STRUCTURAL BASES OF THE ACTION OF EIF3 AND OTHER FACTORS OF INITIATION OF EUKARYOTE TRANSLATION (Q3134784)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3134784 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | STRUCTURAL BASES OF THE ACTION OF EIF3 AND OTHER FACTORS OF INITIATION OF EUKARYOTE TRANSLATION |
Project Q3134784 in Spain |
Statements
96,125.48 Euro
0 references
176,539.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
30 September 2021
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
46010
0 references
EL PROCESO DE TRADUCCION SE PUEDE DIVIDIR EN TRES ETAPAS: INICIACION, ELONGACION Y TERMINACION. A SU VEZ, EN EUCARIOTAS, LA INICIACION EN SU FORMA CANONICA SE PUEDE SUBDIVIDIR EN OCHO ETAPAS QUE IMPLICAN VARIOS COMPLEJOS ENTRE LAS SUBUNIDADES RIBOSOMALES Y LOS DIFERENTES FACTORES DE INICIACION (¿EUKARYOTIC INITIATION FACTORS; EIFS). HAY AL MENOS UNA DOCENA DE EIFS, DE LOS CUALES LOS MAS COMPLEJOS SON EIF3, EIF2 Y EIF4F. MIENTRAS QUE EIF2 Y EIF4F SON PROTEINAS HETEROTRIMERICAS, EIF3 SE COMPONE DE 6 SUBUNIDADES DIFERENTES EN SACCHAROMYCES CEREVISIAE, Y DE 13 SUBUNIDADES EN MAMIFEROS. _x000D_ LA ETAPA DE INICIACION DE LA TRADUCCION ES UN PROCESO ALTAMENTE CONTROLADO CUYA DESREGULACION SE ASOCIA A ENFERMEDADES COMO EL CANCER. POR EJEMPLO, EL ENSAMBLAJE Y LA ACTIVIDAD DE EIF4F, ASI COMO DE EIF2 Y EIF3 ESTAN FUERTEMENTE REGULADAS POR VIAS DE SEÑALIZACION INVOLUCRADAS EN PROCESOS CANCEROSOS, LO QUE ESTA DE ACUERDO CON LA DIVERSIDAD DE FUNCIONES DE ESTOS EIFS Y CON EL HECHO DE SON IMPORTANTES DIANAS PARA EL CONTROL TRADUCCIONAL. _x000D_ DURANTE MI PERIODO POSTDOCTORAL EN EL LABORATORIO DE VENKI RAMAKRISHNAN EN EL MRC-LMB (CAMBRIDGE) HEMOS CONTRIBUIDO, JUNTO AL TRABAJO DE OTROS DOS GRUPOS, A UNA MEJOR COMPRENSION ESTRUCTURAL DE LA INICIACION DE LA TRADUCCION. LA CARACTERIZACION DE CADA UNA DE LAS DIFERENTES ETAPAS DEPENDIA DE ATRAPAR ESTADOS FUNCIONALES PARTICULARES DE UN PROCESO MUY DINAMICO. ESTOS COMPLEJOS MACROMOLECULARES SON GRANDES Y HETEROGENEOS, Y PARA PODER OBTENER INFORMACION ESTRUCTURAL DE ELLOS APRENDI Y USE CRIO-MICROSCOPIA ELECTRONICA (CRIO-ME). SIN EMBARGO, Y A PESAR DE DETERMINAR VARIAS ESTRUCTURAS EN DIFERENTES ESTADOS FUNCIONALES Y DE DISPONER DE ESTRUCTURAS 3-D DE ALGUNOS EIFS, TODAVIA NO SE COMPRENDEN BIEN LAS FUNCIONES DE ESTOS ULTIMOS, SOBRE TODO DEBIDO A LA FALTA DE INFORMACION ESTRUCTURAL DETALLADA DE PARTES IMPORTANTES DE DICHOS FACTORES Y DE LOS COMPLEJOS EN QUE PARTICIPAN. EN PARTICULAR, SERIA MUY IMPORTANTE DETERMINAR LA ESTRUCTURA COMPLETA DE EIF3, EL MAS COMPLEJO DE LOS FACTORES DE INICIACION Y UN DIANA IMPORTANTE PARA LA REGULACION, Y LAS ESTRUCTURAS DE LOS COMPLEJOS DE ESTE FACTOR CON OTRAS PROTEINAS ALTAMENTE REGULADAS COMO EIF4F, EIF4B, EIF2, EIF5 Y EIF1._x000D_ CON ESTE PROPOSITO, TENGO LA INTENCION DE COMBINAR CRISTALOGRAFIA DE RAYOS X Y CRIO-ME PARA DILUCIDAR ESTAS ESTRUCTURAS, LO QUE ARROJARIA LUZ SOBRE ALGUNOS DE LOS ASPECTOS PARTICULARES DE LA INICIACION DE LA TRADUCCION EN EUCARIOTAS. GUIADOS POR LOS MAPAS DE CRYO-ME A BAJA RESOLUCION DISEÑAREMOS VARIAS CONSTRUCCIONES DE VARIOS DOMINIOS DE EIF3 Y LOS SOBRE-EXPRESAREMOS O CO-EXPRESAREMOS CONJUNTAMENTE CON OTROS EIFS O PARTES DE ELLOS EN SISTEMAS HETEROLOGOS Y LLEVAREMOS A CABO ESTUDIOS DE CRISTALIZACION DE RAYOS X. ACTUAREMOS DE FORMA SIMILAR PARA ELUCIDAR LA ESTRUCTURA DEL COMPLEJO EIF4F. DADO EL GRAN TAMAÑO DEL COMPLEJO MULTIFACTORIAL (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) USAREMOS ME, PRIMERO USANDO TINCION NEGATIVA Y MAS TARDE, USANDO CRIO-ME. A SU VEZ, EXPLORAREMOS LA POSIBILIDAD DE ESTUDIAR LA INTERACCION EIF3-EIF4F MEDIANTE ME SI OBTENEMOS COMPLEJOS LO SUFICIENTEMENTE ESTABLES._x000D_ POR ULTIMO, LA TECNICA DE CRIO-ME PUEDE SER TAMBIEN DE GRAN AYUDA PARA LA DETERMINACION ESTRUCTURAL DE OTRO TIPO DE COMPLEJOS MACROMOLECULARES Y POR TANTO, ME IMPLICARE EN EL DESARROLLO Y PROMOCION DE ESTA TECNICA QUE, DADO SU POTENCIAL, DEBERIA INTRODUCIRSE MAS AMPLIAMENTE EN VALENCIA (Y EN ESPAÑA), Y QUE PUEDE RESULTAR CRUCIAL PARA EL PROGRESO DE MUCHOS PROYECTOS ACTUALMENTE EN MARCHA EN EL IBV. (Spanish)
0 references
TRANSLATION CAN BE ROUGHLY DIVIDED INTO THREE STAGES: INITIATION, ELONGATION AND TERMINATION. CANONICAL TRANSLATION INITIATION IN EUKARYOTES CAN BE SUBDIVIDED AS WELL INTO EIGHT STAGES INVOLVING SEVERAL COMPLEXES BETWEEN THE RIBOSOMAL SUBUNITS AND THE DIFFERENT INITIATION FACTORS (EIFS). THERE ARE (AT LEAST) A DOZEN OF INITIATION FACTORS, OF WHICH THE MOST COMPLEX ARE EIF3, EIF4F AND EIF2. WHILE EIF4F AND EIF2 ARE HETEROTRIMERIC PROTEINS, EIF3 IS COMPOSED OF 6 DIFFERENT SUBUNITS IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE AND OF 13 SUBUNITS IN MAMMALS. _x000D_ PROTEIN SYNTHESIS IS A HIGHLY CONTROLLED PROCESS. IN FACT, DEREGULATION OF TRANSLATION INITIATION IN HUMANS IN ASSOCIATED WITH MANY DISEASES, INCLUDING CANCER. FOR EXAMPLE, ASSEMBLY/ACTIVITY OF EIF4F, AND OF EIF2 AND EIF3 COMPLEXES IS STRONGLY REGULATED BY SIGNALING PATHWAYS THAT ARE INVOLVED IN CANCER DEVELOPMENT AND ARE OFTEN OVEREXPRESSED IN HUMAN CANCERS, GIVING PRACTICAL INTEREST TO THE UNDERSTANDING OF THESE EIFS FUNCTIONS. DURING MY POSTDOCTORAL PERIOD IN THE VENKI RAMAKRISHNAN LAB., AT THE MRC-LMB (CAMBRIDGE), I HAVE CONTRIBUTED TO A BETTER UNDERSTANDING OF TRANSLATION INITIATION. THE CHARACTERIZATION OF EVERY ONE OF THE DIFFERENT STAGES DEPENDED ON TRAPPING PARTICULAR TRANSIENT FUNCTIONAL STATES OF A HIGHLY DYNAMIC PROCESS. THESE MACROMOLECULAR ASSEMBLIES ARE BIG AND HETEROGENEOUS AND WE LEARNT AND USED SINGLE-PARTICLE CRYO-EM TO OBTAIN SOME STRUCTURAL INFORMATION OF THEM. HOWEVER AND DESPITE THE RECENT DETERMINATION OF THESE STRUCTURES AND OF THE AVAILABILITY OF STRUCTURAL INFORMATION FOR SOME EUKARYOTIC INITIATION FACTORS, THE FUNCTIONS OF ALL THESE INITIATION FACTORS ARE STILL NOT WELL UNDERSTOOD, MAINLY DUE TO THE LACK OF DETAILED STRUCTURAL INFORMATION FOR IMPORTANT PARTS OF THESE FACTORS AND OF THE COMPLEXES FORMED BETWEEN THEM. IN PARTICULAR, IT WOULD BE HIGHLY IMPORTANT TO DETERMINE THE STRUCTURE OF COMPLETE EIF3, THE MOST COMPLEX OF THE EIFS AND AN IMPORTANT TARGET FOR REGULATION, AND THE STRUCTURES OF COMPLEXES OF EIF3 WITH OTHER IMPORTANT TARGETS FOR REGULATION SUCH AS EIF4F, EIF2, EIF5 AND EIF1. IN ORDER TO DO IT, I INTEND TO COMBINE X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-EM TO ELUCIDATE THESE STRUCTURES, WHICH WOULD SHED LIGHT ON SOME PARTICULAR ASPECTS OF TRANSLATION INITIATION IN EUKARYOTES, AND PAVE THE WAY FOR A MECHANISTIC UNDERSTANDING OF HOW THE PROCESS CAN BE REGULATED. THIS KNOWLEDGE CAN PROVIDE US WITH A STRATEGY FOR TARGETING SOME COMPLEXES THAT CAN BE CANDIDATES FOR DEVELOPMENT OF POSSIBLE ANTI-TUMORAL TREATMENTS, AS WELL AS FOR DEVELOPMENT OF ANTIBIOTICS AND ANTIVIRALS._x000D_ BASED ON OUR PREVIOUS CRYO-EM MAPS AT LOW RESOLUTION, WE WILL DESIGN SEVERAL CONSTRUCTS OF DIFFERENT DOMAINS OF EIF3 AND OVEREXPRESS OR CO-EXPRESS THEM TOGETHER WITH OTHER EIFS OR PARTS OF THEM IN HETEROLOGOUS SYSTEMS AND WE WILL CARRY OUT X-RAY CRYSTALLIZATION TRIALS WITH THEM. WE WILL FOLLOW A SIMILAR APPROACH TO OBTAIN STRUCTURAL INFORMATION OF EIF4F. GIVEN THE LARGE SIZE OF THE MULTIFACTOR COMPLEX (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) WE WILL USE SINGLE PARTICLE EM TO DETERMINE ITS STRUCTURE. WE WILL FIRST USE NEGATIVE STAIN TECHNIQUES AND LATER ON CRYO-EM. IN ADDITION WE WILL EXPLORE THE SUITABILITY OF THE EIF3-EIF4F COMPLEX AS A TARGET FOR STRUCTURAL DETERMINATION BY EM IF WE ARE ABLE TO FORM A STABLE COMPLEX. FINALLY, I WILL BE INVOLVED IN PROMOTING AND DEVELOPING SINGLE PARTICLE EM IN VALENCIA.THIS IS A VERY POWERFUL TECHNIQUE THAT CAN BE CRUCIAL FOR THE SUCCESS OF THE ON-GOING RESEARCH OF MANY OTHER DIFFERENT GROUPS (English)
0.1381661953064821
0 references
LE PROCESSUS DE TRADUCTION PEUT ÊTRE DIVISÉ EN TROIS ÉTAPES: INITIATION, ALLONGEMENT ET TERMINAISON. À SON TOUR, CHEZ LES EUCARYOTES, L’INITIATION SOUS SA FORME CANONIQUE PEUT ÊTRE SUBDIVISÉE EN HUIT STADES IMPLIQUANT PLUSIEURS COMPLEXES ENTRE LES SOUS-UNITÉS RIBOSOMIQUES ET LES DIFFÉRENTS FACTEURS D’INITIATION (FACTEURS D’INITIATION EUKARYOTIQUES; EIFS). IL Y A AU MOINS UNE DOUZAINE D’EIFS, DONT LES PLUS COMPLEXES SONT LE FEI3, LE FEI2 ET LE FEI4F. ALORS QUE LE FEI2 ET LE FEI4F SONT DES PROTÉINES HÉTÉROTRIMÉRIQUES, LE FEI3 SE COMPOSE DE 6 SOUS-UNITÉS DIFFÉRENTES DANS SACCHAROMYCES CEREVISIAE ET DE 13 SOUS-UNITÉS CHEZ LES MAMMIFÈRES. _x000D_ L’ÉTUDE D’INICATION COMMERCIALE EST UNE PROCESSUS DE CONTRÔLE HAUTE QUE la déréglementation est associée à DISEASES AS CANCER. PAR EXEMPLE, L’ASSEMBLAGE ET L’ACTIVITÉ DU FEI4F, AINSI QUE DU FEI2 ET DU FEI3 SONT FORTEMENT RÉGLEMENTÉS PAR DES VOIES DE SIGNALISATION IMPLIQUÉES DANS LES PROCESSUS CANCÉREUX, CE QUI EST CONFORME À LA DIVERSITÉ DES FONCTIONS DE CES EIFS ET AU FAIT QU’ELLES CONSTITUENT DES CIBLES IMPORTANTES POUR LE CONTRÔLE TRANSLATIONNEL. _x000D_ au cours de ma période postdoctorale dans le laboratoire de Venki Ramakrishnan IN MRC-LMB (CAMBRIDGE) Nous avons participé, avec le travail de deux autres groupes, à une meilleure compréhension structurelle du début du commerce. LA CARACTÉRISATION DE CHACUNE DES DIFFÉRENTES ÉTAPES DÉPENDAIT DE LA CAPTURE D’ÉTATS FONCTIONNELS PARTICULIERS D’UN PROCESSUS TRÈS DYNAMIQUE. CES COMPLEXES MACROMOLÉCULAIRES SONT GRANDS ET HÉTÉROGÈNES, ET POUR ÊTRE EN MESURE D’OBTENIR DES INFORMATIONS STRUCTURELLES DE LEUR PART APPRENDRE ET UTILISER LA CRYO-MICROSCOPIE ELECTRONICA (CRIO-ME). TOUTEFOIS, MALGRÉ L’IDENTIFICATION DE PLUSIEURS STRUCTURES DANS DIFFÉRENTS ÉTATS FONCTIONNELS ET L’EXISTENCE DE STRUCTURES 3D DE CERTAINES EID, LES FONCTIONS DE CES DERNIÈRES NE SONT TOUJOURS PAS BIEN COMPRISES, NOTAMMENT EN RAISON DE L’ABSENCE D’INFORMATIONS STRUCTURELLES DÉTAILLÉES SUR LES PARTIES IMPORTANTES DE CES FACTEURS ET LES COMPLEXES AUXQUELS ELLES PARTICIPENT. Dans PARTICULIER, je serais très important de déterminer la structure complète du FEI3, le plus complexe des FACTORs d’inication et un jour important pour le règlement, et la structuration des complexes de ce fabricant avec d’autres produits hautement réglementés tels que EIF4F, EIF4B, EIF2, EIF5 ET EIF1._x000D_ AVEC THIS proposito, J’ai l’INTENCTION DE COMBINING DE LA CHRTALOGRAPHIE ET DU CRIO-ME pour la DILUCTION DE THÈS STRUCTURES, qui mettrait la lumière sur certains des ASPECTS PARTICULIERS DE L’INICIACTION DE LA TRANSITATION DANS L’EUCARS. GUIDÉS PAR LES CARTES CRYO-ME À BASSE RÉSOLUTION, NOUS CONCEVONS PLUSIEURS CONSTRUCTIONS DE DIFFÉRENTS DOMAINES EIF3 ET LES SUREXPRIMONS OU LES CO-EXPRIMONS AVEC D’AUTRES EIFS OU DES PARTIES D’ENTRE EUX DANS DES SYSTÈMES HETEROLOGS ET RÉALISERONS DES ÉTUDES DE CRISTALLISATION DES RAYONS X. NOUS AGIRONS DE LA MÊME MANIÈRE POUR ÉLUCIDER LA STRUCTURE DU COMPLEXE EIF4F. COMPTE TENU DE LA GRANDE TAILLE DU COMPLEXE MULTIFACTORIEL (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) NOUS ALLONS UTILISER MOI, D’ABORD EN UTILISANT UNE COLORATION NÉGATIVE ET PLUS TARD EN UTILISANT DU CRYO-ME. A votre époque, nous voudrions exprimer la capacité d’établir l’INTERACTION EIF3-EIF4F pour MOI si nous avons été en mesure d’accepter des complexités._x000D_ ULTIME, LE TECHNICAL DU CRIO-ME peut être GREEN HELP POUR LA DÉTERMINATION STRUCTURALE D’AUTRES TYPES DE MROMOLE ET PAR THAN COMPLEMENTS, je serai impliqué dans le développement et la promotion de cette technologie qui, compte tenu de votre position, devrait entrer plus en VALENCE (et en Espagne), et cela peut aboutir à un résultat CRUCIAL pour la production de nombreux produits actuellement sur la marque IBV. (French)
