TARGETED EVOLUTION OPTIMISATION OF THE TRUEPRIME GENOMIC AMPLIFICATION SYSTEM (Q4691655)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q4691655 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | TARGETED EVOLUTION OPTIMISATION OF THE TRUEPRIME GENOMIC AMPLIFICATION SYSTEM |
Project Q4691655 in Spain |
Statements
132,809.5 Euro
0 references
265,619.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
7 March 2016
0 references
30 June 2019
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
28760
0 references
La empresa Sygnis desarrolla una fuerte actividad investigadora para identificar enzimas con potencial interés biotecnológico. En los últimos años, uno de sus proyectos más importantes se ha centrado en el estudio y caracterización de un miembro termoestable de la nueva familia de enzimas denominadas PrimPol, ya que combinan las actividades primasa y polimerasa en un único polipéptido. Las propiedades de este enzima permitieron desarrollar un nuevo sistema de amplificación de DNA (TruePrime¿, combinación de PrimPol+ø29DNApol) que evita el uso de iniciadores sintéticos de secuencia al azar, ya que PrimPol es el enzima encargado de sintetizar de manera específica los iniciadores de DNA necesarios para que la DNA polimerasa del fago ø29 lleve a cabo la amplificación exponencial e isoterma mediante síntesis altamente procesiva y asociada al desplazamiento de cadena. Sygnis, conjuntamente con el CBM-CSIC (Grupo de investigación del Dr Blanco), pretende con este proyecto optimizar el sistema de amplificación TruePrime¿ mediante la utilización de variantes mejoradas por evolución dirigida de las dos enzimas implicadas en el proceso: TthPrimPol y ø29DNApol. Estas variantes optimizadas serán diseñadas para resolver limitaciones intrínsecas al proceso de amplificación por este sistema, principalmente orientadas a mejorar la eficiencia de amplificación y a conseguir una óptima cobertura de amplificación de todas las regiones del genoma humano. Estas nuevas variantes permitirán el desarrollo de nuevos kits con el máximo potencial de comercialización para la amplificación de DNA y RNA. (Spanish)
0 references
A empresa Sygnis desenvolve uma forte atividade de pesquisa para identificar enzimas com potencial interesse biotecnológico. Nos últimos anos, um de seus projetos mais importantes tem se concentrado no estudo e caracterização de um membro termoestável da nova família de enzimas chamada PrimPol, uma vez que combinam as atividades em bruto e polimerase em um único polipeptídeo. As propriedades desta enzima permitiram o desenvolvimento de um novo sistema de amplificação de DNA (TruePrime¿, combinação PrimPol+ø29DNApol) que evita o uso de iniciadores de sequência aleatória sintética, uma vez que PrimPol é a enzima responsável pela síntese específica dos iniciadores de DNA necessários para a DNA polimerase do fago ø29 realizar amplificação exponencial e isotérmica através de síntese altamente procesiva e associada ao deslocamento da cadeia. SYGNIS, juntamente com o CBM-CSIC (Dr. White Research Group), visa com este projeto otimizar o sistema de amplificação TruePrime através do uso de variantes melhoradas pela evolução direcionada das duas enzimas envolvidas no processo: TthPrimPol e ø29DNApol. Estas variantes otimizadas serão projetadas para resolver limitações intrínsecas ao processo de amplificação por este sistema, visando principalmente melhorar a eficiência da amplificação e alcançar uma cobertura ótima de amplificação de todas as regiões do genoma humano. Estas novas variantes permitirão o desenvolvimento de novos kits com potencial máximo de comercialização para amplificação de DNA e RNA. (Portuguese)
0 references
The company Sygnis develops a strong research activity to identify enzymes with potential biotechnological interest. In recent years, one of its most important projects has focused on the study and characterisation of a thermostable member of the new family of enzymes called PrimPol, since they combine the raw and polymerase activities into a single polypeptide. The properties of this enzyme allowed the development of a new DNA amplification system (TruePrime¿, PrimPol+ø29DNApol combination) that avoids the use of synthetic random sequence initiators, since PrimPol is the enzyme responsible for synthesising in a specific way the DNA initiators necessary for the DNA polymerase of the phage ø29 to carry out exponential amplification and isotherm through highly