The role of the burial environment in biomolecular archeology and ancient tuberculosis research processes (Q3056348)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3056348 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | The role of the burial environment in biomolecular archeology and ancient tuberculosis research processes |
Project Q3056348 in Latvia |
Statements
550,823.15 Euro
0 references
648,027.24 Euro
0 references
85.0 percent
0 references
1 March 2017
0 references
29 February 2020
0 references
Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
0 references
56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
0 references
56°57'10.22"N, 24°6'48.53"E
0 references
56°58'32.05"N, 24°11'23.93"E
0 references
Biomolekulārai arheoloģijai ir milzīgs potenciāls seno patogēnu izpētē, kas var sniegt zināšanas par to evolūcijas un izpatīšanas procesiem. Šis zināšanas var tikt izmantotas mūsdienu infekciju slimību modeļos un dažādu patogēnu apkarošanas stratēģiju izveidē. Tuberkuloze ir vismaz 8000 gadus veca slimība, un tās izraisītāja Mycobacterium tuberculosis evolūcijas un izplatības izpēte var palīdzēt izveidot jaunas stratēģijas šīs infekcijas slimības veiksmīgai apkarošanai. Pētījumi liecina, ka M. tuberculosis DNS sekvenču detektēšana un analīze arheoloģiskos paraugos ir iespējama, tomēr tā ir apgrūtināta ar vides mikobaktēriju iespējamo klātbūtni apbedījumos.Projekta mērķis: Raksturot augsnes mikrobioma efektu senās DNS izpētes procesos un izpētīt tuberkulozes izraisītāja genoma klātbūtni 15.-18. gadsimta arheologiska materiāla paraugos.Mērķa sasniegšanai ir plānoti fundamentāli, starpdisciplināri pētījumi sadarbības projekta ietvaros. Projektā piedalīsies zinātnieki no Latvijas Biomedicīnas Pētījumu Centra un Latvijas Universitātes Latvijas Vēstures Institūta, kas pārstāv Molekulārās bioloģijas un biomedicīnas un Arheoloģijas sektorus. Projekts atbilst 3.5. “Cita medicīnas zinātne” un 6.1. “Vēsture un Arheoloģija” zinātnes nozarēm un nav saistīts ar saimniecisku darbību. Projekta izmaksas: 648 648 EUR (ERAF atbalsta apjoms: 551 351 EUR), projekta ilgums: 36 mēneši (01.03.2017 – 29.02.2020). Projekta ietvaros ir paredzētas trīs aktivitātes:1.Arheoloģiskajos izrakumos iegūtā 15.-18. gadsimta antropoģiska materiāla (kaulu un zobakmens paraugu) paleopatoloģiskā izpēte un biomolekulārā analīze.2.Apbedījuma vides bioarheoloģiskā raksturošana un vides mikrobioma izpēte.3.Vides mikroorganismu un M. tuberculosis DNS klātbūtnes raksturošana arheoloģiskos paraugos.Šī projekta izpilde sniegs jaunas zināšanas par arheoloģisko paraugu kontaminācijas pakāpi ar vides mikroorganismiem, kas šobrīd ir ļoti svarīgs jautājums paleopatoloģijas un seno patogēnu izpētes attīstībai. Turklāt projektā paredzētie pētījumi, kuru laikā tiks izmantotas nākošās pāaudzes sekvenēšanas tehnoloģijas, dos ieskatu par M. tuberculosis klātbūtni Latvijas antropoģiska materiālā. Projekta ietvaros publicēšanai tiks iesniegti vairāki oriģināli zinātniskie raksti, kā arī rezultāti tiks prezentēti starptautiskās konferencēs.Kopumā, projekta izpilde sniegs informāciju par vides mikroorganismu DNS klātbūtni Viduslaiku arheoloģiskos paraugos, kas palīdzēs izprast to ietekmi uz seno patogēnu pētījumiem. Projektā paredzētie mēģinājumi veikt M. tuberculosis DNS klātbūtnes noteikšanu un raksturošanu 15.-18. gadsimta arheologiska materiāla paraugos palīdzēs apstiprināt un uzlabot tuberkulozes paleopatoloģisku diagnozi un sniegs jaunas zināšanas par tuberkulozes izplatības procesiem Latvijā.Atslēgas vārdi: Mikrobioms, bioarheoloģija, senā DNS, tuberkuloze. (Latvian)
0 references