2 December 2021
0 references
DER ÜBERSETZUNGSPROZESS KANN IN DREI PHASEN UNTERTEILT WERDEN: EINLEITUNG, DEHNUNG UND BEENDIGUNG. IN EUKARYOTES WIEDERUM KANN DIE EINLEITUNG IN IHRER KANONISCHEN FORM IN ACHT STUFEN UNTERTEILT WERDEN, AN DENEN MEHRERE KOMPLEXE ZWISCHEN DEN RIBOSOMALEN UNTEREINHEITEN UND DEN VERSCHIEDENEN INITIATIONSFAKTOREN (EUKARYOTISCHE INITIATIONSFAKTOREN; EIFS). ES GIBT MINDESTENS EIN DUTZEND EIFS, VON DENEN DIE KOMPLEXESTEN SIND EIF3, EIF2 UND EIF4F. WÄHREND EIF2 UND EIF4F HETEROTRIMERISCHE PROTEINE SIND, BESTEHT EIF3 AUS 6 VERSCHIEDENEN UNTEREINHEITEN IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE UND 13 UNTEREINHEITEN BEI SÄUGETIEREN. _x000D_ die TRADE Inication STATEMENT ist ein HIGH CONTROL PROCESS, dass die Deregulierung mit DISEASES AS CANCER verbunden ist. SO WERDEN Z. B. DIE VERSAMMLUNG UND DIE TÄTIGKEIT DES EIF4F SOWIE DES EIF2 UND DES EIF3 DURCH SIGNALWEGE, DIE AN KREBSPROZESSEN BETEILIGT SIND, STARK REGULIERT, WAS DER VIELFALT DER FUNKTIONEN DIESER EIFS UND DER TATSACHE ENTSPRICHT, DASS SIE WICHTIGE ZIELE FÜR DIE TRANSLATIONALE KONTROLLE SIND. _x000D_ während meiner Postdoc-Zeit im Laboratorium von Venki Ramakrishnan IN MRC-LMB (CAMBRIDGE) Wir waren zusammen mit der Arbeit anderer zwei Gruppen an einem besseren strukturellen Verständnis des Beginns des Handels beteiligt. DIE CHARAKTERISIERUNG DER EINZELNEN PHASEN HÄNGT DAVON AB, DASS BESTIMMTE FUNKTIONALE STAATEN EINES SEHR DYNAMISCHEN PROZESSES GEFANGEN WERDEN. DIESE MAKROMOLEKULAREN KOMPLEXE SIND GROSS UND HETEROGEN, UM STRUKTURELLE INFORMATIONEN VON IHNEN ZU ERHALTEN, LERNEN UND NUTZEN KRYOMIKROSKOPIE ELECTRONICA (CRIO-ME). TROTZ DER ERMITTLUNG MEHRERER STRUKTUREN IN VERSCHIEDENEN FUNKTIONALEN STAATEN UND DER EXISTENZ VON 3-D-STRUKTUREN EINIGER SIA SIND DIE FUNKTIONEN DER LETZTGENANNTEN LÄNDER NACH WIE VOR NICHT GUT VERSTANDEN, INSBESONDERE AUFGRUND DES FEHLENS DETAILLIERTER STRUKTURELLER INFORMATIONEN ÜBER WICHTIGE TEILE DIESER FAKTOREN UND DER KOMPLEXE, AN DENEN SIE BETEILIGT SIND. In PARTICULAR wäre ich sehr wichtig, um die vollständige Struktur des EIF3 zu bestimmen, der komplexere der Inication FACTORs und ein wichtiger Tag für die Regulierung, und die Strukturierung der Komplexe dieses Herstellers mit anderen hochregulierten Produkten wie EIF4F, EIF4B, EIF2, EIF5 UND EIF1._x000D_ WITH THIS proposito, ich habe die INTENCTION OF COMBINING X-Ray CHRTALOGRAPHY UND CRIO-ME FÜR DIES STUCKTION DER ZUSAMMENARBEITEN, die LICHT EINSTELLUNG DER PARTIKEL ASPECTS DER INICIACTION DER TRANSITATION in den EU-CARS darstellen würden. GELEITET VON DEN LOW-RESOLUTION-CRYO-ME-KARTEN WERDEN WIR MEHRERE KONSTRUKTIONEN AUS VERSCHIEDENEN EIF3-DOMÄNEN ENTWERFEN UND DIESE ÜBERDRÜCKEN ODER GEMEINSAM MIT ANDEREN EIFS ODER TEILEN DAVON IN HETEROLOGS-SYSTEMEN AUSDRÜCKEN UND RÖNTGENKRISTALLISATIONSSTUDIEN DURCHFÜHREN. WIR WERDEN IN ÄHNLICHER WEISE HANDELN, UM DIE STRUKTUR DES EIF4F-KOMPLEXES ZU VERDEUTLICHEN. ANGESICHTS DER GROSSEN GRÖSSE DES MULTIFAKTORIELLEN KOMPLEXES (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) WERDEN WIR MICH ZUERST MIT NEGATIVFÄRBUNG UND SPÄTER MIT KRYO-ME VERWENDEN. Zu Ihrer Zeit möchten wir die Fähigkeit zum Ausdruck bringen, die EIF3-EIF4F INTERACTION für ME zu etablieren, wenn wir in der Lage waren, Komplexitäten zu akzeptieren._x000D_ ULTIME, DIE TECHNICAL VON CRIO-ME KÖNNEN GREEN HELP FÜR DIE STRUKTURAL DETERMINATION DES ANDEREN TYPE OF MROMOLE UND DEN DANZIERUNGEN, Ich werde an der Entwicklung und Förderung dieser Technologie beteiligt sein, die angesichts Ihrer Position in VALENCE (und in Spanien) eingehen sollte. und das kann zu einem CRUCIAL-Ergebnis für die Produktion vieler Produkte führen, die derzeit auf der IBV-Marke stehen. (German)
9 December 2021
0 references
HET VERTAALPROCES KAN IN DRIE FASEN WORDEN ONDERVERDEELD: INITIATIE, VERLENGING EN BEËINDIGING. OP ZIJN BEURT, IN EUKARYOTES, KAN DE INITIATIE IN ZIJN CANONISCHE VORM WORDEN ONDERVERDEELD IN ACHT STADIA MET VERSCHILLENDE COMPLEXEN TUSSEN DE RIBOSOMALE SUBEENHEDEN EN DE VERSCHILLENDE INITIATIEFACTOREN (OEKARYOTISCHE INITIATIEFACTOREN; EIFS). ER ZIJN MINSTENS EEN DOZIJN EIFS, WAARVAN DE MEEST COMPLEXE ZIJN EIF3, EIF2 EN EIF4F. TERWIJL EIF2 EN EIF4F HETEROTRIMEEREIWITTEN ZIJN, BESTAAT HET EIF3 UIT 6 VERSCHILLENDE SUBEENHEDEN IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE EN 13 SUBEENHEDEN IN ZOOGDIEREN. _x000D_ de TRADE inication STATEMENT IS A HIGH CONTROL PROCESS WHY deregulering wordt geassocieerd met DISEASES AS CANCER. ZO WORDEN DE VERGADERING EN DE ACTIVITEITEN VAN EIF4F, ALSMEDE VAN EIF2 EN EIF3 STERK GEREGULEERD DOOR SIGNALERINGSTRAJECTEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ KANKERPROCESSEN, HETGEEN IN OVEREENSTEMMING IS MET DE DIVERSITEIT VAN DE FUNCTIES VAN DEZE EIFS EN HET FEIT DAT ZIJ BELANGRIJKE DOELSTELLINGEN ZIJN VOOR TRANSLATIONELE CONTROLE. _x000D_ tijdens mijn postdoctorale periode in het Laboratorium van Venki Ramakrishnan IN MRC-LMB (CAMBRIDGE) Wij zijn, samen met het werk van andere twee groepen, betrokken geweest bij een beter structureel begrip van het begin van de handel. DE KARAKTERISERING VAN ELK VAN DE VERSCHILLENDE FASEN HANGT AF VAN HET VANGEN VAN BEPAALDE FUNCTIONELE STATEN VAN EEN ZEER DYNAMISCH PROCES. DEZE MACROMOLECULAIRE COMPLEXEN ZIJN GROOT EN HETEROGEEN, EN OM STRUCTURELE INFORMATIE VAN HEN TE KUNNEN VERKRIJGEN LEREN EN GEBRUIKEN CRYO-MICROSCOPIE ELECTRONICA (CRIO-ME). ONDANKS DE IDENTIFICATIE VAN VERSCHILLENDE STRUCTUREN IN VERSCHILLENDE FUNCTIONELE STATEN EN HET BESTAAN VAN 3-D-STRUCTUREN VAN SOMMIGE SIA’S, ZIJN DE FUNCTIES VAN DEZE LAATSTE NOG STEEDS NIET GOED BEGREPEN, VOORAL VANWEGE HET GEBREK AAN GEDETAILLEERDE STRUCTURELE INFORMATIE OVER BELANGRIJKE ONDERDELEN VAN DEZE FACTOREN EN DE COMPLEXEN WAARAAN ZIJ DEELNEMEN. In PARTICULAR zou ik zeer belangrijk zijn om de volledige structuur van het EIF3, het complexere van de inicatie-FACTORs en een belangrijke dag voor de verordening te bepalen, en de structurering van de complexen van deze producent met andere sterk gereguleerde producten als EIF4F, EIF4B, EIF2, EIF5 en EIF1._x000D_ MET dit voorstel, heb ik de INTENCTIE VAN COMBINING X-Ray CHRTALOGRAPHY EN CRIO-ME VOOR DILUCTIE VAN DIT STRUCTURES, dat werpt LICHT OP DE GEMEENSCHAPPEN VAN DE PARTICULAR ASPECTEN VAN DE INICIACTIE VAN DE TRANSITATIE IN DE EUCARS. GELEID DOOR DE LAGE RESOLUTIE CRYO-ME KAARTEN ZULLEN WE VERSCHILLENDE CONSTRUCTIES UIT VERSCHILLENDE EIF3-DOMEINEN ONTWERPEN EN DEZE OVEREXPRESSEN OF SAMEN MET ANDERE EIFS OF DELEN ERVAN IN HETEROLOGS-SYSTEMEN UITDRUKKEN EN RÖNTGENKRISTALLISATIESTUDIES UITVOEREN. WE ZULLEN OP EEN VERGELIJKBARE MANIER HANDELEN OM DE STRUCTUUR VAN HET EIF4F-COMPLEX TE VERDUIDELIJKEN. GEZIEN DE GROTE OMVANG VAN HET MULTIFACTORIËLE COMPLEX (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) ZULLEN WE ME GEBRUIKEN, EERST MET BEHULP VAN NEGATIEVE VLEKKEN EN LATER MET CRYO-ME. Op uw moment willen wij uiting geven aan de mogelijkheid om de EIF3-EIF4F INTERACTION for ME op te richten als we in staat zijn geweest om complexiteiten te accepteren._x000D_ ULTIME, DE TECHNICAL OF CRIO-ME KAN GREEN HELP VOOR DE STRUCTURALE DETERMINATION OF ANDERE TYPE OF MROMOLE EN BY THAN COMPLEMENTS, ik zal betrokken zijn bij de ontwikkeling en bevordering van deze technologie die, gezien uw positie, uitgebreider zou moeten worden ingevoerd in VALENCE (en in Spanje), en dat kan resulteren in een CRUCIAL resultaat voor de productie van veel producten op het IBV-merk. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL PROCESSO DI TRADUZIONE PUÒ ESSERE SUDDIVISO IN TRE FASI: INIZIAZIONE, ALLUNGAMENTO E TERMINAZIONE. A SUA VOLTA, NEGLI EUCARIOTI, L'INIZIAZIONE NELLA SUA FORMA CANONICA PUÒ ESSERE SUDDIVISA IN OTTO FASI CHE COINVOLGONO DIVERSI COMPLESSI TRA LE SUBUNITÀ RIBOSOMALE E I DIVERSI FATTORI DI INIZIO (FATTORI DI INIZIAZIONE EUCARIOTICA; EIFS). VI SONO ALMENO UNA DOZZINA DI EIFS, DI CUI I PIÙ COMPLESSI SONO FEI3, FEI2 E FEI4F. MENTRE IL FEI2 E IL FEI4F SONO PROTEINE ETEROTRIMERICHE, IL FEI3 È COSTITUITO DA 6 DIVERSE SOTTOUNITÀ IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE E 13 SUBUNITÀ NEI MAMMIFERI. _x000D_ lo STATEMENTO DELL'INICAZIONE TRADE È UN ALTO PROCESSO CONTROLLO CHE la deregolamentazione è associata a DISEASES AS CANCER. AD ESEMPIO, L'ASSEMBLAGGIO E L'ATTIVITÀ DEL FEI4F, NONCHÉ DEL FEI2 E DEL FEI3 SONO FORTEMENTE REGOLAMENTATI DA PERCORSI DI SEGNALAZIONE COINVOLTI NEI PROCESSI CANCEROSI, IN LINEA CON LA DIVERSITÀ DELLE FUNZIONI DI TALI FEI E CON IL FATTO CHE SI TRATTA DI OBIETTIVI IMPORTANTI PER IL CONTROLLO TRASLAZIONALE. _x000D_ durante il mio periodo post-dottorato nel Laboratorium di Venki Ramakrishnan IN MRC-LMB (CAMBRIDGE) Siamo stati coinvolti, insieme al lavoro di altri due gruppi, ad una migliore comprensione strutturale dell'inizio del commercio. LA CARATTERIZZAZIONE DI CIASCUNA DELLE DIVERSE FASI DIPENDEVA DALLA CATTURA DI PARTICOLARI STATI FUNZIONALI DI UN PROCESSO MOLTO DINAMICO. QUESTI COMPLESSI MACROMOLECOLARI SONO GRANDI ED ETEROGENEI, E PER ESSERE IN GRADO DI OTTENERE INFORMAZIONI STRUTTURALI DA LORO IMPARARE E UTILIZZARE CRIO-MICROSCOPIA ELETTRONICA (CRIO-ME). TUTTAVIA, NONOSTANTE L'INDIVIDUAZIONE DI DIVERSE STRUTTURE IN DIVERSI STATI FUNZIONALI E L'ESISTENZA DI STRUTTURE 3-D DI ALCUNE SIA, LE FUNZIONI DI QUESTE ULTIME NON SONO ANCORA BEN COMPRESE, SOPRATTUTTO A CAUSA DELLA MANCANZA DI INFORMAZIONI STRUTTURALI DETTAGLIATE SU PARTI IMPORTANTI DI QUESTI FATTORI E SUI COMPLESSI A CUI PARTECIPANO. In PARTICOLARE, sarei molto importante per determinare la struttura completa del FEI3, il più complesso dei FACTORs di inication e un giorno importante per la regolamentazione, e la strutturazione dei complessi di questo produttore con altri prodotti altamente regolamentati come EIF4F, EIF4B, EIF2, EIF5 E EIF1._x000D_ CON QUESTO PROVOTTO, ho l'INTENZIONE DI COMBINING X-Ray CHRTALOGRAPHY E CRIO-ME PER DILUCTION DI QUESTE STRUTTURE, che getterebbe la LUCE SUL SOME DEGLI ASPETTI PARTICOLARI DELL'INICIAZIONE DELLA TRANSITAZIONE NELL'EUCARS. GUIDATI DALLE MAPPE CRIO-ME A BASSA RISOLUZIONE, PROGETTEREMO DIVERSE COSTRUZIONI DA VARI DOMINI EIF3 E LE EFFETTUEREMO SOVRAESPRIMENDOLE O COESPRIMERLE INSIEME AD ALTRI EIFS O PARTI DI ESSI NEI SISTEMI HETEROLOGS E CONDURREMO STUDI DI CRISTALLIZZAZIONE A RAGGI X. ATTUEREMO IN MODO SIMILE PER CHIARIRE LA STRUTTURA DEL COMPLESSO EIF4F. DATE LE GRANDI DIMENSIONI DEL COMPLESSO MULTIFATTORIALE (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) USEREMO ME, PRIMA USANDO LA COLORAZIONE NEGATIVA E POI USANDO CRIO-ME. Al vostro tempo, vorremmo esprimere la capacità di stabilire l'INTERAZIONE EIF3-EIF4F per me se siamo stati in grado di accettare le complessità._x000D_ ULTIME, IL TECNICALE DI CRIO-ME può essere GREEN HELP FOR THE STRUCTURAL DETERMINATION OF ALTRE TIPO DI MROMOLE E DY THAN COMPLEMENTS, sarò coinvolto nello sviluppo e nella promozione di questa tecnologia che, data la sua posizione, dovrebbe entrare più ampiamente in VALENCE (e in Spagna), e questo può portare a un risultato CRUCIAL per la produzione di molti prodotti attualmente sul marchio IBV. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η ΜΕΤΆΦΡΑΣΗ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΧΩΡΙΣΤΕΊ ΣΕ ΤΡΊΑ ΣΤΆΔΙΑ: ΈΝΑΡΞΗ, ΕΠΙΜΉΚΥΝΣΗ ΚΑΙ ΤΕΡΜΑΤΙΣΜΌΣ. Η ΚΑΝΟΝΙΚΉ ΈΝΑΡΞΗ ΤΗΣ ΜΕΤΆΦΡΑΣΗΣ ΣΤΟΥΣ ΕΥΚΑΡΥΏΤΕΣ ΜΠΟΡΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΝΑ ΥΠΟΔΙΑΙΡΕΘΕΊ ΣΕ ΟΚΤΏ ΣΤΆΔΙΑ ΠΟΥ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ ΔΙΆΦΟΡΑ ΣΎΜΠΛΟΚΑ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΡΙΒΟΣΩΜΙΚΏΝ ΥΠΟΜΟΝΆΔΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΈΝΑΡΞΗΣ (EIFS). ΥΠΆΡΧΟΥΝ (ΤΟΥΛΆΧΙΣΤΟΝ) ΔΏΔΕΚΑ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΕΚΚΊΝΗΣΗΣ, ΕΚ ΤΩΝ ΟΠΟΊΩΝ ΟΙ ΠΙΟ ΣΎΝΘΕΤΟΙ ΕΊΝΑΙ ΤΟ ΕΤΑΕ3, ΤΟ ΕΤΕ4F ΚΑΙ ΤΟ ΕΤΑΕ2. ΕΝΏ ΤΟ EIF4F ΚΑΙ ΤΟ EIF2 ΕΊΝΑΙ ΕΤΕΡΟΤΡΙΜΕΡΕΊΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ, ΤΟ EIF3 ΑΠΟΤΕΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ 6 ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΥΠΟΜΟΝΆΔΕΣ ΣΕ SACCHAROMYCES CEREVISIAE ΚΑΙ ΑΠΌ 13 ΥΠΟΜΟΝΆΔΕΣ ΣΤΑ ΘΗΛΑΣΤΙΚΆ. _x000D_ Η πρωτεΐνη SYNTHESIS είναι μια εξαιρετικά ελεγχόμενη διαδικασία. ΣΤΗΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ, ΑΠΟΡΡΎΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΈΝΑΡΞΗΣ ΤΗΣ ΜΕΤΆΦΡΑΣΗΣ ΣΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΠΟΛΛΈΣ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΟΥ ΤΟΥ ΚΑΡΚΊΝΟΥ. ΓΙΑ ΠΑΡΆΔΕΙΓΜΑ, Η ΣΥΝΑΡΜΟΛΌΓΗΣΗ/ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΑ ΤΟΥ EIF4F ΚΑΙ ΤΩΝ ΣΥΜΠΛΌΚΩΝ ΤΟΥ ΕΤΑΕ2 ΚΑΙ ΤΟΥ ΕΤΑΕ3 ΡΥΘΜΊΖΕΤΑΙ ΣΕ ΜΕΓΆΛΟ ΒΑΘΜΌ ΑΠΌ ΟΔΟΎΣ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΤΟΥ ΚΑΡΚΊΝΟΥ ΚΑΙ ΣΥΧΝΆ ΥΠΕΡΕΚΦΡΆΖΟΝΤΑΙ ΣΕ ΚΑΡΚΊΝΟΥΣ ΤΟΥ ΑΝΘΡΏΠΟΥ, ΔΊΝΟΝΤΑΣ ΠΡΑΚΤΙΚΌ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΏΝ ΤΟΥ EIFS. ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΜΕΤΑΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΉΣ ΜΟΥ ΠΕΡΙΌΔΟΥ ΣΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΟ VENKI RAMAKRISHNAN., ΣΤΟ MRC-LMB (CAMBRIDGE), ΈΧΩ ΣΥΜΒΆΛΕΙ ΣΤΗΝ ΚΑΛΎΤΕΡΗ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΤΗΣ ΈΝΑΡΞΗΣ ΤΗΣ ΜΕΤΆΦΡΑΣΗΣ. Ο ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌΣ ΚΆΘΕ ΕΝΌΣ ΑΠΌ ΤΑ ΔΙΆΦΟΡΑ ΣΤΆΔΙΑ ΕΞΑΡΤΙΌΤΑΝ ΑΠΌ ΤΗΝ ΠΑΓΊΔΕΥΣΗ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΩΝ ΜΕΤΑΒΑΤΙΚΏΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΏΝ ΚΑΤΑΣΤΆΣΕΩΝ ΜΙΑΣ ΕΞΑΙΡΕΤΙΚΆ ΔΥΝΑΜΙΚΉΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ. ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑΚΈΣ ΣΥΝΕΛΕΎΣΕΙΣ ΕΊΝΑΙ ΜΕΓΆΛΕΣ ΚΑΙ ΕΤΕΡΟΓΕΝΕΊΣ ΚΑΙ ΜΆΘΑΜΕ ΚΑΙ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΑΜΕ ΚΡΥΟ-EM ΜΟΝΟΣΩΜΑΤΙΔΊΩΝ ΓΙΑ ΝΑ ΛΆΒΟΥΜΕ ΚΆΠΟΙΕΣ ΔΟΜΙΚΈΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΓΙ’ ΑΥΤΆ. ΩΣΤΌΣΟ, ΠΑΡΆ ΤΟΝ ΠΡΌΣΦΑΤΟ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΔΟΜΏΝ ΚΑΙ ΤΗΣ ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑΣ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΓΙΑ ΟΡΙΣΜΈΝΟΥΣ ΕΥΚΑΡΥΩΤΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΈΝΑΡΞΗΣ, ΟΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΌΛΩΝ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΈΝΑΡΞΗΣ ΕΞΑΚΟΛΟΥΘΟΎΝ ΝΑ ΜΗΝ ΕΊΝΑΙ ΕΠΑΡΚΏΣ ΚΑΤΑΝΟΗΤΈΣ, ΚΥΡΊΩΣ ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΈΛΛΕΙΨΗΣ ΛΕΠΤΟΜΕΡΏΝ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΓΙΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΆ ΤΜΉΜΑΤΑ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΣΥΓΚΡΟΤΗΜΆΤΩΝ ΠΟΥ ΣΧΗΜΑΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕΤΑΞΎ ΤΟΥΣ. ΕΙΔΙΚΌΤΕΡΑ, ΘΑ ΉΤΑΝ ΙΔΙΑΊΤΕΡΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΝΑ ΚΑΘΟΡΙΣΤΕΊ Η ΔΟΜΉ ΤΟΥ ΠΛΉΡΟΥΣ ΕΤΑΕ3, ΤΟ ΠΙΟ ΠΟΛΎΠΛΟΚΟ ΑΠΌ ΤΟ ΕΤΑΕ ΚΑΙ ΈΝΑΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΣ ΣΤΌΧΟΣ ΓΙΑ ΤΗ ΡΎΘΜΙΣΗ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΟΙ ΔΟΜΈΣ ΤΩΝ ΣΥΓΚΡΟΤΗΜΆΤΩΝ ΤΟΥ ΕΤΑΕ3 ΜΕ ΆΛΛΟΥΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΟΎΣ ΣΤΌΧΟΥΣ ΓΙΑ ΤΗ ΡΎΘΜΙΣΗ, ΌΠΩΣ ΤΟ ΕΤΕ4F, ΤΟ ΕΤΑΕ2, ΤΟ ΕΤΕ5 ΚΑΙ ΤΟ ΕΤΑΕ1. ΓΙΑ ΝΑ ΤΟ ΚΆΝΩ, ΣΚΟΠΕΎΩ ΝΑ ΣΥΝΔΥΆΣΩ ΚΡΥΣΤΑΛΛΟΓΡΑΦΊΑ ΑΚΤΊΝΩΝ Χ ΚΑΙ ΚΡΥΟ-EM ΓΙΑ ΝΑ ΔΙΕΥΚΡΙΝΊΣΩ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΔΟΜΈΣ, ΟΙ ΟΠΟΊΕΣ ΘΑ ΡΊΞΟΥΝ ΦΩΣ ΣΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΕΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΗΣ ΈΝΑΡΞΗΣ ΤΗΣ ΜΕΤΆΦΡΑΣΗΣ ΣΕ ΕΥΚΑΡΥΏΤΕΣ, ΚΑΙ ΘΑ ΠΡΟΕΤΟΙΜΆΣΟΥΝ ΤΟ ΈΔΑΦΟΣ ΓΙΑ ΜΙΑ ΜΗΧΑΝΙΣΤΙΚΉ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΤΟΥ ΤΡΌΠΟΥ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ Η ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΡΥΘΜΙΣΤΕΊ. Αυτή η ΓΝΩΣΤΟΠΟΙΗΣΗ ΜΠΟΡΕΙ να ΠΑΡΕΧΕΙ ΜΑΣ ΜΕ ΣΤΡΑΤΗΓΙΑ ΓΙΑ ΤΟ ΣΤΑΓΟΝΙΣΜΕΝΕΣ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΕΣ ΟΠΟΙΕΣ μπορουν να ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΑΝΤΙΒΙΩΤΙΚΩΝ ΚΑΙ ΑΝΤΙΣΤΟΙΧΙΩΝ._x000D_ ΒΑΣΙΖΟΝΤΑΙ ΣΤΙΣ ΠΡΟΜΗΘΕΙΕΣ ΜΑΣ CRYO-EM MAPS AT LOW RESOLUTION, ΘΕΩΡΕΙ ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΙΚΟΤΗΤΑ ΤΩΝ ΔΙΑΦΟΡΩΝ ΔΟΜΩΝ του EIF3 και υπερεκφράζει ή CO-EXPRESS με άλλα EIF ή μέρη αυτών σε ετερόλογα συστήματα και θα εξέλθουν από X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS με αυτά. ΘΑ ΑΚΟΛΟΥΘΉΣΟΥΜΕ ΠΑΡΌΜΟΙΑ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ ΓΙΑ ΝΑ ΛΆΒΟΥΜΕ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΈΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΓΙΑ ΤΟ EIF4F. ΔΕΔΟΜΈΝΟΥ ΤΟΥ ΜΕΓΆΛΟΥ ΜΕΓΈΘΟΥΣ ΤΟΥ ΠΟΛΥΠΑΡΑΓΟΝΤΙΚΟΎ ΣΥΜΠΛΈΓΜΑΤΟΣ (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΈΝΑ ΜΌΡΙΟ EM ΓΙΑ ΝΑ ΚΑΘΟΡΊΣΟΥΜΕ ΤΗ ΔΟΜΉ ΤΟΥ. ΠΡΏΤΑ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΑΡΝΗΤΙΚΈΣ ΤΕΧΝΙΚΈΣ ΛΕΚΈΔΩΝ ΚΑΙ ΑΡΓΌΤΕΡΑ ΣΕ CRYO-EM. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΚΑΤΑΛΛΗΛΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΣΥΜΠΛΈΓΜΑΤΟΣ EIF3-EIF4F ΩΣ ΣΤΌΧΟΥ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΉΣ ΑΠΟΦΑΣΙΣΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΕΚ ΜΈΡΟΥΣ ΤΟΥ, ΕΆΝ ΕΊΜΑΣΤΕ ΣΕ ΘΈΣΗ ΝΑ ΣΧΗΜΑΤΊΣΟΥΜΕ ΈΝΑ ΣΤΑΘΕΡΌ ΣΎΜΠΛΕΓΜΑ. ΤΈΛΟΣ, ΘΑ ΣΥΜΜΕΤΆΣΧΩ ΣΤΗΝ ΠΡΟΏΘΗΣΗ ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΜΟΝΏΝ ΣΩΜΑΤΙΔΊΩΝ EM ΣΤΗ VALENCIA.ΑΥΤΉ ΕΊΝΑΙ ΜΙΑ ΠΟΛΎ ΙΣΧΥΡΉ ΤΕΧΝΙΚΉ ΠΟΥ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΊΝΑΙ ΖΩΤΙΚΉΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΤΥΧΊΑ ΤΗΣ ΣΥΝΕΧΙΖΌΜΕΝΗΣ ΈΡΕΥΝΑΣ ΠΟΛΛΏΝ ΆΛΛΩΝ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΏΝ ΟΜΆΔΩΝ. (Greek)
17 August 2022
0 references
OVERSÆTTELSE KAN GROFT INDDELES I TRE FASER: INDLEDNING, FORLÆNGELSE OG AFSLUTNING. KANONISK OVERSÆTTELSESINITIERING I EUKARYOTER KAN OGSÅ OPDELES I OTTE FASER, DER INVOLVERER FLERE KOMPLEKSER MELLEM DE RIBOSOMALE UNDERENHEDER OG DE FORSKELLIGE INITIERINGSFAKTORER (EIFS). DER ER (MINDST) DUSIN STARTFAKTORER, HVORAF DE MEST KOMPLEKSE ER EIF3, EIF4F OG EIF2. EIF4F OG EIF2 ER HETEROTRIMERISKE PROTEINER, MEN EIF3 BESTÅR AF 6 FORSKELLIGE UNDERENHEDER I SACCHAROMYCES CEREVISIAE OG 13 UNDERENHEDER AF PATTEDYR. _x000D_ protein SYNTHESIS er en HØJDE KONTROLLED PROCESS. FAKTISK DEREGULERING AF OVERSÆTTELSE INITIERING HOS MENNESKER I FORBINDELSE MED MANGE SYGDOMME, HERUNDER KRÆFT. FOR EKSEMPEL REGULERES FORSAMLING/AKTIVITET I EIF4F OG EIF2- OG EIF3-KOMPLEKSER KRAFTIGT VED AT SIGNALERE VEJE, DER ER INVOLVERET I KRÆFTUDVIKLING OG OFTE ER OVERUDTRYKT I KRÆFT HOS MENNESKER, HVILKET GIVER PRAKTISK INTERESSE FOR FORSTÅELSEN AF DISSE EIFS-FUNKTIONER. UNDER MIN POSTDOCTORAL PERIODE I VENKI RAMAKRISHNAN LAB., PÅ MRC-LMB (CAMBRIDGE), JEG HAR BIDRAGET TIL EN BEDRE FORSTÅELSE AF OVERSÆTTELSE INITIERING. KARAKTERISERINGEN AF HVER ENKELT AF DE FORSKELLIGE FASER AFHANG AF, AT BESTEMTE FORBIGÅENDE FUNKTIONELLE STATER BLEV FANGET I EN MEGET DYNAMISK PROCES. DISSE MAKROMOLEKYLÆRE SAMLINGER ER STORE OG HETEROGENE, OG VI LÆRTE OG BRUGTE ENKELTPARTIKEL KRYO-EM TIL AT OPNÅ NOGLE STRUKTURELLE OPLYSNINGER OM DEM. PÅ TRODS AF DEN NYLIGE FASTLÆGGELSE AF DISSE STRUKTURER OG TILGÆNGELIGHEDEN AF STRUKTURELLE OPLYSNINGER OM VISSE EUKARYOTISKE INITIERINGSFAKTORER ER FUNKTIONERNE FOR ALLE DISSE STARTFAKTORER IMIDLERTID STADIG IKKE TILSTRÆKKELIGT FORSTÅET, HOVEDSAGELIG PÅ GRUND AF MANGLEN PÅ DETALJEREDE STRUKTURELLE OPLYSNINGER OM VIGTIGE DELE AF DISSE FAKTORER OG DE KOMPLEKSER, DER DANNES MELLEM DEM. DET VIL NAVNLIG VÆRE MEGET VIGTIGT AT FASTLÆGGE STRUKTUREN FOR HELE EIF3, DET MEST KOMPLEKSE AF EIFS OG ET VIGTIGT MÅL FOR FORORDNING OG STRUKTUREN I EIF3'S KOMPLEKSER MED ANDRE VIGTIGE MÅL FOR FORORDNINGEN SÅSOM EIF4F, EIF2, EIF5 OG EIF1. FOR AT GØRE DET, JEG AGTER AT KOMBINERE RØNTGEN KRYSTALLOGRAFI OG KRYO-EM FOR AT BELYSE DISSE STRUKTURER, SOM VILLE KASTE LYS OVER NOGLE SÆRLIGE ASPEKTER AF OVERSÆTTELSE INITIERING I EUKARYOTER, OG BANE VEJEN FOR EN MEKANISTISK FORSTÅELSE AF, HVORDAN PROCESSEN KAN REGULERES. Dette KAN PROVIDET US MED en STRATEGY FOR TARGETing en komplikation, der kan være CANDIDATEs for udvikling af POSSIBLE ANTI-tumorale TREATMENTER, som vil blive udviklet af ANTIBIOTICS og ANTIVIRALS._x000D_ BASED PÅ VÆRENDE KRYO-EM MAPS ved LOW RESOLUTION, vil I UNDERSTREGER, at EIF3 og overexpressere eller CO-EXPRESSER, der er afhængige af andre EIF'er eller -dele af dem i heterologe SYSTEMER og VIL LÆRERNE UDEN X-RAY SRYSTALLISATION TRIALSER med dem. VI VIL FØLGE EN LIGNENDE TILGANG FOR AT INDHENTE STRUKTURELLE OPLYSNINGER OM EIF4F. I BETRAGTNING AF MULTIFAKTORKOMPLEKSETS STORE STØRRELSE (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) VIL VI BRUGE ENKELTPARTIKELEM TIL AT BESTEMME DENS STRUKTUR. VI VIL FØRST BRUGE NEGATIVE PLET TEKNIKKER OG SENERE PÅ CRYO-EM. DESUDEN VIL VI UNDERSØGE, OM EIF3-EIF4F-KOMPLEKSET ER EGNET SOM MÅL FOR DEN STRUKTURELLE BESTEMMELSE, HVIS VI ER I STAND TIL AT DANNE ET STABILT KOMPLEKS. ENDELIG VIL JEG VÆRE INVOLVERET I AT FREMME OG UDVIKLE ENKELTPARTIKEL EM I VALENCIA.THIS ER EN MEGET KRAFTFULD TEKNIK, DER KAN VÆRE AFGØRENDE FOR SUCCESEN AF DEN IGANGVÆRENDE FORSKNING I MANGE ANDRE FORSKELLIGE GRUPPER (Danish)
17 August 2022
0 references