procesive synthesis and associated with chain displacement. SYGNIS, together with the CBM-CSIC (Dr. White Research Group), aims with this project to optimise the TruePrime amplification system through the use of improved variants by directed evolution of the two enzymes involved in the process: TthPrimPol and ø29DNApol. These optimised variants will be designed to solve intrinsic limitations to the amplification process by this system, mainly aimed at improving amplification efficiency and achieving optimal amplification coverage of all regions of the human genome. These new variants will allow the development of new kits with maximum marketing potential for DNA and RNA amplification. (English)
0 references
Η εταιρεία Σύμνης αναπτύσσει μια ισχυρή ερευνητική δραστηριότητα για τον εντοπισμό ενζύμων με δυνητικό βιοτεχνολογικό ενδιαφέρον. Τα τελευταία χρόνια, ένα από τα σημαντικότερα έργα του έχει επικεντρωθεί στη μελέτη και το χαρακτηρισμό ενός θερμοσταθερού μέλους της νέας οικογένειας ενζύμων που ονομάζεται PrimPol, δεδομένου ότι συνδυάζουν τις ακατέργαστες και τις δραστηριότητες πολυμεράσης σε ένα μόνο πολυπεπτίδιο. Οι ιδιότητες αυτού του ενζύμου επέτρεψαν την ανάπτυξη ενός νέου συστήματος ενίσχυσης DNA (TruePrime, συνδυασμός PrimPol+ø29DNApol) που αποφεύγει τη χρήση συνθετικών τυχαίων εμπνευστών αλληλουχίας, δεδομένου ότι το PrimPol είναι το ένζυμο που είναι υπεύθυνο για τη σύνθεση με συγκεκριμένο τρόπο τους εισαγωγείς DNA που είναι απαραίτητοι για την πολυμεράση DNA του φάγου ø29 για να πραγματοποιήσει εκθετική ενίσχυση και ισοθερμία μέσω εξαιρετικά προαγωγικής σύνθεσης και που σχετίζεται με μετατόπιση αλυσίδας. Η SYGNIS, μαζί με την CBM-CSIC (Dr. White Research Group), στοχεύει στη βελτιστοποίηση του συστήματος ενίσχυσης TruePrime μέσω της χρήσης βελτιωμένων παραλλαγών με κατευθυνόμενη εξέλιξη των δύο ενζύμων που εμπλέκονται στη διαδικασία: TthPrimPol και ø29DNApol. Αυτές οι βελτιστοποιημένες παραλλαγές θα είναι σχεδιασμένες για την επίλυση εγγενών περιορισμών στη διαδικασία ενίσχυσης από αυτό το σύστημα, με στόχο κυρίως τη βελτίωση της αποδοτικότητας της ενίσχυσης και την επίτευξη βέλτιστης ενισχυτικής κάλυψης όλων των περιοχών του ανθρώπινου γονιδιώματος. Αυτές οι νέες παραλλαγές θα επιτρέψουν την ανάπτυξη νέων κιτ με μέγιστο δυναμικό μάρκετινγκ για την ενίσχυση DNA και RNA. (Greek)
0 references
Ettevõte Sygnis arendab tugevat uurimistööd, et tuvastada potentsiaalse biotehnoloogilise huviga ensüüme. Viimastel aastatel on üks selle olulisemaid projekte keskendunud uue ensüümide perekonna termostabiilse liikme PrimPol’i uurimisele ja iseloomustamisele, kuna need ühendavad toor- ja polümeraasi aktiivsuse üheks polüpeptiidiks. Selle ensüümi omadused võimaldasid välja töötada uue DNA võimendussüsteemi (TruePrime’i, PrimPol+ø29DNApol kombinatsioon), mis väldib sünteetiliste juhuslike järjestuste initsiaatorite kasutamist, kuna PrimPol on ensüüm, mis vastutab spetsiifilisel viisil sünteesimise eest DNA initsiaatoritega, mis on vajalikud fage ø29 DNA polümeraasiks, et teostada eksponentsiaalset võimendamist ja isotermi läbi väga protsesiivse sünteesi ja seostatakse ahela nihkega. SYGNIS koos CBM-CSICiga (Dr. White Research Group) püüab selle projektiga optimeerida TruePrime’i võimendussüsteemi, kasutades täiustatud variante kahe protsessi kaasatud ensüümi suunatud evolutsiooni teel: TthPrimPol ja ø29DNApol. Need optimeeritud variandid on kavandatud selleks, et lahendada selle süsteemi võimendusprotsessi olemuslikud piirangud, mille peamine eesmärk on suurendada võimendustõhusust ja saavutada inimese genoomi kõikide piirkondade optimaalne võimendamine. Need uued variandid võimaldavad välja töötada uusi komplekte, millel on maksimaalne turustamispotentsiaal DNA ja RNA võimendamiseks. (Estonian)
0 references
Компанията Sygnis развива силна изследователска дейност за идентифициране на ензими с потенциален биотехнологичен интерес. През последните години един от най-важните проекти се фокусира върху изследването и характеризирането на термостабилен член на новото семейство ензими, наречени PrimPol, тъй като те съчетават суровите и полимеразните дейности в един полипептид. Свойствата на този ензим позволяват развитието на нова система за усилване на ДНК (TruePrime, PrimPol +ø29DNApol), която избягва използването на синтетични инициатори на случайни секвенции, тъй като PrimPol е ензимът, отговорен за синтезирането по специфичен начин на ДНК инициаторите, необходими за ДНК полимеразата на