Identification of chromatin factors affecting meiotic crossover formation in plants (Q84329)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q84329 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Identification of chromatin factors affecting meiotic crossover formation in plants |
Project Q84329 in Poland |
Statements
3,499,750.0 zloty
0 references
3,499,750.0 zloty
0 references
100.0 percent
0 references
1 December 2018
0 references
30 November 2021
0 references
UNIWERSYTET IM. ADAMA MICKIEWICZA W POZNANIU
0 references
Meiotic crossover is a fundamental process that unlocks and generates genetic diversity and is therefore an important substrate for crop breeding. In this proposal, we seek to characterize the chromatin factors controlling meiotic crossover in plant genomes. First, we will develop a new approach which will allow us to study selected crossover hotspots in Arabidopsis with high resolution. This will be based on recombinant seed sorting with fluorescent reporters and successive sequencing of crossover-containing intervals. Next, we will directly test effects of two types of chromatin modification on crossover distribution: histone H3 trimethylation at lysine 4 (H3K4me3), and histone H4 acetylation. For this purpose, we will target histone modifying enzymes to crossover hotspots within our intervals by CRISPR/dCas9 system. This project will lead to new discoveries on the crossover control and will pave a way to generate artificial recombination hotspots for modern plant breeding. (Polish)
0 references
Meiotic crossover is a fundamental process that unlocks and generates genetic diversity and is therefore an important substrate for crop breeding. In this proposal, we seek to characterise the chromatin factors controlling meiotic crossover in plant genomes. First, we will develop a new approach which will allow us to study selected crossover hotspots in Arabidopsis with high resolution. This will be based on recombinant seed sorting with fluorescent Reporters and successive sequencing of crossover-containing intervals. Next, we will directly test effects of two types of chromatin modification on crossover distribution: histone H3 trimethylation at lysine 4 (H3K4me3), and histone H4 acetylation. For this purpose, we will target histone modifying enzymes to crossover hotspots within our intervals by CRISPR/dCas9 system. This project will lead to new discoveries on the crossover control and will pave a way to generate artificial recombination hotspots for modern plant breeding. (English)
14 October 2020
0 references
Le croisement méiotique est un processus fondamental qui débloque et génère la diversité génétique et constitue donc un substrat important pour la sélection des cultures. Dans cette proposition, nous cherchons à caractériser les facteurs de chromatine contrôlant le croisement méiotique dans les génomes végétaux. Tout d’abord, nous allons développer une nouvelle approche qui nous permettra d’étudier des points chauds de croisement sélectionnés dans Arabidopsis à haute résolution. Ceci sera basé sur le tri des graines recombinantes avec des reporters fluorescents et le séquençage successif des intervalles de croisement. Ensuite, nous testerons directement les effets de deux types de modification de la chromatine sur la distribution croisée: triméthylation de l’histone H3 à la lysine 4 (H3K4me3) et acétylation de l’histone H4. À cette fin, nous allons cibler les enzymes de modification de l’histone vers des points chauds croisés à l’intérieur de nos intervalles par le système CRISPR/dCas9. Ce projet mènera à de nouvelles découvertes sur le contrôle croisé et ouvrira la voie à la recombinaison artificielle de points chauds pour la sélection végétale moderne. (French)
30 November 2021
0 references
