Fighting blood-eating insects through NGS technology for mass genomic and transcriptional testing (Q2777277)

From EU Knowledge Graph
Revision as of 18:14, 5 December 2021 by DG Regio (talk | contribs) (‎Changed label, description and/or aliases in de, and other parts: Adding German translations)
Jump to navigation Jump to search
Project Q2777277 in Greece
Language Label Description Also known as
English
Fighting blood-eating insects through NGS technology for mass genomic and transcriptional testing
Project Q2777277 in Greece

    Statements

    0 references
    919,308.0 Euro
    0 references
    9 July 2018
    0 references
    8 January 2022
    0 references
    ΕΙΔΙΚΟΣ ΛΟΓΑΡΙΑΣΜΟΣ ΚΟΝΔΥΛΙΩΝ ΕΡΕΥΝΑΣ ΔΗΜΟΚΡΙΤΕΙΟΥ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟΥ ΘΡΑΚΗΣ
    0 references
    0 references

    41°10'1.60"N, 25°1'29.57"E
    0 references

    41°10'1.60"N, 25°1'29.57"E
    0 references
    Παγκοσμίως η παραγωγή προϊόντων ζωικής προέλευσης (Ζ.Π.) βασίζεται κυρίως στην εκτροφή των παραγωγικών ζώων σε συστηματικές κτηνοτροφικές εκμεταλλεύσεις. Μόνο ένα μικρό μέρος των προϊόντων Ζ.Π. προέρχεται από οικόσιτες εκτροφές ζώων. Η διαδικασία παραγωγής, επεξεργασίας και διάθεσης των προϊόντων Ζ.Π., διέπεται από την αρχή της παραγωγής ασφαλών, ποιοτικών αλλά και οικονομικών προϊόντων.Ωστόσο τόσο παγκοσμίως όσο και στην Ελλάδα διάφορα Λοιμώδη και Παρασιτικά νοσήματα που προσβάλλουν τα ζώα, ιδιαίτερα μάλιστα αυτά τα οποία λαμβάνουν διαστάσεις επιζωοτίας, προκαλούν σοβαρότατες βλάβες στην υγεία και ευζωία των ζώων και καταστροφικές σε ορισμένες περιπτώσεις συνέπειες στην κτηνοτροφική παραγωγή και στην οικονομία. Οι τρόποι μετάδοσης των ασθενειών αυτών ποικίλουν και συντελούνται δια της αναπνευστικής ή πεπτικής οδού, με άμεση επαφή, μηχανική μεταφορά του παθογόνου παράγοντα κ.α. Μια σημαντική οδός μετάδοσης ασθενειών είναι αυτή των φορέων ασθενειών όπως τα αιματοφάγα έντομα, η οποία (σε αντίθεση με τις αντίστοιχες ανθρώπινες ασθένειες και τους φορείς τους) δεν έχει μέχρι πρόσφατα μελετηθεί επαρκώς στην κτηνοτροφία. Τέτοια αιματοφάγα έντομα φορείς ασθενειών στον Ελλαδικό χώρο είναι οι μύγες, οι κρότωνες, οι ψείρες, οι κοριοί, τα κουνούπια και οι σκνίπες.Οι συνέπειες από την εμφάνιση των παραπάνω νοσημάτων αλλά και από την εφαρμογή των Σχεδίων Έκτακτης Ανάγκης για την αποτροπή της διασποράς, τον έλεγχο και τελικά την εξάλειψη τους, είναι καταστρεπτικές καθώς: Η παραγωγή των κτηνοτροφικών προϊόντων μιας εκμετάλλευσης ή ακόμα και μιας ολόκληρης περιοχής μπορεί να μειωθεί δραματικά εξ αιτίας των σοβαρότατων κατά περίπτωση συμπτωμάτων και συνεπειών του νοσήματος (αποβολές, χωλότητες, στειρότητα,, απίσχναση, αλλοιώσεις στην αναπνευστική και στην πεπτική οδό ή το δέρμα, θάνατοι), Θανατώνονται χιλιάδες παραγωγικά ζώα, καθώς ο τρόπος αντιμετώπισης και εκρίζωσης των περισσοτέρων από τις παραπάνω ασθένειες, σύμφωνα με την Εθνική και Κοινοτική Νομοθεσία είναι η ολική ή μερική θανάτωση , Το κόστος θανάτωσης και αποζημίωσης των νοσούντων ζώων (πρωτογενείς ζημίες) ανέρχεται σε πολλά εκατομμύρια ευρώ, Τεράστιες, και εξαιρετικά δύσκολο να εκτιμηθούν, είναι και οι δευτερογενείς ζημιές από την επιβολή δραστικών περιοριστικών μέτρων στο εμπόριο ζώντων ζώων, αλλά και των αντίστοιχων αγροδιατροφικών προϊόντων, οι οποίες πολλές φορές υπερβαίνουν ακόμα και τις πρωτογενείς ζημίες, Προκαλούνται οξύτατα κοινωνικά προβλήματα ειδικά στην πληγείσα περιοχή και γενικότερα στη χώρα με την δημιουργία μεγάλου αριθμού ανέργων κτηνοτρόφων και με την καταστροφή κάθε μέσου επιβίωσης αυτών και των οικογενειών τους.