KÄÄNNÖS VOIDAAN JAKAA KARKEASTI KOLMEEN VAIHEESEEN: ALKU, VENYMÄ JA PÄÄTTÄMINEN. KANONISEN KÄÄNTÄMISEN ALOITTAMINEN EUKARYOTEISSA VOIDAAN JAKAA MYÖS KAHDEKSAAN VAIHEESEEN, JOISSA RIBOSOMAALISEN ALAYKSIKÖN JA ERI ALOITUSTEKIJÖIDEN (EIFS) VÄLILLÄ ON USEITA KOMPLEKSEJA. VIREILLEPANOON ON (AINAKIN) TUSINAA TEKIJÄÄ, JOISTA MONIMUTKAISIMPIA OVAT EIR3, EIR4F JA EIR2. EIF4F JA EIF2 OVAT HETEROTRIMEERISIÄ PROTEIINEJA, KUN TAAS EIF3 KOOSTUU KUUDESTA ERI ALAYKSIKÖSTÄ SACCHAROMYCES CEREVISIAESSA JA 13 ALAYKSIKÖSTÄ NISÄKKÄISSÄ. _x000D_ proteiini SYNTHESIS on suuri CONTROLLED PROCESS. ITSE ASIASSA, SÄÄNTELYN PURKAMINEN KÄÄNNÖSTEN KÄYNNISTÄMINEN IHMISILLÄ LIITTYY MONIA SAIRAUKSIA, MUKAAN LUKIEN SYÖPÄ. ESIMERKIKSI EIR4F:N SEKÄ EIR2- JA EIR3-KOMPLEKSIEN KOKOONPANOA/TOIMINTAA SÄÄDELLÄÄN VOIMAKKAASTI SYÖVÄN KEHITTYMISEEN LIITTYVILLÄ MERKINANTOVÄYLILLÄ, JOTKA USEIN YLIILMAISTUVAT IHMISTEN SYÖPISSÄ, MIKÄ HERÄTTÄÄ KÄYTÄNNÖN KIINNOSTUSTA NÄIDEN EIFS:N TOIMINTOJEN YMMÄRTÄMISEEN. VENKI RAMAKRISHNAN LAB. MRC-LMB:SSÄ (CAMBRIDGE) OLEN EDISTÄNYT KÄÄNNÖSTEN KÄYNNISTÄMISEN YMMÄRTÄMISTÄ TOHTORINTUTKINNON JÄLKEEN. KUNKIN VAIHEEN KARAKTERISOINTI RIIPPUI ERITTÄIN DYNAAMISEN PROSESSIN TIETTYJEN OHIMENEVIEN TOIMINNALLISTEN VALTIOIDEN PYYDYSTÄMISESTÄ. NÄMÄ MAKROMOLEKULAARISET KOKOONPANOT OVAT SUURIA JA HETEROGEENISIÄ, JA OPIMME JA KÄYTIMME YKSIHIUKKASSIA KRYO-EMEJÄ SAADAKSEEN NIISTÄ JONKIN VERRAN RAKENTEELLISIA TIETOJA. VAIKKA NÄMÄ RAKENTEET JA JOISTAKIN EUKARYOOTTISISTA VIREILLEPANOTEKIJÖISTÄ ON HILJATTAIN SAATU RAKENTEELLISIA TIETOJA, KAIKKIEN NÄIDEN VIREILLEPANOTEKIJÖIDEN TOIMINTAA EI KUITENKAAN VIELÄKÄÄN YMMÄRRETÄ HYVIN, MIKÄ JOHTUU LÄHINNÄ SIITÄ, ETTÄ NÄIDEN TEKIJÖIDEN TÄRKEISTÄ OSISTA JA NIIDEN MUODOSTAMISTA KOMPLEKSEISTA EI OLE YKSITYISKOHTAISIA RAKENTEELLISIA TIETOJA. ERITYISESTI OLISI ERITTÄIN TÄRKEÄÄ MÄÄRITELLÄ EIR3:N RAKENNE, JOKA ON EIR:N MONIMUTKAISIN JA TÄRKEÄ TAVOITE SÄÄNTELYLLE, SEKÄ EIR3:N KOMPLEKSIRAKENTEET, JOILLA ON MUITA TÄRKEITÄ SÄÄNTELYTAVOITTEITA, KUTEN EIR4F, EIR2, EIR5 JA EIR1. JOTTA SE VOITAISIIN TEHDÄ, AION YHDISTÄÄ RÖNTGENKIDE JA KRYO-EM SELVENTÄÄ NÄITÄ RAKENTEITA, JOKA VALAISTA JOITAKIN NÄKÖKOHTIA KÄÄNTÄMISEN KÄYNNISTÄMISEN EUKARYOTES, JA TASOITTAA TIETÄ MEKANISTINEN KÄSITYS SIITÄ, MITEN PROSESSIA VOIDAAN SÄÄNNELLÄ. Tämä KNOWLEDGE CAN PROVIDE US STRATEGY FOR TARGETING SOME COMPLEXES, jotka voivat olla CANDIDATES TUOTTEIDEN KÄYTTÖJÄRJESTELMÄN TUOTTEIDEN KOSKEVAT TUOTTEIDEN KOSKEVAT KÄYTTÖJÄRJESTELMÄT ANTIBIOTICS- JA ANTIVIRALIJEN KEHITTÄMINEN._x000D_ BASED ON PREVIOUS CRYO-EM MAPS LOW RESOLUTION, he tutkivat EIF3:n DIFFERENT DOMAINSIA JA yliilmaisuja TAI KOSKEVAT KOSKEVAT KÄYTTÖJÄRJESTELMÄT MUIDEN KÄYTTÖJÄRJESTELMÄN JA HYVÄKSYNNÄN HYVÄKSYTTÄMÄN HYVÄKSYTTÄMÄN. TILINTARKASTUSTUOMIOISTUIN NOUDATTAA SAMANLAISTA LÄHESTYMISTAPAA SAADAKSEEN RAKENNETIETOJA EIR4F:STÄ. MONITEKIJÄKOMPLEKSIN (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) SUUREN KOON VUOKSI KÄYTÄMME YKSITTÄISIÄ HIUKKASEMEJÄ SEN RAKENTEEN MÄÄRITTÄMISEKSI. KÄYTÄMME ENSIN NEGATIIVISIA TAHRATEKNIIKOITA JA MYÖHEMMIN KRYO-EM. LISÄKSI TUTKIMME EIF3-EIR4F-KOMPLEKSIN SOVELTUVUUTTA RAKENTEELLISEN MÄÄRITTÄMISEN TAVOITTEEKSI, JOS PYSTYMME MUODOSTAMAAN VAKAAN KOMPLEKSIN. LOPUKSI AION OLLA MUKANA EDISTÄMÄÄN JA KEHITTÄMÄÄN YKSITTÄISIÄ HIUKKASEMEJÄ VALENCIA.THIS ON ERITTÄIN TEHOKAS TEKNIIKKA, JOKA VOI OLLA RATKAISEVAN TÄRKEÄÄ MENESTYKSEKKÄÄN TUTKIMUKSEN MONIEN MUIDEN ERI RYHMIEN (Finnish)
17 August 2022
0 references
IT-TRADUZZJONI TISTA’ TINQASAM BEJN WIEĦED U IEĦOR FI TLIET STADJI: IL-BIDU, IT-TITWIL U T-TERMINAZZJONI. IL-BIDU TAT-TRADUZZJONI KANONIKA FL-EWKARJOTI JISTA’ JIĠI SUDDIVIŻ UKOLL FI TMIEN STADJI LI JINVOLVU DIVERSI KUMPLESSI BEJN IS-SUBUNITAJIET TAR-RIBOSOMA U L-FATTURI DIFFERENTI TA’ BIDU (EIFS). HEMM (MILL-INQAS) TNAX TA’ FATTURI TA’ BIDU, LI MINNHOM L-AKTAR KUMPLESSI HUMA L-FEI3, L-EIF4F U L-FEI2. FILWAQT LI L-FEI4F U L-FEI2 HUMA PROTEINI ETEROTRIMERIĊI, L-EIF3 HUWA MAGĦMUL MINN 6 SUBUNITAJIET DIFFERENTI F’SACCHAROMYCES CEREVISIAE U MINN 13-IL SUBUNITÀ FIL-MAMMIFERI. _x000D_ proteina SYNTHESIS IS PROĊESS KONTROLLED HIGHLY. FIL-FATT, ID-DEREGOLAMENTAZZJONI TAL-BIDU TAT-TRADUZZJONI FIL-BNEDMIN ASSOĊJATA MA’ ĦAFNA MARD, INKLUŻ IL-KANĊER. PEREŻEMPJU, L-ASSEMBLEA/L-ATTIVITÀ TAL-FEI4F, U TAL-KUMPLESSI TAL-FEI2 U TAL-FEI3 HIJA RREGOLATA B’MOD QAWWI MIS-SINJALAR TA’ ROTOT LI HUMA INVOLUTI FL-IŻVILUPP TAL-KANĊER U ĦAFNA DRABI HUMA ESPRESSI ŻŻEJJED FIL-KANĊER TAL-BNIEDEM, U DAN JAGĦTI INTERESS PRATTIKU GĦALL-FEHIM TA’ DAWN IL-FUNZJONIJIET TAL-FEIS. MATUL IL-PERJODU POSTDOTTORAT TIEGĦI FIL-LABORATORJU VENKI RAMAKRISHNAN., FIL-MRC-LMB (CAMBRIDGE), I KKONTRIBWEW GĦAL FEHIM AĦJAR TAL-BIDU TAT-TRADUZZJONI. IL-KARATTERIZZAZZJONI TA’ KULL WIEĦED MILL-ISTADJI DIFFERENTI KIENET TIDDEPENDI FUQ L-INSIB TA’ STATI FUNZJONALI TRANŻITORJI PARTIKOLARI TA’ PROĊESS DINAMIKU ĦAFNA. DAWN L-ASSEMBLAĠĠI MAKROMOLEKULARI HUMA KBAR U ETEROĠENI U AĦNA TGĦALLIMNA U UŻAJNA CRYO-EM B’PARTIKOLA WAĦDA BIEX NIKSBU XI INFORMAZZJONI STRUTTURALI MINNHOM. MADANKOLLU U MINKEJJA D-DETERMINAZZJONI REĊENTI TA’ DAWN L-ISTRUTTURI U D-DISPONIBBILTÀ TA’ INFORMAZZJONI STRUTTURALI GĦAL XI FATTURI TA’ BIDU EWKARJOTIĊI, IL-FUNZJONIJIET TA’ DAWN IL-FATTURI KOLLHA TA’ BIDU GĦADHOM MHUMIEX MIFHUMA SEW, L-AKTAR MINĦABBA N-NUQQAS TA’ INFORMAZZJONI STRUTTURALI DETTALJATA GĦAL PARTIJIET IMPORTANTI TA’ DAWN IL-FATTURI U TAL-KUMPLESSI FFURMATI BEJNIETHOM. B’MOD PARTIKOLARI, IKUN IMPORTANTI ĦAFNA LI TIĠI DDETERMINATA L-ISTRUTTURA TAL-FEI SĦIĦ3, L-AKTAR KUMPLESS TAL-FEIS U MIRA IMPORTANTI GĦAR-REGOLAMENTAZZJONI, U L-ISTRUTTURI TAL-KUMPLESSI TAL-FEI3 B’MIRI IMPORTANTI OĦRA GĦAR-REGOLAMENTAZZJONI BĦALL-FEI4F, IL-FEI2, IL-FEI5 U L-FEI1. SABIEX NAGĦMEL DAN, GĦANDI L-INTENZJONI LI JIKKOMBINAW X-RAY CRYSTALLOGRAPHY U CRYO-EM BIEX JIĊĊARAW DAWN L-ISTRUTTURI, LI JITFA ‘DAWL FUQ XI ASPETTI PARTIKOLARI TA’ BIDU TA ‘TRADUZZJONI FL-EWKARJOTI, U TWITTI T-TRIQ GĦAL FEHIM MEKKANISTIKU TA’ KIF IL-PROĊESS JISTA ‘JIĠI RREGOLAT. Dan il-KNOWLEDGE CAN PROVIDE U MINGĦAJR STRATEĠIJA GĦALL-KOMPLIŻI TAGĦRIF LI JIKKUNSIDRAW LI GĦANDHOM JIEĦDU DEVELOPMENT TA’ TRATTAMENT TA’ ANTI-Tumorali POSSIBLE, KIF GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM IŻVILUPP TA’ ANTIBIOTICS U ANTIVIRALS._x000D_ FUQ IL-MAPS TA’ CRYO-EM GĦALL-MASLUZZJONI TA’ LOW, WE FIL-KONSTRAT SEVERALI TAL-DIFFERENTI DIFFERENT DOMAINS TAL-FEI3 U esprimi żżejjed jew CO-EXPRESS tagħhom TOGETHER WITH FEI OĦRA jew PARTIJIET TAGĦHOM fis-sistemi eterologi u x-x’aktarx CARRY OUT X-RAY CRYSTALLISAZZJONI TRIALS WITH THEM. AĦNA SE NSEGWU APPROĊĊ SIMILI BIEX NIKSBU INFORMAZZJONI STRUTTURALI TAL-FEI4F. MINĦABBA D-DAQS KBIR TAL-KUMPLESS B’ĦAFNA FATTURI (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) SE NUŻAW EM TA’ PARTIĊELLA WAĦDA BIEX NIDDETERMINAW L-ISTRUTTURA TIEGĦU. AĦNA L-EWWEL SE JUŻAW TEKNIKI TEBGĦA NEGATTIVI U AKTAR TARD FUQ CRYO-EM. BARRA MINN HEKK, SE NESPLORAW L-ADEGWATEZZA TAL-KUMPLESS TAL-FEI3-EIF4F BĦALA MIRA GĦAL DETERMINAZZJONI STRUTTURALI PERMEZZ TA’ EM JEKK INKUNU NISTGĦU NIFFURMAW KUMPLESS STABBLI. FL-AĦĦAR NETT, I SE JKUNU INVOLUTI FIL-PROMOZZJONI U L-IŻVILUPP EM PARTIĊELLA WAĦDA FIL VALENCIA.THIS HIJA TEKNIKA QAWWIJA ĦAFNA LI JISTGĦU JKUNU KRUĊJALI GĦAS-SUĊĊESS TAR-RIĊERKA LI GĦADDEJJA TA ‘ĦAFNA GRUPPI DIFFERENTI OĦRA (Maltese)
17 August 2022
0 references
TULKOJUMU VAR APTUVENI IEDALĪT TRĪS POSMOS: UZSĀKŠANA, PAGARINĀŠANA UN IZBEIGŠANA. KANONISKĀS TULKOŠANAS INICIĀCIJU EUKARYOTES VAR IEDALĪT ASTOŅOS POSMOS, KAS IETVER VAIRĀKUS KOMPLEKSUS STARP RIBOSOMU SUBVIENĪBĀM UN DAŽĀDIEM INICIĒŠANAS FAKTORIEM (EIFS). PASTĀV (VISMAZ) DESMITI UZSĀKŠANAS FAKTORU, NO KURIEM VISSAREŽĢĪTĀKIE IR EIF3, EIF4F UN EIF2. LAI GAN EIF4F UN EIF2 IR HETEROTRIMĒRI PROTEĪNI, EIF3 SASTĀV NO SEŠĀM DAŽĀDĀM SACCHAROMYCES CEREVISIAE APAKŠVIENĪBĀM UN 13 APAKŠVIENĪBĀM ZĪDĪTĀJIEM. _x000D_ proteīns SYNTHESIS ir ļoti KONTROLĒTA PROCESS. PATIESĪBĀ, TULKOŠANAS UZSĀKŠANAS IEROBEŽOJUMU ATCELŠANA CILVĒKIEM, KAS SAISTĪTI AR DAUDZĀM SLIMĪBĀM, TOSTARP VĒZI. PIEMĒRAM, EIF4F, KĀ ARĪ EIF2 UN EIF3 KOMPLEKSU ASAMBLEJU/AKTIVITĀTI STINGRI REGULĒ SIGNĀLCEĻI, KAS IR IESAISTĪTI VĒŽA ATTĪSTĪBĀ UN BIEŽI VIEN IR PĀRMĒRĪGI IZTEIKTI CILVĒKU VĒŽA GADĪJUMĀ, TĀDĒJĀDI RADOT PRAKTISKU INTERESI PAR ŠO EIFS FUNKCIJU IZPRATNI. PĒCDOKTORANTŪRAS LAIKĀ VENKI RAMAKRISHNAN LABORATORIJĀ, MRC-LMB (CAMBRIDGE), ESMU VEICINĀJIS LABĀKU IZPRATNI PAR TULKOŠANAS UZSĀKŠANU. KATRA NO DAŽĀDAJIEM POSMIEM RAKSTUROŠANA BIJA ATKARĪGA NO ĻOTI DINAMISKA PROCESA KONKRĒTU PĀREJOŠU FUNKCIONĀLO VALSTU IESPROSTOŠANAS. ŠIE MAKROMOLEKULĀRIE MEZGLI IR LIELI UN NEVIENDABĪGI, UN MĒS UZZINĀJĀM UN IZMANTOJĀM VIENU DAĻIŅU KRIOEM, LAI IEGŪTU KĀDU STRUKTURĀLU INFORMĀCIJU PAR TIEM. TOMĒR, NERAUGOTIES UZ ŠO STRUKTŪRU NESENO NOTEIKŠANU UN STRUKTURĀLĀS INFORMĀCIJAS PIEEJAMĪBU DAŽIEM EIKARIOTISKĀS INICIĒŠANAS FAKTORIEM, VISU ŠO INICIĀCIJAS FAKTORU FUNKCIJAS JOPROJĀM NAV LABI IZPRASTAS, GALVENOKĀRT TĀPĒC, KA TRŪKST DETALIZĒTAS STRUKTURĀLAS INFORMĀCIJAS PAR SVARĪGĀM ŠO FAKTORU DAĻĀM UN STARP TIEM IZVEIDOTAJIEM KOMPLEKSIEM. JO ĪPAŠI BŪTU ĻOTI SVARĪGI NOTEIKT PILNĪGU EIF3 STRUKTŪRU, EIFS VISSAREŽĢĪTĀKO STRUKTŪRU UN SVARĪGU REGULĒJUMA MĒRĶI, KĀ ARĪ EIF3 KOMPLEKSU STRUKTŪRU AR CITIEM SVARĪGIEM REGULAS MĒRĶIEM, PIEMĒRAM, EIF4F, EIF2, EIF5 UN EIF1. LAI TO IZDARĪTU, ES PLĀNOJU APVIENOT RENTGENA KRISTALOGRĀFIJAS UN KRIO-EM, LAI IZSKAIDROTU ŠĪS STRUKTŪRAS, KAS IZGAISMOTU DAŽUS KONKRĒTUS TULKOŠANAS UZSĀKŠANAS ASPEKTUS EUKARYOTES, UN BRUĢĒTU CEĻU MEHĀNISKAI IZPRATNEI PAR TO, KĀ ŠO PROCESU VAR REGULĒT. Šis ZINĀŠANAS CAN PROVIDE US AR STRATĒĢIJU TARGETING SOME COMPLEXES, kas var būt KAN KAN KAN KANDIDĀTI PASĀKUMI ANTI-tumorālajiem TREATMENTS, AS PELL AS DEVELOPMENT of ANTIBIOTITICS UN ANTIVIRALS._x000D_ BASED par mūsu PREVIOUS CRYO-EM MAPS LOW RESOLUTION, mēs Būs DESIGN SEVERAL CONSTRUCTS of DIFFERENT DOMAINS of EIF3 un overexpress vai CO-EXPRESS THEM TOGETHER ar citiem EIFS vai to daļām heterologos SYSTEMS un BŪS CARRY OUT X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS ar tiem. MĒS IEVĒROSIM LĪDZĪGU PIEEJU, LAI IEGŪTU STRUKTURĀLO INFORMĀCIJU PAR EIF4F. ŅEMOT VĒRĀ DAUDZFAKTORU KOMPLEKSA LIELO IZMĒRU (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2), MĒS IZMANTOSIM VIENU DAĻIŅU EM, LAI NOTEIKTU TĀ STRUKTŪRU. MĒS VISPIRMS IZMANTOSIM NEGATĪVĀS TRAIPU METODES UN VĒLĀK KRIOEM. TURKLĀT MĒS IZPĒTĪSIM, VAI EIF3-EIF4F KOMPLEKSS IR PIEMĒROTS STRUKTURĀLĀS NOTEIKŠANAS MĒRĶIM, JA MĒS SPĒSIM IZVEIDOT STABILU KOMPLEKSU. VISBEIDZOT, ES BŪŠU IESAISTĪTS, LAI VEICINĀTU UN ATTĪSTĪTU VIENU DAĻIŅU EM IN VALENCIA.THIS IR ĻOTI SPĒCĪGS PAŅĒMIENS, KAS VAR BŪT IZŠĶIROŠA, LAI GŪTU PANĀKUMUS NOTIEKOŠO PĒTĪJUMU DAUDZĀS CITĀS DAŽĀDĀS GRUPĀS (Latvian)
17 August 2022
0 references
