Building up modern infrastructure to characterise new synthetic and natural anti-tumour and antimicrobial agents and their target delivery conjugates (Q3958270)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3958270 in Hungary
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Building up modern infrastructure to characterise new synthetic and natural anti-tumour and antimicrobial agents and their target delivery conjugates |
Project Q3958270 in Hungary |
Statements
152,739,288.75 forint
0 references
203,652,385.0 forint
0 references
75.0 percent
0 references
1 July 2017
0 references
28 September 2020
0 references
EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNYEGYETEM
0 references
47°29'30.62"N, 18°58'44.15"E
0 references
A) A megvalósítani kívánt feladatok bemutatása: A projekt célja olyan műszeregyüttes beszerzése és működtetése, amely egyaránt alkalmas új természetes (növény, gomba és bakteriális) eredetű izolált, illetve kémiai szintézissel előállított szerves vegyületek, konjugátumaik (célbajuttató származékok, kolloidális nanorészecskék) valamint metabolitjaik azonosítására/jellemzésére, továbbá a vegyületek hatására a sejtekben bekövetkező fehérje szintű változások (proteomika) kutatására. Mind a tumoros, mind az újra növekvő számú mikrobiális eredetű fertőző betegségek gyógyításában jelentős áttörést hozhat az ún. irányított terápia, amely növeli a hatóanyagok szelektivitását és csökkenti azok mellékhatását. Ezen új gyógyszerkutatási irány közös jellemzője olyan vegyületek létrehozása, amelyek képesek a hatóanyagot célzottan az érintett tumor, illetve fertőzött sejtbe juttatni. A kialakítandó infrastruktúra az új természetes eredetű, biológiailag aktív vegyületek izolálását, azonosítását és a szerves kémiai szintézissel előállított új vegyületek (peptid- és/vagy nanorendszerekkel kialakított konjugátumok) jellemezését kívánja – a legmagasabb nemzetközi elvárásoknak megfelelően – szolgálni. A gyógyászatban jelenleg használt biológiailag aktív hatóanyagok döntő többsége növények, gombák és prokarióta mikroorganizmusok másodlagos anyagcsereterméke, vagy ezekhez köthető félszintetikus, szintetikus vegyület. Kutatásaink egyik fő célja új, eddig ismeretlen növényi, gomba- vagy mikroorganizmus eredetű hatóanyagok és metabolitok azonosítása és jellemzése. Ezen infrastrukturális fejlesztéssel szélesíteni kívánjuk a további gyógy- és mérgező növény hatóanyagok felfedezésének lehetőségét és a vegyületek jellemzési profilját. A kutatások során nem csupán egy adott organizmus eredetű hatóanyagot, hanem a nemzetközi gyakorlatban is egyre alapvetőbb „metabolit-ujjlenyomatot” is meghatározzuk. Fontosnak tartjuk megjegyezni, hogy egyes hipotézisek szerint a legtöbb eddig ismeretlen hatóanyag ezzel a stratégiával azonosítható és jellemezhető eredményesen. Hasonló okokból ígéretes a szélsőséges körülmények között élő mikrobák anyagcsere termékeinek metabolikus jellemzése is (szakmai felelős: Biológiai Intézet, Növényszervezettani Tanszék, Mikrobiológiai Tanszék). A célzott terápiára alkalmas biokonjugátumok többsége három komponensből áll; hatóanyag, irányító molekula és az ezeket összekapcsoló egység. Kutatásunkban arra teszünk kísérletet, hogy olyan vegyülettárakat hozzunk létre, amelyekben a hatóanyag (természetes eredetű vagy szintetizált) és irányító peptid komponensek a kifejlesztett bifunkciós linkerek segítségével sokféle kombinációban kapcsolhatók egymáshoz, növelve a célzott terápiára alkalmas konjugátumok választékát, ami a személyre szabott gyógyítás alapfeltétele is lehet. Az előállított komponensek és a belőlük készített konjugátumok azonosítása és jellemzése mellett a biológiai rendszerekben mért stabilitásuk, metabolizmusuk és a sejtekben általuk kiváltott fehérjeszintű változások méréséhez is elengedhetetlen az alábbiakban bemutatott nagyáteresztő képességű, nagy felbontóképességű elemző platform (szakmai felelős: Kémiai Intézet, MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport). A fenti két kutatási terület közösen támaszkodik az újonnan beszerzendő „cutting edge” UHPLC-MS/MS készülékre, amely nem csak egyszerű rutin analízisekre alkalmas, hanem jelentős kutatási potenciált is hordoz. A minták komponenseinek minőségi és mennyiségi analízise a beszerzésre tervezett folyadékkromatográfiával (HPLC) kapcsolt, nagypontosságú tömegmeghatározást lehetővé tevő, kvadrupol és orbitrap tömegdetektálással rendelkező rendszer (HPLC-MS/MS) alkalmazásával valósítható meg. A vizsgálandó összetevők mennyisége akár több nagyságrendnyi eltérést is mutathat. A rendszer alkalmas ultrahatékony folyadékkromatográfiás (UHPLC) vizsgálatok kivitelezésére, jelentősen lerövidítve a mérési időt, ezzel növelve a feldolgozható minták számát és csökkentve az oldószer felhasználást. Az egymástól elválasztott anyagok azonosítását és mennyiségi meghatározását diódasoros detektor (190-800 nm), a nagyfelbontású tömegspekrometriás detektálást a hibrid kvadrupol-orbitrap tömegspektrométer biztosítja. A széles tömegtartományban (m/z 50-2000), nagy pontossággal (5 ppm alatt) működő tömegspektrométer szerkezetazonosítást és szennyezés profil azonosítást is lehetővé tesz egyedülálló érzékenység (attogram) biztosításával. MS/MS felvételre nagyenergiájú ütköztetést biztosító HCD ütközési cella ad lehetőséget, amellyel könyvtárkeresésre alkalmas, reprodukálható spektrumfelvétel készítés és még biztosabb komponensazonosítás valósítható meg. A cserélhető ionforrások (API ionforrás ház fűtött, kettős deszolvatációs rendszerrel rendelkező electrospray ionizációs - H-ESI II - és APCI ionforrásokkal) a legkülönbözőbb szerkezetű molekulák vizsgálatát teszik lehetővé. A felsorolt főbb jellemzők alkalmassá teszik a műszert nagyszámú minta gyors, „high throughput” elemzésére. A k (Hungarian)
0 references
A) Presentation of the tasks to be implemented: The aim of the project is to acquire and operate a set of instruments that are suitable for identifying/characterising new natural (plant, fungal and bacterial) organic compounds and organic compounds produced by chemical synthesis, their conjugates (directive derivatives, colloidal nanoparticles) and their metabolites, as well as for researching protein-level changes (proteomics) in cells due to the influence of compounds. In the treatment of both tumour and re-infectious diseases of microbial origin, a major breakthrough can be made by so-called directed therapy, which increases the selectivity of active substances and reduces their side effects. The common feature of this new direction of pharmaceutical research is the creation of compounds that are able to target the active substance into the affected tumour or infected cell. The infrastructure to be developed aims at the isolation, identification and characterisation of new naturally produced biologically active compounds (conjugates with peptide and/or nanosystems) produced by organic chemical synthesis, in line with the highest international standards. The vast majority of biologically active substances currently used in medicine are secondary metabolites of plants, fungi and procaryote microorganisms or are related semi-synthetic synthetic compounds. One of the main objectives of our research is to identify and characterise new active substances and metabolites of plant, fungal or micro-organism origin. With this infrastructural development, we aim to broaden the possibility of discovering additional medicinal and toxic plant active substances and the characterisation profile of the compounds. In the course of research, we define not only an active substance of an organism, but also an increasingly fundamental “metabolite fingerprint” in international practice. It is important to note that, according to some hypotheses, most of the previously unknown active substances can be effectively identified and characterised by this strategy. For similar reasons, metabolic characterisation of metabolic products of microbes living in extreme conditions is promising (professional responsible: Institute of Biology, Department of Plant Organology, Department of Microbiology). The majority of bioconjugates suitable for targeted therapy consist of three components; active substance, controlling molecule and interconnecting unit. In our research we attempt to create compound stores in which the active substance (natural or synthesised) and controlling peptide components can be linked together in a wide range of combinations with the developed bifunction linkers, increasing the range of conjugates suitable for targeted therapy, which can also be a prerequisite for personalised healing. In addition to the identification and characterisation of the components produced and the conjugates produced from them, their stability, metabolism and cell-induced protein-level changes in biological systems are also essential for the measurement of their highly permeable, highly disruptive analytical platform (professional operator: Institute of chemistry, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). The above two research areas jointly rely on the newly procured “cutting edge” UHPLC-MS/MS device, which is not only suitable for simple routine analyses, but also has significant research potential. Qualitative and quantitative analysis of the components of the samples may be carried out using a system (HPLC-MS/MS) associated with liquid chromatography (HPLC) designed for procurement, allowing high-accuracy mass determination, with quadrupol and orbitrap mass detection. The quantity of components to be tested may vary by order of magnitude. The system is suitable for performing ultra-efficient liquid chromatography (UHPLC) tests, significantly shortening the measurement time, thereby increasing the number of samples that can be processed and reducing solvent use. The identification and quantification of separated substances is provided by a diode array detector (190-800 nm), high-resolution mass specrometry detection by the hybrid quadrupol-orbitrap mass spectrometer. Operating over a wide mass range (m/z 50-2000) with high precision (less than 5 ppm) mass spectrometers also allow for structural identification and pollution profile identification by providing a unique sensitivity (attogram). Ms/MS recording is provided by a high-energy HCD impact cell, which allows reproducible spectrum recording and more secure component identification for library search. Interchangeable ion sources (API ion source housing with heated electrospray ionisation — H-ESI II and APCI ionisation sources with dual distillation system) allow the examination of molecules of a wide variety of structures. The main characteristics listed make the instrument suitable for rapid “high throughput” analysis of a large number of samples. A (English)
9 February 2022
0.7449494651357501
0 references
A) Présentation des tâches à exécuter: L’objectif du projet est d’acquérir et d’exploiter un ensemble d’instruments aptes à identifier/caractériser de nouveaux composés organiques naturels (plantes, fongiques et bactériennes) et des composés organiques produits par synthèse chimique, leurs conjugués (dérivés de directive, nanoparticules colloïdales) et leurs métabolites, ainsi que la recherche sur les changements au niveau des protéines (protéomiques) dans les cellules dues à l’influence des composés. Dans le traitement des maladies tumorales et réinfectieuses d’origine microbienne, une percée majeure peut être réalisée par une thérapie dite dirigée, qui augmente la sélectivité des substances actives et réduit leurs effets secondaires. La caractéristique commune de cette nouvelle orientation de la recherche pharmaceutique est la création de composés capables de cibler la substance active dans la tumeur touchée ou la cellule infectée. L’infrastructure à développer vise l’isolement, l’identification et la caractérisation de nouveaux composés biologiquement actifs (conjugués avec des peptides et/ou des nanosystèmes) produits par synthèse chimique organique, conformément aux normes internationales les plus élevées. La grande majorité des substances biologiquement actives actuellement utilisées en médecine sont des métabolites secondaires des plantes, des champignons et des micro-organismes procaryotes ou sont des composés synthétiques semi-synthétiques apparentés. L’un des principaux objectifs de notre recherche est d’identifier et de caractériser de nouvelles substances actives et métabolites d’origine végétale, fongique ou micro-organisme. Avec ce développement des infrastructures, nous visons à élargir la possibilité de découvrir d’autres substances actives médicinales et toxiques ainsi que le profil de caractérisation des composés. Au cours de la recherche, nous définissons non seulement une substance active d’un organisme, mais aussi une «empreinte digitale de métabolite» de plus en plus fondamentale dans la pratique internationale. Il est important de noter que, selon certaines hypothèses, la plupart des substances actives précédemment inconnues peuvent être identifiées et caractérisées efficacement par cette stratégie. Pour des raisons similaires, la caractérisation métabolique des produits métaboliques de microbes vivant dans des conditions extrêmes est prometteuse (professionnel responsable: Institut de biologie, Département d’organologie végétale, Département de microbiologie). La majorité des bioconjugués adaptés à une thérapie ciblée se composent de trois composants; substance active, molécule de contrôle et unité d’interconnexion. Dans nos recherches, nous tentons de créer des réserves de composés dans lesquelles la substance active (naturelle ou synthétisée) et les composants peptides de contrôle peuvent être reliés entre eux dans un large éventail de combinaisons avec les liens bifonctionnels développés, augmentant la gamme de conjugués adaptés à une thérapie ciblée, ce qui peut également être une condition préalable à une guérison personnalisée. En plus de l’identification et de la caractérisation des composants produits et des conjugués qui en sont issus, leur stabilité, leur métabolisme et les changements au niveau des protéines induits par les cellules dans les systèmes biologiques sont également essentiels pour la mesure de leur plate-forme analytique hautement perméable et très perturbatrice (opérateur professionnel: Institut de chimie, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Les deux domaines de recherche ci-dessus s’appuient conjointement sur l’appareil UHPLC-MS/MS nouvellement acquis, qui est non seulement adapté à de simples analyses de routine, mais qui présente également un potentiel de recherche important. L’analyse qualitative et quantitative des composants des échantillons peut être effectuée à l’aide d’un système (HPLC-MS/MS) associé à la chromatographie liquide (HPLC) conçu pour l’acquisition, permettant une détermination de masse de haute précision, avec une détection de la masse quadrupol et orbitrapique. La quantité de composants à tester peut varier selon l’ordre de grandeur. Le système est adapté pour effectuer des essais de chromatographie liquide ultra-efficace (UHPLC), ce qui réduit considérablement le temps de mesure, augmentant ainsi le nombre d’échantillons pouvant être traités et réduisant l’utilisation des solvants. L’identification et la quantification des substances séparées sont assurées par un détecteur à diodes (190-800 nm), par spectrométrie de masse à haute résolution par le spectromètre de masse hybride quadrupol-orbitrap. Fonctionnant sur une large plage de masse (m/z 50-2000) avec une grande précision (moins de 5 ppm) les spectromètres de masse permettent également l’identification structurelle et l’identification du profil de pollution en fournissant une sensibilité unique (attogram). L’enregistrement MS/MS est assuré par une cellule d’impact HCD... (French)