Meiotische Crossover ist ein fundamentaler Prozess, der die genetische Vielfalt freisetzt und erzeugt und damit ein wichtiges Substrat für die Pflanzenzucht ist. In diesem Vorschlag versuchen wir, die Chromatinfaktoren zu charakterisieren, die meiotische Crossover in Pflanzengenomen steuern. Zunächst werden wir einen neuen Ansatz entwickeln, der es uns ermöglicht, ausgewählte Crossover-Hotspots in Arabidopsis mit hoher Auflösung zu untersuchen. Dies basiert auf der rekombinanten Samensortierung mit fluoreszierenden Reportern und der sukzessiven Sequenzierung von Crossover-Containing-Intervallen. Als nächstes werden wir direkt die Auswirkungen von zwei Arten von Chromatinmodifikation auf die Frequenzverteilung testen: Histon H3 Trimethylierung bei Lysin 4 (H3K4me3) und Histon H4 Acetylation. Zu diesem Zweck werden wir Histon-Änderungs-Enzyme auf Crossover-Hotspots in unseren Intervallen durch das CRISPR/dCas9-System richten. Dieses Projekt wird zu neuen Entdeckungen auf der Crossover-Kontrolle führen und einen Weg ebnen, künstliche Rekombinations-Hotspots für die moderne Pflanzenzüchtung zu erzeugen. (German)
7 December 2021
0 references
Meiotic crossover is een fundamenteel proces dat genetische diversiteit ontsluit en genereert en daarom een belangrijk substraat is voor de teelt van gewassen. In dit voorstel proberen we de chromatinefactoren te karakteriseren die meiotische kruising in plantengenomen beheersen. Ten eerste zullen we een nieuwe aanpak ontwikkelen die ons in staat stelt om geselecteerde crossover hotspots in Arabidopsis met hoge resolutie te bestuderen. Dit zal gebaseerd zijn op recombinant zaadsortering met fluorescerende verslaggevers en opeenvolgende sequencing van crossover-bevattende intervallen. Vervolgens zullen we direct de effecten van twee soorten chromatinemodificatie op crossover distributie testen: histone H3 trimethylering bij lysine 4 (H3K4me3) en histone H4 acetylatie. Voor dit doel, zullen we richten histone modificerende enzymen op crossover hotspots binnen onze intervallen door CRISPR/dCas9 systeem. Dit project zal leiden tot nieuwe ontdekkingen over de cross-over controle en zal een weg vrijmaken voor het genereren van kunstmatige recombinatie hotspots voor moderne plantenteelt. (Dutch)
16 December 2021
0 references
Il crossover meiotico è un processo fondamentale che sblocca e genera diversità genetica ed è quindi un importante substrato per l'allevamento delle colture. In questa proposta, cerchiamo di caratterizzare i fattori cromatina che controllano il crossover meiotico nei genomi vegetali. In primo luogo, svilupperemo un nuovo approccio che ci permetterà di studiare selezionati hotspot crossover in Arabidopsis ad alta risoluzione. Questo si baserà sulla selezione di semi ricombinanti con reporter fluorescenti e sul sequenziamento successivo degli intervalli contenenti crossover. Successivamente, testeremo direttamente gli effetti di due tipi di modifica della cromatina sulla distribuzione crossover: istone H3 trimetilazione a lisina 4 (H3K4me3), e istone H4 acetilazione. A tal fine, cercheremo di indirizzare gli istoni che modificano gli enzimi in crossover hotspot all'interno dei nostri intervalli dal sistema CRISPR/dCas9. Questo progetto porterà a nuove scoperte sul controllo incrociato e aprirà la strada alla creazione di hotspot di ricombinazione artificiale per la moderna selezione delle piante. (Italian)
16 January 2022
0 references