PREKLAD MOŽNO ZHRUBA ROZDELIŤ DO TROCH ETÁP: ZAČATIE, PREDĹŽENIE A UKONČENIE. INICIÁCIA KÁNONICKÉHO PREKLADU V EUKARYOTOCH MÔŽE BYŤ ROZDELENÁ AJ DO ÔSMICH ETÁP ZAHŔŇAJÚCICH NIEKOĽKO KOMPLEXOV MEDZI RIBOZOMÁLNYMI PODJEDNOTKAMI A RÔZNYMI INICIAČNÝMI FAKTORMI (EIFS). EXISTUJE (ASPOŇ) TUCET INICIAČNÝCH FAKTOROV, Z KTORÝCH NAJZLOŽITEJŠIE SÚ EIF3, EIF4F A EIF2. ZATIAĽ ČO EIF4F A EIF2 SÚ HETEROTRIMERICKÉ BIELKOVINY, EIF3 SA SKLADÁ ZO 6 RÔZNYCH PODJEDNOTIEK V SACCHAROMYCES CEREVISIAE A Z 13 PODJEDNOTIEK U CICAVCOV. _x000D_ proteín SYNTHESIS je VYSOKÝ KONTROLY PROCESS. V SKUTOČNOSTI, DEREGULÁCIA PREKLADU INICIÁCIE U ĽUDÍ V SPOJENÍ S MNOHÝMI CHOROBAMI, VRÁTANE RAKOVINY. NAPRÍKLAD ZHROMAŽDENIE/ČINNOSŤ EIF4F A KOMPLEXOV EIF2 A EIF3 JE SILNE REGULOVANÁ SIGNALIZAČNÝMI DRÁHAMI, KTORÉ SA PODIEĽAJÚ NA VÝVOJI RAKOVINY A SÚ ČASTO NADMERNE EXPRESÍVNE PRI RAKOVINE ĽUDÍ, ČO DÁVA PRAKTICKÝ ZÁUJEM O POCHOPENIE TÝCHTO FUNKCIÍ EIFS. POČAS MÔJHO POSTDOKTORANDSKÉHO OBDOBIA V LABORATÓRIU VENKI RAMAKRISHNAN., V MRC-LMB (CAMBRIDGE), PRISPEL SOM K LEPŠIEMU POCHOPENIU PREKLADOVEJ INICIÁCIE. CHARAKTERIZÁCIA KAŽDEJ Z RÔZNYCH ETÁP ZÁVISELA OD ZACHYTENIA URČITÝCH PRECHODNÝCH FUNKČNÝCH STAVOV VYSOKO DYNAMICKÉHO PROCESU. TIETO MAKROMOLEKULOVÉ ZOSTAVY SÚ VEĽKÉ A HETEROGÉNNE A MY SME SA NAUČILI A POUŽILI JEDNO-ČASTICOVÝ KRYO-EM, ABY SME O NICH ZÍSKALI NEJAKÉ ŠTRUKTURÁLNE INFORMÁCIE. NAPRIEK NEDÁVNEMU URČENIU TÝCHTO ŠTRUKTÚR A DOSTUPNOSTI ŠTRUKTURÁLNYCH INFORMÁCIÍ O NIEKTORÝCH EUKARYOTICKÝCH INICIAČNÝCH FAKTOROCH VŠAK FUNKCIE VŠETKÝCH TÝCHTO INICIAČNÝCH FAKTOROV STÁLE NIE SÚ DOBRE POCHOPENÉ, A TO NAJMÄ Z DÔVODU NEDOSTATKU PODROBNÝCH ŠTRUKTURÁLNYCH INFORMÁCIÍ O DÔLEŽITÝCH ČASTIACH TÝCHTO FAKTOROV A KOMPLEXOV, KTORÉ SA MEDZI NIMI VYTVORILI. PREDOVŠETKÝM BY BOLO VEĽMI DÔLEŽITÉ URČIŤ ŠTRUKTÚRU KOMPLETNÉHO EIF3, NAJKOMPLEXNEJŠIEHO EIFS A DÔLEŽITÉHO CIEĽA PRE NARIADENIE, A ŠTRUKTÚRY KOMPLEXOV EIF3 S ĎALŠÍMI DÔLEŽITÝMI CIEĽMI PRE NARIADENIE, AKO SÚ EIF4F, EIF2, EIF5 A EIF1. ABY SOM TO MOHOL UROBIŤ, MÁM V ÚMYSLE KOMBINOVAŤ RÖNTGENOVÚ KRYŠTALOGRAFIU A KRYO-EM S CIEĽOM OBJASNIŤ TIETO ŠTRUKTÚRY, KTORÉ BY OSVETLILI NIEKTORÉ KONKRÉTNE ASPEKTY PREKLADATEĽSKEJ INICIÁCIE V EUKARYOTÁCH A PRIPRAVILI PÔDU PRE MECHANISTICKÉ POCHOPENIE TOHO, AKO MOŽNO TENTO PROCES REGULOVAŤ. Toto VEDOMIE MÔŽU POSTUPY STRATEGOU na TARGETING SOME COMPLEXES, ktoré môžu byť kandidátmi pre rozvoj POSSIBLE ANTItumorálnych úprav, ktoré by mohli byť založené na vývoji ANTIBIOTICKOV a ANTIVIRALS._x000D_ BASED NA NAŠE PREVIOUS CRYO-EM MAPS NA LOW RESOLUTION, boli by navrhnuté osobitné konštrikty z DIFFERENT DOMAINS OF EIF3 A príliš expresné alebo CO-EXPRESS THE TOTHERERERERERERERER S ĎALŠIEMI EIFmi alebo ich časťami v heterológnych systémoch a budú sa starať o X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS s nimi. PODOBNÝ PRÍSTUP BUDEME UPLATŇOVAŤ PRI ZÍSKAVANÍ ŠTRUKTURÁLNYCH INFORMÁCIÍ O EIF4F. VZHĽADOM NA VEĽKÚ VEĽKOSŤ MULTIFAKTOROVÉHO KOMPLEXU (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) POUŽIJEME NA URČENIE JEHO ŠTRUKTÚRY JEDNOTLIVÉ ČASTICE EM. NAJPRV POUŽIJEME NEGATÍVNE TECHNIKY FARBENIA A NESKÔR NA KRYO-EM. OKREM TOHO PRESKÚMAME VHODNOSŤ KOMPLEXU EIF3-EIF4F AKO CIEĽA ŠTRUKTURÁLNEHO URČENIA EM, AK DOKÁŽEME VYTVORIŤ STABILNÝ KOMPLEX. NAKONIEC SA BUDEM PODIEĽAŤ NA PROPAGÁCII A VÝVOJI JEDNOČASTICOVÉHO EM VO VALENCIA.THIS JE VEĽMI VÝKONNÁ TECHNIKA, KTORÁ MÔŽE BYŤ ROZHODUJÚCA PRE ÚSPECH PREBIEHAJÚCEHO VÝSKUMU MNOHÝCH ĎALŠÍCH RÔZNYCH SKUPÍN. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS FÉIDIR AN T-AISTRIÚCHÁN A ROINNT, A BHEAG NÓ A MHÓR, I DTRÍ CHÉIM: TIONSCNAMH, FADÚ AGUS FOIRCEANNADH. IS FÉIDIR TIONSCNAMH AISTRIÚCHÁIN CANÓNACHA IN EUKARYOTES A FHOROINNT CHOMH MAITH LE HOCHT GCÉIM INA BHFUIL ROINNT COIMPLÉISC IDIR NA FO-AONAID EASÓIDEACHA AGUS NA FACHTÓIRÍ TIONSCNAIMH ÉAGSÚLA (EIFS). TÁ DOSAEN FACHTÓIRÍ TIONSCNAIMH ANN (AR A LAGHAD), ARB IAD CEI3, CEI4F AGUS CEI2 AN CEANN IS CASTA DÍOBH. CÉ GUR PRÓITÉINÍ HEITREATRIMÉIREACHA IAD EIF4F AGUS EIF2, TÁ EIF3 COMHDHÉANTA DE 6 FHO-AONAD ÉAGSÚLA IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE AGUS DE 13 FHO-AONAD I MAMAIGH. tá _x000D_ próitéine SYNTHESIS A RIALÚ go han-mhaith. GO DEIMHIN, DÍRIALÁIL TIONSCNAIMH AISTRIÚCHÁIN I NDAOINE A BHAINEANN LE GO LEOR GALAR, LENA N-ÁIRÍTEAR AILSE. MAR SHAMPLA, DÉANTAR TIONÓL/GNÍOMHAÍOCHT DE CHUID EIF4F, AGUS COIMPLÉISC CEI2 AGUS EIF3 A RIALÚ GO LÁIDIR TRÍ CHONAIRÍ COMHARTHAÍOCHTA A BHFUIL BAINT ACU LE FORBAIRT AILSE AGUS A NDÉANTAR RÓ-LÉIRIÚ ORTHU GO MINIC IN AILSÍ DAONNA, RUD A THUGANN SPÉIS PHRAITICIÚIL DO THUISCINT NA BHFEIDHMEANNA SIN DE CHUID EIFS. LE LINN MO THRÉIMHSE IARDHOCHTÚIREACHTA I SAOTHARLANN VENKI RAMAKRISHNAN, AG MRC-LMB (CAMBRIDGE), CHUIR MÉ LE TUISCINT NÍOS FEARR AR THIONSCNAMH AISTRIÚCHÁIN. BHÍ TRÉITHRIÚ GACH CEANN DE NA CÉIMEANNA ÉAGSÚLA AG BRATH AR STÁIT FHEIDHMIÚLA NEAMHBHUAN AR LEITH DE PHRÓISEAS AN-DINIMICIÚIL A GHAISTEÁIL. TÁ NA TIONÓIL MHACRA-MHÓILÍNEACHA SEO MÓR AGUS ILCHINEÁLACH AGUS D’FHOGHLAIM MUID AGUS D’ÚSÁID MUID CRYO-EM AON-CÁITHNÍN CHUN ROINNT FAISNÉISE STRUCHTÚRAÍ DÍOBH A FHÁIL. MAR SIN FÉIN, IN AINNEOIN AN CHINNIDH A RINNEADH LE DÉANAÍ MAIDIR LEIS NA STRUCHTÚIR SIN AGUS MAIDIR LE HINFHAIGHTEACHT FAISNÉISE STRUCHTÚRAÍ LE HAGHAIDH ROINNT FACHTÓIRÍ TIONSCNAIMH EUKARYOTIC, NÍL TUISCINT MHAITH FÓS AR FHEIDHMEANNA NA BHFACHTÓIRÍ TIONSCNAIMH SIN GO LÉIR, GO PRÍOMHA MAR GHEALL AR EASPA FAISNÉISE STRUCHTÚRAÍ MIONSONRAITHE DO CHODANNA TÁBHACHTACHA DE NA TOSCA SIN AGUS DE NA COIMPLÉISC A CHRUTHAÍTEAR EATARTHU. GO HÁIRITHE, BHEADH SÉ THAR A BHEITH TÁBHACHTACH STRUCHTÚR CEI IOMLÁN A CHINNEADH3, AN STRUCHTÚR IS CASTA DE CEIANNA AGUS SPRIOC THÁBHACHTACH DON RIALACHÁN, AGUS STRUCHTÚIR COIMPLÉISC CEI3 LE SPRIOCANNA TÁBHACHTACHA EILE DON RIALACHÁN AMHAIL CEI4F, CEI2, CEI5 AGUS CEI1. D’FHONN É A DHÉANAMH, TÁ SÉ I GCEIST AGAM CRIOSTALAÍOCHT X-GHA AGUS CRYO-EM A CHUR LE CHÉILE CHUN NA STRUCHTÚIR SIN A SHOILÉIRIÚ, RUD A CHUIRFEADH SOLAS AR ROINNT GNÉITHE ÁIRITHE DE THIONSCNAMH AISTRIÚCHÁIN I EUKARYOTES, AGUS RÉITÍONN SÉ AN BEALACH DO THUISCINT MEICNÍOCH AR CONAS IS FÉIDIR AN PRÓISEAS A RIALÚ. Is é seo an t-údar atá leis an gClár seo le RÓGRAÍOCHTA chun sriantachtaí a thógáil agus a fhorbairt. _x000D_TAR ÉIS AR AN TÁIRGEADH CRYO-EM A CHUR AR AN TÁIRGE AR ANTIBIOTICS agus ANTIVIRALS._x000D_ atá ar fáil in Éirinn a fhorbairt. cé gurbh iad Avondale rogha na coitianta tháinig buachaillí GCM le plean agus chuireadar I bhfeidhm é. LEANFAIMID CUR CHUIGE DEN CHINEÁL CÉANNA CHUN FAISNÉIS STRUCHTÚRACH A FHÁIL FAOI CEI4F. MAR GHEALL AR MHÉID MÓR AN CHASTA ILFHACHTÓIRIGH (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) BAINFIMID ÚSÁID AS EM CÁITHNÍN AMHÁIN CHUN A STRUCHTÚR A CHINNEADH. BAINFIMID ÚSÁID AS TEICNÍCÍ STAIN DIÚLTACHA AR DTÚS AGUS NÍOS DÉANAÍ AR CRYO-EM. CHOMH MAITH LEIS SIN, DÉANFAIMID INIÚCHADH AR A OIRIÚNAÍ ATÁ COIMPLÉASC EIF3-EIF4F MAR SPRIOC DO CHINNEADH STRUCHTÚRACH TRÍ EM MÁS FÉIDIR LINN COIMPLÉASC COBHSAÍ A CHRUTHÚ. MAR FHOCAL SCOIR, BEIDH MÉ PÁIRTEACH I GCUR CHUN CINN AGUS A FHORBAIRT EM CÁITHNÍN AMHÁIN I VALENCIA.THIS IS TEICNÍC AN-CHUMHACHTACH IS FÉIDIR A BHEITH RÍTHÁBHACHTACH DO RATH AN TAIGHDE LEANÚNACH GRÚPAÍ ÉAGSÚLA EILE (Irish)
17 August 2022
0 references
PŘEKLAD LZE ZHRUBA ROZDĚLIT DO TŘÍ FÁZÍ: ZAHÁJENÍ, PRODLOUŽENÍ A UKONČENÍ. ZAHÁJENÍ KANONICKÉHO PŘEKLADU V EUKARYOTECH LZE ROZDĚLIT DO OSMI FÁZÍ ZAHRNUJÍCÍCH NĚKOLIK KOMPLEXŮ MEZI RIBOZOMÁLNÍ PODJEDNOTKY A RŮZNÝMI INICIAČNÍMI FAKTORY (EIFS). EXISTUJE (ALESPOŇ) TUCET INICIAČNÍCH FAKTORŮ, Z NICHŽ NEJSLOŽITĚJŠÍ JSOU EIF3, EIF4F A EIF2. ZATÍMCO EIF4F A EIF2 JSOU HETEROTRIMERICKÉ PROTEINY, EIF3 SE SKLÁDÁ ZE 6 RŮZNÝCH PODJEDNOTEK V SACCHAROMYCES CEREVISIAE A ZE 13 PODJEDNOTEK U SAVCŮ. _x000D_ protein SYNTHESIS JE HIGHLY CONTROLLED PROCESS. DEREGULACE INICIACE PŘEKLADU U LIDÍ V SOUVISLOSTI S MNOHA NEMOCEMI, VČETNĚ RAKOVINY. NAPŘÍKLAD MONTÁŽ/ČINNOST EIF4F A KOMPLEXŮ EIF2 A EIF3 JE SILNĚ REGULOVÁNA SIGNALIZACÍ CEST, KTERÉ SE PODÍLEJÍ NA VÝVOJI RAKOVINY A JSOU ČASTO NADMĚRNĚ VYJADŘOVÁNY U LIDSKÝCH NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ, COŽ DÁVÁ PRAKTICKÝ ZÁJEM O POCHOPENÍ TĚCHTO FUNKCÍ EIFS. BĚHEM MÉHO POSTDOKTORANDSKÉHO OBDOBÍ V LABORATOŘI VENKI RAMAKRISHNAN., NA MRC-LMB (CAMBRIDGE), JSEM PŘISPĚL K LEPŠÍMU POCHOPENÍ INICIACE PŘEKLADU. CHARAKTERIZACE KAŽDÉ Z RŮZNÝCH FÁZÍ ZÁVISELA NA ZACHYCENÍ URČITÝCH PŘECHODNÝCH FUNKČNÍCH STAVŮ VYSOCE DYNAMICKÉHO PROCESU. TYTO MAKROMOLEKULÁRNÍ SESTAVY JSOU VELKÉ A HETEROGENNÍ A MY JSME SE NAUČILI A POUŽILI JEDNOČÁSTICOVÝ KRYOEM K ZÍSKÁNÍ NĚKTERÝCH STRUKTURNÍCH INFORMACÍ O NICH. NAVZDORY NEDÁVNÉMU URČENÍ TĚCHTO STRUKTUR A DOSTUPNOSTI STRUKTURÁLNÍCH INFORMACÍ PRO NĚKTERÉ EUKARYOTICKÉ INICIAČNÍ FAKTORY VŠAK FUNKCE VŠECH TĚCHTO INICIAČNÍCH FAKTORŮ STÁLE NEJSOU DOBŘE POCHOPENY, ZEJMÉNA KVŮLI NEDOSTATKU PODROBNÝCH STRUKTURÁLNÍCH INFORMACÍ O DŮLEŽITÝCH ČÁSTECH TĚCHTO FAKTORŮ A KOMPLEXECH, KTERÉ MEZI NIMI VZNIKAJÍ. ZEJMÉNA BY BYLO VELMI DŮLEŽITÉ URČIT STRUKTURU ÚPLNÉHO EIF3, NEJSLOŽITĚJŠÍHO EIFS A DŮLEŽITÉHO CÍLE PRO REGULACI A STRUKTURY KOMPLEXŮ EIF3 S DALŠÍMI DŮLEŽITÝMI CÍLI PRO REGULACI, JAKO JSOU EIF4F, EIF2, EIF5 A EIF1. ZA TÍMTO ÚČELEM MÁM V ÚMYSLU SPOJIT RENTGENOVOU KRYSTALOGRAFII A KRYO-EM K OBJASNĚNÍ TĚCHTO STRUKTUR, KTERÉ BY OSVĚTLILY NĚKTERÉ KONKRÉTNÍ ASPEKTY INICIACE PŘEKLADU V EUKARYOTECH A PŘIPRAVILY CESTU K MECHANICKÉMU POCHOPENÍ TOHO, JAK MŮŽE BÝT PROCES REGULOVÁN. Tento VĚDOMÍ, že může být KANDIDATES pro rozvoj POSSIBLE A ANTIVIRALS._x000D_ Naše PREVIOUS CRYO-EM MAPS na LOW RESOLUTION budeme dělat SEVERAL CONSTRUCTS DIFFERENT DOMAINs of EIF3 a převyjádřit NEBO CO-EXPRESS, které jsou s jinými EIFS nebo části těchto v heterologních SYSTEMS a budeme se starat o X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS s nimi. PODOBNÝ PŘÍSTUP BUDEME POSTUPOVAT PŘI ZÍSKÁVÁNÍ STRUKTURÁLNÍCH INFORMACÍ O EIF4F. VZHLEDEM K VELKÉ VELIKOSTI MULTIFAKTOROVÉHO KOMPLEXU (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) POUŽIJEME K URČENÍ JEHO STRUKTURY JEDNOTLIVÉ ČÁSTICE EM. NEJPRVE POUŽIJEME TECHNIKY NEGATIVNÍCH SKVRN A POZDĚJI KRYO-EM. KROMĚ TOHO PROZKOUMÁME VHODNOST KOMPLEXU EIF3-EIF4F JAKO CÍLE PRO STRUKTURÁLNÍ STANOVENÍ EM, POKUD BUDEME SCHOPNI VYTVOŘIT STABILNÍ KOMPLEX. NAKONEC SE BUDU PODÍLET NA PODPOŘE A VÝVOJI JEDINÉ ČÁSTICE EM VE VALENCIA.THIS JE VELMI VÝKONNÁ TECHNIKA, KTERÁ MŮŽE BÝT ZÁSADNÍ PRO ÚSPĚCH PROBÍHAJÍCÍHO VÝZKUMU MNOHA DALŠÍCH RŮZNÝCH SKUPIN (Czech)
17 August 2022
0 references
A tradução pode ser dividida em três fases: INÍCIO, ELONGAÇÃO E ENCERRAMENTO. A INICIAÇÃO DA TRADUÇÃO CANÓNICA EM EUCARIÓTESES PODE SER SUBDIVIDA BEM COMO EM OITAS FASES QUE ENVOLVEM VÁRIOS COMPLEXOS ENTRE AS SUBUNIDADES RIBOSÓMICAS E OS DIFERENTES FATORES DE INICIAÇÃO (EIFS). EXISTEM (pelo menos) FATORES DE INÍCIO, DOS QUAIS OS MAIS COMPLEXOS SÃO O EIF3, O EIF4F E O EIF2. Enquanto o EIF4F e o EIF2 são PROTEÍNAS HETEROTRIMÉRICAS, o EIF3 é composto por 6 SUBUNIDADES DIFERENTES EM SACHAROMYCES CEREVISIAE E 13 SUBUNIDADES EM MAMAIS. _x000D_ A SÍNTESE DE PROTEÍNAS É UM PROCESSO ALTAMENTE CONTROLADO. Na realidade, DEREGULAMENTO DA INICIAÇÃO À TRADUÇÃO EM PESSOAS ASSOCIADAS A MUITAS DOENÇAS, INCLUINDO O CANCRO. POR EXEMPLO, A ASSEMBLEIA/ACTIVIDADE DO FEI4F, E DOS COMPLEXOS DO FEI2 E DO FEI3 ESTÁ FORTEMENTE REGULAMENTADA POR SINALIZAÇÃO DE VIAS ENVOLVIDAS NO DESENVOLVIMENTO CANCRO E MUITAS vezes SUPEREXPRESSIONADAS EM CANCERROS HUMANOS, O QUE DÁ INTERESSE PRÁTICO À COMPREENSAÇÃO DAS FUNÇÕES DO FEI. Durante o meu período pós-doutoral no VENKI RAMAKRISHNAN LAB., no MRC-LMB (CAMBRIDGE), contribuí para um melhor entendimento da iniciação à tradução. A CARACTERIZAÇÃO DE CADA UMA DAS DIFERENTES FASES PREVISTAS NO TRAPPING DE ESTADOS FUNCIONAIS TRANSITÁRIOS ESPECÍFICOS DE UM PROCESSO ALTAMENTE DINÂMICO. Estes conjuntos macromoleculares são grandes e heterogéneos e nós aprendemos e usámos crivos de uma só peça para obter algumas informações estruturais sobre eles. No entanto, e apesar da determinação recente destas estruturas e da disponibilidade de informações estruturais para alguns dispositivos de iniciação EUCARIÓTICA, as funções de todos estes dispositivos de iniciação ainda não são bem compreendidas, principalmente devido à falta de informações estruturais pormenorizadas para partes importantes destes dispositivos e dos componentes previstos entre eles. Nomeadamente, seria muito importante determinar a estrutura do QEI completo3, o mais completo dos QEI e uma meta importante para a regulamentação, bem como as estruturas dos QEI com outras metas importantes para a regulamentação, como o QEI, o QEI2, o QEI5 e o QEI1. A fim de o fazer, tenciono combinar a CRISTALLOGRAFIA DE RAIO X e o CRIO-ME para eleger estas estruturas, que deveriam iluminar alguns aspectos específicos da iniciação à tradução nos EUKARYOTES, e preparar o caminho para um entendimento mecanístico sobre a forma como o processo pode ser regulável. Este conhecimento pode fornecer-nos uma estratégia para o desenvolvimento de alguns componentes que podem ser candidatos para o desenvolvimento de possíveis tratamentos anti-tumorais, bem como para o desenvolvimento de antibióticos e antivirais._x000D_ Com base em nossos anteriores CRYO-EM MAPS em baixa resolução, vamos conceber vários conjuntos de diferentes domíns de EIF3 e superexpresença ou co-expresença eles em conjunto com outros EIFs ou partes deles em sistemas heterológicos e vamos realizar testes de cristalização X-RAY com eles. Seguiremos uma abordagem semelhante para obter informações estruturais sobre o EIF4F. DADA A GRANDE DIMENSÃO DO COMPLEXO MULTIFACTOR (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) Iremos UTILIZAR UMA PARTICULAÇÃO ÚNICA EM PARA DETERMINAR A SUA ESTRUTURA. Vamos usar pela primeira vez técnicas de retenção ineficazes e, mais tarde, crio-eles. Além disso, exploraremos a adequação do COMPLEXO EIF3-EIF4F como um objetivo para a determinação estrutural pelo EM, se formos capazes de formar um COMPLEXO ESTÁVEL. Finalmente, serei envolvido na promoção e desenvolvimento de uma única parte na Valência.Esta é uma técnica muito poderosa que pode ser crucial para o sucesso da investigação em curso de muitos outros grupos diferentes. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
