GENETIC DETERMINATION OF IMMUNE CAPACITY IN PIGS: IDENTIFICATION OF FUNCTIONAL GENETIC VARIANTS FOR THE IMPLEMENTATION OF GENOMIC SELECTION (Q3209620)

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Project Q3209620 in Spain
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English
GENETIC DETERMINATION OF IMMUNE CAPACITY IN PIGS: IDENTIFICATION OF FUNCTIONAL GENETIC VARIANTS FOR THE IMPLEMENTATION OF GENOMIC SELECTION
Project Q3209620 in Spain

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    78,650.0 Euro
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    157,300.0 Euro
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    50.0 percent
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    30 December 2016
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    29 June 2021
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    INSTITUTO DE INVESTIGACION Y TECNOLOGIA AGROALIMENTARIAS
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    41°37'56.17"N, 2°10'3.50"E
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    08033
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    EL CRECIENTE REQUERIMIENTO DE PROTEINA ANIMAL DEBIDO AL INCREMENTO DE LA POBLACION MUNDIAL, LA RECIENTE NORMATIVA EUROPEA SOBRE (DES)MEDICALIZACION EN PRODUCCION ANIMAL, Y LA DEMANDA SOCIAL DE PRODUCTOS DE ORIGEN ANIMAL SALUDABLES Y DE SISTEMAS DE PRODUCCION SOSTENIBLES REPRESENTAN IMPORTANTES DESAFIOS PARA LA INDUSTRIA PORCINA. EN ESTE CONTEXTO, LA MEJORA DE LA RESILIENCIA Y LA ROBUSTEZ DE LOS ANIMALES EN PARALELO A LA MEJORA DE LOS RENDIMIENTOS PRODUCTIVOS CONTRIBUIRIAN A INCREMENTAR LA SOSTENIBILIDAD DE LOS SISTEMAS DE PRODUCCION Y TAMBIEN A REDUCIR LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS, AMBOS RETOS PRIORITARIOS DEL H2020. EL SISTEMA INMUNITARIO INNATO ES LA PRIMERA LINEA DE DEFENSA DEL HUESPED CONTRA AGENTES INFECCIOSOS, Y RECONOCE UNA AMPLIA GAMA DE PATOGENOS A TRAVES DE UN CONJUNTO RESTRINGIDO DE RECEPTORES DE RECONOCIMIENTO DE PATRONES. POR ESTE MOTIVO LOS CARACTERES DE INMUNIDAD INNATA SE PERFILAN COMO INTERESANTES OBJETIVOS DE SELECCION PARA MEJORAR LA RESISTENCIA A ENFERMEDADES. EL OBJETIVO GLOBAL DE ESTE PROYECTO ES ESTUDIAR EL DETERMINISMO GENETICO DE LA INMUNOCOMPETENCIA EN CERDOS SANOS, ASI COMO SU RELACION CON EL RENDIMIENTO PRODUCTIVO Y EL BIENESTAR DE LOS ANIMALES. CON ESTE PROPOSITO SE ANALIZARAN UN CONJUNTO DE CARACTERES DE INMUNIDAD INNATA (IIT) EN 450 ANIMALES SANOS PERTENECIENTES A UNA LINEA COMERCIAL DUROC. LOS IIT QUE SE ANALIZARAN INCLUYEN LA SECRECION DE IGA, PROTEINAS DE FASE AGUDA, PROTEINAS DE COMPLEMENTO, FAGOCITOSIS Y FORMACION DE OXIDO NITRICO, DIFERENTES CLASES DE IG CIRCULANTES, Y