El cruce meiótico es un proceso fundamental que desbloquea y genera diversidad genética y, por lo tanto, es un sustrato importante para la cría de cultivos. En esta propuesta, buscamos caracterizar los factores de cromatina que controlan el cruce meiótico en los genomas vegetales. En primer lugar, desarrollaremos un nuevo enfoque que nos permitirá estudiar los hotspots crossover seleccionados en Arabidopsis con alta resolución. Esto se basará en la clasificación de semillas recombinantes con reporteros fluorescentes y la secuenciación sucesivas de intervalos que contienen cruces. A continuación, probaremos directamente los efectos de dos tipos de modificación de cromatina en la distribución cruzada: trimetilación de histona H3 a lisina 4 (H3K4me3), y acetilación de histona H4. Para este propósito, dirigiremos enzimas de modificación de histonas a puntos de acceso cruzados dentro de nuestros intervalos por el sistema CRISPR/dCas9. Este proyecto conducirá a nuevos descubrimientos en el control cruzado y allanará un camino para generar puntos críticos de recombinación artificial para la mejora vegetal moderna. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Meiootiline ristumine on põhiline protsess, mis avab ja loob geneetilise mitmekesisuse ning on seetõttu oluline põllukultuuride kasvatamise alus. Käesolevas ettepanekus püüame iseloomustada kromatiinfaktoreid, mis kontrollivad meiootilist ristumist taimede genoomides. Esiteks, me töötame välja uue lähenemisviisi, mis võimaldab meil uurida valitud crossover levialasid Arabidopsis kõrge resolutsiooniga. See põhineb rekombinantsel seemnete sorteerimisel fluorestseeruvate Reporteritega ja ristuvate intervallide järjestamisel. Seejärel katsetame ristjaotusele otseselt kahte tüüpi kromatiini modifikatsiooni mõju: histone H3 trimetüleerimine lüsiin 4 (H3K4me3) juures ja H4 atsetüülimine. Sel eesmärgil püüame CRISPR/dCas9 süsteemi abil suunata histone’i ensüümide modifitseerimist, et ületada esmase vastuvõtu keskused meie intervallide piires. See projekt viib uute avastusteni ristkontrollis ja sillutab teed kunstlike rekombinatsioonikollete loomiseks kaasaegse sordiaretuse jaoks. (Estonian)
13 August 2022
0 references
Meiotinis kryžminis ryšys yra esminis procesas, kuris atrakina ir generuoja genetinę įvairovę, todėl yra svarbus pasėlių veisimo substratas. Šiame pasiūlyme mes siekiame apibūdinti chromatino veiksnius, kurie kontroliuoja mejozinį augalų genomų kryžminį susikirtimą. Pirma, mes parengsime naują požiūrį, kuris leis mums ištirti pasirinktus kryžminius migrantų antplūdžio valdymo taškus arabų šalyse, pasižyminčius didele skiriamąja geba. Tai bus grindžiama rekombinantiniu sėklų rūšiavimu fluorescenciniais Žurnalistais ir nuosekliu kryžminių intervalų sekos nustatymu. Be to, mes tiesiogiai išbandysime dviejų tipų chromatino modifikavimo poveikį kryžminiam paskirstymui: histono H3 trimetilinimas lizino 4 (H3K4me3) ir histono H4 acetilinimo. Šiuo tikslu mes nukreipsime histoną modifikuojančius fermentus į kryžminius migrantų antplūdžio taškus per mūsų CRISPR/dCas9 sistemą. Šis projektas paskatins naujus kryžminės kontrolės atradimus ir sudarys sąlygas sukurti dirbtinio rekombinacinio židinio taškus šiuolaikinei augalų selekcijai. (Lithuanian)
13 August 2022
0 references
Meiotično križanje temeljni je proces koji otključava i stvara genetsku raznolikost te je stoga važan supstrat za uzgoj usjeva. U ovom prijedlogu nastojimo karakterizirati kromatske faktore koji kontroliraju meiotski križanje u biljnim genomima. Prvo, razvit ćemo novi pristup koji će nam omogućiti proučavanje odabranih unakrsnih žarišnih točaka u Arabidopsisu s visokom rezolucijom. To će se temeljiti na razvrstavanju rekombinantnog sjemena s fluorescentnim Reporterima i uzastopnom sekvenciranju intervala unakrsnog sadržaja. Zatim ćemo izravno testirati učinke dviju vrsta kromatin modifikacije na crossover distribucije: histon H3 trimetilacija na lizin 4 (H3K4me3), i histon H4 acetilacija. U tu ćemo svrhu ciljati enzime koji modificiraju histon kako bi prešli žarišne točke unutar naših intervala pomoću sustava CRISPR/dCas9. Ovaj će projekt dovesti do novih otkrića o unakrsnoj kontroli i utrti put za stvaranje umjetnih žarišnih točaka za rekombinaciju za suvremeni uzgoj biljaka. (Croatian)