фага ø29 за извършване на експоненциално усилване и изотерм чрез високопроцесивен синтез и свързано с изместване на веригата. SYGNIS, заедно с CBM-CSIC (Dr. White Research Group), има за цел с този проект да оптимизира системата за усилване на TruePrime чрез използване на подобрени варианти чрез насочена еволюция на двата ензима, участващи в процеса: TthPrimPol и ø29DNApol. Тези оптимизирани варианти ще бъдат предназначени за решаване на присъщите ограничения на процеса на усилване от тази система, насочени главно към подобряване на ефективността на усилване и постигане на оптимално усилване на всички региони на човешкия геном. Тези нови варианти ще позволят разработването на нови комплекти с максимален маркетингов потенциал за ДНК и РНК усилване. (Bulgarian)
0 references
Compania Sygnis dezvoltă o activitate puternică de cercetare pentru a identifica enzimele cu potențial interes biotehnologic. În ultimii ani, unul dintre cele mai importante proiecte ale sale s-a concentrat pe studiul și caracterizarea unui membru termostabil al noii familii de enzime numite PrimPol, deoarece acestea combină activitățile brute și polimeraze într-o singură polipeptidă. Proprietățile acestei enzime au permis dezvoltarea unui nou sistem de amplificare a ADN-ului (combinație TruePrime, PrimPol+ø29DNApol) care evită utilizarea inițiatorilor sintetici de secvență aleatorie, deoarece PrimPol este enzima responsabilă pentru sintetizarea într-un mod specific a inițiatorilor ADN necesari pentru polimeraza ADN-ului fagului ø29 pentru a efectua amplificarea exponențială și izoterma prin sinteză extrem de procesivă și asociată cu deplasarea în lanț. SYGNIS, împreună cu CBM-CSIC (Dr. White Research Group), își propune prin acest proiect optimizarea sistemului de amplificare TruePrime prin utilizarea variantelor îmbunătățite prin evoluția direcționată a celor două enzime implicate în proces: TthPrimPol și ø29DNApol. Aceste variante optimizate vor fi concepute pentru a rezolva limitările intrinseci ale procesului de amplificare prin acest sistem, având ca scop principal îmbunătățirea eficienței de amplificare și asigurarea unei acoperiri optime de amplificare a tuturor regiunilor genomului uman. Aceste noi variante vor permite dezvoltarea de noi kituri cu potențial maxim de comercializare pentru amplificarea ADN-ului și ARN-ului. (Romanian)
0 references
Podjetje Sygnis razvija močno raziskovalno dejavnost za prepoznavanje encimov s potencialnim biotehnološkim interesom. V zadnjih letih se je eden najpomembnejših projektov osredotočil na preučevanje in karakterizacijo termostabilnega člana nove družine encimov, imenovanih PrimPol, saj združujejo dejavnosti surove in polimeraze v en polipeptid. Lastnosti tega encima so omogočile razvoj novega sistema pomnoževanja DNK (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol kombinacija), ki preprečuje uporabo sintetičnih iniciatorjev naključnega zaporedja, saj je PrimPol encim, ki je odgovoren za sintezo na specifičen način iniciatorje DNA, ki so potrebni za izvedbo eksponentne amplifikacije in izoterme DNA polimeraze fage ø29 z zelo procesno sintezo in povezano z verižnim premikom. SYGNIS skupaj s CBM-CSIC (Dr. White Research Group) želi s tem projektom optimizirati sistem ojačevanja TruePrime z uporabo izboljšanih različic z usmerjenim razvojem dveh encimov, vključenih v proces: TthPrimPol in ø29DNApol. Te optimizirane različice bodo zasnovane tako, da bodo odpravile notranje omejitve procesa ojačevanja v tem sistemu, namenjene predvsem izboljšanju učinkovitosti ojačanja in doseganju optimalne pokritosti ojačanja vseh regij človeškega genoma. Te nove različice bodo omogočile razvoj novih kompletov z največjim tržnim potencialom za ojačanje DNK in RNA. (Slovenian)
0 references
Virksomheden Sygnis udvikler en stærk forskningsaktivitet for at identificere enzymer med potentiel bioteknologisk interesse. I de senere år har et af sine vigtigste projekter fokuseret på undersøgelse og karakterisering af et termostabilt medlem af den nye familie af enzymer kaldet PrimPol, da de kombinerer rå- og polymeraseaktiviteterne i et enkelt polypeptid. Dette enzyms egenskaber gjorde det muligt at udvikle et nyt DNA-forstærkningssystem (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol-kombinationen), der undgår brug af syntetiske tilfældige sekvensinitiatorer, da PrimPol er det enzym, der er ansvarligt for at syntetisere på en bestemt måde de DNA-initiatorer, der er nødvendige