GENETIC AND MOLECULAR BASES OF MULTIPLE RESISTANCE TO PLUM POX VIRUS (PPV, SHARKA) AND APPLE CHLOROTIC LEAF SPOT VIRUS (ACLSV, SMALLPOX) IN APRICOT (Q3156045)
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Project Q3156045 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENETIC AND MOLECULAR BASES OF MULTIPLE RESISTANCE TO PLUM POX VIRUS (PPV, SHARKA) AND APPLE CHLOROTIC LEAF SPOT VIRUS (ACLSV, SMALLPOX) IN APRICOT |
Project Q3156045 in Spain |
Statements
82,280.0 Euro
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102,850.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2016
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31 December 2018
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AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
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37°59'32.57"N, 1°7'49.94"W
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30030
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LAS ENFERMEDADES DE ORIGEN VIRAL COMO LA SHARKA (PLUM POX VIRUS, PPV) Y LA VIRUELA (APPLE CHLOROTIC LEAF SPOT VIRUS, ACLSV), SUPONEN EN ESTOS MOMENTOS EL MAYOR FACTOR LIMITANTE PARA EL CULTIVO DE ALBARICOQUERO EN ESPAÑA Y EN LA REGION DE MURCIA, LA PRINCIPAL REGION PRODUCTORA A NIVEL NACIONAL CON ALREDEDOR DEL 65% DEL TOTAL. EL DESARROLLO DE NUEVAS VARIEDADES RESISTENTES A ESTOS VIRUS ES LA SOLUCION DEFINITIVA AL PROBLEMA. SI BIEN EN EL CASO DE LA RESISTENCIA A PPV NUESTRO GRUPO HA OBTENIDO NUEVAS VARIEDADES RESISTENTES, EN EL CASO DE ACLSV SOLO SE CONOCEN DOS FUENTES DE RESISTENCIA, IDENTIFICADAS RECIENTEMENTE POR NUESTRO GRUPO. NINGUNA DE ESTAS VARIEDADES ES RESISTENTE A LAS DOS VIROSIS. AUNQUE SE HAN REALIZADO DIVERSOS ESTUDIOS SOBRE DIFERENTES ASPECTOS DE ACLSV Y SU RELACION CON LA ENFERMEDAD DENOMINADA VIRUELA DEL ALBARICOQUERO, NUMEROSAS INCOGNITAS PERMANECEN SIN CLARIFICAR EN TORNO A LAS BASES GENETICAS Y MOLECULARES DE LA RESISTENCIA. EN ESTOS MOMENTOS DESPUES DE LA AMPLIA EXPANSION DE LAS NUEVAS VARIEDADES DE ALBARICOQUERO DEL CEBAS-CSIC RESISTENTES A PPV, ES NECESARIA LA INTRODUCCION DE NUEVAS VARIEDADES RESISTENTES TAMBIEN A ACLSV. ESTE PROYECTO TIENE PUES COMO OBJETIVO EL ESTUDIO DE LAS BASES GENETICAS Y MOLECULARES DE LA INTRODUCCION DE RESISTENCIA MULTIPLE A PPV Y ACLSV