10 February 2022
0 references
A) Täidetavate ülesannete tutvustamine: Projekti eesmärk on omandada ja käitada vahendeid, mis sobivad uute looduslike (taimede, seente ja bakterite) orgaaniliste ühendite ja keemilise sünteesi teel toodetud orgaaniliste ühendite, nende konjugaatide (direktiividerivaadid, kolloidsed nanoosakesed) ja nende metaboliitide kindlakstegemiseks/iseloomustamiseks ning ühendite mõjust tingitud rakkude valgutaseme muutuste (proteoomika) uurimiseks. Nii kasvaja kui ka taasnakkuslike mikroobsete haiguste ravis võib suure läbimurde teha nn suunatud raviga, mis suurendab toimeainete selektiivsust ja vähendab nende kõrvalnähte. Ravimiuuringute uue suuna ühine tunnusjoon on selliste ühendite loomine, mis suudavad suunata toimeaine mõjutatud kasvajasse või nakatunud rakusse. Arendatava infrastruktuuri eesmärk on orgaanilise keemilise sünteesi teel toodetud uute looduslikult toodetud bioloogiliselt aktiivsete ühendite (peptiidi ja/või nanosüsteemidega konjugaadid) isoleerimine, identifitseerimine ja iseloomustamine kooskõlas kõrgeimate rahvusvaheliste standarditega. Valdav osa praegu meditsiinis kasutatavatest bioloogilistest toimeainetest on taimede sekundaarsed metaboliidid, seened ja prokarüootmikroorganismid või nendega seotud poolsünteetilised sünteetilised ühendid. Meie teadusuuringute üks peamisi eesmärke on teha kindlaks ja iseloomustada uusi toimeaineid ja metaboliite taimedest, seentest või mikroorganismidest. Selle infrastruktuuri arendamisega püüame laiendada võimalust leida täiendavaid meditsiinilisi ja toksilisi taime toimeaineid ning ühendite iseloomustust. Teadusuuringute käigus määratleme rahvusvahelises praktikas mitte ainult organismi toimeaine, vaid ka üha olulisema metaboliidi sõrmejälje. Oluline on märkida, et mõnede hüpoteeside kohaselt on enamik varem tundmatuid toimeaineid võimalik tõhusalt kindlaks teha ja seda strateegiat iseloomustada. Sarnastel põhjustel on äärmuslikes tingimustes elavate mikroobide ainevahetussaaduste metaboolne iseloomustamine paljutõotav (professionaalne vastutus: Bioloogia Instituut, taimeorganoloogia osakond, mikrobioloogia osakond). Enamik biokonjugaatidest, mis sobivad sihtotstarbelise ravi jaoks, koosnevad kolmest komponendist; toimeaine, kontrolliv molekul ja ühendusüksus. Meie uurimistöös püüame luua ühendkauplusi, kus toimeaine (looduslik või sünteesitud) ja kontrolli peptiid komponendid saab ühendada laias valikus kombinatsioonid arenenud bifunktsionaalne linkers, suurendades valikut konjugaatide sobivad suunatud ravi, mis võib olla ka eeltingimus isikupärastatud paranemise. Lisaks toodetud komponentide ja nendest toodetud konjugaatide identifitseerimisele ja iseloomustamisele on nende stabiilsus, ainevahetus ja rakkude põhjustatud valgutaseme muutused bioloogilistes süsteemides olulised ka nende väga läbilaskva ja äärmiselt häiriva analüütilise platvormi mõõtmiseks (professionaalne operaator: Keemiainstituut, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Eespool nimetatud kaks uurimisvaldkonda toetuvad ühiselt äsja hangitud UHPLC-MS/MS seadmele, mis ei sobi mitte ainult lihtsateks rutiinseteks analüüsideks, vaid millel on ka märkimisväärne uurimispotentsiaal. Proovide komponentide kvalitatiivseks ja kvantitatiivseks analüüsiks võib kasutada süsteemi (HPLC-MS/MS), mis on seotud hankimiseks kavandatud vedelikkromatograafiaga (HPLC-MS, HPLC), mis võimaldab määrata suure täpsusega massi, koos kvadrupoli ja orbiidi massi määramisega. Katsetatavate komponentide kogus võib erineda suurusjärkude kaupa. Süsteem sobib ülitõhusate vedelikkromatograafia (UHPLC) katsete tegemiseks, lühendades oluliselt mõõtmisaega, suurendades seeläbi töödeldavate proovide arvu ja vähendades lahusti kasutamist. Eraldatud ainete identifitseerimiseks ja kvantifitseerimiseks kasutatakse dioodmassiivi detektorit (190–800 nm), mis on kõrge eraldusvõimega massispektromeetriline määramine hübriid-kvadrupol-orbitrapi massispektromeetri abil. Suure massivahemiku (m/z 50–2000) suure täpsusega (alla 5 ppm) massispektromeetrid võimaldavad ka struktuurset identifitseerimist ja saasteprofiili tuvastamist, pakkudes ainulaadset tundlikkust (attogrammi). MS/MS salvestust pakub suure energiasisaldusega HCD lööklahter, mis võimaldab reprodutseeritavat spektrisalvestust ja turvalisemat komponentide tuvastamist raamatukogu otsinguks. Vahetatavad iooniallikad (API iooniallika korpus kuumutatud elektropihustusionisatsiooniga – H-ESI II ja APCI ionisatsiooniallikad, millel on kaks destillatsioonisüsteem) võimaldavad uurida mitmesuguste struktuuride molekule. Loetletud põhiomadused muudavad seadme sobivaks suure hulga proovide kiireks „suure jõudlusega“ analüüsiks. A (Estonian)
13 August 2022
0 references
A) vykdytinų užduočių pristatymas: Projekto tikslas – įsigyti ir eksploatuoti instrumentus, tinkamus identifikuoti/apibūdinti naujus natūralius (augalų, grybelių ir bakterijų) organinius junginius ir organinius junginius, pagamintus cheminės sintezės būdu, jų konjugatus (direktyvos darinius, koloidines nanodaleles) ir jų metabolitus, taip pat tirti ląstelių baltymų lygio pokyčius (proteomiką) dėl junginių įtakos. Gydant tiek auglio, tiek reinfekcines mikrobų kilmės ligas, pagrindinis proveržis gali būti pasiektas vadinamuoju tiksliniu gydymu, kuris padidina veikliųjų medžiagų selektyvumą ir sumažina jų šalutinį poveikį. Bendras šios naujos farmacinių tyrimų krypties bruožas yra junginių, kurie gali nukreipti veikliąją medžiagą į paveiktą naviką arba užkrėstą ląstelę, kūrimas. Infrastruktūra, kurią reikia sukurti, siekiama izoliuoti, identifikuoti ir apibūdinti naujus natūraliai gaminamus biologiškai aktyvius junginius (konjugatus su peptidais ir (arba) nanosistemomis), pagamintus organinės cheminės sintezės būdu, laikantis aukščiausių tarptautinių standartų. Didžioji dauguma medicinoje naudojamų biologiškai aktyvių medžiagų yra antriniai augalų metabolitai, grybai ir prokariotai arba susiję pusiau sintetiniai sintetiniai junginiai. Vienas iš pagrindinių mūsų tyrimų tikslų yra nustatyti ir apibūdinti naujas augalų, grybelių ar mikroorganizmų kilmės veikliąsias medžiagas ir metabolitus. Šiuo infrastruktūriniu vystymusi siekiame išplėsti galimybę atrasti papildomų vaistinių ir toksiškų augalų veikliųjų medžiagų bei junginių charakterizavimo profilį. Mokslinių tyrimų metu mes apibrėžiame ne tik organizmo veikliąją medžiagą, bet ir vis labiau fundamentalų „metabolito pirštų atspaudą“ tarptautinėje praktikoje. Svarbu pažymėti, kad, remiantis kai kuriomis hipotezėmis, dauguma anksčiau nežinomų veikliųjų medžiagų gali būti veiksmingai identifikuojamos ir apibūdinamos šia strategija. Dėl panašių priežasčių mikrobų medžiagų apykaitos produktų, gyvenančių ekstremaliomis sąlygomis, metabolinis apibūdinimas yra perspektyvus (profesionalus atsakingas: Biologijos institutas, Augalų organologijos katedra, Mikrobiologijos katedra). Daugumą tikslinei terapijai tinkamų biologinių konjugatų sudaro trys komponentai; veiklioji medžiaga, kontroliuojanti molekulė ir jungiamasis vienetas. Mūsų mokslinių tyrimų metu mes stengiamės sukurti sudėtines parduotuves, kuriose veiklioji medžiaga (natūrali arba sintezuota) ir peptidų komponentų kontrolė gali būti susieta su įvairiais deriniais su sukurtais dvifunkciais jungikliais, padidinant konjugatų, tinkamų tikslinei terapijai, asortimentą, kuris taip pat gali būti būtina individualizuoto gydymo sąlyga. Be pagamintų komponentų ir iš jų pagamintų konjugatų identifikavimo ir apibūdinimo, jų stabilumas, metabolizmas ir ląstelių sukeliami baltymų lygio pokyčiai biologinėse sistemose taip pat yra labai svarbūs jų labai pralaidi, labai ardomoji analitinė platforma (profesionalus operatorius: Chemijos institutas, MTA-ELTE Peptidchemical tyrimų grupė). Minėtos dvi mokslinių tyrimų sritys kartu priklauso nuo naujai įsigyto UHPLC-MS/MS įrenginio, kuris ne tik tinka paprastoms įprastoms analizėms, bet ir turi didelį mokslinių tyrimų potencialą. Mėginių sudedamųjų dalių kokybinė ir kiekybinė analizė gali būti atliekama naudojant paėmimui skirtą sistemą (HPLC-MS/MS), susijusią su skysčių chromatografija (HPLC), leidžiančia nustatyti didelio tikslumo masę, taikant keturpolio ir orbitrapo masės aptikimą. Bandytinų sudedamųjų dalių kiekis gali skirtis pagal dydį. Sistema tinka atlikti itin efektyvius skysčių chromatografijos (UHPLC) bandymus, žymiai sutrumpinti matavimo laiką, tokiu būdu padidinant mėginių, kuriuos galima apdoroti, skaičių ir sumažinant tirpiklio naudojimą. Atskirtų medžiagų identifikavimas ir kiekybinis nustatymas atliekamas naudojant diodų matricos detektorių (190–800 nm), didelės skiriamosios gebos masių spektrometrijos aptikimą naudojant hibridinį keturpolio orbitrapo masės spektrometrą. Didelio tikslumo (mažiau nei 5 ppm) masių spektrometrai, veikiantys plačiame masės diapazone (m/z 50–2000), taip pat leidžia identifikuoti struktūrinius identifikavimą ir taršos profilį, suteikiant unikalų jautrumą (attogramą). MS/MS įrašymą teikia didelės energijos HCD poveikio ląstelė, kuri leidžia atkurti spektro įrašymą ir saugesnį komponentų identifikavimą bibliotekos paieškai. Keičiami jonų šaltiniai (API jonų šaltinio korpusas su šildomu elektropurškiniu jonizavimu – H-ESI II ir APCI jonizacijos šaltiniai su dviguba distiliavimo sistema) leidžia ištirti įvairių struktūrų molekules. Pagrindinės išvardytos charakteristikos leidžia instrumentui greitai „dideliam pralaidumui“ analizuoti daug mėginių. A (Lithuanian)
13 August 2022
0 references
A) Presentazione dei compiti da svolgere: L'obiettivo del progetto è quello di acquisire e gestire una serie di strumenti idonei a identificare/caratterizzare nuovi composti organici naturali (piante, fungine e batteriche) e composti organici prodotti dalla sintesi chimica, i loro coniugati (derivati diretti, nanoparticelle colloidali) e i loro metaboliti, nonché per la ricerca di cambiamenti a livello proteico (proteomica) nelle cellule dovute all'influenza dei composti. Nel trattamento sia del tumore che delle malattie reinfettive di origine microbica, una svolta importante può essere fatta dalla cosiddetta terapia diretta, che aumenta la selettività dei principi attivi e riduce i loro effetti collaterali. La caratteristica comune di questa nuova direzione della ricerca farmaceutica è la creazione di composti in grado di indirizzare il principio attivo nella cellula tumorale o infetta. L'infrastruttura da sviluppare mira all'isolamento, all'identificazione e alla caratterizzazione di nuovi composti biologicamente attivi prodotti naturalmente (coniugati con peptidi e/o nanosistemi) prodotti mediante sintesi chimica organica, in linea con i più elevati standard internazionali. La stragrande maggioranza delle sostanze biologicamente attive attualmente utilizzate in medicina sono metaboliti secondari di piante, funghi e microrganismi procaryoti o sono composti sintetici semisintetici correlati. Uno dei principali obiettivi della nostra ricerca è identificare e caratterizzare nuove sostanze attive e metaboliti di origine vegetale, fungina o microrganismi. Con questo sviluppo infrastrutturale, ci proponiamo di ampliare la possibilità di scoprire ulteriori sostanze attive medicinali e tossiche e il profilo di caratterizzazione dei composti. Nel corso della ricerca, definiamo non solo una sostanza attiva di un organismo, ma anche una sempre più fondamentale "impronta digitale del metabolita" nella pratica internazionale. È importante notare che, secondo alcune ipotesi, la maggior parte dei principi attivi precedentemente sconosciuti può essere efficacemente identificata e caratterizzata da questa strategia. Per ragioni simili, la caratterizzazione metabolica dei prodotti metabolici di microbi che vivono in condizioni estreme è promettente (responsabile professionale: Istituto di Biologia, Dipartimento di Organologia delle Piante, Dipartimento di Microbiologia). La maggior parte dei bioconiugati adatti alla terapia mirata è costituita da tre componenti; principio attivo, molecola di controllo e unità di interconnessione. Nella nostra ricerca cerchiamo di creare depositi composti in cui la sostanza attiva (naturale o sintetizzata) e i componenti di controllo del peptide possono essere collegati insieme in una vasta gamma di combinazioni con i linker bifunzionali sviluppati, aumentando la gamma di coniugati adatti alla terapia mirata, che può anche essere un prerequisito per la guarigione personalizzata. Oltre all'identificazione e caratterizzazione dei componenti prodotti e dei coniugati da essi prodotti, la loro stabilità, il metabolismo e i cambiamenti a livello di proteine indotti da cellule nei sistemi biologici sono essenziali anche per la misurazione della loro piattaforma analitica altamente permeabile e altamente dirompente (operatore professionale: Istituto di chimica, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). I due settori di ricerca di cui sopra si basano congiuntamente sul dispositivo UHPLC-MS/MS, di recente acquisizione, che non solo è adatto per semplici analisi di routine, ma ha anche un notevole potenziale di ricerca. L'analisi qualitativa e quantitativa dei componenti dei campioni può essere effettuata utilizzando un sistema (HPLC-MS/MS) associato alla cromatografia liquida (HPLC) progettato per l'approvvigionamento, che consenta una determinazione della massa ad alta precisione, con rilevamento della massa del quadrupolo e dell'orbitarapo. La quantità di componenti da sottoporre a prova può variare in base all'ordine di grandezza. Il sistema è adatto per eseguire test di cromatografia liquida ultraefficiente (UHPLC), accorciando significativamente i tempi di misurazione, aumentando così il numero di campioni che possono essere trattati e riducendo l'uso di solventi. L'identificazione e la quantificazione delle sostanze separate sono fornite da un rivelatore ad array di diodi (190-800 nm), rilevamento di specrometria di massa ad alta risoluzione mediante lo spettrometro di massa ibrido quadrupol-orbitrap. Operare su un'ampia gamma di massa (m/z 50-2000) con spettrometri di massa ad alta precisione (meno di 5 ppm) consente anche l'identificazione strutturale e l'identificazione del profilo di inquinamento fornendo una sensibilità unica (attogramma). La registrazione MS/MS è fornita da una cella di impatto HCD ad alta energia, che consente la registrazione riproducibile dello spettro e l'identificazione dei componenti più sicura per la ricerca in biblioteca. Le sorgenti di ioni intercambiabili (all... (Italian)
13 August 2022
0 references
A) Predstavljanje zadataka koje treba provesti: Cilj projekta je stjecanje i upravljanje skupom instrumenata koji su pogodni za identifikaciju/karakterizaciju novih prirodnih (biljnih, gljivičnih i bakterijskih) organskih spojeva i organskih spojeva proizvedenih kemijskom sintezom, njihovih konjugata (direktivi derivati, koloidne nanočestice) i njihovih metabolita, kao i za istraživanje promjena razine proteina (proteomika) u stanicama zbog utjecaja spojeva. U liječenju tumorskih i reinfektivnih bolesti mikrobnog podrijetla, glavni napredak može se postići takozvanom usmjerenom terapijom koja povećava selektivnost djelatnih tvari i smanjuje njihove nuspojave. Zajedničko obilježje ovog novog smjera farmaceutskih istraživanja jest stvaranje spojeva koji mogu ciljati djelatnu tvar u zahvaćeni tumor ili zaraženu stanicu. Infrastruktura koju treba razviti ima za cilj izolaciju, identifikaciju i karakterizaciju novih prirodno proizvedenih biološki aktivnih spojeva (konjugata s peptidom i/ili nanosustavima) proizvedenih organskom kemijskom sintezom, u skladu s najvišim međunarodnim standardima. Velika većina biološki djelatnih tvari koje se trenutačno koriste u medicini su sekundarni metaboliti biljaka, gljivica i prokaryot mikroorganizama ili su povezani polusintetički sintetički spojevi. Jedan od glavnih ciljeva našeg istraživanja je utvrđivanje i karakterizacija novih aktivnih tvari i metabolita biljnog, gljivičnog ili mikroorganizma. Ovim infrastrukturnim razvojem nastojimo proširiti mogućnost otkrivanja dodatnih ljekovitih i toksičnih biljnih djelatnih tvari i karakterizacijskog profila spojeva. Tijekom istraživanja definiramo ne samo aktivnu tvar organizma, već i sve važnije „metabolita otisak prsta” u međunarodnoj praksi. Važno je napomenuti da se, prema nekim pretpostavkama, većina prethodno nepoznatih aktivnih tvari može učinkovito identificirati i karakterizirati ovom strategijom. Iz sličnih razloga obećava metabolička karakterizacija metaboličkih proizvoda mikroba koji žive u ekstremnim uvjetima (profesionalni odgovorni: Institut za biologiju, Zavod za biljnu organologiju, Zavod za mikrobiologiju). Većina biokonjugata pogodnih za ciljanu terapiju sastoji se od tri komponente; djelatna tvar, kontrola molekule i jedinica za međusobno povezivanje. U našem istraživanju pokušavamo stvoriti složene trgovine u kojima se aktivna tvar (prirodna ili sintetizirana) i kontrola peptidnih komponenti mogu povezati u širokom rasponu kombinacija s razvijenim bifunkcijskim vezama, povećavajući raspon konjugata pogodnih za ciljanu terapiju, što također može biti preduvjet za personalizirano liječenje. Osim identifikacije i karakterizacije proizvedenih sastojaka i konjugata koji se od njih proizvode, njihova stabilnost, metabolizam i promjene razine bjelančevina izazvane stanicama u biološkim sustavima također su neophodni za mjerenje njihove vrlo propusne, vrlo disruptivne analitičke platforme (specijalizirani subjekt: Institut za kemiju, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Gore navedena dva istraživačka područja zajednički se oslanjaju na novonabavljeni uređaj UHPLC-MS/MS, koji nije samo prikladan za jednostavne rutinske analize, već ima i značajan istraživački potencijal. Kvalitativna i kvantitativna analiza sastavnih dijelova uzoraka može se provesti pomoću sustava (HPLC-MS/MS) povezanog s tekućinskom kromatografijom (HPLC) namijenjenog za nabavu, koji omogućuje određivanje mase visoke točnosti, s detekcijom mase četverostruke i orbitrapske mase. Količina sastavnih dijelova koje treba ispitati može se razlikovati prema redoslijedu veličine. Sustav je pogodan za provođenje ultra-učinkovitih ispitivanja tekućinske kromatografije (UHPLC), čime se znatno skraćuje vrijeme mjerenja, čime se povećava broj uzoraka koji se mogu obraditi i smanjuje uporaba otapala. Identifikacija i kvantifikacija odvojenih tvari osigurava se detektorom nizova dioda (190 – 800 nm), otkrivanjem masene spektrometrije visoke razlučivosti hibridnim masenim spektrometrom četveropol-orbitrapa. Rad u širokom rasponu mase (m/z 50 – 2000) s visokom preciznošću (manje od 5 ppm) mase spektrometara također omogućuje strukturnu identifikaciju i identifikaciju profila onečišćenja pružanjem jedinstvene osjetljivosti (attogram). MS/MS snimanje osigurava visokoenergetska stanica za utjecaj HCD-a, koja omogućuje ponovljivo snimanje spektra i sigurniju identifikaciju komponenti za pretraživanje knjižnice. Izmjenjivi ionski izvori (api izvor kućišta s grijanom elektrospray ionizacijom – H-ESI II i APCI ionizacijski izvori s dvostrukim destilacijskim sustavom) omogućuju ispitivanje molekula širokog raspona struktura. Navedene glavne karakteristike čine instrument pogodnim za brzu analizu „visoke propusnosti” velikog broja uzoraka. A (Croatian)
13 August 2022
0 references
Α) Παρουσίαση των προς εκτέλεση καθηκόντων: Στόχος του έργου είναι η απόκτηση και λειτουργία ενός συνόλου εργαλείων που είναι κατάλληλα για τον εντοπισμό/χαρακτηρισμό νέων φυσικών (φυτικών, μυκητιασικών και βακτηριακών) οργανικών ενώσεων και οργανικών ενώσεων που παράγονται με χημική σύνθεση, των συζευγμένων τους (οδηγικών παραγώγων, κολλοειδών νανοσωματιδίων) και των μεταβολιτών τους, καθώς και για την έρευνα μεταβολών επιπέδου πρωτεΐνης (πρωτεϊνική) στα κύτταρα λόγω της επίδρασης των ενώσεων. Στη θεραπεία τόσο των όγκων όσο και των επαναμολυσματικών ασθενειών μικροβιακής προέλευσης, μπορεί να γίνει μια σημαντική ανακάλυψη μέσω της λεγόμενης κατευθυνόμενης θεραπείας, η οποία αυξάνει την επιλεκτικότητα των δραστικών ουσιών και μειώνει τις παρενέργειες τους. Το κοινό χαρακτηριστικό αυτής της νέας κατεύθυνσης της φαρμακευτικής έρευνας είναι η δημιουργία ενώσεων που είναι σε θέση να στοχεύσουν τη δραστική ουσία στον προσβεβλημένο όγκο ή μολυσμένο κύτταρο. Η υποδομή που πρόκειται να αναπτυχθεί αποσκοπεί στην απομόνωση, τον προσδιορισμό και τον χαρακτηρισμό νέων φυσικά παραγόμενων βιολογικώς δραστικών ενώσεων (συζευγμάτων με πεπτίδια ή/και νανοσυστήματα) που παράγονται με οργανική χημική σύνθεση, σύμφωνα με τα υψηλότερα διεθνή πρότυπα. Η συντριπτική πλειονότητα των βιολογικά δραστικών ουσιών που χρησιμοποιούνται επί του παρόντος στην ιατρική είναι δευτερογενείς μεταβολίτες φυτών, μυκήτων και προκαρυώτων μικροοργανισμών ή είναι σχετικές ημισυνθετικές συνθετικές ενώσεις. Ένας από τους κύριους στόχους της έρευνάς μας είναι ο εντοπισμός και ο χαρακτηρισμός νέων δραστικών ουσιών και μεταβολιτών φυτικής, μυκητιασικής προέλευσης ή μικροοργανισμών. Με αυτή την ανάπτυξη υποδομών, στοχεύουμε να διευρύνουμε τη δυνατότητα ανακάλυψης πρόσθετων φαρμακευτικών και τοξικών φυτικών δραστικών ουσιών και του προφίλ χαρακτηρισμού των ενώσεων. Κατά τη διάρκεια της έρευνας, ορίζουμε όχι μόνο μια δραστική ουσία ενός οργανισμού, αλλά και ένα ολοένα και πιο θεμελιώδες «δάχτυλο μεταβολίτη» στη διεθνή πρακτική. Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι, σύμφωνα με ορισμένες υποθέσεις, οι περισσότερες από τις προηγουμένως άγνωστες δραστικές ουσίες μπορούν να προσδιοριστούν αποτελεσματικά και να χαρακτηριστούν από τη στρατηγική αυτή. Για παρόμοιους λόγους, ο μεταβολικός χαρακτηρισμός των μεταβολικών προϊόντων μικροβίων που ζουν σε ακραίες συνθήκες είναι ελπιδοφόρος (επαγγελματικός υπεύθυνος: Ινστιτούτο Βιολογίας, Τμήμα Φυτικής Οργανολογίας, Τμήμα Μικροβιολογίας). Η πλειονότητα των βιοσυζευγμάτων που είναι κατάλληλα για στοχευμένη θεραπεία αποτελείται από τρία συστατικά. δραστική ουσία, μόριο ελέγχου και διασυνδεδεμένη μονάδα. Στην έρευνά μας προσπαθούμε να δημιουργήσουμε σύνθετα καταστήματα στα οποία η δραστική ουσία (φυσική ή συνθετική) και ο έλεγχος των συστατικών πεπτιδίων μπορούν να συνδεθούν μεταξύ τους σε ένα ευρύ φάσμα συνδυασμών με τους αναπτυγμένους συνδέσμους διλειτουργίας, αυξάνοντας το φάσμα των συζυγών κατάλληλων για στοχευμένη θεραπεία, η οποία μπορεί επίσης να αποτελέσει προϋπόθεση για εξατομικευμένη επούλωση. Εκτός από την ταυτοποίηση και τον χαρακτηρισμό των παραγόμενων συστατικών και των συζευγμάτων που παράγονται από αυτά, η σταθερότητα, ο μεταβολισμός και οι αλλαγές στο επίπεδο των πρωτεϊνών που προκαλούνται από τα κύτταρα στα βιολογικά συστήματα είναι επίσης απαραίτητες για τη μέτρηση της εξαιρετικά διαπεράσιμης, εξαιρετικά διαταρακτικής αναλυτικής πλατφόρμας τους (επαγγελματίας χειριστής: Ινστιτούτο Χημείας, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Οι παραπάνω δύο ερευνητικοί τομείς βασίζονται από κοινού στη νέα συσκευή UHPLC-MS/MS, η οποία δεν είναι μόνο κατάλληλη για απλές αναλύσεις ρουτίνας, αλλά έχει επίσης σημαντικό ερευνητικό δυναμικό. Η ποιοτική και ποσοτική ανάλυση των συστατικών των δειγμάτων μπορεί να πραγματοποιείται με τη χρήση συστήματος (HPLC-MS/MS) που συνδέεται με υγρή χρωματογραφία (HPLC) σχεδιασμένο για προμήθεια, επιτρέποντας τον προσδιορισμό μάζας υψηλής ακρίβειας, με ανίχνευση μάζας τετραπολικής και τροχιάς. Η ποσότητα των προς δοκιμή συστατικών μπορεί να ποικίλλει κατά τάξη μεγέθους. Το σύστημα είναι κατάλληλο για την εκτέλεση εξαιρετικά αποδοτικών δοκιμών υγρής χρωματογραφίας (UHPLC), μειώνοντας σημαντικά το χρόνο μέτρησης, αυξάνοντας έτσι τον αριθμό των δειγμάτων που μπορούν να υποβληθούν σε επεξεργασία και μειώνοντας τη χρήση διαλύτη. Ο προσδιορισμός και ο ποσοτικός προσδιορισμός των διαχωρισμένων ουσιών παρέχονται από ανιχνευτή συστοιχίας διόδων (190-800 nm), ανίχνευση φασματομετρίας μάζας υψηλής ευκρίνειας με το υβριδικό φασματόμετρο μάζας τετραπολικής τροχιάς. Η λειτουργία σε ευρύ φάσμα μάζας (m/z 50-2000) με φασματογράφους μάζας υψηλής ακρίβειας (κάτω των 5 ppm) επιτρέπει επίσης την αναγνώριση δομικής ταυτοποίησης και την αναγνώριση προφίλ ρύπανσης με την παροχή μιας μοναδικής ευαισθησίας (στοίχημα). Η καταγραφή των κρατών μελών/MS παρέχεται από μια κυψέλη πρόσκρουσης HCD υψηλής ενέργειας, η οποία επιτρέπει την αναπαραγώγιμη καταγραφή φάσματος και την πιο ασφαλή αναγνώριση κατασκευαστικών στοιχείω... (Greek)
13 August 2022
0 references
A) Prezentácia úloh, ktoré sa majú vykonať: Cieľom projektu je získať a prevádzkovať súbor nástrojov, ktoré sú vhodné na identifikáciu/charakterizáciu nových prírodných (rastlinných, hubových a bakteriálnych) organických zlúčenín a organických zlúčenín produkovaných chemickou syntézou, ich konjugátov (smerové deriváty, koloidné nanočastice) a ich metabolitov, ako aj na výskum zmien na úrovni proteínov (proteomika) v bunkách v dôsledku vplyvu zlúčenín. Pri liečbe nádorových a reinfekčných ochorení mikrobiálneho pôvodu môže dôjsť k významnému prielomu takzvanej cielenej terapie, ktorá zvyšuje selektivitu účinných látok a znižuje ich vedľajšie účinky. Spoločným znakom tohto nového smeru farmaceutického výskumu je vytvorenie zlúčenín, ktoré sú schopné zacieliť účinnú látku do postihnutého nádoru alebo infikovaných buniek. Infraštruktúra, ktorá sa má vyvinúť, sa zameriava na izoláciu, identifikáciu a charakterizáciu nových prirodzene produkovaných biologicky aktívnych zlúčenín (konjugátov s peptidom a/alebo nanosystémmi) vyrobených organickou chemickou syntézou v súlade s najvyššími medzinárodnými normami. Prevažná väčšina biologicky účinných látok, ktoré sa v súčasnosti používajú v medicíne, sú sekundárne metabolity rastlín, húb a mikroorganizmov prokaryotov alebo sú príbuzné polosyntetické syntetické zlúčeniny. Jedným z hlavných cieľov nášho výskumu je identifikovať a charakterizovať nové účinné látky a metabolity rastlinného, hubového alebo mikroorganizmu pôvodu. S týmto rozvojom infraštruktúry sa snažíme rozšíriť možnosť objavenia ďalších liečivých a toxických rastlinných účinných látok a charakterizačného profilu zlúčenín. V priebehu výskumu definujeme nielen účinnú látku organizmu, ale aj čoraz zásadnejší „metabolitový odtlačok prsta“ v medzinárodnej praxi. Je dôležité poznamenať, že podľa niektorých hypotéz môže byť väčšina predtým neznámych účinných látok účinne identifikovaná a charakterizovaná touto stratégiou. Z podobných dôvodov je sľubná metabolická charakterizácia metabolických produktov mikróbov žijúcich v extrémnych podmienkach (profesionálne zodpovedné: Ústav biológie, Katedra organológie rastlín, Katedra mikrobiológie). Väčšina biokonjugátov vhodných na cielenú liečbu pozostáva z troch zložiek; účinná látka, riadiaca molekula a prepojovacia jednotka. V našom výskume sa snažíme vytvoriť sklady zlúčenín, v ktorých je aktívna látka (prírodná alebo syntetizovaná) a kontrola peptidových zložiek spojená v širokej škále kombinácií s vyvinutými dvojfunkčnými spojovacími látkami, čím sa zvyšuje škála konjugátov vhodných pre cielenú terapiu, čo môže byť aj predpokladom individuálneho liečenia. Okrem identifikácie a charakterizácie vyrobených zložiek a konjugátov z nich je ich stabilita, metabolizmus a zmeny hladiny bielkovín vyvolané bunkami v biologických systémoch tiež nevyhnutné na meranie ich vysoko priepustnej, vysoko rušivej analytickej platformy (profesionálny operátor: Ústav chémie, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Uvedené dve oblasti výskumu sa spoločne spoliehajú na novo obstarané zariadenie UHPLC-MS/MS, ktoré je vhodné nielen na jednoduché rutinné analýzy, ale má aj významný výskumný potenciál. Kvalitatívna a kvantitatívna analýza zložiek vzoriek sa môže vykonať pomocou systému (HPLC-MS/MS) spojeného s kvapalinovou chromatografiou (HPLC) určeným na odber, ktorý umožňuje vysoko presné stanovenie hmotnosti, s detekciou hmotnosti kvadrupolu a orbitrapu. Množstvo komponentov, ktoré sa majú skúšať, sa môže meniť rádovo. Systém je vhodný na vykonávanie testov ultraúčinnej kvapalinovej chromatografie (UHPLC), čím sa výrazne skracuje čas merania, čím sa zvyšuje počet vzoriek, ktoré možno spracovať, a znižuje sa používanie rozpúšťadla. Identifikácia a kvantifikácia oddelených látok je zabezpečená detektorom diódového poľa (190 – 800 nm), detekciou hmotnostnej spektrometrie s vysokým rozlíšením hybridným hmotnostným spektrometrom quadrupol-orbitrap. Pracujú v širokom hmotnostnom rozsahu (m/z 50 – 2000) s vysokou presnosťou (menej ako 5 ppm) hmotnostných spektrometrov tiež umožňujú identifikáciu konštrukcie a identifikáciu profilu znečistenia tým, že poskytujú jedinečnú citlivosť (attogram). Nahrávanie ČŠ/MS zabezpečuje vysokoenergetická bunka s vplyvom HCD, ktorá umožňuje reprodukovateľné zaznamenávanie spektra a bezpečnejšiu identifikáciu komponentov pri vyhľadávaní v knižnici. Vymeniteľné zdroje iónov (skriňa zdroja iónov API s vyhrievanou elektrospray ionizáciou – H-ESI II a APCI ionizačné zdroje s duálnym destilačným systémom) umožňujú skúmanie molekúl širokej škály štruktúr. Hlavné vlastnosti uvedené robia prístroj vhodný pre rýchlu „vysokú priepustnosť“ analýzu veľkého počtu vzoriek. A (Slovak)