SUBPOBLACIONES DE CELULAS T. SE UTILIZARA LA INFORMACION FENOTIPICA Y EL PEDIGRI PARA ESTIMAR LA VARIABILIDAD GENETICA INTRA-POBLACIONAL DE LOS IITS, ASI COMO LA ASOCIACION ENTRE ELLOS Y CON LOS CARACTERES DE PRODUCCION Y LOS PARAMETROS DE ESTRES MEDIDOS EN EL PROYECTO (RATIO NEUTROFILOS/LINFOCITOS Y NIVELES DE CORTISOL EN PELO). ASIMISMO, SE UTILIZARAN DATOS DE GENOTIPADO DE ALTA DENSIDAD (SNP) DE LOS ANIMALES ANALIZADOS Y DATOS DE NGS DE OTROS ANIMALES DE LA POBLACION PARA IDENTIFICAR REDES GENICAS, GENES CANDIDATOS Y VARIANTES GENETICAS ASOCIADAS CON LA VARIACION FENOTIPICA DE LOS IITS EN CERDOS. A MEDIO PLAZO, SE REALIZARAN VALIDACIONES FUNCIONALES Y GENETICAS DE LOS POLIMORFISMOS IDENTIFICADOS, CON EL OBJETIVO DE SELECCIONAR AQUELLAS VARIANTES GENETICAS MAS ADECUADAS PARA SER INCLUIDAS EN PROGRAMAS DE SELECCION GENOMICA. POR ULTIMO, LA PERSPECTIVA A LARGO PLAZO CONTEMPLA LA IDENTIFICACION DE BIOMARCADORES MOLECULARES EN ANIMALES SANOS QUE PUEDAN PREDECIR LA CAPACIDAD DE RESPUESTA INMUNE FRENTE A INFECCIONES POR PATOGENOS, Y TRANSFERIR A LA INDUSTRIA DE SELECCION PORCINA METODOLOGIAS Y HERRAMIENTAS (CHIPS DE SNP A MEDIDA) APLICABLES EN ESQUEMAS DE SELECCION DIRIGIDOS A MEJORAR LA CAPACIDAD INMUNE EN PARALELO CON LA MEJORA PRODUCTIVA. LOS RESULTADOS GENERADOS REPRESENTARAN UN AVANCE IMPORTANTE EN EL CONOCIMIENTO SOBRE EL CONTROL GENETICO DE CARACTERES RELACIONADOS CON LA INMUNIDAD, Y APORTAN LAS BASES PARA LA FUTURA IMPLEMENTACION DE PROGRAMAS DE SELECCION GENETICA / GENOMICA QUE INCORPOREN LA SALUD ANIMAL ENTRE SUS OBJETIVOS. CABE POR ULTIMO AÑADIR QUE EL CONOCIMIENTO GENERADO SOBRE LOS MECANISMOS FUNCIONALES QUE SUBYACEN A ESTOS CARACTERES COMPLEJOS REPRESENTA UNA GRAN OPORTUNIDAD PARA DESARROLLAR AUN MAS EL CERDO COMO MODELO BIOMEDICO DE UTILIDAD PARA EL ESTUDIO DE LA INMUNIDAD HUMANA. (Spanish)
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    THE GROWING REQUIREMENT FOR ANIMAL PROTEIN DUE TO THE INCREASE IN THE WORLD POPULATION, THE RECENT EUROPEAN REGULATIONS ON (DE)MEDICALISATION IN ANIMAL PRODUCTION, AND THE SOCIAL DEMAND FOR HEALTHY ANIMAL PRODUCTS AND SUSTAINABLE PRODUCTION SYSTEMS REPRESENT IMPORTANT CHALLENGES FOR THE PIG INDUSTRY. IN THIS CONTEXT, IMPROVING ANIMAL RESILIENCE AND ROBUSTNESS IN PARALLEL TO IMPROVING PRODUCTIVE YIELDS WOULD CONTRIBUTE TO INCREASING THE SUSTAINABILITY OF PRODUCTION SYSTEMS AND ALSO REDUCING RESISTANCE TO ANTIBIOTICS, BOTH OF WHICH ARE H2020'S PRIORITY CHALLENGES. THE INNATE IMMUNE SYSTEM IS THE GUEST’S FIRST LINE OF DEFENSE AGAINST INFECTIOUS AGENTS, AND RECOGNISES A WIDE RANGE OF PATHOGENS THROUGH A RESTRICTED SET OF PATTERN RECOGNITION RECEPTORS. FOR THIS REASON THE CHARACTERS OF INNATE