Τα σημαντικότερα αιματοφάγα έντομα κτηνιατρικού ενδιαφέροντος για τη χώρα μας, είναι οι σκνίπες του γένους Culicoides και τα κουνούπια (Culicidae). Σήμερα καταπολεμούνται ένα δίκτυο παρακολούθησης των κουνουπιών με βοήθεια παγίδων CDC για την πληθυσμιακή μελέτη τους κατά τους μήνες δραστηριότητάς τους ενώ περιστασιακά γίνονται και έλεγχοι για παθογόνα ιατρικού ενδιαφέροντος όπως το πλασμώδιο της ελονοσίας και ο ιός του Δυτικού Νείλου. Η συλλογή γίνεται από εξειδικευμένες εταιρείες που αναλαμβάνουν και την καταπολέμηση των κουνουπιών ανά νομό της χώρας με ευθύνη των αντίστοιχων περιφερειών της Χώρας μας. Για τις σκνίπες Culicoides δεν έχει αναπτυχθεί ποτέ αντίστοιχο έργο επιτήρησης ή καταπολέμησης, παρά την καταστροφική για την κτηνοτροφία εγκατάσταση στη χώρα μας και γενικότερα στην Ευρώπη . Η Συλλογιστική της παρούσας πρότασης είναι η ακόλουθη: η μεθοδολογία που ακολουθείται σήμερα στην Ελλάδα ως παρεχόμενη υπηρεσία για την ταξινόμηση των αιματοφάγων εντόμων είναι η μορφολογική ανάλυση. Παγκοσμίως τα τελευταία χρόνια χρησιμοποιείται και το DNA barcoding ως συμπληρωματικό της μορφολογικής ανάλυσης, κυρίως συμπλόκων ειδών, καθώς το κόστος του ανά έντομο είναι υψηλό. Η δυνατότητα που δίνει σήμερα η τεχνολογία του NGS για μαζικό γονιδιωματικό και μεταγραφωμικό έλεγχο μπορεί να βοηθήσει σε μια πιο γρήγορη, αξιόπιστη αλλά και μικρότερου κόστους ανάλυση των αι (Greek)
    0 references
    Worldwide the production of products of animal origin (ZP) is mainly based on the rearing of productive animals on systematic livestock farms. Only a small part of the ZP products come from domestic livestock. The process of production, processing and disposal of ZP products is governed by the principle of production of safe, quality and economic products.However, both worldwide and in Greece various infectious and parasitic diseases affecting animals, especially those which take epizootic proportions, cause serious damage to animal health and well-being and in some cases catastrophic effects on livestock production and the economy. The modes of transmission of these diseases vary and occur through the respiratory or digestive tract, through direct contact, mechanical transfer of the pathogen etc.An important route of disease transmission is that of disease carriers such as blood-eating insects, which (in contrast to the corresponding human diseases and their vectors) has not until recently been adequately studied in animal husbandry. Such blood-eating insects carry diseases in Greece are flies, ticks, lice, bedbugs, mosquitoes and gnats.The consequences of the occurrence of the above diseases and the implementation of Emergency Plans to prevent dispersion, control and eventually eradicate them are devastating as well as: The production of livestock products in a holding or even an entire area may be reduced dramatically by reason of the most serious symptoms and consequences of the disease (carcasses, lameness, sterility, lesions, alterations in respiratory and digestive tracts or skin, deaths, sanctification, sanctification, sanctification, sanctification, sanctity and sanctity of such diseases. Today, a network of monitoring of mosquitoes with the help of CDC traps is being combated for their population study during their months of activity, and occasionally tests for pathogens of medical interest such as malaria plasmodus and West Nile virus are also carried out. The collection is carried out by specialised companies that undertake the fight against mosquitoes per prefecture of the country under the responsibility of the respective regions of our country. For the Culicoides gnats, no corresponding monitoring or control work has ever been developed, despite the disastrous establishment for livestock farming in our country and in Europe in general. The Collective of this proposal is as follows: The methodology used today in Greece as a service for the classification of blood-eating insects is the morphological analysis. In recent years DNA barcoding has also been used worldwide as a complement to morphological analysis, mainly of species complexes, as the cost per insect is high. The potential of NGS technology for mass genomic and transcriptional testing can help to achieve a faster, reliable and cost-effective analysis of the genome. (English)
    2 July 2021
    0 references