for at DNA-polymerase i faget ø29 kan udføre eksponentiel forstærkning og isoterm gennem meget procesiv syntese og forbundet med kædeforskydning. SYGNIS har sammen med CBM-CSIC (Dr. White Research Group) med dette projekt til formål at optimere TruePrime-forstærkningssystemet ved hjælp af forbedrede varianter ved direkte udvikling af de to enzymer, der er involveret i processen: TthPrimPol og ø29DNApol. Disse optimerede varianter vil blive designet til at løse iboende begrænsninger for forstærkningsprocessen med dette system, primært med henblik på at forbedre forstærkningseffektiviteten og opnå optimal forstærkningsdækning af alle regioner i det menneskelige genom. Disse nye varianter vil gøre det muligt at udvikle nye kits med maksimalt markedsføringspotentiale for DNA- og RNA-forstærkning. (Danish)
0 references
Il-kumpanija Sygnis tiżviluppa attività ta’ riċerka b’saħħitha biex tidentifika enzimi b’interess bijoteknoloġiku potenzjali. F’dawn l-aħħar snin, wieħed mill-proġetti l-aktar importanti tiegħu ffoka fuq l-istudju u l-karatterizzazzjoni ta’ membru termostabbli tal-familja l-ġdida ta’ enzimi msejħa PrimPol, peress li jikkombinaw l-attivitajiet tal-materja prima u tal-polimerażi f’polipeptide wieħed. Il-proprjetajiet ta’ din l-enzima ppermettew l-iżvilupp ta’ sistema ġdida ta’ amplifikazzjoni tad-DNA (il-kombinazzjoni TruePrimPol+ø29DNApol) li tevita l-użu ta’ inizjaturi sintetiċi ta’ sekwenza każwali, peress li PrimPol hija l-enzima responsabbli għas-sintesi b’mod speċifiku l-inizjaturi tad-DNA meħtieġa għall-polimerażi tad-DNA tal-phage ø29 biex iwettqu amplifikazzjoni esponenzjali u iżoterm permezz ta’ sinteżi proċesiva ħafna u assoċjati ma’ spostament tal-katina. SYGNIS, flimkien mas-CBM-CSIC (Dr. White Research Group), jimmira ma’ dan il-proġett li jottimizza s-sistema ta’ amplifikazzjoni ta’ TruePrime permezz tal-użu ta’ varjanti mtejba permezz ta’ evoluzzjoni diretta taż-żewġ enzimi involuti fil-proċess: TthPrimPol u ø29DNApol. Dawn il-varjanti ottimizzati se jitfasslu biex isolvu l-limitazzjonijiet intrinsiċi għall-proċess ta’ amplifikazzjoni minn din is-sistema, prinċipalment immirati biex itejbu l-effiċjenza tal-amplifikazzjoni u jiksbu kopertura ottima ta’ amplifikazzjoni tar-reġjuni kollha tal-ġenoma umana. Dawn il-varjanti l-ġodda se jippermettu l-iżvilupp ta’ kits ġodda b’potenzjal massimu għat-tqegħid fis-suq għall-amplifikazzjoni tad-DNA u l-RNA. (Maltese)
0 references
Uzņēmums Sygnis attīsta spēcīgu pētniecisko darbību, lai identificētu fermentus ar potenciālu biotehnoloģisku interesi. Pēdējos gados viens no svarīgākajiem projektiem ir vērsts uz jaunās fermentu grupas “PrimPol” termostabila locekļa izpēti un raksturošanu, jo tie apvieno neapstrādātas un polimerāzes darbības vienā polipeptīdā. Šī fermenta īpašības ļāva izstrādāt jaunu DNS amplifikācijas sistēmu (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol kombinācija), kas ļauj izvairīties no sintētisku nejaušas sekvences iniciatoru izmantošanas, jo PrimPol ir enzīms, kas atbild par specifiskā veidā sintezēt DNS iniciatorus, kas nepieciešami fāga ø29 DNS polimerāzes DNS polimerāzes veikšanai, lai veiktu eksponenciālu amplifikāciju un izotermu, izmantojot augsti apstrādātu sintēzi un kas saistīts ar ķēdes pārvietošanu. SYGNIS kopā ar CBM-CSIC (Dr. White Research Group) ar šo projektu cenšas optimizēt TruePrime pastiprināšanas sistēmu, izmantojot uzlabotus variantus, virzot abu procesā iesaistīto fermentu evolūciju: TthPrimPol un ø29DNApol. Šie optimizētie varianti tiks izstrādāti tā, lai novērstu šīs sistēmas amplifikācijas procesa būtiskos ierobežojumus, galvenokārt ar mērķi uzlabot pastiprināšanas efektivitāti un panākt optimālu cilvēka genoma reģionu amplifikācijas aptvērumu. Šie jaunie varianti ļaus izstrādāt jaunus komplektus ar maksimālu DNS un RNS amplifikācijas tirdzniecības potenciālu. (Latvian)
0 references
