EXPLOITATION OF ENVIRONMENTAL BACTERIA ADAPTED TO WATER SCARCITY FOR SOLID PHASE BIOPROCESS ENGINEERING (SETH) (Q3179451)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3179451 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EXPLOITATION OF ENVIRONMENTAL BACTERIA ADAPTED TO WATER SCARCITY FOR SOLID PHASE BIOPROCESS ENGINEERING (SETH) |
Project Q3179451 in Spain |
Statements
54,450.0 Euro
0 references
108,900.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 December 2021
0 references
UNIVERSIDAD DE LEON
0 references
42°38'2.94"N, 5°58'17.11"W
0 references
24089
0 references
EN UN PROYECTO DE INVESTIGACION PREVIO (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION, EN ESTRECHA COLABORACION CON LOS GRUPOS DE INVESTIGACION DE LOS PROFESORES JOSE LUIS GARCIA Y JULI PERETO, AISLO DIFERENTES MICROORGANISMOS CON TOLERANCIA A LA DESECACION (BACTERIAS XEROTOLERANTES). ESAS BACTERIAS AISLADAS PERTENECEN PRINCIPALMENTE A LOS GRUPOS ACTINOBACTERIA Y FIRMICUTES, CON SOLO UNOS POCOS REPRESENTANTES DE BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS. EN EL PRESENTE PROYECTO DE INVESTIGACION, PROPONEMOS UNA CARACTERIZACION PROFUNDA DE LA FISIOLOGIA Y EL METABOLISMO DE UN GRUPO DE FIRMICUTES NO ESPORULANTES AISLADOS DEL METAGENOMA HELIOS. TAMBIEN SE CONSIDERAN ASPECTOS DE ADSCRIPCION FILOGENETICA Y BIOSEGURIDAD DE ESTAS CEPAS. A PARTIR DE ESTA COLECCION POLIEXTREMOFILA DE MICROORGANISMOS, SE SELECCIONARA UN NUMERO DISCRETO DE ELLOS PARA ANALIZAR LOS GENES IMPLICADOS EN LA TOLERANCIA A DIFERENTES CAUSAS DE ESTRES AMBIENTAL MEDIANTE ESTUDIOS MUTACIONALES, GENOMICOS Y TRANSCRIPTOMICOS. ESTOS MICROORGANISMOS SERAN PROPUESTOS COMO UN CHASIS BIOTECNOLOGICO ADECUADO, Y POR ESTA RAZON, SE DESARROLLARAN TECNICAS, PROTOCOLOS Y HERRAMIENTAS PARA LA INGENIERIA GENETICA Y LA EDICION GENOMICA DE ESTAS CEPAS. COMO PRUEBA DE CONCEPTO DE LA UTILIDAD DE ESTAS CEPAS PARA SER UTILIZADAS COMO NUEVO CHASIS BIOTECNOLOGICO, SE ABORDARA UN PROCESO BIODEGRADATIVO PARA LA DEGRADACION DEL POLI (TEREFTALATO DE ETILENO) (PET), UNO DE LOS PRINCIPALES COMPONENTES DE LOS DESECHOS DE PLASTICO QUE CONTAMINAN TODOS LOS HABITATS DEL MUNDO. LA DEGRADACION DE PET SE LLEVARA A CABO UTILIZANDO GENES QUE CODIFICAN PETASAS NATURALES Y / O SINTETICAS QUE SE EXPRESARAN EN EL CHASIS POLIEXTREMOFILO SELECCIONADO. PARA LOGRAR LA BIODEGRADACION DEL PET Y DE POLIMEROS RELACIONADOS, SE DISEÑARAN PROCESOS DE FERMENTACION DISCONTINUA TRADICIONAL, ASI COMO NUEVOS PROCESOS DE FERMENTACION (ENFOQUES DE FERMENTACION SOLIDA BACTERIANA), UTILIZANDO LOS MICROORGANISMOS POLIEXTREMOFILOS TRANSGENICOS. ADEMAS, SE PONDRAN A PUNTO SISTEMAS DE FERMENTACION EN ESTADO SOLIDO FUNGICOS Y SE LLEVARA A CABO EL DESARROLLO DE UN SISTEMA DE DEGRADACION DE PET POR HONGOS UTILIZANDO ESTAS TECNOLOGIAS. (Spanish)
0 references
IN A PREVIOUS RESEARCH PROJECT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), OUR LABORATORY, IN A CLOSE COLLABORATION WITH THE INVESTIGATION GROUPS LED BY PROF. JOSE LUIS GARCIA AND PROF. JULI PERETO, ISOLATED DIFFERENT MICROORGANISMS WITH TOLERANCE TO DESICCATION (XEROTOLERANT BACTERIA). THOSE ISOLATED BACTERIA BELONG MAINLY TO ACTINOBACTERIA AND FIRMICUTES GROUPS, WITH ONLY A FEW REPRESENTATIVES OF GRAM-NEGATIVE BACTERIA. IN THE PRESENT RESEARCH PROJECT, WE PROPOSE A DEEP CHARACTERIZATION OF THE PHYSIOLOGY AND METABOLISM OF A GROUP OF NON-SPORULATING FIRMICUTES ISOLATED FROM HELIOS METAGENOME. PHYLOGENETIC ADSCRIPTION AND BIOSECURITY ASPECTS OF THESE STRAINS ARE ALSO CONSIDERED. FROM THIS POLYEXTREMOPHILE COLLECTION OF MICROORGANISMS, A DISCRETE NUMBER OF THEM WILL BE SELECTED TO ANALYZE THE GENES INVOLVED IN THE TOLERANCE FOR DIFFERENT ENVIRONMENTAL INJURIES THROUGH MUTATIONAL, GENOMIC, AND TRANSCRIPTOMIC STUDIES. THESE MICROORGANISMS WILL BE CONSIDERED AS SUITABLE BIOTECHNOLOGICAL CHASSIS, AND FOR THIS REASON, TECHNIQUES, PROTOCOLS AND TOOLS FOR GENETIC ENGINEERING AND GENOMIC EDITION OF THESE STRAINS WILL BE DEVELOPED. AS A PROOF OF CONCEPT OF THE UTILITY OF THESE STRAINS AS NEW BIOTECHNOLOGICAL CHASSIS, A BIODEGRADATIVE PROCESS FOR POLY (ETHYLENE TEREPHTHALATE) (PET) DEGRADATION, ONE OF THE MAIN COMPONENTS OF THE PLASTIC WASTES CONTAMINATING ALL HABITATS IN THE WORLD, WILL BE APPROACHED. PET DEGRADATION WILL BE CARRIED OUT BY USING GENES ENCODING NATURAL AND/OR SYNTHETIC PETASES THAT WILL BE EXPRESSED IN THE SELECTED POLYEXTREMOPHILE CHASSIS. TO ACHIEVE THE BIODEGRADATION OF PET AND RELATED POLYMERS, TRADITIONAL BATCH FERMENTATION, AS WELL AS NEW FERMENTATION PROCESSES (BACTERIAL SOLID-FERMENTATION APPROACHES), USING THE TRANSGENIC POLYEXTREMOPHILE MICROORGANISMS WILL BE DESIGNED. MOREOVER, FUNGAL SOLID-STATE FERMENTATIONS WILL BE TUNED UP, AND AN APPROACH TO PET DEGRADATION BY FUNGI USING THIS TECHNOLOGY WILL BE MADE. (English)
0 references
DANS UN PROJET DE RECHERCHE PRÉCÉDENT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), NOTRE GROUPE DE RECHERCHE, EN ÉTROITE COLLABORATION AVEC LES GROUPES DE RECHERCHE DES PROFESSEURS JOSE LUIS GARCIA ET JULI PERETO, ISOLE DIFFÉRENTS MICROORGANISMES AVEC TOLÉRANCE AU SÉCHAGE (BACTÉRIES XÉROTOLÉRANTES). CES BACTÉRIES ISOLÉES APPARTIENNENT PRINCIPALEMENT AUX GROUPES ACTINOBACTERIA ET FIRMICUTES, AVEC SEULEMENT QUELQUES REPRÉSENTANTS DE BACTÉRIES GRAM-NÉGATIVES. DANS CE PROJET DE RECHERCHE, NOUS PROPOSONS UNE CARACTÉRISATION PROFONDE DE LA PHYSIOLOGIE ET DU MÉTABOLISME D’UN GROUPE DE FIRMICUTES NON-SPORULANTS ISOLÉS DE LA MÉTAGÉNOME HELIOS. ELLES SONT ÉGALEMENT CONSIDÉRÉES COMME DES ASPECTS DE L’ATTRIBUTION DE PHYLOGENETICA ET DE LA BIOSÉCURITÉ DE CES SOUCHES. À PARTIR DE CETTE COLLECTION DE MICRO-ORGANISMES POLIEXTREMOFILA, UN CERTAIN NOMBRE D’ENTRE EUX SERONT SÉLECTIONNÉS POUR ANALYSER LES GÈNES IMPLIQUÉS DANS LA TOLÉRANCE AUX DIFFÉRENTES CAUSES DE STRESS ENVIRONNEMENTAL PAR LE BIAIS D’ÉTUDES MUTATIONNELLES, GÉNOMIQUES ET TRANSCRIPTOMIQUES. CES MICRO-ORGANISMES SERONT PROPOSÉS COMME CHÂSSIS BIOTECHNOLOGIQUE APPROPRIÉ ET, POUR CETTE RAISON, DES TECHNIQUES, PROTOCOLES ET OUTILS POUR LE GÉNIE GÉNÉTIQUE ET L’ÉDITION GÉNOMIQUE DE CES SOUCHES SERONT DÉVELOPPÉS. COMME PREUVE DU CONCEPT DE L’UTILITÉ DE CES SOUCHES À UTILISER COMME NOUVEAU CHÂSSIS BIOTECHNOLOGIQUE, UN PROCESSUS BIODÉGRADANT POUR LA DÉGRADATION DU POLY (ÉTHYLÈNE TÉRÉPHTALATE) (PET), L’UN DES PRINCIPAUX COMPOSANTS DES DÉCHETS PLASTIQUES QUI CONTAMINENT TOUS LES HABITATS DANS LE MONDE, SERA ABORDÉ. LA DÉGRADATION DE L’ANIMAL DE COMPAGNIE DOIT ÊTRE EFFECTUÉE À L’AIDE DE GÈNES CODANT PETASAS NATURELS ET/OU SYNTHÉTIQUES QUI SERONT EXPRIMÉS DANS LE CHÂSSIS POLIEXTREMOPHY SÉLECTIONNÉ. POUR PARVENIR À LA BIODÉGRADATION DES POLYMÈRES ANIMAUX DE COMPAGNIE ET DES POLYMÈRES APPARENTÉS, DES PROCÉDÉS TRADITIONNELS DE FERMENTATION DISCONTINUE SERONT CONÇUS, AINSI QUE DE NOUVEAUX PROCÉDÉS DE FERMENTATION (APPROCHES BACTÉRIENNES DE FERMENTATION SOLIDE), UTILISANT DES MICRO-ORGANISMES POLYEXTREMOPHILIC TRANSGÉNIQUES. EN OUTRE, DES SYSTÈMES DE FERMENTATION SERONT MIS AU POINT À L’ÉTAT SOLIDE DE FUNGICOS ET LE DÉVELOPPEMENT D’UN SYSTÈME DE DÉGRADATION DES ANIMAUX DE COMPAGNIE PAR LES CHAMPIGNONS UTILISANT CES TECHNOLOGIES SERA RÉALISÉ. (French)