13 August 2022
0 references
Η μειωτική διασταύρωση είναι μια θεμελιώδης διαδικασία που ξεκλειδώνει και παράγει γενετική ποικιλότητα και, ως εκ τούτου, αποτελεί σημαντικό υπόστρωμα για τη βελτίωση των καλλιεργειών. Σε αυτή την πρόταση, προσπαθούμε να χαρακτηρίσουμε τους παράγοντες χρωματίνης που ελέγχουν τη μειωτική διασταύρωση στα γονιδιώματα των φυτών. Πρώτον, θα αναπτύξουμε μια νέα προσέγγιση που θα μας επιτρέψει να μελετήσουμε επιλεγμένα crossover hotspots στην Arabidopsis με υψηλή ανάλυση. Αυτό θα βασίζεται στην ανασυνδυασμένη διαλογή σπόρων με φθορίζοντα Reporters και στη διαδοχική αλληλουχία των διασταυρούμενων διαστημάτων που περιέχουν. Στη συνέχεια, θα εξετάσουμε άμεσα τα αποτελέσματα δύο τύπων τροποποίησης χρωματίνης στην κατανομή crossover: Histone H3 trimethylation σε λυσίνη 4 (H3K4me3), και λιθόλιθος H4 ακετυλίωση. Για το σκοπό αυτό, θα στοχεύσουμε τα ένζυμα που τροποποιούν τον histone σε crossover hotspots εντός των διαστημάτων μας από το σύστημα CRISPR/dCas9. Το έργο αυτό θα οδηγήσει σε νέες ανακαλύψεις σχετικά με τον έλεγχο διασταύρωσης και θα προετοιμάσει έναν τρόπο για τη δημιουργία τεχνητών σημείων ανασυνδυασμού για τη σύγχρονη βελτίωση των φυτών. (Greek)
13 August 2022
0 references
Meiotický prechod je základným procesom, ktorý odomkne a vytvára genetickú rozmanitosť, a preto je dôležitým substrátom pre šľachtenie plodín. V tomto návrhu sa snažíme charakterizovať chromatínové faktory, ktoré regulujú meiotický kríž v genómoch rastlín. Po prvé, vyvinieme nový prístup, ktorý nám umožní študovať vybrané krížové hotspoty v Arabidopsis s vysokým rozlíšením. Toto bude založené na rekombinantnom triedení semien s fluorescenčnými Reportérmi a postupnom sekvenovaní intervalov obsahujúcich kríženie. Ďalej budeme priamo testovať účinky dvoch typov modifikácie chromatínu na skríženú distribúciu: histónová trimetylácia H3 pri lyzíne 4 (H3K4me3) a acetylácia histónom H4. Na tento účel sa zameriame na enzýmy modifikujúce histón na kríženie hotspotov v našich intervaloch systémom CRISPR/dCas9. Tento projekt povedie k novým objavom v oblasti krížovej kontroly a pripraví cestu na vytvorenie hotspotov s umelou rekombináciou pre moderné šľachtenie rastlín. (Slovak)
13 August 2022
0 references
Meiotic crossover on perustavanlaatuinen prosessi, joka avaa ja luo geneettistä monimuotoisuutta ja on siksi tärkeä kasvualusta. Tässä ehdotuksessa pyrimme luonnehtimaan kromatiinitekijöitä, jotka säätelevät meioottista risteytystä kasvien genomissa. Ensinnäkin kehitämme uuden lähestymistavan, jonka avulla voimme tutkia tiettyjä Arabidopsiksen rajanylittäviä järjestelykeskuksia, joiden resoluutio on korkea. Tämä perustuu rekombinanttien siementen lajitteluun fluoresoivilla toimittajilla ja vuorotteluvälien peräkkäiseen sekvensointiin. Seuraavaksi testaamme suoraan kahdentyyppisen kromatiinin muuntamisen vaikutukset crossover-jakaumaan: histoni H3 trimetylaatio lysiinissä 4 (H3K4me3) ja histoni H4-asetyylilaatio. Tätä tarkoitusta varten, kohdistamme histone muuntamalla entsyymejä crossover hotspots meidän välein CRISPR/dCas9 järjestelmä. Tämä hanke johtaa uusiin löytöihin crossover-valvonnassa ja tasoittaa keinotekoisia rekombinointipisteitä nykyaikaiseen kasvinjalostukseen. (Finnish)
13 August 2022
0 references
