GENETIC INTERACTION BETWEEN THE TOR ROUTE AND MRNA PROCESSING IN MAGNAPORTHE ORYZAE (Q3156424)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3156424 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENETIC INTERACTION BETWEEN THE TOR ROUTE AND MRNA PROCESSING IN MAGNAPORTHE ORYZAE |
Project Q3156424 in Spain |
Statements
111,344.8 Euro
0 references
204,490.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
15 September 2015
0 references
14 September 2018
0 references
UNIVERSIDAD POLITECNICA DE MADRID
0 references
28223
0 references
EL ARROZ ES EL ALIMENTO BASICO MAS AMPLIAMENTE DISTRIBUIDO EN EL MUNDO. ADEMAS REPRESENTA UN IMPORTANTE PORCENTAJE DE LOS CULTIVOS MUNDIALES, ALCANZANDO HASTA 160 MILLONES DE HECTAREAS ANUALES. UNO DE LOS AGENTES PATOGENOS MAS DEVASTADORES DE ARROZ ES EL HONGO QUE PRODUCE LA ENFERMEDAD DE LA PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. LAS PERDIDAS DE RENDIMIENTO CAUSADAS POR ESTA ENFERMEDAD OSCILAN ENTRE EL 10-30% POR AÑO, LO QUE, INCLUSO EN LA ESTIMACION MAS CONSERVADORA, SON SUFICIENTES PARA ALIMENTAR A 60 MILLONES DE PERSONAS (SKAMNIOTI&GURR, 2009). TOR ES UNA CONSERVADA SERINA/TREONINA QUINASA PRESENTE EN TODOS LOS EUCARIOTAS DESDE HONGOS A SERES HUMANOS. TAMBIEN ES EL COMPONENTE ESENCIAL DE LAS RUTAS DE CENSADO DE NUTRIENTES DE LAS CELULAS EUCARIOTAS. AUNQUE LAS QUINASAS TOR (¿TARGET OF RAPAMYCIN¿) ESTAN CONSERVADAS, LOS HONGOS HA DESARROLLADO DISTINTAS ESTRATEGIAS PARA USAR ESTA RUTA DE SEÑALIZACION. RBP35 ES UN FACTOR DE POLIADENILACION ESPECIFICO EN HONGOS FILAMENTOSOS. EL MUTANTE RBP35 PRESENTA UN COMPORTAMIENTO ALTERADO FRENTE A DIFERENTES NUTRIENTES, POSEE UNA AUTOFAGIA ACELERADA Y ADEMAS TIENE UNA MAYOR RESISTENCIA A RAPAMICINA. TODO ESTO NOS SUGIERE QUE RBP35 ESTA ACTUANDO FUERTEMENTE EN LA RUTA DE SEÑALIZACION TOR. DE HECHO, TOR ES LA VIA DE SEÑALIZACION MAS AFECTADA EN ESTE MUTANTE. UN ANALISIS GLOBAL DE SITIOS DE POLI(A) A ESCALA GENOMICA HA IDENTIFICADO LA PARTICIPACION DE RBP35 EN LA POLIADENILACION ALTERNATIVA DE M. ORYZAE. EN CELULAS SOMETIDAS A HAMBRE DE CARBONO, DIECIOCHO DE LOS TREINTA COMPONENTES DE LA RUTA DE SEÑALIZACION TOR POSEEN SITIOS ALTERNATIVOS (APA) DE POLIADENILACION. BASANDONOS EN ESTOS RESULTADOS, PODEMOS AFIRMAR QUE RBP35 ACTUA COMO UN MODULADOR CLAVE DE LA RUTA TOR. ESTE NOVEDOSO PROYECTO IDENTIFICARA LOS VINCULOS EXISTENTES ENTRE EL PROCESAMIENTO DE PRE-MRNA EN SU EXTREMO 3 ' Y LA RUTA TOR. ADEMAS ANALIZARA COMO ESTOS DOS PROCESOS REGULAN LA EXPRESION Y FUNCION DE GENES RELACIONADOS CON LA INFECCION DE M. ORYZAE. PARA ELLO, ESTE PROYECTO UTILIZA DOS ENFOQUES COMPLEMENTARIOS, COMBINANDO APROXIMACIONES DE GENETICA CLASICA, GENOMICA, BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR. CON LA EJECUCION DE SUS DOS OBJETIVOS SE DESCUBRIRA: 1) EL TIPO DE INTERACCIONES GENETICAS QUE CONECTAN RBP35 Y LA VIA TOR Y 2) COMO EL PROCESAMIENTO 3' DEPENDIENTE DE RBP35 PUEDE REGULAR ESTA VIA DE SEÑALIZACION. SE SABE QUE TOR REGULA LA EXPRESION DE PROTEINAS NECESARIAS PARA ADAPTARSE A SEÑALES NUTRICIONALES. ESTE PROYECTO TIENE EL RETO DE IDENTIFICAR NUEVAS PROTEINAS RELEVANTES PARA QUE EL HONGO SE ADAPTE CORRECTAMENTE AL MEDIO EXTERNO Y ANALIZARA COMO SE MODULA LA EXPRESION DE GENES IMPLICADOS EN LA RUTA DE SEÑALIZACION DE TOR A NIVEL POST-TRANSCRIPCIONAL. ESTO SE CONSEGUIRA DETERMINANDO LAS TASAS DE DEGRADACION DE ARNM, SU LOCALIZACION SUBCELULAR Y SUS NIVELES DE TRADUCCION. LOS RESULTADOS DERIVADOS DE ESTE PROYECTO SON RELEVANTES PARA LA SEGURIDAD ALIMENTARIA Y LA PROTECCION DE CULTIVOS. ESTE PROYECTO A SU VEZ TIENE IMPLICACIONES PRACTICAS YA QUE NOS PERMITIRA DESARROLLAR ESTRATEGIAS DURADERAS Y SOSTENIBLES PARA EL CONTROL DE ESTOS HONGOS PATOGENOS. ESPERAMOS ENCONTRAR NUEVAS CONEXIONES EN LA RUTA TOR EN M. ORYZAE. DADO EL IMPORTANTE PAPEL QUE DESEMPEÑA ESTA RUTA EN EL CRECIMIENTO DEL HONGO, LOS NUEVOS GENES IDENTIFICADOS COMO RESULTADO DE ESTE PROYECTO PODRIAN SER CLARAMENTE DIANAS PARA EL DESARROLLO DE MOLECULAS INHIBIDORAS. (Spanish)
0 references
RICE IS THE MOST WIDELY DISTRIBUTED BASIC FOOD IN THE WORLD. IT ALSO ACCOUNTS FOR A SIGNIFICANT PERCENTAGE OF WORLD CROPS, REACHING UP TO 160 MILLION HECTARES PER YEAR. ONE OF THE MOST DEVASTATING PATHOGENS OF RICE IS THE FUNGUS THAT PRODUCES PIRICULARIOSIS DISEASE, MAGNAPORTHE ORYZAE. Loss of income caused by this disease ranges between 10-30 % per year, which, INCLUDE IN THE MORE CONSERVATING STIMATION, are sufficient to feed 60 million people (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR IS A PRESERVED SERINE/THREONINE KINASE PRESENT IN ALL EUKARYOTES FROM FUNGI TO HUMANS. IT IS ALSO THE ESSENTIAL COMPONENT OF THE NUTRIENT CENSUS ROUTES OF EUKARYOTIC CELLS. ALTHOUGH TOR KINASES (TARGET OF RAPAMYCIN) ARE PRESERVED, MUSHROOMS HAVE DEVELOPED DIFFERENT STRATEGIES TO USE THIS SIGNAGE ROUTE. RBP35 IS A SPECIFIC POLYDENILATION FACTOR IN FILAMENTARY FUNGI. THE RBP35 MUTANT EXHIBITS ALTERED BEHAVIOR AGAINST DIFFERENT NUTRIENTS, HAS ACCELERATED AUTOPHAGIA AND ALSO HAS GREATER RESISTANCE TO RAPAMYCIN. ALL THIS SUGGESTS THAT RBP35 IS ACTING STRONGLY ON THE TOR SIGNAGE ROUTE. IN FACT, TOR IS THE MOST AFFECTED SIGNAGE ROUTE IN THIS MUTANT. A GLOBAL ANALYSIS OF POLY(A) SITES AT A GENOMIC SCALE HAS IDENTIFIED THE PARTICIPATION OF RBP35 IN M. ORYZAE’S ALTERNATIVE POLICY. IN CELLS SUBJECT TO CARBON HUNGER, EIGHTEEN OF THE THIRTY COMPONENTS OF THE TOR SIGNAGE ROUTE HAVE ALTERNATIVE SITES (APA) OF POLIADENILACION. BASED ON THESE RESULTS, WE CAN SAY THAT RBP35 ACTS AS A KEY MODULATOR OF THE TOR ROUTE. THIS NOVEL PROJECT WILL IDENTIFY THE LINKS BETWEEN PRE-MRNA PROCESSING AT ITS END 3 ' AND THE TOR ROUTE. IT WILL ALSO ANALYSE HOW THESE TWO PROCESSES REGULATE THE EXPRESSION AND FUNCTION OF GENES RELATED TO M. ORYZAE INFECTION. TO DO THIS, THIS PROJECT USES TWO COMPLEMENTARY APPROACHES, COMBINING APPROACHES OF CLASSICAL GENETICA, GENOMIC, MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY. WITH THE EXECUTION OF ITS TWO OBJECTIVES IT WILL BE DISCOVERED: 1) THE TYPE OF GENETIC INTERACTIONS CONNECTING RBP35 AND VIA TOR AND 2) AS THE 3' RBP35 DEPENDENT PROCESSING CAN REGULATE THIS SIGNALING WAY. TOR IS KNOWN TO REGULATE THE EXPRESSION OF PROTEINS NEEDED TO ADAPT TO NUTRITIONAL SIGNALS. THIS PROJECT HAS THE CHALLENGE OF IDENTIFYING RELEVANT NEW PROTEINS SO THAT THE FUNGUS ADAPTS CORRECTLY TO THE EXTERNAL ENVIRONMENT AND ANALYSED HOW THE EXPRESSION OF GENES INVOLVED IN THE TOR SIGNALING ROUTE AT THE POST-TRANSCRIPTIONAL LEVEL IS MODULATED. THIS WILL BE ACHIEVED BY DETERMINING THE RATES OF MRNA DEGRADATION, ITS SUBCELLULAR LOCATION AND ITS TRANSLATION LEVELS. THE RESULTS DERIVED FROM THIS PROJECT ARE RELEVANT FOR FOOD SECURITY AND CROP PROTECTION. THIS PROJECT IN TURN HAS PRACTICAL IMPLICATIONS AS IT WILL ALLOW US TO DEVELOP LASTING AND SUSTAINABLE STRATEGIES FOR THE CONTROL OF THESE PATHOGEN FUNGI. WE HOPE TO FIND NEW CONNECTIONS ON THE TOR ROUTE IN M. ORYZAE. GIVEN THE IMPORTANT ROLE THIS ROUTE PLAYS IN THE GROWTH OF THE FUNGUS, THE NEW GENES IDENTIFIED AS A RESULT OF THIS PROJECT COULD CLEARLY BE TARGETS FOR THE DEVELOPMENT OF INHIBITING MOLECULES. (English)
12 October 2021
0.4203705635951835
0 references
LE RIZ EST LA NOURRITURE DE BASE LA PLUS RÉPANDUE AU MONDE. ELLE REPRÉSENTE ÉGALEMENT UN POURCENTAGE IMPORTANT DES CULTURES MONDIALES, ATTEIGNANT JUSQU’À 160 MILLIONS D’HECTARES PAR AN. L’UN DES AGENTS PATHOGÈNES LES PLUS DÉVASTATEURS DU RIZ EST LE CHAMPIGNON QUI PRODUIT LA MALADIE DE PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. La perte de revenu causée par cette maladie varie de 10 à 30 % par an, ce qui, INCLUDE DANS LE PLUS de la stimulation conservatrice, est suffisant pour nourrir 60 millions de personnes (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR EST UNE SÉRINE/THRÉONINE KINASE CONSERVÉE PRÉSENTE DANS TOUS LES EUCARYOTES, DES CHAMPIGNONS AUX HUMAINS. C’EST AUSSI L’ÉLÉMENT ESSENTIEL DES VOIES DE RECENSEMENT DES ÉLÉMENTS NUTRITIFS DES CELLULES EUCARYOTES. BIEN QUE LES KINASES TOR (CIBLE DE RAPAMYCINE) SOIENT PRÉSERVÉES, LES CHAMPIGNONS ONT DÉVELOPPÉ DIFFÉRENTES STRATÉGIES POUR UTILISER CETTE VOIE DE SIGNALISATION. LE RBP35 EST UN FACTEUR DE POLYDENILATION SPÉCIFIQUE CHEZ LES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX. LE MUTANT RBP35 PRÉSENTE UN COMPORTEMENT MODIFIÉ CONTRE DIFFÉRENTS NUTRIMENTS, A ACCÉLÉRÉ L’AUTOPHAGIE ET A ÉGALEMENT UNE PLUS GRANDE RÉSISTANCE À LA RAPAMYCINE. TOUT CELA SUGGÈRE QUE RBP35 AGIT FORTEMENT SUR LA ROUTE DE SIGNALISATION TOR. EN FAIT, TOR EST LA ROUTE DE SIGNALISATION LA PLUS AFFECTÉE DANS CE MUTANT. UNE ANALYSE GLOBALE DES POLY(A) SITES À L’ÉCHELLE GÉNOMIQUE A PERMIS D’IDENTIFIER LA PARTICIPATION DE LA RBP35 À LA POLITIQUE ALTERNATIVE DE M. ORYZAE. DANS LES CELLULES SOUMISES À LA FAIM DE CARBONE, DIX-HUIT DES TRENTE COMPOSANTES DE LA ROUTE DE SIGNALISATION TOR ONT DES SITES ALTERNATIFS (APA) DE POLIADENILACION. SUR LA BASE DE CES RÉSULTATS, NOUS POUVONS DIRE QUE RBP35 AGIT COMME UN MODULATEUR CLÉ DE LA ROUTE TOR. CE NOUVEAU PROJET PERMETTRA D’IDENTIFIER LES LIENS ENTRE LE TRAITEMENT DE PRÉ-ARNM À SA FIN 3’ET LA ROUTE DES RPT. IL ANALYSERA ÉGALEMENT COMMENT CES DEUX PROCESSUS RÉGULENT L’EXPRESSION ET LA FONCTION DES GÈNES LIÉS À L’INFECTION PAR M. ORYZAE. POUR CE FAIRE, CE PROJET UTILISE DEUX APPROCHES COMPLÉMENTAIRES, COMBINANT DES APPROCHES DE BIOLOGIE GÉNÉTIQUE CLASSIQUE, GÉNOMIQUE, MOLÉCULAIRE ET CELLULAIRE. AVEC L’EXÉCUTION DE SES DEUX OBJECTIFS, IL SERA DÉCOUVERT: 1) LE TYPE D’INTERACTIONS GÉNÉTIQUES RELIANT RBP35 ET VIA TOR ET 2) EN TANT QUE TRAITEMENT DÉPENDANT 3' RBP35 PEUT RÉGULER CETTE FAÇON DE SIGNALISATION. LE TOR EST CONNU POUR RÉGULER L’EXPRESSION DES PROTÉINES NÉCESSAIRES POUR S’ADAPTER AUX SIGNAUX NUTRITIONNELS. CE PROJET A LE DÉFI D’IDENTIFIER DE NOUVELLES PROTÉINES PERTINENTES AFIN QUE LE CHAMPIGNON S’ADAPTE CORRECTEMENT À L’ENVIRONNEMENT EXTERNE ET ANALYSE COMMENT L’EXPRESSION DES GÈNES IMPLIQUÉS DANS LA VOIE DE SIGNALISATION TOR AU NIVEAU POST-TRANSCRIPTIONNEL EST MODULÉE. POUR CE FAIRE, ON DÉTERMINERA LES TAUX DE DÉGRADATION DE L’ARNM, SON EMPLACEMENT SUBCELLULAIRE ET SES NIVEAUX DE TRADUCTION. LES RÉSULTATS DE CE PROJET SONT PERTINENTS POUR LA SÉCURITÉ ALIMENTAIRE ET LA PROTECTION DES CULTURES. CE PROJET À SON TOUR A DES IMPLICATIONS PRATIQUES CAR IL NOUS PERMETTRA D’ÉLABORER DES STRATÉGIES DURABLES ET DURABLES DE LUTTE CONTRE CES CHAMPIGNONS PATHOGÈNES. NOUS ESPÉRONS TROUVER DE NOUVELLES LIAISONS SUR LA ROUTE TOR À M. ORYZAE. COMPTE TENU DU RÔLE IMPORTANT QUE JOUE CETTE VOIE DANS LA CROISSANCE DU CHAMPIGNON, LES NOUVEAUX GÈNES IDENTIFIÉS À LA SUITE DE CE PROJET POURRAIENT CLAIREMENT ÊTRE DES CIBLES POUR LE DÉVELOPPEMENT DE MOLÉCULES INHIBITRICES. (French)