4 December 2021
0 references
IN EINEM FRÜHEREN FORSCHUNGSPROJEKT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R) ISOLIERT UNSERE FORSCHUNGSGRUPPE IN ENGER ZUSAMMENARBEIT MIT DEN FORSCHERGRUPPEN DER PROFESSOREN JOSE LUIS GARCIA UND JULI PERETO VERSCHIEDENE MIKROORGANISMEN MIT TOLERANZ ZUM AUSTROCKNEN (XEROTOLERANTE BAKTERIEN). DIESE ISOLIERTEN BAKTERIEN GEHÖREN HAUPTSÄCHLICH ZU DEN GRUPPEN ACTINOBACTERIA UND FIRMICUTES, MIT NUR WENIGEN VERTRETERN GRAMNEGATIVER BAKTERIEN. IN DIESEM FORSCHUNGSPROJEKT SCHLAGEN WIR EINE TIEFE CHARAKTERISIERUNG DER PHYSIOLOGIE UND DES STOFFWECHSELS EINER GRUPPE NICHT-SPORULANTER FIRMICUTES VOR, DIE VOM HELIOS-METAGENOM ISOLIERT IST. SIE WERDEN AUCH ASPEKTE DER PHYLOGENETICA ZUORDNUNG UND BIOSICHERHEIT DIESER STÄMME BERÜCKSICHTIGT. AUS DIESER POLIEXTREMOFILA-SAMMLUNG VON MIKROORGANISMEN WIRD EINE DISKRETE ANZAHL VON IHNEN AUSGEWÄHLT, UM DIE GENE ZU ANALYSIEREN, DIE AN DER TOLERANZ GEGENÜBER VERSCHIEDENEN URSACHEN VON UMWELTSTRESS DURCH MUTATIONAL-, GENOMISCHE UND TRANSKRIPTOMISCHE STUDIEN BETEILIGT SIND. DIESE MIKROORGANISMEN WERDEN ALS GEEIGNETE BIOTECHNOLOGISCHE CHASSIS VORGESCHLAGEN, UND AUS DIESEM GRUND WERDEN TECHNIKEN, PROTOKOLLE UND WERKZEUGE FÜR DIE GENTECHNIK UND DIE GENOMISCHE AUSGABE DIESER STÄMME ENTWICKELT. ALS NACHWEIS DES KONZEPTS DER NÜTZLICHKEIT DIESER STÄMME ALS NEUES BIOTECHNOLOGISCHES FAHRGESTELL WIRD EIN BIOLOGISCH ABBAUENDES VERFAHREN ZUM ABBAU VON POLY (ETHYLENTEREPHTHALAT) (PET), EINER DER HAUPTKOMPONENTEN VON KUNSTSTOFFABFÄLLEN, DIE ALLE LEBENSRÄUME DER WELT KONTAMINIERT, BEHANDELT WERDEN. DER ABBAU VON HAUSTIER WIRD MIT GENEN DURCHGEFÜHRT, DIE NATÜRLICHE PETASAS UND/ODER SYNTHETISCHE STOFFE KODIEREN, DIE IM AUSGEWÄHLTEN POLIEXTREMOPHY-CHASSIS AUSGEDRÜCKT WERDEN. UM DEN BIOLOGISCHEN ABBAU VON HEIMTIER- UND VERWANDTEN POLYMEREN ZU ERREICHEN, WERDEN TRADITIONELLE DISKONTINUIERLICHE FERMENTATIONSPROZESSE SOWIE NEUE FERMENTATIONSPROZESSE (BAKTERIELLE FESTFERMENTIERUNGSANSÄTZE) UNTER VERWENDUNG TRANSGENER POLYEXTREMOPHILIC-MIKROORGANISMEN KONZIPIERT. DARÜBER HINAUS WERDEN IN FUNGICOS SOLID STATE FERMENTATIONSSYSTEME ENTWICKELT, UND DIE ENTWICKLUNG EINES SYSTEMS DES ABBAUS VON HAUSTIER DURCH PILZE MIT HILFE DIESER TECHNOLOGIEN WIRD DURCHGEFÜHRT. (German)
9 December 2021
0 references
IN EEN EERDER ONDERZOEKSPROJECT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), ISOLEERT ONZE ONDERZOEKSGROEP, IN NAUWE SAMENWERKING MET DE ONDERZOEKSGROEPEN VAN PROFESSOREN JOSE LUIS GARCIA EN JULI PERETO, VERSCHILLENDE MICRO-ORGANISMEN MET TOLERANTIE VOOR HET OPDROGEN (XEROTOLERANTE BACTERIËN). DEZE GEÏSOLEERDE BACTERIËN BEHOREN VOORNAMELIJK TOT DE ACTINOBACTERIËN EN FIRMICUTES GROEPEN, MET SLECHTS EEN PAAR VERTEGENWOORDIGERS VAN GRAM-NEGATIEVE BACTERIËN. IN DIT ONDERZOEKSPROJECT STELLEN WE EEN DIEPE KARAKTERISERING VOOR VAN DE FYSIOLOGIE EN HET METABOLISME VAN EEN GROEP NIET-SPORULANTE FIRMICUTES GEÏSOLEERD VAN DE HELIOS METAGENOME. ZE WORDEN OOK BESCHOUWD ALS ASPECTEN VAN PHYLOGENETICA TOEWIJZING EN BIOSAFETY VAN DEZE STAMMEN. UIT DEZE POLIEXTREMOFILA-VERZAMELING VAN MICRO-ORGANISMEN ZAL EEN DISCREET AANTAL WORDEN GESELECTEERD OM DE GENEN TE ANALYSEREN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ TOLERANTIE VOOR VERSCHILLENDE OORZAKEN VAN MILIEUSTRESS DOOR MIDDEL VAN MUTATIE-, GENOMISCHE EN TRANSCRIPTOMISCHE STUDIES. DEZE MICRO-ORGANISMEN ZULLEN WORDEN VOORGESTELD ALS EEN GESCHIKT BIOTECHNOLOGISCH CHASSIS EN DAAROM ZULLEN TECHNIEKEN, PROTOCOLLEN EN INSTRUMENTEN VOOR GENETISCHE MANIPULATIE EN DE GENOMISCHE EDITIE VAN DEZE STAMMEN WORDEN ONTWIKKELD. ALS BEWIJS VOOR HET CONCEPT VAN HET NUT VAN DEZE STAMMEN DIE ALS EEN NIEUW BIOTECHNOLOGISCH CHASSIS MOETEN WORDEN GEBRUIKT, ZAL EEN BIOLOGISCH AFBREEKBAAR PROCES VOOR DE AFBRAAK VAN POLY (ETHYLEENTEREFTALAAT) (PET), EEN VAN DE BELANGRIJKSTE COMPONENTEN VAN KUNSTSTOFAFVAL DAT ALLE HABITATS IN DE WERELD VERONTREINIGT, WORDEN AANGEPAKT. DE AFBRAAK VAN GEZELSCHAPSDIEREN MOET WORDEN UITGEVOERD MET GENEN DIE NATUURLIJKE PETAS EN/OF SYNTHETISCHE STOFFEN CODEREN DIE IN HET GESELECTEERDE POLIEXTREMOPHY-CHASSIS ZULLEN WORDEN UITGEDRUKT. OM DE BIOLOGISCHE AFBRAAK VAN HUISDIER- EN AANVERWANTE POLYMEREN TE BEREIKEN, ZULLEN TRADITIONELE DISCONTINUE FERMENTATIEPROCESSEN WORDEN ONTWORPEN, EVENALS NIEUWE FERMENTATIEPROCESSEN (BACTERIËLE VASTE FERMENTATIEBENADERINGEN), WAARBIJ GEBRUIK WORDT GEMAAKT VAN TRANSGENE POLYEXTREMOPHILIC MICRO-ORGANISMEN. BOVENDIEN ZULLEN FERMENTATIESYSTEMEN WORDEN ONTWIKKELD IN FUNGICOS SOLID STATE EN ZAL DE ONTWIKKELING VAN EEN SYSTEEM VAN DEGRADATIE VAN HUISDIEREN DOOR SCHIMMELS MET BEHULP VAN DEZE TECHNOLOGIEËN WORDEN UITGEVOERD. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IN UN PRECEDENTE PROGETTO DI RICERCA (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), IL NOSTRO GRUPPO DI RICERCA, IN STRETTA COLLABORAZIONE CON I GRUPPI DI RICERCA DEI PROFESSORI JOSE LUIS GARCIA E JULI PERETO, ISOLA DIVERSI MICRORGANISMI CON TOLLERANZA ALL'ESSICCAZIONE (BATTERI XEROTOLENTI). QUESTI BATTERI ISOLATI APPARTENGONO PRINCIPALMENTE AI GRUPPI ACTINOBACTERIA E FIRMICUTES, CON SOLO POCHI RAPPRESENTANTI DI BATTERI GRAM-NEGATIVI. IN QUESTO PROGETTO DI RICERCA PROPONIAMO UNA PROFONDA CARATTERIZZAZIONE DELLA FISIOLOGIA E DEL METABOLISMO DI UN GRUPPO DI FIRMICUTE NON SPORULANT ISOLATE DAL METAGENOME DI HELIOS. SONO ANCHE CONSIDERATI ASPETTI DELL'ASSEGNAZIONE DI PHYLOGENETICA E DELLA BIOSICUREZZA DI QUESTI CEPPI. DA QUESTA RACCOLTA POLIEXTREMOFILA DI MICRORGANISMI, UN NUMERO DISCRETO DI ESSI SARÀ SELEZIONATO PER ANALIZZARE I GENI COINVOLTI NELLA TOLLERANZA ALLE DIVERSE CAUSE DI STRESS AMBIENTALE ATTRAVERSO STUDI MUTAZIONALI, GENOMICI E TRASCRITTOMICI. QUESTI MICRORGANISMI SARANNO PROPOSTI COME TELAIO BIOTECNOLOGICO APPROPRIATO E, PER QUESTO MOTIVO, SARANNO SVILUPPATE TECNICHE, PROTOCOLLI E STRUMENTI PER L'INGEGNERIA GENETICA E L'EDIZIONE GENOMICA DI QUESTI CEPPI. COME PROVA DELL'UTILITÀ DI QUESTI CEPPI DA UTILIZZARE COME NUOVO TELAIO BIOTECNOLOGICO, SARÀ AFFRONTATO UN PROCESSO BIODEGRADATIVO PER LA DEGRADAZIONE DEL POLI (ETILENE TEREFTALATO) (PET), UNO DEI PRINCIPALI COMPONENTI DEI RIFIUTI DI PLASTICA CHE CONTAMINA TUTTI GLI HABITAT DEL MONDO. LA DEGRADAZIONE DELL'ANIMALE DA COMPAGNIA DEVE ESSERE EFFETTUATA UTILIZZANDO GENI CHE CODIFICANO PETASAS NATURALI E/O SINTETICI CHE SARANNO ESPRESSI NEL TELAIO POLIEXTREMOPHY SELEZIONATO. PER OTTENERE LA BIODEGRADAZIONE DEGLI ANIMALI DOMESTICI E DEI RELATIVI POLIMERI, VERRANNO PROGETTATI PROCESSI TRADIZIONALI DI FERMENTAZIONE DISCONTINUA, NONCHÉ NUOVI PROCESSI DI FERMENTAZIONE (APPROCCI DI FERMENTAZIONE SOLIDA BATTERICA), UTILIZZANDO MICRORGANISMI POLYEXTREMOPHILIC TRANSGENICI. INOLTRE, I SISTEMI DI FERMENTAZIONE SARANNO SVILUPPATI NELLO STATO SOLIDO FUNGICOS E LO SVILUPPO DI UN SISTEMA DI DEGRADAZIONE DELL'ANIMALE DOMESTICO DA FUNGHI UTILIZZANDO QUESTE TECNOLOGIE SARÀ EFFETTUATO. (Italian)