A meiotikus keresztezés alapvető folyamat, amely felszabadítja és generálja a genetikai sokféleséget, ezért fontos szubsztrátja a növénynemesítésnek. Ebben a javaslatban arra törekszünk, hogy jellemezzük a meiotikus keresztezést szabályozó kromatin-tényezőket a növényi genomokban. Először is, új megközelítést fogunk kidolgozni, amely lehetővé teszi számunkra, hogy nagy felbontással tanulmányozzuk az Arabidopsisban található kiválasztott, kereszteződésű hotspotokat. Ez a fluoreszkáló riporterekkel végzett rekombináns magválogatáson és a keresztezést tartalmazó intervallumok egymást követő szekvenálásán alapul. Ezután közvetlenül teszteljük a kromatin kétféle módosításának hatását a crossover eloszlásra: histone H3 trimetiláció lizin 4-en (H3K4me3) és histone H4 acetilezés. Ebből a célból a CRISPR/dCas9 rendszer segítségével a histone-módosító enzimeket célul tűzzük ki, hogy intervallumainkon belül keresztezzék a hotspotokat. Ez a projekt új felfedezéseket fog eredményezni a keresztellenőrzéssel kapcsolatban, és utat nyit a modern növénynemesítéshez szükséges mesterséges rekombinációs hotspotok létrehozásához. (Hungarian)
13 August 2022
0 references
Meiotický crossover je zásadní proces, který odemyká a vytváří genetickou rozmanitost, a je proto důležitým substrátem pro šlechtění plodin. V tomto návrhu se snažíme charakterizovat chromatinové faktory, které kontrolují meiotický crossover v rostlinných genomech. Za prvé, vypracujeme nový přístup, který nám umožní studovat vybrané křížové hotspoty v Arabidopse s vysokým rozlišením. To bude založeno na rekombinantním třídění osiva s fluorescenčními reportéry a postupném sekvenování intervalů obsahujících křížení. Dále budeme přímo testovat účinky dvou typů modifikace chromatinu na křížovou distribuci: trimethylace histonu H3 při lysinu 4 (H3K4me3) a acetylaci histonu H4. Za tímto účelem se zaměříme na enzymy modifikující histony na křížení hotspotů v našich intervalech systémem CRISPR/dCas9. Tento projekt povede k novým objevům o křížové kontrole a připraví cestu k vytvoření umělých rekombinačních hotspotů pro moderní šlechtění rostlin. (Czech)
13 August 2022
0 references
Meiotiskais krustojums ir fundamentāls process, kas atraisa un rada ģenētisko daudzveidību, un tāpēc ir svarīgs substrāts kultūraugu audzēšanai. Šajā priekšlikumā mēs cenšamies raksturot hromatīna faktorus, kas kontrolē meiotisku krustošanos augu genomos. Pirmkārt, mēs izstrādāsim jaunu pieeju, kas ļaus mums izpētīt izvēlētos crossover karstos punktus Arabidopsis ar augstu izšķirtspēju. Tas balstīsies uz rekombinētu sēklu šķirošanu ar fluorescējošiem žurnālistiem un secīgu krustošanas intervālu secīgu secību. Tālāk mēs tieši pārbaudīsim divu veidu hromatīna modifikācijas ietekmi uz krustenisko izplatību: histone H3 trimetilācija pie lizīna 4 (H3K4me3) un histone H4 acetilēšanas. Šim nolūkam mēs vērsīsimies pret histone modificējošiem fermentiem, lai krustotos karstajos punktos mūsu intervālos ar CRISPR/dCas9 sistēmu. Šis projekts radīs jaunus atklājumus par krustošanas kontroli un pavērs ceļu mākslīgās rekombinācijas karsto punktu radīšanai modernai augu selekcijai. (Latvian)
13 August 2022
0 references
Is próiseas bunúsach é crossover meiotic a dhíghlasálann agus a ghineann éagsúlacht ghéiniteach agus dá bhrí sin is foshraith thábhachtach é le haghaidh pórú barr. Sa togra seo, déanaimid iarracht na fachtóirí chromatin a rialaíonn crosiompar meiotic i ngéanóim plandaí a thréithriú. Ar an gcéad dul síos, forbróimid cur chuige nua a ligfidh dúinn staidéar a dhéanamh ar teophointí roghnaithe in Arabidopsis le réiteach ard. Beidh sé seo bunaithe ar shórtáil síolta athchuingreach le Tuairisceoirí fluaraiseacha agus ar sheicheamhú leanúnach na n-eatramh tras-imeallacha. Ansin, déanfaimid tástáil dhíreach ar éifeachtaí dhá chineál modhnú chromatin ar dháileadh crossover: histone H3 trimethylation ag lísín 4 (H3K4me3), agus histone H4 aicéitliú. Chun na críche sin, beidh muid ag díriú histone einsímí a mhodhnú chun hotspots crossover laistigh dár n-eatramh ag córas CRISPR/dCas9. Beidh fionnachtana nua ar an rialú trasover mar thoradh ar an tionscadal seo agus réiteoidh sé bealach chun teophointí athchuingrithe saorga a ghiniúint le haghaidh pórú plandaí nua-aimseartha. (Irish)
13 August 2022
0 references
