No label defined (Q3157086)

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Project Q3157086 in Spain
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No label defined
Project Q3157086 in Spain

    Statements

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    36,300.0 Euro
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    72,600.0 Euro
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    50.0 percent
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    1 January 2014
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    31 December 2016
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    UNIVERSIDAD DE GERONA
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    17079
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    EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) HA SIDO IMPLICADO RECIENTEMENTE EN LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN, ESPECIALMENTE EN PACIENTES CON AFECTACION ILEAL, AUNQUE CADA VEZ SON MAS LOS ESTUDIOS QUE TAMBIEN LO RELACIONAN CON OTRAS AFECTACIONES INTESTINALES COMO LA COLITIS ULCEROSA Y EL CANCER DE COLON. AMBAS ENFERMEDADES TIENEN UNA INCIDENCIA CRECIENTE EN PAISES DESARROLLADOS._x000D_ _x000D_ EL PATOTIPO AIEC SE DEFINE POR SU CAPACIDAD DE ADHERENCIA E INVASION DE CELULAS EPITELIALES INTESTINALES Y POR SER CAPAZ DE SOBREVIVIR Y REPLICARSE EN MACROFAGOS. LAS CEPAS AIEC AISLADAS HASTA EL MOMENTO SON GENETICAMENTE MUY DIVERSAS, PERTENECEN A DISTINTOS FILOGRUPOS Y PUEDEN PRESENTAR DIVERSOS GRUPOS DE GENES DE VIRULENCIA CARACTERISTICOS DE E. COLI PATOGENAS EXTRAINTESTINALES. NO OBSTANTE, EL HECHO DE TENER ESTOS GENES NO JUSTIFICA EL FENOTIPO AIEC. POR OTRO LADO, SE HA DEMOSTRADO QUE GENES DIRECTAMENTE IMPLICADOS EN LA PATOGENICIDAD DEL PATOTIPO SE HALLAN TAMBIEN EN CEPAS DE E. COLI NO PATOGENAS. EN RESUMEN, NO SE CONOCEN QUE DETERMINANTES GENETICOS ESTAN ESPECIFICAMENTE RELACIONADOS CON EL FENOTIPO AIEC. _x000D_ _x000D_ EN UN ESTUDIO PREVIO, NUESTRO GRUPO MOSTRO QUE AISLADOS DE E. COLI CON PULSOTIPOS IDENTICOS DIFIEREN EN EL FENOTIPO AIEC. EN EL ANTERIOR PROYECTO (GENAIEC, SAF2010-15896) SE SELECCIONARON TRES PAREJAS DE CEPAS (CADA PAREJA CONSISTE EN UN AISLADO AIEC Y UNO NO-AIEC CON EL MISMO PULSOTIPO) Y SE SECUENCIARON SUS GENOMAS. SE LLEVO A CABO UNA SECUENCIACION DE NOVO CON EL OBJETIVO DE TENER GENOMAS DE REFERENCIA DE ALTA CALIDAD EN QUE SE PUEDAN IDENTIFICAR NO SOLO DIFERENCIAS DE PRESENCIA/AUSENCIA DE GENES SINO TAMBIEN DIFERENCIAS ESTRUCTURALES. SE ANOTARON FUNCIONALMENTE LOS SEIS GENOMAS Y SE REALIZO UN ANALISIS COMPARATIVO DOS A DOS. LA COMPARACION DE CEPAS TAN CERCANAS GENETICAMENTE PERO QUE DIFIEREN EN EL FENOTIPO AIEC NOS HA PERMITIDO OBTENER UNA LISTA RELATIVAMENTE REDUCIDA DE ELEMENTOS GENETICOS CANDIDATOS. ADEMAS, AL SECUENCIAR TRES PAREJAS DE CEPAS QUE PERTENECEN A FILOGRUPOS DISTINTOS PODEMOS CONOCER QUE DIFERENCIAS SON ESPECIFICAS DE LA PAREJA ESTUDIADA Y CUALES SON ¿TRANSVERSALES¿ EN LAS AIEC DE DISTINTOS FILOGRUPOS._x000D_ EN EL PRESENTE PROYECTO PRETENDEMOS IDENTIFICAR ELEMENTOS GENETICOS DISTINTIVOS DEL PATOTIPO AIEC. EN PRIMER LUGAR SE PROPONE DISEÑAR HERRAMIENTAS MOLECULARES QUE PERMITAN LA DETECCION Y CUANTIFICACION DEL PATOTIPO AIEC, ACTUALMENTE INEXISTENTES, Y QUE PODRAN APLICARSE EN MUESTRAS DE PACIENTES. POR OTRO LADO, PRETENDEMOS CONOCER EL MECANISMO MEDIANTE EL CUAL ESTOS ELEMENTOS GENETICOS ESTAN IMPLICADOS EN LA PATOGENICIDAD DE LAS AIEC._x000D_ EL DISEÑO DE HERRAMIENTAS MOLECULARES PARA LA DETECCION DEL PATOTIPO AIEC PODRIA SER DE UTILIDAD EN EL DIAGNOSTICO DIFERENCIAL DE DISTINTOS SUBTIPOS DE ENFERMEDADES INFLAMATORIAS INTESTINALES. ADEMAS, ESTAS HERRAMIENTAS FACILITARIAN LOS ESTUDIOS A GRAN ESCALA, PUDIENDO CONOCER MEJOR LA PREVALENCIA DEL PATOTIPO E IDENTIFICAR LOS RESERVORIOS Y VIAS DE TRANSMISION. ESTOS ESTUDIOS SON DIFICILMENTE EJECUTABLES MEDIANTE LAS TECNICAS ACTUALES DE IDENTIFICACION DEL PATOTIPO. ADEMAS, ESCLARECER CUALES SON LOS DETERMINANTES GENETICOS RELACIONADOS CON SU PATOGENICIDAD NO SOLO AYUDARIA A COMPRENDER MEJOR EL MECANISMO DE PATO¬GENICIDAD DEL PATOTIPO SI NO QUE SIGNIFICARIA UN GRAN AVANCE EN LA DETECCION DE NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS PARA LA ENFERMEDAD DE CROHN. (Spanish)
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    Girona
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    Identifiers

    SAF2013-43284-P
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