16 January 2022
0 references
ÜHES VARASEMAS UURIMISPROJEKTIS (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R) ERALDAS MEIE LABOR TIHEDAS KOOSTÖÖS PROF JOSE LUIS GARCIA JA PROF JULI PERETO JUHITUD UURIMISRÜHMADEGA ERI MIKROORGANISME, MIS TALUVAD KUIVATAMIST (KSEROTOLERANTSED BAKTERID). NEED ISOLEERITUD BAKTERID KUULUVAD PEAMISELT ACTINOBACTERIA JA FIRMICUTES RÜHMADESSE, KUS ON VAID VÄHESED GRAMNEGATIIVSETE BAKTERITE ESINDAJAD. KÄESOLEVAS UURIMISPROJEKTIS TEEME ETTEPANEKU HELIOSE METAGENOOMIST ERALDATUD MITTEPOORSETE PÜSIVATE AINETE FÜSIOLOOGIA JA AINEVAHETUSE PÕHJALIKUKS ISELOOMUSTAMISEKS. ARVESSE VÕETAKSE KA NENDE TÜVEDE FÜLOGENEETILISE KIRJELDUSE JA BIOTURVALISUSE ASPEKTE. SELLEST MIKROORGANISMIDE POLYEXTREMOPHILE KOLLEKTSIOONIST VALITAKSE DISKREETNE ARV NEID, ET ANALÜÜSIDA MUTATSIOONI-, GENOOMI- JA TRANSKRIPTOOMILISTE UURINGUTE ABIL ERINEVATE KESKKONNAVIGASTUSTE TALUVUSE GEENE. NEID MIKROORGANISME PEETAKSE SOBIVAKS BIOTEHNOLOOGILISEKS ŠASSIIKS NING SEL PÕHJUSEL TÖÖTATAKSE VÄLJA NENDE TÜVEDE GEENITEHNOLOOGIA JA GENOOMILISE VÄLJAANDE MEETODID, PROTOKOLLID JA VAHENDID. SELLEKS ET TÕENDADA NENDE TÜVEDE KASULIKKUST UUE BIOTEHNOLOOGIA ŠASSIINA, LÄHENETAKSE BIOLAGUNEVALE PROTSESSILE POLÜ(ETÜLEENTEREFTALAADI) (PET) LAGUNEMISEKS, MIS ON ÜKS PEAMISI PLASTIJÄÄTMETE KOMPONENTE, MIS SAASTAVAD KÕIKI ELUPAIKU MAAILMAS. LEMMIKLOOMADE LAGUNEMISEL KASUTATAKSE LOODUSLIKKE JA/VÕI SÜNTEETILISI PETASES KODEERIVAID GEENE, MIDA VÄLJENDATAKSE VALITUD POLYEXTREMOPHILE ŠASSIIS. LEMMIKLOOMADE JA NENDEGA SEOTUD POLÜMEERIDE BIOLAGUNDAMISEKS TÖÖTATAKSE VÄLJA NII TRADITSIOONILINE PARTIIDE KÄÄRITAMINE KUI KA UUED KÄÄRIMISPROTSESSID (BAKTERIAALSED TAHKE KÄÄRITAMISE MEETODID), KASUTADES TRANSGEENSEID POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANISME. LISAKS SELLELE HÄÄLESTATAKSE TAHKISVALGU KÄÄRITAMIST SEENTE ABIL NING TÖÖTATAKSE VÄLJA LÄHENEMISVIIS LEMMIKLOOMADE LAGUNEMISELE SEENTE POOLT, KASUTADES SEDA TEHNOLOOGIAT. (Estonian)
4 August 2022
0 references
ANKSTESNIAME MOKSLINIŲ TYRIMŲ PROJEKTE (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R) MŪSŲ LABORATORIJA, GLAUDŽIAI BENDRADARBIAUDAMA SU PROF. JOSE LUIS GARCIA IR PROF. JULI PERETO VADOVAUJAMOMIS TYRIMO GRUPĖMIS, IZOLIAVO ĮVAIRIUS MIKROORGANIZMUS SU TOLERANCIJA DESICCACIJAI (KSEROTOLERANTIŠKOS BAKTERIJOS). ŠIOS IZOLIUOTOS BAKTERIJOS DAUGIAUSIA PRIKLAUSO ACTINOBACTERIA IR FIRMICUTES GRUPĖMS, KURIOSE YRA TIK KELI GRAMNEIGIAMŲ BAKTERIJŲ ATSTOVAI. DABARTINIAME MOKSLINIŲ TYRIMŲ PROJEKTE SIŪLOME IŠ HELIOS METAGENOMOS IZOLIUOTŲ NEPORUOJANČIŲ FIRMICUTES GRUPĖS FIZIOLOGIJOS IR METABOLIZMO GILŲ APIBŪDINIMĄ. TAIP PAT ATSIŽVELGIAMA Į ŠIŲ PADERMIŲ FILOGOGENETINĮ SKELBIMĄ IR BIOLOGINIO SAUGUMO ASPEKTUS. IŠ ŠIOS POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANIZMŲ KOLEKCIJOS BUS PASIRINKTAS ATSKIRAS JŲ SKAIČIUS, KAD BŪTŲ GALIMA ANALIZUOTI GENUS, DALYVAUJANČIUS ĮVAIRIŲ APLINKOS SUŽALOJIMŲ TOLERANCIJA, ATLIEKANT MUTACIJŲ, GENOMINIUS IR TRANSKRIPTOMINIUS TYRIMUS. ŠIE MIKROORGANIZMAI BUS LAIKOMI TINKAMA BIOTECHNOLOGINE VAŽIUOKLE, TODĖL BUS SUKURTI ŠIŲ PADERMIŲ GENETINĖS INŽINERIJOS IR GENOMINIO LEIDIMO METODAI, PROTOKOLAI IR PRIEMONĖS. SIEKIANT ĮRODYTI ŠIŲ ŠTAMŲ, KAIP NAUJOS BIOTECHNOLOGINĖS VAŽIUOKLĖS, NAUDINGUMĄ, BUS PRADĖTAS BIOLOGINIS POLIETILENTEREFTALATO (NAMINIŲ GYVŪNĖLIŲ) SKILIMO PROCESAS, KURIS YRA VIENA IŠ PAGRINDINIŲ PLASTIKO ATLIEKŲ, TERŠIANČIŲ VISAS PASAULIO BUVEINES, SUDEDAMŲJŲ DALIŲ. NAMINIŲ GYVŪNĖLIŲ SKILIMAS BUS ATLIEKAMAS NAUDOJANT GENUS, KODUOJANČIUS NATŪRALIUS IR (ARBA) SINTETINIUS PETAS, KURIE BUS IŠREIKŠTI PASIRINKTOJE POLYEXTREMOPHILE VAŽIUOKLĖJE. NORINT PASIEKTI NAMINIŲ GYVŪNĖLIŲ IR SUSIJUSIŲ POLIMERŲ BIOLOGINĮ SKAIDYMĄ, BUS SUKURTA TRADICINĖ PARTIJOS FERMENTACIJA, TAIP PAT NAUJI FERMENTACIJOS PROCESAI (BAKTERINIAI KIETOSIOS FERMENTACIJOS METODAI), NAUDOJANT TRANSGENINIUS POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANIZMUS. BE TO, BUS SUREGULIUOTOS GRYBELINĖS KIETOSIOS BŪSENOS FERMENTACIJOS IR BUS SUKURTAS POŽIŪRIS Į NAMINIŲ GYVŪNĖLIŲ DEGRADACIJĄ GRYBAIS NAUDOJANT ŠIĄ TECHNOLOGIJĄ. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
U PRETHODNOM ISTRAŽIVAČKOM PROJEKTU (HELIOS, BIO 2015 – 66960-C3 – 3-R) NAŠ LABORATORIJ, U BLISKOJ SURADNJI S ISTRAŽIVAČKIM GRUPAMA KOJE SU VODILI PROF. JOSE LUIS GARCIA I PROF. JULI PERETO, IZDVOJIO JE RAZLIČITE MIKROORGANIZME S TOLERANCIJOM NA SUŠENJE (KSEROTOLERANTNE BAKTERIJE). TE IZOLIRANE BAKTERIJE UGLAVNOM PRIPADAJU SKUPINAMA ACTINOBACTERIA I FIRMICUTES, SA SAMO NEKOLIKO PREDSTAVNIKA GRAM-NEGATIVNIH BAKTERIJA. U OVOM ISTRAŽIVAČKOM PROJEKTU PREDLAŽEMO DUBINSKU KARAKTERIZACIJU FIZIOLOGIJE I METABOLIZMA SKUPINE NESPORULIRAJUĆIH FIRMIKUTA IZOLIRANIH IZ HELIOS MEAGENOMA. RAZMATRAJU SE I FILOGENETSKI ADSCRIPTION I BIOSIGURNOSNI ASPEKTI TIH SOJEVA. IZ OVE POLIEXTREMOPHILE KOLEKCIJE MIKROORGANIZAMA ODABIRE SE DISKRETNI BROJ TIH MIKROORGANIZAMA ZA ANALIZU GENA UKLJUČENIH U TOLERANCIJU NA RAZLIČITE OZLJEDE OKOLIŠA KROZ MUTACIJSKA, GENOMSKA I TRANSKRIPTOMSKA ISTRAŽIVANJA. TI MIKROORGANIZMI SMATRAT ĆE SE PRIKLADNIM BIOTEHNOLOŠKIM ŠASIJAMA, TE ĆE SE IZ TOG RAZLOGA RAZVITI TEHNIKE, PROTOKOLI I ALATI ZA GENETIČKI INŽENJERING I GENOMSKO IZDANJE TIH SOJEVA. KAO DOKAZ KONCEPTA KORISNOSTI OVIH SOJEVA KAO NOVE BIOTEHNOLOŠKE ŠASIJE, PRISTUPIT ĆE SE BIORAZGRADNOM PROCESU ZA RAZGRADNJU POLI (ETILEN TEREFTALATA) (KUĆNI LJUBIMCI), JEDNOJ OD GLAVNIH KOMPONENTI PLASTIČNOG OTPADA KOJI KONTAMINIRA SVA STANIŠTA U SVIJETU. DEGRADACIJA KUĆNIH LJUBIMACA PROVODIT ĆE SE POMOĆU GENA KOJI KODIRAJU PRIRODNE I/ILI SINTETIČKE PETASES KOJI ĆE BITI IZRAŽENI U ODABRANOM POLIEXTREMOPHILE ŠASIJI. ZA POSTIZANJE BIORAZGRADNJE KUĆNIH LJUBIMACA I SRODNIH POLIMERA, KONCIPIRAT ĆE SE TRADICIONALNA SERIJSKA FERMENTACIJA, KAO I NOVI PROCESI FERMENTACIJE (BAKTERIJSKI PRISTUPI SOLIDNE FERMENTACIJE), PRIMJENOM TRANSGENSKIH POLIEXTREMOPHILE MIKROORGANIZAMA. OSIM TOGA, GLJIVIČNE SOLID-STATE FERMENTACIJE ĆE SE PODEŠAVATI, A PRISTUP PET DEGRADACIJE GLJIVA POMOĆU OVE TEHNOLOGIJE ĆE BITI NAPRAVLJEN. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΣΕ ΈΝΑ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΌ ΈΡΓΟ (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), ΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΌ ΜΑΣ, ΣΕ ΣΤΕΝΉ ΣΥΝΕΡΓΑΣΊΑ ΜΕ ΤΙΣ ΟΜΆΔΕΣ ΈΡΕΥΝΑΣ ΜΕ ΕΠΙΚΕΦΑΛΉΣ ΤΟΝ ΚΑΘΗΓΗΤΉ JOSE LUIS GARCIA ΚΑΙ ΤΟΝ ΚΑΘΗΓΗΤΉ JULI PERETO, ΑΠΟΜΌΝΩΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΟΎΣ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎΣ ΜΕ ΑΝΟΧΉ ΣΤΗΝ ΑΦΥΔΆΤΩΣΗ (ΞΕΡΟΑΝΘΕΚΤΙΚΆ ΒΑΚΤΉΡΙΑ). ΑΥΤΆ ΤΑ ΜΕΜΟΝΩΜΈΝΑ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΑΝΉΚΟΥΝ ΚΥΡΊΩΣ ΣΕ ΟΜΆΔΕΣ ACTINOBACTERIA ΚΑΙ FIRMICUTES, ΜΕ ΛΊΓΟΥΣ ΜΌΝΟ ΕΚΠΡΟΣΏΠΟΥΣ ΑΡΝΗΤΙΚΏΝ ΚΑΤΆ GRAM ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ. ΣΤΟ ΠΑΡΌΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΌ ΈΡΓΟ ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΈΝΑΝ ΒΑΘΎ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΦΥΣΙΟΛΟΓΊΑΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΎ ΜΙΑΣ ΟΜΆΔΑΣ ΜΗ-ΑΠΟΡΡΥΠΑΝΤΙΚΏΝ FIRMICUTES ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΏΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ ΜΕΤΑΓΟΝΙΏΔΕΣ HELIOS. ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΥΠΌΨΗ Η ΦΥΛΟΓΕΝΕΤΙΚΉ ΕΠΙΓΡΑΦΉ ΚΑΙ ΟΙ ΠΤΥΧΈΣ ΒΙΟΠΡΟΦΎΛΑΞΗΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ. ΑΠΌ ΑΥΤΉ ΤΗ ΣΥΛΛΟΓΉ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ POLYEXTREMOPHILE, ΘΑ ΕΠΙΛΕΓΕΊ ΈΝΑΣ ΔΙΑΚΡΙΤΌΣ ΑΡΙΘΜΌΣ ΑΠΌ ΑΥΤΟΎΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΝΟΧΉ ΓΙΑ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΟΎΣ ΤΡΑΥΜΑΤΙΣΜΟΎΣ ΜΈΣΩ ΜΕΤΑΛΛΑΞΙΟΛΟΓΙΚΏΝ, ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ ΚΑΙ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΏΝ ΜΕΛΕΤΏΝ. ΑΥΤΟΊ ΟΙ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΊ ΘΑ ΘΕΩΡΗΘΟΎΝ ΚΑΤΆΛΛΗΛΟ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΌ ΠΛΑΊΣΙΟ ΚΑΙ ΓΙΑ ΤΟ ΛΌΓΟ ΑΥΤΌ ΘΑ ΑΝΑΠΤΥΧΘΟΎΝ ΤΕΧΝΙΚΈΣ, ΠΡΩΤΌΚΟΛΛΑ ΚΑΙ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΜΗΧΑΝΙΚΉΣ ΚΑΙ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΈΚΔΟΣΗΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ. ΩΣ ΑΠΌΔΕΙΞΗ ΤΗΣ ΈΝΝΟΙΑΣ ΤΗΣ ΧΡΗΣΙΜΌΤΗΤΑΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΩΣ ΝΈΟΥ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟΎ ΠΛΑΙΣΊΟΥ, ΘΑ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙ ΜΙΑ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΒΙΟΑΠΟΙΚΟΔΌΜΗΣΗΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΠΟΔΌΜΗΣΗ ΠΟΛΥ(ΤΕΡΕΦΘΑΛΙΚΟΎ ΑΙΘΥΛΕΝΊΟΥ) (PET), ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΚΎΡΙΑ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΤΩΝ ΠΛΑΣΤΙΚΏΝ ΑΠΟΒΛΉΤΩΝ ΠΟΥ ΜΟΛΎΝΟΥΝ ΌΛΟΥΣ ΤΟΥΣ ΟΙΚΟΤΌΠΟΥΣ ΣΤΟΝ ΚΌΣΜΟ. Η ΑΠΟΙΚΟΔΌΜΗΣΗ ΤΩΝ ΖΏΩΝ ΣΥΝΤΡΟΦΙΆΣ ΘΑ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΕΊΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΟΎΝ ΦΥΣΙΚΆ Ή/ΚΑΙ ΣΥΝΘΕΤΙΚΆ PETASES ΠΟΥ ΘΑ ΕΚΦΡΆΖΟΝΤΑΙ ΣΤΟ ΕΠΙΛΕΓΜΈΝΟ ΠΛΑΊΣΙΟ POLYEXTREMOPHILE. ΓΙΑ ΝΑ ΕΠΙΤΕΥΧΘΕΊ Η ΒΙΟΑΠΟΙΚΟΔΌΜΗΣΗ ΤΟΥ ΚΑΤΟΙΚΊΔΙΟΥ ΖΏΟΥ ΚΑΙ ΤΩΝ ΣΥΝΑΦΏΝ ΠΟΛΥΜΕΡΏΝ, ΘΑ ΣΧΕΔΙΑΣΤΕΊ Η ΠΑΡΑΔΟΣΙΑΚΉ ΖΎΜΩΣΗ ΠΑΡΤΊΔΑΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΝΈΕΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ ΖΎΜΩΣΗΣ (ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΈΣ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ ΣΤΕΡΕΆΣ ΖΎΜΩΣΗΣ), ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΤΟΥΣ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΟΎΣ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎΣ POLYEXTREMOPHILE. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΟΙ ΜΥΚΗΤΙΑΣΙΚΈΣ ΖΥΜΏΣΕΙΣ ΣΤΕΡΕΆΣ ΚΑΤΆΣΤΑΣΗΣ ΘΑ ΣΥΝΤΟΝΙΣΤΟΎΝ ΚΑΙ ΘΑ ΓΊΝΕΙ ΜΙΑ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ ΓΙΑ ΤΗΝ ΥΠΟΒΆΘΜΙΣΗ ΤΩΝ ΖΏΩΝ ΣΥΝΤΡΟΦΙΆΣ ΑΠΌ ΜΎΚΗΤΕΣ ΠΟΥ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΤΕΧΝΟΛΟΓΊΑ. (Greek)
4 August 2022
0 references
V PREDCHÁDZAJÚCOM VÝSKUMNOM PROJEKTE (HELIOS, BIO 2015 – 66960-C3 – 3-R), NAŠE LABORATÓRIUM, V ÚZKEJ SPOLUPRÁCI S VÝSKUMNÝMI SKUPINAMI POD VEDENÍM PROF. JOSE LUIS GARCIA A PROF. JULI PERETO, IZOLOVANÉ RÔZNE MIKROORGANIZMY S TOLERANCIOU NA VYSÚŠANIE (XEROTOLERANTNÉ BAKTÉRIE). TIETO IZOLOVANÉ BAKTÉRIE PATRIA NAJMÄ DO SKUPÍN ACTINOBACTERIA A FIRMICUTES, PRIČOM LEN NIEKOĽKO ZÁSTUPCOV GRAMNEGATÍVNYCH BAKTÉRIÍ. V SÚČASNOM VÝSKUMNOM PROJEKTE NAVRHUJEME HLBOKÚ CHARAKTERIZÁCIU FYZIOLÓGIE A METABOLIZMU SKUPINY NESPORULAČNÝCH FIRMICUTES IZOLOVANÝCH OD HELIOS METAGENOME. UVAŽUJE SA AJ O FYTOGENETICKÝCH PRÍPISOCH A BIOBEZPEČNOSTNÝCH ASPEKTOCH TÝCHTO KMEŇOV. Z TEJTO POLYEXTREMOPHILE KOLEKCIE MIKROORGANIZMOV SA VYBERIE DISKRÉTNY POČET Z NICH, ABY SA ANALYZOVALI GÉNY PODIEĽAJÚCE SA NA TOLERANCII RÔZNYCH PORANENÍ ŽIVOTNÉHO PROSTREDIA PROSTREDNÍCTVOM MUTAČNÝCH, GENÓMOVÝCH A TRANSKRIPTOMICKÝCH ŠTÚDIÍ. TIETO MIKROORGANIZMY SA BUDÚ POVAŽOVAŤ ZA VHODNÝ BIOTECHNOLOGICKÝ PODVOZOK, A PRETO SA VYVINÚ TECHNIKY, PROTOKOLY A NÁSTROJE PRE GENETICKÉ INŽINIERSTVO A GENÓMOVÉ VYDANIE TÝCHTO KMEŇOV. AKO DÔKAZ KONCEPCIE UŽITOČNOSTI TÝCHTO KMEŇOV AKO NOVÉHO BIOTECHNOLOGICKÉHO PODVOZKU SA BUDE PRISTUPOVAŤ K BIOLOGICKY ROZLOŽITEĽNÉMU PROCESU ROZKLADU POLY(ETYLÉNTEREFTALÁTU) (PET), KTORÝ JE JEDNOU Z HLAVNÝCH ZLOŽIEK PLASTOVÉHO ODPADU KONTAMINUJÚCEHO VŠETKY BIOTOPY NA SVETE. DEGRADÁCIA SPOLOČENSKÝCH ZVIERAT SA VYKONÁ POMOCOU GÉNOV KÓDUJÚCICH PRÍRODNÉ A/ALEBO SYNTETICKÉ PETASES, KTORÉ SA VYJADRIA VO VYBRANOM PODVOZKU POLYEXTREMOPHILE. NA DOSIAHNUTIE BIODEGRADÁCIE SPOLOČENSKÝCH ZVIERAT A PRÍBUZNÝCH POLYMÉROV BUDE NAVRHNUTÁ TRADIČNÁ DÁVKOVÁ FERMENTÁCIA, AKO AJ NOVÉ FERMENTAČNÉ PROCESY (BAKTERIÁLNE PEVNÉ FERMENTAČNÉ PRÍSTUPY) POMOCOU TRANSGÉNNYCH POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANIZMOV. OKREM TOHO SA NALADÍ KVASENIE V PEVNEJ FORME HÚB A UROBÍ SA PRÍSTUP K DEGRADÁCII DOMÁCICH ZVIERAT HUBAMI POMOCOU TEJTO TECHNOLÓGIE. (Slovak)
4 August 2022
0 references
