EXPLOITATION OF ENVIRONMENTAL BACTERIA ADAPTED TO WATER SCARCITY FOR SOLID PHASE BIOPROCESS ENGINEERING (SETH) (Q3179451)
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Project Q3179451 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EXPLOITATION OF ENVIRONMENTAL BACTERIA ADAPTED TO WATER SCARCITY FOR SOLID PHASE BIOPROCESS ENGINEERING (SETH) |
Project Q3179451 in Spain |
Statements
54,450.0 Euro
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108,900.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2019
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31 December 2021
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UNIVERSIDAD DE LEON
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42°38'2.94"N, 5°58'17.11"W
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24089
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EN UN PROYECTO DE INVESTIGACION PREVIO (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION, EN ESTRECHA COLABORACION CON LOS GRUPOS DE INVESTIGACION DE LOS PROFESORES JOSE LUIS GARCIA Y JULI PERETO, AISLO DIFERENTES MICROORGANISMOS CON TOLERANCIA A LA DESECACION (BACTERIAS XEROTOLERANTES). ESAS BACTERIAS AISLADAS PERTENECEN PRINCIPALMENTE A LOS GRUPOS ACTINOBACTERIA Y FIRMICUTES, CON SOLO UNOS POCOS REPRESENTANTES DE BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS. EN EL PRESENTE PROYECTO DE INVESTIGACION, PROPONEMOS UNA CARACTERIZACION PROFUNDA DE LA FISIOLOGIA Y EL METABOLISMO DE UN GRUPO DE FIRMICUTES NO ESPORULANTES AISLADOS DEL METAGENOMA HELIOS. TAMBIEN SE CONSIDERAN ASPECTOS DE ADSCRIPCION FILOGENETICA Y BIOSEGURIDAD DE ESTAS CEPAS. A PARTIR DE ESTA COLECCION POLIEXTREMOFILA DE MICROORGANISMOS, SE SELECCIONARA UN NUMERO DISCRETO DE ELLOS PARA ANALIZAR LOS GENES IMPLICADOS EN LA TOLERANCIA A DIFERENTES CAUSAS DE ESTRES AMBIENTAL MEDIANTE ESTUDIOS MUTACIONALES, GENOMICOS Y TRANSCRIPTOMICOS. ESTOS MICROORGANISMOS SERAN PROPUESTOS COMO UN CHASIS BIOTECNOLOGICO ADECUADO, Y POR ESTA RAZON, SE DESARROLLARAN TECNICAS, PROTOCOLOS Y HERRAMIENTAS PARA LA INGENIERIA GENETICA Y LA EDICION GENOMICA DE ESTAS CEPAS. COMO PRUEBA DE CONCEPTO DE LA UTILIDAD DE ESTAS CEPAS PARA SER UTILIZADAS COMO NUEVO CHASIS BIOTECNOLOGICO, SE ABORDARA UN PROCESO BIODEGRADATIVO PARA LA DEGRADACION DEL POLI (TEREFTALATO DE ETILENO) (PET), UNO DE LOS PRINCIPALES COMPONENTES DE LOS DESECHOS DE PLASTICO QUE CONTAMINAN TODOS LOS HABITATS DEL MUNDO. LA DEGRADACION DE PET SE LLEVARA A CABO UTILIZANDO GENES QUE CODIFICAN PETASAS NATURALES Y / O SINTETICAS QUE SE EXPRESARAN EN EL CHASIS