4 December 2021
0 references
REIS IST DAS AM WEITESTEN VERBREITETE GRUNDNAHRUNGSMITTEL DER WELT. AUF SIE ENTFÄLLT AUCH EIN ERHEBLICHER ANTEIL DER WELTKULTUREN, DIE BIS ZU 160 MILLIONEN HEKTAR PRO JAHR ERREICHEN. EINER DER VERHEERENDSTEN KRANKHEITSERREGER VON REIS IST DER PILZ, DER PIRICULARIOSIS-KRANKHEIT, MAGNAPORTHE ORYZAE PRODUZIERT. Einkommensverluste, die durch diese Krankheit verursacht werden, liegen zwischen 10-30 % pro Jahr, was, INCLUDE IN DER MEHR konservierenden Schätzwerte, ausreichen, um 60 Millionen Menschen zu ernähren (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR IST EINE ERHALTENE SERIN/THREONINKINASE, DIE IN ALLEN EUKARYOTES VON PILZEN BIS ZUM MENSCHEN VORHANDEN IST. ES IST AUCH DER WESENTLICHE BESTANDTEIL DER NÄHRSTOFFZÄHLUNGSWEGE VON EUKARYOTISCHEN ZELLEN. OBWOHL TEM-KINASEN (ZIEL VON RAPAMYCIN) ERHALTEN SIND, HABEN PILZE UNTERSCHIEDLICHE STRATEGIEN ENTWICKELT, UM DIESE SIGNAGEROUTE ZU VERWENDEN. RBP35 IST EIN SPEZIFISCHER POLYDENILATION-FAKTOR IN FADENFÖRMIGEN PILZEN. DIE RBP35 MUTANT ZEIGT VERÄNDERTES VERHALTEN GEGEN VERSCHIEDENE NÄHRSTOFFE, HAT DIE AUTOPHAGIE BESCHLEUNIGT UND HAT AUCH EINE GRÖSSERE WIDERSTANDSFÄHIGKEIT GEGEN RAPAMYCIN. ALL DIES DEUTET DARAUF HIN, DASS RBP35 STARK AUF DER TEM-BESCHILDERUNGSROUTE WIRKT. IN DER TAT IST TOR DER AM STÄRKSTEN BETROFFENE SCHILDERUNGSWEG IN DIESER MUTANTE. EINE GLOBALE ANALYSE VON POLY(A)-STANDORTEN IM GENOMISCHEN MASSSTAB HAT DIE BETEILIGUNG VON RBP35 AN DER ALTERNATIVEN POLITIK VON M. ORYZAE IDENTIFIZIERT. IN ZELLEN, DIE DEM KOHLENSTOFFHUNGER AUSGESETZT SIND, VERFÜGEN ACHTZEHN DER DREISSIG KOMPONENTEN DER TEM-BESCHILDERUNG ÜBER ALTERNATIVE STANDORTE (APA) VON POLIADENILACION. BASIEREND AUF DIESEN ERGEBNISSEN KÖNNEN WIR SAGEN, DASS RBP35 ALS SCHLÜSSELMODULATOR DER TOR-ROUTE FUNGIERT. IN DIESEM NEUARTIGEN PROJEKT WERDEN DIE VERBINDUNGEN ZWISCHEN DER PRE-MRNA-VERARBEITUNG AM ENDE 3 ' UND DER TEM-ROUTE ERMITTELT. ES WIRD AUCH ANALYSIEREN, WIE DIESE BEIDEN PROZESSE DIE EXPRESSION UND FUNKTION VON GENEN IM ZUSAMMENHANG MIT M. ORYZAE-INFEKTIONEN REGULIEREN. DAZU VERWENDET DIESES PROJEKT ZWEI KOMPLEMENTÄRE ANSÄTZE, DIE ANSÄTZE KLASSISCHER GENETICA, GENOMISCHER, MOLEKULARER UND ZELLULÄRER BIOLOGIE KOMBINIERT. MIT DER UMSETZUNG SEINER BEIDEN ZIELE WIRD ES ENTDECKT WERDEN: 1) DIE ART DER GENETISCHEN WECHSELWIRKUNGEN, DIE RBP35 UND ÜBER TOR UND 2) VERBINDEN, DA DIE 3' RBP35-ABHÄNGIGE VERARBEITUNG DIESE SIGNALGEBUNG REGULIEREN KANN. TEM IST BEKANNT, UM DIE EXPRESSION VON PROTEINEN ZU REGULIEREN, DIE NOTWENDIG SIND, UM SICH AN ERNÄHRUNGSSIGNALE ANZUPASSEN. DIESES PROJEKT HAT DIE HERAUSFORDERUNG, RELEVANTE NEUE PROTEINE ZU IDENTIFIZIEREN, DAMIT SICH DER PILZ KORREKT AN DIE ÄUSSERE UMGEBUNG ANPASST UND ANALYSIERT, WIE DIE EXPRESSION VON GENEN, DIE AN DER TEM-SIGNALROUTE AUF DER POST-TRANSKRIPTIONALEN EBENE BETEILIGT SIND, MODULIERT WIRD. DIES WIRD DURCH DIE BESTIMMUNG DER WERTE DES ABBAUS VON MRNA, SEINER SUBZELLULÄREN LAGE UND SEINER ÜBERSETZUNGSNIVEAUS ERREICHT. DIE ERGEBNISSE AUS DIESEM PROJEKT SIND FÜR ERNÄHRUNGSSICHERHEIT UND PFLANZENSCHUTZ RELEVANT. DIESES PROJEKT WIEDERUM HAT PRAKTISCHE AUSWIRKUNGEN, DA ES UNS ERMÖGLICHEN WIRD, DAUERHAFTE UND NACHHALTIGE STRATEGIEN ZUR BEKÄMPFUNG DIESER KRANKHEITSPILZE ZU ENTWICKELN. WIR HOFFEN, NEUE VERBINDUNGEN AUF DER TOR-ROUTE IN M. ORYZAE ZU FINDEN. ANGESICHTS DER WICHTIGEN ROLLE, DIE DIESER WEG FÜR DAS WACHSTUM DES PILZES SPIELT, KÖNNTEN DIE NEUEN GENE, DIE ALS ERGEBNIS DIESES PROJEKTS IDENTIFIZIERT WURDEN, EINDEUTIG ZIELE FÜR DIE ENTWICKLUNG HEMMENDER MOLEKÜLE SEIN. (German)
9 December 2021
0 references
RIJST IS HET MEEST VERSPREIDE BASISVOEDSEL TER WERELD. HET IS OOK GOED VOOR EEN AANZIENLIJK PERCENTAGE VAN DE GEWASSEN IN DE WERELD, TOT 160 MILJOEN HECTARE PER JAAR. EEN VAN DE MEEST VERWOESTENDE ZIEKTEVERWEKKERS VAN RIJST IS DE SCHIMMEL DIE DE ZIEKTE VAN PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE PRODUCEERT. Inkomensverlies als gevolg van deze ziekte varieert van 10-30 % per jaar, wat voldoende is om 60 miljoen mensen te voeden (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR IS EEN BEWAARD GEBLEVEN SERINE/THREONINE KINASE AANWEZIG IN ALLE EUKARYOTES VAN SCHIMMELS TOT MENSEN. HET IS OOK DE ESSENTIËLE COMPONENT VAN DE NUTRIËNTENTELLING ROUTES VAN EUKARYOTIC CELLEN. HOEWEL TOR KINASEN (DOEL VAN RAPAMYCINE) WORDEN BEWAARD, HEBBEN PADDENSTOELEN VERSCHILLENDE STRATEGIEËN ONTWIKKELD OM DEZE BEWEGWIJZERING TE GEBRUIKEN. RBP35 IS EEN SPECIFIEKE POLYDENILATION FACTOR IN FILAMENTAIRE SCHIMMELS. DE RBP35 MUTANT VERTOONT VERANDERD GEDRAG TEGEN VERSCHILLENDE VOEDINGSSTOFFEN, HEEFT VERSNELDE AUTOPHAGIA EN HEEFT OOK EEN GROTERE WEERSTAND TEGEN RAPAMYCINE. DIT ALLES SUGGEREERT DAT RBP35 STERK WERKT OP DE TEM-SIGNAGEROUTE. IN FEITE, TEM IS DE MEEST GETROFFEN BEWEGWIJZERING ROUTE IN DEZE MUTANT. EEN GLOBALE ANALYSE VAN POLY(A) SITES OP GENOMISCHE SCHAAL HEEFT DE DEELNAME VAN RBP35 AAN HET ALTERNATIEVE BELEID VAN M. ORYZAE VASTGESTELD. IN CELLEN DIE AAN KOOLSTOFHONGER ONDERHEVIG ZIJN, HEBBEN ACHTTIEN VAN DE DERTIG COMPONENTEN VAN DE TOR-SIGNAGEROUTE ALTERNATIEVE LOCATIES (APA) VAN POLIADENILACION. OP BASIS VAN DEZE RESULTATEN KUNNEN WE ZEGGEN DAT RBP35 FUNGEERT ALS EEN BELANGRIJKE MODULATOR VAN DE TOR ROUTE. DIT NIEUWE PROJECT ZAL DE KOPPELINGEN IDENTIFICEREN TUSSEN PRE-MRNA-VERWERKING AAN HET EIND 3 ' EN DE TEM-ROUTE. HET ZAL OOK ANALYSEREN HOE DEZE TWEE PROCESSEN DE EXPRESSIE EN FUNCTIE VAN GENEN MET BETREKKING TOT M. ORYZAE-INFECTIE REGULEREN. OM DIT TE DOEN, GEBRUIKT DIT PROJECT TWEE COMPLEMENTAIRE BENADERINGEN, WAARBIJ BENADERINGEN VAN KLASSIEKE GENETICA, GENOMIC, MOLECULAIRE EN CELLULAIRE BIOLOGIE WORDEN GECOMBINEERD. MET DE VERWEZENLIJKING VAN DE TWEE DOELSTELLINGEN ZAL HET WORDEN ONTDEKT: 1) HET TYPE GENETISCHE INTERACTIES DIE RBP35 VERBINDEN EN VIA TOR EN 2) AANGEZIEN DE 3' RBP35 AFHANKELIJKE VERWERKING DEZE SIGNALERENDE MANIER KAN REGULEREN. HET IS BEKEND DAT TOR DE EXPRESSIE VAN EIWITTEN REGELT DIE NODIG ZIJN OM ZICH AAN TE PASSEN AAN VOEDINGSSIGNALEN. DIT PROJECT HEEFT DE UITDAGING OM RELEVANTE NIEUWE EIWITTEN TE IDENTIFICEREN ZODAT DE SCHIMMEL ZICH CORRECT AAN DE EXTERNE OMGEVING AANPAST EN GEANALYSEERD HOE DE EXPRESSIE VAN GENEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE TOR-SIGNALERINGSROUTE OP POST-TRANSCRIPTIONELE NIVEAU WORDT GEMODULEERD. DIT ZAL WORDEN BEREIKT DOOR DE SNELHEID VAN MRNA-DEGRADATIE, ZIJN SUBCELLULAIRE LOCATIE EN ZIJN VERTAALNIVEAUS TE BEPALEN. DE RESULTATEN VAN DIT PROJECT ZIJN RELEVANT VOOR VOEDSELZEKERHEID EN GEWASBESCHERMING. DIT PROJECT HEEFT OP ZIJN BEURT PRAKTISCHE IMPLICATIES OMDAT HET ONS IN STAAT ZAL STELLEN DUURZAME EN DUURZAME STRATEGIEËN TE ONTWIKKELEN VOOR DE BESTRIJDING VAN DEZE ZIEKTEVERWEKKERS. WE HOPEN NIEUWE VERBINDINGEN TE VINDEN OP DE TOR ROUTE IN M. ORYZAE. GEZIEN DE BELANGRIJKE ROL DIE DEZE ROUTE SPEELT IN DE GROEI VAN DE SCHIMMEL, KUNNEN DE NIEUWE GENEN DIE ALS GEVOLG VAN DIT PROJECT WORDEN GEÏDENTIFICEERD, DUIDELIJK DOELEN ZIJN VOOR DE ONTWIKKELING VAN REMMENDE MOLECULEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL RISO È IL CIBO DI BASE PIÙ DIFFUSO AL MONDO. RAPPRESENTA INOLTRE UNA PERCENTUALE SIGNIFICATIVA DELLE COLTURE MONDIALI, RAGGIUNGENDO FINO A 160 MILIONI DI ETTARI ALL'ANNO. UNO DEI PATOGENI PIÙ DEVASTANTI DEL RISO È IL FUNGO CHE PRODUCE LA MALATTIA DI PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. La perdita di reddito causata da questa malattia varia tra il 10-30 % all'anno, che, INCLUDE NEL MORE conservante stima, sono sufficienti a nutrire 60 milioni di persone (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR È UNA SERINA/TREONINA CHINASI CONSERVATA PRESENTE IN TUTTI GLI EUCARIOTI DAI FUNGHI ALL'UOMO. È ANCHE LA COMPONENTE ESSENZIALE DELLE VIE DI CENSIMENTO DEI NUTRIENTI DELLE CELLULE EUCARIOTICHE. SEBBENE LE TOR CHINASI (OBIETTIVO DI RAPAMICINA) SIANO CONSERVATE, I FUNGHI HANNO SVILUPPATO DIVERSE STRATEGIE PER UTILIZZARE QUESTA VIA DI SEGNALETICA. RBP35 È UN FATTORE SPECIFICO DI POLIDENILAZIONE NEI FUNGHI FILAMENTOSI. IL MUTANTE RBP35 MOSTRA UN COMPORTAMENTO ALTERATO CONTRO DIVERSI NUTRIENTI, HA ACCELERATO L'AUTOFAGIA E HA ANCHE UNA MAGGIORE RESISTENZA ALLA RAPAMICINA. TUTTO CIÒ SUGGERISCE CHE L'RBP35 STIA AGENDO CON FORZA SULLA ROTTA SEGNALETICA DELLE RPT. INFATTI, LA TOR È LA VIA DI SEGNALETICA PIÙ COLPITA IN QUESTO MUTANTE. UN'ANALISI GLOBALE DEI SITI POLI(A) SU SCALA GENOMICA HA INDIVIDUATO LA PARTECIPAZIONE DI RBP35 ALLA POLITICA ALTERNATIVA DI M. ORYZAE. NELLE CELLULE SOGGETTE ALLA FAME DI CARBONIO, DICIOTTO DEI TRENTA COMPONENTI DELLA SEGNALETICA TOR HANNO SITI ALTERNATIVI (APA) DI POLIADENILACION. SULLA BASE DI QUESTI RISULTATI, POSSIAMO DIRE CHE RBP35 FUNGE DA MODULATORE CHIAVE DEL PERCORSO TOR. QUESTO NUOVO PROGETTO INDIVIDUERÀ I COLLEGAMENTI TRA L'ELABORAZIONE PRE-MRNA ALLA SUA FINE 3'E IL PERCORSO TOR. ANALIZZERÀ ANCHE COME QUESTI DUE PROCESSI REGOLANO L'ESPRESSIONE E LA FUNZIONE DEI GENI RELATIVI ALL'INFEZIONE DA M. ORYZAE. PER FARE QUESTO, QUESTO PROGETTO UTILIZZA DUE APPROCCI COMPLEMENTARI, COMBINANDO APPROCCI DI GENETICA CLASSICA, GENOMICA, MOLECOLARE E BIOLOGIA CELLULARE. CON L'ESECUZIONE DEI SUOI DUE OBIETTIVI VERRÀ SCOPERTO: 1) IL TIPO DI INTERAZIONI GENETICHE CHE COLLEGANO RBP35 E VIA TOR E 2) COME L'ELABORAZIONE DIPENDENTE DA 3' RBP35 PUÒ REGOLARE QUESTO MODO DI SEGNALAZIONE. TOR È NOTO PER REGOLARE L'ESPRESSIONE DELLE PROTEINE NECESSARIE PER ADATTARSI AI SEGNALI NUTRIZIONALI. QUESTO PROGETTO HA LA SFIDA DI IDENTIFICARE NUOVE PROTEINE RILEVANTI IN MODO CHE IL FUNGO SI ADATTA CORRETTAMENTE ALL'AMBIENTE ESTERNO E HA ANALIZZATO COME L'ESPRESSIONE DEI GENI COINVOLTI NEL PERCORSO DI SEGNALAZIONE TOR A LIVELLO POST-TRANSCRIPTIONAL È MODULATA. CIÒ SARÀ RAGGIUNTO DETERMINANDO I TASSI DI DEGRADAZIONE DELL'MRNA, LA SUA POSIZIONE SUBCELLULARE E I SUOI LIVELLI DI TRADUZIONE. I RISULTATI OTTENUTI DA QUESTO PROGETTO SONO RILEVANTI PER LA SICUREZZA ALIMENTARE E LA PROTEZIONE DELLE COLTURE. QUESTO PROGETTO HA A SUA VOLTA IMPLICAZIONI PRATICHE IN QUANTO CI PERMETTERÀ DI SVILUPPARE STRATEGIE DURATURE E SOSTENIBILI PER IL CONTROLLO DI QUESTI FUNGHI PATOGENI. SPERIAMO DI TROVARE NUOVI COLLEGAMENTI SULLA ROTTA TOR IN M. ORYZAE. DATO IL RUOLO IMPORTANTE CHE QUESTA VIA SVOLGE NELLA CRESCITA DEL FUNGO, I NUOVI GENI IDENTIFICATI COME RISULTATO DI QUESTO PROGETTO POTREBBERO CHIARAMENTE ESSERE OBIETTIVI PER LO SVILUPPO DI MOLECOLE INIBITRICI. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΟ ΡΎΖΙ ΕΊΝΑΙ ΤΟ ΠΙΟ ΔΙΑΔΕΔΟΜΈΝΟ ΒΑΣΙΚΌ ΦΑΓΗΤΌ ΣΤΟΝ ΚΌΣΜΟ. ΑΝΤΙΠΡΟΣΩΠΕΎΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΠΟΣΟΣΤΌ ΤΩΝ ΠΑΓΚΌΣΜΙΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ, ΦΘΆΝΟΝΤΑΣ ΈΩΣ ΚΑΙ 160 ΕΚΑΤΟΜΜΎΡΙΑ ΕΚΤΆΡΙΑ ΕΤΗΣΊΩΣ. ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΠΙΟ ΚΑΤΑΣΤΡΟΦΙΚΆ ΠΑΘΟΓΌΝΑ ΤΟΥ ΡΥΖΙΟΎ ΕΊΝΑΙ Ο ΜΎΚΗΤΑΣ ΠΟΥ ΠΑΡΆΓΕΙ ΤΗ ΝΌΣΟ PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. Η απώλεια εισοδήματος που προκαλείται από τη νόσο αυτή κυμαίνεται μεταξύ 10-30 % ετησίως, τα οποία, INCLUDE IN THE MORE διατήρηση της διέγερσης, είναι επαρκή για τη διατροφή 60 εκατομμύρια άτομα (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). ΤΟ TOR ΕΊΝΑΙ ΜΙΑ ΔΙΑΤΗΡΗΜΈΝΗ SERINE/THREONINE ΚΙΝΆΣΗ ΠΟΥ ΥΠΆΡΧΕΙ ΣΕ ΌΛΟΥΣ ΤΟΥΣ ΕΥΚΑΡΥΏΤΕΣ ΑΠΌ ΜΎΚΗΤΕΣ ΣΕ ΑΝΘΡΏΠΟΥΣ. ΕΊΝΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΤΟ ΒΑΣΙΚΌ ΣΥΣΤΑΤΙΚΌ ΤΩΝ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΏΝ ΟΔΏΝ ΑΠΟΓΡΑΦΉΣ ΤΩΝ ΕΥΚΑΡΥΩΤΙΚΏΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ. ΑΝ ΚΑΙ ΟΙ ΚΙΝΆΣΕΣ (ΣΤΌΧΟΣ ΤΗΣ ΡΑΠΑΜΥΚΊΝΗΣ) ΔΙΑΤΗΡΟΎΝΤΑΙ, ΤΑ ΜΑΝΙΤΆΡΙΑ ΈΧΟΥΝ ΑΝΑΠΤΎΞΕΙ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΓΙΑ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΑΥΤΉΣ ΤΗΣ ΔΙΑΔΡΟΜΉΣ ΣΉΜΑΝΣΗΣ. ΤΟ RBP35 ΕΊΝΑΙ ΈΝΑΣ ΕΙΔΙΚΌΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΠΟΛΥΔΕΝΩΣΗΣ ΣΕ ΝΗΜΑΤΏΔΕΙΣ ΜΎΚΗΤΕΣ. Ο ΜΕΤΑΛΛΑΓΜΈΝΟΣ RBP35 ΠΑΡΟΥΣΙΆΖΕΙ ΑΛΛΟΙΩΜΈΝΗ ΣΥΜΠΕΡΙΦΟΡΆ ΕΝΆΝΤΙΑ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΘΡΕΠΤΙΚΆ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ, ΈΧΕΙ ΕΠΙΤΑΧΎΝΕΙ ΤΗΝ ΑΥΤΟΦΑΓΊΑ ΚΑΙ ΈΧΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΑΝΤΟΧΉ ΣΤΗ ΡΑΠΑΜΥΚΊΝΗ. ΌΛΑ ΑΥΤΆ ΔΕΊΧΝΟΥΝ ΌΤΙ ΤΟ RBP35 ΕΝΕΡΓΕΊ ΈΝΤΟΝΑ ΣΤΗ ΔΙΑΔΡΟΜΉ ΣΉΜΑΝΣΗΣ ΠΙΠ. ΣΤΗΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ, ΤΟ TOR ΕΊΝΑΙ Η ΠΙΟ ΕΠΗΡΕΑΖΌΜΕΝΗ ΟΔΌΣ ΣΉΜΑΝΣΗΣ ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΜΕΤΑΛΛΑΓΜΈΝΟ. ΜΙΑ ΣΦΑΙΡΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΠΟΛΥ(Α) ΤΟΠΟΘΕΣΙΏΝ ΣΕ ΚΛΊΜΑΚΑ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΈΧΕΙ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΕΙ ΤΗ ΣΥΜΜΕΤΟΧΉ ΤΗΣ RBP35 ΣΤΗΝ ΕΝΑΛΛΑΚΤΙΚΉ ΠΟΛΙΤΙΚΉ ΤΟΥ M. ORYZAE. ΣΕ ΚΥΨΈΛΕΣ ΠΟΥ ΥΠΌΚΕΙΝΤΑΙ ΣΕ ΠΕΊΝΑ ΆΝΘΡΑΚΑ, ΔΕΚΑΟΚΤΏ ΑΠΌ ΤΙΣ ΤΡΙΆΝΤΑ ΣΥΝΙΣΤΏΣΕΣ ΤΗΣ ΟΔΟΎ ΣΉΜΑΝΣΗΣ ΠΙΠ ΈΧΟΥΝ ΕΝΑΛΛΑΚΤΙΚΈΣ ΤΟΠΟΘΕΣΊΕΣ (APA) ΤΗΣ POLIADENILACION. ΜΕ ΒΆΣΗ ΑΥΤΆ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ, ΜΠΟΡΟΎΜΕ ΝΑ ΠΟΎΜΕ ΌΤΙ ΤΟ RBP35 ΛΕΙΤΟΥΡΓΕΊ ΩΣ ΒΑΣΙΚΌΣ ΔΙΑΜΟΡΦΩΤΉΣ ΤΗΣ ΔΙΑΔΡΟΜΉΣ ΠΙΠ. ΑΥΤΌ ΤΟ ΝΈΟ ΣΧΈΔΙΟ ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΕΙ ΤΙΣ ΣΥΝΔΈΣΕΙΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΗΣ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑΣ PRE-MRNA ΣΤΟ ΤΈΛΟΣ ΤΟΥ 3’ ΚΑΙ ΤΗΣ ΔΙΑΔΡΟΜΉΣ ΤΩΝ ΠΙΠ. ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΤΟΝ ΤΡΌΠΟ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΔΎΟ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΚΑΙ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΛΟΊΜΩΞΗ ΑΠΌ M. ORYZAE. ΓΙΑ ΝΑ ΓΊΝΕΙ ΑΥΤΌ, ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΕΊ ΔΎΟ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΈΣ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ, ΣΥΝΔΥΆΖΟΝΤΑΣ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ ΤΗΣ ΚΛΑΣΙΚΉΣ GENETICA, ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ, ΜΟΡΙΑΚΉΣ ΚΑΙ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ. ΜΕ ΤΗΝ ΕΚΤΈΛΕΣΗ ΤΩΝ ΔΎΟ ΣΤΌΧΩΝ ΤΗΣ ΘΑ ΑΝΑΚΑΛΥΦΘΕΊ: 1) Ο ΤΎΠΟΣ ΤΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΩΝ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΥΝ ΤΟ RBP35 ΚΑΙ ΜΈΣΩ ΤΩΝ ΠΙΠ ΚΑΙ 2) ΌΠΩΣ Η 3’ RBP35 ΕΞΑΡΤΏΜΕΝΗ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΡΥΘΜΊΣΕΙ ΑΥΤΌΝ ΤΟΝ ΤΡΌΠΟ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ. ΤΟ TOR ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΌ ΌΤΙ ΡΥΘΜΊΖΕΙ ΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΠΟΥ ΑΠΑΙΤΟΎΝΤΑΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΣΤΑ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΆ ΣΉΜΑΤΑ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΈΧΕΙ ΤΗΝ ΠΡΌΚΛΗΣΗ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΕΙ ΣΧΕΤΙΚΈΣ ΝΈΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ, ΈΤΣΙ ΏΣΤΕ Ο ΜΎΚΗΤΑΣ ΝΑ ΠΡΟΣΑΡΜΌΖΕΤΑΙ ΣΩΣΤΆ ΣΤΟ ΕΞΩΤΕΡΙΚΌ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝ ΚΑΙ ΝΑ ΑΝΑΛΎΕΙ ΤΟΝ ΤΡΌΠΟ ΔΙΑΜΌΡΦΩΣΗΣ ΤΗΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗ ΔΙΑΔΡΟΜΉ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΠΙΠ ΣΕ ΜΕΤΑΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ. ΑΥΤΌ ΘΑ ΕΠΙΤΕΥΧΘΕΊ ΜΕ ΤΟΝ ΚΑΘΟΡΙΣΜΌ ΤΩΝ ΠΟΣΟΣΤΏΝ ΥΠΟΒΆΘΜΙΣΗΣ ΤΟΥ MRNA, ΤΗΣ ΥΠΟΚΥΤΤΑΡΙΚΉΣ ΘΈΣΗΣ ΤΟΥ ΚΑΙ ΤΩΝ ΕΠΙΠΈΔΩΝ ΜΕΤΆΦΡΑΣΉΣ ΤΟΥ. ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΑΥΤΟΎ ΕΊΝΑΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΆ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΣΙΤΙΣΤΙΚΉ ΑΣΦΆΛΕΙΑ ΚΑΙ ΤΗΝ ΠΡΟΣΤΑΣΊΑ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΜΕ ΤΗ ΣΕΙΡΆ ΤΟΥ ΈΧΕΙ ΠΡΑΚΤΙΚΈΣ ΕΠΙΠΤΏΣΕΙΣ, ΚΑΘΏΣ ΘΑ ΜΑΣ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΝΑ ΑΝΑΠΤΎΞΟΥΜΕ ΒΙΏΣΙΜΕΣ ΚΑΙ ΒΙΏΣΙΜΕΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΜΥΚΉΤΩΝ. ΕΛΠΊΖΟΥΜΕ ΝΑ ΒΡΟΎΜΕ ΝΈΕΣ ΣΥΝΔΈΣΕΙΣ ΣΤΗ ΔΙΑΔΡΟΜΉ TOR ΣΤΟ M. ORYZAE. ΔΕΔΟΜΈΝΟΥ ΤΟΥ ΣΗΜΑΝΤΙΚΟΎ ΡΌΛΟΥ ΠΟΥ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΖΕΙ ΑΥΤΉ Η ΟΔΌΣ ΣΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΤΟΥ ΜΎΚΗΤΑ, ΤΑ ΝΈΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΟΝΤΑΙ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΑΝ ΣΑΦΏΣ ΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΟΥΝ ΣΤΌΧΟΥΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΑΝΑΣΤΑΛΤΙΚΏΝ ΜΟΡΊΩΝ. (Greek)
17 August 2022
0 references
RIS ER DEN MEST UDBREDTE GRUNDLÆGGENDE MAD I VERDEN. DEN TEGNER SIG OGSÅ FOR EN BETYDELIG PROCENTDEL AF VERDENS AFGRØDER, DER NÅR OP PÅ 160 MIO. HA OM ÅRET. ET AF DE MEST ØDELÆGGENDE PATOGENER AF RIS ER SVAMPEN, DER PRODUCERER PIRICULARIOSIS SYGDOM, MAGNAPORTHE ORYZAE. Indkomsttab som følge af denne sygdom ligger på mellem 10-30 % om året, hvilket er tilstrækkeligt til at brødføde 60 millioner mennesker (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR ER EN KONSERVERET SERIN/THREONINKINASE, DER FINDES I ALLE EUKARYOTER FRA SVAMPE TIL MENNESKER. DET ER OGSÅ DEN VÆSENTLIGE KOMPONENT I NÆRINGSSTOFTÆLLINGEN AF EUKARYOTISKE CELLER. SELVOM TOR KINASER (MÅL FOR RAPAMYCIN) ER BEVARET, SVAMPE HAR UDVIKLET FORSKELLIGE STRATEGIER FOR AT BRUGE DENNE SKILTNING RUTE. RBP35 ER EN SPECIFIK POLYDENILATIONSFAKTOR I TRÅDSVAMPE. RBP35 MUTANT UDVISER ÆNDRET ADFÆRD MOD FORSKELLIGE NÆRINGSSTOFFER, HAR ACCELERERET AUTOFAGI OG HAR OGSÅ STØRRE RESISTENS OVER FOR RAPAMYCIN. ALT DETTE TYDER PÅ, AT RBP35 HANDLER STÆRKT PÅ SKILTNINGSRUTEN FOR TRADITIONELLE EGNE INDTÆGTER. FAKTISK, TOR ER DEN MEST BERØRTE SKILTNING RUTE I DENNE MUTANT. EN GLOBAL ANALYSE AF POLY(A)-OMRÅDER PÅ GENOMISK SKALA HAR IDENTIFICERET RBP35'S DELTAGELSE I M. ORYZAES ALTERNATIVE POLITIK. I CELLER, DER ER UDSAT FOR KULSTOF SULT, HAR ATTEN AF DE TREDIVE KOMPONENTER I TOR SKILTNING RUTE ALTERNATIVE STEDER (APA) AF POLIADENILACION. BASERET PÅ DISSE RESULTATER, KAN VI SIGE, AT RBP35 FUNGERER SOM EN CENTRAL MODULATOR AF TOR RUTE. DETTE NYE PROJEKT VIL IDENTIFICERE FORBINDELSERNE MELLEM PRE-MRNA-BEHANDLING I SLUTNINGEN AF 3 ") OG TOR-RUTEN. DET VIL OGSÅ ANALYSERE, HVORDAN DISSE TO PROCESSER REGULERER EKSPRESSIONEN OG FUNKTIONEN AF GENER RELATERET TIL M. ORYZAE INFEKTION. FOR AT GØRE DETTE BRUGER DETTE PROJEKT TO KOMPLEMENTÆRE TILGANGE, DER KOMBINERER METODER FRA KLASSISK GENETICA, GENOMISK, MOLEKYLÆR OG CELLULÆR BIOLOGI. MED GENNEMFØRELSEN AF SINE TO MÅL VIL DET BLIVE OPDAGET: 1) TYPEN AF GENETISKE INTERAKTIONER FORBINDER RBP35 OG VIA TOR OG 2) SOM 3' RBP35 AFHÆNGIG BEHANDLING KAN REGULERE DENNE SIGNALING MÅDE. TOR ER KENDT FOR AT REGULERE UDTRYKKET AF PROTEINER, DER ER NØDVENDIGE FOR AT TILPASSE SIG ERNÆRINGSSIGNALER. DETTE PROJEKT HAR DEN UDFORDRING AT IDENTIFICERE RELEVANTE NYE PROTEINER, SÅLEDES AT SVAMPEN TILPASSER SIG DET YDRE MILJØ OG ANALYSEREDE, HVORDAN EKSPRESSIONEN AF GENER, DER ER INVOLVERET I TOR-SIGNALVEJEN PÅ POST-TRANSKRIPTIONSNIVEAU, MODULERES. DETTE VIL BLIVE OPNÅET VED AT BESTEMME HASTIGHEDEN AF MRNA NEDBRYDNING, DENS SUBCELLULÆRE PLACERING OG DETS OVERSÆTTELSESNIVEAUER. RESULTATERNE AF DETTE PROJEKT ER RELEVANTE FOR FØDEVARESIKKERHED OG AFGRØDEBESKYTTELSE. DETTE PROJEKT HAR IGEN PRAKTISKE KONSEKVENSER, DA DET VIL GIVE OS MULIGHED FOR AT UDVIKLE VARIGE OG BÆREDYGTIGE STRATEGIER FOR BEKÆMPELSE AF DISSE PATOGENSVAMPE. VI HÅBER AT FINDE NYE FORBINDELSER PÅ TOR RUTEN I M. ORYZAE. I BETRAGTNING AF DEN VIGTIGE ROLLE, SOM DENNE RUTE SPILLER FOR SVAMPENS VÆKST, KAN DE NYE GENER, DER IDENTIFICERES SOM FØLGE AF DETTE PROJEKT, HELT KLART VÆRE MÅL FOR UDVIKLINGEN AF HÆMMENDE MOLEKYLER. (Danish)
17 August 2022
0 references