AIEMMASSA TUTKIMUSHANKKEESSA (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R) LABORATORIOMME EROTTI LÄHEISESSÄ YHTEISTYÖSSÄ PROFESSORI JOSE LUIS GARCIAN JA PROFESSORI JULI PERETON JOHTAMAN TUTKIMUSRYHMÄN KANSSA ERI MIKRO-ORGANISMIT, JOTKA SIETÄVÄT KUIVUMISTA (KSEROTOLERANTTEJA BAKTEEREJA). NÄMÄ ERISTETYT BAKTEERIT KUULUVAT PÄÄASIASSA ACTINOBACTERIA- JA FIRMICUTES-RYHMIIN, JOISSA ON VAIN MUUTAMIA GRAMNEGATIIVISTEN BAKTEERIEN EDUSTAJIA. TÄSSÄ TUTKIMUSHANKKEESSA EHDOTAMME HELIOS METAGENOMEISTA ERISTETTYJEN EI-SPORULOIVAN FIRMICUTE-RYHMÄN FYSIOLOGIAN JA AINEENVAIHDUNNAN SYVÄLLISTÄ KARAKTERISOINTIA. MYÖS NÄIDEN KANTOJEN FYLOGENEETTINEN ADKRIPTIO JA BIOTURVALLISUUS OTETAAN HUOMIOON. TÄSTÄ MIKRO-ORGANISMIEN POLYEXTREMOPHILE-KOKOELMASTA VALITAAN ERILLINEN MÄÄRÄ NIITÄ ANALYSOIMAAN GEENEJÄ, JOTKA LIITTYVÄT ERILAISTEN YMPÄRISTÖVAHINKOJEN SIETOKYKYYN MUTAATIO-, GENOMI- JA TRANSKRIPTOMISTEN TUTKIMUSTEN AVULLA. NÄITÄ MIKRO-ORGANISMEJA PIDETÄÄN SOPIVANA BIOTEKNOLOGISENA ALUSTANA, JA TÄSTÄ SYYSTÄ KEHITETÄÄN GEENITEKNIIKAN TEKNIIKOITA, PROTOKOLLIA JA TYÖKALUJA SEKÄ NÄIDEN KANTOJEN GENOMIVERSIOTA. OSOITUKSENA NÄIDEN KANTOJEN HYÖDYLLISYYDESTÄ UUTENA BIOTEKNOLOGISENA ALUSTANA LÄHESTYTÄÄN BIOHAJOAVAA PROSESSIA POLY(ETEENITEREFTALAATIN) (LEMMIKKIELÄINTEN) HAJOAMISESSA, JOKA ON YKSI MAAILMAN KAIKKIA ELINYMPÄRISTÖJÄ SAASTUTTAVIEN MUOVIJÄTTEIDEN TÄRKEIMMISTÄ KOMPONENTEISTA. LEMMIKKIELÄINTEN HAJOAMINEN SUORITETAAN KÄYTTÄMÄLLÄ GEENEJÄ, JOTKA KOODAAVAT LUONNOLLISIA JA/TAI SYNTEETTISIÄ PETASESEJA, JOTKA ILMAISTAAN VALITUSSA POLYEXTREMOPHILE-ALUSTASSA. LEMMIKKIELÄINTEN JA NIIHIN LIITTYVIEN POLYMEERIEN BIOHAJOAVUUDEN SAAVUTTAMISEKSI SUUNNITELLAAN PERINTEINEN ERÄKÄYMINEN SEKÄ UUDET KÄYMISPROSESSIT (BAKTEERINEN KIINTEÄ FERMENTOINTI) KÄYTTÄEN SIIRTOGEENISIÄ POLYEXTREMOPHILE-MIKRO-ORGANISMEJA. LISÄKSI SIENI KIINTEÄ-TILA KÄYMINEN VIRITETÄÄN, JA LÄHESTYMISTAPA LEMMIKKIELÄINTEN HAJOAMINEN SIENIÄ KÄYTTÄMÄLLÄ TÄTÄ TEKNIIKKAA TEHDÄÄN. (Finnish)
4 August 2022
0 references
W POPRZEDNIM PROJEKCIE BADAWCZYM (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R) NASZE LABORATORIUM, W ŚCISŁEJ WSPÓŁPRACY Z GRUPAMI DOCHODZENIOWYMI PROWADZONYMI PRZEZ PROF. JOSE LUISA GARCIĘ I PROF. JULI PERETO, WYIZOLOWAŁO RÓŻNE MIKROORGANIZMY Z TOLERANCJĄ NA OSUSZANIE (BAKTERIE KSEROTOLERANCYJNE). TE WYIZOLOWANE BAKTERIE NALEŻĄ GŁÓWNIE DO GRUP ACTINOBACTERIA I FIRMICUTES, Z ZALEDWIE KILKOMA PRZEDSTAWICIELAMI BAKTERII GRAM-UJEMNYCH. W OBECNYM PROJEKCIE BADAWCZYM PROPONUJEMY GŁĘBOKĄ CHARAKTERYSTYKĘ FIZJOLOGII I METABOLIZMU GRUPY NIESPORUJĄCYCH JĘDRNOŚCI WYIZOLOWANYCH Z METAGENOMU HELIOSA. ROZWAŻANE SĄ RÓWNIEŻ ASPEKTY FITOGENETYCZNE I BIOASEKURACJI TYCH SZCZEPÓW. Z TEJ KOLEKCJI DROBNOUSTROJÓW POLYEXTREMOPHILE WYBRANA ZOSTANIE DYSKRETNA ICH LICZBA DO ANALIZY GENÓW ZAANGAŻOWANYCH W TOLERANCJĘ NA RÓŻNE URAZY ŚRODOWISKOWE POPRZEZ BADANIA MUTACYJNE, GENOMOWE I TRANSKRYPTOMICZNE. MIKROORGANIZMY TE ZOSTANĄ UZNANE ZA ODPOWIEDNIE BIOTECHNOLOGICZNE PODWOZIE I Z TEGO POWODU OPRACOWANE ZOSTANĄ TECHNIKI, PROTOKOŁY I NARZĘDZIA INŻYNIERII GENETYCZNEJ I GENOMICZNEJ EDYCJI TYCH SZCZEPÓW. JAKO DOWÓD NA UŻYTECZNOŚĆ TYCH SZCZEPÓW JAKO NOWEGO BIOTECHNOLOGICZNEGO PODWOZIA, PODEJMOWANY BĘDZIE BIODEGRADACYJNY PROCES DEGRADACJI POLI(TEREFTALANU ETYLENU) (ZWIERZĘT), KTÓRY JEST JEDNYM Z GŁÓWNYCH SKŁADNIKÓW ODPADÓW Z TWORZYW SZTUCZNYCH ZANIECZYSZCZAJĄCYCH WSZYSTKIE SIEDLISKA NA ŚWIECIE. DEGRADACJA PET ZOSTANIE PRZEPROWADZONA PRZY UŻYCIU GENÓW KODUJĄCYCH NATURALNE I/LUB SYNTETYCZNE PETASES, KTÓRE BĘDĄ WYRAŻONE W WYBRANEJ PODWOZIU POLYEXTREMOPHILE. ABY OSIĄGNĄĆ BIODEGRADACJĘ ZWIERZĄT DOMOWYCH I POWIĄZANYCH POLIMERÓW, ZOSTANIE OPRACOWANA TRADYCYJNA FERMENTACJA WSADOWA, A TAKŻE NOWE PROCESY FERMENTACJI (BAKTERYJNE METODY FERMENTACJI STAŁEJ), PRZY UŻYCIU TRANSGENICZNYCH MIKROORGANIZMÓW POLYEXTREMOPHILE. PONADTO FERMENTACJE STAŁE GRZYBICZE BĘDĄ DOSTROJONE, A PODEJŚCIE DO DEGRADACJI ZWIERZĄT DOMOWYCH PRZEZ GRZYBY ZA POMOCĄ TEJ TECHNOLOGII ZOSTANIE WYKONANE. (Polish)
4 August 2022
0 references
EGY KORÁBBI KUTATÁSI PROJEKTBEN (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R), LABORATÓRIUMUNK, SZOROS EGYÜTTMŰKÖDÉSBEN A PROF. JOSE LUIS GARCIA ÉS PROF. JULI PERETO ÁLTAL VEZETETT VIZSGÁLATI CSOPORTOKKAL, KÜLÖNBÖZŐ MIKROORGANIZMUSOKAT IZOLÁLTAK KISZÁRADÁSSAL SZEMBEN (XEROTOLERANT BAKTÉRIUMOK). EZEK AZ IZOLÁLT BAKTÉRIUMOK FŐLEG AZ ACTINOBACTERIA ÉS A FIRMICUTES CSOPORTOKHOZ TARTOZNAK, A GRAM-NEGATÍV BAKTÉRIUMOKNAK CSAK NÉHÁNY KÉPVISELŐJE VAN. A JELEN KUTATÁSI PROJEKTBEN A HELIOS METAGENOME-BŐL IZOLÁLT, NEM PORLÁLÓ FIRMICUTES CSOPORT FIZIOLÓGIAI ÉS METABOLIZMUSÁNAK MÉLY JELLEMZÉSÉT JAVASOLJUK. E TÖRZSEK FILOGENETIKAI ADSCRIPTION ÉS BIOLÓGIAI BIZTONSÁGI VONATKOZÁSAIT IS FIGYELEMBE KELL VENNI. EBBŐL A POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANIZMUS-GYŰJTEMÉNYBŐL KIVÁLASZTANAK EGY DISZKRÉT SZÁMOT A MUTÁCIÓS, GENOMIKUS ÉS TRANSZKRIPTOMIKUS VIZSGÁLATOK SORÁN A KÜLÖNBÖZŐ KÖRNYEZETI SÉRÜLÉSEKKEL SZEMBENI TOLERANCIÁBAN RÉSZT VEVŐ GÉNEK ELEMZÉSÉRE. EZEK A MIKROORGANIZMUSOK MEGFELELŐ BIOTECHNOLÓGIAI ALVÁZNAK TEKINTENDŐK, ÉS EZÉRT E TÖRZSEK GÉNTECHNOLÓGIAI ÉS GENOMIKUS KIADÁSÁRA SZOLGÁLÓ TECHNIKÁKAT, PROTOKOLLOKAT ÉS ESZKÖZÖKET FOGNAK KIDOLGOZNI. E TÖRZSEK ÚJ BIOTECHNOLÓGIAI ALVÁZKÉNT VALÓ HASZNOSSÁGÁNAK BIZONYÍTÉKAKÉNT A POLI(ETILÉN TEREFTALÁT) (PET) LEBOMLÁSÁNAK BIOLÓGIAI LEBONTHATÓSÁGÁT, AMELY A VILÁG VALAMENNYI ÉLŐHELYÉT SZENNYEZŐ MŰANYAGHULLADÉKOK EGYIK FŐ ÖSSZETEVŐJE, MEG FOGJÁK KÖZELÍTENI. A KEDVTELÉSBŐL TARTOTT ÁLLATOK LEBOMLÁSA TERMÉSZETES ÉS/VAGY SZINTETIKUS PETASES KÓDOLÓ GÉNEKKEL TÖRTÉNIK, AMELYEKET A KIVÁLASZTOTT POLYEXTREMOPHILE ALVÁZBAN FEJEZNEK KI. A KEDVTELÉSBŐL TARTOTT ÁLLATOK ÉS A KAPCSOLÓDÓ POLIMEREK BIOLÓGIAI LEBOMLÁSÁNAK ELÉRÉSE ÉRDEKÉBEN A TRANSZGENIKUS POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANIZMUSOK FELHASZNÁLÁSÁVAL HAGYOMÁNYOS SZAKASZOS FERMENTÁCIÓT, VALAMINT ÚJ FERMENTÁCIÓS FOLYAMATOKAT (BAKTERIÁLIS SZILÁRD ERJESZTÉSI MEGKÖZELÍTÉSEK) TERVEZNEK. TOVÁBBÁ, GOMBÁS SZILÁRD ÁLLAPOTÚ FERMENTÁCIÓK HANGOLJÁK FEL, ÉS A MEGKÖZELÍTÉS A KEDVTELÉSBŐL TARTOTT ÁLLATOK GOMBÁK SEGÍTSÉGÉVEL EZT A TECHNOLÓGIÁT. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
V PŘEDCHOZÍM VÝZKUMNÉM PROJEKTU (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R) NAŠE LABORATOŘ V ÚZKÉ SPOLUPRÁCI S VYŠETŘOVACÍMI SKUPINAMI VEDENÝMI PROF. JOSEM LUISEM GARCIOU A PROF. JULI PERETOVOU IZOLOVALA RŮZNÉ MIKROORGANISMY S TOLERANCÍ K VYSUŠENÍ (XEROTOLERANTNÍ BAKTERIE). TYTO IZOLOVANÉ BAKTERIE PATŘÍ HLAVNĚ DO SKUPIN ACTINOBACTERIA A FIRMICUTES, S NĚKOLIKA ZÁSTUPCI GRAMNEGATIVNÍCH BAKTERIÍ. V SOUČASNÉM VÝZKUMNÉM PROJEKTU NAVRHUJEME HLOUBKOVOU CHARAKTERIZACI FYZIOLOGIE A METABOLISMU SKUPINY NESPORUJÍCÍCH FIRMICUTES IZOLOVANÝCH Z HELIOS METAGENOMU. ZVAŽOVÁNY JSOU ROVNĚŽ ASPEKTY FYLOGENETICKÉHO NÁPISU A BIOLOGICKÉ BEZPEČNOSTI TĚCHTO KMENŮ. Z TÉTO SBÍRKY MIKROORGANISMŮ POLYEXTREMOPHILE BUDE VYBRÁN DISKRÉTNÍ POČET Z NICH PRO ANALÝZU GENŮ PODÍLEJÍCÍCH SE NA TOLERANCI PRO RŮZNÁ POŠKOZENÍ ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ PROSTŘEDNICTVÍM MUTAČNÍCH, GENOMICKÝCH A TRANSKRIPTOMICKÝCH STUDIÍ. TYTO MIKROORGANISMY BUDOU POVAŽOVÁNY ZA VHODNÉ BIOTECHNOLOGICKÉ PODVOZKY A Z TOHOTO DŮVODU BUDOU VYVINUTY TECHNIKY, PROTOKOLY A NÁSTROJE PRO GENETICKÉ INŽENÝRSTVÍ A GENOMICKÉ VYDÁNÍ TĚCHTO KMENŮ. JAKO DŮKAZ KONCEPTU UŽITEČNOSTI TĚCHTO KMENŮ JAKO NOVÉHO BIOTECHNOLOGICKÉHO PODVOZKU BUDE PŘISTUPOVÁN K BIODEGRADAČNÍMU PROCESU PRO ODBOURÁVÁNÍ POLY (ETHYLENTEREFTALÁTU) (PET), COŽ JE JEDNA Z HLAVNÍCH SLOŽEK PLASTOVÝCH ODPADŮ KONTAMINUJÍCÍCH VŠECHNA STANOVIŠTĚ NA SVĚTĚ. ODBOURÁVÁNÍ ZVÍŘAT V ZÁJMOVÉM CHOVU SE PROVEDE POMOCÍ GENŮ KÓDUJÍCÍCH PŘÍRODNÍ A/NEBO SYNTETICKÉ PETASES, KTERÉ BUDOU VYJÁDŘENY VE VYBRANÉM PODVOZKU POLYEXTREMOPHILE. PRO DOSAŽENÍ BIOLOGICKÉHO ROZKLADU DOMÁCÍCH A PŘÍBUZNÝCH POLYMERŮ BUDOU NAVRŽENY TRADIČNÍ DÁVKOVÉ FERMENTACE, JAKOŽ I NOVÉ FERMENTAČNÍ PROCESY (PŘÍSTUPY BAKTERIÁLNÍ TUHÉ FERMENTACE) POMOCÍ TRANSGENNÍCH MIKROORGANISMŮ POLYEXTREMOPHILE. KROMĚ TOHO BUDOU VYLADĚNY PLÍSŇOVÉ KVAŠENÍ V PEVNÉM STAVU A BUDE VYTVOŘEN PŘÍSTUP K DEGRADACI ZVÍŘAT HOUBAMI POMOCÍ TÉTO TECHNOLOGIE. (Czech)