Företaget Sygnis utvecklar en stark forskningsaktivitet för att identifiera enzymer med potentiellt biotekniskt intresse. Under de senaste åren har ett av dess viktigaste projekt fokuserat på studier och karakterisering av en termostabil medlem av den nya familjen av enzymer som kallas PrimPol, eftersom de kombinerar råa och polymerasaktiviteter i en enda polypeptid. Egenskaperna hos detta enzym gjorde det möjligt att utveckla ett nytt DNA-förstärkningssystem (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol-kombinationen) som undviker användning av syntetiska slumpmässiga sekvensinitiatorer, eftersom PrimPol är det enzym som ansvarar för syntetiseringen på ett specifikt sätt de DNA-initiatorer som krävs för att DNA-polymeraset i fagen ø29 ska kunna utföra exponentiell förstärkning och isotermisering genom mycket procesiv syntes och förknippas med kedjeförskjutning. SYGNIS, tillsammans med CBM-CSIC (Dr. White Research Group), syftar till att optimera TruePrime-förstärkningssystemet genom användning av förbättrade varianter genom riktad utveckling av de två enzymer som är involverade i processen: TthPrimPol och ø29DNApol. Dessa optimerade varianter kommer att utformas för att lösa inneboende begränsningar i förstärkningsprocessen genom detta system, främst syftar till att förbättra amplifiering effektivitet och uppnå optimal förstärkning täckning av alla regioner i det mänskliga genomet. Dessa nya varianter kommer att möjliggöra utveckling av nya kit med maximal marknadsföringspotential för DNA och RNA-förstärkning. (Swedish)
0 references
Sygnis ontwikkelt een sterke onderzoeksactiviteit om enzymen met potentieel biotechnologisch belang te identificeren. In de afgelopen jaren heeft een van de belangrijkste projecten zich gericht op de studie en karakterisering van een thermostabiel lid van de nieuwe familie van enzymen genaamd PrimPol, omdat ze de ruwe en polymerase-activiteiten combineren tot een enkel polypeptide. De eigenschappen van dit enzym maakten de ontwikkeling mogelijk van een nieuw DNA-versterkingssysteem (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol-combinatie) dat het gebruik van synthetische willekeurige sequentie-initiators vermijdt, omdat PrimPol het enzym is dat verantwoordelijk is voor het synthetiseren op een specifieke manier de DNA-initiators die nodig zijn voor het DNA-polymerase van de phage ø29 om exponentiële versterking en isotherm uit te voeren door middel van zeer procesieve synthese en geassocieerd met kettingverplaatsing. SYGNIS wil met dit project samen met de CBM-CSIC (Dr. White Research Group) het TruePrime-versterkingssysteem optimaliseren door het gebruik van verbeterde varianten door gerichte evolutie van de twee enzymen die betrokken zijn bij het proces: TthPrimPol en ø29DNApol. Deze geoptimaliseerde varianten zullen worden ontworpen om intrinsieke beperkingen van het versterkingsproces door dit systeem op te lossen, voornamelijk gericht op het verbeteren van de efficiëntie van de versterking en het bereiken van een optimale versterkingsdekking van alle regio’s van het menselijk genoom. Deze nieuwe varianten zullen de ontwikkeling van nieuwe kits met maximaal marketingpotentieel voor DNA en RNA versterking mogelijk maken. (Dutch)
0 references
Tvrtka Sygnis razvija snažnu istraživačku aktivnost za identifikaciju enzima s potencijalnim biotehnološkim interesom. Posljednjih godina jedan od njegovih najvažnijih projekata bio je usmjeren na proučavanje i karakterizaciju termostabilnog člana nove obitelji enzima nazvanih PrimPol, budući da kombiniraju sirovo i polimerazno djelovanje u jedan polipeptid. Svojstva ovog enzima omogućila su razvoj novog sustava za pojačavanje DNK (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol kombinacija) koji izbjegava upotrebu sintetskih inicijatora slučajnih sekvenci, budući da je PrimPol enzim odgovoran za sintezu na specifičan način DNA inicijatora potrebnih za DNK polimerazu faga ø29 za provođenje eksponencijalnog pojačanja i izoterme kroz visoko procesivnu sintezu i povezanu s lančanim pomicanjem. SYGNIS, zajedno s CBM-CSIC (Dr. White Research Group), ima za cilj optimizirati TruePrime sustav pojačanja korištenjem poboljšanih varijanti kroz usmjerenu evoluciju dvaju enzima uključenih u proces: TthPrimPol i ø29DNApol. Ove optimizirane varijante bit će osmišljene kako bi se riješila intrinzična ograničenja procesa pojačanja ovog sustava, uglavnom usmjerena na poboljšanje učinkovitosti pojačanja i postizanje optimalne pojačane pokrivenosti svih regija ljudskog genoma. Ove nove varijante omogućit će razvoj novih kompleta s maksimalnim marketinškim potencijalom za DNA i RNA pojačanje. (Croatian)
0 references
