EPIDEMIOLOGICAL SURVEILLANCE OF THE TRANSMISSION OF ANTIRETROVIRAL RESISTANCE IN SPAIN. PHYLOGENETIC, PHYLODYMICAL AND PHYLOTECHNIC STUDY (Q3165041)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3165041 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EPIDEMIOLOGICAL SURVEILLANCE OF THE TRANSMISSION OF ANTIRETROVIRAL RESISTANCE IN SPAIN. PHYLOGENETIC, PHYLODYMICAL AND PHYLOTECHNIC STUDY |
Project Q3165041 in Spain |
Statements
49,947.2 Euro
0 references
62,000.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 March 2022
0 references
FUNDACION PARA LA INVESTIGACION BIOSANITARIA DE ANDALUCIA ORIENTAL - ALEJANDRO OTERO
0 references
Objetivo General: Generar los datos virológicos de la infección por VIH representativos de nuestro país para poder responder a los objetivos específicos; Objetivos Específicos: a. Evaluar la transmisión de resistencias primarias y los cambios en la epidemiología molecular de VIH-1 en España a lo largo del periodo 2019-2021. b. Analizar los nuevos diagnósticos en España para identificar en tiempo real los clusters con una alta tasa de transmisión por análisis filogenético, para proponer las medidas preventivas que eviten su expansión c. Investigar los patrones de transmisión entre los migrantes que viven en España, para elaborar recomendaciones encaminadas a frenar/disminuir los eventos de transmisión en este colectivo. Metodología: Adultos con infección por el VIH confirmada y naive a tratamiento antiretroviral que acuden a centros de la cohorte CoRIS participantes en el WP de resistencias y para los que se realiza, bien una secuenciación para determinación de TDR, bien una recogida de una muestra de sangre para el biobanco de la red de investigación en sida. Para el análisis filogenético, las secuencias únicas obtenidas serán alineadas utilizando ClustalW, seguidamente se buscara el modelo de sustitución de nucleótidos que mejor se ajuste al análisis filogenético mediante FindModel, la construcción del modelo resumido de árbol filogenético de máxima verosimilitud será generado en Beast v1.7.5. Para el estudio en migrantes se aplicarán métodos estadístico filoetnicos. (Spanish)
0 references
General objective: To generate virological data on HIV infection that are representative of our country in order to meet the specific objectives; Specific Objectives: a. Evaluate the transmission of primary resistance and changes in the molecular epidemiology of HIV-1 in Spain over the period 2019-2021. b. Analyse new diagnoses in Spain to identify in real time clusters with a high rate of transmission by phylogenetic analysis, to propose preventive measures to prevent their expansion c. Investigate transmission patterns among migrants living in Spain, to elaborate recommendations aimed at curbing/decreasing transmission events in this group. Methodology: Adults with confirmed HIV infection and naive to antiretroviral treatment who come to centers in the CoRIS cohort participating in WP resistance and for whom it is performed, either a sequencing for the determination of RRT or a collection of a blood sample for the biobank from the AIDS research network. For the phylogenetic analysis, the unique sequences obtained will be aligned using ClustalW, then the nucleotide substitution model that best fits the phylogenetic analysis using FindModel is sought, the construction of the summary model of the phylogenetic tree with maximum probability will be generated in Beast v1.7.5. Phyloethnic statistical methods shall be applied for the study of migrants. (English)
12 October 2021
0.6278652616521225
0 references
Objectif général: Produire des données virologiques sur l’infection par le VIH qui sont représentatives de notre pays afin d’atteindre les objectifs spécifiques; Objectifs spécifiques: a. Évaluer la transmission de la résistance primaire et les changements dans l’épidémiologie moléculaire du VIH-1 en Espagne au cours de la période 2019-2021. b. Analyser les nouveaux diagnostics en Espagne afin d’identifier en temps réel des grappes présentant un taux élevé de transmission par analyse phylogénétique, afin de proposer des mesures préventives pour empêcher leur expansion. Méthodologie: Adultes atteints d’une infection à VIH confirmée et d’un traitement naïf aux antirétroviraux qui viennent aux centres de la cohorte CoRIS participant à la résistance à la WP et pour lesquels il est effectué, soit un séquençage pour la détermination de la TRR, soit une collecte d’un échantillon de sang pour la biobanque provenant du réseau de recherche sur le sida. Pour l’analyse phylogénétique, les séquences uniques obtenues seront alignées à l’aide de ClustalW, puis le modèle de substitution des nucléotides qui correspond le mieux à l’analyse phylogénétique à l’aide de FindModel est recherché, la construction du modèle sommaire de l’arbre phylogénétique avec une probabilité maximale sera générée dans Beast v1.7.5. Des méthodes statistiques phyloethniques sont appliquées pour l’étude des migrants. (French)