Biomolecular archaeology has enormous potential in researching ancient pathogens, which can provide knowledge of their evolution and spoiling processes. This knowledge can be used in modern models of infectious diseases and in developing strategies to combat various pathogens. Tuberculosis is at least 8000 years old and research into the evolution and spread of Mycobacterium tuberculosis may help to develop new strategies for the successful control of this infectious disease. Research has shown that detection and analysis of M. tuberculosis DNA sequences in archaeological samples is possible, but it is difficult with the possible presence of environmental mycobacteria in burials. To characterise the effect of soil microbiome in ancient DNA research processes and to investigate the presence of tuberculosis-causing genome in samples of 15th-18th century archaeology material. The project will be attended by scientists from Latvian Biomedical Research Centre and University of Latvia Institute of History, which represents Molecular Biology and Biomedical and Archaeology sectors. The project is in line with 3.5. “Other medical science” and 6.1. “History and Archaeology” in scientific fields and not related to economic activity. Project costs: EUR 648648 (the amount of the ERDF aid: EUR 551351), duration of the project: 36 months (01.03.2017-29.02.2020). Three activities are planned within the framework of the project: 1.Paleopathological research and biomolecular analysis of anthropogenic material (bone and tartar samples) obtained from archaeological excavations.2. Bioarcheological characterisation of burial environment and environmental microbiome.3. characterisation of environmental microorganisms and M. tuberculosis DNA in archaeological samples. Moreover, the studies envisaged in the project, during which the technologies for sequencing the next generation will be used, will provide an insight into the presence of M. tuberculosis in Latvian anthropological material. Within the framework of the project several original scientific articles will be submitted for publication, as well as the results will be presented at international conferences.In general, the implementation of the project will provide information on the presence of environmental micro-organism DNA in Medieval archaeological samples, which will help to understand their impact on the research of ancient pathogens. The project’s attempts to detect and characterise the presence of M. tuberculosis DNA in samples of 15th-18th century archaeological material will help confirm and improve the paleopathological diagnosis of tuberculosis and provide new knowledge about tuberculosis spread processes in Latvia. Microbiome, bioarcheology, ancient DNA, tuberculosis. (English)
15 July 2021
0 references
L’archéologie biomoléculaire a un énorme potentiel dans la recherche d’agents pathogènes anciens, qui peuvent fournir des connaissances sur leurs processus d’évolution et de gratification. Ces connaissances peuvent être utilisées dans les modèles modernes de maladies infectieuses et dans l’élaboration de stratégies de lutte contre divers agents pathogènes. La tuberculose est une maladie d’au moins 8000 ans et la recherche sur l’évolution et la propagation de Mycobacterium tuberculosis, son agent causal, peut aider à élaborer de nouvelles stratégies pour lutter efficacement contre cette maladie infectieuse. Des études montrent qu’il est possible de détecter et d’analyser les séquences d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques, mais il est difficile de détecter et d’analyser des mycobactéries de l’environnement dans les sépultures. Caractériser l’effet du microbiome du sol dans les recherches anciennes sur l’ADN et étudier la présence du génome de l’agent tuberculeux dans des échantillons de matériel archéologique des XVe et XVIIIe siècles. Des scientifiques du Centre letton de recherche biomédicale et de l’Institut d’histoire letton de l’Université de Lettonie participeront au projet, représentant les secteurs de la biologie moléculaire et de la biomédicale et de l’archéologie. Le projet correspond à 3.5. «Autres sciences médicales» et 6.1. «Histoire et archéologie» pour les disciplines scientifiques et non liées à l’activité économique. Coûts du projet: 648 648 EUR (montant de l’aide du FEDER: 551 351 EUR), durée du projet: 36 mois (01.03.2017-29.02.2020). Dans le cadre du projet, trois études paléopathologiques et des analyses biomoléculaires de matériaux anthropiques (échantillons d’os et de tartre) obtenues à partir d’excavations du 15 au XVIIIe siècle sont prévues.2. Caractérisation bioarchéologique de l’environnement et microbiome environnemental.3. Caractérisation de la présence de microorganismes