RIISI ON MAAILMAN LAAJIN PERUSRUOKA. SE KATTAA MYÖS MERKITTÄVÄN OSAN MAAPALLON VILJELYKASVEISTA, JA SEN OSUUS ON 160 MILJOONAA HEHTAARIA VUODESSA. YKSI TUHOISIMMISTA RIISIN PATOGEENEISTÄ ON SIENI, JOKA TUOTTAA PIRICULARIOSIS-TAUTIA, MAGNAPORTHE ORYZAEA. Tämän taudin aiheuttama tulonmenetys vaihtelee 10–30 % vuodessa, mikä, INCLUDE IN LISÄÄ Stimaatio, riittävät ruokkimaan 60 miljoonaa ihmistä (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR ON SÄILÖTTY SERIINI/TREONIINIKINAASI, JOTA ESIINTYY KAIKISSA EUKARYOTEISSA SIENISTÄ IHMISIIN. SE ON MYÖS OLENNAINEN OSA EUKARYOOTTISTEN SOLUJEN RAVINNELASKENNAN REITTEJÄ. VAIKKA PERINTEISET KINAASIT (RAPAMYSIININ KOHDE) SÄILYVÄT, SIENET OVAT KEHITTÄNEET ERILAISIA STRATEGIOITA KÄYTTÄÄKSEEN TÄTÄ OPASTINREITTIÄ. RBP35 ON ERITYINEN POLYDENILATION-TEKIJÄ SÄIESIENISSÄ. RBP35 MUTANTTI ESITTELEE MUUTTUNUT KÄYTTÄYTYMISTÄ VASTAAN ERI RAVINTOAINEITA, ON KIIHDYTTÄNYT AUTOFAGIA JA ON MYÖS SUUREMPI VASTUSTUSKYKY RAPAMYSIINILLE. KAIKKI TÄMÄ VIITTAA SIIHEN, ETTÄ RBP35 TOIMII VOIMAKKAASTI PERINTEISTEN OMIEN VAROJEN OPASTUSREITILLÄ. ITSE ASIASSA, TOR ON ENITEN VAIKUTUSVALTAINEN OPASTEIDEN REITTI TÄSSÄ MUTANTISSA. MAAILMANLAAJUISESSA ANALYYSISSÄ POLY(A)-PAIKOISTA GENOMIASTEIKOLLA ON TUNNISTETTU RBP35:N OSALLISTUMINEN ORYZAEN VAIHTOEHTOISEEN POLITIIKKAAN. HIILINÄLÄN KOETTELEMISSA SOLUISSA 18:LLA PERINTEISTEN OMIEN VAROJEN ILMOITUSREITIN KOLMESTAKYMMENESTÄ OSASTA ON POLIADENILACIONIN VAIHTOEHTOISIA PAIKKOJA (APA). NÄIDEN TULOSTEN PERUSTEELLA VOIDAAN SANOA, ETTÄ RBP35 TOIMII TOR-REITIN KESKEISENÄ MODULAATTORINA. TÄMÄ UUSI HANKE TUNNISTAA YHTEYDET PRE-MRNA KÄSITTELY SEN LOPUSSA 3 ’ JA TOR REITTI. SE ANALYSOI MYÖS, MITEN NÄMÄ KAKSI PROSESSIA SÄÄTELEVÄT M. ORYZAE -INFEKTIOON LIITTYVIEN GEENIEN ILMENTYMISTÄ JA TOIMINTAA. TÄTÄ VARTEN TÄSSÄ HANKKEESSA KÄYTETÄÄN KAHTA TOISIAAN TÄYDENTÄVÄÄ LÄHESTYMISTAPAA, JOISSA YHDISTYVÄT KLASSISEN GENETIIKAN, GENOMI-, MOLEKYYLI- JA SOLUBIOLOGIAN LÄHESTYMISTAVAT. SEN KAHDEN TAVOITTEEN TÄYTÄNTÖÖNPANOSSA HAVAITAAN SEURAAVAA: 1) GENEETTISTEN VUOROVAIKUTUSTEN TYYPPI YHDISTÄÄ RBP35 JA KAUTTA TOR JA 2) KOSKA 3’ RBP35 RIIPPUVAINEN KÄSITTELY VOI SÄÄDELLÄ TÄTÄ SIGNAALIN. PERINTEISTEN OMIEN VAROJEN TIEDETÄÄN SÄÄNTELEVÄN RAVINTOSIGNAALEIHIN MUKAUTUMISEEN TARVITTAVIEN PROTEIINIEN ILMENTYMISTÄ. HANKKEEN HAASTEENA ON TUNNISTAA UUSIA MERKITYKSELLISIÄ PROTEIINEJA, JOTTA SIENI MUKAUTUU OIKEIN ULKOISEEN YMPÄRISTÖÖN JA ANALYSOIDAAN, MITEN PERINTEISTEN OMIEN VAROJEN MERKINANTOREITTIIN LIITTYVIEN GEENIEN ILMENTYMINEN TRANSKRIPTION JÄLKEISELLÄ TASOLLA ON MODULOITU. TÄMÄ SAAVUTETAAN MÄÄRITTÄMÄLLÄ MRNA-HAJOAMISNOPEUDET, SEN SUBSELLULAARINEN SIJAINTI JA SEN MUUNNOSTASOT. HANKKEEN TULOKSET OVAT MERKITYKSELLISIÄ ELINTARVIKETURVAN JA KASVINSUOJELUN KANNALTA. HANKKEELLA ON PUOLESTAAN KÄYTÄNNÖN VAIKUTUKSIA, KOSKA SEN AVULLA VOIMME KEHITTÄÄ KESTÄVIÄ JA KESTÄVIÄ STRATEGIOITA NÄIDEN TAUDINAIHEUTTAJIEN SIENTEN TORJUMISEKSI. TOIVOMME LÖYTÄVÄMME UUSIA YHTEYKSIÄ TOR-REITILLE ORYZAEN. KOSKA TÄLLÄ REITILLÄ ON TÄRKEÄ ROOLI SIENTEN KASVUSSA, TÄMÄN HANKKEEN TULOKSENA TUNNISTETUT UUDET GEENIT VOIVAT SELVÄSTIKIN OLLA TAVOITTEITA MOLEKYYLIEN ESTÄMISEN KEHITTYMISELLE. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IR-ROSS HUWA L-IKEL BAŻIKU L-AKTAR MIFRUX FID-DINJA. DAN JAMMONTA WKOLL GĦAL PERĊENTWAL SINIFIKANTI TA’ UĊUĦ TAR-RABA’ DINJIJA, LI JILĦAQ SA 160 MILJUN ETTARU FIS-SENA. WIEĦED MILL-PATOĠENI L-AKTAR DEVASTANTI TAR-ROSS HUWA L-FUNGU LI JIPPRODUĊI L-MARDA PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. It-telf ta’ dħul ikkawżat minn din il-marda jvarja bejn 10–30 % fis-sena, li, INCLUDE FIL-MORE jikkonservaw stimazzjoni, huma biżżejjed biex jitimgħu 60 miljun persuna (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR HUWA SERINE/THREONINE KINASE IPPRESERVAT PREŻENTI FL-EUKARYOTES KOLLHA MILL-FUNGI GĦALL-BNEDMIN. HUWA WKOLL IL-KOMPONENT ESSENZJALI TAR-ROTOT TAĊ-ĊENSIMENT TAN-NUTRIJENTI TAĊ-ĊELLOLI EWKARJOTIĊI. GĦALKEMM TOR KINASES (MIRA TA’ RAPAMYCIN) HUMA PPRESERVATI, IL-FAQQIEGĦ ŻVILUPPA STRATEĠIJI DIFFERENTI BIEX JUŻA DIN IR-ROTTA TA’ SINJALI. RBP35 HUWA FATTUR SPEĊIFIKU TA’ POLYDENILAZZJONI FIL-FUNGI FILAMENTARI. IL-MUTANT RBP35 JURI MĠIBA MIBDULA KONTRA NUTRIJENTI DIFFERENTI, GĦANDU AUTOPHAGIA AĊĊELLERAT U GĦANDU WKOLL REŻISTENZA AKBAR GĦAL RAPAMYCIN. DAN KOLLU JISSUĠĠERIXXI LI L-RPB35 QED JAĠIXXI B’MOD QAWWI FUQ IR-ROTTA TAS-SINJALI TAR-RPT. FIL-FATT, L-RPT HIJA L-AKTAR ROTTA TA’ SINJALAZZJONI AFFETTWATA F’DAN IL-MUTANTI. ANALIŻI GLOBALI TA’ SITI POLI(A) FUQ SKALA ĠENOMIKA IDENTIFIKAT IL-PARTEĊIPAZZJONI TAL-RPB35 FIL-POLITIKA ALTERNATTIVA TA’ M. ORYZAE’S. FIĊ-ĊELLOLI SOĠĠETTI GĦALL-ĠUĦ TAL-KARBONJU, TMINTAX MIT-TLETIN KOMPONENT TAR-ROTTA TAS-SINJALAR TAR-RPT GĦANDHOM SITI ALTERNATTIVI (APA) TA’ POLIADENILACION. ABBAŻI TA’ DAWN IR-RIŻULTATI, NISTGĦU NGĦIDU LI L-RPB35 JAĠIXXI BĦALA MODULATUR EWLIENI TAR-ROTTA TAL-RPT. DAN IL-PROĠETT ĠDID SE JIDENTIFIKA R-RABTIET BEJN L-IPPROĊESSAR TA’ QABEL IL-MRNA FI TMIEMU 3 ' U R-ROTTA TAR-RPT. SE TANALIZZA WKOLL KIF DAWN IŻ-ŻEWĠ PROĊESSI JIRREGOLAW L-ESPRESSJONI U L-FUNZJONI TAL-ĠENI RELATATI MAL-INFEZZJONI M. ORYZAE. BIEX ISIR DAN, DAN IL-PROĠETT JUŻA ŻEWĠ APPROĊĊI KOMPLEMENTARI, LI JIKKOMBINAW APPROĊĊI TA’ BIJOLOĠIJA KLASSIKA ĠENETIKA, ĠENOMIKA, MOLEKULARI U ĊELLULARI. BL-EŻEKUZZJONI TAŻ-ŻEWĠ GĦANIJIET TIEGĦU SE JIĠI SKOPERT: 1) IT-TIP TA ‘INTERAZZJONIJIET ĠENETIĊI LI JGĦAQQDU RBP35 U PERMEZZ TOR U 2) BĦALA L-IPPROĊESSAR DIPENDENTI 3' RBP35 JISTGĦU JIRREGOLAW DAN IL-MOD SINJALAR. IR-RPT HUWA MAGĦRUF LI JIRREGOLA L-ESPRESSJONI TAL-PROTEINI MEĦTIEĠA GĦALL-ADATTAMENT GĦAS-SINJALI NUTRITTIVI. DAN IL-PROĠETT GĦANDU L-ISFIDA LI JIDENTIFIKA PROTEINI ĠODDA RILEVANTI SABIEX IL-FUNGUS JADATTA B’MOD KORRETT GĦALL-AMBJENT ESTERN U ANALIZZA KIF L-ESPRESSJONI TAL-ĠENI INVOLUTI FIR-ROTTA TAS-SINJALAR TAR-RPT FIL-LIVELL TA’ WARA T-TRASKRIZZJONI HIJA MODULATA. DAN SER JINKISEB BILLI JIĠU DDETERMINATI R-RATI TA’ DEGRADAZZJONI TAL-MRNA, IL-POST SUBĊELLULARI TIEGĦU U L-LIVELLI TA’ TRADUZZJONI TIEGĦU. IR-RIŻULTATI DERIVATI MINN DAN IL-PROĠETT HUMA RILEVANTI GĦAS-SIGURTÀ TAL-IKEL U L-PROTEZZJONI TAL-GĦELEJJEL. DAN IL-PROĠETT IMBAGĦAD GĦANDU IMPLIKAZZJONIJIET PRATTIĊI PERESS LI SE JIPPERMETTILNA NIŻVILUPPAW STRATEĠIJI DEJJIEMA U SOSTENIBBLI GĦALL-KONTROLL TA’ DAWN IL-FUNGI PATOĠENI. NITTAMAW LI JSIBU KONNESSJONIJIET ĠODDA FUQ IR-ROTTA TOR FIL M. ORYZAE. MINĦABBA R-RWOL IMPORTANTI LI DIN IR-ROTTA GĦANDHA FIT-TKABBIR TAL-FUNGUS, IL-ĠENI L-ĠODDA IDENTIFIKATI BĦALA RIŻULTAT TA’ DAN IL-PROĠETT JISTGĦU JKUNU B’MOD ĊAR MIRI GĦALL-IŻVILUPP TA’ MOLEKULI LI JINIBIXXU. (Maltese)
17 August 2022
0 references
RĪSI IR VISPLAŠĀK IZPLATĪTĀ PAMATA PĀRTIKA PASAULĒ. TĀ VEIDO ARĪ IEVĒROJAMU DAĻU NO PASAULES KULTŪRAUGIEM, SASNIEDZOT 160 MILJONUS HEKTĀRU GADĀ. VIENS NO POSTOŠĀKAJIEM RĪSU PATOGĒNIEM IR SĒNĪTE, KAS RAŽO PIRICULARIOSIS SLIMĪBU, MAGNAPORTHE ORYZAE. Šīs slimības izraisītais ienākumu zudums svārstās no 10–30 % gadā, kas, INCLUDE VAIRĀK saglabājot stimāciju, ir pietiekams, lai pabarotu 60 miljonus cilvēku (SKAMNIOTI& Gurr, 2009). TOR IR KONSERVĒTA SERĪNA/TREONĪNA KINĀZE, KAS ATRODAS VISOS EIKARIOTOS NO SĒNĪTĒM LĪDZ CILVĒKIEM. TĀ IR ARĪ EIKARIOTISKO ŠŪNU BARĪBAS VIELU SKAITĪŠANAS CEĻU BŪTISKA SASTĀVDAĻA. LAI GAN TOR KINĀZES (RAPAMICĪNA MĒRĶIS) TIEK SAGLABĀTAS, SĒNES IR IZSTRĀDĀJUŠAS DAŽĀDAS STRATĒĢIJAS, LAI IZMANTOTU ŠO APZĪMĒJUMU. RBP35 IR SPECIFISKS POLYDENILATION KOEFICIENTS PAVEDIENU SĒNĪTĒM. RBP35 MUTANTS UZRĀDA MAINĪTU UZVEDĪBU PRET DAŽĀDĀM BARĪBAS VIELĀM, IR PAĀTRINĀJUSI AUTOFĀGIJU UN IR ARĪ LIELĀKA IZTURĪBA PRET RAPAMICĪNU. TAS VISS LIECINA, KA RBP35 STINGRI DARBOJAS TPR ZĪMJU MARŠRUTĀ. FAKTISKI TPR IR VISVAIRĀK SKARTAIS ZĪMJU CEĻŠ ŠAJĀ MUTANTĀ. POLI(A) VIETU VISPĀRĒJĀ ANALĪZĒ GENOMISKĀ MĒROGĀ IR KONSTATĒTA RBP35 DALĪBA M. ORYZAE’S ALTERNATĪVAJĀ POLITIKĀ. ŠŪNĀS, KAS PAKĻAUTAS OGLEKĻA IZSALKUMAM, ASTOŅPADSMIT NO TRĪSDESMIT TPR ZĪMJU MARŠRUTA KOMPONENTIEM IR ALTERNATĪVAS POLIADENILACION VIETAS (APA). PAMATOJOTIES UZ ŠIEM REZULTĀTIEM, MĒS VARAM TEIKT, KA RBP35 DARBOJAS KĀ GALVENAIS TPR MARŠRUTA MODULATORS. ŠIS JAUNAIS PROJEKTS IDENTIFICĒS SAIKNI STARP PIRMSMRNS APSTRĀDI TĀ BEIGĀS 3 " UN TPR MARŠRUTU. TĀ ARĪ ANALIZĒS, KĀ ŠIE DIVI PROCESI REGULĒ AR M. ORYZAE INFEKCIJU SAISTĪTO GĒNU EKSPRESIJU UN FUNKCIJU. LAI TO PAVEIKTU, ŠAJĀ PROJEKTĀ TIEK IZMANTOTAS DIVAS SAVSTARPĒJI PAPILDINOŠAS PIEEJAS, APVIENOJOT KLASISKĀS ĢENĒTIKAS, GENOMIKAS, MOLEKULĀRĀS UN ŠŪNU BIOLOĢIJAS PIEEJAS. ĪSTENOJOT SAVUS DIVUS MĒRĶUS, TAS TIKS ATKLĀTS: 1) ĢENĒTISKĀS MIJIEDARBĪBAS VEIDS, KAS SAVIENO RBP35 UN IZMANTOJOT TOR, UN 2) KĀ 3’ RBP35 ATKARĪGĀ APSTRĀDE VAR REGULĒT ŠO SIGNALIZĒŠANAS VEIDU. IR ZINĀMS, KA TPR REGULĒ OLBALTUMVIELU IZTEIKSMI, KAS NEPIECIEŠAMA, LAI PIELĀGOTOS UZTURA SIGNĀLIEM. ŠĀ PROJEKTA UZDEVUMS IR IDENTIFICĒT ATTIECĪGOS JAUNOS PROTEĪNUS, LAI SĒNĪTE PAREIZI PIELĀGOTOS ĀRĒJAI VIDEI UN ANALIZĒTU, KĀ TIEK MODULĒTA TOR SIGNALIZĀCIJAS CEĻĀ IESAISTĪTO GĒNU EKSPRESIJA PĒC TRANSKRIPCIJAS. TO PANĀKS, NOSAKOT MRNS NOĀRDĪŠANĀS ĀTRUMU, TĀS APAKŠŠŪNU ATRAŠANĀS VIETU UN TĀS TULKOŠANAS LĪMEŅUS. ŠĀ PROJEKTA REZULTĀTI IR BŪTISKI PĀRTIKAS NODROŠINĀJUMAM UN KULTŪRAUGU AIZSARDZĪBAI. ŠIM PROJEKTAM SAVUKĀRT IR PRAKTISKA IETEKME, JO TAS ĻAUS MUMS IZSTRĀDĀT ILGSTOŠAS UN ILGTSPĒJĪGAS STRATĒĢIJAS ŠO PATOGĒNU SĒNĪŠU KONTROLEI. MĒS CERAM ATRAST JAUNUS SAVIENOJUMUS TPR MARŠRUTĀ M. ORYZAE. ŅEMOT VĒRĀ, KA ŠIM CEĻAM IR LIELA NOZĪME SĒNĪTES AUGŠANĀ, JAUNIE GĒNI, KAS IDENTIFICĒTI ŠĀ PROJEKTA REZULTĀTĀ, NEPĀRPROTAMI VARĒTU BŪT MĒRĶI MOLEKULU INHIBĒŠANAI. (Latvian)
17 August 2022
0 references