4 December 2021
0 references
Allgemeines Ziel: Virologische Daten über HIV-Infektionen zu generieren, die für unser Land repräsentativ sind, um die spezifischen Ziele zu erreichen; Spezifische Ziele: a. Bewerten Sie die Übertragung von Primärresistenz und Veränderungen in der molekularen Epidemiologie von HIV-1 in Spanien im Zeitraum 2019-2021. b. Analysieren Sie neue Diagnosen in Spanien, um Cluster in Echtzeit mit einer hohen Übertragungsrate durch phylogenetische Analysen zu identifizieren, um präventive Maßnahmen vorzuschlagen, um deren Expansion zu verhindern c. Untersuchung von Übertragungsmustern unter in Spanien lebenden Migranten, um Empfehlungen zur Eindämmung/Verringerung von Übertragungsereignissen in dieser Gruppe auszuarbeiten. Methodik: Erwachsene mit bestätigter HIV-Infektion und naiv zur antiretroviralen Behandlung, die zu Zentren der CoRIS-Kohorte kommen, die an der WP-Resistenz teilnehmen und für die sie durchgeführt wird, entweder eine Sequenzierung zur Bestimmung der RRT oder eine Sammlung einer Blutprobe für die Biobank aus dem AIDS-Forschungsnetzwerk. Für die phylogenetische Analyse werden die einzigartigen Sequenzen mit ClustalW ausgerichtet, dann wird das Nukleotidsubstitutionsmodell, das am besten zur phylogenetischen Analyse mit FindModel passt, gesucht, die Konstruktion des zusammenfassenden Modells des phylogenetischen Baumes mit maximaler Wahrscheinlichkeit wird in Beast v1.7.5 erzeugt. Phyloethnische statistische Methoden sind für die Studie von Migranten anzuwenden. (German)
9 December 2021
0 references
Algemene doelstelling: Virologische gegevens over hiv-infecties te genereren die representatief zijn voor ons land om de specifieke doelstellingen te bereiken; Specifieke doelstellingen: a. Evaluatie van de overdracht van primaire resistentie en veranderingen in de moleculaire epidemiologie van HIV-1 in Spanje in de periode 2019-2021. b. Analyseer nieuwe diagnoses in Spanje om clusters in real time te identificeren met een hoge snelheid van overdracht door phylogenetische analyse, om preventieve maatregelen voor te stellen om hun expansie te voorkomen c. Onderzoek transmissiepatronen onder migranten die in Spanje wonen, om aanbevelingen uit te werken die gericht zijn op het beperken/afbouwen van transmissiegebeurtenissen in deze groep. Methodologie: Volwassenen met bevestigde hiv-infectie en naïef voor antiretrovirale behandeling die naar centra in de CoRIS-cohort komen die deelnemen aan WP-resistentie en voor wie het wordt uitgevoerd, hetzij een sequencing voor de bepaling van RRT of een verzameling van een bloedmonster voor de biobank van het AIDS-onderzoeksnetwerk. Voor de fylogenetische analyse zullen de unieke verkregen sequenties worden uitgelijnd met behulp van ClustalW, dan wordt het nucleotide-substitutiemodel dat het beste past bij de fylogenetische analyse met behulp van FindModel gezocht, wordt de constructie van het samenvattende model van de fylogenetische boom met maximale waarschijnlijkheid gegenereerd in Beast v1.7.5. Voor de studie van migranten worden fyloethnische statistische methoden toegepast. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Obiettivo generale: Generare dati virologici sull'infezione da HIV rappresentativi del nostro paese al fine di conseguire gli obiettivi specifici; Obiettivi specifici: a. Valutare la trasmissione della resistenza primaria e i cambiamenti nell'epidemiologia molecolare dell'HIV-1 in Spagna nel periodo 2019-2021. b. Analizzare nuove diagnosi in Spagna per identificare in tempo reale cluster con un alto tasso di trasmissione mediante analisi filogenetica, proporre misure preventive per prevenire la loro espansione c. Investire modelli di trasmissione tra i migranti residenti in Spagna, elaborare raccomandazioni