IMMUNITY ARE PROFILED AS INTERESTING SELECTION TARGETS TO IMPROVE DISEASE RESISTANCE. THE OVERALL OBJECTIVE OF THIS PROJECT IS TO STUDY THE GENETIC DETERMINISM OF IMMUNOCOMPETENCE IN HEALTHY PIGS, AS WELL AS ITS RELATION TO PRODUCTIVE PERFORMANCE AND ANIMAL WELFARE. FOR THIS PURPOSE, A SET OF INNATE IMMUNITY CHARACTERS (IIT) WILL BE ANALYSED IN 450 HEALTHY ANIMALS BELONGING TO A DUROC COMMERCIAL LINE. THE ITIS TO BE ANALYSED INCLUDE IGA SECRETION, ACUTE PHASE PROTEINS, COMPLEMENT PROTEINS, PHAGOCYTOSIS AND NITRIC OXIDE FORMATION, DIFFERENT CLASSES OF CIRCULATING GIS, AND T CELL SUBPOPULATIONS. PHENOTYPIC INFORMATION AND PEDIGRI WILL BE USED TO ESTIMATE INTRA-POPULATION GENETIC VARIABILITY OF ITIS, AS WELL AS THE ASSOCIATION BETWEEN THEM AND WITH THE PRODUCTION CHARACTERS AND STRESS PARAMETERS MEASURED IN THE PROJECT (NEUTRAL PHIL/LYMPHOCYTE RATIO AND CORTISOL LEVELS IN HAIR). IN ADDITION, HIGH DENSITY GENOTYPING (HDS) DATA FROM THE ANALYSED ANIMALS AND NGS DATA FROM OTHER ANIMALS IN THE POPULATION WILL BE USED TO IDENTIFY GENICAS NETWORKS, CANDIDATE GENES AND GENETIC VARIANTS ASSOCIATED WITH PHENOTYPIC VARIATION OF ITIS IN PIGS. IN THE MEDIUM TERM, FUNCTIONAL AND GENETIC VALIDATIONS OF THE IDENTIFIED POLYMORPHISMS WILL BE CARRIED OUT, WITH THE AIM OF SELECTING THE MOST SUITABLE GENETIC VARIANTS TO BE INCLUDED IN GENOMIC SELECTION PROGRAMS. FINALLY, THE LONG-TERM PERSPECTIVE CONTEMPLATES THE IDENTIFICATION OF MOLECULAR BIOMARKERS IN HEALTHY ANIMALS THAT CAN PREDICT IMMUNE RESPONSE TO PATHOGEN INFECTIONS, AND TRANSFER TO THE PORCINE SELECTION INDUSTRY METHODS AND TOOLS (SNP CHIPS) APPLICABLE IN SELECTION SCHEMES AIMED AT IMPROVING IMMUNE CAPACITY IN PARALLEL WITH PRODUCTIVE IMPROVEMENT. THE RESULTS GENERATED REPRESENT AN IMPORTANT ADVANCE IN THE KNOWLEDGE OF GENETIC CONTROL OF CHARACTERS RELATED TO IMMUNITY, AND PROVIDE THE BASIS FOR THE FUTURE IMPLEMENTATION OF GENETIC/GENOMIC SELECTION PROGRAMS THAT INCORPORATE ANIMAL HEALTH AMONG THEIR OBJECTIVES. FINALLY, IT SHOULD BE ADDED THAT THE KNOWLEDGE GENERATED ABOUT THE FUNCTIONAL MECHANISMS UNDERLYING THESE COMPLEX CHARACTERS REPRESENTS A GREAT OPPORTUNITY TO FURTHER DEVELOP THE PIG AS A USEFUL BIOMEDICAL MODEL FOR THE STUDY OF HUMAN IMMUNITY. (English)
    14 October 2021
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    LES BESOINS CROISSANTS EN PROTÉINES ANIMALES EN RAISON DE L’AUGMENTATION DE LA POPULATION MONDIALE, LES RÉCENTES RÉGLEMENTATIONS EUROPÉENNES SUR LA (DÉ)MÉDIALISATION DANS LA PRODUCTION ANIMALE ET LA DEMANDE SOCIALE DE PRODUITS ANIMAUX SAINS ET DE SYSTÈMES DE PRODUCTION DURABLES REPRÉSENTENT DES DÉFIS IMPORTANTS POUR L’INDUSTRIE PORCINE. DANS CE CONTEXTE, L’AMÉLIORATION DE