RYŽA JE NAJROZŠÍRENEJŠIE ZÁKLADNÉ JEDLO NA SVETE. PREDSTAVUJE TIEŽ VÝZNAMNÉ PERCENTO SVETOVÝCH PLODÍN, KTORÉ DOSAHUJÚ AŽ 160 MILIÓNOV HEKTÁROV ROČNE. JEDNÝM Z NAJVIAC NIČIVÝCH PATOGÉNOV RYŽE JE HUBA, KTORÁ PRODUKUJE OCHORENIE PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. Strata príjmu spôsobená touto chorobou sa pohybuje medzi 10 – 30 % ročne, čo, VYKONÁVAJÚCE Väčšinu šetrenia, sú dostatočné na kŕmenie 60 miliónov ľudí (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR JE ZACHOVANÁ SERÍNOVÁ/TREONÍNKINÁZA PRÍTOMNÁ VO VŠETKÝCH EUKARYOTOCH OD HÚB AŽ PO ĽUDÍ. JE TIEŽ ZÁKLADNOU ZLOŽKOU SPÔSOBOV SČÍTANIA ŽIVÍN EUKARYOTICKÝCH BUNIEK. HOCI SÚ KINÁZY TOR (CIEĽ RAPAMYCÍNU) ZACHOVANÉ, HUBY VYVINULI RÔZNE STRATÉGIE NA POUŽÍVANIE TEJTO TRASY ZNAČENIA. RBP35 JE ŠPECIFICKÝ POLYDENILATION FAKTOR V VLÁKNITÝCH HUBÁCH. MUTANT RBP35 VYKAZUJE ZMENENÉ SPRÁVANIE PROTI RÔZNYM ŽIVINÁM, URÝCHĽUJE AUTOFÁGIU A TIEŽ MÁ VÄČŠIU ODOLNOSŤ VOČI RAPAMYCÍNU. TO VŠETKO NAZNAČUJE, ŽE RBP35 VÝRAZNE PÔSOBÍ NA TRASE ZNAČENIA TVZ. V SKUTOČNOSTI, TOR JE NAJVIAC POSTIHNUTÉ ZNAČENIE TRASA V TOMTO MUTANTE. GLOBÁLNA ANALÝZA POLY(A) LOKALÍT V GENOMICKEJ ŠKÁLE IDENTIFIKOVALA ÚČASŤ RBP35 NA ALTERNATÍVNEJ POLITIKE M. ORYZAE. V BUNKÁCH VYSTAVENÝCH HLADU UHLÍKA MÁ OSEMNÁSŤ Z TRIDSIATICH ZLOŽIEK ZNAČENIA TVZ ALTERNATÍVNE MIESTA (APA) POLIADENILACIONU. NA ZÁKLADE TÝCHTO VÝSLEDKOV MÔŽEME POVEDAŤ, ŽE RBP35 PÔSOBÍ AKO KĽÚČOVÝ MODULÁTOR TRASY TVZ. TENTO NOVÝ PROJEKT IDENTIFIKUJE PREPOJENIA MEDZI SPRACOVANÍM PRED MRNA NA KONCI 3 " A TRASOU TVZ. BUDE TIEŽ ANALYZOVAŤ, AKO TIETO DVA PROCESY REGULUJÚ EXPRESIU A FUNKCIU GÉNOV SÚVISIACICH S INFEKCIOU M. ORYZAE. NA TENTO ÚČEL TENTO PROJEKT VYUŽÍVA DVA KOMPLEMENTÁRNE PRÍSTUPY, KTORÉ KOMBINUJÚ PRÍSTUPY KLASICKEJ GENETIKY, GENÓMOVEJ, MOLEKULÁRNEJ A BUNKOVEJ BIOLÓGIE. PRI PLNENÍ JEHO DVOCH CIEĽOV BUDE OBJAVENÝ: 1) TYP GENETICKÝCH INTERAKCIÍ SPÁJAJÚCICH RBP35 A PROSTREDNÍCTVOM TOR A 2) AKO 3' RBP35 ZÁVISLÉ SPRACOVANIE MÔŽE REGULOVAŤ TENTO SPÔSOB SIGNALIZÁCIE. TVZ JE ZNÁME, ŽE REGULUJE EXPRESIU PROTEÍNOV POTREBNÝCH NA PRISPÔSOBENIE SA NUTRIČNÝM SIGNÁLOM. TENTO PROJEKT MÁ VÝZVU IDENTIFIKOVAŤ RELEVANTNÉ NOVÉ PROTEÍNY TAK, ABY SA HUBA SPRÁVNE PRISPÔSOBOVALA VONKAJŠIEMU PROSTREDIU A ANALYZOVALA, AKO SA MODIFIKUJE EXPRESIA GÉNOV ZAPOJENÝCH DO TRASY SIGNALIZÁCIE TVZ NA POST-PREPISNEJ ÚROVNI. TO SA DOSIAHNE STANOVENÍM RÝCHLOSTI DEGRADÁCIE MRNA, JEJ SUBCELULÁRNEJ POLOHY A ÚROVNE JEJ PREKLADU. VÝSLEDKY VYPLÝVAJÚCE Z TOHTO PROJEKTU SÚ RELEVANTNÉ PRE POTRAVINOVÚ BEZPEČNOSŤ A OCHRANU PLODÍN. TENTO PROJEKT MÁ ZASE PRAKTICKÉ DÔSLEDKY, PRETOŽE NÁM UMOŽNÍ VYPRACOVAŤ TRVALÉ A UDRŽATEĽNÉ STRATÉGIE NA KONTROLU TÝCHTO PATOGÉNNYCH HÚB. DÚFAME, ŽE NÁJDEME NOVÉ SPOJENIA NA TRASE TOR V M. ORYZAE. VZHĽADOM NA DÔLEŽITÚ ÚLOHU, KTORÚ TÁTO CESTA ZOHRÁVA V RASTE HUBY, NOVÉ GÉNY IDENTIFIKOVANÉ AKO VÝSLEDOK TOHTO PROJEKTU BY MOHLI BYŤ JASNE CIEĽMI PRE VÝVOJ INHIBUJÚCICH MOLEKÚL. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS É RÍS AN BIA BUNÚSACH IS MÓ A DHÁILTEAR AR FUD AN DOMHAIN. IS IONANN É FREISIN AGUS CÉATADÁN SUNTASACH DE BHARRA AN DOMHAIN, A SHROICHEANN SUAS LE 160 MILLIÚN HEICTEÁR IN AGHAIDH NA BLIANA. IS É CEANN DE NA PATAIGINÍ IS TUBAISTEACHA RÍSE AN FUNGAS A THÁIRGEANN GALAR PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. Tá caillteanas ioncaim de bharr an ghalair seo idir 10-30 % in aghaidh na bliana, a bhfuil, INCLUDE SA spreagadh CONSERVATING MORE, leordhóthanach chun beatha 60 milliún duine (SKAMNIOTI &Gurr, 2009). IS KINASE SERINE/TRÉÓINÍN CAOMHNAITHE É TOR ATÁ I LÁTHAIR I NGACH EUKARYOTES Ó FHUNGAS GO DAOINE. IS É FREISIN AN CHUID RIACHTANACH DE BHEALAÍ DAONÁIRIMH COTHAITHEACH NA GCEALL EUKARYOTIC. CÉ GO GCAOMHNAÍTEAR KINASES TOR (SPRIOC RAPAMYCIN), TÁ STRAITÉISÍ ÉAGSÚLA FORBARTHA AG BEACÁIN CHUN AN BEALACH COMHARTHAÍOCHTA SEO A ÚSÁID. IS FACHTÓIR POLYDENILATION SONRACH É RBP35 I BHFUNGAIS FHILIMÉADACHA. NA TAISPEÁNTAIS MUTANT RBP35 ATHRÚ IOMPAR I GCOINNE COTHAITHIGH ÉAGSÚLA, TÁ AUTOPHAGIA LUATHAITHE AGUS FREISIN TÁ FRIOTAÍOCHT NÍOS MÓ A RAPAMYCIN. TUGANN SÉ SEO GO LÉIR LE FIOS GO BHFUIL RBP35 AG GNÍOMHÚ GO LÁIDIR AR BHEALACH COMHARTHAÍOCHTA TOR. GO DEIMHIN, IS É TOR AN BEALACH COMHARTHAÍOCHTA IS MÓ A BHFUIL TIONCHAR AIGE AIR SA MUTANT SEO. TÁ ANAILÍS DHOMHANDA AR SHUÍOMHANNA POLA(A) AR SCÁLA GÉANÓMAÍOCH TAR ÉIS RANNPHÁIRTÍOCHT RBP35 I MBEARTAS MALARTACH M. ORYZAE’S A SHAINAITHINT. I GCEALLA ATÁ FAOI RÉIR OCRAS CARBÓIN, TÁ SUÍOMHANNA MALARTACHA (APA) DE POLIADENILACION AG OCHT GCINN DÉAG DE NA TRÍOCHA COMHPHÁIRTEANNA DE BHEALACH COMHARTHAÍOCHTA TOR. BUNAITHE AR NA TORTHAÍ SEO, IS FÉIDIR LINN A RÁ GO NGNÍOMHAÍONN RBP35 MAR PHRÍOMH-MHODHNÓIR AR BHEALACH TOR. LEIS AN TIONSCADAL NUA SEO, SAINAITHNEOFAR NA NAISC IDIR PRÓISEÁIL RÉAMH-MRNA AG DEIREADH 3 AGUS BEALACH TOR. DÉANFAIDH SÉ ANAILÍS FREISIN AR AN GCAOI A RIALAÍONN AN DÁ PHRÓISEAS SEO LÉIRIÚ AGUS FEIDHM NA NGÉINTE A BHAINEANN LE HIONFHABHTÚ M. ORYZAE. CHUN SEO A DHÉANAMH, ÚSÁIDEANN AN TIONSCADAL SEO DHÁ CHUR CHUIGE COMHLÁNTACH, LE CHÉILE CUR CHUIGE GÉINITEACHA CLASAICEACH, BITHEOLAÍOCHT GHÉANÓMAÍOCH, MHÓILÍNEACH AGUS CHEALLACHA. LE FORGHNÍOMHÚ A DHÁ CHUSPÓIR, GHEOFAR AMACH É: 1) IS FÉIDIR LEIS AN GCINEÁL IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ GÉINITEACHA AG NASCADH RBP35 AGUS TRÍ TOR AGUS 2) MAR AN PHRÓISEÁIL 3' RBP35 AG BRATH A RIALÁIL AR AN MBEALACH COMHARTHAÍOCHTA. IS EOL DO TOR RIALÁIL A DHÉANAMH AR LÉIRIÚ PRÓITÉINÍ A THEASTAÍONN CHUN DUL IN OIRIÚINT DO CHOMHARTHAÍ COTHAITHEACHA. TÁ DÚSHLÁN AG BAINT LEIS AN TIONSCADAL SEO PRÓITÉINÍ NUA ÁBHARTHA A SHAINAITHINT IONAS GO MBEIDH AN FUNGAS IN OIRIÚINT I GCEART DON TIMPEALLACHT SHEACHTRACH AGUS ANAILÍS A DHÉANAMH AR AN GCAOI A MODHNAÍTEAR LÉIRIÚ NA NGÉINTE A BHFUIL BAINT ACU LE BEALACH COMHARTHAÍOCHTA TOR AR AN LEIBHÉAL IAR-TRAS-TRAS-SCRÍOFA. BAINFEAR É SIN AMACH TRÍ RÁTAÍ DÍGHRÁDAITHE MRNA, A SHUÍOMH FOCHEALLACH AGUS A LEIBHÉIL AISTRIÚCHÁIN A CHINNEADH. TÁ NA TORTHAÍ A DHÍORTHAÍTEAR ÓN TIONSCADAL SEO ÁBHARTHA MAIDIR LE SLÁNDÁIL BIA AGUS COSAINT BARR. TÁ IMPLEACHTAÍ PRAITICIÚLA AG AN TIONSCADAL SEO MAR GO GCUIRFIDH SÉ AR ÁR GCUMAS STRAITÉISÍ MARTHANACHA AGUS INBHUANAITHE A FHORBAIRT CHUN NA FUNGAIS PHATAIGINE SIN A RIALÚ. TÁ SÚIL AGAINN NAISC NUA A AIMSIÚ AR BHEALACH TOR I M. ORYZAE. MAR GHEALL AR AN RÓL TÁBHACHTACH A IMRÍONN AN BEALACH SEO I BHFÁS AN FUNGAS, D’FHÉADFADH NA GÉINTE NUA A AITHNÍODH MAR THORADH AR AN TIONSCADAL SEO A BHEITH INA SPRIOCANNA GO SOILÉIR D’FHORBAIRT MÓILÍNÍ COSC. (Irish)
17 August 2022
0 references
RÝŽE JE NEJROZŠÍŘENĚJŠÍ ZÁKLADNÍ POTRAVINY NA SVĚTĚ. PŘEDSTAVUJE TAKÉ VÝZNAMNÉ PROCENTO SVĚTOVÝCH PLODIN, KTERÉ DOSAHUJÍ AŽ 160 MILIONŮ HEKTARŮ ROČNĚ. JEDNÍM Z NEJNIČIVĚJŠÍCH PATOGENŮ RÝŽE JE HOUBA, KTERÁ PRODUKUJE PIRICULARIOSIS NEMOC, MAGNAPORTHE ORYZAE. Ztráta příjmu způsobená touto chorobou se pohybuje mezi 10–30 % ročně, což, VÍCE konzervační stimulace, postačí na krmení 60 milionů lidí (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR JE DOCHOVANÁ SERINOVÁ/THREONINKINÁZA PŘÍTOMNÁ VE VŠECH EUKARYOTECH OD HUB AŽ PO ČLOVĚKA. JE TAKÉ ZÁKLADNÍ SLOŽKOU CEST SČÍTÁNÍ ŽIVIN EUKARYOTICKÝCH BUNĚK. AČKOLI JSOU TOR KINÁZY (CÍL RAPAMYCINU) ZACHOVÁNY, HOUBY VYVINULY RŮZNÉ STRATEGIE PRO POUŽITÍ TÉTO CESTY ZNAČENÍ. RBP35 JE SPECIFICKÝ FAKTOR POLYDENILATION VE VLÁKNOVÝCH HUBÁCH. RBP35 MUTANT VYKAZUJE ZMĚNĚNÉ CHOVÁNÍ PROTI RŮZNÝM ŽIVINÁM, URYCHLILA AUTOFAGII A MÁ TAKÉ VĚTŠÍ ODOLNOST VŮČI RAPAMYCINU. TO VŠE NAZNAČUJE, ŽE RBP35 PŮSOBÍ SILNĚ NA TRASE ZNAČENÍ TVZ. VE SKUTEČNOSTI JE TOR NEJPOSTIŽENĚJŠÍ TRASOU ZNAČENÍ V TOMTO MUTANTU. GLOBÁLNÍ ANALÝZA POLY(A) LOKALIT V GENOMICKÉM MĚŘÍTKU IDENTIFIKOVALA ÚČAST RBP35 V ALTERNATIVNÍ POLITICE SPOLEČNOSTI M. ORYZAE. V BUŇKÁCH S UHLÍKOVÝM HLADEM MÁ OSMNÁCT ZE TŘICETI SLOŽEK CESTY ZNAČENÍ TOR ALTERNATIVNÍ MÍSTA (APA) POLIADENILACION. NA ZÁKLADĚ TĚCHTO VÝSLEDKŮ MŮŽEME ŘÍCI, ŽE RBP35 FUNGUJE JAKO KLÍČOVÝ MODULÁTOR TRASY TOR. TENTO NOVÝ PROJEKT IDENTIFIKUJE SPOJENÍ MEZI ZPRACOVÁNÍM PŘED MRNA NA KONCI 3’ A TRASOU TRADIČNÍCH VLASTNÍCH ZDROJŮ. BUDE TAKÉ ANALYZOVAT, JAK TYTO DVA PROCESY REGULUJÍ EXPRESI A FUNKCI GENŮ SOUVISEJÍCÍCH S INFEKCÍ M. ORYZAE. K TOMU VYUŽÍVÁ TENTO PROJEKT DVA VZÁJEMNĚ SE DOPLŇUJÍCÍ PŘÍSTUPY, KTERÉ KOMBINUJÍ PŘÍSTUPY KLASICKÉ GENETIKY, GENOMICKÉ, MOLEKULÁRNÍ A BUNĚČNÉ BIOLOGIE. PŘI PLNĚNÍ SVÝCH DVOU CÍLŮ BUDE ODHALENO: 1) TYP GENETICKÝCH INTERAKCÍ SPOJUJÍCÍCH RBP35 A PŘES TOR A 2) JAKO 3’ RBP35 ZÁVISLÉ ZPRACOVÁNÍ MŮŽE REGULOVAT TENTO SIGNÁLNÍ ZPŮSOB. JE ZNÁMO, ŽE TOR REGULUJE EXPRESI PROTEINŮ POTŘEBNÝCH K PŘIZPŮSOBENÍ SE NUTRIČNÍM SIGNÁLŮM. TENTO PROJEKT MÁ ZA ÚKOL IDENTIFIKOVAT RELEVANTNÍ NOVÉ BÍLKOVINY TAK, ABY SE HOUBA SPRÁVNĚ PŘIZPŮSOBOVALA VNĚJŠÍMU PROSTŘEDÍ A ANALYZOVALA, JAK JE MODULOVÁNA EXPRESE GENŮ ZAPOJENÝCH DO SIGNÁLNÍ CESTY TOR NA POST-TRANKRIPČNÍ ÚROVNI. TOHO BUDE DOSAŽENO STANOVENÍM MÍRY DEGRADACE MRNA, JEJÍ SUBCELULÁRNÍ POLOHY A ÚROVNÍ JEHO PŘEKLADU. VÝSLEDKY TOHOTO PROJEKTU JSOU RELEVANTNÍ PRO ZAJIŠTĚNÍ POTRAVIN A OCHRANU PLODIN. TENTO PROJEKT MÁ PRAKTICKÉ DŮSLEDKY, NEBOŤ NÁM UMOŽNÍ ROZVÍJET TRVALÉ A UDRŽITELNÉ STRATEGIE PRO KONTROLU TĚCHTO PATOGENOVÝCH HUB. DOUFÁME, ŽE NAJDEME NOVÉ SPOJENÍ NA TRASE TOR V M. ORYZAE. VZHLEDEM K TOMU, ŽE TATO CESTA HRAJE DŮLEŽITOU ROLI V RŮSTU HOUBY, NOVÉ GENY IDENTIFIKOVANÉ V DŮSLEDKU TOHOTO PROJEKTU BY MOHLY BÝT JASNĚ CÍLI PRO VÝVOJ INHIBUJÍCÍCH MOLEKUL. (Czech)
17 August 2022
0 references
O ARROZ É O ALIMENTO BÁSICO MAIS DISTRIBUÍDO NO MUNDO. É também responsável por uma percentagem significativa de culturas mundiais, atingindo 160 milhões de hectares por ano. Um dos patogéneos mais degradantes do gelo é o fungo que produz a doença da piriculariose, Magnaporthe Oryzae. A perda de rendimento causada por esta doença varia entre 10-30 % ao ano, o que, INCLUINDO A ESTIMAÇÃO MAIS CONSERVATIVA, é suficiente para alimentar 60 milhões de pessoas (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). O TOR é uma KINASE SERINE/THREONINE PRESENTE EM TODOS OS EUKARYOTES, DE FUNGI A HUMANOS. É também a componente essencial das rotas nucleares das células EUCARIÓTICAS. Apesar de serem conservados torrões (tarefa de rapamicina), os cogumelos desenvolveram diferentes estratégias para utilizar esta rota de sinalização. RBP35 É UM FATOR ESPECÍFICO DE POLIDENILAÇÃO EM FUNGI FILAMENTAR. O RBP35 MUTANT EXHIBITS ALTEROU O COMPORTAMENTO CONTRA DIFERENTES NUTRIENTES, ACELEROU A AUTOFÁGIA E TAMBÉM TEM MELHOR RESISTÊNCIA À RAPAMÍCIA. Tudo isto sugere que o RBP35 está a actuar fortemente na rota do sinal do Tor. Na verdade, o Tor é a rota de sinal mais afectada neste sentido. A ANÁLISE GLOBAL DE SITES DE POLI(A) A UMA ESCALA GENÓMICA IDENTIFICOU A PARTICIPAÇÃO DA RBP35 NA POLÍTICA ALTERNATIVA DE M. ORYZAE. Nas pilhas sujeitas à fome de carbono, dezoito dos três componentes da rota de sinalização do veículo têm sítios alternativos (APA) de poliadenilação. Com base nestes resultados, podemos dizer que o RBP35 atua como um dos principais motores da rota do Tor. Este novo projecto identificará as ligações entre o processamento pré-MRNA no final de 3' e a rota do Tor. Analisará