÍTOTTÁK MEG, ÉS NEM HASONLÍTOTTÁK ÖSSZE AZ EMBERI FERTŐZÉSEKÉRT FELELŐS TÖRZSEKKEL. ELVÉGEZZÜK AZ ÉLELMISZEREKBŐL ÉS ÁLLATOKBÓL IZOLÁLT ST131 TÖRZSEK RÉSZLETES MOLEKULÁRIS JELLEMZÉSÉT (MLST, PFGE, TELJES GENOMSZEKVENÁLÁS A VIRULENCIA GÉNJEINEK ÉS PATOGENITÁSI SZIGETEINEK MEGHATÁROZÁSÁRA), ÉS IN VIVO VIRULENCIÁJUKAT A MURIN SZEPSZIS MODELLJÉBEN HATÁROZZUK MEG. ÖSSZEHASONLÍTJUK A KAPOTT ADATOKAT AZ ST131 TÖRZSEK ADATAIVAL, AMELYEK PATOLÓGIÁT OKOZNAK AZ EMBEREKBEN. A CÉL AZ, HOGY AZ EREDMÉNYEK HATÁST GYAKOROLJANAK A KÖZEGÉSZSÉGÜGYRE ÉS AZ ÉLELMISZER-BIZTONSÁGRA, MIVEL JOBBAN ISMERIK AZOKAT A MECHANIZMUSOKAT, AMELYEK A VIRULENCIA ÉS A TERJESZTÉS SZEMPONTJÁBÓL SIKERESSÉ TESZIK EZT A KLÓNCSOPORTOT. AZ EREDMÉNYEK TUDOMÁNYOS HATÁSÁT TELJES MÉRTÉKBEN BIZTOSÍTJA ÉS AKKREDITÁLJA AZ ÁLTALUNK 2008 ÓTA KÉSZÍTETT KIADVÁNYOK MAGAS HATÁSMUTATÓJA, AMELY AZ ST131 KLONÁLIS CSOPORT INTERKONTINENTÁLIS ELOSZLÁSÁT BIZONYÍTOTTA A FORMASEMOS NEMZETKÖZI KONZORCIUMBAN. (Hungarian)
    17 August 2022
    0 references
    ПРЕДЛОЖЕНОТО В НАСТОЯЩОТО ПРИЛОЖЕНИЕ ИЗСЛЕДВАНЕ ПОПАДА В РАМКИТЕ НА ПРЕДИЗВИКАТЕЛСТВОТО „БЕЗОПАСНОСТ И КАЧЕСТВО НА ХРАНИТЕ“. КЛОНАЛНАТА ГРУПА НА E. COLI ST131 НАРУШАВА ПАРАДИГМАТА НА НЕСЪВМЕСТИМОСТТА НА ГЕНИТЕ ЗА АНТИБИОТИЧНА РЕЗИСТЕНТНОСТ И ТЕЗИ НА ВИРУЛЕНТНОСТ ПРИ ТЕЗИ НА ИЗВЪНЧРЕВНИТЕ ПАТОГЕНИ НА E. COLI (EXPEC). СЛЕД ИДЕНТИФИЦИРАНЕТО СИ НА МЕЖДУКОНТИНЕНТАЛНО НИВО, ПРЕЗ 2008 Г. ТАЗИ КЛОНАЛНА ГРУПА ИМА ЗАБЕЛЕЖИТЕЛНО РАЗШИРЯВАНЕ, КАТО ПОНАСТОЯЩЕМ ПРЕДСТАВЛЯВА ПОВЕЧЕ ОТ 50 % ОТ БЕТА-ПРОИЗВЕЖДАЩИТЕ ЩАМОВЕ НА РАЗШИРЕНИЯ СПЕКТЪР ЛАКТАМАЗИ (ESBL) И ПОВЕЧЕ ОТ 30 % ОТ МУЛТИРЕЗИСТЕНТНИ ЕКСПЕК ЩАМОВЕ. В ТОЗИ ПРОЕКТ ИСКАМЕ ЯСНО ДА ОПРЕДЕЛИМ МАРШРУТИТЕ И ИЗТОЧНИЦИТЕ НА ПРЕДАВАНЕ НА КЛОНАЛНАТА ГРУПА ST131, АКО ИМА РИСК И КАКВА СТЕПЕН НА РИСК ПРИ КОНСУМАЦИЯТА НА МЕСО ОТ ЖИВОТНИ, ОТГЛЕЖДАНИ ЗА ПРОИЗВОДСТВО, И КАКВИ МЕРКИ ЗА КОНТРОЛ МОГАТ ДА СЕ ПРИЛАГАТ В ХРАНИТЕЛНАТА ВЕРИГА. ИСКАМЕ СЪЩО ТАКА ДА АНАЛИЗИРАМЕ РОЛЯТА НА ДИВАТА ФЛОРА И ФАУНА В ПОДДЪРЖАНЕТО И РАЗПРОСТРАНЕНИЕТО НА ЩАМОВЕ ST131. ПО-КОНКРЕТНО ЩЕ ИЗСЛЕДВАМЕ ДИВИ ПТИЦИ, ЛИСИЦИ И JABALIES, КОИТО ПОРАДИ ДЕМОГРАФСКАТА СИ ЕКСПЛОЗИЯ В МОМЕНТА ПОДДЪРЖАТ ВАЖЕН КОНТАКТ С ЖИВОТНИ ОТ ПРОИЗВОДСТВО И ЧОВЕШКИ СЕЛИЩА. СПОРЕД НАШИТЕ ДАННИ ТОВА Е ПЪРВИЯТ ПЪТ, КОГАТО ЛИСИЦИТЕ И JABALIES СЕ ИЗСЛЕДВАТ КАТО НОСИТЕЛИ НА ЩАМОВЕ ST131, И ВЪПРЕКИ ЧЕ, АКО ST131 ЩАМОВЕ НА ДИВИ ПТИЦИ СА ИЗОЛИРАНИ В НЯКОЛКО ДЪРЖАВИ, ТЕХНИТЕ VIROTIPOS НЕ СА УСТАНОВЕНИ, НИТО СА СРАВНЕНИ С ЩАМОВЕТЕ, ОТГОВОРНИ ЗА ИНФЕКЦИИТЕ ПРИ ХОРАТА. ЩЕ ИЗВЪРШИМ ПОДРОБНА МОЛЕКУЛЯРНА ХАРАКТЕРИСТИКА (MLST, PFGE, ПЪЛНА СЕКВЕНЦИЯ НА ГЕНОМА ЗА ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ВИРУЛЕНТНИТЕ ГЕНИ И ОСТРОВИТЕ НА ПАТОГЕННОСТ) НА ЩАМОВЕ ST131, ИЗОЛИРАНИ ОТ ХРАНА И ЖИВОТНИ, И ЩЕ ОПРЕДЕЛИМ ТЯХНАТА ВИРУЛЕНТНОСТ IN VIVO В МОДЕЛ НА МИШИ СЕПСИС. ЩЕ СРАВНИМ ПОЛУЧЕНИТЕ ДАННИ С ТЕЗИ НА ЩАМОВЕТЕ ST131, ПРИЧИНЯВАЩИ ПАТОЛОГИЯ ПРИ ХОРАТА. ЦЕЛТА Е РЕЗУЛТАТИТЕ ДА ОКАЖАТ ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ ОБЩЕСТВЕНОТО ЗДРАВЕ И БЕЗОПАСНОСТТА НА ХРАНИТЕ ЧРЕЗ ПО-ДОБРО ПОЗНАВАНЕ НА МЕХАНИЗМИТЕ, КОИТО ПРАВЯТ ТАЗИ КЛОНОВА ГРУПА УСПЕШНА ОТ ГЛЕДНА ТОЧКА НА ВИРУЛЕНТНОСТТА И РАЗПРОСТРАНЕНИЕТО. НАУЧНОТО ВЪЗДЕЙСТВИЕ НА РЕЗУЛТАТИТЕ Е НАПЪЛНО ГАРАНТИРАНО И АКРЕДИТИРАНО ОТ ИНДЕКСА ЗА ВИСОКО ВЪЗДЕЙСТВИЕ НА ПУБЛИКАЦИИТЕ, КОИТО ПРОИЗВЕЖДАМЕ ОТ 2008 Г. НАСАМ FORMASEMOS ЧАСТ ОТ МЕЖДУНАРОДНИЯ КОНСОРЦИУМ, КОЙТО ДЕМОНСТРИРА МЕЖДУКОНТИНЕНТАЛНОТО РАЗПРОСТРАНЕНИЕ НА КЛОНАЛНАТА ГРУПА ST131. (Bulgarian)
    17 August 2022
    0 references
    ŠIOJE PARAIŠKOJE SIŪLOMAS MOKSLINIS TYRIMAS PATENKA Į „MAISTO SAUGOS IR KOKYBĖS“ IŠŠŪKĮ. E. COLI ST131 KLONŲ GRUPĖ SULAUŽO ATSPARUMO ANTIBIOTIKAMS GENŲ IR VIRULENTIŠKUMO GENŲ E. COLI EKSTRAINTINKSTŲ (EXPEC) NESUDERINAMUMO PARADIGMĄ. NUO JOS NUSTATYMO TARPŽEMYNINIU LYGMENIU 2008 M. ŠIOS KLONŲ GRUPĖS PLĖTRA BUVO ĮSPŪDINGA, ŠIUO METU JI SUDARO DAUGIAU KAIP 50 % BETA GAMINAMŲ IŠPLĖSTINIO SPEKTRO LAKTAMŲ (ESBL) PADERMIŲ IR DAUGIAU KAIP 30 % DAUGELIUI VAISTŲ ATSPARIŲ EKSPEC PADERMIŲ. ŠIAME PROJEKTE NORIME AIŠKIAI APIBRĖŽTI KLONŲ GRUPĖS ST131 PERDAVIMO MARŠRUTUS IR ŠALTINIUS, JEI YRA PAVOJUS, KOKS YRA PAVOJUS, KOKS YRA PAVOJUS, KOKS YRA MĖSINIŲ GYVŪNŲ MĖSOS VARTOJIMAS, IR KOKIOS KONTROLĖS PRIEMONĖS GALI BŪTI TAIKOMOS MAISTO