LA RÉSILIENCE ET DE LA ROBUSTESSE DES ANIMAUX PARALLÈLEMENT À L’AMÉLIORATION DES RENDEMENTS PRODUCTIFS CONTRIBUERAIT À ACCROÎTRE LA DURABILITÉ DES SYSTÈMES DE PRODUCTION ET À RÉDUIRE LA RÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES, DEUX DÉFIS PRIORITAIRES POUR H2020. LE SYSTÈME IMMUNITAIRE INNÉ EST LA PREMIÈRE LIGNE DE DÉFENSE DE L’INVITÉ CONTRE LES AGENTS INFECTIEUX, ET RECONNAÎT UN LARGE ÉVENTAIL D’AGENTS PATHOGÈNES À TRAVERS UN ENSEMBLE RESTREINT DE RÉCEPTEURS DE RECONNAISSANCE DES PATRONS. POUR CETTE RAISON, LES CARACTÈRES DE L’IMMUNITÉ INNÉE SONT PRÉSENTÉS COMME DES CIBLES DE SÉLECTION INTÉRESSANTES POUR AMÉLIORER LA RÉSISTANCE AUX MALADIES. L’OBJECTIF GÉNÉRAL DE CE PROJET EST D’ÉTUDIER LE DÉTERMINISME GÉNÉTIQUE DE L’IMMUNOCOMPÉTENCE CHEZ LES PORCS EN BONNE SANTÉ, AINSI QUE SA RELATION AVEC LA PERFORMANCE PRODUCTIVE ET LE BIEN-ÊTRE DES ANIMAUX. À CETTE FIN, UN ENSEMBLE DE CARACTÈRES D’IMMUNITÉ INNÉE (IIT) SERA ANALYSÉ CHEZ 450 ANIMAUX SAINS APPARTENANT À UNE LIGNÉE COMMERCIALE DUROC. L’ANALYSE COMPREND LA SÉCRÉTION D’IGA, LES PROTÉINES DE PHASE AIGUË, LES PROTÉINES DE COMPLÉMENT, LA PHAGOCYTOSE ET LA FORMATION D’OXYDE NITRIQUE, LES DIFFÉRENTES CLASSES DE SIG CIRCULANT ET LES SOUS-POPULATIONS DE CELLULES T. L’INFORMATION PHÉNOTYPIQUE ET LE PÉDIGRI SERONT UTILISÉS POUR ESTIMER LA VARIABILITÉ GÉNÉTIQUE INTRA-POPULATION DE L’ITIS, AINSI QUE L’ASSOCIATION ENTRE EUX ET AVEC LES CARACTÈRES DE PRODUCTION ET LES PARAMÈTRES DE STRESS MESURÉS DANS LE PROJET (RAPPORT PHIL/LYMPHOCYTE NEUTRE ET TAUX DE CORTISOL DANS LES CHEVEUX). DE PLUS, LES DONNÉES DE GÉNOTYPAGE À HAUTE DENSITÉ (HDS) DES ANIMAUX ANALYSÉS ET LES DONNÉES NGS D’AUTRES ANIMAUX DE LA POPULATION SERVIRONT À IDENTIFIER LES RÉSEAUX GENICAS, LES GÈNES CANDIDATS ET LES VARIANTES GÉNÉTIQUES ASSOCIÉES À LA VARIATION PHÉNOTYPIQUE DE L’ITIS CHEZ LES PORCS. À MOYEN TERME, DES VALIDATIONS FONCTIONNELLES ET GÉNÉTIQUES DES POLYMORPHISMES IDENTIFIÉS SERONT EFFECTUÉES DANS LE BUT DE SÉLECTIONNER LES VARIANTES GÉNÉTIQUES LES PLUS APPROPRIÉES À INCLURE DANS LES PROGRAMMES DE SÉLECTION GÉNOMIQUE. ENFIN, LA PERSPECTIVE À LONG TERME ENVISAGE L’IDENTIFICATION DE BIOMARQUEURS MOLÉCULAIRES CHEZ DES ANIMAUX SAINS QUI PEUVENT PRÉDIRE LA RÉPONSE IMMUNITAIRE AUX INFECTIONS PATHOGÈNES, ET LE TRANSFERT AUX MÉTHODES ET OUTILS DE SÉLECTION PORCINE (PUCES SNP) APPLICABLES DANS LES PROGRAMMES DE SÉLECTION VISANT À AMÉLIORER LA CAPACITÉ IMMUNITAIRE PARALLÈLEMENT À L’AMÉLIORATION DE LA PRODUCTION. LES RÉSULTATS OBTENUS REPRÉSENTENT UNE AVANCÉE IMPORTANTE DANS LA CONNAISSANCE DU CONTRÔLE GÉNÉTIQUE DES CARACTÈRES LIÉS À L’IMMUNITÉ ET CONSTITUENT LA BASE DE LA MISE EN ŒUVRE FUTURE DE PROGRAMMES DE SÉLECTION GÉNÉTIQUE/GÉNOMIQUE QUI INTÈGRENT LA SANTÉ ANIMALE À LEURS OBJECTIFS. ENFIN, IL CONVIENT D’AJOUTER QUE LES CONNAISSANCES GÉNÉRÉES SUR LES MÉCANISMES FONCTIONNELS QUI SOUS-TENDENT CES CARACTÈRES COMPLEXES REPRÉSENTENT UNE EXCELLENTE OCCASION DE DÉVELOPPER LE PORC EN TANT QUE MODÈLE BIOMÉDICAL UTILE POUR L’ÉTUDE DE L’IMMUNITÉ HUMAINE. (French)