EN ALBARICOQUERO. SE ANALIZARAN LA TRANSMISION DE LA RESISTENCIA A ACLSV, LA UTILIZACION DE GENOTIPOS HOMOZIGOTICOS RESISTENTES A PPV Y LA INTEGRACION DE GENES DE RESISTENCIA A PPV Y ACLSV. POR OTRO LADO DESDE UN PUNTO DE VISTA MOLECULAR SE IDENTIFICARAN LOS QTLS LIGADOS A LA RESISTENCIA A ACLSV Y LA INTEGRACION DE QTLS LIGADOS A LA RESISTENCIA A ACLSV Y PPV. FINALMENTE ESTOS RESULTADOS GENOMICOS SE VALIDARAN A NIVEL TRANSCRIPTOMICO MEDIANTE RNA-SEQ Y QPCR PARA PROFUNDIZAR EN LA EXPRESION GENICA DE LA RESISTENCIA A ACLSV EN ALBARICOQUERO. DEBEMOS DESTACAR QUE LA CONSECUCION DE ESTOS OBJETIVOS SERIA IMPOSIBLE DE ABORDAR EN EL PERIODO DEL PROYECTO (3 AÑOS) SI NO CONTARAMOS CON EL MATERIAL VEGETAL NECESARIO. PARA TAL FIN, DISPONEMOS DE VARIEDADES RESISTENTES A ACLSV, RESISTENTES A PPV, DIVERSOS CRUZAMIENTOS MAS UNA POBLACION DE 130 DESCENDIENTES PARA ESTUDIAR LA HERENCIA DE LA RESISTENCIA A ACLSV, INCLUYENDO SU MAPA DE LIGAMIENTO CON 90 MARCADORES POSICIONADOS, ASI COMO CRUZAMIENTOS ENTRE VARIEDADES RESISTENTES A PPV Y A ACLSV. A TODO ESTO DEBEMOS AÑADIR LA DISPONIBILIDAD DE LAS HERRAMIENTAS Y TECNICAS NECESARIAS QUE FACILITARAN LA CONSECUCION DE LOS OBJETIVOS PREVISTOS. (Spanish)
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DISEASES OF VIRAL ORIGIN SUCH AS SHARKA (PLUM POX VIRUS, PPV) AND SMALLPOX (APPLE CHLOROTIC LEAF SPOT VIRUS, ACLSV) ARE CURRENTLY THE BIGGEST LIMITING FACTOR FOR APRICOT CULTIVATION IN SPAIN AND IN THE REGION OF MURCIA, THE MAIN PRODUCING REGION NATIONWIDE WITH AROUND 65 % OF THE TOTAL. THE DEVELOPMENT OF NEW VARIETIES RESISTANT TO THESE VIRUSES IS THE DEFINITIVE SOLUTION TO THE PROBLEM. ALTHOUGH IN THE CASE OF RESISTANCE TO PPV OUR GROUP HAS OBTAINED NEW RESISTANT VARIETIES, IN THE CASE OF ACLSV ONLY TWO SOURCES OF RESISTANCE ARE KNOWN, RECENTLY IDENTIFIED BY OUR GROUP. NEITHER OF THESE VARIETIES IS RESISTANT TO BOTH VIROSIS. ALTHOUGH SEVERAL STUDIES HAVE BEEN CARRIED OUT ON DIFFERENT ASPECTS OF ACLSV AND ITS RELATION TO THE DISEASE CALLED APRICOT POX, NUMEROUS INCOGNITES REMAIN UNCLARIFIED AROUND THE GENETIC AND MOLECULAR BASES OF RESISTANCE. NOW AFTER THE WIDE EXPANSION OF THE NEW APRICOT VARIETIES OF CEBAS-CSIC RESISTANT TO PPV, IT IS NECESSARY TO INTRODUCE NEW VARIETIES RESISTANT TO ACLSV AS WELL. THIS PROJECT