4 August 2022
0 references
IEPRIEKŠĒJĀ PĒTNIECĪBAS PROJEKTĀ (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R), MŪSU LABORATORIJA CIEŠĀ SADARBĪBĀ AR IZMEKLĒŠANAS GRUPĀM PROF. JOSE LUIS GARCIA UN PROF. JULI PERETO, IZOLĒJA DAŽĀDUS MIKROORGANISMUS AR IZTURĪBU PRET DESIKĀCIJU (XEROTOLERANT BAKTĒRIJAS). ŠĪS IZOLĒTĀS BAKTĒRIJAS GALVENOKĀRT PIEDER ACTINOBACTERIA UN FIRMICUTES GRUPĀM, KURĀS IR TIKAI DAŽI GRAMNEGATĪVO BAKTĒRIJU PĀRSTĀVJI. ŠAJĀ PĒTNIECĪBAS PROJEKTĀ MĒS IEROSINĀM DZIĻI RAKSTUROT NO HELIOS METAGENOME IZOLĒTU NESPORĒJOŠU FIRMICUTES GRUPAS FIZIOLOĢIJU UN METABOLISMU. TIEK ŅEMTI VĒRĀ ARĪ ŠO CELMU FILOGĒNISKIE REKRIPCIJAS UN BIOLOĢISKĀS DROŠĪBAS ASPEKTI. NO ŠĪS POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANISMU KOLEKCIJAS TIKS IZVĒLĒTS DISKRĒTS TO SKAITS, LAI ANALIZĒTU GĒNUS, KAS IESAISTĪTI PANESĪBĀ PRET DAŽĀDIEM VIDES IEVAINOJUMIEM, IZMANTOJOT MUTĀCIJAS, GENOMIKAS UN TRANSKRIPTOMIKAS PĒTĪJUMUS. ŠIE MIKROORGANISMI TIKS UZSKATĪTI PAR PIEMĒROTU BIOTEHNOLOĢISKO ŠASIJU, UN ŠĀ IEMESLA DĒĻ TIKS IZSTRĀDĀTAS METODES, PROTOKOLI UN INSTRUMENTI ŠO CELMU GĒNU INŽENIERIJAI UN GENOMISKAJAM IZDEVUMAM. KĀ PIERĀDĪJUMS ŠO CELMU LIETDERĪBAI KĀ JAUNAI BIOTEHNOLOĢISKAI ŠASIJAI TIKS PIEVĒRSTA UZMANĪBA BIONOĀRDĪŠANĀS PROCESAM POLI (ETILĒNTEREFTALĀTA) (LOLOTU) DEGRADĀCIJAI, KAS IR VIENA NO GALVENAJĀM PLASTMASAS ATKRITUMU SASTĀVDAĻĀM, PIESĀRŅOJOT VISAS DZĪVOTNES PASAULĒ. LOLOJUMDZĪVNIEKU DEGRADĀCIJU VEIC, IZMANTOJOT GĒNUS, KAS KODĒ DABISKOS UN/VAI SINTĒTISKOS PETASES UN KAS TIKS IZTEIKTI IZVĒLĒTAJĀ POLYEXTREMOPHILE ŠASIJĀ. LAI PANĀKTU LOLOJUMDZĪVNIEKU UN SAISTĪTO POLIMĒRU BIONOĀRDĪŠANOS, TIKS IZSTRĀDĀTA TRADICIONĀLĀ PARTIJAS FERMENTĀCIJA, KĀ ARĪ JAUNI FERMENTĀCIJAS PROCESI (BAKTERIĀLAS CIETVIELAS FERMENTĀCIJAS PIEEJAS), IZMANTOJOT TRANSGĒNUS POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANISMUS. TURKLĀT SĒNĪŠU CIETVIELU FERMENTĀCIJAS TIKS NOREGULĒTAS, UN TIKS VEIKTA PIEEJA LOLOJUMDZĪVNIEKU DEGRADĀCIJAI AR SĒNĪTĒM, IZMANTOJOT ŠO TEHNOLOĢIJU. (Latvian)
4 August 2022
0 references
I DTIONSCADAL TAIGHDE ROIMHE SEO (HELIOS, BITH 2015-66960-C3-3-R), ÁR SAOTHARLANN, I NDLÚTHCHOMHAR LEIS NA GRÚPAÍ IMSCRÚDAITHE FAOI STIÚIR AN TOLLAMH JOSE LUIS GARCIA AGUS AN TOLLAMH JULI PERETO, SCOITE AMACH MICROORGANISMS ÉAGSÚLA LE CAOINFHULAINGT A DESICCATION (BAICTÉAR XEROTOLERANT). BAINEANN NA BAICTÉIR SCOITE SIN DEN CHUID IS MÓ LE GRÚPAÍ ACTINOBACTERIA AGUS FIRMICUTES, GAN ACH CÚPLA IONADAÍ AR BHAICTÉIR GHRAM-DHIÚLTACHA. SA TIONSCADAL TAIGHDE ATÁ ANN FAOI LÁTHAIR, MOLAIMID TRÉITHRIÚ DOMHAIN AR FHISEOLAÍOCHT AGUS AR MHEITIBILEACHT GRÚPA GNÓLACHTAÍ NEAMH-SPORULATING SCOITE AMACH Ó HELIOS METAGENOME. BREITHNÍTEAR FREISIN GNÉITHE ADSCRIPTION PHYLOGENETIC AGUS BITHSHLÁNDÁLA DE NA TRÉITHCHINEÁLACHA SIN. ÓN MBAILIÚCHÁN POLYEXTREMOPHILE SEO DE MHIOCRORGÁNAIGH, ROGHNÓFAR LÍON SCOITE DÍOBH CHUN ANAILÍS A DHÉANAMH AR NA GÉINTE A BHAINEANN LEIS AN GCAOINFHULAINGT LE HAGHAIDH GORTUITHE COMHSHAOIL ÉAGSÚLA TRÍ STAIDÉIR SHÓCHÁINEACHA, GHÉANÓMACHA AGUS TRAS-SCRÍBHINNE. MEASFAR GUR FONNADH BITEICNEOLAÍOCHTA OIRIÚNACH IAD NA MIOCRORGÁNAIGH SEO, AGUS AR AN GCÚIS SIN, FORBRÓFAR TEICNÍCÍ, PRÓTACAIL AGUS UIRLISÍ LE HAGHAIDH INNEALTÓIREACHT GHÉINITEACH AGUS EAGRÁN GÉANÓMAÍOCH DE NA TRÉITHCHINEÁLACHA SEO. MAR CHRUTHÚNAS AR CHOINCHEAP ÁIRGIÚLACHT NA DTRÉITHCHINEÁLACHA SEO MAR FHONNADH BITEICNEOLAÍOCHTA NUA, RACHFAR I DTEAGMHÁIL LE PRÓISEAS BITH-DHÍGHRÁDAITHE DO DHÍGHRÁDÚ POLAILE (TEIREATALÁIT EITILÉINE) (PEATAÍ), CEANN DE PHRÍOMH-CHOMHPHÁIRTEANNA NA DRAMHAÍOLA PLAISTEACHA A DHÉANANN ÉILLIÚ AR GACH GNÁTHÓGA AR DOMHAN. DÉANFAR DÍGHRÁDÚ PEATAÍ TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS GÉINTE A IONCHÓDAÍONN PETASES NÁDÚRTHA AGUS/NÓ SINTÉISEACHA A SHLOINNFEAR SA CHASSIS POLYEXTREMOPHILE ROGHNAITHE. CHUN BITH-DHÍGHRÁDÚ POLAIMÉIRÍ PEATAÍ AGUS POLAIMÉIRÍ GAOLMHARA A BHAINT AMACH, DÉANFAR COIPEADH BAISCE TRAIDISIÚNTA, CHOMH MAITH LE PRÓISIS CHOIPTHE NUA (CUR CHUIGE COIPEADH SOLADACH BAICTÉARACH), AG BAINT ÚSÁIDE AS NA MIOCRORGÁNAIGH POLYEXTREMOPHILE TRANSGENIC A DHEARADH. THAIRIS SIN, DÉANFAR COIPEADH SOLADACH-STÁIT FUNGAIS A THIÚNADH SUAS, AGUS DÉANFAR CUR CHUIGE MAIDIR LE DÍGHRÁDÚ PEATAÍ AG FUNGAIS AG BAINT ÚSÁIDE AS AN TEICNEOLAÍOCHT SEO. (Irish)
4 August 2022
0 references
V PREJŠNJEM RAZISKOVALNEM PROJEKTU (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R) JE NAŠ LABORATORIJ V TESNEM SODELOVANJU S PREISKOVALNIMI SKUPINAMI, KI STA JIH VODILA PROF. JOSE LUIS GARCIA IN PROF. JULI PERETO, IZOLIRAL RAZLIČNE MIKROORGANIZME Z ODPORNOSTJO NA SUŠENJE (KSEROTOLERANTNE BAKTERIJE). TE IZOLIRANE BAKTERIJE SPADAJO PREDVSEM V SKUPINE ACTINOBACTERIA IN FIRMICUTES, Z LE NEKAJ PREDSTAVNIKI GRAM NEGATIVNIH BAKTERIJ. V TEM RAZISKOVALNEM PROJEKTU PREDLAGAMO GLOBOKO KARAKTERIZACIJO FIZIOLOGIJE IN METABOLIZMA SKUPINE NESPORNIH FIRMICUTES, IZOLIRANIH IZ HELIOS METAGENOMA. UPOŠTEVAJO SE TUDI FILOGENETSKI NAPISI IN VIDIKI BIOLOŠKE VARNOSTI TEH SEVOV. IZ TE POLYEXTREMOPHILE ZBIRKE MIKROORGANIZMOV SE IZBERE LOČENO ŠTEVILO MIKROORGANIZMOV ZA ANALIZO GENOV, VKLJUČENIH V TOLERANCO ZA RAZLIČNE OKOLJSKE POŠKODBE S POMOČJO MUTACIJSKIH, GENOMSKIH IN TRANSKRIPTOMSKIH ŠTUDIJ. TI MIKROORGANIZMI SE BODO ŠTELI ZA PRIMERNO BIOTEHNOLOŠKO ŠASIJO, ZATO SE BODO RAZVILE TEHNIKE, PROTOKOLI IN ORODJA ZA GENETSKI INŽENIRING IN GENOMSKO IZDAJO TEH SEVOV. KOT DOKAZ KONCEPTA UPORABNOSTI TEH SEVOV KOT NOVEGA BIOTEHNOLOŠKEGA PODVOZJA SE BO PRISTOPIL K BIORAZGRADLJIVEMU POSTOPKU ZA RAZGRADNJO POLI (ETILEN TEREFTALATA) (HIŠNIH ŽIVALI), KI JE ENA OD GLAVNIH SESTAVIN PLASTIČNIH ODPADKOV, KI ONESNAŽUJEJO VSE HABITATE NA SVETU. RAZGRADNJA HIŠNIH ŽIVALI SE IZVEDE Z UPORABO GENOV, KI KODIRAJO NARAVNE IN/ALI SINTETIČNE PETASES, IZRAŽENE V IZBRANEM PODVOZJU POLYEXTREMOPHILE. DA BI DOSEGLI BIORAZGRADNJO HIŠNIH ŽIVALI IN PODOBNIH POLIMEROV, BODO ZASNOVANI TRADICIONALNI ŠARŽNI FERMENTACIJA IN NOVI FERMENTACIJSKI POSTOPKI (PRISTOPI BAKTERIJSKE FERMENTACIJE TRDNIH SNOVI) Z UPORABO TRANSGENSKIH POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANIZMOV. POLEG TEGA BODO GLIVIČNE FERMENTACIJE TRDNEGA STANJA UGLAŠENE IN NAREJEN BO PRISTOP K DEGRADACIJI HIŠNIH ŽIVALI Z GLIVAMI, KI UPORABLJAJO TO TEHNOLOGIJO. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