Mejotski crossover je temeljni proces, ki odklene in ustvari gensko raznovrstnost in je zato pomemben substrat za vzrejo pridelkov. V tem predlogu želimo opredeliti kromatične faktorje, ki nadzorujejo mejotski križec v rastlinskih genomih. Najprej bomo razvili nov pristop, ki nam bo omogočil preučevanje izbranih križnih žariščnih točk v Arabidopsisu z visoko ločljivostjo. To bo temeljilo na rekombinantnem razvrščanju semen s fluorescenčnimi poročevalci in zaporednem zaporedju presledkov, ki vsebujejo navzkrižni prehod. Nato bomo neposredno testirali učinke dveh vrst modifikacije kromatina na crossover porazdelitvi: trimetilacija histona H3 pri lizinu 4 (H3K4me3) in acetilacija histona H4. V ta namen bomo s sistemom CRISPR/dCas9 usmerili histone, ki spreminjajo encime in tako prehajajo žariščne točke v naših intervalih. Ta projekt bo privedel do novih odkritij na crossover kontroli in bo utrl pot za ustvarjanje umetnih rekombinacijskih žarišč za sodobno žlahtnjenje rastlin. (Slovenian)
13 August 2022
0 references
Мейотичният кръстосване е основен процес, който отключва и генерира генетично разнообразие и следователно е важен субстрат за отглеждането на култури. В това предложение се стремим да характеризираме хроматиновите фактори, които контролират мейотичния кръстосване в растителните геноми. Първо, ще разработим нов подход, който ще ни позволи да проучим избрани пресечни точки в Арабидопсис с висока разделителна способност. Това ще се основава на рекомбинантно сортиране на семената с флуоресцентни репортери и последователно секвениране на интервалите, съдържащи кръстосани семена. След това директно ще тестваме ефектите на два вида хроматинова модификация върху кръстосаното разпределение: Histone H3 триметилиране при лизин 4 (H3K4me3) и хистонен H4 ацетилиране. За тази цел, ние ще се насочим към хистоун модифициране ензими към пресичане на горещи точки в рамките на нашите интервали от време чрез CRISPR/dCas9 система. Този проект ще доведе до нови открития относно кръстосания контрол и ще проправи начин за генериране на изкуствени горещи точки за рекомбинация за съвременно растениевъдство. (Bulgarian)
13 August 2022
0 references
It-transover mejotiku huwa proċess fundamentali li jiftaħ u jiġġenera d-diversità ġenetika u għalhekk huwa sottostrat importanti għat-tnissil tal-uċuħ tar-raba’. F’din il-proposta, aħna nfittxu li nikkaratterizzaw il-fatturi tal-kromatin li jikkontrollaw it-transover mejotiku fil-ġenomi tal-pjanti. L-ewwel nett, se niżviluppaw approċċ ġdid li se jippermettilna nistudjaw hotspots ta’ crossover magħżula fl-Għarab b’riżoluzzjoni għolja. Dan se jkun ibbażat fuq l-issortjar taż-żerriegħa rikombinanti b’Reporters fluworexxenti u sekwenzar suċċessiv ta’ intervalli li jkun fihom il-crossover. Li jmiss, aħna se jittestjaw direttament l-effetti ta ‘żewġ tipi ta’ modifika kromatina fuq id-distribuzzjoni crossover: histone H3 trimethylation fil-lysine 4 (H3K4me3), u histone H4 acetylation. Għal dan il-għan, aħna se nimmiraw lejn enzimi li jimmodifikaw il-ġebel biex jaqsmu l-hotspots fl-intervalli tagħna permezz tas-sistema CRISPR/dCas9. Dan il-proġett se jwassal għal skoperti ġodda dwar il-kontroll tal-kontroversja u se jwitti t-triq biex jiġu ġġenerati hotspots artifiċjali ta’ rikombinazzjoni għat-tnissil modern tal-pjanti. (Maltese)
13 August 2022
0 references
O cruzamento metiótico é um processo fundamental que desbloqueia e gera diversidade genética e, portanto, é um importante substrato para a criação de culturas. Nesta proposta, buscamos caracterizar os fatores cromatinas que controlam o cruzamento metiótico nos genomas das plantas. Em primeiro lugar, desenvolveremos uma nova abordagem que nos permitirá estudar com alta resolução os pontos de acesso cruzados selecionados em Arabidopsis. Isto será ganza na separação de sementes recombinantes com repórteres fluorescentes e sequenciamento sucessivo de intervalos de cruzamento. Em seguida, testaremos diretamente os efeitos de dois tipos de modificação da cromatina na distribuição cruzada: trimetilação de histona H3 em lisina 4 (H3K4me3), e histona H4 acetilação. Para esse fim, vamos direcionar enzimas modificadoras de histonas para pontos quentes cruzados dentro de nossos intervalos pelo sistema CRISPR/dCas9. Este projeto conduzirá a novas descobertas sobre o controlo cruzado e abrirá uma forma de gerar centros de recombinação artificial para o melhoramento vegetal moderno. (Portuguese)