environnementaux et d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques. La mise en œuvre de ce projet fournira de nouvelles connaissances sur le degré de contamination des échantillons archéologiques par des micro-organismes environnementaux, un enjeu très important pour le développement de la paléopathologie et de la recherche sur les agents pathogènes anciens. En outre, les études envisagées dans le projet, au cours desquelles les technologies de séquençage de la prochaine génération seront utilisées, fourniront un aperçu de la présence de M. tuberculosis dans le matériel anthropique letton. Dans le cadre du projet, plusieurs articles scientifiques originaux seront soumis pour publication, ainsi que les résultats seront présentés lors de conférences internationales. En général, la mise en œuvre du projet fournira des informations sur la présence d’ADN de micro-organismes environnementaux dans des échantillons archéologiques médiévaux, ce qui aidera à comprendre leur impact sur la recherche d’agents pathogènes anciens. Les tentatives de détection et de caractérisation de la présence d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons de matériel archéologique du XVe et XVIIIe siècle aideront à confirmer et à améliorer le diagnostic paléopathologique de la tuberculose et fourniront de nouvelles connaissances sur les processus de distribution de la tuberculose en Lettonie. Microbiome, bioarchéologie, ADN ancien, tuberculose. (French)
25 November 2021
0 references
Die biomolekulare Archäologie hat ein enormes Potenzial für die Erforschung alter Krankheitserreger, die Wissen über ihre evolutionären und befriedigenden Prozesse liefern können. Dieses Wissen kann in modernen Modellen von Infektionskrankheiten und bei der Entwicklung von Strategien zur Bekämpfung verschiedener Krankheitserreger eingesetzt werden. Tuberkulose ist eine Krankheit im Alter von mindestens 8000 Jahren und die Erforschung der Entwicklung und Ausbreitung von Mycobacterium tuberculosis, ihrem ursiven Wirkstoff, kann helfen, neue Strategien zur erfolgreichen Bekämpfung dieser Infektionskrankheit zu entwickeln. Studien zeigen, dass die Entdeckung und Analyse von DNA-Sequenzen von M. Tuberkulose in archäologischen Proben möglich ist, es ist jedoch schwierig mit dem möglichen Vorhandensein von Umweltmykobakterien in Bestattungen. Um die Wirkung von Bodenmikrobiom in der antiken DNA-Forschung zu charakterisieren und das Vorhandensein von Tuberkulose-Agenom in Proben von archäologischem Material des 15. und 18. Jahrhunderts zu untersuchen. An dem Projekt beteiligen sich Wissenschaftler des lettischen biomedizinischen Forschungszentrums und des Lettischen Geschichtsinstituts der Universität Lettland, die die Bereiche Molekulare Biologie und Biomedizin und Archäologie vertreten. Das Projekt entspricht 3.5. „Sonstige Medizinwissenschaft“ und 6.1. „Geschichte und Archäologie“ für wissenschaftliche Disziplinen, die nicht mit der Wirtschaftstätigkeit zusammenhängen. Projektkosten: 648 648 EUR (EFRE-Beihilfebetrag: 551 351 EUR), Laufzeit des Projekts: 36 Monate (01.03.2017-29.02.2020). Im Rahmen des Projekts sind drei paläopathologische Studien und biomolekulare Analysen von anthropogenem Material (Knochen- und Tartarproben) aus den Ausgrabungen des 15.-18. Jahrhunderts geplant.2. Bioarcheologische Charakterisierung von Bestattungsumgebung und Umweltmikrobiom.3. Charakterisierung des Vorhandenseins von Umweltmikroorganismen und M. Tuberkulose-DNA in archäologischen Proben. Die Umsetzung dieses Projekts wird neue Erkenntnisse über den Grad der Kontamination archäologischer Proben mit Umweltmikroorganismen vermitteln, was ein sehr wichtiges Thema für die Entwicklung der Paläopathologie und der antiken Pathogenforschung ist. Darüber hinaus werden die im Projekt geplanten Studien, bei denen die Sequenzierungstechnologien der nächsten Generation eingesetzt werden, einen Einblick in das Vorhandensein von M. Tuberkulose im lettischen anthropogenen Material geben. Im Rahmen des Projekts werden mehrere ursprüngliche wissenschaftliche Artikel zur Veröffentlichung vorgelegt, sowie die Ergebnisse auf internationalen Konferenzen vorgestellt. Im Allgemeinen