В ПРЕДИШЕН ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИ ПРОЕКТ (HELIOS, БИО 2015—66960-C3—3-R) НАШАТА ЛАБОРАТОРИЯ, В ТЯСНО СЪТРУДНИЧЕСТВО С ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИТЕ ГРУПИ, РЪКОВОДЕНИ ОТ ПРОФ. ХОСЕ ЛУИС ГАРСИЯ И ПРОФ. ХУЛИ ПЕРЕТО, ИЗОЛИРА РАЗЛИЧНИ МИКРООРГАНИЗМИ С ПОНОСИМОСТ КЪМ ИЗСУШАВАНЕ (КСЕРОТОЛЕРАНТНИ БАКТЕРИИ). ТЕЗИ ИЗОЛИРАНИ БАКТЕРИИ ПРИНАДЛЕЖАТ ГЛАВНО КЪМ ГРУПИТЕ ACTINOBACTERIA И FIRMICUTES, С САМО НЯКОЛКО ПРЕДСТАВИТЕЛИ НА ГРАМ-ОТРИЦАТЕЛНИ БАКТЕРИИ. В НАСТОЯЩИЯ ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИ ПРОЕКТ ПРЕДЛАГАМЕ ДЪЛБОКО ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА ФИЗИОЛОГИЯТА И МЕТАБОЛИЗМА НА ГРУПА НЕСПОРИРАЩИ ФИРМИКУТИ, ИЗОЛИРАНИ ОТ МЕТАГЕНОМ НА ХЕЛИОС. РАЗГЛЕДАНИ СА И АСПЕКТИТЕ НА ФИЛОГЕНЕТИЧНАТА ПРИНАДЛЕЖНОСТ И БИОЛОГИЧНАТА СИГУРНОСТ НА ТЕЗИ ЩАМОВЕ. ОТ ТАЗИ КОЛЕКЦИЯ ОТ МИКРООРГАНИЗМИ POLYEXTREMOPHILE ЩЕ БЪДЕ ИЗБРАН ОТДЕЛЕН БРОЙ ОТ ТЯХ, ЗА ДА СЕ АНАЛИЗИРАТ ГЕНИТЕ, УЧАСТВАЩИ В ПОНОСИМОСТТА КЪМ РАЗЛИЧНИ НАРАНЯВАНИЯ НА ОКОЛНАТА СРЕДА ЧРЕЗ МУТАЦИОННИ, ГЕНОМНИ И ТРАНСКРИПТОМНИ ИЗСЛЕДВАНИЯ. ТЕЗИ МИКРООРГАНИЗМИ ЩЕ СЕ СЧИТАТ ЗА ПОДХОДЯЩО БИОТЕХНОЛОГИЧНО ШАСИ И ПОРАДИ ТАЗИ ПРИЧИНА ЩЕ БЪДАТ РАЗРАБОТЕНИ ТЕХНИКИ, ПРОТОКОЛИ И ИНСТРУМЕНТИ ЗА ГЕННО ИНЖЕНЕРСТВО И ГЕНОМНО ИЗДАНИЕ НА ТЕЗИ ЩАМОВЕ. КАТО ДОКАЗАТЕЛСТВО ЗА КОНЦЕПЦИЯТА ЗА ПОЛЕЗНОСТТА НА ТЕЗИ ЩАМОВЕ КАТО НОВО БИОТЕХНОЛОГИЧНО ШАСИ, ЩЕ СЕ ПОДХОДИ КЪМ БИОРАЗГРАДИТЕЛНИЯ ПРОЦЕС ЗА РАЗГРАЖДАНЕ НА ПОЛИ (ЕТИЛЕН ТЕРЕФТАЛАТ) (ДОМАШНИ ЛЮБИМЦИ), КОЙТО Е ЕДИН ОТ ОСНОВНИТЕ КОМПОНЕНТИ НА ПЛАСТМАСОВИТЕ ОТПАДЪЦИ, ЗАМЪРСЯВАЩИ ВСИЧКИ МЕСТООБИТАНИЯ ПО СВЕТА. РАЗГРАЖДАНЕТО НА ДОМАШНИ ЛЮБИМЦИ СЕ ИЗВЪРШВА ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕ НА ГЕНИ, КОДИРАЩИ ЕСТЕСТВЕНИ И/ИЛИ СИНТЕТИЧНИ PETASES, КОИТО ЩЕ БЪДАТ ИЗРАЗЕНИ В ИЗБРАНОТО ШАСИ POLYEXTREMOPHILE. ЗА ДА СЕ ПОСТИГНЕ БИОРАЗГРАЖДАНЕ НА ДОМАШНИ ЛЮБИМЦИ И СВЪРЗАНИ С ТЯХ ПОЛИМЕРИ, ЩЕ БЪДАТ ПРОЕКТИРАНИ ТРАДИЦИОННИ ПАРТИДНИ ФЕРМЕНТАЦИЯ, КАКТО И НОВИ ФЕРМЕНТАЦИОННИ ПРОЦЕСИ (БАКТЕРИАЛНИ ТВЪРДО-ФЕРМЕНТАЦИОННИ ПОДХОДИ), КАТО СЕ ИЗПОЛЗВАТ ТРАНСГЕННИТЕ ПОЛИКСТРЕМОННИ МИКРООРГАНИЗМИ. ОСВЕН ТОВА, ГЪБИЧНИ ТВЪРДО-ДЪРЖАВНИ ФЕРМЕНТИ ЩЕ БЪДАТ НАСТРОЕНИ, И ЩЕ БЪДЕ НАПРАВЕН ПОДХОД КЪМ ДЕГРАДАЦИЯТА НА ДОМАШНИ ЛЮБИМЦИ ОТ ГЪБИЧКИ С ПОМОЩТА НА ТАЗИ ТЕХНОЛОГИЯ. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
FI PROĠETT TA’ RIĊERKA PREĊEDENTI (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R), LABORATORJU TAGĦNA, F’KOLLABORAZZJONI MILL-QRIB MAL-GRUPPI TA’ INVESTIGAZZJONI MMEXXIJA MILL-PROF. JOSE LUIS GARCIA U L-PROF. JULI PERETO, IL-MIKROORGANIŻMI DIFFERENTI IŻOLATI B’TOLLERANZA GĦAD-DESSIKAZZJONI (BATTERJI SEROTOLLERANTI). DAWK IL-BATTERJI IŻOLATI JAPPARTJENU PRINĊIPALMENT GĦALL-GRUPPI ACTINOBACTERIA U FIRMICUTES, BI FTIT BISS RAPPREŻENTANTI TA ‘BATTERJI GRAM-NEGATTIVI. FIL-PROĠETT TA ‘RIĊERKA PREŻENTI, AĦNA NIPPROPONU KARATTERIZZAZZJONI FIL-FOND TAL-FIŻJOLOĠIJA U L-METABOLIŻMU TA’ GRUPP TA FIRMICUTES NON-SPORULATING IŻOLATI MINN METAGENOME HELIOS. HUMA KKUNSIDRATI WKOLL ASPETTI TA’ ADSKRIZZJONI FILOĠENETIKA U BIJOSIGURTÀ TA’ DAWN IR-RAZEZ. MINN DAN IL-ĠBIR TA’ MIKROORGANIŻMI POLYEXTREMOPHILE, SE JINTGĦAŻEL NUMRU DISKRET MINNHOM BIEX JIĠU ANALIZZATI L-ĠENI INVOLUTI FIT-TOLLERANZA GĦAL KORRIMENTI AMBJENTALI DIFFERENTI PERMEZZ TA’ STUDJI MUTAZZJONILI, ĠENOMIĊI U TRASKRITOMIĊI. DAWN IL-MIKROORGANIŻMI SE JITQIESU BĦALA XAŻI BIJOTEKNOLOĠIKU XIERAQ, U GĦAL DIN IR-RAĠUNI, SE JIĠU ŻVILUPPATI TEKNIKI, PROTOKOLLI U GĦODOD GĦALL-INĠINERIJA ĠENETIKA U L-EDIZZJONI ĠENOMIKA TA’ DAWN IR-RAZEZ. BĦALA PROVA TAL-KUNĊETT TAL-UTILITÀ TA’ DAWN IR-RAZEZ BĦALA XAŻI BIJOTEKNOLOĠIKU ĠDID, PROĊESS BIJODEGRADATTIV GĦAD-DEGRADAZZJONI TAL-POLI (TEREFTALAT TAL-ETILEN) (PET), SE JIĠI AVVIĊINAT WIEĦED MILL-KOMPONENTI EWLENIN TAL-ISKART TAL-PLASTIK LI JIKKONTAMINA L-ĦABITATS KOLLHA FID-DINJA. ID-DEGRADAZZJONI TAL-ANNIMALI DOMESTIĊI SE TITWETTAQ BL-UŻU TA’ ĠENI LI JIKKODIFIKAW PETASES NATURALI U/JEW SINTETIĊI LI SE JIĠU ESPRESSI FIX-XAŻI POLYEXTREMOPHILE MAGĦŻUL. BIEX TINKISEB IL-BIJODEGRADAZZJONI TAL-ANNIMALI DOMESTIĊI U L-POLIMERI RELATATI, SE JITFASSLU L-FERMENTAZZJONI TRADIZZJONALI F’LOTTIJIET, KIF UKOLL PROĊESSI ĠODDA TA’ FERMENTAZZJONI (APPROĊĊI BATTERIĊI TA’ FERMENTAZZJONI SOLIDA), BL-UŻU TAL-MIKROORGANIŻMI TRANSĠENIĊI POLYEXTREMOPHILE. BARRA MINN HEKK, IL-FERMENTAZZJONIJIET FUNGALI FI STAT SOLIDU SE JIĠU SINTONIZZATI, U SE JSIR APPROĊĊ LEJN ID-DEGRADAZZJONI TAL-ANNIMALI DOMESTIĊI MILL-FUNGI LI JUŻAW DIN IT-TEKNOLOĠIJA. (Maltese)
4 August 2022
0 references
EM UM PROJETO DE PESQUISA ANTERIOR (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), NOSSO LABORATÓRIO, EM ESTREITA COLABORAÇÃO COM OS GRUPOS DE INVESTIGAÇÃO LIDERADOS PELO PROF. JOSÉ LUIS GARCIA E PROF. JULI PERETO, ISOLARAM DIFERENTES MICRORGANISMOS COM TOLERÂNCIA À DESSECAÇÃO (BACTÉRIA XEROTOLERANTE). ESSAS BACTÉRIAS ISOLADAS PERTENCEM PRINCIPALMENTE AOS GRUPOS ACTINOBACTERIA E FIRMICUTES, COM APENAS ALGUNS REPRESENTANTES DE BACTÉRIAS GRAM-NEGATIVAS. NO PRESENTE PROJETO DE PESQUISA, PROPOMOS UMA CARACTERIZAÇÃO PROFUNDA DA FISIOLOGIA E METABOLISMO DE UM GRUPO DE FIRMICUTES NÃO ESPORULANTES ISOLADOS DO METAGENOME DE HELIOS. ASPETOS DE ADSCRIÇÃO FILOGENÉTICA E BIOSSEGURANÇA DESSAS CEPAS TAMBÉM SÃO CONSIDERADOS. A PARTIR DESTA COLEÇÃO POLYEXTREMOPHILE DE MICRORGANISMOS, UM NÚMERO DISCRETO DELES SERÁ SELECIONADO PARA ANALISAR OS GENES ENVOLVIDOS NA TOLERÂNCIA PARA DIFERENTES LESÕES AMBIENTAIS ATRAVÉS DE ESTUDOS MUTACIONAIS, GENÔMICOS E TRANSCRIPTÔMICOS. ESTES MICRORGANISMOS SERÃO CONSIDERADOS COMO CHASSIS BIOTECNOLÓGICOS ADEQUADOS, PELO QUE SERÃO DESENVOLVIDAS TÉCNICAS, PROTOCOLOS E FERRAMENTAS PARA A ENGENHARIA GENÉTICA E A EDIÇÃO GENÓMICA DESTAS ESTIRPES. COMO PROVA DO CONCEITO DA UTILIDADE DESTAS ESTIRPES COMO NOVO CHASSIS BIOTECNOLÓGICO, SERÁ ABORDADO UM PROCESSO BIODEGRADATIVO PARA A DEGRADAÇÃO DO POLI(TEREFTALATO DE ETILENO) (PET), UM DOS PRINCIPAIS COMPONENTES DOS RESÍDUOS PLÁSTICOS QUE CONTAMINAM TODOS OS HABITATS DO MUNDO. A DEGRADAÇÃO DOS ANIMAIS DE ESTIMAÇÃO SERÁ REALIZADA UTILIZANDO GENES QUE CODIFICAM PETASES NATURAIS E/OU SINTÉTICAS QUE SERÃO EXPRESSAS NO QUADRO POLYEXTREMOPHILE SELECIONADO. PARA ALCANÇAR A BIODEGRADAÇÃO DE ANIMAIS DE ESTIMAÇÃO E POLÍMEROS RELACIONADOS, A FERMENTAÇÃO TRADICIONAL EM LOTE, BEM COMO NOVOS PROCESSOS DE FERMENTAÇÃO (ABORDAGENS BACTERIANAS DE FERMENTAÇÃO SÓLIDA), USANDO OS MICRORGANISMOS POLYEXTREMOPHILE TRANSGÊNICOS SERÃO PROJETADOS. ALÉM DISSO, AS FERMENTAÇÕES FÚNGICAS DO ESTADO SÓLIDO SERÃO SINTONIZADAS, E UMA ABORDAGEM PARA A DEGRADAÇÃO DE ANIMAIS DE ESTIMAÇÃO POR FUNGOS USANDO ESTA TECNOLOGIA SERÁ FEITA. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