13 August 2022
0 references
Meiotisk crossover er en grundlæggende proces, der låser op for og skaber genetisk mangfoldighed og derfor er et vigtigt substrat for afgrødeavl. I dette forslag søger vi at karakterisere de kromatinfaktorer, der styrer meiotiske krydsninger i plantegenomer. For det første vil vi udvikle en ny tilgang, som vil gøre det muligt for os at studere udvalgte crossover hotspots i Arabidopsis med høj opløsning. Dette vil være baseret på rekombinant frøsortering med fluorescerende reportere og successive sekvensering af krydsningsintervaller. Næste, Vi vil direkte teste effekter af to typer af chromatin modifikation på crossover fordeling: histone H3 trimethylation ved lysin 4 (H3K4me3) og histone H4 acetylation. Til dette formål, vil vi målrette histone modificerende enzymer til crossover hotspots inden for vores intervaller af CRISPR/dCas9 system. Dette projekt vil føre til nye opdagelser om krydskontrollen og bane vejen for kunstig rekombination af hotspots til moderne planteavl. (Danish)
13 August 2022
0 references
Crossover meiotic este un proces fundamental care deblochează și generează diversitate genetică și, prin urmare, este un substrat important pentru creșterea culturilor. În această propunere, încercăm să caracterizăm factorii de cromatină care controlează încrucișarea meiotică în genomii plantelor. În primul rând, vom dezvolta o nouă abordare care ne va permite să studiem cu rezoluție înaltă punctele de acces selectate din Arabidopsis. Aceasta se va baza pe sortarea semințelor recombinante cu Reporteri fluorescenti și pe secvențierea succesivă a intervalelor care conțin încrucișare. În continuare, vom testa direct efectele a două tipuri de modificări ale cromatinei asupra distribuției încrucișate: histone H3 trimetilare la lizină 4 (H3K4me3) și histonă H4 acetilare. În acest scop, vom viza enzimele de modificare histone pentru a crossover hotspot-uri în intervalele noastre prin sistemul CRISPR/dCas9. Acest proiect va conduce la noi descoperiri privind controlul încrucișat și va deschide o cale de a genera hotspoturi artificiale de recombinare pentru ameliorarea modernă a plantelor. (Romanian)
13 August 2022
0 references
Meiotisk crossover är en grundläggande process som låser upp och genererar genetisk mångfald och är därför ett viktigt substrat för odling av grödor. I detta förslag försöker vi karakterisera de kromatinfaktorer som styr meiotisk korsning i växtgenom. För det första kommer vi att utveckla en ny strategi som gör det möjligt för oss att studera utvalda crossover hotspots i Arabidopsis med hög upplösning. Detta kommer att baseras på rekombinant frösortering med fluorescerande Reportrar och successiv sekvensering av crossover-innehållande intervall. Därefter kommer vi direkt att testa effekter av två typer av kromatinmodifiering på crossover-distribution: histon H3 trimetylering vid lysin 4 (H3K4me3), och histon H4 acetylering. För detta ändamål kommer vi att rikta in oss på histonmodifierande enzymer för att korsa hotspots inom våra intervall med CRISPR/dCas9-systemet. Detta projekt kommer att leda till nya upptäckter av crossover-kontrollen och kommer att bana väg för artificiell rekombination hotspots för modern växtförädling. (Swedish)
13 August 2022
0 references
Cały Kraj
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-5C0F/17
0 references