    5 December 2021
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    DER WACHSENDE BEDARF AN TIERISCHEM EIWEISS AUFGRUND DES ANSTIEGS DER WELTBEVÖLKERUNG, DER JÜNGSTEN EUROPÄISCHEN VERORDNUNGEN ZUR (DE-)MEDIZINISIERUNG IN DER TIERPRODUKTION UND DER SOZIALEN NACHFRAGE NACH GESUNDEN TIERISCHEN ERZEUGNISSEN UND NACHHALTIGEN PRODUKTIONSSYSTEMEN STELLEN FÜR DIE SCHWEINEINDUSTRIE GROSSE HERAUSFORDERUNGEN DAR. IN DIESEM ZUSAMMENHANG WÜRDE DIE VERBESSERUNG DER WIDERSTANDSFÄHIGKEIT UND ROBUSTHEIT DER TIERE PARALLEL ZUR VERBESSERUNG DER PRODUKTIONSERTRÄGE DAZU BEITRAGEN, DIE NACHHALTIGKEIT DER PRODUKTIONSSYSTEME ZU ERHÖHEN UND DIE RESISTENZ GEGEN ANTIBIOTIKA ZU VERRINGERN, DIE BEIDE DIE VORRANGIGEN HERAUSFORDERUNGEN VON HORIZONT 2020 DARSTELLEN. DAS ANGEBORENE IMMUNSYSTEM IST DIE ERSTE VERTEIDIGUNGSLINIE DES GASTES GEGEN INFEKTIONSERREGER UND ERKENNT EINE BREITE PALETTE VON KRANKHEITSERREGERN DURCH EINE BEGRENZTE ANZAHL VON MUSTERERKENNUNGSREZEPTOREN. AUS DIESEM GRUND WERDEN DIE CHARAKTERE DER ANGEBORENEN IMMUNITÄT ALS INTERESSANTE SELEKTIONSZIELE ZUR VERBESSERUNG DER KRANKHEITSRESISTENZ PROFILIERT. ÜBERGEORDNETES ZIEL DIESES PROJEKTS IST ES, DEN GENETISCHEN DETERMINISMUS DER IMMUNKOMPETENZ BEI GESUNDEN SCHWEINEN SOWIE DESSEN VERHÄLTNIS ZUR PRODUKTIONSLEISTUNG UND ZUM TIERSCHUTZ ZU UNTERSUCHEN. ZU DIESEM ZWECK WIRD EINE REIHE VON ANGEBORENEN IMMUNITÄTSZEICHEN (IIT) BEI 450 GESUNDEN TIEREN ANALYSIERT, DIE ZU EINER HANDELSLINIE VON DUROC GEHÖREN. ANALYSIERT WERDEN SOLLEN U. A. IGA-SEKRETION, AKUTE PHASEPROTEINE, KOMPLEMENTPROTEINE, PHAGOZYTOSE UND STICKOXIDBILDUNG, VERSCHIEDENE KLASSEN ZIRKULIERENDER GIS UND T ZELLSUBPOPULATIONEN. PHÄNOTYPISCHE INFORMATIONEN UND PEDIGRI WERDEN ZUR SCHÄTZUNG DER GENETISCHEN VARIABILITÄT INNERHALB DER BEVÖLKERUNG VERWENDET, SOWIE DIE ASSOZIATION ZWISCHEN IHNEN UND MIT DEN IM PROJEKT GEMESSENEN PRODUKTIONSCHARAKTEREN UND STRESSPARAMETERN (NEUTRALES PHIL/LYMPHOZYT-VERHÄLTNIS UND CORTISOLSPIEGEL IM HAAR). DARÜBER HINAUS WERDEN DATEN DER HOCHDICHTEN GENOTYPISIERUNG (HDS) DER ANALYSIERTEN TIERE UND NGS-DATEN VON ANDEREN TIEREN DER POPULATION VERWENDET, UM GENICAS-NETZWERKE, KANDIDATENGENE UND GENETISCHE VARIANTEN ZU IDENTIFIZIEREN, DIE MIT PHÄNOTYPISCHER VARIATION VON ITIS BEI SCHWEINEN VERBUNDEN SIND. MITTELFRISTIG WERDEN FUNKTIONALE UND GENETISCHE VALIDIERUNGEN DER IDENTIFIZIERTEN