GRANDINĖJE. TAIP PAT NORIME IŠANALIZUOTI LAUKINĖS GAMTOS VAIDMENĮ PALAIKANT IR PLATINANT ST131 PADERMES. KONKREČIAI MES TIRSIME LAUKINIUS PAUKŠČIUS, LAPES IR JABALIES, KURIE DĖL JŲ DEMOGRAFINIO SPROGIMO ŠIUO METU PALAIKO SVARBŲ RYŠĮ SU GAMYBOS GYVŪNAIS IR ŽMONIŲ GYVENVIETĖMIS. REMIANTIS MŪSŲ DUOMENIMIS, TAI YRA PIRMAS KARTAS, KAI LAPĖS IR JABALIES YRA TIRIAMOS KAIP ST131 PADERMIŲ NEŠĖJAI, IR NORS, JEI KELIOSE ŠALYSE BUVO IZOLIUOTA ST131 LAUKINIŲ PAUKŠČIŲ PADERMĖ, JŲ VIROTIPOS NEBUVO NUSTATYTA IR NELYGINAMA SU ŽMONIŲ INFEKCIJOMIS. MES ATLIKSIME IŠSAMŲ IŠ MAISTO IR GYVŪNŲ IŠSKIRTŲ ST131 PADERMIŲ MOLEKULINĮ APIBŪDINIMĄ (MLST, PFGE, VISIŠKĄ GENOMO SEKOS NUSTATYMĄ, SIEKIANT APIBRĖŽTI VIRULENTIŠKUMO GENUS IR PATOGENIŠKUMO SALAS), IR MES NUSTATYSIME JŲ VIRULENTIŠKUMĄ IN VIVO PELIŲ SEPSIO MODELYJE. MES PALYGINSIME GAUTUS DUOMENIS SU ST131 PADERMIŲ DUOMENIMIS, SUKELIANČIAIS PATOLOGIJĄ ŽMONĖMS. SIEKIAMA, KAD REZULTATAI DARYTŲ POVEIKĮ VISUOMENĖS SVEIKATAI IR MAISTO SAUGAI, NES BŪTŲ GERIAU IŠMANOMI MECHANIZMAI, DĖL KURIŲ ŠI KLONŲ GRUPĖ VIRULENTIŠKUMO IR SKLAIDOS POŽIŪRIU BŪTŲ SĖKMINGA. MOKSLINIS REZULTATŲ POVEIKIS YRA VISIŠKAI UŽTIKRINTAS IR AKREDITUOTAS PUBLIKACIJŲ, KURIAS PARENGĖME NUO 2008 M. FORMASEMOS, KURI PARODĖ TARPŽEMYNINĮ KLONŲ GRUPĖS ST131 PASISKIRSTYMĄ TARPŽEMYNINIU, POVEIKIO INDEKSU. (Lithuanian)
    17 August 2022
    0 references
    ISTRAŽIVAČKA STUDIJA PREDLOŽENA U OVOJ APLIKACIJI SPADA U IZAZOV „SIGURNOST I KVALITETA HRANE”. KLONSKA SKUPINA E. COLI ST131 RAZBIJA PARADIGMU NEKOMPATIBILNOSTI GENA OTPORNOSTI NA ANTIBIOTIKE I VIRULENCIJE KOD E. COLI EKSTRAINSTINALNIH PATOGENA (STRUČNI). OD SVOG IDENTIFICIRANJA NA INTERKONTINENTALNOJ RAZINI, 2008. GODINE, OVA KLONSKA GRUPA IMALA JE SPEKTAKULARNO ŠIRENJE, TRENUTAČNO ČINI VIŠE OD 50 % BETA-PROIZVODNIH SOJEVA LAKTAMAZA PROŠIRENOG SPEKTRA (ESBL) I VIŠE OD 30 % EXPEC SOJEVA OTPORNIH NA VIŠE LIJEKOVA. U OVOM PROJEKTU ŽELIMO JASNO DEFINIRATI PUTOVE I IZVORE PRIJENOSA KLONSKE SKUPINE ST131, AKO POSTOJI RIZIK, TE KOLIKI JE STUPANJ RIZIKA U KONZUMACIJI MESA OD PROIZVODNIH ŽIVOTINJA I KOJE SE KONTROLNE MJERE MOGU PRIMIJENITI