volte a limitare/diminuire gli eventi di trasmissione in questo gruppo. Metodologia: Adulti con infezione da HIV confermata e trattamento ingenuo a antiretrovirale che vengono a centri della coorte CoRIS partecipanti alla resistenza WP e per i quali viene eseguito, o un sequenziamento per la determinazione della RRT o una raccolta di un campione di sangue per la biobanca dalla rete di ricerca sull'AIDS. Per l'analisi filogenetica, le sequenze uniche ottenute saranno allineate utilizzando ClustalW, quindi si cerca il modello di sostituzione nucleotidica che meglio si adatta all'analisi filogenetica utilizzando FindModel, la costruzione del modello sommario dell'albero filogenetico con la massima probabilità sarà generata in Bestia v1.7.5. Per lo studio dei migranti si applicano metodi statistici filoetnici. (Italian)
16 January 2022
0 references
Γενικός στόχος: Η παραγωγή ιολογικών δεδομένων για τη λοίμωξη HIV, αντιπροσωπευτικών της χώρας μας, προκειμένου να επιτευχθούν οι συγκεκριμένοι στόχοι· Ειδικοί στόχοι: α. Αξιολογήστε τη μετάδοση της πρωτογενούς αντίστασης και τις αλλαγές στη μοριακή επιδημιολογία του HIV-1 στην Ισπανία κατά την περίοδο 2019-2021. β. Αναλύστε νέες διαγνώσεις στην Ισπανία για να εντοπίσετε σε πραγματικό χρόνο συστάδες με υψηλό ποσοστό μετάδοσης μέσω φυλογενετικής ανάλυσης, να προτείνετε προληπτικά μέτρα για την πρόληψη της επέκτασής τους. Μεθοδολογία: Ενήλικες με επιβεβαιωμένη λοίμωξη HIV και αφελής στην αντιρετροϊκή θεραπεία που έρχονται σε κέντρα της κοόρτης CoRIS που συμμετέχουν στην αντίσταση του WP και για τους οποίους εκτελείται, είτε μια αλληλουχία για τον προσδιορισμό της RRT είτε μια συλλογή δείγματος αίματος για τη βιοτράπεζα από το ερευνητικό δίκτυο του AIDS. Για τη φυλογενετική ανάλυση, οι μοναδικές ακολουθίες που λαμβάνονται θα ευθυγραμμιστούν με τη χρήση του ClustalW, στη συνέχεια το μοντέλο υποκατάστασης νουκλεοτιδίων που ταιριάζει καλύτερα στη φυλογενετική ανάλυση με χρήση του FindModel αναζητείται, η κατασκευή του συνοπτικού μοντέλου του φυλογενετικού δέντρου με τη μέγιστη πιθανότητα θα δημιουργηθεί στο Τέρας v1.7.5. Για τη μελέτη των μεταναστών εφαρμόζονται Φυλοεθνικές στατιστικές μέθοδοι. (Greek)
18 August 2022
0 references
Overordnet mål: At generere virologiske data om hiv-infektion, der er repræsentative for vores land, med henblik på at opfylde de specifikke mål Specifikke mål: a. Evaluer transmissionen af primær resistens og ændringer i den molekylære epidemiologi for hiv-1 i Spanien i perioden 2019-2021. b. Analyser nye diagnoser i Spanien for at identificere klynger i realtid med en høj overførselshastighed ved hjælp af fylogenetisk analyse, for at foreslå forebyggende foranstaltninger for at forhindre deres ekspansion c. Investere transmissionsmønstre blandt migranter, der bor i Spanien, for at udarbejde anbefalinger med henblik på at begrænse/reducere overførselshændelser i denne gruppe. Metode: Voksne med bekræftet hiv-infektion og naiv antiretroviral behandling, der kommer til centre i CORIS-kohorten, der deltager i WP-resistens, og for hvem den udføres, enten en sekventering til bestemmelse af RRT eller en indsamling af en blodprøve til biobanken fra AIDS-forskningsnetværket. For den phylogenetiske analyse vil de unikke sekvenser, der opnås, blive justeret ved hjælp af ClustalW, derefter søges den nukleotidsubstitutionsmodel, der bedst passer til den phylogenetiske analyse ved hjælp af FindModel, konstruktionen af resumémodellen af det phylogenetiske træ med maksimal sandsynlighed vil blive genereret i Beast v1.7.5. Der anvendes phyloetniske statistiske metoder til undersøgelse af migranter. (Danish)
18 August 2022
0 references
Yleistavoite: Tuotetaan virologisia tietoja hiv-tartunnasta, jotka edustavat maatamme erityistavoitteiden saavuttamiseksi; Erityistavoitteet: a. Arvioi primääriresistenssin leviämistä ja HIV-1:n molekyyliepidemiologian muutoksia Espanjassa vuosina 2019–2021. b. Analysoi uusia diagnooseja Espanjassa, jotta voidaan tunnistaa reaaliaikaisissa klustereissa, joilla on korkea tartuntanopeus fylogeneettisellä analyysillä, ehdottaa ennaltaehkäiseviä toimenpiteitä niiden laajenemisen estämiseksi c. Tutkia tartuntamalleja Espanjassa asuvien maahanmuuttajien keskuudessa, laatia suosituksia, joiden tarkoituksena on hillitä tai vähentää lähetystapahtumia tässä ryhmässä. Menetelmät: Aikuiset, joilla on vahvistettu HIV-infektio ja