Antisense transcription requirement for plant external environment sensing. (Q84239)
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Project Q84239 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Antisense transcription requirement for plant external environment sensing. |
Project Q84239 in Poland |
Statements
3,500,000.0 zloty
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100.0 percent
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1 December 2017
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30 November 2020
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INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI POLSKIEJ AKADEMII NAUK
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Eukaryotic genomes including plants are pervasively transcribed producing a myriad of non-protein-coding RNA transcripts (ncRNA), including antisense transcripts. Although the prevalent nature of antisense transcription is now well accepted, its functional consequence is much less appreciated. In this application we propose existence of a novel, generic mechanism of Arabidopsis gene regulation by long, non-protein-coding antisense transcription in response to external environment. We will combine an in-depth analysis of antisense transcription absolute requirement for regulation by external signals, of a master regulator of seed dormancy - DOG1 with several, genome-wide approaches to test the proposed mechanism. Finally we will explore the mechanistic aspects of how DOG1 protein controls plant stress response. (Polish)
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Eukaryotic genomes including plants are pervasively transcribed producing a myriad of non-protein-coding RNA transcripts (ncRNA), including antisense transcripts. Although the prevalent nature of antisense transcription is now well accepted, its functional consequence is much less appreciated. In this application we propose existence of a novel, generic mechanism of Arabidopsis gene regulation by long, non-protein-coding antisense transcription in response to external environment. We will combine an in-depth analysis of antisense transcription absolute requirement for regulation by external signals, of a master regulator of seed dormancy – DOG1 with several, genome-wide approaches to test the proposed mechanism. Finally we will explore the mechanistic aspects of how DOG1 protein controls plant stress response. (English)
14 October 2020
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Les génomes eucaryotes, y compris les plantes, sont largement transcrits, produisant une myriade de transcriptions d’ARN non codés par des protéines (ARNnc), y compris des transcriptions antisens. Bien que la nature prédominante de la transcription antisens soit maintenant bien acceptée, sa conséquence fonctionnelle est beaucoup moins appréciée. Dans cette application, nous proposons l’existence d’un nouveau mécanisme générique de régulation des gènes d’Arabidopsis par transcription antisens longue et non protéique en réponse à un environnement externe. Nous allons combiner une analyse approfondie de l’exigence absolue de transcription antisens pour la régulation par des signaux externes, d’un régulateur maître de la dormance des semences — DOG1 avec plusieurs approches à l’échelle du génome pour tester le mécanisme proposé. Enfin, nous explorerons les aspects mécaniques de la façon dont la protéine DOG1 contrôle la réponse au stress des plantes. (French)
30 November 2021
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Eukaryotische Genome, einschließlich Pflanzen, werden durchdringend transkribiert und produzieren eine Vielzahl von RNA Transcripts (ncRNA), einschließlich Antisense Transcripts. Obwohl die vorherrschende Natur der Antisense-Transkription jetzt gut akzeptiert wird, wird ihre funktionelle Konsequenz viel weniger geschätzt. In dieser Anwendung schlagen wir die Existenz eines neuartigen, generischen Mechanismus der Arabidopsis Genregulierung durch lange, nicht-eiweiß-kodierende Antisense Transkription als Reaktion auf externe Umgebung vor. Wir werden eine eingehende Analyse der absoluten Antisense Transkriptionspflicht für die Regulierung durch externe Signale, eines Masterregulators für Saatgutruhe – DOG1 mit mehreren genomweiten Ansätzen zur Prüfung des vorgeschlagenen Mechanismus kombinieren. Abschließend werden wir die mechanischen Aspekte untersuchen, wie DOG1-Protein die Reaktion auf Pflanzenstress kontrolliert. (German)
7 December 2021
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Eukaryotic genoom waaronder planten worden doordringend getranscribeerd producerend een groot aantal niet-eiwit-coderende RNA Transcripts (ncRNA), met inbegrip van antisense Transcripts. Hoewel de overheersende aard van antisense transcriptie nu goed wordt geaccepteerd, wordt de functionele consequentie veel minder gewaardeerd. In deze toepassing stellen we het bestaan voor van een nieuw, generiek mechanisme van Arabidopsis genregulering door lange, niet-eiwitcoderende antisense transcriptie in reactie op externe omgeving. We zullen een diepgaande analyse van antisense transcriptie absolute vereiste voor regulering door externe signalen, van een master regulator van zaad dormancy — DOG1 combineren met verschillende, genoom-brede benaderingen om het voorgestelde mechanisme te testen. Tot slot zullen we de Mechanistische aspecten onderzoeken van hoe DOG1 eiwit de reactie op plantenstress controleert. (Dutch)
16 December 2021
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I genomi eucariotici comprese le piante sono trascritti in modo pervasivo producendo una miriade di trascrizioni RNA non codificanti (ncRNA), comprese le trascrizioni antisense. Anche se la natura prevalente della trascrizione antisense è ormai ben accettata, la sua conseguenza funzionale è molto meno apprezzata. In questa applicazione proponiamo l'esistenza di un meccanismo nuovo e generico di regolazione genica Arabidopsis da lunga, non-proteina-coding antisense trascrizione in risposta all'ambiente esterno. Uniremo un'analisi approfondita del requisito assoluto di trascrizione antisense per la regolazione da parte di segnali esterni, di un regolatore master della dormienza dei semi — DOG1 con diversi approcci a livello genoma per testare il meccanismo proposto. Infine esamineremo gli aspetti meccanici di come la proteina DOG1 controlla la risposta allo stress delle piante. (Italian)
16 January 2022
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Los genomas eucariotas, incluidas las plantas, se transcriben de forma generalizada produciendo una miríada de transcripciones de ARN que no codifican proteínas (ncRNA), incluyendo transcripciones antisentidos. Aunque la naturaleza prevalente de la transcripción antisentido es ahora bien aceptada, su consecuencia funcional es mucho menos apreciada. En esta aplicación proponemos la existencia de un mecanismo novedoso y genérico de regulación genética de Arabidopsis mediante una larga transcripción antisentido que no codifica proteicas en respuesta al entorno externo. Combinaremos un análisis en profundidad del requisito absoluto de transcripción antisentido para la regulación por señales externas, de un regulador maestro de la dormancia de semillas — DOG1 con varios enfoques genomas para probar el mecanismo propuesto. Finalmente exploraremos los aspectos mecánicos de cómo la proteína DOG1 controla la respuesta al estrés de las plantas. (Spanish)
19 January 2022
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Identifiers
POIR.04.04.00-00-3C97/16
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