POLYMORPHISMEN DURCHGEFÜHRT, UM DIE AM BESTEN GEEIGNETEN GENETISCHEN VARIANTEN AUSZUWÄHLEN, DIE IN GENOMISCHE SELEKTIONSPROGRAMME AUFGENOMMEN WERDEN SOLLEN. SCHLIESSLICH WIRD IN DER LANGFRISTIGEN PERSPEKTIVE DIE IDENTIFIZIERUNG MOLEKULARER BIOMARKER BEI GESUNDEN TIEREN IN BETRACHT GEZOGEN, DIE DIE IMMUNANTWORT AUF KRANKHEITSERREGER-INFEKTIONEN VORHERSAGEN KÖNNEN, UND AUF DIE METHODEN UND WERKZEUGE DER SCHWEINEAUSWAHLINDUSTRIE (SNP-CHIPS) ÜBERTRAGEN, DIE IN AUSWAHLSCHEMATA ZUR VERBESSERUNG DER IMMUNKAPAZITÄT PARALLEL ZUR PRODUKTIVEN VERBESSERUNG ANWENDBAR SIND. DIE GEWONNENEN ERGEBNISSE STELLEN EINEN WICHTIGEN FORTSCHRITT IN DER KENNTNIS DER GENETISCHEN KONTROLLE VON CHARAKTEREN IM ZUSAMMENHANG MIT DER IMMUNITÄT DAR UND BILDEN DIE GRUNDLAGE FÜR DIE KÜNFTIGE UMSETZUNG GENETISCHER/GENOMISCHER SELEKTIONSPROGRAMME, DIE DIE TIERGESUNDHEIT IN IHRE ZIELE EINBEZIEHEN. SCHLIESSLICH SOLLTE HINZUGEFÜGT WERDEN, DASS DAS WISSEN ÜBER DIE FUNKTIONALEN MECHANISMEN, DIE DIESEN KOMPLEXEN CHARAKTEREN ZUGRUNDE LIEGEN, EINE GROSSE CHANCE DARSTELLT, DAS SCHWEIN ALS NÜTZLICHES BIOMEDIZINISCHES MODELL FÜR DIE UNTERSUCHUNG DER MENSCHLICHEN IMMUNITÄT WEITERZUENTWICKELN. (German)
    9 December 2021
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    DE GROEIENDE BEHOEFTE AAN DIERLIJKE EIWITTEN ALS GEVOLG VAN DE TOENAME VAN DE WERELDBEVOLKING, DE RECENTE EUROPESE REGELGEVING INZAKE (DE)MEDICALISERING VAN DE DIERLIJKE PRODUCTIE EN DE MAATSCHAPPELIJKE VRAAG NAAR GEZONDE DIERLIJKE PRODUCTEN EN DUURZAME PRODUCTIESYSTEMEN VORMEN BELANGRIJKE UITDAGINGEN VOOR DE VARKENSINDUSTRIE. IN DIT VERBAND ZOU HET VERBETEREN VAN DE VEERKRACHT EN ROBUUSTHEID VAN DIEREN, PARALLEL AAN HET VERBETEREN VAN DE PRODUCTIEOPBRENGSTEN, BIJDRAGEN TOT EEN GROTERE DUURZAAMHEID VAN DE PRODUCTIESYSTEMEN EN TOT EEN VERMINDERING VAN DE RESISTENTIE TEGEN ANTIBIOTICA, DIE BEIDE DE PRIORITAIRE UITDAGINGEN VAN HORIZON 2020 ZIJN. HET AANGEBOREN IMMUUNSYSTEEM IS DE EERSTE VERDEDIGINGSLINIE VAN DE GAST TEGEN INFECTIEUZE AGENTIA, EN HERKENT EEN BREED SCALA AAN ZIEKTEVERWEKKERS DOOR EEN BEPERKT AANTAL PATROONHERKENNINGSRECEPTOREN. OM DEZE REDEN WORDEN DE KARAKTERS VAN AANGEBOREN IMMUNITEIT GEPROFILEERD ALS INTERESSANTE SELECTIEDOELEN OM ZIEKTERESISTENTIE TE VERBETEREN. HET ALGEMENE DOEL VAN DIT PROJECT IS HET GENETISCHE DETERMINISME VAN IMMUNOCOMPETENTIE BIJ GEZONDE VARKENS TE BESTUDEREN, EVENALS DE RELATIE MET PRODUCTIEVE PRESTATIES EN DIERENWELZIJN. DAARTOE ZAL EEN REEKS AANGEBOREN IMMUNITEITSKARAKTERS (IIT) WORDEN GEANALYSEERD BIJ 450 GEZONDE DIEREN DIE TOT EEN COMMERCIËLE LIJN VAN DUROC BEHOREN. HET TE ANALYSEREN ITIS OMVATTEN IGA SECRETIE, ACUTE FASE EIWITTEN, AANVULLING EIWITTEN, FAGOCYTOSE EN STIKSTOFMONOXIDE