    À l’échelle mondiale, la production de produits d’origine animale (ZO) repose principalement sur l’élevage d’animaux de production dans des élevages systématiques. Seule une petite partie des produits Z.P. provient d’élevages domestiques. Le processus de production, de transformation et d’élimination des produits Z.P. est régi par le principe de la production de produits sûrs, de qualité et économiques. À l’échelle mondiale et en Grèce, diverses maladies infectieuses et parasitaires affectant les animaux, en particulier celles qui ont une dimension épizootique, causent de graves dommages à la santé et au bien-être des animaux et, dans certains cas, des conséquences catastrophiques pour la production animale et l’économie. Les méthodes de transmission de ces maladies varient et se produisent par les voies respiratoires ou digestives, avec contact direct, transfert mécanique de l’agent pathogène, etc. Une voie importante pour la transmission des maladies est celle des vecteurs de maladies telles que les insectes sanguins qui (par opposition aux maladies humaines correspondantes et leurs vecteurs) n’ont pas été suffisamment étudiés chez le bétail jusqu’à récemment. Ces maladies vecteurs d’insectes sanguins en Grèce sont les mouches, les tiques, les poux, les punaises de lit, les moustiques et les gnats.Les conséquences de l’apparition des maladies ci-dessus et de l’application des plans d’urgence pour prévenir la propagation, le contrôle et, éventuellement, les éliminer, sont destructrices car: La production de produits animaux dans une exploitation ou même dans toute une zone peut être considérablement réduite en raison des symptômes et des conséquences très graves de la maladie (abus, boiterie, infertilité, desulsion, lésions des voies respiratoires et digestives ou de la peau, décès), des milliers d’animaux de production sont tués, la manière dont la plupart des maladies susmentionnées sont traitées et éradiquées; selon la législation nationale et communautaire, la mise à mort totale ou partielle, le coût de la mise à mort et de l’indemnisation des animaux malades (dommages primaires) s’élève à plusieurs millions d’euros, énormes et extrêmement difficiles à estimer, c’est aussi le préjudice secondaire causé par l’imposition de mesures restrictives drastiques sur le commerce des animaux vivants et des produits agroalimentaires correspondants, qui dépassent souvent même les dommages primaires. Il y a des problèmes sociaux aigus, en particulier dans la zone touchée et dans le pays en général, avec la création d’un grand nombre d’agriculteurs au chômage et la destruction de tous les moyens de survie de ces animaux et de leurs familles. Les insectes hématophages les plus importants d’intérêt vétérinaire en Grèce sont le genre Culicoides et moustiques (Culicidae). Aujourd’hui, un réseau de surveillance des moustiques est combattu à l’aide de pièges CDC pour l’étude de leur population pendant leurs mois d’activité et, à l’occasion, des contrôles sont effectués pour rechercher des agents pathogènes d’intérêt médical tels que le plasmode du paludisme et le virus du Nil occidental. La collecte est effectuée par des entreprises spécialisées qui mènent également la lutte contre les moustiques par préfecture dans le pays sous la responsabilité des régions respectives de la Grèce. Pour les gnats Culicoides, aucun travail similaire de surveillance ou de contrôle n’a jamais été développé, malgré la plante dévastatrice pour l’élevage dans notre pays et en Europe en général. Le recueil de cette proposition est le suivant: la méthodologie actuellement utilisée en Grèce en tant que service fourni pour la classification des insectes hématophages est l’analyse morphologique. Ces dernières années, le codage à barres d’ADN a été utilisé dans le monde entier comme complément à l’analyse morphologique, principalement des espèces complexes, car son coût par insecte est élevé. La capacité de la technologie NGS pour la génomique de masse et le contrôle de transcription aujourd’hui peut aider à une analyse plus rapide, fiable et à moindre coût de la (French)
    29 November 2021
    0 references