POLIEXTREMOFILO SELECCIONADO. PARA LOGRAR LA BIODEGRADACION DEL PET Y DE POLIMEROS RELACIONADOS, SE DISEÑARAN PROCESOS DE FERMENTACION DISCONTINUA TRADICIONAL, ASI COMO NUEVOS PROCESOS DE FERMENTACION (ENFOQUES DE FERMENTACION SOLIDA BACTERIANA), UTILIZANDO LOS MICROORGANISMOS POLIEXTREMOFILOS TRANSGENICOS. ADEMAS, SE PONDRAN A PUNTO SISTEMAS DE FERMENTACION EN ESTADO SOLIDO FUNGICOS Y SE LLEVARA A CABO EL DESARROLLO DE UN SISTEMA DE DEGRADACION DE PET POR HONGOS UTILIZANDO ESTAS TECNOLOGIAS. (Spanish)
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IN A PREVIOUS RESEARCH PROJECT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), OUR LABORATORY, IN A CLOSE COLLABORATION WITH THE INVESTIGATION GROUPS LED BY PROF. JOSE LUIS GARCIA AND PROF. JULI PERETO, ISOLATED DIFFERENT MICROORGANISMS WITH TOLERANCE TO DESICCATION (XEROTOLERANT BACTERIA). THOSE ISOLATED BACTERIA BELONG MAINLY TO ACTINOBACTERIA AND FIRMICUTES GROUPS, WITH ONLY A FEW REPRESENTATIVES OF GRAM-NEGATIVE BACTERIA. IN THE PRESENT RESEARCH PROJECT, WE PROPOSE A DEEP CHARACTERIZATION OF THE PHYSIOLOGY AND METABOLISM OF A GROUP OF NON-SPORULATING FIRMICUTES ISOLATED FROM HELIOS METAGENOME. PHYLOGENETIC ADSCRIPTION AND BIOSECURITY ASPECTS OF THESE STRAINS ARE ALSO CONSIDERED. FROM THIS POLYEXTREMOPHILE COLLECTION OF MICROORGANISMS, A DISCRETE NUMBER OF THEM WILL BE SELECTED TO ANALYZE THE GENES INVOLVED IN THE TOLERANCE FOR DIFFERENT ENVIRONMENTAL INJURIES THROUGH MUTATIONAL, GENOMIC, AND TRANSCRIPTOMIC STUDIES. THESE MICROORGANISMS WILL BE CONSIDERED AS SUITABLE BIOTECHNOLOGICAL CHASSIS, AND FOR THIS REASON, TECHNIQUES, PROTOCOLS AND TOOLS FOR GENETIC ENGINEERING AND GENOMIC EDITION OF THESE STRAINS WILL BE DEVELOPED. AS A PROOF OF CONCEPT OF THE UTILITY OF THESE STRAINS AS NEW BIOTECHNOLOGICAL CHASSIS, A BIODEGRADATIVE PROCESS FOR POLY (ETHYLENE TEREPHTHALATE) (PET) DEGRADATION, ONE OF THE MAIN COMPONENTS OF THE PLASTIC WASTES CONTAMINATING ALL HABITATS IN THE WORLD, WILL BE APPROACHED. PET DEGRADATION WILL BE CARRIED OUT BY USING GENES ENCODING NATURAL AND/OR SYNTHETIC PETASES THAT WILL BE EXPRESSED IN THE SELECTED POLYEXTREMOPHILE CHASSIS. TO ACHIEVE THE BIODEGRADATION OF PET AND RELATED POLYMERS, TRADITIONAL BATCH FERMENTATION, AS WELL AS NEW FERMENTATION PROCESSES (BACTERIAL SOLID-FERMENTATION APPROACHES), USING THE TRANSGENIC POLYEXTREMOPHILE MICROORGANISMS WILL BE DESIGNED. MOREOVER, FUNGAL SOLID-STATE FERMENTATIONS WILL BE TUNED UP, AND AN APPROACH TO PET DEGRADATION BY FUNGI USING THIS TECHNOLOGY WILL BE MADE. (English)