TÕLKIMINE JAGUNEB LAIAS LAASTUS KOLMEKS ETAPIKS: ALGATAMINE, PIKENEMINE JA LÕPETAMINE. KANOONILISE TÕLKE ALUSTAMISE EUKARÜOOTIDEL VÕIB JAGADA KAHEKSAKS ETAPIKS, MIS HÕLMAVAD MITUT KOMPLEKSI RIBOSOOMIDE ALLÜKSUSTE JA ERINEVATE INITSIEERIMISTEGURITE VAHEL. ON OLEMAS (VÄHEMALT) TOSIN ALGATAMISTEGURIT, MILLEST KÕIGE KEERULISEMAD ON EIF3, EIF4F JA EIF2. KUIGI EIF4F JA EIF2 ON HETEROTRIMEERILISED VALGUD, KOOSNEB EIF3 SACCHAROMYCES CEREVISIAE KUUEST ALLÜKSUSEST JA 13 ALLÜKSUSEST IMETAJATEL. _x000D_ valk SYNTHESIS on KÕRGUD PROCESS. TEGELIKULT DEREGULEERIMINE TRANSLATSIOONI ALGATAMISE INIMESTEL SEOTUD PALJUDE HAIGUSTE, SEALHULGAS VÄHK. NÄITEKS EIF4FI NING EIF2 JA EIF3 KOMPLEKSIDE ASSAMBLEED/TEGEVUS ON TUGEVALT REGULEERITUD MÄRGUANNETEGA, MIS ON SEOTUD VÄHI ARENEMISEGA JA MIDA SAGELI ÜLEVÄLJENDATAKSE INIMESTE VÄHIVORMIDES, ANDES PRAKTILISE HUVI NENDE EIFSI FUNKTSIOONIDE MÕISTMISEKS. AJAL MINU JÄRELDOKTORI PERIOODIL VENKI RAMAKRISHNAN LAB., KELL MRC-LMB (CAMBRIDGE), OLEN AIDANUD PAREMINI MÕISTA TÕLKE ALGATAMISE. IGA ETAPI ISELOOMUSTAMINE SÕLTUS VÄGA DÜNAAMILISE PROTSESSI KONKREETSETE AJUTISTE FUNKTSIONAALSETE RIIKIDE PÜÜDMISEST. NEED MAKROMOLEKULAARSED KOOSTUD ON SUURED JA HETEROGEENSED NING ME ÕPPISIME JA KASUTASIME ÜHEOSAKESTE KRÜO-EM-D, ET SAADA NENDE KOHTA STRUKTUURITEAVET. HOOLIMATA NENDE STRUKTUURIDE HILJUTISEST KINDLAKSMÄÄRAMISEST JA STRUKTUURITEABE KÄTTESAADAVUSEST MÕNEDE EUKARÜOOTSETE INITSIATIIVTEGURITE KOHTA, EI OLE KÕIGI NENDE ALGATAMISTEGURITE FUNKTSIOONID IKKA VEEL HÄSTI MÕISTETAVAD, PEAMISELT SEETÕTTU, ET PUUDUB ÜKSIKASJALIK STRUKTUURITEAVE NENDE TEGURITE OLULISTE OSADE JA NENDE VAHEL MOODUSTUNUD KOMPLEKSIDE KOHTA. EELKÕIGE OLEKS VÄGA OLULINE MÄÄRATA KINDLAKS TÄIELIKU EIFI STRUKTUUR,3 MIS ON EIFI KÕIGE KEERULISEM JA OLULINE MÄÄRUSE EESMÄRK, NING EIF3 KOMPLEKSIDE STRUKTUURID KOOS MUUDE OLULISTE MÄÄRUSE EESMÄRKIDEGA, NAGU EIF4F, EIF2, EIF5 JA EIF1. ET SEDA TEHA, KAVATSEN KOMBINEERIDA RÖNTGENKRISTALLOGRAAFIA JA KRÜO-EM SELGITADA NEID STRUKTUURE, MIS HEIDAKS VALGUST MÕNED KONKREETSED ASPEKTID TÕLKE ALGATAMISE EUKARYOTES, JA SILLUTADA TEED MEHHAANILINE ARUSAAM, KUIDAS PROTSESSI SAAB REGULEERIDA. See KASUTAMINE KASUTATAKSE STRATEGY STRATEGY STRATEGY STRATEGY STRATEGY STRATEGY STRATEGY KASUTAMISE KOHTUASI KASUTATAVAD KOHUSTUSED POSSIBILE-kasvanute arenguks, VÄLJAVÕTJAD JA ANTIVIRALSID._x000D_BASED OUR PREVIOUS CRYO-EM MAPS LOW RESOLUTSIOON, MIDA DESIGN SEVERALALITE CONSTRUCTSID DIFFERENT DOMAINS of EIF3 JA üleekspressioon VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI SEISUKOHAL SÜSTEEMISED JA VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI VÕI SEISUKOHE TÜSTEEMISED TRIALSID. JÄRGIME SARNAST LÄHENEMISVIISI, ET SAADA EIF4FI STRUKTUURILIST TEAVET. ARVESTADES MITMETEGURILISE KOMPLEKSI (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) SUURT SUURUST, KASUTAME SELLE STRUKTUURI MÄÄRAMISEKS ÜKSIKUID OSAKESI EM. ME KASUTAME KÕIGEPEALT NEGATIIVSEID PLEKITEHNIKAID JA HILJEM KRÜO-EMME. LISAKS UURIME EIF3-EIF4FI KOMPLEKSI SOBIVUST KUI EESMÄRKI STRUKTUURSEKS KINDLAKSMÄÄRAMISEKS, KUI SUUDAME MOODUSTADA STABIILSE KOMPLEKSI. LÕPUKS, MA OSALEN EDENDADA JA ARENDADA ÜHE OSAKESE EM VALENCIA.THIS ON VÄGA VÕIMAS TEHNIKA, MIS VÕIB OLLA OLULINE EDU KÄIMASOLEVA UURIMISTÖÖ PALJUD TEISED ERINEVAD RÜHMAD (Estonian)
17 August 2022
0 references
A FORDÍTÁS NAGYJÁBÓL HÁROM SZAKASZRA OSZTHATÓ: BEAVATÁS, NYÚLÁS ÉS MEGSZÜNTETÉS. AZ EUKARIÓTÁK KANONIKUS FORDÍTÁSI KEZDEMÉNYEZÉSE NYOLC SZAKASZRA OSZTHATÓ, AMELYEK A RIBOSZOMÁLIS ALEGYSÉGEK ÉS A KÜLÖNBÖZŐ KEZDÉSI TÉNYEZŐK (EIFS) KÖZÖTT TÖBB KOMPLEXET FOGLALNAK MAGUKBAN. (LEGALÁBB) TUCATNYI KEZDEMÉNYEZÉSI TÉNYEZŐ LÉTEZIK, AMELYEK KÖZÜL A LEGÖSSZETETTEBB AZ EBA3, AZ EBA4F ÉS AZ EBA2. MÍG AZ EIF4F ÉS AZ EIF2 HETEROTRIMER FEHÉRJÉK, AZ EIF3 6 KÜLÖNBÖZŐ ALEGYSÉGBŐL ÁLL A SACCHAROMYCES CEREVISIAE-BAN ÉS 13 ALEGYSÉGBŐL EMLŐSÖKBEN. _x000D_ fehérje SYNTHESIS egy nagy kontrolált PROCESS. TÉNY, HOGY DEREGULÁCIÓ A FORDÍTÁSI BEAVATÁS EMBERBEN EGYÜTT SZÁMOS BETEGSÉG, BELEÉRTVE A RÁKOT. PÉLDÁUL AZ EBA4F, VALAMINT AZ EBA2 ÉS AZ EIF3 KOMPLEXEK ÖSSZESZERELÉSÉT/TEVÉKENYSÉGÉT ERŐTELJESEN SZABÁLYOZZA A RÁK KIALAKULÁSÁBAN RÉSZT VEVŐ ÉS GYAKRAN AZ EMBERI RÁKOS MEGBETEGEDÉSEKBEN TÚL EXPRESSZÁLT ÚTVONALAK JELZÉSE, AMI GYAKORLATI ÉRDEKLŐDÉST MUTAT EZEN EIFS-FUNKCIÓK MEGÉRTÉSE IRÁNT. POSZTDOKTORI IDŐSZAKOM ALATT A VENKI RAMAKRISHNAN LABORBAN, AZ MRC-LMB-BEN (CAMBRIDGE) HOZZÁJÁRULTAM A FORDÍTÁSI BEAVATÁS JOBB MEGÉRTÉSÉHEZ. A KÜLÖNBÖZŐ SZAKASZOK MINDEGYIKÉNEK JELLEMZÉSE EGY RENDKÍVÜL DINAMIKUS FOLYAMAT BIZONYOS ÁTMENETI FUNKCIONÁLIS ÁLLAPOTAINAK BEFOGÁSÁTÓL FÜGGÖTT. EZEK A MAKROMOLEKULÁRIS EGYSÉGEK NAGYOK ÉS HETEROGÉNEK, ÉS MEGTANULTUK ÉS FELHASZNÁLTUK AZ EGYRÉSZECSKÉS KRIO-EMEKET, HOGY BIZONYOS SZERKEZETI INFORMÁCIÓKAT SZEREZZÜNK RÓLUK. E STRUKTÚRÁK KÖZELMÚLTBELI MEGHATÁROZÁSA ÉS EGYES EUKARIÓTA INDÍTÓ TÉNYEZŐKRE VONATKOZÓ STRUKTURÁLIS INFORMÁCIÓK RENDELKEZÉSRE ÁLLÁSA ELLENÉRE AZONBAN E KEZDETI TÉNYEZŐK FUNKCIÓI MÉG MINDIG NEM TELJESEN ISMERTEK, FŐKÉNT AZÉRT, MERT NEM ÁLLNAK RENDELKEZÉSRE RÉSZLETES STRUKTURÁLIS INFORMÁCIÓK E TÉNYEZŐK FONTOS RÉSZEIRŐL ÉS A KÖZÖTTÜK KIALAKULT KOMPLEXEKRŐL. KÜLÖNÖSEN FONTOS LENNE MEGHATÁROZNI A TELJES EIF3 SZERKEZETÉT, AMELY A LEGÖSSZETETTEBB EIFS ÉS EGY FONTOS SZABÁLYOZÁSI CÉLKITŰZÉS, VALAMINT AZ EBA3 KOMPLEXUMAINAK STRUKTÚRÁIT A RENDELET EGYÉB FONTOS CÉLJAIVAL EGYÜTT, MINT PÉLDÁUL AZ EBA4F, AZ EBA2, AZ EBA5 ÉS AZ EBA1 ANNAK ÉRDEKÉBEN, HOGY EZT MEGTEGYEM, ÖSSZE KÍVÁNOM KAPCSOLNI A RÖNTGEN KRISTÁLYRAJZOT ÉS A KRIO-EMET, HOGY TISZTÁZZUK EZEKET A STRUKTÚRÁKAT, AMELYEK MEGVILÁGÍTANÁK AZ EUKARIÓTÁK FORDÍTÁSI KEZDEMÉNYEZÉSÉNEK BIZONYOS ASPEKTUSAIT, ÉS ELŐKÉSZÍTENEM AZ UTAT A FOLYAMAT SZABÁLYOZÁSÁNAK MECHANIKUS MEGÉRTÉSÉHEZ. Ez a TUDOMÁNY TUDOMÁSUL VONATKOZÓ KÖZÖSSÉGEK TERÜLETÉNEK TERÜLETÉBEN AZ EGYESÜLT TERMÉKEKRE VONATKOZÓ TERMÉKEKRE VONATKOZÓ TERMÉKEKRE VONATKOZÓ TERMÉKEKRE VONATKOZÓ TUDOMÁNYOKRA VONATKOZÓ TUDOMÁNYOKRA VONATKOZÓ TUDOMÁNYOK ÉS A TERMÉKEKRE VONATKOZÓ TUDOMÁSULÓK._x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_x000D_A PREVIOUS CRYO-EM MAPS-on a LOW RESOLUCIÓBAN, mik az EIF3 DIFFERENT DOMAINS- nak, és túl expresszálnak, vagy CO-EXPRESS-nek, mivel ezek az EIF-ek vagy azok részei heterológ skálán mozognak, és az X-RAY CRYSTALLISATION TRIALSÓI SZERINTI IRÁNYELVEK. HASONLÓ MEGKÖZELÍTÉST FOGUNK KÖVETNI AZ EBA4F STRUKTURÁLIS INFORMÁCIÓINAK BESZERZÉSE ÉRDEKÉBEN. TEKINTETTEL A MULTIFAKTOR KOMPLEX NAGY MÉRETÉRE (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2), EGYETLEN RÉSZECSKE EM SEGÍTSÉGÉVEL HATÁROZZUK MEG SZERKEZETÉT. ELŐSZÖR NEGATÍV FOLTTECHNIKÁT, MAJD KÉSŐBB KRIO-EMET HASZNÁLUNK. EZEN TÚLMENŐEN MEGVIZSGÁLJUK, HOGY AZ EIF3-EIF4F KOMPLEXUM ALKALMAS-E AZ ÁLTALUK TÖRTÉNŐ STRUKTURÁLIS MEGHATÁROZÁS CÉLKÉNT VALÓ MEGHATÁROZÁSÁRA, HA KÉPESEK VAGYUNK STABIL KOMPLEXUMOT ALKOTNI. VÉGÜL, RÉSZT FOGOK VENNI AZ EGYRÉSZECSKÉS EM ELŐMOZDÍTÁSÁBAN ÉS FEJLESZTÉSÉBEN A VALENCIA-BAN.THIS EGY NAGYON ERŐS TECHNIKA, AMELY DÖNTŐ FONTOSSÁGÚ LEHET SZÁMOS MÁS CSOPORT FOLYAMATBAN LÉVŐ KUTATÁSÁNAK SIKERÉHEZ. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ПРЕВОДЪТ МОЖЕ ДА БЪДЕ РАЗДЕЛЕН ПРИБЛИЗИТЕЛНО НА ТРИ ЕТАПА: ИНИЦИИРАНЕ, УДЪЛЖАВАНЕ И ПРЕКРАТЯВАНЕ. ИНИЦИИРАНЕТО НА КАНОНИЧНИЯ ПРЕВОД В ЕУКАРИОТИ МОЖЕ ДА БЪДЕ РАЗДЕЛЕНО НА ОСЕМ ЕТАПА, ВКЛЮЧВАЩИ НЯКОЛКО КОМПЛЕКСА МЕЖДУ РИБОЗОМНИТЕ СУБЕДИНИЦИ И РАЗЛИЧНИТЕ ФАКТОРИ НА ИНИЦИИРАНЕ (EIFS). СЪЩЕСТВУВАТ (ПОНЕ) ДУЗИНА ИНИЦИИРАЩИ ФАКТОРИ, ОТ КОИТО НАЙ-СЛОЖНИ СА ЕИФ3, ЕИФ4Ф И ЕИФ2. ДОКАТО EIF4F И EIF2 СА ХЕТЕРОТРИМЕРНИ ПРОТЕИНИ, EIF3 СЕ СЪСТОИ ОТ 6 РАЗЛИЧНИ СУБЕДИНИЦИ В SACCHAROMYCES CEREVISIAE И ОТ 13 СУБЕДИНИЦИ ПРИ БОЗАЙНИЦИ. _x000D_ протеин SYNTHESIS е голяма контролуирана процеса. В ДЕЙСТВИТЕЛНОСТ, ДЕРЕГУЛАЦИЯ НА ИНИЦИИРАНЕТО НА ПРЕВОД ПРИ ХОРАТА В СВЪРЗАНИ С МНОГО ЗАБОЛЯВАНИЯ, ВКЛЮЧИТЕЛНО РАК. НАПРИМЕР СГЛОБЯВАНЕТО/ДЕЙНОСТТА НА КОМПЛЕКСИТЕ EIF4F И EIF2 И EIF3 Е СИЛНО РЕГУЛИРАНО ЧРЕЗ СИГНАЛИЗИРАНЕ НА ПЪТИЩА, КОИТО УЧАСТВАТ В РАЗВИТИЕТО НА РАКОВИ ЗАБОЛЯВАНИЯ И ЧЕСТО СА СВРЪХИЗРАЗЕНИ ОТ РАКОВИ ЗАБОЛЯВАНИЯ ПРИ ЧОВЕКА, КОЕТО ДАВА ПРАКТИЧЕСКИ ИНТЕРЕС ЗА РАЗБИРАНЕТО НА ТЕЗИ ФУНКЦИИ НА ЕРОС. ПО ВРЕМЕ НА ПОСТДОКТОРСКИЯ МИ ПЕРИОД В ЛАБОРАТОРИЯТА „ВЕНКИ РАМАКРИШНАН“, В MRC-LMB (CAMBRIDGE), ДОПРИНЕСОХ ЗА ПО-ДОБРОТО РАЗБИРАНЕ НА ИНИЦИИРАНЕТО НА ПРЕВОДА. ХАРАКТЕРИЗИРАНЕТО НА ВСЕКИ ЕДИН ОТ РАЗЛИЧНИТЕ ЕТАПИ ЗАВИСИ ОТ УЛАВЯНЕТО НА ОПРЕДЕЛЕНИ ПРЕХОДНИ ФУНКЦИОНАЛНИ СЪСТОЯНИЯ НА ЕДИН ИЗКЛЮЧИТЕЛНО ДИНАМИЧЕН ПРОЦЕС. ТЕЗИ МАКРОМОЛЕКУЛНИ ВЪЗЛИ СА ГОЛЕМИ И ХЕТЕРОГЕННИ И НИЕ НАУЧИХМЕ И ИЗПОЛЗВАХМЕ КРИО-ЕМ С ЕДНА ЧАСТИЦА, ЗА ДА ПОЛУЧИМ НЯКАКВА СТРУКТУРНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА ТЯХ. ВЪПРЕКИ НЕОТДАВНАШНОТО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ТЕЗИ СТРУКТУРИ И НАЛИЧИЕТО НА СТРУКТУРНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА НЯКОИ ЕУКАРИОТНИ ИНИЦИИРАЩИ ФАКТОРИ, ФУНКЦИИТЕ НА ВСИЧКИ ТЕЗИ ФАКТОРИ ВСЕ ОЩЕ НЕ СА ДОБРЕ РАЗБРАНИ, ГЛАВНО ПОРАДИ ЛИПСАТА НА ПОДРОБНА СТРУКТУРНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА ВАЖНИ ЧАСТИ ОТ ТЕЗИ ФАКТОРИ И ЗА ОБРАЗУВАНИТЕ ПОМЕЖДУ ИМ КОМПЛЕКСИ. ПО-СПЕЦИАЛНО, БИ БИЛО МНОГО ВАЖНО ДА СЕ ОПРЕДЕЛИ СТРУКТУРАТА НА ПЪЛНИЯ ЕРОС3, НАЙ-СЛОЖНАТА НА ЕИФС И ВАЖНА ЦЕЛ ЗА РЕГУЛИРАНЕ, КАКТО И СТРУКТУРАТА НА КОМПЛЕКСИТЕ НА ЕИФ3 С ДРУГИ ВАЖНИ ЦЕЛИ ЗА РЕГЛАМЕНТ, КАТО НАПРИМЕР ЕИФ4F, ЕИФ2, ЕИФ5 И ЕИФ1. ЗА ДА ГО НАПРАВЯ, ВЪЗНАМЕРЯВАМ ДА СЪЧЕТАЯ РЕНТГЕНОВА КРИСТАЛОГРАФИЯ И КРИО-ЕМ, ЗА ДА ИЗЯСНЯ ТЕЗИ СТРУКТУРИ, КОЕТО ЩЕ ХВЪРЛИ СВЕТЛИНА ВЪРХУ НЯКОИ КОНКРЕТНИ АСПЕКТИ НА ИНИЦИИРАНЕТО НА ПРЕВОДА В ЕУКАРИОТИТЕ И ЩЕ ПРОПРАВИ ПЪТЯ ЗА МЕХАНИЧНО РАЗБИРАНЕ ЗА ТОВА КАК ПРОЦЕСЪТ МОЖЕ ДА БЪДЕ РЕГУЛИРАН. Това знаме може да ни осигури Стретегия за ТАРГЕТНИТЕ ОБЩИ КОМПЛЕКСИ, които могат да бъдат кандидатства за разработване на позибилни анти-туморни тържества, които биха могли да бъдат за разработване на антибиотиците и антивиралите._x000D_ОБРАЗОВАНИЕ НА НАШИТЕ ПРЕВОЗИИ CRYO-EM MAPS в LOW RESOLUTION, ние ще направим SEVERAL CONSTRUCTS на DIFFERENT DOMAINS на EIF3 и свръхекспресиране ИЛИ CO-EXPRESS тях до там, където и други EIFS или части от тях в хетерологични системи и ние ще се грижим за X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS с тях. ЩЕ СЛЕДВАМЕ ПОДОБЕН ПОДХОД ЗА ПОЛУЧАВАНЕ НА СТРУКТУРНА ИНФОРМАЦИЯ ЗА ЕИФ4F. КАТО СЕ ИМА ПРЕДВИД ГОЛЕМИЯТ РАЗМЕР НА МНОГОФАКТОРНИЯ КОМПЛЕКС (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2), НИЕ ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ ЕДИНИЧНИ ЧАСТИЦИ EM, ЗА ДА ОПРЕДЕЛИМ НЕГОВАТА СТРУКТУРА. ПЪРВО ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ НЕГАТИВНИ ПЕТНА ТЕХНИКИ, А ПО-КЪСНО НА КРИО-ЕМ. ОСВЕН ТОВА ЩЕ ПРОУЧИМ ПРИГОДНОСТТА НА КОМПЛЕКСА EIF3-EIF4F КАТО ЦЕЛ ЗА СТРУКТУРНО ОПРЕДЕЛЯНЕ ОТ EM, АКО СМЕ В СЪСТОЯНИЕ ДА ФОРМИРАМЕ СТАБИЛЕН КОМПЛЕКС. И НАКРАЯ, АЗ ЩЕ УЧАСТВАМ В НАСЪРЧАВАНЕТО И РАЗВИТИЕТО НА ЕДИНИЧНИ ЧАСТИЦИ EM ВЪВ VALENCIA.THIS Е МНОГО МОЩНА ТЕХНИКА, КОЯТО МОЖЕ ДА БЪДЕ ОТ РЕШАВАЩО ЗНАЧЕНИЕ ЗА УСПЕХА НА ТЕКУЩИТЕ ИЗСЛЕДВАНИЯ НА МНОГО ДРУГИ РАЗЛИЧНИ ГРУПИ (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