U PREHRAMBENOM LANCU. TAKOĐER ŽELIMO ANALIZIRATI ULOGU DIVLJIH ŽIVOTINJA U ODRŽAVANJU I ŠIRENJU SOJEVA ST131. POSEBNO ĆEMO PROUČAVATI DIVLJE PTICE, LISICE I JABALIES, KOJI ZBOG SVOJE DEMOGRAFSKE EKSPLOZIJE TRENUTNO ODRŽAVAJU VAŽAN KONTAKT SA ŽIVOTINJAMA PROIZVODNJE I LJUDSKIM NASELJIMA. PREMA NAŠIM PODACIMA OVO JE PRVI PUT DA SE LISICE I JABALIES ISTRAŽUJU KAO NOSITELJI SOJEVA ST131 I IAKO SU SOJEVI ST131 DIVLJIH PTICA IZOLIRANI U NEKOLIKO ZEMALJA, NJIHOVI VIROTIPOS NISU UTVRĐENI NITI USPOREĐENI SA SOJEVIMA ODGOVORNIMA ZA INFEKCIJE U LJUDI. OBAVIT ĆEMO DETALJNU MOLEKULARNU KARAKTERIZACIJU (MLST, PFGE, KOMPLETAN GENOM SEKVENCIRANJE ZA DEFINIRANJE VIRULENCIJE GENA I OTOKA PATOGENOSTI) ST131 SOJEVA IZOLIRANIH IZ HRANE I ŽIVOTINJA, A MI ĆEMO ODREDITI NJIHOVU VIRULENCE IN VIVO U MODELU SEPSE MURINA. USPOREDIT ĆEMO DOBIVENE PODATKE S ONIMA ST131 SOJEVA KOJI UZROKUJU PATOLOGIJU KOD LJUDI. CILJ JE DA REZULTATI UTJEČU NA JAVNO ZDRAVLJE I SIGURNOST HRANE ZAHVALJUJUĆI BOLJEM POZNAVANJU MEHANIZAMA KOJI OVU KLONSKU SKUPINU ČINE USPJEŠNIM SA STAJALIŠTA VIRULENCIJE I ŠIRENJA. ZNANSTVENI UTJECAJ REZULTATA U POTPUNOSTI JE OSIGURAN I AKREDITIRAN VISOKIM INDEKSOM UTJECAJA PUBLIKACIJA KOJE SMO PROIZVELI OD 2008. FORMASEMOS DIO MEĐUNARODNOG KONZORCIJA KOJI JE POKAZAO INTERKONTINENTALNU DISTRIBUCIJU KLONSKE GRUPE ST131. (Croatian)
    17 August 2022
    0 references
    DEN FORSKNINGSSTUDIE SOM FÖRESLÅS I DENNA ANSÖKAN FALLER INOM UTMANINGEN ”LIVSMEDELSSÄKERHET OCH KVALITET”. KLONGRUPPEN E. COLI ST131 BRYTER PARADIGMET FÖR INKOMPATIBILITET MELLAN ANTIBIOTIKARESISTENSGENER OCH VIRULENSGENER HOS E. COLI EXTRAINTESTINAL PATOGENER (EXPEC). SEDAN DEN IDENTIFIERADES PÅ INTERKONTINENTAL NIVÅ 2008 HAR DENNA KLONGRUPP HAFT EN SPEKTAKULÄR EXPANSION, SOM FÖR NÄRVARANDE STÅR FÖR MER ÄN 50 % AV DE BETAPRODUCERANDE STAMMARNA AV LAKTAMASER (ESBL) OCH MER ÄN 30 % AV DE MULTIRESISTENTA EXPEC-STAMMARNA. I DETTA PROJEKT VILL VI TYDLIGT DEFINIERA ÖVERFÖRINGSVÄGARNA OCH ÖVERFÖRINGSKÄLLORNA FÖR KLONINGSGRUPPEN ST131, OM DET FINNS EN RISK, OCH VILKEN GRAD AV RISK I KONSUMTIONEN AV KÖTT FRÅN PRODUKTIONSDJUR