VORMING, VERSCHILLENDE KLASSEN VAN CIRCULERENDE GIS, EN T CEL SUBPOPULATIES. FENOTYPISCHE INFORMATIE EN PEDIGRI ZAL WORDEN GEBRUIKT OM DE GENETISCHE VARIABILITEIT VAN ITIS BINNEN DE POPULATIE TE SCHATTEN, EVENALS DE ASSOCIATIE TUSSEN HEN EN MET DE PRODUCTIEKARAKTERS EN STRESSPARAMETERS GEMETEN IN HET PROJECT (NEUTRALE PHIL/LYMPHOCYTE RATIO EN CORTISOL NIVEAUS IN HAAR). DAARNAAST ZULLEN GEGEVENS MET HOGE DICHTHEID VAN GENOTYPERING (HDS) VAN DE GEANALYSEERDE DIEREN EN NGS-GEGEVENS VAN ANDERE DIEREN IN DE POPULATIE WORDEN GEBRUIKT OM GENICAS-NETWERKEN, KANDIDAAT-GENEN EN GENETISCHE VARIANTEN TE IDENTIFICEREN DIE VERBAND HOUDEN MET FENOTYPISCHE VARIATIE VAN ITIS BIJ VARKENS. OP MIDDELLANGE TERMIJN ZULLEN FUNCTIONELE EN GENETISCHE VALIDATIES VAN DE GEÏDENTIFICEERDE POLYMORFISMEN WORDEN UITGEVOERD, MET ALS DOEL DE MEEST GESCHIKTE GENETISCHE VARIANTEN TE SELECTEREN DIE IN GENOMISCHE SELECTIEPROGRAMMA’S MOETEN WORDEN OPGENOMEN. TEN SLOTTE OVERWEEGT HET LANGETERMIJNPERSPECTIEF DE IDENTIFICATIE VAN MOLECULAIRE BIOMARKERS BIJ GEZONDE DIEREN DIE DE IMMUUNRESPONS OP ZIEKTEVERWEKKERS KUNNEN VOORSPELLEN, EN DE OVERDRACHT NAAR DE SELECTIEMETHODEN EN -INSTRUMENTEN VOOR VARKENSSELECTIE (SNP-CHIPS) DIE VAN TOEPASSING ZIJN IN SELECTIESCHEMA’S DIE GERICHT ZIJN OP HET VERBETEREN VAN DE IMMUUNCAPACITEIT PARALLEL MET PRODUCTIEVE VERBETERING. DE GEGENEREERDE RESULTATEN VORMEN EEN BELANGRIJKE VOORUITGANG IN DE KENNIS VAN GENETISCHE CONTROLE VAN KARAKTERS DIE VERBAND HOUDEN MET IMMUNITEIT, EN VORMEN DE BASIS VOOR DE TOEKOMSTIGE UITVOERING VAN GENETISCHE/GENOMISCHE SELECTIEPROGRAMMA’S WAARIN DIERGEZONDHEID TOT HUN DOELSTELLINGEN BEHOORT. TEN SLOTTE MOET WORDEN TOEGEVOEGD DAT DE KENNIS DIE WORDT GEGENEREERD OVER DE FUNCTIONELE MECHANISMEN DIE AAN DEZE COMPLEXE KARAKTERS TEN GRONDSLAG LIGGEN, EEN GEWELDIGE KANS BIEDT OM HET VARKEN VERDER TE ONTWIKKELEN ALS EEN NUTTIG BIOMEDISCH MODEL VOOR DE STUDIE VAN DE MENSELIJKE IMMUNITEIT. (Dutch)
    17 December 2021
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    IL CRESCENTE FABBISOGNO DI PROTEINE ANIMALI DOVUTO ALL'AUMENTO DELLA POPOLAZIONE MONDIALE, I RECENTI REGOLAMENTI EUROPEI SULLA (DE)MEDICALIZZAZIONE DELLA PRODUZIONE ANIMALE E LA DOMANDA SOCIALE DI PRODOTTI ANIMALI SANI E SISTEMI DI PRODUZIONE SOSTENIBILI RAPPRESENTANO SFIDE IMPORTANTI PER L'INDUSTRIA SUINA. IN TALE CONTESTO, MIGLIORARE LA RESILIENZA E LA ROBUSTEZZA DEGLI ANIMALI PARALLELAMENTE AL MIGLIORAMENTO DELLE RESE PRODUTTIVE CONTRIBUIREBBE AD AUMENTARE LA SOSTENIBILITÀ DEI SISTEMI DI PRODUZIONE E A RIDURRE ANCHE LA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI, CHE SONO ENTRAMBE LE SFIDE PRIORITARIE DI ORIZZONTE 2020. IL SISTEMA IMMUNITARIO INNATO