THEREFORE AIMS TO STUDY THE GENETIC AND MOLECULAR BASES OF THE INTRODUCTION OF MULTIPLE RESISTANCE TO PPV AND ACLSV IN APRICOT. THE TRANSMISSION OF RESISTANCE TO ACLSV, THE USE OF PPV-RESISTANT HOMOZIGOTIC GENOTYPES AND THE INTEGRATION OF PPV AND ACLSV RESISTANCE GENES WILL BE ANALYSED. ON THE OTHER HAND, FROM A MOLECULAR POINT OF VIEW, THE QTLS LINKED TO THE RESISTANCE TO ACLSV AND THE INTEGRATION OF QTLS LINKED TO THE RESISTANCE TO ACLSV AND PPV WILL BE IDENTIFIED. FINALLY, THESE GENOMIC RESULTS WILL BE VALIDATED AT THE TRANSCRIPTOMIC LEVEL USING RNA-SEQ AND QPCR TO DEEPEN THE GENIC EXPRESSION OF RESISTANCE TO ACLSV IN APRICOT. WE MUST EMPHASISE THAT THE ACHIEVEMENT OF THESE OBJECTIVES WOULD BE IMPOSSIBLE TO ADDRESS IN THE PERIOD OF THE PROJECT (3 YEARS) IF WE DID NOT HAVE THE NECESSARY PLANT MATERIAL. TO THIS END, WE HAVE VARIETIES RESISTANT TO ACLSV, RESISTANT TO PPV, VARIOUS CROSSES PLUS A POPULATION OF 130 DESCENDANTS TO STUDY THE HERITAGE OF RESISTANCE TO ACLSV, INCLUDING ITS BINDING MAP WITH 90 MARKERS POSITIONED, AS WELL AS CROSSES BETWEEN VARIETIES RESISTANT TO PPV AND ACLSV. WE MUST ADD TO ALL THIS THE AVAILABILITY OF THE NECESSARY TOOLS AND TECHNIQUES TO FACILITATE THE ACHIEVEMENT OF THE INTENDED OBJECTIVES. (English)
12 October 2021
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LES MALADIES D’ORIGINE VIRALE TELLES QUE LE SHARKA (VIRUS DE LA VARICELLE, VPP) ET LA VARIOLE (VIRUS DES TACHES FOLIAIRES CHLOROTIQUES DE L’APPLE, ACLSV) SONT ACTUELLEMENT LE FACTEUR LIMITATIF LE PLUS IMPORTANT POUR LA CULTURE D’ABRICOTS EN ESPAGNE ET DANS LA RÉGION DE MURCIE, LA PRINCIPALE RÉGION PRODUCTRICE À L’ÉCHELLE NATIONALE, AVEC ENVIRON 65 % DU TOTAL. LE DÉVELOPPEMENT DE NOUVELLES VARIÉTÉS RÉSISTANTES À CES VIRUS EST LA SOLUTION DÉFINITIVE AU PROBLÈME. BIEN QUE DANS LE CAS DE LA RÉSISTANCE AU VPV NOTRE GROUPE AIT OBTENU DE NOUVELLES VARIÉTÉS RÉSISTANTES, DANS LE CAS DE L’ACLSV, SEULES DEUX SOURCES DE RÉSISTANCE SONT CONNUES, RÉCEMMENT IDENTIFIÉES PAR NOTRE GROUPE. AUCUNE DE CES VARIÉTÉS N’EST RÉSISTANTE AUX DEUX VIROSES. BIEN QUE PLUSIEURS ÉTUDES AIENT ÉTÉ MENÉES SUR DIFFÉRENTS ASPECTS DE L’ACLSV ET SA RELATION AVEC LA MALADIE APPELÉE VARICELLE D’ABRICOT, DE NOMBREUX INCOGNITES RESTENT NON PRÉCISÉS AUTOUR DES BASES GÉNÉTIQUES ET