igualmente a forma como estes dois processos regulam a expressão e a função dos genes relacionados com a infecção por M. ORYZAE. Para o efeito, o presente projecto utiliza duas abordagens complementares, que combinam as abordagens da genética clássica, genética, molecular e celular. COM A EXECUÇÃO DOS SEUS DOIS OBJETIVOS, SERÁ DESCOBRIDA: 1) O TIPO DE INTERACÇÕES GENÉTICAS LIGADAS A RBP35 E A VIA TOR E 2) COMO O PROCESSO DE 3' RBP35 DEPENDENTE PODE REGULAR ESTA FORMA DE SINALIZAÇÃO. CONHECE-SE O TOR PARA REGULAR A EXPRESSÃO DAS PROTEÍNAS NECESSÁRIAS PARA ADAPTAR A SINAIS NUTRICIONAIS. Este projecto tem o desafio de identificar novas proteínas relevantes, de modo a que o fungo se adapte correctamente ao ambiente externo e seja analisado de acordo com a forma como é modulada a expressão dos genes envolvidos na rota de sinalização do tractor a nível pós-transcricional. Isto será conseguido através da determinação das taxas de degradação do MRNA, a sua localização subcelular e os seus níveis de tradução. Os resultados deste projecto são relevantes para a segurança alimentar e a protecção das culturas. Este projecto tem implicações práticas, uma vez que nos permitirá desenvolver estratégias sustentáveis para o controlo destes fungos. Esperamos encontrar novas ligações na rota do Tor em M. ORYZAE. Dado o papel importante que esta rota desempenha no crescimento do fungo, os novos genes identificados como um resultado deste projeto podem claramente ser metas para o desenvolvimento de inibidores de moléculas. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
RIIS ON KÕIGE LEVINUM PÕHITOIT MAAILMAS. SAMUTI MOODUSTAB SEE MÄRKIMISVÄÄRSE OSA MAAILMA PÕLLUKULTUURIDEST, ULATUDES KUNI 160 MILJONI HEKTARINI AASTAS. RIISI ÜKS LAASTAVAMAID PATOGEENE ON SEENE, MIS TOODAB PIRICULARIOSISE HAIGUST, MAGNAPORTHE ORYZAE. Selle haiguse põhjustatud sissetuleku kaotus on 10–30 % aastas, mis on piisav 60 miljoni inimese toitmiseks (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR ON SÄILITATUD SERIIN/TREONIINKINAASI, MIS ESINEB KÕIGIS EUKARÜOOTIDES SEENTEST INIMESTELE. SEE ON KA EUKARÜOOTSETE RAKKUDE TOITAINETE LOENDUSRADADE OLULINE OSA. KUIGI TRADITSIOONILISTE OMAVAHENDITE KINAASID (RAPAMÜTSIINI SIHTMÄRK) ON SÄILINUD, ON SEENED VÄLJA TÖÖTANUD ERINEVAD STRATEEGIAD SELLE MÄRGISTUSE KASUTAMISEKS. RBP35 ON SPETSIIFILINE POLYDENILATION TEGUR NIIT SEENTES. RBP35 MUTANT EKSPONEERIB MUUTUNUD KÄITUMIST ERINEVATE TOITAINETE VASTU, KIIRENDAS AUTOFAAGIAT JA ON KA SUUREMA RESISTENTSUSE RAPAMÜTSIINI SUHTES. KÕIK SEE VIITAB SELLELE, ET RBP35 TEGUTSEB JÕULISELT TRADITSIOONILISTE OMAVAHENDITE MÄRGISTUSLIINIL. TEGELIKULT ON TRADITSIOONILISED OMAVAHENDID SELLES MUTANDIS KÕIGE ROHKEM MÕJUTATUD MÄRGISTUSTEED. POLÜ(A) TOOTMISKOHTADE GENOOMILISES ÜLDANALÜÜSIS TEHTI KINDLAKS RBP35 OSALEMINE M. ORYZAE ALTERNATIIVSES POLIITIKAS. SÜSINIKU NÄLJA ALL OLEVATES RAKKUDES ON KAHEKSATEISTKÜMNEST TRADITSIOONILISTE OMAVAHENDITE MÄRGISTUSE KOMPONENDIST KAHEKSATEISTKÜMNEST POLIADENILACIONIST ALTERNATIIVSED KOHAD (APA). NENDE TULEMUSTE PÕHJAL VÕIME ÖELDA, ET RBP35 TOIMIB TRADITSIOONILISTE OMAVAHENDITE MARSRUUDI PÕHIMODULAATORINA. SELLES UUDSES PROJEKTIS MÄÄRATAKSE KINDLAKS SEOSED MRNA-EELSE TÖÖTLEMISE VAHEL SELLE 3. LÕPUS "JA TRADITSIOONILISTE OMAVAHENDITE MARSRUUDI VAHEL. SAMUTI ANALÜÜSITAKSE, KUIDAS NEED KAKS PROTSESSI REGULEERIVAD M. ORYZAE INFEKTSIOONIGA SEOTUD GEENIDE EKSPRESSIOONI JA FUNKTSIOONI. SELLEKS KASUTATAKSE PROJEKTIS KAHTE ÜKSTEIST TÄIENDAVAT LÄHENEMISVIISI, MIS ÜHENDAVAD KLASSIKALISE GENEETIKA, GENOOMI, MOLEKULAAR- JA RAKUBIOLOOGIA LÄHENEMISVIISE. SELLE KAHE EESMÄRGI TÄITMISEL AVASTATAKSE: 1) TÜÜPI GENEETILISI KOOSTOIMEID ÜHENDAVAD RBP35 JA KAUDU TOR JA 2) KUI 3’ RBP35 SÕLTUV TÖÖTLEMINE VÕIB REGULEERIDA SEDA SIGNAALIMISE VIIS. TRADITSIOONILISED OMAVAHENDID REGULEERIVAD TEADAOLEVALT VALKUDE EKSPRESSIOONI, MIS ON VAJALIKUD TOITUMISSIGNAALIDEGA KOHANEMISEKS. SELLE PROJEKTI ÜLESANNE ON TEHA KINDLAKS ASJAKOHASED UUED VALGUD, NII ET SEEN KOHANDUKS ÕIGESTI VÄLISKESKKONNAGA, NING ANALÜÜSITI, KUIDAS MUUDETAKSE TRADITSIOONILISTE OMAVAHENDITE SIGNAALIMISE TEEL OSALEVATE GEENIDE EKSPRESSIOONI TRANSKRIPTSIOONIJÄRGSEL TASANDIL. SEE SAAVUTATAKSE MRNA LAGUNEMISE KIIRUSE, RAKUALUSE ASUKOHA JA TRANSLATSIOONITASEME MÄÄRAMISEGA. SELLE PROJEKTI TULEMUSED ON OLULISED TOIDUGA KINDLUSTATUSE JA TAIMEKAITSE SEISUKOHAST. SELLEL PROJEKTIL ON OMAKORDA PRAKTILINE MÕJU, SEST SEE VÕIMALDAB MEIL VÄLJA TÖÖTADA PÜSIVAD JA JÄTKUSUUTLIKUD STRATEEGIAD NENDE PATOGEENIDE SEENTE TÕRJEKS. LOODAME LEIDA UUSI ÜHENDUSI TOR LIINIL M. ORYZAE. ARVESTADES SELLE TEE OLULIST ROLLI SEENTE KASVUS, VÕIVAD SELLE PROJEKTI TULEMUSENA TUVASTATUD UUED GEENID SELGELT OLLA INHIBEERIVATE MOLEKULIDE ARENGU SIHTMÄRGIKS. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A RIZS A VILÁG LEGELTERJEDTEBB ALAPÉLELMISZERE. EMELLETT A VILÁG NÖVÉNYKULTÚRÁINAK JELENTŐS HÁNYADÁT TESZI KI, ELÉRVE AZ ÉVI 160 MILLIÓ HEKTÁRT IS. A RIZS EGYIK LEGPUSZTÍTÓBB KÓROKOZÓJA A PIRICULARIOSIS-KÓRT, A MAGNAPORTHE ORYZA-T TERMELŐ GOMBA. A betegség által okozott jövedelemkiesés évente 10–30% között mozog, ami, INCLUDE IN THE MORE konzervatív stimuláció, elegendő 60 millió ember táplálásához (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). A TOR EGY TARTÓSÍTOTT SZERIN/TREONIN-KINÁZ, AMELY A GOMBÁKTÓL AZ EMBEREKIG MINDEN EUKARIÓTÁBAN JELEN VAN. EZ AZ EUKARIÓTA SEJTEK TÁPANYAG-SZÁMLÁLÁSI ÚTVONALAINAK ALAPVETŐ ÖSSZETEVŐJE IS. BÁR A TOR-KINÁZOK (A RAPAMYCIN CÉLPONTJA) MEGMARADNAK, A GOMBÁK KÜLÖNBÖZŐ STRATÉGIÁKAT DOLGOZTAK KI E JELZŐÚTVONAL HASZNÁLATÁRA. AZ RBP35 EGY SPECIFIKUS POLYDENILATION FAKTOR A ROSTOS GOMBÁKBAN. AZ RBP35 MUTÁNS MUTAT MEGVÁLTOZOTT VISELKEDÉS ELLEN KÜLÖNBÖZŐ TÁPANYAGOK, FELGYORSÍTOTTA AZ AUTOPHAGIA ÉS NAGYOBB ELLENÁLLÁST A RAPAMYCIN. MINDEZ ARRA UTAL, HOGY AZ RBP35 HATÁROZOTTAN FELLÉP A TRADICIONÁLIS SAJÁT FORRÁSOK JELZÉSI ÚTVONALÁN. VALÓJÁBAN A TRADICIONÁLIS SAJÁT FORRÁSOK A LEGINKÁBB ÉRINTETT JELZÉSI ÚTVONAL EBBEN A MUTÁNSBAN. A POLI(A) TERÜLETEK GENOMIKUS LÉPTÉKŰ GLOBÁLIS ELEMZÉSE AZONOSÍTOTTA AZ RBP35 RÉSZVÉTELÉT AZ M. ORYZAE ALTERNATÍV POLITIKÁJÁBAN. A SZÉN-DIOXID-ÉHEZÉSNEK KITETT SEJTEKBEN A TOR JELZÉSI ÚTVONAL HARMINC ÖSSZETEVŐJÉBŐL TIZENNYOLCNAK VAN ALTERNATÍV HELYE (APA) A POLIADENILACION-RA. EZEN EREDMÉNYEK ALAPJÁN ELMONDHATJUK, HOGY AZ RBP35 A TRADICIONÁLIS SAJÁT FORRÁSOK FŐ MODULÁTORAKÉNT MŰKÖDIK. EZ AZ ÚJ PROJEKT AZONOSÍTJA A KAPCSOLATOT AZ MRNS ELŐTTI FELDOLGOZÁS VÉGÉN 3 " ÉS A TRADICIONÁLIS SAJÁT FORRÁSOK ÚTVONALA KÖZÖTT. AZT IS ELEMEZNI FOGJA, HOGY EZ A KÉT FOLYAMAT HOGYAN SZABÁLYOZZA AZ M. ORYZAE FERTŐZÉSHEZ KAPCSOLÓDÓ GÉNEK KIFEJEZŐDÉSÉT ÉS MŰKÖDÉSÉT. EHHEZ A PROJEKT KÉT EGYMÁST KIEGÉSZÍTŐ MEGKÖZELÍTÉST ALKALMAZ, AMELYEK ÖTVÖZIK A KLASSZIKUS GENETICA, GENOMIKUS, MOLEKULÁRIS ÉS SEJTBIOLÓGIA MEGKÖZELÍTÉSEIT. KÉT CÉLKITŰZÉSÉNEK MEGVALÓSÍTÁSÁVAL FELFEDEZIK: 1) AZ RBP35-ÖT ÉS A TOR-T ÖSSZEKÖTŐ GENETIKAI KÖLCSÖNHATÁSOK TÍPUSA ÉS 2) MIVEL A 3’ RBP35 FÜGGŐ FELDOLGOZÁS SZABÁLYOZHATJA EZT A JELZÉSI MÓDOT. A TOR KÖZTUDOTT, HOGY SZABÁLYOZZA A TÁPLÁLKOZÁSI JELEKHEZ VALÓ ALKALMAZKODÁSHOZ SZÜKSÉGES FEHÉRJÉK EXPRESSZIÓJÁT. ENNEK A PROJEKTNEK AZ A KIHÍVÁSA, HOGY AZONOSÍTSA A RELEVÁNS ÚJ FEHÉRJÉKET, HOGY A GOMBA MEGFELELŐEN ALKALMAZKODJON A KÜLSŐ KÖRNYEZETHEZ, ÉS ELEMEZZE, HOGY A HAGYOMÁNYOS SAJÁT FORRÁSOK JELZÉSI ÚTVONALÁBAN RÉSZT VEVŐ GÉNEK EXPRESSZIÓJA HOGYAN MODULÁLÓDIK A TRANSZKRIPCIÓ UTÁNI SZINTEN. EZ AZ MRNS LEBOMLÁSI ARÁNYÁNAK, A SEJT ALATTI ELHELYEZKEDÉSÉNEK ÉS A FORDÍTÁSI SZINTEK MEGHATÁROZÁSÁVAL ÉRHETŐ EL. AZ E PROJEKTBŐL SZÁRMAZÓ EREDMÉNYEK AZ ÉLELMEZÉSBIZTONSÁG ÉS A NÖVÉNYVÉDELEM SZEMPONTJÁBÓL RELEVÁNSAK. EZ A PROJEKT GYAKORLATI KÖVETKEZMÉNYEKKEL JÁR, MIVEL LEHETŐVÉ TESZI SZÁMUNKRA, HOGY TARTÓS ÉS FENNTARTHATÓ STRATÉGIÁKAT DOLGOZZUNK KI E KÓROKOZÓ GOMBÁK ELLENŐRZÉSÉRE. REMÉLJÜK, HOGY TALÁLUNK ÚJ KAPCSOLATOKAT A TOR ÚTVONALON M. ORYZAE. TEKINTETTEL ARRA, HOGY EZ AZ ÚTVONAL FONTOS SZEREPET JÁTSZIK A GOMBA NÖVEKEDÉSÉBEN, A PROJEKT EREDMÉNYEKÉNT AZONOSÍTOTT ÚJ GÉNEK EGYÉRTELMŰEN A MOLEKULÁK KIALAKULÁSÁNAK CÉLPONTJAI LEHETNEK. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ОРИЗЪТ Е НАЙ-ШИРОКО РАЗПРОСТРАНЕНАТА ОСНОВНА ХРАНА В СВЕТА. ТОЙ СЪЩО ТАКА ПРЕДСТАВЛЯВА ЗНАЧИТЕЛЕН ПРОЦЕНТ ОТ СВЕТОВНИТЕ КУЛТУРИ, ДОСТИГАЙКИ ДО 160 МИЛИОНА ХЕКТАРА ГОДИШНО. ЕДИН ОТ НАЙ-ОПУСТОШИТЕЛНИТЕ ПАТОГЕНИ НА ОРИЗА Е ГЪБАТА, КОЯТО ПРОИЗВЕЖДА БОЛЕСТТА PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. Загубата на доходи, причинена от това заболяване, варира между 10—30 % годишно, което, INCLUDE IN THE MORE консервационна стимулация, е достатъчно за изхранване на 60 милиона души (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR Е ЗАПАЗЕНА СЕРИН/ТРЕОНИНОВА КИНАЗА, ПРИСЪСТВАЩА ВЪВ ВСИЧКИ ЕУКАРИОТИ ОТ ГЪБИ ДО ХОРА. ТОЙ СЪЩО ТАКА Е ОСНОВЕН КОМПОНЕНТ НА ХРАНИТЕЛНИТЕ ПРЕБРОЯВАНИЯ ПЪТИЩА НА ЕУКАРИОТНИТЕ КЛЕТКИ. ВЪПРЕКИ ЧЕ TOR КИНАЗИТЕ (ЦЕЛ НА РАПАМИЦИН) СА ЗАПАЗЕНИ, ГЪБИТЕ СА РАЗРАБОТИЛИ РАЗЛИЧНИ СТРАТЕГИИ ЗА ИЗПОЛЗВАНЕ НА ТОЗИ МАРКИРАЩ МАРШРУТ. RBP35 Е СПЕЦИФИЧЕН ФАКТОР ПОЛИДЕНИЛА ПРИ НИШКОВИДНИ ГЪБИ. МУТАНТЪТ RBP35 ПОКАЗВА ПРОМЕНЕНО ПОВЕДЕНИЕ СРЕЩУ РАЗЛИЧНИ ХРАНИТЕЛНИ ВЕЩЕСТВА, УСКОРЯВА АВТОФАГИЯТА И СЪЩО ТАКА ИМА ПО-ГОЛЯМА РЕЗИСТЕНТНОСТ КЪМ РАПАМИЦИН. ВСИЧКО ТОВА ПРЕДПОЛАГА, ЧЕ RBP35 ДЕЙСТВА СИЛНО ПО МАРШРУТА ЗА ОБОЗНАЧАВАНЕ НА ТСР. ВСЪЩНОСТ ТСР Е НАЙ-ЗАСЕГНАТИЯТ ПЪТ ЗА СИГНАЛИЗАЦИЯ В ТОЗИ МУТАНТ. ГЛОБАЛЕН АНАЛИЗ НА ПОЛИ(А) ОБЕКТИ В ГЕНОМНА СКАЛА ИДЕНТИФИЦИРА УЧАСТИЕТО НА RBP35 В АЛТЕРНАТИВНАТА ПОЛИТИКА НА M. ORYZAE. В КЛЕТКИТЕ, ПОДЛОЖЕНИ НА ВЪГЛЕРОДЕН ГЛАД, ОСЕМНАДЕСЕТ ОТ ТРИДЕСЕТТЕ КОМПОНЕНТА НА МАРШРУТА ЗА ОБОЗНАЧАВАНЕ НА ТСР ИМАТ АЛТЕРНАТИВНИ МЕСТА (APA) НА POLIADENILACION. ВЪЗ ОСНОВА НА ТЕЗИ РЕЗУЛТАТИ МОЖЕМ ДА КАЖЕМ, ЧЕ RBP35 ДЕЙСТВА КАТО КЛЮЧОВ МОДУЛАТОР НА МАРШРУТА НА ТСР. ТОЗИ НОВ ПРОЕКТ ЩЕ ИДЕНТИФИЦИРА ВРЪЗКИТЕ МЕЖДУ ПРЕДВАРИТЕЛНАТА ОБРАБОТКА НА МРНК В КРАЯ НА 3 " И МАРШРУТА НА ТСР. ТОЙ СЪЩО ТАКА ЩЕ АНАЛИЗИРА КАК ТЕЗИ ДВА ПРОЦЕСА РЕГУЛИРАТ ЕКСПРЕСИЯТА И ФУНКЦИЯТА НА ГЕНИТЕ, СВЪРЗАНИ С ИНФЕКЦИЯТА С M. ORYZAE. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ ТОЗИ ПРОЕКТ ИЗПОЛЗВА ДВА ДОПЪЛВАЩИ СЕ ПОДХОДА, СЪЧЕТАВАЩИ ПОДХОДИ НА КЛАСИЧЕСКАТА ГЕНЕТИКА, ГЕНОМНАТА, МОЛЕКУЛЯРНАТА И КЛЕТЪЧНАТА БИОЛОГИЯ. С ИЗПЪЛНЕНИЕТО НА ДВЕТЕ СИ ЦЕЛИ ТЯ ЩЕ БЪДЕ ОТКРИТА: 1) ВИДА ГЕНЕТИЧНИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ, СВЪРЗВАЩИ RBP35 И ЧРЕЗ TOR И 2) КАТО ЗАВИСИМАТА ОБРАБОТКА 3' RBP35 МОЖЕ ДА РЕГУЛИРА ТОЗИ СИГНАЛЕН НАЧИН. ИЗВЕСТНО Е, ЧЕ ТСР РЕГУЛИРА ЕКСПРЕСИЯТА НА ПРОТЕИНИТЕ, НЕОБХОДИМИ ЗА АДАПТИРАНЕ КЪМ ХРАНИТЕЛНИТЕ СИГНАЛИ. ТОЗИ ПРОЕКТ ИМА ПРЕДИЗВИКАТЕЛСТВОТО ДА ИДЕНТИФИЦИРА СЪОТВЕТНИТЕ НОВИ ПРОТЕИНИ, ТАКА ЧЕ ГЪБИЧКИТЕ ДА СЕ АДАПТИРАТ ПРАВИЛНО КЪМ ВЪНШНАТА СРЕДА И ДА АНАЛИЗИРА КАК СЕ МОДУЛИРА ЕКСПРЕСИЯТА НА ГЕНИТЕ, УЧАСТВАЩИ В СИГНАЛИЗИРАЩИЯ МАРШРУТ НА ТСР НА ПОСТТРАНСКРИПЦИОННО НИВО. ТОВА ЩЕ БЪДЕ ПОСТИГНАТО ЧРЕЗ ОПРЕДЕЛЯНЕ НА СТЕПЕНТА НА РАЗГРАЖДАНЕ НА ИРНК, НЕЙНОТО ПОДКЛЕТЪЧНО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ И НИВАТА НА ПРЕВОД. РЕЗУЛТАТИТЕ, ПОЛУЧЕНИ ОТ ТОЗИ ПРОЕКТ, СА ОТ ЗНАЧЕНИЕ ЗА ПРОДОВОЛСТВЕНАТА СИГУРНОСТ И РАСТИТЕЛНАТА ЗАЩИТА. ТОЗИ ПРОЕКТ ОТ СВОЯ СТРАНА ИМА ПРАКТИЧЕСКИ ПОСЛЕДИЦИ, ТЪЙ КАТО ЩЕ НИ ПОЗВОЛИ ДА РАЗРАБОТИМ ТРАЙНИ И УСТОЙЧИВИ СТРАТЕГИИ ЗА КОНТРОЛ НА ТЕЗИ ПАТОГЕННИ ГЪБИ. НАДЯВАМЕ СЕ ДА НАМЕРИМ НОВИ ВРЪЗКИ ПО МАРШРУТА НА ТСР В М. ОРИЗА. КАТО СЕ ИМА ПРЕДВИД ВАЖНАТА РОЛЯ, КОЯТО ТОЗИ ПЪТ ИГРАЕ ЗА РАСТЕЖА НА ГЪБИЧКИТЕ, НОВИТЕ ГЕНИ, ИДЕНТИФИЦИРАНИ В РЕЗУЛТАТ НА ТОЗИ ПРОЕКТ, ОЧЕВИДНО БИХА МОГЛИ ДА БЪДАТ МИШЕНИ ЗА РАЗВИТИЕТО НА ИНХИБИРАЩИ МОЛЕКУЛИ. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