13 August 2022
0 references
A) Täytäntöönpantavien tehtävien esittely: Hankkeen tavoitteena on hankkia ja käyttää välineitä, jotka soveltuvat kemiallisella synteesillä tuotettujen uusien luonnollisten (kasvi-, sieni- ja bakteeri) orgaanisten yhdisteiden ja niiden konjugaattien (direktiivijohdannaiset, kolloidiset nanohiukkaset) ja niiden metaboliittien tunnistamiseen ja luonnehtimiseen sekä yhdisteiden vaikutuksesta johtuvien valkuaistason muutosten (proteomiikan) tutkimiseen soluissa. Sekä kasvainten että mikrobiperäisten uudelleen tarttuvien sairauksien hoidossa merkittävä läpimurto voidaan tehdä ns. suunnatulla hoidolla, joka lisää vaikuttavien aineiden valikoivuutta ja vähentää niiden sivuvaikutuksia. Lääketutkimuksen uuden suunnan yhteinen piirre on sellaisten yhdisteiden luominen, jotka pystyvät kohdistamaan vaikuttavan aineen kyseessä olevaan kasvaimeen tai tartunnan saaneeseen soluun. Kehitettävän infrastruktuurin tarkoituksena on eristää, tunnistaa ja luonnehtia luonnonmukaisesti tuotettuja biologisesti aktiivisia yhdisteitä (konjugaatteja peptidin ja/tai nanojärjestelmien kanssa), jotka on tuotettu orgaanisella kemiallisella synteesillä korkeimpien kansainvälisten standardien mukaisesti. Valtaosa tällä hetkellä lääketieteessä käytettävistä biologisesti vaikuttavista aineista on kasvien, sienien ja prokaryoottimikro-organismien sekundaarisia metaboliitteja tai niihin liittyviä puolisynteettisiä synteettisiä yhdisteitä. Yksi tutkimuksen päätavoitteista on tunnistaa ja luonnehtia uusia tehoaineita ja kasvi-, sieni- tai mikro-organismiperäisiä metaboliitteja. Tämän infrastruktuurin kehittämisen avulla pyrimme laajentamaan mahdollisuuksia löytää uusia lääkeaineita ja myrkyllisiä kasvin vaikuttavia aineita sekä yhdisteiden karakterisointiprofiilia. Tutkimuksen aikana määrittelemme paitsi organismin vaikuttavan aineen myös yhä perustavanlaatuisemman ”metaboliittisormen” kansainvälisessä käytännössä. On tärkeää huomata, että joidenkin olettamusten mukaan suurin osa aiemmin tuntemattomista tehoaineista voidaan tehokkaasti tunnistaa ja luonnehtia tällä strategialla. Samoista syistä äärimmäisissä olosuhteissa elävien mikrobien metabolisten tuotteiden metabolinen luonnehdinta on lupaava (ammattimainen vastuullinen: Biologian laitos, kasvinorganologian laitos, mikrobiologian laitos). Suurin osa kohdennettuun hoitoon soveltuvista biokonjugateista koostuu kolmesta komponentista; vaikuttava aine, molekyyliä säätelevä ja toisiinsa kytkevä yksikkö. Tutkimuksessamme pyrimme luomaan yhdistevarastoja, joissa vaikuttava aine (luonnollinen tai syntetisoitu) ja kontrolloiva peptidikomponentti voidaan yhdistää moninaisiin yhdistelmiin kehitettyjen kaksitoimisten linkkien kanssa, mikä lisää kohdennettuun hoitoon soveltuvien konjugaattien valikoimaa, mikä voi olla myös henkilökohtaisen paranemisen edellytys. Tuotettujen komponenttien ja niistä valmistettujen konjugaattien tunnistamisen ja karakterisoimisen lisäksi niiden stabiilisuus, aineenvaihdunta ja solujen aiheuttamat proteiinitason muutokset biologisissa järjestelmissä ovat olennaisen tärkeitä niiden erittäin läpäisevän, erittäin häiritsevän analyyttisen alustan mittaamiseksi (ammattimainen toimija: Kemian instituutti, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Edellä mainitut kaksi tutkimusaluetta perustuvat yhdessä äskettäin hankittuun UHPLC-MS/MS-laitteeseen, joka soveltuu paitsi yksinkertaisiin rutiinianalyyseihin myös merkittävään tutkimuspotentiaaliin. Näytteiden komponenttien kvalitatiiviset ja kvantitatiiviset analyysit voidaan tehdä käyttämällä nestekromatografiaan (HPLC-MS/MS) liittyvää järjestelmää (HPLC), joka on suunniteltu talteenottoa varten ja joka mahdollistaa korkean tarkkuuden massamäärityksen sekä quadrupolin ja orbitrapien massan havaitsemisen. Testattavien komponenttien määrä voi vaihdella suuruusluokittain. Järjestelmä soveltuu erittäin tehokkaiden nestekromatografiatestien (UHPLC) suorittamiseen, mikä lyhentää merkittävästi mittausaikaa, mikä lisää prosessoitavien näytteiden määrää ja vähentää liuottimien käyttöä. Erotettujen aineiden tunnistaminen ja kvantifiointi tapahtuu diodimatriisidetektorilla (190–800 nm), joka on korkean resoluution massaspektrometrin avulla tehtävä hybridi quadrupol-orbitrap-massaspektrometri. Laajalla massa-alueella (m/z 50–2000) toimivat erittäin tarkat (alle 5 ppm) massaspektrometrit mahdollistavat myös rakenteellisen tunnistamisen ja pilaantumisprofiilin tunnistamisen antamalla ainutlaatuisen herkkyyden (attogrammi). MS/MS-tallennus tapahtuu korkean energian HCD-vaikutussolulla, joka mahdollistaa toistettavissa olevan taajuuksien tallennuksen ja suojatumman komponentin tunnistamisen kirjastohakua varten. Vaihdettavat ionilähteet (API-ionilähdekotelo, jossa on lämmitetty elektrospray-ionisaatio – H-ESI II- ja APCI-ionisaatiolähteet, joissa on kaksitislausjärjestelmä) mahdollistavat monenlaisten rakenteiden molekyylien tutkimisen. Tärkeimmät luetellut ominaisuudet tekevät instrumentista sopivan nopean ”korkean läpimenon” analysointiin suuresta... (Finnish)
13 August 2022
0 references
A) Prezentacja zadań do realizacji: Celem projektu jest pozyskanie i eksploatacja zestawu instrumentów, które nadają się do identyfikacji/charakteryzowania nowych naturalnych (roślinnych, grzybowych i bakteryjnych) związków organicznych i związków organicznych wytwarzanych w wyniku syntezy chemicznej, ich koniugatów (pochodnych dyrektyw, koloidalnych nanocząsteczek) i ich metabolitów, a także do badania zmian poziomu białek (proteomiki) w komórkach ze względu na wpływ związków. W leczeniu zarówno nowotworów, jak i chorób zakaźnych pochodzenia mikrobiologicznego, przełom może być dokonany przez tzw. terapię kierowaną, która zwiększa selektywność substancji czynnych i zmniejsza ich skutki uboczne. Wspólną cechą tego nowego kierunku badań farmaceutycznych jest tworzenie związków, które są w stanie skierować substancję czynną do chorego guza lub zakażonej komórki. Rozwijana infrastruktura ma na celu izolację, identyfikację i charakterystykę nowych naturalnie wytwarzanych biologicznie aktywnych związków (sprzężonych z peptydami lub nanosystemami) wytwarzanych w drodze organicznej syntezy chemicznej, zgodnie z najwyższymi międzynarodowymi standardami. Zdecydowana większość substancji biologicznie czynnych obecnie stosowanych w medycynie to drugorzędne metabolity mikroorganizmów roślinnych, grzybów i prokariotów lub pokrewne półsyntetyczne związki syntetyczne. Jednym z głównych celów naszych badań jest identyfikacja i scharakteryzowanie nowych substancji czynnych i metabolitów pochodzenia roślinnego, grzybowego lub drobnoustrojowego. Dzięki temu rozwojowi infrastruktury dążymy do poszerzenia możliwości odkrycia dodatkowych leczniczych i toksycznych substancji czynnych roślin oraz profilu charakterystyki związków. W trakcie badań definiujemy nie tylko substancję czynną organizmu, ale także coraz bardziej fundamentalny „metabolitowy odcisk palca” w międzynarodowej praktyce. Należy zauważyć, że zgodnie z niektórymi hipotezami większość wcześniej nieznanych substancji czynnych może być skutecznie identyfikowana i charakteryzowana tą strategią. Z podobnych powodów charakterystyka metaboliczna produktów metabolicznych drobnoustrojów żyjących w ekstremalnych warunkach jest obiecująca (zawodowy odpowiedzialny: Instytut Biologii, Zakład Organologii Roślin, Zakład Mikrobiologii). Większość biokoniugatów nadających się do terapii ukierunkowanej składa się z trzech składników; substancja czynna, kontrolująca cząsteczkę i jednostkę łączącą. W naszych badaniach staramy się tworzyć sklepy złożone, w których substancja czynna (naturalna lub syntezowana) i kontrolująca składniki peptydowe mogą być połączone ze sobą w szerokim zakresie kombinacji z opracowanymi łącznikami dwufunkcyjnymi, zwiększając zakres koniugatów odpowiednich do terapii ukierunkowanej, co może być również warunkiem spersonalizowanego gojenia. Oprócz identyfikacji i charakterystyki produkowanych z nich składników i wytworzonych z nich koniugatów, ich stabilność, metabolizm i zmiany poziomu białek wywołanych komórkami w systemach biologicznych są również niezbędne do pomiaru ich wysoce przepuszczalnej, wysoce zakłócającej platformy analitycznej (operator profesjonalny: Instytut chemii, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Powyższe dwa obszary badań wspólnie opierają się na nowo zamówionym urządzeniu UHPLC-MS/MS, który nadaje się nie tylko do prostych rutynowych analiz, ale ma również znaczny potencjał badawczy. Jakościową i ilościową analizę składników próbek można przeprowadzić przy użyciu układu (HPLC-MS/MS) związanego z chromatografią cieczową (HPLC) przeznaczonego do pobierania, umożliwiającego określenie masy o wysokiej dokładności, z detekcją masową quadrupolu i orbitrapa. Ilość badanych składników może się różnić w zależności od rzędu wielkości. System nadaje się do wykonywania ultra wydajnych badań chromatografii cieczowej (UHPLC), znacznie skracając czas pomiaru, zwiększając tym samym liczbę próbek, które można przetwarzać, i zmniejszając zużycie rozpuszczalnika. Identyfikację i kwantyfikację rozdzielonych substancji zapewnia detektor diody (190-800 nm), detekcja masowa o wysokiej rozdzielczości za pomocą hybrydowego spektrometru masowego quadrupol-orbitrap. Praca w szerokim zakresie mas (m/z 50-2000) z dużą precyzją (poniżej 5 ppm) masowymi spektrometrami umożliwiają również identyfikację strukturalną i identyfikację profilu zanieczyszczenia poprzez zapewnienie niepowtarzalnej czułości (attogram). Nagrywanie MS/MS odbywa się przez wysokoenergetyczną komórkę uderzeniową HCD, która umożliwia odtwarzalne rejestrowanie widma i bezpieczniejszą identyfikację komponentów do wyszukiwania w bibliotece. Wymienne źródła jonów (obudowa źródła jonowego API z podgrzaną jonizacją elektrosprayową – źródła jonizacji H-ESI II i APCI z systemem podwójnej destylacji) umożliwiają badanie cząsteczek o szerokiej gamie struktur. Główne wymienione cechy sprawiają, że przyrząd nadaje się do szybkiej analizy „wysokiej przepustowości” dużej liczby próbek. A (Polish)
13 August 2022
0 references
A) Presentatie van de uit te voeren taken: Het doel van het project is het verwerven en exploiteren van een reeks instrumenten die geschikt zijn voor het identificeren/karakteriseren van nieuwe natuurlijke (plant-, schimmel- en bacteriële) organische verbindingen en organische verbindingen die worden geproduceerd door chemische synthese, hun conjugaten (richtlijnende derivaten, colloïdale nanodeeltjes) en hun metabolieten, alsook voor het onderzoeken van veranderingen op eiwitniveau (proteomica) in cellen als gevolg van de invloed van verbindingen. Bij de behandeling van zowel tumor- als herinfectieziekten van microbiële oorsprong kan een belangrijke doorbraak worden gemaakt door middel van zogenaamde gerichte therapie, die de selectiviteit van werkzame stoffen verhoogt en de bijwerkingen ervan vermindert. Het gemeenschappelijke kenmerk van deze nieuwe richting van farmaceutisch onderzoek is het creëren van verbindingen die in staat zijn om de werkzame stof in de aangetaste tumor of geïnfecteerde cel te richten. De te ontwikkelen infrastructuur is gericht op de isolatie, identificatie en karakterisering van nieuwe natuurlijk geproduceerde biologisch actieve verbindingen (conjugaten met peptide en/of nanosystemen) die worden geproduceerd door organische chemische synthese, in overeenstemming met de hoogste internationale normen. De overgrote meerderheid van de biologisch werkzame stoffen die momenteel in de geneeskunde worden gebruikt, zijn secundaire metabolieten van planten, schimmels en procaryote-micro-organismen of zijn verwante halfsynthetische synthetische verbindingen. Een van de belangrijkste doelstellingen van ons onderzoek is het identificeren en karakteriseren van nieuwe werkzame stoffen en metabolieten van plantaardige, schimmel- of micro-organismen. Met deze infrastructurele ontwikkeling willen we de mogelijkheid van het ontdekken van aanvullende medicinale en toxische plantaardige werkzame stoffen en het karakteriseringsprofiel van de verbindingen verbreden. In de loop van het onderzoek definiëren we niet alleen een werkzame stof van een organisme, maar ook een steeds fundamentelere „metabolietenafdruk” in de internationale praktijk. Het is belangrijk op te merken dat, volgens sommige hypothesen, de meeste van de voorheen onbekende werkzame stoffen effectief kunnen worden geïdentificeerd en gekenmerkt door deze strategie. Om soortgelijke redenen is metabole karakterisering van metabole producten van microben die in extreme omstandigheden leven veelbelovend (professioneel verantwoordelijke: Instituut voor Biologie, Departement Plantenorganologie, Departement Microbiologie). De meeste bioconjugaten die geschikt zijn voor gerichte therapie bestaan uit drie componenten; werkzame stof, regulerend molecuul en interconnecterende eenheid. In ons onderzoek proberen we samengestelde winkels te creëren waarin de werkzame stof (natuurlijk of gesynthetiseerd) en de controle van peptide componenten kunnen worden gekoppeld in een breed scala van combinaties met de ontwikkelde bifunction linkers, waardoor het bereik van conjugaten die geschikt zijn voor gerichte therapie kan worden vergroot, wat ook een voorwaarde kan zijn voor gepersonaliseerde genezing. Naast de identificatie en karakterisering van de geproduceerde componenten en de daaruit geproduceerde conjugaten, zijn de stabiliteit, het metabolisme en veranderingen in eiwitniveau in biologische systemen ook essentieel voor het meten van hun zeer doordringbare, zeer verstorende analyseplatform (professionele operator: Instituut voor scheikunde, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). De bovengenoemde twee onderzoeksgebieden zijn gezamenlijk afhankelijk van het nieuw aangeschafte „cutting edge” UHPLC-MS/MS-apparaat, dat niet alleen geschikt is voor eenvoudige routineanalyses, maar ook een aanzienlijk onderzoekspotentieel heeft. De kwalitatieve en kwantitatieve analyse van de bestanddelen van de monsters kan worden uitgevoerd met behulp van een systeem (HPLC-MS/MS) dat is gekoppeld aan vloeistofchromatografie (HPLC) dat is ontworpen voor verkrijging, zodat de massa met een hoge nauwkeurigheid kan worden bepaald, met quadrupol- en orbitrapmassadetectie. De hoeveelheid te testen onderdelen kan variëren in orde van grootte. Het systeem is geschikt voor het uitvoeren van ultra-efficiënte vloeistofchromatografie (UHPLC) tests, waardoor de meettijd aanzienlijk wordt verkort, waardoor het aantal monsters wordt verhoogd dat kan worden verwerkt en het gebruik van oplosmiddelen wordt verminderd. De identificatie en kwantificering van gescheiden stoffen wordt geleverd door een diode array detector (190-800 nm), hoge resolutie massaspectrometrie detectie door de hybride quadrupol-orbitrap massaspectrometer. Werkend over een breed massabereik (m/z 50-2000) met hoge precisie (minder dan 5 ppm) massaspectrometers maken ook structurele identificatie en identificatie van het verontreinigingsprofiel mogelijk door het verstrekken van een unieke gevoeligheid (attogram). M... (Dutch)