OCH VILKA KONTROLLÅTGÄRDER SOM KAN TILLÄMPAS I LIVSMEDELSKEDJAN. VI VILL OCKSÅ ANALYSERA VILDA DJURS ROLL I UNDERHÅLL OCH SPRIDNING AV ST131-STAMMAR. SPECIFIKT KOMMER VI ATT STUDERA VILDA FÅGLAR, RÄVAR OCH JABALIES, SOM PÅ GRUND AV DERAS DEMOGRAFISKA EXPLOSION FÖR NÄRVARANDE UPPRÄTTHÅLLER VIKTIG KONTAKT MED PRODUKTIONSDJUR OCH MÄNNISKORS BOSÄTTNINGAR. ENLIGT VÅRA DATA ÄR DETTA FÖRSTA GÅNGEN RÄVAR OCH JABALIES UNDERSÖKS SOM BÄRARE AV STAMMAR ST131, OCH ÄVEN OM ST131 STAMMAR AV VILDA FÅGLAR HAR ISOLERATS I FLERA LÄNDER, HAR DERAS VIROTIPOS INTE FASTSTÄLLTS ELLER JÄMFÖRTS MED DE STAMMAR SOM ORSAKAR INFEKTIONER HOS MÄNNISKOR. VI KOMMER ATT UTFÖRA EN DETALJERAD MOLEKYLÄR KARAKTERISERING (MLST, PFGE, KOMPLETT GENOMSEKVENSERING FÖR ATT DEFINIERA VIRULENSGENER OCH ÖAR AV PATOGENICITET) AV ST131 STAMMAR ISOLERADE FRÅN LIVSMEDEL OCH DJUR, OCH VI KOMMER ATT BESTÄMMA DERAS VIRULENS IN VIVO I EN MODELL AV MURIN SEPSIS. VI KOMMER ATT JÄMFÖRA DE DATA SOM ERHÅLLITS MED DE ST131-STAMMAR SOM ORSAKAR PATOLOGI HOS MÄNNISKOR. MÅLET ÄR ATT RESULTATEN SKA PÅVERKA FOLKHÄLSAN OCH LIVSMEDELSSÄKERHETEN GENOM ÖKAD KUNSKAP OM DE MEKANISMER SOM GÖR DENNA KLONGRUPP FRAMGÅNGSRIK UR VIRULENS- OCH SPRIDNINGSSYNPUNKT. DEN VETENSKAPLIGA EFFEKTEN AV RESULTATEN ÄR HELT SÄKERSTÄLLD OCH ACKREDITERAD AV DET HÖGA EFFEKTINDEXET FÖR DE PUBLIKATIONER SOM VI HAR PRODUCERAT SEDAN 2008 FORMASEMOS DEL AV DET INTERNATIONELLA KONSORTIET SOM DEMONSTRERADE DEN INTERKONTINENTALA FÖRDELNINGEN AV KLONINGSGRUPPEN ST131. (Swedish)
    17 August 2022
    0 references
    STUDIUL DE CERCETARE PROPUS ÎN PREZENTA CERERE SE ÎNCADREAZĂ ÎN PROVOCAREA „SIGURANȚA ȘI CALITATEA ALIMENTELOR”. GRUPUL CLONAL DE E. COLI ST131 RUPE PARADIGMA INCOMPATIBILITĂȚII GENELOR DE REZISTENȚĂ LA ANTIBIOTICE ȘI A CELOR ALE VIRULENȚEI ÎN CEI AI AGENȚILOR PATOGENI EXTRAINTESTINALI E. COLI (EXPEC). DE LA IDENTIFICAREA SA LA NIVEL INTERCONTINENTAL, ÎN 2008, ACEST GRUP CLONAL A AVUT O EXPANSIUNE SPECTACULOASĂ, REPREZENTÂND ÎN PREZENT PESTE 50 % DIN TULPINILE PRODUCĂTOARE DE BETA ALE LACTAMAZELOR CU SPECTRU EXTINS (ESBL) ȘI PESTE 30 % DIN