RYŽIAI YRA PLAČIAUSIAI PAPLITĘS PAGRINDINIS MAISTAS PASAULYJE. JIS TAIP PAT SUDARO DIDELĘ PASAULIO PASĖLIŲ DALĮ, KURI SIEKIA IKI 160 MLN. HEKTARŲ PER METUS. VIENAS IŠ LABIAUSIAI NIOKOJANČIŲ RYŽIŲ PATOGENŲ YRA GRYBELIS, SUKELIANTIS PIRICULARIOSIS LIGĄ, MAGNAPORTHE ORYZAE. Šios ligos sukeltas pajamų praradimas svyruoja nuo 10–30 % per metus, o tai, INCLUDE IN THE DAUGIAU išsaugant stimuliaciją, yra pakankama 60 milijonų žmonių maitinimui (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TNI YRA KONSERVUOTA SERINO/TREONINO KINAZĖ, ESANTI VISOSE EUKARYOTES NUO GRYBŲ IKI ŽMONIŲ. JIS TAIP PAT YRA PAGRINDINĖ EUKARIOTINIŲ LĄSTELIŲ MAISTINGŲJŲ MEDŽIAGŲ SURAŠYMO KELIŲ SUDEDAMOJI DALIS. NORS TOR KINAZĖS (RAPAMICINO TAIKINYS) YRA IŠSAUGOTOS, GRYBAI SUKŪRĖ SKIRTINGAS STRATEGIJAS, KAIP NAUDOTI ŠĮ ŽENKLINIMO BŪDĄ. RBP35 YRA SPECIFINIS POLIDIBILIZACIJOS FAKTORIUS GIJINIUOSE GRYBUOSE. RBP35 MUTANTAS EKSPONUOJA PAKITUSĮ ELGESĮ PRIEŠ SKIRTINGAS MAISTINES MEDŽIAGAS, PAGREITINO AUTOFAGIJĄ IR TAIP PAT TURI DIDESNĮ ATSPARUMĄ RAPAMICINUI. VISA TAI RODO, KAD RBP35 AKTYVIAI VEIKIA TNI ŽENKLŲ MARŠRUTU. TIESĄ SAKANT, TNI YRA LABIAUSIAI PAVEIKTAS ŽENKLŲ MARŠRUTAS ŠIAME MUTANTE. ATLIKUS BENDRĄ GENOMINIO MASTO POLI(A) VIETŲ ANALIZĘ, NUSTATYTA, KAD M. ORYZAE’S ALTERNATYVIOJE POLITIKOJE DALYVAUJA RBP35. AŠTUONIOLIKA IŠ TRISDEŠIMTIES ELEMENTŲ, KURIEMS BŪDINGAS ANGLIES ALKIS, TURI ALTERNATYVIAS POLIADENILACION VIETAS (APA). REMDAMIESI ŠIAIS REZULTATAIS, GALIME PASAKYTI, KAD RBP35 VEIKIA KAIP PAGRINDINIS TNI MARŠRUTO MODULIATORIUS. ŠIAME NAUJAME PROJEKTE BUS NUSTATYTOS SĄSAJOS TARP PRE-MRNR APDOROJIMO 3 PABAIGOJE " IR TNI MARŠRUTO. JI TAIP PAT ANALIZUOS, KAIP ŠIE DU PROCESAI REGULIUOJA GENŲ, SUSIJUSIŲ SU M. ORYZAE INFEKCIJA, EKSPRESIJĄ IR FUNKCIJĄ. ŠIAM TIKSLUI ĮGYVENDINTI ŠIAME PROJEKTE NAUDOJAMI DU VIENAS KITĄ PAPILDANTYS METODAI, DERINANT KLASIKINĖS GENETIKOS, GENOMINĖS, MOLEKULINĖS IR LĄSTELIŲ BIOLOGIJOS METODUS. ĮGYVENDINUS DU JOS TIKSLUS, BUS NUSTATYTA: 1) GENETINĖS SĄVEIKOS TIPAS JUNGIANTIS RBP35 IR PER TOR IR 2) KAIP 3’ RBP35 PRIKLAUSOMAS APDOROJIMAS GALI REGULIUOTI ŠĮ SIGNALIZAVIMO BŪDĄ. ŽINOMA, KAD TNI REGULIUOJA BALTYMŲ, REIKALINGŲ PRISITAIKYTI PRIE MITYBOS SIGNALŲ, EKSPRESIJĄ. ŠIO PROJEKTO UŽDAVINYS – NUSTATYTI ATITINKAMUS NAUJUS BALTYMUS, KAD GRYBELIS TINKAMAI PRISITAIKYTŲ PRIE IŠORINĖS APLINKOS, IR IŠANALIZUOTI, KAIP MODULIUOJAMA GENŲ, DALYVAUJANČIŲ TNI SIGNALIZAVIMO KELYJE PO TRANSKRIPCIJOS, EKSPRESIJA. TAI BUS PASIEKTA NUSTATANT MRNR DEGRADACIJOS SPARTĄ, JOS POLĄSTELINĘ VIETĄ IR JOS VERTIMO LYGIUS. ŠIO PROJEKTO REZULTATAI YRA SVARBŪS APSIRŪPINIMO MAISTU SAUGUMUI IR PASĖLIŲ APSAUGAI. ŠIS PROJEKTAS SAVO RUOŽTU TURI PRAKTINIŲ PASEKMIŲ, NES LEIS MUMS PARENGTI ILGALAIKES IR TVARIAS ŠIŲ PATOGENŲ GRYBŲ KONTROLĖS STRATEGIJAS. TIKIMĖS RASTI NAUJŲ JUNGČIŲ TOR MARŠRUTE M. ORYZAE. ATSIŽVELGIANT Į SVARBŲ ŠIO KELIO VAIDMENĮ GRYBELIO AUGIMUI, NAUJI GENAI, NUSTATYTI KAIP ŠIO PROJEKTO REZULTATAS, GALĖTŲ BŪTI AKIVAIZDŪS SLOPINANČIŲ MOLEKULIŲ VYSTYMOSI TIKSLAI. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
RIŽA JE NAJRAŠIRENIJA OSNOVNA HRANA NA SVIJETU. ONA TAKOĐER ČINI ZNATAN POSTOTAK SVJETSKIH USJEVA I DOSEŽE DO 160 MILIJUNA HEKTARA GODIŠNJE. JEDAN OD NAJRAZORNIJIH PATOGENA RIŽE JE GLJIVA KOJA PROIZVODI PIRICULARIOSIS BOLEST, MAGNAPORTHE ORYZAE. Gubitak prihoda uzrokovan ovom bolešću kreće se između 10 – 30 % godišnje, što je, INCLUDE U VIŠE očuvanje stimacije, dovoljno za hranjenje 60 milijuna ljudi (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR JE OČUVANA SERIN/TREONIN KINAZA PRISUTNA U SVIM EUKARIOTIMA, OD GLJIVICA DO LJUDI. TO JE TAKOĐER BITNA KOMPONENTA POPISA HRANJIVIH PUTOVA EUKARIOTSKIH STANICA. IAKO SU TOR KINAZE (CILJ RAPAMICINA) OČUVANE, GLJIVE SU RAZVILE RAZLIČITE STRATEGIJE ZA KORIŠTENJE OVOG PUTOKAZA. RBP35 JE SPECIFIČNI FAKTOR POLIDENILACIJE U FILAMENTNIM GLJIVICAMA. MUTANT RBP35 POKAZUJE PROMIJENJENO PONAŠANJE PROTIV RAZLIČITIH HRANJIVIH TVARI, UBRZAO JE AUTOFAGIJU I TAKOĐER IMA VEĆU OTPORNOST NA RAPAMICIN. SVE TO UPUĆUJE NA TO DA RBP35 SNAŽNO DJELUJE NA SIGNALNOM PUTU TOR-A. U STVARI, TOR JE NAJVIŠE POGOĐENI PUT SIGNALIZACIJE U OVOM MUTANTU. GLOBALNA ANALIZA POLI(A) LOKACIJA NA GENOMSKOJ LJESTVICI UTVRDILA JE SUDJELOVANJE RBP35 U ALTERNATIVNOJ POLITICI M. ORYZAE. U ĆELIJAMA KOJE SU IZLOŽENE UGLJIČNOJ GLADI, OSAMNAEST OD TRIDESET SASTAVNIH DIJELOVA SIGNALNOG PUTA TOR-A IMA ALTERNATIVNA MJESTA (APA) POLIADENILACIJA. NA TEMELJU TIH REZULTATA MOŽEMO REĆI DA RBP35 DJELUJE KAO KLJUČNI MODULATOR TOR RUTE. OVIM NOVIM PROJEKTOM UTVRDIT ĆE SE POVEZNICE IZMEĐU OBRADE PRIJE MRNA-E NA KRAJU 3. I RUTE TRADICIONALNIH VLASTITIH SREDSTAVA. TAKOĐER ĆE ANALIZIRATI KAKO TA DVA PROCESA REGULIRAJU EKSPRESIJU I FUNKCIJU GENA POVEZANIH S INFEKCIJOM M. ORYZAE. DA BI SE TO POSTIGLO, OVAJ PROJEKT KORISTI DVA KOMPLEMENTARNA PRISTUPA, KOMBINIRAJUĆI PRISTUPE KLASIČNE GENETIKE, GENOMSKE, MOLEKULARNE I STANIČNE BIOLOGIJE. OSTVARIVANJEM DVAJU CILJEVA BIT ĆE OTKRIVENO: 1) VRSTA GENETSKIH INTERAKCIJA KOJE POVEZUJU RBP35 I PUTEM TOR-A I 2) KAO 3' RBP35 OVISNA OBRADA MOŽE REGULIRATI OVAJ SIGNALNI NAČIN. POZNATO JE DA TOR REGULIRA EKSPRESIJU BJELANČEVINA POTREBNIH ZA PRILAGODBU PREHRAMBENIM SIGNALIMA. OVAJ PROJEKT IMA IZAZOV PREPOZNAVANJA RELEVANTNIH NOVIH PROTEINA KAKO BI SE GLJIVA ISPRAVNO PRILAGODILA VANJSKOM OKRUŽENJU I ANALIZIRALA KAKO SE MODULIRA EKSPRESIJA GENA UKLJUČENIH U PUT SIGNALIZACIJE TOR-A NA POSTTRANSKRIPCIJSKOJ RAZINI. TO ĆE SE POSTIĆI ODREĐIVANJEM STOPA RAZGRADNJE MRNA, NJEZINE PODSTANIČNE LOKACIJE I RAZINA PRIJEVODA. REZULTATI OVOG PROJEKTA VAŽNI SU ZA SIGURNOST OPSKRBE HRANOM I ZAŠTITU USJEVA. OVAJ PROJEKT PAK IMA PRAKTIČNE POSLJEDICE JER ĆE NAM OMOGUĆITI RAZVOJ TRAJNIH I ODRŽIVIH STRATEGIJA ZA KONTROLU TIH PATOGENIH GLJIVICA. NADAMO SE DA ĆEMO PRONAĆI NOVE VEZE NA RUTI TOR U M. ORYZAEU. S OBZIROM NA VAŽNU ULOGU KOJU OVAJ PUT IMA U RASTU GLJIVICA, NOVI GENI IDENTIFICIRANI KAO REZULTAT OVOG PROJEKTA JASNO BI MOGLI BITI CILJEVI ZA RAZVOJ INHIBICIJSKIH MOLEKULA. (Croatian)
17 August 2022
0 references
RIS ÄR DEN MEST SPRIDDA BASMATEN I VÄRLDEN. DEN STÅR OCKSÅ FÖR EN BETYDANDE ANDEL AV VÄRLDENS GRÖDOR OCH UPPGÅR TILL UPP TILL 160 MILJONER HEKTAR PER ÅR. EN AV DE MEST FÖRÖDANDE PATOGENERNA AV RIS ÄR SVAMPEN SOM PRODUCERAR PIRICULARIOSIS SJUKDOM, MAGNAPORTHE ORYZAE. Inkomstbortfallet som orsakas av denna sjukdom varierar mellan 10–30 % per år, vilket, INCLUDE I MER bevarande stimering, är tillräckligt för att föda 60 miljoner människor (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR ÄR EN BEVARAD SERIN/TREONINKINAS SOM FINNS I ALLA EUKARYOTER FRÅN SVAMPAR TILL MÄNNISKOR. DET ÄR OCKSÅ DEN VIKTIGASTE KOMPONENTEN I NÄRINGSÄMNESRÄKNINGSVÄGARNA FÖR EUKARYOTIC CELLER. ÄVEN OM TOR-KINASER (MÅL FÖR RAPAMYCIN) BEVARAS, HAR SVAMP UTVECKLAT OLIKA STRATEGIER FÖR ATT ANVÄNDA DENNA SKYLTNING VÄG. RBP35 ÄR EN SPECIFIK POLYDENILATIONSFAKTOR I FIBERSVAMPAR. RBP35-MUTANTEN UPPVISAR FÖRÄNDRAT BETEENDE MOT OLIKA NÄRINGSÄMNEN, HAR ACCELERERAT AUTOFAGI OCH HAR OCKSÅ STÖRRE MOTSTÅNDSKRAFT MOT RAPAMYCIN. ALLT DETTA TYDER PÅ ATT RBP35 AGERAR STARKT PÅ SKYLTNINGSVÄGEN FÖR TRADITIONELLA EGNA MEDEL. I SJÄLVA VERKET ÄR TOR DEN MEST DRABBADE SKYLTVÄGEN I DENNA MUTANT. EN GLOBAL ANALYS AV POLY(A) ANLÄGGNINGAR PÅ GENOMISK SKALA HAR IDENTIFIERAT RBP35:S DELTAGANDE I M. ORYZAES ALTERNATIVA POLICY. I CELLER SOM LIDER AV KOL HUNGER HAR ARTON AV DE TRETTIO KOMPONENTERNA I TOR SKYLTNING VÄG ALTERNATIVA PLATSER (APA) AV POLIADENILACION. BASERAT PÅ DESSA RESULTAT KAN VI SÄGA ATT RBP35 FUNGERAR SOM EN VIKTIG MODULATOR FÖR TOR-RUTTEN. DETTA NYA PROJEKT KOMMER ATT IDENTIFIERA KOPPLINGARNA MELLAN PRE-MRNA-BEHANDLING I SLUTET AV 3 ” OCH TOR-RUTTEN. DET KOMMER OCKSÅ ATT ANALYSERA HUR DESSA TVÅ PROCESSER REGLERAR UTTRYCK OCH FUNKTION AV GENER RELATERADE TILL M. ORYZAE INFEKTION. FÖR ATT GÖRA DETTA ANVÄNDER DETTA PROJEKT TVÅ KOMPLETTERANDE TILLVÄGAGÅNGSSÄTT, SOM KOMBINERAR METODER FÖR KLASSISK GENETIK, GENOMISK, MOLEKYLÄR OCH CELLULÄR BIOLOGI. MED GENOMFÖRANDET AV DE TVÅ MÅLEN KOMMER DET ATT UPPTÄCKAS: 1) DEN TYP AV GENETISKA INTERAKTIONER SOM FÖRBINDER RBP35 OCH VIA TOR OCH 2) SOM 3’ RBP35 BEROENDE BEARBETNING KAN REGLERA DETTA SIGNALSÄTT. TOR ÄR KÄND FÖR ATT REGLERA UTTRYCKET AV PROTEINER SOM BEHÖVS FÖR ATT ANPASSA SIG TILL NÄRINGSSIGNALER. DETTA PROJEKT HAR UTMANINGEN ATT IDENTIFIERA RELEVANTA NYA PROTEINER SÅ ATT SVAMPEN ANPASSAR SIG KORREKT TILL DEN YTTRE MILJÖN OCH ANALYSERAR HUR UTTRYCKET AV GENER SOM ÄR INVOLVERADE I TOR-SIGNALVÄGEN PÅ POST-TRANSCRIPTIONAL NIVÅ MODULERAS. DETTA KOMMER ATT UPPNÅS GENOM ATT FASTSTÄLLA GRADEN AV MRNA-NEDBRYTNING, DESS SUBCELLULÄRA LÄGE OCH DESS ÖVERSÄTTNINGSNIVÅER. RESULTATEN FRÅN DETTA PROJEKT ÄR RELEVANTA FÖR LIVSMEDELSTRYGGHET OCH VÄXTSKYDD. DETTA PROJEKT HAR I SIN TUR PRAKTISKA KONSEKVENSER EFTERSOM DET KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT UTVECKLA VARAKTIGA OCH HÅLLBARA STRATEGIER FÖR KONTROLL AV DESSA PATOGENA SVAMPAR. VI HOPPAS KUNNA HITTA NYA FÖRBINDELSER PÅ TOR-RUTTEN I M. ORYZAE. MED TANKE PÅ DEN VIKTIGA ROLL SOM DENNA VÄG SPELAR I SVAMPENS TILLVÄXT, KAN DE NYA GENER SOM IDENTIFIERAS SOM ETT RESULTAT AV DETTA PROJEKT TYDLIGT VARA MÅL FÖR UTVECKLINGEN AV HÄMMANDE MOLEKYLER. (Swedish)