13 August 2022
0 references
A) Představení úkolů, které mají být provedeny: Cílem projektu je získat a provozovat soubor nástrojů, které jsou vhodné pro identifikaci/charakterizaci nových přírodních (rostlinných, plísňových a bakteriálních) organických sloučenin a organických sloučenin produkovaných chemickou syntézou, jejich konjugátů (směrných derivátů, koloidních nanočástic) a jejich metabolitů, jakož i pro výzkum změn hladiny bílkovin (proteomiky) v buňkách v důsledku vlivu sloučenin. Při léčbě nádorových i reinfekčních onemocnění mikrobiálního původu může dojít k zásadnímu průlomu tzv. cílené terapie, která zvyšuje selektivitu účinných látek a snižuje jejich vedlejší účinky. Společným rysem tohoto nového směru farmaceutického výzkumu je tvorba sloučenin, které jsou schopny zacílit účinnou látku do postiženého nádoru nebo infikované buňky. Cílem infrastruktury, která má být vyvinuta, je izolace, identifikace a charakterizace nových přirozeně vyráběných biologicky aktivních sloučenin (konjugátů s peptidy a/nebo nanosystémy) produkovaných organickou chemickou syntézou v souladu s nejpřísnějšími mezinárodními normami. Převážná většina biologicky účinných látek, které se v současné době používají v medicíně, jsou sekundární metabolity rostlin, plísní a prokaryotových mikroorganismů nebo se jedná o příbuzné polosyntetické syntetické sloučeniny. Jedním z hlavních cílů našeho výzkumu je identifikovat a charakterizovat nové účinné látky a metabolity rostlinného, houbového nebo mikroorganismu původu. Tímto rozvojem infrastruktury se snažíme rozšířit možnost objevování dalších léčivých a toxických rostlinných účinných látek a charakterizační profil sloučenin. V průběhu výzkumu definujeme nejen účinnou látku organismu, ale také stále zásadnější „metabolitový otisk“ v mezinárodní praxi. Je důležité poznamenat, že podle některých hypotéz může být většina dříve neznámých účinných látek účinně identifikována a charakterizována touto strategií. Z podobných důvodů je slibná metabolická charakteristika metabolických produktů mikrobů žijících v extrémních podmínkách (profesionální odpovědný: Biologický ústav, Katedra rostlinné orologie, Katedra mikrobiologie). Většina biokonjugátů vhodných pro cílenou léčbu se skládá ze tří složek; účinná látka, řídící molekula a propojovací jednotka. V našem výzkumu se snažíme vytvořit sklady sloučenin, ve kterých může být účinná látka (přírodní nebo syntetizovaná) a kontrola peptidových složek propojena v široké škále kombinací s vyvinutými dvoufunkčními linkami, čímž se zvyšuje rozsah konjugátů vhodných pro cílenou terapii, což může být také předpokladem pro individuální léčení. Kromě identifikace a charakterizace vyrobených složek a z nich vyrobených konjugátů je jejich stabilita, metabolismus a změny hladiny bílkovin vyvolané buňkami v biologických systémech rovněž nezbytné pro měření jejich vysoce propustné, vysoce rušivé analytické platformy (profesionální provozovatel: Ústav chemie, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Výše uvedené dvě oblasti výzkumu se společně spoléhají na nově pořízené „ostří“ UHPLC-MS/MS zařízení, které je vhodné nejen pro jednoduché rutinní analýzy, ale má také významný výzkumný potenciál. Kvalitativní a kvantitativní analýza složek vzorků může být provedena za použití systému (HPLC-MS/MS) spojeného s kapalinovou chromatografií (HPLC) určeným pro odběr, umožňujícího stanovení vysoké přesnosti hmotnosti, s hmotnostní detekcí quadrupolu a orbitrapu. Množství zkoušených složek se může lišit podle velikosti. Systém je vhodný pro ultraúčinné zkoušky kapalinové chromatografie (UHPLC), což významně zkracuje dobu měření, čímž se zvyšuje počet vzorků, které lze zpracovat, a snižuje se používání rozpouštědel. Identifikace a kvantifikace separovaných látek je zajištěna detektorem diodového pole (190–800 nm), hmotnostní spektrometrickou detekcí s vysokým rozlišením hybridním hmotnostním spektrometrem quadrupol-orbitrap. Provoz v širokém hmotnostním rozsahu (m/z 50–2000) s vysoce přesnými hmotnostními spektrometry (méně než 5 ppm) rovněž umožňuje identifikaci struktury a identifikaci profilu znečištění tím, že poskytuje jedinečnou citlivost (attogram). Záznam MS/MS je zajišťován vysokoenergetickou rázovou buňkou HCD, která umožňuje reprodukovatelný záznam spektra a bezpečnější identifikaci komponent pro vyhledávání v knihovně. Výměnné iontové zdroje (pouzdro iontového zdroje API s vyhřívanou elektrosprayovou ionizací – H-ESI II a APCI ionizační zdroje s duální destilační soustavou) umožňují vyšetření molekul široké škály struktur. Hlavní uvedené vlastnosti činí přístroj vhodný pro rychlou „vysokou propustnost“ analýzy velkého počtu vzorků. A (Czech)
13 August 2022
0 references
A) iepazīstināšana ar veicamajiem uzdevumiem: Projekta mērķis ir iegūt un izmantot instrumentu kopumu, kas ir piemērots jaunu dabisko (augu, sēnīšu un baktēriju) organisko savienojumu un organisko savienojumu, kas iegūti ķīmiskā sintēzē, to konjugātu (direktīvās atvasinājumu, koloidālo nanodaļiņu) un to metabolītu identificēšanai/raksturošanai, kā arī proteīnu līmeņa izmaiņu (proteomikas) izpētei šūnās savienojumu ietekmes dēļ. Ārstējot gan audzējus, gan mikrobu izcelsmes atkārtotas infekcijas slimības, būtiskus panākumus var panākt ar tā saukto virzīto terapiju, kas palielina aktīvo vielu selektivitāti un samazina to blakusparādības. Šī jaunā farmācijas pētniecības virziena kopējā iezīme ir tādu savienojumu radīšana, kas spēj virzīt aktīvo vielu skartajā audzējā vai inficētajā šūnā. Attīstāmās infrastruktūras mērķis ir izolēt, identificēt un raksturot jaunus dabiski ražotus bioloģiski aktīvus savienojumus (konjugātus ar peptīdiem un/vai nanosistēmām), kas iegūti organiskās ķīmiskās sintēzes ceļā, saskaņā ar augstākajiem starptautiskajiem standartiem. Lielākā daļa bioloģiski aktīvo vielu, ko pašlaik izmanto medicīnā, ir augu, sēnīšu un prokarota mikroorganismu sekundārie metabolīti vai ir saistīti pussintētiski sintētiski savienojumi. Viens no galvenajiem mūsu pētījumu mērķiem ir identificēt un raksturot jaunas aktīvās vielas un augu, sēnīšu vai mikroorganismu izcelsmes metabolītus. Ar šo infrastruktūras attīstību mūsu mērķis ir paplašināt iespēju atklāt papildu ārstnieciskās un toksiskās augu aktīvās vielas un savienojumu raksturojošo profilu. Pētījumu gaitā mēs definējam ne tikai organisma aktīvo vielu, bet arī arvien būtiskāko “metabolīta pirkstu nospiedumu” starptautiskajā praksē. Ir svarīgi atzīmēt, ka saskaņā ar dažām hipotēzēm lielāko daļu iepriekš nezināmo aktīvo vielu var efektīvi identificēt un raksturot ar šo stratēģiju. Līdzīgu iemeslu dēļ ekstremālos apstākļos dzīvojošu mikrobu vielmaiņas produktu vielmaiņas raksturojums ir daudzsološs (profesionāls atbildīgs: Institūts Bioloģijas, Department of Plant Organology, Department of Microbiology). Lielākā daļa biokonjugātu, kas piemēroti mērķtiecīgai terapijai, sastāv no trim komponentiem; aktīvā viela, kontrolējot molekulu un savienojošo vienību. Mūsu pētījumos mēs cenšamies izveidot savienojumu veikalus, kuros aktīvā viela (dabiskā vai sintezētā) un peptīdu sastāvdaļas var tikt savienotas kopā ar dažādām kombinācijām ar izstrādātajiem divfunkciju linkiem, palielinot konjugātu klāstu, kas piemēroti mērķtiecīgai terapijai, kas var būt arī priekšnoteikums personalizētai dziedināšanai. Papildus ražoto komponentu un no tiem iegūto konjugātu identifikācijai un raksturošanai to stabilitāte, metabolisms un šūnu izraisītas olbaltumvielu līmeņa izmaiņas bioloģiskajās sistēmās ir būtiskas arī to ļoti caurlaidīgās, ļoti graujošās analītiskās platformas mērīšanai (profesionāls operators: Ķīmijas institūts, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Iepriekš minētās divas pētniecības jomas kopīgi paļaujas uz nesen iegādāto “progresīvo” UHPLC-MS/MS ierīci, kas ir ne tikai piemērota vienkāršai regulārai analīzei, bet tai ir arī ievērojams pētniecības potenciāls. Paraugu komponentu kvalitatīvo un kvantitatīvo analīzi var veikt, izmantojot sistēmu (HPLC-MS/MS), kas saistīta ar šķidruma hromatogrāfiju (HPLC), kas paredzēta ieguvei, ļaujot noteikt augstas precizitātes masu, ar četrpola un orbītas masas noteikšanu. Testējamo sastāvdaļu daudzums var atšķirties atkarībā no lieluma. Sistēma ir piemērota īpaši efektīvu šķidrumu hromatogrāfijas (UHPLC) testu veikšanai, ievērojami saīsinot mērījumu laiku, tādējādi palielinot apstrādājamo paraugu skaitu un samazinot šķīdinātāju izmantošanu. Atsevišķu vielu identifikāciju un kvantifikāciju nodrošina ar diožu bloku detektoru (190–800 nm), augstas izšķirtspējas masspektrometrijas noteikšanu ar hibrīda četrpola orbīta masspektrometru. Darbojoties plašā masas diapazonā (m/z 50–2000) ar augstas precizitātes (mazāk par 5 ppm) masspektrometriem, ir iespējama arī konstrukcijas identifikācija un piesārņojuma profila identifikācija, nodrošinot unikālu jutību (attogrammu). MS/MS ierakstu nodrošina augstas enerģijas HCD triecienelements, kas ļauj reproducējamus spektra ierakstus un drošāku komponentu identifikāciju bibliotēkas meklēšanai. Maināmie jonu avoti (API jonu avota korpuss ar apsildāmu elektrosmidzināšanas jonizāciju — H-ESI II un APCI jonizācijas avoti ar divkāršu destilācijas sistēmu) ļauj pārbaudīt dažādu struktūru molekulas. Galvenās uzskaitītās īpašības padara instrumentu piemērotu ātrai “augstas caurlaidspējas” analīzei lielam paraugu skaitam. A (Latvian)
13 August 2022
0 references
A) Cur i láthair na gcúraimí atá le cur chun feidhme: Is é is aidhm don tionscadal sraith ionstraimí a fháil agus a oibriú atá oiriúnach chun comhdhúile orgánacha (planda, fungais agus baictéarach) nua agus comhdhúile orgánacha arna dtáirgeadh ag sintéis cheimiceach, a gcomhchuingigh (díorthaigh threocha, nanacháithníní collóideacha) agus a meitibilítí a shainaithint/a shaintréithiú, chomh maith le taighde a dhéanamh ar athruithe ar leibhéal próitéine (próitéamaíocht) i gcealla mar gheall ar thionchar comhdhúile. I gcóireáil na galair idir siadaí agus ath-thógálacha de bhunadh miocróbach, is féidir dul chun cinn mór a dhéanamh trí theiripe dírithe mar a thugtar air, rud a mhéadaíonn roghnaíocht substaintí gníomhacha agus a laghdaíonn a gcuid fo-iarsmaí. Is í an ghné choiteann den treo nua seo de thaighde cógaisíochta ná comhdhúile a chruthú atá in ann díriú ar an tsubstaint ghníomhach isteach sa séa nó sa chill ionfhabhtaithe atá buailte. Is é is aidhm don bhonneagar atá le forbairt comhdhúile nua atá gníomhach ó thaobh na bitheolaíochta de (comhchuingigh le peiptíd agus/nó nanachórais) a tháirgtear trí shintéis cheimiceach orgánach a leithlisiú, a shainaithint agus a thréithriú, i gcomhréir leis na caighdeáin idirnáisiúnta is airde. Is meitibilítí tánaisteacha plandaí, fungais agus miocrorgánach procaryote iad formhór mór na substaintí atá gníomhach ó thaobh na bitheolaíochta de faoi láthair nó is comhdhúile sintéiseacha leathshintéiseacha iad. Ceann de phríomhchuspóirí ár dtaighde is ea substaintí gníomhacha nua agus meitibilítí de bhunús plandaí, fungais nó miocrorgánach a shainaithint agus a thréithriú. Leis an bhforbairt bonneagair seo, tá sé mar aidhm againn leathnú a dhéanamh ar an bhféidearthacht substaintí gníomhacha plandaí míochaine agus tocsaineacha breise a aimsiú agus próifíl thréithriú na gcomhdhúl. Le linn an taighde, ní hamháin go sainmhínímid substaint ghníomhach orgánach, ach freisin “méarlorg meitibilíte” atá ag éirí níos bunúsaí sa chleachtas idirnáisiúnta. Tá sé tábhachtach a thabhairt faoi deara, de réir roinnt hipitéisí, gur féidir an chuid is mó de na substaintí gníomhacha nach rabhthas ar an eolas fúthu roimhe seo a shainaithint go héifeachtach agus a shaintréithriú ag an straitéis seo. Ar chúiseanna den chineál céanna, tá gealladh faoi thréithriú meitibileach táirgí meitibileach de mhiocróib atá ina gcónaí i ndálaí foircneacha (freagracht ghairmiúil: Institiúid na Bitheolaíochta, An Roinn Organology Plandaí, Roinn na Micribhitheolaíochta). Tá trí chomhpháirt i bhformhór na mbithchuingeach atá oiriúnach do theiripe spriocdhírithe; substaint ghníomhach, móilín a rialú agus aonad idirnasctha. In ár dtaighde iarracht a chruthú siopaí cumaisc inar féidir leis an tsubstaint ghníomhach (nádúrtha nó sintéisithe) agus a rialú comhpháirteanna peptide a nascadh le chéile i raon leathan de teaglamaí leis na nascóirí bifunction forbartha, méadú ar an raon comhchuingigh oiriúnach le haghaidh teiripe spriocdhírithe, is féidir a bheith chomh maith réamhriachtanais le haghaidh leighis pearsanta. Chomh maith leis na comhpháirteanna a tháirgtear agus na comhchuingigh a tháirgtear uathu a shainaithint agus a thréithriú, tá a gcobhsaíocht, a meitibileacht agus a n-athruithe ar leibhéal próitéine de bharr ceall i gcórais bhitheolaíocha fíor-riachtanach freisin chun a n-ardán anailíseach thar a bheith tréscaoilteach a thomhas (oibreoir gairmiúil: Institiúid na ceimice, Grúpa Taighde Peptidchemical MTA-ELTE). An dá réimse taighde thuas ag brath go comhpháirteach ar an nua-soláthraithe “gearradh imeall” UHPLC-MS/MS gléas, atá ní hamháin oiriúnach le haghaidh anailísí gnáthamh simplí, ach freisin a bhfuil poitéinseal taighde suntasach. Féadfar anailís cháilíochtúil agus chainníochtúil a dhéanamh ar chomhpháirteanna na samplaí trí úsáid a bhaint as córas (HPLC-MS/MS) a bhaineann le crómatagrafaíocht leachta (HPLC) atá deartha le haghaidh soláthair, lenar féidir mais ardchruinnis a chinneadh, le brath maise quadrupol agus orbitrap. D’fhéadfadh cainníocht na gcomhpháirteanna atá le tástáil athrú de réir ord méide. Tá an córas oiriúnach chun tástálacha crómatagrafaíochta leachtach ultra-éifeachtach (UHPLC) a dhéanamh, ag giorrú go suntasach an t-am tomhais, rud a mhéadaíonn líon na samplaí is féidir a phróiseáil agus úsáid tuaslagóirí a laghdú. Soláthraítear sainaithint agus cainníochtú substaintí deighilte le brathadóir eagair dé-óide (190-800 nm), brath mais-speictriméadrachta ardtaifigh leis an mais-speictriméadar ceathruapach-nóbatrap hibrideach. Ach oibriú thar raon leathan mais-speictriméadar (m/z 50-2000) ag a bhfuil mais-speictriméadair ardchruinnis (níos lú ná 5 ppm) is féidir próifíl truaillithe a shainaithint trí íogaireacht uathúil (attogram) a sholáthar. Cuirtear taifeadadh MS/MS ar fáil trí chill tionchair HCD ardfhuinnimh, a cheadaíonn taifeadadh speictrim in-atáirgthe agus sainaithint comhpháirteanna níos sláine le haghaidh cuardach leabharlainne. Ceadaíonn foinsí ian idirmhalartaithe (tithí... (Irish)
13 August 2022
0 references