TULPINILE EXPEC REZISTENTE LA MEDICAMENTE. ÎN ACEST PROIECT DORIM SĂ DEFINIM ÎN MOD CLAR CĂILE ȘI SURSELE DE TRANSMITERE A GRUPULUI CLONAL ST131, DACĂ EXISTĂ UN RISC, ȘI CE GRAD DE RISC ÎN CONSUMUL DE CARNE DE LA ANIMALELE DE PRODUCȚIE ȘI CE MĂSURI DE CONTROL POT FI APLICATE ÎN LANȚUL ALIMENTAR. DE ASEMENEA, DORIM SĂ ANALIZĂM ROLUL FAUNEI SĂLBATICE ÎN MENȚINEREA ȘI DISEMINAREA TULPINILOR ST131. ÎN MOD SPECIFIC, VOM STUDIA PĂSĂRILE SĂLBATICE, VULPILE ȘI JABALIES, CARE, DATORITĂ EXPLOZIEI LOR DEMOGRAFICE, MENȚIN ÎN PREZENT UN CONTACT IMPORTANT CU ANIMALELE DE PRODUCȚIE ȘI CU AȘEZĂRILE UMANE. CONFORM DATELOR NOASTRE, ACEASTA ESTE PRIMA DATĂ CÂND VULPILE ȘI JABALIES SUNT INVESTIGATE CA PURTĂTORI AI TULPINILOR ST131 ȘI DEȘI DACĂ TULPINILE ST131 DE PĂSĂRI SĂLBATICE AU FOST IZOLATE ÎN MAI MULTE ȚĂRI, VIROTIPOS LOR NU AU FOST STABILITE ȘI NICI COMPARATE CU TULPINILE RESPONSABILE DE INFECȚIILE LA OM. VOM EFECTUA O CARACTERIZARE MOLECULARĂ DETALIATĂ (MLST, PFGE, SECVENȚIERE COMPLETĂ A GENOMULUI PENTRU A DEFINI GENELE DE VIRULENȚĂ ȘI INSULELE PATOGENE) A TULPINILOR ST131 IZOLATE DIN ALIMENTE ȘI ANIMALE ȘI VOM DETERMINA VIRULENȚA LOR IN VIVO ÎNTR-UN MODEL DE SEPSIS MURIN. VOM COMPARA DATELE OBȚINUTE CU CELE ALE TULPINILOR ST131 CARE CAUZEAZĂ PATOLOGIE LA OM. OBIECTIVUL ESTE CA REZULTATELE SĂ AIBĂ UN IMPACT ASUPRA SĂNĂTĂȚII PUBLICE ȘI SIGURANȚEI ALIMENTARE PRINTR-O MAI BUNĂ CUNOAȘTERE A MECANISMELOR CARE FAC CA ACEST GRUP CLONAL SĂ AIBĂ SUCCES DIN PUNCTUL DE VEDERE AL VIRULENȚEI ȘI AL DISEMINĂRII. IMPACTUL ȘTIINȚIFIC AL REZULTATELOR ESTE PE DEPLIN ASIGURAT ȘI ACREDITAT DE INDICELE DE IMPACT RIDICAT AL PUBLICAȚIILOR PE CARE LE-AM PRODUS ÎNCEPÂND CU 2008 FORMASEMOS PARTE A CONSORȚIULUI INTERNAȚIONAL CARE A DEMONSTRAT DISTRIBUȚIA INTERCONTINENTALĂ A GRUPULUI CLONAL ST131. (Romanian)
    17 August 2022
    0 references