I ET TIDLIGERE FORSKNINGSPROJEKT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R) ISOLEREDE VORES LABORATORIUM I TÆT SAMARBEJDE MED UNDERSØGELSESGRUPPERNE UNDER LEDELSE AF PROFESSOR JOSE LUIS GARCIA OG PROFESSOR JULI PERETO FORSKELLIGE MIKROORGANISMER MED TOLERANCE OVER FOR UDTØRRING (XEROTOLERANTE BAKTERIER). DISSE ISOLEREDE BAKTERIER TILHØRER HOVEDSAGELIGT ACTINOBAKTERIER OG FIRMICUTES GRUPPER, MED KUN FÅ REPRÆSENTANTER FOR GRAM-NEGATIVE BAKTERIER. I DET NUVÆRENDE FORSKNINGSPROJEKT FORESLÅR VI EN DYB BESKRIVELSE AF FYSIOLOGIEN OG METABOLISMEN AF EN GRUPPE IKKE-SPORULERENDE FIRMICUTES ISOLERET FRA HELIOS METAGENOME. DER TAGES OGSÅ HENSYN TIL FYLOGENETISKE ADSKRIPTION OG BIOSIKKERHEDSMÆSSIGE ASPEKTER AF DISSE STAMMER. FRA DENNE POLYEXTREMOPHILE SAMLING AF MIKROORGANISMER VIL ET DISKRET ANTAL AF DEM BLIVE UDVALGT TIL AT ANALYSERE DE GENER, DER ER INVOLVERET I TOLERANCEN FOR FORSKELLIGE MILJØSKADER GENNEM MUTATIONS-, GENOM- OG TRANSKRIPTOMSTUDIER. DISSE MIKROORGANISMER VIL BLIVE BETRAGTET SOM EGNEDE BIOTEKNOLOGISKE CHASSISER, OG DERFOR VIL DER BLIVE UDVIKLET TEKNIKKER, PROTOKOLLER OG VÆRKTØJER TIL GENTEKNOLOGI OG GENOMISK UDGAVE AF DISSE STAMMER. SOM BEVIS FOR, AT DISSE STAMMER ER NYTTIGE SOM NYT BIOTEKNOLOGISK CHASSIS, VIL DER BLIVE TAGET FAT PÅ EN BIONEDBRYDELIG PROCES FOR NEDBRYDNING AF POLY(ETHYLENTEREPHTHALAT) (PETENTE), SOM ER EN AF HOVEDKOMPONENTERNE I PLASTAFFALDET, DER FORURENER ALLE LEVESTEDER I VERDEN. NEDBRYDNING AF KÆLEDYR VIL SKE VED HJÆLP AF GENER, DER KODER NATURLIGE OG/ELLER SYNTETISKE PETASES, SOM VIL BLIVE UDTRYKT I DET VALGTE POLYEXTREMOPHILE CHASSIS. FOR AT OPNÅ BIONEDBRYDNING AF KÆLEDYR OG BESLÆGTEDE POLYMERER, VIL TRADITIONEL BATCHFERMENTERING SAMT NYE FERMENTERINGSPROCESSER (BAKTERIELLE FASTGÆRINGSMETODER) VED HJÆLP AF DE TRANSGENE POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANISMER BLIVE DESIGNET. DESUDEN, SVAMPE FAST-STATE FERMENTERINGER VIL BLIVE AFSTEMT OP, OG EN TILGANG TIL KÆLEDYR NEDBRYDNING AF SVAMPE VED HJÆLP AF DENNE TEKNOLOGI VIL BLIVE GJORT. (Danish)
4 August 2022
0 references
ÎNTR-UN PROIECT DE CERCETARE ANTERIOR (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), LABORATORUL NOSTRU, ÎN STRÂNSĂ COLABORARE CU GRUPURILE DE ANCHETĂ CONDUSE DE PROF. JOSE LUIS GARCIA ȘI PROF. JULI PERETO, AU IZOLAT DIFERITE MICROORGANISME CU TOLERANȚĂ LA DESICARE (BACTERII XEROTOLERANTE). ACESTE BACTERII IZOLATE APARȚIN ÎN PRINCIPAL GRUPURILOR ACTINOBACTERIA ȘI FIRMICUTES, CU DOAR CÂȚIVA REPREZENTANȚI AI BACTERIILOR GRAM-NEGATIVE. ÎN PREZENTUL PROIECT DE CERCETARE, PROPUNEM O CARACTERIZARE PROFUNDĂ A FIZIOLOGIEI ȘI METABOLISMULUI UNUI GRUP DE FIRMICUTE NESPORULANTE IZOLATE DIN METAGENOMUL HELIOS. DE ASEMENEA, SE IAU ÎN CONSIDERARE MENȚIONAREA FILOGENETICĂ ȘI ASPECTELE DE BIOSECURITATE ALE ACESTOR TULPINI. DIN ACEASTĂ COLECȚIE DE MICROORGANISME POLYEXTREMOPHILE, UN NUMĂR DISCRET DINTRE ACESTEA VA FI SELECTAT PENTRU A ANALIZA GENELE IMPLICATE ÎN TOLERANȚA LA DIFERITE LEZIUNI ALE MEDIULUI PRIN STUDII MUTAȚIALE, GENOMICE ȘI TRANSCRIMINICE. ACESTE MICROORGANISME VOR FI CONSIDERATE ȘASIU BIOTEHNOLOGIC ADECVAT ȘI, DIN ACEST MOTIV, VOR FI DEZVOLTATE TEHNICI, PROTOCOALE ȘI INSTRUMENTE PENTRU INGINERIA GENETICĂ ȘI EDIȚIA GENOMICĂ A ACESTOR TULPINI. CA DOVADĂ A CONCEPTULUI DE UTILITATE A ACESTOR TULPINI CA ȘASIU BIOTEHNOLOGIC NOU, VA FI ABORDAT UN PROCES BIODEGRADANT PENTRU DEGRADAREA POLI(ETILEN TEREFTALAT) (PET), UNA DINTRE PRINCIPALELE COMPONENTE ALE DEȘEURILOR DE PLASTIC CARE CONTAMINEAZĂ TOATE HABITATELE DIN LUME. DEGRADAREA ANIMALELOR DE COMPANIE SE VA REALIZA PRIN UTILIZAREA GENELOR CARE CODIFICĂ PETASES NATURALE ȘI/SAU SINTETICE CARE VOR FI EXPRIMATE ÎN ȘASIUL POLYEXTREMOPHILE SELECTAT. PENTRU A REALIZA BIODEGRADAREA ANIMALELOR DE COMPANIE ȘI A POLIMERILOR ÎNRUDIȚI, SE VOR PROIECTA FERMENTAREA TRADIȚIONALĂ PE LOTURI, PRECUM ȘI NOI PROCESE DE FERMENTARE (ABORDĂRI BACTERIENE DE FERMENTARE SOLIDĂ), FOLOSIND MICROORGANISMELE POLYEXTREMOPHILE TRANSGENICE. ÎN PLUS, FERMENTAȚIILE FUNGICE SOLID-STAT VOR FI REGLATE, ȘI SE VA FACE O ABORDARE A DEGRADĂRII ANIMALELOR DE COMPANIE DE CĂTRE CIUPERCI FOLOSIND ACEASTĂ TEHNOLOGIE. (Romanian)
4 August 2022
0 references
I ETT TIDIGARE FORSKNINGSPROJEKT (HELIOS, BIO 2015–66960-C3–3-R), VÅRT LABORATORIUM, I NÄRA SAMARBETE MED UTREDNINGSGRUPPER LEDDA AV PROFESSOR JOSE LUIS GARCIA OCH PROFESSOR JULI PERETO, ISOLERADE OLIKA MIKROORGANISMER MED TOLERANS MOT UTTORKNING (XEROTOLERANTA BAKTERIER). DESSA ISOLERADE BAKTERIER TILLHÖR FRÄMST ACTINOBAKTERIER OCH FIRMICUTES-GRUPPER, MED ENDAST ETT FÅTAL REPRESENTANTER FÖR GRAMNEGATIVA BAKTERIER. I DETTA FORSKNINGSPROJEKT FÖRESLÅR VI EN DJUP KARAKTERISERING AV FYSIOLOGIN OCH METABOLISMEN HOS EN GRUPP ICKE-SPORULERANDE FIRMICUTES ISOLERADE FRÅN HELIOS METAGENOME. FYLOGENETISK ADSCRIPTION OCH BIOSÄKERHETSASPEKTER AV DESSA STAMMAR BEAKTAS OCKSÅ. FRÅN DENNA POLYEXTREMOPHILE SAMLING AV MIKROORGANISMER KOMMER ETT DISKRET ANTAL AV DEM ATT VÄLJAS UT FÖR ATT ANALYSERA DE GENER SOM ÄR INVOLVERADE I TOLERANSEN FÖR OLIKA MILJÖSKADOR GENOM MUTATIONS-, GENOM- OCH TRANSKRIPTOMISKA STUDIER. DESSA MIKROORGANISMER KOMMER ATT BETRAKTAS SOM LÄMPLIGA BIOTEKNISKA CHASSIN, OCH DÄRFÖR KOMMER TEKNIKER, PROTOKOLL OCH VERKTYG FÖR GENTEKNIK OCH GENOMISK UTGÅVA AV DESSA STAMMAR ATT UTVECKLAS. SOM ETT BEVIS PÅ NYTTAN AV DESSA STAMMAR SOM ETT NYTT BIOTEKNISKT CHASSI KOMMER MAN ATT NÄRMA SIG EN BIOLOGISK NEDBRYTANDE PROCESS FÖR NEDBRYTNING AV POLYETENTEREFTALAT (BENSIN), EN AV DE VIKTIGASTE KOMPONENTERNA I PLASTAVFALLET SOM FÖRORENAR ALLA LIVSMILJÖER I VÄRLDEN. NEDBRYTNING AV SÄLLSKAPSDJUR KOMMER ATT UTFÖRAS MED HJÄLP AV GENER SOM KODAR NATURLIGA OCH/ELLER SYNTETISKA PETASES SOM KOMMER ATT UTTRYCKAS I DET VALDA POLYEXTREMOPHILE CHASSIT. FÖR ATT UPPNÅ BIOLOGISK NEDBRYTNING AV SÄLLSKAPSDJUR OCH RELATERADE POLYMERER KOMMER TRADITIONELL SATSJÄSNING SAMT NYA FERMENTERINGSPROCESSER (BAKTERIELLA FASTA JÄSNINGSMETODER) ATT UTFORMAS MED HJÄLP AV DE TRANSGENA POLYEXTREMOPHILE MIKROORGANISMERNA. DESSUTOM KOMMER SVAMP JÄSNING I FAST STAT ATT STÄLLAS IN, OCH EN STRATEGI FÖR ATT FÖRSTÖRA SÄLLSKAPSDJUR GENOM SVAMPAR MED HJÄLP AV DENNA TEKNIK KOMMER ATT GÖRAS. (Swedish)
4 August 2022
0 references
León
0 references
Identifiers
RTI2018-095584-B-C43
0 references