17 August 2022
0 references
OREZUL ESTE CEA MAI RĂSPÂNDITĂ MÂNCARE DE BAZĂ DIN LUME. ACESTA REPREZINTĂ, DE ASEMENEA, UN PROCENT SEMNIFICATIV DIN CULTURILE MONDIALE, AJUNGÂND PÂNĂ LA 160 DE MILIOANE DE HECTARE PE AN. UNA DINTRE CELE MAI DEVASTATOARE AGENȚI PATOGENI AI OREZULUI ESTE CIUPERCA CARE PRODUCE BOALA PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. Pierderile de venit cauzate de această boală variază între 10-30 % pe an, care, INCLUDE ÎN MAI MULT de conservare a stimulării, sunt suficiente pentru a hrăni 60 de milioane de oameni (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR ESTE O SERINĂ/TREONIN KINAZĂ CONSERVATĂ PREZENTĂ ÎN TOATE EUCARIOTELE DE LA CIUPERCI LA OM. ESTE, DE ASEMENEA, COMPONENTA ESENȚIALĂ A CĂILOR DE RECENSĂMÂNT AL NUTRIENȚILOR CELULELOR EUCARIOTE. DEȘI KINAZELE RPT (ȚINTĂ DE RAPAMICINĂ) SUNT CONSERVATE, CIUPERCILE AU DEZVOLTAT STRATEGII DIFERITE PENTRU A UTILIZA ACEASTĂ CALE DE SEMNALIZARE. RBP35 ESTE UN FACTOR SPECIFIC DE POLIDENILARE ÎN CIUPERCILE FILAMENTARE. MUTANTUL RBP35 PREZINTĂ UN COMPORTAMENT MODIFICAT ÎMPOTRIVA DIFERIȚILOR NUTRIENȚI, A ACCELERAT AUTOFAGIA ȘI ARE, DE ASEMENEA, O REZISTENȚĂ MAI MARE LA RAPAMICINĂ. TOATE ACESTEA SUGEREAZĂ CĂ RBP35 ACȚIONEAZĂ PUTERNIC PE RUTA SEMNALIZĂRII RPT. DE FAPT, RPT ESTE CEA MAI AFECTATĂ RUTĂ DE SEMNALIZARE DIN ACEST MUTANT. O ANALIZĂ GLOBALĂ A POLI(A) SITURILOR LA SCARĂ GENOMICĂ A IDENTIFICAT PARTICIPAREA RBP35 LA POLITICA ALTERNATIVĂ A LUI M. ORYZAE. ÎN CELULELE SUPUSE FOAMETEI DE CARBON, OPTSPREZECE DIN CELE TREIZECI DE COMPONENTE ALE RUTEI DE SEMNALIZARE A RPT AU SITURI ALTERNATIVE (APA) DE POLIADENILACION. PE BAZA ACESTOR REZULTATE, PUTEM SPUNE CĂ RBP35 ACȚIONEAZĂ CA UN MODULATOR CHEIE AL RUTEI RPT. ACEST PROIECT NOU VA IDENTIFICA LEGĂTURILE DINTRE PRELUCRAREA PRE-MARN LA SFÂRȘITUL SĂU 3" ȘI RUTA RPT. DE ASEMENEA, VA ANALIZA MODUL ÎN CARE ACESTE DOUĂ PROCESE REGLEAZĂ EXPRESIA ȘI FUNCȚIA GENELOR LEGATE DE INFECȚIA CU M. ORYZAE. PENTRU A FACE ACEST LUCRU, ACEST PROIECT UTILIZEAZĂ DOUĂ ABORDĂRI COMPLEMENTARE, COMBINÂND ABORDĂRILE CLASICE GENETICA, BIOLOGIA GENOMICĂ, MOLECULARĂ ȘI CELULARĂ. ODATĂ CU REALIZAREA CELOR DOUĂ OBIECTIVE ALE SALE, SE VOR DESCOPERI: 1) TIPUL DE INTERACȚIUNI GENETICE CARE LEAGĂ RBP35 ȘI PRIN TOR ȘI 2) CA 3’ RBP35 DE PRELUCRARE DEPENDENTĂ POATE REGLA ACEST MOD DE SEMNALIZARE. SE ȘTIE CĂ TOR REGLEAZĂ EXPRESIA PROTEINELOR NECESARE PENTRU ADAPTAREA LA SEMNALELE NUTRIȚIONALE. ACEST PROIECT ARE PROVOCAREA DE A IDENTIFICA NOI PROTEINE RELEVANTE, ASTFEL ÎNCÂT CIUPERCA SĂ SE ADAPTEZE CORECT LA MEDIUL EXTERN ȘI SĂ ANALIZEZE MODUL ÎN CARE ESTE MODULATĂ EXPRESIA GENELOR IMPLICATE ÎN RUTA DE SEMNALIZARE A RPT LA NIVEL POST-TRANSCRIPTIONAL. ACEST LUCRU SE VA REALIZA PRIN DETERMINAREA RATELOR DE DEGRADARE A ARNM, A LOCALIZĂRII SALE SUBCELULARE ȘI A NIVELURILOR SALE DE TRADUCERE. REZULTATELE OBȚINUTE ÎN URMA ACESTUI PROIECT SUNT RELEVANTE PENTRU SECURITATEA ALIMENTARĂ ȘI PROTECȚIA CULTURILOR. LA RÂNDUL SĂU, ACEST PROIECT ARE IMPLICAȚII PRACTICE, DEOARECE NE VA PERMITE SĂ DEZVOLTĂM STRATEGII DURABILE ȘI DURABILE PENTRU CONTROLUL ACESTOR CIUPERCI PATOGENE. SPERĂM SĂ GĂSIM NOI CONEXIUNI PE RUTA RPT ÎN M. ORYZAE. AVÂND ÎN VEDERE ROLUL IMPORTANT PE CARE ACEASTĂ CALE ÎL JOACĂ ÎN CREȘTEREA CIUPERCII, NOILE GENE IDENTIFICATE CA URMARE A ACESTUI PROIECT AR PUTEA FI ÎN MOD CLAR ȚINTE PENTRU DEZVOLTAREA MOLECULELOR INHIBANTE. (Romanian)
17 August 2022
0 references
RIŽ JE NAJBOLJ RAZŠIRJENA OSNOVNA HRANA NA SVETU. PRAV TAKO PREDSTAVLJA VELIK DELEŽ SVETOVNIH PRIDELKOV, KI DOSEGAJO DO 160 MILIJONOV HEKTAROV LETNO. EDEN OD NAJBOLJ UNIČUJOČIH PATOGENOV RIŽA JE GLIVA, KI PROIZVAJA PIRICULARIOSIS BOLEZEN, MAGNAPORTHE ORYZAE. Izguba dohodka, ki jo povzroča ta bolezen, se giblje med 10–30 % na leto, kar, INCLUDE V VEČ konzervativne stimacije, zadostuje za hranjenje 60 milijonov ljudi (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR JE OHRANJENA SERIN/TREONIN KINAZA PRISOTNA V VSEH EVKARIONTIH OD GLIV DO LJUDI. JE TUDI BISTVENA SESTAVINA POPISA HRANILNIH POTI EVKARIONTSKIH CELIC. ČEPRAV SO KINAZE TOR (CILJ RAPAMICINA) OHRANJENE, SO GOBE RAZVILE RAZLIČNE STRATEGIJE ZA UPORABO TE OZNAČEVALNE POTI. RBP35 JE SPECIFIČEN FAKTOR POLYDENILATION V NITASTIH GLIVAH. MUTANT RBP35 KAŽE SPREMENJENO VEDENJE PROTI RAZLIČNIM HRANILOM, POSPEŠUJE AVTOFAGIJO IN IMA TUDI VEČJO ODPORNOST NA RAPAMICIN. VSE TO KAŽE NA TO, DA RBP35 DELUJE MOČNO NA OZNAČEVALNI POTI TLS. PRAVZAPRAV JE TOR NAJBOLJ PRIZADETA OZNAČEVALNA POT V TEM MUTANTU. GLOBALNA ANALIZA POLI(A) LOKACIJ NA GENOMSKI LESTVICI JE OPREDELILA SODELOVANJE RBP35 V ALTERNATIVNI POLITIKI M. ORYZAE’S. V CELICAH, IZPOSTAVLJENIH LAKOTI ZARADI OGLJIKA, IMA OSEMNAJST OD TRIDESETIH KOMPONENT SIGNALNE POTI TOR ALTERNATIVNA MESTA (APA) ZDRAVILA POLIADENILACION. NA PODLAGI TEH REZULTATOV LAHKO REČEMO, DA RBP35 DELUJE KOT KLJUČNI MODULATOR POTI TLS. TA NOVI PROJEKT BO OPREDELIL POVEZAVE MED OBDELAVO PRED MRNA NA KONCU 3 " IN POTJO TRADICIONALNIH LASTNIH SREDSTEV. PRAV TAKO BO ANALIZIRALA, KAKO TA DVA PROCESA URAVNAVATA IZRAŽANJE IN DELOVANJE GENOV, POVEZANIH Z OKUŽBO Z BAKTERIJO M. ORYZAE. V TA NAMEN TA PROJEKT UPORABLJA DVA DOPOLNJUJOČA SE PRISTOPA, KI ZDRUŽUJETA PRISTOPE KLASIČNE GENETIKE, GENOMSKE, MOLEKULARNE IN CELIČNE BIOLOGIJE. Z URESNIČEVANJEM DVEH CILJEV BO ODKRITA: 1) VRSTA GENETSKIH INTERAKCIJ, KI POVEZUJEJO RBP35 IN PREKO TOR IN 2) KOT 3’ RBP35 ODVISNA OBDELAVA LAHKO REGULIRA TA SIGNALNI NAČIN. ZNANO JE, DA TOR URAVNAVA IZRAŽANJE BELJAKOVIN, POTREBNIH ZA PRILAGAJANJE PREHRANSKIM SIGNALOM. TA PROJEKT IMA IZZIV PREPOZNATI USTREZNE NOVE BELJAKOVINE, TAKO DA SE GLIVE PRAVILNO PRILAGODIJO ZUNANJEMU OKOLJU IN ANALIZIRAJO, KAKO SE MODULIRA IZRAŽANJE GENOV, VKLJUČENIH V SIGNALNO POT TOR NA POSTTRANSKRIPCIJSKI RAVNI. TO BO DOSEŽENO Z DOLOČANJEM STOPENJ DEGRADACIJE MRNK, NJENE PODCELIČNE LOKACIJE IN RAVNI PREVODOV. REZULTATI TEGA PROJEKTA SO POMEMBNI ZA PREHRANSKO VARNOST IN ZAŠČITO PRIDELKOV. TA PROJEKT IMA PRAKTIČNE POSLEDICE, SAJ NAM BO OMOGOČIL RAZVOJ TRAJNIH IN TRAJNOSTNIH STRATEGIJ ZA NADZOR TEH PATOGENIH GLIV. UPAMO, DA BOMO NAŠLI NOVE POVEZAVE NA POTI TOR V M. ORYZAE. GLEDE NA POMEMBNO VLOGO, KI JO IMA TA POT PRI RASTI GLIV, BI LAHKO BILI NOVI GENI, OPREDELJENI KOT REZULTAT TEGA PROJEKTA, CILJI ZA RAZVOJ INHIBITIVNIH MOLEKUL. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
RYŻ JEST NAJBARDZIEJ ROZPOWSZECHNIONYM PODSTAWOWYM POKARMEM NA ŚWIECIE. STANOWI ON RÓWNIEŻ ZNACZNY ODSETEK UPRAW ŚWIATOWYCH, OSIĄGAJĄC DO 160 MLN HEKTARÓW ROCZNIE. JEDNYM Z NAJBARDZIEJ NISZCZYCIELSKICH PATOGENÓW RYŻU JEST GRZYB, KTÓRY WYTWARZA CHOROBĘ PIRICULARIOSIS, MAGNAPORTHE ORYZAE. Utrata dochodów spowodowana tą chorobą waha się od 10-30 % rocznie, co, WIĘCEJ W MOŻEJ zachowaniu stymulacji, jest wystarczające do wyżywienia 60 milionów osób (SKAMNIOTI&Gurr, 2009). TOR TO ZACHOWANA KINAZA SERYNA/TREONINA OBECNA WE WSZYSTKICH EUKARIOTACH OD GRZYBÓW DO LUDZI. JEST TO RÓWNIEŻ ZASADNICZY SKŁADNIK SZLAKÓW SPISU SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH KOMÓREK EUKARIOTYCZNYCH. CHOCIAŻ KINAZY TOR (CEL RAPAMYCYNY) SĄ KONSERWOWANE, GRZYBY OPRACOWAŁY RÓŻNE STRATEGIE KORZYSTANIA Z TEJ TRASY OZNAKOWANIA. RBP35 JEST SPECYFICZNYM CZYNNIKIEM POLYDENILATION W GRZYBACH WŁÓKIENKOWYCH. MUTANT RBP35 WYKAZUJE ZMIENIONE ZACHOWANIE WOBEC RÓŻNYCH SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH, PRZYSPIESZYŁ AUTOFAGIĘ, A TAKŻE MA WIĘKSZĄ ODPORNOŚĆ NA RAPAMYCYNĘ. WSZYSTKO TO SUGERUJE, ŻE RBP35 DZIAŁA SILNIE NA TRASIE OZNAKOWANIA TZW. W RZECZYWISTOŚCI TOR JEST NAJBARDZIEJ DOTKNIĘTYM SZLAKIEM OZNAKOWANIA W TYM MUTANCIE. GLOBALNA ANALIZA OBSZARÓW POLI(A) W SKALI GENOMOWEJ WYKAZAŁA UDZIAŁ RBP35 W ALTERNATYWNEJ POLITYCE M. ORYZAE. W KOMÓRKACH, W KTÓRYCH WYSTĘPUJE GŁÓD WĘGLOWY, OSIEMNAŚCIE Z TRZYDZIESTU ELEMENTÓW SZLAKU OZNAKOWANIA TOR MA ALTERNATYWNE MIEJSCA (APA) POLIADENILACION. NA PODSTAWIE TYCH WYNIKÓW MOŻNA POWIEDZIEĆ, ŻE RBP35 PEŁNI ROLĘ KLUCZOWEGO MODULATORA TRASY TOR. TEN NOWY PROJEKT OKREŚLI POWIĄZANIA MIĘDZY PRZETWARZANIEM PRZEDMRNA NA KOŃCU 3' A TRASĄ TZW. PRZEANALIZUJE RÓWNIEŻ, W JAKI SPOSÓB TE DWA PROCESY REGULUJĄ EKSPRESJĘ I FUNKCJĘ GENÓW ZWIĄZANYCH Z ZAKAŻENIEM M. ORYZAE. ABY TO ZROBIĆ, W PROJEKCIE WYKORZYSTUJE SIĘ DWA UZUPEŁNIAJĄCE SIĘ PODEJŚCIA, ŁĄCZĄCE PODEJŚCIA KLASYCZNEJ GENETYKI, BIOLOGII GENOMOWEJ, MOLEKULARNEJ I KOMÓRKOWEJ. DZIĘKI REALIZACJI DWÓCH CELÓW ZOSTANIE ONA ODKRYTA: 1) RODZAJ INTERAKCJI GENETYCZNYCH ŁĄCZĄCYCH RBP35 I PRZEZ TOR I 2) PONIEWAŻ PRZETWARZANIE ZALEŻNE 3' RBP35 MOŻE REGULOWAĆ TEN SPOSÓB SYGNALIZOWANIA. TOR JEST ZNANY Z REGULACJI EKSPRESJI BIAŁEK POTRZEBNYCH DO DOSTOSOWANIA SIĘ DO SYGNAŁÓW ŻYWIENIOWYCH. PROJEKT TEN STANOWI WYZWANIE, JAKIM JEST IDENTYFIKACJA ODPOWIEDNICH NOWYCH BIAŁEK, TAK ABY GRZYB PRAWIDŁOWO DOPASOWYWAŁ SIĘ DO ŚRODOWISKA ZEWNĘTRZNEGO I ANALIZOWAŁ SPOSÓB MODULACJI EKSPRESJI GENÓW ZAANGAŻOWANYCH W TRASĘ SYGNALIZACYJNĄ TOR NA POZIOMIE POTRANSKRYPCYJNYM. ZOSTANIE TO OSIĄGNIĘTE POPRZEZ OKREŚLENIE TEMPA DEGRADACJI MRNA, JEJ LOKALIZACJI PODKOMÓRKOWEJ I POZIOMU TŁUMACZEŃ. WYNIKI TEGO PROJEKTU MAJĄ ZNACZENIE DLA BEZPIECZEŃSTWA ŻYWNOŚCIOWEGO I OCHRONY UPRAW. TEN PROJEKT Z KOLEI MA PRAKTYCZNE KONSEKWENCJE, PONIEWAŻ POZWOLI NAM OPRACOWAĆ TRWAŁE I ZRÓWNOWAŻONE STRATEGIE KONTROLI TYCH GRZYBÓW PATOGENOWYCH. MAMY NADZIEJĘ ZNALEŹĆ NOWE POŁĄCZENIA NA TRASIE TOR W M. ORYZAE. BIORĄC POD UWAGĘ WAŻNĄ ROLĘ, JAKĄ TA DROGA ODGRYWA W ROZWOJU GRZYBA, NOWE GENY ZIDENTYFIKOWANE W WYNIKU TEGO PROJEKTU MOGĄ BYĆ WYRAŹNIE CELEM DLA ROZWOJU CZĄSTECZEK HAMUJĄCYCH. (Polish)
17 August 2022
0 references
Pozuelo de Alarcón
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BIO2014-54233-JIN
0 references