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DANS UN PROJET DE RECHERCHE PRÉCÉDENT (HELIOS, BIO 2015-66960-C3-3-R), NOTRE GROUPE DE RECHERCHE, EN ÉTROITE COLLABORATION AVEC LES GROUPES DE RECHERCHE DES PROFESSEURS JOSE LUIS GARCIA ET JULI PERETO, ISOLE DIFFÉRENTS MICROORGANISMES AVEC TOLÉRANCE AU SÉCHAGE (BACTÉRIES XÉROTOLÉRANTES). CES BACTÉRIES ISOLÉES APPARTIENNENT PRINCIPALEMENT AUX GROUPES ACTINOBACTERIA ET FIRMICUTES, AVEC SEULEMENT QUELQUES REPRÉSENTANTS DE BACTÉRIES GRAM-NÉGATIVES. DANS CE PROJET DE RECHERCHE, NOUS PROPOSONS UNE CARACTÉRISATION PROFONDE DE LA PHYSIOLOGIE ET DU MÉTABOLISME D’UN GROUPE DE FIRMICUTES NON-SPORULANTS ISOLÉS DE LA MÉTAGÉNOME HELIOS. ELLES SONT ÉGALEMENT CONSIDÉRÉES COMME DES ASPECTS DE L’ATTRIBUTION DE PHYLOGENETICA ET DE LA BIOSÉCURITÉ DE CES SOUCHES. À PARTIR DE CETTE COLLECTION DE MICRO-ORGANISMES POLIEXTREMOFILA, UN CERTAIN NOMBRE D’ENTRE EUX SERONT SÉLECTIONNÉS POUR ANALYSER LES GÈNES IMPLIQUÉS DANS LA TOLÉRANCE AUX DIFFÉRENTES CAUSES DE STRESS ENVIRONNEMENTAL PAR LE BIAIS D’ÉTUDES MUTATIONNELLES, GÉNOMIQUES ET TRANSCRIPTOMIQUES. CES MICRO-ORGANISMES SERONT PROPOSÉS COMME CHÂSSIS BIOTECHNOLOGIQUE APPROPRIÉ ET, POUR CETTE RAISON, DES TECHNIQUES, PROTOCOLES ET OUTILS POUR LE GÉNIE GÉNÉTIQUE ET L’ÉDITION GÉNOMIQUE DE CES SOUCHES SERONT DÉVELOPPÉS. COMME PREUVE DU CONCEPT DE L’UTILITÉ DE CES SOUCHES À UTILISER COMME NOUVEAU CHÂSSIS BIOTECHNOLOGIQUE, UN PROCESSUS BIODÉGRADANT POUR LA DÉGRADATION DU POLY (ÉTHYLÈNE TÉRÉPHTALATE) (PET), L’UN DES PRINCIPAUX COMPOSANTS DES DÉCHETS PLASTIQUES QUI CONTAMINENT TOUS LES HABITATS DANS LE MONDE, SERA ABORDÉ. LA DÉGRADATION DE L’ANIMAL DE COMPAGNIE DOIT ÊTRE EFFECTUÉE À L’AIDE DE GÈNES CODANT PETASAS NATURELS ET/OU SYNTHÉTIQUES QUI SERONT EXPRIMÉS DANS LE CHÂSSIS POLIEXTREMOPHY SÉLECTIONNÉ. POUR PARVENIR À LA BIODÉGRADATION DES POLYMÈRES ANIMAUX DE COMPAGNIE ET DES POLYMÈRES APPARENTÉS, DES PROCÉDÉS TRADITIONNELS DE FERMENTATION DISCONTINUE SERONT CONÇUS, AINSI QUE DE NOUVEAUX PROCÉDÉS DE FERMENTATION (APPROCHES BACTÉRIENNES DE FERMENTATION SOLIDE), UTILISANT DES MICRO-ORGANISMES POLYEXTREMOPHILIC TRANSGÉNIQUES. EN OUTRE, DES SYSTÈMES DE FERMENTATION SERONT MIS AU POINT À L’ÉTAT SOLIDE DE FUNGICOS ET LE DÉVELOPPEMENT D’UN SYSTÈME DE DÉGRADATION DES ANIMAUX DE COMPAGNIE PAR LES CHAMPIGNONS UTILISANT CES TECHNOLOGIES SERA RÉALISÉ. (French)
4 December 2021
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León
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Identifiers
RTI2018-095584-B-C43
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