Application OF GENOMA EDITION (CRISPR-Cas9), Massive Sequencing AND GENERATION OF iPSCs IN THE STUDIO OF POSTLOCUTIVE HEREDITARIAL DEAcuses (Q3141148)
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Project Q3141148 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Application OF GENOMA EDITION (CRISPR-Cas9), Massive Sequencing AND GENERATION OF iPSCs IN THE STUDIO OF POSTLOCUTIVE HEREDITARIAL DEAcuses |
Project Q3141148 in Spain |
Statements
82,875.0 Euro
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165,750.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2018
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31 March 2021
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FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
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40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W
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28079
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(Continua. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Reclutar nuevas familias con hipoacusia hereditaria postlocutiva (HHP). 2) Identificación de nuevos genes. 3) Diseño de una nueva versión del OTO-NGS-Panel para la detección de mutaciones (SNPs y CNVs). 4) Patofisiología de DIAPH1 y de los nuevos genes de sordera identificados. 5) Generación de ratones knock-in para dos mutaciones en KITLG asociadas a hipoacusia unilateral. 6) Abordajes terapéuticos para la hipoacusia DFNA50 en ratones knock-in generados con mutaciones en miR96. 7) Generación de lineas iPSC en pacientes con mutaciones en miR96. Met.:1) Obtención de muestras de sangre, epitelio nasal y fibroblastos previo consentimiento informado. 2) Análisis genético: A) Identificación de nuevos genes de HHP mediante WES. B) Generación de la versión OTO-NGS-Panel-V2 mediante sistema de captura (sondas IDT) y análisis bioinformático con software de Sophia Genetics. 3) Pruebas funcionales: Implementación de técnicas de biología molecular y celular (transfecciones transitorias, inmunohisto- y -citoquímica,..) 4) Ratones knock-in (KITLG): generación mediante tecnología CRISPR-Cas9 en colaboración con el grupo del Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Análisis del oído interno morfológico y auditivo por PEATC y OEAs (colaboración con Prof. Karen Steel). 5) Terapias para la hipoacusia DFNA50: análisis de RNA-Seq (oido interno y en epitelio nasal) en dos ratones knock-in con las mutaciones humanas de miR96. Identificación pathways comunes y genes modulables (SPIED software) por fármacos. 6) Generación de iPSCs: a partir de fibroblastos de pacientes con mutaciones en miR96 mediante virus Sendai no integrativos. (Spanish)
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(Continues. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recruiting new families with hereditary hearing loss (HHP). 2) Identification of new genes. 3) Design of a new version of the OTO-NGS-Panel for the detection of mutations (SNPs and CNVs). 4) Pathophysiology of DIAPH1 and new identified deafness genes. 5) Generation of knock-in mice for two KITLG mutations associated with unilateral hearing loss. 6) Therapeutic approaches for hearing loss DFNA50 in knock-in mice generated with miR96 mutations. 7) Generation of iPSC lines in patients with miR96 mutations. Met.:1) Obtaining blood samples, nasal epithelium and fibroblasts with informed consent. 2) Genetic analysis: A) Identification of new HHP genes using WES. Generation of the OTO-NGS-Panel-V2 version using capture system (ITD probes) and bioinformatics analysis using Sophia Genetics software. 3) Functional tests: Implementation of molecular and cell biology techniques (transient transfections, immunohisto- and -cytochemistry,..) 4) knock-in mouse (KITLG): generation using CRISPR-Cas9 technology in collaboration with the group of Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morphological and auditory internal ear analysis by PEATC and OEAs (collaboration with Prof. Karen Steel). 5. Therapies for hearing loss DFNA50: analysis of RNA-Seq (internal ear and nasal epithelium) in two knock-in mice with the human mutations of miR96. Identification of common pathways and modulable genes (spied software) by drugs. 6) Generation of iPSCs: from fibroblasts in patients with miR96 mutations using non-integrative Sendai virus. (English)
12 October 2021
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Madrid
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Identifiers
PI17_01659
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