È LA PRIMA LINEA DI DIFESA DELL'OSPITE CONTRO GLI AGENTI INFETTIVI E RICONOSCE UNA VASTA GAMMA DI AGENTI PATOGENI ATTRAVERSO UN INSIEME RISTRETTO DI RECETTORI DI RICONOSCIMENTO DEL MODELLO. PER QUESTO MOTIVO I CARATTERI DELL'IMMUNITÀ INNATA SONO PROFILATI COME INTERESSANTI OBIETTIVI DI SELEZIONE PER MIGLIORARE LA RESISTENZA ALLE MALATTIE. L'OBIETTIVO GENERALE DI QUESTO PROGETTO È QUELLO DI STUDIARE IL DETERMINISMO GENETICO DELL'IMMUNOCOMPETENZA NEI SUINI SANI, NONCHÉ LA SUA RELAZIONE CON LE PRESTAZIONI PRODUTTIVE E IL BENESSERE DEGLI ANIMALI. A TAL FINE, UN INSIEME DI CARATTERI IMMUNITARI INNATI (IIT) SARÀ ANALIZZATO IN 450 ANIMALI SANI APPARTENENTI A UNA LINEA COMMERCIALE DI DUROC. LE INFORMAZIONI FENOTIPICHE E IL PEDIGRI SARANNO UTILIZZATI PER STIMARE LA VARIABILITÀ GENETICA INTRA-POPOLAZIONE DELL'ITIS, COSÌ COME L'ASSOCIAZIONE TRA LORO E CON I CARATTERI DI PRODUZIONE E I PARAMETRI DI STRESS MISURATI NEL PROGETTO (RAPPORTO PHIL/LYMPHOCYTE NEUTRALE E LIVELLI DI CORTISOLO NEI CAPELLI). INOLTRE, I DATI DI GENOTIPIZZAZIONE AD ALTA DENSITÀ (HDS) DEGLI ANIMALI ANALIZZATI E I DATI NGS DI ALTRI ANIMALI DELLA POPOLAZIONE SARANNO UTILIZZATI PER IDENTIFICARE LE RETI GENICAS, I GENI CANDIDATI E LE VARIANTI GENETICHE ASSOCIATE ALLA VARIAZIONE FENOTIPICA DELLO ITIS NEI SUINI. A MEDIO TERMINE VERRANNO EFFETTUATE VALIDAZIONI FUNZIONALI E GENETICHE DEI POLIMORFISMI IDENTIFICATI, CON L'OBIETTIVO DI SELEZIONARE LE VARIANTI GENETICHE PIÙ IDONEE DA INCLUDERE NEI PROGRAMMI DI SELEZIONE GENOMICA. INFINE, LA PROSPETTIVA A LUNGO TERMINE PREVEDE L'IDENTIFICAZIONE DI BIOMARCATORI MOLECOLARI IN ANIMALI SANI IN GRADO DI PREVEDERE LA RISPOSTA IMMUNITARIA ALLE INFEZIONI PATOLOGICHE E IL TRASFERIMENTO AI METODI E AGLI STRUMENTI DEL SETTORE DELLA SELEZIONE DEI SUINI (SNP CHIPS) APPLICABILI NEGLI SCHEMI DI SELEZIONE VOLTI A MIGLIORARE LA CAPACITÀ IMMUNITARIA PARALLELAMENTE AL MIGLIORAMENTO PRODUTTIVO. I RISULTATI GENERATI RAPPRESENTANO UN IMPORTANTE PROGRESSO NELLA CONOSCENZA DEL CONTROLLO GENETICO DEI CARATTERI RELATIVI ALL'IMMUNITÀ E FORNISCONO LA BASE PER LA FUTURA ATTUAZIONE DI PROGRAMMI DI SELEZIONE GENETICA/GENOMICA CHE INCORPORANO LA SALUTE DEGLI ANIMALI TRA I LORO OBIETTIVI. INFINE, VA AGGIUNTO CHE LE CONOSCENZE GENERATE SUI MECCANISMI FUNZIONALI ALLA BASE DI QUESTI COMPLESSI CARATTERI RAPPRESENTANO UNA GRANDE OPPORTUNITÀ PER SVILUPPARE ULTERIORMENTE IL MAIALE COME UTILE MODELLO BIOMEDICO PER LO STUDIO DELL'IMMUNITÀ UMANA. (Italian)
    16 January 2022
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    Caldes de Montbui
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    Identifiers

    AGL2016-75432-R
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