    Weltweit basiert die Produktion von Erzeugnissen tierischen Ursprungs (ZO) hauptsächlich auf der Aufzucht von Nutztieren in systematischen Tierhaltungsbetrieben. Nur ein kleiner Teil der Z.P.-Produkte stammt aus heimischen Tierhaltungsbetrieben. Der Herstellungs-, Verarbeitungs- und Entsorgungsprozess von Z.P.-Produkten unterliegt dem Prinzip der Herstellung sicherer, hochwertiger und wirtschaftlicher Produkte. Sowohl weltweit als auch in Griechenland verursachen verschiedene infektiöse und parasitäre Krankheiten, die Tiere betreffen, insbesondere solche, die eine epizootische Dimension haben, schwerwiegende Schäden für die Tiergesundheit und das Wohlergehen der Tiere und in einigen Fällen katastrophale Folgen für die Tierproduktion und die Wirtschaft. Die Methoden der Übertragung dieser Krankheiten variieren und treten durch den Atem- oder Verdauungstrakt, mit direktem Kontakt, mechanischer Übertragung des Erregers usw. Ein wichtiger Weg für die Übertragung von Krankheiten ist der der Vektoren von Krankheiten wie blutfressenden Insekten, die (im Gegensatz zu den entsprechenden menschlichen Krankheiten und ihren Vektoren) erst vor kurzem in der Tierhaltung ausreichend untersucht wurden. Solche blutfressenden Insekten Vektorkrankheiten in Griechenland sind Fliegen, Zecken, Läuse, Bettwanzen, Mücken und Gnats.Die Folgen des Auftretens der oben genannten Krankheiten und aus der Anwendung von Notfallplänen, um Verbreitung, Kontrolle und schließlich zu beseitigen, sind zerstörerisch wie: Die Erzeugung von tierischen Erzeugnissen in einem Betrieb oder sogar in einem ganzen Gebiet kann aufgrund der sehr schwerwiegenden Symptome und Folgen der Krankheit drastisch reduziert werden (Missbrauch, Lahmheit, Unfruchtbarkeit, Desulsion, Läsion im Atem- und Verdauungstrakt oder Haut, Todesfälle), Tausende von Nutztieren getötet werden, da die meisten der oben genannten Krankheiten behandelt und ausgerottet werden; nach den einzelstaatlichen und gemeinschaftlichen Rechtsvorschriften ist die vollständige oder teilweise Tötung, die Kosten für die Tötung und Kompensation kranker Tiere (Primärschäden) belaufen sich auf viele Millionen Euro, riesig und äußerst schwer zu schätzen. Es ist auch der sekundäre Schaden, der durch die Einführung drastischer restriktiver Maßnahmen im Handel mit lebenden Tieren und der entsprechenden Agrar- und Lebensmittelerzeugnisse verursacht wird, die oft sogar Primärschäden übersteigen. Es gibt akute soziale Probleme, vor allem im betroffenen Gebiet und im Land im Allgemeinen durch die Schaffung einer großen Zahl von arbeitslosen Landwirten und die Zerstörung aller Überlebensmittel dieser und ihrer Familien. Die wichtigsten Hematophagusinsekten von tierärztlichem Interesse in Griechenland sind die Gattungen Culicoides und Moskitos (Culicidae). Heute wird ein Überwachungsnetz für Mücken für ihre Bevölkerungsstudie während ihrer Tätigkeitsmonate mit CDC-Trapen bekämpft und gelegentlich auch auf Krankheitserreger von medizinischem Interesse wie Malaria plasmodus und Western Nile untersucht. Die Sammlung wird von spezialisierten Unternehmen durchgeführt, die auch den Kampf gegen Mücken pro Präfektur im Land unter der Verantwortung der jeweiligen Regionen Griechenlands durchführen. Für Gnats Culicoides wurden trotz der verheerenden Tierhaltungsanlage in unserem Land und in Europa im Allgemeinen keine ähnlichen Überwachungs- oder Kontrollarbeiten entwickelt. Das Kompendium dieses Vorschlags lautet wie folgt: die derzeit in Griechenland als Dienstleistung für die Einstufung von hämatophagösen Insekten angewandte Methodik ist morphologische Analyse. In den letzten Jahren wurde die DNA-Barcodierung weltweit als Ergänzung zur morphologischen Analyse, vor allem komplexer Arten, eingesetzt, da die Kosten pro Insekt hoch sind. Die Fähigkeit der NGS-Technologie zur Massen-Genomik- und Transkriptionssteuerung kann heute bei einer schnelleren, zuverlässigen und kostengünstigeren Analyse der Kosten helfen. (German)
    5 December 2021
    0 references

    Identifiers

    5.030.757
    0 references