wird die Durchführung des Projekts Informationen über das Vorhandensein von DNA des Umweltmikroorganismus in mittelalterlichen archäologischen Proben liefern, die dazu beitragen werden, ihre Auswirkungen auf die Erforschung alter Krankheitserreger zu verstehen. Versuche, das Vorhandensein von M. Tuberkulose-DNA in Proben von archäologischem Material des 15. und 18. Jahrhunderts zu erkennen und zu charakterisieren, werden dazu beitragen, die paläopathologische Diagnose von Tuberkulose zu bestätigen und zu verbessern und neue Erkenntnisse über die Tuberkuloseverteilungsprozesse in Lettland zu vermitteln. Mikrobiom, Bioarchäologie, alte DNA, Tuberkulose. (German)
28 November 2021
0 references
Biomoleculaire archeologie heeft een enorm potentieel in het onderzoeken van oude pathogenen, die kennis kunnen verschaffen van hun evolutionaire en bevredigingsprocessen. Deze kennis kan worden gebruikt in moderne modellen van infectieziekten en bij de ontwikkeling van strategieën om verschillende ziekteverwekkers te bestrijden. Tuberculose is een ziekte van ten minste 8000 jaar oud en onderzoek naar de evolutie en verspreiding van Mycobacterium tuberculosis, zijn veroorzaker, kan helpen om nieuwe strategieën te ontwikkelen om deze infectieziekte met succes te bestrijden. Studies tonen aan dat detectie en analyse van M. tuberculosis DNA sequenties in archeologische monsters mogelijk is, maar het is moeilijk met de mogelijke aanwezigheid van milieumycobacteriën in begrafenissen. Om het effect van bodemmicrobiome in oud DNA-onderzoek te karakteriseren en de aanwezigheid van tuberculosegenoom te onderzoeken in monsters van archeologisch materiaal uit de 15e en 18e eeuw. Het project zal worden bijgewoond door wetenschappers van het Letse Biomedisch Onderzoekscentrum en het Letse Instituut voor Geschiedenis van de Universiteit van Letland, die de sectoren Moleculaire Biologie, Biomedische en Archeologie vertegenwoordigen. Het project komt overeen met 3.5. „Andere medische wetenschap” en 6.1. „Geschiedenis en archeologie” voor wetenschappelijke disciplines die geen verband houden met economische activiteit. Projectkosten: 648 648 EUR (steun uit het EFRO: 551 351 EUR), duur van het project: 36 maanden (01.03.2017-29.02.2020). In het kader van het project zijn drie paleopathologische studies en biomoleculaire analyse van antropogene materialen (beender- en tartaarmonsters) uit 15-18e-eeuwse opgravingen gepland.2. Bioarcheologische karakterisering van het begraven milieu en milieumicrobioom.3. Karakterisatie van de aanwezigheid van milieumicro-organismen en M. tuberculosis DNA in archeologische monsters. De uitvoering van dit project zal nieuwe kennis verschaffen over de mate van besmetting van archeologische monsters met micro-organismen in het milieu, wat een zeer belangrijke kwestie is voor de ontwikkeling van palaeopathologie en onderzoek naar oude ziekteverwekkers. Bovendien zullen de in het project geplande studies, waarin de volgende generatie sequencingtechnologieën zullen worden gebruikt, inzicht verschaffen in de aanwezigheid van M. tuberculosis in het antropogene materiaal van Letland. In het kader van het project zullen verschillende originele wetenschappelijke artikelen ter publicatie worden voorgelegd, evenals de resultaten zullen worden gepresenteerd op internationale conferenties. In het algemeen zal de uitvoering van het project informatie verschaffen over de aanwezigheid van milieumicro-organisme DNA in middeleeuwse archeologische monsters, die zullen helpen om hun impact op het onderzoek van oude ziekteverwekkers te begrijpen. Pogingen om de aanwezigheid van M. tuberculosis DNA op te sporen en te karakteriseren in monsters van archeologisch materiaal uit de 15e en 18e eeuw zullen helpen de paleopathologische diagnose van tuberculose te bevestigen en te verbeteren en nieuwe kennis te verschaffen over de verspreidingsprocessen van tuberculose in Letland. Microbiome, bioarcheologie, oud DNA, tuberculose. (Dutch)
28 November 2021
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Kalpaka bulvāris 4, Rīga, LV-1050
0 references
Lielvārdes iela 24, Rīga, LV-1006
0 references
Identifiers
1.1.1.1/16/A/101
0 references