A) Predstavitev nalog, ki jih je treba izvesti: Cilj projekta je pridobiti in upravljati vrsto instrumentov, ki so primerni za identifikacijo/opredelitev novih naravnih (rastlinskih, glivičnih in bakterijskih) organskih spojin in organskih spojin, proizvedenih s kemično sintezo, njihovih konjugatov (direktivni derivati, koloidni nanodelci) in njihovih metabolitov ter za raziskovanje sprememb na ravni beljakovin (proteomika) v celicah zaradi vpliva spojin. Pri zdravljenju tumorskih in ponovno nalezljivih bolezni mikrobnega izvora lahko pride do pomembnega preboja s tako imenovano usmerjeno terapijo, ki poveča selektivnost zdravilnih učinkovin in zmanjša njihove neželene učinke. Skupna značilnost te nove smeri farmacevtskih raziskav je ustvarjanje spojin, ki lahko usmerijo zdravilno učinkovino v prizadet tumor ali okuženo celico. Infrastruktura, ki jo je treba razviti, je namenjena izolaciji, identifikaciji in karakterizaciji novih naravno proizvedenih biološko aktivnih spojin (konjugatov s peptidi in/ali nanosistemi), proizvedenih z organsko kemično sintezo, v skladu z najvišjimi mednarodnimi standardi. Velika večina biološko aktivnih snovi, ki se trenutno uporabljajo v medicini, so sekundarni metaboliti rastlin, gliv in prokariotnih mikroorganizmov ali so sorodne polsintetične sintetične spojine. Eden od glavnih ciljev naših raziskav je opredeliti in opredeliti nove aktivne snovi in metabolite rastlinskega, glivičnega ali mikroorganizmskega izvora. S tem infrastrukturnim razvojem želimo razširiti možnost odkrivanja dodatnih zdravilnih in toksičnih rastlinskih zdravilnih učinkovin ter karakterizacijskega profila spojin. V okviru raziskav opredeljujemo ne le aktivno snov organizma, temveč tudi vse bolj temeljno „presnovni odtis“ v mednarodni praksi. Pomembno je opozoriti, da je po nekaterih hipotezah večino prej neznanih aktivnih snovi mogoče učinkovito opredeliti in označiti s to strategijo. Iz podobnih razlogov je obetavna presnovna karakterizacija metabolnih produktov mikrobov, ki živijo v ekstremnih pogojih (strokovna odgovornost: Inštitut za biologijo, Oddelek za rastlinsko organologijo, Oddelek za mikrobiologijo). Večina biokonjugatov, primernih za ciljno zdravljenje, je sestavljena iz treh komponent; zdravilna učinkovina, nadzor molekule in povezovalna enota. V naši raziskavi poskušamo ustvariti zaloge spojin, v katerih se lahko zdravilna učinkovina (naravna ali sintetizirana) in nadzor peptidnih komponent povežeta v širokem spektru kombinacij z razvitimi bifunkcionalnimi vezniki, kar povečuje obseg konjugatov, primernih za ciljno zdravljenje, kar je lahko tudi predpogoj za osebno zdravljenje. Poleg identifikacije in karakterizacije proizvedenih sestavin in konjugatov, proizvedenih iz njih, so njihova stabilnost, presnova in spremembe ravni beljakovin v bioloških sistemih, ki jih povzročajo celice, prav tako bistvenega pomena za merjenje njihove zelo prepustne, zelo moteče analitične platforme (strokovni izvajalec: Inštitut za kemijo, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Zgoraj navedeni raziskovalni področji se skupaj opirata na novo naročeno napravo UHPLC-MS/MS, ki ni primerna le za preproste rutinske analize, temveč ima tudi velik raziskovalni potencial. Kvalitativna in kvantitativna analiza sestavin vzorcev se lahko izvede s sistemom (HPLC-MS/MS), povezanim s tekočinsko kromatografijo (HPLC), zasnovanim za pridobivanje, ki omogoča določanje mase z visoko natančnostjo, s kvadrupolom in detekcijo mase orbitrapa. Količina sestavnih delov, ki jih je treba preskusiti, se lahko spreminja glede na velikost. Sistem je primeren za izvajanje ultra-učinkovitih testov tekočinske kromatografije (UHPLC), s čimer se znatno skrajša čas merjenja, s čimer se poveča število vzorcev, ki jih je mogoče obdelati, in zmanjša uporaba topila. Identifikacijo in količinsko opredelitev ločenih snovi zagotavlja detektor diod (190–800 nm) z masno spektrometrijo visoke ločljivosti z masnim spektrometrijo hibridnega kvadrupol-orbitrapa. Delovanje v širokem masnem območju (m/z 50–2000) z masnimi spektrometri z visoko natančnostjo (manj kot 5 ppm) omogoča tudi strukturno identifikacijo in identifikacijo profila onesnaževanja z zagotavljanjem edinstvene občutljivosti (attogram). Snemanje MS/MS zagotavlja visokoenergijska celica za vpliv HCD, ki omogoča ponovljivo snemanje spektra in varnejšo identifikacijo komponent za iskanje v knjižnici. Zamenljivi ionski viri (ohišje virov ionov API z ogrevano elektrospray ionizacijo – H-ESI II in viri ionizacije APCI z dvojnim destilacijskim sistemom) omogočajo pregled molekul različnih struktur. Zaradi glavnih značilnosti je instrument primeren za hitro analizo velikega števila vzorcev. A (Slovenian)
13 August 2022
0 references
A) Presentación de las tareas que deben llevarse a cabo: El objetivo del proyecto es adquirir y operar un conjunto de instrumentos que sean adecuados para identificar/caracterizar nuevos compuestos orgánicos naturales (plantas, fúngicos y bacterianos) y compuestos orgánicos producidos por síntesis química, sus conjugados (derivados directos, nanopartículas coloidales) y sus metabolitos, así como para investigar cambios a nivel de proteínas (proteomics) en las células debido a la influencia de los compuestos. En el tratamiento de las enfermedades tumorales y reinfecciosas de origen microbiano, se puede lograr un gran avance mediante la llamada terapia dirigida, que aumenta la selectividad de las sustancias activas y reduce sus efectos secundarios. La característica común de esta nueva dirección de la investigación farmacéutica es la creación de compuestos que son capaces de dirigir el principio activo en el tumor afectado o célula infectada. La infraestructura que se desarrollará tiene por objeto el aislamiento, la identificación y la caracterización de nuevos compuestos biológicamente activos producidos de forma natural (conjugados con péptidos o nanosistemas) producidos por la síntesis química orgánica, en consonancia con los más altos estándares internacionales. La gran mayoría de las sustancias biológicamente activas que se utilizan actualmente en la medicina son metabolitos secundarios de plantas, hongos y microorganismos procaryote o son compuestos sintéticos semisintéticos relacionados. Uno de los principales objetivos de nuestra investigación es identificar y caracterizar nuevas sustancias activas y metabolitos de origen vegetal, fúngico o microorganismo. Con este desarrollo de infraestructuras, buscamos ampliar la posibilidad de descubrir sustancias activas de plantas medicinales y tóxicas adicionales y el perfil de caracterización de los compuestos. En el curso de la investigación, definimos no solo una sustancia activa de un organismo, sino también una «huella de metabolito» cada vez más fundamental en la práctica internacional. Es importante señalar que, según algunas hipótesis, la mayoría de las sustancias activas previamente desconocidas pueden identificarse y caracterizarse eficazmente por esta estrategia. Por razones similares, la caracterización metabólica de los productos metabólicos de los microbios que viven en condiciones extremas es prometedora (profesional responsable: Instituto de Biología, Departamento de Organología Vegetal, Departamento de Microbiología. La mayoría de los bioconjugados adecuados para la terapia dirigida consisten en tres componentes; sustancia activa, molécula de control y unidad de interconexión. En nuestra investigación intentamos crear almacenes compuestos en los que el principio activo (natural o sintetizado) y el control de los componentes del péptido pueden vincularse en una amplia gama de combinaciones con los enlaces bifuncionales desarrollados, aumentando la gama de conjugados adecuados para la terapia dirigida, lo que también puede ser un requisito previo para la curación personalizada. Además de la identificación y caracterización de los componentes producidos y de los conjugados producidos a partir de ellos, su estabilidad, metabolismo y cambios a nivel de proteínas inducidos por células en los sistemas biológicos también son esenciales para la medición de su plataforma analítica altamente permeable y altamente disruptiva (operador profesional: Instituto de Química, Grupo de Investigación Peptidquímica MTA-ELTE). Las dos áreas de investigación mencionadas se basan conjuntamente en el dispositivo UHPLC-MS/MS recientemente adquirido, que no solo es adecuado para análisis rutinarios simples, sino que también tiene un potencial de investigación significativo. El análisis cualitativo y cuantitativo de los componentes de las muestras podrá realizarse utilizando un sistema (HPLC-MS/MS) asociado a la cromatografía líquida (HPLC) diseñado para la obtención, que permita la determinación de la masa de alta precisión, con detección de la masa de quadrupol y orbitrap. La cantidad de componentes a probar puede variar según el orden de magnitud. El sistema es adecuado para realizar pruebas de cromatografía de líquidos ultraeficientes (UHPLC), acortando significativamente el tiempo de medición, aumentando así el número de muestras que pueden procesarse y reduciendo el uso de disolventes. La identificación y cuantificación de sustancias separadas se proporciona mediante un detector de conjuntos de diodos (190-800 nm), detección de espectrometría de masa de alta resolución por el espectrómetro de masas híbrido de quadrupol-orbitrap. El funcionamiento en un amplio rango de masas (m/z 50-2000) con espectrómetros de masa de alta precisión (menos de 5 ppm) también permite la identificación estructural y el perfil de contaminación proporcionando una sensibilidad única (attograma). La grabación MS/MS es proporcionada por una célula de impacto HCD de alta energía, que permit... (Spanish)
13 August 2022
0 references
А) Представяне на задачите, които трябва да бъдат изпълнени: Целта на проекта е да се придобие и експлоатира набор от инструменти, които са подходящи за идентифициране/характеризиране на нови естествени (растителни, гъбични и бактериални) органични съединения и органични съединения, произведени чрез химичен синтез, техните конюгати (директивни производни, колоидни наночастици) и техните метаболити, както и за изследване на промените на протеиновото ниво (протеомика) в клетките поради влиянието на съединенията. При лечението както на туморни, така и на реинфекциозни заболявания с микробен произход, може да се направи голям пробив чрез така наречената насочена терапия, която увеличава селективността на активните вещества и намалява техните странични ефекти. Общата характеристика на тази нова посока на фармацевтичните изследвания е създаването на съединения, които са в състояние да прицелят активното вещество в засегнатия тумор или инфектирана клетка. Инфраструктурата, която ще бъде разработена, има за цел изолирането, идентифицирането и характеризирането на нови естествено произведени биологично активни съединения (конюгати с пептид и/или наносистеми), произведени чрез органичен химичен синтез, в съответствие с най-високите международни стандарти. По-голямата част от биологично активните вещества, които понастоящем се използват в медицината, са вторични метаболити на растения, гъбички и прокариотни микроорганизми или са свързани полусинтетични синтетични съединения. Една от основните цели на нашето изследване е да идентифицираме и характеризираме нови активни вещества и метаболити с растителен, гъбичен или микроорганичен произход. С това инфраструктурно развитие се стремим да разширим възможността за откриване на допълнителни лечебни и токсични растителни активни вещества и характеризационния профил на съединенията. В хода на изследванията определяме не само активно вещество на организма, но и все по-фундаментален „метаболит“ в международната практика. Важно е да се отбележи, че според някои хипотези повечето от неизвестните преди това активни вещества могат ефективно да бъдат идентифицирани и характеризирани с тази стратегия. Поради подобни причини метаболитната характеристика на метаболитните продукти на микробите, живеещи в екстремни условия, е обещаваща (професионална отговорна: Институт по биология, Катедра по растителна органиология, Катедра по микробиология. По-голямата част от биоконюгатите, подходящи за целева терапия, се състоят от три компонента; активно вещество, контролираща молекула и свързваща единица. В нашите изследвания се опитваме да създадем съставни магазини, в които активното вещество (естествено или синтезирано) и контролиращите пептидни компоненти могат да бъдат свързани заедно в широк спектър от комбинации с разработените двуфункционални свързващи вещества, увеличавайки гамата от конюгати, подходящи за целева терапия, което също може да бъде предпоставка за персонализирано лечение. В допълнение към идентифицирането и характеризирането на произведените компоненти и произведените от тях конюгати, техните стабилност, метаболизъм и предизвикани от клетките промени на протеиновото ниво в биологичните системи също са от съществено значение за измерването на тяхната високопропусклива, силно разрушителна аналитична платформа (професионален оператор: Институт по химия, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Горепосочените две научноизследователски области съвместно разчитат на новозареденото устройство UHPLC-MS/MS, което е подходящо не само за обикновени рутинни анализи, но и има значителен изследователски потенциал. Качественият и количественият анализ на компонентите на пробите може да се извършва с помощта на система (HPLC-MS/MS), свързана с течна хроматография (HPLC), проектирана за доставка, позволяваща определяне на масата с висока точност, с откриване на квадрупол и орбитапна маса. Количеството на компонентите, които трябва да бъдат изпитвани, може да варира в зависимост от големината. Системата е подходяща за извършване на свръхефективни тестове за течна хроматография (UHPLC), като значително се съкращава времето за измерване, като по този начин се увеличава броят на пробите, които могат да бъдат обработени, и се намалява използването на разтворители. Идентифицирането и количественото определяне на отделените вещества се осигурява от детектор с диодна решетка (190—800 nm), масспектрометричен детектор с висока разделителна способност от хибридния квадрупол-орбитрап масспектрометър. Работещи в широк обхват на масата (m/z 50—2000) с висока точност (по-малко от 5 ppm) масспектрометри също дават възможност за идентификация на конструкцията и идентифициране на профила на замърсяване чрез осигуряване на уникална чувствителност (аттограма). Записът на MS/MS се осигурява от високоенергийна HCD ударна клетка, която позволява възпроизводимо записване на спектъра и по-сигурна идентификация на компонентите за търсене в библиотеката. Взаимозаменяемите йонни източници (съдържание на източник на ... (Bulgarian)
13 August 2022
0 references