MOLÉCULAIRES DE LA RÉSISTANCE. MAINTENANT, APRÈS LA GRANDE EXPANSION DES NOUVELLES VARIÉTÉS D’ABRICOTS DE CEBAS-CSIC RÉSISTANTS AU PPV, IL EST NÉCESSAIRE D’INTRODUIRE DE NOUVELLES VARIÉTÉS RÉSISTANTES À L’ACLSV. CE PROJET VISE DONC À ÉTUDIER LES BASES GÉNÉTIQUES ET MOLÉCULAIRES DE L’INTRODUCTION DE LA RÉSISTANCE MULTIPLE AU VPV ET À L’ACLSV CHEZ L’ABRICOT. LA TRANSMISSION DE LA RÉSISTANCE À L’ACLSV, L’UTILISATION DE GÉNOTYPES HOMOZIGOTIC RÉSISTANTS AU PPV ET L’INTÉGRATION DES GÈNES DE RÉSISTANCE AU VPV ET À L’ACLSV SERONT ANALYSÉES. D’AUTRE PART, D’UN POINT DE VUE MOLÉCULAIRE, LES QTL LIÉS À LA RÉSISTANCE À L’ACLSV ET À L’INTÉGRATION DES QTL LIÉS À LA RÉSISTANCE À L’ACLSV ET AU PPV SERONT IDENTIFIÉS. ENFIN, CES RÉSULTATS GÉNOMIQUES SERONT VALIDÉS AU NIVEAU TRANSCRIPTOMIQUE À L’AIDE DE L’ARN-SEQ ET DU QPCR POUR APPROFONDIR L’EXPRESSION GÉNIQUE DE LA RÉSISTANCE À L’ACLSV CHEZ L’ABRICOT. NOUS DEVONS SOULIGNER QUE LA RÉALISATION DE CES OBJECTIFS SERAIT IMPOSSIBLE À ATTEINDRE AU COURS DE LA PÉRIODE DU PROJET (3 ANS) SI NOUS N’AVIONS PAS LE MATÉRIEL VÉGÉTAL NÉCESSAIRE. À CETTE FIN, NOUS AVONS DES VARIÉTÉS RÉSISTANTES À L’ACLSV, RÉSISTANTES À LA PPV, DIVERS CROISEMENTS PLUS UNE POPULATION DE 130 DESCENDANTS POUR ÉTUDIER LE PATRIMOINE DE RÉSISTANCE À L’ACLSV, Y COMPRIS SA CARTE DE LIAISON AVEC 90 MARQUEURS POSITIONNÉS, AINSI QUE DES CROISEMENTS ENTRE VARIÉTÉS RÉSISTANTES AU PPV ET ACLSV. NOUS DEVONS AJOUTER À TOUT CELA LA DISPONIBILITÉ DES OUTILS ET DES TECHNIQUES NÉCESSAIRES POUR FACILITER LA RÉALISATION DES OBJECTIFS VISÉS. (French)
4 December 2021
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KRANKHEITEN VIRALER HERKUNFT WIE SHARKA (PLUMPOXVIRUS, PPV) UND POCKEN (APPLE CHLOROTISCHE BLATTFLECKENVIRUS, ACLSV) SIND DERZEIT DER GRÖSSTE GRENZFAKTOR FÜR DEN APRIKOSENANBAU IN SPANIEN UND IN DER REGION MURCIA, DER WICHTIGSTEN PRODUZIERENDEN REGION MIT RUND 65 % DER GESAMTPRODUKTION. DIE ENTWICKLUNG NEUER SORTEN, DIE GEGEN DIESE VIREN RESISTENT SIND, IST DIE ENDGÜLTIGE LÖSUNG DES PROBLEMS. OBWOHL IM FALLE DER RESISTENZ GEGEN PPV UNSERE GRUPPE NEUE RESISTENTE SORTEN ERHALTEN HAT, SIND IM FALLE VON ACLSV NUR ZWEI RESISTENZQUELLEN BEKANNT, DIE KÜRZLICH VON UNSERER GRUPPE IDENTIFIZIERT WURDEN. KEINE DIESER SORTEN IST GEGEN BEIDE VIROSE RESISTENT. OBWOHL