La société Sygnis développe une forte activité de recherche pour identifier les enzymes présentant un intérêt biotechnologique potentiel. Ces dernières années, l’un de ses projets les plus importants a porté sur l’étude et la caractérisation d’un membre thermostable de la nouvelle famille d’enzymes appelée PrimPol, puisqu’ils combinent les activités brutes et polymérases en un seul polypeptide. Les propriétés de cette enzyme ont permis le développement d’un nouveau système d’amplification de l’ADN (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol) qui évite l’utilisation d’initiateurs de séquences aléatoires synthétiques, puisque PrimPol est l’enzyme responsable de la synthèse des initiateurs d’ADN nécessaires à la polymérase de l’ADN du phage ø29 pour effectuer l’amplification exponentielle et l’isomère par synthèse hautement procésive et associée au déplacement de la chaîne. SYGNIS, en collaboration avec le CBM-CSIC (Dr. White Research Group), vise, avec ce projet, à optimiser le système d’amplification TruePrime grâce à l’utilisation de variantes améliorées par l’évolution dirigée des deux enzymes impliquées dans le processus: TthPrimPol et ø29DNApol. Ces variantes optimisées seront conçues pour résoudre les limitations intrinsèques du processus d’amplification par ce système, visant principalement à améliorer l’efficacité de l’amplification et à obtenir une couverture d’amplification optimale de toutes les régions du génome humain. Ces nouvelles variantes permettront le développement de nouveaux kits avec un potentiel de commercialisation maximal pour l’amplification de l’ADN et de l’ARN. (French)
0 references
Spoločnosť Sygnis vyvíja silnú výskumnú činnosť na identifikáciu enzýmov s potenciálnym biotechnologickým záujmom. V posledných rokoch sa jeden z jeho najdôležitejších projektov zameral na štúdium a charakterizáciu termostabilného člena novej rodiny enzýmov s názvom PrimPol, pretože kombinujú surovú a polymerázovú aktivitu do jedného polypeptidu. Vlastnosti tohto enzýmu umožnili vývoj nového systému zosilňovania DNA (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol), ktorý zabraňuje použitiu syntetických iniciátorov náhodných sekvencií, pretože PrimPol je enzým zodpovedný za špecifickú syntézu iniciátorov DNA potrebných pre DNA polymerázu fágu ø29 na vykonanie exponenciálneho zosilnenia a izotermy prostredníctvom vysoko procesnej syntézy a spojenej s posunom reťazca. SYGNIS spolu s CBM-CSIC (Dr. White Research Group) sa zameriava na optimalizáciu systému zosilňovania TruePrime pomocou vylepšených variantov riadeným vývojom dvoch enzýmov zapojených do procesu: TthPrimPol a ø29DNApol. Tieto optimalizované varianty budú navrhnuté tak, aby riešili vnútorné obmedzenia procesu zosilňovania prostredníctvom tohto systému, zamerané najmä na zlepšenie účinnosti zosilnenia a dosiahnutie optimálneho pokrytia všetkých oblastí ľudského genómu. Tieto nové varianty umožnia vývoj nových súprav s maximálnym marketingovým potenciálom pre zosilnenie DNA a RNA. (Slovak)
0 references
Forbraíonn an chuideachta Sygnis gníomhaíocht láidir taighde chun einsímí a d’fhéadfadh a bheith ina n-ábhar biteicneolaíochta a aithint. Le blianta beaga anuas, tá ceann de na tionscadail is tábhachtaí dírithe ar staidéar agus ar thréithriú ball thermostable den teaghlach nua einsímí ar a dtugtar PrimPol, ós rud é go gcomhcheanglaíonn siad na gníomhaíochtaí amh agus Polyase i polypeptide amháin. Cheadaigh airíonna na heinsíme seo forbairt a dhéanamh ar chóras nua aimpliúcháin DNA (trádáil PrimPol + PrimPol +ø29DNApol) a sheachnaíonn úsáid tionscnóirí seicheamh randamach sintéiseach, ós rud é gurb é PrimPol an einsím atá freagrach as sintéisiú ar bhealach sonrach na tionscnóirí DNA is gá chun polaiméirí DNA an phage ø29 a dhéanamh aimpliú easpónantúil agus isotherm trí shintéis an-phcesive agus a bhaineann le díláithriú slabhra. Tá sé mar aidhm ag SYGNIS, in éineacht le CBM-CSIC (An Dr. White Research Group), leis an tionscadal seo barrfheabhas a chur ar an gcóras aimpliúcháin TruePrime trí úsáid a bhaint as malairtí feabhsaithe trí éabhlóid dírithe ar an dá einsím a bhfuil baint acu leis an bpróiseas: TthPrimPol agus ø29DNApol. Déanfar na hathraithigh bharrfheabhsaithe sin a dhearadh chun na teorainneacha intreacha a bhaineann leis an bpróiseas aimpliúcháin leis an gcóras sin a réiteach, arb é is aidhm dóibh go príomha éifeachtúlacht aimplithe a fheabhsú agus cumhdach aimplithe barrmhaith a bhaint amach i ngach réigiún den ghéanóm daonna. Leis na hathraithigh nua sin, beifear in ann fearais nua a fhorbairt lena mbainfidh uasacmhainneacht mhargaíochta do DNA agus d’aimpliú RNA. (Irish)
0 references