A) Preżentazzjoni tal-kompiti li għandhom jiġu implimentati: L-għan tal-proġett huwa li jakkwista u jopera sett ta’ strumenti li huma adattati għall-identifikazzjoni/karatterizzazzjoni ta’ komposti organiċi u komposti organiċi naturali (tal-pjanti, fungali u batteriċi) ġodda prodotti permezz ta’ sinteżi kimika, il-konjugati tagħhom (derivattivi diretti, nanopartikoli kollojdali) u l-metaboliti tagħhom, kif ukoll għar-riċerka ta’ bidliet fil-livell tal-proteini (proteomiċi) fiċ-ċelloli minħabba l-influwenza tal-komposti. Fit-trattament kemm ta’ mard tat-tumur kif ukoll ta’ mard li jerġa’ jinfetta mill-ġdid ta’ oriġini mikrobjali, jista’ jsir progress kbir permezz tal-hekk imsejħa terapija diretta, li żżid is-selettività tas-sustanzi attivi u tnaqqas l-effetti sekondarji tagħhom. Il-karatteristika komuni ta’ din id-direzzjoni ġdida tar-riċerka farmaċewtika hija l-ħolqien ta’ komposti li jistgħu jimmiraw is-sustanza attiva lejn it-tumur affettwat jew iċ-ċellola infettata. L-infrastruttura li għandha tiġi żviluppata timmira għall-iżolament, l-identifikazzjoni u l-karatterizzazzjoni ta’ komposti attivi bijoloġikament ġodda prodotti b’mod naturali (konjugati b’peptidi u/jew nanosistemi) prodotti minn sinteżi kimika organika, f’konformità mal-ogħla standards internazzjonali. Il-maġġoranza l-kbira tas-sustanzi bijoloġikament attivi attwalment użati fil-mediċina huma metaboliti sekondarji tal-pjanti, fungi u mikroorganiżmi procaryote jew huma komposti sintetiċi semisintetiċi relatati. Wieħed mill-għanijiet ewlenin tar-riċerka tagħna huwa li jiġu identifikati u kkaratterizzati sustanzi attivi ġodda u l-metaboliti ta ‘l-oriġini tal-pjanti, fungali jew mikro-organiżmu. B’dan l-iżvilupp infrastrutturali, għandna l-għan li nwessgħu l-possibbiltà li niskopru sustanzi attivi mediċinali u tossiċi addizzjonali tal-pjanti u l-profil tal-karatterizzazzjoni tal-komposti. Matul ir-riċerka, aħna niddefinixxu mhux biss sustanza attiva ta’ organiżmu, iżda wkoll “metabolita tal-marki tas-swaba’” dejjem aktar fundamentali fil-prattika internazzjonali. Huwa importanti li wieħed jinnota li, skont xi ipoteżijiet, il-biċċa l-kbira tas-sustanzi attivi li ma kinux magħrufa qabel jistgħu jiġu identifikati b’mod effettiv u kkaratterizzati minn din l-istrateġija. Għal raġunijiet simili, il-karatterizzazzjoni metabolika ta’ prodotti metaboliċi ta’ mikrobi li jgħixu f’kundizzjonijiet estremi hija promettenti (professjonali responsabbli: Istitut tal-Bijoloġija, Dipartiment tal-Pjanti Organoloġija, Dipartiment tal-Mikrobijoloġija). Il-maġġoranza tal-bijokonjugati adattati għal terapija mmirata jikkonsistu fi tliet komponenti; is-sustanza attiva, il-molekula ta’ kontroll u l-unità ta’ interkonnessjoni. Fir-riċerka tagħna nippruvaw noħolqu ħwienet komposti li fihom is-sustanza attiva (naturali jew sintetizzati) u l-kontroll tal-komponenti tal-peptide jistgħu jintrabtu flimkien f’firxa wiesgħa ta ‘kombinazzjonijiet mal-linkers bifunzjonali żviluppati, iżidu l-firxa ta’ konjugati adattati għal terapija mmirata, li tista ‘wkoll tkun prerekwiżit għall-fejqan personalizzat. Minbarra l-identifikazzjoni u l-karatterizzazzjoni tal-komponenti prodotti u l-konjugati prodotti minnhom, l-istabbiltà, il-metaboliżmu u l-bidliet fil-livell tal-proteini indotti miċ-ċelloli fis-sistemi bijoloġiċi huma essenzjali wkoll għall-kejl tal-pjattaforma analitika tagħhom permeabbli ħafna u ta’ tfixkil kbir (operatur professjonali: Istitut tal-kimika, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Iż-żewġ oqsma ta’ riċerka ta’ hawn fuq jiddependu b’mod konġunt fuq l-apparat “cut edge” li għadu kemm ġie akkwistat UHPLC-MS/MS, li mhux biss huwa adattat għal analiżi sempliċi ta’ rutina, iżda għandu wkoll potenzjal sinifikanti ta’ riċerka. Analiżi kwalitattiva u kwantitattiva tal-komponenti tal-kampjuni tista’ titwettaq bl-użu ta’ sistema (HPLC-MS/MS) assoċjata ma’ kromatografija likwida (HPLC) iddisinjata għall-ksib, li tippermetti determinazzjoni tal-massa ta’ preċiżjoni għolja, bi quadrupol u detezzjoni tal-massa ta’ orbitrap. Il-kwantità tal-komponenti li għandhom jiġu ttestjati tista’ tvarja skont l-ordni tal-kobor. Is-sistema hija adattata għat-twettiq ta’ testijiet tal-kromatografija likwida ultra-effiċjenti (UHPLC), li jqassru b’mod sinifikanti l-ħin tal-kejl, u b’hekk jiżdied in-numru ta’ kampjuni li jistgħu jiġu pproċessati u jitnaqqas l-użu tas-solventi. L-identifikazzjoni u l-kwantifikazzjoni ta’ sustanzi separati hija pprovduta permezz ta’ ditekter diode array (190–800 nm), detezzjoni ta’ spettrometrija tal-massa b’riżoluzzjoni għolja permezz tal-ispettrometru tal-massa ta’ quadrupol-orbitrap ibridu. L-operazzjoni fuq firxa wiesgħa ta’ massa (m/z 50–2000) bi spettrometri tal-massa ta’ preċiżjoni għolja (inqas minn 5 ppm) tippermetti wkoll l-identifikazzjoni strutturali u l-identifikazzjoni tal-profil tat-tniġġis billi tipprovdi sensittività unika (attogramma). Ir-reġistrazzjoni tal-SM/MS hija pprovduta minn ċellula ta’ impatt HCD ta’ enerġija għolja, li tippermetti reġ... (Maltese)
13 August 2022
0 references
A) Apresentação das tarefas a executar: O objetivo do projeto é adquirir e operar um conjunto de instrumentos que são adequados para identificar/caracterizar novos compostos orgânicos naturais (plantas, fúngicas e bacterianas) e compostos orgânicos produzidos por síntese química, seus conjugados (derivados diretos, nanopartículas coloidal) e seus metabolitos, bem como para pesquisar alterações do nível de proteína (proteômica) nas células devido à influência dos compostos. No tratamento de doenças tumorais e reinfecciosas de origem microbiana, um avanço importante pode ser feito pela chamada terapia dirigida, o que aumenta a seletividade das substâncias ativas e reduz os seus efeitos colaterais. A característica comum desta nova direção da investigação farmacêutica é a criação de compostos capazes de direcionar a substância ativa para o tumor afetado ou para a célula infetada. A infraestrutura a desenvolver visa o isolamento, a identificação e a caracterização de novos compostos biologicamente ativos produzidos naturalmente (conjugados com peptídeos e/ou nanosistemas) produzidos por síntese química orgânica, em conformidade com os mais elevados padrões internacionais. A grande maioria das substâncias biologicamente ativas atualmente utilizadas em medicina são metabolitos secundários de plantas, fungos e microrganismos de procarioto ou são compostos sintéticos semissintéticos relacionados. Um dos principais objetivos da nossa investigação é identificar e caracterizar novas substâncias ativas e metabolitos de origem vegetal, fúngica ou microrganismo. Com este desenvolvimento infraestrutural, pretendemos ampliar a possibilidade de descobrir substâncias ativas medicinais e tóxicas adicionais de plantas e o perfil de caracterização dos compostos. No decorrer da pesquisa, definimos não só uma substância ativa de um organismo, mas também uma «impressão digital metabolita» cada vez mais fundamental na prática internacional. É importante notar que, de acordo com algumas hipóteses, a maioria das substâncias ativas anteriormente desconhecidas pode ser efetivamente identificada e caracterizada por essa estratégia. Por razões semelhantes, a caracterização metabólica de produtos metabólicos de micróbios que vivem em condições extremas é promissora (profissional responsável: Instituto de Biologia, Departamento de Organização Vegetal, Departamento de Microbiologia). A maioria dos bioconjugados adequados para terapia direcionada consiste em três componentes; substância ativa, molécula de controlo e unidade de interligação. Em nossa pesquisa, tentamos criar lojas compostas nas quais a substância ativa (natural ou sintetizada) e os componentes peptídicos de controle podem ser ligados em uma ampla gama de combinações com os ligadores bifuncionais desenvolvidos, aumentando a gama de conjugados adequados para terapia direcionada, o que também pode ser um pré-requisito para a cura personalizada. Além da identificação e caracterização dos componentes produzidos e dos conjugados produzidos a partir deles, a sua estabilidade, metabolismo e alterações do nível de proteínas induzidas por células nos sistemas biológicos são também essenciais para a medição da sua plataforma analítica altamente permeável e altamente disruptiva (operador profissional: Instituto de Química, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). As duas áreas de investigação acima referidas contam conjuntamente com o dispositivo UHPLC-MS/MS recém-adquirido, que não só é adequado para análises de rotina simples, mas também tem um potencial de investigação significativo. A análise qualitativa e quantitativa dos componentes das amostras pode ser efetuada através de um sistema (HPLC-MS/MS) associado à cromatografia líquida (HPLC) concebido para a colheita, permitindo a determinação da massa de elevada precisão, com deteção de quadrupol e de massa orbitrap. A quantidade de componentes a testar pode variar por ordem de magnitude. O sistema é adequado para a realização de testes de cromatografia líquida ultraeficiente (UHPLC), reduzindo significativamente o tempo de medição, aumentando assim o número de amostras que podem ser processadas e reduzindo o uso de solventes. A identificação e quantificação de substâncias separadas é fornecida por um detetor de díodos (190-800 nm), deteção de espetrometria de massa de alta resolução pelo espectrômetro de massa híbrido quadrupol-orbitrap. Operando em uma ampla faixa de massa (m/z 50-2000) com espectrômetros de massa de alta precisão (menos de 5 ppm) também permitem a identificação estrutural e a identificação do perfil de poluição, fornecendo uma sensibilidade única (attograma). A gravação MS/MS é fornecida por uma célula de impacto HCD de alta energia, que permite a gravação de espetro reprodutível e a identificação de componentes mais segura para pesquisa na biblioteca. Fontes iônicas intercambiáveis (caixa de fonte de íons API com ionização por eletrospray aquecida — fontes de ionização H-ESI II e APCI com sistema de dupla desti... (Portuguese)
13 August 2022
0 references
A) Præsentation af de opgaver, der skal udføres: Formålet med projektet er at erhverve og drive et sæt instrumenter, der er egnede til at identificere/karakterisere nye naturlige (plante-, svampe- og bakterielle) organiske forbindelser og organiske forbindelser fremstillet ved kemisk syntese, deres konjugater (direktivderivater, kolloid nanopartikler) og deres metabolitter samt til forskning i ændringer i proteinniveau (proteomik) i celler som følge af forbindelsers indflydelse. Ved behandling af både tumorer og reinfektiøse sygdomme af mikrobiel oprindelse kan der opnås et stort gennembrud ved såkaldt målrettet behandling, hvilket øger selektiviteten af aktive stoffer og reducerer deres bivirkninger. Det fælles træk ved denne nye retning for farmaceutisk forskning er dannelsen af forbindelser, der er i stand til at målrette det aktive stof mod den berørte tumor eller inficerede celle. Den infrastruktur, der skal udvikles, har til formål at isolere, identificere og karakterisere nye naturligt producerede biologisk aktive forbindelser (konjugater med peptid og/eller nanosystemer), der produceres ved organisk kemisk syntese, i overensstemmelse med de højeste internationale standarder. Langt størstedelen af de biologisk aktive stoffer, der i øjeblikket anvendes i medicin, er sekundære metabolitter af planter, svampe og procaryotemikroorganismer eller er beslægtede halvsyntetiske syntetiske forbindelser. Et af hovedformålene med vores forskning er at identificere og karakterisere nye aktive stoffer og metabolitter af plante-, svampe- eller mikroorganismeoprindelse. Med denne infrastrukturudvikling sigter vi mod at udvide muligheden for at opdage yderligere medicinske og toksiske planteaktive stoffer og karakteriseringsprofilen for forbindelserne. I løbet af forskning definerer vi ikke kun et aktivt stof i en organisme, men også et stadig mere grundlæggende "metabolit-fingeraftryk" i international praksis. Det er vigtigt at bemærke, at ifølge nogle hypoteser kan de fleste af de hidtil ukendte aktivstoffer identificeres og karakteriseres effektivt ved denne strategi. Af lignende årsager er metabolisk karakterisering af metaboliske produkter af mikrober, der lever under ekstreme forhold, lovende (professionel ansvarlig: Institut for Biologi, Institut for Planteorganologi, Institut for Mikrobiologi). De fleste biokonjugater, der er egnede til målrettet behandling, består af tre komponenter; aktivt stof, kontrollerende molekyle og forbindelsesenhed. I vores forskning forsøger vi at skabe sammensatte butikker, hvor det aktive stof (naturligt eller syntetiseret) og kontrollerende peptidkomponenter kan knyttes sammen i en bred vifte af kombinationer med de udviklede bifunktionslinkere, hvilket øger udvalget af konjugater, der egner sig til målrettet terapi, hvilket også kan være en forudsætning for personlig helbredelse. Ud over identifikation og karakterisering af de fremstillede komponenter og de konjugater, der fremstilles af dem, er deres stabilitet, metabolisme og ændringer i de biologiske systemers proteinniveau også afgørende for målingen af deres yderst gennemtrængelige, stærkt forstyrrende analyseplatform (professionel operatør: Institut for Kemi, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). De to ovennævnte forskningsområder er i fællesskab afhængige af den nyligt indkøbte "skærekant" UHPLC-MS/MS-enhed, som ikke kun er egnet til enkle rutineanalyser, men også har et betydeligt forskningspotentiale. Kvalitativ og kvantitativ analyse af prøvernes komponenter kan udføres ved hjælp af et system (HPLC-MS/MS) forbundet med væskekromatografi (HPLC), der er konstrueret til udtagning, og som muliggør bestemmelse af masse med høj nøjagtighed, med quadrupol og orbitrapmassedetektion. Mængden af komponenter, der skal afprøves, kan variere efter størrelse. Systemet er velegnet til udførelse af ultraeffektive væskekromatografitest (UHPLC), hvilket reducerer måletiden betydeligt, hvilket øger antallet af prøver, der kan behandles, og reducerer brugen af opløsningsmiddel. Identifikation og kvantificering af separerede stoffer sker ved hjælp af en diodearraydetektor (190-800 nm), massespektrometri med høj opløsning ved det hybride quadrupol-orbitrapmassespektrometer. Drift over et bredt masseområde (m/z 50-2000) med høj præcision (mindre end 5 ppm) massespektrometre giver også mulighed for strukturel identifikation og identifikation af forureningsprofil ved at give en unik følsomhed (attogram). MS/MS-optagelse leveres af en højenergi-HCD-slagcelle, som muliggør reproducerbar frekvensoptagelse og en mere sikker komponentidentifikation til bibliotekssøgning. Udskiftelige ionkilder (API-ionkildehus med opvarmet elektrosprayionisering — H-ESI II- og APCI-ioniseringskilder med dobbelt destillationssystem) gør det muligt at undersøge molekyler af en bred vifte af strukturer. De vigtigste egenskaber, der er anført, gør instrumentet egnet til hurtig "høj kapacitet" analyse af et stort antal prøver. A (Danish)
13 August 2022
0 references