MEHRERE STUDIEN ZU VERSCHIEDENEN ASPEKTEN VON ACLSV UND DEREN BEZIEHUNG ZUR KRANKHEIT ALS APRIKOSENPOCKEN DURCHGEFÜHRT WURDEN, BLEIBEN ZAHLREICHE INCOGNITES RUND UM DIE GENETISCHEN UND MOLEKULAREN GRUNDLAGEN DER RESISTENZ NICHT GEKLÄRT. NACH DEM BREITEN AUSBAU DER NEUEN APRIKOSENSORTEN VON CEBAS-CSIC, DIE GEGEN PPV RESISTENT SIND, MÜSSEN AUCH NEUE, GEGEN ACLSV RESISTENTE SORTEN EINGEFÜHRT WERDEN. DAS PROJEKT ZIELT DAHER DARAUF AB, DIE GENETISCHEN UND MOLEKULAREN GRUNDLAGEN DER EINFÜHRUNG EINER MEHRFACHRESISTENZ GEGEN PPV UND ACLSV IN APRIKOSEN ZU UNTERSUCHEN. DIE ÜBERTRAGUNG DER RESISTENZ GEGEN ACLSV, DIE VERWENDUNG VON PPV-RESISTENTEN HOMOZIGOTIC-GENEN UND DIE INTEGRATION VON PPV- UND ACLSV-RESISTENZGENEN WERDEN ANALYSIERT. ANDERERSEITS WERDEN AUS MOLEKULARER SICHT DIE QTLS IDENTIFIZIERT, DIE MIT DEM WIDERSTAND GEGEN ACLSV UND DER INTEGRATION VON QTLS VERBUNDEN SIND, DIE MIT DEM WIDERSTAND GEGEN ACLSV UND PPV VERBUNDEN SIND. SCHLIESSLICH WERDEN DIESE GENOMISCHEN ERGEBNISSE AUF TRANSKRIPTOM-EBENE MIT RNA-SEQ UND QPCR VALIDIERT, UM DIE GENENE EXPRESSION DER RESISTENZ GEGEN ACLSV IN APRIKOSEN ZU VERTIEFEN. WIR MÜSSEN BETONEN, DASS DIE VERWIRKLICHUNG DIESER ZIELE IM PROJEKTZEITRAUM (3 JAHRE) UNMÖGLICH WÄRE, WENN WIR NICHT ÜBER DAS NOTWENDIGE PFLANZENMATERIAL VERFÜGEN. ZU DIESEM ZWECK HABEN WIR SORTEN RESISTENT GEGEN ACLSV, BESTÄNDIG GEGEN PPV, VERSCHIEDENE KREUZE UND EINE POPULATION VON 130 NACHKOMMEN, UM DAS ERBE DER WIDERSTANDSFÄHIGKEIT GEGEN ACLSV ZU UNTERSUCHEN, EINSCHLIESSLICH SEINER BINDUNGSKARTE MIT 90 MARKERN POSITIONIERT, SOWIE KREUZUNGEN ZWISCHEN PPV UND ACLSV RESISTENTEN SORTEN. DAZU MÜSSEN WIR DIE ERFORDERLICHEN INSTRUMENTE UND TECHNIKEN ERGÄNZEN, UM DIE VERWIRKLICHUNG DER ANGESTREBTEN ZIELE ZU ERLEICHTERN. (German)
9 December 2021
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ZIEKTEN VAN VIRALE OORSPRONG ZOALS SHARKA (PRUIMPOXVIRUS, PPV) EN POKKEN (APPELCHLOROTISCHE BLADVLEKVIRUS, ACLSV) ZIJN MOMENTEEL DE GROOTSTE BEPERKENDE FACTOR VOOR DE ABRIKOZENTEELT IN SPANJE EN IN DE REGIO MURCIA, DE BELANGRIJKSTE PRODUCERENDE REGIO IN HET HELE LAND, MET ONGEVEER 65 % VAN HET TOTAAL. DE ONTWIKKELING VAN NIEUWE RASSEN DIE BESTAND ZIJN TEGEN DEZE VIRUSSEN IS DE DEFINITIEVE OPLOSSING VOOR HET PROBLEEM. HOEWEL IN HET GEVAL VAN RESISTENTIE