    RAZISKOVALNA ŠTUDIJA, PREDLAGANA V TEJ VLOGI, SPADA MED IZZIV „VARNOSTI IN KAKOVOSTI HRANE“. KLONSKA SKUPINA E. COLI ST131 ZLOMI PARADIGMO NEZDRUŽLJIVOSTI GENOV ZA ODPORNOST PROTI ANTIBIOTIKOM IN VIRULENCE V EKSTRAINTESTINALNIH PATOGENIH E. COLI (EXPEC). OD SVOJE IDENTIFIKACIJE NA MEDCELINSKI RAVNI JE TA KLONSKA SKUPINA LETA 2008 DOŽIVELA SPEKTAKULARNO ŠIRITEV, KI TRENUTNO PREDSTAVLJA VEČ KOT 50 % BETA SEVOV LAKTAMAZE RAZŠIRJENEGA SPEKTRA (ESBL) IN VEČ KOT 30 % EKSPEC SEVOV, ODPORNIH NA VEČ ZDRAVIL. V TEM PROJEKTU ŽELIMO JASNO OPREDELITI POTI IN VIRE PRENOSA KLONSKE SKUPINE ST131, ČE OBSTAJA TVEGANJE, IN KAKŠNO STOPNJO TVEGANJA PRI UŽIVANJU MESA REJNIH ŽIVALI TER KATERE NADZORNE UKREPE JE MOGOČE UPORABITI V PREHRANSKI VERIGI. PRAV TAKO ŽELIMO ANALIZIRATI VLOGO PROSTOŽIVEČIH ŽIVALI PRI VZDRŽEVANJU IN ŠIRJENJU SEVOV ST131. POSEBEJ BOMO PREUČEVALI DIVJE PTICE, LISICE IN JABALIES, KI ZARADI DEMOGRAFSKE EKSPLOZIJE OHRANJAJO POMEMBEN STIK Z ŽIVALMI PROIZVODNJE IN ČLOVEŠKIMI NASELJI. PO NAŠIH PODATKIH JE TO PRVIČ RAZISKANO LISICE IN JABALIES KOT PRENAŠALKE SEVOV ST131, IN ČEPRAV SO BILI SEVI ST131 DIVJIH PTIC IZOLIRANI V VEČ DRŽAVAH, NJIHOVI VIROTIPOS NISO BILI UGOTOVLJENI ALI PRIMERJANI S SEVI, ODGOVORNIMI ZA OKUŽBE PRI LJUDEH. IZVEDLI BOMO PODROBNO MOLEKULARNO KARAKTERIZACIJO (MLST, PFGE, POPOLNO SEKVENCIRANJE GENOV GENOV ZA DOLOČANJE VIRULENCE IN OTOKOV PATOGENOSTI) SEVOV ST131, IZOLIRANIH IZ HRANE IN ŽIVALI, TER DOLOČILI NJIHOVO VIRULENCO IN VIVO V MODELU MIŠJE SEPSE. PRIDOBLJENE PODATKE BOMO PRIMERJALI S PODATKI SEVOV ST131, KI POVZROČAJO PATOLOGIJO PRI LJUDEH. CILJ JE, DA REZULTATI VPLIVAJO NA JAVNO ZDRAVJE IN VARNOST HRANE Z BOLJŠIM POZNAVANJEM MEHANIZMOV, ZARADI KATERIH JE TA KLONALNA SKUPINA USPEŠNA Z VIDIKA VIRULENCE IN RAZŠIRJANJA. ZNANSTVENI VPLIV REZULTATOV JE V CELOTI ZAGOTOVLJEN IN AKREDITIRAN Z VISOKIM INDEKSOM VPLIVA PUBLIKACIJ, KI SMO JIH PRIPRAVILI OD LETA 2008 V OKVIRU MEDNARODNEGA KONZORCIJA FORMASEMOS, KI JE POKAZAL MEDCELINSKO DISTRIBUCIJO KLONALNE SKUPINE ST131. (Slovenian)
    17 August 2022
    0 references