A) Prezentarea sarcinilor care urmează să fie implementate: Scopul proiectului este de a achiziționa și de a exploata un set de instrumente care sunt adecvate pentru identificarea/caracterizarea noilor compuși organici naturali (plante, fungice și bacterieni) și a compușilor organici produși prin sinteză chimică, conjugații acestora (derivați direcți, nanoparticule coloidale) și metaboliții acestora, precum și pentru cercetarea modificărilor la nivel de proteine (proteomice) în celule datorită influenței compușilor. În tratamentul bolilor tumorale și reinfecțioase de origine microbiană, se poate face o descoperire majoră prin așa-numita terapie direcționată, care crește selectivitatea substanțelor active și reduce efectele secundare ale acestora. Caracteristica comună a acestei noi direcții de cercetare farmaceutică este crearea de compuși care pot viza substanța activă în tumora sau celula infectată afectată. Infrastructura care urmează să fie dezvoltată vizează izolarea, identificarea și caracterizarea noilor compuși biologic activi produși în mod natural (conjugați cu peptidă și/sau nanosisteme) produși prin sinteză chimică organică, în conformitate cu cele mai înalte standarde internaționale. Marea majoritate a substanțelor biologic active utilizate în prezent în medicină sunt metaboliți secundari ai plantelor, ciupercilor și microorganismelor procariote sau sunt compuși sintetici semisintetici înrudiți. Unul dintre obiectivele principale ale cercetării noastre este de a identifica și caracteriza noi substanțe active și metaboliți de origine vegetală, fungică sau microorganism. Prin această dezvoltare a infrastructurii, ne propunem să extindem posibilitatea de a descoperi substanțe active vegetale medicinale și toxice suplimentare și profilul caracterizării compușilor. În cursul cercetării, definim nu numai o substanță activă a unui organism, ci și o „amprentă metabolită” din ce în ce mai fundamentală în practica internațională. Este important de remarcat faptul că, potrivit unor ipoteze, majoritatea substanțelor active necunoscute anterior pot fi identificate în mod eficient și caracterizate de această strategie. Din motive similare, caracterizarea metabolică a produselor metabolice ale microbilor care trăiesc în condiții extreme este promițătoare (profesionist responsabil: Institutul de Biologie, Departamentul de Organologie a Plantelor, Departamentul de Microbiologie). Majoritatea bioconjugaților potriviți pentru terapia direcționată constau din trei componente; substanță activă, moleculă de control și unitate de interconectare. În cercetarea noastră încercăm să creăm magazine compuse în care substanța activă (naturală sau sintetizată) și componentele peptide de control pot fi legate împreună într-o gamă largă de combinații cu conexiunile bifuncționale dezvoltate, crescând gama de conjugați potrivite pentru terapia direcționată, care poate fi, de asemenea, o condiție prealabilă pentru vindecarea personalizată. Pe lângă identificarea și caracterizarea componentelor produse și a conjugaților produși din acestea, stabilitatea, metabolismul și modificările de nivel de proteine induse de celule în sistemele biologice sunt, de asemenea, esențiale pentru măsurarea platformei analitice extrem de permeabile și extrem de perturbatoare (operator profesionist: Institutul de Chimie, Grupul de Cercetare Peptidchimică MTA-ELTE). Cele două domenii de cercetare menționate mai sus se bazează în comun pe dispozitivul UHPLC-MS/MS/MS nou achiziționat, care nu numai că este potrivit pentru analize de rutină simple, ci are, de asemenea, un potențial semnificativ de cercetare. Analiza calitativă și cantitativă a componentelor eșantioanelor poate fi efectuată cu ajutorul unui sistem (HPLC-MS/MS) asociat cu cromatografia lichidă (HPLC) conceput pentru prelevare, permițând determinarea masei de înaltă precizie, cu detecție a masei cvadruplului și a materialelor orbitale. Cantitatea de componente care urmează să fie testate poate varia în funcție de ordinul de mărime. Sistemul este potrivit pentru efectuarea de teste ultra-eficiente de cromatografie lichidă (UHPLC), reducând semnificativ timpul de măsurare, crescând astfel numărul de probe care pot fi prelucrate și reducând utilizarea solvenților. Identificarea și cuantificarea substanțelor separate este asigurată de un detector cu rețele de diode (190-800 nm), detectarea specrometriei de masă de înaltă rezoluție prin spectrometrul de masă hibrid cvadrupol-orbitrapice. Funcționarea pe o gamă largă de mase (m/z 50-2000) cu spectrometre de masă de înaltă precizie (mai puțin de 5 ppm) permite, de asemenea, identificarea structurală și identificarea profilului de poluare prin furnizarea unei sensibilități unice (attograme). Înregistrarea SM/SM este furnizată de o celulă de impact HCD de înaltă energie, care permite înregistrarea spectrului reproductibil și identificarea mai sigură a componentelor pentru căutarea în bibliotecă. Sursele de ioni interschimbabile (carcasa sursă de i... (Romanian)
13 August 2022
0 references
A) Darstellung der durchzuführenden Aufgaben: Ziel des Projekts ist es, eine Reihe von Instrumenten zu erwerben und zu betreiben, die geeignet sind, neue natürliche (Pflanzen-, Pilz- und bakterielle) organische Verbindungen und organische Verbindungen, die durch chemische Synthese, ihre Konjugate (direktive Derivate, kolloidale Nanopartikel) und deren Metaboliten hergestellt werden, sowie zur Erforschung von Protein-Level-Veränderungen (Proteomik) in Zellen aufgrund des Einflusses von Verbindungen zu identifizieren und zu charakterisieren. Bei der Behandlung von Tumor- und reinfektiösen Erkrankungen mikrobieller Herkunft kann durch die sogenannte gezielte Therapie ein großer Durchbruch erzielt werden, die die Selektivität von Wirkstoffen erhöht und ihre Nebenwirkungen reduziert. Das gemeinsame Merkmal dieser neuen Richtung der pharmazeutischen Forschung ist die Bildung von Verbindungen, die in der Lage sind, den Wirkstoff in den betroffenen Tumor oder infizierte Zelle zu zielen. Die zu entwickelnde Infrastruktur zielt auf die Isolierung, Identifizierung und Charakterisierung neuer natürlich hergestellter biologisch aktiver Verbindungen (Konjugate mit Peptid und/oder Nanosystemen) ab, die durch organische chemische Synthese nach höchsten internationalen Standards hergestellt werden. Die überwiegende Mehrheit der biologischen Wirkstoffe, die derzeit in der Medizin verwendet werden, sind sekundäre Metaboliten von Pflanzen, Pilzen und Prokaryote-Mikroorganismen oder sind verwandte semisynthetische synthetische Verbindungen. Eines der Hauptziele unserer Forschung ist es, neue Wirkstoffe und Metaboliten von Pflanzen, Pilzen oder Mikroorganismus zu identifizieren und zu charakterisieren. Mit dieser infrastrukturellen Entwicklung wollen wir die Möglichkeit erweitern, zusätzliche medizinische und toxische Pflanzenwirkstoffe und das Charakterisierungsprofil der Verbindungen zu entdecken. Im Laufe der Forschung definieren wir nicht nur einen Wirkstoff eines Organismus, sondern auch einen zunehmend grundlegenden „Metabolit-Fingerabdruck“ in der internationalen Praxis. Es ist wichtig zu beachten, dass nach einigen Hypothesen die meisten der bisher unbekannten Wirkstoffe durch diese Strategie wirksam identifiziert und gekennzeichnet werden können. Aus ähnlichen Gründen ist die metabolische Charakterisierung von Stoffwechselprodukten von Mikroben, die unter extremen Bedingungen leben, vielversprechend (professionell verantwortlich: Institut für Biologie, Abteilung für Pflanzenorganologie, Institut für Mikrobiologie). Die Mehrzahl der für eine gezielte Therapie geeigneten Biokonjugate besteht aus drei Komponenten; Wirkstoff, Kontrolle des Moleküls und Verbindungseinheit. In unserer Forschung versuchen wir, zusammengesetzte Filialen zu schaffen, in denen der Wirkstoff (natürlich oder synthetisiert) und die Kontrolle von Peptidkomponenten in einer Vielzahl von Kombinationen mit den entwickelten Bifunktions-Linkern verbunden werden können, wodurch das Spektrum an Konjugaten, die für eine gezielte Therapie geeignet sind, erhöht wird, was auch eine Voraussetzung für eine personalisierte Heilung sein kann. Neben der Identifizierung und Charakterisierung der hergestellten Komponenten und der daraus hergestellten Konjugate sind ihre Stabilität, Metabolismus und zellinduzierte Proteinspiegelveränderungen in biologischen Systemen auch wesentlich für die Messung ihrer hochdurchlässigen, hoch disruptiven analytischen Plattform (Professional Operator: Institut für Chemie, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Die oben genannten beiden Forschungsbereiche setzen gemeinsam auf das neu beschaffte UHPLC-MS/MS-Gerät, das nicht nur für einfache Routineanalysen geeignet ist, sondern auch über ein erhebliches Forschungspotenzial verfügt. Die qualitative und quantitative Analyse der Bestandteile der Proben kann mit Hilfe eines Systems (HPLC-MS/MS) im Zusammenhang mit der Flüssigkeitschromatographie (HPLC) durchgeführt werden, das für die Beschaffung ausgelegt ist und eine hochgenaue Massenbestimmung mit Quadrupol- und Orbitrap-Massendetektion ermöglicht. Die zu prüfende Menge der zu prüfenden Komponenten kann je nach Größenordnung variieren. Das System eignet sich für ultraeffiziente Flüssigkeitschromatographie-Tests (UHPLC) und verkürzt die Messzeit deutlich und erhöht so die Anzahl der Proben, die verarbeitet werden können, und reduziert den Lösungsmitteleinsatz. Die Identifizierung und Quantifizierung getrennter Substanzen erfolgt durch einen Dioden-Array-Detektor (190-800 nm), eine hochauflösende Massenspektrometrie-Detektion durch das Hybrid-Quadrupol-Orbitrap-Massenspektrometer. Der Betrieb über einen breiten Massenbereich (m/z 50-2000) mit hochpräzisen Massenspektrometern (weniger als 5 ppm) ermöglicht auch die strukturelle Identifizierung und Identifizierung von Verschmutzungsprofilen durch eine einzigartige Empfindlichkeit (Atogramm). MS/MS-Aufzeichnung wird von einer hochenergetischen HCD-Wirkungszelle bereitgestellt, die reprodu... (German)
13 August 2022
0 references
A) Presentation av de uppgifter som ska genomföras: Syftet med projektet är att förvärva och driva en uppsättning instrument som är lämpliga för att identifiera/karakterisera nya naturliga (växt-, svamp- och bakteriella) organiska föreningar och organiska föreningar framställda genom kemisk syntes, deras konjugater (direktivderivat, kolloidala nanopartiklar) och deras metaboliter, samt för forskning om proteinnivåförändringar (proteomics) i celler på grund av påverkan av föreningar. Vid behandling av både tumör- och återinfektiösa sjukdomar av mikrobiellt ursprung kan ett stort genombrott göras genom s.k. riktad behandling, vilket ökar de aktiva substansernas selektivitet och minskar deras biverkningar. Det gemensamma draget i denna nya inriktning av farmaceutisk forskning är skapandet av föreningar som kan rikta den aktiva substansen in i den drabbade tumören eller infekterade cellen. Den infrastruktur som ska utvecklas syftar till isolering, identifiering och karakterisering av nya naturligt producerade biologiskt aktiva föreningar (konjugat med peptid och/eller nanosystem) som framställs genom organisk kemisk syntes, i enlighet med högsta internationella standard. De allra flesta biologiskt aktiva substanser som för närvarande används i medicin är sekundära metaboliter av växter, svampar och prokaryotmikroorganismer eller är besläktade semisyntetiska syntetiska föreningar. Ett av huvudmålen med vår forskning är att identifiera och karakterisera nya verksamma ämnen och metaboliter av växt-, svamp- eller mikroorganismursprung. Med denna infrastrukturutveckling strävar vi efter att bredda möjligheten att upptäcka ytterligare medicinska och giftiga växtaktiva substanser och föreningarnas karakteriseringsprofil. Inom ramen för forskningen definierar vi inte bara en aktiv substans i en organism, utan också ett alltmer grundläggande ”metabolitavtryck” i internationell praxis. Det är viktigt att notera att enligt vissa hypoteser kan de flesta av de tidigare okända aktiva substanserna effektivt identifieras och karakteriseras av denna strategi. Av liknande skäl är metabolisk karakterisering av metaboliska produkter av mikrober som lever under extrema förhållanden lovande (yrkesmässigt ansvarig: Biologiinstitutet, Institutionen för växtorganologi, Institutionen för mikrobiologi). De flesta biokonjugat som är lämpliga för riktad behandling består av tre komponenter; aktiv substans, kontrollerande molekyl och sammankopplande enhet. I vår forskning försöker vi skapa sammansatta butiker där den aktiva substansen (naturlig eller syntetiserad) och kontrollerande peptidkomponenter kan kopplas samman i ett brett spektrum av kombinationer med de utvecklade bifunktionslänkarna, vilket ökar utbudet av konjugat som lämpar sig för riktad terapi, vilket också kan vara en förutsättning för personlig läkning. Förutom identifiering och karakterisering av de komponenter som produceras och de konjugat som produceras av dem är deras stabilitet, metabolism och cellinducerade proteinnivåförändringar i biologiska system också nödvändiga för att mäta deras mycket genomsläppliga och mycket störande analysplattform (yrkesmässig aktör: Kemiinstitutet, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Ovanstående två forskningsområden bygger gemensamt på den nyligen upphandlade ”cut edge” UHPLC-MS/MS-enheten, som inte bara lämpar sig för enkla rutinanalyser utan också har en betydande forskningspotential. Kvalitativ och kvantitativ analys av provkomponenterna får utföras med hjälp av ett system (HPLC-MS/MS) associerat med vätskekromatografi (HPLC) som är utformat för tillvaratagande och som möjliggör massbestämning med hög noggrannhet, med kvadupol- och orbitrapmassadetektion. Mängden komponenter som ska provas kan variera i storleksordning. Systemet är lämpligt för att utföra ultraeffektiva vätskekromatografitester (UHPLC), vilket avsevärt förkortar mättiden, vilket ökar antalet prover som kan bearbetas och minskar användningen av lösningsmedel. Identifieringen och kvantifieringen av separerade ämnen tillhandahålls av en diodmatrisdetektor (190–800 nm), högupplösande massspektrometridetektion med hjälp av masspektrometrarna hybrid quadrupol-orbitrap. Med masspektrometrar med hög precision (mindre än 5 ppm) med ett brett masspektrometrar (m/z 50–2000) kan man också identifiera konstruktioner och identifiera föroreningsprofiler genom att tillhandahålla en unik känslighet (attogram). MS/MS-inspelningen tillhandahålls av en HCD-kollisionscell med hög energi som möjliggör reproducerbar spektrumregistrering och säkrare komponentidentifiering för bibliotekssökning. Utbytbara jonkällor (API jonkälla hölje med uppvärmd elektrosprayjonisering – H-ESI II och APCI joniseringskällor med dubbla destillationssystem) möjliggör undersökning av molekyler av en mängd olika strukturer. De viktigaste egenskaper som anges gör instrumentet lämpligt för snabb ”hög genomströmningsanalys” av ett stort antal prover. A (Swedish)
13 August 2022
0 references
Budapest, Budapest
0 references
Identifiers
VEKOP-2.3.3-15-2017-00020
0 references