jotka eivät ole saaneet antiretroviraalista hoitoa ja jotka tulevat CoRIS-kohortin keskuksiin, jotka osallistuvat WP-resistenssiin ja joille se suoritetaan, joko sekvensointi RRT: n määrittämiseksi tai kokoelma verinäyte biopankkia varten AIDS-tutkimusverkostosta. Fylogeneettisessä analyysissä saadut ainutlaatuiset sekvenssit yhdenmukaistetaan ClustalW: n avulla, sitten etsitään nukleotidin korvausmallia, joka parhaiten sopii fylogeneettiseen analyysiin FindModelilla. Fylogeneettisen puun yhteenvetomallin rakentaminen suurimmalla todennäköisyydellä syntyy Beast v1.7.5: ssä. Maahanmuuttajien tutkimukseen sovelletaan fyloetnisia tilastollisia menetelmiä. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Għan ġenerali: Li tiġi ġġenerata data viroloġika dwar l-infezzjoni tal-HIV li tkun rappreżentattiva ta’ pajjiżna sabiex jintlaħqu l-għanijiet speċifiċi; Għanijiet Speċifiċi: a. Tevalwa t-trażmissjoni tar-reżistenza primarja u l-bidliet fl-epidemjoloġija molekulari tal-HIV-1 fi Spanja matul il-perjodu 2019–2021. b. Analiżi ta’ dijanjożijiet ġodda fi Spanja biex jiġu identifikati f’ħin reali raggruppamenti b’rata għolja ta’ trażmissjoni permezz ta’ analiżi filoġenetika, biex jiġu proposti miżuri preventivi biex tiġi evitata l-espansjoni tagħhom c. Tinvestiga t-tendenzi ta’ trażmissjoni fost il-migranti li jgħixu fi Spanja, biex jiġu elaborati rakkomandazzjonijiet immirati lejn it-trażżin/it-tnaqqis ta’ avvenimenti ta’ trażmissjoni f’dan il-grupp. Metodoloġija: Adulti b’infezzjoni tal-HIV ikkonfermata u inġenwi għal trattament antiretrovirali li jiġu f’ċentri fil-koorti tal-KtRIS li jipparteċipaw fir-reżistenza tal-Grupp ta’ Ħidma u li għalihom titwettaq, jew sekwenzjar għad-determinazzjoni tal-RTR jew ġabra ta’ kampjun tad-demm għall-bijobank min-netwerk ta’ riċerka dwar l-AIDS. Għall-analiżi filoġenetika, is-sekwenzi uniċi miksuba se jiġu allinjati bl-użu ta’ ClustalW, allura l-mudell ta’ sostituzzjoni tan-nukleotidi li jaqbel l-aħjar mal-analiżi filoġenetika bl-użu ta’ FindModel huwa mfittex, il-kostruzzjoni tal-mudell sommarju tas-siġra filoġenetika bi probabbiltà massima se tiġi ġġenerata fil-Beast v1.7.5. Metodi statistiċi Fitoetniċi għandhom jiġu applikati għall-istudju tal-migranti. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Vispārīgais mērķis: Sagatavot virusoloģiskus datus par HIV infekciju, kas ir reprezentatīvi mūsu valstij, lai sasniegtu konkrētos mērķus; Konkrētie mērķi: a. Novērtēt primārās rezistences pārraidi un izmaiņas HIV-1 molekulārajā epidemioloģijā Spānijā laikposmā no 2019. līdz 2021. gadam. b. Analizējiet jaunas diagnozes Spānijā, lai reāllaikā identificētu klasterus ar augstu transmisijas līmeni ar filogēnisku analīzi, ierosinātu preventīvus pasākumus, lai novērstu to izplešanos c. Izpētīt transmisijas modeļus Spānijā dzīvojošo migrantu vidū, lai izstrādātu ieteikumus, kuru mērķis ir ierobežot/samazināt transmisijas notikumus šajā grupā. Metodika: Pieaugušie, kuriem ir apstiprināta HIV infekcija un kuri nav saņēmuši antiretrovīrusu terapiju un kuri ierodas CoRIS kohortas centros, kuri piedalās WP rezistences ārstēšanā un kuriem tā tiek veikta, vai nu RRT noteikšanai, vai asins parauga kolekcijai biobankai no AIDS pētniecības tīkla. Filogēniskajai analīzei unikālās sekvences tiks izlīdzinātas, izmantojot ClustalW, pēc tam tiek meklēts nukleotīdu aizvietošanas modelis, kas vislabāk atbilst filogēniskajai analīzei, izmantojot FindModel, filogēniskā koka kopsavilkuma modeļa izveide ar maksimālo varbūtību tiks ģenerēta Beast v1.7.5. Migrantu izpētei izmanto filoetniskās statistikas metodes. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Všeobecný cieľ: Generovať virologické údaje o infekcii HIV, ktoré sú reprezentatívne pre našu krajinu, s cieľom splniť špecifické ciele; Špecifické ciele: a. Hodnotiť prenos primárnej rezistencie a zmeny v molekulárnej epidemiológii HIV-1 v Španielsku v období 2019 – 2021. b. Analyzujte nové diagnózy v Španielsku s cieľom identifikovať v reálnom čase klastre s vysokou mierou prenosu fylogenetickou analýzou, navrhnúť preventívne opatrenia na zabránenie ich expanzii c. Investigate modely prenosu medzi migrantmi žijúcimi v Španielsku, vypracovať odporúčania zamerané na obmedzenie/zníženie prenosových udalostí v tejto skupine. Metodika: Dospelí s potvrdenou infekciou HIV a bez antiretrovírusovej liečby, ktorí prichádzajú do centier v kohorte CoRIS, ktorí sa zúčastňujú na WP rezistencii a u ktorých sa vykonáva, buď sekvenovanie na stanovenie RRT alebo odber vzorky krvi pre biobanku z výskumnej siete AIDS. Pre fylogénnu analýzu sa získané jedinečné sekvencie zarovnajú pomocou ClustalW, potom sa vyhľadá substitučný nukleotidový model, ktorý najlepšie vyhovuje fylogenetickej analýze pomocou FindModel, konštrukcia súhrnného modelu fytogenetického stromu s maximálnou pravdepodobnosťou bude generovaná v Beast v1.7.5. Na štúdium migrantov sa použijú fytoetnické štatistické metódy. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Cuspóir Ginearálta: Sonraí víreolaíocha a ghiniúint maidir le hionfhabhtú VEID atá ionadaíoch dár dtír d’fhonn na cuspóirí sonracha a bhaint amach; Cuspóirí Sonracha: a. Meastóireacht a dhéanamh ar tharchur na príomhfhriotaíochta agus na n-athruithe ar eipidéimeolaíocht mhóilíneach VEID-1 sa Spáinn le linn na tréimhse 2019-2021. b. Anailís a dhéanamh ar dhiagnóisí nua sa Spáinn chun braislí fíor-ama a shainaithint i bhfíor-am a bhfuil ráta ard tarchuir acu trí anailís phylogenetic, bearta coisctheacha a mholadh chun cosc a chur ar a leathnú c. Patrúin tarchuir i measc imirceach atá ina gcónaí sa Spáinn a imscrúdú, moltaí a mhionsaothrú atá dírithe ar imeachtaí tarchuir sa ghrúpa seo a shrianadh/a laghdú. Modheolaíocht: Daoine fásta a bhfuil ionfhabhtú VEID deimhnithe agus naive do chóireáil frith-aisvíreasach a thagann chuig ionaid sa chohórt CORIS ag glacadh páirte i bhfrithsheasmhacht WP agus dá ndéantar é, seicheamhú chun RRT a chinneadh nó bailiúchán de shampla fola don bhithbhainc ón líonra taighde SEIF. Maidir leis an anailís phylogenetic, déanfar na seichimh uathúla a fhaightear a ailíniú ag baint úsáide as ClustalW, ansin déanfar an tsamhail ionadaíochta núicléitide is fearr a oireann don anailís phylogenetic ag baint úsáide as FindModel a lorg, déanfar samhail achomair an chrainn phylogenetic a thógáil le dóchúlacht uasta i Beast v1.7.5. Cuirfear modhanna staitistiúla feileatacha i bhfeidhm chun staidéar a dhéanamh ar imircigh. (Irish)
18 August 2022
0 references
Obecný cíl: Získávat virologické údaje o infekci HIV, které jsou reprezentativní pro naši zemi, aby byly splněny specifické cíle; Specifické cíle: a. Hodnotit přenos primární rezistence a změny molekulární epidemiologie HIV-1 ve Španělsku v období 2019–2021. b. Analyzovat nové diagnózy ve Španělsku k identifikaci klastrů v reálném čase s vysokou rychlostí přenosu fylogenetické analýzy, navrhnout preventivní opatření, aby se zabránilo jejich expanzi c. Vyšetřit přenosové vzorce mezi migranty žijícími ve Španělsku, vypracovat doporučení zaměřená na omezení/snížení přenosových událostí v této skupině. Metodika: Dospělí s potvrzenou infekcí HIV a naivní antiretrovirovou léčbou, kteří přicházejí do center v kohortě CoRIS, kteří se účastní rezistence vůči WP a u nichž je prováděna, buď sekvenování pro stanovení RRT nebo odběr krevního vzorku pro biobanku z výzkumné sítě AIDS. Pro fylogenetickou analýzu budou získané jedinečné sekvence sladěny pomocí ClustalW, pak se hledá substituční model nukleotidu, který nejlépe vyhovuje fylogenetické analýze pomocí FindModel, konstrukce souhrnného modelu fylogenetického stromu s maximální pravděpodobností bude generována v Beast v1.7.5. Pro studium migrantů se použijí fyloetnické statistické metody. (Czech)
18 August 2022
0 references
Objetivo geral: Gerar dados virológicos sobre a infeção pelo HIV representativos de nosso país, a fim de atender aos objetivos específicos; Objetivos específicos: a. Avaliar a transmissão de resistência primária e mudanças na epidemiologia molecular do HIV-1 na Espanha durante o período 2019-2021. b. Analisar novos diagnósticos na Espanha para identificar em tempo real clusters com alta taxa de transmissão por análise filogenética, para propor medidas preventivas para evitar sua expansão c. Investigar padrões de transmissão entre migrantes que vivem na Espanha, para elaborar recomendações visando reduzir/diminuir eventos de transmissão neste grupo. Metodologia: Adultos com infeção confirmada pelo HIV e ingênuos ao tratamento antirretroviral que vêm a centros da coorte CoRIS que participam da resistência do PT e para quem é realizado, seja um sequenciamento para a determinação da TRS ou uma coleta de uma amostra de sangue para o biobanco da rede de pesquisa da SIDA. Para a análise filogenética, as sequências únicas obtidas serão alinhadas com ClustalW, então o modelo de substituição de nucleotídeos que melhor se encaixa na análise filogenética usando FindModel é procurado, a construção do modelo sumário da árvore filogenética com máxima probabilidade será gerada em Besta v1.7.5. Devem ser aplicados métodos estatísticos filoétnicos para o estudo dos migrantes. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Üldeesmärk: Luua viroloogilised andmed HIV-nakkuse kohta, mis esindavad meie riiki, et saavutada konkreetsed eesmärgid; Konkreetsed eesmärgid: a. Hinnake esmase resistentsuse edasikandumist ja muutusi HIV-1 molekulaarepidemioloogias Hispaanias ajavahemikul 2019–2021. b. Analüüsige uusi diagnoosimisi Hispaanias, et tuvastada reaalajas klastreid, millel on kõrge ülekandekiirus fülogeneetilise analüüsi abil, teha ettepanekuid ennetusmeetmete kohta, et vältida nende laienemist c. Uurige Hispaanias elavate sisserändajate ülekandemustreid, et töötada välja soovitused, mille eesmärk on piirata/vähendada ülekandesündmusi selles rühmas. Metoodika: Kinnitatud HIV-infektsiooniga ja retroviirusevastast ravi mittesaanud täiskasvanud, kes tulevad RIS-i kohordi keskustesse, osalevad WP-resistentsuses ja kellele seda tehakse, kas sekveneerimine RRT määramiseks või vereproovi kogumine biopanga jaoks AIDSi uurimisvõrgustikust. Fülogeneetilise analüüsi jaoks ühtlustatakse saadud unikaalsed järjestused ClustalW-ga, seejärel otsitakse nukleotiidi asendusmudelit, mis sobib kõige paremini fülogeneetilise analüüsiga, otsitakse fülogeneetilise puu koondmudelit maksimaalse tõenäosusega Beast v1.7.5. Sisserändajate uurimiseks kasutatakse Phyloetnilisi statistilisi meetodeid. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Általános célkitűzés: Az országunkra nézve reprezentatív HIV-fertőzésre vonatkozó virológiai adatok gyűjtése a konkrét célkitűzések elérése érdekében; Egyedi célkitűzések: a. Értékelje az elsődleges rezisztencia átvitelét és a HIV-1 molekuláris epidemiológiájának változásait Spanyolországban a 2019–2021 közötti időszakban. b. elemezze az új diagnózisokat Spanyolországban, hogy azonosítsa a valós idejű klasztereket a magas átviteli sebességgel filogenetikai elemzéssel, hogy megelőző intézkedéseket javasoljon a terjeszkedés megakadályozására c. A Spanyolországban élő migránsok körében az átviteli minták vizsgálata, hogy ajánlásokat dolgozzon ki e csoport átviteli eseményeinek megfékezésére/csökkentésére. Módszertan: Igazolt HIV-fertőzésben szenvedő és antiretrovirális kezelésre még nem reagáló felnőttek, akik a CoRIS kohorsz központjába érkeznek, akik részt vesznek a WP-rezisztenciában, és akik esetében ezt elvégzik, vagy az RRT meghatározására szolgáló szekvenálás, vagy az AIDS kutatóhálózat biobankjának vérmintája. A filogenetikai elemzéshez a kapott egyedi szekvenciákat a ClustalW segítségével igazítják össze, majd a nukleotid szubsztitúciós modellt, amely a FindModel segítségével a legjobban illeszkedik a filogenetikai elemzéshez, a filogenetikai fa összefoglaló modelljének maximális valószínűségű felépítését a Beast v1.7.5. A migránsok tanulmányozásához filoetnikai statisztikai módszereket kell alkalmazni. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Обща цел: Да се генерират вирусологични данни за ХИВ инфекцията, които са представителни за нашата страна, за да се постигнат конкретните цели; Специфични цели: а. Оценка на предаването на първична резистентност и промени в молекулярната епидемиология на ХИВ-1 в Испания през периода 2019—2021 г. б. Анализиране на нови диагнози в Испания, за да се идентифицират в реално време клъстери с висока степен на предаване чрез филогенетичен анализ, да се предложат превантивни мерки за предотвратяване на тяхното разширяване в. Разследване на моделите на предаване сред мигрантите, живеещи в Испания, да се разработят препоръки, насочени към ограничаване/намаляване на трансмисионните събития в тази група. Методология: Възрастни с потвърдена HIV инфекция и наивно на антиретровирусно лечение, които идват в центрове в кохортата на КРИС, участващи в резистентността на WP и за които се извършва, или секвениране за определяне на RRT или вземане на кръвна проба за биобанката от мрежата за изследване на СПИН. За филогенетичния анализ получените уникални последователности ще бъдат подравнени с помощта на ClustalW, след което се търси моделът на заместване на нуклеотидите, който най-добре отговаря на филогенетичния анализ, като се използва FindModel, изграждането на обобщения модел на филогенетичното дърво с максимална вероятност ще бъде генерирано в Beast v1.7.5. За изследването на мигрантите се прилагат филоетнически статистически методи. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Bendrasis tikslas: Rinkti virusologinius duomenis apie ŽIV infekciją, kurie būtų tipiški mūsų šaliai, kad būtų pasiekti konkretūs tikslai; Konkretūs tikslai: a. Įvertinti pirminio atsparumo perdavimą ir ŽIV-1 molekulinės epidemiologijos pokyčius Ispanijoje per laikotarpį 2019–2021. b. Analizuokite naujas diagnozes Ispanijoje, kad realiuoju laiku nustatytų klasterius, turinčius didelį perdavimo greitį filogenetine analize, pasiūlyti prevencines priemones, skirtas užkirsti kelią jų plėtrai c. Ištirti Ispanijoje gyvenančių migrantų perdavimo modelius, parengti rekomendacijas, kuriomis siekiama pažaboti/sumažinti perdavimo įvykius šioje grupėje. Metodika: Suaugusieji, sergantys patvirtinta ŽIV infekcija ir negydomi antiretrovirusiniu gydymu, kurie atvyksta į CoRIS kohortos centrus, dalyvaujančius atsparumo WP srityje, ir kuriems ji atliekama, arba RRT nustatymo seką, arba kraujo mėginio, skirto biobankui iš AIDS mokslinių tyrimų tinklo, rinkinį. Filogenetinei analizei, gautos unikalios sekos bus suderintos naudojant ClustalW, tada nukleotidų pakeitimo modelis, kuris geriausiai tinka filogenetinei analizei naudojant FindModel, ieškoma filogenetinio medžio santraukos modelio su didžiausia tikimybe konstrukcija Beast v1.7.5. Migrantų studijoms taikomi filoetniniai statistiniai metodai. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Opći cilj: Generirati virološke podatke o infekciji HIV-om koji su reprezentativni za našu zemlju kako bi se ispunili posebni ciljevi; Posebni ciljevi: a. Procijenite prijenos primarnog otpora i promjene u molekularnoj epidemiologiji HIV-1 u Španjolskoj u razdoblju 2019 – 2021. b. Analizirajte nove dijagnoze u Španjolskoj kako biste u stvarnom vremenu identificirali klastere s visokom stopom prijenosa filogenetskom analizom, predložili preventivne mjere kako bi se spriječilo njihovo širenje c. Istražite obrasce prijenosa među migrantima koji žive u Španjolskoj, kako biste razradili preporuke usmjerene na suzbijanje/smanjenje prijenosa događaja u ovoj skupini. Metodologija: Odrasli s potvrđenom infekcijom HIV-om i naivni na antiretrovirusno liječenje koji dolaze u centre u ORIS-ovoj kohorti koja sudjeluje u otporu WP-a i za koje se provodi, bilo da je riječ o sekvenciranju za određivanje RRT-a ili skupu uzorka krvi za biobanku iz istraživačke mreže AIDS-a. Za filogenetsku analizu, jedinstvene dobivene sekvence poravnat će se pomoću ClustalW-a, a zatim se traži model zamjene nukleotida koji najbolje odgovara filogenetskoj analizi pomoću FindModel-a, izgradnja sažetog modela filogenetskog stabla s maksimalnom vjerojatnošću generira se u Zvijeri v1.7.5. Za proučavanje migranata primjenjuju se fitosanitarne statističke metode. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Allmänt mål: Att ta fram virologiska uppgifter om hiv-infektioner som är representativa för vårt land för att uppnå de särskilda målen. Särskilda mål: a. Utvärdera överföringen av primär resistens och förändringar i den molekylära epidemiologin av HIV-1 i Spanien under perioden 2019–2021. b. Analysera nya diagnoser i Spanien för att i realtid identifiera kluster med en hög överföringshastighet genom fylogenetisk analys, för att föreslå förebyggande åtgärder för att förhindra deras expansion c. Undersök överföringsmönster bland migranter som bor i Spanien, för att utarbeta rekommendationer som syftar till att begränsa/minska överföringshändelser i denna grupp. Metod: Vuxna med bekräftad hiv-infektion och naiv till antiretroviral behandling som kommer till centrum i ReK:s kohort som deltar i WP-resistens och för vilka den utförs, antingen en ordningsföljd för bestämning av RRT eller en insamling av ett blodprov för biobanken från AIDS-forskningsnätverket. För den fylogenetiska analysen kommer de unika sekvenser som erhålls att anpassas med ClustalW, sedan den nukleotidsubstitutionsmodell som bäst passar den fylogenetiska analysen med FindModel söks, konstruktionen av den sammanfattande modellen av det fylogenetiska trädet med maximal sannolikhet kommer att genereras i Beast v1.7.5. Fyletniska statistiska metoder ska användas för studier av migranter. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Obiectiv general: Generarea de date virologice privind infecția cu HIV care sunt reprezentative pentru țara noastră în vederea îndeplinirii obiectivelor specifice; Obiective specifice: a. Evaluați transmiterea rezistenței primare și modificările epidemiologiei moleculare a HIV-1 în Spania în perioada 2019-2021. b. Analizați noi diagnostice în Spania pentru a identifica în grupuri în timp real cu o rată ridicată de transmitere prin analiză filogenetică, pentru a propune măsuri preventive pentru a preveni extinderea acestora c. modele de transmitere a migranților care trăiesc în Spania, pentru a elabora recomandări menite să reducă/scăderea evenimentelor de transmitere în acest grup. Metodologie: Adulții cu infecție HIV confirmată și naivi la tratament antiretroviral care vin în centrele din cohorta CoRIS care participă la rezistența la WP și pentru care se efectuează, fie o secvențiere pentru determinarea RRT, fie o colectare a unei probe de sânge pentru banca biologică din rețeaua de cercetare SIDA. Pentru analiza filogenetică, secvențele unice obținute vor fi aliniate folosind ClustalW, apoi modelul de substituție nucleotidic care se potrivește cel mai bine analizei filogenetice folosind FindModel este căutat, construcția modelului sintetic al arborelui filogenetic cu o probabilitate maximă va fi generată în Bestia v1.7.5. Pentru studiul migranților se aplică metode statistice fenoetnice. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Splošni cilj: Zbiranje viroloških podatkov o okužbi z virusom HIV, ki so reprezentativni za našo državo, da bi izpolnili posebne cilje; Posebni cilji: a. Ocenite prenos primarne odpornosti in sprememb v molekularni epidemiologiji HIV-1 v Španiji v obdobju 2019–2021. b. Analizirajte nove diagnoze v Španiji, da bi v realnem času identificirali grozde z visoko stopnjo prenosa s filogenetsko analizo, da bi predlagali preventivne ukrepe za preprečevanje njihove širitve c. Raziskujte vzorce prenosa med migranti, ki živijo v Španiji, da bi pripravili priporočila za omejevanje/zmanjšanje prenosnih dogodkov v tej skupini. Metodologija: Odrasli s potrjeno okužbo s HIV in naivnimi za protiretrovirusno zdravljenje, ki pridejo v središče kohorte CoRIS, ki sodelujejo v odpornosti WP in za katere se izvaja, bodisi zaporedje za določanje RRT bodisi zbiranje vzorca krvi za biobanko iz raziskovalne mreže za AIDS. Za filogenetsko analizo bodo dobljena edinstvena zaporedja poravnana z uporabo ClustalW, nato pa se bo poiskal model substitucije nukleotida, ki najbolj ustreza filogenetski analizi z uporabo FindModel, konstrukcija zbirnega modela filogenetičnega drevesa z največjo verjetnostjo pa bo ustvarjena pri zveri v1.7.5. Za preučevanje migrantov se uporabljajo fitoetnične statistične metode. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Cel ogólny: Generowanie danych wirusologicznych na temat zakażenia HIV, które są reprezentatywne dla naszego kraju, aby osiągnąć konkretne cele; Cele szczegółowe: a. Oceń przekazywanie pierwotnej oporności i zmiany w epidemiologii molekularnej HIV-1 w Hiszpanii w okresie 2019-2021. b. Analizuj nowe diagnozy w Hiszpanii w celu identyfikacji w czasie rzeczywistym klastrów o wysokim wskaźniku przenoszenia za pomocą analizy filogenetycznej, aby zaproponować środki zapobiegawcze, aby zapobiec ich ekspansji c. Badanie wzorców transmisji wśród migrantów mieszkających w Hiszpanii, opracowanie zaleceń mających na celu ograniczenie/zmniejszenie zdarzeń przenoszenia w tej grupie. Metodyka: Dorośli z potwierdzonym zakażeniem wirusem HIV i naiwni na leczenie przeciwretrowirusowe, którzy przybywają do ośrodków w kohorcie CoRIS uczestniczącej w oporności na WP i dla których jest ona wykonywana, albo sekwencjonowanie w celu oznaczenia RRT, albo pobranie próbki krwi do biobanku z sieci badawczej ds. AIDS. Do analizy filogenetycznej uzyskane unikalne sekwencje zostaną wyrównane za pomocą ClustalW, a następnie model substytucji nukleotydów, który najlepiej pasuje do analizy filogenetycznej za pomocą FindModel, zostanie wygenerowany w Beast v1.7.5. Do badań nad migrantami stosuje się metody statystyczne filoetniczne. (Polish)
18 August 2022
0 references
Granada
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI18_00819
0 references