Společnost Sygnis vyvíjí silnou výzkumnou činnost s cílem identifikovat enzymy s potenciálním biotechnologickým zájmem. V posledních letech se jeden z jeho nejdůležitějších projektů zaměřil na studium a charakterizaci termostabilního člena nové rodiny enzymů s názvem PrimPol, protože kombinují surové a polymerázové aktivity do jediného polypeptidu. Vlastnosti tohoto enzymu umožnily vývoj nového amplifikačního systému DNA (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol kombinace), který se vyhýbá použití syntetických náhodných iniciátorů sekvence, protože PrimPol je enzym zodpovědný za syntézu specifickým způsobem iniciátory DNA potřebné pro DNA polymerázu phage ø29 k provedení exponenciální amplifikace a izoterma prostřednictvím vysoce procesivní syntézy a spojené s přemístěním řetězce. Společnost SYGNIS společně s CBM-CSIC (Dr. White Research Group) usiluje s tímto projektem o optimalizaci amplifikačního systému TruePrime pomocí vylepšených variant pomocí řízené evoluce dvou enzymů zapojených do procesu: TthPrimPol a ø29DNApol. Tyto optimalizované varianty budou navrženy tak, aby vyřešily vnitřní omezení procesu zesílení tímto systémem, zaměřené především na zlepšení účinnosti zesílení a dosažení optimálního pokrytí všech oblastí lidského genomu. Tyto nové varianty umožní vývoj nových sad s maximálním marketingovým potenciálem pro amplifikaci DNA a RNA. (Czech)
0 references
Das Unternehmen Sygnis entwickelt eine starke Forschungstätigkeit, um Enzyme mit potenziellem biotechnologischem Interesse zu identifizieren. In den letzten Jahren hat sich eines seiner wichtigsten Projekte auf die Untersuchung und Charakterisierung eines thermostabilen Mitglieds der neuen Enzymfamilie PrimPol konzentriert, da sie die Roh- und Polymeraseaktivitäten zu einem einzigen Polypeptid kombinieren. Die Eigenschaften dieses Enzyms ermöglichten die Entwicklung eines neuen DNA-Verstärkungssystems (TruePrime¿, PrimPol+ø29DNApol-Kombination), das die Verwendung synthetischer Zufallssequenz-Initiatoren vermeidet, da PrimPol das Enzym ist, das für die Synthese der DNA-Initiatoren verantwortlich ist, die für die DNA-Polymerase des Phagen ø29 erforderlich sind, um eine exponentielle Verstärkung und Isotherme durch hochprozesive Synthese durchzuführen und mit Kettenverschiebung verbunden. Gemeinsam mit der CBM-CSIC (Dr. White Research Group) zielt SYGNIS mit diesem Projekt darauf ab, das TruePrime-Amplifikationssystem durch den Einsatz verbesserter Varianten durch gezielte Evolution der beiden am Prozess beteiligten Enzyme zu optimieren: TthPrimPol und ø29DNApol. Diese optimierten Varianten werden entwickelt, um intrinsische Einschränkungen des Amplifikationsprozesses durch dieses System zu lösen, die hauptsächlich darauf abzielen, die Amplifikationseffizienz zu verbessern und eine optimale Verstärkungsabdeckung aller Regionen des menschlichen Genoms zu erreichen. Diese neuen Varianten ermöglichen die Entwicklung neuer Kits mit maximalem Vermarktungspotenzial für DNA- und RNA-Verstärkung. (German)
0 references
Bendrovė „Sygnis“ plėtoja stiprią mokslinių tyrimų veiklą, kad nustatytų fermentus, galinčius turėti biotechnologinių interesų. Pastaraisiais metais vienas iš svarbiausių jos projektų buvo orientuotas į naujos fermentų šeimos, vadinamos PrimPol, termostabilio nario tyrimą ir apibūdinimą, nes jie sujungia žaliavą ir polimerazės veiklą į vieną polipeptidą. Šio fermento savybės leido sukurti naują DNR amplifikacijos sistemą (TruePrimeт, PrimPol+ų29DNApol derinys), kuri neleidžia naudoti sintetinių atsitiktinės sekos iniciatorių, nes PrimPol yra fermentas, atsakingas už DNR iniciatorių, reikalingų fago ų29 DNR polimerazės eksponentinei amplifikacijai ir izotermiui atlikti eksponentinę amplifikaciją ir izotermiją per labai progresuojančią sintezę ir susijusį su grandininiu poslinkiu, sintezę. SYGNIS kartu su CBM-CSIC (Dr. White Research Group) šiuo projektu siekia optimizuoti „TruePrime“ stiprinimo sistemą naudojant patobulintus variantus, nukreipiant dviejų procese dalyvaujančių fermentų evoliuciją: TthPrimPol ir ų29DNApol. Šie optimizuoti variantai bus sukurti taip, kad būtų išspręsti esminiai šios sistemos stiprinimo proceso apribojimai, daugiausia skirti pagerinti stiprinimo efektyvumą ir pasiekti optimalią visų žmogaus genomo regionų stiprinimo aprėptį. Šie nauji variantai leis kurti naujus rinkinius, turinčius didžiausią rinkodaros potencialą DNR ir RNR stiprinimui. (Lithuanian)
0 references