VERTIMĄ GALIMA SUSKIRSTYTI Į TRIS ETAPUS: INICIJAVIMAS, PAILGĖJIMAS IR NUTRAUKIMAS. KANONINIO VERTIMO INICIJAVIMAS EUKARIOTUOSE TAIP PAT GALI BŪTI SUSKIRSTYTAS Į AŠTUONIS ETAPUS, APIMANČIUS KELIS KOMPLEKSUS TARP RIBOSOMINIŲ SUBVIENETŲ IR SKIRTINGŲ INICIJAVIMO VEIKSNIŲ (EIFS). YRA (BENT) DAUGYBĖ INICIJAVIMO VEIKSNIŲ, IŠ KURIŲ SUDĖTINGIAUSI YRA EIF3, EIF4F IR EIF2. EIF4F IR EIF2 YRA HETEROTRIMERINIAI BALTYMAI, O EIF3 SUDARO 6 SKIRTINGI SACCHAROMYCES CEREVISIAE SUBVIENETAI IR 13 ŽINDUOLIŲ SUBVIENETŲ. _x000D_ baltymų SYNTHESIS yra labai KONTROLĖ PROCESS. TIESĄ SAKANT, VERTIMO INICIJAVIMO ŽMONĖMS PANAIKINIMAS, SUSIJĘS SU DAUGELIU LIGŲ, ĮSKAITANT VĖŽĮ. PAVYZDŽIUI, EIF4F IR EIF2 BEI EIF3 KOMPLEKSŲ SURINKIMAS IR (ARBA) VEIKLA YRA GRIEŽTAI REGLAMENTUOJAMI SIGNALINIAIS BŪDAIS, KURIE YRA SUSIJĘ SU VĖŽIO VYSTYMUSI IR DAŽNAI PER DAUG IŠREIŠKIAMI ŽMONIŲ VĖŽIO ATVEJAIS, TODĖL PRAKTIŠKAI DOMIMASI ŠIŲ EIFS FUNKCIJŲ SUPRATIMU. PER SAVO DOKTORANTŪROS LAIKOTARPĮ VENKI RAMAKRISHNAN LABORATORIJOJE., MRC-LMB (KAMBRIDGE), AŠ PRISIDĖJO PRIE GERESNIO SUPRATIMO VERTIMO INICIJAVIMO. KIEKVIENO IŠ SKIRTINGŲ ETAPŲ APIBŪDINIMAS PRIKLAUSĖ NUO LABAI DINAMIŠKO PROCESO TAM TIKRŲ LAIKINŲ FUNKCINIŲ VALSTYBIŲ GAUDYMO. ŠIE MAKROMOLEKULINIAI MAZGAI YRA DIDELI IR NEVIENALYČIAI, IR MES IŠMOKOME IR NAUDOJOME VIENOS DALELĖS KRIO-EM, KAD GAUTUME TAM TIKRĄ STRUKTŪRINĘ INFORMACIJĄ APIE JUOS. TAČIAU, NEPAISANT NESENIAI NUSTATYTŲ ŠIŲ STRUKTŪRŲ IR STRUKTŪRINĖS INFORMACIJOS APIE KAI KURIUOS EUKARIOTINIUS INICIJAVIMO VEIKSNIUS, VISŲ ŠIŲ INICIJAVIMO VEIKSNIŲ FUNKCIJOS VIS DAR NĖRA GERAI SUPRANTAMOS, DAUGIAUSIA DĖL TO, KAD TRŪKSTA IŠSAMIOS STRUKTŪRINĖS INFORMACIJOS APIE SVARBIAS ŠIŲ VEIKSNIŲ DALIS IR TARP JŲ SUSIDARIUSIUS KOMPLEKSUS. VISŲ PIRMA BŪTŲ LABAI SVARBU NUSTATYTI VISIŠKO EIF3 STRUKTŪRĄ3, SUDĖTINGIAUSIĄ EIFS IR SVARBŲ REGLAMENTO TIKSLĄ, TAIP PAT EIF3 KOMPLEKSŲ STRUKTŪRĄ IR KITUS SVARBIUS REGLAMENTO TIKSLUS, PAVYZDŽIUI, EIF4F, EIF2, EIF5 IR EIF1. SIEKDAMAS TAI PADARYTI, KETINU SUJUNGTI RENTGENO KRISTALOGRAFIJĄ IR KRIO-EM, KAD IŠSIAIŠKINČIAU ŠIAS STRUKTŪRAS, KURIOS ATSKLEISTŲ KAI KURIUOS KONKREČIUS VERTIMO INICIJAVIMO EUKARYOTES ASPEKTUS IR NUTIESTŲ KELIĄ MECHANISTINIAM SUPRATIMUI APIE TAI, KAIP ŠIS PROCESAS GALI BŪTI REGULIUOJAMAS. Šis KNOWLEDGE CAN PROVIDEUS SU TIKSLAS TAIKOMOS KONKURSŲ KONTROLĖS KONTROLĖS KONTROLĖS TYRIMAI TAIKOMAS ANTI-NTALŲ GYVYBĖJE, TAIKOMAS ANTIBIOTICS IR ANTIVIRALŲ VYRIAUSYBĖ._x000D_ PASTABA, mes DESIGN SVEIKINĖS KONSTRUKCIJOS DIFFERENTŲ DOMAI3 ir overexpress AR CO-EXPRESS KONGETHER SU KITOS EIF AR DALYS į heterologines SISTEMOS IR JŪSŲ PRIEŽIŪROS, išskyrus X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS su jais. MES LAIKYSIMĖS PANAŠAUS POŽIŪRIO, KAD GAUTUME EIF4F STRUKTŪRINĘ INFORMACIJĄ. ATSIŽVELGIANT Į DIDELĮ DAUGIAVEIKSNIO KOMPLEKSO DYDĮ (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2), MES NAUDOSIME VIENĄ DALELĘ EM, KAD NUSTATYTUME JO STRUKTŪRĄ. PIRMIAUSIA NAUDOSIME NEIGIAMUS DĖMIŲ METODUS, O VĖLIAU – KRIO-EM. BE TO, MES IŠNAGRINĖSIME EIF3-EIF4F KOMPLEKSO TINKAMUMĄ KAIP STRUKTŪRINIO RYŽTO TIKSLĄ EM, JEI GALĖSIME SUFORMUOTI STABILŲ KOMPLEKSĄ. GALIAUSIAI AŠ DALYVAUSIU SKATINANT IR KURIANT VIENOS DALELĖS EM VALENCIA.THIS YRA LABAI GALINGAS METODAS, KURIS GALI BŪTI LABAI SVARBUS VYKSTANČIŲ MOKSLINIŲ TYRIMŲ DAUGELIO KITŲ SKIRTINGŲ GRUPIŲ SĖKMĘ (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
PRIJEVOD SE MOŽE GRUBO PODIJELITI U TRI FAZE: INICIJACIJA, IZDUŽENJE I PREKID. INICIJACIJA KANONSKOG PRIJEVODA U EUKARIOTE MOŽE SE PODIJELITI I U OSAM FAZA KOJE UKLJUČUJU NEKOLIKO KOMPLEKSA IZMEĐU RIBOSOMSKIH PODJEDINICA I RAZLIČITIH INICIJACIJSKIH ČIMBENIKA (EIFS). POSTOJI (BAREM) DESETAK ČIMBENIKA ZA POKRETANJE, OD KOJIH SU NAJSLOŽENIJI EIF3, EIF4F I EIF2. DOK SU EIF4F I EIF2 HETEROTRIMERIČKI PROTEINI, EIF3 SE SASTOJI OD 6 RAZLIČITIH PODJEDINICA U SACCHAROMYCES CEREVISIAE I OD 13 PODJEDINICA U SISAVACA. _x000D_ proteinski SYNTHESIS je vrlo uslužan PROCESS. ZAPRAVO, DEREGULACIJA INICIJACIJE PRIJEVODA KOD LJUDI POVEZANIH S MNOGIM BOLESTIMA, UKLJUČUJUĆI RAK. NA PRIMJER, SKUPŠTINA/AKTIVNOST EIF4F-A I KOMPLEKSA EIF2 I EIF3 SNAŽNO JE REGULIRANA SIGNALIZIRANJEM PUTOVA KOJI SU UKLJUČENI U RAZVOJ RAKA I ČESTO SU PRETJERANO IZRAŽENI KOD RAKA KOD LJUDI, ŠTO DAJE PRAKTIČAN INTERES ZA RAZUMIJEVANJE TIH FUNKCIJA EIFS-A. TIJEKOM MOG POSTDOKTORSKOG RAZDOBLJA U VENKI RAMAKRISHNAN LABORATORIJU., NA MRC-LMB (CAMBRIDGE), DOPRINIJELA SAM BOLJEM RAZUMIJEVANJU INICIJACIJE PRIJEVODA. KARAKTERIZACIJA SVAKE OD RAZLIČITIH FAZA OVISILA JE O HVATANJU ODREĐENIH PRIJELAZNIH FUNKCIONALNIH STANJA VRLO DINAMIČNOG PROCESA. OVI MAKROMOLEKULARNI SKLOPOVI SU VELIKI I HETEROGENI I NAUČILI SMO I KORISTILI KRIO-EM KAKO BISMO DOBILI NEKE STRUKTURNE INFORMACIJE O NJIMA. MEĐUTIM, UNATOČ NEDAVNOM UTVRĐIVANJU TIH STRUKTURA I DOSTUPNOSTI STRUKTURNIH INFORMACIJA ZA NEKE EUKARIOTSKE INICIJACIJSKE ČIMBENIKE, FUNKCIJE SVIH TIH ČIMBENIKA ZA POKRETANJE JOŠ UVIJEK NISU DOBRO SHVAĆENE, UGLAVNOM ZBOG NEDOSTATKA DETALJNIH STRUKTURNIH INFORMACIJA ZA VAŽNE DIJELOVE TIH ČIMBENIKA I KOMPLEKSA KOJI SU MEĐU NJIMA NASTALI. POSEBNO BI BILO VRLO VAŽNO ODREDITI STRUKTURU POTPUNOG EIF-A3, NAJSLOŽENIJEG EIFS-A I VAŽNOG CILJA UREDBE TE STRUKTURE KOMPLEKSA EIF3 S DRUGIM VAŽNIM CILJEVIMA ZA UREDBU KAO ŠTO SU EIF4F, EIF2, EIF5 I EIF1. DA BIH TO UČINIO, NAMJERAVAM KOMBINIRATI RENDGENSKU KRISTALOGRAFIJU I KRIO-EM KAKO BIH RAZJASNIO TE STRUKTURE, ŠTO BI RASVIJETLILO NEKE ODREĐENE ASPEKTE INICIJACIJE PRIJEVODA U EUKARYOTES, I OTVORILO PUT ZA MEHANISTIČKO RAZUMIJEVANJE KAKO SE PROCES MOŽE REGULIRATI. Ova ZNAČAJKA ZA PROVEDBLJANJE NAS STRATEGIJE za utvrÄ’ivanje ureÄ’aja koji mogu biti kandidirani za odreÄ’ivanje POSSIBLE ANTI-tumoralnih TREATMENTA, Ä e se Ä iti za odreÄ’ivanje ANTIBIOTICS i ANTIVIRALS._x000D_ BASED NA NAŠIH PREVIOUS CRYO-EM MAPS na LOW RESOLUTION, mi ćemo DESIGN SEVERALNI KONSTRUKOVI DIFFERENTNI DOMAINS EIF3 i pretjerano ili CO-EXPRESS im TOGETHER s drugim EIFS ILI DIJELIMA U heterološkim SYSTEMS I mi ćemo brinuti o X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS s njima. SLIJEDIT ĆEMO SLIČAN PRISTUP KAKO BISMO DOBILI STRUKTURNE INFORMACIJE EIF4F-A. S OBZIROM NA VELIKU VELIČINU MULTIFAKTORSKOG KOMPLEKSA (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) UPOTRIJEBIT ĆEMO JEDNU ČESTICU EM KAKO BISMO ODREDILI NJEGOVU STRUKTURU. PRVO ĆEMO KORISTITI NEGATIVNE TEHNIKE MRLJA, A KASNIJE NA KRIO-EM. OSIM TOGA, ISPITAT ĆEMO PRIKLADNOST KOMPLEKSA EIF3-EIF4F KAO CILJA ZA STRUKTURNO ODREĐIVANJE EM AKO MOŽEMO STVORITI STABILAN KOMPLEKS. KONAČNO, JA ĆU BITI UKLJUČEN U PROMICANJE I RAZVOJ JEDNE ČESTICE EM U VALENCIA.THIS JE VRLO MOĆNA TEHNIKA KOJA MOŽE BITI KLJUČNA ZA USPJEH TEKUĆIH ISTRAŽIVANJA MNOGIH DRUGIH RAZLIČITIH SKUPINA (Croatian)
17 August 2022
0 references
ÖVERSÄTTNINGEN KAN GROVT DELAS IN I TRE STEG: INLEDANDE, FÖRLÄNGNING OCH AVSLUTANDE. KANONISK ÖVERSÄTTNINGSINITIERING I EUKARYOTER KAN DELAS IN I ÅTTA STEG SOM OMFATTAR FLERA KOMPLEX MELLAN DE RIBOSOMALA UNDERENHETERNA OCH DE OLIKA INITIERINGSFAKTORERNA (EIFS). DET FINNS (ÅTMINSTONE) ETT DUSSIN INLEDANDE FAKTORER, VARAV DE MEST KOMPLEXA ÄR EIF3, EIF4F OCH EIF2. EIF4F OCH EIF2 ÄR HETEROTRIMERISKA PROTEINER, MEN EIF3 BESTÅR AV SEX OLIKA UNDERENHETER I SACCHAROMYCES CEREVISIAE OCH 13 UNDERENHETER PÅ DÄGGDJUR. _x000D_ protein SYNTHESIS ÄR ett stort CONTROLLED PROCESS. I SJÄLVA VERKET AVREGLERING AV ÖVERSÄTTNINGSINITIERING HOS MÄNNISKOR I SAMBAND MED MÅNGA SJUKDOMAR, INKLUSIVE CANCER. EXEMPELVIS REGLERAS SAMMANSÄTTNINGEN/AKTIVITETEN AV EIF4F OCH EIF2 OCH EIF3 STARKT AV SIGNALERINGSVÄGAR SOM ÄR INVOLVERADE I CANCERUTVECKLING OCH OFTA ÖVERUTTRYCKS I CANCERSJUKDOMAR, VILKET GER PRAKTISKT INTRESSE FÖR FÖRSTÅELSEN AV DESSA EIFS-FUNKTIONER. UNDER MIN POSTDOKTORPERIOD I VENKI RAMAKRISHNAN LAB., PÅ MRC-LMB (CAMBRIDGE), HAR JAG BIDRAGIT TILL EN BÄTTRE FÖRSTÅELSE FÖR ÖVERSÄTTNINGSINITIERING. KARAKTERISERINGEN AV VART OCH ETT AV DE OLIKA STEGEN BERODDE PÅ ATT SÄRSKILDA ÖVERGÅENDE FUNKTIONELLA STATER FÅNGADES IN I EN MYCKET DYNAMISK PROCESS. DESSA MAKROMOLEKYLÄRA FÖRSAMLINGAR ÄR STORA OCH HETEROGENA OCH VI LÄRDE OSS OCH ANVÄNDE EN ENDA PARTIKELKRYO-EM FÖR ATT FÅ VISS STRUKTURELL INFORMATION OM DEM. TROTS DEN SENASTE TIDENS FASTSTÄLLANDE AV DESSA STRUKTURER OCH TILLGÅNGEN TILL STRUKTURELL INFORMATION FÖR VISSA EUKARYOTISKA INITIERINGSFAKTORER ÄR FUNKTIONERNA HOS ALLA DESSA INITIERINGSFAKTORER FORTFARANDE INTE KÄNDA, FRÄMST PÅ GRUND AV BRISTEN PÅ DETALJERAD STRUKTURELL INFORMATION OM VIKTIGA DELAR AV DESSA FAKTORER OCH DE KOMPLEX SOM BILDAS MELLAN DEM. DET SKULLE I SYNNERHET VARA MYCKET VIKTIGT ATT FASTSTÄLLA STRUKTUREN FÖR DEN FULLSTÄNDIGA EIF3, DEN MEST KOMPLEXA EIFS OCH ETT VIKTIGT MÅL FÖR FÖRORDNINGEN SAMT STRUKTURERNA FÖR EIF3:S KOMPLEX MED ANDRA VIKTIGA MÅL FÖR FÖRORDNINGEN, SÅSOM EIF4F, EIF2, EIF5 OCH EIF1. FÖR ATT GÖRA DET TÄNKER JAG KOMBINERA RÖNTGENKRISTALLOGRAFI OCH KRYO-EM FÖR ATT BELYSA DESSA STRUKTURER, VILKET SKULLE BELYSA VISSA ASPEKTER AV ÖVERSÄTTNINGSINITIERING I EUKARYOTER OCH BANA VÄG FÖR EN MEKANISTISK FÖRSTÅELSE FÖR HUR PROCESSEN KAN REGLERAS. Denna kunskap KAN PROVIDE OSS med en STRATEGY FÖR TargetING SOME COMPLEXES SOM ÄR KANDIDATES FÖR UTVECKLING AV POSSIBELLA ANTI-tumorala ämnen, som WELL AS FÖR UTVECKLING AV ANTIBIOTICER OCH ANTIVIRALSER._x000D_ BASED ON VÅRA PREVIOUS CRYO-EM MAPS I LOW RESOLUTION, vi kommer att utveckla SEVERAL CONSTRUKTER AV DIFFERENT DOMAINS AV EIF3 och överuttryck eller CO-EXPRESS THEM TOGETHER MED ANDRA EIFS ELLER DENNA I heterologa SYSTEMS och vi kommer att leverera till X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS med dessa. VI KOMMER ATT FÖLJA EN LIKNANDE STRATEGI FÖR ATT FÅ STRUKTURELL INFORMATION FRÅN EIF4F. MED TANKE PÅ DEN STORA STORLEKEN PÅ MULTIFAKTORKOMPLEXET (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) KOMMER VI ATT ANVÄNDA EN ENDA PARTIKEL EM FÖR ATT BESTÄMMA DESS STRUKTUR. VI KOMMER FÖRST ATT ANVÄNDA NEGATIV FLÄCKTEKNIK OCH SENARE PÅ KRYO-EM. DESSUTOM KOMMER VI ATT UNDERSÖKA LÄMPLIGHETEN HOS EIF3-EIF4F-KOMPLEXET SOM ETT MÅL FÖR STRUKTURELL BESTÄMNING AV EM OM VI KAN BILDA ETT STABILT KOMPLEX. SLUTLIGEN KOMMER JAG ATT VARA INVOLVERAD I ATT FRÄMJA OCH UTVECKLA ENSTAKA PARTIKLAR EM I VALENCIA.THIS ÄR EN MYCKET KRAFTFULL TEKNIK SOM KAN VARA AVGÖRANDE FÖR FRAMGÅNGEN FÖR DEN PÅGÅENDE FORSKNINGEN I MÅNGA ANDRA OLIKA GRUPPER (Swedish)