    ANALIZA BADAWCZA ZAPROPONOWANA W NINIEJSZYM WNIOSKU WCHODZI W ZAKRES WYZWANIA „BEZPIECZEŃSTWO I JAKOŚĆ ŻYWNOŚCI”. GRUPA KLONALNA E. COLI ST131 ŁAMIE PARADYGMAT NIEZGODNOŚCI GENÓW OPORNOŚCI NA ANTYBIOTYKI I ZJADLIWOŚCI U PATOGENÓW POZAJELITOWYCH E. COLI (EXPEC). OD CZASU JEJ ZIDENTYFIKOWANIA NA POZIOMIE MIĘDZYKONTYNENTALNYM W 2008 R. TA GRUPA KLONALNA ULEGŁA SPEKTAKULARNEMU ROZBUDOWIE, ODPOWIADAJĄC OBECNIE ZA PONAD 50 % SZCZEPÓW BAKTERII WYTWARZAJĄCYCH BETA LAKTAM O ROZSZERZONYM SPEKTRUM (ESBL) I PONAD 30 % ODPORNYCH NA WIELE LEKÓW SZCZEPÓW EXPEC. W TYM PROJEKCIE CHCEMY JASNO OKREŚLIĆ DROGI I ŹRÓDŁA PRZENOSZENIA GRUPY KLONALNEJ ST131, JEŚLI ISTNIEJE RYZYKO I JAKI STOPIEŃ RYZYKA W SPOŻYCIU MIĘSA POCHODZĄCEGO OD ZWIERZĄT PRODUKCYJNYCH ORAZ JAKIE ŚRODKI KONTROLI MOŻNA ZASTOSOWAĆ W ŁAŃCUCHU ŻYWNOŚCIOWYM. CHCEMY RÓWNIEŻ PRZEANALIZOWAĆ ROLĘ DZIKIEJ FAUNY I FLORY W UTRZYMANIU I ROZPOWSZECHNIANIU SZCZEPÓW ST131. W SZCZEGÓLNOŚCI BĘDZIEMY BADAĆ DZIKIE PTAKI, LISY I JABALIES, KTÓRE ZE WZGLĘDU NA ICH EKSPLOZJĘ DEMOGRAFICZNĄ UTRZYMUJĄ OBECNIE WAŻNY KONTAKT ZE ZWIERZĘTAMI PRODUKCYJNYMI I OSADAMI LUDZKIMI. ZGODNIE Z NASZYMI DANYMI PO RAZ PIERWSZY LISY I JABALIES SĄ BADANE JAKO NOSICIELE SZCZEPÓW ST131, I CHOCIAŻ W KILKU KRAJACH SZCZEPY DZIKIEGO PTACTWA ST131 ZOSTAŁY ODIZOLOWANE, ICH VIROTIPOS NIE ZOSTAŁ USTANOWIONY ANI PORÓWNANY Z SZCZEPAMI ODPOWIEDZIALNYMI ZA ZAKAŻENIA U LUDZI. WYKONAMY SZCZEGÓŁOWĄ CHARAKTERYSTYKĘ MOLEKULARNĄ (MLST, PFGE, KOMPLETNE SEKWENCJONOWANIE GENÓW W CELU ZDEFINIOWANIA GENÓW ZJADLIWOŚCI I WYSP CHOROBOTWÓRCZYCH) SZCZEPÓW ST131 WYIZOLOWANYCH Z POŻYWIENIA I ZWIERZĄT, A TAKŻE OKREŚLIMY ICH ZJADLIWOŚĆ IN VIVO W MODELU POSOCZNICY KOSTNEJ. PORÓWNAMY UZYSKANE DANE ZE SZCZEPAMI ST131, KTÓRE POWODUJĄ PATOLOGIĘ U LUDZI. CELEM JEST, ABY WYNIKI MIAŁY WPŁYW NA ZDROWIE PUBLICZNE I BEZPIECZEŃSTWO ŻYWNOŚCI POPRZEZ WIĘKSZĄ WIEDZĘ NA TEMAT MECHANIZMÓW, KTÓRE SPRAWIAJĄ, ŻE TA GRUPA KLONÓW ODNOSI SUKCESY Z PUNKTU WIDZENIA ZJADLIWOŚCI I ROZPOWSZECHNIANIA. NAUKOWE ODDZIAŁYWANIE WYNIKÓW JEST W PEŁNI ZAPEWNIONE I AKREDYTOWANE PRZEZ WYSOKI WSKAŹNIK ODDZIAŁYWANIA PUBLIKACJI, KTÓRE PRODUKUJEMY OD 2008 ROKU FORMASEMOS CZĘŚĆ MIĘDZYNARODOWEGO KONSORCJUM, KTÓRA WYKAZAŁA MIĘDZYKONTYNENTALNE ROZMIESZCZENIE GRUPY KLONALNEJ ST131. (Polish)
    17 August 2022
    0 references
    Lugo
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    AGL2013-47852-R
    0 references