TEGEN PPV ONZE GROEP NIEUWE RESISTENTE RASSEN HEEFT VERKREGEN, ZIJN IN HET GEVAL VAN ACLSV SLECHTS TWEE RESISTENTIEBRONNEN BEKEND, DIE ONLANGS DOOR ONZE GROEP ZIJN GEÏDENTIFICEERD. GEEN VAN DEZE RASSEN IS RESISTENT TEGEN BEIDE VIROSIS. HOEWEL VERSCHILLENDE STUDIES ZIJN UITGEVOERD NAAR VERSCHILLENDE ASPECTEN VAN ACLSV EN ZIJN RELATIE TOT DE ZIEKTE GENAAMD ABRIKOZENPOKKEN, BLIJVEN TAL VAN INCOGNITES NIET OPGEHELDERD ROND DE GENETISCHE EN MOLECULAIRE BASEN VAN RESISTENTIE. NU NA DE BREDE UITBREIDING VAN DE NIEUWE ABRIKOZENVARIËTEITEN VAN CEBAS-CSIC BESTAND TEGEN PPV, IS HET NOODZAKELIJK OM NIEUWE RASSEN TE INTRODUCEREN DIE BESTAND ZIJN TEGEN ACLSV. DIT PROJECT HEEFT DAAROM TOT DOEL DE GENETISCHE EN MOLECULAIRE BASEN TE BESTUDEREN VAN DE INTRODUCTIE VAN MEERVOUDIGE RESISTENTIE TEGEN PPV EN ACLSV IN ABRIKOZEN. DE OVERDRACHT VAN RESISTENTIE NAAR ACLSV, HET GEBRUIK VAN PPV-RESISTENTE HOMOZIGOTIC GENOTYPES EN DE INTEGRATIE VAN PPV- EN ACLSV-RESISTENTIEGENEN ZULLEN WORDEN GEANALYSEERD. ANDERZIJDS ZULLEN VANUIT MOLECULAIR OOGPUNT DE QTL’S DIE GEKOPPELD ZIJN AAN DE WEERSTAND TEGEN ACLSV EN DE INTEGRATIE VAN QTL’S GEKOPPELD AAN DE WEERSTAND TEGEN ACLSV EN PPV WORDEN GEÏDENTIFICEERD. TEN SLOTTE ZULLEN DEZE GENOMISCHE RESULTATEN OP TRANSCRIPTOMISCH NIVEAU WORDEN GEVALIDEERD MET BEHULP VAN RNA-SEQ EN QPCR OM DE GENIC EXPRESSIE VAN RESISTENTIE TEGEN ACLSV IN ABRIKOZEN TE VERDIEPEN. WE MOETEN BENADRUKKEN DAT DE VERWEZENLIJKING VAN DEZE DOELSTELLINGEN IN DE PERIODE VAN HET PROJECT (3 JAAR) ONMOGELIJK ZOU ZIJN ALS WE NIET OVER HET NODIGE PLANTAARDIGE MATERIAAL ZOUDEN BESCHIKKEN. DAARTOE HEBBEN WE RASSEN DIE BESTAND ZIJN TEGEN ACLSV, BESTAND TEGEN PPV, VERSCHILLENDE KRUISINGEN PLUS EEN POPULATIE VAN 130 AFSTAMMELINGEN OM HET ERFGOED VAN WEERSTAND TEGEN ACLSV TE BESTUDEREN, INCLUSIEF DE BINDINGSKAART MET 90 MARKERS GEPOSITIONEERD, EVENALS KRUISINGEN TUSSEN VARIËTEITEN DIE BESTAND ZIJN TEGEN PPV EN ACLSV. WIJ MOETEN HIERAAN DE NODIGE INSTRUMENTEN EN TECHNIEKEN TOEVOEGEN OM DE VERWEZENLIJKING VAN DE BEOOGDE DOELSTELLINGEN TE VERGEMAKKELIJKEN. (Dutch)
17 December 2021
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Murcia
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Identifiers
AGL2015-68021-R
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