L'azienda Sygnis sviluppa una forte attività di ricerca per identificare enzimi con potenziale interesse biotecnologico. Negli ultimi anni, uno dei suoi progetti più importanti si è concentrato sullo studio e la caratterizzazione di un membro termostabile della nuova famiglia di enzimi chiamati PrimPol, poiché combinano le attività grezze e polimerasi in un unico polipeptide. Le proprietà di questo enzima hanno permesso lo sviluppo di un nuovo sistema di amplificazione del DNA (TruePrime¿, combinazione PrimPol+ø29DNApol) che evita l'uso di iniziatori di sequenza casuale sintetici, poiché PrimPol è l'enzima responsabile della sintesi specifica degli iniziatori del DNA necessari per la DNA polimerasi del fago ø29 per effettuare amplificazione esponenziale e isoterma attraverso sintesi altamente procesiva e associata allo spostamento a catena. SYGNIS, insieme al CBM-CSIC (Dr. White Research Group), si propone con questo progetto di ottimizzare il sistema di amplificazione TruePrime attraverso l'utilizzo di varianti migliorate attraverso l'evoluzione diretta dei due enzimi coinvolti nel processo: TthPrimPol e ø29DNApol. Queste varianti ottimizzate saranno progettate per risolvere le limitazioni intrinseche al processo di amplificazione da parte di questo sistema, principalmente volte a migliorare l'efficienza di amplificazione e ottenere una copertura ottimale di amplificazione di tutte le regioni del genoma umano. Queste nuove varianti consentiranno lo sviluppo di nuovi kit con il massimo potenziale di marketing per l'amplificazione del DNA e dell'RNA. (Italian)
0 references
Sygnis kehittää vahvaa tutkimustoimintaa tunnistaakseen mahdollisesti bioteknologisesti kiinnostavia entsyymejä. Viime vuosina yksi sen tärkeimmistä hankkeista on keskittynyt uuden PrimPol-nimisen entsyymiperheen termostaattijäsenen tutkimiseen ja karakterisointiin, koska ne yhdistävät raaka- ja polymeraasitoiminnot yhdeksi polypeptidiksi. Tämän entsyymin ominaisuudet mahdollistivat uuden DNA-vahvistusjärjestelmän (TruePrime, PrimPol+ø29DNApol yhdistelmä), joka estää synteettisten satunnaisten sekvenssien initiaattoreiden käytön, koska PrimPol on entsyymi, joka vastaa syntetisoinnista tietyllä tavalla DNA-aloittajien, joita tarvitaan faasin ø29 DNA-polymeraasi suorittaa eksponentiaalinen vahvistus ja isotherm erittäin procesiivisen synteesin kautta ja liittyy ketjusiirtymään. SYGNIS pyrkii yhdessä CBM-CSIC:n (Dr. White Research Group) kanssa optimoimaan TruePrime-vahvistusjärjestelmän käyttämällä parannettuja variantteja kehittämällä kahta prosessiin osallistuvaa entsyymiä: TthPrimPol ja ø29DNApol. Nämä optimoidut variantit suunnitellaan ratkaisemaan luontaiset rajoitukset vahvistusprosessille tällä järjestelmällä, jolla pyritään pääasiassa parantamaan vahvistustehokkuutta ja saavuttamaan optimaalinen vahvistuskattavuus kaikilla ihmisen genomin alueilla. Nämä uudet versiot mahdollistavat uusien pakkausten kehittämisen, joilla on suurin mahdollinen markkinointipotentiaali DNA- ja RNA-vahvistukseen. (Finnish)
0 references
A Sygnis cég erős kutatási tevékenységet fejleszt a potenciális biotechnológiai érdeklődéssel bíró enzimek azonosítására. Az utóbbi években az egyik legfontosabb projekt a PrimPol nevű új enzimcsalád termosztálható tagjának tanulmányozására és jellemzésére összpontosított, mivel a nyers és polimeráz aktivitást egyetlen polipeptidbe egyesíti. Ennek az enzimnek a tulajdonságai lehetővé tették egy új DNS amplifikációs rendszer (TruePrimeò, PrimPol+ø29DNApol kombináció) kifejlesztését, amely elkerüli a szintetikus véletlenszerű szekvencia-kezdeményezők használatát, mivel a PrimPol az enzim, amely a fág ø29 DNS-polimerázához szükséges DNS-kezdeményezők specifikus módon történő szintéziséért felelős az exponenciális erősítéshez és az izotermmához rendkívül procezív szintézissel és lánckiszorítással társítva. A SYGNIS és a CBM-CSIC (Dr. White Research Group) célja a TruePrime erősítőrendszer optimalizálása a folyamatban részt vevő két enzim irányított evolúciója révén továbbfejlesztett változatok alkalmazásával: TthPrimPol és ø29DNApol. Ezeket az optimalizált variánsokat úgy tervezik meg, hogy megoldják az erősítő folyamat belső korlátait, elsősorban az amplifikáció hatékonyságának javítására és az emberi genom valamennyi régiójának optimális amplifikációs lefedettségének elérésére. Ezek az új változatok lehetővé teszik olyan új készletek kifejlesztését, amelyek maximális marketing potenciállal rendelkeznek a DNS és az RNS erősítésére. (Hungarian)
0 references
12 June 2023
0 references
Tres Cantos
0 references
Identifiers
RTC-2016-4710-1-P01
0 references