17 August 2022
0 references
TRADUCEREA POATE FI ÎMPĂRȚITĂ APROXIMATIV ÎN TREI ETAPE: INIȚIERE, ALUNGIRE ȘI ÎNCETARE. INIȚIEREA TRADUCERII CANONICE ÎN EUCARIOTE POATE FI ÎMPĂRȚITĂ, DE ASEMENEA, ÎN OPT ETAPE CARE IMPLICĂ MAI MULTE COMPLEXE ÎNTRE SUBUNITĂȚILE RIBOZOMALE ȘI DIFERIȚII FACTORI DE INIȚIERE (EIFS). EXISTĂ (CEL PUȚIN) O DUZINĂ DE FACTORI DE INIȚIERE, DINTRE CARE CEI MAI COMPLEXI SUNT FEI3, FEI4F ȘI FEI2. ÎN TIMP CE EIF4F ȘI EIF2 SUNT PROTEINE HETEROTRIMERICE, EIF3 ESTE COMPUS DIN 6 SUBUNITĂȚI DIFERITE ÎN SACCHAROMYCES CEREVISIAE ȘI DIN 13 SUBUNITĂȚI LA MAMIFERE. _x000D_ SYNTHESIS proteină este un produs foarte controlat. DE FAPT, DEREGLEMENTAREA INIȚIERII TRADUCERII LA OM ÎN ASOCIERE CU MULTE BOLI, INCLUSIV CANCERUL. DE EXEMPLU, ADUNAREA/ACTIVITATEA EIF4F ȘI A COMPLEXELOR FEI2 ȘI FEI3 ESTE PUTERNIC REGLEMENTATĂ PRIN SEMNALIZAREA UNOR CĂI CARE SUNT IMPLICATE ÎN DEZVOLTAREA CANCERULUI ȘI SUNT ADESEA SUPRAEXPRIMATE ÎN CAZURILE DE CANCER LA OM, DÂND UN INTERES PRACTIC PENTRU ÎNȚELEGEREA ACESTOR FUNCȚII ALE SIE. ÎN PERIOADA MEA POSTDOCTORALĂ ÎN LABORATORUL VENKI RAMAKRISHNAN, LA MRC-LMB (CAMBRIDGE), AM CONTRIBUIT LA O MAI BUNĂ ÎNȚELEGERE A INIȚIERII TRADUCERILOR. CARACTERIZAREA FIECĂREIA DINTRE DIFERITELE ETAPE DEPINDEA DE CAPTURAREA ANUMITOR STĂRI FUNCȚIONALE TRANZITORII ALE UNUI PROCES EXTREM DE DINAMIC. ACESTE ANSAMBLURI MACROMOLECULARE SUNT MARI ȘI ETEROGENE ȘI AM ÎNVĂȚAT ȘI AM FOLOSIT O SINGURĂ PARTICULĂ CRIO-EM PENTRU A OBȚINE UNELE INFORMAȚII STRUCTURALE DESPRE ELE. CU TOATE ACESTEA ȘI ÎN CIUDA RECENTEI DETERMINĂRI A ACESTOR STRUCTURI ȘI A DISPONIBILITĂȚII INFORMAȚIILOR STRUCTURALE PENTRU ANUMIȚI FACTORI DE INIȚIERE EUCARIOTICI, FUNCȚIILE TUTUROR ACESTOR FACTORI DE INIȚIERE NU SUNT ÎNCĂ BINE ÎNȚELESE, ÎN PRINCIPAL DIN CAUZA LIPSEI DE INFORMAȚII STRUCTURALE DETALIATE PENTRU PĂRȚI IMPORTANTE ALE ACESTOR FACTORI ȘI ALE COMPLEXELOR FORMATE ÎNTRE ACEȘTIA. ÎN SPECIAL, AR FI FOARTE IMPORTANT SĂ SE DETERMINE STRUCTURA FEI3 COMPLET, CEA MAI COMPLEXĂ DINTRE FEIS ȘI UN OBIECTIV IMPORTANT DE REGLEMENTARE, PRECUM ȘI STRUCTURILE COMPLEXE ALE FEI3 CU ALTE OBIECTIVE IMPORTANTE PENTRU REGULAMENT, CUM AR FI FEI4F, FEI2, FEI5 ȘI FEI1. PENTRU A FACE ACEST LUCRU, INTENȚIONEZ SĂ COMBIN CRISTALOGRAFIA CU RAZE X ȘI CRIO-EM PENTRU A ELUCIDA ACESTE STRUCTURI, CEEA CE AR FACE LUMINĂ ASUPRA UNOR ASPECTE PARTICULARE ALE INIȚIERII TRADUCERILOR ÎN EUCARIOTE ȘI AR DESCHIDE CALEA UNEI ÎNȚELEGERI MECANICISTE A MODULUI ÎN CARE PROCESUL POATE FI REGLEMENTAT. Acest KNOWLEDGE CAN PROVIDE US CU O STRATEGIE PENTRU TARGETARE COMPLEXELE SOME care pot fi CANDIDATE PENTRU DEZVOLTAREA TREATURILOR ANTI-tumorale POSSIBLE, precum și pentru desfacerea antibiotică și antiVIRALS._x000D_ BASED PE MAPS PREVIOUS CRYO-EM la REZOLUȚIE LOW, vom desface constructivele individuale de DIFERENTE de EIF3 și supraexprimate sau co-exprimate, cu alte EIF-uri sau părți ale lor în sisteme heterologe și vom face uz de mașini de cultură cu raze X cu ele. VOM URMA O ABORDARE SIMILARĂ PENTRU A OBȚINE INFORMAȚII STRUCTURALE ALE FEI4F. AVÂND ÎN VEDERE DIMENSIUNEA MARE A COMPLEXULUI MULTIFACTOR (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) VOM FOLOSI O SINGURĂ PARTICULĂ EM PENTRU A DETERMINA STRUCTURA ACESTUIA. VOM FOLOSI MAI ÎNTÂI TEHNICI DE PATĂ NEGATIVĂ ȘI MAI TÂRZIU PE CRIO-EM. ÎN PLUS, VOM EXPLORA CARACTERUL ADECVAT AL COMPLEXULUI FEI3-EIF4F CA OBIECTIV PENTRU DETERMINAREA STRUCTURALĂ PRIN EM, DACĂ VOM PUTEA FORMA UN COMPLEX STABIL. ÎN CELE DIN URMĂ, VOI FI IMPLICAT ÎN PROMOVAREA ȘI DEZVOLTAREA DE PARTICULE UNICE EM ÎN VALENCIA.THIS ESTE O TEHNICĂ FOARTE PUTERNICĂ, CARE POATE FI CRUCIALĂ PENTRU SUCCESUL CERCETĂRII ÎN CURS DE DESFĂȘURARE A MULTOR ALTE GRUPURI DIFERITE (Romanian)
17 August 2022
0 references
PREVOD JE MOGOČE V GROBEM RAZDELITI NA TRI FAZE: ZAČETEK, RAZTEZEK IN PREKINITEV. ZAČETEK KANONIČNEGA PREVAJANJA V EVKARIONTIH JE MOGOČE RAZDELITI TUDI NA OSEM STOPENJ, KI VKLJUČUJEJO VEČ KOMPLEKSOV MED RIBOSOMSKIMI PODENOTAMI IN RAZLIČNIMI INDUKCIJSKIMI DEJAVNIKI (EIFS). OBSTAJA (VSAJ) DUCAT ZAČETNIH DEJAVNIKOV, MED KATERIMI SO NAJBOLJ KOMPLEKSNI EIF3, EIF4F IN EIF2. MEDTEM KO STA EIF4F IN EIF2 HETEROTRIMERNI BELJAKOVINI, JE EIF3 SESTAVLJEN IZ 6 RAZLIČNIH PODENOT V SACCHAROMYCES CEREVISIAE IN 13 PODENOT PRI SESALCIH. _x000D_ proteinski SYNTHESIS je zelo cenjen. DEREGULACIJA UVEDBE PREVODA PRI LJUDEH PRI ŠTEVILNIH BOLEZNIH, VKLJUČNO Z RAKOM. NA PRIMER, ZBIRANJE/DEJAVNOST EIF4F TER KOMPLEKSOV EIF2 IN EIF3 JE MOČNO UREJENO S SIGNALNIMI POTMI, KI SO VKLJUČENE V RAZVOJ RAKA IN SO POGOSTO PREKOMERNO IZRAŽENE PRI RAKU PRI LJUDEH, KAR V PRAKSI DAJE ZANIMANJE ZA RAZUMEVANJE TEH FUNKCIJ EIFS. V MOJEM PODOKTORSKEM OBDOBJU V LABORATORIJU VENKI RAMAKRISHNAN, V MRC-LMB (CAMBRIDGE), SEM PRISPEVAL K BOLJŠEMU RAZUMEVANJU INICIACIJE PREVAJANJA. KARAKTERIZACIJA VSAKE OD RAZLIČNIH FAZ JE BILA ODVISNA OD LOVA DOLOČENIH PREHODNIH FUNKCIONALNIH DRŽAV ZELO DINAMIČNEGA PROCESA. TI MAKROMOLEKULARNI SKLOPI SO VELIKI IN HETEROGENI, ZATO SMO SE NAUČILI IN UPORABILI ENODELNI KRIO-EM, DA SMO PRIDOBILI NEKAJ STRUKTURNIH INFORMACIJ O NJIH. VENDAR PA KLJUB NEDAVNI DOLOČITVI TEH STRUKTUR IN RAZPOLOŽLJIVOSTI STRUKTURNIH INFORMACIJ ZA NEKATERE EVKARIONTSKE ZAČETNE DEJAVNIKE FUNKCIJE VSEH TEH ZAČETNIH DEJAVNIKOV ŠE VEDNO NISO DOBRO RAZUMLJENE, PREDVSEM ZARADI POMANJKANJA PODROBNIH STRUKTURNIH INFORMACIJ ZA POMEMBNE DELE TEH DEJAVNIKOV IN KOMPLEKSOV, KI SO NASTALI MED NJIMI. ZLASTI BI BILO ZELO POMEMBNO DOLOČITI STRUKTURO POPOLNEGA EIS3, KI JE NAJBOLJ ZAPLETEN EIFS IN POMEMBEN CILJ ZA UREDITEV, TER STRUKTURE KOMPLEKSOV EIF3 Z DRUGIMI POMEMBNIMI CILJI ZA UREDBO, KOT SO EIF4F, EIF2, EIF5 IN EIF1. DA BI TO STORIL, NAMERAVAM ZDRUŽITI RENTGENSKO KRISTALOGRAFIJO IN KRIO-EM, DA BI POJASNIL TE STRUKTURE, KAR BI OSVETLILO NEKATERE POSEBNE VIDIKE INICIACIJE PREVODOV V EVKARIONTE IN UTRLO POT MEHANISTIČNEMU RAZUMEVANJU, KAKO JE PROCES MOGOČE REGULIRATI. Ta NAROČILA ZA PROVIRAJO Z STRATEGIJAMI ZA VARSTVO SOME KAKOVOSTI KANDIDATOV ZA RAZVOJ POŠTEVNIH ANTI-tumorskih obdelav, KI JE VELIKO ZA RAZVEDANJE ANTIBIOTIK IN ŽIVALOV._x000D_ NA NAŠIJI NA NAŠI PREVIOUS CRYO-EM MAPS NA LOW RESOLUTION, BIKO POGLAVJE SEVERNIH PREDSTAVNIKOV DRUŽNIH DOMAINOV EIF3 in preveč ekspresnih ALI POGOJI JIH NA DRUGIH DRUGIH ALI DELOVNIH DRUGIH V heterolognih SYSTEMIH IN ODLOČENIH VARNOSTIH KRISTALNOSTI Z ZDRAVILOM. UPORABILI BOMO PODOBEN PRISTOP ZA PRIDOBITEV STRUKTURNIH INFORMACIJ EIF4F. GLEDE NA VELIKO VELIKOST VEČFAKTORSKEGA KOMPLEKSA (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2) BOMO ZA DOLOČITEV NJEGOVE STRUKTURE UPORABILI EN DELEC EM. NAJPREJ BOMO UPORABILI TEHNIKE NEGATIVNIH MADEŽEV, KASNEJE PA KRIO-EM. POLEG TEGA BOMO PREUČILI PRIMERNOST KOMPLEKSA EIF3-EIF4F KOT CILJA ZA STRUKTURNO DOLOČITEV, ČE BOMO SPOSOBNI OBLIKOVATI STABILEN KOMPLEKS. KONČNO, BOM SODELOVAL PRI SPODBUJANJU IN RAZVOJU POSAMEZNIH DELCEV EM V VALENCIA.THIS JE ZELO MOČNA TEHNIKA, KI JE LAHKO KLJUČNEGA POMENA ZA USPEH TEKOČIH RAZISKAV ŠTEVILNIH DRUGIH RAZLIČNIH SKUPIN (Slovenian)
17 August 2022
0 references
TŁUMACZENIE MOŻNA Z GRUBSZA PODZIELIĆ NA TRZY ETAPY: INICJACJA, WYDŁUŻENIE I ZAKOŃCZENIE. INICJACJĘ TŁUMACZENIA KANONICZNEGO W EUKARIOTACH MOŻNA PODZIELIĆ NA OSIEM ETAPÓW OBEJMUJĄCYCH KILKA KOMPLEKSÓW MIĘDZY PODJEDNOSTKAMI RYBOSOMALNYMI A RÓŻNYMI CZYNNIKAMI INICJACYJNYMI (EIFS). ISTNIEJE (CO NAJMNIEJ) TUZIN CZYNNIKÓW INICJUJĄCYCH, Z KTÓRYCH NAJBARDZIEJ ZŁOŻONE SĄ EFI3, EIF4F I EFI2. PODCZAS GDY EIF4F I EIF2 SĄ BIAŁKAMI HETEROTRIMEROWYMI, EIF3 SKŁADA SIĘ Z 6 RÓŻNYCH PODJEDNOSTEK W SACCHAROMYCES CEREVISIAE I Z 13 PODJEDNOSTEK U SSAKÓW. _x000D_ białko SYNTHESIS JEST HIGHLY CONTROLLED PROCESS. DEREGULACJA INICJACJI TŁUMACZENIA U LUDZI W ZWIĄZKU Z WIELOMA CHOROBAMI, W TYM RAKIEM. NA PRZYKŁAD MONTAŻ/DZIAŁALNOŚĆ EIF4F ORAZ KOMPLEKSÓW EIF2 I EIF3 JEST SILNIE UREGULOWANY POPRZEZ SYGNALIZOWANIE ŚCIEŻEK, KTÓRE SĄ ZAANGAŻOWANE W ROZWÓJ NOWOTWORÓW I SĄ CZĘSTO NADEKSPRESOWANE W PRZYPADKU NOWOTWORÓW U LUDZI, CO DAJE PRAKTYCZNE ZAINTERESOWANIE ZROZUMIENIEM TYCH FUNKCJI EFIS. W OKRESIE STUDIÓW PODOKTORSKICH W LABORATORIUM VENKI RAMAKRISHNAN, W MRC-LMB (CAMBRIDGE), PRZYCZYNIŁEM SIĘ DO LEPSZEGO ZROZUMIENIA INICJACJI TŁUMACZENIA. CHARAKTERYSTYKA KAŻDEGO Z POSZCZEGÓLNYCH ETAPÓW ZALEŻAŁA OD SCHWYTANIA POSZCZEGÓLNYCH PRZEJŚCIOWYCH STANÓW FUNKCJONALNYCH WYSOCE DYNAMICZNEGO PROCESU. TE ZESPOŁY MAKROCZĄSTECZKOWE SĄ DUŻE I NIEJEDNORODNE I NAUCZYLIŚMY SIĘ I UŻYLIŚMY KRIO-CZĄSTECZEK JEDNOCZĄSTECZKOWYCH, ABY UZYSKAĆ PEWNE INFORMACJE STRUKTURALNE O NICH. JEDNAK I POMIMO NIEDAWNEGO OKREŚLENIA TYCH STRUKTUR I DOSTĘPNOŚCI INFORMACJI STRUKTURALNYCH DLA NIEKTÓRYCH EUKARIOTYCZNYCH CZYNNIKÓW INICJUJĄCYCH, FUNKCJE WSZYSTKICH TYCH CZYNNIKÓW INICJUJĄCYCH NADAL NIE SĄ DOBRZE ZROZUMIAŁE, GŁÓWNIE ZE WZGLĘDU NA BRAK SZCZEGÓŁOWYCH INFORMACJI STRUKTURALNYCH DOTYCZĄCYCH WAŻNYCH CZĘŚCI TYCH CZYNNIKÓW ORAZ KOMPLEKSÓW POWSTAŁYCH MIĘDZY NIMI. W SZCZEGÓLNOŚCI BARDZO WAŻNE BYŁOBY OKREŚLENIE STRUKTURY KOMPLETNEGO EFI3, NAJBARDZIEJ ZŁOŻONEGO Z EFI I WAŻNEGO CELU REGULACJI, A TAKŻE STRUKTURY KOMPLEKSÓW EFI3 WRAZ Z INNYMI WAŻNYMI CELAMI ROZPORZĄDZENIA, TAKIMI JAK EFI4F, EFI2, EFI5 I EFI1. ABY TO ZROBIĆ, ZAMIERZAM POŁĄCZYĆ KRYSTALOGRAFIĘ RTG I KRIO-EM, ABY WYJAŚNIĆ TE STRUKTURY, KTÓRE RZUCĄ ŚWIATŁO NA PEWNE SZCZEGÓLNE ASPEKTY INICJACJI TŁUMACZENIA W EUKARIOTACH, I UTORUJĄ DROGĘ DO MECHANISTYCZNEGO ZROZUMIENIA TEGO, JAK MOŻNA REGULOWAĆ TEN PROCES. To WNOWLEDGE PROVIDE US W STRATEGY DLA TARGETING SOME COMPLEXES, Które mogą być kandydatami do rozmieszczania POSSIBLE ANTI-tumoral TREATMENTS, tak jak to jest konieczne do zagospodarowania ANTIBIOTICY I ANTIVIRALS._x000D_ BASED NA NASZYCH KRYO-EM MAPS W LOW RESOLUTION, będziemy projektować SEVERAL CONSTRUCTS DIFFERENT DOMAINS EIF3 i overexpress LUB CO-EXPRESS THE TOGETHER Z innymi EIFS LUB CZĘŚCIEM W SYSTEMACH heterologicznych I będziemy CARRY OUT X-RAY CRYSTALLISATION TRIALS z nimi. BĘDZIEMY STOSOWAĆ PODOBNE PODEJŚCIE W CELU UZYSKANIA INFORMACJI STRUKTURALNYCH DOTYCZĄCYCH EFI4F. BIORĄC POD UWAGĘ DUŻĄ WIELKOŚĆ KOMPLEKSU WIELOCZYNNIKOWEGO (EIF3-EIF2-EIF5-EIF2), DO OKREŚLENIA JEGO STRUKTURY UŻYJEMY POJEDYNCZEJ CZĄSTKI EM. NAJPIERW UŻYJEMY UJEMNYCH TECHNIK PLAM, A PÓŹNIEJ NA KRIO-EM. PONADTO ZBADAMY PRZYDATNOŚĆ KOMPLEKSU EFI3-EIF4F JAKO CELU STRUKTURALNEGO OKREŚLENIA PRZEZ EM, JEŚLI UDA NAM SIĘ STWORZYĆ STABILNY KOMPLEKS. WRESZCIE, BĘDĘ ZAANGAŻOWANY W PROMOWANIE I ROZWÓJ MONOCZĄSTECZEK EM W VALENCIA.THIS JEST BARDZO POTĘŻNĄ TECHNIKĄ, KTÓRA MOŻE BYĆ KLUCZOWA DLA SUKCESU TRWAJĄCYCH BADAŃ WIELU INNYCH RÓŻNYCH GRUP. (Polish)
17 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2017-85814-P
0 references